+++ /dev/null
-File ex1.fa contains two sequences cut from the human genome
-build36. They were exatracted with command:
-
- samtools faidx human_b36.fa 2:2043966-2045540 20:67967-69550
-
-Sequence names were changed manually for simplicity. File ex1.sam.gz
-contains MAQ alignments exatracted with:
-
- (samtools view NA18507_maq.bam 2:2044001-2045500;
- samtools view NA18507_maq.bam 20:68001-69500)
-
-and processed with `samtools fixmate' to make it self-consistent as a
-standalone alignment.
-
-To try samtools, you may run the following commands:
-
- samtools faidx ex1.fa # index the reference FASTA
- samtools import ex1.fa.fai ex1.sam.gz ex1.bam # SAM->BAM
- samtools index ex1.bam # index BAM
- samtools tview ex1.bam ex1.fa # view alignment
- samtools pileup -cf ex1.fa ex1.bam # pileup and consensus
- samtools pileup -cf ex1.fa -t ex1.fa.fai ex1.sam.gz
-
-In order for the script pysam_test.py to work, you will need pysam
-in your PYTHONPATH.
-
-In order for the script example.py to work, you will need pysam
-in your PYTHONPATH and run
-
- make all
-
-beforehand.
+++ /dev/null
-#!/usr/bin/env python
-'''unit testing code for pysam.
-
-Execute in the :file:`tests` directory as it requires the Makefile
-and data files located there.
-'''
-
-import pysam
-import unittest
-import os
-import shutil
-import sys
-import collections
-import subprocess
-import logging
-from TestUtils import checkBinaryEqual, checkURL
-
-IS_PYTHON3 = sys.version_info[0] >= 3
-
-SAMTOOLS = "samtools"
-WORKDIR = "pysam_test_work"
-DATADIR = "pysam_data"
-
-
-class BasicTestBAMFetch(unittest.TestCase):
-
- '''basic first test - detailed testing
- if information in file is consistent
- with information in AlignedSegment object.'''
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.AlignmentFile(
- os.path.join(DATADIR, "ex3.bam"),
- "rb")
- self.reads = list(self.samfile.fetch())
-
- def testARqname(self):
- self.assertEqual(
- self.reads[0].query_name,
- "read_28833_29006_6945",
- "read name mismatch in read 1: %s != %s" % (
- self.reads[0].query_name, "read_28833_29006_6945"))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].query_name,
- "read_28701_28881_323b",
- "read name mismatch in read 2: %s != %s" % (
- self.reads[1].query_name, "read_28701_28881_323b"))
-
- def testARflag(self):
- self.assertEqual(
- self.reads[0].flag, 99,
- "flag mismatch in read 1: %s != %s" % (
- self.reads[0].flag, 99))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].flag, 147,
- "flag mismatch in read 2: %s != %s" % (
- self.reads[1].flag, 147))
-
- def testARrname(self):
- self.assertEqual(
- self.reads[0].reference_id, 0,
- "chromosome/target id mismatch in read 1: %s != %s" %
- (self.reads[0].reference_id, 0))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].reference_id, 1,
- "chromosome/target id mismatch in read 2: %s != %s" %
- (self.reads[1].reference_id, 1))
-
- def testARpos(self):
- self.assertEqual(
- self.reads[0].reference_start, 33 - 1,
- "mapping position mismatch in read 1: %s != %s" %
- (self.reads[0].reference_start, 33 - 1))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].reference_start, 88 - 1,
- "mapping position mismatch in read 2: %s != %s" %
- (self.reads[1].reference_start, 88 - 1))
-
- def testARmapq(self):
- self.assertEqual(
- self.reads[0].mapping_quality, 20,
- "mapping quality mismatch in read 1: %s != %s" %
- (self.reads[0].mapping_quality, 20))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].mapping_quality, 30,
- "mapping quality mismatch in read 2: %s != %s" % (
- self.reads[1].mapping_quality, 30))
-
- def testARcigar(self):
- self.assertEqual(
- self.reads[0].cigartuples,
- [(0, 10), (2, 1), (0, 25)],
- "read name length mismatch in read 1: %s != %s" %
- (self.reads[0].cigartuples, [(0, 10), (2, 1), (0, 25)]))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].cigartuples, [(0, 35)],
- "read name length mismatch in read 2: %s != %s" %
- (self.reads[1].cigartuples, [(0, 35)]))
-
- def testARcigarstring(self):
- self.assertEqual(self.reads[0].cigarstring, '10M1D25M')
- self.assertEqual(self.reads[1].cigarstring, '35M')
-
- def testARmrnm(self):
- self.assertEqual(
- self.reads[0].next_reference_id, 0,
- "mate reference sequence name mismatch in read 1: %s != %s" %
- (self.reads[0].next_reference_id, 0))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].next_reference_id, 1,
- "mate reference sequence name mismatch in read 2: %s != %s" %
- (self.reads[1].next_reference_id, 1))
- self.assertEqual(
- self.reads[0].next_reference_id, 0,
- "mate reference sequence name mismatch in read 1: %s != %s" %
- (self.reads[0].next_reference_id, 0))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].next_reference_id, 1,
- "mate reference sequence name mismatch in read 2: %s != %s" %
- (self.reads[1].next_reference_id, 1))
-
- def testARmpos(self):
- self.assertEqual(self.reads[
- 0].next_reference_start, 200 - 1, "mate mapping position mismatch in read 1: %s != %s" % (self.reads[0].next_reference_start, 200 - 1))
- self.assertEqual(self.reads[
- 1].next_reference_start, 500 - 1, "mate mapping position mismatch in read 2: %s != %s" % (self.reads[1].next_reference_start, 500 - 1))
- self.assertEqual(self.reads[
- 0].next_reference_start, 200 - 1, "mate mapping position mismatch in read 1: %s != %s" % (self.reads[0].next_reference_start, 200 - 1))
- self.assertEqual(self.reads[
- 1].next_reference_start, 500 - 1, "mate mapping position mismatch in read 2: %s != %s" % (self.reads[1].next_reference_start, 500 - 1))
-
- def testARQueryLength(self):
- self.assertEqual(
- self.reads[0].query_length, 35,
- "insert size mismatch in read 1: %s != %s" %
- (self.reads[0].query_length, 35))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].query_length, 35,
- "insert size mismatch in read 2: %s != %s" %
- (self.reads[1].query_length, 35))
- self.assertEqual(
- self.reads[0].query_length, 35,
- "insert size mismatch in read 1: %s != %s" %
- (self.reads[0].query_length, 35))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].query_length, 35,
- "insert size mismatch in read 2: %s != %s" %
- (self.reads[1].query_length, 35))
-
- def testARseq(self):
- self.assertEqual(self.reads[0].query_sequence, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG", "sequence mismatch in read 1: %s != %s" % (
- self.reads[0].query_sequence, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG"))
- self.assertEqual(self.reads[1].query_sequence, "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA", "sequence size mismatch in read 2: %s != %s" % (
- self.reads[1].query_sequence, "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA"))
- self.assertEqual(self.reads[3].query_sequence, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG", "sequence mismatch in read 4: %s != %s" % (
- self.reads[3].query_sequence, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG"))
-
- def testARqual(self):
- self.assertEqual(pysam.toQualityString(self.reads[0].query_qualities), "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<",
- "quality string mismatch in read 1: %s != %s" % (pysam.toQualityString(self.reads[0].query_qualities), "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<"))
- self.assertEqual(pysam.toQualityString(self.reads[1].query_qualities), "<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<", "quality string mismatch in read 2: %s != %s" % (
- pysam.toQualityString(self.reads[1].query_qualities), "<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<"))
- self.assertEqual(pysam.toQualityString(self.reads[3].query_qualities), "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<",
- "quality string mismatch in read 3: %s != %s" % (pysam.toQualityString(self.reads[3].query_qualities), "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<"))
-
- def testARquery(self):
- self.assertEqual(self.reads[0].query_alignment_sequence, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG", "query mismatch in read 1: %s != %s" % (
- self.reads[0].query_alignment_sequence, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG"))
- self.assertEqual(self.reads[1].query_alignment_sequence, "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA", "query size mismatch in read 2: %s != %s" % (
- self.reads[1].query_alignment_sequence, "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA"))
- self.assertEqual(self.reads[3].query_alignment_sequence, "TAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTT", "query mismatch in read 4: %s != %s" % (
- self.reads[3].query_alignment_sequence, "TAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTT"))
-
- def testARqqual(self):
- self.assertEqual(pysam.toQualityString(self.reads[0].query_alignment_qualities), "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<",
- "qquality string mismatch in read 1: %s != %s" % (pysam.toQualityString(self.reads[0].query_alignment_qualities), "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<"))
- self.assertEqual(pysam.toQualityString(self.reads[1].query_alignment_qualities), "<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<", "qquality string mismatch in read 2: %s != %s" % (
- pysam.toQualityString(self.reads[1].query_alignment_qualities), "<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<"))
- self.assertEqual(pysam.toQualityString(self.reads[3].query_alignment_qualities), "<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22",
- "qquality string mismatch in read 3: %s != %s" % (pysam.toQualityString(self.reads[3].query_alignment_qualities), "<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22"))
-
- def testPresentOptionalFields(self):
- self.assertEqual(self.reads[0].opt(
- 'NM'), 1, "optional field mismatch in read 1, NM: %s != %s" % (self.reads[0].opt('NM'), 1))
- self.assertEqual(self.reads[0].opt(
- 'RG'), 'L1', "optional field mismatch in read 1, RG: %s != %s" % (self.reads[0].opt('RG'), 'L1'))
- self.assertEqual(self.reads[1].opt(
- 'RG'), 'L2', "optional field mismatch in read 2, RG: %s != %s" % (self.reads[1].opt('RG'), 'L2'))
- self.assertEqual(self.reads[1].opt(
- 'MF'), 18, "optional field mismatch in read 2, MF: %s != %s" % (self.reads[1].opt('MF'), 18))
-
- def testPairedBools(self):
- self.assertEqual(self.reads[0].is_paired, True, "is paired mismatch in read 1: %s != %s" % (
- self.reads[0].is_paired, True))
- self.assertEqual(self.reads[1].is_paired, True, "is paired mismatch in read 2: %s != %s" % (
- self.reads[1].is_paired, True))
- self.assertEqual(self.reads[0].is_proper_pair, True, "is proper pair mismatch in read 1: %s != %s" % (
- self.reads[0].is_proper_pair, True))
- self.assertEqual(self.reads[1].is_proper_pair, True, "is proper pair mismatch in read 2: %s != %s" % (
- self.reads[1].is_proper_pair, True))
-
- def testTags(self):
- self.assertEqual(self.reads[0].tags,
- [('NM', 1), ('RG', 'L1'),
- ('PG', 'P1'), ('XT', 'U')])
- self.assertEqual(self.reads[1].tags,
- [('MF', 18), ('RG', 'L2'),
- ('PG', 'P2'), ('XT', 'R')])
-
- def testAddTags(self):
- self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
- sorted([('NM', 1), ('RG', 'L1'),
- ('PG', 'P1'), ('XT', 'U')]))
-
- self.reads[0].setTag('X1', 'C')
- self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
- sorted([('X1', 'C'), ('NM', 1), ('RG', 'L1'),
- ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ]))
- self.reads[0].setTag('X2', 5)
- self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
- sorted([('X2', 5), ('X1', 'C'),
- ('NM', 1), ('RG', 'L1'),
- ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ]))
- # add with replacement
- self.reads[0].setTag('X2', 10)
- self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
- sorted([('X2', 10), ('X1', 'C'),
- ('NM', 1), ('RG', 'L1'),
- ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ]))
-
- # add without replacement
- self.reads[0].setTag('X2', 5, replace=False)
- self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
- sorted([('X2', 10), ('X1', 'C'),
- ('X2', 5),
- ('NM', 1), ('RG', 'L1'),
- ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ]))
-
- def testAddTagsType(self):
- self.reads[0].tags = None
- self.assertEqual(self.reads[0].tags, [])
-
- self.reads[0].setTag('X1', 5.0)
- self.reads[0].setTag('X2', "5.0")
- self.reads[0].setTag('X3', 5)
-
- self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
- sorted([('X1', 5.0),
- ('X2', "5.0"),
- ('X3', 5)]))
-
- # test setting float for int value
- self.reads[0].setTag('X4', 5, value_type='d')
- self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
- sorted([('X1', 5.0),
- ('X2', "5.0"),
- ('X3', 5),
- ('X4', 5.0)]))
-
- # test setting int for float value - the
- # value will be rounded.
- self.reads[0].setTag('X5', 5.2, value_type='i')
- self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
- sorted([('X1', 5.0),
- ('X2', "5.0"),
- ('X3', 5),
- ('X4', 5.0),
- ('X5', 5)]))
-
- # test setting invalid type code
- self.assertRaises(ValueError, self.reads[0].setTag, 'X6', 5.2, 'g')
-
- def testTagsUpdatingFloat(self):
- self.assertEqual(self.reads[0].tags,
- [('NM', 1), ('RG', 'L1'),
- ('PG', 'P1'), ('XT', 'U')])
- self.reads[0].tags += [('XC', 5.0)]
- self.assertEqual(self.reads[0].tags,
- [('NM', 1), ('RG', 'L1'),
- ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ('XC', 5.0)])
-
- def testOpt(self):
- self.assertEqual(self.reads[0].opt("XT"), "U")
- self.assertEqual(self.reads[1].opt("XT"), "R")
-
- def testMissingOpt(self):
- self.assertRaises(KeyError, self.reads[0].opt, "XP")
-
- def testEmptyOpt(self):
- self.assertRaises(KeyError, self.reads[2].opt, "XT")
-
- def tearDown(self):
- self.samfile.close()
-
-
-class BasicTestBAMFile(BasicTestBAMFetch):
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.AlignmentFile(
- os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"),
- "r")
- self.reads = [r for r in self.samfile]
-
-
-class BasicTestSAMFile(BasicTestBAMFetch):
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.AlignmentFile(
- os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"),
- "r")
- self.reads = [r for r in self.samfile]
-
-
-class BasicTestSAMFetch(BasicTestBAMFetch):
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.AlignmentFile(
- os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"),
- "r")
- self.reads = list(self.samfile.fetch())
-
-
-# needs to be implemented
-# class TestAlignedSegmentFromSamWithoutHeader(TestAlignedSegmentFromBam):
-#
-# def setUp(self):
-# self.samfile=pysam.AlignmentFile( "ex7.sam","r" )
-# self.reads=list(self.samfile.fetch())
-
-
-class TestIO(unittest.TestCase):
-
- '''check if reading samfile and writing a samfile are consistent.'''
-
- def checkEcho(self,
- input_filename,
- reference_filename,
- output_filename,
- input_mode, output_mode,
- use_template=True):
- '''iterate through *input_filename* writing to *output_filename* and
- comparing the output to *reference_filename*.
-
- The files are opened according to the *input_mode* and *output_mode*.
-
- If *use_template* is set, the header is copied from infile
- using the template mechanism, otherwise target names and
- lengths are passed explicitely.
-
- '''
-
- infile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, input_filename),
- input_mode)
- if use_template:
- outfile = pysam.AlignmentFile(output_filename,
- output_mode,
- template=infile)
- else:
- outfile = pysam.AlignmentFile(output_filename,
- output_mode,
- referencenames=infile.references,
- referencelengths=infile.lengths,
- add_sq_text=False)
-
- iter = infile.fetch()
-
- for x in iter:
- outfile.write(x)
- infile.close()
- outfile.close()
-
- self.assertTrue(
- checkBinaryEqual(os.path.join(DATADIR, reference_filename),
- output_filename),
- "files %s and %s are not the same" % (reference_filename,
- output_filename))
-
- def testReadWriteBam(self):
-
- input_filename = "ex1.bam"
- output_filename = "pysam_ex1.bam"
- reference_filename = "ex1.bam"
-
- self.checkEcho(input_filename, reference_filename, output_filename,
- "rb", "wb", use_template=True)
-
- # Disabled - should work, files are not binary equal, but are
- # non-binary equal:
- # diff <(samtools view pysam_ex1.bam) <(samtools view pysam_data/ex1.bam)
- # def testReadWriteBamWithTargetNames(self):
- # input_filename = "ex1.bam"
- # output_filename = "pysam_ex1.bam"
- # reference_filename = "ex1.bam"
-
- # self.checkEcho(input_filename, reference_filename, output_filename,
- # "rb", "wb", use_template=False)
-
- def testReadWriteSamWithHeader(self):
-
- input_filename = "ex2.sam"
- output_filename = "pysam_ex2.sam"
- reference_filename = "ex2.sam"
-
- self.checkEcho(input_filename,
- reference_filename,
- output_filename,
- "r", "wh")
-
- # Release 0.8.0
- # no samfiles without header
- def testReadWriteSamWithoutHeader(self):
-
- input_filename = "ex2.sam"
- output_filename = "pysam_ex2.sam"
- reference_filename = "ex1.sam"
-
- self.checkEcho(input_filename,
- reference_filename,
- output_filename,
- "r", "w")
-
- def testReadSamWithoutTargetNames(self):
- '''see issue 104.'''
- input_filename = os.path.join(DATADIR,
- "example_unmapped_reads_no_sq.sam")
-
- # raise exception in default mode
- self.assertRaises(ValueError, pysam.AlignmentFile, input_filename, "r")
-
- # raise exception if no SQ files
- self.assertRaises(ValueError, pysam.AlignmentFile,
- input_filename, "r",
- check_header=True)
-
- infile = pysam.AlignmentFile(
- input_filename,
- check_header=False,
- check_sq=False)
-
- # TODO
- # result = list(infile.fetch(until_eof=True))
- # self.assertEqual(2, len(result))
-
- def testReadBamWithoutTargetNames(self):
- '''see issue 104.'''
- input_filename = os.path.join(
- DATADIR, "example_unmapped_reads_no_sq.bam")
-
- # raise exception in default mode
- self.assertRaises(ValueError, pysam.AlignmentFile, input_filename, "r")
-
- # raise exception if no SQ files
- self.assertRaises(ValueError, pysam.AlignmentFile, input_filename, "r",
- check_header=True)
-
- infile = pysam.AlignmentFile(
- input_filename, check_header=False, check_sq=False)
- result = list(infile.fetch(until_eof=True))
-
- # TODO
- def testReadSamWithoutHeader(self):
- input_filename = os.path.join(DATADIR, "ex1.sam")
-
- # reading from a samfile without header is not
- # implemented
- self.assertRaises(ValueError,
- pysam.AlignmentFile,
- input_filename,
- "r")
-
- # TODO
- # without check_header header is no read
- # leading to segfault
- # self.assertRaises(ValueError,
- # pysam.AlignmentFile,
- # input_filename,
- # "r",
- # check_header=False)
-
- # TODO
- # def testReadUnformattedFile(self):
- # '''test reading from a file that is not bam/sam formatted'''
- # input_filename = os.path.join(DATADIR, 'Makefile')
-
- # # bam - file raise error
- # self.assertRaises(ValueError,
- # pysam.AlignmentFile,
- # input_filename,
- # "rb")
-
- # # sam - file error, but can't fetch
- # self.assertRaises(ValueError,
- # pysam.AlignmentFile,
- # input_filename,
- # "r")
-
- # self.assertRaises(ValueError,
- # pysam.AlignmentFile,
- # input_filename,
- # "r",
- # check_header=False)
-
- def testBAMWithoutAlignedSegments(self):
- '''see issue 117'''
- input_filename = os.path.join(DATADIR, "test_unaligned.bam")
- samfile = pysam.AlignmentFile(input_filename, "rb", check_sq=False)
- samfile.fetch(until_eof=True)
-
- def testBAMWithShortBAI(self):
- '''see issue 116'''
- input_filename = os.path.join(DATADIR, "example_bai.bam")
- samfile = pysam.AlignmentFile(input_filename, "rb", check_sq=False)
- samfile.fetch('chr2')
-
- def testFetchFromClosedFile(self):
-
- samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
- samfile.close()
- self.assertRaises(ValueError, samfile.fetch, 'chr1', 100, 120)
-
- def testClosedFile(self):
- '''test that access to a closed samfile raises ValueError.'''
-
- samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
- samfile.close()
- self.assertRaises(ValueError, samfile.fetch, 'chr1', 100, 120)
- self.assertRaises(ValueError, samfile.pileup, 'chr1', 100, 120)
- self.assertRaises(ValueError, samfile.getrname, 0)
- # TODO
- self.assertRaises(ValueError, samfile.tell)
- self.assertRaises(ValueError, samfile.seek, 0)
- self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "nreferences")
- self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "references")
- self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "lengths")
- self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "text")
- self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "header")
-
- # write on closed file
- self.assertEqual(0, samfile.write(None))
-
- def testAutoDetection(self):
- '''test if autodetection works.'''
-
- # TODO
- # samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"))
- # self.assertRaises(ValueError, samfile.fetch, 'chr1')
- # samfile.close()
-
- samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex3.bam"))
- samfile.fetch('chr1')
- samfile.close()
-
- # TOOD
- # def testReadingFromSamFileWithoutHeader(self):
- # '''read from samfile without header.
- # '''
- # samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex7.sam"),
- # check_header=False,
- # check_sq=False)
- # self.assertRaises(NotImplementedError, samfile.__iter__)
-
- def testReadingFromFileWithoutIndex(self):
- '''read from bam file without index.'''
-
- shutil.copyfile(os.path.join(DATADIR, "ex2.bam"), 'tmp_ex2.bam')
- samfile = pysam.AlignmentFile('tmp_ex2.bam',
- "rb")
- self.assertRaises(ValueError, samfile.fetch)
- self.assertEqual(len(list(samfile.fetch(until_eof=True))),
- 3270)
- os.unlink('tmp_ex2.bam')
-
- # def testReadingUniversalFileMode(self):
- # '''read from samfile without header.
- # '''
-
- # input_filename = "ex2.sam"
- # output_filename = "pysam_ex2.sam"
- # reference_filename = "ex1.sam"
-
- # self.checkEcho(input_filename,
- # reference_filename,
- # output_filename,
- # "rU", "w")
-
- def testHead(self):
- '''test IteratorRowHead'''
- samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
- l10 = list(samfile.head(10))
- l100 = list(samfile.head(100))
- self.assertEqual(len(l10), 10)
- self.assertEqual(len(l100), 100)
- self.assertEqual(list(map(str, l10)),
- list(map(str, l100[:10])))
-
- def testWriteUncompressedBAMFile(self):
- '''read from uncompressed BAM file, see issue #43'''
-
- input_filename = "ex2.sam"
- output_filename = "pysam_uncompressed.bam"
- reference_filename = "uncompressed.bam"
-
- self.checkEcho(input_filename,
- reference_filename,
- output_filename,
- "r", "wb0")
-
- self.checkEcho(input_filename,
- reference_filename,
- output_filename,
- "r", "wbu")
-
- def testEmptyBAM(self):
- samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "empty.bam"),
- "rb")
- self.assertEqual(samfile.mapped, 0)
- self.assertEqual(samfile.unmapped, 0)
- self.assertEqual(samfile.nocoordinate, 0)
-
-
-class TestFloatTagBug(unittest.TestCase):
-
- '''see issue 71'''
-
- def testFloatTagBug(self):
- '''a float tag before another exposed a parsing bug in bam_aux_get.
-
- Fixed in 0.1.19
- '''
- samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "tag_bug.bam"))
- read = next(samfile.fetch(until_eof=True))
- self.assertTrue(('XC', 1) in read.tags)
- self.assertEqual(read.opt('XC'), 1)
-
-
-class TestLargeFieldBug(unittest.TestCase):
-
- '''see issue 100'''
-
- def testLargeFileBug(self):
- '''when creating a read with a large entry in the tag field
- causes an error:
- NotImplementedError: tags field too large
- '''
- samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "issue100.bam"))
- read = next(samfile.fetch(until_eof=True))
- new_read = pysam.AlignedSegment()
- new_read.tags = read.tags
- self.assertEqual(new_read.tags, read.tags)
-
-
-class TestTagParsing(unittest.TestCase):
-
- '''tests checking the accuracy of tag setting and retrieval.'''
-
- def makeRead(self):
- a = pysam.AlignedSegment()
- a.query_name = "read_12345"
- a.reference_id = 0
- a.query_sequence = "ACGT" * 3
- a.flag = 0
- a.reference_id = 0
- a.reference_start = 1
- a.mapping_quality = 20
- a.cigartuples = ((0, 10), (2, 1), (0, 25))
- a.next_reference_id = 0
- a.next_reference_start = 200
- a.template_length = 0
- a.query_qualities = pysam.fromQualityString("1234") * 3
- # todo: create tags
- return a
-
- def testNegativeIntegers(self):
- x = -2
- aligned_read = self.makeRead()
- aligned_read.tags = [("XD", int(x))]
- self.assertEqual(aligned_read.opt('XD'), x)
- # print (aligned_read.tags)
-
- def testNegativeIntegers2(self):
- x = -2
- r = self.makeRead()
- r.tags = [("XD", int(x))]
- outfile = pysam.AlignmentFile(
- "test.bam",
- "wb",
- referencenames=("chr1",),
- referencelengths = (1000,))
- outfile.write(r)
- outfile.close()
-
- def testCigarString(self):
- r = self.makeRead()
- self.assertEqual(r.cigarstring, "10M1D25M")
- r.cigarstring = "20M10D20M"
- self.assertEqual(r.cigartuples, [(0, 20), (2, 10), (0, 20)])
- # unsetting cigar string
- r.cigarstring = None
- self.assertEqual(r.cigarstring, None)
-
- def testCigar(self):
- r = self.makeRead()
- self.assertEqual(r.cigartuples, [(0, 10), (2, 1), (0, 25)])
- # unsetting cigar string
- r.cigartuples = None
- self.assertEqual(r.cigartuples, None)
-
- def testLongTags(self):
- '''see issue 115'''
-
- r = self.makeRead()
- rg = 'HS2000-899_199.L3'
- tags = [('XC', 85), ('XT', 'M'), ('NM', 5),
- ('SM', 29), ('AM', 29), ('XM', 1),
- ('XO', 1), ('XG', 4), ('MD', '37^ACCC29T18'),
- ('XA', '5,+11707,36M1I48M,2;21,-48119779,46M1I38M,2;hs37d5,-10060835,40M1D45M,3;5,+11508,36M1I48M,3;hs37d5,+6743812,36M1I48M,3;19,-59118894,46M1I38M,3;4,-191044002,6M1I78M,3;')]
-
- r.tags = tags
- r.tags += [("RG", rg)] * 100
- tags += [("RG", rg)] * 100
-
- self.assertEqual(tags, r.tags)
-
- def testArrayTags(self):
-
- r = self.makeRead()
-
- def c(r, l):
- r.tags = [('ZM', l)]
- self.assertEqual(r.opt("ZM"), list(l))
-
- # signed integers
- c(r, (-1, 1))
- c(r, (-1, 100))
- c(r, (-1, 200))
- c(r, (-1, 1000))
- c(r, (-1, 30000))
- c(r, (-1, 50000))
- c(r, (1, -1))
- c(r, (1, -100))
- c(r, (1, -200))
- c(r, (1, -1000))
- c(r, (1, -30000))
- c(r, (1, -50000))
-
- # unsigned integers
- c(r, (1, 100))
- c(r, (1, 1000))
- c(r, (1, 10000))
- c(r, (1, 100000))
-
- # floats
- c(r, (1.0, 100.0))
-
-
-class TestClipping(unittest.TestCase):
-
- def testClipping(self):
-
- self.samfile = pysam.AlignmentFile(
- os.path.join(DATADIR, "softclip.bam"),
- "rb")
-
- for read in self.samfile:
-
- if read.query_name == "r001":
- self.assertEqual(read.query_sequence, 'AAAAGATAAGGATA')
- self.assertEqual(read.query_alignment_sequence, 'AGATAAGGATA')
- self.assertEqual(pysam.toQualityString(read.query_qualities),
- None)
- self.assertEqual(
- pysam.toQualityString(read.query_alignment_qualities),
- None)
-
- elif read.query_name == "r002":
-
- self.assertEqual(read.query_sequence, 'GCCTAAGCTAA')
- self.assertEqual(read.query_alignment_sequence, 'AGCTAA')
- self.assertEqual(
- pysam.toQualityString(read.query_qualities),
- '01234567890')
- self.assertEqual(
- pysam.toQualityString(read.query_alignment_qualities),
- '567890')
-
- elif read.query_name == "r003":
-
- self.assertEqual(read.query_sequence, 'GCCTAAGCTAA')
- self.assertEqual(read.query_alignment_sequence, 'GCCTAA')
- self.assertEqual(
- pysam.toQualityString(read.query_qualities),
- '01234567890')
- self.assertEqual(
- pysam.toQualityString(read.query_alignment_qualities),
- '012345')
-
- elif read.query_name == "r004":
-
- self.assertEqual(read.query_sequence, 'TAGGC')
- self.assertEqual(read.query_alignment_sequence, 'TAGGC')
- self.assertEqual(
- pysam.toQualityString(read.query_qualities),
- '01234')
- self.assertEqual(
- pysam.toQualityString(read.query_alignment_qualities),
- '01234')
-
-
-class TestIteratorRow(unittest.TestCase):
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
-
- def checkRange(self, rnge):
- '''compare results from iterator with those from samtools.'''
- ps = list(self.samfile.fetch(region=rnge))
- sa = list(pysam.view(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- rnge,
- raw=True))
- self.assertEqual(len(ps), len(
- sa), "unequal number of results for range %s: %i != %i" % (rnge, len(ps), len(sa)))
- # check if the same reads are returned and in the same order
- for line, (a, b) in enumerate(list(zip(ps, sa))):
- d = b.split("\t")
- self.assertEqual(
- a.query_name, d[0], "line %i: read id mismatch: %s != %s" % (line, a.reference_id, d[0]))
- self.assertEqual(a.reference_start, int(d[3]) - 1, "line %i: read position mismatch: %s != %s, \n%s\n%s\n" %
- (line, a.reference_start, int(d[3]) - 1,
- str(a), str(d)))
- qual = d[10]
- self.assertEqual(pysam.toQualityString(a.query_qualities), qual, "line %i: quality mismatch: %s != %s, \n%s\n%s\n" %
- (line, pysam.toQualityString(a.query_qualities), qual,
- str(a), str(d)))
-
- def testIteratePerContig(self):
- '''check random access per contig'''
- for contig in self.samfile.references:
- self.checkRange(contig)
-
- def testIterateRanges(self):
- '''check random access per range'''
- for contig, length in zip(self.samfile.references,
- self.samfile.lengths):
- for start in range(1, length, 90):
- # this includes empty ranges
- self.checkRange("%s:%i-%i" % (contig, start, start + 90))
-
- def tearDown(self):
- self.samfile.close()
-
-
-class TestIteratorRowAll(unittest.TestCase):
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
-
- def testIterate(self):
- '''compare results from iterator with those from samtools.'''
- ps = list(self.samfile.fetch())
- sa = list(pysam.view(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- raw=True))
- self.assertEqual(
- len(ps), len(sa), "unequal number of results: %i != %i" % (len(ps), len(sa)))
- # check if the same reads are returned
- for line, pair in enumerate(list(zip(ps, sa))):
- data = pair[1].split("\t")
- self.assertEqual(pair[0].query_name, data[
- 0], "read id mismatch in line %i: %s != %s" % (line, pair[0].reference_id, data[0]))
-
- def tearDown(self):
- self.samfile.close()
-
-
-class TestIteratorColumn(unittest.TestCase):
-
- '''test iterator column against contents of ex4.bam.'''
-
- # note that samfile contains 1-based coordinates
- # 1D means deletion with respect to reference sequence
- #
- mCoverages = {'chr1': [0] * 20 + [1] * 36 + [0] * (100 - 20 - 35),
- 'chr2': [0] * 20 + [1] * 35 + [0] * (100 - 20 - 35),
- }
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex4.bam"),
- "rb")
-
- def checkRange(self, contig, start=None, end=None, truncate=False):
- '''compare results from iterator with those from samtools.'''
- # check if the same reads are returned and in the same order
- for column in self.samfile.pileup(
- contig, start, end, truncate=truncate):
- if truncate:
- self.assertGreaterEqual(column.reference_pos, start)
- self.assertLess(column.reference_pos, end)
- thiscov = len(column.pileups)
- refcov = self.mCoverages[
- self.samfile.getrname(column.reference_id)][column.reference_pos]
- self.assertEqual(thiscov, refcov, "wrong coverage at pos %s:%i %i should be %i" % (
- self.samfile.getrname(column.reference_id), column.reference_pos, thiscov, refcov))
-
- def testIterateAll(self):
- '''check random access per contig'''
- self.checkRange(None)
-
- def testIteratePerContig(self):
- '''check random access per contig'''
- for contig in self.samfile.references:
- self.checkRange(contig)
-
- def testIterateRanges(self):
- '''check random access per range'''
- for contig, length in zip(
- self.samfile.references, self.samfile.lengths):
- for start in range(1, length, 90):
- # this includes empty ranges
- self.checkRange(contig, start, start + 90)
-
- def testInverse(self):
- '''test the inverse, is point-wise pileup accurate.'''
- for contig, refseq in list(self.mCoverages.items()):
- refcolumns = sum(refseq)
- for pos, refcov in enumerate(refseq):
- columns = list(self.samfile.pileup(contig, pos, pos + 1))
- if refcov == 0:
- # if no read, no coverage
- self.assertEqual(
- len(columns),
- refcov,
- "wrong number of pileup columns returned for position %s:%i, %i should be %i" % (
- contig, pos,
- len(columns), refcov))
- elif refcov == 1:
- # one read, all columns of the read are returned
- self.assertEqual(
- len(columns),
- refcolumns,
- "pileup incomplete at position %i: got %i, expected %i " %
- (pos, len(columns), refcolumns))
-
- def testIterateTruncate(self):
- '''check random access per range'''
- for contig, length in zip(self.samfile.references, self.samfile.lengths):
- for start in range(1, length, 90):
- # this includes empty ranges
- self.checkRange(contig, start, start + 90, truncate=True)
-
- def tearDown(self):
- self.samfile.close()
-
-
-class TestIteratorColumn2(unittest.TestCase):
-
- '''test iterator column against contents of ex1.bam.'''
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
-
- def testStart(self):
- # print self.samfile.fetch().next().reference_start
- # print self.samfile.pileup().next().reference_start
- pass
-
- def testTruncate(self):
- '''see issue 107.'''
- # note that ranges in regions start from 1
- p = self.samfile.pileup(region='chr1:170:172', truncate=True)
- columns = [x.reference_pos for x in p]
- self.assertEqual(len(columns), 3)
- self.assertEqual(columns, [169, 170, 171])
-
- p = self.samfile.pileup('chr1', 169, 172, truncate=True)
- columns = [x.reference_pos for x in p]
-
- self.assertEqual(len(columns), 3)
- self.assertEqual(columns, [169, 170, 171])
-
- def testAccessOnClosedIterator(self):
- '''see issue 131
-
- Accessing pileup data after iterator has closed.
- '''
- pcolumn = self.samfile.pileup('chr1', 170, 180).__next__()
- self.assertRaises(ValueError, getattr, pcolumn, "pileups")
-
-
-class TestHeaderSam(unittest.TestCase):
-
- header = {'SQ': [{'LN': 1575, 'SN': 'chr1'},
- {'LN': 1584, 'SN': 'chr2'}],
- 'RG': [{'LB': 'SC_1', 'ID': 'L1', 'SM': 'NA12891',
- 'PU': 'SC_1_10', "CN": "name:with:colon"},
- {'LB': 'SC_2', 'ID': 'L2', 'SM': 'NA12891',
- 'PU': 'SC_2_12', "CN": "name:with:colon"}],
- 'PG': [{'ID': 'P1', 'VN': '1.0'}, {'ID': 'P2', 'VN': '1.1'}],
- 'HD': {'VN': '1.0'},
- 'CO': ['this is a comment', 'this is another comment'],
- }
-
- def compareHeaders(self, a, b):
- '''compare two headers a and b.'''
- for ak, av in a.items():
- self.assertTrue(ak in b, "key '%s' not in '%s' " % (ak, b))
- self.assertEqual(av, b[ak])
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"),
- "r")
-
- def testHeaders(self):
- self.compareHeaders(self.header, self.samfile.header)
- self.compareHeaders(self.samfile.header, self.header)
-
- def testNameMapping(self):
- for x, y in enumerate(("chr1", "chr2")):
- tid = self.samfile.gettid(y)
- ref = self.samfile.getrname(x)
- self.assertEqual(tid, x)
- self.assertEqual(ref, y)
-
- self.assertEqual(self.samfile.gettid("chr?"), -1)
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.getrname, 2)
-
- def tearDown(self):
- self.samfile.close()
-
-
-class TestHeaderBam(TestHeaderSam):
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex3.bam"),
- "rb")
-
-
-class TestHeaderFromRefs(unittest.TestCase):
-
- '''see issue 144
-
- reference names need to be converted to string for python 3
- '''
-
- # def testHeader( self ):
- # refs = ['chr1', 'chr2']
- # tmpfile = "tmp_%i" % id(self)
- # s = pysam.AlignmentFile(tmpfile, 'wb',
- # referencenames=refs,
- # referencelengths=[100]*len(refs))
- # s.close()
-
- # self.assertTrue( checkBinaryEqual( 'issue144.bam', tmpfile ),
- # 'bam files differ')
- # os.unlink( tmpfile )
-
-
-class TestHeader1000Genomes(unittest.TestCase):
- '''see issue 110'''
- # bamfile = "http://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/phase2b_alignment/data/NA07048/exome_alignment/NA07048.unmapped.ILLUMINA.bwa.CEU.exome.20120522_p2b.bam"
- bamfile = "http://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/phase3_EX_or_LC_only_alignment/data/HG00104/alignment/HG00104.chrom11.ILLUMINA.bwa.GBR.low_coverage.20130415.bam"
-
- def testRead(self):
-
- if not checkURL(self.bamfile):
- return
-
- f = pysam.AlignmentFile(self.bamfile, "rb")
- data = f.header.copy()
- self.assertTrue(data)
-
-
-class TestUnmappedReads(unittest.TestCase):
-
- # TODO
- # def testSAM(self):
- # samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex5.sam"),
- # "r")
- # self.assertEqual(len(list(samfile.fetch(until_eof=True))), 2)
- # samfile.close()
-
- def testBAM(self):
- samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex5.bam"),
- "rb")
- self.assertEqual(len(list(samfile.fetch(until_eof=True))), 2)
- samfile.close()
-
-
-class TestPileupObjects(unittest.TestCase):
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
-
- def testPileupColumn(self):
- for pcolumn1 in self.samfile.pileup(region="chr1:105"):
- if pcolumn1.reference_pos == 104:
- self.assertEqual(
- pcolumn1.reference_id, 0,
- "chromosome/target id mismatch in position 1: %s != %s" %
- (pcolumn1.reference_id, 0))
- self.assertEqual(
- pcolumn1.reference_pos, 105 - 1,
- "position mismatch in position 1: %s != %s" %
- (pcolumn1.reference_pos, 105 - 1))
- self.assertEqual(
- pcolumn1.nsegments, 2,
- "# reads mismatch in position 1: %s != %s" %
- (pcolumn1.nsegments, 2))
- for pcolumn2 in self.samfile.pileup(region="chr2:1480"):
- if pcolumn2.reference_pos == 1479:
- self.assertEqual(
- pcolumn2.reference_id, 1,
- "chromosome/target id mismatch in position 1: %s != %s" %
- (pcolumn2.reference_id, 1))
- self.assertEqual(
- pcolumn2.reference_pos, 1480 - 1,
- "position mismatch in position 1: %s != %s" %
- (pcolumn2.reference_pos, 1480 - 1))
- self.assertEqual(
- pcolumn2.nsegments, 12,
- "# reads mismatch in position 1: %s != %s" %
- (pcolumn2.nsegments, 12))
-
- def testPileupRead(self):
- for pcolumn1 in self.samfile.pileup(region="chr1:105"):
- if pcolumn1.reference_pos == 104:
- self.assertEqual(
- len(pcolumn1.pileups), 2,
- "# reads aligned to column mismatch in position 1"
- ": %s != %s" %
- (len(pcolumn1.pileups), 2))
-
-
-# self.assertEqual( pcolumn1.pileups[0] # need to test additional
-# properties here
-
- def tearDown(self):
- self.samfile.close()
-
- def testIteratorOutOfScope(self):
- '''test if exception is raised if pileup col is accessed after
- iterator is exhausted.'''
-
- for pileupcol in self.samfile.pileup():
- pass
-
- self.assertRaises(ValueError, getattr, pileupcol, "pileups")
-
-
-class TestContextManager(unittest.TestCase):
-
- def testManager(self):
- with pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, 'ex1.bam'),
- 'rb') as samfile:
- samfile.fetch()
- self.assertEqual(samfile._isOpen(), False)
-
-
-class TestExceptions(unittest.TestCase):
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
-
- def testMissingFile(self):
-
- self.assertRaises(IOError, pysam.AlignmentFile, "exdoesntexist.bam", "rb")
- self.assertRaises(IOError, pysam.AlignmentFile, "exdoesntexist.sam", "r")
- self.assertRaises(IOError, pysam.AlignmentFile, "exdoesntexist.bam", "r")
- self.assertRaises(IOError, pysam.AlignmentFile, "exdoesntexist.sam", "rb")
-
- def testBadContig(self):
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr88")
-
- def testMeaninglessCrap(self):
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "skljf")
-
- def testBackwardsOrderNewFormat(self):
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, 'chr1', 100, 10)
-
- def testBackwardsOrderOldFormat(self):
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, region="chr1:100-10")
-
- def testOutOfRangeNegativeNewFormat(self):
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr1", 5, -10)
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr1", 5, 0)
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr1", -5, -10)
-
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, "chr1", 5, -10)
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, "chr1", 5, 0)
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, "chr1", -5, -10)
-
- def testOutOfRangeNegativeOldFormat(self):
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, region="chr1:-5-10")
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, region="chr1:-5-0")
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, region="chr1:-5--10")
-
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, region="chr1:-5-10")
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, region="chr1:-5-0")
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, region="chr1:-5--10")
-
- def testOutOfRangNewFormat(self):
- self.assertRaises(
- ValueError, self.samfile.fetch, "chr1", 9999999999, 99999999999)
- self.assertRaises(
- ValueError, self.samfile.count, "chr1", 9999999999, 99999999999)
-
- def testOutOfRangeLargeNewFormat(self):
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr1",
- 9999999999999999999999999999999, 9999999999999999999999999999999999999999)
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, "chr1",
- 9999999999999999999999999999999, 9999999999999999999999999999999999999999)
-
- def testOutOfRangeLargeOldFormat(self):
- self.assertRaises(
- ValueError, self.samfile.fetch, "chr1:99999999999999999-999999999999999999")
- self.assertRaises(
- ValueError, self.samfile.count, "chr1:99999999999999999-999999999999999999")
-
- def testZeroToZero(self):
- '''see issue 44'''
- self.assertEqual(len(list(self.samfile.fetch('chr1', 0, 0))), 0)
-
- def tearDown(self):
- self.samfile.close()
-
-
-class TestWrongFormat(unittest.TestCase):
-
- '''test cases for opening files not in bam/sam format.'''
-
- def testOpenSamAsBam(self):
- self.assertRaises(ValueError,
- pysam.AlignmentFile,
- os.path.join(DATADIR, 'ex1.sam'),
- 'rb')
-
- def testOpenBamAsSam(self):
- # test fails, needs to be implemented.
- # sam.fetch() fails on reading, not on opening
- # self.assertRaises( ValueError, pysam.AlignmentFile, 'ex1.bam', 'r' )
- pass
-
- def testOpenFastaAsSam(self):
- # test fails, needs to be implemented.
- # sam.fetch() fails on reading, not on opening
- # self.assertRaises( ValueError, pysam.AlignmentFile, 'ex1.fa', 'r' )
- pass
-
- def testOpenFastaAsBam(self):
- self.assertRaises(ValueError,
- pysam.AlignmentFile,
- os.path.join(DATADIR, 'ex1.fa'),
- 'rb')
-
-
-class ReadTest(unittest.TestCase):
-
- def checkFieldEqual(self, read1, read2, exclude=[]):
- '''check if two reads are equal by comparing each field.'''
-
- # add the . for refactoring purposes.
- for x in (".query_name",
- ".query_sequence",
- ".flag",
- ".reference_id",
- ".reference_start",
- ".mapping_quality",
- ".cigartuples",
- ".next_reference_id",
- ".next_reference_start",
- ".template_length",
- ".query_length",
- ".query_qualities",
- ".bin",
- ".is_paired", ".is_proper_pair",
- ".is_unmapped", ".mate_is_unmapped",
- ".is_reverse", ".mate_is_reverse",
- ".is_read1", ".is_read2",
- ".is_secondary", ".is_qcfail",
- ".is_duplicate"):
- n = x[1:]
- if n in exclude:
- continue
- self.assertEqual(getattr(read1, n), getattr(read2, n),
- "attribute mismatch for %s: %s != %s" %
- (n, getattr(read1, n), getattr(read2, n)))
-
-
-class TestAlignedSegment(ReadTest):
-
- '''tests to check if aligned read can be constructed
- and manipulated.
- '''
-
- def testEmpty(self):
- a = pysam.AlignedSegment()
- self.assertEqual(a.query_name, None)
- self.assertEqual(a.query_sequence, None)
- self.assertEqual(pysam.toQualityString(a.query_qualities), None)
- self.assertEqual(a.flag, 0)
- self.assertEqual(a.reference_id, 0)
- self.assertEqual(a.mapping_quality, 0)
- self.assertEqual(a.cigartuples, None)
- self.assertEqual(a.tags, [])
- self.assertEqual(a.next_reference_id, 0)
- self.assertEqual(a.next_reference_start, 0)
- self.assertEqual(a.template_length, 0)
-
- def testStrOfEmptyRead(self):
- a = pysam.AlignedSegment()
- s = str(a)
- self.assertEqual(
- "None\t0\t0\t0\t0\tNone\t0\t0\t0\tNone\tNone\t[]",
- s)
-
- def buildRead(self):
- '''build an example read.'''
-
- a = pysam.AlignedSegment()
- a.query_name = "read_12345"
- a.query_sequence = "ACGT" * 10
- a.flag = 0
- a.reference_id = 0
- a.reference_start = 20
- a.mapping_quality = 20
- a.cigartuples = ((0, 10), (2, 1), (0, 9), (1, 1), (0, 20))
- a.next_reference_id = 0
- a.next_reference_start = 200
- a.template_length = 167
- a.query_qualities = pysam.fromQualityString("1234") * 10
- # todo: create tags
- return a
-
- def testUpdate(self):
- '''check if updating fields affects other variable length data
- '''
- a = self.buildRead()
- b = self.buildRead()
-
- # check qname
- b.query_name = "read_123"
- self.checkFieldEqual(a, b, "query_name")
- b.query_name = "read_12345678"
- self.checkFieldEqual(a, b, "query_name")
- b.query_name = "read_12345"
- self.checkFieldEqual(a, b)
-
- # check cigar
- b.cigartuples = ((0, 10), )
- self.checkFieldEqual(a, b, "cigartuples")
- b.cigartuples = ((0, 10), (2, 1), (0, 10))
- self.checkFieldEqual(a, b, "cigartuples")
- b.cigartuples = ((0, 10), (2, 1), (0, 9), (1, 1), (0, 20))
- self.checkFieldEqual(a, b)
-
- # check seq
- b.query_sequence = "ACGT"
- self.checkFieldEqual(
- a, b,
- ("query_sequence", "query_qualities", "query_length"))
- b.query_sequence = "ACGT" * 3
- self.checkFieldEqual(
- a, b,
- ("query_sequence", "query_qualities", "query_length"))
- b.query_sequence = "ACGT" * 10
- self.checkFieldEqual(a, b, ("query_qualities",))
-
- # reset qual
- b = self.buildRead()
-
- # check flags:
- for x in (
- "is_paired", "is_proper_pair",
- "is_unmapped", "mate_is_unmapped",
- "is_reverse", "mate_is_reverse",
- "is_read1", "is_read2",
- "is_secondary", "is_qcfail",
- "is_duplicate"):
- setattr(b, x, True)
- self.assertEqual(getattr(b, x), True)
- self.checkFieldEqual(a, b, ("flag", x,))
- setattr(b, x, False)
- self.assertEqual(getattr(b, x), False)
- self.checkFieldEqual(a, b)
-
- def testUpdate2(self):
- '''issue 135: inplace update of sequence and quality score.
-
- This does not work as setting the sequence will erase
- the quality scores.
- '''
- a = self.buildRead()
- a.query_sequence = a.query_sequence[5:10]
- self.assertEqual(pysam.toQualityString(a.query_qualities), None)
-
- a = self.buildRead()
- s = pysam.toQualityString(a.query_qualities)
- a.query_sequence = a.query_sequence[5:10]
- a.query_qualities = pysam.fromQualityString(s[5:10])
-
- self.assertEqual(pysam.toQualityString(a.query_qualities), s[5:10])
-
- def testLargeRead(self):
- '''build an example read.'''
-
- a = pysam.AlignedSegment()
- a.query_name = "read_12345"
- a.query_sequence = "ACGT" * 200
- a.flag = 0
- a.reference_id = 0
- a.reference_start = 20
- a.mapping_quality = 20
- a.cigartuples = ((0, 4 * 200), )
- a.next_reference_id = 0
- a.next_reference_start = 200
- a.template_length = 167
- a.query_qualities = pysam.fromQualityString("1234") * 200
-
- return a
-
- def testTagParsing(self):
- '''test for tag parsing
-
- see http://groups.google.com/group/pysam-user-group/browse_thread/thread/67ca204059ea465a
- '''
- samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex8.bam"),
- "rb")
-
- for entry in samfile:
- before = entry.tags
- entry.tags = entry.tags
- after = entry.tags
- self.assertEqual(after, before)
-
- def testUpdateTlen(self):
- '''check if updating tlen works'''
- a = self.buildRead()
- oldlen = a.template_length
- oldlen *= 2
- a.template_length = oldlen
- self.assertEqual(a.template_length, oldlen)
-
- def testPositions(self):
- a = self.buildRead()
- self.assertEqual(a.get_reference_positions(),
- [20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29,
- 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39,
- 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49,
- 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59])
-
- self.assertEqual(a.get_aligned_pairs(),
- [(0, 20), (1, 21), (2, 22), (3, 23), (4, 24),
- (5, 25), (6, 26), (7, 27), (8, 28), (9, 29),
- (None, 30),
- (10, 31), (11, 32), (12, 33), (13, 34), (14, 35),
- (15, 36), (16, 37), (17, 38), (18, 39), (19, None),
- (20, 40), (21, 41), (22, 42), (23, 43), (24, 44),
- (25, 45), (26, 46), (27, 47), (28, 48), (29, 49),
- (30, 50), (31, 51), (32, 52), (33, 53), (34, 54),
- (35, 55), (36, 56), (37, 57), (38, 58), (39, 59)])
-
- self.assertEqual(
- a.get_reference_positions(),
- [x[1] for x in a.get_aligned_pairs()
- if x[0] is not None and x[1] is not None])
- # alen is the length of the aligned read in genome
- self.assertEqual(a.reference_length,
- a.get_aligned_pairs()[-1][0] + 1)
- # aend points to one beyond last aligned base in ref
- self.assertEqual(a.get_reference_positions()[-1],
- a.reference_end - 1)
-
- def testFullReferencePositions(self):
- '''see issue 26'''
- a = self.buildRead()
- a.cigar = [(4, 30), (0, 20), (1, 3), (0, 47)]
-
- self.assertEqual(100,
- len(a.get_reference_positions(full_length=True)))
-
- def testBlocks(self):
- a = self.buildRead()
- self.assertEqual(a.get_blocks(),
- [(20, 30), (31, 40), (40, 60)])
-
- # Disabled as not backwards compatible
- # def testFancyStr(self):
- # a = self.buildRead()
- # output = a.fancy_str()
- # self.assertEqual(len(output), 9)
-
-
-class TestDeNovoConstruction(ReadTest):
-
- '''check BAM/SAM file construction using ex6.sam
-
- (note these are +1 coordinates):
-
- read_28833_29006_6945 99 chr1 33 20 10M1D25M = 200 167 AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<< NM:i:1 RG:Z:L1
- read_28701_28881_323b 147 chr2 88 30 35M = 500 412 ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<< MF:i:18 RG:Z:L2
- '''
-
- header = {'HD': {'VN': '1.0'},
- 'SQ': [{'LN': 1575, 'SN': 'chr1'},
- {'LN': 1584, 'SN': 'chr2'}], }
-
- bamfile = os.path.join(DATADIR, "ex6.bam")
- samfile = os.path.join(DATADIR, "ex6.sam")
-
- def setUp(self):
-
- a = pysam.AlignedSegment()
- a.query_name = "read_28833_29006_6945"
- a.query_sequence = "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG"
- a.flag = 99
- a.reference_id = 0
- a.reference_start = 32
- a.mapping_quality = 20
- a.cigartuples = ((0, 10), (2, 1), (0, 25))
- a.next_reference_id = 0
- a.next_reference_start = 199
- a.template_length = 167
- a.query_qualities = pysam.fromQualityString("<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<")
- a.tags = (("NM", 1),
- ("RG", "L1"))
-
- b = pysam.AlignedSegment()
- b.query_name = "read_28701_28881_323b"
- b.query_sequence = "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA"
- b.flag = 147
- b.reference_id = 1
- b.reference_start = 87
- b.mapping_quality = 30
- b.cigartuples = ((0, 35), )
- b.next_reference_id = 1
- b.next_reference_start = 499
- b.template_length = 412
- b.query_qualities = pysam.fromQualityString("<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<")
- b.tags = (("MF", 18),
- ("RG", "L2"))
-
- self.reads = (a, b)
-
- # TODO
- # def testSAMWholeFile(self):
-
- # tmpfilename = "tmp_%i.sam" % id(self)
-
- # outfile = pysam.AlignmentFile(tmpfilename,
- # "wh",
- # header=self.header)
-
- # for x in self.reads:
- # outfile.write(x)
- # outfile.close()
- # self.assertTrue(checkBinaryEqual(tmpfilename, self.samfile),
- # "mismatch when construction SAM file, see %s %s" % (tmpfilename, self.samfile))
-
- # os.unlink(tmpfilename)
-
- def testBAMPerRead(self):
- '''check if individual reads are binary equal.'''
- infile = pysam.AlignmentFile(self.bamfile, "rb")
-
- others = list(infile)
- for denovo, other in zip(others, self.reads):
- self.checkFieldEqual(other, denovo)
- self.assertEqual(other.compare(denovo), 0)
-
- # TODO
- # def testSAMPerRead(self):
- # '''check if individual reads are binary equal.'''
- # infile = pysam.AlignmentFile(self.samfile, "r")
-
- # others = list(infile)
- # for denovo, other in zip(others, self.reads):
- # self.checkFieldEqual(other, denovo)
- # self.assertEqual(other.compare(denovo), 0)
-
- def testBAMWholeFile(self):
-
- tmpfilename = "tmp_%i.bam" % id(self)
-
- outfile = pysam.AlignmentFile(tmpfilename, "wb", header=self.header)
-
- for x in self.reads:
- outfile.write(x)
- outfile.close()
-
- self.assertTrue(checkBinaryEqual(tmpfilename, self.bamfile),
- "mismatch when construction BAM file, see %s %s" % (tmpfilename, self.bamfile))
-
- os.unlink(tmpfilename)
-
-
-class TestDeNovoConstructionUserTags(TestDeNovoConstruction):
-
- '''test de novo construction with a header that contains lower-case tags.'''
-
- header = {'HD': {'VN': '1.0'},
- 'SQ': [{'LN': 1575, 'SN': 'chr1'},
- {'LN': 1584, 'SN': 'chr2'}],
- 'x1': {'A': 2, 'B': 5},
- 'x3': {'A': 6, 'B': 5},
- 'x2': {'A': 4, 'B': 5}}
-
- bamfile = os.path.join(DATADIR, "example_user_header.bam")
- samfile = os.path.join(DATADIR, "example_user_header.sam")
-
-
-class TestEmptyHeader(unittest.TestCase):
-
- '''see issue 84.'''
-
- def testEmptyHeader(self):
- s = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR,
- 'example_empty_header.bam'))
- self.assertEqual(s.header, {'SQ': [{'LN': 1000, 'SN': 'chr1'}]})
-
-
-class TestHeaderWithProgramOptions(unittest.TestCase):
- '''see issue 39.'''
-
- def testHeader(self):
- s = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR,
- 'rg_with_tab.bam'))
- self.assertEqual(
- s.header,
- {'SQ': [{'LN': 1575, 'SN': 'chr1'},
- {'LN': 1584, 'SN': 'chr2'}],
- 'PG': [{'PN': 'bwa',
- 'ID': 'bwa',
- 'VN': '0.7.9a-r786',
- 'CL': 'bwa mem -p -t 8 -M -R '
- '@RG\tID:None\tSM:None\t/mnt/data/hg19.fa\t'
- '/mnt/analysis/default-0.fastq'}]})
-
-
-class TestTruncatedBAM(unittest.TestCase):
-
- '''see pull request 50.'''
-
- def testTruncatedBam(self):
-
- s = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, 'ex2_truncated.bam'))
- iterall = lambda x: len([a for a in x])
- self.assertRaises(IOError, iterall, s)
-
-
-class TestBTagSam(unittest.TestCase):
-
- '''see issue 81.'''
-
- compare = [[100, 1, 91, 0, 7, 101, 0, 201, 96, 204, 0, 0, 87, 109, 0, 7, 97, 112, 1, 12, 78, 197, 0, 7, 100, 95, 101, 202, 0, 6, 0, 1, 186, 0, 84, 0, 244, 0, 0, 324, 0, 107, 195, 101, 113, 0, 102, 0, 104, 3, 0, 101, 1, 0, 212, 6, 0, 0, 1, 0, 74, 1, 11, 0, 196, 2, 197, 103, 0, 108, 98, 2, 7, 0, 1, 2, 194, 0, 180, 0, 108, 0, 203, 104, 16, 5, 205, 0, 0, 0, 1, 1, 100, 98, 0, 0, 204, 6, 0, 79, 0, 0, 101, 7, 109, 90, 265, 1, 27, 10, 109, 102, 9, 0, 292, 0, 110, 0, 0, 102, 112, 0, 0, 84, 100, 103, 2, 81, 126, 0, 2, 90, 0, 15, 96, 15, 1, 0, 2, 0, 107, 92, 0, 0, 101, 3, 98, 15, 102, 13, 116, 116, 90, 93, 198, 0, 0, 0, 199, 92, 26, 495, 100, 5, 0, 100, 5, 209, 0, 92, 107, 90, 0, 0, 0, 0, 109, 194, 7, 94, 200, 0, 40, 197, 0, 11, 0, 0, 112, 110, 6, 4, 200, 28, 0, 196, 0, 203, 1, 129, 0, 0, 1, 0, 94, 0, 1, 0, 107, 5, 201, 3, 3, 100, 0, 121, 0, 7, 0, 1, 105, 306, 3, 86, 8, 183, 0, 12, 163, 17, 83, 22, 0, 0, 1, 8, 109, 103, 0, 0, 295, 0, 200, 16, 172, 3, 16, 182, 3, 11, 0, 0, 223, 111, 103, 0, 5, 225, 0, 95],
- [-100, 200, -300, -400],
- [-100, 12],
- [12, 15],
- [-1.0, 5.0, 2.5]]
-
- filename = os.path.join(DATADIR, 'example_btag.sam')
-
- def testRead(self):
-
- s = pysam.AlignmentFile(self.filename)
- for x, read in enumerate(s):
- if x == 0:
- self.assertEqual(read.tags, [('RG', 'QW85I'), ('PG', 'tmap'), ('MD', '140'), ('NM', 0), ('AS', 140), ('FZ', [100, 1, 91, 0, 7, 101, 0, 201, 96, 204, 0, 0, 87, 109, 0, 7, 97, 112, 1, 12, 78, 197, 0, 7, 100, 95, 101, 202, 0, 6, 0, 1, 186, 0, 84, 0, 244, 0, 0, 324, 0, 107, 195, 101, 113, 0, 102, 0, 104, 3, 0, 101, 1, 0, 212, 6, 0, 0, 1, 0, 74, 1, 11, 0, 196, 2, 197, 103, 0, 108, 98, 2, 7, 0, 1, 2, 194, 0, 180, 0, 108, 0, 203, 104, 16, 5, 205, 0, 0, 0, 1, 1, 100, 98, 0, 0, 204, 6, 0, 79, 0, 0, 101, 7, 109, 90, 265, 1, 27, 10, 109, 102, 9, 0, 292, 0, 110, 0, 0, 102, 112, 0, 0, 84, 100, 103, 2, 81, 126, 0, 2, 90, 0, 15, 96, 15, 1, 0, 2, 0, 107, 92, 0, 0, 101, 3, 98, 15, 102, 13, 116, 116, 90, 93, 198, 0, 0, 0, 199, 92, 26, 495, 100, 5, 0, 100, 5, 209, 0, 92, 107, 90, 0, 0, 0, 0, 109, 194, 7, 94, 200, 0, 40, 197, 0, 11, 0, 0, 112, 110, 6, 4, 200, 28, 0, 196, 0, 203, 1, 129, 0, 0, 1, 0, 94, 0, 1, 0, 107, 5, 201, 3, 3, 100, 0, 121, 0, 7, 0, 1, 105, 306, 3, 86, 8, 183, 0, 12, 163, 17, 83, 22, 0, 0, 1, 8, 109, 103, 0, 0, 295, 0, 200, 16, 172, 3, 16, 182, 3, 11, 0, 0, 223, 111, 103, 0, 5, 225, 0, 95]), ('XA', 'map2-1'), ('XS', 53), ('XT', 38), ('XF', 1), ('XE', 0)]
- )
-
- fz = dict(read.tags)["FZ"]
- self.assertEqual(fz, self.compare[x])
- self.assertEqual(read.opt("FZ"), self.compare[x])
-
- def testWrite(self):
-
- s = pysam.AlignmentFile(self.filename)
- for read in s:
- before = read.tags
- read.tags = read.tags
- after = read.tags
- self.assertEqual(after, before)
-
-
-class TestBTagBam(TestBTagSam):
- filename = os.path.join(DATADIR, 'example_btag.bam')
-
-
-class TestDoubleFetch(unittest.TestCase):
- '''check if two iterators on the same bamfile are independent.'''
-
- filename = os.path.join(DATADIR, 'ex1.bam')
-
- def testDoubleFetch(self):
-
- samfile1 = pysam.AlignmentFile(self.filename, 'rb')
-
- for a, b in zip(samfile1.fetch(multiple_iterators=True),
- samfile1.fetch(multiple_iterators=True)):
- self.assertEqual(a.compare(b), 0)
-
- def testDoubleFetchWithRegion(self):
-
- samfile1 = pysam.AlignmentFile(self.filename, 'rb')
- chr, start, stop = 'chr1', 200, 3000000
- # just making sure the test has something to catch
- self.assertTrue(len(list(samfile1.fetch(chr, start, stop))) > 0)
-
- for a, b in zip(samfile1.fetch(chr, start, stop),
- samfile1.fetch(chr, start, stop,
- multiple_iterators=True)):
- self.assertEqual(a.compare(b), 0)
-
- def testDoubleFetchUntilEOF(self):
-
- samfile1 = pysam.AlignmentFile(self.filename, 'rb')
-
- for a, b in zip(samfile1.fetch(until_eof=True),
- samfile1.fetch(until_eof=True,
- multiple_iterators=True)):
- self.assertEqual(a.compare(b), 0)
-
-
-class TestRemoteFileFTP(unittest.TestCase):
-
- '''test remote access.
-
- '''
-
- # Need to find an ftp server without password on standard
- # port.
-
- url = "ftp://ftp.sanger.ac.uk/pub/rd/humanSequences/CV.bam"
- region = "1:1-1000"
-
- def testFTPView(self):
- return
- if not checkURL(self.url):
- return
-
- result = pysam.view(self.url, self.region)
- self.assertEqual(len(result), 36)
-
- def testFTPFetch(self):
- return
- if not checkURL(self.url):
- return
-
- samfile = pysam.AlignmentFile(self.url, "rb")
- result = list(samfile.fetch(region=self.region))
- self.assertEqual(len(result), 36)
-
-
-class TestRemoteFileHTTP(unittest.TestCase):
-
- url = "http://genserv.anat.ox.ac.uk/downloads/pysam/test/ex1.bam"
- region = "chr1:1-1000"
- local = os.path.join(DATADIR, "ex1.bam")
-
- def testView(self):
- if not checkURL(self.url):
- return
-
- samfile_local = pysam.AlignmentFile(self.local, "rb")
- ref = list(samfile_local.fetch(region=self.region))
-
- result = pysam.view(self.url, self.region)
- self.assertEqual(len(result), len(ref))
-
- def testFetch(self):
- if not checkURL(self.url):
- return
-
- samfile = pysam.AlignmentFile(self.url, "rb")
- result = list(samfile.fetch(region=self.region))
- samfile_local = pysam.AlignmentFile(self.local, "rb")
- ref = list(samfile_local.fetch(region=self.region))
-
- self.assertEqual(len(ref), len(result))
- for x, y in zip(result, ref):
- self.assertEqual(x.compare(y), 0)
-
- def testFetchAll(self):
- if not checkURL(self.url):
- return
-
- samfile = pysam.AlignmentFile(self.url, "rb")
- result = list(samfile.fetch())
- samfile_local = pysam.AlignmentFile(self.local, "rb")
- ref = list(samfile_local.fetch())
-
- self.assertEqual(len(ref), len(result))
- for x, y in zip(result, ref):
- self.assertEqual(x.compare(y), 0)
-
-
-class TestLargeOptValues(unittest.TestCase):
-
- ints = (65536, 214748, 2147484, 2147483647)
- floats = (65536.0, 214748.0, 2147484.0)
-
- def check(self, samfile):
-
- i = samfile.fetch()
- for exp in self.ints:
- rr = next(i)
- obs = rr.opt("ZP")
- self.assertEqual(exp, obs,
- "expected %s, got %s\n%s" %
- (str(exp), str(obs), str(rr)))
-
- for exp in [-x for x in self.ints]:
- rr = next(i)
- obs = rr.opt("ZP")
- self.assertEqual(exp, obs,
- "expected %s, got %s\n%s" %
- (str(exp), str(obs), str(rr)))
-
- for exp in self.floats:
- rr = next(i)
- obs = rr.opt("ZP")
- self.assertEqual(exp, obs,
- "expected %s, got %s\n%s" %
- (str(exp), str(obs), str(rr)))
-
- for exp in [-x for x in self.floats]:
- rr = next(i)
- obs = rr.opt("ZP")
- self.assertEqual(exp, obs, "expected %s, got %s\n%s" %
- (str(exp), str(obs), str(rr)))
-
- def testSAM(self):
- samfile = pysam.AlignmentFile(
- os.path.join(DATADIR, "ex10.sam"),
- "r")
- self.check(samfile)
-
- def testBAM(self):
- samfile = pysam.AlignmentFile(
- os.path.join(DATADIR, "ex10.bam"),
- "rb")
- self.check(samfile)
-
-
-class TestPileup(unittest.TestCase):
- '''test pileup functionality.'''
-
- samfilename = "pysam_data/ex1.bam"
- fastafilename = "pysam_data/ex1.fa"
-
- def setUp(self):
-
- self.samfile = pysam.AlignmentFile(self.samfilename)
- self.fastafile = pysam.Fastafile(self.fastafilename)
-
- def checkEqual(self, references, iterator):
-
- for x, column in enumerate(iterator):
- (contig, pos, reference_base,
- read_bases, read_qualities, alignment_mapping_qualities) \
- = references[x][:-1].split("\t")
- self.assertEqual(int(pos) - 1, column.reference_pos)
-
- def testSamtoolsStepper(self):
- refs = pysam.mpileup(
- "-f", self.fastafilename,
- self.samfilename)
- iterator = self.samfile.pileup(
- stepper="samtools",
- fastafile=self.fastafile)
- self.checkEqual(refs, iterator)
-
- def testAllStepper(self):
- refs = pysam.mpileup(
- "-f", self.fastafilename,
- "-A", "-B",
- self.samfilename)
-
- iterator = self.samfile.pileup(
- stepper="all",
- fastafile=self.fastafile)
- self.checkEqual(refs, iterator)
-
-
-class TestLogging(unittest.TestCase):
-
- '''test around bug issue 42,
-
- failed in versions < 0.4
- '''
-
- def check(self, bamfile, log):
-
- if log:
- logger = logging.getLogger('franklin')
- logger.setLevel(logging.INFO)
- formatter = logging.Formatter(
- '%(asctime)s %(levelname)s %(message)s')
- log_hand = logging.FileHandler('log.txt')
- log_hand.setFormatter(formatter)
- logger.addHandler(log_hand)
-
- bam = pysam.AlignmentFile(bamfile, 'rb')
- cols = bam.pileup()
- self.assertTrue(True)
-
- def testFail1(self):
- self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_fail.bam"),
- False)
- self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_fail.bam"),
- True)
-
- def testNoFail1(self):
- self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_nofail.bam"),
- False)
- self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_nofail.bam"),
- True)
-
- def testNoFail2(self):
- self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_nofail.bam"),
- True)
- self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_nofail.bam"),
- True)
-
-# TODOS
-# 1. finish testing all properties within pileup objects
-# 2. check exceptions and bad input problems (missing files, optional fields that aren't present, etc...)
-# 3. check: presence of sequence
-
-
-class TestAlignmentFileUtilityFunctions(unittest.TestCase):
-
- def testCount(self):
-
- samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
-
- for contig in ("chr1", "chr2"):
- for start in range(0, 2000, 100):
- end = start + 1
- self.assertEqual(
- len(list(samfile.fetch(contig, start, end))),
- samfile.count(contig, start, end),
- 'number mismatch for %s:%i-%i %i != %i' % (
- contig, start, end,
- len(list(samfile.fetch(contig, start, end))),
- samfile.count(contig, start, end)))
-
- # test empty intervals
- self.assertEqual(
- len(list(samfile.fetch(contig, start, start))),
- samfile.count(contig, start, start),
- 'number mismatch for %s:%i-%i %i != %i' % (
- contig, start, start,
- len(list(samfile.fetch(contig, start, start))),
- samfile.count(contig, start, start)))
-
- # test half empty intervals
- self.assertEqual(len(list(samfile.fetch(contig, start))),
- samfile.count(contig, start))
-
- self.assertEqual(
- len(list(samfile.fetch(contig, start))),
- samfile.count(contig, start),
- 'number mismatch for %s:%i %i != %i' % (
- contig, start,
- len(list(samfile.fetch(contig, start))),
- samfile.count(contig, start)))
-
- def testMate(self):
- '''test mate access.'''
-
- with open(os.path.join(DATADIR, "ex1.sam"), "rb") as inf:
- readnames = [x.split(b"\t")[0] for x in inf.readlines()]
- if sys.version_info[0] >= 3:
- readnames = [name.decode('ascii') for name in readnames]
-
- counts = collections.defaultdict(int)
- for x in readnames:
- counts[x] += 1
-
- samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
-
- for read in samfile.fetch():
- if not read.is_paired:
- self.assertRaises(ValueError, samfile.mate, read)
- elif read.mate_is_unmapped:
- self.assertRaises(ValueError, samfile.mate, read)
- else:
- if counts[read.query_name] == 1:
- self.assertRaises(ValueError, samfile.mate, read)
- else:
- mate = samfile.mate(read)
- self.assertEqual(read.query_name, mate.query_name)
- self.assertEqual(read.is_read1, mate.is_read2)
- self.assertEqual(read.is_read2, mate.is_read1)
- self.assertEqual(
- read.reference_start, mate.next_reference_start)
- self.assertEqual(
- read.next_reference_start, mate.reference_start)
-
- def testIndexStats(self):
- '''test if total number of mapped/unmapped reads is correct.'''
-
- samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
- self.assertEqual(samfile.mapped, 3235)
- self.assertEqual(samfile.unmapped, 35)
- self.assertEqual(samfile.nocoordinate, 0)
-
-
-class TestSamtoolsProxy(unittest.TestCase):
-
- '''tests for sanity checking access to samtools functions.'''
-
- def testIndex(self):
- self.assertRaises(IOError, pysam.index, "missing_file")
-
- def testView(self):
- # note that view still echos "open: No such file or directory"
- self.assertRaises(pysam.SamtoolsError, pysam.view, "missing_file")
-
- def testSort(self):
- self.assertRaises(pysam.SamtoolsError, pysam.sort, "missing_file")
-
-
-class TestAlignmentFileIndex(unittest.TestCase):
-
- def testIndex(self):
- samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
- index = pysam.IndexedReads(samfile)
- index.build()
- reads = collections.defaultdict(int)
-
- for read in samfile:
- reads[read.query_name] += 1
-
- for qname, counts in reads.items():
- found = list(index.find(qname))
- self.assertEqual(len(found), counts)
- for x in found:
- self.assertEqual(x.query_name, qname)
-
-
-if __name__ == "__main__":
- # build data files
- print ("building data files")
- subprocess.call("make -C %s" % DATADIR, shell=True)
- print ("starting tests")
- unittest.main()
- print ("completed tests")
+++ /dev/null
-#!/usr/bin/env python
-'''unit testing code for pysam.
-
-Execute in the :file:`tests` directory as it requires the Makefile
-and data files located there.
-'''
-
-import pysam
-import unittest
-import os
-import shutil
-import sys
-import collections
-import subprocess
-import logging
-from TestUtils import checkBinaryEqual, checkURL
-
-IS_PYTHON3 = sys.version_info[0] >= 3
-
-SAMTOOLS = "samtools"
-WORKDIR = "pysam_test_work"
-DATADIR = "pysam_data"
-
-
-class BasicTestBAMFetch(unittest.TestCase):
-
- '''basic first test - detailed testing
- if information in file is consistent
- with information in AlignedRead object.'''
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.Samfile(
- os.path.join(DATADIR, "ex3.bam"),
- "rb")
- self.reads = list(self.samfile.fetch())
-
- def testARqname(self):
- self.assertEqual(
- self.reads[0].qname,
- "read_28833_29006_6945",
- "read name mismatch in read 1: %s != %s" % (
- self.reads[0].qname, "read_28833_29006_6945"))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].qname,
- "read_28701_28881_323b",
- "read name mismatch in read 2: %s != %s" % (
- self.reads[1].qname, "read_28701_28881_323b"))
-
- def testARflag(self):
- self.assertEqual(
- self.reads[0].flag, 99,
- "flag mismatch in read 1: %s != %s" % (
- self.reads[0].flag, 99))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].flag, 147,
- "flag mismatch in read 2: %s != %s" % (
- self.reads[1].flag, 147))
-
- def testARrname(self):
- self.assertEqual(
- self.reads[0].rname, 0,
- "chromosome/target id mismatch in read 1: %s != %s" %
- (self.reads[0].rname, 0))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].rname, 1,
- "chromosome/target id mismatch in read 2: %s != %s" %
- (self.reads[1].rname, 1))
-
- def testARpos(self):
- self.assertEqual(
- self.reads[0].pos, 33 - 1,
- "mapping position mismatch in read 1: %s != %s" %
- (self.reads[0].pos, 33 - 1))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].pos, 88 - 1,
- "mapping position mismatch in read 2: %s != %s" %
- (self.reads[1].pos, 88 - 1))
-
- def testARmapq(self):
- self.assertEqual(
- self.reads[0].mapq, 20,
- "mapping quality mismatch in read 1: %s != %s" %
- (self.reads[0].mapq, 20))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].mapq, 30,
- "mapping quality mismatch in read 2: %s != %s" % (
- self.reads[1].mapq, 30))
-
- def testARcigar(self):
- self.assertEqual(
- self.reads[0].cigar,
- [(0, 10), (2, 1), (0, 25)],
- "read name length mismatch in read 1: %s != %s" %
- (self.reads[0].cigar, [(0, 10), (2, 1), (0, 25)]))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].cigar, [(0, 35)],
- "read name length mismatch in read 2: %s != %s" %
- (self.reads[1].cigar, [(0, 35)]))
-
- def testARcigarstring(self):
- self.assertEqual(self.reads[0].cigarstring, '10M1D25M')
- self.assertEqual(self.reads[1].cigarstring, '35M')
-
- def testARmrnm(self):
- self.assertEqual(
- self.reads[0].mrnm, 0,
- "mate reference sequence name mismatch in read 1: %s != %s" %
- (self.reads[0].mrnm, 0))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].mrnm, 1,
- "mate reference sequence name mismatch in read 2: %s != %s" %
- (self.reads[1].mrnm, 1))
- self.assertEqual(
- self.reads[0].rnext, 0,
- "mate reference sequence name mismatch in read 1: %s != %s" %
- (self.reads[0].rnext, 0))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].rnext, 1,
- "mate reference sequence name mismatch in read 2: %s != %s" %
- (self.reads[1].rnext, 1))
-
- def testARmpos(self):
- self.assertEqual(self.reads[
- 0].mpos, 200 - 1, "mate mapping position mismatch in read 1: %s != %s" % (self.reads[0].mpos, 200 - 1))
- self.assertEqual(self.reads[
- 1].mpos, 500 - 1, "mate mapping position mismatch in read 2: %s != %s" % (self.reads[1].mpos, 500 - 1))
- self.assertEqual(self.reads[
- 0].pnext, 200 - 1, "mate mapping position mismatch in read 1: %s != %s" % (self.reads[0].pnext, 200 - 1))
- self.assertEqual(self.reads[
- 1].pnext, 500 - 1, "mate mapping position mismatch in read 2: %s != %s" % (self.reads[1].pnext, 500 - 1))
-
- def testARisize(self):
- self.assertEqual(self.reads[0].isize, 167, "insert size mismatch in read 1: %s != %s" % (
- self.reads[0].isize, 167))
- self.assertEqual(self.reads[1].isize, 412, "insert size mismatch in read 2: %s != %s" % (
- self.reads[1].isize, 412))
- self.assertEqual(self.reads[0].tlen, 167, "insert size mismatch in read 1: %s != %s" % (
- self.reads[0].tlen, 167))
- self.assertEqual(self.reads[1].tlen, 412, "insert size mismatch in read 2: %s != %s" % (
- self.reads[1].tlen, 412))
-
- def testARseq(self):
- self.assertEqual(self.reads[0].seq, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG", "sequence mismatch in read 1: %s != %s" % (
- self.reads[0].seq, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG"))
- self.assertEqual(self.reads[1].seq, "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA", "sequence size mismatch in read 2: %s != %s" % (
- self.reads[1].seq, "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA"))
- self.assertEqual(self.reads[3].seq, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG", "sequence mismatch in read 4: %s != %s" % (
- self.reads[3].seq, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG"))
-
- def testARqual(self):
- self.assertEqual(self.reads[0].qual, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<",
- "quality string mismatch in read 1: %s != %s" % (self.reads[0].qual, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<"))
- self.assertEqual(self.reads[1].qual, "<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<", "quality string mismatch in read 2: %s != %s" % (
- self.reads[1].qual, "<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<"))
- self.assertEqual(self.reads[3].qual, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<",
- "quality string mismatch in read 3: %s != %s" % (self.reads[3].qual, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<"))
-
- def testARquery(self):
- self.assertEqual(self.reads[0].query, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG", "query mismatch in read 1: %s != %s" % (
- self.reads[0].query, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG"))
- self.assertEqual(self.reads[1].query, "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA", "query size mismatch in read 2: %s != %s" % (
- self.reads[1].query, "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA"))
- self.assertEqual(self.reads[3].query, "TAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTT", "query mismatch in read 4: %s != %s" % (
- self.reads[3].query, "TAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTT"))
-
- def testARqqual(self):
- self.assertEqual(
- self.reads[0].qqual, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<",
- "qquality string mismatch in read 1: %s != %s" %
- (self.reads[0].qqual, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<"))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].qqual, "<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<",
- "qquality string mismatch in read 2: %s != %s" %
- (self.reads[1].qqual, "<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<"))
- self.assertEqual(
- self.reads[3].qqual, "<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22",
- "qquality string mismatch in read 3: %s != %s" %
- (self.reads[3].qqual, "<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22"))
-
- def testPresentOptionalFields(self):
- self.assertEqual(
- self.reads[0].opt('NM'), 1,
- "optional field mismatch in read 1, NM: %s != %s" %
- (self.reads[0].opt('NM'), 1))
- self.assertEqual(
- self.reads[0].opt('RG'), 'L1',
- "optional field mismatch in read 1, RG: %s != %s" %
- (self.reads[0].opt('RG'), 'L1'))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].opt('RG'), 'L2',
- "optional field mismatch in read 2, RG: %s != %s" %
- (self.reads[1].opt('RG'), 'L2'))
- self.assertEqual(
- self.reads[1].opt('MF'), 18,
- "optional field mismatch in read 2, MF: %s != %s" %
- (self.reads[1].opt('MF'), 18))
-
- def testPairedBools(self):
- self.assertEqual(self.reads[0].is_paired, True,
- "is paired mismatch in read 1: %s != %s" % (
- self.reads[0].is_paired, True))
- self.assertEqual(self.reads[1].is_paired, True,
- "is paired mismatch in read 2: %s != %s" % (
- self.reads[1].is_paired, True))
- self.assertEqual(self.reads[0].is_proper_pair, True,
- "is proper pair mismatch in read 1: %s != %s" % (
- self.reads[0].is_proper_pair, True))
- self.assertEqual(self.reads[1].is_proper_pair, True,
- "is proper pair mismatch in read 2: %s != %s" % (
- self.reads[1].is_proper_pair, True))
-
- def testTags(self):
- self.assertEqual(self.reads[0].tags,
- [('NM', 1), ('RG', 'L1'),
- ('PG', 'P1'), ('XT', 'U')])
- self.assertEqual(self.reads[1].tags,
- [('MF', 18), ('RG', 'L2'),
- ('PG', 'P2'), ('XT', 'R')])
-
- def testAddTags(self):
- self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
- sorted([('NM', 1), ('RG', 'L1'),
- ('PG', 'P1'), ('XT', 'U')]))
-
- self.reads[0].setTag('X1', 'C')
- self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
- sorted([('X1', 'C'), ('NM', 1), ('RG', 'L1'),
- ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ]))
- self.reads[0].setTag('X2', 5)
- self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
- sorted([('X2', 5), ('X1', 'C'),
- ('NM', 1), ('RG', 'L1'),
- ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ]))
- # add with replacement
- self.reads[0].setTag('X2', 10)
- self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
- sorted([('X2', 10), ('X1', 'C'),
- ('NM', 1), ('RG', 'L1'),
- ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ]))
-
- # add without replacement
- self.reads[0].setTag('X2', 5, replace=False)
- self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
- sorted([('X2', 10), ('X1', 'C'),
- ('X2', 5),
- ('NM', 1), ('RG', 'L1'),
- ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ]))
-
- def testAddTagsType(self):
- self.reads[0].tags = None
- self.assertEqual(self.reads[0].tags, [])
-
- self.reads[0].setTag('X1', 5.0)
- self.reads[0].setTag('X2', "5.0")
- self.reads[0].setTag('X3', 5)
-
- self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
- sorted([('X1', 5.0),
- ('X2', "5.0"),
- ('X3', 5)]))
-
- # test setting float for int value
- self.reads[0].setTag('X4', 5, value_type='d')
- self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
- sorted([('X1', 5.0),
- ('X2', "5.0"),
- ('X3', 5),
- ('X4', 5.0)]))
-
- # test setting int for float value - the
- # value will be rounded.
- self.reads[0].setTag('X5', 5.2, value_type='i')
- self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
- sorted([('X1', 5.0),
- ('X2', "5.0"),
- ('X3', 5),
- ('X4', 5.0),
- ('X5', 5)]))
-
- # test setting invalid type code
- self.assertRaises(ValueError, self.reads[0].setTag, 'X6', 5.2, 'g')
-
- def testTagsUpdatingFloat(self):
- self.assertEqual(self.reads[0].tags,
- [('NM', 1), ('RG', 'L1'),
- ('PG', 'P1'), ('XT', 'U')])
- self.reads[0].tags += [('XC', 5.0)]
- self.assertEqual(self.reads[0].tags,
- [('NM', 1), ('RG', 'L1'),
- ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ('XC', 5.0)])
-
- def testOpt(self):
- self.assertEqual(self.reads[0].opt("XT"), "U")
- self.assertEqual(self.reads[1].opt("XT"), "R")
-
- def testMissingOpt(self):
- self.assertRaises(KeyError, self.reads[0].opt, "XP")
-
- def testEmptyOpt(self):
- self.assertRaises(KeyError, self.reads[2].opt, "XT")
-
- def tearDown(self):
- self.samfile.close()
-
-
-class BasicTestBAMFile(BasicTestBAMFetch):
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.Samfile(
- os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"),
- "r")
- self.reads = [r for r in self.samfile]
-
-
-class BasicTestSAMFile(BasicTestBAMFetch):
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.Samfile(
- os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"),
- "r")
- self.reads = [r for r in self.samfile]
-
-
-class BasicTestSAMFetch(BasicTestBAMFetch):
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.Samfile(
- os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"),
- "r")
- self.reads = list(self.samfile.fetch())
-
-
-# needs to be implemented
-# class TestAlignedReadFromSamWithoutHeader(TestAlignedReadFromBam):
-#
-# def setUp(self):
-# self.samfile=pysam.Samfile( "ex7.sam","r" )
-# self.reads=list(self.samfile.fetch())
-
-
-class TestIO(unittest.TestCase):
-
- '''check if reading samfile and writing a samfile are consistent.'''
-
- def checkEcho(self,
- input_filename,
- reference_filename,
- output_filename,
- input_mode, output_mode,
- use_template=True):
- '''iterate through *input_filename* writing to *output_filename* and
- comparing the output to *reference_filename*.
-
- The files are opened according to the *input_mode* and *output_mode*.
-
- If *use_template* is set, the header is copied from infile
- using the template mechanism, otherwise target names and
- lengths are passed explicitely.
-
- '''
-
- infile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, input_filename),
- input_mode)
- if use_template:
- outfile = pysam.Samfile(output_filename,
- output_mode,
- template=infile)
- else:
- outfile = pysam.Samfile(output_filename,
- output_mode,
- referencenames=infile.references,
- referencelengths=infile.lengths,
- add_sq_text=False)
-
- iter = infile.fetch()
-
- for x in iter:
- outfile.write(x)
- infile.close()
- outfile.close()
-
- self.assertTrue(
- checkBinaryEqual(os.path.join(DATADIR, reference_filename),
- output_filename),
- "files %s and %s are not the same" % (reference_filename,
- output_filename))
-
- def testReadWriteBam(self):
-
- input_filename = "ex1.bam"
- output_filename = "pysam_ex1.bam"
- reference_filename = "ex1.bam"
-
- self.checkEcho(input_filename, reference_filename, output_filename,
- "rb", "wb", use_template=True)
-
- # Disabled - should work, files are not binary equal, but are
- # non-binary equal:
- # diff <(samtools view pysam_ex1.bam) <(samtools view pysam_data/ex1.bam)
- # def testReadWriteBamWithTargetNames(self):
- # input_filename = "ex1.bam"
- # output_filename = "pysam_ex1.bam"
- # reference_filename = "ex1.bam"
-
- # self.checkEcho(input_filename, reference_filename, output_filename,
- # "rb", "wb", use_template=False)
-
- def testReadWriteSamWithHeader(self):
-
- input_filename = "ex2.sam"
- output_filename = "pysam_ex2.sam"
- reference_filename = "ex2.sam"
-
- self.checkEcho(input_filename,
- reference_filename,
- output_filename,
- "r", "wh")
-
- # Release 0.8.0
- # no samfiles without header
- def testReadWriteSamWithoutHeader(self):
-
- input_filename = "ex2.sam"
- output_filename = "pysam_ex2.sam"
- reference_filename = "ex1.sam"
-
- self.checkEcho(input_filename,
- reference_filename,
- output_filename,
- "r", "w")
-
- def testReadSamWithoutTargetNames(self):
- '''see issue 104.'''
- input_filename = os.path.join(DATADIR,
- "example_unmapped_reads_no_sq.sam")
-
- # raise exception in default mode
- self.assertRaises(ValueError, pysam.Samfile, input_filename, "r")
-
- # raise exception if no SQ files
- self.assertRaises(ValueError, pysam.Samfile,
- input_filename, "r",
- check_header=True)
-
- infile = pysam.Samfile(
- input_filename,
- check_header=False,
- check_sq=False)
-
- # TODO
- # result = list(infile.fetch(until_eof=True))
- # self.assertEqual(2, len(result))
-
- def testReadBamWithoutTargetNames(self):
- '''see issue 104.'''
- input_filename = os.path.join(
- DATADIR, "example_unmapped_reads_no_sq.bam")
-
- # raise exception in default mode
- self.assertRaises(ValueError, pysam.Samfile, input_filename, "r")
-
- # raise exception if no SQ files
- self.assertRaises(ValueError, pysam.Samfile, input_filename, "r",
- check_header=True)
-
- infile = pysam.Samfile(
- input_filename, check_header=False, check_sq=False)
- result = list(infile.fetch(until_eof=True))
-
- # TODO
- def testReadSamWithoutHeader(self):
- input_filename = os.path.join(DATADIR, "ex1.sam")
-
- # reading from a samfile without header is not
- # implemented
- self.assertRaises(ValueError,
- pysam.Samfile,
- input_filename,
- "r")
-
- # TODO
- # without check_header header is no read
- # leading to segfault
- # self.assertRaises(ValueError,
- # pysam.Samfile,
- # input_filename,
- # "r",
- # check_header=False)
-
- # TODO
- # def testReadUnformattedFile(self):
- # '''test reading from a file that is not bam/sam formatted'''
- # input_filename = os.path.join(DATADIR, 'Makefile')
-
- # # bam - file raise error
- # self.assertRaises(ValueError,
- # pysam.Samfile,
- # input_filename,
- # "rb")
-
- # # sam - file error, but can't fetch
- # self.assertRaises(ValueError,
- # pysam.Samfile,
- # input_filename,
- # "r")
-
- # self.assertRaises(ValueError,
- # pysam.Samfile,
- # input_filename,
- # "r",
- # check_header=False)
-
- def testBAMWithoutAlignedReads(self):
- '''see issue 117'''
- input_filename = os.path.join(DATADIR, "test_unaligned.bam")
- samfile = pysam.Samfile(input_filename, "rb", check_sq=False)
- samfile.fetch(until_eof=True)
-
- def testBAMWithShortBAI(self):
- '''see issue 116'''
- input_filename = os.path.join(DATADIR, "example_bai.bam")
- samfile = pysam.Samfile(input_filename, "rb", check_sq=False)
- samfile.fetch('chr2')
-
- def testFetchFromClosedFile(self):
-
- samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
- samfile.close()
- self.assertRaises(ValueError, samfile.fetch, 'chr1', 100, 120)
-
- def testClosedFile(self):
- '''test that access to a closed samfile raises ValueError.'''
-
- samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
- samfile.close()
- self.assertRaises(ValueError, samfile.fetch, 'chr1', 100, 120)
- self.assertRaises(ValueError, samfile.pileup, 'chr1', 100, 120)
- self.assertRaises(ValueError, samfile.getrname, 0)
- # TODO
- self.assertRaises(ValueError, samfile.tell)
- self.assertRaises(ValueError, samfile.seek, 0)
- self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "nreferences")
- self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "references")
- self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "lengths")
- self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "text")
- self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "header")
-
- # write on closed file
- self.assertEqual(0, samfile.write(None))
-
- def testAutoDetection(self):
- '''test if autodetection works.'''
-
- # TODO
- # samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"))
- # self.assertRaises(ValueError, samfile.fetch, 'chr1')
- # samfile.close()
-
- samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex3.bam"))
- samfile.fetch('chr1')
- samfile.close()
-
- # TOOD
- # def testReadingFromSamFileWithoutHeader(self):
- # '''read from samfile without header.
- # '''
- # samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex7.sam"),
- # check_header=False,
- # check_sq=False)
- # self.assertRaises(NotImplementedError, samfile.__iter__)
-
- def testReadingFromFileWithoutIndex(self):
- '''read from bam file without index.'''
-
- shutil.copyfile(os.path.join(DATADIR, "ex2.bam"), 'tmp_ex2.bam')
- samfile = pysam.Samfile('tmp_ex2.bam',
- "rb")
- self.assertRaises(ValueError, samfile.fetch)
- self.assertEqual(len(list(samfile.fetch(until_eof=True))),
- 3270)
- os.unlink('tmp_ex2.bam')
-
- # def testReadingUniversalFileMode(self):
- # '''read from samfile without header.
- # '''
-
- # input_filename = "ex2.sam"
- # output_filename = "pysam_ex2.sam"
- # reference_filename = "ex1.sam"
-
- # self.checkEcho(input_filename,
- # reference_filename,
- # output_filename,
- # "rU", "w")
-
- def testHead(self):
- '''test IteratorRowHead'''
- samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
- l10 = list(samfile.head(10))
- l100 = list(samfile.head(100))
- self.assertEqual(len(l10), 10)
- self.assertEqual(len(l100), 100)
- self.assertEqual(list(map(str, l10)),
- list(map(str, l100[:10])))
-
-
-class TestFloatTagBug(unittest.TestCase):
-
- '''see issue 71'''
-
- def testFloatTagBug(self):
- '''a float tag before another exposed a parsing bug in bam_aux_get.
-
- Fixed in 0.1.19
- '''
- samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "tag_bug.bam"))
- read = next(samfile.fetch(until_eof=True))
- self.assertTrue(('XC', 1) in read.tags)
- self.assertEqual(read.opt('XC'), 1)
-
-
-class TestLargeFieldBug(unittest.TestCase):
-
- '''see issue 100'''
-
- def testLargeFileBug(self):
- '''when creating a read with a large entry in the tag field
- causes an errror:
- NotImplementedError: tags field too large
- '''
- samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "issue100.bam"))
- read = next(samfile.fetch(until_eof=True))
- new_read = pysam.AlignedRead()
- new_read.tags = read.tags
- self.assertEqual(new_read.tags, read.tags)
-
-
-class TestTagParsing(unittest.TestCase):
-
- '''tests checking the accuracy of tag setting and retrieval.'''
-
- def makeRead(self):
- a = pysam.AlignedRead()
- a.qname = "read_12345"
- a.tid = 0
- a.seq = "ACGT" * 3
- a.flag = 0
- a.rname = 0
- a.pos = 1
- a.mapq = 20
- a.cigar = ((0, 10), (2, 1), (0, 25))
- a.mrnm = 0
- a.mpos = 200
- a.isize = 0
- a.qual = "1234" * 3
- # todo: create tags
- return a
-
- def testNegativeIntegers(self):
- x = -2
- aligned_read = self.makeRead()
- aligned_read.tags = [("XD", int(x))]
- # print (aligned_read.tags)
-
- def testNegativeIntegers2(self):
- x = -2
- r = self.makeRead()
- r.tags = [("XD", int(x))]
- outfile = pysam.Samfile("test.bam",
- "wb",
- referencenames=("chr1",),
- referencelengths = (1000,))
- outfile.write(r)
- outfile.close()
-
- def testCigarString(self):
- r = self.makeRead()
- self.assertEqual(r.cigarstring, "10M1D25M")
- r.cigarstring = "20M10D20M"
- self.assertEqual(r.cigar, [(0, 20), (2, 10), (0, 20)])
- # unsetting cigar string
- r.cigarstring = None
- self.assertEqual(r.cigarstring, None)
-
- def testCigar(self):
- r = self.makeRead()
- self.assertEqual(r.cigar, [(0, 10), (2, 1), (0, 25)])
- # unsetting cigar string
- r.cigar = None
- self.assertEqual(r.cigar, [])
-
- def testLongTags(self):
- '''see issue 115'''
-
- r = self.makeRead()
- rg = 'HS2000-899_199.L3'
- tags = [('XC', 85), ('XT', 'M'), ('NM', 5),
- ('SM', 29), ('AM', 29), ('XM', 1),
- ('XO', 1), ('XG', 4), ('MD', '37^ACCC29T18'),
- ('XA', '5,+11707,36M1I48M,2;21,-48119779,46M1I38M,2;hs37d5,-10060835,40M1D45M,3;5,+11508,36M1I48M,3;hs37d5,+6743812,36M1I48M,3;19,-59118894,46M1I38M,3;4,-191044002,6M1I78M,3;')]
-
- r.tags = tags
- r.tags += [("RG", rg)] * 100
- tags += [("RG", rg)] * 100
-
- self.assertEqual(tags, r.tags)
-
-
-class TestClipping(unittest.TestCase):
-
- def testClipping(self):
-
- self.samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "softclip.bam"),
- "rb")
- for read in self.samfile:
-
- if read.qname == "r001":
- self.assertEqual(read.seq, 'AAAAGATAAGGATA')
- self.assertEqual(read.query, 'AGATAAGGATA')
- self.assertEqual(read.qual, None)
- self.assertEqual(read.qqual, None)
-
- elif read.qname == "r002":
-
- self.assertEqual(read.seq, 'GCCTAAGCTAA')
- self.assertEqual(read.query, 'AGCTAA')
- self.assertEqual(read.qual, '01234567890')
- self.assertEqual(read.qqual, '567890')
-
- elif read.qname == "r003":
-
- self.assertEqual(read.seq, 'GCCTAAGCTAA')
- self.assertEqual(read.query, 'GCCTAA')
- self.assertEqual(read.qual, '01234567890')
- self.assertEqual(read.qqual, '012345')
-
- elif read.qname == "r004":
-
- self.assertEqual(read.seq, 'TAGGC')
- self.assertEqual(read.query, 'TAGGC')
- self.assertEqual(read.qual, '01234')
- self.assertEqual(read.qqual, '01234')
-
-
-class TestIteratorRow(unittest.TestCase):
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
-
- def checkRange(self, rnge):
- '''compare results from iterator with those from samtools.'''
- ps = list(self.samfile.fetch(region=rnge))
- sa = list(pysam.view(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- rnge,
- raw=True))
- self.assertEqual(len(ps), len(
- sa), "unequal number of results for range %s: %i != %i" % (rnge, len(ps), len(sa)))
- # check if the same reads are returned and in the same order
- for line, (a, b) in enumerate(list(zip(ps, sa))):
- d = b.split("\t")
- self.assertEqual(
- a.qname, d[0], "line %i: read id mismatch: %s != %s" % (line, a.rname, d[0]))
- self.assertEqual(a.pos, int(d[3]) - 1, "line %i: read position mismatch: %s != %s, \n%s\n%s\n" %
- (line, a.pos, int(d[3]) - 1,
- str(a), str(d)))
- qual = d[10]
- self.assertEqual(a.qual, qual, "line %i: quality mismatch: %s != %s, \n%s\n%s\n" %
- (line, a.qual, qual,
- str(a), str(d)))
-
- def testIteratePerContig(self):
- '''check random access per contig'''
- for contig in self.samfile.references:
- self.checkRange(contig)
-
- def testIterateRanges(self):
- '''check random access per range'''
- for contig, length in zip(self.samfile.references, self.samfile.lengths):
- for start in range(1, length, 90):
- # this includes empty ranges
- self.checkRange("%s:%i-%i" % (contig, start, start + 90))
-
- def tearDown(self):
- self.samfile.close()
-
-
-class TestIteratorRowAll(unittest.TestCase):
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
-
- def testIterate(self):
- '''compare results from iterator with those from samtools.'''
- ps = list(self.samfile.fetch())
- sa = list(pysam.view(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- raw=True))
- self.assertEqual(
- len(ps), len(sa), "unequal number of results: %i != %i" % (len(ps), len(sa)))
- # check if the same reads are returned
- for line, pair in enumerate(list(zip(ps, sa))):
- data = pair[1].split("\t")
- self.assertEqual(pair[0].qname, data[
- 0], "read id mismatch in line %i: %s != %s" % (line, pair[0].rname, data[0]))
-
- def tearDown(self):
- self.samfile.close()
-
-
-class TestIteratorColumn(unittest.TestCase):
-
- '''test iterator column against contents of ex4.bam.'''
-
- # note that samfile contains 1-based coordinates
- # 1D means deletion with respect to reference sequence
- #
- mCoverages = {'chr1': [0] * 20 + [1] * 36 + [0] * (100 - 20 - 35),
- 'chr2': [0] * 20 + [1] * 35 + [0] * (100 - 20 - 35),
- }
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex4.bam"),
- "rb")
-
- def checkRange(self, contig, start=None, end=None, truncate=False):
- '''compare results from iterator with those from samtools.'''
- # check if the same reads are returned and in the same order
- for column in self.samfile.pileup(contig, start, end,
- truncate=truncate):
- if truncate:
- self.assertGreaterEqual(column.pos, start)
- self.assertLess(column.pos, end)
- thiscov = len(column.pileups)
- refcov = self.mCoverages[
- self.samfile.getrname(column.tid)][column.pos]
- self.assertEqual(
- thiscov, refcov, "wrong coverage at pos %s:%i %i should be %i" % (
- self.samfile.getrname(column.tid), column.pos, thiscov, refcov))
-
- def testIterateAll(self):
- '''check random access per contig'''
- self.checkRange(None)
-
- def testIteratePerContig(self):
- '''check random access per contig'''
- for contig in self.samfile.references:
- self.checkRange(contig)
-
- def testIterateRanges(self):
- '''check random access per range'''
- for contig, length in zip(self.samfile.references, self.samfile.lengths):
- for start in range(1, length, 90):
- # this includes empty ranges
- self.checkRange(contig, start, start + 90)
-
- def testInverse(self):
- '''test the inverse, is point-wise pileup accurate.'''
- for contig, refseq in list(self.mCoverages.items()):
- refcolumns = sum(refseq)
- for pos, refcov in enumerate(refseq):
- columns = list(self.samfile.pileup(contig, pos, pos + 1))
- if refcov == 0:
- # if no read, no coverage
- self.assertEqual(
- len(columns),
- refcov,
- "wrong number of pileup columns returned for position %s:%i, %i should be %i" % (
- contig, pos,
- len(columns), refcov))
- elif refcov == 1:
- # one read, all columns of the read are returned
- self.assertEqual(
- len(columns),
- refcolumns,
- "pileup incomplete at position %i: got %i, expected %i " %
- (pos, len(columns), refcolumns))
-
- def testIterateTruncate(self):
- '''check random access per range'''
- for contig, length in zip(self.samfile.references, self.samfile.lengths):
- for start in range(1, length, 90):
- # this includes empty ranges
- self.checkRange(contig, start, start + 90, truncate=True)
-
- def tearDown(self):
- self.samfile.close()
-
-
-class TestIteratorColumn2(unittest.TestCase):
-
- '''test iterator column against contents of ex1.bam.'''
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
-
- def testStart(self):
- # print self.samfile.fetch().next().pos
- # print self.samfile.pileup().next().pos
- pass
-
- def testTruncate(self):
- '''see issue 107.'''
- # note that ranges in regions start from 1
- p = self.samfile.pileup(region='chr1:170:172', truncate=True)
- columns = [x.pos for x in p]
- self.assertEqual(len(columns), 3)
- self.assertEqual(columns, [169, 170, 171])
-
- p = self.samfile.pileup('chr1', 169, 172, truncate=True)
- columns = [x.pos for x in p]
-
- self.assertEqual(len(columns), 3)
- self.assertEqual(columns, [169, 170, 171])
-
- def testAccessOnClosedIterator(self):
- '''see issue 131
-
- Accessing pileup data after iterator has closed.
- '''
- pcolumn = self.samfile.pileup('chr1', 170, 180).__next__()
- self.assertRaises(ValueError, getattr, pcolumn, "pileups")
-
-
-class TestHeaderSam(unittest.TestCase):
-
- header = {'SQ': [{'LN': 1575, 'SN': 'chr1'},
- {'LN': 1584, 'SN': 'chr2'}],
- 'RG': [{'LB': 'SC_1', 'ID': 'L1', 'SM': 'NA12891', 'PU': 'SC_1_10', "CN": "name:with:colon"},
- {'LB': 'SC_2', 'ID': 'L2', 'SM': 'NA12891', 'PU': 'SC_2_12', "CN": "name:with:colon"}],
- 'PG': [{'ID': 'P1', 'VN': '1.0'}, {'ID': 'P2', 'VN': '1.1'}],
- 'HD': {'VN': '1.0'},
- 'CO': ['this is a comment', 'this is another comment'],
- }
-
- def compareHeaders(self, a, b):
- '''compare two headers a and b.'''
- for ak, av in a.items():
- self.assertTrue(ak in b, "key '%s' not in '%s' " % (ak, b))
- self.assertEqual(av, b[ak])
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"),
- "r")
-
- def testHeaders(self):
- self.compareHeaders(self.header, self.samfile.header)
- self.compareHeaders(self.samfile.header, self.header)
-
- def testNameMapping(self):
- for x, y in enumerate(("chr1", "chr2")):
- tid = self.samfile.gettid(y)
- ref = self.samfile.getrname(x)
- self.assertEqual(tid, x)
- self.assertEqual(ref, y)
-
- self.assertEqual(self.samfile.gettid("chr?"), -1)
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.getrname, 2)
-
- def tearDown(self):
- self.samfile.close()
-
-
-class TestHeaderBam(TestHeaderSam):
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex3.bam"),
- "rb")
-
-
-class TestHeaderFromRefs(unittest.TestCase):
-
- '''see issue 144
-
- reference names need to be converted to string for python 3
- '''
-
- # def testHeader( self ):
- # refs = ['chr1', 'chr2']
- # tmpfile = "tmp_%i" % id(self)
- # s = pysam.Samfile(tmpfile, 'wb',
- # referencenames=refs,
- # referencelengths=[100]*len(refs))
- # s.close()
-
- # self.assertTrue( checkBinaryEqual( 'issue144.bam', tmpfile ),
- # 'bam files differ')
- # os.unlink( tmpfile )
-
-
-class TestHeader1000Genomes(unittest.TestCase):
- '''see issue 110'''
- # bamfile = "http://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/phase2b_alignment/data/NA07048/exome_alignment/NA07048.unmapped.ILLUMINA.bwa.CEU.exome.20120522_p2b.bam"
- bamfile = "http://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/phase3_EX_or_LC_only_alignment/data/HG00104/alignment/HG00104.chrom11.ILLUMINA.bwa.GBR.low_coverage.20130415.bam"
-
- def testRead(self):
-
- if not checkURL(self.bamfile):
- return
-
- f = pysam.Samfile(self.bamfile, "rb")
- data = f.header.copy()
- self.assertTrue(data)
-
-
-class TestUnmappedReads(unittest.TestCase):
-
- # TODO
- # def testSAM(self):
- # samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex5.sam"),
- # "r")
- # self.assertEqual(len(list(samfile.fetch(until_eof=True))), 2)
- # samfile.close()
-
- def testBAM(self):
- samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex5.bam"),
- "rb")
- self.assertEqual(len(list(samfile.fetch(until_eof=True))), 2)
- samfile.close()
-
-
-class TestPileupObjects(unittest.TestCase):
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
-
- def testPileupColumn(self):
- for pcolumn1 in self.samfile.pileup(region="chr1:105"):
- if pcolumn1.pos == 104:
- self.assertEqual(
- pcolumn1.tid, 0, "chromosome/target id mismatch in position 1: %s != %s" % (pcolumn1.tid, 0))
- self.assertEqual(
- pcolumn1.pos, 105 - 1, "position mismatch in position 1: %s != %s" % (pcolumn1.pos, 105 - 1))
- self.assertEqual(
- pcolumn1.n, 2, "# reads mismatch in position 1: %s != %s" % (pcolumn1.n, 2))
- for pcolumn2 in self.samfile.pileup(region="chr2:1480"):
- if pcolumn2.pos == 1479:
- self.assertEqual(
- pcolumn2.tid, 1, "chromosome/target id mismatch in position 1: %s != %s" % (pcolumn2.tid, 1))
- self.assertEqual(
- pcolumn2.pos, 1480 - 1, "position mismatch in position 1: %s != %s" % (pcolumn2.pos, 1480 - 1))
- self.assertEqual(
- pcolumn2.n, 12, "# reads mismatch in position 1: %s != %s" % (pcolumn2.n, 12))
-
- def testPileupRead(self):
- for pcolumn1 in self.samfile.pileup(region="chr1:105"):
- if pcolumn1.pos == 104:
- self.assertEqual(
- len(pcolumn1.pileups), 2,
- "# reads aligned to column mismatch in position 1"
- ": %s != %s" %
- (len(pcolumn1.pileups), 2))
-
-
-# self.assertEqual( pcolumn1.pileups[0] # need to test additional
-# properties here
-
- def tearDown(self):
- self.samfile.close()
-
- def testIteratorOutOfScope(self):
- '''test if exception is raised if pileup col is accessed after
- iterator is exhausted.'''
-
- for pileupcol in self.samfile.pileup():
- pass
-
- self.assertRaises(ValueError, getattr, pileupcol, "pileups")
-
-
-class TestContextManager(unittest.TestCase):
-
- def testManager(self):
- with pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, 'ex1.bam'),
- 'rb') as samfile:
- samfile.fetch()
- self.assertEqual(samfile._isOpen(), False)
-
-
-class TestExceptions(unittest.TestCase):
-
- def setUp(self):
- self.samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
-
- def testMissingFile(self):
-
- self.assertRaises(IOError, pysam.Samfile, "exdoesntexist.bam", "rb")
- self.assertRaises(IOError, pysam.Samfile, "exdoesntexist.sam", "r")
- self.assertRaises(IOError, pysam.Samfile, "exdoesntexist.bam", "r")
- self.assertRaises(IOError, pysam.Samfile, "exdoesntexist.sam", "rb")
-
- def testBadContig(self):
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr88")
-
- def testMeaninglessCrap(self):
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "skljf")
-
- def testBackwardsOrderNewFormat(self):
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, 'chr1', 100, 10)
-
- def testBackwardsOrderOldFormat(self):
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, region="chr1:100-10")
-
- def testOutOfRangeNegativeNewFormat(self):
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr1", 5, -10)
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr1", 5, 0)
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr1", -5, -10)
-
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, "chr1", 5, -10)
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, "chr1", 5, 0)
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, "chr1", -5, -10)
-
- def testOutOfRangeNegativeOldFormat(self):
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, region="chr1:-5-10")
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, region="chr1:-5-0")
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, region="chr1:-5--10")
-
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, region="chr1:-5-10")
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, region="chr1:-5-0")
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, region="chr1:-5--10")
-
- def testOutOfRangNewFormat(self):
- self.assertRaises(
- ValueError, self.samfile.fetch, "chr1", 9999999999, 99999999999)
- self.assertRaises(
- ValueError, self.samfile.count, "chr1", 9999999999, 99999999999)
-
- def testOutOfRangeLargeNewFormat(self):
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr1",
- 9999999999999999999999999999999, 9999999999999999999999999999999999999999)
- self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, "chr1",
- 9999999999999999999999999999999, 9999999999999999999999999999999999999999)
-
- def testOutOfRangeLargeOldFormat(self):
- self.assertRaises(
- ValueError, self.samfile.fetch, "chr1:99999999999999999-999999999999999999")
- self.assertRaises(
- ValueError, self.samfile.count, "chr1:99999999999999999-999999999999999999")
-
- def testZeroToZero(self):
- '''see issue 44'''
- self.assertEqual(len(list(self.samfile.fetch('chr1', 0, 0))), 0)
-
- def tearDown(self):
- self.samfile.close()
-
-
-class TestWrongFormat(unittest.TestCase):
-
- '''test cases for opening files not in bam/sam format.'''
-
- def testOpenSamAsBam(self):
- self.assertRaises(ValueError,
- pysam.Samfile,
- os.path.join(DATADIR, 'ex1.sam'),
- 'rb')
-
- def testOpenBamAsSam(self):
- # test fails, needs to be implemented.
- # sam.fetch() fails on reading, not on opening
- # self.assertRaises( ValueError, pysam.Samfile, 'ex1.bam', 'r' )
- pass
-
- def testOpenFastaAsSam(self):
- # test fails, needs to be implemented.
- # sam.fetch() fails on reading, not on opening
- # self.assertRaises( ValueError, pysam.Samfile, 'ex1.fa', 'r' )
- pass
-
- def testOpenFastaAsBam(self):
- self.assertRaises(ValueError,
- pysam.Samfile,
- os.path.join(DATADIR, 'ex1.fa'),
- 'rb')
-
-
-class ReadTest(unittest.TestCase):
-
- def checkFieldEqual(self, read1, read2, exclude=[]):
- '''check if two reads are equal by comparing each field.'''
-
- # add the . for refactoring purposes.
- for x in (".qname", ".seq", ".flag",
- ".rname", ".pos", ".mapq", ".cigar",
- ".mrnm", ".mpos", ".isize",
- ".qual",
- ".bin",
- ".is_paired", ".is_proper_pair",
- ".is_unmapped", ".mate_is_unmapped",
- ".is_reverse", ".mate_is_reverse",
- ".is_read1", ".is_read2",
- ".is_secondary", ".is_qcfail",
- ".is_duplicate"):
- n = x[1:]
- if n in exclude:
- continue
- self.assertEqual(getattr(read1, n), getattr(read2, n),
- "attribute mismatch for %s: %s != %s" %
- (n, getattr(read1, n), getattr(read2, n)))
-
-
-class TestAlignedRead(ReadTest):
-
- '''tests to check if aligned read can be constructed
- and manipulated.
- '''
-
- def testEmpty(self):
- a = pysam.AlignedRead()
- self.assertEqual(a.qname, None)
- self.assertEqual(a.seq, None)
- self.assertEqual(a.qual, None)
- self.assertEqual(a.flag, 0)
- self.assertEqual(a.rname, 0)
- self.assertEqual(a.mapq, 0)
- self.assertEqual(a.cigar, [])
- self.assertEqual(a.tags, [])
- self.assertEqual(a.mrnm, 0)
- self.assertEqual(a.mpos, 0)
- self.assertEqual(a.isize, 0)
-
-
- def testStrOfEmptyRead(self):
- a = pysam.AlignedRead()
- s = str(a)
- self.assertEqual(
- "None\t0\t0\t0\t0\tNone\t0\t0\t0\tNone\tNone\t[]",
- s)
-
-
- def buildRead(self):
- '''build an example read.'''
-
- a = pysam.AlignedRead()
- a.qname = "read_12345"
- a.seq = "ACGT" * 10
- a.flag = 0
- a.rname = 0
- a.pos = 20
- a.mapq = 20
- a.cigar = ((0, 10), (2, 1), (0, 9), (1, 1), (0, 20))
- a.mrnm = 0
- a.mpos = 200
- a.isize = 167
- a.qual = "1234" * 10
- # todo: create tags
- return a
-
- def testUpdate(self):
- '''check if updating fields affects other variable length data
- '''
- a = self.buildRead()
- b = self.buildRead()
-
- # check qname
- b.qname = "read_123"
- self.checkFieldEqual(a, b, "qname")
- b.qname = "read_12345678"
- self.checkFieldEqual(a, b, "qname")
- b.qname = "read_12345"
- self.checkFieldEqual(a, b)
-
- # check cigar
- b.cigar = ((0, 10), )
- self.checkFieldEqual(a, b, "cigar")
- b.cigar = ((0, 10), (2, 1), (0, 10))
- self.checkFieldEqual(a, b, "cigar")
- b.cigar = ((0, 10), (2, 1), (0, 9), (1, 1), (0, 20))
- self.checkFieldEqual(a, b)
-
- # check seq
- b.seq = "ACGT"
- self.checkFieldEqual(a, b, ("seq", "qual"))
- b.seq = "ACGT" * 3
- self.checkFieldEqual(a, b, ("seq", "qual"))
- b.seq = "ACGT" * 10
- self.checkFieldEqual(a, b, ("qual",))
-
- # reset qual
- b = self.buildRead()
-
- # check flags:
- for x in (
- "is_paired", "is_proper_pair",
- "is_unmapped", "mate_is_unmapped",
- "is_reverse", "mate_is_reverse",
- "is_read1", "is_read2",
- "is_secondary", "is_qcfail",
- "is_duplicate"):
- setattr(b, x, True)
- self.assertEqual(getattr(b, x), True)
- self.checkFieldEqual(a, b, ("flag", x,))
- setattr(b, x, False)
- self.assertEqual(getattr(b, x), False)
- self.checkFieldEqual(a, b)
-
- def testUpdate2(self):
- '''issue 135: inplace update of sequence and quality score.
-
- This does not work as setting the sequence will erase
- the quality scores.
- '''
- a = self.buildRead()
- a.seq = a.seq[5:10]
- self.assertEqual(a.qual, None)
-
- a = self.buildRead()
- s = a.qual
- a.seq = a.seq[5:10]
- a.qual = s[5:10]
-
- self.assertEqual(a.qual, s[5:10])
-
- def testLargeRead(self):
- '''build an example read.'''
-
- a = pysam.AlignedRead()
- a.qname = "read_12345"
- a.seq = "ACGT" * 200
- a.flag = 0
- a.rname = 0
- a.pos = 20
- a.mapq = 20
- a.cigar = ((0, 4 * 200), )
- a.mrnm = 0
- a.mpos = 200
- a.isize = 167
- a.qual = "1234" * 200
-
- return a
-
- def testTagParsing(self):
- '''test for tag parsing
-
- see http://groups.google.com/group/pysam-user-group/browse_thread/thread/67ca204059ea465a
- '''
- samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex8.bam"),
- "rb")
-
- for entry in samfile:
- before = entry.tags
- entry.tags = entry.tags
- after = entry.tags
- self.assertEqual(after, before)
-
- def testUpdateTlen(self):
- '''check if updating tlen works'''
- a = self.buildRead()
- oldlen = a.tlen
- oldlen *= 2
- a.tlen = oldlen
- self.assertEqual(a.tlen, oldlen)
-
- def testPositions(self):
- a = self.buildRead()
- self.assertEqual(a.positions,
- [20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29,
- 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39,
- 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49,
- 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59])
-
- self.assertEqual(a.aligned_pairs,
- [(0, 20), (1, 21), (2, 22), (3, 23), (4, 24),
- (5, 25), (6, 26), (7, 27), (8, 28), (9, 29),
- (None, 30),
- (10, 31), (11, 32), (12, 33), (13, 34), (14, 35),
- (15, 36), (16, 37), (17, 38), (18, 39), (19, None),
- (20, 40), (21, 41), (22, 42), (23, 43), (24, 44),
- (25, 45), (26, 46), (27, 47), (28, 48), (29, 49),
- (30, 50), (31, 51), (32, 52), (33, 53), (34, 54),
- (35, 55), (36, 56), (37, 57), (38, 58), (39, 59)])
-
- self.assertEqual(
- a.positions,
- [x[1] for x in a.aligned_pairs
- if x[0] is not None and x[1] is not None])
- # alen is the length of the aligned read in genome
- self.assertEqual(a.alen, a.aligned_pairs[-1][0] + 1)
- # aend points to one beyond last aligned base in ref
- self.assertEqual(a.positions[-1], a.aend - 1)
-
- def testBlocks(self):
- a = self.buildRead()
- self.assertEqual(a.blocks,
- [(20, 30), (31, 40), (40, 60)])
-
- # Disabled as not backwards compatible
- # def testFancyStr(self):
- # a = self.buildRead()
- # output = a.fancy_str()
- # self.assertEqual(len(output), 9)
-
-
-class TestDeNovoConstruction(ReadTest):
-
- '''check BAM/SAM file construction using ex6.sam
-
- (note these are +1 coordinates):
-
- read_28833_29006_6945 99 chr1 33 20 10M1D25M = 200 167 AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<< NM:i:1 RG:Z:L1
- read_28701_28881_323b 147 chr2 88 30 35M = 500 412 ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<< MF:i:18 RG:Z:L2
- '''
-
- header = {'HD': {'VN': '1.0'},
- 'SQ': [{'LN': 1575, 'SN': 'chr1'},
- {'LN': 1584, 'SN': 'chr2'}], }
-
- bamfile = os.path.join(DATADIR, "ex6.bam")
- samfile = os.path.join(DATADIR, "ex6.sam")
-
- def setUp(self):
-
- a = pysam.AlignedRead()
- a.qname = "read_28833_29006_6945"
- a.seq = "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG"
- a.flag = 99
- a.rname = 0
- a.pos = 32
- a.mapq = 20
- a.cigar = ((0, 10), (2, 1), (0, 25))
- a.mrnm = 0
- a.mpos = 199
- a.isize = 167
- a.qual = "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<"
- a.tags = (("NM", 1),
- ("RG", "L1"))
-
- b = pysam.AlignedRead()
- b.qname = "read_28701_28881_323b"
- b.seq = "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA"
- b.flag = 147
- b.rname = 1
- b.pos = 87
- b.mapq = 30
- b.cigar = ((0, 35), )
- b.mrnm = 1
- b.mpos = 499
- b.isize = 412
- b.qual = "<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<"
- b.tags = (("MF", 18),
- ("RG", "L2"))
-
- self.reads = (a, b)
-
- # TODO
- # def testSAMWholeFile(self):
-
- # tmpfilename = "tmp_%i.sam" % id(self)
-
- # outfile = pysam.Samfile(tmpfilename,
- # "wh",
- # header=self.header)
-
- # for x in self.reads:
- # outfile.write(x)
- # outfile.close()
- # self.assertTrue(checkBinaryEqual(tmpfilename, self.samfile),
- # "mismatch when construction SAM file, see %s %s" % (tmpfilename, self.samfile))
-
- # os.unlink(tmpfilename)
-
- def testBAMPerRead(self):
- '''check if individual reads are binary equal.'''
- infile = pysam.Samfile(self.bamfile, "rb")
-
- others = list(infile)
- for denovo, other in zip(others, self.reads):
- self.checkFieldEqual(other, denovo)
- self.assertEqual(other.compare(denovo), 0)
-
- # TODO
- # def testSAMPerRead(self):
- # '''check if individual reads are binary equal.'''
- # infile = pysam.Samfile(self.samfile, "r")
-
- # others = list(infile)
- # for denovo, other in zip(others, self.reads):
- # self.checkFieldEqual(other, denovo)
- # self.assertEqual(other.compare(denovo), 0)
-
- def testBAMWholeFile(self):
-
- tmpfilename = "tmp_%i.bam" % id(self)
-
- outfile = pysam.Samfile(tmpfilename, "wb", header=self.header)
-
- for x in self.reads:
- outfile.write(x)
- outfile.close()
-
- self.assertTrue(checkBinaryEqual(tmpfilename, self.bamfile),
- "mismatch when construction BAM file, see %s %s" % (tmpfilename, self.bamfile))
-
- os.unlink(tmpfilename)
-
-
-class TestDeNovoConstructionUserTags(TestDeNovoConstruction):
-
- '''test de novo construction with a header that contains lower-case tags.'''
-
- header = {'HD': {'VN': '1.0'},
- 'SQ': [{'LN': 1575, 'SN': 'chr1'},
- {'LN': 1584, 'SN': 'chr2'}],
- 'x1': {'A': 2, 'B': 5},
- 'x3': {'A': 6, 'B': 5},
- 'x2': {'A': 4, 'B': 5}}
-
- bamfile = os.path.join(DATADIR, "example_user_header.bam")
- samfile = os.path.join(DATADIR, "example_user_header.sam")
-
-
-class TestEmptyHeader(unittest.TestCase):
-
- '''see issue 84.'''
-
- def testEmptyHeader(self):
-
- s = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, 'example_empty_header.bam'))
- self.assertEqual(s.header, {'SQ': [{'LN': 1000, 'SN': 'chr1'}]})
-
-
-class TestBTagSam(unittest.TestCase):
-
- '''see issue 81.'''
-
- compare = [[100, 1, 91, 0, 7, 101, 0, 201, 96, 204, 0, 0, 87, 109, 0, 7, 97, 112, 1, 12, 78, 197, 0, 7, 100, 95, 101, 202, 0, 6, 0, 1, 186, 0, 84, 0, 244, 0, 0, 324, 0, 107, 195, 101, 113, 0, 102, 0, 104, 3, 0, 101, 1, 0, 212, 6, 0, 0, 1, 0, 74, 1, 11, 0, 196, 2, 197, 103, 0, 108, 98, 2, 7, 0, 1, 2, 194, 0, 180, 0, 108, 0, 203, 104, 16, 5, 205, 0, 0, 0, 1, 1, 100, 98, 0, 0, 204, 6, 0, 79, 0, 0, 101, 7, 109, 90, 265, 1, 27, 10, 109, 102, 9, 0, 292, 0, 110, 0, 0, 102, 112, 0, 0, 84, 100, 103, 2, 81, 126, 0, 2, 90, 0, 15, 96, 15, 1, 0, 2, 0, 107, 92, 0, 0, 101, 3, 98, 15, 102, 13, 116, 116, 90, 93, 198, 0, 0, 0, 199, 92, 26, 495, 100, 5, 0, 100, 5, 209, 0, 92, 107, 90, 0, 0, 0, 0, 109, 194, 7, 94, 200, 0, 40, 197, 0, 11, 0, 0, 112, 110, 6, 4, 200, 28, 0, 196, 0, 203, 1, 129, 0, 0, 1, 0, 94, 0, 1, 0, 107, 5, 201, 3, 3, 100, 0, 121, 0, 7, 0, 1, 105, 306, 3, 86, 8, 183, 0, 12, 163, 17, 83, 22, 0, 0, 1, 8, 109, 103, 0, 0, 295, 0, 200, 16, 172, 3, 16, 182, 3, 11, 0, 0, 223, 111, 103, 0, 5, 225, 0, 95],
- [-100, 200, -300, -400],
- [-100, 12],
- [12, 15],
- [-1.0, 5.0, 2.5]]
-
- filename = os.path.join(DATADIR, 'example_btag.sam')
-
- def testRead(self):
-
- s = pysam.Samfile(self.filename)
- for x, read in enumerate(s):
- if x == 0:
- self.assertEqual(read.tags, [('RG', 'QW85I'), ('PG', 'tmap'), ('MD', '140'), ('NM', 0), ('AS', 140), ('FZ', [100, 1, 91, 0, 7, 101, 0, 201, 96, 204, 0, 0, 87, 109, 0, 7, 97, 112, 1, 12, 78, 197, 0, 7, 100, 95, 101, 202, 0, 6, 0, 1, 186, 0, 84, 0, 244, 0, 0, 324, 0, 107, 195, 101, 113, 0, 102, 0, 104, 3, 0, 101, 1, 0, 212, 6, 0, 0, 1, 0, 74, 1, 11, 0, 196, 2, 197, 103, 0, 108, 98, 2, 7, 0, 1, 2, 194, 0, 180, 0, 108, 0, 203, 104, 16, 5, 205, 0, 0, 0, 1, 1, 100, 98, 0, 0, 204, 6, 0, 79, 0, 0, 101, 7, 109, 90, 265, 1, 27, 10, 109, 102, 9, 0, 292, 0, 110, 0, 0, 102, 112, 0, 0, 84, 100, 103, 2, 81, 126, 0, 2, 90, 0, 15, 96, 15, 1, 0, 2, 0, 107, 92, 0, 0, 101, 3, 98, 15, 102, 13, 116, 116, 90, 93, 198, 0, 0, 0, 199, 92, 26, 495, 100, 5, 0, 100, 5, 209, 0, 92, 107, 90, 0, 0, 0, 0, 109, 194, 7, 94, 200, 0, 40, 197, 0, 11, 0, 0, 112, 110, 6, 4, 200, 28, 0, 196, 0, 203, 1, 129, 0, 0, 1, 0, 94, 0, 1, 0, 107, 5, 201, 3, 3, 100, 0, 121, 0, 7, 0, 1, 105, 306, 3, 86, 8, 183, 0, 12, 163, 17, 83, 22, 0, 0, 1, 8, 109, 103, 0, 0, 295, 0, 200, 16, 172, 3, 16, 182, 3, 11, 0, 0, 223, 111, 103, 0, 5, 225, 0, 95]), ('XA', 'map2-1'), ('XS', 53), ('XT', 38), ('XF', 1), ('XE', 0)]
- )
-
- fz = dict(read.tags)["FZ"]
- self.assertEqual(fz, self.compare[x])
- self.assertEqual(read.opt("FZ"), self.compare[x])
-
- def testWrite(self):
-
- s = pysam.Samfile(self.filename)
- for read in s:
- before = read.tags
- read.tags = read.tags
- after = read.tags
- self.assertEqual(after, before)
-
-
-class TestBTagBam(TestBTagSam):
- filename = os.path.join(DATADIR, 'example_btag.bam')
-
-
-class TestDoubleFetch(unittest.TestCase):
- '''check if two iterators on the same bamfile are independent.'''
-
- filename = os.path.join(DATADIR, 'ex1.bam')
-
- def testDoubleFetch(self):
-
- samfile1 = pysam.Samfile(self.filename, 'rb')
-
- for a, b in zip(samfile1.fetch(multiple_iterators=True),
- samfile1.fetch(multiple_iterators=True)):
- self.assertEqual(a.compare(b), 0)
-
- def testDoubleFetchWithRegion(self):
-
- samfile1 = pysam.Samfile(self.filename, 'rb')
- chr, start, stop = 'chr1', 200, 3000000
- # just making sure the test has something to catch
- self.assertTrue(len(list(samfile1.fetch(chr, start, stop))) > 0)
-
- for a, b in zip(samfile1.fetch(chr, start, stop),
- samfile1.fetch(chr, start, stop,
- multiple_iterators=True)):
- self.assertEqual(a.compare(b), 0)
-
- def testDoubleFetchUntilEOF(self):
-
- samfile1 = pysam.Samfile(self.filename, 'rb')
-
- for a, b in zip(samfile1.fetch(until_eof=True),
- samfile1.fetch(until_eof=True,
- multiple_iterators=True)):
- self.assertEqual(a.compare(b), 0)
-
-
-class TestRemoteFileFTP(unittest.TestCase):
-
- '''test remote access.
-
- '''
-
- # Need to find an ftp server without password on standard
- # port.
-
- url = "ftp://ftp.sanger.ac.uk/pub/rd/humanSequences/CV.bam"
- region = "1:1-1000"
-
- def testFTPView(self):
- return
- if not checkURL(self.url):
- return
-
- result = pysam.view(self.url, self.region)
- self.assertEqual(len(result), 36)
-
- def testFTPFetch(self):
- return
- if not checkURL(self.url):
- return
-
- samfile = pysam.Samfile(self.url, "rb")
- result = list(samfile.fetch(region=self.region))
- self.assertEqual(len(result), 36)
-
-
-class TestRemoteFileHTTP(unittest.TestCase):
-
- url = "http://genserv.anat.ox.ac.uk/downloads/pysam/test/ex1.bam"
- region = "chr1:1-1000"
- local = os.path.join(DATADIR, "ex1.bam")
-
- def testView(self):
- if not checkURL(self.url):
- return
-
- samfile_local = pysam.Samfile(self.local, "rb")
- ref = list(samfile_local.fetch(region=self.region))
-
- result = pysam.view(self.url, self.region)
- self.assertEqual(len(result), len(ref))
-
- def testFetch(self):
- if not checkURL(self.url):
- return
-
- samfile = pysam.Samfile(self.url, "rb")
- result = list(samfile.fetch(region=self.region))
- samfile_local = pysam.Samfile(self.local, "rb")
- ref = list(samfile_local.fetch(region=self.region))
-
- self.assertEqual(len(ref), len(result))
- for x, y in zip(result, ref):
- self.assertEqual(x.compare(y), 0)
-
- def testFetchAll(self):
- if not checkURL(self.url):
- return
-
- samfile = pysam.Samfile(self.url, "rb")
- result = list(samfile.fetch())
- samfile_local = pysam.Samfile(self.local, "rb")
- ref = list(samfile_local.fetch())
-
- self.assertEqual(len(ref), len(result))
- for x, y in zip(result, ref):
- self.assertEqual(x.compare(y), 0)
-
-
-class TestLargeOptValues(unittest.TestCase):
-
- ints = (65536, 214748, 2147484, 2147483647)
- floats = (65536.0, 214748.0, 2147484.0)
-
- def check(self, samfile):
-
- i = samfile.fetch()
- for exp in self.ints:
- rr = next(i)
- obs = rr.opt("ZP")
- self.assertEqual(exp, obs,
- "expected %s, got %s\n%s" %
- (str(exp), str(obs), str(rr)))
-
- for exp in [-x for x in self.ints]:
- rr = next(i)
- obs = rr.opt("ZP")
- self.assertEqual(exp, obs,
- "expected %s, got %s\n%s" %
- (str(exp), str(obs), str(rr)))
-
- for exp in self.floats:
- rr = next(i)
- obs = rr.opt("ZP")
- self.assertEqual(exp, obs,
- "expected %s, got %s\n%s" %
- (str(exp), str(obs), str(rr)))
-
- for exp in [-x for x in self.floats]:
- rr = next(i)
- obs = rr.opt("ZP")
- self.assertEqual(exp, obs, "expected %s, got %s\n%s" %
- (str(exp), str(obs), str(rr)))
-
- def testSAM(self):
- samfile = pysam.Samfile(
- os.path.join(DATADIR, "ex10.sam"),
- "r")
- self.check(samfile)
-
- def testBAM(self):
- samfile = pysam.Samfile(
- os.path.join(DATADIR, "ex10.bam"),
- "rb")
- self.check(samfile)
-
-
-class TestPileup(unittest.TestCase):
- '''test pileup functionality.'''
-
- samfilename = "pysam_data/ex1.bam"
- fastafilename = "pysam_data/ex1.fa"
-
- def setUp(self):
-
- self.samfile = pysam.Samfile(self.samfilename)
- self.fastafile = pysam.Fastafile(self.fastafilename)
-
- def checkEqual(self, references, iterator):
-
- for x, column in enumerate(iterator):
- (contig, pos, reference_base,
- read_bases, read_qualities, alignment_mapping_qualities) \
- = references[x][:-1].split("\t")
- self.assertEqual(int(pos) - 1, column.pos)
-
- def testSamtoolsStepper(self):
- refs = pysam.mpileup(
- "-f", self.fastafilename,
- self.samfilename)
- iterator = self.samfile.pileup(
- stepper="samtools",
- fastafile=self.fastafile)
- self.checkEqual(refs, iterator)
-
- def testAllStepper(self):
- refs = pysam.mpileup(
- "-f", self.fastafilename,
- "-A", "-B",
- self.samfilename)
-
- iterator = self.samfile.pileup(
- stepper="all",
- fastafile=self.fastafile)
- self.checkEqual(refs, iterator)
-
-
-class TestLogging(unittest.TestCase):
-
- '''test around bug issue 42,
-
- failed in versions < 0.4
- '''
-
- def check(self, bamfile, log):
-
- if log:
- logger = logging.getLogger('franklin')
- logger.setLevel(logging.INFO)
- formatter = logging.Formatter(
- '%(asctime)s %(levelname)s %(message)s')
- log_hand = logging.FileHandler('log.txt')
- log_hand.setFormatter(formatter)
- logger.addHandler(log_hand)
-
- bam = pysam.Samfile(bamfile, 'rb')
- cols = bam.pileup()
- self.assertTrue(True)
-
- def testFail1(self):
- self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_fail.bam"),
- False)
- self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_fail.bam"),
- True)
-
- def testNoFail1(self):
- self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_nofail.bam"),
- False)
- self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_nofail.bam"),
- True)
-
- def testNoFail2(self):
- self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_nofail.bam"),
- True)
- self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_nofail.bam"),
- True)
-
-# TODOS
-# 1. finish testing all properties within pileup objects
-# 2. check exceptions and bad input problems (missing files, optional fields that aren't present, etc...)
-# 3. check: presence of sequence
-
-
-class TestSamfileUtilityFunctions(unittest.TestCase):
-
- def testCount(self):
-
- samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
-
- for contig in ("chr1", "chr2"):
- for start in range(0, 2000, 100):
- end = start + 1
- self.assertEqual(
- len(list(samfile.fetch(contig, start, end))),
- samfile.count(contig, start, end),
- 'number mismatch for %s:%i-%i %i != %i' % (
- contig, start, end,
- len(list(samfile.fetch(contig, start, end))),
- samfile.count(contig, start, end)))
-
- # test empty intervals
- self.assertEqual(
- len(list(samfile.fetch(contig, start, start))),
- samfile.count(contig, start, start),
- 'number mismatch for %s:%i-%i %i != %i' % (
- contig, start, start,
- len(list(samfile.fetch(contig, start, start))),
- samfile.count(contig, start, start)))
-
- # test half empty intervals
- self.assertEqual(len(list(samfile.fetch(contig, start))),
- samfile.count(contig, start))
-
- self.assertEqual(
- len(list(samfile.fetch(contig, start))),
- samfile.count(contig, start),
- 'number mismatch for %s:%i %i != %i' % (
- contig, start,
- len(list(samfile.fetch(contig, start))),
- samfile.count(contig, start)))
-
- def testMate(self):
- '''test mate access.'''
-
- with open(os.path.join(DATADIR, "ex1.sam"), "rb") as inf:
- readnames = [x.split(b"\t")[0] for x in inf.readlines()]
- if sys.version_info[0] >= 3:
- readnames = [name.decode('ascii') for name in readnames]
-
- counts = collections.defaultdict(int)
- for x in readnames:
- counts[x] += 1
-
- samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
-
- for read in samfile.fetch():
- if not read.is_paired:
- self.assertRaises(ValueError, samfile.mate, read)
- elif read.mate_is_unmapped:
- self.assertRaises(ValueError, samfile.mate, read)
- else:
- if counts[read.qname] == 1:
- self.assertRaises(ValueError, samfile.mate, read)
- else:
- mate = samfile.mate(read)
- self.assertEqual(read.qname, mate.qname)
- self.assertEqual(read.is_read1, mate.is_read2)
- self.assertEqual(read.is_read2, mate.is_read1)
- self.assertEqual(read.pos, mate.mpos)
- self.assertEqual(read.mpos, mate.pos)
-
- def testIndexStats(self):
- '''test if total number of mapped/unmapped reads is correct.'''
-
- samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
- self.assertEqual(samfile.mapped, 3235)
- self.assertEqual(samfile.unmapped, 35)
- self.assertEqual(samfile.nocoordinate, 0)
-
-
-class TestSamtoolsProxy(unittest.TestCase):
-
- '''tests for sanity checking access to samtools functions.'''
-
- def testIndex(self):
- self.assertRaises(IOError, pysam.index, "missing_file")
-
- def testView(self):
- # note that view still echos "open: No such file or directory"
- self.assertRaises(pysam.SamtoolsError, pysam.view, "missing_file")
-
- def testSort(self):
- self.assertRaises(pysam.SamtoolsError, pysam.sort, "missing_file")
-
-
-class TestSamfileIndex(unittest.TestCase):
-
- def testIndex(self):
- samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
- "rb")
- index = pysam.IndexedReads(samfile)
- index.build()
- reads = collections.defaultdict(int)
-
- for read in samfile:
- reads[read.qname] += 1
-
- for qname, counts in reads.items():
- found = list(index.find(qname))
- self.assertEqual(len(found), counts)
- for x in found:
- self.assertEqual(x.qname, qname)
-
-
-if __name__ == "__main__":
- # build data files
- print ("building data files")
- subprocess.call("make -C %s" % DATADIR, shell=True)
- print ("starting tests")
- unittest.main()
- print ("completed tests")
+++ /dev/null
-import sys
-import os
-
-IS_PYTHON3 = sys.version_info[0] >= 3
-
-if IS_PYTHON3:
- from itertools import zip_longest
- from urllib.request import urlopen
-else:
- from itertools import izip as zip_longest
- from urllib2 import urlopen
-
-
-def checkBinaryEqual(filename1, filename2):
- '''return true if the two files are binary equal.'''
- if os.path.getsize(filename1) != os.path.getsize(filename2):
- return False
-
- infile1 = open(filename1, "rb")
- infile2 = open(filename2, "rb")
-
- def chariter(infile):
- while 1:
- c = infile.read(1)
- if c == b"":
- break
- yield c
-
- found = False
- for c1, c2 in zip_longest(chariter(infile1), chariter(infile2)):
- if c1 != c2:
- break
- else:
- found = True
-
- infile1.close()
- infile2.close()
- return found
-
-
-def checkURL(url):
- '''return True if URL is available.
-
- A URL might not be available if it is the wrong URL
- or there is no connection to the URL.
- '''
- try:
- urlopen(url, timeout=1)
- return True
- except:
- return False
-
+++ /dev/null
-from pysam.calignmentfile cimport AlignmentFile, AlignedSegment
-from pysam.ctabix cimport Tabixfile
-
-cdef AlignmentFile samfile
-cdef Tabixfile tabixfile
-
-
-def testCountBAM(AlignmentFile samfile):
- '''test reading from a BAM file accessing
- the flag field directly.'''
-
- cdef AlignedSegment read
- cdef int n = 0
-
- for read in samfile.fetch():
- flag = read._delegate.core.flag
- n += 1
-
- return n
-
-def testCountGTF(Tabixfile tabixfile):
- '''test reading from a tabixfile.'''
-
- cdef int n = 0
-
- for entry in tabixfile.fetch():
- n += 1
-
- return n
+++ /dev/null
-# link against pysam
-def make_ext(modname, pyxfilename):
- from distutils.extension import Extension
- import pysam
- return Extension(name = modname,
- sources = [pyxfilename],
- include_dirs = pysam.get_include(),
- define_macros = pysam.get_defines())
+++ /dev/null
-from pysam.calignmentfile cimport AlignmentFile, AlignedSegment
-from pysam.calignmentfile cimport pysam_get_flag
-from pysam.calignmentfile cimport BAM_FPROPER_PAIR, BAM_FPAIRED
-
-def count(AlignmentFile samfile):
- cdef int is_proper = 0
- cdef int is_paired = 0
- cdef AlignedSegment read
- cdef int f
-
- for read in samfile:
- f = pysam_get_flag(read._delegate)
- if f & BAM_FPAIRED:
- is_paired += 1
- if f & BAM_FPROPER_PAIR:
- is_proper += 1
-
- return is_paired, is_proper
+++ /dev/null
-def make_ext(modname, pyxfilename):
- from distutils.extension import Extension
- import pysam
- return Extension(name=modname,
- sources=[pyxfilename],
- extra_link_args=pysam.get_libraries(),
- include_dirs=pysam.get_include(),
- define_macros=pysam.get_defines())
+++ /dev/null
-'''
-compile_test.py - check pyximport
-=================================
-
-test script for checking if compilation against
-pysam and tabix works.
-'''
-# clean up previous compilation
-import os
-try:
- os.unlink('_compile_test.c')
- os.unlink('_compile_test.pyxbldc')
-except OSError:
- pass
-
-
-import pyximport
-pyximport.install(build_in_temp=False)
-import _compile_test
-
-import unittest
-import pysam
-
-
-class BAMTest(unittest.TestCase):
-
- input_filename = "pysam_data/ex1.bam"
-
- def testCount(self):
-
- nread = _compile_test.testCountBAM(
- pysam.Samfile(self.input_filename))
- self.assertEqual(nread, 3270)
-
-
-class GTFTest(unittest.TestCase):
-
- input_filename = "tabix_data/example.gtf.gz"
-
- def testCount(self):
- nread = _compile_test.testCountGTF(
- pysam.Tabixfile(self.input_filename))
- self.assertEqual(nread, 237)
-
-if __name__ == "__main__":
- unittest.main()
+++ /dev/null
-import pysam
-
-import pyximport
-pyximport.install()
-import _cython_flagstat
-
-is_paired, is_proper = _cython_flagstat.count(
- pysam.AlignmentFile("ex1.bam", "rb"))
-
-print ("there are alignments of %i paired reads" % is_paired)
-print ("there are %i proper paired alignments" % is_proper)
-
+++ /dev/null
-import pysam
-import unittest
-import os
-
-DATADIR = "pysam_data"
-
-
-class TestFastaFile(unittest.TestCase):
-
- sequences = {
- 'chr1':
- b"CACTAGTGGCTCATTGTAAATGTGTGGTTTAACTCGTCCATGGCCCAGCATTAGGGAGCTGTGGACCCTGCAGCCTGGCTGTGGGGGCCGCAGTGGCTGAGGGGTGCAGAGCCGAGTCACGGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTCGTCTTCTTA",
- 'chr2':
- b"TTCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCCACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATGCCAGAAAAAAATATTTACAGTAACT",
- }
-
- def setUp(self):
- self.file = pysam.FastaFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.fa"))
-
- def testFetch(self):
- for id, seq in list(self.sequences.items()):
- self.assertEqual(seq, self.file.fetch(id))
- for x in range(0, len(seq), 10):
- self.assertEqual(seq[x:x + 10], self.file.fetch(id, x, x + 10))
- # test x:end
- self.assertEqual(seq[x:], self.file.fetch(id, x))
- # test 0:x
- self.assertEqual(seq[:x], self.file.fetch(id, None, x))
-
- # unknown sequence returns ""
- # change: should be an IndexError
- self.assertEqual(b"", self.file.fetch("chr12"))
-
- def testOutOfRangeAccess(self):
- '''test out of range access.'''
- # out of range access returns an empty string
- for contig, s in self.sequences.items():
- self.assertEqual(self.file.fetch(contig, len(s), len(s) + 1), b"")
-
- self.assertEqual(self.file.fetch("chr3", 0, 100), b"")
-
- def testFetchErrors(self):
- self.assertRaises(ValueError, self.file.fetch)
- self.assertRaises(IndexError, self.file.fetch, "chr1", -1, 10)
- self.assertRaises(ValueError, self.file.fetch, "chr1", 20, 10)
-
- # does not work yet
- # self.assertRaises( KeyError, self.file.fetch, "chrX" )
-
- def testLength(self):
- self.assertEqual(len(self.file), 2)
-
- def testSequenceLengths(self):
- self.assertEqual(1575, self.file.get_reference_length("chr1"))
- self.assertEqual(1584, self.file.get_reference_length("chr2"))
-
- def tearDown(self):
- self.file.close()
-
-
-class TestFastqFile(unittest.TestCase):
-
- def setUp(self):
- self.file = pysam.FastqFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.fq"))
-
- def testCounts(self):
- self.assertEqual(len([x for x in self.file]), 3270)
-
- def testMissingFile(self):
- self.assertRaises(IOError, pysam.FastqFile, "nothere.fq")
-
- def testSequence(self):
- s = self.file.__next__()
- # test first entry
- self.assertEqual(s.sequence, b"GGGAACAGGGGGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCC")
- self.assertEqual(s.quality, b"<<86<<;<78<<<)<;4<67<;<;<74-7;,;8,;")
- self.assertEqual(s.name, b"B7_589:1:101:825:28")
-
- for s in self.file:
- pass
- # test last entry
- self.assertEqual(s.sequence, b"TAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATAT")
- self.assertEqual(s.quality, b"<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;;;<<<;<<8;<;<")
- self.assertEqual(s.name, b"EAS56_65:8:64:507:478")
-
-if __name__ == "__main__":
- unittest.main()
+++ /dev/null
-SAM=$(wildcard *.sam)
-BAM=$(SAM:%.sam=%.bam)
-BAI=$(BAM:%.bam=%.bam.bai)
-
-# ex2.bam - bam file without index
-
-all: ex1.pileup.gz \
- ex1.sam ex1.bam \
- ex2.sam.gz ex2.sam ex2.bam \
- uncompressed.bam \
- $(BAM) $(BAI) \
- example_bai.bam \
- rg_with_tab.bam \
- ex2_truncated.bam \
- empty.bam empty.bam.bai
-
-# ex2.sam - as ex1.sam, but with header
-ex2.sam.gz: ex1.bam ex1.bam.bai
- samtools view -h ex1.bam | gzip > ex2.sam.gz
-
-#%.bam: %.sam ex1.fa.fai
-# samtools import ex1.fa.fai $< $@
-
-uncompressed.bam: ex2.sam
- samtools view -buS $< > $@
-
-%.bam: %.sam
- samtools view -bS $< > $@
-
-%.sam: %.sam.gz
- gunzip < $< > $@
-
-ex1.fa.fai:ex1.fa
- samtools faidx ex1.fa
-ex1.bam:ex1.sam.gz ex1.fa.fai
- samtools import ex1.fa.fai ex1.sam.gz ex1.bam
-
-%.bam.bai:%.bam
- samtools index $<
-
-ex1.pileup.gz:ex1.bam ex1.fa
- samtools pileup -cf ex1.fa ex1.bam | gzip > ex1.pileup.gz
-
-ex2_truncated.bam: ex2.bam
- head -c 124000 ex2.bam > ex2_truncated.bam
-
-empty.bam: ex2.sam
- grep "^@" $< | samtools view -Sb - > $@
-
-example_unmapped_reads_no_sq.bam: example_unmapped_reads_no_sq.sam
- touch tmp.list
- samtools import tmp.list $< $@
- rm -f tmp.list
-
-example_bai.bam: ex1.bam
- cp ex1.bam $@
- samtools index $@
- mv $@.bai example_bai.bai
-
-clean:
- rm -fr *.bam *.bai *.fai *.pileup* \
- *~ calDepth *.dSYM pysam_*.sam \
- ex2.sam ex2.sam.gz ex1.sam
+++ /dev/null
-chr1 10 100
-chr1 100 1000
+++ /dev/null
->chr1
-CACTAGTGGCTCATTGTAAATGTGTGGTTTAACTCGTCCATGGCCCAGCATTAGGGAGCT
-GTGGACCCTGCAGCCTGGCTGTGGGGGCCGCAGTGGCTGAGGGGTGCAGAGCCGAGTCAC
-GGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAG
-TCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTC
-AGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCAA
-CAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACC
-AAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCT
-CTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCA
-ATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGC
-AGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAAC
-AACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACAC
-ATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATAC
-CATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCT
-TTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTT
-TCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAAT
-GCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAAT
-ACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGA
-ACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTG
-TGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTA
-CGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAG
-TCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGC
-TTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTC
-TCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTG
-TTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTTGGG
-AGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATA
-TTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTC
-TCCCTCGTCTTCTTA
->chr2
-TTCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAG
-CTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCT
-TATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTT
-CAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAA
-AAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTT
-AGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATAC
-ATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAG
-GAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCAT
-CAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATT
-TTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTA
-AGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATA
-ATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAAT
-TAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATA
-AAACAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACC
-TCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATA
-GATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATT
-AATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCA
-AATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGT
-AAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATAT
-AACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAAT
-ACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGAT
-GATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTG
-CGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATA
-GCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAA
-AAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCCACTTTGGAAAACAA
-TTTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATGC
-CAGAAAAAAATATTTACAGTAACT
+++ /dev/null
-@B7_589:1:101:825:28
-GGGAACAGGGGGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCC
-+
-<<86<<;<78<<<)<;4<67<;<;<74-7;,;8,;
-@B7_589:1:101:825:28
-TGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTAT
-+
-0;0'0;<<<<<<8<;<<<<;;3<<;;<<<8<<<<<
-@B7_589:1:110:543:934
-AAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACT
-+
-<<<<<5<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<
-@B7_589:1:110:543:934
-ACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACT
-+
-<<<<<<<<<<<<;<<<<<;;<<<;;<<<<<,,;<<
-@B7_589:1:122:337:968
-ACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCACT
-+
-<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;<;;;;
-@B7_589:1:122:337:968
-GCTTTACTGTCTAAACTATGAAGAGACTATTGCCA
-+
-%454<75!7<+!990<9<6<<<<6<</<<<<<<<<
-@B7_589:1:122:77:789
-ACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAA
-+
-<<<:<4<<9<:7<<<:<<<7<<<<<<<<<<9<9<<
-@B7_589:1:122:77:789
-GGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAA
-+
-9<;<:<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_589:1:168:69:249
-ATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;<
-@B7_589:1:168:69:249
-TTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACA
-+
-;0;<;;<<<<<<<<<<<<<;<<<8<<<<<<<<<<<
-@B7_589:1:29:529:379
-CAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAAT
-+
-<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<;<672;<<<
-@B7_589:1:29:529:379
-GACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTT
-+
-;<<<:<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_589:2:30:644:942
-TACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGAT
-+
-85%+;<<9;<9<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_589:2:30:644:942
-TATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<9;<9<
-@B7_589:2:73:730:487
-AGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<:<<<;<;<<
-@B7_589:2:73:730:487
-TAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTA
-+
-<;;<<2;<;<<<;0<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_589:2:9:49:661
-TACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAA
-+
-<<6<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<
-@B7_589:2:9:49:661
-TGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGCGGAAATAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;:<<;;;7<9;9
-@B7_589:3:71:478:175
-ACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGT
-+
-<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<<;
-@B7_589:3:71:478:175
-TAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCA
-+
-<<<<;<96<<<<;<<<<<<<<<77<<<<<<<<<<;
-@B7_589:3:82:13:897
-ATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCAGCAGAATA
-+
-<<<<;<<<<<<;<;<;5<51;<1<<<<%<<<<,58
-@B7_589:3:82:13:897
-CATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCT
-+
-,<2<;<<;<<<<;;;<<;<<<<<<<;;;;<<<<<<
-@B7_589:4:54:989:654
-ACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<9<<<<<1<<<88;
-@B7_589:4:54:989:654
-TCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTT
-+
-,<1<2<<<;9)9<<;<<;<<<4<<<;<<<<<<<<<
-@B7_589:5:147:405:738
-AGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;
-@B7_589:5:147:405:738
-ATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAA
-+
-<9/<:<<<<<<<<7</<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_589:5:198:564:731
-ACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCA
-+
-<6<;<<<<<<:7<<;<<<8<<+<<<<<<<<<<<<<
-@B7_589:5:198:564:731
-ATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTA
-+
-<<<<<;<<<<<<;<<:<<;9<<<<<<<<1;<<58<
-@B7_589:5:50:950:562
-CTATTTTTGTCTTGACACCCTACTAATATTTGTCT
-+
-<<3<<<8<;<<<<<<+<<8<&<<<<7<<<<<<<<<
-@B7_589:5:50:950:562
-GCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<&<<8<<<<<<<5<:<+<:+;
-@B7_589:5:68:440:424
-ACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_589:5:68:440:424
-TGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACAC
-+
-<<2<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_589:6:108:958:42
-AAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTA
-+
-<<<;;</<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+
-@B7_589:6:108:958:42
-TATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<<<<<<9<<;<5<:
-@B7_589:6:114:714:317
-AACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGC
-+
-;8<;:<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_589:6:114:714:317
-TGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<5;<;
-@B7_589:6:120:14:944
-CAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACA
-+
-:;<<;<;<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_589:6:120:14:944
-CAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<<<<:;8;;7
-@B7_589:6:33:356:636
-TTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
-+
-<<<<<<<8;<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<;;3&3
-@B7_589:7:112:203:90
-CCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCT
-+
-;<;:;<;;;<<<<<<<<<:<<<7<<<<<<<<<<<<
-@B7_589:7:112:203:90
-CTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGA
-+
-<<:<<<<<<<<.<<<<<<<<<<<<6<:867<8884
-@B7_589:7:154:26:712
-ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAAC
-+
-<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
-@B7_589:7:154:26:712
-TTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAA
-+
-;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_589:7:72:916:763
-CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGT
-+
-<;;:<<<<<<<;<<;;;<<<<<<<<<;;<;<<<<<
-@B7_589:7:72:916:763
-GTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGT
-+
-</:8<8)<<<<:<<<<<;.89<:67<.;<<7+336
-@B7_589:7:76:306:561
-GGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAA
-+
-9<7<<9<<<<<<7<<71<71*7<<<<<<<<<<1<<
-@B7_589:7:76:306:561
-TACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAAC
-+
-<<)<<<<<<8<<8<<<<<<<;;;<<1<<3;=7<<9
-@B7_589:7:93:634:323
-CTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<,<<<
-@B7_589:7:93:634:323
-TAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAA
-+
-<<<<;<;<<<<;;<<2<:<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_589:8:113:968:19
-GAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATA
-+
-8;<;8;9<<<<<<<9<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<
-@B7_589:8:118:829:36
-AGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTC
-+
-<8<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_589:8:118:829:36
-TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTT
-+
-<<<<<<<<<:<2<<<<<<:<<<<<<<<<<<<71;<
-@B7_589:8:139:727:808
-AAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGC
-+
-<<;<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_589:8:139:727:808
-ACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<:<;<<<<<<<<9;<;9<6;<<9
-@B7_589:8:157:935:374
-CAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGA
-+
-<<<<<<<<<<;<<;;<<<<<<<<<::8'5++;+11
-@B7_589:8:157:935:374
-TCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCA
-+
-94988994.<:<+42::<<<<<:<:<4<<<<;<1<
-@B7_589:8:2:434:715
-AGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCT
-+
-<<<<<<<<<:;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_589:8:2:434:715
-CTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<0<<<68<<<+
-@B7_589:8:74:674:124
-CACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGG
-+
-<<<<<<<<<<<<:<;<<<<;<<<<;9;<<;;.;;;
-@B7_589:8:74:674:124
-TTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATAT
-+
-;;;;;<<:<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:1:191:462:705
-CAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<::<6
-@B7_591:1:191:462:705
-CATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAG
-+
-<<'<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:1:60:837:923
-CATCAACCGCATACACTCACATGGTTTAGGGGTATA
-+
-0<4<<<02.<99+<+&!<<<<+<<<<<<<<<<<<3<
-@B7_591:1:60:837:923
-TTCACGCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTCTGA
-+
-<<<<<4<<+<<*<<<<88<<<<<'*<4-+<<4&<40
-@B7_591:2:123:924:645
-TATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGT
-+
-;<<<<*<<<<<<</7<2<8<<<<<<<4<<<<<<<<<
-@B7_591:2:123:924:645
-TGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<6:<7<1<+<
-@B7_591:2:134:868:252
-AAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<:<<<
-@B7_591:2:134:868:252
-ATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGA
-+
-<;<<<8<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:2:13:100:876
-ACAGGGATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGT
-+
-<8<<<*<2<7<<<6<<<<<<6<<8<<<<5<<<<4<9
-@B7_591:2:13:100:876
-AGAATATATAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCT
-+
-;9<$<<<$<<<<<<<<75<<<<<<<9<9<<<<<<<<
-@B7_591:2:223:583:968
-AATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAA
-+
-<<<<<<<29<<<<4<<<<<<<<<<<7<<7<..<<47
-@B7_591:2:223:583:968
-TATGAGGCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAG
-+
-1<';<<&%-:<<<<<:66%<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:2:240:603:890
-GCTCCCAAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCA
-+
-;+&+//&<<<<<<<<<<9<<<8<<<<9<<<<<<<<<
-@B7_591:2:240:603:890
-TCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<:<<;<<<<<8865
-@B7_591:2:279:124:41
-GAATTAACCCAGTCAGACAAAAANNAAGAAAAAAGA
-+
-<<<<<<<7/<8<<<<<<<<<<4*!!<<7<7<<5<<3
-@B7_591:2:279:124:41
-GCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAA
-+
-:17<8<<<:&<<<<<<:;'<<<<<<<<<<;<<<<<<
-@B7_591:2:27:280:592
-AATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGC
-+
-<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:2:27:280:592
-AGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<5<
-@B7_591:2:309:798:997
-TTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT
-+
-466;<<744077+&7097&%&4<9<<<9<<<::<<<
-@B7_591:2:323:639:311
-AAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTAGGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<<<;<<<<<<81<
-@B7_591:2:323:639:311
-TACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAA
-+
--94<<<<<<<4<<<<<<<<2<<<<<7<<<-<<<<<<
-@B7_591:2:46:220:58
-CAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<:<;
-@B7_591:2:46:220:58
-TTCCACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTT
-+
-98<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:3:168:69:605
-TACCCGAGGGATGGAGGGTAGAGGGACGCTGAAGTG
-+
-<<<4(<<<<<<<<<<<<<(1<6<-<2<<7<<6<<++
-@B7_591:3:168:69:605
-TCTGACAGGCGGCAACTGTGAGCCATCACAATGAAC
-+
-'<'<144<0<&<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:3:179:496:161
-AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAA
-+
-<<<<<9<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:3:179:496:161
-AAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+
-@B7_591:3:277:458:330
-AATGTCAGGGAAGGAGCCTTTTGTCAGTTACCAAAT
-+
-<<7<<<<<<<<<2<<<%,<6<&<<,<<<<:<<<<(7
-@B7_591:3:277:458:330
-TGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGAC
-+
-<<<<<8;<<<1<;7<<<;<<<<<<<<7<<7<<<<;7
-@B7_591:3:291:404:199
-TATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGG
-+
-<<<<<<<7<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:3:291:404:199
-TGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:
-@B7_591:3:305:565:952
-GTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGT
-+
-5(<1<147<81<*8--8<<<7<91<<<;+<+<<<<<
-@B7_591:3:305:565:952
-TAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTG
-+
-7<<<<<<<<<7<<<<<<<<<7<<<;;<;<;<<<<<+
-@B7_591:3:45:294:380
-ATAATTGTGTCCATGTACACACGATGTCATATGTAC
-+
-<<<<<<<<9<<<<<<<<<70<<7<6272&:3<+</%
-@B7_591:3:45:294:380
-CCTCGTCCACACTGGTTCGCTTGAAAGCTTGGGCTG
-+
-;<+<7<<<<;7<,<7<<<+/7;<<;<<;7<<<;<<<
-@B7_591:4:103:111:720
-CAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<5;<5<:;
-@B7_591:4:103:111:720
-TCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAG
-+
-;4<<<;)<<-<9<;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:4:159:508:571
-CAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
-@B7_591:4:159:508:571
-TGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATG
-+
-9<6<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:4:216:650:516
-GAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
-@B7_591:4:216:650:516
-TTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT
-+
-;9;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:4:329:339:408
-CAATCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTC
-+
-7<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:4:329:339:408
-TAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<;
-@B7_591:4:92:411:955
-GGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;
-@B7_591:4:92:411:955
-TACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCA
-+
-2<+<<<<9<<<<<<<;+<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:5:124:978:501
-AATTTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTC
-+
-<9<;<<::<;<<;<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:5:124:978:501
-ATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
-@B7_591:5:134:751:831
-AGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<948
-@B7_591:5:134:751:831
-ATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC
-+
-;:<4<8<<<;<;<<5<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:5:243:557:560
-AAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA
-+
-<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<89<<9<;
-@B7_591:5:243:557:560
-CTAAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGAT
-+
-69&<;&<&<<;6.<<<+<<<;;<<<<<<<<;<<<<<
-@B7_591:5:254:542:848
-CCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAA
-+
-<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;4<;8<<<;;9<9;8;9
-@B7_591:5:254:542:848
-CTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAAC
-+
-,:4<8<<<<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:5:289:132:526
-CACCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<
-@B7_591:5:289:132:526
-TCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCT
-+
-;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:5:42:540:501
-CTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATT
-+
-;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:5:90:828:633
-CTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAG
-+
-<<<;<;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:5:90:828:633
-GGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATG
-+
-<<<<<<<<<<<8<;96<;<<<<<99<2<<;<96<8;
-@B7_591:6:11:646:628
-GTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTAC
-+
-<<<3<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<6<
-@B7_591:6:11:646:628
-TTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATG
-+
-<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<</<;<<<<<<6<;
-@B7_591:6:155:12:674
-CTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATT
-+
-;<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<8<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:6:181:191:418
-AAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<988
-@B7_591:6:181:191:418
-AGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:6:190:42:671
-TATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:6:190:42:671
-TGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCA
-+
-<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:6:29:575:453
-TACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATTTAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<1<:<9<&<98
-@B7_591:6:29:575:453
-TCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTG
-+
-;<<<;;<:<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<
-@B7_591:7:116:814:89
-ACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAA
-+
-:38<;<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
-@B7_591:7:116:814:89
-CCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<;<<;<<66<
-@B7_591:7:129:956:115
-AGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATAC
-+
-<<:<9<4<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:7:129:956:115
-GCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;877-
-@B7_591:7:157:447:758
-AAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGA
-+
-<<<;<<5<</<<6<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:7:157:447:758
-ACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<
-@B7_591:7:200:192:373
-AGTGCCTTTGTTCACATAGACCCCCTTGCAACAACC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<;5<<;<<
-@B7_591:7:200:192:373
-CTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGAC
-+
-<<<8<<<4<4<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:7:22:632:176
-AAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATT
-+
-<9<<<<<<<-;<;<<7;6;<<<<<<<<<;<<<<<<<
-@B7_591:7:22:632:176
-AGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAA
-+
-<<<<<;<<<<<<;<<;<:<<<:<<:<<<;<<<;;;:
-@B7_591:7:68:242:834
-AAATAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTAT
-+
-<<68<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_591:7:68:242:834
-TACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<
-@B7_591:7:89:67:709
-TTTTTTTTTTTGTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTT
-+
-:7:::9:7:<<7<'<<477<<<<<<<<<:<<<<<:<
-@B7_591:8:4:841:340
-TTCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAA
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<;<;:<<<<<<<;;
-@B7_593:1:12:158:458
-CTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCT
-+
-<77<<<7<<<<<<<<<<<<5<4;<<;5<;;+2<+;;
-@B7_593:1:12:158:458
-TAATAATGCTACATGGATGATTATGAAATCAATGTT
-+
-++++++$((+*+++++++++++++&+++++++++++
-@B7_593:1:189:876:833
-CAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAG
-+
-<<<<<<<<<<<8<8<<<<<;<;;<<;<<<<<;<<<6
-@B7_593:1:189:876:833
-TTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTA
-+
-7;<<<<:;;<</<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:1:19:695:59
-AACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTT
-+
-<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<;;<;<<7<<<<;
-@B7_593:1:19:695:59
-GTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAAT
-+
-;+;8<<<<<<<<<<<5<<+<:<<;<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:1:200:559:765
-GGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<;<<;;4<7<9;<<-;
-@B7_593:1:200:559:765
-TGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATT
-+
-8<;;4<3;<;<<<<<<5<<;;<<98;;<<<<;<<<<
-@B7_593:1:215:861:605
-GAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTC
-+
-;<<<<<;:<7:<<<;<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:1:215:861:605
-NAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACA
-+
-!+++++++++++++++++++++++++++++++++++
-@B7_593:1:36:485:632
-AAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<;<18;
-@B7_593:1:36:485:632
-GGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCT
-+
-0;;;<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<
-@B7_593:1:85:361:418
-AGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTT
-+
-;;;5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:1:85:361:418
-GAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATG
-+
-<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;4;<<<<3
-@B7_593:2:104:744:280
-CATATGGAAAGGTTGTTGGGATTTTTTTAATGATTC
-+
-'&+74*0<'/.47:8<<<<;<7''6/1<<<.<<68<
-@B7_593:2:104:744:280
-TGGGCTGTAATGATGCCCCTTGTCCATCACCCGGTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<:4<<4<<0<;80+;:
-@B7_593:2:125:875:553
-AACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<;
-@B7_593:2:125:875:553
-TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTA
-+
--;<;:;<<;6<<<<<<6<;<:<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:2:128:555:941
-AACCAAAAGAGAGAAGGAGTAGTTATACACATATCA
-+
-55--555560355$55555555.57757$7555577
-@B7_593:2:133:460:542
-CCTATAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATT
-+
-<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;
-@B7_593:2:133:460:542
-TTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGA
-+
-;:;7;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:2:259:467:737
-CTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAA
-+
-8<<<<<<<:<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:2:259:467:737
-TCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCA
-+
-<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<'<<.<<<<<<;;;<67
-@B7_593:2:270:430:269
-AAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;7;:
-@B7_593:2:270:430:269
-CCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAA
-+
-28<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:2:273:348:37
-AGAAATGCGCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAA
-+
-9;7;;0<++1<<<;<7<+;;1<<<;<17<<<<<<<<
-@B7_593:2:273:348:37
-GAATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACACG
-+
-<<<<<<<9<49<<<;<<<<*<<19<15;<</5<;.5
-@B7_593:2:313:531:169
-GAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATG
-+
-<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<:<<:<;<<;<2
-@B7_593:2:313:531:169
-GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATT
-+
-98;<;;<<;8<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<8<<<<<
-@B7_593:2:43:239:977
-TGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;7;<;
-@B7_593:2:68:140:542
-AAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGT
-+
-;;<<;7<<<<<<:<<<:<<<:<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:2:68:140:542
-GGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAAT
-+
-<<<8;<<;<<<<<;<<;<<<<<8;<-<8<82;;;-8
-@B7_593:2:68:692:347
-TATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCATGGAGC
-+
-<<<<<<<<<+6<;<<<<3<:<<<<6<8<<<&*/;*0
-@B7_593:2:68:692:347
-TGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTT
-+
-9<;;;;<<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:2:81:435:410
-AGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGT
-+
-;<;;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:2:81:435:410
-ATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<;<<;;
-@B7_593:3:102:856:670
-AAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAG
-+
-<<<<<<<;<<<;<<;:<<<<<<<<<<:;;<<;<<<7
-@B7_593:3:102:856:670
-AGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCA
-+
-;;<<<<:<<<:<<4<<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<
-@B7_593:3:115:649:259
-ATTAATTGAGAATACAGAGCAACTAGGTAAAAAATT
-+
-;<;<<;<<<<;&<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:3:115:649:259
-GGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<9
-@B7_593:3:148:437:481
-CGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<;0;8
-@B7_593:3:148:437:481
-GTACTGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTT
-+
-<<<;<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:3:180:89:582
-ATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTA
-+
-<<<<<<<<<7<<<<<<<<<7<<<:<<<:<<::77:<
-@B7_593:3:180:89:582
-TAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCAT
-+
-;<<<<<<4<<<:<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<;<<<
-@B7_593:3:194:168:684
-AAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGT
-+
-;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:3:194:168:684
-CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<.<<6-<<
-@B7_593:3:196:11:27
-AAGACCCAGTTAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGC
-+
-96&6<'<7:!!<,:;+7<<6:<<<<<<<<<7<7;:<
-@B7_593:3:196:11:27
-CTATGTTTCTTATCTGCNCATTACTACCCTGCAATT
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<8!4<<<;+<88;8<+2,8<;
-@B7_593:3:303:131:673
-ACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;;;
-@B7_593:3:303:131:673
-ATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATC
-+
-<;<<<<<<<<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:3:310:193:629
-CATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<;
-@B7_593:3:310:193:629
-TACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATAT
-+
-9<9<6;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:4:104:153:698
-CCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAG
-+
-;<<<<<<;6<<<<<<<<<<;<<<<;<;;;<.<::50
-@B7_593:4:104:153:698
-CTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTT
-+
-69<<)9<<:5:6<<<16:<6/<6<1<<<<<:<:<<<
-@B7_593:4:106:316:452
-CTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATT
-+
-:<<<<<;<<<<:<<:<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:4:142:63:937
-GAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<;<<:<<:<:
-@B7_593:4:142:63:937
-TTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATG
-+
-;;;<;<<<<;<<<<<;:<<<<<<<;<<<<<<<<<<<
-@B7_593:4:28:781:723
-AATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTC
-+
-<<<<<<<<<7<<<;;<<;;<<;<5<4<7<;7<+:<9
-@B7_593:4:28:781:723
-ACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAG
-+
-8488<::;4;;<:;;;::<;7<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:4:29:794:282
-CACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<&<<;:<<8<<8
-@B7_593:4:29:794:282
-TAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTG
-+
-7<<<<45::-<<<<<;<<-;<<;<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:4:30:117:411
-TCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACA
-+
-;88<<<<<:<7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:4:30:117:411
-TCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<:<<<<<<<<<:
-@B7_593:4:30:812:345
-TATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTA
-+
-;<;<<<<5<<<:<;<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:4:30:812:345
-TCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTC
-+
-<<<<<<<7<;<<7<;77;3<&0-;<5<;6<1'13<:
-@B7_593:4:315:201:673
-AAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<:;
-@B7_593:4:315:201:673
-TTGGACTTATTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACAC
-+
-;;;;<-;;&;;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:5:171:343:758
-ACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGA
-+
-:+;;<<<<<;<;:<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:5:171:343:758
-GCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<59<<<9;<<3
-@B7_593:5:267:71:603
-TTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<9;
-@B7_593:5:267:71:603
-TTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTG
-+
-9;;<;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
-@B7_593:5:299:743:762
-AAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATA
-+
-;<<<1<<<<<+<;<;7<<;<<<<<<<<<;<<;;<<7
-@B7_593:5:299:743:762
-CAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAG
-+
-<<<;<<<<<<<<<:;<<<.<:<<<<<<<<<<;;;;;
-@B7_593:5:30:599:589
-CTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGCAGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;<&<<;
-@B7_593:5:30:599:589
-TCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGA
-+
-90<;<<<<<<<<+<<<;;<;<;<<<<<<<<6<<8<<
-@B7_593:6:118:121:760
-GAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAA
-+
-:<<<;;<<<<6<;<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:6:119:428:415
-GCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCA
-+
-84<<<<;;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:6:119:428:415
-TAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;;<;;;
-@B7_593:6:185:96:948
-CTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATA
-+
-6<;;<;<<;<<<<<747<<<<<<<<77<<<<<<<<<
-@B7_593:6:185:96:948
-TTTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGAT
-+
-<<<<<<<<<;6<<<<<<<<<;<<<;;<<<<<<<;<;
-@B7_593:6:38:332:54
-CCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAG
-+
-<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<0;;;<;;
-@B7_593:6:38:332:54
-TGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATAT
-+
-8;;&<;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:6:61:628:681
-CAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTT
-+
-95<<<<<<<<;<<<<;<<<:<<;;<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:6:61:628:681
-GCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<:<<;;;;;;
-@B7_593:7:15:244:876
-AAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGTGAGTATA
-+
-;<<<7<<<<<.2<-<<<<<<<<<:<<<<<<<<<2<<
-@B7_593:7:15:244:876
-GTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCA
-+
-<<<<<<;<<<<<<<<;<<;;;<<<<<:<<<9;<<<;
-@B7_593:7:189:530:40
-AAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATAC
-+
-<<<<<<<<<<;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<;<<<;
-@B7_593:7:189:530:40
-CCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTT
-+
-883;<<<<<<<<<:<<<<<<<<3<;<<<<<<<<;<<
-@B7_593:7:256:354:173
-CATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<;
-@B7_593:7:256:354:173
-TCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAAT
-+
--9<<:9<<;6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:7:283:186:707
-AATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<;<<<<8
-@B7_593:7:283:186:707
-CGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAAATT
-+
-889;<7;<7<<7<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:7:307:481:625
-AAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;9<;
-@B7_593:7:307:481:625
-TCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGA
-+
-;4<<4<;;<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:7:67:302:762
-GTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCC
-+
-:8;88<;<<<;<<8<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_593:7:67:302:762
-TTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;65;<-<;<:8<<<3
-@B7_593:7:6:585:132
-GCCCCTTGACCACCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCT
-+
-:<473$'<+5;7*+<7<&<37<7<<<<7;;7<<:<7
-@B7_593:7:6:585:132
-TGTACTTATCATGTTTCTTTCCTAATTTTTCAATTA
-+
-6666166&6)+61))646+6&)&%&-44))1'144'
-@B7_593:7:87:89:696
-TGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:;<<<;<<
-@B7_593:7:87:89:696
-TTCCTATGGAAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGAT
-+
-;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:1:209:345:87
-AAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGT
-+
-<<;<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:1:209:345:87
-TTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTTTTTGAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<-<<<6<<<+8<
-@B7_595:1:209:653:400
-AGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTA
-+
-<69<98<+<<6<<4<<<<</4<<:<4<<<<<<<<<
-@B7_595:1:209:653:400
-CTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCT
-+
-<;<9<<+<2<9<,;;64;<<<<;8<00*1<48:+8
-@B7_595:1:252:19:955
-AGCCAGTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTCC
-+
-<8<884<<<<<<68<<<<<<<2<;<<;<+<<<;<<
-@B7_595:1:252:19:955
-TGAACAAAAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGA
-+
-<<<<<<<<<<4<<<<9<<+9)9<<4:9+<<0<909
-@B7_595:1:81:1000:375
-ACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGC
-+
-;8<;+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:1:81:1000:375
-NATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAA
-+
-!.............................+.(+.
-@B7_595:2:178:77:424
-CTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTACA
-+
-:5:8<;<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:2:178:77:424
-TGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<6<<;<<<<<<<<6<;<<<<6
-@B7_595:2:251:121:479
-GGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGG
-+
-<<<<<<<<<<<;:<<<<;:;:<:<;:188;7:<+(
-@B7_595:2:251:121:479
-GGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTG
-+
-<<<<<6'..663;&<<;<<9<<<9<<<<<<<<<<<
-@B7_595:2:29:729:70
-AAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATAC
-+
-<<<:<<<<<<7<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:2:29:729:70
-ANTATTANCTTTGANNAAAAAGGGATTAAATTCCC
-+
-:!<:<<8!::::5:!!:.77::33888633:8777
-@B7_595:3:229:543:583
-ATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACAC
-+
-</<;+5<855;<6<<<<;<<<<<<9<<<<<<<<<<
-@B7_595:3:229:543:583
-TCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAA
-+
-<<<<<<<<<<8<8<9<<<<8<<588<<<<*<2:2*
-@B7_595:3:297:637:86
-CAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCC
-+
-<<<<<<<<<<<<;+<+;<;<:<<<<<9<<957<;(
-@B7_595:3:297:637:86
-TCTCAGCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCG
-+
-<:75<;<;;<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:3:57:735:151
-CTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTC
-+
-<<<<<<<<8<<8<:<<*<:<<<4<<<;,<<<<:<:
-@B7_595:3:57:735:151
-TAAACTCTCACCTTATTGCTGCATCCCTGTCTTCC
-+
-07;+79:;<)<<9<+8<:<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:3:85:964:950
-AACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;:
-@B7_595:3:85:964:950
-GAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAG
-+
-<<8::<<;;<<<;<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:4:12:402:843
-AGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;<
-@B7_595:4:12:402:843
-ATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATG
-+
-<7<+<<11<9<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:4:319:250:718
-AAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTG
-+
-<;:<<<<;<<<:<<<<<<49:<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:4:319:250:718
-AGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAG
-+
-<<<<<<<<<<<;<<5<5;<851;85;)9;;8594;
-@B7_595:4:58:703:72
-GTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCT
-+
-5&<<7;+95;7'6<<<<<.<<<<<;<<9<7<<<<<
-@B7_595:4:58:703:72
-TCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCC
-+
-2<7<<<<<<<<<<<8:<<<<8<(<8<:::8.::<3
-@B7_595:4:84:802:737
-CATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAG
-+
-+<1<-;69;;;;8;:<<6<;<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:4:84:802:737
-CTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCAAG
-+
-<<<<<<<<<<;9<9<<<;<<;73;<<<<<37;1+.
-@B7_595:5:184:912:258
-ATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
-@B7_595:5:184:912:258
-GTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAG
-+
-<;;<<<<;:<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:5:36:649:554
-AAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGA
-+
-<<<<<888;<<<;<<<;<;<8<<<<8<<<<<<<<<
-@B7_595:5:36:649:554
-CAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGA
-+
-<<<<<4<<8<<<<<<8<6<<88<<<<<<<-;<;0;
-@B7_595:5:84:91:614
-GAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC
-+
-<<;;<<<7<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:5:84:91:614
-TTTCCCATCATGAAGCACTGATCTTCCACGTCTCA
-+
-;4<<<<<-84<<<;<<<<8<7.<4<<;77&:%<::
-@B7_595:6:119:730:190
-AGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATA
-+
-<<<9<;;<<<;<<<<<<<8<<<1<<918<;;;<<<
-@B7_595:6:119:730:190
-AGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGA
-+
-;;;3;<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:6:137:811:130
-AAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAA
-+
-<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:6:137:811:130
-AGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;;;
-@B7_595:6:290:270:557
-ACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCA
-+
-87:9;;;<851+:5.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:6:290:270:557
-GGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<;<<<<9<:;<<<<<<5<0<<;+
-@B7_595:6:47:720:789
-CCCTTGGCCATCACCCGGTCCCGGCCCCTTCTCTT
-+
-<<72<<<<<<<<;;<7;,0<2;*7<2;<*;;<<64
-@B7_595:6:47:720:789
-TCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACA
-+
-/)040<.878<<<<;8<;<9<9;<<<<<<<<<<93
-@B7_595:6:52:751:360
-AAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:76<<<<;9:;:
-@B7_595:6:52:751:360
-AGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCC
-+
-<-<9<<<<<6<<<8<<;;<<9<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:6:99:557:427
-AACAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACA
-+
-<<-<<<<9<<<<<:<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:6:99:557:427
-ATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<+;<7:8:;
-@B7_595:7:123:610:472
-GTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTC
-+
-:<::+<<9<<9<<<<=<<<<<=<<<<<<<<?<<<<
-@B7_595:7:123:610:472
-TGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGT
-+
-<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<+:<<<<<<<<;
-@B7_595:7:149:123:265
-AAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9
-@B7_595:7:149:123:265
-AGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAG
-+
-<;&<<<<<:<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:7:166:203:416
-AATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGC
-+
-<<<<<<<<::<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:7:166:203:416
-ATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<97<
-@B7_595:7:188:802:71
-ATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAG
-+
-<<<<<<<<<;<<<<<9<<<:<<<:<<<<<<:<<<;
-@B7_595:7:188:802:71
-TGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGC
-+
-;;;;<:::<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:7:190:481:295
-GAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTG
-+
-;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_595:7:190:481:295
-TCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<9<7<2::
-@B7_595:7:242:4:593
-ATATACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACT
-+
-1.%55877+8+88808887+7;7;18:8;;;.&;8
-@B7_595:7:242:4:593
-TCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCC
-+
-<<<<<<<<<<<8<<<<-<<<<<88;<;<<8<;88<
-@B7_595:8:26:242:35
-ATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;
-@B7_595:8:26:242:35
-ATATTTTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACT
-+
-<<<77!!7<;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:2:100:563:301
-GAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;8;;;
-@B7_597:2:132:493:921
-ACGGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<;;88:
-@B7_597:2:132:493:921
-GTTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<77;0<;;6777
-@B7_597:2:165:431:857
-GAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6&:<7<:76,;;
-@B7_597:2:165:431:857
-TTGGGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCAC
-+
-''7'/;'1%0447<<<*<6<<<*<*<<<<6<<<<<
-@B7_597:2:168:829:88
-ACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTAT
-+
-<,,;<838883;;;<<<<<;<8<8;<<<<<<<<<<
-@B7_597:2:168:829:88
-TAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<9;4;2
-@B7_597:2:42:28:552
-AAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<3<:;9;8
-@B7_597:2:42:28:552
-ACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTA
-+
-</8:<<:<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:3:10:394:392
-TCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<;<<;;:6&;
-@B7_597:3:10:394:392
-TTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACA
-+
-28-:;0-<0<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:3:115:646:430
-CACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAG
-+
-5;5<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:3:115:646:430
-GTTATGCCCTGCTAAACTTAGCATCATAAATGAAG
-+
-<7<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<7<<<<;5;<;67<
-@B7_597:3:133:707:886
-ACCTAATAAATACATATGCACCTAACACAAGACTA
-+
-%5-2;&6<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:3:133:707:886
-AGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAAC
-+
-<<<<7;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<5<;66<
-@B7_597:3:157:361:309
-CCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<;<<;<
-@B7_597:3:157:361:309
-TACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAA
-+
-:<-<5<0<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:3:39:966:551
-ACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<;<&<<&<<;
-@B7_597:3:39:966:551
-AGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTC
-+
-8;;;;;<<6'<<<+8<<<1<<<<4<<<<<<<<<<<
-@B7_597:3:46:981:766
-TCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATG
-+
-<<<<<<<<<<<<<;<<<<<-<;<<<<-<-<;-:6;
-@B7_597:3:46:981:766
-TGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAG
-+
-/<<<;/;<<316<<<3<<<<7<<<7<<<;<<<<<7
-@B7_597:3:53:616:842
-CTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCACTTACGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;07<<<<<-&<<-<4;
-@B7_597:3:53:616:842
-TCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTC
-+
-;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:3:67:620:344
-AGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATT
-+
-<<<<2<:2<<<<<<7<<<<:<<*<<<<<<***3<<
-@B7_597:3:67:620:344
-CCCCCGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCC
-+
-+++*+++#++++++,++++++++,,+,&+,,,,+,
-@B7_597:3:73:273:488
-AAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGG
-+
-</<<:<<9;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:3:73:273:488
-CTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTG
-+
-<<<<<2<88<88<<<8<<1<<<<<<68<<<;<;<*
-@B7_597:4:138:211:582
-CATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGG
-+
-:<8;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:4:138:211:582
-TGAGACTACAGAGCAAATAGGTAAAAAATTAACAT
-+
-<<;<<<<<<<<<<<<<&;<;<7<<;<<<<<<<5<<
-@B7_597:4:144:492:61
-AAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACA
-+
-+;;3;,:7<:;<<7<<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:4:144:492:61
-AACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAAC
-+
-<<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<7:<<<<::;9;;6
-@B7_597:4:146:961:63
-TACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACA
-+
-7;;<<<<<;<<<7<<<<<<<<;;<<;<;<<;<<<7
-@B7_597:4:146:961:63
-TGAATAAAAAGGGCTTAAATTCCCCCACTTAAGGG
-+
-<<+<<<<::+1<;&<<88<<<<;;.<0;;85(;(8
-@B7_597:4:38:999:463
-GCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTA
-+
-.*:&<<0<0!<<+<<<<<<<<<<<<<0<<<<<<<<
-@B7_597:4:38:999:463
-TAGACATCTAAATGAAAGNNGCNNNAAGAATGCCA
-+
-7<<<<<<<<:07<<:<<7!!<<!!!::<88<<<<4
-@B7_597:5:125:957:753
-TTTTTTTTTTTTCTCTCCTCTTTTTTTTTTTTTTT
-+
-<8<<<;<8;8//++(,(+++&++(/+008880;;/
-@B7_597:5:160:434:853
-ATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<,<<<<:<<<<,<:
-@B7_597:5:160:434:853
-GCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCC
-+
-;;*4;<;<<<;<<<<<<<8<<<;<<<<<<<<8<<<
-@B7_597:5:58:684:520
-AGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;<<
-@B7_597:5:58:684:520
-ATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCA
-+
-<85;;:<<<7<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:5:6:882:784
-CATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATAC
-+
-4;7<;64<<:<<4<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:5:6:882:784
-CTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<:6::::<,2
-@B7_597:5:98:995:929
-GTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGT
-+
-<;<;<8<;<<;1;<<<<<;<;;;08;<;<1&0+8<
-@B7_597:5:98:995:929
-TATAACAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAA
-+
-&<+<'7<<+<&<<<7+4<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:6:106:595:322
-GAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<::
-@B7_597:6:106:595:322
-GCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAA
-+
-;+<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<7<<<<<<<<<<<
-@B7_597:6:193:661:771
-AAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGG
-+
-<<<<<<<<<;<<<;;;<<<<<;<<<=;<:;5:9::
-@B7_597:6:193:661:771
-GCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATG
-+
-:&<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<;<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:6:20:592:496
-CTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<==<<<<<<:<
-@B7_597:6:20:592:496
-TCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGG
-+
-97<7;<;<;<<<<;<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:6:29:249:878
-ATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTT
-+
-<,;<9<;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<><<<
-@B7_597:6:29:249:878
-TCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<=<<:<<6&
-@B7_597:6:73:420:812
-CTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAA
-+
-5'<<<,<&,<<,<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:6:73:420:812
-CTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGT
-+
-<<<<<1<<<<::1<7<:<96<9<:<<:4<70:11<
-@B7_597:7:103:731:697
-AATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<6<<<<<<<:<;:
-@B7_597:7:103:731:697
-CTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGC
-+
-:::;3:<<<<<<<:<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:7:113:408:211
-AAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGG
-+
-<:;:;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:7:113:408:211
-GAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<:&<<<&:<<<<<<<<<<;:/
-@B7_597:7:31:948:254
-CCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<:<<8<;;;;<
-@B7_597:7:31:948:254
-TGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAA
-+
-7;;;98<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<
-@B7_597:7:41:34:211
-CACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAA
-+
-7</::<<7<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:7:41:34:211
-GTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3:;5;
-@B7_597:7:5:753:806
-AAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7:-<;;3;;
-@B7_597:7:5:753:806
-ATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATT
-+
-;:<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:7:94:273:165
-AGAAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATAT
-+
-;3&;;:<<:<-<-<<8:<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:7:94:273:165
-TTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;:7
-@B7_597:8:147:360:141
-TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAA
-+
-<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7
-@B7_597:8:147:360:141
-TTTGGTAATTTAGTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTT
-+
-<86<<<<73<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:8:186:850:838
-GGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTT
-+
-<;<;<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:8:186:850:838
-GTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATT
-+
-<<<<<;<<<<<<<<<<<:<<<<<;<<<;</<<;<<
-@B7_597:8:35:118:589
-TCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATG
-+
-67<<<<<;<<<<<<<:7<<<<:<<<<<<<<<<<<<
-@B7_597:8:35:118:589
-TGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<<<<9
-@B7_597:8:48:805:860
-AAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAA
-+
-<<<<<<<;<<<<<<<41;<<8<<<<<<<8+<4,+;
-@B7_597:8:48:805:860
-AAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTA
-+
-<<<;3<;7<<97<7<<<<7<4<<<<<<<<<<;8<+
-@B7_610:1:12:88:200
-ACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTT
-+
-<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<:<<<<<<9<<5<
-@B7_610:1:12:88:200
-GAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACC
-+
-9<<;<<<;<;6;<;:<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:1:139:152:856
-AGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTT
-+
-<<<<<;<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:1:139:152:856
-CTAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTA
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<;<<<;<<<<;<;;;
-@B7_610:1:37:652:403
-CCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTAT
-+
-<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:1:37:652:403
-TTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGG
-+
-<;<<<<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:2:189:831:878
-AGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCC
-+
-<9<<<<<<<<<<;9<:<<<<<6<<<<<<<;<<<<<
-@B7_610:2:189:831:878
-AGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGAT
-+
-:<<<2<<<<<<<<<<:8<8<<<<<<<<<<87489;
-@B7_610:2:194:688:289
-TCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGG
-+
-;8;%28<;<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:2:194:688:289
-TGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<:;
-@B7_610:2:6:529:366
-CATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:2:6:529:366
-GCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTT
-+
-9;8;8<:<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:2:75:887:149
-TACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<;<;;;
-@B7_610:2:75:887:149
-TACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGC
-+
-:<:<0<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:3:102:825:507
-TGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;;<
-@B7_610:3:102:825:507
-TTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAAC
-+
-<05<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<
-@B7_610:3:120:63:653
-AACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATG
-+
-<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:3:120:63:653
-TCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<9<<<
-@B7_610:3:137:895:681
-CTTCCTATGGAAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATG
-+
-4;5+6;<<<<<<<<<9;<4<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:3:137:895:681
-GCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<-8<<
-@B7_610:3:148:340:479
-TCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:3:148:340:479
-TTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGG
-+
-<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:3:182:23:585
-AGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<
-@B7_610:3:182:23:585
-ATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGT
-+
-9:<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:3:5:863:302
-ACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAAT
-+
-:4:29:<<<9;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:3:5:863:302
-TGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<
-@B7_610:3:82:998:566
-ATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCT
-+
-<9<9<<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:3:82:998:566
-GCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTC
-+
-<<<<<<<:<<0<<<<:<82<<::<4<<;<<4<4<;
-@B7_610:3:84:101:328
-AATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCT
-+
-<<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<:<;;<44;;<;<
-@B7_610:3:84:101:328
-TATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAAT
-+
-<<<<<<<<:<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:3:85:219:371
-GACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGT
-+
-<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:3:85:219:371
-TAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<;<;
-@B7_610:4:139:989:144
-ACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTAT
-+
-<&<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:4:139:989:144
-ACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<;<<<<<<<;;<;;
-@B7_610:4:15:805:420
-ATGAAGAGACTATTCACATGTGAACCACACATTTA
-+
-;73;;;;67.;1<<+*.;*&<4947<&474&*9*(
-@B7_610:4:15:805:420
-GAACAGTTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTTTGTAA
-+
-<64<59&996<(64<)7).68<0<0<<7741<1:<
-@B7_610:4:198:59:675
-AATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAAT
-+
-<<<<<4<4<:<<<;7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:4:198:59:675
-ACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTATCCT
-+
-<.<<<<<<;<<<<<<<<<<<**<;<;2<;6;&*2&
-@B7_610:4:67:317:249
-CTACATGGCTGATTATGAAATCTATGTTCCCCATA
-+
-<<<<<<;<<<<;:;<<7;<<.<&3<;;<<(;;6.<
-@B7_610:4:67:317:249
-TTCCCATCATGACGCACCGAACTTCCACGTCTCAT
-+
-.5;7;++;<8.;&:7<<.5<<<<7<<7<<<<<<;7
-@B7_610:5:102:915:87
-AACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<3<<;<<<<;
-@B7_610:5:102:915:87
-CACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAA
-+
-;<8<;;<<<<7;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:5:120:596:847
-AACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<;<<<9<<<<<<<;:<62;58;2
-@B7_610:5:120:596:847
-TCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAG
-+
-;/<<:<;<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<;<<<<<<<
-@B7_610:5:136:260:254
-AAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<><<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:5:136:260:254
-GTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAA
-+
-;:;;<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:5:147:68:353
-AACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGT
-+
-<;<;<<7<<<<<<<7<<;;<7<4<8<<<8.;4;;;
-@B7_610:5:147:68:353
-CCTTTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCC
-+
-<<;;<<<<<<<<+;<<;<<0;<<<<;<<<<<<<<<
-@B7_610:5:51:904:391
-ACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;:;<2<6;;;;;
-@B7_610:5:51:904:391
-TATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAA
-+
-;<96<<<<<<7<<7<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<
-@B7_610:5:7:761:623
-CCGGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTAT
-+
-::';-8);<<<<;<1<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:5:7:761:623
-CTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<8<<<<;;<0<<<<<;;<;<;;&
-@B7_610:6:107:252:533
-AGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;9
-@B7_610:6:107:252:533
-CAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTA
-+
-3<<<<+<<96<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<
-@B7_610:6:111:379:700
-ACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATAT
-+
-7<<:<<<<02<<6&<</<<</+9/98*<966/3/<
-@B7_610:6:111:379:700
-CGCACTGGCAATATTTGTGTGTTTACTTTTTTGCA
-+
-:1+&;;6;:;918;);;):,19.9:).):::.&3(
-@B7_610:6:143:620:158
-ACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAAT
-+
-<4;<;<;<;6<<7<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:6:143:620:158
-CAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATA
-+
-<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<
-@B7_610:6:148:776:486
-AACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;
-@B7_610:6:148:776:486
-AGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATT
-+
-;:<<<;<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:7:116:157:612
-GTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:7:116:157:612
-TTAAGAGATATAGATTGGCAGTACAGATTTAAAAA
-+
-;;<<<<<<<<<<<<<<<<;<</<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:7:117:857:942
-AGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCT
-+
-<<;<<<<<<<9<<<8<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
-@B7_610:7:117:857:942
-GGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:6<;;7;9<;
-@B7_610:7:158:943:467
-AAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAA
-+
-<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<<;8<<
-@B7_610:7:158:943:467
-AGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTT
-+
-<:<<;;<:5<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<
-@B7_610:7:15:696:693
-TCAAACACGAATGTTAATCCCTGCTAAACTAATCA
-+
-)6<:7<.7<6.<0&&<&3:&7<<7<0<<<<<<<<<
-@B7_610:7:15:696:693
-TCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAAT
-+
-2:+:7<<3<<<<<6+36<<<<<<<6<<6&<<;<.7
-@B7_610:7:177:469:800
-AAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATA
-+
-=<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:7:177:469:800
-TTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;<<<;<;
-@B7_610:7:26:749:174
-CAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<9<8<<<9<;94
-@B7_610:7:26:749:174
-TAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAA
-+
-(<<)<<<<6<<<<<<<<<<&:<3<<<6<<<)<:<<
-@B7_610:7:34:144:868
-AATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4;<
-@B7_610:7:34:144:868
-AGCTAAGGAATGGGAAAGGTGTGGGGAAAAAAGTA
-+
-&9+&7<&&0&<6<.0<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:7:35:378:681
-GCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCAT
-+
-:<5-<);;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:7:35:378:681
-GTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:<
-@B7_610:8:163:757:432
-CCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTCAT
-+
-1+<8<<<<<<;<5<;<<<<<;5<<<<<<<<<<<<<
-@B7_610:8:163:757:432
-GGTTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCT
-+
-<<<<<<<;<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<83:<
-@B7_610:8:68:570:705
-AACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<8<
-@B7_610:8:68:570:705
-CATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGA
-+
-4<;4<;;:<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<;<
-@B7_610:8:95:426:791
-CCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAG
-+
-<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<,<<
-@B7_610:8:95:426:791
-GNTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACT
-+
-!!!!<<<<<;;<<<<;<<;<;;<<<<<<<<<<<<<
-@EAS112_32:7:113:809:364
-GATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACT
-+
-;<;;;<<<:<6<<<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS112_32:7:113:809:364
-TATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;<;<<<4
-@EAS112_32:7:135:401:735
-AATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCAC
-+
-<<::7<<<<<<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS112_32:7:135:401:735
-CCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<8<<<<<<;
-@EAS112_32:7:168:117:441
-TCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCA
-+
-<<3<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+<<17;<;:<995
-@EAS112_32:7:168:117:441
-TCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTG
-+
-;;;;3;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS112_32:7:272:328:400
-CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAA
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;:7
-@EAS112_32:7:272:328:400
-CTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAG
-+
-4;<<<<<7<;<<<-<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS112_32:7:322:391:742
-ATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATT
-+
-<63<<<<9<<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS112_32:7:322:391:742
-CATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;
-@EAS112_32:7:42:804:114
-ATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<;;<;;
-@EAS112_32:7:42:804:114
-TCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCC
-+
-;9<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS112_32:8:88:90:59
-ATAATACCTCTACATGTCTGATTATGAAAACAATG
-+
-<<<<<<<4;7;<<<;;47;&9..1;6&4<755;1;
-@EAS112_32:8:88:90:59
-TGCACCTCCCTGTTCACCTAGATGCTAGGAGGACA
-+
-=7595=92=72.=+5(:4=9092((.2&(&%07%.
-@EAS112_32:8:89:254:332
-AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT
-+
-<<<<<<:<;<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS112_32:8:89:254:332
-GAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAAG
-+
-==================;=========;=7;;<;
-@EAS112_34:4:12:273:89
-AGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCA
-+
-<:737<288<<<7<<<<<<<<<:9<<<<<<<<<<<
-@EAS112_34:4:12:273:89
-CCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACC
-+
-==========<====:=========+===4414;;
-@EAS112_34:4:17:989:186
-TTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAA
-+
-87;38$<3=/<==============9=========
-@EAS112_34:4:17:989:186
-TTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;<7;::::
-@EAS112_34:4:22:206:150
-AAAAAAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACA
-+
-8&)<)<<<<+<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS112_34:4:22:206:150
-GAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGC
-+
-==========================::=5&;<2<
-@EAS112_34:4:74:570:695
-CACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGA
-+
-=========================7====;8<8;
-@EAS112_34:4:74:570:695
-TTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAAT
-+
-.;:8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS112_34:4:92:412:435
-AGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGG
-+
-<;<52:=,====:=========<============
-@EAS112_34:4:92:412:435
-CTACGCAAACAGAAACCAANTGAGAGAAGGAGTAG
-+
-<<<<<<<4<<<<<<<<<66!<<<<<<6<<77<<97
-@EAS112_34:6:127:153:861
-CTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<=<*<<<24;;::
-@EAS112_34:6:127:153:861
-TTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACAT
-+
-:;:6;9<<1;<<95<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS112_34:6:130:865:838
-AAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;:<;3
-@EAS112_34:6:130:865:838
-AATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCC
-+
-;<:84<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS112_34:6:145:144:263
-TTTCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCCTTTCTTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<+4+4&+&(&&*2&8&&&)&
-@EAS112_34:6:43:47:279
-AAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAA
-+
-<:<<79<<<19<<<1<<9<<+<<<<<3<3<<<<<<
-@EAS112_34:6:43:47:279
-TAGACCTAAGAGGGATGAGAAGTTACCTAATTGGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<;:<-<<<<<<<<<<<<:;;+7;
-@EAS112_34:6:71:85:629
-CCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGA
-+
-<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<5<9<<+6
-@EAS112_34:6:71:85:629
-TTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAG
-+
-,,1<1<7&%<9+:<<9<<9<<<<<<<<5<<<<<<<
-@EAS112_34:6:75:615:555
-AAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<29<;.484
-@EAS112_34:6:75:615:555
-TGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAA
-+
-;<<<;<<<<<<<<<:;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS112_34:7:118:523:591
-GAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<;;<;
-@EAS112_34:7:118:523:591
-GGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATG
-+
-4:--&0:67<<8:<<<<<<<<<<<:4<<<<<<<<<
-@EAS112_34:7:141:80:875
-AGCCGAGTCACGGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<8;<<8+7;-7
-@EAS112_34:7:141:80:875
-AGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCA
-+
-6/<;84<;<;<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS112_34:7:142:457:584
-GGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGT
-+
-8::<:<<9<<.<:<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<
-@EAS112_34:7:142:457:584
-TGAAGAGACTATTTCCAGATGAACCACACATTAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<</<<,6<66<<<;<;;<*4744.
-@EAS112_34:7:71:62:254
-AAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGT
-+
-<<<<<<;8<<<<;<:<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<
-@EAS112_34:7:71:62:254
-GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTCCTGCTACTCA
-+
-<<<<<<7<<<<7<<<<<3<<<<<<&<<.<<::<:%
-@EAS112_34:7:86:498:373
-CACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAG
-+
-):)4:<5<<<<;89<<<969<<<:<<<<<<<<<<<
-@EAS112_34:7:86:498:373
-GATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCACCAGAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5:<<<:<;7+67
-@EAS112_34:7:96:489:453
-AAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGAT
-+
-;<;;;<<<<5:<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS112_34:7:96:489:453
-AGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;:
-@EAS112_34:8:103:812:255
-ATGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAAC
-+
-7:777:7<<::7<7<7<<:7<7<:<<<<<<<<<7<
-@EAS112_34:8:103:812:255
-TGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<9<<;<<<39;;<;32:7;7+
-@EAS112_34:8:174:557:872
-GGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAAT
-+
-.77<:<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS112_34:8:174:557:872
-TGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<7<<;<<6:<<2117
-@EAS112_34:8:179:13:782
-GACAGTCTACAACTGTGAGCCATCACAATGAACAA
-+
-&37.3&;3'*<3<;9<9<<5<<<<<<<<<9<<<<<
-@EAS112_34:8:179:13:782
-TGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:7<<<<::<7<:-:1
-@EAS112_34:8:30:816:90
-ACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTAC
-+
-:<3:%9299<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS112_34:8:30:816:90
-AGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCCAGCCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<::1&(1::7
-@EAS112_34:8:45:800:733
-ACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGA
-+
-<<<</<<<<<<<<<<<<<<<2<9<<<<<5*5;599
-@EAS112_34:8:45:800:733
-ATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTG
-+
-<7<<7&<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS112_34:8:4:841:339
-ACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<7<<&;;<5<+<;7<<;
-@EAS112_34:8:4:841:339
-CTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGG
-+
-77-):22<<<33;<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_26:1:113:367:659
-AGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA
-+
-<<5<0&9;<3<<<<<9<<<<4<;<9<9<<<<7<3<
-@EAS114_26:1:113:367:659
-CACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGCGAGAA
-+
-=9====8==========:=:=====9=:=&====5
-@EAS114_26:1:155:807:19
-AAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<9+<<<<<<9<<9;4<<<<:
-@EAS114_26:1:155:807:19
-CAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACA
-+
-:==4=5:====:============:==========
-@EAS114_26:1:171:527:247
-AACAAATGCTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAAT
-+
-<547*9)&&7+;+<<7<<<;<<<;3<<<<<<<<<<
-@EAS114_26:1:171:527:247
-AGAAGGAGTAGCTAGACTTATATCAGATAAAGCAC
-+
-=4==4===8==99=&=8+9=19+.2.6'=99+999
-@EAS114_26:1:324:238:736
-AGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACT
-+
-<<<9<<<70,<<4<<<<<7<4<7<<<<<0<<<<<7
-@EAS114_26:1:324:238:736
-TCAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACC
-+
-===================================
-@EAS114_26:1:35:522:294
-GGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTA
-+
-===============================:=:=
-@EAS114_26:1:35:522:294
-TTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_26:1:99:212:522
-ACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTT
-+
-================8==;====;=;===1==:8
-@EAS114_26:1:99:212:522
-AGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACT
-+
-<1<16<7<3<<;;<8<<<<<<<<<<<<;<<<<9<<
-@EAS114_26:2:130:609:467
-AAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAA
-+
-===:2===;<====>==>=>=>=>>>==>>>=>>>
-@EAS114_26:2:130:609:467
-CAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACA
-+
-==8=====;==8==;=4=;;8=====;6=177.==
-@EAS114_26:2:214:950:32
-ACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGT
-+
->>=>>>>==>=>>>==>=>=:=====;=:=6:::6
-@EAS114_26:2:214:950:32
-AGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCAC
-+
-=&==4======:;==6<==:===============
-@EAS114_26:2:237:497:165
-GAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGC
-+
-9=:=======2=27======<>&<=,==4>4=>>=
-@EAS114_26:2:237:497:165
-TACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAA
-+
-8===<8===========37=<===7=;7=8=====
-@EAS114_26:2:315:219:7
-GAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTG
-+
-7==::<2=8<<<=====>888<=2=>==>,>,>>8
-@EAS114_26:2:329:458:365
-GTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGT
-+
-==========================9========
-@EAS114_26:2:329:458:365
-TTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGG
-+
-====:==9========>==7>==9>=7=>=>>=>>
-@EAS114_26:2:73:513:102
-GTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGC
-+
-==::===8=>=====>=>=>>>=>>==>=>>>>>>
-@EAS114_26:2:73:513:102
-TGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTT
-+
-===========================;=======
-@EAS114_26:3:117:284:589
-ACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAA
-+
-==================================0
-@EAS114_26:3:117:284:589
-GAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAG
-+
-==8==;==================;==========
-@EAS114_26:3:284:261:124
-ACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTG
-+
-===27===.====&===========;;========
-@EAS114_26:3:287:665:495
-GAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCA
-+
-===,9=;;====7=====5===;==1=========
-@EAS114_26:3:287:665:495
-TGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAA
-+
-==========================98====8=8
-@EAS114_26:4:100:238:596
-ATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATAT
-+
-======9=====;=======5===;====/=;===
-@EAS114_26:4:100:238:596
-CAAAAACTATTCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGG
-+
-4<<<<;<3<3&<3<1<5<31<<3<<<<<<2<<;<,
-@EAS114_26:4:110:840:431
-CTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAA
-+
-77<;7<<<<<<<<<4<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_26:4:110:840:431
-GTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGA
-+
-=====================5:======54=+3+
-@EAS114_26:4:123:1001:580
-AGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGC
-+
-<.00..3<6<<<<<<<3;<<08<<<<<6<<<<<<<
-@EAS114_26:4:123:1001:580
-GGGAANTAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAAT
-+
-=====!=====================1.8131*=
-@EAS114_26:4:253:285:104
-CTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGA
-+
-======================:========7==;
-@EAS114_26:4:253:285:104
-GTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACA
-+
-2<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_26:4:306:388:342
-CCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACT
-+
-================5====:=====;==1=4==
-@EAS114_26:4:306:388:342
-GGGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGG
-+
-9/<9;<<<;<;<<7<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_26:4:40:352:151
-ATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<;<<9<<<<:<<<<;<99<3<
-@EAS114_26:4:40:352:151
-TTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT
-+
-;=;;5=:-=9=====;;==================
-@EAS114_26:5:139:331:63
-GACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTC
-+
-7===================:=:============
-@EAS114_26:5:139:331:63
-TTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT
-+
-====================<<=============
-@EAS114_26:5:228:189:826
-AAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCCGCATGGTT
-+
-;9=========;=1======9=====1;=<3=:6;
-@EAS114_26:5:228:189:826
-ATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCT
-+
-:74=:.==1==========================
-@EAS114_26:5:238:31:968
-ACACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGG
-+
-=(.7=5%===9:7==+==77===============
-@EAS114_26:5:238:31:968
-ATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTG
-+
-9======8====*=====,=1=======<=7:::,
-@EAS114_26:5:43:114:617
-AATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAG
-+
-+=22=6=================9===========
-@EAS114_26:5:43:114:617
-AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATG
-+
-=============;=========;===========
-@EAS114_26:6:129:694:359
-CCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCT
-+
-7777<7<7;77+<3<<;<<;<<<<;<<<<<<<<<<
-@EAS114_26:6:129:694:359
-TGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCCGAGGGAT
-+
-============+7=======:==;;;'=;==7;=
-@EAS114_26:6:140:253:322
-AATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;;;<<;
-@EAS114_26:6:140:253:322
-GAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAA
-+
-=;===;54:====================>>===>
-@EAS114_26:6:183:697:555
-AAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCCAGACAGACT
-+
-=====================:===&==:;==5;;
-@EAS114_26:6:183:697:555
-AGAAATCTTAGAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAAT
-+
-<<<;&,.;);&96<84<<81<<&<<<9<<8<8<<1
-@EAS114_26:6:46:13:880
-AAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<7<3<<<9<+;;<9
-@EAS114_26:6:46:13:880
-AGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCA
-+
-=&====8==========0=================
-@EAS114_26:7:13:172:720
-AATTCATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAG
-+
-============:3<==:====<=9=3===;==83
-@EAS114_26:7:157:876:302
-AAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGA
-+
-===:=8=;==:892=,28==88==28====8=;;8
-@EAS114_26:7:157:876:302
-CAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACACGAACA
-+
-2<<;<<<22<<<<<<77<<<<22<7<<<<%-<<1<
-@EAS114_26:7:218:858:445
-AAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTT
-+
-;===5=;=======;==3======9;,79==;===
-@EAS114_26:7:218:858:445
-GAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATA
-+
-;<<<<<<<8;:<<<<<<;<<:<<<<<<<<<<<<;<
-@EAS114_26:7:245:323:744
-ACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCC
-+
-/.848299;&;9;9;=2.=7========;;=====
-@EAS114_26:7:245:323:744
-GATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAG
-+
-<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<+<<<<<<<4<
-@EAS114_26:7:37:79:581
-TTAAAATTTAAAAAAAGTAAATAAAACACATAGCT
-+
-<>4<>>>>;>>&>->9>9;4>->>>>,4>9>,<1>
-@EAS114_26:7:37:79:581
-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATGCCAGAAAA
-+
-3,,,===6===<===<;=====-============
-@EAS114_26:7:86:308:648
-GAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTG
-+
-<7<<<;<<<<+;<<<2<5<<<77;<<2<;;<<<<<
-@EAS114_26:7:86:308:648
-TATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGA
-+
-=8=====;=8======;=======35==;=;.;25
-@EAS114_28:1:144:242:602
-ATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGG
-+
-========================;=====<;;<<;
-@EAS114_28:1:144:242:602
-ATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:1:168:389:889
-GAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;9;;<<<<
-@EAS114_28:1:168:389:889
-TAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAA
-+
-;<<;;56;==================8========8
-@EAS114_28:1:168:609:646
-GGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAG
-+
-;;<<<<=======;;:;======;==<=========
-@EAS114_28:1:168:609:646
-GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAA
-+
-<<<<<<<<<<<;<<<<<:<8<<<<;<<<<<4<<<9<
-@EAS114_28:1:220:801:282
-AACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGG
-+
-;7;87;===;==;====:===<==7===========
-@EAS114_28:1:220:801:282
-AATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<+<;<<<<<::<<:
-@EAS114_28:1:232:351:909
-ACATGGCTGATTATGAAATCAATGTTCCCCAGATGC
-+
-<<<<<99<<<<<<99<7<'<9<<<6<<+<;7;<<&;
-@EAS114_28:1:232:351:909
-CCATCATGAAGCGCTGAACTTCCACGTCTCATCTAG
-+
-:8%3<8====130=8==+===;=3=8===48==;3*
-@EAS114_28:1:28:708:463
-CCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<9;<:<<
-@EAS114_28:1:28:708:463
-GTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAAT
-+
-;;<;<<====3=====5===================
-@EAS114_28:2:114:938:216
-CTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4;
-@EAS114_28:2:114:938:216
-GAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGA
-+
-<<<<7<6<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:2:141:7:963
-CACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGA
-+
-<<<<<<<<<<<<;<:<<<<<<1<<&<;<;<<;,<;5
-@EAS114_28:2:141:7:963
-TACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAA
-+
-95+<<9<<5<;;<<;<<;'<<<<<;<<<7<9<<<<<
-@EAS114_28:2:149:650:44
-CGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCC
-+
-;8<<</<<:<<595<<9<<<<<<<<<<<<<<3<9<<
-@EAS114_28:2:149:650:44
-CTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;6<<;<<7<<<
-@EAS114_28:2:167:905:852
-AGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGAAAATCCCAT
-+
-<<<7<<<<<<<<<<<<<<:<:<<:::&.<:<66:3<
-@EAS114_28:2:167:905:852
-CAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTC
-+
-+<<<9;7;<<+<<<<<39<;9<;9<<7<<<<<<<<<
-@EAS114_28:2:251:819:772
-TCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGAT
-+
-6+7++1<<%<<<<<<<+<+<9<<99<9<<<<<<9<<
-@EAS114_28:2:251:819:772
-TTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTAC
-+
-<3<<<9<9<3<</<<<<<<59<3<9<<</9/++*/'
-@EAS114_28:2:28:474:566
-ACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<;<;;<<7;8;<
-@EAS114_28:2:28:474:566
-TGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC
-+
-;<<<+<<<<5<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:2:329:437:643
-AAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<<1
-@EAS114_28:2:329:437:643
-TTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAAC
-+
-885<8;;<;3,8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:2:55:562:403
-CAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTT
-+
-+<<&<<<<<<<<<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:2:55:562:403
-CAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<<;<;:
-@EAS114_28:3:110:984:98
-AAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTC
-+
-98<<<<<<2<<<<<<;;<;;<<<5;5;<<;;<<<<+
-@EAS114_28:3:110:984:98
-ACTAAAACCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATC
-+
-:81<<<<+;;8<+<8<<<<<;<<<8;<<<<<<<<8;
-@EAS114_28:3:173:627:465
-GTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATT
-+
-:<<<<;<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:3:173:627:465
-TGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<2;;4;;7
-@EAS114_28:3:176:402:458
-AAATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTA
-+
-</<+<4&;<<<<7<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:3:176:402:458
-CCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<;;<;
-@EAS114_28:3:202:275:776
-CAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTAC
-+
-;<<<<;;<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<
-@EAS114_28:3:202:275:776
-TCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<9<;;<<<;<;<;
-@EAS114_28:3:250:628:423
-CAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAA
-+
-+<<4;;9;;7.;7<;7<;<<<;;<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:3:250:628:423
-CTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;<<<<:<<<<;;;;;;4
-@EAS114_28:3:279:763:945
-CTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4:<<47<:<;<<</<9<
-@EAS114_28:3:279:763:945
-GCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACT
-+
-+9:-+<:1-44<<':<;<+<-<<<;:<<;;<<<<<0
-@EAS114_28:3:308:509:948
-AATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCT
-+
-;;+;;;.8<<;;;<<<<<<<<<<<<<8<<<<<;<<<
-@EAS114_28:3:308:509:948
-AATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATAC
-+
-<9<<<<<<<;<7<<;<<<<<<<;<<<<7<<;2;<<<
-@EAS114_28:3:32:492:907
-CAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATC
-+
-8<;<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:3:32:492:907
-TGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:3:78:773:660
-ATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGA
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<<8<8<<;<<<;<<;7<<4:
-@EAS114_28:3:78:773:660
-CCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCC
-+
-7<;7<<<7;9<<8;<<<<<<;<<<<<<<<<<7<<<<
-@EAS114_28:4:13:701:55
-AAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATC
-+
-<<<<<<<<<9<<<9<<<<<<6<<<<<<<6<<6<<6+
-@EAS114_28:4:13:701:55
-TTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATG
-+
-0:+<7<;9<;<<<<<<<3<<<<<;;<<<:<<3<<<<
-@EAS114_28:4:149:572:877
-ATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTC
-+
-=>7><>;>+>>/;>>=>=>=:>><>=<<==;)<=8;
-@EAS114_28:4:149:572:877
-GAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGA
-+
-6<94693<;<<<<;;<<<<<<<<<<;9<<<<<<<<<
-@EAS114_28:4:215:246:640
-AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCA
-+
-<<<<<<<<<<9<;<<<<<<<<<<9;<<<<<<3;<;3
-@EAS114_28:4:215:246:640
-AAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGAT
-+
-;<<,<<<96<<:<:<9<6<97<<<<<9<<<<9<<9<
-@EAS114_28:4:305:707:258
-AAAAAGATGTTCTACGCAAGCAGAAACCAAATGAGA
-+
-3<<7<,;<<<<0<66<6+<%<<<.<<<<<<<<<9<<
-@EAS114_28:4:305:707:258
-GAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATA
-+
-9<<<<<<<<<<<<;<<-<<;;<;<<9<<;<<+99;7
-@EAS114_28:4:322:631:245
-CCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<0<<<<<<<<<<<<<<<<5;
-@EAS114_28:4:322:631:245
-TATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:4:9:55:730
-ATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGC
-+
-<:<;;<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:4:9:55:730
-CAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCT
-+
->>=>>+==>>==<==<=8=><:;8/;7</5724-2;
-@EAS114_28:5:104:350:749
-AAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTT
-+
-<<8<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<0;<<<9;<85;;;
-@EAS114_28:5:104:350:749
-TGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCG
-+
-;<93;9;<3;<<<;<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS114_28:5:11:868:62
-TCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGT
-+
-;;77;;7<<<<<<<<7<<<;<7<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:5:11:868:62
-TTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<;<<<<(7:7039
-@EAS114_28:5:163:832:715
-TAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA
-+
-<<0;<9<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<;;;<6
-@EAS114_28:5:163:832:715
-TAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGA
-+
-;<<<<9<<<<<<<<;;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:5:206:671:49
-ACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAA
-+
-;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:5:206:671:49
-GCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCA
-+
-<<<<<<;<<<<8<<<;;<<<3<<8<8<35+,55;,3
-@EAS114_28:5:209:778:588
-AACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCT
-+
-;8;98;;;<3<<<<<<<<<;<<;<<<<<;<<<<<<<
-@EAS114_28:5:209:778:588
-TTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<;<8<8<<<<;7;;;
-@EAS114_28:5:23:944:377
-AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGA
-+
-<<<<<<<<9<<<<;<<<<<<<<<;<7<<<<;8;<<;
-@EAS114_28:5:23:944:377
-AGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATT
-+
-<;7;8<<<<:<;<:<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;
-@EAS114_28:6:11:151:750
-GTTTTTATTTTTTTCCTCTCTCTTTTTTTTTTTTTT
-+
-:'1:%4;4<<<+;6;&9+6;/<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:6:155:68:326
-CCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<
-@EAS114_28:6:155:68:326
-GTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTG
-+
-;<<<:6<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:6:175:705:982
-CATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGAT
-+
-')'''''')'''''*')*)'*)')))+,'*)+'*,!
-@EAS114_28:6:175:705:982
-CTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAG
-+
-<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<;<<+<:;39;+<40<
-@EAS114_28:6:185:87:475
-AAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAA
-+
-<<4<<<+<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:6:185:87:475
-ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6;
-@EAS114_28:6:187:996:432
-TGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<;
-@EAS114_28:6:187:996:432
-TTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAG
-+
-;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:6:51:506:878
-TAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<0<<<<<:;
-@EAS114_28:6:51:506:878
-TTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACT
-+
-<970;49;<;+<<<:<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<;
-@EAS114_28:6:54:263:585
-TGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATC
-+
-1:::6<<<<;;;<4<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:6:54:263:585
-TGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;<<;<:;::<<;;:;4
-@EAS114_28:7:133:514:754
-AGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATC
-+
-;;4;<;<;<<<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:7:133:514:754
-TAAATTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTT
-+
-***&,,,+(*,*********+*)*(***(**((*)(
-@EAS114_28:7:157:786:424
-GCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<;<<;<<<<+4:70
-@EAS114_28:7:157:786:424
-TTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAG
-+
-;<;2;;<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:7:178:276:693
-GTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;
-@EAS114_28:7:178:276:693
-TTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAAC
-+
-:;<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:7:215:863:521
-ACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;
-@EAS114_28:7:215:863:521
-TAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA
-+
-;<<<<<<<<<<<<<;<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:7:242:354:637
-AACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<6<;;
-@EAS114_28:7:242:354:637
-CCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCT
-+
-8<;;;;;<<<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_28:7:287:492:169
-CGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGG
-+
-;/;6<<<<4(<(<<<<6<<<<<<<<<<;<<<<<<<<
-@EAS114_28:7:287:492:169
-GTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCAACAAC
-+
-<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8;;<;6<<;
-@EAS114_28:7:57:324:546
-GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATG
-+
-;;5<;,<<<;;<<<<<<<97<<<<<<<<<<9<<<<<
-@EAS114_28:7:57:324:546
-TAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<8:8<<;::;;;
-@EAS114_30:1:134:379:893
-AGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<5<<<<;<<<<<;<:5;<<4+<<
-@EAS114_30:1:134:379:893
-CGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAA
-+
-7137::;<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS114_30:1:154:818:165
-GAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<:7;:;
-@EAS114_30:1:154:818:165
-TTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATAT
-+
-;;;;<<<;<;;<;<<<<;<<;;;<<;<<<<<<<<<
-@EAS114_30:1:176:168:513
-ATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTT
-+
-<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:&<<<<:;0;;
-@EAS114_30:1:176:168:513
-TTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTA
-+
-;0;;;7:<<<<<<<;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:1:188:863:790
-CATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTC
-+
-;<7<<<55<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:1:188:863:790
-TTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATT
-+
-++<;<<;;;:<<<<:<:<<:1<<1<<<6:6;4;;4
-@EAS114_30:1:243:10:911
-TATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGT
-+
-;<;;;<4;9:<<<;<<;<<<<<;;<<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:1:64:526:339
-ACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATA
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<<<7<:<<<<<<<<<8:<:
-@EAS114_30:1:64:526:339
-CAAATGAGAGAAGGAGTATCTATACTTATATCAGA
-+
-3<<<7<<;<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:2:111:142:21
-ATCAGAATAACAATGGGCTTCACAGCGGAAACCTT
-+
-;88<:<;;<6<;;<<<:<<<<;<<<<<<<<;<<<<
-@EAS114_30:2:111:142:21
-CTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGC
-+
-<<<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;9
-@EAS114_30:2:226:885:729
-AAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAG
-+
-<<<;<<<<<<;<;<<<<<<<:;<<;4;%;<<;<<.
-@EAS114_30:2:226:885:729
-GCTGAACTTACATCAGATAAAGCACACTTTAAATC
-+
-/*220%.(;<%<3.<<<4<<<<86;<8<<8<<<<<
-@EAS114_30:2:272:750:698
-GTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGATGACGGAC
-+
-<)<<<<<7;<<<4<;7<<<<78068:(%<3*861,
-@EAS114_30:2:272:750:698
-TGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAG
-+
-0<;8;64;<<<;<;.<+;:<4;4<;<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:2:297:949:26
-ACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
-@EAS114_30:2:297:949:26
-CATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATT
-+
-5<;<;<;:<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:2:303:428:326
-AAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;
-@EAS114_30:2:303:428:326
-TTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT
-+
-4<;<<;<;<4<<8;;;;.8+;<<;<8<;<;<<<<<
-@EAS114_30:2:30:887:404
-CAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTG
-+
-<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<:(<<<7;7
-@EAS114_30:2:30:887:404
-TTGCCTTCAGACCCTGCACGAATGCGTCTCTACCA
-+
-<<<<5<;::<<<;<<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:2:315:412:921
-GTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATA
-+
-4-<79;<<<4:;:<<<<<<<<4<<<38<<;<<<<<
-@EAS114_30:2:315:412:921
-TTCTGATGATGGTTACACTACAAGCCCATACTGTA
-+
-<;<;<<<<<<<;<<<<<<<<8<<<;<<:<<;;+<8
-@EAS114_30:2:82:963:128
-ATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;<<;
-@EAS114_30:2:82:963:128
-GGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATAT
-+
-585<;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:3:139:117:262
-AGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTG
-+
-<<<<;<<<<<<<<<<<<<:<<<<<:<<8<<<<:<:
-@EAS114_30:3:139:117:262
-GTTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAAC
-+
-<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<37;3
-@EAS114_30:3:14:697:541
-TAAAAGCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTAT
-+
-8<<<<&6<;8<<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<8
-@EAS114_30:3:14:697:541
-TTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<;;;;8;;<
-@EAS114_30:3:161:366:544
-CTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<
-@EAS114_30:3:181:582:435
-CAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATT
-+
-<<<<<<<<;<<<<<;<<4<<<<<<;<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:3:181:582:435
-GAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;::
-@EAS114_30:3:187:294:947
-ACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCACT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<&<<%:<)7;7::4
-@EAS114_30:3:187:294:947
-AGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACT
-+
-<<:<<8181;<8<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<:
-@EAS114_30:3:215:840:760
-AAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACT
-+
-<<<8<::<;;<<<:<7<7<;;;<<<<<<<<<<;<<
-@EAS114_30:3:215:840:760
-CTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTCCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<;<<<88<+<<:<;3585,+:
-@EAS114_30:3:24:195:604
-TCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGTGC
-+
-<;<<<<<<<<<89<<<<<868<8;6<8;3(38&<8
-@EAS114_30:3:24:195:604
-TGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATT
-+
-;6<02;<<<<59<<;<;<<<<9<3<<<<<<<<<;<
-@EAS114_30:3:302:288:657
-AGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGG
-+
-<:5<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:3:302:288:657
-CCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;<<
-@EAS114_30:3:35:361:546
-TGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCAC
-+
-:4;4;;<<;4<8<;;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:3:35:361:546
-TTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<;<5<<<<<;<2<<<:<8<4
-@EAS114_30:3:39:348:594
-AAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTC
-+
-<<;;<;:<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<
-@EAS114_30:3:39:348:594
-CTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTA
-+
-<<;<<<<<<<<<;<;;<<<<<<<<<<;<<<:<:<:
-@EAS114_30:4:183:852:253
-ACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<;;<8
-@EAS114_30:4:183:852:253
-CCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACAC
-+
-;<9<;<<<<<<<<;<<<<<;<<<;<<<<;<<<<<<
-@EAS114_30:4:317:378:535
-AGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACC
-+
-;7;':<77<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:4:317:378:535
-GCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<;<<;<8<;:7:1(
-@EAS114_30:4:327:795:103
-AACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAG
-+
-;::;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:4:327:795:103
-ACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;
-@EAS114_30:4:328:537:640
-AAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGA
-+
-<;<<<<<<;<<<<<<<<<:;<<8<<<;:<<<;<;9
-@EAS114_30:4:328:537:640
-GGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATA
-+
-;:<<;<<<<<::<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:5:327:991:508
-ACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;:<7:47;:75;
-@EAS114_30:5:327:991:508
-TCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTG
-+
-0:;::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:5:32:461:154
-ACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<+<;;
-@EAS114_30:5:32:461:154
-TTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAG
-+
-;;</<<<<<;:<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:6:137:741:866
-ACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATAT
-+
-<<<<8<<;;;<<<<;<<<;;;<;4<<8;<<;%<8;
-@EAS114_30:6:137:741:866
-GATGAGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCT
-+
-<;0:%<:9<<<:<<<<;<<:<<;0;<<<<<::<<6
-@EAS114_30:6:157:42:763
-TCTGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCG
-+
-4++;((2(5;24<./<:<<<<<<<<;<<88<<<<9
-@EAS114_30:6:157:42:763
-TTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTATTA
-+
-<<;<;<<<<<;<:4<<<<<<<<<;;4<<<:;;+;+
-@EAS114_30:6:163:312:891
-CCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGC
-+
-<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<:;;<;;<;0
-@EAS114_30:6:163:312:891
-TTCCCCAGATACCGTCCCTGTCTTACTTCCAGCTC
-+
-0.<;;8<<<0<<<<<<<<<<6<<<<<<8<<<<<<<
-@EAS114_30:6:214:565:337
-AAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATAC
-+
-<;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<9<<<<<;;;;<<<<
-@EAS114_30:6:214:565:337
-CAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTAC
-+
-;;<;<1<9<<<8<<<<<;<<<<<<8<<<;<<<<<<
-@EAS114_30:6:220:809:850
-GGGGGGAAAAAGATGTGCTACACAAAAAGATTCCA
-+
-<<;7;<<0::8<-6:<0624-*<&-93-,8+(&08
-@EAS114_30:6:220:809:850
-TTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGAT
-+
-9+5<;*<<<2:0<<8:<*00<<<:<*<<<<<<<<&
-@EAS114_30:6:238:803:383
-ACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<;<<;<<;<<<9<;<<
-@EAS114_30:6:238:803:383
-ACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGG
-+
-;;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:6:243:209:110
-AAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAA
-+
-;<;;;:<:<:;<<;;<;<;<;7<<;<<;;<;<<<<
-@EAS114_30:6:243:209:110
-CACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAG
-+
-<<<<<;<;<<<;<<<<<<<<<<<;<:;<<:;;+85
-@EAS114_30:6:277:397:932
-TTTCTTTTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:8(,0%(
-@EAS114_30:6:290:146:36
-CTTTCCCATCCCCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGT
-+
-7;%%%<8-4<(<<<7<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:6:290:146:36
-TTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<;;<;;<
-@EAS114_30:6:326:309:149
-CAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<;;;;:
-@EAS114_30:6:326:309:149
-CTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGAT
-+
-;;<<;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:6:41:461:436
-TAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<;<;;;:;
-@EAS114_30:6:41:461:436
-TAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAA
-+
-;<986<;6<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS114_30:6:49:656:507
-AAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<;9
-@EAS114_30:6:49:656:507
-TCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCA
-+
-%44;;<:<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:6:4:665:771
-GAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGA
-+
-<;<<;<18<;<8<<<<;<;;<<<<1<<<<6;;;;;
-@EAS114_30:6:4:665:771
-GTGCTTTATCTGATATCAATGCCGATAAACTGCCT
-+
-<<<<<<<<<<<<%<8<3:7:77<(7,:3(:&2:(0
-@EAS114_30:6:62:386:959
-AAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGC
-+
-%;71131((<<6<92(+<1<<;<-3<8<<;<;;<<
-@EAS114_30:6:62:386:959
-AATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGT
-+
-<<8<<<<;<<<<-<<87;</<;<+<;5<+;;<3;+
-@EAS114_30:7:269:944:220
-ATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAA
-+
-<;<;8<<;7<<<<<;<<-<<<<<<;<<<;<<<<<<
-@EAS114_30:7:269:944:220
-TGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTAC
-+
-<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<;81
-@EAS114_30:7:283:799:560
-ACATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCA
-+
-<4<6<8;;6<<<+;<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:7:283:799:560
-GGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGAC
-+
-<<<<+<<<<8<<<+<<<<<;<<:07;8;7402447
-@EAS114_30:7:310:155:312
-CAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGA
-+
-;<<<;<<<8<<<<<<<<<<<<;<<<<<8<<<<8<<
-@EAS114_30:7:310:155:312
-CATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCT
-+
-2;<<;<<;<<;;/<<<<<<;<<<<8<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:7:319:11:255
-TACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:
-@EAS114_30:7:319:11:255
-TCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATA
-+
-;8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<
-@EAS114_30:7:59:871:351
-GTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;
-@EAS114_30:7:59:871:351
-TAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAG
-+
-;<<<<<:<;<<<4;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_30:7:71:311:202
-TATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<:4<<<<<<<<<<<<8;4;:
-@EAS114_30:7:71:311:202
-TCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAA
-+
-;6<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS114_32:1:199:760:42
-ACCCAATTAATATTTTTCTTAGCAAAACAGTCTAG
-+
-58*5.<+<<<<,4<<**<90**9<<<<<<4<<<<<
-@EAS114_32:1:199:760:42
-CTCTCTAATTTTTGCTGCTTCCATGTCTTACTCTG
-+
-+2&2&2&22222220222&220-222-22-22-22
-@EAS114_32:1:208:971:600
-AAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGC
-+
-<<<<<<<3*+<4/<<<<7<<<<0<<:<8<<<<0<<
-@EAS114_32:1:208:971:600
-AGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<:<<<0;44<<:4<:<
-@EAS114_32:2:163:618:570
-AGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAG
-+
-<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<+<.7<<..<;&;8;
-@EAS114_32:2:163:618:570
-GGAAAGCTGTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGG
-+
-<9774<88&:8<:8<8:8<8<<<<<;88<88<<<<
-@EAS114_32:2:197:170:559
-CTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACC
-+
-<:<;;:<5<5<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_32:2:197:170:559
-TTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACA
-+
-:;;;;<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_32:2:247:900:123
-AAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;<;
-@EAS114_32:2:247:900:123
-AATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATA
-+
-;;;;.<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_32:2:283:577:398
-ACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAG
-+
-;8;;&<<<;<;67<;<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS114_32:2:283:577:398
-CTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<;<<<<<
-@EAS114_32:2:306:119:56
-CTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
-@EAS114_32:2:306:119:56
-TCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATG
-+
-;;;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_32:3:236:475:254
-AGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAAT
-+
-<:<<<<<;9<7<;<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<
-@EAS114_32:3:236:475:254
-TTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:::<:;</;/
-@EAS114_32:3:307:113:346
-AATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATA
-+
-<<<<9<<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_32:3:307:113:346
-ATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<8
-@EAS114_32:4:156:21:69
-AAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<4<<<:<;<;;
-@EAS114_32:4:156:21:69
-TTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATC
-+
-<:3:<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_32:4:20:41:138
-CATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACG
-+
-;;;<;<<<::<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_32:4:20:41:138
-GTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;<<<<<(<<
-@EAS114_32:4:228:587:504
-GCACATTACGACCCGGCAAGGTGTATAATTGTGTC
-+
-;4;4;&&82&04+&&48;3&3&*<7<47<<;-<-8
-@EAS114_32:4:228:587:504
-GTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCA
-+
-<<<<7<<7;7<<3<<<<7<<<<<*3<<<<74<:<*
-@EAS114_32:4:246:647:765
-GATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTA
-+
-9<+,<<&,39<,<;<<<<<<<&<<<<;0<<3;<<<
-@EAS114_32:4:246:647:765
-TATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACAT
-+
-;<<<<<<<<<;<&<<3+3<<<3<<9&</:/87</8
-@EAS114_32:4:42:923:169
-ACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAA
-+
-9<<<;9<<<<<;<;<<.<<;<;6<<<<1;8<<-0;
-@EAS114_32:4:42:923:169
-TTCCTATGTACTTATCATGAATCTATCCCAAATTC
-+
-&;972<;&<9<,;;;<<<;<&99<<;<;;3<<3<<
-@EAS114_32:4:5:396:292
-ATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTC
-+
-<:<6<7<:<:;;;<<<;<7<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_32:4:5:396:292
-TAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<:<<<<;;<;;3/&+8
-@EAS114_32:4:7:282:424
-CAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGTTAAAGAT
-+
-1<<<<<9<<<<<31<77;;;;7<3<<2+;<3<<<<
-@EAS114_32:4:7:282:424
-TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTT
-+
-<<<3<<<9<<<<3<<<<<9<<<9,<;;9;&*;3,.
-@EAS114_32:5:109:199:592
-ACGAATATTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAA
-+
-;9<9<:&:<<<<;;<;;<<<<<<<<<;<<<<<<<<
-@EAS114_32:5:109:199:592
-AGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA
-+
-<<<<<<<<<<<;:<;;<<:;6<<;:;:<<+;;;<;
-@EAS114_32:5:182:313:319
-AATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGT
-+
-</<;185;8<;;87<;8<<<<8<;83<<<<<<<<<
-@EAS114_32:5:182:313:319
-GATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<;<;
-@EAS114_32:5:267:170:250
-CATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<;
-@EAS114_32:5:267:170:250
-CATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTA
-+
--<;<5-:<<<<;<<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_32:5:78:583:499
-TTTACGCTATTCAGTACTAAATATAGAAATTGAAA
-+
-&6&9774&<;67<44&-4<;<9<7<<<<<;<<<<<
-@EAS114_32:6:122:342:296
-AAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCA
-+
-<:;:<<<;<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_32:6:122:342:296
-TCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<*<<<<9<
-@EAS114_32:6:178:342:866
-AACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAA
-+
-<<9<<<&;;<<<<77<;<<<5;:<<<:<<<<<<<<
-@EAS114_32:6:178:342:866
-ATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTC
-+
-;<<<<<;<<<8<<;<;<3<8/<<<<6<<</<8;<<
-@EAS114_32:6:179:735:569
-ATGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAAC
-+
-<5<3:<<<<5;8<<<55;<:</:<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_32:6:179:735:569
-CATCACCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<<<<<<<4/<;<<
-@EAS114_32:6:199:818:124
-AACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_32:6:199:818:124
-ACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;7<<<<<<9<9;
-@EAS114_32:6:78:909:394
-ATTGCTTGGTGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCC
-+
-6167&+&&/&//734/3<<<9*<;;3<3<;9<<3<
-@EAS114_32:6:78:909:394
-TACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGA
-+
-<<<<<<8<<<&<<<-<<<14,4;<<-0<2+<)/82
-@EAS114_32:6:88:162:587
-GGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGAC
-+
-386;;388-<8;<;68<<;;<;<6<<<8<<<<<<<
-@EAS114_32:6:88:162:587
-TTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCT
-+
-<;<<<<<<<<<;<5<;<;<<7<++<<2&*:322+7
-@EAS114_32:7:174:597:66
-TCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCT
-+
-9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<
-@EAS114_32:7:174:597:66
-TCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;6;<
-@EAS114_32:7:201:959:19
-CTCTACATGGCTGATTATTAAAACAATGTTCCCCA
-+
-;4;.9<:0&/<5<::<<9/.<<<<<<<<<<<<;<<
-@EAS114_32:7:201:959:19
-TATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;<<<:<;<<;<<;+;+<3494
-@EAS114_32:7:256:407:470
-AACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTC
-+
-<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<;;<</<<;;83;7;9
-@EAS114_32:7:256:407:470
-CAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATT
-+
-7.47;0;;5<4033*<<<<<9,<<<<<;<<<<<3<
-@EAS114_39:1:12:884:219
-GAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<5:<
-@EAS114_39:1:12:884:219
-GCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTT
-+
-7;::<:<<<7<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:1:28:350:895
-ATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAA
-+
-<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<;;<<;<<<<<;;<;8
-@EAS114_39:1:28:350:895
-TATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAA
-+
-:<;<<<:;<-<<<<<4;77<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:1:43:1120:878
-ACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<=7;7
-@EAS114_39:1:43:1120:878
-TAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTAC
-+
-<<<;<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:1:70:147:84
-ATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGG
-+
-<<<:<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
-@EAS114_39:1:70:147:84
-CCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;(5<<
-@EAS114_39:1:71:636:533
-GCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<5<<<-847
-@EAS114_39:1:71:636:533
-GTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGG
-+
-,51(<<8<:<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:1:73:302:1574
-AAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATG
-+
-7<88;;<;;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<
-@EAS114_39:1:73:302:1574
-CCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCT
-+
-<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<+:;<<;:8;<<<
-@EAS114_39:1:98:641:1040
-CAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGC
-+
-<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
-@EAS114_39:1:98:641:1040
-TAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAG
-+
-4<<<<7<<<<<<<<<:<<;<;<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:2:18:967:582
-AAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<;<<<<<8
-@EAS114_39:2:18:967:582
-ACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAG
-+
-<:<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:2:38:670:564
-CAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<<<;<5<;
-@EAS114_39:2:38:670:564
-CTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATA
-+
-3<<<3:<<<<<:;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:2:41:576:1016
-CTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<4<::<
-@EAS114_39:2:41:576:1016
-TGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTT
-+
-:<;<<<<<6<<<<;<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:2:57:1064:925
-TGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<
-@EAS114_39:2:5:1219:137
-AAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAG
-+
-<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<
-@EAS114_39:2:5:1219:137
-ACCTAAGAGGGATGAGAAATTACATAATTGGTACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<(<<<<<<:9<;=
-@EAS114_39:3:11:1238:1728
-AGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAG
-+
-<<7<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<;;<
-@EAS114_39:3:11:1238:1728
-TCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAA
-+
-:677<;<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:3:55:464:146
-AAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:3:55:464:146
-CTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTAC
-+
-;(;;;;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:3:6:1064:1805
-TAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:3:6:1064:1805
-TTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTT
-+
-;88<;<;;<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:3:88:84:1558
-AGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGTG
-+
-<<;<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<::<<<<<<7&<
-@EAS114_39:3:88:84:1558
-ATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAA
-+
-;;<<;<<;<<5<<<<<<;<<:<<<;<<<<<<;<<<
-@EAS114_39:4:10:1312:1558
-AACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAA
-+
-<<:<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:4:10:1312:1558
-AGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGC
-+
-5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<;8;<
-@EAS114_39:4:30:432:228
-ATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACT
-+
-<76<<<:<<<<<<<;<:<<<<<:<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:4:30:432:228
-GACATGAGTTCAGGGAAAGGGGTGGAAAAAGATGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<:<<<<<;;
-@EAS114_39:4:30:570:902
-AAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTA
-+
-<<<<<<<<<<<;4<<:<<44<<<<<<<<<<<4<<+
-@EAS114_39:4:30:570:902
-ATACTCACCATCATAAATACGCACAAAAGTACAAA
-+
-<:<6:6<&:<<6<<<<<<<<.<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:4:43:1047:1626
-GATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGT
-+
-<<4<<<<<<<<<<<:<<<;<<<<<:<7<<;<<<<<
-@EAS114_39:4:43:1047:1626
-GTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<:<<<<:+;-4:(
-@EAS114_39:4:58:271:612
-AGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTA
-+
-<;<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<+47<<;<::
-@EAS114_39:4:58:271:612
-ATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGCAA
-+
-;:2=<<;<<<<<<:67:<<:<<<<<<<<<<<<,<<
-@EAS114_39:4:93:77:1338
-GCTGCTTACAAGAAGCGCATTAATAAAGACATGAG
-+
-<<<<*<2<<<:<4<&<6<8<4<::<8<<<<82;;7
-@EAS114_39:4:93:77:1338
-GTCATCATACAATGAAAAAAAGATCAATTCAGCAA
-+
-<<7<7<<<<<1<7<<&97;;<1<;1<<7<;7<<;<
-@EAS114_39:5:17:1222:783
-AAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCGT
-+
-<<<<<<<)<<<16<<;<<<6<4<:<4<+://<7)<
-@EAS114_39:5:17:1222:783
-TGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATT
-+
-6<<<8<69<8199<7<<<6<<<<<<<<<1:<:<<:
-@EAS114_39:5:42:1223:1087
-CAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<5<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:5:42:1223:1087
-TTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAA
-+
-;:<<<:<7<<<;;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:5:50:972:1286
-AGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<6<<7:7:;
-@EAS114_39:5:50:972:1286
-TTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCAC
-+
-:;;7;7;;0<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:5:61:1000:1534
-CTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCA
-+
-<<<<4:<:<1)<<<<<<<+<:44<</7<<<)4:<)
-@EAS114_39:5:61:1000:1534
-GGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGA
-+
-<<;<<<<;;<<;6;<<<;<4;<<7<<<<<;<<<<<
-@EAS114_39:5:93:312:331
-AACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<=<<
-@EAS114_39:5:93:312:331
-ATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACT
-+
-<;;:;<6<<<<;<:<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:6:13:1034:1144
-AAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTC
-+
-<<:%<9)<<<<<<8<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:6:13:1034:1144
-AATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<<;<<;<++
-@EAS114_39:6:34:380:815
-AAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;:
-@EAS114_39:6:34:380:815
-ATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTT
-+
-;;;;<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
-@EAS114_39:6:71:644:1792
-AAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATT
-+
-<<<<;<<<<<<:;/<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:6:71:644:1792
-CCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAAT
-+
-<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<;:<:<
-@EAS114_39:6:76:282:1668
-AACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGG
-+
-<<<<<:<<<8<8<<<<<::<<<<7<<<<<<2<<<8
-@EAS114_39:6:76:282:1668
-TACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<;<;<<<8
-@EAS114_39:6:7:492:1088
-ACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<:<<<<<<6;
-@EAS114_39:6:7:492:1088
-TGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATT
-+
-4;<<75<<::<:<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:6:85:1224:625
-GAACTCCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTC
-+
-17;;7&-;<;<;:<6<<:;<<<<<<<;<<<<<<<<
-@EAS114_39:6:85:1224:625
-GCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTCCTT
-+
-<<<<<<<<<;<<;<<7<<:<<7.<<<:&7<<.<;<
-@EAS114_39:6:94:1273:1462
-AAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<:<<<<:6:7;744;
-@EAS114_39:6:94:1273:1462
-CCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAAT
-+
-8.<<<;<:<<<<;<<;;;<<<;<;<;<<<<<<<<<
-@EAS114_39:7:100:708:1984
-AGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCT
-+
-:8<(8<)9<;<<<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:7:100:708:1984
-TACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<7%:
-@EAS114_39:7:23:1126:1886
-ACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATAT
-+
-5*.:.5<<::<<<<<<<<:5<<<<<<<<<<:2<<<
-@EAS114_39:7:23:1126:1886
-GGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCA
-+
-7<<<7<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<;8<;<<5<
-@EAS114_39:7:32:562:1695
-GATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGC
-+
-:5:::<88/<:<<<<<<<<<7<9<<&<959<<<<<
-@EAS114_39:7:32:562:1695
-TAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<:<<<<<<<:<8<<<<
-@EAS114_39:7:57:1114:2032
-TAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAA
-+
-<7<<<<<<<<<<<<<<<<<777<<<7<<<<<3<<7
-@EAS114_39:7:57:1114:2032
-TATTACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAG
-+
-;+!5<4<<<<<<<<<<<<<;<&<;7<<<<<<<<<<
-@EAS114_39:7:90:406:631
-CATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<:;<<<<;<<8;<8
-@EAS114_39:7:90:406:631
-TGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTT
-+
-<<<:<:<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_45:1:100:979:1863
-ATTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAAT
-+
-6&,*3;6;66;9(572692;;;79;4)9;96;59+
-@EAS114_45:1:100:979:1863
-TTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGG
-+
-;<;;;;;;;7;;;79;;77;9;;99;974;677-6
-@EAS114_45:1:12:1296:358
-CTTGAAAGCTTGGTCTGTAATGATGCCCCTTGGCC
-+
--770074;;6;&42;:2;;;:;;;;:;;/:;;;;:
-@EAS114_45:1:12:1296:358
-GTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCAT
-+
-;;;6;7;7;;;;;7;9;;-*1;9;699/99/7477
-@EAS114_45:1:2:1422:1820
-CACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAA
-+
-*4617;;4;1;;79;/7&,4;9;;;7<;;<<<;<<
-@EAS114_45:1:2:1422:1820
-TACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGC
-+
-;7;;;;;;;;:;;;;;;;;;;;;;;;;;;;77777
-@EAS114_45:1:30:1882:1210
-ATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAA
-+
-776778;5;;;;8;;7:8;;;;;;;<<<;;;;;<;
-@EAS114_45:1:30:1882:1210
-GCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTA
-+
-;;::;;;;:;;;;;:;;;;;;9;;:7;;8:77777
-@EAS114_45:1:33:1407:94
-TAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAG
-+
-;;;;;;;6:;;:::7;:;;;;:::;;;;:;47771
-@EAS114_45:1:33:1407:94
-TTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGAT
-+
-77477;4;;;;;44;;;;;;7;;;;;;;9;;;;;<
-@EAS114_45:1:77:1000:1780
-AGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAG
-+
-777774;;4-7;;;;;;:;;;:;;;<;;;;<<<<;
-@EAS114_45:1:77:1000:1780
-TGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAA
-+
-;;;:;;;;;;;/;;;7:4;;7;;;;;;;;;77777
-@EAS114_45:1:84:275:1572
-AGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCC
-+
-777777::7:;74;:;:7;:::;;;;:;;8;;;<;
-@EAS114_45:1:84:275:1572
-TTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAAC
-+
-/6;;;4;;;;;;;;7;;4;.4;;;;;6;;;77077
-@EAS114_45:1:95:1530:28
-AAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA
-+
-;;;;;;;;;;:;;;;;;;8;;;;;;;;;;;77747
-@EAS114_45:1:95:1530:28
-AATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAA
-+
-77741(9;;994;5;;4;;1;;;;;1;<;<<<<;<
-@EAS114_45:1:9:1289:215
-AGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCC
-+
-7747*7;;;;+;;:2;7;:1;;9:;:;:;;:;::;
-@EAS114_45:1:9:1289:215
-TATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACA
-+
-;;;;;;9;;;67;;;;;99;9;;;;;;;;977747
-@EAS114_45:2:13:1507:1146
-AAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGA
-+
-88788;,;:-:2;;;;;;;;:;:;;;;;;;;;;;;
-@EAS114_45:2:13:1507:1146
-CAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCT
-+
-;<9;;;;<<;;;;<<;<;;;;<;;<<;<;<99777
-@EAS114_45:2:15:1497:1530
-AATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGC
-+
-0<;;;9;;86<;;;<<&<<.<<;)3;7;654-471
-@EAS114_45:2:15:1497:1530
-TAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCC
-+
-77778:;;;:;;;;:9;:;;;;;;;;;9;:;;;;;
-@EAS114_45:2:1:1140:1206
-TCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGT
-+
-;;;;;;;;;;;;;:9;;7;;:;:;97;:;:88888
-@EAS114_45:2:1:1140:1206
-TTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCT
-+
-77977::99;;;:;;<;;;:;;;<<;<;;;;<;;;
-@EAS114_45:2:20:413:1334
-CCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTT
-+
-7<<;<<<.;<;67;7;;;:;;3;<59+...77677
-@EAS114_45:2:20:413:1334
-TTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAG
-+
-88878777;:;:1:;9;;;6;;;6;9;;;;;296;
-@EAS114_45:2:23:1754:796
-CTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAA
-+
-;<<;<;<;<;<;<<;;;;;<<<<;;<<<<<97999
-@EAS114_45:2:23:1754:796
-CTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTTTTT
-+
-88897;;;;:;:;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
-@EAS114_45:2:33:1445:1357
-TATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAA
-+
-;;<;<<<<<<;;;<9:;:;;;;;:;:;;;;99777
-@EAS114_45:2:33:1445:1357
-TTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAA
-+
-88888;;;;;;;:;;;;;;;:;9;;;;;;;;;;;;
-@EAS114_45:2:41:199:388
-AGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGG
-+
-;;<<<<<;;<<<<<<;;<;;<<;;<<<<<<99999
-@EAS114_45:2:41:199:388
-TCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAAT
-+
-84898;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
-@EAS114_45:2:49:163:904
-GCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGG
-+
-;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;78958
-@EAS114_45:2:49:163:904
-TCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTC
-+
-79779<<<<<;;;;9;;<<7<;*9<<<7<<;<<;<
-@EAS114_45:2:54:1886:719
-CTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGT
-+
-;;;9;;<;;;9;;;;;:;<9;:;;;;9;;;99799
-@EAS114_45:2:54:1886:719
-TTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACA
-+
-883777;;:;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
-@EAS114_45:2:59:396:359
-GGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAAC
-+
-28288;;;;;;;;;::;;;;:;;;;;;;;;;;;;;
-@EAS114_45:2:59:396:359
-TCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGA
-+
-<<9;;<;<;;;;<;;9;;;;;<;;;;;<;;77677
-@EAS114_45:2:76:1765:700
-AAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATA
-+
-77777;;;;7;7;<;;;;+;;<9<<<79;<1<<77
-@EAS114_45:2:76:1765:700
-GTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGT
-+
-;;6;;;;;;;;;6;;;;6;;;;;;;;;;;;88878
-@EAS114_45:2:79:554:354
-AAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAA
-+
-17;<;;+<<;;;;93;;:;3;;;;1;;;;<77744
-@EAS114_45:2:79:554:354
-CAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAA
-+
-98988;7;;;;:;;;;;;;;;;:;;;:;;;;;9;;
-@EAS114_45:3:26:1867:162
-ATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAAC
-+
-;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;78698
-@EAS114_45:3:26:1867:162
-ATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCT
-+
-97999:;<<9;;<:<<;;;<;;<<<<<<<;;<<<<
-@EAS114_45:3:27:1881:486
-AAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTC
-+
-99797;;9:<:;;;<;;;;<<<;;;;<;<;;<<<<
-@EAS114_45:3:27:1881:486
-CCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCAC
-+
-;;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;78;8;8;8878/
-@EAS114_45:3:2:1200:1076
-CATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTA
-+
-7779779;9;:;;4;;9;;:7;<<<7;;;:<;<<;
-@EAS114_45:3:2:1200:1076
-GATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATG
-+
-;;;;;;;;;;/;;;;;;;;6;;9;489;;;88888
-@EAS114_45:3:32:1379:738
-TTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAAC
-+
-;;;;;;;8;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;88888
-@EAS114_45:3:35:896:1588
-CTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGG
-+
-77999:.:<<;<;;;<<;<;<<<<<;<;;<<<<;;
-@EAS114_45:3:35:896:1588
-GAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTT
-+
-;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;;;;8;;;88989
-@EAS114_45:3:39:208:644
-ATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACC
-+
-<;<<<<<;;:<<;;<<<<<<;;;;;;.<;<79997
-@EAS114_45:3:39:208:644
-TTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAG
-+
-78899;;;;4;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;8;;;
-@EAS114_45:3:3:1377:1663
-CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCA
-+
-<<;;;;<:;;:<;;<;;<;:;;<;9;;::977676
-@EAS114_45:3:3:1377:1663
-GGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACAC
-+
-6-88663;8;81;;66;8;;89939;;;67;2;;;
-@EAS114_45:3:3:864:1888
-AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATG
-+
-888588;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;;;;;;;
-@EAS114_45:3:3:864:1888
-CAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGA
-+
-;<<;;<<;;;<;;<<;<;<<;<<;8<<:<;79799
-@EAS114_45:3:41:653:1568
-AACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTT
-+
-977979;:;<;;;;;;<<5;<;<;<<<;;;;;;;;
-@EAS114_45:3:41:653:1568
-GGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTA
-+
-;;;;;;;8;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;88888
-@EAS114_45:3:44:1578:1674
-CCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCT
-+
-;<<;<<;<<;;;;;9<;9;;<9:;;<:;9;76669
-@EAS114_45:3:44:1578:1674
-GCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGA
-+
-62631;;4;;;8;;48;;7;8;;;;;;;;;8;;;;
-@EAS114_45:3:75:217:337
-GACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAA
-+
-4779797;;;<;:4;;<<<77<;;;7<<;<;<;<<
-@EAS114_45:3:75:217:337
-GAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCT
-+
-;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;;;;;;;;;;88787
-@EAS114_45:3:90:1403:1635
-TGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAA
-+
-86878;;;8;788;;;;;;;;;;;;;8;5;;;;;;
-@EAS114_45:3:90:1403:1635
-TTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCT
-+
-<<;<;<<<<;<;<;;<<<<<9;<.;;<:;99.979
-@EAS114_45:4:48:310:473
-TGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAA
-+
-<<<;<<;;;<<;;<;;;;;;;;;;;;;;;;89799
-@EAS114_45:4:48:310:473
-TTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAA
-+
-77999;;6;;;;;;;;;;;;;;;9;;;;;;;;;;;
-@EAS114_45:4:73:1208:495
-AGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCA
-+
-8-889<<;<;;:<;<;;;;;;<<;;<;;;;<<;;;
-@EAS114_45:4:73:1208:495
-TAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCC
-+
-;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5;;;;;37377
-@EAS114_45:4:7:1347:375
-CTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATC
-+
-;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;9;;;8;;;;;97777
-@EAS114_45:4:7:1347:375
-GGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGA
-+
-47999<<<;;;;;;:5;:;<;;<;;;;;<;;;;;<
-@EAS114_45:4:87:323:895
-ATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCT
-+
-;<<;;;;<<;<959;;;<;:<<;9<;;;4377788
-@EAS114_45:4:87:323:895
-GGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACA
-+
-55777;;;939;9;;9;;;;9;;;;;;;;;;;;;;
-@EAS114_45:4:88:55:1187
-GTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAG
-+
-;;<;;;<<99<<;;<;;;;;:;49;:;;;;87898
-@EAS114_45:4:88:55:1187
-GTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAA
-+
-7769,7;;;;;;;;;;;;;;9;;;;;;;;;;;;;;
-@EAS114_45:5:56:1757:1319
-CATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGG
-+
-&7778<<<<<8<;<<:::;<:<4<<:<:;8<8<;<
-@EAS114_45:5:56:1757:1319
-TTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACT
-+
-;;;;9;;;;;;;;;;;;;4;9;98;;;;;9388&7
-@EAS114_45:5:62:841:1994
-ATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAA
-+
-87878;;6:;;:<<<<:<:;;;<;<<<;<;;<;<<
-@EAS114_45:5:62:841:1994
-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
-+
-!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
-@EAS114_45:5:66:959:1311
-CAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAGGCCCATCTGGAGC
-+
-;;4;;;+;;;-01;;&-;;4;;&;;73)(&**274
-@EAS114_45:5:66:959:1311
-GGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTT
-+
-67.68:4::6;;;7:6:;:5;8;;<<:;;<;;;;<
-@EAS114_45:5:82:843:1838
-CTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAA
-+
-;<<;:;;<<<;;<<<<;;<<;;;;;<;;;;68887
-@EAS114_45:5:82:843:1838
-TGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGA
-+
-888829;;;;;;;;;;;;;;:;;;;;;;;;;;;;;
-@EAS114_45:5:85:401:1190
-TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC
-+
-64778:;69739:;+9::7;;;<;6<;7;;;;;7<
-@EAS114_45:5:85:401:1190
-TCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGA
-+
-4;;;1;;;;;;.6;;;(;;/;/;3;;;7;(3&063
-@EAS114_45:5:91:89:666
-GAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACAT
-+
-74752;;4;;;;;;;;7);;;4;;;;)4;;;;;13
-@EAS114_45:6:14:1211:1332
-AGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGAT
-+
-978961;;991;97;<;;<;<<;;;;;<;;<:8:<
-@EAS114_45:6:14:1211:1332
-TTTCAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAA
-+
-;;.;;;;;;;3;;;;;6;;;;;;8;;;;;;63777
-@EAS114_45:6:37:156:134
-AGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCC
-+
-99998<<<<:<<<<<<<;<<><<<<<<<<<<<<<<
-@EAS114_45:6:37:156:134
-GGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACC
-+
-;;;;;;;;;;9;;;;;;;;;;;;;;;9;;;77679
-@EAS114_45:6:39:956:676
-TAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGA
-+
-899985;;<;:9;;:9<;:9:5;<;;;<;<;<<<<
-@EAS114_45:6:39:956:676
-TGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAA
-+
-;;;;;;;;;;;;9;;;;;;;;;;;;;;;9957777
-@EAS114_45:6:44:77:1255
-CTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGT
-+
-;;;;;;;8;;;7;8;;;;;;;;;;886;;;76777
-@EAS114_45:6:44:77:1255
-TAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATC
-+
-79998;;;9:;<696<;.<;;<<;<;<;<;;;<8;
-@EAS114_45:6:45:1769:1130
-ACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAA
-+
-;;;;;;;;;;;;9;;;;;;19;;;9;;;;176777
-@EAS114_45:6:45:1769:1130
-TGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTAG
-+
-88989;<;97;9<<;<;;;;9<98<<<<<<<;<<<
-@EAS114_45:6:47:1791:444
-AAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGT
-+
-978879;:;;<:;;<<;:<9<<<<;6;;;;<<<<;
-@EAS114_45:6:47:1791:444
-TACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACA
-+
-;3;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;877977
-@EAS114_45:6:59:1548:1096
-CCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTG
-+
-88888;;88;;;;8;;9;;;<<<<<<<<<<<<<<;
-@EAS114_45:6:59:1548:1096
-GTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTC
-+
-;.;;;;;;;;6;;;;;;;;;;;;;;;73;;77777
-@EAS114_45:6:5:730:1436
-GAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAA
-+
-7977979;;;;;;;;;7;3<;2<;26;<;<<;;<<
-@EAS114_45:6:5:730:1436
-TATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGT
-+
-;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;;;;8;;;;;67777
-@EAS114_45:6:86:693:234
-AAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGA
-+
-;;;;;;;;;;;;;;;;9;;;;;;;;99;;&70777
-@EAS114_45:6:86:693:234
-GTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGA
-+
-83997;<;;;;98;;3*6<<;<:8;;;;;<;;<<<
-@EAS114_45:6:86:859:1779
-TTTTTTTCATTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
-+
-;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;)7699
-@EAS114_45:6:90:561:850
-ACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTT
-+
-;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;9;9;6;77777
-@EAS114_45:6:90:561:850
-TACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGC
-+
-78376<;;9<;<<;:9<<<6;<;<;;8;;<;/;;;
-@EAS114_45:6:93:1475:542
-TGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCAT
-+
-98987:9:<:;:;;;;;<<;<;<;;;;<<<;;;<<
-@EAS114_45:6:93:1475:542
-TTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTC
-+
-;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;9;;;9;;;77777
-@EAS114_45:7:14:1256:204
-AAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATAT
-+
-66777:;;37;;:;;0;:;;;;):;;:7;;;;;;;
-@EAS114_45:7:14:1256:204
-TCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTC
-+
-<<<<<;;;;;;<;;;;;;;<;<;;;;<:-;79697
-@EAS114_45:7:14:978:1296
-ATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGAT
-+
-;6;;;;;;;;;;;:;;;;;;;6;;;;;;;;77777
-@EAS114_45:7:14:978:1296
-CAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATA
-+
-77177;9;2:;;:;;(;;9;<;;;;:;;;:7;<<;
-@EAS114_45:7:24:1374:211
-AGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTG
-+
-;;:<<;<;:;;;;;;;;;;<::;;;6;;2+74917
-@EAS114_45:7:24:1374:211
-TGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCT
-+
-77661;;;5;;:;;:;:;;;;;;8:;;;:;;;;;:
-@EAS114_45:7:2:168:1878
-AAAAAACCTGGCAAACACGAATGTTATGACATGTN
-+
-;<:;;<:<;<;<;;;;:;<;:::&9:&:68&6&*!
-@EAS114_45:7:2:168:1878
-TAAATACACACAAAAGTAGAAAACGCACCAGTTTT
-+
-*3/6)9.;;;;;;;;5;;);;;3;(;;;+(;7.)3
-@EAS114_45:7:33:1566:588
-ACAGCTTAGGCATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAG
-+
--6246;;97;77;;97;;;;;;9;7;79;)&;37;
-@EAS114_45:7:33:1566:588
-TACTGTCATAACTATGAAGAGCCTATTGCCAGATG
-+
-<;.;;;;6;;;;6;;29;;;<+9;;;.3;;73797
-@EAS114_45:7:35:538:1882
-TATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAA
-+
-;);43.50;3;93;;4;3;;;9-7.;*;;966*75
-@EAS114_45:7:35:538:1882
-TCTATAACAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATA
-+
-73797;;3<;;<6;;<<<;8:;:;<;:<:;<<;;;
-@EAS114_45:7:37:763:1437
-AAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAG
-+
-;;;;;6;;;;;;;;;:;6;5;5;;;;;76;767/7
-@EAS114_45:7:37:763:1437
-TAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGA
-+
-79979;<;<;;;<;;;;;;6:;<:;<:8;<<<<;<
-@EAS114_45:7:45:1339:1807
-GACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGG
-+
-77797;;:;::&:;;0:;8;;4;;:;;6;;;;;;;
-@EAS114_45:7:69:1130:832
-ATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGC
-+
-;;2<;<;;<;9;<;;;;;;;7;8;;7;;;;77437
-@EAS114_45:7:69:1130:832
-TCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAA
-+
-6)377;3;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;
-@EAS114_45:7:6:758:988
-AAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGAT
-+
-3+;0;0;;;0;;;;;;5;;;9;;;;90;;;57560
-@EAS114_45:7:6:758:988
-ATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTT
-+
-3-7*73;;399:9;9;7<-(<;;<;;:;9::;;7;
-@EAS114_45:7:88:451:1773
-ATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTT
-+
-;;:::<:;:<<;:6::;:;;:::;;<;;;367177
-@EAS114_45:7:88:451:1773
-ATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTA
-+
-973776;;;;;;;;;::;;;;;;;;;;;;;;3;;;
-@EAS114_45:7:97:1584:777
-CCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTAT
-+
-<<;<;;;;<;<;<<;;;;;;;;;;;;;;:;79979
-@EAS114_45:7:97:1584:777
-GTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCC
-+
-66746,9::9;;;;:;;;;;;;;;;;;;;;:;;;;
-@EAS114_45:7:9:512:826
-AACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTG
-+
-67<<<;;;<;;<<;;<;<:;9;;;9;;;;<59777
-@EAS114_45:7:9:512:826
-ACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACAT
-+
-76777:;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;:;;;
-@EAS139_11:1:35:631:594
-ATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:1:35:631:594
-ATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCTGCCCC
-+
-<<<<4<<<<<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:1:59:742:549
-ACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<
-@EAS139_11:1:59:742:549
-TTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCA
-+
--<<<3<<<<6<<6<<<<<6<<<<6<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:1:81:1019:558
-ACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGA
-+
-<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<
-@EAS139_11:1:81:1019:558
-TGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATT
-+
-<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:1:84:92:1246
-GAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<5<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:1:84:92:1246
-GTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<5<:<<5<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:2:31:628:1820
-AACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<
-@EAS139_11:2:31:628:1820
-CAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTG
-+
-<<<<<<:<<<<:6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:2:42:333:516
-AGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAA
-+
-<<<<<5<*<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<</
-@EAS139_11:2:42:333:516
-TCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATG
-+
-<<<<<<<<7<63<7<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<
-@EAS139_11:2:55:296:1457
-CACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGG
-+
--<%63<<<<<1<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<7<<
-@EAS139_11:2:55:296:1457
-CCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:2:63:816:921
-AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT
-+
-<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:2:63:816:921
-TGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<4<846
-@EAS139_11:2:6:251:1557
-AAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTTAC
-+
-<<<<<<<<<<<<6:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:2:6:251:1557
-CCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:2:71:83:58
-AAAGAAAAAAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:2:71:83:58
-CCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAG
-+
-8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:3:34:970:1374
-ATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;7<77;<<;<;;9;;:86:::
-@EAS139_11:3:34:970:1374
-CTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGA
-+
-<6<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:3:43:1229:1855
-ATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGC
-+
-8<<<<;8<<<;;5<<28<<<<<<<<<<<<7;;<<;
-@EAS139_11:3:43:1229:1855
-CAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<
-@EAS139_11:3:65:556:1505
-CAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:3:65:556:1505
-TGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCAC
-+
-<6<8<<4<8;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:3:81:12:1231
-AAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGT
-+
-<<<<<<<7<<<<<<<5<'<6/<<<5<<<<<<2<<<
-@EAS139_11:3:81:12:1231
-TTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGA
-+
-<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<6
-@EAS139_11:4:26:137:1382
-AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATG
-+
-<<-<8<<<<<<:<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:4:26:137:1382
-AGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTC
-+
-<<<<<<7<<<77<<<<<<</<<+<<<<<<7<+<<<
-@EAS139_11:4:36:1184:994
-GCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTT
-+
-<84<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:4:36:1184:994
-TACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<8<
-@EAS139_11:4:36:1231:1381
-AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA
-+
-<<<<<<;<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:4:36:1231:1381
-TAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:4:38:557:1441
-GATAAAAATAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCT
-+
-<&<<<<<,<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:4:38:557:1441
-TAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<
-@EAS139_11:4:50:30:15
-AGATTATGTAAAGTAACTTAACCTATGAGTCCAAG
-+
-+:79.68872.:9&:92/.299169/5+/6/3/&2
-@EAS139_11:4:50:30:15
-TACATTGCAAGACAGTCGTCAGCAAGATATGTAGT
-+
-1-%-22&&)&11,&/&&176<&<<<222<,6,<<<
-@EAS139_11:4:63:527:1923
-GCTTTACTGTCATAACCATGAAGAGACTATTGCCA
-+
-9<<<8<-8;;8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:4:63:527:1923
-TACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<3<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:5:32:686:735
-AAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:5:32:686:735
-CAGAAGAAAGAGGTTCANANNNTGANGACAAGTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<!<!!!<<<!<<<<<<<<<
-@EAS139_11:5:41:314:1173
-AAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGC
-+
-<;<<<<<<<;;<<<<<-<<<;;;<;8<*;;<<<<'
-@EAS139_11:5:41:314:1173
-AATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACA
-+
-<<2**<<82/<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:5:52:1278:1478
-GCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAAATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<
-@EAS139_11:5:52:1278:1478
-GTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTT
-+
-.8::<<<<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:5:61:38:1182
-AGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<<
-@EAS139_11:5:61:38:1182
-GTTTGATTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCC
-+
-9:;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:5:64:199:1288
-GTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<
-@EAS139_11:5:64:199:1288
-TACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:5:78:775:555
-AATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAG
-+
-<<-<%4/<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<0<<<<<<
-@EAS139_11:5:78:775:555
-TTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAA
-+
-6:<<<<:<<<<6:<<)::8<6<<:<<)<::63832
-@EAS139_11:6:11:285:1567
-ACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATA
-+
-<8<4<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:6:11:285:1567
-CCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:6:11:360:1577
-GAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<4<;;<<;;<;<<<8<<<<
-@EAS139_11:6:11:360:1577
-TTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGT
-+
-1<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:6:13:682:680
-AGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<
-@EAS139_11:6:13:682:680
-ATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAA
-+
-<<<<<<<<<<:<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:6:17:1179:393
-CTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:4<
-@EAS139_11:6:17:1179:393
-TGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:6:19:306:982
-ATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCA
-+
-<<<<<<<<<9<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:6:19:306:982
-GACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<
-@EAS139_11:6:75:946:1035
-AACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAA
-+
-<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<8;<6<<<<44<:4
-@EAS139_11:6:75:946:1035
-AATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCT
-+
-<<)4</<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<66<<<<
-@EAS139_11:6:82:164:1924
-GAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<3<<'<7<8
-@EAS139_11:6:82:164:1924
-GCCCAGCACCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTG
-+
-6<<<<<<-<<<<<<<<<2<<06<9<<<<<1<<<<<
-@EAS139_11:6:89:1151:1878
-CCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTC
-+
-<;;<<<<<;;;<<<<4;;::;<;8;;<;;8:<8<4
-@EAS139_11:6:89:1151:1878
-CTTTCAACGATTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTG
-+
-8<66,,<<<<<<:<<<<<9<<<:<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:7:24:1345:1627
-AGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<8<3
-@EAS139_11:7:24:1345:1627
-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
-+
-!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
-@EAS139_11:7:42:1091:1726
-CAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<8:<.<:
-@EAS139_11:7:42:1091:1726
-TCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATT
-+
-4443838<4<8<87<<3</8<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:7:46:695:738
-CAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACT
-+
-<<<<2<5<<-<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<3<<
-@EAS139_11:7:46:695:738
-TGAAACAGCTGAGTTTAGCGCCTGTGTTCACATAG
-+
-<;<<<<;<<),&4<3<<7&7<0;)).3;79;7<;0
-@EAS139_11:7:50:1229:1313
-ACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:7:50:1229:1313
-TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATGCCA
-+
-<<<<,<&<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:7:53:458:581
-CTCAATTAATTGTTTTATAAAACCTGTGAGTTTTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<99<<<<<
-@EAS139_11:7:53:458:581
-TTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:7:60:163:1612
-AGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAA
-+
-<<<<<<<<<21<<<<<<<<<3<--<+<<<+<<63<
-@EAS139_11:7:60:163:1612
-GGGAACTAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAAT
-+
--<<<<)<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<
-@EAS139_11:7:74:213:877
-AGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAA
-+
-<<<<<<<&<<-<-<<<7<<<<<77<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:7:74:213:877
-TTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:7:92:367:1495
-ACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<6<<
-@EAS139_11:7:92:367:1495
-CTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAA
-+
-<8<88<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:8:17:437:1378
-ACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:8:17:437:1378
-ATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATT
-+
-<<7<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:8:26:1221:222
-AAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:8:26:1221:222
-CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCA
-+
-<<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:8:38:842:395
-GTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<93<;9
-@EAS139_11:8:76:205:587
-GAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACGA
-+
-8<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<</<
-@EAS139_11:8:76:205:587
-TGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_11:8:82:566:1096
-CAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACA
-+
-<<<<<<<<<<:<<<<<<<:<<<<<<:<<<<<<<<<
-@EAS139_11:8:82:566:1096
-CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<;<;
-@EAS139_11:8:96:1314:1448
-CCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAATAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<4<<<<-<<<
-@EAS139_11:8:96:1314:1448
-GTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGA
-+
-<<<<7<<:<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:1:14:420:712
-TGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCC
-+
-1::::<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:1:14:420:712
-TGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTTTTTGAAGACA
-+
-<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<-;<<<&,<&*8111:6
-@EAS139_19:1:1:1598:843
-TCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAAT
-+
-1)::6::<<;<98<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:1:1:1598:843
-TGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATA
-+
-<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<4:8::
-@EAS139_19:1:36:481:1079
-GTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::::8
-@EAS139_19:1:36:481:1079
-TCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAA
-+
-:11+)*<4;<<<<<<<<<;;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:1:40:1596:1433
-CCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<1<<<<<::;::
-@EAS139_19:1:40:1596:1433
-GCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTT
-+
--:8:1841<4;<88<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:1:47:352:1492
-AGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGCCCACTA
-+
-:<<<::<24<04-&<;<<2<<<&<60)&<5<<6*8:)9+*
-@EAS139_19:1:47:352:1492
-TTTGTTTTGTATGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTA
-+
-+7+/7+/%%1'6+3++1;:</<<5<)27<<9<)9<<9<7<
-@EAS139_19:1:53:463:1132
-ATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCC
-+
-;::;:<<<<<<<<:<<;<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:1:53:463:1132
-ATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACANGAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<8<<<<<<<8<!1488
-@EAS139_19:1:58:726:1746
-AGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<8<<<<<<<<:8:8:88
-@EAS139_19:1:58:726:1746
-CAATTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTC
-+
-&:&::;<<<76<<:<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:1:82:946:392
-CAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<8<<8<<:4488
-@EAS139_19:1:82:946:392
-GAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTC
-+
-:;:;:,::<:;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:1:85:1521:58
-AAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAAT
-+
-:::86<<:<<8<<<<;<<8<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<
-@EAS139_19:1:85:1521:58
-CTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACC
-+
-<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<;;:7:
-@EAS139_19:1:87:1222:878
-TATAGGGCCTTTGTTCAAACCCCTTGCAACAACCTTGAGA
-+
-&+6<6&<:<<9<1112<<;)9227</);;;2-79;)/769
-@EAS139_19:1:87:1222:878
-TCAGCGCGTCACTCCGCTCTCATTCACCCCAGCTCCCTGT
-+
-!!;*:885<&<<<)8&<:<<<8<8<::*<4<88<<<8<<<
-@EAS139_19:1:99:1632:76
-AAAGAAAAAAAACCCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTG
-+
-<<<<<<<<<<<<*<<<<8<9<<<<<<<<<9;;;;<18:;:
-@EAS139_19:1:99:1632:76
-TTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATA
-+
-4641::<<4<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:2:12:1335:1372
-GAAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTT
-+
-:&;;;<*<<<9<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:2:12:1335:1372
-TAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<99::.:
-@EAS139_19:2:29:1822:1881
-AGAAAAAAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<:<<<:<<;:::::
-@EAS139_19:2:29:1822:1881
-ATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAA
-+
-;87;;<<<;<5<5<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<:<<<<<<
-@EAS139_19:2:2:1217:398
-CAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAA
-+
-+;;:9<<66<<<;+<<7<<<<;<<+;<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:2:2:1217:398
-TAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<7<<<3<<<<;<<<<9:7::
-@EAS139_19:2:33:1193:664
-GCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTTCTGCATCCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<%:<'<9:::9
-@EAS139_19:2:33:1193:664
-TATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAA
-+
-;;;;;;<;;-9<<<:</+9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:2:57:1672:1890
-CCCCCCCCCCCCCCCCCAGCCACTGCGGCCCCCCCAGCCA
-+
--+)%)'-'+,,<066,))090+:&486083:5&&:<<5<0
-@EAS139_19:2:57:1672:1890
-TATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTA
-+
-:;;;9<8;;*<<<<<<:<<<<<<<<1:<<<<<<<<<<<7<
-@EAS139_19:2:82:154:1333
-TTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACACAGCTAAAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;;:;:
-@EAS139_19:2:82:154:1333
-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT
-+
-:5'::<<<;<<<<<<</3<<<&4&7<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:3:10:349:1147
-GCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAA
-+
-:/:::<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:3:24:1135:563
-CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGA
-+
-6+96:87<&8<<79:<;<<<<:<<;<<<<<<;;<<<<<<<
-@EAS139_19:3:24:1135:563
-GCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCAACAACC
-+
-<<<<:<<<<:1:<<<<<<.<<<<<<<<;<;;;43+:30::
-@EAS139_19:3:4:1502:1911
-CTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTT
-+
-:+:::5/;99<;<&<*<-9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:3:4:1502:1911
-TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGC
-+
-<<<:4<<<<<<;<<<<;9;5<95<;<<;9+;1612:1:::
-@EAS139_19:3:58:923:1915
-GCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTA
-+
-:+;;;8<<<<<<,<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:3:58:923:1915
-TATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<:::::
-@EAS139_19:3:5:538:401
-AAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATG
-+
-<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;<::7<<;<53:<98;;;;;
-@EAS139_19:3:5:538:401
-TTTGCCTTCACACCCTACACGAATGCGTCTCTGCCACAGG
-+
-671&7::49:&0<<<(<::<&<<<:<<<<<<<&<<<<1<<
-@EAS139_19:3:66:718:481
-AACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATG
-+
-::5::1<;;<<<<<<1<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:3:66:718:481
-AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<:1:;:
-@EAS139_19:3:73:1158:535
-AATAAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT
-+
-+;6+;<;<<<<<<<<<0<<;<<<;<<<8<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:3:73:1158:535
-CCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<;;<<<<<9<<9::8:8
-@EAS139_19:3:73:936:1509
-CTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTTATTT
-+
-<<<<<<<<<7<<7<<<<<<<;<<<<<<<<<:<:<;%8:::
-@EAS139_19:3:73:936:1509
-TTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCT
-+
-99;66:<<;-<<<<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:3:75:732:442
-CGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC
-+
-7,*&28<61:88<.7<:<<:6<1<85:<:1<5<&::<<&<
-@EAS139_19:3:75:732:442
-CTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGG
-+
-<<<<<;<<<<<9<<<;<<;<<<5<<;8<<<<<<<<;:9%%
-@EAS139_19:3:87:133:930
-CAGTCTCAGGGCGCCGTCCGTTTCCTCCCATCTGGCCTCG
-+
-)8&)907)-;9&,<<9)<;<<0<;<<99<<<<<<;<<9<<
-@EAS139_19:3:87:133:930
-TTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGT
-+
-<<<7<<<<;<<;7<<7<<;;<<<;<5;<;;;5;;<:/48:
-@EAS139_19:3:88:1656:896
-AGGGAAGAGGGATGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTT
-+
-<<<9<<<<<<<9<<<;<<<<<<<<<;6<<;7<<<<::9:;
-@EAS139_19:3:88:1656:896
-TGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGC
-+
-6/8::*9/*3*'<88<:9*<<<8<<<;<<<<<<<<;<<<<
-@EAS139_19:4:13:1155:631
-ACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTG
-+
-<<<<<<;<<;<<<<<<;<<<<<9<;<;94<<%<<<7:777
-@EAS139_19:4:13:1155:631
-AGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAAT
-+
-;:398<<;<<<<<;<3<;;<<<<;;<<<<<<<<<<;<<;<
-@EAS139_19:4:18:1335:1514
-ATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAA
-+
-::/::<<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:4:18:1335:1514
-CTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCAT
-+
-<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<;<<<<<<;<;<;;;9;
-@EAS139_19:4:1:156:196
-AAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<:;9:9
-@EAS139_19:4:1:156:196
-ACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTA
-+
-:::::<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:4:26:1312:1400
-ACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAA
-+
-<<<<;<<<:<<:<;<:<<<;:;<<<<<<:<8<1;;:::88
-@EAS139_19:4:26:1312:1400
-TATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA
-+
-::77:<;:+6<+<<<;<<74<<<;<<;<<<<<<<<<<<;<
-@EAS139_19:4:26:274:1078
-AATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGAC
-+
-<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;:;;;:::::
-@EAS139_19:4:26:274:1078
-GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCT
-+
-9:*:64<<;<<<<<<<<<;8;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:4:68:1122:79
-ATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCC
-+
-::77*:1<<<<<<<<<<<<<<<:;<<<;<<<<<<8<<<<<
-@EAS139_19:4:68:1122:79
-TGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<;<<<4;<<4;99::;
-@EAS139_19:4:69:1593:819
-ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;;<:<<<<<:<<<<<:777:
-@EAS139_19:4:69:1593:819
-CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAA
-+
-);::7<<<<:;<<<<<<<<<<<<<<<9<<9<3<<<<<<<<
-@EAS139_19:4:77:1780:693
-GGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGAT
-+
-:**::799<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:4:77:1780:693
-TGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<;<<:<<;<<<<<<<<<<<<;<<<;;:69
-@EAS139_19:4:78:806:800
-AAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA
-+
-::;9:<<<;<<:<<<<:<.<1:<<1<<<<<<;<<<<<<<<
-@EAS139_19:4:78:806:800
-AACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<:<1<0<;<9;<:78::::
-@EAS139_19:5:29:411:1208
-AAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCAC
-+
-<<<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;;
-@EAS139_19:5:29:411:1208
-CCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAA
-+
-766+6<996<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:5:40:758:116
-GTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAG
-+
-25/8/:<75:2<<<<<<7<<;<<<<<<<88;<<<<<<<<<
-@EAS139_19:5:40:758:116
-GTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:7262
-@EAS139_19:5:4:939:2021
-AAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAAT
-+
-;;;;:8;<5:<<<7/<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:5:4:939:2021
-GGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<97<<<;<<;<7;<<:48::
-@EAS139_19:5:57:366:844
-AAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGAT
-+
-;;;7:8&555<,;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:5:57:366:844
-TAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::::7:
-@EAS139_19:5:61:1885:163
-AGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<9::::4
-@EAS139_19:5:61:1885:163
-ATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTG
-+
-;:;;;;<<8<<:<<:<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:5:66:1381:181
-GGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGT
-+
-;;;+;;&<7<<<+<<<<<<<;<;8<<<;<<<<8<<<;<<<
-@EAS139_19:5:66:1381:181
-TTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACT
-+
-<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<::4:7
-@EAS139_19:5:68:306:409
-AACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAG
-+
-::2:7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:5:68:306:409
-CCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;:;;
-@EAS139_19:5:70:318:1631
-TAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGA
-+
-<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;9:<<<<<<<<<<<<<:::78
-@EAS139_19:5:74:668:424
-GACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTT
-+
-;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;::;;
-@EAS139_19:5:74:668:424
-GTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAA
-+
-:::::<<96<<<<<;<<<;<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:5:89:525:113
-GACGCTGAAGAACTTTGATTCCCTCTTCTTCCAAAGATGA
-+
-);:+4-&<<+<<:<+<)<<<7<8<8:<:<<:<82::<<2<
-@EAS139_19:5:89:525:113
-TATTTATGCTATTCAGTTATAAATATAGAAATTGAAACAG
-+
-<1<7<6;+0;7;7'<70;-<7<:<:<<5<<:9<5:7:%:7
-@EAS139_19:5:95:944:247
-GGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<:;:::
-@EAS139_19:5:95:944:247
-GTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCT
-+
-:7::;<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:6:21:1601:1666
-GAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAG
-+
-7<<<<<<<<:<<7<<<:<<<<<<4<<44<<914<;:5:::
-@EAS139_19:6:21:1601:1666
-TATTACTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAA
-+
--;;3&1<<<<<<<<<<<<1<<<</<<<<<</<<<<<<<<<
-@EAS139_19:6:52:1455:1212
-CCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGT
-+
-6::4::;4%;9:<79)<:<;<<:4::7<<9<&+71<9;<<
-@EAS139_19:6:52:1455:1212
-TTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCT
-+
-<9<<<99<;<<9<;<-<<<6<<75;;<*%<5<3+.8:*5;
-@EAS139_19:6:72:308:839
-AGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<;<99494416:
-@EAS139_19:6:72:308:839
-ATCGTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATT
-+
-:8:.:<;<<5<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:6:75:1503:1399
-CAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTA
-+
-&;;8;<<<;<<<<,6<<70<<7<<<<<<9<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:6:75:1503:1399
-CATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<;<<<<<<;<<<<:::711
-@EAS139_19:6:78:1029:512
-AGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGC
-+
-;;;;;<;;<<<.<<6;<<;<;8<<<<::<<<<<<<<;<<<
-@EAS139_19:6:78:1029:512
-TCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAAT
-+
-<0:;<<<<<<<<<:<<:;<<<;<7<<;<7;;;:6;::672
-@EAS139_19:6:82:1051:921
-GCAAATAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAAC
-+
-3-::-7<;+:9<;<<<5<;9,::53-;:3<<<<9<<3<<<
-@EAS139_19:6:82:1051:921
-GGGGAAATAAAGTCAAGGCTTTCCTGACAAGCAAATGCTA
-+
-<<<<<9<799<<<<7::/<<<9<7:9:;2:7552+9''66
-@EAS139_19:6:84:438:1505
-ATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACTCTGTCCTATGT
-+
-:0::413::;:::0:179::3<;<:<9<&6<<<;<019<<
-@EAS139_19:6:84:438:1505
-GCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTC
-+
-35<<:;9<;<;5<<<:<3<<7:<9/<)<<:::9<&5;;+1
-@EAS139_19:7:44:1807:833
-ATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<;<<9<<<<<89;;;:
-@EAS139_19:7:44:1807:833
-CTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCCAC
-+
-:6:9:<<<6<88<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS139_19:7:85:262:751
-CCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAC
-+
-22;99;<<8<<<<<<<;<;<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<+
-@EAS139_19:7:85:262:751
-TACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:::92
-@EAS139_19:7:92:288:1354
-TCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATT
-+
-<<<<<<:<<<<<<<<<<<8<<:<<<<;;<8<<<8<:8+::
-@EAS139_19:7:92:288:1354
-TGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGT
-+
-::::;;;<<<<9;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_4:5:103:870:105
-AAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<;<<7;
-@EAS188_4:5:103:870:105
-ATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<=<:<;<<<<<<<<<<*<<<<<<
-@EAS188_4:5:166:776:590
-CTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCC
-+
-<;:;<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_4:5:166:776:590
-TAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTAC
-+
-<<<<<</<<<<<<<<<<<<<'<=<:26.</79<::
-@EAS188_4:5:202:326:680
-ACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCTCAATTACG
-+
-<<<<<<<4<<<*<<<*<<<7..:7<3*:7.7<+.;
-@EAS188_4:5:202:326:680
-GTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCTGC
-+
-+33<81<:*<;<;;30;<<<;<<<8<<<<<<<<<<
-@EAS188_4:5:295:547:216
-ATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_4:5:295:547:216
-TAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;
-@EAS188_4:5:302:997:951
-ATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAA
-+
-<<<<<<<<<<;<<:<<52<<:;;<6<<;<:<2:9/
-@EAS188_4:5:308:552:77
-TTTTCTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTT
-+
-1;-<%<;8<<<<<&<5-<58:5:<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_4:5:8:377:655
-CTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCT
-+
-;<8;;:<;<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
-@EAS188_4:5:8:377:655
-CTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_4:7:282:567:481
-GGAACAGGGAGGCGCACTAATGCGCTCCACGCCCA
-+
-<<<<<<<<<<<<3<7<7<<<<;<<0)<<<<<<<<3
-@EAS188_4:7:282:567:481
-TGCAATTAATATAATTGTGTCCACGTACACACGCT
-+
-<9<6<;<9<<<;<<<;<5<7<5</7<<<<<<<<<<
-@EAS188_4:7:296:401:60
-AATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACA
-+
-<<*<<<<7<<)<<3<<<9<<<<<<<<<<<<<<;<<
-@EAS188_4:7:35:408:348
-AAGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATACACTCCAGC
-+
-4,'3<6;)2);<3<-6<;<;7+7<5+<<<7<<<<<
-@EAS188_4:7:35:408:348
-GGTTCTCAAGGTTGTTGCAATGGGGTCTATGTGAA
-+
-.73<;<<:77<<<<<<<<<<-<<;<<<<<<<<<<<
-@EAS188_4:7:78:583:670
-CAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTT
-+
-8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_4:7:78:583:670
-TAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCT
-+
-<<<<<<<<<<;;;<;;<<<:7;5;<5;;<2--8-;
-@EAS188_4:7:96:899:106
-TCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_4:7:96:899:106
-TTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATC
-+
-;;;;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:1:115:683:296
-AACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTC
-+
-<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:1:115:683:296
-CTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTC
-+
-<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<6<<<<3<<<<<<<
-@EAS188_7:1:177:522:118
-TAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<
-@EAS188_7:1:177:522:118
-TCTCAATTAATTGTTTTATAAAACCTGTGAGTTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<57<<<<
-@EAS188_7:1:290:286:763
-TTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<8<<
-@EAS188_7:1:290:286:763
-TTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT
-+
-<<<<;<<<<<<<&<<<<&77<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:1:316:949:122
-TCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCT
-+
-59899<<<<;;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:1:316:949:122
-TTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<0<:<<
-@EAS188_7:1:77:251:446
-CAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATT
-+
-<<9<<<<<<<<<<<<<97<<<<<<<<<96<<<+<<
-@EAS188_7:1:77:251:446
-TTATCATGACTCTATCCCAAATGCCCAATTACGTC
-+
-<<24,:8<<<:1<<<:35<:<:,<<<<<<:5:<<<
-@EAS188_7:2:152:765:744
-ACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTCGT
-+
-6<;6<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:2:152:765:744
-TTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<&<7293<<
-@EAS188_7:2:172:622:707
-ACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATA
-+
-92<3996;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<
-@EAS188_7:2:172:622:707
-TTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:<5:<<
-@EAS188_7:2:187:227:818
-CAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<;<<
-@EAS188_7:2:187:227:818
-CCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATT
-+
-<<9<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:2:19:736:559
-AAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATC
-+
-)<7<2;;4<<4<<<<;<<<<<<<<<<7<<<<<<<<
-@EAS188_7:2:19:736:559
-TGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<
-@EAS188_7:2:218:877:489
-TATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTG
-+
-9<<<8<<<;<9<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:2:259:219:114
-GAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<7<7<<<<<0<<9<
-@EAS188_7:2:259:219:114
-TTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAA
-+
-666<:6/:6::6::<:::<<<;<<<<<<<<;<<<<
-@EAS188_7:3:100:735:530
-GCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:3:100:735:530
-TGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:3:101:572:491
-CAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTG
-+
-8<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:3:101:572:491
-TTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<1<<<
-@EAS188_7:3:13:122:187
-AGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCA
-+
-<<&<;;<<<;7<<<<;<;<<<<<<<<<<<<;<<<<
-@EAS188_7:3:13:122:187
-GACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAGTCCCCTT
-+
-<<<<<<<;<;<<<;<<<<:;6<<<<;;;;:<<%%<
-@EAS188_7:3:15:568:42
-TTTTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT
-+
-!!;:<8<;<<<8<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:3:15:568:42
-TTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATA
-+
-!!!!!!!!!++++!!!!!!!!!!!!!!!!!!!,!,
-@EAS188_7:3:182:104:921
-ATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<
-@EAS188_7:3:182:104:921
-CACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATA
-+
-;<;<<<<<<:<<<<<:<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:3:200:712:439
-CGTCACCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTC
-+
-<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:3:200:712:439
-GTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAA
-+
-<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<7
-@EAS188_7:3:296:224:724
-ATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGC
-+
-<<<<;<<<<<<7;<<<<<6<<<06<<<<<<2(<<<
-@EAS188_7:3:296:224:724
-TGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAAC
-+
-8<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<;<9<
-@EAS188_7:3:76:333:905
-AATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACT
-+
-<<;<<<<;7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:3:76:333:905
-TTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACA
-+
-<<<<<7;<;<<6<<6<<7<<7<)&<4+6)0+<;(0
-@EAS188_7:4:164:719:947
-AAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<<
-@EAS188_7:4:164:719:947
-ACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCT
-+
-===,=========6====)================
-@EAS188_7:4:171:104:398
-AGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCC
-+
-=========)===97===3===4===4==,)=/)=
-@EAS188_7:4:171:104:398
-CAATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGT
-+
-79<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:4:21:443:404
-AGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCC
-+
-=9=9=9==:==========================
-@EAS188_7:4:21:443:404
-TTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<;<<;+<<<<<<
-@EAS188_7:4:238:441:727
-GTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<;;<<
-@EAS188_7:4:259:869:641
-GTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAA
-+
-99=:=9=99<=========<=<<============
-@EAS188_7:4:259:869:641
-TGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<,;<:<<<<<<<<<1
-@EAS188_7:4:92:693:228
-AAGGTTTTATAAAAAAATTAATTGAGACTACAGAG
-+
-6=77=<<=======&====================
-@EAS188_7:4:92:693:228
-AGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;9<<
-@EAS188_7:5:112:51:128
-AGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGA
-+
-++<<<<<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<;<;<6
-@EAS188_7:5:112:51:128
-CCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAAT
-+
-;9<;;:<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:5:115:249:673
-TAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<6<
-@EAS188_7:5:115:249:673
-TAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTT
-+
-:<<<;<<<;<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:5:163:982:695
-CTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGA
-+
-<:<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:5:163:982:695
-TCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;
-@EAS188_7:5:308:354:124
-GCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<
-@EAS188_7:5:308:354:124
-TGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCT
-+
-%+<)2<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:5:74:329:459
-ACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACA
-+
-</<;<8/<<9<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:5:74:329:459
-TAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;9;599
-@EAS188_7:6:107:447:488
-TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTT
-+
-<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:6:107:447:488
-TGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTA
-+
-<<3<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<
-@EAS188_7:6:107:636:642
-AAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTC
-+
-<<<<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:6:107:636:642
-GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:6:11:994:584
-GAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAG
-+
-<<<<;<<<<<<<;<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:6:11:994:584
-GGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTT
-+
-<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<3<6
-@EAS188_7:6:191:540:493
-AAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
-@EAS188_7:6:191:540:493
-GTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGT
-+
-<<9<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:6:194:998:663
-ACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAA
-+
-;</<<<7<<<<;<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:6:194:998:663
-TCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTA
-+
-<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<
-@EAS188_7:6:205:873:464
-AGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAG
-+
-<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<:<<,:<:<<<<::
-@EAS188_7:6:205:873:464
-CCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATT
-+
-<-((+:+;289<--;<;-;<:;;<<<;;<<<<<<<
-@EAS188_7:6:46:122:479
-AAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<
-@EAS188_7:6:46:122:479
-AAGTGAGAAGTTTGGAAGAACTATTTGAGGAAGTA
-+
-<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:7:19:886:279
-CCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTA
-+
-<9<<<<<<<<<<<<6<28:<<85<<<<<2<;<9<<
-@EAS188_7:7:19:886:279
-GAAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTA
-+
-9%<2)2.2::<;<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
-@EAS188_7:7:213:309:373
-TAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCA
-+
-<<<86<82<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:7:213:309:373
-TTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGAT
-+
-<;<<<<<<;<7<<<<<-<<<<<<<<<<<<<<4<7<
-@EAS188_7:7:243:876:758
-AGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;78<<
-@EAS188_7:7:243:876:758
-CCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCC
-+
-0%3<1;.70;3363;31;<<<<<<6<<<;<<<<<<
-@EAS188_7:7:67:719:786
-GGATGAGAAATTACCTAATTGGTACACTGTACAAT
-+
-;;<<<<<<&<<:13&<1<<<:<<<)/&/))<'6-<
-@EAS188_7:7:67:719:786
-TAAAAAAAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAA
-+
-$<<;<-1<<<8<<*&<;<;,<<3<<<<33<<<33<
-@EAS188_7:8:60:182:718
-GTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<;<;<<
-@EAS188_7:8:60:182:718
-TGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGT
-+
-<<<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:8:64:350:174
-CCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAAT
-+
-709<<;<;<<<<<<<;7<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS188_7:8:64:350:174
-GTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<6<<<<<:<
-@EAS192_3:1:114:19:769
-AAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATC
-+
-5+;+3/6;<+;/8<8*/<7/59<97147<;;9<7<
-@EAS192_3:1:114:19:769
-TAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCA
-+
-<<<<<*2;6;<<<4.;;<&;;<.<40)<);5-/7;
-@EAS192_3:1:225:195:543
-AACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGT
-+
-;;8;;+;(<<<<<<<<7;<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:1:225:195:543
-GGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<;::388998
-@EAS192_3:3:194:378:230
-AATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACC
-+
-<<;<8<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:3:194:378:230
-ATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:3:221:881:916
-TAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATAC
-+
-<<;<<8<<;<<<<<<<;<<<<28<:<8<:;<;;;<
-@EAS192_3:3:221:881:916
-TAATTCTAAATCTAGAACAAAATTAAAATTTAACA
-+
-44%-4(5<;9/,:<68:1<:8<:<<84;<<<<<;<
-@EAS192_3:3:257:611:440
-ACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGC
-+
-2<;;8<;;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:3:257:611:440
-GGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<;<<<<8<<+5
-@EAS192_3:3:27:973:518
-CTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCC
-+
-+<<<<<<9<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:3:27:973:518
-TCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;<<<<7<<<<<<<<88;0:8;
-@EAS192_3:3:285:349:797
-ATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:3:285:349:797
-GTTTTAAAAAACCAATAATTGAGACTACAGAGCAA
-+
-;;<<<7.:<<<..<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:3:309:187:267
-ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAAC
-+
-<:0;<;<4<<7<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:3:309:187:267
-GGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<;<;68;;8
-@EAS192_3:3:88:866:774
-ATGTAACAAATCTGCTCTTGTACTTCTAAATCTAT
-+
-<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<68<<<<<<
-@EAS192_3:3:88:866:774
-TTGTTTTCCACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTC
-+
-<<<;<<<<:<<<<<:<8<<<<<<<<<<8<<<<<<<
-@EAS192_3:4:184:237:476
-ATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAA
-+
-<;2<;<4<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:4:184:237:476
-ATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<;;<
-@EAS192_3:4:255:549:422
-AAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACA
-+
-&<;;+<;4;<<<<<<<<<<<;<;<<;<<<<<<<<<
-@EAS192_3:4:255:549:422
-CTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<:<<<<<<;;;<
-@EAS192_3:4:293:168:240
-ATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATGTA
-+
-<<<<;<<<;;;<;<<;;;<<;;<<::::<<;;+;7
-@EAS192_3:4:293:168:240
-CAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGAC
-+
-+;;;;<8<<86<<<<<<<;;8;7;<;<8<8;<<<<
-@EAS192_3:4:312:915:751
-AATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAAAGCTA
-+
-<:-<<<99:::);:7<4;8<<<<<<<;<2<+8<;<
-@EAS192_3:4:312:915:751
-ATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGG
-+
-<2<<<<<<<8;<<<<<<<<:<<<<8<<<<<84,4:
-@EAS192_3:4:63:5:870
-AAAGAAAAAAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTT
-+
-<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;;<<<
-@EAS192_3:4:63:5:870
-GAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTG
-+
-:<;<;<<<4:;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:5:197:914:256
-ACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTG
-+
-<5;<8<5/;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:5:197:914:256
-TCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8;:::
-@EAS192_3:5:223:142:410
-CTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTG
-+
-8;<<<;<<<<;<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<;<<
-@EAS192_3:5:27:577:849
-AGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<;<<<<<<;;;
-@EAS192_3:5:27:577:849
-TTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCC
-+
-5:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:5:287:334:110
-GATGAATACTAAGATTGATGTAGCAGCTTTTGCAA
-+
-.5+7)09<))&-&:33953<-./&&&)((;+3399
-@EAS192_3:5:287:334:110
-TATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<4;<<<<<<<::6<55:.
-@EAS192_3:6:116:464:261
-CAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATA
-+
-;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:6:116:464:261
-CTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<;;8<
-@EAS192_3:6:170:169:57
-GGCTTGACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCC
-+
-<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<:<<<<<;;+%
-@EAS192_3:6:170:169:57
-TGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAA
-+
-778<:<<<9<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:6:175:437:950
-CCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:59
-@EAS192_3:6:175:437:950
-CCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC
-+
-;;5:;;9<<:<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:6:185:868:496
-CCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTT
-+
-<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<9<<;<<<
-@EAS192_3:6:185:868:496
-GATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTAT
-+
-:;;<;;<<<<<<<<;4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:6:201:195:757
-CCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC
-+
-:<':<:<<46<:<;:<;<;<<9<<<<<<<<;<<<<
-@EAS192_3:6:201:195:757
-TATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;;;;8
-@EAS192_3:6:216:292:528
-GGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGT
-+
-;:;;8<<<<<<<<<<<<<:<<;<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:6:216:292:528
-TAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCC
-+
-<;<;<<<<<<<;<<<<<<<<;;;;:;;:<%<;1;:
-@EAS192_3:6:235:505:553
-GGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAA
-+
-;8518<<<<<;<;<<<;<<;<.<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:6:235:505:553
-GTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;:;:
-@EAS192_3:6:326:887:180
-CTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATT
-+
-8:<<:<5<<<;7<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:6:326:887:180
-TGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGC
-+
-;<<<<<;<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<0<;;<+
-@EAS192_3:6:45:183:25
-CAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<86;<;:;
-@EAS192_3:6:45:183:25
-CTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATT
-+
-;1<<;<<<;;;;<<<<<+<<<<<<<<<9<<<<<<<
-@EAS192_3:7:149:354:667
-CTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<><<<<<<<<;<:<<<<
-@EAS192_3:7:149:354:667
-GAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTC
-+
-;<;;;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:7:298:644:697
-CTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAAT
-+
-8:<8;<;:7;<<;4;:+<7<<<<;<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:7:298:644:697
-TCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<::;;;6<8:;;9;98;668;
-@EAS192_3:7:66:891:294
-AGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<;<<<<
-@EAS192_3:7:66:891:294
-TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTT
-+
-:<<5;;<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:7:78:692:671
-AATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACA
-+
-<<);<<;;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<
-@EAS192_3:7:78:692:671
-CAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<:<<:<<<:8<<0;;
-@EAS192_3:7:93:945:176
-CCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTC
-+
-6;;;8<<3<<8.<;6)<<<<<9<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:7:93:945:176
-GTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;;<;:7;<3
-@EAS192_3:8:6:104:118
-AAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<=<<<<<<
-@EAS192_3:8:6:104:118
-TCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGA
-+
-;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:8:6:237:885
-AAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATA
-+
-<<<<1:<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS192_3:8:6:237:885
-TATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT
-+
-<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;<;
-@EAS1_103:1:151:159:43
-AACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATA
-+
-;;4;6<<;<<<<7<77<6;<6<<<<<;;<<<<<<<
-@EAS1_103:1:151:159:43
-TCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGAC
-+
-<<<<<<<;<<<8<<<;<;8<<<<7<77;;79<09+
-@EAS1_103:1:228:736:747
-AAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACA
-+
-<<<<<<<<<;<<<<<<<;;<<;<<<<;::<;;7;7
-@EAS1_103:1:228:736:747
-TTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACA
-+
-<07<<&<;+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS1_103:1:274:176:479
-CCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTAT
-+
-7)<<7<626<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<<
-@EAS1_103:1:274:176:479
-GAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<9<59<<<<
-@EAS1_103:1:2:831:692
-GTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTA
-+
-2749'979<9<<<6;<<<0<;<<<<<3<<<<<<<<
-@EAS1_103:1:2:831:692
-TCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATC
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<<<9<<:9<<<;;96<796
-@EAS1_103:2:184:980:396
-AAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATT
-+
-<<;;<77;;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_103:2:184:980:396
-ACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<
-@EAS1_103:2:226:302:758
-GGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGG
-+
-;<<<<9;<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_103:2:226:302:758
-TGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTTTGAGCGNT
-+
-<<<<<<<;;;,<;<92;66<;))42<&2&(/1!!!
-@EAS1_103:2:234:167:381
-AAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGAT
-+
-<<;<;<<<<;<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_103:2:234:167:381
-AGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;;7<;;
-@EAS1_103:2:235:805:373
-TATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCA
-+
-<<;<<<<<<9<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_103:2:235:805:373
-TTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTTCCAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<;;<99;
-@EAS1_103:2:307:252:632
-ACCATCCTGCTAAATACATATGCACCTAACACAAG
-+
-<77<;,5<,9<<<<<<;<<<<<7<;<<<<<<<<<<
-@EAS1_103:2:307:252:632
-ATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;<;;
-@EAS1_103:3:253:175:31
-CAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<:<;;;
-@EAS1_103:3:253:175:31
-TTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGAT
-+
-;+;<;<<<<<<<<9<<9<<<<<;<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_103:3:277:921:474
-AAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<5<<;;;;;
-@EAS1_103:3:277:921:474
-AAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_103:3:320:505:814
-ACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCT
-+
-<2<;;5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_103:3:320:505:814
-CTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTTTTTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<;<<8<<76<<<<;<&<<<7
-@EAS1_103:3:323:196:855
-ACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAA
-+
-<<<<<<<7<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<;7:
-@EAS1_103:3:323:196:855
-TAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCA
-+
-&<<<<<<09<<7<7;<;<<0<<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS1_103:3:41:474:283
-TGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<+<<
-@EAS1_103:3:41:474:283
-TTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCC
-+
-6/;;;88;;<:;48<<<<<;<;<<<<<<<<<<;<<
-@EAS1_103:4:143:560:194
-GTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAAT
-+
-9:<;7<:::<:<;<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<
-@EAS1_103:4:143:560:194
-TCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCC
-+
-<<<<;;<<<<<<<<<<<6<;<<<<;;<<;9<999<
-@EAS1_103:4:164:79:134
-ACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<
-@EAS1_103:4:164:79:134
-AGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGA
-+
-<;<;<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_103:4:231:815:626
-GATCAATACAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTA
-+
-'<4%<<<22<<,<<;<<4;<<<<<<<<<<<<<<7<
-@EAS1_103:4:231:815:626
-GCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAG
-+
-<;<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;5<<<;:;
-@EAS1_103:4:235:899:847
-AGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAA
-+
-<<3<;<<<<<<<<<;;<<<<<<<+<<<+6<8<3/<
-@EAS1_103:4:235:899:847
-ATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCAT
-+
-<7<<<<<<<<:<<<<:<</<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_103:4:294:525:849
-AGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTA
-+
-;<;:;:<;<;<<<3<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_103:4:294:525:849
-CTGGCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9+<:<<<<9;;15
-@EAS1_103:4:61:433:385
-ACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAA
-+
-<*97<<<<&9<<;<&<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
-@EAS1_103:4:61:433:385
-GGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGCACTTTGAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<6<<)91<<;;,;
-@EAS1_103:5:141:711:813
-TATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGA
-+
-=<5<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_103:5:141:711:813
-TATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGT
-+
-<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:+<
-@EAS1_103:5:188:20:592
-CTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAAT
-+
-2<<7;<<<<,;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_103:5:188:20:592
-GAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<:<<<;<;;<
-@EAS1_103:5:285:241:560
-GAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATA
-+
-<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<;<;;;<.
-@EAS1_103:5:285:241:560
-TAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCT
-+
-:<<<<;<<,<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_103:5:319:165:698
-ATCACCCAGTCCCTGCCCCATATCTTGTAATCTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<9<<<<<<<;<<<<<
-@EAS1_103:5:319:165:698
-TGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGT
-+
-;5;2;<:;<<:<<<<<<<<<;:;<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_103:6:7:858:437
-CAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<3<<<<<<<<<33
-@EAS1_103:6:7:858:437
-CCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACAC
-+
-7;<4;;:;80<;<;<<<<<<:<<;<<<;;<<<<<<
-@EAS1_103:7:112:578:782
-AAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAA
-+
-+<<<%<<<<6<;<<<<6:<<<<:<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_103:7:112:578:782
-CAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAG
-+
-<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<
-@EAS1_103:7:139:578:951
-AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<0;;
-@EAS1_103:7:139:578:951
-GAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAG
-+
-;<0;:&<:9<<<7<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<
-@EAS1_103:7:166:84:766
-ATAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATA
-+
-%8<=+<-<<<</<<<<8<<<<<;<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_103:7:166:84:766
-GGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATG
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<;<<<7<;::93
-@EAS1_103:7:311:100:539
-AAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAG
-+
-;<;<<;;<;<<;<<<<<;9<<<;<<<<<<<<9<<;
-@EAS1_103:7:311:100:539
-CAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGA
-+
-<<<<;<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<:<::;7;<0;
-@EAS1_103:7:313:83:546
-TCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCT
-+
-;)<994<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<5<<<<
-@EAS1_103:7:313:83:546
-TGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAA
-+
-<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<4<<<:<;<<9
-@EAS1_103:7:53:783:78
-AAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTA
-+
-<;;;;<<0<,<<<<<<<<<;<<<;<;<<<<;<<<<
-@EAS1_103:7:53:783:78
-TGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<7;<:;
-@EAS1_105:1:115:226:443
-AAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAA
-+
-<<;;<;<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:1:115:226:443
-ATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<
-@EAS1_105:1:141:415:738
-AAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;<<;<<<<6:
-@EAS1_105:1:141:415:738
-TTACCTAGTTGCTCTGTAGTCTCAATTAATTGTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<8<<<
-@EAS1_105:1:234:185:359
-AAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;9--:
-@EAS1_105:1:234:185:359
-CAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAG
-+
-<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:1:28:745:352
-ATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAA
-+
-<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:1:28:745:352
-CTTCTAAATCTATAACAAAATTAAAATTTAACAAA
-+
-4;;*;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:1:297:283:948
-CCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<9;)+1;19-
-@EAS1_105:1:297:283:948
-TGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTC
-+
-6;;3;6<<66<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:1:329:407:872
-TTCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTTTTTTTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<6;<<&4::<++<(&;<<
-@EAS1_105:1:3:903:957
-AAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;<;<<<<<<66<;<<;
-@EAS1_105:1:3:903:957
-ATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGC
-+
-<%12<&<<<;<:<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:1:45:239:851
-CTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAAT
-+
-*2*0<<<<<<<<<<<<<<<<9<<3<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:1:45:239:851
-TGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAA
-+
-<<88;<208<9<;6<<<6269;94<&401-662&2
-@EAS1_105:1:87:430:995
-GAAAAGAGTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTG
-+
-1<4%81<..1<<<<<0<<<<<0.<<9<<(<6<<6<
-@EAS1_105:1:87:430:995
-TACTCACCATCATAAATACACACAAAATTACAAAA
-+
-<<;<<7;;;<;<<777;7(77;;1;7;%117;,7(
-@EAS1_105:2:110:584:649
-CCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<::<38
-@EAS1_105:2:110:584:649
-CTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCT
-+
-++:4686<<68<;<;<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:2:146:374:692
-AAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<</<<<<<<<<<<<<<<<<<:
-@EAS1_105:2:146:374:692
-ATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCA
-+
-<4:<<<1:<:<::<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;
-@EAS1_105:2:179:532:82
-CCATCACCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCT
-+
-<:96<6<<<<89<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:2:179:532:82
-TGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<;<;<<<<:<8<<<
-@EAS1_105:2:280:662:939
-AAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATC
-+
-<<;<;<<<<<:<<<;<<<;<<;<<<<<<<<<<<;<
-@EAS1_105:2:280:662:939
-CCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<;<<<;;7<<<<<<<<<<<<:8<
-@EAS1_105:2:299:360:220
-ATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTG
-+
-<<<<<<<9<9<<<<<<<<<<<<<<<<<5<;<0<<<
-@EAS1_105:2:299:360:220
-GAAGAACTTAGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAA
-+
-66<;;4;<<()<<4<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:2:301:161:195
-ACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:<<<<
-@EAS1_105:2:301:161:195
-GTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTA
-+
-''6%6<6<<<4<<<<<<<<)<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:3:176:431:647
-ATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<<<<<6<<<<9<<6<
-@EAS1_105:3:176:431:647
-CCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCT
-+
-<(9(<<<7;<<7<<<<<<<7<<<<<<7<<<<<<<<
-@EAS1_105:3:182:404:693
-ACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:::<6<;<94;77
-@EAS1_105:3:182:404:693
-GCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCAT
-+
-<;7;;4<<<<<<<7<<7<<<<<<<<<8<<<<<<<<
-@EAS1_105:3:232:364:583
-CAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:3:232:364:583
-TCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTG
-+
-;%;7;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:3:308:66:538
-CGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAAAT
-+
-996999;<9;<:<<<<<:<<7<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:3:308:66:538
-TATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<
-@EAS1_105:3:329:177:267
-CATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<9;
-@EAS1_105:3:329:177:267
-TACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:3:7:35:528
-TTTTTTTTTTGTTCTTTACTCTTTTTTTTTTTTTT
-+
-<<<<<<<<<<5<<<(<<%<<-8<<<<<<<<<8<<<
-@EAS1_105:3:86:823:683
-ACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCG
-+
-<4<<<<<<<<:<<6<<7<<<8<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:3:86:823:683
-CAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTT
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;9<<<
-@EAS1_105:6:134:853:558
-AATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTAT
-+
-<<<<8<<<7<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:6:134:853:558
-GGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCA
-+
-==========================9=9=;<;<5
-@EAS1_105:6:162:594:858
-CTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAA
-+
-90;<99;==99==;4=:========;=====;===
-@EAS1_105:6:162:594:858
-GTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<9<;<<<<<<<<<<3<<<;
-@EAS1_105:6:172:827:592
-AATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCAC
-+
-=;=======;==;===:==========;==9<<.3
-@EAS1_105:6:172:827:592
-TAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAA
-+
-8<<<<;7;7<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:6:23:885:274
-ACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<;;<
-@EAS1_105:6:23:885:274
-CTACTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC
-+
-2+*27==;;==<<.;:<=<=<==============
-@EAS1_105:6:267:953:459
-ACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTT
-+
-<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:6:267:953:459
-CATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAA
-+
-%<07<94========<<==================
-@EAS1_105:7:110:355:323
-ACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;;<<8;
-@EAS1_105:7:110:355:323
-CCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAAT
-+
-6069;1<<;4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:7:168:247:414
-AAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<*<<<<<<<<<;:6<<<<<;
-@EAS1_105:7:168:247:414
-TAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGA
-+
-,;;;,146<6;6<<8<<<<1<8<<<<<<<<<<;1<
-@EAS1_105:7:289:472:86
-ATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;
-@EAS1_105:7:45:462:455
-TCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGACGGAACGC
-+
-<<<<<<8<<<;<;<<<;<<<<<<<6;8&:80;733
-@EAS1_105:7:45:462:455
-TCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCA
-+
-62*<;;;;<<;<<9;;<<<<<<<<<<<<<<<<;<<
-@EAS1_105:7:57:722:347
-ACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:7:57:722:347
-CGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;
-@EAS1_105:8:160:130:351
-CAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAAT
-+
-4<;;<;<<<-<<<<<<<<<<;;<<<<;<<<<<<<<
-@EAS1_105:8:160:130:351
-TGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<4<<<<<;<<<:<<:<
-@EAS1_105:8:179:119:876
-ATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCAT
-+
-<<<<<<<7<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:8:179:119:876
-TTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACCAG
-+
-<<<<<<<7<<<<<<<8<<<6<<<<<<7<<<:0&<0
-@EAS1_105:8:24:718:322
-AACTCATTAATAATGTCATGAGTTCAGGTAAAGGG
-+
-5:+:0;**&+<00&<&<<<5<28<<;;<83<<<<<
-@EAS1_105:8:24:718:322
-ACAATTAATTGAGACTACAGACCAATTATGTAAAA
-+
-5/7<3+<;<1<<1<95<.&&.&&.<&)5)1)17<%
-@EAS1_105:8:254:617:73
-AACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTT
-+
-<<:<<<9;<<<;;<:<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_105:8:254:617:73
-GCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<6;:;4%
-@EAS1_105:8:256:404:584
-ACTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAA
-+
-&&326+23<3<<<+:<</<<8<<<:7:<<<<<<<<
-@EAS1_105:8:256:404:584
-GTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<3;<:;;3:3:</
-@EAS1_105:8:96:720:940
-AAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTC
-+
-<<<<<<;<<<<<<<<<<;9<<8<<6<;:;<;;.;;
-@EAS1_105:8:96:720:940
-TAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAA
-+
-*<<<<;<<<9<<;,<;0<;<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:1:111:796:737
-ATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCT
-+
-<3<<<<<<<<<<<7<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:1:111:796:737
-CCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGTGATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<:<<;7;<<<<993<4%:%<<
-@EAS1_108:1:131:518:588
-AAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<1<<
-@EAS1_108:1:131:518:588
-ATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTG
-+
-<.<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:1:148:286:316
-AGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCT
-+
-;::::;9/:<9<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:1:148:286:316
-CCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGT
-+
-<<<<<<<<+<<7<<<<<<<6<<<6<142<<<6<2<
-@EAS1_108:1:155:809:543
-AAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAA
-+
-<<<+0<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:1:155:809:543
-TACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<7<;<<<<<<<<<<<1<;<;
-@EAS1_108:1:16:438:245
-TTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGA
-+
-8*8<5'<77;;;;;7<7<<7-<;<<<;;<<<;;79
-@EAS1_108:1:189:863:213
-CTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAAT
-+
-7:<7<<<<44;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:1:189:863:213
-TATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<;7<9;<
-@EAS1_108:1:242:419:512
-AATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAA
-+
-<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<8<(<30
-@EAS1_108:1:242:419:512
-CTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATT
-+
-*:<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:1:277:194:143
-TGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGT
-+
-<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<9;<<<8</<<6<:
-@EAS1_108:1:277:194:143
-TTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTT
-+
-;<<;<<<;8;<0<7<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<
-@EAS1_108:1:328:614:638
-AAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAAT
-+
-<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:1:328:614:638
-ACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4/;<<9<<<<7<<*:
-@EAS1_108:1:33:779:821
-AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATG
-+
-<<730<<<<9<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:1:33:779:821
-TGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<
-@EAS1_108:1:49:911:980
-ACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAA
-+
-<<<<<<<<<<;<<<<<<<8<<<<;<;<<88-<;33
-@EAS1_108:1:49:911:980
-GGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGG
-+
-44:7<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:1:65:787:74
-TGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTA
-+
-44848=:1661/66==?:<=:?6><<<<1>><<<<
-@EAS1_108:2:102:543:160
-CAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<:<
-@EAS1_108:2:102:543:160
-CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAA
-+
-9==9=====;=====================<===
-@EAS1_108:2:116:966:193
-ATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<
-@EAS1_108:2:116:966:193
-GACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGT
-+
-===================================
-@EAS1_108:2:170:326:433
-CTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTCGTC
-+
-:44<<<<<<<<<<:6<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:2:170:326:433
-TTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGG
-+
-=====<=9===:=<:==2=======2:===9==/5
-@EAS1_108:2:176:653:957
-AAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAA
-+
-===::=============<==<====<========
-@EAS1_108:2:176:653:957
-ACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATA
-+
-????????????<<???@<<<<<@<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:2:204:737:61
-AAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<9<+4:<0
-@EAS1_108:2:204:737:61
-TCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGG
-+
-(7=72=;==2=====<===<<==============
-@EAS1_108:2:240:593:842
-ATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCT
-+
-============<================9===:=
-@EAS1_108:2:240:593:842
-CATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGA
-+
-*<<<;<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:2:266:994:429
-ACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGA
-+
-</<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:2:266:994:429
-TGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAG
-+
-=====================9=======4===:=
-@EAS1_108:2:316:176:543
-ATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTT
-+
-<<)/3<<<&<*<<0<<8<<82</5<<<<<88<<<<
-@EAS1_108:2:316:176:543
-CATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCC
-+
-====<=9===<<<=====9====<<=3==,96==9
-@EAS1_108:2:49:271:588
-CACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<5:<<<<<<:<<<<<<<:7%9<
-@EAS1_108:2:49:271:588
-GCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTC
-+
-:0=:===:<===;;===;=================
-@EAS1_108:2:62:879:264
-AATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<<
-@EAS1_108:2:62:879:264
-GGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAA
-+
-====:=<============================
-@EAS1_108:2:82:879:246
-AAGAGGGACGCTGAAGAATTTTGATGCCCTCTTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<&<<<77<<-<<<6<62<
-@EAS1_108:2:82:879:246
-ACAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGA
-+
-%+=661;&===:&==1<5======1==========
-@EAS1_108:2:85:580:481
-AAAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAA
-+
-=)====77========8=3====3===========
-@EAS1_108:2:85:580:481
-CTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<;<<<<6:<<
-@EAS1_108:3:216:988:883
-AAGCCAACACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCT
-+
-(=/1+=&:=&======<==<===============
-@EAS1_108:3:216:988:883
-AGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTT
-+
-<<<<<<<<<<<<8;<;88<;8;;;;828;8;8;;;
-@EAS1_108:3:24:319:429
-GTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<1<<-6<<</<
-@EAS1_108:3:24:319:429
-TAATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGT
-+
-0%=3%=3====<=9=====89==93==9=6=====
-@EAS1_108:3:75:934:439
-AAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATAC
-+
-==7=:=========================<====
-@EAS1_108:3:75:934:439
-CCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
-@EAS1_108:3:82:356:253
-AGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATA
-+
-97;7<<;;<<<<<7;<<:<<<9<<;<<<9<<<<<<
-@EAS1_108:3:82:356:253
-GAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGC
-+
-===================<========;===39=
-@EAS1_108:4:163:611:211
-TAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCA
-+
-<<<<9<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:4:163:611:211
-TGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAAC
-+
-============8===============;=6;;<;
-@EAS1_108:4:248:753:731
-TATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACA
-+
-<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<:<<<<&<:<.:
-@EAS1_108:4:248:753:731
-TGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGA
-+
-7;55;=,=89=====3===9=======9=======
-@EAS1_108:4:31:622:216
-ATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<96<7
-@EAS1_108:4:37:604:389
-ATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGG
-+
-<<<<<<<<<3<<<<<4<<<<<9<2;949<;35:95
-@EAS1_108:4:37:604:389
-TCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATG
-+
-00;:;========9========<9========<==
-@EAS1_108:4:75:166:463
-GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAAT
-+
-<<<<<==============================
-@EAS1_108:4:75:166:463
-TAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<++3
-@EAS1_108:4:91:521:517
-CCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATG
-+
-8;8<4=:===7===9=============<======
-@EAS1_108:4:91:521:517
-CCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTACACAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<8<<;;;<<
-@EAS1_108:5:115:193:231
-GAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<6<7
-@EAS1_108:5:115:193:231
-TATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAA
-+
-=========7===========<=============
-@EAS1_108:5:11:555:330
-CGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<4<;<
-@EAS1_108:5:11:555:330
-GGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTT
-+
-6;6;9766+<<<<9:2=<===6=============
-@EAS1_108:5:175:149:296
-AAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATA
-+
-=;==26==;==;================7======
-@EAS1_108:5:175:149:296
-AAGGGGAAATAAAGTCAAGCCTTTCCTGACAAGCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<49<<<<<<<<<<<<;4
-@EAS1_108:5:180:905:36
-CCTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTG
-+
-6%%<;<662<<*;<<<8<<:<<<<<<<<<<<<<<;
-@EAS1_108:5:180:905:36
-TACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCA
-+
-==========8===;;=========;==77%41=;
-@EAS1_108:5:229:717:121
-ACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACAC
-+
-=================<)=<4<0=.<<<71;41&
-@EAS1_108:5:229:717:121
-TTCTTCTGAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTT
-+
-6;-;7<<(<<<<<8<18<7<<<<<<<<<;<<<<<<
-@EAS1_108:5:321:712:224
-AGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGAAAAAT
-+
-<<<<<<<<2<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<(<<:<,
-@EAS1_108:5:321:712:224
-ATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATAT
-+
-=;===7;===7=========;=:;=========;=
-@EAS1_108:5:89:942:84
-AAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;
-@EAS1_108:5:89:942:84
-TACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATTG
-+
-===================>=>>>==>>===>==>
-@EAS1_108:6:159:493:275
-ACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGA
-+
-=====3=============================
-@EAS1_108:6:159:493:275
-TGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGA
-+
-4949;<<<<<<<<<<<6<;<<<<;<<<<<*<<<<<
-@EAS1_108:6:165:464:123
-CATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCT
-+
-===============7==============8====
-@EAS1_108:6:165:464:123
-GTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCA
-+
-9;<)<<%<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:6:222:579:961
-AGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAG
-+
-=58====;==8=======;================
-@EAS1_108:6:222:579:961
-CAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<:7;;;68
-@EAS1_108:6:71:187:824
-AGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACT
-+
-;===;======3==;==========4=;=7;;3;6
-@EAS1_108:6:71:187:824
-TCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCT
-+
-0040;<7<<<<0<7<<<;<7*<<<<<7<<771<<<
-@EAS1_108:6:73:735:329
-AAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGA
-+
-================;==;====;=;=======;
-@EAS1_108:6:73:735:329
-TAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAA
-+
-;;;9;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<<<<
-@EAS1_108:6:77:48:860
-CTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTTGTTTTCTGTT
-+
-=========;===========9==*;5=;=;=,7=
-@EAS1_108:6:77:48:860
-TAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGC
-+
-;8;8;<9<9<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:6:94:294:387
-ACCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCAC
-+
-779=53=9===;=:=;=========;=========
-@EAS1_108:6:94:294:387
-GAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAAT
-+
-<<<<<<<;<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<;)7;;
-@EAS1_108:6:95:235:746
-CTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAG
-+
-==&=;===7=3===8======;=;8===8=====;
-@EAS1_108:6:95:235:746
-TCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGACATCT
-+
-<<<<;<<<<<<<<79<<<<<<<<<<<<<<*;;;<9
-@EAS1_108:7:108:440:208
-CCCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAG
-+
-+35:486<<4<<<<<<<<<<<-<<<<<7<<)<<<-
-@EAS1_108:7:108:440:208
-TTCAGGTAAAGGGGAGGAAAAAGATGTTCTACGCA
-+
-<<<;<<<<<<<<<</<<<<;<<<;<<;<;<64/:+
-@EAS1_108:7:222:538:267
-ATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATTTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<74;;39%6+
-@EAS1_108:7:222:538:267
-TCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTT
-+
-52/8-<<7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:7:266:556:252
-CCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<4;;<;;;<7;;
-@EAS1_108:7:266:556:252
-GATTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATG
-+
-.8558<72<(<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:7:82:926:112
-CAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTGCCAA
-+
-<1:/<*6<<6<<<<<6<<<<<<4<<<<82<+<<<<
-@EAS1_108:7:82:926:112
-CTGCTGGCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTC
-+
-<;<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<;<<1:<4<
-@EAS1_108:8:118:440:850
-AATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<949<<<<
-@EAS1_108:8:129:477:427
-ATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<::<9<;<<;<<
-@EAS1_108:8:129:477:427
-TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC
-+
-<<<9;<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_108:8:19:929:765
-AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;77<
-@EAS1_108:8:19:929:765
-ATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATC
-+
-<3+<<;<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:1:131:946:353
-TCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTG
-+
-<<:<<66<<<6<<4<<<:8<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:1:131:946:353
-TGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<;<<<<;;<<<<<<<;<:52;<2
-@EAS1_93:1:179:629:513
-GTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAA
-+
-<;,<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:1:179:629:513
-GTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<;<<<
-@EAS1_93:1:20:635:509
-CAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGT
-+
-<<<<<<<<<;<<<<;<<<;<;;;<<<;<<<<<<(8
-@EAS1_93:1:20:635:509
-TGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGT
-+
-50<59<<9<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<
-@EAS1_93:1:214:784:690
-AAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<4<44
-@EAS1_93:1:214:784:690
-GATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAA
-+
--<7<<7<:<<2<<<<;<<<<<;<<<<3<<<<<<<<
-@EAS1_93:1:216:381:608
-TAATTGTGTCCATGTACACTCGCTGTCCTATGTAC
-+
-55<99<<<99;<;<<(<39&7<<<<<<<<<<<<<9
-@EAS1_93:1:216:381:608
-TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;+<6:<;26;
-@EAS1_93:1:253:59:242
-CCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<</<<9;<
-@EAS1_93:1:253:59:242
-TTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCA
-+
-<<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:1:264:988:663
-CGAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCAC
-+
-(%<:4<4<<7<<1-:<1766<66<<<<+<:<;8;<
-@EAS1_93:1:264:988:663
-TGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCA
-+
-<<<<<<<<<<<1<4<<<4<<0<;<-<74*(<&51-
-@EAS1_93:1:92:213:217
-ACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCT
-+
-<<<<<:<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:1:92:213:217
-TGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<
-@EAS1_93:2:173:995:93
-GCTGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATG
-+
-<(0<<9<<<7<<<<<<7<<<<<<<<<7<<<<<<<<
-@EAS1_93:2:173:995:93
-TAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7:<<<<;:<:<<<<:7
-@EAS1_93:2:286:923:549
-TCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:2:30:466:652
-AAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<4;7<<<7
-@EAS1_93:2:30:466:652
-AAGAGGCTAAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA
-+
-<<<<<;3;&<<<<<<<</6<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:2:313:711:530
-ACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTT
-+
-<7;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:2:313:711:530
-TAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTA
-+
-+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<:
-@EAS1_93:3:181:93:694
-ACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGG
-+
-<4;8<<+<<:<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:3:181:93:694
-TTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATT
-+
-++<<<<<<;<<<<<<:;8<<;<<<5;<;<<<+<<<
-@EAS1_93:3:79:879:15
-AGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTA
-+
-<;;5;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:3:79:879:15
-AGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<;<<1<
-@EAS1_93:4:160:896:275
-AAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAG
-+
-============<====<==<====<==<==;=:6
-@EAS1_93:4:160:896:275
-AGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTC
-+
-;;;9;<<<<<<;<;;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<
-@EAS1_93:4:321:271:138
-GTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;9<<;<<;;<88;&
-@EAS1_93:4:321:271:138
-TTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGA
-+
-261:5969==9=:=<==<=================
-@EAS1_93:4:325:352:67
-ATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAA
-+
-==================<========<=<;-===
-@EAS1_93:4:325:352:67
-TACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAAC
-+
-;<8<<<;;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:5:197:52:58
-AAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<2<<<<<<;<<<<
-@EAS1_93:5:197:52:58
-TCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGA
-+
-<7;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:5:246:177:525
-CATCATAAATACACACAAAAGTAAAAAACTCACAG
-+
-%<(4<2<<<<<:<;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:5:246:177:525
-TCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<<<<<<;;;<8;;
-@EAS1_93:5:256:444:399
-CTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC
-+
-;+549<:<.<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:5:256:444:399
-GAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<-;<<8
-@EAS1_93:5:292:122:666
-GGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTG
-+
-<;<;;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:5:292:122:666
-TACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGTCAGATG
-+
-<<<<<<6<<<<<<<<8;<<<<<<<<<<3&9+;;(;
-@EAS1_93:5:62:969:12
-TATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTT
-+
-<<;<;<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:5:62:969:12
-TCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:5:66:372:343
-ATTACAAAATATAGTTGAAAGATCTAACAATAGAC
-+
-<<<<<<<<<<8<<<<<6<<<8&8<<<<<58<:<::
-@EAS1_93:5:66:372:343
-TATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGG
-+
-;<1;89<<<<<;<9<<<<9<<<;8<9<;<<<<<;8
-@EAS1_93:6:132:717:233
-AGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGAGTTTCTCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:6:132:717:233
-TGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGA
-+
-<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<7<<<<&-<4<1
-@EAS1_93:6:159:273:253
-TTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAA
-+
-<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:6:191:948:257
-AACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGA
-+
-:;;;;<<<<<<5<5<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:6:191:948:257
-CTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGAT
-+
-:<<<<<<<<9<:<<<<<<:<<<<;<<<<8<<<<7<
-@EAS1_93:6:216:47:302
-AAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCT
-+
-<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<+<<<<<//6;<
-@EAS1_93:6:216:47:302
-AATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACAA
-+
-<<;<8<:<6<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:6:218:144:794
-GGGTGCATTGCTATGTTGCGGTCGCTTTGCCTCCT
-+
-++(3:&)5<9035<3):-<53<+&&-+)<<&)&<6
-@EAS1_93:6:218:144:794
-TTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTT
-+
-;92/;5:<6)+<5)67</9<&<&<<<:<<<57<<<
-@EAS1_93:6:238:514:194
-AAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTT
-+
-<<6<<<<:9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:6:238:514:194
-AATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<;<;<
-@EAS1_93:6:255:441:47
-AACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<;:<;<
-@EAS1_93:6:255:441:47
-TGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACAC
-+
-;;7<;:<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS1_93:6:271:244:568
-ATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTT
-+
-;<<<<<<;<;<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:6:271:244:568
-CTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<.<<<<<<
-@EAS1_93:6:45:601:439
-AATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAG
-+
-<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<4<<<<9<<<<<<;;
-@EAS1_93:6:45:601:439
-ATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATA
-+
-<8<<<<<<1<<<<<<<<)<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:7:14:426:613
-AGGGAGGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTG
-+
-:<<<<&<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:7:14:426:613
-GTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAA
-+
-======;=;==========;;==3=;==-=<;<;<
-@EAS1_93:7:252:171:323
-GCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCT
-+
-;8<;<=3=6==:====;;======;==========
-@EAS1_93:7:270:995:918
-AAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<8<8<8<<<<:<;4;4
-@EAS1_93:7:319:280:57
-AAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTC
-+
-<<<<<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_93:7:319:280:57
-TGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTC
-+
-;==========;=====6;=========;=<;6;;
-@EAS1_93:8:13:325:483
-AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;
-@EAS1_93:8:13:325:483
-ATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAA
-+
-;:;<;=:========;==========;========
-@EAS1_93:8:14:601:624
-AAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACAC
-+
-1;;;;==5===.(=9=5=========8====;===
-@EAS1_93:8:14:601:624
-CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCAACCC
-+
-<<1<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<::<<7<<1,<:(
-@EAS1_95:1:16:823:343
-AGACATAACCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTT
-+
-<<<:<<<;+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:1:16:823:343
-TCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAA
-+
-================================4==
-@EAS1_95:1:196:533:921
-AAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAG
-+
-=====1========8===:===7======971=3=
-@EAS1_95:1:196:533:921
-CCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTT
-+
-7<<<<7<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:1:202:341:984
-GGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCA
-+
-<<<(<8&<92<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:1:202:341:984
-TGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATT
-+
-=========================4;========
-@EAS1_95:1:249:986:224
-CTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGAT
-+
-=========5======7878===98==7=9==.-=
-@EAS1_95:1:249:986:224
-TATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGA
-+
-<<<3<;<;;<<;8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:1:261:504:780
-TCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<</2<<<9<<<5<<,<<
-@EAS1_95:1:261:504:780
-TTTGTCTGAGAAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAAC
-+
-80;8(;0==8+====;==49===============
-@EAS1_95:1:301:54:240
-AACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAG
-+
-<<<<:<9<<<<:<<<<9<<<<<<690<<6</<(83
-@EAS1_95:1:301:54:240
-CCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTACACAC
-+
-&..*3===1=========5.5==5===4====:5=
-@EAS1_95:1:77:589:741
-AGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<
-@EAS1_95:1:77:589:741
-TGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTC
-+
-8=;;==606;=========================
-@EAS1_95:2:142:353:398
-CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAA
-+
-===================================
-@EAS1_95:2:142:353:398
-GGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCT
-+
-=================================9=
-@EAS1_95:2:162:503:769
-AGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTT
-+
-========================:==========
-@EAS1_95:2:162:503:769
-AGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAG
-+
-;:;1;=8=;:+=====;&==7==============
-@EAS1_95:2:198:691:595
-ACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATG
-+
-==============&===============;7;=1
-@EAS1_95:2:198:691:595
-CATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGG
-+
-:=:;=;===========;=================
-@EAS1_95:2:211:954:174
-AAAGAAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAA
-+
-====*=====6========================
-@EAS1_95:2:211:954:174
-AGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTA
-+
-===============================777=
-@EAS1_95:2:228:915:631
-AAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACA
-+
-=================;==========4======
-@EAS1_95:2:228:915:631
-ATTATTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAAT
-+
-&-))-*===/=========9====4==========
-@EAS1_95:2:278:918:892
-AGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCT
-+
-=============:====================8
-@EAS1_95:2:278:918:892
-CCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAA
-+
-=6=3=<===&=========================
-@EAS1_95:2:40:918:950
-AATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTTTCCTTT
-+
-=========,=9=====2=7===7=0==&=+3=-=
-@EAS1_95:2:40:918:950
-GTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCT
-+
-=0=&&33======;=====.===============
-@EAS1_95:3:268:523:511
-ACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGAT
-+
-8<7<99<<<<<<<<<:<<<<<<4<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:3:268:523:511
-TGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<6<:9<<3<44
-@EAS1_95:3:303:970:243
-AACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAAC
-+
-<<0+<<<,<4<:<:<<<<<<<<<<<::<<<<<<<<
-@EAS1_95:3:303:970:243
-CAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<<8<8<
-@EAS1_95:3:308:956:873
-ATAAAAATAAGTGTGTCCATGTACACACGCTGTCC
-+
-91.97&9499&-1*98*19999839999.9&9799
-@EAS1_95:3:308:956:873
-CTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<;<;<;1<<<<<.<9<;<<<<+;
-@EAS1_95:4:174:157:573
-CAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:4:174:157:573
-TAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGA
-+
-8<<<<4<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:4:176:971:874
-TAAAATCAGAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATA
-+
-<<<<<:<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:4:176:971:874
-TGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<:<;<<<<<<<<<<<<<5<<<<7
-@EAS1_95:4:184:17:636
-TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC
-+
-8<89<<:<<<;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:4:184:17:636
-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCACAGGT
-+
-!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!77777777
-@EAS1_95:4:224:592:744
-GATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATG
-+
-6<6<<<<<<9+<6-<<<:<:<:<<<<<:<<<<<<<
-@EAS1_95:4:224:592:744
-TATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<7<<<<<<<&<*<<
-@EAS1_95:4:238:124:196
-TTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
-+
-<0<9.<5.5<<<<9<1<<5<<85<5<<<9<:<<<<
-@EAS1_95:4:61:631:567
-AAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCA
-+
-<<7<<<<<<<<</<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:4:61:631:567
-CATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:4:66:179:118
-CCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;<<6<<
-@EAS1_95:4:66:179:118
-TGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGT
-+
-<<99<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<:<<<<<<<
-@EAS1_95:4:71:517:742
-AACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTT
-+
-<<<<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:4:71:517:742
-AAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<48:4<<<<3
-@EAS1_95:5:257:654:116
-TAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<88
-@EAS1_95:5:257:654:116
-TCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAA
-+
-0+37<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:5:263:511:936
-CAAATAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACA
-+
-+<<%<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:5:263:511:936
-CAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<:<:<<<<<<
-@EAS1_95:5:284:212:932
-CTTTAAATCAACAACAATAAAAAAAAACAAAGGAG
-+
-<<9<<<<<<<<<<<<<&&<<<<5<<<<8<<<1:<:
-@EAS1_95:5:284:212:932
-TGATGATGGTTACGCTAAAAGTCCATGCTTTACTG
-+
-82%<8:<-:<<:**:<-<<8<)/2/<:/<<<<<<<
-@EAS1_95:6:174:650:125
-AAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:6:174:650:125
-CAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAG
-+
-===;===============================
-@EAS1_95:6:185:312:167
-CTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATG
-+
-===========================;855;===
-@EAS1_95:6:185:312:167
-TGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAAT
-+
-<<8:<8<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:6:194:696:490
-ACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTA
-+
-========;======;==========8==:=====
-@EAS1_95:6:194:696:490
-TTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;5<<<<<:<1<8<<<8
-@EAS1_95:6:53:156:845
-ACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCT
-+
-171(*00,0;;&;7=77=;5;;(;1:=5=======
-@EAS1_95:6:53:156:845
-TTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCT
-+
-<<<<<<8<<<.<<<<.6<<--<-<<<<<<<6<<<<
-@EAS1_95:6:87:734:888
-ATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGG
-+
-===========;8=========;;=;====;;3(;
-@EAS1_95:6:87:734:888
-TGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTG
-+
-56<<86;:<<<4;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:7:155:530:532
-AGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATAT
-+
-===================================
-@EAS1_95:7:155:530:532
-TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAA
-+
-:<<<><<8<<<<<><<<<<><<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:7:280:607:113
-ATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAAT
-+
-===================;===;=====<=7=9:
-@EAS1_95:7:280:607:113
-GGAGTATAAATTGTTTTCCACTTTGGAAAACAATT
-+
-18<-<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:7:282:817:710
-TGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCC
-+
-366=6;======8====:========;========
-@EAS1_95:7:282:817:710
-TTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<<:8,<<8
-@EAS1_95:7:310:800:761
-AAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAA
-+
-===========================+=======
-@EAS1_95:7:310:800:761
-CAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATA
-+
-1<<:<:<:<<<<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:7:46:522:426
-AAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGA
-+
-<<<<<:<<<<<<1/<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:7:46:522:426
-GGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCT
-+
-=======================:==;<===78==
-@EAS1_95:7:55:506:125
-CTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTACTGCCAG
-+
-118%67;1;8,4:187<4>::1:818;;&::<>.;
-@EAS1_95:7:55:506:125
-TCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGA
-+
-<<<<<<<<<;<9<;<<;558<<<<5(5*<<<<<51
-@EAS1_95:7:61:702:720
-ATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAA
-+
-<<<4<4+0;<<:<<<<<<<<-<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_95:7:61:702:720
-CTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTC
-+
-==============;=======&=========3:=
-@EAS1_95:7:74:866:49
-CATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTC
-+
-====================9==91==<=6==;:=
-@EAS1_95:7:74:866:49
-CCAACCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGA
-+
-:8<&<<<<7<<<<:<<<<<<8<5<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_97:2:128:629:484
-AAAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAA
-+
-:(::<</*;<<99<<<-<;<<<<4<<<<<<<<<<<
-@EAS1_97:2:128:629:484
-GATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGG
-+
-<<49<<<<<9<<<<99<<<<<<<<<<<<+<-)7))
-@EAS1_97:2:193:420:78
-ATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;
-@EAS1_97:2:193:420:78
-TTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA
-+
-81<<;<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_97:2:59:882:980
-AATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTAT
-+
-<<<<<<<<<8<<<<<9<+<<<9<<<1<<77889+6
-@EAS1_97:2:59:882:980
-GGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTC
-+
-7339%<6<<<<<;<<9<<8<<<<;<<<<<<<<<<<
-@EAS1_97:2:96:419:327
-TACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;;9<9
-@EAS1_97:2:96:419:327
-TCTAAATCTATAACAAAATTAAAATTTAACAAAAG
-+
-;1<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_97:2:9:203:653
-CACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTA
-+
-37))&<8<<<<<7<4<;<777<<:<<<<<<<<;<<
-@EAS1_97:2:9:203:653
-TCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::<9<<<<<;;;<
-@EAS1_97:3:147:423:584
-GAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;;96
-@EAS1_97:3:147:423:584
-GCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAA
-+
-27<;<3<<<+<<;<<<;;-4<<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS1_97:3:160:173:889
-TATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;0<7<<;<<<;7<09
-@EAS1_97:3:160:173:889
-TCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAA
-+
-;)<</<8<<<<<<</<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_97:3:277:144:848
-TAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTT
-+
-<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<9;;6;
-@EAS1_97:3:277:144:848
-TATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGG
-+
-<<<)63<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_97:3:73:292:429
-GAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTTGC
-+
-<<<<<<<<<<7<<;<<<<<<<2<<<5<<<<<:%)<
-@EAS1_97:3:73:292:429
-TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG
-+
-;6;6;<<<<<;<<<<;<<<<<<<<7<<<<<<5<<<
-@EAS1_97:4:261:267:597
-GGGTAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAAT
-+
-<<<<<<<<<;<<<<<7<<<<<<<<<:7<7<;44:;
-@EAS1_97:4:261:267:597
-TTGAGAATAAAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA
-+
-*-1<9<+1<+<<<<:<<;9<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_97:4:274:287:423
-CTAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<
-@EAS1_97:4:274:287:423
-TTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT
-+
-7<<<<9<<9<<<.<<<<90-<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_97:4:290:121:79
-ATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCA
-+
-<1<<:<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_97:4:290:121:79
-TGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<7;<<
-@EAS1_97:4:77:29:126
-ACAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTT
-+
-()9;;<<<<<<<<<<5<<<7<<<<<<;<<<;7<<<
-@EAS1_97:4:77:29:126
-GCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCT
-+
-<<<<<<<<<<3<<<<<<<;;;7<;<<449<-:977
-@EAS1_97:4:83:731:540
-CTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAA
-+
-;7<:+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_97:4:83:731:540
-TAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAG
-+
-<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<:<7<*;&;<;;9
-@EAS1_97:5:154:952:558
-AAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTA
-+
-%<<9;;<<;;;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_97:5:154:952:558
-GCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<
-@EAS1_97:5:219:174:684
-AAAAAAACTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCT
-+
-<<<<:;+9<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_97:5:219:174:684
-AGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA
-+
-<<<<<<<<<<<8<8<<<7<<;<<<<<2<;&;;;;9
-@EAS1_97:5:28:538:148
-AAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCT
-+
-<<<<<<<<<<7;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_97:5:28:538:148
-TCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<+771;
-@EAS1_97:5:318:177:383
-TACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTA
-+
-;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;1'<;
-@EAS1_97:5:318:177:383
-TCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGC
-+
-5:9;7;777<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4
-@EAS1_97:5:84:927:843
-CCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<;9;;4;<<0<<7<<9<;<:<5<
-@EAS1_97:5:84:927:843
-TTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTT
-+
-588;<:<<<<<<<6<<<<;<<<:/<<3<:;<*<<<
-@EAS1_97:6:222:305:337
-TTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTTTTTTTTTTTTT
-+
-;;;;;<<';<<<<*;<<<78;7<7<;<<<<<<<<<
-@EAS1_97:6:308:667:658
-AAAGATCACTTCAGCAATAAGATATAACCATCCTA
-+
-<9;;;45;&<;&.<5683;84+<;<;+8<;<<8;<
-@EAS1_97:6:308:667:658
-TAAAAACATGAACTAACTATATCCTTCTTACAATA
-+
-9<96<<<;<96<<9<51<<<<<1:9++<9*%4;*5
-@EAS1_97:6:93:334:858
-CTGCCCCCAGCATGGTTGTACTTGGCAATACATGA
-+
-<<<<<<<<;<<<<;;<<9<<<<&;&<<9<9;/;&;
-@EAS1_97:6:93:334:858
-GTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTA
-+
-;<;+;;<<;<<<<<;<<<<;;8<<<<8<<<<<<<<
-@EAS1_97:7:20:979:96
-GAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCA
-+
-'9996;(:;-<;1<<<<=<<<<=<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_97:7:264:642:506
-AAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTATTGTAT
-+
-<<;<<<<<<;<<<;:;;:;;<<;<<<<;*+;*&.4
-@EAS1_97:7:264:642:506
-ACTTCATCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCT
-+
-&;(-/)-1&:<<9<25<<<<2<1<';8<<<:888<
-@EAS1_97:7:28:979:519
-AAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTA
-+
-<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<6<<<<
-@EAS1_97:7:28:979:519
-CCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;9:
-@EAS1_97:7:63:727:203
-AAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGA
-+
-<<;7<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_97:7:63:727:203
-AGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<;
-@EAS1_97:7:9:648:712
-AAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTA
-+
-<9<;<<<<<<<;<<<<<8<<<<9<<;<<8)<:1<:
-@EAS1_97:7:9:648:712
-TACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGT
-+
-*;0;;;95<<<<7<<<;;<<<;;<<<<;<<<<<<<
-@EAS1_97:8:36:927:478
-AAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<:<:<<<<8<9;<8
-@EAS1_97:8:36:927:478
-GACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCT
-+
-,6;;;3;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_99:1:17:595:863
-AAGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC
-+
-))55))+2&<<,:5<,0657<<<<:<:<:<<<<<<
-@EAS1_99:1:17:595:863
-ATAACCATCCTACTAAATACACATGCACCTAACTC
-+
-:<4:<<1:<<<9<+<+1<%<7&&9-71<17)7</4
-@EAS1_99:1:187:715:521
-AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<;<<;<;;
-@EAS1_99:1:187:715:521
-GCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAA
-+
-<7<:<9<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_99:1:34:649:318
-AAGAATAACAATGGGCTTCACAGCGGAACCCTTAC
-+
-)<7<<3<<<<<<+<1<;<8&<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_99:1:34:649:318
-ATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACAT
-+
-9<<3<<<9<<<<<<<<<7<<9<<0<<.0<*:77,;
-@EAS1_99:1:86:871:319
-GGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGA
-+
-<<<<<:<<<:<:<<<<<<<<<<<<8<<:<1;<::)
-@EAS1_99:1:86:871:319
-TGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTA
-+
-7;+1;<:<<<<<<<<;<<;<<9<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_99:2:152:355:962
-CAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACA
-+
-&<.9.<;+;<;<<<<<<<<<<::<<:<<<<<<<<<
-@EAS1_99:2:152:355:962
-TATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT
-+
-<;<<<<<;8<<<<<<<<<;5;;88<<3<<<<<&0;
-@EAS1_99:2:162:257:203
-AAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<
-@EAS1_99:2:162:257:203
-ATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAA
-+
-<;<;:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_99:2:188:782:483
-CTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTA
-+
-7<<<<<<4<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_99:2:188:782:483
-GAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<7<;77
-@EAS1_99:3:118:851:285
-CCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAAC
-+
-3+7<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_99:3:118:851:285
-TGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;<:<<<<;;
-@EAS1_99:3:135:543:760
-ATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTAC
-+
-;;.;;8;<8;<<32;<<<<<7<<<<<9<<<<<<<<
-@EAS1_99:3:135:543:760
-TTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATA
-+
-<<<<;;<;<<<<<<<9<<<<<<<<<<<;<<<<5<:
-@EAS1_99:3:187:791:153
-AATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCA
-+
-:;55&<99<<1<;<<8<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_99:3:187:791:153
-TACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:+;;<;<88*6;68
-@EAS1_99:3:21:423:169
-ACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATAT
-+
-<<<<<;<<<<<<;<<<<<;;<<<<<<<<9+:5<;;
-@EAS1_99:3:21:423:169
-GGAGTATAAATTGTTTTCCACTTTGGAAAACAATT
-+
-;376;0<<<<99<<<<<<-;<4<<<<<<<<<;<<<
-@EAS1_99:3:61:183:767
-GTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATC
-+
-6&.;;<3<363<<<<<<<<8<<<6<<<<3<<<<<<
-@EAS1_99:3:61:183:767
-TTGCCAGATGAACCACACCTTAATACTATGTTTCT
-+
-<<<<<<<<<<;<<<9<9<+<<<8<<<<<<;8<<<<
-@EAS1_99:5:147:479:41
-CTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTT
-+
-;:;:;<::<:<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_99:5:147:479:41
-TACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::6<<;<<<;;9;;6
-@EAS1_99:5:191:885:623
-TGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;;;;
-@EAS1_99:5:191:885:623
-TTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTA
-+
-66<<<<<<<<<<<<<2<<<<9<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_99:6:135:354:66
-GATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTA
-+
-;;;;7<<<<:<<<<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_99:6:135:354:66
-TATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<2<;;;
-@EAS1_99:6:177:562:806
-ACAGTGTAGATGAGAGAGACCTTCCCTGGAGGTCT
-+
-)2<9;'/:<5<<<:<<:<:&5:&<8,<<+:<&<<<
-@EAS1_99:6:177:562:806
-TGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTTTT
-+
-<;<29<99<<;<<<9<20<9<<5;;<<<<<<<+.<
-@EAS1_99:6:181:392:500
-GGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGC
-+
-/5<<;(88<<<;<;<<6<<<<<7<<<<<<<7<<<<
-@EAS1_99:6:181:392:500
-TTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAA
-+
-<<<<<:<<<2<<<<;5<<<<29+<<)</65<7.24
-@EAS1_99:6:63:48:631
-CAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTC
-+
-<<<<<<;<<7</<<<<<<;;;<<<;<;<<7;;);<
-@EAS1_99:6:63:48:631
-TCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTA
-+
-;*:;;<2<<2779;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_99:7:126:361:250
-AAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCAT
-+
-<<<<<<;9<<<<<<<<<<<<<<;;;<<<;<664;;
-@EAS1_99:7:126:361:250
-TCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTA
-+
-72:;7</<<<:<-7<<:<<<<<<<:<6<+:<<<<<
-@EAS1_99:7:171:196:287
-ATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;6<<<<<<2:8<0:
-@EAS1_99:7:171:196:287
-ATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAA
-+
-<;;;98;<;&<;;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_99:7:183:645:699
-GTGGCCCTCCCCCATTCCCTGCCCCATCTCTTGTA
-+
-&)))2-&420<<<'--<6:6-<7<<<+:7<65<<<
-@EAS1_99:7:183:645:699
-TATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCT
-+
-<<9<9<<<<<<<<<;<<;<<*175;173<;;;<-/
-@EAS1_99:7:37:400:627
-ACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAA
-+
-<<<<<<7+<<<<<<2615<<6<<<<5<<1<<;:74
-@EAS1_99:7:37:400:627
-TCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTG
-+
-474*;<<9<;<<<;<<:<<<<<<;<<<<<<;<<;<
-@EAS1_99:8:117:578:853
-AATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAA
-+
-<;<9<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<,<98;<;;&92
-@EAS1_99:8:152:778:228
-ATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;
-@EAS1_99:8:152:778:228
-ATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACA
-+
-<;;7=<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_99:8:187:199:369
-TGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATT
-+
-;<><<<<<<<<7<<<<<<<<=<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS1_99:8:27:228:31
-AAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;9<:;<<<<<<75<<<<<
-@EAS1_99:8:27:228:31
-GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCA
-+
-99;;;<<<<<<:<<;<;<<;<<<<;<<;<<<<<<<
-@EAS1_99:8:99:756:130
-GAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCT
-+
-;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<;<
-@EAS1_99:8:99:756:130
-GACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCT
-+
-;;<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:2:10:686:1024
-ACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGT
-+
-<:<<<<:<<<<<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<5<<<
-@EAS218_1:2:10:686:1024
-CATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGA
-+
-&<<<3<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<7<<<<
-@EAS218_1:2:15:1763:1143
-AAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:2:15:1763:1143
-TGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:2:18:1498:1475
-CTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCG
-+
-<<<<<7<<<<<<+<<-3<<3<:<2<1<<:<<<<<+
-@EAS218_1:2:18:1498:1475
-GAAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAA
-+
-:<4<*7<<<<<<<:<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:2:19:752:816
-CGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<7;<;<<767277;6
-@EAS218_1:2:19:752:816
-TTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGA
-+
-+<<+<--/<<<<4<2<<<<45<<<:<<<<<<+<<<
-@EAS218_1:2:26:211:481
-ACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<:<7<<<
-@EAS218_1:2:26:211:481
-CACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAA
-+
-:<:<<<<<<9:5<<<<<<<<<<<<<<:<:<<<<<<
-@EAS218_1:2:40:1291:1045
-CTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATA
-+
-*<<<9<<<<<<:0<9<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:2:40:1291:1045
-GTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAACAAG
-+
-<<<<<<<<<5<<5<<<<7<<<<<<<<<5<9<&%73
-@EAS218_1:2:64:1318:1711
-GGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:2:64:1318:1711
-TGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<:<<<<<2<<<<
-@EAS218_1:4:14:1872:1521
-TCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGTCAGA
-+
-7<<<<77<<<3<3<7.'<<<<<7<67<+.0%4*<4
-@EAS218_1:4:14:1872:1521
-TCATCAAAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGAT
-+
-/1<%73&7<1<3577,<<<7/733<<<<<<<<1<<
-@EAS218_1:4:15:856:340
-CACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:4:15:856:340
-CCCCAGCATGGTTGCACTGGGCAATACATGAGATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<77<<
-@EAS218_1:4:28:315:310
-AAACTGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATG
-+
-+%,768<<:<:<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:4:28:315:310
-CATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<+.<<.<+7<*17
-@EAS218_1:4:37:1626:862
-ACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAG
-+
-:663<<3<<<<<<<<<<:<<<<7<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:4:37:1626:862
-TCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:4:61:1369:440
-AAAGACATGATTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGA
-+
-<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:4:61:1369:440
-CAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<8
-@EAS218_1:4:62:561:531
-AGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:4:62:561:531
-TACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATT
-+
-<<7<<<<:<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:4:71:832:743
-ACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:4:71:832:743
-CTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<*<<<<<<<
-@EAS218_1:4:73:42:1038
-AAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:4:73:42:1038
-TCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<.<<<<<
-@EAS218_1:4:75:555:1591
-TGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<
-@EAS218_1:6:49:905:27
-CCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCCTGAAGCA
-+
-<<;<.89<9.<2<9<:91+447.9,04&000(,+(
-@EAS218_1:6:49:905:27
-GAAGAGACTATTGCCAGTTGAACCACACATTAATA
-+
-99515<<&<<6595-56%;86&<;<<<6<<<<6;<
-@EAS218_1:6:66:1282:1215
-GTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;;
-@EAS218_1:6:66:1282:1215
-TTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGG
-+
-::;<;<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:6:77:1529:522
-AAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAA
-+
-<<;<<<<<<<<<<<4<<4<;;:;2:7<<<2*<;;8
-@EAS218_1:6:77:1529:522
-AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA
-+
-<<<;7;,<<<<<<.<,6<<6<<<<<<<;<<<<<<<
-@EAS218_1:6:88:1413:14
-AATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACA
-+
-<<<<<<<<<<<;;;<<<<<<;<;;<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:8:13:1729:1844
-ATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAA
-+
-<<<;;<;7<<<<4<<<<762;6<<<<<<<;6;618
-@EAS218_1:8:16:1081:1894
-AAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACAC
-+
-;5;;&<;<<<<<<<<;<;<<;<<<;<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:8:16:1081:1894
-AGATGAAACGCGTAACTGGGCTCTCATTCACTCCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<;<<;<<<<<<<+
-@EAS218_1:8:26:785:882
-CAGTTTCTGCCCCAAGCATGGTTGTACTGGGCAAT
-+
-<<<0<<<<<<<<<6,<<)<<<<<<<&<<0<<,<'<
-@EAS218_1:8:26:785:882
-TACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTAC
-+
-<<&5&<<<<5.;5<'<<;.76<<<<<7<7<<<<<<
-@EAS218_1:8:61:1797:113
-CAGATAGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGA
-+
-<<0<<&<<<<;<<4;;3<;<:<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:8:61:1797:113
-GGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGA
-+
-<<<<<<;<<<<;:<3<<<<;;<<<8<<;:<<;3<.
-@EAS218_1:8:70:445:1289
-CTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTG
-+
-<<<<<<<<<<2<<<<<<<<<<:<<<<<<<;;;;<:
-@EAS218_1:8:70:445:1289
-GAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCA
-+
-<<<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:8:82:1540:77
-ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAAC
-+
-<48;<;</;<<<<<<:<<0<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_1:8:82:1540:77
-GAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<:8
-@EAS218_1:8:90:706:1276
-AATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<:<:<
-@EAS218_1:8:90:706:1276
-GTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAG
-+
-<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:1:34:1614:558
-CAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGA
-+
-<<<<<<<<<<<7<<<<<8<<<<<<2<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:1:34:1614:558
-GTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGC
-+
-<<9<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:1:48:9:409
-CAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTG
-+
-<<<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:1:48:9:409
-GTTTAGTGCCTTTGTTCACATAGACCCCCTTGCAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:1:84:1505:1037
-GTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<::)
-@EAS218_4:1:84:1505:1037
-TGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGA
-+
-<<966<<7<<<<7<<<<9<<;<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:1:9:206:901
-AGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:1:9:206:901
-CTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<5<<%%:<<<7
-@EAS218_4:3:12:630:707
-ATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACA
-+
-<:<<<<<<<;<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:3:12:630:707
-CACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:3:39:1671:1928
-AGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGT
-+
-<<<<<<<;<<<<;<<<<<4<<<;3<<<;<<<<<<<
-@EAS218_4:3:39:1671:1928
-CAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCCA
-+
-<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:3:41:1281:1785
-ACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTA
-+
-<6<<<6<<<<<<:<<6<:<<<<<<<<<<<<6<<<<
-@EAS218_4:3:41:1281:1785
-GGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<8<
-@EAS218_4:3:65:85:1547
-AAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAA
-+
-<<<<<<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:3:65:85:1547
-GTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<:<<<
-@EAS218_4:5:41:118:1246
-ACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<</<<<<<<1<<(
-@EAS218_4:5:41:118:1246
-CTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:5:63:875:1339
-CCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:5:63:875:1339
-GGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCC
-+
-;;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:7:71:31:1973
-AAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGC
-+
-<<<<<7<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:7:72:1288:1211
-ATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTAC
-+
-<);<:<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:7:72:1288:1211
-GATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:7:85:923:726
-ACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAA
-+
-<<<<<<<7<<<<<<<<<<<55<<<9<*<<<991<4
-@EAS218_4:7:85:923:726
-GTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCC
-+
-<:<<<%3<<1<<86<<-<<<<<<<<<<<<6<<1<<
-@EAS218_4:7:87:964:826
-CACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<<8;4;;<
-@EAS218_4:7:87:964:826
-TGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAAT
-+
-)6<<<<<<:;<6<<::<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:7:89:1487:520
-CACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGT
-+
-8<<<6/<<<<<<<<<:<<8<:<<3<<:668<86<3
-@EAS218_4:7:89:1487:520
-TATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTA
-+
-4;;/<<<<<:<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:7:90:1873:89
-GAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGT
-+
-<<<<;49<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS218_4:7:90:1873:89
-GCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<7<<<7
-@EAS219_1:1:22:490:2011
-ATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGC
-+
-<7<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_1:1:22:490:2011
-GCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_1:1:37:1004:1136
-CCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<:<<;;369<<<
-@EAS219_1:1:37:1004:1136
-GTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGG
-+
-</8<<<<7<+<<<<<<<,<<<<<<<<<6<<<<1<<
-@EAS219_1:1:44:1466:425
-GTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGG
-+
-6-<<9<<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_1:1:44:1466:425
-TTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<
-@EAS219_1:1:50:257:341
-AAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<6<<<<
-@EAS219_1:1:50:257:341
-TGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_1:1:5:497:687
-AAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_1:1:5:497:687
-TTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCA
-+
-<8<<8<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_1:1:60:1420:660
-AATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<8<<<<
-@EAS219_1:1:60:1420:660
-GTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTC
-+
-99<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_1:1:63:28:1549
-AAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTA
-+
-<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_1:1:63:28:1549
-TACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;<<<<7
-@EAS219_1:1:67:191:668
-ACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<;<;<;<<<<<<6;%2
-@EAS219_1:1:67:191:668
-CCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACA
-+
-<<<<<7<<7<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_1:3:11:706:1030
-ATCTCTTGTAATCTCTCTCATCTTTGCTGCATCCC
-+
-<<<2<<2<<<<<<<<<<<<0<&<<<+<:2<4<<):
-@EAS219_1:3:11:706:1030
-ATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTT
-+
-+<5069+9<<<<+<;<<<<;<<77<7<<;<<;<<<
-@EAS219_1:3:33:1168:1762
-AGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<;<<<<<<<<:;2::
-@EAS219_1:3:33:1168:1762
-GTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCA
-+
-79<9;3<<<4<<<97<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_1:3:4:1620:413
-CATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCA
-+
-<<<<<<<<<<6<<<6<<<;<6<9-1<;<&66<<<2
-@EAS219_1:3:4:1620:413
-TCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCC
-+
--<<<7<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_1:3:62:603:1552
-AATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGT
-+
-8::;:<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_1:3:62:603:1552
-GAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<;<
-@EAS219_1:3:88:465:1877
-AAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAA
-+
-<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<
-@EAS219_1:3:88:465:1877
-TAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATG
-+
-<<<<<<<:<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<7;<<<<
-@EAS219_1:3:90:219:528
-ACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<9
-@EAS219_1:3:90:219:528
-GTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATT
-+
-;:<5<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_1:5:5:259:250
-GTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;5<<5<;7<::
-@EAS219_1:5:5:259:250
-TATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT
-+
-8<83;<<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_1:5:6:1067:91
-CTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACA
-+
-3<;<<:;9;<<7;;<;<<<;<<<;<<<<<<<<<<<
-@EAS219_1:5:6:1067:91
-CTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<:8<<
-@EAS219_1:7:16:1343:1621
-AAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTC
-+
-;<<9;7=====;;==<==================<
-@EAS219_1:7:16:1343:1621
-AAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTA
-+
-<<<<<<<<8<<<<;<<<;<;<<<<<<<:;4;71:;
-@EAS219_1:7:18:571:1110
-GAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTC
-+
-7<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<788<<<;6<
-@EAS219_1:7:18:571:1110
-TAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTA
-+
-9<<;<;==;;=;=<;<===================
-@EAS219_1:7:20:1444:328
-AAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGA
-+
-<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<;<;;8:7
-@EAS219_1:7:20:1444:328
-TACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCC
-+
-9<3<<==;=<===;=<=====<<===========<
-@EAS219_1:7:35:392:2042
-ATAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGT
-+
-+<<<<</<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_1:7:35:392:2042
-TAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACNAATAC
-+
-======;==========<<=======7=;!<7;;;
-@EAS219_1:7:50:1339:1154
-CATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCC
-+
-==========<<==============;==7<;<<;
-@EAS219_1:7:50:1339:1154
-GTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAA
-+
-7;7;8;<5<:86<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS219_1:7:62:1076:540
-CCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGAT
-+
-<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;<7;
-@EAS219_1:7:62:1076:540
-TAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTC
-+
-6<<;:+=====5=:6===================2
-@EAS219_1:7:94:1655:1921
-AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATC
-+
-<<<<;:===<==;<==<;================;
-@EAS219_1:7:94:1655:1921
-TTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAA
-+
-<<<8<<<<<<<<<8<<8;8<;<;<;;<<9+868<;
-@EAS219_FC30151:1:18:1418:237
-CCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<7<
-@EAS219_FC30151:1:18:1418:237
-CTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTC
-+
-<<:<<<<<<<<:<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<:
-@EAS219_FC30151:1:53:140:421
-AACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:1:53:140:421
-GATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGG
-+
-<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:1:54:436:1452
-AAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<;<<<
-@EAS219_FC30151:1:54:436:1452
-AGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:1:55:8:1412
-ATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATG
-+
-<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:1:55:8:1412
-GCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:1:76:34:691
-ATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTA
-+
-<<<<<<16<<<<<916<<<499<966161919<<<
-@EAS219_FC30151:1:88:1454:418
-CCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAG
-+
-:<<:<<<<<<<<<<<::::<:<:<9<5<<<<<<8:
-@EAS219_FC30151:1:88:1454:418
-GAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAG
-+
-<<<<<<<<<<6<96<<<1911<<<1<<<<<<<<<1
-@EAS219_FC30151:3:13:674:1717
-AGAAAAGCATGCAGTCATCTATAAAGGAAATCCCA
-+
-<<<<<<<<<<%<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:;;;
-@EAS219_FC30151:3:13:674:1717
-TAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:3:40:1128:1940
-CCCCTTACAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTT
-+
-<<<:///77:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:3:40:1128:1940
-CCGAGTCACGGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<5;;<<<9;;;;7:
-@EAS219_FC30151:3:55:74:1040
-CTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<
-@EAS219_FC30151:3:55:74:1040
-GGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTA
-+
-;;;;;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:3:73:1458:1337
-AAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGAC
-+
-<<<<<;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<7;;;;
-@EAS219_FC30151:3:73:1458:1337
-AGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACC
-+
-<</<<<<<<<6:<::<<<1<<:<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:3:81:1723:1820
-ATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTT
-+
-;6;;;<<<<<<<<<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:3:81:1723:1820
-CATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:
-@EAS219_FC30151:3:90:1906:1528
-CACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAA
-+
-:<<<<<<<<<3:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:3:90:1906:1528
-TTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<:<<<:<<<<;<<<<<;:7:;
-@EAS219_FC30151:3:9:1595:1826
-ACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAG
-+
-;76;;6:9<9<963;<<7<<<<<<<;<;<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:3:9:1595:1826
-ATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:5:29:817:854
-AGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:5:29:817:854
-GTTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTTTATGTGAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<1..;:;;;;1%407)07&7.
-@EAS219_FC30151:5:54:1351:910
-ACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATAT
-+
-<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<18<<:<
-@EAS219_FC30151:5:54:1351:910
-ACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTT
-+
-<7<7;;<<<<<;<<;;<<;<<<<<<<<<<<<<<;<
-@EAS219_FC30151:5:63:424:1643
-GACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCT
-+
-9+<<<+7<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:5:63:424:1643
-GGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACC
-+
-;;<<<<<<;<<<<<<<<<<5;9;<<<<<<<<<<;<
-@EAS219_FC30151:5:6:1243:981
-ATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAA
-+
-<;<;;<<<;3;;3<<<;<<;<7%<<<.1<<<..<3
-@EAS219_FC30151:5:6:1243:981
-TTACCTAGTTGCTCTGTAGTCTCAATTAATTGTTT
-+
-<<<<8<<8<<<<2<<<<<<<<8<55<<8*<<8<<<
-@EAS219_FC30151:5:70:348:972
-GAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTC
-+
-<99<-7<<7<<<87<<<)<<<<<<8<<<<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:5:70:348:972
-TCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTT
-+
-<.<<3+.7<<7<<:78:<<7<:<7:<3<<7.:::<
-@EAS219_FC30151:5:72:1426:1883
-ACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTTGG
-+
-;9<;<;0<;<;<<<<;<<<;:<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:5:72:1426:1883
-CATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<
-@EAS219_FC30151:7:11:1261:1200
-AAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTG
-+
-<<<<<<<:<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:7:11:1261:1200
-TTGCAAGACAGACTTCATCAAGTTATGTAGTCATC
-+
-<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<;<:<<8<<:<<
-@EAS219_FC30151:7:51:1429:1043
-TATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGT
-+
-9<5<<<<<<<<<<<<<9<<<9<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:7:87:1289:83
-ACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<<<:
-@EAS219_FC30151:7:87:1289:83
-ATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGG
-+
-<<<::<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS219_FC30151:7:94:1440:2016
-AACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;;<<:<8:::75
-@EAS219_FC30151:7:94:1440:2016
-CACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACA
-+
-:<8<<<<9<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:2:11:1274:1230
-TGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCT
-+
-.<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<5<<<<<<
-@EAS220_1:2:11:1274:1230
-TTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;;;;
-@EAS220_1:2:43:656:1866
-TGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;;:;
-@EAS220_1:2:47:591:698
-CAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAA
-+
-7;;;;:<<:<:<<<<<7<<:<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:2:47:591:698
-TCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<
-@EAS220_1:2:50:513:882
-AAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAA
-+
-<<<<:<<<<<:<<:<<<<::<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:2:50:513:882
-GGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;;
-@EAS220_1:2:52:1779:1664
-CCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<71<<<<<<<<<<<<<<%
-@EAS220_1:2:52:1779:1664
-TGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACT
-+
-6;;:;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:2:54:91:1232
-AAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAG
-+
-;;;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:2:54:91:1232
-AAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:2:62:1109:804
-TAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<:<<:<<<<<<:<:<<<<;;;;;
-@EAS220_1:2:62:1109:804
-TGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGAT
-+
-<<<<<:<<<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:2:63:267:545
-ATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:2:63:267:545
-CTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTG
-+
-<<<<<<<<<<<<:<<<<<::<<<<<<.<<<;;;;5
-@EAS220_1:2:72:1809:1398
-AATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<::<9<<<<<<<<<6<<:
-@EAS220_1:2:72:1809:1398
-CTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATC
-+
-;:;;:<7:7<:<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:4:100:20:1199
-AAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCA
-+
-:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:4:100:20:1199
-CAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACA
-+
-7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<
-@EAS220_1:4:14:1665:1772
-GGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTC
-+
-<&7<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:4:14:1665:1772
-TATAATGGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGT
-+
-<<<<<7*<<<<<<<<<78<5<<7<<5<556<(73(
-@EAS220_1:4:46:1566:668
-CTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACC
-+
-5<<:<<<<<<<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:4:46:1566:668
-TTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:4:69:88:1154
-ATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACA
-+
-<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:4:69:88:1154
-CACGAATGCGTCTCTACCACAGGCGGCTGCGCGGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<:<<<<<7
-@EAS220_1:4:6:1178:1105
-GATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAA
-+
-<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:4:6:1178:1105
-GGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAA
-+
-<:<<9<<<<::7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:4:70:766:2016
-AAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:4:70:766:2016
-ATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:6:24:105:1046
-AGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:6:24:105:1046
-CATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTA
-+
-+<<<</<<<<<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:6:7:1547:1933
-AATATTTGACTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGA
-+
-<<<<<<<<-<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:6:7:1547:1933
-CTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<8<<<<<<<<
-@EAS220_1:8:18:1757:95
-ATGAGTCGCAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<:<<<<<<:<<<;:<
-@EAS220_1:8:18:1757:95
-CTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAA
-+
-<<<6<&:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:8:33:672:473
-ATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAAT
-+
-<<<<<<<<7<7<7<<62<<<<66<15*/99*5241
-@EAS220_1:8:33:672:473
-TCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCT
-+
-5<70<<55<4<24.5<<<<<<<<<6<<<<<<2<<<
-@EAS220_1:8:38:1576:1923
-CACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<:;<<;<
-@EAS220_1:8:38:1576:1923
-CTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAA
-+
-8;<98<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:8:45:178:1321
-AGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:8:45:178:1321
-CATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:8:46:1528:799
-ATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<
-@EAS220_1:8:46:1528:799
-CATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:8:46:485:482
-AGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGG
-+
-<<<<<::<<<<<<<<6<<<<<<<<<6<<<<<<<<<
-@EAS220_1:8:46:485:482
-ATTACCAGAGGGATGAAGGGAAGAGGGACGCTGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<:<:89<
-@EAS220_1:8:5:996:2000
-AGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:
-@EAS220_1:8:5:996:2000
-CACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:8:66:1046:167
-ACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS220_1:8:66:1046:167
-ACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAG
-+
-<<<<<:<<<<<<<<<<<<<9<;77<9<7<<;<9;-
-@EAS220_1:8:83:1456:1854
-AAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<
-@EAS220_1:8:83:1456:1854
-AAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATG
-+
-<<67<:<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:2:23:127:880
-CGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:2:23:127:880
-TAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAAT
-+
-<<<<<<<<<%<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:2:24:1037:84
-TGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGC
-+
-<;<<;<<<7<<7&<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:2:24:1037:84
-TTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;:<57<
-@EAS221_1:2:29:1486:672
-AATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCACA
-+
-<<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<++
-@EAS221_1:2:3:542:428
-AAGACATGAGTTCAGGTACAGGGGTGGAAAAAGAT
-+
-<<876</3<8874:<8:<)<5<<<;<<<<7<<<:<
-@EAS221_1:2:3:542:428
-AGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGG
-+
-7<4<<<6<<,<9)<<<<6<,<<7<<7<<<<<<<<1
-@EAS221_1:2:3:945:2005
-AACCAAGCAGAAGAAAGAGGCTCAGAACTTGAAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<%<<<<<<;<<<<<<<
-@EAS221_1:2:3:945:2005
-GAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCT
-+
-7<<<<;;<<;<<<<<7<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS221_1:2:52:1144:509
-AAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAG
-+
-<<<<:<<<<<<<<<<;::;:<;<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:2:52:1144:509
-TGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<;<<;<<
-@EAS221_1:2:73:955:728
-AATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<
-@EAS221_1:2:73:955:728
-TACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAA
-+
-;<-<<6<;<<<6<<<<;7<6<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:2:8:327:522
-AACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTT
-+
-<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<:<<<
-@EAS221_1:2:8:327:522
-TTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGT
-+
-;;4;<-<-<<<7<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:2:90:986:1224
-CTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCAAC
-+
-<7*37;;;;;;;9<<;<7<<<<<<<<<<<;;<<<<
-@EAS221_1:2:91:856:504
-CTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGG
-+
-:::<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<<<<
-@EAS221_1:2:91:856:504
-GTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<7<<<&;<<<&&<&
-@EAS221_1:4:36:1402:1709
-AGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<:9<<
-@EAS221_1:4:36:1402:1709
-TTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATT
-+
-;;;:<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<
-@EAS221_1:4:3:248:1491
-TTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:8:<
-@EAS221_1:4:41:519:609
-AACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGG
-+
-<4;<;<<<<<<<<;4:<<;<<<<<<<<<<<;<<<<
-@EAS221_1:4:41:519:609
-TACCTAATTGGTACAATGGACAATATTCTGATGAT
-+
-1<<<<<<<<<<<<<<<4<-:<+6<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:4:4:1732:88
-GCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCC
-+
-:<4<:<<:<::<<<<<::<<<<<:<:<<<<<<<<<
-@EAS221_1:4:4:1732:88
-TGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<2<8;8<;<8;<2;2:<:<
-@EAS221_1:4:68:64:783
-AAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGT
-+
-<<9<8<6<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:4:68:64:783
-TCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<;<<<9:<<:9
-@EAS221_1:4:87:1375:1303
-AGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTA
-+
-<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:4:87:1375:1303
-GAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTG
-+
-:<;<(<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<
-@EAS221_1:6:38:1071:155
-ATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCATC
-+
-<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<8<<<:<<:;;8:;
-@EAS221_1:6:38:1071:155
-TAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAAT
-+
-<<62<<<<<<3<<<<</<<<<<<<%<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:6:4:1131:104
-ACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTTTT
-+
-61;;;<<<<<<<<<;:<<<:<<;<<<<;<<<<<<<
-@EAS221_1:6:4:1131:104
-ATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<::
-@EAS221_1:6:57:1342:1166
-AAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGA
-+
-<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:6:57:1342:1166
-CAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<;
-@EAS221_1:6:60:1037:1146
-AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATC
-+
-<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:6:60:1037:1146
-GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:;;;;;;<
-@EAS221_1:6:69:735:1915
-AATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAG
-+
-<<::<<<7<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:6:69:735:1915
-ACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAGTCCCATTT
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<;<8<<<<;1:<<
-@EAS221_1:6:89:1164:573
-AAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCT
-+
-3<<<6<%7<<08<<4<3<<103<1<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:6:89:1164:573
-AGACTTCATCAAGAGATGTAGTCATCAGACTATCT
-+
-<:<<;<2<<<<<<<&:2<;<;<<<<;,+;:<<4:<
-@EAS221_1:6:92:1807:1185
-AGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<:<<<<;<<<;<<;
-@EAS221_1:6:92:1807:1185
-CTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCT
-+
-<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<><<<<<
-@EAS221_1:6:96:491:1891
-AGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGG
-+
-<:<<<<<::<<<<<<<<<<<<<<<<:<<::7<<:7
-@EAS221_1:6:96:491:1891
-GTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAA
-+
-:;5<<7<;:<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:8:15:881:1932
-CACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<:<<<2<26<8<<;;.
-@EAS221_1:8:15:881:1932
-CACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGG
-+
-)<4<<<<<<<4<<4<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:8:4:679:110
-AATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:8:4:679:110
-TCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<::<;;:7
-@EAS221_1:8:58:369:244
-CTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:8:58:369:244
-TTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:8:60:1020:1259
-CTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATT
-+
-<;<<<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<8<<<<<:<:<<
-@EAS221_1:8:60:1020:1259
-TAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:8:65:1928:1125
-CATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCA
-+
-<<;<<<7<<7<;<7<<<<<<<7<<<<;<.-;<+88
-@EAS221_1:8:65:1928:1125
-GGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATACGTCTC
-+
-<+<<<2<4<<<0<<4<<<<<6<<<6<<<'<<<<0<
-@EAS221_1:8:67:1797:1931
-GGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:8:67:1797:1931
-TGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<
-@EAS221_1:8:70:1349:1788
-ATTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAAC
-+
-&<8<<<85:580;<:0-><;>588>9<>7:<0<9;
-@EAS221_1:8:70:1349:1788
-TACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATT
-+
-<7;<<8<74;;<1<<71<;7<;;<;<7<<<<<<<<
-@EAS221_1:8:73:108:1621
-GAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTC
-+
-<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:8:73:108:1621
-GTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACA
-+
-<<<<<<<<71<<<<<<<<<+<<<<70:0<9<<61<
-@EAS221_1:8:77:781:676
-TCATGAAGCACTGAACTTCCACGTATCATCTAGGG
-+
-<<<<<<<5<<5<<<<<<<<<<<<13<<2<<<<<,<
-@EAS221_1:8:77:781:676
-TTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCT
-+
-:<;<2<<<<<<26<<<<6<;<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:8:78:1478:1446
-GGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<:<<<;
-@EAS221_1:8:78:1478:1446
-TGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACA
-+
-<8,8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:8:84:1013:1074
-GCAAGGGGGTCTATGTGAACAAAGGCACTAAACAC
-+
-<7<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:8:84:1013:1074
-TTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAA
-+
-8;;<;8744<7<<4<<47<<<<<<7<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:8:8:1351:1986
-CCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATG
-+
-<8;<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_1:8:8:1351:1986
-TCTTACTTCCAGATCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAA
-+
-<<<<<<<<<<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:2:100:1147:124
-AAAAAAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<
-@EAS221_3:2:100:1147:124
-AATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCAT
-+
-<<<<96<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<
-@EAS221_3:2:22:1623:709
-GAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGAC
-+
-<<<<<<<<<7<<<<<<<:<<<<<<<<:85:<:2<<
-@EAS221_3:2:22:1623:709
-GGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGAC
-+
-<'<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:2:2:491:1886
-CTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAAT
-+
-<<:<8:<<<:<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<:
-@EAS221_3:2:59:1576:946
-AACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAA
-+
-<:<<<<<<<<<<<<:<:<<<<<<<8<<::1<<<<<
-@EAS221_3:2:59:1576:946
-CAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTT
-+
-9<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:2:60:590:1760
-AAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTG
-+
-<:<<<<<2<<<<:<::<<<::<<<<<6<<<<<<<6
-@EAS221_3:2:60:590:1760
-TCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGT
-+
-<8<-<<<<<<<82<<<4<<<<<<<<<<<<<8<<<<
-@EAS221_3:2:67:1467:1447
-AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:2:67:1467:1447
-ATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTA
-+
-<<<<<::<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:2:67:1864:477
-AATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:2:67:1864:477
-TAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:2:76:1729:813
-TAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTT
-+
-<+6<<<&1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:2:76:1729:813
-TCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:4:12:276:1797
-ACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATGT
-+
-<<<<<<<<<<<<:</<<9<:<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:4:12:276:1797
-TCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTC
-+
-)9<02)<<<<<<<<<<<<<1<<<<&<<<<9<<<<<
-@EAS221_3:4:21:132:1423
-GCCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:4:21:132:1423
-TCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCC
-+
-:<<<<<6<<;<<;<5<;<<<<<<;<6<<<<<<<<<
-@EAS221_3:4:29:1061:574
-ATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<8<:<<<<
-@EAS221_3:4:29:1061:574
-GGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATG
-+
-<87<5<<9<<<66<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:4:30:1452:1563
-ATGAATTAACCAAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<:<<<<1<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:4:30:1452:1563
-GATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAAT
-+
-<<39<<<59<<:<<+<<<6<<:<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:4:41:1308:619
-CATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCA
-+
-0<9476<<<<<0<<<2<&<0<.<<<<<<<<<.<<<
-@EAS221_3:4:41:1308:619
-GAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATG
-+
-<6+<*<<<<<<<:<<<<<<<:<<&<<<<1<6<11:
-@EAS221_3:4:57:1675:720
-TATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:4:57:1675:720
-TCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGAT
-+
-<,<<<<<<:<<<<<<<<:9<<<<<<<<;<<<<<<<
-@EAS221_3:4:66:584:407
-GCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCT
-+
-<<<*9<9<<<1<<<<<<<<*<59<4<)<2<<<<<<
-@EAS221_3:4:66:584:407
-GGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACT
-+
-<<84<<<766<<<.6<<<<<<4<<7<<<<<<<7<<
-@EAS221_3:4:78:1314:1275
-AGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAG
-+
-<<<<<<<<6:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<
-@EAS221_3:4:78:1314:1275
-GAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<8
-@EAS221_3:4:81:687:1379
-CCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<
-@EAS221_3:4:81:687:1379
-TAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAA
-+
-<<<<<<<<<<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:4:90:247:212
-ACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCT
-+
-7655:;87;<;;;8<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS221_3:4:90:247:212
-TGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<8<
-@EAS221_3:6:20:492:850
-AGTATGAAAACAATGTTCCCCAGATGCCGTCCCGG
-+
-:.5:+.;;&91:;79:766:1:9+6&:1&&:+:))
-@EAS221_3:6:20:492:850
-CCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTT
-+
-<7<<<<<<<<<<<.<54<7&<<<7<74<2<<<2<<
-@EAS221_3:6:26:227:1053
-ATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:6:26:227:1053
-GGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS221_3:6:51:1486:1131
-ATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAA
-+
-<<<<<<<<<<,<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<
-@EAS221_3:6:51:1486:1131
-TCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGAT
-+
-<<<<<<<<<;<<<<<<<<<1<5<<8<<<'<;<<;1
-@EAS221_3:6:70:843:706
-AATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTGTC
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:6:70:843:706
-ATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<5<<<<<<
-@EAS221_3:8:33:1240:846
-ACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<7<<2<;<<;<<<;<<<:6:<<<:
-@EAS221_3:8:33:1240:846
-ATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAA
-+
-<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:8:34:956:1309
-AACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACA
-+
-<<<<<<7<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<:<8<8
-@EAS221_3:8:34:956:1309
-AGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTC
-+
-9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:8:50:1203:1094
-AAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:8:50:1203:1094
-ACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAG
-+
-<7<<<<<5:+63<<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<<<
-@EAS221_3:8:55:932:613
-TAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:8:55:932:613
-TGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:8:63:1265:820
-CTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTC
-+
-<<<<<<<<<<27<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<03<
-@EAS221_3:8:63:1265:820
-TGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAA
-+
-<<<<<<3<<1<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<+<
-@EAS221_3:8:65:463:703
-GAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<
-@EAS221_3:8:65:463:703
-TGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTT
-+
-<<3<9<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:8:74:770:1712
-ACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<7<<
-@EAS221_3:8:74:770:1712
-GAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCAC
-+
-3.&::6<<<9<6:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:8:7:1864:1569
-AAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS221_3:8:7:1864:1569
-AGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<8<<<<
-@EAS51_62:1:38:250:647
-AATAATAAAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGA
-+
-+<&+<1<,<<7<<7<<<<<<<1,<<<<7<<2<<<<
-@EAS51_62:1:38:250:647
-ACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAT
-+
-<<<<<<<9<<9<<<<<<<6<<<<<<<<<<8<779%
-@EAS51_62:2:133:8:379
-ATAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATA
-+
-&=========='==7==0=2====28===00====
-@EAS51_62:2:133:8:379
-GGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8;<<8<<<:6<
-@EAS51_62:2:258:266:101
-ACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<;,<-2<<<<;68<<6
-@EAS51_62:2:258:266:101
-CCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCT
-+
-%==/7&8=======:===6================
-@EAS51_62:2:260:147:818
-AAAATTTGGTAATTTAGTTTTTTTTTTTTTCTTTT
-+
-6.=..++==6=76==&===========99======
-@EAS51_62:2:260:147:818
-ATCCATGTAACAAATCTGCGCTTTTACTTCTAAAT
-+
-<<<<<<3<<<<<;<<<<)<1<<<&<7<<<;<4/9<
-@EAS51_62:3:103:443:166
-ACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<1<-;;;<
-@EAS51_62:3:103:443:166
-TACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAA
-+
-7<4<4<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:3:169:292:652
-ATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<-<<<<8<
-@EAS51_62:3:169:292:652
-GCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGA
-+
-79919-<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<
-@EAS51_62:3:200:263:280
-AGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;8<;1
-@EAS51_62:3:200:263:280
-TTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACA
-+
-)<<<8<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:3:263:74:407
-AAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCAT
-+
-;;88<::+;<)<5<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:3:263:74:407
-CTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAA
-+
-<<<<2<<<<<<:<<<9<<4<<<<:<<<<9<999.7
-@EAS51_62:3:314:386:190
-AGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGA
-+
-++<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<
-@EAS51_62:3:314:386:190
-CACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGAT
-+
-76;%;<<3<9;<69<<<7;;;<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:3:50:312:219
-ACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCG
-+
-<,;83:<::6<<<<<<<;:<;<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS51_62:3:50:312:219
-TCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTA
-+
-<<<<<<<<<<<;<<<<<;<;<<<;<<<<<<;;;;;
-@EAS51_62:3:55:340:837
-TCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAAT
-+
-61378<::<<<5:<;;:<<<<<<<<<<<<;<<<<<
-@EAS51_62:3:55:340:837
-TTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCT
-+
-<<;<<;<<<<<8<;<<<;<7<<<;<<<<<93+79(
-@EAS51_62:3:68:996:104
-AGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTA
-+
-<1<8<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:3:68:996:104
-TACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<
-@EAS51_62:4:156:857:494
-CTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<:<<
-@EAS51_62:4:156:857:494
-GTTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTC
-+
-<<<8<:5<<;<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:4:187:907:145
-TTTCTTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTATTGCAT
-+
-<<<+;;,6<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:4:282:962:46
-GAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAG
-+
-69<<<<<:<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:4:282:962:46
-TACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<
-@EAS51_62:4:308:614:911
-AAAAACAATTTGGTAATTTAGTTTTTTTTTTTTTC
-+
-%<<<;:<::<6,<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:4:308:614:911
-TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<8<
-@EAS51_62:5:119:38:945
-ATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCAT
-+
-=;;8=====:========<================
-@EAS51_62:5:119:38:945
-TCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<8<<<8<;<<7<:<<
-@EAS51_62:5:131:779:345
-GTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAA
-+
-============================9====;=
-@EAS51_62:5:131:779:345
-TGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGT
-+
-<<7<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<
-@EAS51_62:5:154:669:853
-GTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCA
-+
-============<===.====<:=<9=<<<9;:;2
-@EAS51_62:5:154:669:853
-TGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGA
-+
-<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:5:192:716:235
-ATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTA
-+
-======================9==:<==:;;69;
-@EAS51_62:5:192:716:235
-GACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCT
-+
-<5<<<8<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:5:236:498:526
-ACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGT
-+
-===================================
-@EAS51_62:5:236:498:526
-CAGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTG
-+
-<%88<;<:8<<<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:5:290:319:736
-CGAGTCACGGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCT
-+
-==;=======7====6=;==:;;====66=::27:
-@EAS51_62:5:290:319:736
-GTTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAAC
-+
-<<<<<<:7:<.<<<<7<<.<.<<.9*<4<:<4%74
-@EAS51_62:5:295:882:282
-AATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAG
-+
-<<:<8<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:5:295:882:282
-CAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAA
-+
-========================<6<======8;
-@EAS51_62:5:86:697:941
-AAAAAAATCCCGGAAGATACATTGCAAGACAGACT
-+
-1<<%<<<1:<58<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:5:86:697:941
-GTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGT
-+
-=====================<=<==<<====;=5
-@EAS51_62:6:12:484:836
-AAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAA
-+
-<<<<</<4<<&7<<<<;<<<<<<<<<<<<<1<<<<
-@EAS51_62:6:12:484:836
-AAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<7<:<<<<<<9<<<<<<<<
-@EAS51_62:6:148:170:895
-AAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGT
-+
-<<9<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:6:148:170:895
-AAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGA
-+
-<<<<<<<<<<9<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<6<
-@EAS51_62:6:50:542:881
-CCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGA
-+
-+2<<<;<3;29<6<5;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:6:50:542:881
-TCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGTAAGAA
-+
-<<<<<4<09<<9<<2<<<<<<<<<<<2/.&2<%<7
-@EAS51_62:7:144:28:475
-AGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<::8<
-@EAS51_62:7:144:28:475
-CAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGT
-+
-;;;9;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:7:157:784:936
-GCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<;<<<<814<4<
-@EAS51_62:7:157:784:936
-TGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTT
-+
-<:<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:7:162:195:761
-AACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACT
-+
-<<8<<:<<:<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:7:162:195:761
-TCACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<<<;;
-@EAS51_62:7:178:286:414
-CACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAG
-+
-68;38::<<;<<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:7:178:286:414
-TTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<1<<<1;998
-@EAS51_62:7:196:511:896
-ATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<4<88;<<
-@EAS51_62:7:196:511:896
-GAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCAT
-+
-8<<<<<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:7:248:17:435
-ATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACAC
-+
-<1<<88++<:<<:;<;<<<:<<<;<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:7:248:17:435
-CATGAGTTCAGGAAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTC
-+
-<<<<8<<<888<+<<<<<;<:<<<<8<<<<<;3<3
-@EAS51_62:7:312:236:655
-GAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTC
-+
-<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:7:312:236:655
-TGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTA
-+
-<<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_62:7:96:836:737
-ATCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATA
-+
-<<<<<<71<<<<<<<<<<899<:5<<<96858<<.
-@EAS51_62:7:96:836:737
-TCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATC
-+
-1<;<7;;1;8;;8:<<1<;<<;<<<<<<<<<<;<<
-@EAS51_62:8:52:967:804
-AACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<
-@EAS51_62:8:52:967:804
-TTACCTAGTTGCTCTGTAGTCTCAATTAATTGTTT
-+
-===============<=======<<===<======
-@EAS51_64:2:326:153:231
-ATTGTTTTCAACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTT
-+
-::6=68=<*$;*=========6=============
-@EAS51_64:2:326:153:231
-TGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCT
-+
-<<<<<<<<<9<<<<<<<<<,<<<<<<8<<8.;.;4
-@EAS51_64:3:143:310:958
-CTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTG
-+
-84<;<6<<<<;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_64:3:143:310:958
-GTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGC
-+
-<<<<<<<<<<<8<8<<<<<;;7<<<;6;<<+4;;;
-@EAS51_64:3:190:727:308
-ACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTG
-+
-;;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_64:3:190:727:308
-GGTGCAGAGCCGAGTCACGGGGTTGCCAGCACAGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::<<<844
-@EAS51_64:3:255:45:399
-AAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGA
-+
-<5<5<4$;;7/<<<177&7;<<<<<<;<<4<<<<<
-@EAS51_64:3:255:45:399
-GGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACT
-+
-<<3<8<<8<0<<;<<<0<<<</+8<611<<;71;7
-@EAS51_64:3:285:417:147
-AGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAA
-+
-<..)<<<<;<<<<7<;-<<;<<<<<;8<<<<<<<<
-@EAS51_64:3:285:417:147
-TTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<;8<<<<<<<<<;6<:<;<<;
-@EAS51_64:3:309:303:278
-CTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<+<<+<<7<<<<<5<<<;;;
-@EAS51_64:3:309:303:278
-TCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCC
-+
-<:<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_64:3:67:782:132
-ATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAG
-+
-;;<;;;<<;;<<<;<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<;
-@EAS51_64:3:67:782:132
-TCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;4<<<<
-@EAS51_64:3:7:268:263
-TCGTACAGAAGTTTAATGGAGCCTTGGGACCTTAC
-+
-!!66'&+/&'8+2''1+'611'&6&+/&+.&+1'&
-@EAS51_64:3:7:268:263
-TTGCGTTATTTGAGTTGGTGGAAGACATAATCCCA
-+
-',)*&2<$7+<<<'<-<7<<<<<<<7<<</4/;<<
-@EAS51_64:3:80:885:513
-GAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCA
-+
-<7<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_64:3:80:885:513
-GCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<2:<;<<75<7;
-@EAS51_64:3:90:435:691
-GGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGT
-+
-;;<;;;+<<:<<<:<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<;
-@EAS51_64:3:90:435:691
-TCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAGT
-+
-<<<<<<<<<<;<<<;<<<<:<<<;<81;<<1;784
-@EAS51_64:4:102:467:897
-AGCATGGTTGTACAGGGCAATACATGAGATTATTA
-+
-83333<+02<:<.&<+<.<::7<<::<<<<:<<<<
-@EAS51_64:4:102:467:897
-GCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGTCTTTT
-+
-<<<<9<<<<9<2<<<&,/</<<<<7<<;&&<$;*<
-@EAS51_64:4:116:738:142
-AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA
-+
-<:<7;+:<<:<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_64:4:116:738:142
-TGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<:;2
-@EAS51_64:4:163:31:455
-CTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGACAGCTNNCAAC
-+
-<+<<<<<<<;0+<<<<;06070-9(0(9<!!5)05
-@EAS51_64:4:163:31:455
-GGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCT
-+
-8;<<;<<<78+<=</<<=;23<=<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_64:4:179:389:585
-TGGCCACTTTTTATCGCATTTCCCTTTAGAACCTA
-+
-<.4<9.4+.+'&-220<+<4<6<<20*6;<0(9<%
-@EAS51_64:4:179:389:585
-TGTGAAATGAATGAGATTATTAGGAAATGCTTTAC
-+
-;<)<;*;9*+<;<<,,<,<4<4<<<<<;<4<9494
-@EAS51_64:4:181:476:394
-AACAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATT
-+
-<+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_64:4:181:476:394
-TCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<:<<<:;;
-@EAS51_64:4:189:467:475
-CTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGA
-+
-*.;*;7<75<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_64:4:189:467:475
-TATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCC
-+
-<<<<<<<<<<<<;;;<<<<<<<<<:<<<<:+<<;;
-@EAS51_64:4:189:571:366
-AACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAAT
-+
-<<;<<<<<:<<<;<<<;;;<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_64:4:189:571:366
-TCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<:<<99;;;
-@EAS51_64:4:318:345:156
-GGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATT
-+
-<<<<<<<<:<<<<<<<<5<:5<<<3:'<72')*;9
-@EAS51_64:4:318:345:156
-TTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGT
-+
-;8<8<<<<<;<<:<<;<;77<<<<<;<<;<<<<<<
-@EAS51_64:4:57:786:414
-CTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACC
-+
-;;;8;1;:<<<<;<::;;<<<<;<;;<<<<<<<<<
-@EAS51_64:4:57:786:414
-TGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:<<:;;7<7
-@EAS51_64:5:177:24:389
-AGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;;<;9969;
-@EAS51_64:5:177:24:389
-CAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGA
-+
-+<<;<9<<<9<<;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_64:5:202:39:380
-CAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<:;<<18<84:<&<+<
-@EAS51_64:5:202:39:380
-CTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAG
-+
-/92/;2<+2<<<<64<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<
-@EAS51_64:5:290:247:509
-AGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<92<;;;<;96;19
-@EAS51_64:5:290:247:509
-TCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTT
-+
-49';<<<<<8;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_64:6:118:41:489
-ACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAA
-+
-<+<<;<<<38<<<<5<<3<<<<3<<8<<<<<<<<<
-@EAS51_64:6:118:41:489
-CCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<95:
-@EAS51_64:6:124:128:489
-CTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTT
-+
-::55<<<8<<<6<<;<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<
-@EAS51_64:6:124:128:489
-GTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<6:6<<-4<::;;<<:48<
-@EAS51_64:6:143:763:480
-AAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCC
-+
-::3<:6<<<:<<<<7<<<<<<<<)6<<<1<<<<;<
-@EAS51_64:6:143:763:480
-CTGAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACAAA
-+
-;<&-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_64:6:195:348:703
-CAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGA
-+
-<9<<9</<<<<<<<<<<<<<<2<8<<<<<<<<<<<
-@EAS51_64:6:195:348:703
-TAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAA
-+
-<<<<<<<;<<<<<;:<<<<<<<<<<<<:<1:<:7<
-@EAS51_64:6:206:994:556
-ATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<;<<
-@EAS51_64:6:206:994:556
-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
-+
-!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
-@EAS51_64:6:210:809:735
-AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_64:6:210:809:735
-GAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<5<<
-@EAS51_64:6:213:54:878
-CTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTTTGTT
-+
-<<<<<<<<<;<<<<<<<<:<<:<<++<<<<%<%<<
-@EAS51_64:6:300:622:86
-GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCA
-+
-<:<<<:<6;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_64:6:300:622:86
-TCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<
-@EAS51_64:6:54:695:952
-ACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
-@EAS51_64:6:54:695:952
-GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCA
-+
-277%<9<4)<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_64:7:104:965:517
-AGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<8<<;<<
-@EAS51_64:7:104:965:517
-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
-+
-!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
-@EAS51_64:7:140:752:822
-CATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAA
-+
-;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_64:7:140:752:822
-GCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<;<:;
-@EAS51_64:7:152:918:824
-TACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCA
-+
-;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_64:7:152:918:824
-TTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<8
-@EAS51_64:7:92:493:891
-AAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<8
-@EAS51_64:7:92:493:891
-AGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCA
-+
-<383<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_66:1:282:274:50
-ATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAA
-+
-</7;/:<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_66:1:282:274:50
-CCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<99<9<5909;5;
-@EAS51_66:1:289:207:323
-CCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAAC
-+
-<<<:<<<<<:<<<<<<<<<<;<<899<<13)939;
-@EAS51_66:1:289:207:323
-CTAGTGGGAGTATAAATTGATTTCCACTTTGGAAA
-+
-&</<7<<:<7::<<<<+3<-7<<:<7<<<<<<<<<
-@EAS51_66:1:64:182:741
-AAAAAAACAAATTAAACTCTAACAAAAGTAAATAA
-+
-(+;1&(9*%0<*(*&<*5,/+<,&<&<<6<<<<<<
-@EAS51_66:3:102:511:946
-ATGTAAAAGTGACTGTTATTGTCTTGACACCCAAC
-+
-<%-4:6<:/&46;/*;<*84<0<'<&*<2<<<<<<
-@EAS51_66:3:102:511:946
-CCCAGTCCCTGCCCCATCTCGGGTAATCTCTCTCC
-+
-<<9<<;<<<<;<<<<;<<7;%<5<<0<<<)<.<.+
-@EAS51_66:3:155:375:623
-AAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACAC
-+
-;;;;<<:<<<<;<<;<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<
-@EAS51_66:3:155:375:623
-CAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCC
-+
-0<<<<<;<<<<<<<<<<<<<4<<8<<<<<<<<;<;
-@EAS51_66:3:166:532:438
-AACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;<<<<;<;:;;<;<
-@EAS51_66:3:166:532:438
-AACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTA
-+
-<<&7<<<<<<<+<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_66:3:233:191:520
-TGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<8<<
-@EAS51_66:3:246:711:981
-AAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGC
-+
-;;:;7<<:5:<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_66:3:246:711:981
-AGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCT
-+
-<<<<<<<<;<<<<:;<<;;<:<<<4<<:4;00<;<
-@EAS51_66:3:263:689:572
-AAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATG
-+
-<9<2<<<<<<<<<22;;02<<<9<<;9<9<<;<<3
-@EAS51_66:3:263:689:572
-AAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACA
-+
-<<<<;<<<<<;<<<<<<&;;<<<;<<:<+;;7;;7
-@EAS51_66:3:29:381:169
-ATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCT
-+
-<<<<<<<<<<<2<288;<<;<<:4<:<<;&92929
-@EAS51_66:3:29:381:169
-CATCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTAT
-+
-2<82<;66<:<;<:<;<;<8<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_66:3:39:59:738
-GAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAATTAT
-+
-3<8.<<<<<<<-<<<<3<388;;880<0<0)-722
-@EAS51_66:3:39:59:738
-GTCCTATGTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGT
-+
-;.;4;<;3<<9<<9<&<<9<<<<<;<9<;<<;9<<
-@EAS51_66:4:188:460:1000
-GTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<7<<;:4;44<;;:8;;9;;
-@EAS51_66:4:188:460:1000
-TCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGC
-+
-+;+077<7;<57<;;8<<<<<<<<<<8<<<<<<<<
-@EAS51_66:4:191:40:536
-ATAAAAAAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATA
-+
-+1<<,<&<<:<.;<7/7<<<<;.<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_66:4:191:40:536
-CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAA
-+
-<<<<<<<<8<<;<<8<<;<;;<<8<<<<<</<74/
-@EAS51_66:4:209:92:210
-GAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<5<7<<;;;<;<
-@EAS51_66:4:209:92:210
-TTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTT
-+
-;9;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_66:4:240:264:231
-CAACAGATCAAGAAGGAGGGGCAATGGACGAGTTA
-+
-%15+5022))0&<<)0)+7:4+&<0<<:0<<<7<<
-@EAS51_66:4:240:264:231
-TGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTA
-+
-9;,;;62<9<)29<<<;96<<<;<<7<<<<<<;<<
-@EAS51_66:4:277:482:316
-CACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<:<;<<<<;<<<1<1;
-@EAS51_66:4:277:482:316
-TGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATT
-+
-9998;<<<<<;;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<
-@EAS51_66:4:310:287:420
-AAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGAT
-+
-<<<<;<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_66:4:310:287:420
-TACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;;
-@EAS51_66:4:322:350:374
-ACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAA
-+
-<+;8&84<<<:<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<
-@EAS51_66:4:322:350:374
-CATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
-@EAS51_66:5:210:674:911
-TCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;
-@EAS51_66:5:210:674:911
-TGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATA
-+
-27;2<;<<5<<<<;;<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<
-@EAS51_66:5:269:280:716
-TGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGA
-+
-6;<;;6:;<<<;64;<<<<<<<<;<<;<<;<<<<<
-@EAS51_66:5:269:280:716
-TTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTTTCAGTT
-+
-<<<<<<<<<2<<:2:1<<7/2/:3<<<<*<3($<<
-@EAS51_66:5:273:545:1001
-AACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATC
-+
-<7(<<72;<2;27<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_66:5:273:545:1001
-AGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<;<8;28<8;<<8
-@EAS51_66:5:285:395:450
-GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAAT
-+
-8)3<8+;<)<<<<<<<<97:7<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_66:5:285:395:450
-TATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT
-+
-<<<<<<<;<<<;<<<<<;:<:7<;<;7<7<<;;7<
-@EAS51_66:5:308:400:602
-ATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGG
-+
-;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;<<;<;76
-@EAS51_66:5:308:400:602
-CCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCT
-+
-;77;2<<;<7<<;<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_66:6:284:442:747
-AAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGC
-+
-<;<<<<<:<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_66:6:310:747:415
-TGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<;<<<<<;<;<;
-@EAS51_66:6:310:747:415
-TGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGG
-+
-;<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_66:7:174:987:334
-ACACCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGC
-+
-<<;4<<<<;;</4<4<+<<<<<;<<<<<</<93+2
-@EAS51_66:7:174:987:334
-GTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCAT
-+
-,;<;;<<<&<<<1<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<
-@EAS51_66:7:4:234:610
-AAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTCCT
-+
-<<<<<<<<7;<<<;7<7;7;7<;-<-<&<<<0%06
-@EAS51_66:7:4:234:610
-AAAAATCAACATCACAAATACACACAAAAGTACAA
-+
-<:+:'+&<+'<+'2&<:<7<2<':2<:<<7<7<<<
-@EAS51_66:7:84:411:336
-GCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAATT
-+
-<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<:<<;<<<<<<;8<;<
-@EAS51_66:8:36:688:722
-ATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTT
-+
-<;;<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_66:8:36:688:722
-GTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_66:8:43:972:506
-AGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAAT
-+
-<;<<<<<<<<<<<<6;<;<<<<<<<<<<:;;<;<<
-@EAS51_66:8:43:972:506
-TAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAAT
-+
-;<<<<<<<+;<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS51_66:8:66:655:769
-TCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCT
-+
-8<<;:69<;:;9<2<*9<;6<<<<<17<;<3+<;<
-@EAS51_66:8:66:655:769
-TTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGG
-+
-8;<<<<<8<<<<<;<<<7<;<<<<<;<7<27<;;7
-@EAS51_66:8:9:80:353
-AATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<;;<<5<<2;2
-@EAS51_66:8:9:80:353
-CCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCT
-+
-;;5;:8<:<:;:;<<<<;<:<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_78:7:113:43:634
-ATTTGTCTGAGAAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAA
-+
-;9;1;<5:<<<%<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_78:7:113:43:634
-CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<.<<<<<<<<<<<<</<<2;;%%;
-@EAS51_78:7:147:64:416
-AAACAATGTCCCCCAGATACCATCCCTGTCTTACT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<;;:<;;;;;
-@EAS51_78:7:147:64:416
-CTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGC
-+
-/;49;:6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_78:7:164:727:977
-GAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAA
-+
-;<;<;<:<:<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_78:7:164:727:977
-TACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTCGAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<;;79;
-@EAS51_78:7:186:199:927
-CTACGCGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGC
-+
--;++)6<*8+;&<&/<<<<7<<71<<<<<6<<<7<
-@EAS51_78:7:186:199:927
-TGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCT
-+
-<77<<<<2<;<<<<<06<<<<<<<<60<<684/6&
-@EAS51_78:7:215:516:299
-AAGCTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAA
-+
-;;))7<8:855<<4<;:<<87<<<7<<;<<<*3<<
-@EAS51_78:7:215:516:299
-AATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGAT
-+
-<<<<<<;<<<<;;;;<;;<<<<;<<9<;<<1;7/;
-@EAS51_78:7:270:448:491
-GTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<&<<.<<<<<<<:;;;<;
-@EAS51_78:7:270:448:491
-TTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAAC
-+
-7;;;;+2;<<+<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS51_78:7:303:402:142
-AGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCA
-+
-;;;;;<9<<8;<<<<7<<;<<<<;<<<<<<<<<<<
-@EAS51_78:7:303:402:142
-TCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGT
-+
-<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<46<648;;';
-@EAS51_78:7:316:961:576
-TGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCCG
-+
-<<<<<<<;<<<<;<<:<<;<;<<:;<9+34;;6%/
-@EAS51_78:7:316:961:576
-TTACGGGTGTAATCTCTCTACATGGCTAATTATGA
-+
-(++%%+++),+,+*++,+,,-,**+,-&-,+-+--
-@EAS54_61:1:115:868:887
-CATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCT
-+
-==;==8=;=;=========================
-@EAS54_61:1:115:868:887
-TCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGAC
-+
->>>>>>>>>>>>>>;<>>>>><<>>>;<+<</;;1
-@EAS54_61:2:168:61:867
-GATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAG
-+
-====7====================7======6==
-@EAS54_61:2:168:61:867
-TCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATG
-+
-;7<<<<<<<<<<<<<7<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_61:2:66:757:918
-CCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGA
-+
-<9<45;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_61:2:66:757:918
-GGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACC
-+
-===================================
-@EAS54_61:3:150:933:810
-AGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATT
-+
-:89===:=:=;;==;====================
-@EAS54_61:3:150:933:810
-CAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGG
-+
-===================================
-@EAS54_61:3:155:758:710
-ATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAA
-+
-=46=4=5===:========:=7=7======11===
-@EAS54_61:3:155:758:710
-TTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAG
-+
-=======8================6=:7===:=:=
-@EAS54_61:3:20:762:748
-CACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAA
-+
-===================================
-@EAS54_61:3:20:762:748
-TTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAAT
-+
-=:747;7=;;==7=;==7===7==7;=========
-@EAS54_61:4:143:69:578
-ATTGGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAATG
-+
-222&<21<<<<12<7<01<<<<<0<<<<<<<20<<
-@EAS54_61:4:83:452:970
-AATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAAT
-+
-==========================;========
-@EAS54_61:4:83:452:970
-AGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTG
-+
-<<<39<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_61:4:86:660:932
-AATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATT
-+
-================================9:=
-@EAS54_61:4:86:660:932
-ATATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAA
-+
-&<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_61:6:126:541:194
-AGTACGACCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAAC
-+
-+%&:/+(46=47&71/2==;=;8====28212===
-@EAS54_61:6:126:541:194
-CAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGC
-+
-<<<<<<<<8<<<<<8<<<<<<<<<8<<<428+<80
-@EAS54_61:6:25:949:33
-AAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTG
-+
-=;===/8========*==&;6=&=&:=6&:=::67
-@EAS54_61:6:25:949:33
-GATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATG
-+
--<4<666<<-7<5<<<<<(<<<<<<<<<<<<<<-<
-@EAS54_61:7:114:506:971
-ACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCA
-+
-;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_61:7:114:506:971
-GGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCA
-+
-===================================
-@EAS54_61:7:64:37:257
-CCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTT
-+
-================<=====;===8;4======
-@EAS54_61:7:64:37:257
-TTTGATTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCT
-+
-;47<<47+9<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_61:8:165:441:708
-CCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACA
-+
-6+<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_61:8:165:441:708
-CTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTT
-+
-=<===============================99
-@EAS54_61:8:4:173:814
-CTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC
-+
-<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_61:8:4:173:814
-GATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCA
-+
-=====================<==========;==
-@EAS54_65:2:127:288:655
-ACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<;;
-@EAS54_65:2:127:288:655
-TGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGA
-+
-<<:<3<<:<.<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:2:182:924:833
-TTTTTTTTTTTTTATTTGCGCTTTTTTTTTTTTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<)7<<)3/:07<<9<9<<==<7<
-@EAS54_65:2:264:157:150
-GGAAAAATGGACAAGATTCTGATGAGGGTTACACT
-+
-.3%:+<<*;*<2<<1<1*,*<<7<<+<<<&<<<<<
-@EAS54_65:2:264:157:150
-TAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAA
-+
-<<<<<<9<9<<<<.9;<<9&<97<;9933309605
-@EAS54_65:2:94:356:809
-AAATCTATAACAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAA
-+
-<<<<3<<<<;;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:2:94:356:809
-CTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:;
-@EAS54_65:3:102:884:63
-GTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAA
-+
-<;7;;<<8<;8;<<<8<<<<<<8<<<8;<<<<<<<
-@EAS54_65:3:102:884:63
-TGTCTTCCTCTGTCTTGATTTCCTTGTTGTTGGTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<<%<<<9<<9<<7+;<
-@EAS54_65:3:155:541:234
-CTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAG
-+
-<<7<<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<;;;08
-@EAS54_65:3:155:541:234
-TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAA
-+
-78;<7<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<
-@EAS54_65:3:214:946:229
-AAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGATATTATG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<::<;;;<;<;7<:<<7<2
-@EAS54_65:3:214:946:229
-ACAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGA
-+
-)+<<<*<<77;8<;7<<8<4<;<88<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:3:273:901:459
-CCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTAT
-+
-<<8<<<;<;8<;<;<;7+8<788<;;22<27;77;
-@EAS54_65:3:273:901:459
-TGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATT
-+
-4;+/+7,;<8+&<;;82;;<8<8<2<;<<<<<<<<
-@EAS54_65:3:290:558:349
-ACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGCGGGA
-+
-<<<;<<;<;<188<<<8::<686+4:<<6:&3)*&
-@EAS54_65:3:290:558:349
-TCTCAGCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCG
-+
-2;2;;'5&;<<5<<;5/<<<<<7<<;+;<<+1<8<
-@EAS54_65:3:320:20:250
-AAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;+:<;<<3
-@EAS54_65:3:320:20:250
-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATGCCAGAAA
-+
-+'''/<<<<7:;+<;::<<<;;<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:3:321:311:983
-ATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAA
-+
-;;4;;<7<<<<<<77<<<<<<<<<<17<<<<<<<<
-@EAS54_65:3:326:652:890
-TTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAA
-+
-<<<<<<<<<<2<<<<<<<<<<<<<<+<8:<<9998
-@EAS54_65:4:137:319:642
-CTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTTTTTGATTTT
-+
-<<<<<<<<<27<<<<<<<<<<<<<<&;<<&3;;<%
-@EAS54_65:4:174:753:617
-ATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCT
-+
-<;<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:4:174:753:617
-GATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<
-@EAS54_65:4:192:714:341
-AAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATA
-+
-<<<3;<<<<9:<<</<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:4:192:714:341
-ACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTA
-+
-<<9<<<<<<<<<<<8<<<<<;<<;8<<<88;;;;9
-@EAS54_65:4:193:38:987
-AGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTTGTGTTCT
-+
-<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:4:193:38:987
-TGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<:;:;;
-@EAS54_65:4:246:313:499
-ACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<;<<<<<;;<<<
-@EAS54_65:4:246:313:499
-CTTTAAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTG
-+
-+;77%;;;&:;:7;<<<<<6<:<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:4:325:795:213
-AGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTA
-+
-<<<0<<;<<<<;<<;:<<<<<<<<<<<;<<<<<9<
-@EAS54_65:4:325:795:213
-GGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATG
-+
-<<<<<<<;<<<<;;<<<<<<<<<<<<;:<</;/;;
-@EAS54_65:4:61:346:384
-CAACTAAGAAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATT
-+
-7&$+&,<<+;;<;;<<6<<8<<<;<<;<<<<<<<<
-@EAS54_65:4:61:346:384
-CTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGAT
-+
-<<;<<<<<<<<9<;<<9;<6<2;<6<<<;9*558;
-@EAS54_65:4:91:267:655
-CAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:;;7<9477<74;
-@EAS54_65:4:91:267:655
-TGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGT
-+
-;,:;5:<6:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:6:115:538:276
-CAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGA
-+
-:<<<<<<<<;;<5<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:6:115:538:276
-TATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGT
-+
-<<<<<<<<;<<<;;<<<;<:<<<:<<<<<<;;;7;
-@EAS54_65:6:164:797:930
-AGCTAGAGACCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<;;;:<<<<<;<;<<<<<,::
-@EAS54_65:6:164:797:930
-GTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGT
-+
-;;:;8<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:6:18:376:416
-GCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGA
-+
-70<<<<<<<7<7<<<2<<<<<<<<<<8<<<<<<<<
-@EAS54_65:6:18:376:416
-TTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<;:(<<
-@EAS54_65:6:277:590:364
-CTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCA
-+
-:::<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:6:277:590:364
-CTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTC
-+
-<<<<<8<<<<<<<<;<<<<<;;<7<<;;7858;;8
-@EAS54_65:6:326:71:741
-TCTCGTTTTTTTTTCTTTCTTTTCTCTTTTTTTTT
-+
-!!<66<<<<<<<<<&<<7&<<<<:<*<<<<<<<<1
-@EAS54_65:6:49:183:435
-CCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;:;8;:
-@EAS54_65:6:49:183:435
-GACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATG
-+
-1<7<<<<;:<<<<<;<<<;<<<;<;<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:6:67:56:806
-TATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<:7:
-@EAS54_65:6:67:56:806
-TCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCA
-+
-844:8;7<88;8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:7:117:452:744
-AATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCC
-+
-<;;<;<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:7:117:452:744
-ACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAA
-+
-<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<:<<<<<<<;;
-@EAS54_65:7:155:629:357
-AGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAA
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<;<<<
-@EAS54_65:7:155:629:357
-AGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAA
-+
-<<<<<<<<8<8<<6<<<<<<<<;<9<5<;<;;941
-@EAS54_65:7:159:253:353
-ATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGG
-+
-<8<<<<:<<;;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:7:159:253:353
-GAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAGGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<0,%4(+,
-@EAS54_65:7:56:57:985
-TTCTGTCTTCTCTCCTGTCTTCTTTTCTCTTCTTT
-+
-<9'<.<7<<2<<;77<7<<<<7<7<<<<7<<<2<<
-@EAS54_65:7:56:57:985
-TTTTTTCTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
-+
-666666*6&1666+64666666666&266666666
-@EAS54_65:7:68:825:405
-AAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;9
-@EAS54_65:7:68:825:405
-AAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATAT
-+
-<<<;<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:8:10:975:766
-AATAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAAT
-+
-++4<<+<+<<<<8<<22;<<<<<2<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:8:10:975:766
-TTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGAAA
-+
-<<<<<<<<;<<<<;<:<<;<6;;<<<:6-:+1+;;
-@EAS54_65:8:140:924:923
-GAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<5;<;
-@EAS54_65:8:140:924:923
-TTTTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACC
-+
-<<&<<;;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:8:147:687:428
-ATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAA
-+
-;1<''48;4)<<:<<<<;<<6;<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:8:147:687:428
-ATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:8:178:187:610
-AAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:8:178:187:610
-TTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTAT
-+
-66:,:<7<<<<<<<1<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<
-@EAS54_65:8:240:719:799
-AGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAAC
-+
-<:<<<<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_65:8:240:719:799
-TTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<
-@EAS54_65:8:305:819:245
-AAATTCATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAA
-+
-8<<<<8<;<<<<<;<8<<8<8<<<<8<<<899<<+
-@EAS54_65:8:76:493:708
-TTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAA
-+
-5/)63.&1517(544(055(0454&7706566679
-@EAS54_67:1:138:186:274
-GGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGG
-+
-<;<<<<<6;<<<<<3<<36;3;<9<<<<<<3;<<<
-@EAS54_67:1:138:186:274
-TAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTAC
-+
-=39====9===;=;=;=9=;=====;===-=+=-7
-@EAS54_67:1:159:222:274
-GAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC
-+
-=;9====;=9==59=+==9========9===5;7=
-@EAS54_67:1:159:222:274
-GTCTGGGGAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCT
-+
-''7*<&<'<<<<.<2<<<<<<<<<<+<<<8<8<<;
-@EAS54_67:1:15:381:715
-GACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTT
-+
-;=====;===9==;===9;;;=4;9=====;====
-@EAS54_67:1:15:381:715
-GGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<97;<<<<<<<<9<<
-@EAS54_67:1:88:54:900
-ATCAACAACAGAAAAATAAAACAAAGGAGGTCATC
-+
-.....&.....,.......................
-@EAS54_67:1:88:54:900
-TGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTCACTG
-+
-============;=================;9===
-@EAS54_67:2:22:471:500
-GTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAA
-+
-=9===0====;=77<==8;====;===========
-@EAS54_67:2:22:471:500
-TACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTA
-+
-=======<=<====:<2===9==;=;9;;=;;;;5
-@EAS54_67:3:114:736:433
-AACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATA
-+
-;<<9<8;<<<<8<8<;<<;;;0<<8;<;<<47;;;
-@EAS54_67:3:114:736:433
-ATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAGTGAGAGAAGG
-+
-<9<9+9;<6<9<<;9<<<<<;<<<99<<<<<<<<<
-@EAS54_67:3:172:196:746
-AAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCT
-+
-<<<;><<+<<<<:<<<<2<;<<<;<<<<<<<<<<<
-@EAS54_67:3:172:196:746
-GCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAA
-+
-<<<<<<<<9<<<<9<<<<<<<<<;<<<<6<<<<;<
-@EAS54_67:3:175:730:949
-TTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAAC
-+
-<<<<;+<<<<7<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_67:3:197:261:624
-GACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCT
-+
-<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<;<<<<<<;<<<9<
-@EAS54_67:3:197:261:624
-GCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAA
-+
-866;2:/;<<<;:<<<;<;;<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_67:3:47:471:858
-ACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCT
-+
-/;9<<63<<<<3<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<
-@EAS54_67:3:47:471:858
-CATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTG
-+
-<<;<<<<<<<<9<<<4;;<<<<;<<<<<.<<4;<4
-@EAS54_67:4:142:943:582
-TTCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTA
-+
-<<<<<<;<<<<<<:<<;<<<<;<<<;<<<:;<<<5
-@EAS54_67:4:145:607:216
-AACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCC
-+
-<<<<<<<<8<<<<<<<<<<4<<<7<:<<1<<;;99
-@EAS54_67:4:145:607:216
-TGAAAAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGA
-+
-/;<<&<<8<<<<<<<<<<<<<;872<<<<<<<<<<
-@EAS54_67:4:7:526:343
-TCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<:<<<5<<<<<<5;<<<+8<;
-@EAS54_67:4:7:526:343
-TGAAAACAGTGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTT
-+
-(7:;;;<<;;;<1<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_67:5:117:33:262
-AATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATAT
-+
-<<;;<<;<:8<7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_67:5:117:33:262
-ACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAA
-+
-<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
-@EAS54_67:5:124:241:608
-CTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAG
-+
-9;;<<;<<<;<<<;<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_67:5:124:241:608
-GGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAAC
-+
-<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;;<<<;<<<<;;8;;:
-@EAS54_67:5:127:828:697
-ATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;<;
-@EAS54_67:5:127:828:697
-TAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTAT
-+
-;<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_67:5:149:639:910
-CAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;;<<;<<;<
-@EAS54_67:5:149:639:910
-TCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGA
-+
-<;49;<<;;<<<<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
-@EAS54_67:5:71:408:741
-AGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
-@EAS54_67:5:71:408:741
-TCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCA
-+
-;7;<;<0<<<<<<<<:;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_67:6:107:395:312
-CAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;<:<<<<
-@EAS54_67:6:107:395:312
-CAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGT
-+
-;<;;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_67:6:109:953:668
-CAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTT
-+
-;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<;<<
-@EAS54_67:6:109:953:668
-CCACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTT
-+
-<:)9<<<<<<<<8:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_67:6:198:503:669
-CAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATA
-+
-5<<:<<;<<<<<<<;;<<9<<<<<<<<;<<<<;<<
-@EAS54_67:6:198:503:669
-CAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTT
-+
-<<<<<<<<<<;8<<<<<;<<<<<<;<;<8<<8<<<
-@EAS54_67:6:43:859:229
-TTCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTA
-+
-+37<=<.;<<7.;77<5<<0<<<;<<<27<<<<<<
-@EAS54_67:6:46:285:790
-AACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCC
-+
-;;<8<;<<<<88<8<<;;<;<<;<<<<<<<<;<<<
-@EAS54_67:6:46:285:790
-TCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACAAAG
-+
-!!<<3<<<;;<<<<<<<<<;<;7<<7<<<<<<;<<
-@EAS54_67:7:101:752:996
-AACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<9<<<<<<;<<;;;;
-@EAS54_67:7:101:752:996
-AAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATT
-+
-<<<<<<<<7<7<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<
-@EAS54_67:7:197:399:319
-CAAAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGA
-+
-&<+==<<5<<<8<89;;<<<<<<8<<<<<<<<<<<
-@EAS54_67:7:197:399:319
-TAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTA
-+
-+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;;<<;
-@EAS54_67:8:19:855:491
-TGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCT
-+
-8<<<<;:<<<<:<<<<<:<;;<<<<<<<;<<<;<;
-@EAS54_67:8:19:855:491
-TGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGT
-+
-<<<<<<<<<<<;<<.:<<<<;;;<4<:<:<7<;;;
-@EAS54_67:8:46:900:610
-GATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGAC
-+
-<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;;4;<
-@EAS54_67:8:46:900:610
-TACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGAT
-+
-<;5<;<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<8<<<<<8<<
-@EAS54_71:2:125:628:79
-GCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGA
-+
-95&<<<<<<<63<<<6<<<<8<;<<8<<<<<<<<
-@EAS54_71:2:125:628:79
-TTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAA
-+
-==================<6<====<<:<==7;::
-@EAS54_71:2:204:264:413
-CAATGAACAACAGAAAGAAAAGTTCTTTCAAAAGG
-+
-1==(4=::;/7::&===;====/=;===;;=====
-@EAS54_71:2:204:264:413
-TGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<;:59<+<<:<<<9<<;:62<)
-@EAS54_71:2:85:686:696
-AATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAA
-+
-==================<=====:==<=<;=:==
-@EAS54_71:2:85:686:696
-TAAACTAAGCATCATAAATGAAGTGGAAATAAAG
-+
-:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:3:186:989:869
-ACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATG
-+
-;<<;:<<<7:<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:3:186:989:869
-GGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;:<<<<<<<<<$<
-@EAS54_71:3:254:32:275
-GATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<:<::<:2*<
-@EAS54_71:3:254:32:275
-TGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAG
-+
-(6+<;+6:9<<:7:<95<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:3:257:288:731
-AAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCA
-+
-<<:<<7<<<<<;<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:3:257:288:731
-TGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATG
-+
-<<<<<<<<8<8<<;<;<<<;<<<5<;;88.8<6<
-@EAS54_71:3:267:821:860
-GCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGA
-+
-$&<<<.<:;6<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:3:267:821:860
-TCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATG
-+
-;<<<<<8<<<<<8<<;<8<<<<<5<;<<<<<2;<5
-@EAS54_71:3:78:855:352
-AAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTT
-+
-2<<<<<<<9<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:3:78:855:352
-AACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTC
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<;<<:<:
-@EAS54_71:4:127:725:381
-AATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;;;;;<<8:
-@EAS54_71:4:127:725:381
-TGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAA
-+
-+<<.<<;<;<<<3;<;<<<<<<6<8;<<<<<<<1
-@EAS54_71:4:13:981:659
-CGGGACAATGGACGAGGTAAACCGCACATTGACAA
-+
-+)---3&&3&--+0)&+3:7777).333:<06<<<
-@EAS54_71:4:13:981:659
-TGTAGCCCCTCTAAGGCGTTCTATTTGTAATGAA
-+
-()&)06636;;<664*6;<<<<<<<<<<<<<<<1
-@EAS54_71:4:14:88:306
-AAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGAC
-+
-<<<<<<8<<<<<<;<<<3<<<8<<;<;;<15<:6
-@EAS54_71:4:14:88:306
-AGAAGAGATTAGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAA
-+
-<1;<;<;<4<&<<<:<<<:<<<<;<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:4:165:397:25
-GCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGA
-+
-<<7<<<<<<)97<6<:3:60:3+37-37+<:33:3
-@EAS54_71:4:165:397:25
-TTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGC
-+
-&(33'60;-'+'<7;<<*3-<;;183<<<;<;<<
-@EAS54_71:4:169:256:888
-AGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;<<;<<:;;<
-@EAS54_71:4:169:256:888
-ATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT
-+
-&<<:<;<<;;<8<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:4:169:862:829
-AAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<;<<<<:<;;<78
-@EAS54_71:4:169:862:829
-GCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTAC
-+
-,1<6<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<
-@EAS54_71:4:206:741:810
-ACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAA
-+
-<3<<;5<<<<<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:4:206:741:810
-CAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:-;<<
-@EAS54_71:4:209:159:130
-CTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGT
-+
-;:6<:<8::;<<<;<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:4:209:159:130
-GCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAG
-+
-<<<<<<8<<<<<<&<<+7<<4<<<22<;<<<<3<
-@EAS54_71:4:233:97:262
-ACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCCCA
-+
-<<<<<<<<<<<;<;<<:<<<<<<<<<<<<.<&77
-@EAS54_71:4:233:97:262
-GTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGA
-+
---;;7<;<;;:;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:4:252:428:683
-TGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCT
-+
-<<<<<<;<<<<<<<<7<<7<<&+<<<<:<&<<<4<
-@EAS54_71:4:284:269:882
-TTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTGCA
-+
-<;<<<<<8<7<8;<<<;<7<<<<<;272;73&&)
-@EAS54_71:4:328:669:662
-GGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+9;<;;.<<<
-@EAS54_71:4:328:669:662
-TCTTCATCCTGTACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCA
-+
-4<<;<<8<.<88.<<;4<<<<<<<4<.<<<<7<<<
-@EAS54_71:4:72:63:435
-CCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<;;39:7:7
-@EAS54_71:4:72:63:435
-TGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGA
-+
-::<;<<<<;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:4:73:182:444
-AACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTCG
-+
-:1<4;;::<<;<<<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<
-@EAS54_71:4:73:182:444
-CTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTT
-+
-<<<<;;<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<:<<<<<7<
-@EAS54_71:5:153:543:671
-GCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<<7
-@EAS54_71:5:153:543:671
-TAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAAT
-+
-;;;;;=;==================;=========
-@EAS54_71:5:16:434:204
-AGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGC
-+
-<:7:<<<<<<<<<<<9<<<+<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:5:16:434:204
-CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGT
-+
-=================;)===8===:==7;<+%;
-@EAS54_71:5:81:685:141
-ACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;<<<',7,7
-@EAS54_71:5:81:685:141
-AGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT
-+
-;+;(;)..=3.1=.7=;=8;==<4====;======
-@EAS54_71:6:172:896:83
-AGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;+;<<<<<<<<9;;;
-@EAS54_71:6:172:896:83
-CATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTA
-+
-;<.5.;;<+;<<<<<<<4<<<<<<<;<<<<<;<<<
-@EAS54_71:6:215:133:909
-TGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<996(
-@EAS54_71:6:215:133:909
-TTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCA
-+
-7758;<;<;8<<<<;<;<<<<<:;<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:6:224:932:942
-CTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGG
-+
-<;<<;;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:6:224:932:942
-GTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<7<<(;3,
-@EAS54_71:6:228:354:203
-AATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTC
-+
-88<<<8<<<<<<<<<8<<<<<<<<<4<<<4/9/;
-@EAS54_71:6:228:354:203
-TCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAA
-+
-%1<851<5<<<982<<<<<<<<::<<<<7<<<<3<
-@EAS54_71:6:264:705:89
-AAACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTC
-+
-<(<2<&<)<<<7<8<<<<<<<<<<.<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:6:264:705:89
-AAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAA
-+
-<<<<<<<<<<;8<<<<<<<<<<<<<<<&<<,;;(
-@EAS54_71:6:324:515:230
-AAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAG
-+
-7<<1<<<7<+<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:6:324:515:230
-CCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGG
-+
-<<;<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<8<<<4<<4<<34
-@EAS54_71:6:82:932:400
-GACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTC
-+
-<<;<<72<<7<<<<<<<<<<;<<<+7<<<<<<<<<
-@EAS54_71:6:82:932:400
-GTAATCTCTCTCCTCTTCGCTGCATCCCTGTCTT
-+
-<<<<<<8<1<<<<8+<<&<<<8<<<<<<<+(,/8
-@EAS54_71:7:130:260:553
-AGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAA
-+
-<*;<<7<);<<;9;<5<*<9<;<<;;<7<<<<<1<
-@EAS54_71:7:130:260:553
-GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGCAC
-+
-<<<<<1<<<<<<<<<<6<<81</<4*2;7:+90(
-@EAS54_71:7:194:867:616
-ATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTATT
-+
-<8<<<<<<<<<<<8<<4<<<<<<8<<3<<5<&(+
-@EAS54_71:7:194:867:616
-TTTTCCACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTT
-+
-38:;;:<:<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:7:212:329:348
-AACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC
-+
-8<6:<:<<<;<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:7:212:329:348
-CCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;;<
-@EAS54_71:7:250:698:842
-AAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAA
-+
-)<<<<<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:7:250:698:842
-AAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<24
-@EAS54_71:7:80:760:490
-CATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATAC
-+
-%::::+<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:7:80:760:490
-CTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAG
-+
-<<<<<<<<<<8<;<7<<<<<<;<;;<2<;<<<1,
-@EAS54_71:7:97:743:602
-AAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<:
-@EAS54_71:7:97:743:602
-ATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATAT
-+
-<(&<:<<&<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:8:105:854:975
-ATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7:<;;;;5
-@EAS54_71:8:105:854:975
-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG
-+
-<<<<;<:<<;<&<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:8:113:856:319
-AAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGT
-+
-<<<77<<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_71:8:113:856:319
-CCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<
-@EAS54_71:8:215:830:609
-AAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGC
-+
-+<)<:<<:<<<<<<<<<9<<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS54_71:8:234:21:950
-TTTTTTTTTTTTCTCCTCTCTTTTTTTTTTTTT
-+
-<<<<<<<<<&<;2;&-<,<+;<<<7<<<;<;<;
-@EAS54_71:8:321:642:388
-TACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGG
-+
-19<<<<<8<<<<<<<<;<<<<<<<<<<7<<<<<
-@EAS54_71:8:321:642:388
-TCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<8;
-@EAS54_71:8:38:856:336
-AATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATT
-+
-<<<<<<<<<<<;;<;<;<:69<<;<5-500373
-@EAS54_71:8:38:856:336
-CACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGG
-+
-2;4;4<:;6:5:<<;:;<<;<<;<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_73:3:203:419:243
-GGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTAT
-+
-;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_73:3:203:419:243
-TTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<9<;<8<<<;<<<;<<<4<77
-@EAS54_73:3:239:796:221
-ATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGCTGACCCCCC
-+
-<<<7<<7<<7<<7<;<<<<<,;;,+'<+/+99%:'
-@EAS54_73:3:239:796:221
-GGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGT
-+
-;;<<;<<;<<<+:<<<4<4<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_73:3:23:502:103
-AGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTT
-+
-<2<<<<<<<<<<.<<<<<<<:1&:<<<7<<<<<<:
-@EAS54_73:3:23:502:103
-GACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTC
-+
-4:386:6<:::<:<:4:+<::4<<<6<<<<<<<66
-@EAS54_73:3:29:833:612
-AAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;<<;;
-@EAS54_73:3:29:833:612
-CAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGT
-+
-<<;<<<;<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_73:3:313:827:992
-AAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTG
-+
-<<<<6<<<<:<<<<<66<<<:33:<<<80<;6<8+
-@EAS54_73:3:313:827:992
-TGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACATAATCC
-+
-'187:1'<75<.*<<:5<..<<*<<917<<7<<17
-@EAS54_73:3:37:761:635
-CCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCT
-+
-<6<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<8<8<<4<4<
-@EAS54_73:3:37:761:635
-TGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGG
-+
-+37:<088<+<<;<<;<<<<<;<<;<<<<<<<<<<
-@EAS54_73:3:4:854:140
-CCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCAC
-+
-:9':<;<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_73:3:4:854:140
-GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAAT
-+
-<<<6<<<:<6<<<:36:<<<<3<<8:.6<38::4<
-@EAS54_73:3:88:24:744
-GTCCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCAT
-+
-4%++88;-9<;<<<+8<<<:<;8:<<<<<<<<<<<
-@EAS54_73:3:88:24:744
-TGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTTGAAGTTTA
-+
-<7*:<<::.'<<<<:<<:<<'<63'6+'303*%%+
-@EAS54_73:5:145:635:390
-TAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<8<<<::;;;
-@EAS54_73:5:145:635:390
-TTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGA
-+
-+9;<<;<<<<<;;;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_73:5:169:714:644
-CCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<
-@EAS54_73:5:169:714:644
-GAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAG
-+
-;<<<<<<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_73:5:220:733:736
-CCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGA
-+
-:;<77;<<9<<<<<9;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_73:5:220:733:736
-TTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<5<<;9
-@EAS54_73:5:231:339:551
-CTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTG
-+
-<;<<;<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<<<;<<<<
-@EAS54_73:5:231:339:551
-TGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGAT
-+
-<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<;5<<46;<;:1
-@EAS54_73:5:255:796:239
-AAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATAGAGAT
-+
-<<3;;<7:<<<;(7<<7;<<;<<<<<<<<<7<<<<
-@EAS54_73:5:255:796:239
-ATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGT
-+
-<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<;6<<<:<:<<
-@EAS54_73:5:263:557:988
-AATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<;<<<
-@EAS54_73:5:263:557:988
-CTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC
-+
-1-41:<15+<<<<<<599<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_73:5:271:874:367
-AAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCT
-+
-<<<<<<5;<<<:<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_73:5:271:874:367
-ATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<4<;<;<:<;4<4<<99<7<+%
-@EAS54_73:5:3:233:911
-GTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_73:5:3:233:911
-TGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<;<<;<
-@EAS54_73:5:44:498:945
-ATAGGGATGGAGGGAAGAGGGCCGCTGAAGAACTT
-+
-<%*50<7<4<<<7<,<<.<8/,9<:</<<<;<;<<
-@EAS54_73:5:44:498:945
-CCTATAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATAT
-+
-;<;<<<<<<<<<<9<;<:<<<<<<:<<<<;:;<3<
-@EAS54_73:5:53:61:31
-AAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGATAA
-+
-<<<7;<7<<<;7<;;<7<7<7<;5<73<<</%;/;
-@EAS54_73:5:53:61:31
-CAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAAT
-+
-5;;<95<<5<<<<<<<<<<:5;<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_73:7:134:243:630
-ACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCA
-+
-63<;37:<*&:<<<,,*<<:7<<7<<<<<<<::<<
-@EAS54_73:7:134:243:630
-TCATCTAGGGGAACAGGGAGGCGCACTAATGAGCT
-+
-<<<:<<<<</<<<-<<<<6/<-<:<5+<::-2</2
-@EAS54_73:7:200:65:291
-CAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACA
-+
-<<<<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<8<<<<:<;<
-@EAS54_73:7:200:65:291
-CTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATA
-+
-;9<;3<<9<7<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_73:7:223:440:667
-AATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATT
-+
-<<;;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_73:7:223:440:667
-TTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<;;
-@EAS54_73:7:254:572:431
-AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<99;;;;;
-@EAS54_73:7:254:572:431
-ATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAA
-+
-<63<;<;<<<:7<:<7;<:<<<<:<<<<7<<<<:<
-@EAS54_73:7:63:854:610
-AATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGT
-+
-:.5;2<:88<<72:<<;<<7<8;<;/<<<<<<<<<
-@EAS54_73:7:63:854:610
-GACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<
-@EAS54_73:7:97:892:419
-AATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_73:7:97:892:419
-GCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAAC
-+
-;8<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_81:2:128:394:455
-GTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTC
-+
-;=;9.=5=;=9====;;==================
-@EAS54_81:2:128:394:455
-TTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTT
-+
-======6==========;===9==;5===;==;==
-@EAS54_81:2:27:856:401
-ACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCC
-+
-======6===;2==;===;=+=92=;5+=&556:6
-@EAS54_81:2:27:856:401
-TCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCT
-+
-.'=.93======;;====;======;===;=;===
-@EAS54_81:2:280:512:316
-GGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTG
-+
-;9===;======;7==;;======;=====;====
-@EAS54_81:2:280:512:316
-TTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGCT
-+
-==<========6==4==6;;==:===;=2/:+8%6
-@EAS54_81:2:285:367:932
-ATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGG
-+
-===========;======;=====;=======5==
-@EAS54_81:2:285:367:932
-GCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGT
-+
-9=5==;=;7===;==;===================
-@EAS54_81:2:317:72:221
-AAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATAC
-+
-=========:======;==;===============
-@EAS54_81:2:317:72:221
-ATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTC
-+
-===========;=======;;:==6=;=====;==
-@EAS54_81:2:31:98:804
-CACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGC
-+
-=======9===;============5=;9=;=;==&
-@EAS54_81:2:31:98:804
-CTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAG
-+
-====;========7=====================
-@EAS54_81:2:49:330:699
-AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA
-+
-===/=;========;=;==================
-@EAS54_81:2:49:330:699
-TTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAA
-+
-==;=================;======5;;;==5=
-@EAS54_81:2:5:491:391
-CCCTGCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTA
-+
--/+5-.&&:5+:92=6===========9=======
-@EAS54_81:2:5:491:391
-TTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTC
-+
-=========;===;==:4=========;3;==7;=
-@EAS54_81:6:11:801:386
-AAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGA
-+
-<<<<<<<<<<8<<<<<:4<::<854:5<:::;4+4
-@EAS54_81:6:11:801:386
-CACTATAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGG
-+
-5<2:$6<<<38<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_81:6:122:589:134
-AAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAA
-+
-;<;4<<538<<;<<;<<<<';,:<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_81:6:122:589:134
-ACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTAT
-+
-<<:<<:<:<<<<<:<8<<<<<<<:<::<<<4:<;;
-@EAS54_81:6:199:511:426
-AATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:<<<<<<<<<;:<;
-@EAS54_81:6:199:511:426
-GGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAA
-+
-<:7:<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_81:6:204:779:181
-AACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATG
-+
-<<<<<<5<<:<<<<<8<<,<<<<<<<<<<91<91<
-@EAS54_81:6:204:779:181
-CTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGC
-+
-;:;/*<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_81:6:265:251:147
-AAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATT
-+
-<<<<::<8<<<;<;8<8<<<<<<<<:<<<<<<<<<
-@EAS54_81:6:265:251:147
-TGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<88<<<80:;<<<<<;:4;;:4
-@EAS54_81:6:273:424:207
-AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA
-+
-<,<,<9<<9<<<<<<<<<<79<,599,<191<99+
-@EAS54_81:6:273:424:207
-TAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTC
-+
-;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_81:6:35:186:412
-ATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACAC
-+
-<<<<<<<<4<<<<<:<<<<<<:<<<<<<<<<;;<:
-@EAS54_81:6:35:186:412
-CATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTA
-+
-<<4:6<;<&<:4<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_81:6:75:917:886
-ACTGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<71<<<:6<:8<
-@EAS54_81:6:75:917:886
-TTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTC
-+
-<<<<8<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_81:7:124:253:889
-CTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAG
-+
-8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<
-@EAS54_81:7:124:253:889
-TCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGG
-+
-<<<<<<6<<:<<<<<<<<<<<<<;;<<;<<<<<<<
-@EAS54_81:7:166:979:531
-ATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTTGGGAGAT
-+
-81<<<3<*<<:<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<:<<<
-@EAS54_81:7:166:979:531
-TGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCC
-+
-<<</<<<<<<<<<9<<9<<;<7<<<<9<<<9<,)6
-@EAS54_81:7:226:869:36
-ATATATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGG
-+
-<0/)</<<<:<<<<<)<<7<<<<<+55<<1<<<:<
-@EAS54_81:7:226:869:36
-TGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTG
-+
-:<<<<,:<;:.:<<:<<717,;2171717717116
-@EAS54_81:7:246:205:734
-CTCCAGGGAAGTTATCTCTCATCTAGANNNNNTTG
-+
-<<<<<<:/<<<,6'</7;<-+9<<;<7!!!!!8<,
-@EAS54_81:7:246:205:734
-CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGT
-+
-<<<4<<6666<<6<:<<<3<<<:'<<:<<<<;6<+
-@EAS54_81:7:293:355:321
-GCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTC
-+
-<<<:<;<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<;4<<<:+:<
-@EAS54_81:7:293:355:321
-TTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGG
-+
-<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_81:7:324:472:791
-AAAGCCAATACTTTACTGCTACTCAATATATCCAT
-+
-<<.)5*&;;11<<<,5<33:-<<6<<<<:<<<<<<
-@EAS54_81:7:324:472:791
-TGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACC
-+
-<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<:3
-@EAS54_81:7:325:150:465
-AACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATG
-+
-<<:<<<<<<<<;<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_81:7:325:150:465
-TGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<3;;:
-@EAS54_81:7:74:596:137
-CTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCT
-+
-<<<<<<<<<</4<<<<<<*<:6<<<<<<<<;/3<<
-@EAS54_81:7:74:596:137
-GGTCCCTGCCCCATCGCTTGTAATCTCTCGCCTTT
-+
-+40778449779049'+*87489498949%89948
-@EAS54_81:8:130:912:658
-TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC
-+
-<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;;<
-@EAS54_81:8:130:912:658
-TCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATC
-+
-;=;;;<<<<<=55=;==<=======<=========
-@EAS54_81:8:142:858:903
-ATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATTAGGA
-+
-======;====5=======9======;===3=5=;
-@EAS54_81:8:142:858:903
-CTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTC
-+
-<<<<<;<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_81:8:14:360:580
-ACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCGG
-+
-===========3===;5<==8;====79==.=5'5
-@EAS54_81:8:14:360:580
-ATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACT
-+
-<,1<;<;;<<<<<1<<<;<7<<6<:;;<<<<<<;;
-@EAS54_81:8:159:71:155
-AAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCGAT
-+
-5;;9<<:<;:<<<<7<<7;<3<<<:<<<;<<<<<;
-@EAS54_81:8:159:71:155
-GTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAA
-+
-=========;=<======;=:=3;==;=6<==;=;
-@EAS54_81:8:177:800:714
-CTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<;<<<<<;<
-@EAS54_81:8:177:800:714
-TTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTG
-+
-=;3=+=<:=<========8================
-@EAS54_81:8:271:180:509
-AATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACAA
-+
-=============================='====
-@EAS54_81:8:271:180:509
-ATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAAC
-+
-<<<<<<<<<9<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS54_81:8:40:925:442
-GAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAAT
-+
-;<;<<<<<<<<<<<3;<7;:<;;<<<;<<:<32<<
-@EAS54_81:8:40:925:442
-TTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCT
-+
-=;=================================
-@EAS54_81:8:41:530:663
-AGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCT
-+
-=8=;*=5==;;=====:=====;===;========
-@EAS54_81:8:41:530:663
-ATACTCACCATCATAAATACACACAAAATTACAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;;;;<<
-@EAS54_81:8:63:930:152
-ACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATTC
-+
-<<<<;<<<<<<<7<<;::<<)726;)<99<)&;&+
-@EAS54_81:8:63:930:152
-ATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTTGGGAGAT
-+
-;:4:8;:::;=:8;=;========;=:========
-@EAS54_81:8:78:735:536
-TTTTTTTTTTTTTCATTTCTCTTTTTTTTTTTTTT
-+
-;9<<<<<<<.7<9'%1<<)2::<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_53:1:124:243:35
-GCATATCCAGATTGCTGGTGGTCTGACAGGCAGCA
-+
-&+<+;<694;+&99<<2<;423<26<-<<<<,<3<
-@EAS56_53:1:124:243:35
-TGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGCGA
-+
-<<<<<;;<<<<<<:<<<.<<<:++5+:1(;1;$<(
-@EAS56_53:1:154:118:488
-AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:7<<<<7<:;;::
-@EAS56_53:1:154:118:488
-AAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGA
-+
-<<<;58<<95:<<;<;<<<;<<<;;<<<<<<<<<<
-@EAS56_53:1:23:403:981
-TACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATG
-+
-<8<<<;<<<<<<;<<<<<<8;<<<9<9,3;,6(91
-@EAS56_53:1:23:403:981
-TCTTCATAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTG
-+
-(;3+<&3<</7<<<<<<;<<<<<<<<<<<<</<2<
-@EAS56_53:1:47:303:887
-ACATTACTACCCTGCCATTAATATACTTGTGTCCA
-+
-<<;;<+<9<<<<<9<(6<;//</<8(<<89;6084
-@EAS56_53:1:47:303:887
-CACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGA
-+
-<;<6<;<;<8<<<8<<<<;<<<.<<<<<<<8<8;<
-@EAS56_53:1:92:875:345
-AAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAA
-+
-<<<;<.;7<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS56_53:1:92:875:345
-CGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_53:2:170:265:818
-GAGGGGAAGCTTTCAACGCTTCTAGCACTTTCTTT
-+
-<<<<<(5/959<8.<9<8<<<2<&59&&:22:8+(
-@EAS56_53:2:170:265:818
-TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG
-+
-3+;%;.;;<<9+;3;;;<<<;57<1<;<<<<<<<;
-@EAS56_53:2:59:286:290
-AAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTC
-+
-<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<;;;<<;7;<
-@EAS56_53:2:59:286:290
-TCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAAT
-+
-77<<<<7<<<97<<,7<<<;<<<;<9<<<<<<<<<
-@EAS56_53:3:101:809:776
-GTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAAC
-+
-<<<-<;7;<<<<:;<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_53:3:101:809:776
-TATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<
-@EAS56_53:3:107:738:484
-GGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCA
-+
-.8/<<<7<8<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<
-@EAS56_53:3:107:738:484
-TGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<
-@EAS56_53:3:126:558:408
-TTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<7<;<<;;
-@EAS56_53:3:126:558:408
-TTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCT
-+
-<:<<:;;<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_53:3:134:126:465
-AAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<5<<:<<41
-@EAS56_53:3:134:126:465
-AAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAA
-+
-<<;:&<3)<<7<:<<<<.:<<<<<8<<<<<<<<<<
-@EAS56_53:4:130:568:978
-TAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGAC
-+
-7<<;<<;<7<:;<7<<<<<<<<);4;+<7+3+%;<
-@EAS56_53:4:130:568:978
-TGAAACGCGAAACTGCACTCTCATTCACTCCAGCT
-+
---;066;;62<<<2&<+<+<2;<<2<<<;<<<7<<
-@EAS56_53:4:153:977:200
-TCATCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTA
-+
-1:<83<<9;;9<<9;;<<;<<;;;;<;;<<<<<<;
-@EAS56_53:4:153:977:200
-TGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGG
-+
-;<<;<<<<7<<;;;;;<<6<<<<<86;;8<;8;6;
-@EAS56_53:4:154:762:630
-AGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;
-@EAS56_53:4:154:762:630
-CCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAG
-+
-<<-::<91<<<<;<;<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<
-@EAS56_53:4:168:528:288
-CAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<;<<;
-@EAS56_53:4:168:528:288
-GCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCC
-+
-8<%<31;<<;<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<
-@EAS56_53:4:45:707:147
-AAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAG
-+
-<<<<<<;3<<<<<4;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_53:4:45:707:147
-ATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<&<<<<:<<9<<<9<<<<75;;;<
-@EAS56_53:6:180:695:621
-ATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;::<<<
-@EAS56_53:6:180:695:621
-TACTGAAAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCA
-+
-;&377<&<<;7<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_53:7:22:22:934
-ATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAA
-+
-<+72::72<<60<<<<<<<96<<<<0<<<<1<<<<
-@EAS56_53:7:22:22:934
-CTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTG
-+
-<<<<<<<<<<<6<<<;<<<;84;<<48;<;6;<;)
-@EAS56_53:8:122:430:882
-CCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;
-@EAS56_53:8:122:430:882
-CTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAA
-+
-0<<:<<<<<<<:3<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_53:8:179:549:753
-TACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<7<<<:<9<<
-@EAS56_53:8:179:549:753
-TGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTC
-+
-:77<</<<<::<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_53:8:28:701:724
-TGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGAT
-+
-.;..3;8.8<8;<<;9<9<<<7;<<<<<<<<7<<7
-@EAS56_53:8:28:701:724
-TTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGG
-+
-<<<<<<7<<<<<<7::<:<<-<<::::::<747::
-@EAS56_57:1:122:38:103
-ATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<3<<<<9<8;<
-@EAS56_57:1:122:38:103
-GAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTAC
-+
-===;3<===:=======<=================
-@EAS56_57:1:125:884:276
-TTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATC
-+
-<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;
-@EAS56_57:1:125:884:276
-TTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAAC
-+
-,;;3,<7<;7<<===;============;======
-@EAS56_57:1:189:130:136
-ATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATG
-+
-==<<=================<<====<<=;=6==
-@EAS56_57:1:189:130:136
-GGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGA
-+
-823;23<7<57<7<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:1:189:503:110
-ATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGA
-+
-=;;6:==============================
-@EAS56_57:1:189:503:110
-CTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<
-@EAS56_57:1:228:182:717
-GGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCCCCATG
-+
-<=9============5==5=<,59<=1=<&;&;;7
-@EAS56_57:1:228:182:717
-TCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAA
-+
-778;8;474<<<;2;;<2<<<<<<<<;<;;9<<<<
-@EAS56_57:1:278:440:902
-AAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACA
-+
-=========<==<==============:;;=;=;;
-@EAS56_57:1:278:440:902
-ATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGC
-+
-<;7;4<;<;;;<<;<;;;<<<<<9<<<;<<<<;<<
-@EAS56_57:1:288:384:444
-TAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACT
-+
-;=9;;<====<=;=/=9;<========<=======
-@EAS56_57:1:288:384:444
-TCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;
-@EAS56_57:2:158:909:321
-ATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:2:158:909:321
-TTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
-@EAS56_57:2:178:192:499
-GTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGT
-+
-<<<<<<<;<1<<<<<<;<<;6<<3666;;;;;/6/
-@EAS56_57:2:178:192:499
-TCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCC
-+
-86<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:2:206:873:186
-ACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;53
-@EAS56_57:2:206:873:186
-GTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTG
-+
-;<<;--7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:2:236:841:20
-AAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<:<<9<<<<;<:<9
-@EAS56_57:2:236:841:20
-GCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTAT
-+
-7;<<<;<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<
-@EAS56_57:2:237:855:581
-CTAAACGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATC
-+
-/+<<<&)2;66;/;;+<;;3133<3<3;9;<999<
-@EAS56_57:2:237:855:581
-TACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATA
-+
-<;4<7<<<;47<<74<:*<<2:<<7.799:2<<9:
-@EAS56_57:2:23:268:529
-TGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATT
-+
-7;<<<<<<57;-<<<<<<:<77<<<<<<<;<;<<<
-@EAS56_57:2:259:42:969
-GCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCC
-+
-<<<<<;<<;<<3<<<;9<36<<29;<<;;;</;<2
-@EAS56_57:2:259:42:969
-GGAAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCA
-+
-<<<6<<<<<<-<<<<<<;<<;<6<<<<<<<;<<<<
-@EAS56_57:2:262:297:601
-TGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTC
-+
-<<<<;<<9<<57<<7<<<;<<;77-;;53<<;;<7
-@EAS56_57:2:262:297:601
-TGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTAG
-+
-;;<26;;;<;<7;<<<<<99<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:2:284:597:682
-AAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCT
-+
-<<<<<<<<9;;7<;:<<<:<;<<<<<<<<;<<<<;
-@EAS56_57:2:284:597:682
-TTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAG
-+
-<<<<<<<9<<<<<;<<6<<<<<;<9<<<<<<1;;9
-@EAS56_57:2:44:153:969
-AAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAA
-+
-*:::7<77<:<<<<:<<(597:<:<9//7<529/0
-@EAS56_57:2:44:153:969
-AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATC
-+
-<<5<:7<72<51<7<*79<<<<<5<<<<<<<<<2<
-@EAS56_57:3:112:729:591
-ATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTT
-+
-;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:3:112:729:591
-GAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:3:119:761:239
-CGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATC
-+
-<<<<<<<<<<<<6<<<<<<;<2<<<<;<<<<<;;<
-@EAS56_57:3:119:761:239
-TGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAAT
-+
-;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:3:285:489:327
-AATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<
-@EAS56_57:3:285:489:327
-CTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAA
-+
-9;;<<8<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;<
-@EAS56_57:3:319:174:811
-CACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATG
-+
-;7;3<<3.<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<0<
-@EAS56_57:3:319:174:811
-TTATCTGCACATTTCTACCCTGCAATTAATATAAT
-+
-<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;;<<<<<<<8<<;9<<
-@EAS56_57:3:41:739:907
-CAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAA
-+
-;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:3:41:739:907
-GAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<9<<<;;;;;
-@EAS56_57:3:81:786:340
-TACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCA
-+
-;<;<<<;<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:3:81:786:340
-TCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGAGAGGTGCACT
-+
-<<<<7<<<<<<<<<<<<<<7<<;<&<<;;7<7;;;
-@EAS56_57:4:233:478:792
-GCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACA
-+
-6<;9:<<9-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:4:233:478:792
-GTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+<<<<<<<9<<<+;;;
-@EAS56_57:4:262:965:756
-AGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<9;<
-@EAS56_57:4:262:965:756
-TTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCT
-+
-<<:<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:4:71:707:568
-CTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<;<;<
-@EAS56_57:4:71:707:568
-GTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGAT
-+
-;9;<;<<<<<;<<<<<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:4:98:862:154
-AAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<:99<;
-@EAS56_57:4:98:862:154
-TGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCT
-+
-856:;7<:<<9<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:5:105:521:563
-TATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAA
-+
-;<)<9995<9<<59<7<<<<7<7<35,0,544<3(
-@EAS56_57:5:105:521:563
-TGTAATGCTGCCCCTTGGCCATCCCCCGGTCCCTG
-+
-/8)-8/6(98<967<3<<979<<1<<<7<<<<7<<
-@EAS56_57:5:136:389:320
-TCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCC
-+
-.5:,666<)<8<:<<:66<<<<<<<<<<5<<7<<<
-@EAS56_57:5:136:389:320
-TTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACAT
-+
-7<<<<<;<<7<6<<;;<;<;;677<6;(27;<(97
-@EAS56_57:5:145:383:182
-AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT
-+
-<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:5:145:383:182
-TTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;;<;
-@EAS56_57:5:207:926:427
-GGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTG
-+
-;;7<<;4<<<2<<;<<<<<<<<<<7<;<<<<<<<<
-@EAS56_57:5:207:926:427
-TAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGAC
-+
-<<<<<<7<<<<<;<<<<<6:<;<6<&<58<<6:::
-@EAS56_57:5:214:644:390
-AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;
-@EAS56_57:5:214:644:390
-AAATAAAACAAAGGAGGTCATGATACAATGATAAA
-+
-<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<&<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:5:24:284:360
-AGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<9;<;99;;
-@EAS56_57:5:24:284:360
-CTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAA
-+
-:;<;:<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<
-@EAS56_57:5:266:133:789
-AAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
-@EAS56_57:5:266:133:789
-GTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAA
-+
-9;;<<<<<<<<<<<<5<<;<5<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:5:303:542:924
-AATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAA
-+
-<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;
-@EAS56_57:5:303:542:924
-CAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAA
-+
-+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:5:309:109:987
-AACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAAT
-+
-<<<<<<:<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:5:309:109:987
-GAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<;<;;;
-@EAS56_57:5:30:788:376
-ACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<:<;<<(<7;7;:(;
-@EAS56_57:5:30:788:376
-TGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAA
-+
-:5<<4:88;9<<<<<;<<<<;<8<;<<<<1<<<<<
-@EAS56_57:5:324:728:956
-ATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGT
-+
-<;;;;5;<<0<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS56_57:5:324:728:956
-TGCTGGCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<:<::;;;;<:<
-@EAS56_57:5:53:544:889
-AGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGA
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<
-@EAS56_57:5:53:544:889
-GCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGAT
-+
-,<;<<<;<<<<<<<<<:;;<<<<<;;<<<<<<<<<
-@EAS56_57:5:71:994:576
-AAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<5<<<<<<<<
-@EAS56_57:5:71:994:576
-TAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAAC
-+
-<<9;;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:6:145:144:796
-ATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<4;4;<;/
-@EAS56_57:6:145:144:796
-GGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGAC
-+
-;<<<;<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:6:157:643:175
-GGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGA
-+
-;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:6:157:643:175
-TTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTC
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<)<<<<;<
-@EAS56_57:6:175:289:351
-CATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGAC
-+
-<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<9<<<
-@EAS56_57:6:175:289:351
-TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAA
-+
-9;;:+<<<<<;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:6:190:289:82
-AGGGGTGCAGAGCCGAGTCACGGGGTTGCCAGCAC
-+
-<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<;<<<<;8<6;9;;2;
-@EAS56_57:6:190:289:82
-CTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACAAA
-+
-<<<7<<<;<<<<<<<<8;;<7;4<;<;;;;;94<;
-@EAS56_57:6:21:553:57
-AAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTAC
-+
-<<<<<<<<<<<;;<<<;<<;<<;<<<;;9<;<;<9
-@EAS56_57:6:21:553:57
-AACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAA
-+
-<<+<<<<<<<<<;<<<<8<<<<<<8<<<<<;<<<<
-@EAS56_57:6:234:787:12
-AAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCAC
-+
-;;.<;;994<;9<<;;;<<<<<<<7<<<<<<<<<;
-@EAS56_57:6:234:787:12
-ACACGCTGGCCTATGTACTTATAATGACTCTATCC
-+
-<;<<<9<<&+9;3;<993;<9<+94;9&41;08%9
-@EAS56_57:6:325:759:288
-GCTGCTGGCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCT
-+
-8<;<<<<81<<<<<;<<;<<<;9</;6;;809034
-@EAS56_57:6:325:759:288
-GGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTAC
-+
-9;<9<;<;;<;<;<;<<<:<;<<<;<<<<<;<<<<
-@EAS56_57:6:44:280:641
-AACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAA
-+
-;<<<<<<<<<<66<;<<<<<;<<2;;;<<;;;;,;
-@EAS56_57:6:44:280:641
-TCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCT
-+
-9;<<9;9;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:6:4:223:776
-AGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<:;<;2<
-@EAS56_57:6:4:223:776
-TGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGG
-+
-<;9<;<0<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:7:159:125:297
-GCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCACTCTAAGAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<;<<6;)<:9;26;39
-@EAS56_57:7:159:125:297
-GGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTA
-+
-89<;;8<<;<;<4<;<8<<<<;;8<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:7:247:522:670
-CTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTC
-+
-;;;9;:<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:7:247:522:670
-TACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<5;<<<;
-@EAS56_57:7:273:562:954
-AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA
-+
-;<<+;95<<<;5;<<;:<<;<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:7:273:562:954
-TTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;:;;;;
-@EAS56_57:7:287:258:321
-TAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCT
-+
-<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<42:<+<<<;<<;;;;
-@EAS56_57:7:287:258:321
-TGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCAT
-+
-:.<9<)<;<9<.<<:<:+5:<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:7:33:954:724
-CCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAA
-+
-;<;<;<<-7;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
-@EAS56_57:7:33:954:724
-TCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAA
-+
-;<<<<<<<<<<<<<8<<<<:<;;<<;;<;<<;;;;
-@EAS56_57:7:57:826:977
-ATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<+<<<<<<<<6<9:6<<<<<
-@EAS56_57:7:57:826:977
-TGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTT
-+
-875:6<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;8<<<<<<
-@EAS56_57:7:76:786:458
-GGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTAC
-+
-<<.<<<<2<<:84<:<<<:<8<<)<)429<2<<8<
-@EAS56_57:7:76:786:458
-TCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATT
-+
-;<;:7<.<<<<<8;<<<<<<<6<;8<<<<<<<<<<
-@EAS56_57:8:72:44:435
-AAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTA
-+
-<<<<;7;<<<<;<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<
-@EAS56_57:8:72:44:435
-ATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTAA
-+
-<<<<<<<<<<<2;<;<<;<<<;<<8<82<;22<8&
-@EAS56_59:1:126:526:276
-GAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<
-@EAS56_59:1:128:584:952
-ATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<+<;<<<<<<;<<<;<<<+<66
-@EAS56_59:1:128:584:952
-GCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTA
-+
-7<;9;0:<<<:<<:<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:1:219:294:861
-CTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCC
-+
-;,;<;<<<;&<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:1:219:294:861
-TATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTCTGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<9<<<5<9<<<9<<544<<'<+:
-@EAS56_59:1:248:122:558
-AATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAG
-+
-<<<<:<<<<<<<<<<<<<;<<<<:<6:4<<::6:6
-@EAS56_59:1:248:122:558
-GGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGA
-+
-<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:1:278:906:933
-AATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTAT
-+
-<88::<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:1:278:906:933
-TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<.
-@EAS56_59:1:82:670:302
-AGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5
-@EAS56_59:1:82:670:302
-TCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTA
-+
-%448<7<<<<<<7<<<<<&<<7<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:1:93:490:901
-AGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCA
-+
-<<<<<<<;<<<;<<<;<<;<<;<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:1:93:490:901
-GTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<:<<1+4-8
-@EAS56_59:2:104:402:732
-AAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAA
-+
-=========================7=;===;=:=
-@EAS56_59:2:104:402:732
-AATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:2:162:272:415
-ACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<9;<<<<<
-@EAS56_59:2:162:272:415
-ATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCAT
-+
-=7=======;5==<<6==1==<=============
-@EAS56_59:2:177:266:842
-ACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGT
-+
-=====)===========8=====7882855355'5
-@EAS56_59:2:177:266:842
-GGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTC
-+
-<9<<6;9<;9;;<<<<;;;9<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:2:177:552:234
-ACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCA
-+
-::;:=;=99=====;;====;==========<===
-@EAS56_59:2:177:552:234
-GCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<9<969<<<<3<<<
-@EAS56_59:2:201:768:529
-AGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTT
-+
-==========================1=======;
-@EAS56_59:2:201:768:529
-CAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATT
-+
-3<:<9<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:2:239:1001:406
-AGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGA
-+
-<<<<<<7<<<<<<<<8<;<<<7<<<<36<<3<:33
-@EAS56_59:2:239:1001:406
-CTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCA
-+
-0':.71;;:9==9=;====;=;=============
-@EAS56_59:2:60:677:921
-CATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAA
-+
-========9==;======8==>=============
-@EAS56_59:2:60:677:921
-GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:3:149:953:349
-AGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTG
-+
-2;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:3:149:953:349
-TTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAAT
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;7:<:<<:<:;;::;
-@EAS56_59:3:166:626:836
-AGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAAT
-+
-<;;7<<<<<<;<7;<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<+
-@EAS56_59:3:166:626:836
-CTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<;<;;;9
-@EAS56_59:3:182:1002:639
-AAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAG
-+
-<<;;9;9<<<<<<;<7;<;<<<<;;<<<;<<7;<<
-@EAS56_59:3:182:1002:639
-AACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9-<<<<4<;<;;<;
-@EAS56_59:3:316:25:230
-GATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCTGCCCCAT
-+
-8;8;<<;<;;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:3:316:25:230
-TGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<);2;;
-@EAS56_59:4:119:651:88
-GATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAA
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:4:119:651:88
-GCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;<
-@EAS56_59:4:262:928:237
-TGAGTTCAGGTAAAGGTGTGGAAAAAGATGTTCTA
-+
-;<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:4:262:928:237
-TTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<
-@EAS56_59:4:267:394:437
-AAACATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCA
-+
-&<&,<8.<;<<<;<8<8<7<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:4:267:394:437
-GGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACG
-+
-<<<<<<<<<<;<;<<<<<;;<<<<<;<<:;8<;<8
-@EAS56_59:4:278:524:521
-CACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACT
-+
-<<<;<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<7;5;<<<;;<
-@EAS56_59:4:278:524:521
-CCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAA
-+
-7777,<;<<7<<<<;;<<;;<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:4:329:577:757
-AACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCC
-+
-;;;888;<<<<<<6<<<2;<<<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS56_59:4:329:577:757
-TCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACAAAG
-+
-!!<<<<9;<:<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:5:113:694:725
-CTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCT
-+
-;::<<:<:<<<<<<<<<<:<:<<<<<<;<<<<<<<
-@EAS56_59:5:113:694:725
-GTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<9<<<<<:<<<<<<<<<<:;;<;;
-@EAS56_59:5:125:137:58
-AACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAA
-+
-<<9;<<<<<;<;<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:5:125:137:58
-GGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<9;<
-@EAS56_59:5:181:713:140
-AGGGGAAATAAAGTCAAGTATTTCCTGACAAGCAA
-+
-<7<<<<<<<<<<<<7<7<6+<<<5;<;<2<;;+;;
-@EAS56_59:5:181:713:140
-CTACAGAGCAACAAGGTAAAAAATTAACATTACAA
-+
-78<+<7<-7;;;&<5<7<<<<7<<<<<<<<<<<7<
-@EAS56_59:5:198:929:684
-AAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGA
-+
-<<;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<
-@EAS56_59:5:198:929:684
-GAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCA
-+
-<7<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<:<<<<::<:7
-@EAS56_59:5:232:336:46
-ATTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTGTTTCTTTTTTT
-+
-+<<<<<<<<<<<<6<<<<;<6<<&&<,3<<<<3,,
-@EAS56_59:5:325:544:349
-AAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACA
-+
-<<<<57<<<7<;6<<<<;<7<7;<<7<<<<<<<<<
-@EAS56_59:5:325:544:349
-CAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6;;;<<
-@EAS56_59:5:90:629:652
-AGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<;<<<<<<<<<
-@EAS56_59:5:90:629:652
-ATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCCACTT
-+
-<:<7::<:<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<
-@EAS56_59:6:187:925:547
-GGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCAAGATACCAT
-+
-43<<<:9<;;;:7<<<<6<:<8<-4-/,81<(48:
-@EAS56_59:6:187:925:547
-TGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGG
-+
-((988+&8<<;<09<;<<9<<4<<-<99<<;<9<;
-@EAS56_59:6:199:327:965
-ATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCT
-+
-<5<:<<<58<:<<<<<<8<<<<<<<<<;<<<<<<<
-@EAS56_59:6:199:327:965
-NCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAAT
-+
-!,+*+++++++++++*+++++++**)+*+**+(**
-@EAS56_59:6:227:657:95
-GTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<8<85
-@EAS56_59:6:227:657:95
-GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAAT
-+
-;3;<);<<<<<<<<<<<<18<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:6:286:753:854
-TCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTC
-+
-;<2<<<,57:<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:6:286:753:854
-TTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<<<<<9999<;<<9;
-@EAS56_59:6:312:837:406
-AGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:6:312:837:406
-CTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTG
-+
-;<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:6:3:186:68
-AAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATT
-+
-<<;<<<<<&:,<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:6:3:186:68
-TTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGTA
-+
-<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;;<<<<<&%8
-@EAS56_59:6:89:457:591
-ATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGG
-+
-<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<8<7/4<<<<4+
-@EAS56_59:6:89:457:591
-CAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACATAG
-+
-797<<9<<<<<<<3<7<<<<<<<<<<)<<<<<07<
-@EAS56_59:7:260:985:520
-TCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATT
-+
-;9;7<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:7:260:985:520
-TGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;:;<<;<:<<<,:1;)<;
-@EAS56_59:7:318:679:883
-GATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAAT
-+
-<<;4<<;<:<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:7:319:246:304
-CTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;:
-@EAS56_59:7:319:246:304
-TGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGG
-+
-;;<;;;<<<<8;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;<<
-@EAS56_59:7:82:902:868
-CTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTG
-+
-<<;;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:7:82:902:868
-TTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCA
-+
-<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:8:49:182:192
-ACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAAC
-+
-<5<;<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_59:8:49:182:192
-GTTATGCCCTGCTAAACTGAGCATCATAAATGAAG
-+
-=====================;============<
-@EAS56_59:8:80:542:549
-AGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAA
-+
-=9====7=;=======;;==;========<=====
-@EAS56_59:8:80:542:549
-CTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATC
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<:<<<<-<;;<;7<;3;9;
-@EAS56_61:1:119:880:781
-ACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAA
-+
-;8<<;<<<<:<84<<<<:<<<<<<<<<<<<<5<<<
-@EAS56_61:1:119:880:781
-ACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+<<<<7<<<<<
-@EAS56_61:1:210:880:606
-GGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:<<<<3<<8&
-@EAS56_61:1:210:880:606
-TCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCA
-+
-.<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_61:1:303:184:14
-CAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCA
-+
-<<<<<<8<0<<<<-<-98<<--<<<6;076;75+&
-@EAS56_61:1:303:184:14
-CAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTC
-+
-:<<.<;;7<:<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_61:2:152:860:286
-AGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTAT
-+
-<;<<<;<<0:<3<:<<2<<<<<7+<7+47<9(999
-@EAS56_61:2:152:860:286
-TTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCA
-+
-2;5;8<<;5<<<;<2<8<<<<<<;8<;<<<<;<<<
-@EAS56_61:3:140:522:212
-CGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;<;95;
-@EAS56_61:3:140:522:212
-GACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAA
-+
-:;8;:::<<:<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_61:3:165:665:220
-ACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAA
-+
-<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_61:3:165:665:220
-GGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;<<<;;<;<<;
-@EAS56_61:3:208:118:673
-AAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA
-+
-<<<<<;;<;<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_61:3:208:118:673
-GAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATGTAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;;
-@EAS56_61:3:260:827:289
-AAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAA
-+
-<<<<2<<<<;<<<<;<<<<<<:<<<&-<8<<88<3
-@EAS56_61:3:260:827:289
-TGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGA
-+
-6;99+<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<7<<<<<<<<<
-@EAS56_61:3:45:758:616
-ATAAATTGTTTTCCACTTTGGAAAACAATTTGGTA
-+
-<<;<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_61:3:45:758:616
-CATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<;;<
-@EAS56_61:3:5:45:441
-TTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
-+
-;;58:<:<(:<<11<&<1<<;<<<<><<<<<<<<<
-@EAS56_61:4:262:456:74
-TACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;:;7:<::7<7:3
-@EAS56_61:4:262:456:74
-TGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCT
-+
-862;<<<:;<;<<<;;;<<<<;;<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_61:5:194:470:416
-AAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTT
-+
-<<<7<<;<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_61:5:194:470:416
-TCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<
-@EAS56_61:5:209:824:866
-ATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
-@EAS56_61:5:209:824:866
-CAGCAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTG
-+
-;<:&<<:<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_61:5:263:314:696
-AACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<:<<;<775
-@EAS56_61:5:263:314:696
-AAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTAC
-+
-<<;<;:<<<<7<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_61:5:272:240:950
-CAGCAGAGCTTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTCA
-+
-6<<&:<<<&<::;&7<<<3<;<<;<:;:<8:<<(<
-@EAS56_61:5:272:240:950
-TCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAA
-+
-37<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;<<<<<<;
-@EAS56_61:6:10:106:737
-ACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGT
-+
-<<<;<1<;<<<<<<9<<<<;;<<<<<99<<94008
-@EAS56_61:6:10:106:737
-ACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATAT
-+
-<-<<;<<<<<<<<<<<;<<<<;<<;<<<<<<<<<<
-@EAS56_61:6:160:272:398
-AATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCA
-+
-9<<<3<<<<<<<<<<<9<<;8<<<<;<+.;;89..
-@EAS56_61:6:160:272:398
-GTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCA
-+
-3:,<,;;<<;<<1<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_61:6:226:370:91
-AGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACA
-+
-<':<6<;<<<;2<;<-7;;;<<<<<<<;;;<<7;<
-@EAS56_61:6:226:370:91
-AGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGA
-+
-8<<<;<8<8<;<<<8<<;7<7;8784<<,;864<&
-@EAS56_61:6:227:259:597
-AATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTT
-+
-<8<;2;9;<;;-92<;;;<;<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_61:6:256:67:461
-TCATGTTTGTGTCTTTCTATGCATTTTTTTTTTTT
-+
-!!7181!63:6-:!-163(-1%-18<<4<<<<<<<
-@EAS56_61:6:256:67:461
-TTGTTTTTTCTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT
-+
-*.%53.:)1+9;3397;1795507+335;.&51)5
-@EAS56_61:6:283:963:234
-AAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;<<;<<;<
-@EAS56_61:6:283:963:234
-ACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCAT
-+
-<5<;<;97;;:;<<7<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_61:6:307:208:477
-AAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATA
-+
-<<<<<.<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_61:6:307:208:477
-ACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAA
-+
-<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<88;
-@EAS56_61:7:280:133:495
-AGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCT
-+
-<:<9:<<7:<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_61:7:280:133:495
-CCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
-@EAS56_61:7:41:745:603
-CATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCA
-+
-<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<6<:8<<:
-@EAS56_61:7:41:745:603
-TAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGT
-+
-;<<;;<;<8<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<;<
-@EAS56_61:7:7:682:201
-CATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAAT
-+
-0:8;5<8<1:78<<<<<<<<<<<<:8<<2<<<<:<
-@EAS56_61:7:7:682:201
-GGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACA
-+
-<<<<<<<7<<7<<<<77&;-9<97<76<;<<993<
-@EAS56_61:8:60:358:494
-GGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<;;4;
-@EAS56_61:8:60:358:494
-TACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTA
-+
-7<77;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_61:8:7:171:402
-GTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<;/<<<<;<<<<<;<<1<<<4
-@EAS56_61:8:7:171:402
-TCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAG
-+
-:086::::847:<7<<7<<<<<<;7<<;<<<<7<<
-@EAS56_63:1:119:446:185
-TGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAAT
-+
-+70730;<0<77;;<<<<<9<<<<<<9<<<<<<<<
-@EAS56_63:1:119:446:185
-TTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAG
-+
-<<<<<<<7<<<4<<<<9<<54<:<7<5:<::7-5;
-@EAS56_63:1:145:71:26
-CTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;<<;<;<9<9;;99;
-@EAS56_63:1:145:71:26
-TTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATA
-+
-882;8;<;;887<<<;;<<<<;<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:2:119:161:322
-ATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTT
-+
-<83<;<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:2:119:161:322
-CTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<</6
-@EAS56_63:2:33:357:858
-AAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<:<<<<;<<<<<<
-@EAS56_63:2:33:357:858
-AGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATT
-+
-<;<:<<<<<<<<<;<9<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:2:74:656:272
-AACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:2:74:656:272
-TGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCC
-+
-;;;</<<<<<5;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:3:40:594:752
-ATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTA
-+
-<<<<<<<<<<;<<<;<<<::;<:;<;:<;;;<;<:
-@EAS56_63:3:40:594:752
-CTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTCC
-+
-;7;9<;;;<;<;:<<;;<<<<<<<<<;<<<<<<<<
-@EAS56_63:3:41:468:459
-AAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;;7
-@EAS56_63:3:41:468:459
-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTT
-+
-+;<<<<<<<<<<<;&<<;;88&<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:3:93:1002:845
-AATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAA
-+
-<<::;;;<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:3:93:1002:845
-GGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;<<<;<<<</<
-@EAS56_63:4:141:9:811
-TTTCTTTTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTCTACAT
-+
-<<<;<<<<<<<;<;<:<<<;<<<<<<<<..));;.
-@EAS56_63:4:184:659:377
-AAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;;
-@EAS56_63:4:184:659:377
-CAAAACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTA
-+
-1;<+<;<6;66<<;<<<<;;<<<8<<<<8<<;<<<
-@EAS56_63:4:38:28:122
-AAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACC
-+
-<<<<<<;<<<<<<<;<<<<6<<<<<<:<<<<;;<<
-@EAS56_63:4:38:28:122
-GTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTG
-+
-;9;9;-1<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:5:117:570:971
-ACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<;;;<<<<6<7;9;<:;<;<;;<
-@EAS56_63:5:117:570:971
-ACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGA
-+
-<,<9<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:5:123:998:248
-ATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;9<<<68<
-@EAS56_63:5:123:998:248
-TTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAA
-+
-;:;5;<;:<9<<<<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:5:36:678:316
-ATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAA
-+
-<<72.2,;;<)6<<<<:<<;;<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:5:36:678:316
-TTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<,2<<<)
-@EAS56_63:5:96:788:614
-TAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;6;<<;;<;;7;9
-@EAS56_63:5:96:788:614
-TTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCAC
-+
-;9;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:6:102:816:260
-AAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGA
-+
-<<<<<<::<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:6:102:816:260
-TCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAA
-+
-<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;;
-@EAS56_63:6:42:920:522
-AATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<:<<<<<<<:;;::&
-@EAS56_63:6:42:920:522
-CTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCC
-+
-;;;;;99<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:6:91:360:585
-AAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCC
-+
-<<<<9<<<<<;<<<;<<77<<<;<;;<;;<;<;;<
-@EAS56_63:6:91:360:585
-GACATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTT
-+
-5&&<<3:;<<<<<<)<<3<<<<<<<;;<<<<;<<<
-@EAS56_63:7:109:22:383
-ATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGC
-+
-<;9;<8<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
-@EAS56_63:7:109:22:383
-CAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<;<<
-@EAS56_63:7:137:139:248
-GTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGC
-+
-;;;99<<<;<;;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:7:137:139:248
-TATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAA
-+
-<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<;<<<<<<<;;<;<;<
-@EAS56_63:7:166:42:147
-AATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTAACAGTTTC
-+
-<<;<<<<<<<<<<<<<<<<;6<<64;)<<7;7;;;
-@EAS56_63:7:166:42:147
-CTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTG
-+
-3.7;;;;:<<<77<<3<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:7:185:213:330
-CAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAA
-+
-<<<<<<<<<;<<;<<<<<;<<<<;;;<<;<<;<38
-@EAS56_63:7:185:213:330
-TCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATT
-+
-;4<<<;<<<<<<<<;<<;;;<<<<9<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:7:190:95:706
-TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<;;<;<;;<<;<;;<,
-@EAS56_63:7:190:95:706
-TTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTA
-+
-9;97437;<;;<<;<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:7:34:334:825
-CATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3;<<<<6<<<<
-@EAS56_63:8:138:186:459
-CATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCA
-+
-<*<<7<<0<7<<+<-:<<&<:6:4:0-:<<2.:5<
-@EAS56_63:8:138:186:459
-GCCAGAAGAGATTGGAGCTAATTTTTGGACTTCTT
-+
-+/2/;<:<&7:7</<2&<<<&<<<<<<<<<8<<:3
-@EAS56_63:8:150:508:757
-ATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<8<<,<
-@EAS56_63:8:150:508:757
-CTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACA
-+
-6;;;<8<6;8<<8<<<<<;<<<<;<<<<;<<<<<<
-@EAS56_63:8:4:571:820
-AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA
-+
-<<<<<<<<<<<9<<;9<;;;<;6;:<<<3:;;;:6
-@EAS56_63:8:4:571:820
-CAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCAT
-+
-&<<7<<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:8:62:125:888
-CGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAA
-+
-,;3<<<8;;3<,<<<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_63:8:62:125:888
-TGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::<<<:7<::<:;<<:
-@EAS56_65:1:163:846:223
-CCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCT
-+
-<7<5<*<<<<0<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:1:163:846:223
-GCCTTTGTTCACATAGACCCCCTTGCAACAACCTT
-+
-<<<<;<<;4<<<;;9<<<<<+<<;<</27;;47;.
-@EAS56_65:1:178:305:843
-ATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTA
-+
-<<<<<<<4<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:1:178:305:843
-CCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<;<<:<<:<;:
-@EAS56_65:1:23:536:229
-AAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<:<8<:<<;<<<<<<7<<<
-@EAS56_65:1:23:536:229
-AAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCA
-+
-<<99<<<<<;<<<;2<<<<<<;<<<9<<<<<<<<<
-@EAS56_65:1:53:272:944
-CAACCCCCTTGCAACAACCTTGCGAACCCCAGGGA
-+
-<<<<<<<<<<<<.7<.<<<<<<-<-<<<<<&<222
-@EAS56_65:1:53:272:944
-TGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAA
-+
-&94<4&8.6<6&;<:0:8;;:6;<;:<*<<<<<<<
-@EAS56_65:2:224:579:433
-ATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<8<+8;:
-@EAS56_65:2:224:579:433
-TTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCT
-+
-'<08/8<+<</<<:<<<<<8<<9<38<<<<<<<<;
-@EAS56_65:2:56:155:49
-ATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACT
-+
-;:5;;<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<=
-@EAS56_65:2:56:155:49
-ATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<;<9<9;
-@EAS56_65:3:168:741:680
-AGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<<<<<<<<<
-@EAS56_65:3:168:741:680
-TGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAAT
-+
-<<5<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:3:47:64:359
-TTTTTTTTTTTCTCTCCTCTTTTTTTTTTTTTTTT
-+
-<<<6<<<<<<<4<4</9<4@<<;<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:4:124:367:72
-AGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;
-@EAS56_65:4:124:367:72
-CATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTA
-+
-,<<<8,<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:4:126:966:514
-AGAAGAAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCAC
-+
-<4<<<%<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:4:126:966:514
-TAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<;
-@EAS56_65:4:150:94:843
-AAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGA
-+
-<<<<<<<<7<<<6<<<<<<<<<<<6<<62<<<<<2
-@EAS56_65:4:150:94:843
-CAGATACATCCCACTTTAAATCAACCACAGTAAAA
-+
-4<9<41*747*7<:9<:7:::<72;+<;::<7<<<
-@EAS56_65:4:296:78:421
-TCTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT
-+
-!!<<<:<<<<..<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:4:296:78:421
-TGTTGGTGTTCGTTTTTTCTCCTGTTTCTTTTTCT
-+
-<<*<4<<<;:<0<<<<<<<<+;<9<<1<<;<<<+:
-@EAS56_65:5:121:380:656
-AATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<83<:<<
-@EAS56_65:5:121:380:656
-GCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTG
-+
-:;<<;<<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:5:131:742:561
-TCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:5:131:742:561
-TGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCAC
-+
-<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:5:211:84:84
-CTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:<<:<<<44<4<<9<<
-@EAS56_65:5:211:84:84
-GCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAA
-+
-6:<<:<<<<<<9<<<<<<<<<<<;<<<;;;<;<3;
-@EAS56_65:5:262:53:888
-AAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGAT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:5:262:53:888
-TTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA
-+
-<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<;<;<;6<<;<;;<
-@EAS56_65:5:278:848:765
-GTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCT
-+
-7;;<;5<55<<;;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:5:278:848:765
-TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4
-@EAS56_65:5:299:336:613
-ATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:5:299:336:613
-TACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGT
-+
-1;4(+<<5<4<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:5:30:92:753
-TATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAAT
-+
-<<<<<<;<<<<<<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:5:30:92:753
-TGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:5:312:985:871
-ATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAAC
-+
-<8<<<<.<.<<<<:<<<<<.<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:5:312:985:871
-TAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATG
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<9<<
-@EAS56_65:5:37:611:267
-AATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACA
-+
-<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:5:37:611:267
-TATAAAGGAAATCCCATAAGAATAACAATGGGCTT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:5:75:637:650
-CTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<:
-@EAS56_65:5:75:637:650
-GTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGC
-+
-<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:6:197:759:975
-AAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:6:197:759:975
-AATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;
-@EAS56_65:6:37:610:260
-CAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGT
-+
-/74<.<4.&<<<:<<<<::<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:6:37:610:260
-CCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTC
-+
-<<<;<;<<7<<<<<<<<<<<<<<;6<963;;;3;1
-@EAS56_65:6:46:173:214
-AACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCA
-+
-<<2<<<<<<<<<<<5<<5<7<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:6:46:173:214
-CTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<3<<<<<<;
-@EAS56_65:6:66:257:524
-ATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCAT
-+
-<;<<<<<<<<3<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:6:66:257:524
-GCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<%
-@EAS56_65:6:67:800:450
-TCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGA
-+
-9-<9<;<<<<9;5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:6:67:800:450
-TTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACT
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<
-@EAS56_65:6:82:822:767
-AACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAA
-+
-<<9<<<<<<<<<<;;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:6:82:822:767
-TTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<.<<.<,<
-@EAS56_65:7:118:775:467
-AACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;
-@EAS56_65:7:118:775:467
-TGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:7:122:398:994
-GGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTG
-+
-95:<9<<<<:9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:7:122:398:994
-TAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCA
-+
-<:<9<<<<<<4<<<;9<<<<<98<;<<<:;<;<;7
-@EAS56_65:7:219:40:833
-CCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAA
-+
-<<*<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:7:219:40:833
-GGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:7:288:552:440
-AGAGGGAACGCTTTCAACTCTTCTAGCCATTTCTT
-+
-9<<%'%<<.2<<<<<<<<5:<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:7:288:552:440
-TGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCTTCCAT
-+
-<<<<71<77<<<:<<<&<4<<77<16<88&36+%%
-@EAS56_65:7:67:692:110
-ATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:7:67:692:110
-GTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGA
-+
-;;<<8<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:8:117:156:84
-GGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:8:117:156:84
-TGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAG
-+
-<;;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:8:206:563:262
-ATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCT
-+
-<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7
-@EAS56_65:8:206:563:262
-ATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAG
-+
-<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<-;<4;
-@EAS56_65:8:218:173:667
-CCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<.<
-@EAS56_65:8:218:173:667
-TAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTGT
-+
-<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:8:24:415:944
-GTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGC
-+
-<;;<<<<:<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<
-@EAS56_65:8:24:415:944
-TAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAAC
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<
-@EAS56_65:8:275:851:240
-CCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGTTTCTAGCCATT
-+
-66614/&3616630666&66666&66666868666
-@EAS56_65:8:275:851:240
-GTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAA
-+
-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<4<7<<<<<<
-@EAS56_65:8:317:83:500
-TTTTTTTTTTTTCTTTTCTCCTTTTTTTTTTGTTT
-+
-;;;;;<<<<<<<3<<<)-;31<<)97<;9<<:<<<
-@EAS56_65:8:64:507:478
-TAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATAT
-+
-<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;;;<<<;<<8;<;<
+++ /dev/null
-@HD VN:1.0
-@SQ SN:1 LN:249250621
-read1 115 1 142618765 255 25M = 142618765 25 CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII NM:i:0 ZP:i:65536 ZL:i:25
-read2 115 1 142618765 255 25M = 142618765 25 CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII NM:i:0 ZP:i:214748 ZL:i:25
-read3 115 1 142618765 255 25M = 142618765 25 CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII NM:i:0 ZP:i:2147484 ZL:i:25
-read4 115 1 142618765 255 25M = 142618765 25 CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII NM:i:0 ZP:i:2147483647 ZL:i:25
-read5 115 1 142618765 255 25M = 142618765 25 CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII NM:i:0 ZP:i:-65536 ZL:i:25
-read6 115 1 142618765 255 25M = 142618765 25 CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII NM:i:0 ZP:i:-214748 ZL:i:25
-read7 115 1 142618765 255 25M = 142618765 25 CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII NM:i:0 ZP:i:-2147484 ZL:i:25
-read8 115 1 142618765 255 25M = 142618765 25 CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII NM:i:0 ZP:i:-2147483647 ZL:i:25
-read1 115 1 142618765 255 25M = 142618765 25 CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII NM:i:0 ZP:f:65536 ZL:i:25
-read2 115 1 142618765 255 25M = 142618765 25 CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII NM:i:0 ZP:f:214748 ZL:i:25
-read3 115 1 142618765 255 25M = 142618765 25 CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII NM:i:0 ZP:f:2147484 ZL:i:25
-read5 115 1 142618765 255 25M = 142618765 25 CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII NM:i:0 ZP:f:-65536 ZL:i:25
-read6 115 1 142618765 255 25M = 142618765 25 CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII NM:i:0 ZP:f:-214748 ZL:i:25
-read7 115 1 142618765 255 25M = 142618765 25 CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII NM:i:0 ZP:f:-2147484 ZL:i:25
+++ /dev/null
-@HD VN:1.0
-@SQ SN:chr1 LN:1575
-@SQ SN:chr2 LN:1584
-@RG ID:L1 PU:SC_1_10 LB:SC_1 SM:NA12891 CN:name:with:colon
-@RG ID:L2 PU:SC_2_12 LB:SC_2 SM:NA12891 CN:name:with:colon
-@PG ID:P1 VN:1.0
-@PG ID:P2 VN:1.1
-@CO this is a comment
-@CO this is another comment
-read_28833_29006_6945 99 chr1 33 20 10M1D25M = 200 167 AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<< NM:i:1 RG:Z:L1 PG:Z:P1 XT:A:U
-read_28701_28881_323b 147 chr2 88 30 35M = 500 412 ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<< MF:i:18 RG:Z:L2 PG:Z:P2 XT:A:R
-read_28701_28881_323c 147 chr2 88 30 35M = 500 412 ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<
-test_clipped1 99 chr2 997 20 4S6M1D20M5S = 200 167 AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<< NM:i:1 RG:Z:L1 PG:Z:P1 XT:A:U
+++ /dev/null
-@HD VN:1.0
-@SQ SN:chr1 LN:100
-@SQ SN:chr2 LN:100
-@RG ID:L1 PU:SC_1_10 LB:SC_1 SM:NA12891
-@RG ID:L2 PU:SC_2_12 LB:SC_2 SM:NA12891
-@CO this is a comment
-@CO this is another comment
-read_28833_29006_6945 99 chr1 21 20 10M1D25M = 200 167 AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<< NM:i:1 RG:Z:L1
-read_28701_28881_323b 147 chr2 21 30 35M = 500 412 ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<< MF:i:18 RG:Z:L2
+++ /dev/null
-@HD VN:1.0
-@SQ SN:chr1 LN:100
-@SQ SN:chr2 LN:100
-read_28833_29006_6945 0 * 0 0 * * 200 167 AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<
-read_28701_28881_323b 0 * 0 0 * * 500 412 ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<
+++ /dev/null
-@HD VN:1.0
-@SQ SN:chr1 LN:1575
-@SQ SN:chr2 LN:1584
-read_28833_29006_6945 99 chr1 33 20 10M1D25M = 200 167 AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<< NM:i:1 RG:Z:L1
-read_28701_28881_323b 147 chr2 88 30 35M = 500 412 ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<< MF:i:18 RG:Z:L2
+++ /dev/null
-read_28833_29006_6945 99 chr1 33 20 10M1D25M = 200 167 AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<< NM:i:1 RG:Z:L1 PG:Z:P1 XT:A:U
-read_28701_28881_323b 147 chr2 88 30 35M = 500 412 ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<< MF:i:18 RG:Z:L2 PG:Z:P2 XT:A:R
+++ /dev/null
-@HD VN:1.0
-@SQ SN:2 LN:48297693
-GJP00TM04CAQ5W 0 2 38297693 60 45H51M1D13M1D12M1D9M2D5M1D7M4D2M1I6M1D28M1D5M1D2M1D18M55H * 0 0 CATGAAGAACCGCTGGGTATGGAGCACACCTCACCTGATGGACAGTTGATTATGCTCACCTTAACGCTAATTGAGAGCAGCACAAGAGGACTGGAAACTAGAATTTACTCCTCATCTCCGAAGATGTGAATATTCTAAATTCAGCTTGCCTCTTGCTTC IID7757111/=;?///:D>777;EEGAAAEEIHHIIIIIIIIIIIIIIBBBIIIIH==<<<DDGEEE;<<<A><<<DEDDA>>>D?1112544556::03---//25.22=;DD?;;;>BDDDEEEGGGA<888<BAA888<GGGGGEB?9::DD551 NM:i:15 MD:Z:51^T13^A12^A9^AA5^A7^AAAA8^T28^T5^A2^T18 RG:Z:GJP00TM04
+++ /dev/null
-@HD VN:1.0 GO:none SO:coordinate
-@SQ SN:CUTC000001 LN:810
-@SQ SN:CUTC000002 LN:1213
-@SQ SN:CUTC000003 LN:525
-@SQ SN:CUTC000004 LN:620
-@SQ SN:CUTC000005 LN:550
-@SQ SN:CUTC000006 LN:723
-@SQ SN:CUTC000007 LN:773
-@SQ SN:CUTC000008 LN:667
-@SQ SN:CUTC000009 LN:593
-@SQ SN:CUTC000010 LN:556
-@SQ SN:CUTC000011 LN:519
-@SQ SN:CUTC000012 LN:537
-@SQ SN:CUTC000013 LN:930
-@SQ SN:CUTC000014 LN:944
-@SQ SN:CUTC000015 LN:829
-@SQ SN:CUTC000016 LN:1109
-@SQ SN:CUTC000017 LN:513
-@SQ SN:CUTC000018 LN:1043
-@SQ SN:CUTC000019 LN:884
-@SQ SN:CUTC000020 LN:567
-@SQ SN:CUTC000021 LN:1001
-@SQ SN:CUTC000022 LN:754
-@SQ SN:CUTC000023 LN:1045
-@SQ SN:CUTC000024 LN:1091
-@SQ SN:CUTC000025 LN:606
-@SQ SN:CUTC000026 LN:635
-@SQ SN:CUTC000027 LN:563
-@SQ SN:CUTC000028 LN:830
-@SQ SN:CUTC000029 LN:1456
-@SQ SN:CUTC000030 LN:872
-@SQ SN:CUTC000031 LN:742
-@SQ SN:CUTC000032 LN:553
-@SQ SN:CUTC000033 LN:624
-@SQ SN:CUTC000034 LN:641
-@SQ SN:CUTC000035 LN:695
-@SQ SN:CUTC000036 LN:1519
-@SQ SN:CUTC000037 LN:536
-@SQ SN:CUTC000038 LN:619
-@SQ SN:CUTC000039 LN:643
-@SQ SN:CUTC000040 LN:650
-@SQ SN:CUTC000041 LN:571
-@SQ SN:CUTC000042 LN:1457
-@SQ SN:CUTC000043 LN:618
-@SQ SN:CUTC000044 LN:1261
-@SQ SN:CUTC000045 LN:544
-@SQ SN:CUTC000046 LN:1234
-@SQ SN:CUTC000047 LN:867
-@SQ SN:CUTC000048 LN:792
-@SQ SN:CUTC000049 LN:1076
-@SQ SN:CUTC000050 LN:479
-@SQ SN:CUTC000051 LN:584
-@SQ SN:CUTC000052 LN:841
-@SQ SN:CUTC000053 LN:518
-@SQ SN:CUTC000054 LN:1052
-@SQ SN:CUTC000055 LN:626
-@SQ SN:CUTC000056 LN:773
-@SQ SN:CUTC000057 LN:542
-@SQ SN:CUTC000058 LN:566
-@SQ SN:CUTC000059 LN:931
-@SQ SN:CUTC000060 LN:755
-@SQ SN:CUTC000061 LN:606
-@SQ SN:CUTC000062 LN:640
-@SQ SN:CUTC000063 LN:667
-@SQ SN:CUTC000064 LN:1717
-@SQ SN:CUTC000065 LN:695
-@SQ SN:CUTC000066 LN:1735
-@SQ SN:CUTC000067 LN:474
-@SQ SN:CUTC000068 LN:813
-@SQ SN:CUTC000069 LN:746
-@SQ SN:CUTC000070 LN:1141
-@SQ SN:CUTC000071 LN:624
-@SQ SN:CUTC000072 LN:1097
-@SQ SN:CUTC000073 LN:510
-@SQ SN:CUTC000074 LN:638
-@SQ SN:CUTC000075 LN:682
-@SQ SN:CUTC000076 LN:1043
-@SQ SN:CUTC000077 LN:727
-@SQ SN:CUTC000078 LN:1124
-@SQ SN:CUTC000079 LN:711
-@SQ SN:CUTC000080 LN:578
-@SQ SN:CUTC000081 LN:718
-@SQ SN:CUTC000082 LN:1779
-@SQ SN:CUTC000083 LN:630
-@SQ SN:CUTC000084 LN:850
-@SQ SN:CUTC000085 LN:590
-@SQ SN:CUTC000086 LN:578
-@SQ SN:CUTC000087 LN:727
-@SQ SN:CUTC000088 LN:582
-@SQ SN:CUTC000089 LN:632
-@SQ SN:CUTC000090 LN:792
-@SQ SN:CUTC000091 LN:553
-@SQ SN:CUTC000092 LN:606
-@SQ SN:CUTC000093 LN:1263
-@SQ SN:CUTC000094 LN:1119
-@SQ SN:CUTC000095 LN:1107
-@SQ SN:CUTC000096 LN:1240
-@SQ SN:CUTC000097 LN:578
-@SQ SN:CUTC000098 LN:739
-@SQ SN:CUTC000099 LN:959
-@SQ SN:CUTC000100 LN:701
-@SQ SN:CUTC000101 LN:1047
-@SQ SN:CUTC000102 LN:961
-@SQ SN:CUTC000103 LN:548
-@SQ SN:CUTC000104 LN:579
-@SQ SN:CUTC000105 LN:1376
-@SQ SN:CUTC000106 LN:1202
-@SQ SN:CUTC000107 LN:615
-@SQ SN:CUTC000108 LN:634
-@SQ SN:CUTC000109 LN:742
-@SQ SN:CUTC000110 LN:645
-@SQ SN:CUTC000111 LN:567
-@SQ SN:CUTC000112 LN:715
-@SQ SN:CUTC000113 LN:705
-@SQ SN:CUTC000114 LN:548
-@SQ SN:CUTC000115 LN:555
-@SQ SN:CUTC000116 LN:1370
-@SQ SN:CUTC000117 LN:715
-@SQ SN:CUTC000118 LN:737
-@SQ SN:CUTC000119 LN:595
-@SQ SN:CUTC000120 LN:674
-@SQ SN:CUTC000121 LN:858
-@SQ SN:CUTC000122 LN:571
-@SQ SN:CUTC000123 LN:656
-@SQ SN:CUTC000124 LN:923
-@SQ SN:CUTC000125 LN:487
-@SQ SN:CUTC000126 LN:488
-@SQ SN:CUTC000127 LN:548
-@SQ SN:CUTC000128 LN:547
-@SQ SN:CUTC000129 LN:593
-@SQ SN:CUTC000130 LN:980
-@SQ SN:CUTC000131 LN:605
-@SQ SN:CUTC000132 LN:942
-@SQ SN:CUTC000133 LN:599
-@SQ SN:CUTC000134 LN:755
-@SQ SN:CUTC000135 LN:544
-@SQ SN:CUTC000136 LN:623
-@SQ SN:CUTC000137 LN:680
-@SQ SN:CUTC000138 LN:633
-@SQ SN:CUTC000139 LN:4441
-@SQ SN:CUTC000140 LN:894
-@SQ SN:CUTC000141 LN:688
-@SQ SN:CUTC000142 LN:683
-@SQ SN:CUTC000143 LN:679
-@SQ SN:CUTC000144 LN:698
-@SQ SN:CUTC000145 LN:629
-@SQ SN:CUTC000146 LN:534
-@SQ SN:CUTC000147 LN:643
-@SQ SN:CUTC000148 LN:614
-@SQ SN:CUTC000149 LN:845
-@SQ SN:CUTC000150 LN:652
-@SQ SN:CUTC000151 LN:1332
-@SQ SN:CUTC000152 LN:1091
-@SQ SN:CUTC000153 LN:702
-@SQ SN:CUTC000154 LN:677
-@SQ SN:CUTC000155 LN:902
-@SQ SN:CUTC000156 LN:557
-@SQ SN:CUTC000157 LN:735
-@SQ SN:CUTC000158 LN:940
-@SQ SN:CUTC000159 LN:668
-@SQ SN:CUTC000160 LN:2002
-@SQ SN:CUTC000161 LN:665
-@SQ SN:CUTC000162 LN:907
-@SQ SN:CUTC000163 LN:497
-@SQ SN:CUTC000164 LN:966
-@SQ SN:CUTC000165 LN:645
-@SQ SN:CUTC000166 LN:595
-@SQ SN:CUTC000167 LN:651
-@SQ SN:CUTC000168 LN:410
-@SQ SN:CUTC000169 LN:1122
-@SQ SN:CUTC000170 LN:1021
-@SQ SN:CUTC000171 LN:804
-@SQ SN:CUTC000172 LN:972
-@SQ SN:CUTC000173 LN:1839
-@SQ SN:CUTC000174 LN:647
-@SQ SN:CUTC000175 LN:675
-@SQ SN:CUTC000176 LN:647
-@SQ SN:CUTC000177 LN:1713
-@SQ SN:CUTC000178 LN:911
-@SQ SN:CUTC000179 LN:664
-@SQ SN:CUTC000180 LN:765
-@SQ SN:CUTC000181 LN:950
-@SQ SN:CUTC000182 LN:914
-@SQ SN:CUTC000183 LN:1166
-@SQ SN:CUTC000184 LN:834
-@SQ SN:CUTC000185 LN:812
-@SQ SN:CUTC000186 LN:793
-@SQ SN:CUTC000187 LN:1148
-@SQ SN:CUTC000188 LN:1376
-@SQ SN:CUTC000189 LN:724
-@SQ SN:CUTC000190 LN:762
-@SQ SN:CUTC000191 LN:940
-@SQ SN:CUTC000192 LN:707
-@SQ SN:CUTC000193 LN:1596
-@SQ SN:CUTC000194 LN:557
-@SQ SN:CUTC000195 LN:596
-@SQ SN:CUTC000196 LN:930
-@SQ SN:CUTC000197 LN:1447
-@SQ SN:CUTC000198 LN:566
-@SQ SN:CUTC000199 LN:686
-@SQ SN:CUTC000200 LN:685
-@SQ SN:CUTC000201 LN:579
-@SQ SN:CUTC000202 LN:1282
-@SQ SN:CUTC000203 LN:1601
-@SQ SN:CUTC000204 LN:1034
-@SQ SN:CUTC000205 LN:1370
-@SQ SN:CUTC000206 LN:530
-@SQ SN:CUTC000207 LN:947
-@SQ SN:CUTC000208 LN:655
-@SQ SN:CUTC000209 LN:611
-@SQ SN:CUTC000210 LN:700
-@SQ SN:CUTC000211 LN:940
-@SQ SN:CUTC000212 LN:496
-@SQ SN:CUTC000213 LN:849
-@SQ SN:CUTC000214 LN:713
-@SQ SN:CUTC000215 LN:879
-@SQ SN:CUTC000216 LN:686
-@SQ SN:CUTC000217 LN:655
-@SQ SN:CUTC000218 LN:1139
-@SQ SN:CUTC000219 LN:712
-@SQ SN:CUTC000220 LN:987
-@SQ SN:CUTC000221 LN:581
-@SQ SN:CUTC000222 LN:867
-@SQ SN:CUTC000223 LN:1591
-@SQ SN:CUTC000224 LN:661
-@SQ SN:CUTC000225 LN:1490
-@SQ SN:CUTC000226 LN:1207
-@SQ SN:CUTC000227 LN:785
-@SQ SN:CUTC000228 LN:700
-@SQ SN:CUTC000229 LN:474
-@SQ SN:CUTC000230 LN:539
-@SQ SN:CUTC000231 LN:1095
-@SQ SN:CUTC000232 LN:556
-@SQ SN:CUTC000233 LN:609
-@SQ SN:CUTC000234 LN:1335
-@SQ SN:CUTC000235 LN:566
-@SQ SN:CUTC000236 LN:612
-@SQ SN:CUTC000237 LN:918
-@SQ SN:CUTC000238 LN:572
-@SQ SN:CUTC000239 LN:690
-@SQ SN:CUTC000240 LN:539
-@SQ SN:CUTC000241 LN:1861
-@SQ SN:CUTC000242 LN:730
-@SQ SN:CUTC000243 LN:775
-@SQ SN:CUTC000244 LN:1439
-@SQ SN:CUTC000245 LN:687
-@SQ SN:CUTC000246 LN:754
-@SQ SN:CUTC000247 LN:646
-@SQ SN:CUTC000248 LN:543
-@SQ SN:CUTC000249 LN:1182
-@SQ SN:CUTC000250 LN:650
-@SQ SN:CUTC000251 LN:732
-@SQ SN:CUTC000252 LN:1040
-@SQ SN:CUTC000253 LN:979
-@SQ SN:CUTC000254 LN:1055
-@SQ SN:CUTC000255 LN:971
-@SQ SN:CUTC000256 LN:817
-@SQ SN:CUTC000257 LN:606
-@SQ SN:CUTC000258 LN:624
-@SQ SN:CUTC000259 LN:516
-@SQ SN:CUTC000260 LN:987
-@SQ SN:CUTC000261 LN:1071
-@SQ SN:CUTC000262 LN:588
-@SQ SN:CUTC000263 LN:1389
-@SQ SN:CUTC000264 LN:672
-@SQ SN:CUTC000265 LN:954
-@SQ SN:CUTC000266 LN:1072
-@SQ SN:CUTC000267 LN:713
-@SQ SN:CUTC000268 LN:1192
-@SQ SN:CUTC000269 LN:540
-@SQ SN:CUTC000270 LN:592
-@SQ SN:CUTC000271 LN:901
-@SQ SN:CUTC000272 LN:420
-@SQ SN:CUTC000273 LN:670
-@SQ SN:CUTC000274 LN:1088
-@SQ SN:CUTC000275 LN:786
-@SQ SN:CUTC000276 LN:846
-@SQ SN:CUTC000277 LN:839
-@SQ SN:CUTC000278 LN:901
-@SQ SN:CUTC000279 LN:3005
-@SQ SN:CUTC000280 LN:727
-@SQ SN:CUTC000281 LN:982
-@SQ SN:CUTC000282 LN:553
-@SQ SN:CUTC000283 LN:513
-@SQ SN:CUTC000284 LN:666
-@SQ SN:CUTC000285 LN:480
-@SQ SN:CUTC000286 LN:726
-@SQ SN:CUTC000287 LN:1225
-@SQ SN:CUTC000288 LN:783
-@SQ SN:CUTC000289 LN:802
-@SQ SN:CUTC000290 LN:1190
-@SQ SN:CUTC000291 LN:1323
-@SQ SN:CUTC000292 LN:700
-@SQ SN:CUTC000293 LN:748
-@SQ SN:CUTC000294 LN:840
-@SQ SN:CUTC000295 LN:447
-@SQ SN:CUTC000296 LN:475
-@SQ SN:CUTC000297 LN:693
-@SQ SN:CUTC000298 LN:838
-@SQ SN:CUTC000299 LN:933
-@SQ SN:CUTC000300 LN:1175
-@SQ SN:CUTC000301 LN:795
-@SQ SN:CUTC000302 LN:514
-@SQ SN:CUTC000303 LN:650
-@SQ SN:CUTC000304 LN:1015
-@SQ SN:CUTC000305 LN:869
-@SQ SN:CUTC000306 LN:1218
-@SQ SN:CUTC000307 LN:943
-@SQ SN:CUTC000308 LN:879
-@SQ SN:CUTC000309 LN:758
-@SQ SN:CUTC000310 LN:895
-@SQ SN:CUTC000311 LN:1060
-@SQ SN:CUTC000312 LN:1414
-@SQ SN:CUTC000313 LN:1841
-@SQ SN:CUTC000314 LN:1040
-@SQ SN:CUTC000315 LN:769
-@SQ SN:CUTC000316 LN:1400
-@SQ SN:CUTC000317 LN:1097
-@SQ SN:CUTC000318 LN:953
-@SQ SN:CUTC000319 LN:793
-@SQ SN:CUTC000320 LN:840
-@SQ SN:CUTC000321 LN:734
-@SQ SN:CUTC000322 LN:528
-@SQ SN:CUTC000323 LN:492
-@SQ SN:CUTC000324 LN:737
-@SQ SN:CUTC000325 LN:681
-@SQ SN:CUTC000326 LN:446
-@SQ SN:CUTC000327 LN:836
-@SQ SN:CUTC000328 LN:745
-@SQ SN:CUTC000329 LN:1514
-@SQ SN:CUTC000330 LN:773
-@SQ SN:CUTC000331 LN:608
-@SQ SN:CUTC000332 LN:814
-@SQ SN:CUTC000333 LN:655
-@SQ SN:CUTC000334 LN:697
-@SQ SN:CUTC000335 LN:818
-@SQ SN:CUTC000336 LN:650
-@SQ SN:CUTC000337 LN:1787
-@SQ SN:CUTC000338 LN:695
-@SQ SN:CUTC000339 LN:1638
-@SQ SN:CUTC000340 LN:903
-@SQ SN:CUTC000341 LN:638
-@SQ SN:CUTC000342 LN:659
-@SQ SN:CUTC000343 LN:1335
-@SQ SN:CUTC000344 LN:775
-@SQ SN:CUTC000345 LN:834
-@SQ SN:CUTC000346 LN:1356
-@SQ SN:CUTC000347 LN:1566
-@SQ SN:CUTC000348 LN:1240
-@SQ SN:CUTC000349 LN:810
-@SQ SN:CUTC000350 LN:885
-@SQ SN:CUTC000351 LN:532
-@SQ SN:CUTC000352 LN:434
-@SQ SN:CUTC000353 LN:705
-@SQ SN:CUTC000354 LN:740
-@SQ SN:CUTC000355 LN:833
-@SQ SN:CUTC000356 LN:680
-@SQ SN:CUTC000357 LN:1362
-@SQ SN:CUTC000358 LN:621
-@SQ SN:CUTC000359 LN:1108
-@SQ SN:CUTC000360 LN:721
-@SQ SN:CUTC000361 LN:709
-@SQ SN:CUTC000362 LN:908
-@SQ SN:CUTC000363 LN:1044
-@SQ SN:CUTC000364 LN:701
-@SQ SN:CUTC000365 LN:798
-@SQ SN:CUTC000366 LN:550
-@SQ SN:CUTC000367 LN:1007
-@SQ SN:CUTC000368 LN:1355
-@SQ SN:CUTC000369 LN:469
-@SQ SN:CUTC000370 LN:629
-@SQ SN:CUTC000371 LN:1065
-@SQ SN:CUTC000372 LN:415
-@SQ SN:CUTC000373 LN:977
-@SQ SN:CUTC000374 LN:547
-@SQ SN:CUTC000375 LN:699
-@SQ SN:CUTC000376 LN:1150
-@SQ SN:CUTC000377 LN:576
-@SQ SN:CUTC000378 LN:626
-@SQ SN:CUTC000379 LN:1326
-@SQ SN:CUTC000380 LN:621
-@SQ SN:CUTC000381 LN:900
-@SQ SN:CUTC000382 LN:1573
-@SQ SN:CUTC000383 LN:634
-@SQ SN:CUTC000384 LN:1186
-@SQ SN:CUTC000385 LN:623
-@SQ SN:CUTC000386 LN:1082
-@SQ SN:CUTC000387 LN:948
-@SQ SN:CUTC000388 LN:912
-@SQ SN:CUTC000389 LN:1564
-@SQ SN:CUTC000390 LN:1046
-@SQ SN:CUTC000391 LN:1302
-@SQ SN:CUTC000392 LN:1070
-@SQ SN:CUTC000393 LN:519
-@SQ SN:CUTC000394 LN:558
-@SQ SN:CUTC000395 LN:802
-@SQ SN:CUTC000396 LN:592
-@SQ SN:CUTC000397 LN:903
-@SQ SN:CUTC000398 LN:926
-@SQ SN:CUTC000399 LN:1054
-@SQ SN:CUTC000400 LN:626
-@SQ SN:CUTC000401 LN:1078
-@SQ SN:CUTC000402 LN:1369
-@SQ SN:CUTC000403 LN:1616
-@SQ SN:CUTC000404 LN:608
-@SQ SN:CUTC000405 LN:1418
-@SQ SN:CUTC000406 LN:583
-@SQ SN:CUTC000407 LN:658
-@SQ SN:CUTC000408 LN:1265
-@SQ SN:CUTC000409 LN:745
-@SQ SN:CUTC000410 LN:690
-@SQ SN:CUTC000411 LN:609
-@SQ SN:CUTC000412 LN:1061
-@SQ SN:CUTC000413 LN:899
-@SQ SN:CUTC000414 LN:925
-@SQ SN:CUTC000415 LN:552
-@SQ SN:CUTC000416 LN:559
-@SQ SN:CUTC000417 LN:964
-@SQ SN:CUTC000418 LN:855
-@SQ SN:CUTC000419 LN:1045
-@SQ SN:CUTC000420 LN:1479
-@SQ SN:CUTC000421 LN:537
-@SQ SN:CUTC000422 LN:1080
-@SQ SN:CUTC000423 LN:792
-@SQ SN:CUTC000424 LN:1201
-@SQ SN:CUTC000425 LN:1332
-@SQ SN:CUTC000426 LN:929
-@SQ SN:CUTC000427 LN:606
-@SQ SN:CUTC000428 LN:727
-@SQ SN:CUTC000429 LN:1085
-@SQ SN:CUTC000430 LN:504
-@SQ SN:CUTC000431 LN:1231
-@SQ SN:CUTC000432 LN:859
-@SQ SN:CUTC000433 LN:728
-@SQ SN:CUTC000434 LN:553
-@SQ SN:CUTC000435 LN:1124
-@SQ SN:CUTC000436 LN:1430
-@SQ SN:CUTC000437 LN:1770
-@SQ SN:CUTC000438 LN:831
-@SQ SN:CUTC000439 LN:1062
-@SQ SN:CUTC000440 LN:945
-@SQ SN:CUTC000441 LN:1082
-@SQ SN:CUTC000442 LN:2057
-@SQ SN:CUTC000443 LN:1425
-@SQ SN:CUTC000444 LN:1133
-@SQ SN:CUTC000445 LN:1478
-@SQ SN:CUTC000446 LN:755
-@SQ SN:CUTC000447 LN:548
-@SQ SN:CUTC000448 LN:1087
-@SQ SN:CUTC000449 LN:594
-@SQ SN:CUTC000450 LN:1012
-@SQ SN:CUTC000451 LN:1777
-@SQ SN:CUTC000452 LN:631
-@SQ SN:CUTC000453 LN:914
-@SQ SN:CUTC000454 LN:1701
-@SQ SN:CUTC000455 LN:869
-@SQ SN:CUTC000456 LN:1024
-@SQ SN:CUTC000457 LN:802
-@SQ SN:CUTC000458 LN:663
-@SQ SN:CUTC000459 LN:951
-@SQ SN:CUTC000460 LN:739
-@SQ SN:CUTC000461 LN:658
-@SQ SN:CUTC000462 LN:1055
-@SQ SN:CUTC000463 LN:807
-@SQ SN:CUTC000464 LN:1157
-@SQ SN:CUTC000465 LN:1340
-@SQ SN:CUTC000466 LN:1016
-@SQ SN:CUTC000467 LN:646
-@SQ SN:CUTC000468 LN:998
-@SQ SN:CUTC000469 LN:687
-@SQ SN:CUTC000470 LN:919
-@SQ SN:CUTC000471 LN:1062
-@SQ SN:CUTC000472 LN:1454
-@SQ SN:CUTC000473 LN:875
-@SQ SN:CUTC000474 LN:774
-@SQ SN:CUTC000475 LN:671
-@SQ SN:CUTC000476 LN:880
-@SQ SN:CUTC000477 LN:1297
-@SQ SN:CUTC000478 LN:722
-@SQ SN:CUTC000479 LN:985
-@SQ SN:CUTC000480 LN:797
-@SQ SN:CUTC000481 LN:741
-@SQ SN:CUTC000482 LN:598
-@SQ SN:CUTC000483 LN:841
-@SQ SN:CUTC000484 LN:1193
-@SQ SN:CUTC000485 LN:856
-@SQ SN:CUTC000486 LN:1020
-@SQ SN:CUTC000487 LN:984
-@SQ SN:CUTC000488 LN:1145
-@SQ SN:CUTC000489 LN:862
-@SQ SN:CUTC000490 LN:558
-@SQ SN:CUTC000491 LN:484
-@SQ SN:CUTC000492 LN:1097
-@SQ SN:CUTC000493 LN:763
-@SQ SN:CUTC000494 LN:2369
-@SQ SN:CUTC000495 LN:993
-@SQ SN:CUTC000496 LN:716
-@SQ SN:CUTC000497 LN:590
-@SQ SN:CUTC000498 LN:992
-@SQ SN:CUTC000499 LN:1223
-@SQ SN:CUTC000500 LN:956
-@SQ SN:CUTC000501 LN:761
-@SQ SN:CUTC000502 LN:1533
-@SQ SN:CUTC000503 LN:951
-@SQ SN:CUTC000504 LN:1599
-@SQ SN:CUTC000505 LN:1393
-@SQ SN:CUTC000506 LN:1064
-@SQ SN:CUTC000507 LN:1198
-@SQ SN:CUTC000508 LN:650
-@SQ SN:CUTC000509 LN:1190
-@SQ SN:CUTC000510 LN:1168
-@SQ SN:CUTC000511 LN:926
-@SQ SN:CUTC000512 LN:1528
-@SQ SN:CUTC000513 LN:516
-@SQ SN:CUTC000514 LN:886
-@SQ SN:CUTC000515 LN:779
-@SQ SN:CUTC000516 LN:955
-@SQ SN:CUTC000517 LN:1795
-@SQ SN:CUTC000518 LN:1028
-@SQ SN:CUTC000519 LN:799
-@SQ SN:CUTC000520 LN:1170
-@SQ SN:CUTC000521 LN:1348
-@SQ SN:CUTC000522 LN:611
-@SQ SN:CUTC000523 LN:795
-@SQ SN:CUTC000524 LN:767
-@SQ SN:CUTC000525 LN:679
-@SQ SN:CUTC000526 LN:1216
-@SQ SN:CUTC000527 LN:1105
-@SQ SN:CUTC000528 LN:757
-@SQ SN:CUTC000529 LN:951
-@SQ SN:CUTC000530 LN:446
-@SQ SN:CUTC000531 LN:759
-@SQ SN:CUTC000532 LN:751
-@SQ SN:CUTC000533 LN:629
-@SQ SN:CUTC000534 LN:903
-@SQ SN:CUTC000535 LN:652
-@SQ SN:CUTC000536 LN:584
-@SQ SN:CUTC000537 LN:785
-@SQ SN:CUTC000538 LN:3820
-@SQ SN:CUTC000539 LN:582
-@SQ SN:CUTC000540 LN:980
-@SQ SN:CUTC000541 LN:613
-@SQ SN:CUTC000542 LN:978
-@SQ SN:CUTC000543 LN:1717
-@SQ SN:CUTC000544 LN:1069
-@SQ SN:CUTC000545 LN:770
-@SQ SN:CUTC000546 LN:1249
-@SQ SN:CUTC000547 LN:940
-@SQ SN:CUTC000548 LN:1018
-@SQ SN:CUTC000549 LN:962
-@SQ SN:CUTC000550 LN:768
-@SQ SN:CUTC000551 LN:576
-@SQ SN:CUTC000552 LN:687
-@SQ SN:CUTC000553 LN:1354
-@SQ SN:CUTC000554 LN:664
-@SQ SN:CUTC000555 LN:847
-@SQ SN:CUTC000556 LN:1580
-@SQ SN:CUTC000557 LN:950
-@SQ SN:CUTC000558 LN:877
-@SQ SN:CUTC000559 LN:857
-@SQ SN:CUTC000560 LN:802
-@SQ SN:CUTC000561 LN:1022
-@SQ SN:CUTC000562 LN:1082
-@SQ SN:CUTC000563 LN:623
-@SQ SN:CUTC000564 LN:1403
-@SQ SN:CUTC000565 LN:1766
-@SQ SN:CUTC000566 LN:891
-@SQ SN:CUTC000567 LN:864
-@SQ SN:CUTC000568 LN:1010
-@SQ SN:CUTC000569 LN:510
-@SQ SN:CUTC000570 LN:812
-@SQ SN:CUTC000571 LN:582
-@SQ SN:CUTC000572 LN:677
-@SQ SN:CUTC000573 LN:899
-@SQ SN:CUTC000574 LN:1121
-@SQ SN:CUTC000575 LN:601
-@SQ SN:CUTC000576 LN:1757
-@SQ SN:CUTC000577 LN:1015
-@SQ SN:CUTC000578 LN:1147
-@SQ SN:CUTC000579 LN:692
-@SQ SN:CUTC000580 LN:638
-@SQ SN:CUTC000581 LN:504
-@SQ SN:CUTC000582 LN:945
-@SQ SN:CUTC000583 LN:512
-@SQ SN:CUTC000584 LN:761
-@SQ SN:CUTC000585 LN:957
-@SQ SN:CUTC000586 LN:611
-@SQ SN:CUTC000587 LN:776
-@SQ SN:CUTC000588 LN:658
-@SQ SN:CUTC000589 LN:727
-@SQ SN:CUTC000590 LN:833
-@SQ SN:CUTC000591 LN:488
-@SQ SN:CUTC000592 LN:774
-@SQ SN:CUTC000593 LN:784
-@SQ SN:CUTC000594 LN:835
-@SQ SN:CUTC000595 LN:752
-@SQ SN:CUTC000596 LN:523
-@SQ SN:CUTC000597 LN:468
-@SQ SN:CUTC000598 LN:1021
-@SQ SN:CUTC000599 LN:982
-@SQ SN:CUTC000600 LN:671
-@SQ SN:CUTC000601 LN:1063
-@SQ SN:CUTC000602 LN:482
-@SQ SN:CUTC000603 LN:1087
-@SQ SN:CUTC000604 LN:1043
-@SQ SN:CUTC000605 LN:1176
-@SQ SN:CUTC000606 LN:897
-@SQ SN:CUTC000607 LN:764
-@SQ SN:CUTC000608 LN:1724
-@SQ SN:CUTC000609 LN:579
-@SQ SN:CUTC000610 LN:657
-@SQ SN:CUTC000611 LN:627
-@SQ SN:CUTC000612 LN:1110
-@SQ SN:CUTC000613 LN:1065
-@SQ SN:CUTC000614 LN:765
-@SQ SN:CUTC000615 LN:813
-@SQ SN:CUTC000616 LN:1510
-@SQ SN:CUTC000617 LN:906
-@SQ SN:CUTC000618 LN:1733
-@SQ SN:CUTC000619 LN:490
-@SQ SN:CUTC000620 LN:841
-@SQ SN:CUTC000621 LN:1331
-@SQ SN:CUTC000622 LN:1082
-@SQ SN:CUTC000623 LN:1310
-@SQ SN:CUTC000624 LN:977
-@SQ SN:CUTC000625 LN:1122
-@SQ SN:CUTC000626 LN:613
-@SQ SN:CUTC000627 LN:486
-@SQ SN:CUTC000628 LN:1411
-@SQ SN:CUTC000629 LN:1005
-@SQ SN:CUTC000630 LN:1090
-@SQ SN:CUTC000631 LN:715
-@SQ SN:CUTC000632 LN:1475
-@SQ SN:CUTC000633 LN:823
-@SQ SN:CUTC000634 LN:949
-@SQ SN:CUTC000635 LN:1125
-@SQ SN:CUTC000636 LN:904
-@SQ SN:CUTC000637 LN:472
-@SQ SN:CUTC000638 LN:668
-@SQ SN:CUTC000639 LN:788
-@SQ SN:CUTC000640 LN:1314
-@SQ SN:CUTC000641 LN:920
-@SQ SN:CUTC000642 LN:952
-@SQ SN:CUTC000643 LN:859
-@SQ SN:CUTC000644 LN:1001
-@SQ SN:CUTC000645 LN:1386
-@SQ SN:CUTC000646 LN:1109
-@SQ SN:CUTC000647 LN:708
-@SQ SN:CUTC000648 LN:1011
-@SQ SN:CUTC000649 LN:1061
-@SQ SN:CUTC000650 LN:1213
-@SQ SN:CUTC000651 LN:633
-@SQ SN:CUTC000652 LN:667
-@SQ SN:CUTC000653 LN:1364
-@SQ SN:CUTC000654 LN:593
-@SQ SN:CUTC000655 LN:1099
-@SQ SN:CUTC000656 LN:1155
-@SQ SN:CUTC000657 LN:482
-@SQ SN:CUTC000658 LN:1122
-@SQ SN:CUTC000659 LN:1060
-@SQ SN:CUTC000660 LN:558
-@SQ SN:CUTC000661 LN:957
-@SQ SN:CUTC000662 LN:851
-@SQ SN:CUTC000663 LN:1100
-@SQ SN:CUTC000664 LN:868
-@SQ SN:CUTC000665 LN:1147
-@SQ SN:CUTC000666 LN:572
-@SQ SN:CUTC000667 LN:1032
-@SQ SN:CUTC000668 LN:703
-@SQ SN:CUTC000669 LN:1411
-@SQ SN:CUTC000670 LN:1938
-@SQ SN:CUTC000671 LN:1586
-@SQ SN:CUTC000672 LN:1165
-@SQ SN:CUTC000673 LN:897
-@SQ SN:CUTC000674 LN:845
-@SQ SN:CUTC000675 LN:876
-@SQ SN:CUTC000676 LN:756
-@SQ SN:CUTC000677 LN:1253
-@SQ SN:CUTC000678 LN:812
-@SQ SN:CUTC000679 LN:581
-@SQ SN:CUTC000680 LN:753
-@SQ SN:CUTC000681 LN:1146
-@SQ SN:CUTC000682 LN:925
-@SQ SN:CUTC000683 LN:819
-@SQ SN:CUTC000684 LN:913
-@SQ SN:CUTC000685 LN:946
-@SQ SN:CUTC000686 LN:1112
-@SQ SN:CUTC000687 LN:1056
-@SQ SN:CUTC000688 LN:941
-@SQ SN:CUTC000689 LN:892
-@SQ SN:CUTC000690 LN:780
-@SQ SN:CUTC000691 LN:587
-@SQ SN:CUTC000692 LN:696
-@SQ SN:CUTC000693 LN:810
-@SQ SN:CUTC000694 LN:1198
-@SQ SN:CUTC000695 LN:1089
-@SQ SN:CUTC000696 LN:596
-@SQ SN:CUTC000697 LN:1100
-@SQ SN:CUTC000698 LN:639
-@SQ SN:CUTC000699 LN:1254
-@SQ SN:CUTC000700 LN:709
-@SQ SN:CUTC000701 LN:797
-@SQ SN:CUTC000702 LN:915
-@SQ SN:CUTC000703 LN:2222
-@SQ SN:CUTC000704 LN:772
-@SQ SN:CUTC000705 LN:1080
-@SQ SN:CUTC000706 LN:1421
-@SQ SN:CUTC000707 LN:1369
-@SQ SN:CUTC000708 LN:475
-@SQ SN:CUTC000709 LN:775
-@SQ SN:CUTC000710 LN:1192
-@SQ SN:CUTC000711 LN:1226
-@SQ SN:CUTC000712 LN:373
-@SQ SN:CUTC000713 LN:483
-@SQ SN:CUTC000714 LN:647
-@SQ SN:CUTC000715 LN:1087
-@SQ SN:CUTC000716 LN:1006
-@SQ SN:CUTC000717 LN:1179
-@SQ SN:CUTC000718 LN:1032
-@SQ SN:CUTC000719 LN:605
-@SQ SN:CUTC000720 LN:807
-@SQ SN:CUTC000721 LN:1042
-@SQ SN:CUTC000722 LN:970
-@SQ SN:CUTC000723 LN:831
-@SQ SN:CUTC000724 LN:1140
-@SQ SN:CUTC000725 LN:1293
-@SQ SN:CUTC000726 LN:923
-@SQ SN:CUTC000727 LN:754
-@SQ SN:CUTC000728 LN:1052
-@SQ SN:CUTC000729 LN:680
-@SQ SN:CUTC000730 LN:825
-@SQ SN:CUTC000731 LN:1366
-@SQ SN:CUTC000732 LN:2118
-@SQ SN:CUTC000733 LN:733
-@SQ SN:CUTC000734 LN:1328
-@SQ SN:CUTC000735 LN:1059
-@SQ SN:CUTC000736 LN:1025
-@SQ SN:CUTC000737 LN:964
-@SQ SN:CUTC000738 LN:776
-@SQ SN:CUTC000739 LN:1112
-@SQ SN:CUTC000740 LN:1200
-@SQ SN:CUTC000741 LN:634
-@SQ SN:CUTC000742 LN:840
-@SQ SN:CUTC000743 LN:1103
-@SQ SN:CUTC000744 LN:1714
-@SQ SN:CUTC000745 LN:612
-@SQ SN:CUTC000746 LN:512
-@SQ SN:CUTC000747 LN:1120
-@SQ SN:CUTC000748 LN:957
-@SQ SN:CUTC000749 LN:821
-@SQ SN:CUTC000750 LN:475
-@SQ SN:CUTC000751 LN:957
-@SQ SN:CUTC000752 LN:743
-@SQ SN:CUTC000753 LN:533
-@SQ SN:CUTC000754 LN:1345
-@SQ SN:CUTC000755 LN:476
-@SQ SN:CUTC000756 LN:871
-@SQ SN:CUTC000757 LN:843
-@SQ SN:CUTC000758 LN:513
-@SQ SN:CUTC000759 LN:775
-@SQ SN:CUTC000760 LN:1275
-@SQ SN:CUTC000761 LN:1375
-@SQ SN:CUTC000762 LN:1001
-@SQ SN:CUTC000763 LN:1114
-@SQ SN:CUTC000764 LN:974
-@SQ SN:CUTC000765 LN:398
-@SQ SN:CUTC000766 LN:974
-@SQ SN:CUTC000767 LN:689
-@SQ SN:CUTC000768 LN:853
-@SQ SN:CUTC000769 LN:1029
-@SQ SN:CUTC000770 LN:1400
-@SQ SN:CUTC000771 LN:667
-@SQ SN:CUTC000772 LN:939
-@SQ SN:CUTC000773 LN:1054
-@SQ SN:CUTC000774 LN:779
-@SQ SN:CUTC000775 LN:1247
-@SQ SN:CUTC000776 LN:1848
-@SQ SN:CUTC000777 LN:979
-@SQ SN:CUTC000778 LN:852
-@SQ SN:CUTC000779 LN:695
-@SQ SN:CUTC000780 LN:675
-@SQ SN:CUTC000781 LN:1312
-@SQ SN:CUTC000782 LN:895
-@SQ SN:CUTC000783 LN:451
-@SQ SN:CUTC000784 LN:1063
-@SQ SN:CUTC000785 LN:719
-@SQ SN:CUTC000786 LN:915
-@SQ SN:CUTC000787 LN:1050
-@SQ SN:CUTC000788 LN:1056
-@SQ SN:CUTC000789 LN:657
-@SQ SN:CUTC000790 LN:630
-@SQ SN:CUTC000791 LN:877
-@SQ SN:CUTC000792 LN:1279
-@SQ SN:CUTC000793 LN:875
-@SQ SN:CUTC000794 LN:1121
-@SQ SN:CUTC000795 LN:1009
-@SQ SN:CUTC000796 LN:785
-@SQ SN:CUTC000797 LN:546
-@SQ SN:CUTC000798 LN:578
-@SQ SN:CUTC000799 LN:854
-@SQ SN:CUTC000800 LN:987
-@SQ SN:CUTC000801 LN:604
-@SQ SN:CUTC000802 LN:919
-@SQ SN:CUTC000803 LN:1633
-@SQ SN:CUTC000804 LN:984
-@SQ SN:CUTC000805 LN:559
-@SQ SN:CUTC000806 LN:788
-@SQ SN:CUTC000807 LN:918
-@SQ SN:CUTC000808 LN:846
-@SQ SN:CUTC000809 LN:939
-@SQ SN:CUTC000810 LN:946
-@SQ SN:CUTC000811 LN:874
-@SQ SN:CUTC000812 LN:886
-@SQ SN:CUTC000813 LN:813
-@SQ SN:CUTC000814 LN:1369
-@SQ SN:CUTC000815 LN:827
-@SQ SN:CUTC000816 LN:867
-@SQ SN:CUTC000817 LN:1158
-@SQ SN:CUTC000818 LN:742
-@SQ SN:CUTC000819 LN:831
-@SQ SN:CUTC000820 LN:942
-@SQ SN:CUTC000821 LN:740
-@SQ SN:CUTC000822 LN:1191
-@SQ SN:CUTC000823 LN:2043
-@SQ SN:CUTC000824 LN:1642
-@SQ SN:CUTC000825 LN:1314
-@SQ SN:CUTC000826 LN:723
-@SQ SN:CUTC000827 LN:966
-@SQ SN:CUTC000828 LN:995
-@SQ SN:CUTC000829 LN:1118
-@SQ SN:CUTC000830 LN:546
-@SQ SN:CUTC000831 LN:995
-@SQ SN:CUTC000832 LN:860
-@SQ SN:CUTC000833 LN:970
-@SQ SN:CUTC000834 LN:862
-@SQ SN:CUTC000835 LN:458
-@SQ SN:CUTC000836 LN:774
-@SQ SN:CUTC000837 LN:824
-@SQ SN:CUTC000838 LN:1083
-@SQ SN:CUTC000839 LN:866
-@SQ SN:CUTC000840 LN:959
-@SQ SN:CUTC000841 LN:1275
-@SQ SN:CUTC000842 LN:1271
-@SQ SN:CUTC000843 LN:786
-@SQ SN:CUTC000844 LN:598
-@SQ SN:CUTC000845 LN:643
-@SQ SN:CUTC000846 LN:1263
-@SQ SN:CUTC000847 LN:968
-@SQ SN:CUTC000848 LN:1210
-@SQ SN:CUTC000849 LN:634
-@SQ SN:CUTC000850 LN:1085
-@SQ SN:CUTC000851 LN:792
-@SQ SN:CUTC000852 LN:1049
-@SQ SN:CUTC000853 LN:513
-@SQ SN:CUTC000854 LN:839
-@SQ SN:CUTC000855 LN:912
-@SQ SN:CUTC000856 LN:1127
-@SQ SN:CUTC000857 LN:796
-@SQ SN:CUTC000858 LN:769
-@SQ SN:CUTC000859 LN:455
-@SQ SN:CUTC000860 LN:1067
-@SQ SN:CUTC000861 LN:2816
-@SQ SN:CUTC000862 LN:1486
-@SQ SN:CUTC000863 LN:1037
-@SQ SN:CUTC000864 LN:699
-@SQ SN:CUTC000865 LN:1266
-@SQ SN:CUTC000866 LN:719
-@SQ SN:CUTC000867 LN:762
-@SQ SN:CUTC000868 LN:1182
-@SQ SN:CUTC000869 LN:825
-@SQ SN:CUTC000870 LN:1325
-@SQ SN:CUTC000871 LN:579
-@SQ SN:CUTC000872 LN:851
-@SQ SN:CUTC000873 LN:790
-@SQ SN:CUTC000874 LN:793
-@SQ SN:CUTC000875 LN:2194
-@SQ SN:CUTC000876 LN:1237
-@SQ SN:CUTC000877 LN:856
-@SQ SN:CUTC000878 LN:1438
-@SQ SN:CUTC000879 LN:2190
-@SQ SN:CUTC000880 LN:793
-@SQ SN:CUTC000881 LN:1844
-@SQ SN:CUTC000882 LN:1184
-@SQ SN:CUTC000883 LN:933
-@SQ SN:CUTC000884 LN:1372
-@SQ SN:CUTC000885 LN:373
-@SQ SN:CUTC000886 LN:1141
-@SQ SN:CUTC000887 LN:447
-@SQ SN:CUTC000888 LN:1789
-@SQ SN:CUTC000889 LN:593
-@SQ SN:CUTC000890 LN:1020
-@SQ SN:CUTC000891 LN:904
-@SQ SN:CUTC000892 LN:1417
-@SQ SN:CUTC000893 LN:823
-@SQ SN:CUTC000894 LN:1315
-@SQ SN:CUTC000895 LN:999
-@SQ SN:CUTC000896 LN:716
-@SQ SN:CUTC000897 LN:1244
-@SQ SN:CUTC000898 LN:1059
-@SQ SN:CUTC000899 LN:741
-@SQ SN:CUTC000900 LN:762
-@SQ SN:CUTC000901 LN:589
-@SQ SN:CUTC000902 LN:1199
-@SQ SN:CUTC000903 LN:1895
-@SQ SN:CUTC000904 LN:417
-@SQ SN:CUTC000905 LN:976
-@SQ SN:CUTC000906 LN:1405
-@SQ SN:CUTC000907 LN:1652
-@SQ SN:CUTC000908 LN:1138
-@SQ SN:CUTC000909 LN:1099
-@SQ SN:CUTC000910 LN:777
-@SQ SN:CUTC000911 LN:1057
-@SQ SN:CUTC000912 LN:1065
-@SQ SN:CUTC000913 LN:895
-@SQ SN:CUTC000914 LN:745
-@SQ SN:CUTC000915 LN:605
-@SQ SN:CUTC000916 LN:719
-@SQ SN:CUTC000917 LN:709
-@SQ SN:CUTC000918 LN:799
-@SQ SN:CUTC000919 LN:1057
-@SQ SN:CUTC000920 LN:867
-@SQ SN:CUTC000921 LN:629
-@SQ SN:CUTC000922 LN:780
-@SQ SN:CUTC000923 LN:856
-@SQ SN:CUTC000924 LN:814
-@SQ SN:CUTC000925 LN:786
-@SQ SN:CUTC000926 LN:1193
-@SQ SN:CUTC000927 LN:1094
-@SQ SN:CUTC000928 LN:987
-@SQ SN:CUTC000929 LN:1380
-@SQ SN:CUTC000930 LN:1039
-@SQ SN:CUTC000931 LN:487
-@SQ SN:CUTC000932 LN:1016
-@SQ SN:CUTC000933 LN:1449
-@SQ SN:CUTC000934 LN:2138
-@SQ SN:CUTC000935 LN:581
-@SQ SN:CUTC000936 LN:1100
-@SQ SN:CUTC000937 LN:1035
-@SQ SN:CUTC000938 LN:966
-@SQ SN:CUTC000939 LN:856
-@SQ SN:CUTC000940 LN:802
-@SQ SN:CUTC000941 LN:892
-@SQ SN:CUTC000942 LN:1122
-@SQ SN:CUTC000943 LN:923
-@SQ SN:CUTC000944 LN:1125
-@SQ SN:CUTC000945 LN:600
-@SQ SN:CUTC000946 LN:1718
-@SQ SN:CUTC000947 LN:856
-@SQ SN:CUTC000948 LN:1062
-@SQ SN:CUTC000949 LN:934
-@SQ SN:CUTC000950 LN:1006
-@SQ SN:CUTC000951 LN:1797
-@SQ SN:CUTC000952 LN:1347
-@SQ SN:CUTC000953 LN:930
-@SQ SN:CUTC000954 LN:639
-@SQ SN:CUTC000955 LN:776
-@SQ SN:CUTC000956 LN:807
-@SQ SN:CUTC000957 LN:1050
-@SQ SN:CUTC000958 LN:774
-@SQ SN:CUTC000959 LN:1496
-@SQ SN:CUTC000960 LN:497
-@SQ SN:CUTC000961 LN:1052
-@SQ SN:CUTC000962 LN:949
-@SQ SN:CUTC000963 LN:1105
-@SQ SN:CUTC000964 LN:1040
-@SQ SN:CUTC000965 LN:717
-@SQ SN:CUTC000966 LN:1341
-@SQ SN:CUTC000967 LN:866
-@SQ SN:CUTC000968 LN:925
-@SQ SN:CUTC000969 LN:1527
-@SQ SN:CUTC000970 LN:1437
-@SQ SN:CUTC000971 LN:1144
-@SQ SN:CUTC000972 LN:744
-@SQ SN:CUTC000973 LN:839
-@SQ SN:CUTC000974 LN:872
-@SQ SN:CUTC000975 LN:880
-@SQ SN:CUTC000976 LN:785
-@SQ SN:CUTC000977 LN:919
-@SQ SN:CUTC000978 LN:1153
-@SQ SN:CUTC000979 LN:844
-@SQ SN:CUTC000980 LN:919
-@SQ SN:CUTC000981 LN:902
-@SQ SN:CUTC000982 LN:861
-@SQ SN:CUTC000983 LN:1017
-@SQ SN:CUTC000984 LN:660
-@SQ SN:CUTC000985 LN:922
-@SQ SN:CUTC000986 LN:1119
-@SQ SN:CUTC000987 LN:359
-@SQ SN:CUTC000988 LN:1490
-@SQ SN:CUTC000989 LN:1621
-@SQ SN:CUTC000990 LN:789
-@SQ SN:CUTC000991 LN:1064
-@SQ SN:CUTC000992 LN:687
-@SQ SN:CUTC000993 LN:1092
-@SQ SN:CUTC000994 LN:843
-@SQ SN:CUTC000995 LN:1053
-@SQ SN:CUTC000996 LN:552
-@SQ SN:CUTC000997 LN:881
-@SQ SN:CUTC000998 LN:1067
-@SQ SN:CUTC000999 LN:817
-@SQ SN:CUTC001000 LN:641
-@SQ SN:CUTC001001 LN:901
-@SQ SN:CUTC001002 LN:1005
-@SQ SN:CUTC001003 LN:1411
-@SQ SN:CUTC001004 LN:853
-@SQ SN:CUTC001005 LN:621
-@SQ SN:CUTC001006 LN:1374
-@SQ SN:CUTC001007 LN:1122
-@SQ SN:CUTC001008 LN:1098
-@SQ SN:CUTC001009 LN:819
-@SQ SN:CUTC001010 LN:939
-@SQ SN:CUTC001011 LN:591
-@SQ SN:CUTC001012 LN:580
-@SQ SN:CUTC001013 LN:1057
-@SQ SN:CUTC001014 LN:1551
-@SQ SN:CUTC001015 LN:701
-@SQ SN:CUTC001016 LN:885
-@SQ SN:CUTC001017 LN:1209
-@SQ SN:CUTC001018 LN:650
-@RG ID:mu16_454_mu16 PL:454 LB:mu16 SM:mu16
-@RG ID:upv196_454_upv196 PL:454 LB:upv196 SM:upv196
-CUESOXRA74 0 CUTC000001 1 10 77M1I222M * 0 0 GCCTTTTATAATTATTATAAATTTCGGTTGACCCGACCCCATTAGACAGAGTCTATTAAAGCCCCGTGAAAGCCCGGCAAAACCCAGTAGCGCAGAGATCGGCGAGGGCGAATTTTCGATTGCATTTTCGTTCGTTTCTCTTCTGAATTTCTGTAATCTGTAACGATGTCTCAGACTACTGTCCTCAAGGTTGCTATGTCATGTCAGGGCTGTGTTGGAGCCGCCAAAAGGGTCTTGGGGAAACTGGAAGGTGTTGAAACATTTGACATCGACATAGATGCACAAAAGGTGACTGTGAAA 1BB@@BBHFHHHHHIIHIHFFF@@A@@>9>?999<0////8888>=??@DDDDFFFF???:;;;;AAA???DDDDFFFAAAAFFD8AAFFFC???CFFFFFFFFFFFFFFFFAAAAFFFFCCCF<<<<F?88FFFFFFFFFFFC:::666DAA:::DDFA@@@FFFFFFFFFDDDDDFFF?;;;FFFFFFFDDDDFFFFFFFFFFD666DBBBA>=424226622....666=?==4466444@?4444==?;;;9688<0...:::9<:7988989????984444A@?AABBA=?==; AS:i:260 XS:i:239 XF:i:2 XE:i:3 XN:i:1 RG:Z:mu16_454_mu16
+++ /dev/null
-@HD VN:1.0 GO:none SO:coordinate
-@SQ SN:CUTC000001 LN:810
-@SQ SN:CUTC000002 LN:1213
-@SQ SN:CUTC000003 LN:525
-@SQ SN:CUTC000004 LN:620
-@SQ SN:CUTC000005 LN:550
-@SQ SN:CUTC000006 LN:723
-@SQ SN:CUTC000007 LN:773
-@SQ SN:CUTC000008 LN:667
-@SQ SN:CUTC000009 LN:593
-@SQ SN:CUTC000010 LN:556
-@SQ SN:CUTC000011 LN:519
-@SQ SN:CUTC000012 LN:537
-@SQ SN:CUTC000013 LN:930
-@SQ SN:CUTC000014 LN:944
-@SQ SN:CUTC000015 LN:829
-@SQ SN:CUTC000016 LN:1109
-@SQ SN:CUTC000017 LN:513
-@SQ SN:CUTC000018 LN:1043
-@SQ SN:CUTC000019 LN:884
-@SQ SN:CUTC000020 LN:567
-@SQ SN:CUTC000021 LN:1001
-@SQ SN:CUTC000022 LN:754
-@SQ SN:CUTC000023 LN:1045
-@SQ SN:CUTC000024 LN:1091
-@SQ SN:CUTC000025 LN:606
-@SQ SN:CUTC000026 LN:635
-@SQ SN:CUTC000027 LN:563
-@SQ SN:CUTC000028 LN:830
-@SQ SN:CUTC000029 LN:1456
-@SQ SN:CUTC000030 LN:872
-@SQ SN:CUTC000031 LN:742
-@SQ SN:CUTC000032 LN:553
-@SQ SN:CUTC000033 LN:624
-@SQ SN:CUTC000034 LN:641
-@SQ SN:CUTC000035 LN:695
-@SQ SN:CUTC000036 LN:1519
-@SQ SN:CUTC000037 LN:536
-@SQ SN:CUTC000038 LN:619
-@SQ SN:CUTC000039 LN:643
-@SQ SN:CUTC000040 LN:650
-@SQ SN:CUTC000041 LN:571
-@SQ SN:CUTC000042 LN:1457
-@SQ SN:CUTC000043 LN:618
-@SQ SN:CUTC000044 LN:1261
-@SQ SN:CUTC000045 LN:544
-@SQ SN:CUTC000046 LN:1234
-@SQ SN:CUTC000047 LN:867
-@SQ SN:CUTC000048 LN:792
-@SQ SN:CUTC000049 LN:1076
-@SQ SN:CUTC000050 LN:479
-@SQ SN:CUTC000051 LN:584
-@SQ SN:CUTC000052 LN:841
-@SQ SN:CUTC000053 LN:518
-@SQ SN:CUTC000054 LN:1052
-@SQ SN:CUTC000055 LN:626
-@SQ SN:CUTC000056 LN:773
-@SQ SN:CUTC000057 LN:542
-@SQ SN:CUTC000058 LN:566
-@SQ SN:CUTC000059 LN:931
-@SQ SN:CUTC000060 LN:755
-@SQ SN:CUTC000061 LN:606
-@SQ SN:CUTC000062 LN:640
-@SQ SN:CUTC000063 LN:667
-@SQ SN:CUTC000064 LN:1717
-@SQ SN:CUTC000065 LN:695
-@SQ SN:CUTC000066 LN:1735
-@SQ SN:CUTC000067 LN:474
-@SQ SN:CUTC000068 LN:813
-@SQ SN:CUTC000069 LN:746
-@SQ SN:CUTC000070 LN:1141
-@SQ SN:CUTC000071 LN:624
-@SQ SN:CUTC000072 LN:1097
-@SQ SN:CUTC000073 LN:510
-@SQ SN:CUTC000074 LN:638
-@SQ SN:CUTC000075 LN:682
-@SQ SN:CUTC000076 LN:1043
-@SQ SN:CUTC000077 LN:727
-@SQ SN:CUTC000078 LN:1124
-@SQ SN:CUTC000079 LN:711
-@SQ SN:CUTC000080 LN:578
-@SQ SN:CUTC000081 LN:718
-@SQ SN:CUTC000082 LN:1779
-@SQ SN:CUTC000083 LN:630
-@SQ SN:CUTC000084 LN:850
-@SQ SN:CUTC000085 LN:590
-@SQ SN:CUTC000086 LN:578
-@SQ SN:CUTC000087 LN:727
-@SQ SN:CUTC000088 LN:582
-@SQ SN:CUTC000089 LN:632
-@SQ SN:CUTC000090 LN:792
-@SQ SN:CUTC000091 LN:553
-@SQ SN:CUTC000092 LN:606
-@SQ SN:CUTC000093 LN:1263
-@SQ SN:CUTC000094 LN:1119
-@SQ SN:CUTC000095 LN:1107
-@SQ SN:CUTC000096 LN:1240
-@SQ SN:CUTC000097 LN:578
-@SQ SN:CUTC000098 LN:739
-@SQ SN:CUTC000099 LN:959
-@SQ SN:CUTC000100 LN:701
-@SQ SN:CUTC000101 LN:1047
-@SQ SN:CUTC000102 LN:961
-@SQ SN:CUTC000103 LN:548
-@SQ SN:CUTC000104 LN:579
-@SQ SN:CUTC000105 LN:1376
-@SQ SN:CUTC000106 LN:1202
-@SQ SN:CUTC000107 LN:615
-@SQ SN:CUTC000108 LN:634
-@SQ SN:CUTC000109 LN:742
-@SQ SN:CUTC000110 LN:645
-@SQ SN:CUTC000111 LN:567
-@SQ SN:CUTC000112 LN:715
-@SQ SN:CUTC000113 LN:705
-@SQ SN:CUTC000114 LN:548
-@SQ SN:CUTC000115 LN:555
-@SQ SN:CUTC000116 LN:1370
-@SQ SN:CUTC000117 LN:715
-@SQ SN:CUTC000118 LN:737
-@SQ SN:CUTC000119 LN:595
-@SQ SN:CUTC000120 LN:674
-@SQ SN:CUTC000121 LN:858
-@SQ SN:CUTC000122 LN:571
-@SQ SN:CUTC000123 LN:656
-@SQ SN:CUTC000124 LN:923
-@SQ SN:CUTC000125 LN:487
-@SQ SN:CUTC000126 LN:488
-@SQ SN:CUTC000127 LN:548
-@SQ SN:CUTC000128 LN:547
-@SQ SN:CUTC000129 LN:593
-@SQ SN:CUTC000130 LN:980
-@SQ SN:CUTC000131 LN:605
-@SQ SN:CUTC000132 LN:942
-@SQ SN:CUTC000133 LN:599
-@SQ SN:CUTC000134 LN:755
-@SQ SN:CUTC000135 LN:544
-@SQ SN:CUTC000136 LN:623
-@SQ SN:CUTC000137 LN:680
-@SQ SN:CUTC000138 LN:633
-@SQ SN:CUTC000139 LN:4441
-@SQ SN:CUTC000140 LN:894
-@SQ SN:CUTC000141 LN:688
-@SQ SN:CUTC000142 LN:683
-@SQ SN:CUTC000143 LN:679
-@SQ SN:CUTC000144 LN:698
-@SQ SN:CUTC000145 LN:629
-@SQ SN:CUTC000146 LN:534
-@SQ SN:CUTC000147 LN:643
-@SQ SN:CUTC000148 LN:614
-@SQ SN:CUTC000149 LN:845
-@SQ SN:CUTC000150 LN:652
-@SQ SN:CUTC000151 LN:1332
-@SQ SN:CUTC000152 LN:1091
-@SQ SN:CUTC000153 LN:702
-@SQ SN:CUTC000154 LN:677
-@SQ SN:CUTC000155 LN:902
-@SQ SN:CUTC000156 LN:557
-@SQ SN:CUTC000157 LN:735
-@SQ SN:CUTC000158 LN:940
-@SQ SN:CUTC000159 LN:668
-@SQ SN:CUTC000160 LN:2002
-@SQ SN:CUTC000161 LN:665
-@SQ SN:CUTC000162 LN:907
-@SQ SN:CUTC000163 LN:497
-@SQ SN:CUTC000164 LN:966
-@SQ SN:CUTC000165 LN:645
-@SQ SN:CUTC000166 LN:595
-@SQ SN:CUTC000167 LN:651
-@SQ SN:CUTC000168 LN:410
-@SQ SN:CUTC000169 LN:1122
-@SQ SN:CUTC000170 LN:1021
-@SQ SN:CUTC000171 LN:804
-@SQ SN:CUTC000172 LN:972
-@SQ SN:CUTC000173 LN:1839
-@SQ SN:CUTC000174 LN:647
-@SQ SN:CUTC000175 LN:675
-@SQ SN:CUTC000176 LN:647
-@SQ SN:CUTC000177 LN:1713
-@SQ SN:CUTC000178 LN:911
-@SQ SN:CUTC000179 LN:664
-@SQ SN:CUTC000180 LN:765
-@SQ SN:CUTC000181 LN:950
-@SQ SN:CUTC000182 LN:914
-@SQ SN:CUTC000183 LN:1166
-@SQ SN:CUTC000184 LN:834
-@SQ SN:CUTC000185 LN:812
-@SQ SN:CUTC000186 LN:793
-@SQ SN:CUTC000187 LN:1148
-@SQ SN:CUTC000188 LN:1376
-@SQ SN:CUTC000189 LN:724
-@SQ SN:CUTC000190 LN:762
-@SQ SN:CUTC000191 LN:940
-@SQ SN:CUTC000192 LN:707
-@SQ SN:CUTC000193 LN:1596
-@SQ SN:CUTC000194 LN:557
-@SQ SN:CUTC000195 LN:596
-@SQ SN:CUTC000196 LN:930
-@SQ SN:CUTC000197 LN:1447
-@SQ SN:CUTC000198 LN:566
-@SQ SN:CUTC000199 LN:686
-@SQ SN:CUTC000200 LN:685
-@SQ SN:CUTC000201 LN:579
-@SQ SN:CUTC000202 LN:1282
-@SQ SN:CUTC000203 LN:1601
-@SQ SN:CUTC000204 LN:1034
-@SQ SN:CUTC000205 LN:1370
-@SQ SN:CUTC000206 LN:530
-@SQ SN:CUTC000207 LN:947
-@SQ SN:CUTC000208 LN:655
-@SQ SN:CUTC000209 LN:611
-@SQ SN:CUTC000210 LN:700
-@SQ SN:CUTC000211 LN:940
-@SQ SN:CUTC000212 LN:496
-@SQ SN:CUTC000213 LN:849
-@SQ SN:CUTC000214 LN:713
-@SQ SN:CUTC000215 LN:879
-@SQ SN:CUTC000216 LN:686
-@SQ SN:CUTC000217 LN:655
-@SQ SN:CUTC000218 LN:1139
-@SQ SN:CUTC000219 LN:712
-@SQ SN:CUTC000220 LN:987
-@SQ SN:CUTC000221 LN:581
-@SQ SN:CUTC000222 LN:867
-@SQ SN:CUTC000223 LN:1591
-@SQ SN:CUTC000224 LN:661
-@SQ SN:CUTC000225 LN:1490
-@SQ SN:CUTC000226 LN:1207
-@SQ SN:CUTC000227 LN:785
-@SQ SN:CUTC000228 LN:700
-@SQ SN:CUTC000229 LN:474
-@SQ SN:CUTC000230 LN:539
-@SQ SN:CUTC000231 LN:1095
-@SQ SN:CUTC000232 LN:556
-@SQ SN:CUTC000233 LN:609
-@SQ SN:CUTC000234 LN:1335
-@SQ SN:CUTC000235 LN:566
-@SQ SN:CUTC000236 LN:612
-@SQ SN:CUTC000237 LN:918
-@SQ SN:CUTC000238 LN:572
-@SQ SN:CUTC000239 LN:690
-@SQ SN:CUTC000240 LN:539
-@SQ SN:CUTC000241 LN:1861
-@SQ SN:CUTC000242 LN:730
-@SQ SN:CUTC000243 LN:775
-@SQ SN:CUTC000244 LN:1439
-@SQ SN:CUTC000245 LN:687
-@SQ SN:CUTC000246 LN:754
-@SQ SN:CUTC000247 LN:646
-@SQ SN:CUTC000248 LN:543
-@SQ SN:CUTC000249 LN:1182
-@SQ SN:CUTC000250 LN:650
-@SQ SN:CUTC000251 LN:732
-@SQ SN:CUTC000252 LN:1040
-@SQ SN:CUTC000253 LN:979
-@SQ SN:CUTC000254 LN:1055
-@SQ SN:CUTC000255 LN:971
-@SQ SN:CUTC000256 LN:817
-@SQ SN:CUTC000257 LN:606
-@SQ SN:CUTC000258 LN:624
-@SQ SN:CUTC000259 LN:516
-@SQ SN:CUTC000260 LN:987
-@SQ SN:CUTC000261 LN:1071
-@SQ SN:CUTC000262 LN:588
-@SQ SN:CUTC000263 LN:1389
-@SQ SN:CUTC000264 LN:672
-@SQ SN:CUTC000265 LN:954
-@SQ SN:CUTC000266 LN:1072
-@SQ SN:CUTC000267 LN:713
-@SQ SN:CUTC000268 LN:1192
-@SQ SN:CUTC000269 LN:540
-@SQ SN:CUTC000270 LN:592
-@SQ SN:CUTC000271 LN:901
-@SQ SN:CUTC000272 LN:420
-@SQ SN:CUTC000273 LN:670
-@SQ SN:CUTC000274 LN:1088
-@SQ SN:CUTC000275 LN:786
-@SQ SN:CUTC000276 LN:846
-@SQ SN:CUTC000277 LN:839
-@SQ SN:CUTC000278 LN:901
-@SQ SN:CUTC000279 LN:3005
-@SQ SN:CUTC000280 LN:727
-@SQ SN:CUTC000281 LN:982
-@SQ SN:CUTC000282 LN:553
-@SQ SN:CUTC000283 LN:513
-@SQ SN:CUTC000284 LN:666
-@SQ SN:CUTC000285 LN:480
-@SQ SN:CUTC000286 LN:726
-@SQ SN:CUTC000287 LN:1225
-@SQ SN:CUTC000288 LN:783
-@SQ SN:CUTC000289 LN:802
-@SQ SN:CUTC000290 LN:1190
-@SQ SN:CUTC000291 LN:1323
-@SQ SN:CUTC000292 LN:700
-@SQ SN:CUTC000293 LN:748
-@SQ SN:CUTC000294 LN:840
-@SQ SN:CUTC000295 LN:447
-@SQ SN:CUTC000296 LN:475
-@SQ SN:CUTC000297 LN:693
-@SQ SN:CUTC000298 LN:838
-@SQ SN:CUTC000299 LN:933
-@SQ SN:CUTC000300 LN:1175
-@SQ SN:CUTC000301 LN:795
-@SQ SN:CUTC000302 LN:514
-@SQ SN:CUTC000303 LN:650
-@SQ SN:CUTC000304 LN:1015
-@SQ SN:CUTC000305 LN:869
-@SQ SN:CUTC000306 LN:1218
-@SQ SN:CUTC000307 LN:943
-@SQ SN:CUTC000308 LN:879
-@SQ SN:CUTC000309 LN:758
-@SQ SN:CUTC000310 LN:895
-@SQ SN:CUTC000311 LN:1060
-@SQ SN:CUTC000312 LN:1414
-@SQ SN:CUTC000313 LN:1841
-@SQ SN:CUTC000314 LN:1040
-@SQ SN:CUTC000315 LN:769
-@SQ SN:CUTC000316 LN:1400
-@SQ SN:CUTC000317 LN:1097
-@SQ SN:CUTC000318 LN:953
-@SQ SN:CUTC000319 LN:793
-@SQ SN:CUTC000320 LN:840
-@SQ SN:CUTC000321 LN:734
-@SQ SN:CUTC000322 LN:528
-@SQ SN:CUTC000323 LN:492
-@SQ SN:CUTC000324 LN:737
-@SQ SN:CUTC000325 LN:681
-@SQ SN:CUTC000326 LN:446
-@SQ SN:CUTC000327 LN:836
-@SQ SN:CUTC000328 LN:745
-@SQ SN:CUTC000329 LN:1514
-@SQ SN:CUTC000330 LN:773
-@SQ SN:CUTC000331 LN:608
-@SQ SN:CUTC000332 LN:814
-@SQ SN:CUTC000333 LN:655
-@SQ SN:CUTC000334 LN:697
-@SQ SN:CUTC000335 LN:818
-@SQ SN:CUTC000336 LN:650
-@SQ SN:CUTC000337 LN:1787
-@SQ SN:CUTC000338 LN:695
-@SQ SN:CUTC000339 LN:1638
-@SQ SN:CUTC000340 LN:903
-@SQ SN:CUTC000341 LN:638
-@SQ SN:CUTC000342 LN:659
-@SQ SN:CUTC000343 LN:1335
-@SQ SN:CUTC000344 LN:775
-@SQ SN:CUTC000345 LN:834
-@SQ SN:CUTC000346 LN:1356
-@SQ SN:CUTC000347 LN:1566
-@SQ SN:CUTC000348 LN:1240
-@SQ SN:CUTC000349 LN:810
-@SQ SN:CUTC000350 LN:885
-@SQ SN:CUTC000351 LN:532
-@SQ SN:CUTC000352 LN:434
-@SQ SN:CUTC000353 LN:705
-@SQ SN:CUTC000354 LN:740
-@SQ SN:CUTC000355 LN:833
-@SQ SN:CUTC000356 LN:680
-@SQ SN:CUTC000357 LN:1362
-@SQ SN:CUTC000358 LN:621
-@SQ SN:CUTC000359 LN:1108
-@SQ SN:CUTC000360 LN:721
-@SQ SN:CUTC000361 LN:709
-@SQ SN:CUTC000362 LN:908
-@SQ SN:CUTC000363 LN:1044
-@SQ SN:CUTC000364 LN:701
-@SQ SN:CUTC000365 LN:798
-@SQ SN:CUTC000366 LN:550
-@SQ SN:CUTC000367 LN:1007
-@SQ SN:CUTC000368 LN:1355
-@SQ SN:CUTC000369 LN:469
-@SQ SN:CUTC000370 LN:629
-@SQ SN:CUTC000371 LN:1065
-@SQ SN:CUTC000372 LN:415
-@SQ SN:CUTC000373 LN:977
-@SQ SN:CUTC000374 LN:547
-@SQ SN:CUTC000375 LN:699
-@SQ SN:CUTC000376 LN:1150
-@SQ SN:CUTC000377 LN:576
-@SQ SN:CUTC000378 LN:626
-@SQ SN:CUTC000379 LN:1326
-@SQ SN:CUTC000380 LN:621
-@SQ SN:CUTC000381 LN:900
-@SQ SN:CUTC000382 LN:1573
-@SQ SN:CUTC000383 LN:634
-@SQ SN:CUTC000384 LN:1186
-@SQ SN:CUTC000385 LN:623
-@SQ SN:CUTC000386 LN:1082
-@SQ SN:CUTC000387 LN:948
-@SQ SN:CUTC000388 LN:912
-@SQ SN:CUTC000389 LN:1564
-@SQ SN:CUTC000390 LN:1046
-@SQ SN:CUTC000391 LN:1302
-@SQ SN:CUTC000392 LN:1070
-@SQ SN:CUTC000393 LN:519
-@SQ SN:CUTC000394 LN:558
-@SQ SN:CUTC000395 LN:802
-@SQ SN:CUTC000396 LN:592
-@SQ SN:CUTC000397 LN:903
-@SQ SN:CUTC000398 LN:926
-@SQ SN:CUTC000399 LN:1054
-@SQ SN:CUTC000400 LN:626
-@SQ SN:CUTC000401 LN:1078
-@SQ SN:CUTC000402 LN:1369
-@SQ SN:CUTC000403 LN:1616
-@SQ SN:CUTC000404 LN:608
-@SQ SN:CUTC000405 LN:1418
-@SQ SN:CUTC000406 LN:583
-@SQ SN:CUTC000407 LN:658
-@SQ SN:CUTC000408 LN:1265
-@SQ SN:CUTC000409 LN:745
-@SQ SN:CUTC000410 LN:690
-@SQ SN:CUTC000411 LN:609
-@SQ SN:CUTC000412 LN:1061
-@SQ SN:CUTC000413 LN:899
-@SQ SN:CUTC000414 LN:925
-@SQ SN:CUTC000415 LN:552
-@SQ SN:CUTC000416 LN:559
-@SQ SN:CUTC000417 LN:964
-@SQ SN:CUTC000418 LN:855
-@SQ SN:CUTC000419 LN:1045
-@SQ SN:CUTC000420 LN:1479
-@SQ SN:CUTC000421 LN:537
-@SQ SN:CUTC000422 LN:1080
-@SQ SN:CUTC000423 LN:792
-@SQ SN:CUTC000424 LN:1201
-@SQ SN:CUTC000425 LN:1332
-@SQ SN:CUTC000426 LN:929
-@SQ SN:CUTC000427 LN:606
-@SQ SN:CUTC000428 LN:727
-@SQ SN:CUTC000429 LN:1085
-@SQ SN:CUTC000430 LN:504
-@SQ SN:CUTC000431 LN:1231
-@SQ SN:CUTC000432 LN:859
-@SQ SN:CUTC000433 LN:728
-@SQ SN:CUTC000434 LN:553
-@SQ SN:CUTC000435 LN:1124
-@SQ SN:CUTC000436 LN:1430
-@SQ SN:CUTC000437 LN:1770
-@SQ SN:CUTC000438 LN:831
-@SQ SN:CUTC000439 LN:1062
-@SQ SN:CUTC000440 LN:945
-@SQ SN:CUTC000441 LN:1082
-@SQ SN:CUTC000442 LN:2057
-@SQ SN:CUTC000443 LN:1425
-@SQ SN:CUTC000444 LN:1133
-@SQ SN:CUTC000445 LN:1478
-@SQ SN:CUTC000446 LN:755
-@SQ SN:CUTC000447 LN:548
-@SQ SN:CUTC000448 LN:1087
-@SQ SN:CUTC000449 LN:594
-@SQ SN:CUTC000450 LN:1012
-@SQ SN:CUTC000451 LN:1777
-@SQ SN:CUTC000452 LN:631
-@SQ SN:CUTC000453 LN:914
-@SQ SN:CUTC000454 LN:1701
-@SQ SN:CUTC000455 LN:869
-@SQ SN:CUTC000456 LN:1024
-@SQ SN:CUTC000457 LN:802
-@SQ SN:CUTC000458 LN:663
-@SQ SN:CUTC000459 LN:951
-@SQ SN:CUTC000460 LN:739
-@SQ SN:CUTC000461 LN:658
-@SQ SN:CUTC000462 LN:1055
-@SQ SN:CUTC000463 LN:807
-@SQ SN:CUTC000464 LN:1157
-@SQ SN:CUTC000465 LN:1340
-@SQ SN:CUTC000466 LN:1016
-@SQ SN:CUTC000467 LN:646
-@SQ SN:CUTC000468 LN:998
-@SQ SN:CUTC000469 LN:687
-@SQ SN:CUTC000470 LN:919
-@SQ SN:CUTC000471 LN:1062
-@SQ SN:CUTC000472 LN:1454
-@SQ SN:CUTC000473 LN:875
-@SQ SN:CUTC000474 LN:774
-@SQ SN:CUTC000475 LN:671
-@SQ SN:CUTC000476 LN:880
-@SQ SN:CUTC000477 LN:1297
-@SQ SN:CUTC000478 LN:722
-@SQ SN:CUTC000479 LN:985
-@SQ SN:CUTC000480 LN:797
-@SQ SN:CUTC000481 LN:741
-@SQ SN:CUTC000482 LN:598
-@SQ SN:CUTC000483 LN:841
-@SQ SN:CUTC000484 LN:1193
-@SQ SN:CUTC000485 LN:856
-@SQ SN:CUTC000486 LN:1020
-@SQ SN:CUTC000487 LN:984
-@SQ SN:CUTC000488 LN:1145
-@SQ SN:CUTC000489 LN:862
-@SQ SN:CUTC000490 LN:558
-@SQ SN:CUTC000491 LN:484
-@SQ SN:CUTC000492 LN:1097
-@SQ SN:CUTC000493 LN:763
-@SQ SN:CUTC000494 LN:2369
-@SQ SN:CUTC000495 LN:993
-@SQ SN:CUTC000496 LN:716
-@SQ SN:CUTC000497 LN:590
-@SQ SN:CUTC000498 LN:992
-@SQ SN:CUTC000499 LN:1223
-@SQ SN:CUTC000500 LN:956
-@SQ SN:CUTC000501 LN:761
-@SQ SN:CUTC000502 LN:1533
-@SQ SN:CUTC000503 LN:951
-@SQ SN:CUTC000504 LN:1599
-@SQ SN:CUTC000505 LN:1393
-@SQ SN:CUTC000506 LN:1064
-@SQ SN:CUTC000507 LN:1198
-@SQ SN:CUTC000508 LN:650
-@SQ SN:CUTC000509 LN:1190
-@SQ SN:CUTC000510 LN:1168
-@SQ SN:CUTC000511 LN:926
-@SQ SN:CUTC000512 LN:1528
-@SQ SN:CUTC000513 LN:516
-@SQ SN:CUTC000514 LN:886
-@SQ SN:CUTC000515 LN:779
-@SQ SN:CUTC000516 LN:955
-@SQ SN:CUTC000517 LN:1795
-@SQ SN:CUTC000518 LN:1028
-@SQ SN:CUTC000519 LN:799
-@SQ SN:CUTC000520 LN:1170
-@SQ SN:CUTC000521 LN:1348
-@SQ SN:CUTC000522 LN:611
-@SQ SN:CUTC000523 LN:795
-@SQ SN:CUTC000524 LN:767
-@SQ SN:CUTC000525 LN:679
-@SQ SN:CUTC000526 LN:1216
-@SQ SN:CUTC000527 LN:1105
-@SQ SN:CUTC000528 LN:757
-@SQ SN:CUTC000529 LN:951
-@SQ SN:CUTC000530 LN:446
-@SQ SN:CUTC000531 LN:759
-@SQ SN:CUTC000532 LN:751
-@SQ SN:CUTC000533 LN:629
-@SQ SN:CUTC000534 LN:903
-@SQ SN:CUTC000535 LN:652
-@SQ SN:CUTC000536 LN:584
-@SQ SN:CUTC000537 LN:785
-@SQ SN:CUTC000538 LN:3820
-@SQ SN:CUTC000539 LN:582
-@SQ SN:CUTC000540 LN:980
-@SQ SN:CUTC000541 LN:613
-@SQ SN:CUTC000542 LN:978
-@SQ SN:CUTC000543 LN:1717
-@SQ SN:CUTC000544 LN:1069
-@SQ SN:CUTC000545 LN:770
-@SQ SN:CUTC000546 LN:1249
-@SQ SN:CUTC000547 LN:940
-@SQ SN:CUTC000548 LN:1018
-@SQ SN:CUTC000549 LN:962
-@SQ SN:CUTC000550 LN:768
-@SQ SN:CUTC000551 LN:576
-@SQ SN:CUTC000552 LN:687
-@SQ SN:CUTC000553 LN:1354
-@SQ SN:CUTC000554 LN:664
-@SQ SN:CUTC000555 LN:847
-@SQ SN:CUTC000556 LN:1580
-@SQ SN:CUTC000557 LN:950
-@SQ SN:CUTC000558 LN:877
-@SQ SN:CUTC000559 LN:857
-@SQ SN:CUTC000560 LN:802
-@SQ SN:CUTC000561 LN:1022
-@SQ SN:CUTC000562 LN:1082
-@SQ SN:CUTC000563 LN:623
-@SQ SN:CUTC000564 LN:1403
-@SQ SN:CUTC000565 LN:1766
-@SQ SN:CUTC000566 LN:891
-@SQ SN:CUTC000567 LN:864
-@SQ SN:CUTC000568 LN:1010
-@SQ SN:CUTC000569 LN:510
-@SQ SN:CUTC000570 LN:812
-@SQ SN:CUTC000571 LN:582
-@SQ SN:CUTC000572 LN:677
-@SQ SN:CUTC000573 LN:899
-@SQ SN:CUTC000574 LN:1121
-@SQ SN:CUTC000575 LN:601
-@SQ SN:CUTC000576 LN:1757
-@SQ SN:CUTC000577 LN:1015
-@SQ SN:CUTC000578 LN:1147
-@SQ SN:CUTC000579 LN:692
-@SQ SN:CUTC000580 LN:638
-@SQ SN:CUTC000581 LN:504
-@SQ SN:CUTC000582 LN:945
-@SQ SN:CUTC000583 LN:512
-@SQ SN:CUTC000584 LN:761
-@SQ SN:CUTC000585 LN:957
-@SQ SN:CUTC000586 LN:611
-@SQ SN:CUTC000587 LN:776
-@SQ SN:CUTC000588 LN:658
-@SQ SN:CUTC000589 LN:727
-@SQ SN:CUTC000590 LN:833
-@SQ SN:CUTC000591 LN:488
-@SQ SN:CUTC000592 LN:774
-@SQ SN:CUTC000593 LN:784
-@SQ SN:CUTC000594 LN:835
-@SQ SN:CUTC000595 LN:752
-@SQ SN:CUTC000596 LN:523
-@SQ SN:CUTC000597 LN:468
-@SQ SN:CUTC000598 LN:1021
-@SQ SN:CUTC000599 LN:982
-@SQ SN:CUTC000600 LN:671
-@SQ SN:CUTC000601 LN:1063
-@SQ SN:CUTC000602 LN:482
-@SQ SN:CUTC000603 LN:1087
-@SQ SN:CUTC000604 LN:1043
-@SQ SN:CUTC000605 LN:1176
-@SQ SN:CUTC000606 LN:897
-@SQ SN:CUTC000607 LN:764
-@SQ SN:CUTC000608 LN:1724
-@SQ SN:CUTC000609 LN:579
-@SQ SN:CUTC000610 LN:657
-@SQ SN:CUTC000611 LN:627
-@SQ SN:CUTC000612 LN:1110
-@SQ SN:CUTC000613 LN:1065
-@SQ SN:CUTC000614 LN:765
-@SQ SN:CUTC000615 LN:813
-@SQ SN:CUTC000616 LN:1510
-@SQ SN:CUTC000617 LN:906
-@SQ SN:CUTC000618 LN:1733
-@SQ SN:CUTC000619 LN:490
-@SQ SN:CUTC000620 LN:841
-@SQ SN:CUTC000621 LN:1331
-@SQ SN:CUTC000622 LN:1082
-@SQ SN:CUTC000623 LN:1310
-@SQ SN:CUTC000624 LN:977
-@SQ SN:CUTC000625 LN:1122
-@SQ SN:CUTC000626 LN:613
-@SQ SN:CUTC000627 LN:486
-@SQ SN:CUTC000628 LN:1411
-@SQ SN:CUTC000629 LN:1005
-@SQ SN:CUTC000630 LN:1090
-@SQ SN:CUTC000631 LN:715
-@SQ SN:CUTC000632 LN:1475
-@SQ SN:CUTC000633 LN:823
-@SQ SN:CUTC000634 LN:949
-@SQ SN:CUTC000635 LN:1125
-@SQ SN:CUTC000636 LN:904
-@SQ SN:CUTC000637 LN:472
-@SQ SN:CUTC000638 LN:668
-@SQ SN:CUTC000639 LN:788
-@SQ SN:CUTC000640 LN:1314
-@SQ SN:CUTC000641 LN:920
-@SQ SN:CUTC000642 LN:952
-@SQ SN:CUTC000643 LN:859
-@SQ SN:CUTC000644 LN:1001
-@SQ SN:CUTC000645 LN:1386
-@SQ SN:CUTC000646 LN:1109
-@SQ SN:CUTC000647 LN:708
-@SQ SN:CUTC000648 LN:1011
-@SQ SN:CUTC000649 LN:1061
-@SQ SN:CUTC000650 LN:1213
-@SQ SN:CUTC000651 LN:633
-@SQ SN:CUTC000652 LN:667
-@SQ SN:CUTC000653 LN:1364
-@SQ SN:CUTC000654 LN:593
-@SQ SN:CUTC000655 LN:1099
-@SQ SN:CUTC000656 LN:1155
-@SQ SN:CUTC000657 LN:482
-@SQ SN:CUTC000658 LN:1122
-@SQ SN:CUTC000659 LN:1060
-@SQ SN:CUTC000660 LN:558
-@SQ SN:CUTC000661 LN:957
-@SQ SN:CUTC000662 LN:851
-@SQ SN:CUTC000663 LN:1100
-@SQ SN:CUTC000664 LN:868
-@SQ SN:CUTC000665 LN:1147
-@SQ SN:CUTC000666 LN:572
-@SQ SN:CUTC000667 LN:1032
-@SQ SN:CUTC000668 LN:703
-@SQ SN:CUTC000669 LN:1411
-@SQ SN:CUTC000670 LN:1938
-@SQ SN:CUTC000671 LN:1586
-@SQ SN:CUTC000672 LN:1165
-@SQ SN:CUTC000673 LN:897
-@SQ SN:CUTC000674 LN:845
-@SQ SN:CUTC000675 LN:876
-@SQ SN:CUTC000676 LN:756
-@SQ SN:CUTC000677 LN:1253
-@SQ SN:CUTC000678 LN:812
-@SQ SN:CUTC000679 LN:581
-@SQ SN:CUTC000680 LN:753
-@SQ SN:CUTC000681 LN:1146
-@SQ SN:CUTC000682 LN:925
-@SQ SN:CUTC000683 LN:819
-@SQ SN:CUTC000684 LN:913
-@SQ SN:CUTC000685 LN:946
-@SQ SN:CUTC000686 LN:1112
-@SQ SN:CUTC000687 LN:1056
-@SQ SN:CUTC000688 LN:941
-@SQ SN:CUTC000689 LN:892
-@SQ SN:CUTC000690 LN:780
-@SQ SN:CUTC000691 LN:587
-@SQ SN:CUTC000692 LN:696
-@SQ SN:CUTC000693 LN:810
-@SQ SN:CUTC000694 LN:1198
-@SQ SN:CUTC000695 LN:1089
-@SQ SN:CUTC000696 LN:596
-@SQ SN:CUTC000697 LN:1100
-@SQ SN:CUTC000698 LN:639
-@SQ SN:CUTC000699 LN:1254
-@SQ SN:CUTC000700 LN:709
-@SQ SN:CUTC000701 LN:797
-@SQ SN:CUTC000702 LN:915
-@SQ SN:CUTC000703 LN:2222
-@SQ SN:CUTC000704 LN:772
-@SQ SN:CUTC000705 LN:1080
-@SQ SN:CUTC000706 LN:1421
-@SQ SN:CUTC000707 LN:1369
-@SQ SN:CUTC000708 LN:475
-@SQ SN:CUTC000709 LN:775
-@SQ SN:CUTC000710 LN:1192
-@SQ SN:CUTC000711 LN:1226
-@SQ SN:CUTC000712 LN:373
-@SQ SN:CUTC000713 LN:483
-@SQ SN:CUTC000714 LN:647
-@SQ SN:CUTC000715 LN:1087
-@SQ SN:CUTC000716 LN:1006
-@SQ SN:CUTC000717 LN:1179
-@SQ SN:CUTC000718 LN:1032
-@SQ SN:CUTC000719 LN:605
-@SQ SN:CUTC000720 LN:807
-@SQ SN:CUTC000721 LN:1042
-@SQ SN:CUTC000722 LN:970
-@SQ SN:CUTC000723 LN:831
-@SQ SN:CUTC000724 LN:1140
-@SQ SN:CUTC000725 LN:1293
-@SQ SN:CUTC000726 LN:923
-@SQ SN:CUTC000727 LN:754
-@SQ SN:CUTC000728 LN:1052
-@SQ SN:CUTC000729 LN:680
-@SQ SN:CUTC000730 LN:825
-@SQ SN:CUTC000731 LN:1366
-@SQ SN:CUTC000732 LN:2118
-@SQ SN:CUTC000733 LN:733
-@SQ SN:CUTC000734 LN:1328
-@SQ SN:CUTC000735 LN:1059
-@SQ SN:CUTC000736 LN:1025
-@SQ SN:CUTC000737 LN:964
-@SQ SN:CUTC000738 LN:776
-@SQ SN:CUTC000739 LN:1112
-@SQ SN:CUTC000740 LN:1200
-@SQ SN:CUTC000741 LN:634
-@SQ SN:CUTC000742 LN:840
-@SQ SN:CUTC000743 LN:1103
-@SQ SN:CUTC000744 LN:1714
-@SQ SN:CUTC000745 LN:612
-@SQ SN:CUTC000746 LN:512
-@SQ SN:CUTC000747 LN:1120
-@SQ SN:CUTC000748 LN:957
-@SQ SN:CUTC000749 LN:821
-@SQ SN:CUTC000750 LN:475
-@SQ SN:CUTC000751 LN:957
-@SQ SN:CUTC000752 LN:743
-@SQ SN:CUTC000753 LN:533
-@SQ SN:CUTC000754 LN:1345
-@SQ SN:CUTC000755 LN:476
-@SQ SN:CUTC000756 LN:871
-@SQ SN:CUTC000757 LN:843
-@SQ SN:CUTC000758 LN:513
-@SQ SN:CUTC000759 LN:775
-@SQ SN:CUTC000760 LN:1275
-@SQ SN:CUTC000761 LN:1375
-@SQ SN:CUTC000762 LN:1001
-@SQ SN:CUTC000763 LN:1114
-@SQ SN:CUTC000764 LN:974
-@SQ SN:CUTC000765 LN:398
-@SQ SN:CUTC000766 LN:974
-@SQ SN:CUTC000767 LN:689
-@SQ SN:CUTC000768 LN:853
-@SQ SN:CUTC000769 LN:1029
-@SQ SN:CUTC000770 LN:1400
-@SQ SN:CUTC000771 LN:667
-@SQ SN:CUTC000772 LN:939
-@SQ SN:CUTC000773 LN:1054
-@SQ SN:CUTC000774 LN:779
-@SQ SN:CUTC000775 LN:1247
-@SQ SN:CUTC000776 LN:1848
-@SQ SN:CUTC000777 LN:979
-@SQ SN:CUTC000778 LN:852
-@SQ SN:CUTC000779 LN:695
-@SQ SN:CUTC000780 LN:675
-@SQ SN:CUTC000781 LN:1312
-@SQ SN:CUTC000782 LN:895
-@SQ SN:CUTC000783 LN:451
-@SQ SN:CUTC000784 LN:1063
-@SQ SN:CUTC000785 LN:719
-@SQ SN:CUTC000786 LN:915
-@SQ SN:CUTC000787 LN:1050
-@SQ SN:CUTC000788 LN:1056
-@SQ SN:CUTC000789 LN:657
-@SQ SN:CUTC000790 LN:630
-@SQ SN:CUTC000791 LN:877
-@SQ SN:CUTC000792 LN:1279
-@SQ SN:CUTC000793 LN:875
-@SQ SN:CUTC000794 LN:1121
-@SQ SN:CUTC000795 LN:1009
-@SQ SN:CUTC000796 LN:785
-@SQ SN:CUTC000797 LN:546
-@SQ SN:CUTC000798 LN:578
-@SQ SN:CUTC000799 LN:854
-@SQ SN:CUTC000800 LN:987
-@SQ SN:CUTC000801 LN:604
-@SQ SN:CUTC000802 LN:919
-@SQ SN:CUTC000803 LN:1633
-@SQ SN:CUTC000804 LN:984
-@SQ SN:CUTC000805 LN:559
-@SQ SN:CUTC000806 LN:788
-@SQ SN:CUTC000807 LN:918
-@SQ SN:CUTC000808 LN:846
-@SQ SN:CUTC000809 LN:939
-@SQ SN:CUTC000810 LN:946
-@SQ SN:CUTC000811 LN:874
-@SQ SN:CUTC000812 LN:886
-@SQ SN:CUTC000813 LN:813
-@SQ SN:CUTC000814 LN:1369
-@SQ SN:CUTC000815 LN:827
-@SQ SN:CUTC000816 LN:867
-@SQ SN:CUTC000817 LN:1158
-@SQ SN:CUTC000818 LN:742
-@SQ SN:CUTC000819 LN:831
-@SQ SN:CUTC000820 LN:942
-@SQ SN:CUTC000821 LN:740
-@SQ SN:CUTC000822 LN:1191
-@SQ SN:CUTC000823 LN:2043
-@SQ SN:CUTC000824 LN:1642
-@SQ SN:CUTC000825 LN:1314
-@SQ SN:CUTC000826 LN:723
-@SQ SN:CUTC000827 LN:966
-@SQ SN:CUTC000828 LN:995
-@SQ SN:CUTC000829 LN:1118
-@SQ SN:CUTC000830 LN:546
-@SQ SN:CUTC000831 LN:995
-@SQ SN:CUTC000832 LN:860
-@SQ SN:CUTC000833 LN:970
-@SQ SN:CUTC000834 LN:862
-@SQ SN:CUTC000835 LN:458
-@SQ SN:CUTC000836 LN:774
-@SQ SN:CUTC000837 LN:824
-@SQ SN:CUTC000838 LN:1083
-@SQ SN:CUTC000839 LN:866
-@SQ SN:CUTC000840 LN:959
-@SQ SN:CUTC000841 LN:1275
-@SQ SN:CUTC000842 LN:1271
-@SQ SN:CUTC000843 LN:786
-@SQ SN:CUTC000844 LN:598
-@SQ SN:CUTC000845 LN:643
-@SQ SN:CUTC000846 LN:1263
-@SQ SN:CUTC000847 LN:968
-@SQ SN:CUTC000848 LN:1210
-@SQ SN:CUTC000849 LN:634
-@SQ SN:CUTC000850 LN:1085
-@SQ SN:CUTC000851 LN:792
-@SQ SN:CUTC000852 LN:1049
-@SQ SN:CUTC000853 LN:513
-@SQ SN:CUTC000854 LN:839
-@SQ SN:CUTC000855 LN:912
-@SQ SN:CUTC000856 LN:1127
-@SQ SN:CUTC000857 LN:796
-@SQ SN:CUTC000858 LN:769
-@SQ SN:CUTC000859 LN:455
-@SQ SN:CUTC000860 LN:1067
-@SQ SN:CUTC000861 LN:2816
-@SQ SN:CUTC000862 LN:1486
-@SQ SN:CUTC000863 LN:1037
-@SQ SN:CUTC000864 LN:699
-@SQ SN:CUTC000865 LN:1266
-@SQ SN:CUTC000866 LN:719
-@SQ SN:CUTC000867 LN:762
-@SQ SN:CUTC000868 LN:1182
-@SQ SN:CUTC000869 LN:825
-@SQ SN:CUTC000870 LN:1325
-@SQ SN:CUTC000871 LN:579
-@SQ SN:CUTC000872 LN:851
-@SQ SN:CUTC000873 LN:790
-@SQ SN:CUTC000874 LN:793
-@SQ SN:CUTC000875 LN:2194
-@SQ SN:CUTC000876 LN:1237
-@SQ SN:CUTC000877 LN:856
-@SQ SN:CUTC000878 LN:1438
-@SQ SN:CUTC000879 LN:2190
-@SQ SN:CUTC000880 LN:793
-@SQ SN:CUTC000881 LN:1844
-@SQ SN:CUTC000882 LN:1184
-@SQ SN:CUTC000883 LN:933
-@SQ SN:CUTC000884 LN:1372
-@SQ SN:CUTC000885 LN:373
-@SQ SN:CUTC000886 LN:1141
-@SQ SN:CUTC000887 LN:447
-@SQ SN:CUTC000888 LN:1789
-@SQ SN:CUTC000889 LN:593
-@SQ SN:CUTC000890 LN:1020
-@SQ SN:CUTC000891 LN:904
-@SQ SN:CUTC000892 LN:1417
-@SQ SN:CUTC000893 LN:823
-@SQ SN:CUTC000894 LN:1315
-@SQ SN:CUTC000895 LN:999
-@SQ SN:CUTC000896 LN:716
-@SQ SN:CUTC000897 LN:1244
-@SQ SN:CUTC000898 LN:1059
-@SQ SN:CUTC000899 LN:741
-@SQ SN:CUTC000900 LN:762
-@SQ SN:CUTC000901 LN:589
-@SQ SN:CUTC000902 LN:1199
-@SQ SN:CUTC000903 LN:1895
-@SQ SN:CUTC000904 LN:417
-@SQ SN:CUTC000905 LN:976
-@SQ SN:CUTC000906 LN:1405
-@SQ SN:CUTC000907 LN:1652
-@SQ SN:CUTC000908 LN:1138
-@SQ SN:CUTC000909 LN:1099
-@SQ SN:CUTC000910 LN:777
-@SQ SN:CUTC000911 LN:1057
-@SQ SN:CUTC000912 LN:1065
-@SQ SN:CUTC000913 LN:895
-@SQ SN:CUTC000914 LN:745
-@SQ SN:CUTC000915 LN:605
-@SQ SN:CUTC000916 LN:719
-@SQ SN:CUTC000917 LN:709
-@SQ SN:CUTC000918 LN:799
-@SQ SN:CUTC000919 LN:1057
-@SQ SN:CUTC000920 LN:867
-@SQ SN:CUTC000921 LN:629
-@SQ SN:CUTC000922 LN:780
-@SQ SN:CUTC000923 LN:856
-@SQ SN:CUTC000924 LN:814
-@SQ SN:CUTC000925 LN:786
-@SQ SN:CUTC000926 LN:1193
-@SQ SN:CUTC000927 LN:1094
-@SQ SN:CUTC000928 LN:987
-@SQ SN:CUTC000929 LN:1380
-@SQ SN:CUTC000930 LN:1039
-@SQ SN:CUTC000931 LN:487
-@SQ SN:CUTC000932 LN:1016
-@SQ SN:CUTC000933 LN:1449
-@SQ SN:CUTC000934 LN:2138
-@SQ SN:CUTC000935 LN:581
-@SQ SN:CUTC000936 LN:1100
-@SQ SN:CUTC000937 LN:1035
-@SQ SN:CUTC000938 LN:966
-@SQ SN:CUTC000939 LN:856
-@SQ SN:CUTC000940 LN:802
-@SQ SN:CUTC000941 LN:892
-@SQ SN:CUTC000942 LN:1122
-@SQ SN:CUTC000943 LN:923
-@SQ SN:CUTC000944 LN:1125
-@SQ SN:CUTC000945 LN:600
-@SQ SN:CUTC000946 LN:1718
-@SQ SN:CUTC000947 LN:856
-@SQ SN:CUTC000948 LN:1062
-@SQ SN:CUTC000949 LN:934
-@SQ SN:CUTC000950 LN:1006
-@SQ SN:CUTC000951 LN:1797
-@SQ SN:CUTC000952 LN:1347
-@SQ SN:CUTC000953 LN:930
-@SQ SN:CUTC000954 LN:639
-@SQ SN:CUTC000955 LN:776
-@SQ SN:CUTC000956 LN:807
-@SQ SN:CUTC000957 LN:1050
-@SQ SN:CUTC000958 LN:774
-@SQ SN:CUTC000959 LN:1496
-@SQ SN:CUTC000960 LN:497
-@SQ SN:CUTC000961 LN:1052
-@SQ SN:CUTC000962 LN:949
-@SQ SN:CUTC000963 LN:1105
-@SQ SN:CUTC000964 LN:1040
-@SQ SN:CUTC000965 LN:717
-@SQ SN:CUTC000966 LN:1341
-@SQ SN:CUTC000967 LN:866
-@SQ SN:CUTC000968 LN:925
-@SQ SN:CUTC000969 LN:1527
-@SQ SN:CUTC000970 LN:1437
-@SQ SN:CUTC000971 LN:1144
-@SQ SN:CUTC000972 LN:744
-@SQ SN:CUTC000973 LN:839
-@SQ SN:CUTC000974 LN:872
-@SQ SN:CUTC000975 LN:880
-@SQ SN:CUTC000976 LN:785
-@SQ SN:CUTC000977 LN:919
-@SQ SN:CUTC000978 LN:1153
-@SQ SN:CUTC000979 LN:844
-@SQ SN:CUTC000980 LN:919
-@SQ SN:CUTC000981 LN:902
-@SQ SN:CUTC000982 LN:861
-@SQ SN:CUTC000983 LN:1017
-@SQ SN:CUTC000984 LN:660
-@SQ SN:CUTC000985 LN:922
-@SQ SN:CUTC000986 LN:1119
-@SQ SN:CUTC000987 LN:359
-@SQ SN:CUTC000988 LN:1490
-@SQ SN:CUTC000989 LN:1621
-@SQ SN:CUTC000990 LN:789
-@SQ SN:CUTC000991 LN:1064
-@SQ SN:CUTC000992 LN:687
-@SQ SN:CUTC000993 LN:1092
-@SQ SN:CUTC000994 LN:843
-@SQ SN:CUTC000995 LN:1053
-@SQ SN:CUTC000996 LN:552
-@SQ SN:CUTC000997 LN:881
-@SQ SN:CUTC000998 LN:1067
-@SQ SN:CUTC000999 LN:817
-@SQ SN:CUTC001000 LN:641
-@SQ SN:CUTC001001 LN:901
-@SQ SN:CUTC001002 LN:1005
-@SQ SN:CUTC001003 LN:1411
-@SQ SN:CUTC001004 LN:853
-@SQ SN:CUTC001005 LN:621
-@SQ SN:CUTC001006 LN:1374
-@SQ SN:CUTC001007 LN:1122
-@SQ SN:CUTC001008 LN:1098
-@SQ SN:CUTC001009 LN:819
-@SQ SN:CUTC001010 LN:939
-@SQ SN:CUTC001011 LN:591
-@SQ SN:CUTC001012 LN:580
-@SQ SN:CUTC001013 LN:1057
-@SQ SN:CUTC001014 LN:1551
-@SQ SN:CUTC001015 LN:701
-@SQ SN:CUTC001016 LN:885
-@SQ SN:CUTC001017 LN:1209
-@RG ID:mu16_454_mu16 PL:454 LB:mu16 SM:mu16
-@RG ID:upv196_454_upv196 PL:454 LB:upv196 SM:upv196
-CUESOXRA74 0 CUTC000001 1 10 77M1I222M * 0 0 GCCTTTTATAATTATTATAAATTTCGGTTGACCCGACCCCATTAGACAGAGTCTATTAAAGCCCCGTGAAAGCCCGGCAAAACCCAGTAGCGCAGAGATCGGCGAGGGCGAATTTTCGATTGCATTTTCGTTCGTTTCTCTTCTGAATTTCTGTAATCTGTAACGATGTCTCAGACTACTGTCCTCAAGGTTGCTATGTCATGTCAGGGCTGTGTTGGAGCCGCCAAAAGGGTCTTGGGGAAACTGGAAGGTGTTGAAACATTTGACATCGACATAGATGCACAAAAGGTGACTGTGAAA 1BB@@BBHFHHHHHIIHIHFFF@@A@@>9>?999<0////8888>=??@DDDDFFFF???:;;;;AAA???DDDDFFFAAAAFFD8AAFFFC???CFFFFFFFFFFFFFFFFAAAAFFFFCCCF<<<<F?88FFFFFFFFFFFC:::666DAA:::DDFA@@@FFFFFFFFFDDDDDFFF?;;;FFFFFFFDDDDFFFFFFFFFFD666DBBBA>=424226622....666=?==4466444@?4444==?;;;9688<0...:::9<:7988989????984444A@?AABBA=?==; AS:i:260 XS:i:239 XF:i:2 XE:i:3 XN:i:1 RG:Z:mu16_454_mu16
+++ /dev/null
-@SQ LN:200000000 SN:chr1
-QW85I:468:729 0 chr1 156268499 63 140M15H * 0 0 GTCCAGTCTCCTGTAATTCTTGGGCTTGACTAGGCTTCCGACAACCTGGAGGCATTGCTCTTTCAGGGTATACACTGCAGTGTGATGTTGGCAAAAACAGGCTGTCCATTAACATTGGAAGATGGCACAAACAATTCAGT >>>>>>>====>=>>;:8,,((1*0536;;=<>;:;>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><9=556.2<<<8===<<<9;9=>=>>>>>>>>>>>>>>>>.>>>===>>>>>>>4=>>==;<<896=>===<>>588-1.19<= RG:Z:QW85I PG:Z:tmap MD:Z:140 NM:i:0 AS:i:140 FZ:B:S,100,1,91,0,7,101,0,201,96,204,0,0,87,109,0,7,97,112,1,12,78,197,0,7,100,95,101,202,0,6,0,1,186,0,84,0,244,0,0,324,0,107,195,101,113,0,102,0,104,3,0,101,1,0,212,6,0,0,1,0,74,1,11,0,196,2,197,103,0,108,98,2,7,0,1,2,194,0,180,0,108,0,203,104,16,5,205,0,0,0,1,1,100,98,0,0,204,6,0,79,0,0,101,7,109,90,265,1,27,10,109,102,9,0,292,0,110,0,0,102,112,0,0,84,100,103,2,81,126,0,2,90,0,15,96,15,1,0,2,0,107,92,0,0,101,3,98,15,102,13,116,116,90,93,198,0,0,0,199,92,26,495,100,5,0,100,5,209,0,92,107,90,0,0,0,0,109,194,7,94,200,0,40,197,0,11,0,0,112,110,6,4,200,28,0,196,0,203,1,129,0,0,1,0,94,0,1,0,107,5,201,3,3,100,0,121,0,7,0,1,105,306,3,86,8,183,0,12,163,17,83,22,0,0,1,8,109,103,0,0,295,0,200,16,172,3,16,182,3,11,0,0,223,111,103,0,5,225,0,95 XA:Z:map2-1 XS:i:53 XT:i:38 XF:i:1 XE:i:0
-QW85I:468:729 0 chr1 156268499 63 140M15H * 0 0 GTCCAGTCTCCTGTAATTCTTGGGCTTGACTAGGCTTCCGACAACCTGGAGGCATTGCTCTTTCAGGGTATACACTGCAGTGTGATGTTGGCAAAAACAGGCTGTCCATTAACATTGGAAGATGGCACAAACAATTCAGT >>>>>>>====>=>>;:8,,((1*0536;;=<>;:;>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><9=556.2<<<8===<<<9;9=>=>>>>>>>>>>>>>>>>.>>>===>>>>>>>4=>>==;<<896=>===<>>588-1.19<= RG:Z:QW85I PG:Z:tmap MD:Z:140 NM:i:0 AS:i:140 FZ:B:s,-100,200,-300,-400 XA:Z:map2-1 XS:i:53 XT:i:38 XF:i:1 XE:i:0
-QW85I:468:729 0 chr1 156268499 63 140M15H * 0 0 GTCCAGTCTCCTGTAATTCTTGGGCTTGACTAGGCTTCCGACAACCTGGAGGCATTGCTCTTTCAGGGTATACACTGCAGTGTGATGTTGGCAAAAACAGGCTGTCCATTAACATTGGAAGATGGCACAAACAATTCAGT >>>>>>>====>=>>;:8,,((1*0536;;=<>;:;>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><9=556.2<<<8===<<<9;9=>=>>>>>>>>>>>>>>>>.>>>===>>>>>>>4=>>==;<<896=>===<>>588-1.19<= RG:Z:QW85I PG:Z:tmap MD:Z:140 NM:i:0 AS:i:140 FZ:B:c,-100,12 XA:Z:map2-1 XS:i:53 XT:i:38 XF:i:1 XE:i:0
-QW85I:468:729 0 chr1 156268499 63 140M15H * 0 0 GTCCAGTCTCCTGTAATTCTTGGGCTTGACTAGGCTTCCGACAACCTGGAGGCATTGCTCTTTCAGGGTATACACTGCAGTGTGATGTTGGCAAAAACAGGCTGTCCATTAACATTGGAAGATGGCACAAACAATTCAGT >>>>>>>====>=>>;:8,,((1*0536;;=<>;:;>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><9=556.2<<<8===<<<9;9=>=>>>>>>>>>>>>>>>>.>>>===>>>>>>>4=>>==;<<896=>===<>>588-1.19<= RG:Z:QW85I PG:Z:tmap MD:Z:140 NM:i:0 AS:i:140 FZ:B:C,12,15 XA:Z:map2-1 XS:i:53 XT:i:38 XF:i:1 XE:i:0
-QW85I:468:729 0 chr1 156268499 63 140M15H * 0 0 GTCCAGTCTCCTGTAATTCTTGGGCTTGACTAGGCTTCCGACAACCTGGAGGCATTGCTCTTTCAGGGTATACACTGCAGTGTGATGTTGGCAAAAACAGGCTGTCCATTAACATTGGAAGATGGCACAAACAATTCAGT >>>>>>>====>=>>;:8,,((1*0536;;=<>;:;>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><9=556.2<<<8===<<<9;9=>=>>>>>>>>>>>>>>>>.>>>===>>>>>>>4=>>==;<<896=>===<>>588-1.19<= RG:Z:QW85I PG:Z:tmap MD:Z:140 NM:i:0 AS:i:140 FZ:B:f,-1.0,5.0,2.5 XA:Z:map2-1 XS:i:53 XT:i:38 XF:i:1 XE:i:0
+++ /dev/null
-@SQ SN:chr1 LN:1000
-XXX0000 0 chr1 100 170 171M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTC * AS:i:170 MS:i:50
-XXX0001 0 chr1 100 255 284M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGT * AS:i:283 MS:i:50
-XXX0002 0 chr1 100 205 206M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGA * AS:i:205 MS:i:50
-XXX0003 0 chr1 100 212 213M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCC * AS:i:212 MS:i:50
-XXX0004 0 chr1 100 208 209M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGG * AS:i:208 MS:i:50
-XXX0005 0 chr1 100 245 245M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGG * AS:i:245 MS:i:50
-XXX0006 0 chr1 100 251 251M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATC * AS:i:251 MS:i:50
-XXX0007 0 chr1 100 255 257M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAA * AS:i:257 MS:i:50
-XXX0008 0 chr1 100 255 285M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTT * AS:i:284 MS:i:50
-XXX0009 0 chr1 100 255 261M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTA * AS:i:261 MS:i:50
-XXX0010 0 chr1 100 255 289M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCG * AS:i:288 MS:i:50
-XXX0011 0 chr1 100 173 174M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCG * AS:i:173 MS:i:50
-XXX0012 0 chr1 100 255 265M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCC * AS:i:265 MS:i:50
-XXX0013 0 chr1 100 255 293M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATC * AS:i:292 MS:i:50
-XXX0014 0 chr1 100 166 167M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGA * AS:i:166 MS:i:50
-XXX0015 0 chr1 100 247 247M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAA * AS:i:247 MS:i:50
-XXX0016 0 chr1 100 255 295M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCA * AS:i:294 MS:i:50
-XXX0017 0 chr1 100 210 211M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTC * AS:i:210 MS:i:50
-XXX0018 0 chr1 100 235 236M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTG * AS:i:235 MS:i:50
-XXX0019 0 chr1 100 195 196M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCC * AS:i:195 MS:i:50
-XXX0020 0 chr1 100 178 179M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGG * AS:i:178 MS:i:50
-XXX0021 0 chr1 100 255 259M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGG * AS:i:259 MS:i:50
-XXX0022 0 chr1 100 238 239M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACT * AS:i:238 MS:i:50
-XXX0023 0 chr1 100 255 272M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCAC * AS:i:272 MS:i:50
-XXX0024 0 chr1 100 255 257M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAA * AS:i:257 MS:i:50
-XXX0025 0 chr1 100 255 268M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCA * AS:i:268 MS:i:50
-XXX0026 0 chr1 100 201 202M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGG * AS:i:201 MS:i:50
-XXX0027 0 chr1 100 180 181M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGT * AS:i:180 MS:i:50
-XXX0028 0 chr1 100 153 154M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCG * AS:i:153 MS:i:50
-XXX0029 0 chr1 100 255 280M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGA * AS:i:279 MS:i:50
-XXX0030 0 chr1 100 255 275M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCC * AS:i:274 MS:i:50
-XXX0031 0 chr1 100 255 259M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGG * AS:i:259 MS:i:50
-XXX0032 0 chr1 100 229 230M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCC * AS:i:229 MS:i:50
-XXX0033 0 chr1 100 229 230M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCC * AS:i:229 MS:i:50
-XXX0034 0 chr1 100 172 173M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGC * AS:i:172 MS:i:50
-XXX0035 0 chr1 100 246 246M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGA * AS:i:246 MS:i:50
-XXX0036 0 chr1 100 187 188M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACT * AS:i:187 MS:i:50
-XXX0037 0 chr1 100 189 190M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTG * AS:i:189 MS:i:50
-XXX0038 0 chr1 100 192 193M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTC * AS:i:192 MS:i:50
-XXX0039 0 chr1 100 221 222M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAA * AS:i:221 MS:i:50
-XXX0040 0 chr1 100 186 187M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCAC * AS:i:186 MS:i:50
-XXX0041 0 chr1 100 185 186M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCA * AS:i:185 MS:i:50
-XXX0042 0 chr1 100 255 299M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACT * AS:i:298 MS:i:50
-XXX0043 0 chr1 100 156 157M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTT * AS:i:156 MS:i:50
-XXX0044 0 chr1 100 255 270M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACC * AS:i:270 MS:i:50
-XXX0045 0 chr1 100 206 207M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGAC * AS:i:206 MS:i:50
-XXX0046 0 chr1 100 255 262M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAA * AS:i:262 MS:i:50
-XXX0047 0 chr1 100 249 249M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGA * AS:i:249 MS:i:50
-XXX0048 0 chr1 100 226 226M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGT * AS:i:226 MS:i:50
-XXX0049 0 chr1 100 233 234M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACG * AS:i:233 MS:i:50
-XXX0050 0 chr1 100 162 163M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGT * AS:i:162 MS:i:50
-XXX0051 0 chr1 100 242 242M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATA * AS:i:242 MS:i:50
-XXX0052 0 chr1 100 255 288M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCC * AS:i:287 MS:i:50
-XXX0053 0 chr1 100 255 267M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCC * AS:i:267 MS:i:50
-XXX0054 0 chr1 100 196 197M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCA * AS:i:196 MS:i:50
-XXX0055 0 chr1 100 236 237M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGA * AS:i:236 MS:i:50
-XXX0056 0 chr1 100 223 223M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAA * AS:i:223 MS:i:50
-XXX0057 0 chr1 100 171 172M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCG * AS:i:171 MS:i:50
-XXX0058 0 chr1 100 178 179M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGG * AS:i:178 MS:i:50
-XXX0059 0 chr1 100 255 269M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCAC * AS:i:269 MS:i:50
-XXX0060 0 chr1 100 195 196M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCC * AS:i:195 MS:i:50
-XXX0061 0 chr1 100 212 213M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCC * AS:i:212 MS:i:50
-XXX0062 0 chr1 100 255 258M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAG * AS:i:258 MS:i:50
-XXX0063 0 chr1 100 157 158M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTC * AS:i:157 MS:i:50
-XXX0064 0 chr1 100 173 174M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCG * AS:i:173 MS:i:50
-XXX0065 0 chr1 100 178 179M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGG * AS:i:178 MS:i:50
-XXX0066 0 chr1 100 186 187M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCAC * AS:i:186 MS:i:50
-XXX0067 0 chr1 100 255 290M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGG * AS:i:289 MS:i:50
-XXX0068 0 chr1 100 238 239M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACT * AS:i:238 MS:i:50
-XXX0069 0 chr1 100 176 177M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAG * AS:i:176 MS:i:50
-XXX0070 0 chr1 100 255 288M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCC * AS:i:287 MS:i:50
-XXX0071 0 chr1 100 206 207M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGAC * AS:i:206 MS:i:50
-XXX0072 0 chr1 100 224 224M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAA * AS:i:224 MS:i:50
-XXX0073 0 chr1 100 218 219M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTA * AS:i:218 MS:i:50
-XXX0074 0 chr1 100 237 238M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGAC * AS:i:237 MS:i:50
-XXX0075 0 chr1 100 250 250M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGAT * AS:i:250 MS:i:50
-XXX0076 0 chr1 100 255 265M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCC * AS:i:265 MS:i:50
-XXX0077 0 chr1 100 255 264M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGC * AS:i:264 MS:i:50
-XXX0078 0 chr1 100 242 242M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATA * AS:i:242 MS:i:50
-XXX0079 0 chr1 100 159 160M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTT * AS:i:159 MS:i:50
-XXX0080 0 chr1 100 248 248M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAG * AS:i:248 MS:i:50
-XXX0081 0 chr1 100 253 253M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCA * AS:i:253 MS:i:50
-XXX0082 0 chr1 100 199 200M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAA * AS:i:199 MS:i:50
-XXX0083 0 chr1 100 168 169M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATT * AS:i:168 MS:i:50
-XXX0084 0 chr1 100 249 249M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGA * AS:i:249 MS:i:50
-XXX0085 0 chr1 100 255 268M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCA * AS:i:268 MS:i:50
-XXX0086 0 chr1 100 255 298M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACAC * AS:i:297 MS:i:50
-XXX0087 0 chr1 100 229 230M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCC * AS:i:229 MS:i:50
-XXX0088 0 chr1 100 255 278M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCA * AS:i:277 MS:i:50
-XXX0089 0 chr1 100 198 199M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAA * AS:i:198 MS:i:50
-XXX0090 0 chr1 100 255 273M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACC * AS:i:272 MS:i:50
-XXX0091 0 chr1 100 182 183M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGA * AS:i:182 MS:i:50
-XXX0092 0 chr1 100 211 212M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCC * AS:i:211 MS:i:50
-XXX0093 0 chr1 100 207 208M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACG * AS:i:207 MS:i:50
-XXX0094 0 chr1 100 221 222M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAA * AS:i:221 MS:i:50
-XXX0095 0 chr1 100 177 178M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGG * AS:i:177 MS:i:50
-XXX0096 0 chr1 100 255 289M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCG * AS:i:288 MS:i:50
-XXX0097 0 chr1 100 255 276M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCT * AS:i:275 MS:i:50
-XXX0098 0 chr1 100 237 238M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGAC * AS:i:237 MS:i:50
-XXX0099 0 chr1 100 255 273M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACC * AS:i:272 MS:i:50
-XXX0100 0 chr1 100 255 264M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGC * AS:i:264 MS:i:50
-XXX0101 0 chr1 100 255 285M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTT * AS:i:284 MS:i:50
-XXX0102 0 chr1 100 233 234M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACG * AS:i:233 MS:i:50
-XXX0103 0 chr1 100 237 238M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGAC * AS:i:237 MS:i:50
-XXX0104 0 chr1 100 214 215M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCAT * AS:i:214 MS:i:50
-XXX0105 0 chr1 100 154 155M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGT * AS:i:154 MS:i:50
-XXX0106 0 chr1 100 181 182M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTG * AS:i:181 MS:i:50
-XXX0107 0 chr1 100 255 265M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCC * AS:i:265 MS:i:50
-XXX0108 0 chr1 100 255 259M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGG * AS:i:259 MS:i:50
-XXX0109 0 chr1 100 186 187M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCAC * AS:i:186 MS:i:50
-XXX0110 0 chr1 100 172 173M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGC * AS:i:172 MS:i:50
-XXX0111 0 chr1 100 155 156M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTT * AS:i:155 MS:i:50
-XXX0112 0 chr1 100 209 210M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGT * AS:i:209 MS:i:50
-XXX0113 0 chr1 100 255 257M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAA * AS:i:257 MS:i:50
-XXX0114 0 chr1 100 255 260M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGT * AS:i:260 MS:i:50
-XXX0115 0 chr1 100 195 196M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCC * AS:i:195 MS:i:50
-XXX0116 0 chr1 100 200 201M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAG * AS:i:200 MS:i:50
-XXX0117 0 chr1 100 255 271M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCA * AS:i:271 MS:i:50
-XXX0118 0 chr1 100 255 297M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACA * AS:i:296 MS:i:50
-XXX0119 0 chr1 100 163 164M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTA * AS:i:163 MS:i:50
-XXX0120 0 chr1 100 255 256M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGA * AS:i:256 MS:i:50
-XXX0121 0 chr1 100 255 284M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGT * AS:i:283 MS:i:50
-XXX0122 0 chr1 100 176 177M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAG * AS:i:176 MS:i:50
-XXX0123 0 chr1 100 251 251M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATC * AS:i:251 MS:i:50
-XXX0124 0 chr1 100 255 260M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGT * AS:i:260 MS:i:50
-XXX0125 0 chr1 100 255 285M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTT * AS:i:284 MS:i:50
-XXX0126 0 chr1 100 201 202M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGG * AS:i:201 MS:i:50
-XXX0127 0 chr1 100 165 166M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACG * AS:i:165 MS:i:50
-XXX0128 0 chr1 100 255 279M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAG * AS:i:278 MS:i:50
-XXX0129 0 chr1 100 165 166M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACG * AS:i:165 MS:i:50
-XXX0130 0 chr1 100 204 205M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGG * AS:i:204 MS:i:50
-XXX0131 0 chr1 100 199 200M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAA * AS:i:199 MS:i:50
-XXX0132 0 chr1 100 208 209M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGG * AS:i:208 MS:i:50
-XXX0133 0 chr1 100 209 210M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGT * AS:i:209 MS:i:50
-XXX0134 0 chr1 100 183 184M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGAT * AS:i:183 MS:i:50
-XXX0135 0 chr1 100 255 266M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCC * AS:i:266 MS:i:50
-XXX0136 0 chr1 100 255 293M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATC * AS:i:292 MS:i:50
-XXX0137 0 chr1 100 255 285M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTT * AS:i:284 MS:i:50
-XXX0138 0 chr1 100 219 220M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAG * AS:i:219 MS:i:50
-XXX0139 0 chr1 100 247 247M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAA * AS:i:247 MS:i:50
-XXX0140 0 chr1 100 192 193M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTC * AS:i:192 MS:i:50
-XXX0141 0 chr1 100 255 261M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTA * AS:i:261 MS:i:50
-XXX0142 0 chr1 100 212 213M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCC * AS:i:212 MS:i:50
-XXX0143 0 chr1 100 255 276M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCT * AS:i:275 MS:i:50
-XXX0144 0 chr1 100 177 178M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGG * AS:i:177 MS:i:50
-XXX0145 0 chr1 100 179 180M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGG * AS:i:179 MS:i:50
-XXX0146 0 chr1 100 255 263M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAG * AS:i:263 MS:i:50
-XXX0147 0 chr1 100 255 272M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCAC * AS:i:272 MS:i:50
-XXX0148 0 chr1 100 255 299M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACT * AS:i:298 MS:i:50
-XXX0149 0 chr1 100 255 274M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCC * AS:i:273 MS:i:50
-XXX0150 0 chr1 100 255 300M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTC * AS:i:299 MS:i:50
-XXX0151 0 chr1 100 157 158M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTC * AS:i:157 MS:i:50
-XXX0152 0 chr1 100 161 162M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTG * AS:i:161 MS:i:50
-XXX0153 0 chr1 100 202 203M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGC * AS:i:202 MS:i:50
-XXX0154 0 chr1 100 171 172M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCG * AS:i:171 MS:i:50
-XXX0155 0 chr1 100 183 184M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGAT * AS:i:183 MS:i:50
-XXX0156 0 chr1 100 255 286M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTG * AS:i:285 MS:i:50
-XXX0157 0 chr1 100 255 257M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAA * AS:i:257 MS:i:50
-XXX0158 0 chr1 100 255 275M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCC * AS:i:274 MS:i:50
-XXX0159 0 chr1 100 255 276M * 0 0 CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCT * AS:i:275 MS:i:50
-XXX0174 16 chr1 201 255 300M * 0 0 CCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:298 MS:i:50
-XXX0238 16 chr1 202 255 299M * 0 0 CTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:297 MS:i:50
-XXX0286 16 chr1 203 255 298M * 0 0 TGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:296 MS:i:50
-XXX0249 16 chr1 204 255 297M * 0 0 GAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:295 MS:i:50
-XXX0201 16 chr1 205 255 296M * 0 0 AGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:294 MS:i:50
-XXX0225 16 chr1 205 255 296M * 0 0 AGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:294 MS:i:50
-XXX0265 16 chr1 206 255 295M * 0 0 GACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:293 MS:i:50
-XXX0182 16 chr1 207 255 294M * 0 0 ACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:292 MS:i:50
-XXX0275 16 chr1 207 255 294M * 0 0 ACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:292 MS:i:50
-XXX0168 16 chr1 209 255 292M * 0 0 ACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:290 MS:i:50
-XXX0208 16 chr1 209 255 292M * 0 0 ACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:290 MS:i:50
-XXX0264 16 chr1 209 255 292M * 0 0 ACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:290 MS:i:50
-XXX0258 16 chr1 210 255 291M * 0 0 CGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:289 MS:i:50
-XXX0226 16 chr1 211 255 290M * 0 0 GGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:288 MS:i:50
-XXX0228 16 chr1 211 255 290M * 0 0 GGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:288 MS:i:50
-XXX0263 16 chr1 211 255 290M * 0 0 GGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:288 MS:i:50
-XXX0205 16 chr1 212 255 289M * 0 0 GGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:287 MS:i:50
-XXX0276 16 chr1 212 255 289M * 0 0 GGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:287 MS:i:50
-XXX0192 16 chr1 213 255 288M * 0 0 GATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:286 MS:i:50
-XXX0298 16 chr1 213 255 288M * 0 0 GATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:286 MS:i:50
-XXX0196 16 chr1 214 255 287M * 0 0 ATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:285 MS:i:50
-XXX0291 16 chr1 215 255 286M * 0 0 TCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:284 MS:i:50
-XXX0245 16 chr1 216 255 285M * 0 0 CTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:283 MS:i:50
-XXX0284 16 chr1 220 255 281M * 0 0 ATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:278 MS:i:50
-XXX0227 16 chr1 221 255 280M * 0 0 TCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:277 MS:i:50
-XXX0166 16 chr1 222 255 279M * 0 0 CGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:276 MS:i:50
-XXX0294 16 chr1 222 255 279M * 0 0 CGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:276 MS:i:50
-XXX0300 16 chr1 224 255 277M * 0 0 CCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:274 MS:i:50
-XXX0212 16 chr1 228 255 273M * 0 0 TGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:271 MS:i:50
-XXX0313 16 chr1 228 255 273M * 0 0 TGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:271 MS:i:50
-XXX0318 16 chr1 229 255 272M * 0 0 GAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:270 MS:i:50
-XXX0193 16 chr1 230 255 271M * 0 0 AGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:268 MS:i:50
-XXX0315 16 chr1 230 255 271M * 0 0 AGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:268 MS:i:50
-XXX0211 16 chr1 231 255 270M * 0 0 GACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:267 MS:i:50
-XXX0295 16 chr1 231 255 270M * 0 0 GACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:267 MS:i:50
-XXX0235 16 chr1 232 255 269M * 0 0 ACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:266 MS:i:50
-XXX0170 16 chr1 233 255 268M * 0 0 CCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:265 MS:i:50
-XXX0310 16 chr1 233 255 268M * 0 0 CCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:265 MS:i:50
-XXX0252 16 chr1 234 255 267M * 0 0 CCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:265 MS:i:50
-XXX0206 16 chr1 235 255 266M * 0 0 CACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:264 MS:i:50
-XXX0223 16 chr1 236 255 265M * 0 0 ACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:263 MS:i:50
-XXX0229 16 chr1 236 255 265M * 0 0 ACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:263 MS:i:50
-XXX0268 16 chr1 236 255 265M * 0 0 ACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:263 MS:i:50
-XXX0189 16 chr1 237 255 264M * 0 0 CACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:262 MS:i:50
-XXX0299 16 chr1 237 255 264M * 0 0 CACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:262 MS:i:50
-XXX0316 16 chr1 238 255 263M * 0 0 ACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:261 MS:i:50
-XXX0224 16 chr1 239 255 262M * 0 0 CACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:260 MS:i:50
-XXX0255 16 chr1 240 255 261M * 0 0 ACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:259 MS:i:50
-XXX0278 16 chr1 241 255 260M * 0 0 CCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:258 MS:i:50
-XXX0314 16 chr1 243 255 258M * 0 0 ACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:257 MS:i:50
-XXX0282 16 chr1 244 255 257M * 0 0 CGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:256 MS:i:50
-XXX0311 16 chr1 244 255 257M * 0 0 CGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:256 MS:i:50
-XXX0176 16 chr1 245 255 256M * 0 0 GCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:255 MS:i:50
-XXX0188 16 chr1 246 254 255M * 0 0 CTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:254 MS:i:50
-XXX0290 16 chr1 246 254 255M * 0 0 CTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:254 MS:i:50
-XXX0187 16 chr1 248 252 253M * 0 0 TTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:252 MS:i:50
-XXX0259 16 chr1 248 252 253M * 0 0 TTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:252 MS:i:50
-XXX0292 16 chr1 248 252 253M * 0 0 TTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:252 MS:i:50
-XXX0222 16 chr1 250 249 251M * 0 0 CCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:249 MS:i:50
-XXX0256 16 chr1 250 249 251M * 0 0 CCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:249 MS:i:50
-XXX0296 16 chr1 250 249 251M * 0 0 CCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:249 MS:i:50
-XXX0281 16 chr1 252 248 249M * 0 0 CGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:248 MS:i:50
-XXX0289 16 chr1 252 248 249M * 0 0 CGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:248 MS:i:50
-XXX0171 16 chr1 253 247 248M * 0 0 GTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:247 MS:i:50
-XXX0181 16 chr1 253 247 248M * 0 0 GTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:247 MS:i:50
-XXX0266 16 chr1 253 247 248M * 0 0 GTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:247 MS:i:50
-XXX0319 16 chr1 253 247 248M * 0 0 GTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:247 MS:i:50
-XXX0172 16 chr1 255 245 246M * 0 0 TTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:245 MS:i:50
-XXX0317 16 chr1 255 245 246M * 0 0 TTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:245 MS:i:50
-XXX0207 16 chr1 257 242 244M * 0 0 CTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:242 MS:i:50
-XXX0240 16 chr1 258 242 243M * 0 0 TTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:242 MS:i:50
-XXX0246 16 chr1 258 242 243M * 0 0 TTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:242 MS:i:50
-XXX0203 16 chr1 259 240 242M * 0 0 TTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:240 MS:i:50
-XXX0217 16 chr1 259 240 242M * 0 0 TTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:240 MS:i:50
-XXX0216 16 chr1 262 237 239M * 0 0 TACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:237 MS:i:50
-XXX0230 16 chr1 262 237 239M * 0 0 TACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:237 MS:i:50
-XXX0277 16 chr1 263 236 238M * 0 0 ACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:236 MS:i:50
-XXX0308 16 chr1 263 236 238M * 0 0 ACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:236 MS:i:50
-XXX0288 16 chr1 264 235 237M * 0 0 CGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:235 MS:i:50
-XXX0305 16 chr1 264 235 237M * 0 0 CGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:235 MS:i:50
-XXX0210 16 chr1 265 234 236M * 0 0 GATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:234 MS:i:50
-XXX0164 16 chr1 266 233 235M * 0 0 ATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:233 MS:i:50
-XXX0221 16 chr1 267 232 234M * 0 0 TTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:232 MS:i:50
-XXX0163 16 chr1 268 231 233M * 0 0 TTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:231 MS:i:50
-XXX0244 16 chr1 270 228 231M * 0 0 CGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:228 MS:i:50
-XXX0237 16 chr1 272 226 229M * 0 0 CGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:226 MS:i:50
-XXX0178 16 chr1 273 226 228M * 0 0 GCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:226 MS:i:50
-XXX0202 16 chr1 273 226 228M * 0 0 GCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:226 MS:i:50
-XXX0236 16 chr1 273 226 228M * 0 0 GCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:226 MS:i:50
-XXX0304 16 chr1 273 226 228M * 0 0 GCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:226 MS:i:50
-XXX0270 16 chr1 274 225 227M * 0 0 CAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:225 MS:i:50
-XXX0161 16 chr1 276 223 225M * 0 0 GGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:223 MS:i:50
-XXX0287 16 chr1 277 222 224M * 0 0 GGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:222 MS:i:50
-XXX0306 16 chr1 277 222 224M * 0 0 GGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:222 MS:i:50
-XXX0173 16 chr1 279 220 222M * 0 0 GTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:220 MS:i:50
-XXX0269 16 chr1 280 219 221M * 0 0 TGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:219 MS:i:50
-XXX0303 16 chr1 282 216 219M * 0 0 ATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:216 MS:i:50
-XXX0220 16 chr1 283 215 218M * 0 0 TCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:215 MS:i:50
-XXX0219 16 chr1 284 214 217M * 0 0 CACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:214 MS:i:50
-XXX0177 16 chr1 286 212 215M * 0 0 CTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:212 MS:i:50
-XXX0257 16 chr1 287 211 214M * 0 0 TTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:211 MS:i:50
-XXX0241 16 chr1 288 210 213M * 0 0 TGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:210 MS:i:50
-XXX0167 16 chr1 289 209 212M * 0 0 GGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:209 MS:i:50
-XXX0261 16 chr1 290 208 211M * 0 0 GTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:208 MS:i:50
-XXX0312 16 chr1 293 205 208M * 0 0 TCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:205 MS:i:50
-XXX0272 16 chr1 294 204 207M * 0 0 CCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:204 MS:i:50
-XXX0253 16 chr1 295 203 206M * 0 0 CAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:203 MS:i:50
-XXX0254 16 chr1 296 202 205M * 0 0 AAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:202 MS:i:50
-XXX0307 16 chr1 297 201 204M * 0 0 AAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:201 MS:i:50
-XXX0169 16 chr1 298 200 203M * 0 0 AAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:200 MS:i:50
-XXX0232 16 chr1 299 199 202M * 0 0 AGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:199 MS:i:50
-XXX0195 16 chr1 300 198 201M * 0 0 GGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:198 MS:i:50
-XXX0179 16 chr1 302 196 199M * 0 0 CGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:196 MS:i:50
-XXX0160 16 chr1 305 193 196M * 0 0 ACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:193 MS:i:50
-XXX0271 16 chr1 305 193 196M * 0 0 ACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:193 MS:i:50
-XXX0180 16 chr1 306 192 195M * 0 0 CGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:192 MS:i:50
-XXX0185 16 chr1 306 192 195M * 0 0 CGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:192 MS:i:50
-XXX0199 16 chr1 306 192 195M * 0 0 CGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:192 MS:i:50
-XXX0191 16 chr1 310 188 191M * 0 0 CCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:188 MS:i:50
-XXX0250 16 chr1 311 187 190M * 0 0 CCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:187 MS:i:50
-XXX0273 16 chr1 312 186 189M * 0 0 CATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:186 MS:i:50
-XXX0239 16 chr1 314 184 187M * 0 0 TGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:184 MS:i:50
-XXX0301 16 chr1 314 184 187M * 0 0 TGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:184 MS:i:50
-XXX0197 16 chr1 316 182 185M * 0 0 TTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:182 MS:i:50
-XXX0260 16 chr1 317 181 184M * 0 0 TAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:181 MS:i:50
-XXX0190 16 chr1 319 179 182M * 0 0 GAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:179 MS:i:50
-XXX0309 16 chr1 319 179 182M * 0 0 GAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:179 MS:i:50
-XXX0285 16 chr1 320 178 181M * 0 0 AAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:178 MS:i:50
-XXX0214 16 chr1 322 176 179M * 0 0 AAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:176 MS:i:50
-XXX0279 16 chr1 322 176 179M * 0 0 AAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:176 MS:i:50
-XXX0280 16 chr1 322 176 179M * 0 0 AAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:176 MS:i:50
-XXX0242 16 chr1 323 175 178M * 0 0 AGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:175 MS:i:50
-XXX0213 16 chr1 325 173 176M * 0 0 TTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:173 MS:i:50
-XXX0233 16 chr1 325 173 176M * 0 0 TTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:173 MS:i:50
-XXX0297 16 chr1 325 173 176M * 0 0 TTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:173 MS:i:50
-XXX0183 16 chr1 326 172 175M * 0 0 TCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:172 MS:i:50
-XXX0194 16 chr1 326 172 175M * 0 0 TCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:172 MS:i:50
-XXX0283 16 chr1 326 172 175M * 0 0 TCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:172 MS:i:50
-XXX0215 16 chr1 328 170 173M * 0 0 CCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:170 MS:i:50
-XXX0162 16 chr1 332 166 169M * 0 0 CGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:166 MS:i:50
-XXX0262 16 chr1 333 165 168M * 0 0 GTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:165 MS:i:50
-XXX0200 16 chr1 335 163 166M * 0 0 GACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:163 MS:i:50
-XXX0234 16 chr1 336 161 165M * 0 0 ACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:161 MS:i:50
-XXX0186 16 chr1 337 161 164M * 0 0 CTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:161 MS:i:50
-XXX0218 16 chr1 337 161 164M * 0 0 CTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:161 MS:i:50
-XXX0248 16 chr1 338 160 163M * 0 0 TATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:160 MS:i:50
-XXX0267 16 chr1 338 160 163M * 0 0 TATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:160 MS:i:50
-XXX0247 16 chr1 339 158 162M * 0 0 ATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:158 MS:i:50
-XXX0274 16 chr1 339 158 162M * 0 0 ATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:158 MS:i:50
-XXX0198 16 chr1 340 158 161M * 0 0 TATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:158 MS:i:50
-XXX0251 16 chr1 340 158 161M * 0 0 TATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:158 MS:i:50
-XXX0204 16 chr1 341 156 160M * 0 0 ATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:156 MS:i:50
-XXX0175 16 chr1 342 155 159M * 0 0 TGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:155 MS:i:50
-XXX0209 16 chr1 342 155 159M * 0 0 TGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:155 MS:i:50
-XXX0243 16 chr1 343 154 158M * 0 0 GGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:154 MS:i:50
-XXX0165 16 chr1 345 152 156M * 0 0 AAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:152 MS:i:50
-XXX0231 16 chr1 346 151 155M * 0 0 AGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:151 MS:i:50
-XXX0293 16 chr1 349 148 152M * 0 0 TCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:148 MS:i:50
-XXX0302 16 chr1 349 148 152M * 0 0 TCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:148 MS:i:50
-XXX0184 16 chr1 351 146 150M * 0 0 CAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA * AS:i:146 MS:i:50
+++ /dev/null
-@HD VN:1.0
-read_28833_29006_6945 0 * 0 0 * * 200 167 AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<
-read_28701_28881_323b 0 * 0 0 * * 500 412 ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<
+++ /dev/null
-@HD VN:1.0
-@SQ SN:chr1 LN:1575
-@SQ SN:chr2 LN:1584
-@x1 A:2 B:5
-@x2 A:4 B:5
-@x3 A:6 B:5
-read_28833_29006_6945 99 chr1 33 20 10M1D25M = 200 167 AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<< NM:i:1 RG:Z:L1
-read_28701_28881_323b 147 chr2 88 30 35M = 500 412 ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<< MF:i:18 RG:Z:L2
+++ /dev/null
-@SQ SN:chr1 LN:249250621
-@SQ SN:chr10 LN:135534747
-@SQ SN:chr11 LN:135006516
-@SQ SN:chr12 LN:133851895
-@SQ SN:chr13 LN:115169878
-@SQ SN:chr14 LN:107349540
-@SQ SN:chr15 LN:102531392
-@SQ SN:chr16 LN:90354753
-@SQ SN:chr17 LN:81195210
-@SQ SN:chr18 LN:78077248
-@SQ SN:chr19 LN:59128983
-@SQ SN:chr2 LN:243199373
-@SQ SN:chr20 LN:63025520
-@SQ SN:chr21 LN:48129895
-@SQ SN:chr22 LN:51304566
-@SQ SN:chr3 LN:198022430
-@SQ SN:chr4 LN:191154276
-@SQ SN:chr5 LN:180915260
-@SQ SN:chr6 LN:171115067
-@SQ SN:chr7 LN:159138663
-@SQ SN:chr8 LN:146364022
-@SQ SN:chr9 LN:141213431
-@SQ SN:chrM LN:16571
-@SQ SN:chrX LN:155270560
-@SQ SN:chrY LN:59373566
-@PG ID:bwa PN:bwa VN:0.5.9-r16
-YILLUMINA-B8EC94_231:1:50:18506:14866#0 0 chr1 164170895 0 28M * 0 0 AAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAGG IIIIIGIIIIIIIIHIIIIFIIGIDHIG XT:A:R NM:i:0 X0:i:46 X1:i:488 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 MD:Z:28 XA:Z:chr7,-76584917,28M,0;chr7,-76086813,28M,0;chr19,-14658154,28M,0;chr12,-44420884,28M,0;chr4,-46749296,28M,0;chr16,-65813760,28M,0;chr12,-125218307,28M,0;chr22,-49521364,28M,0;chr8,-67441969,28M,0;chrX,-24771433,28M,0;chr2,-97418606,28M,0;chr17,-48859141,28M,0;chr19,-33212584,28M,0;chr7,-69136775,28M,0;chr5,-80182155,28M,0;chr5,-40957547,28M,0;chr1,-8992207,28M,0;chr4,-41653011,28M,0;chr3,-5149300,28M,0;chr3,+49488805,28M,0;chr5,+58266193,28M,0;chr22,+42021002,28M,0;chr11,+85612617,28M,0;chr7,+151315540,28M,0;chr17,+17559883,28M,0;chr11,+74995947,28M,0;chr12,+119190631,28M,0;chr8,+121033303,28M,0;chr9,+122813065,28M,0;chr1,+92280874,28M,0;chr3,+49184061,28M,0;chr2,+104675746,28M,0;chr6,+108461339,28M,0;chr20,+20548540,28M,0;chr10,+62601188,28M,0;chr4,+8350545,28M,0;chr1,+150194440,28M,0;chr20,+50633348,28M,0;chr1,+25648175,28M,0;chr19,+33713380,28M,0;chr8,+56596974,28M,0;chr10,+19488747,28M,0;chrX,+43980718,28M,0;chr22,+28827966,28M,0;chr7,+76248706,28M,0;chr12,+34385994,28M,1;chr22,+24200895,28M,1;chr11,+9935206,28M,1;chr7,+71057507,28M,1;chr8,+75964204,28M,1;chr11,+70749536,28M,1;chr6,+121876867,28M,1;chr8,+9904069,28M,1;chr2,+167975020,28M,1;chr8,+65343650,28M,1;chr2,+203338523,28M,1;chr6,+134519042,28M,1;chr19,+15588539,28M,1;chrX,+21005486,28M,1;chr1,+51600244,28M,1;chr6,+135071574,28M,1;chrX,+142060697,28M,1;chr3,+88036270,28M,1;chr11,+107768031,28M,1;chr1,+43452382,28M,1;chr3,+119162759,28M,1;chr7,+137682479,28M,1;chrY,+771178,28M,1;chrX,+821178,28M,1;chr3,+131863613,28M,1;chr4,+5198466,28M,1;chr8,+42219792,28M,1;chr18,+21867757,28M,1;chr1,+205771873,28M,1;chr7,+106381815,28M,1;chr3,+152231119,28M,1;chr18,+38121876,28M,1;chr18,+13226733,28M,1;chr2,+113982439,28M,1;chr13,+38527369,28M,1;chr16,+61112193,28M,1;chr13,+63276179,28M,1;chr6,+22044433,28M,1;chr8,+75971314,28M,1;chr1,+155919065,28M,1;chr10,+9075352,28M,1;chr14,+41766647,28M,1;chr4,+38881700,28M,1;chr14,+63221608,28M,1;chr1,+96460706,28M,1;chr1,+31541552,28M,1;chr2,+130852364,28M,1;chr2,+131240936,28M,1;chr16,+54409861,28M,1;chr7,+138085971,28M,1;chr6,+168960156,28M,1;chr7,+35021562,28M,1;chr3,+5192468,28M,1;chr5,+139685004,28M,1;chr16,+57887328,28M,1;chr1,+240683393,28M,1;chr7,+51529361,28M,1;chr15,+38755713,28M,1;chr17,+45077478,28M,1;chr7,+98657066,28M,1;chrX,+15178325,28M,1;chr15,+50856486,28M,1;chr6,+26677004,28M,1;chr11,+67754723,28M,1;chr11,+60378362,28M,1;chr13,+74834741,28M,1;chr7,+139512903,28M,1;chr15,+65775953,28M,1;chr22,+39161266,28M,1;chr5,+42576221,28M,1;chr6,+142807488,28M,1;chr16,+65067646,28M,1;chrY,+17168022,28M,1;chrY,+20444338,28M,1;chr6,+85793701,28M,1;chr7,+95669552,28M,1;chr2,+99252467,28M,1;chr5,+93286660,28M,1;chr12,+19541000,28M,1;chr9,+28932106,28M,1;chr7,+62487286,28M,1;chr5,+152475447,28M,1;chr10,+104206440,28M,1;chr4,+182765824,28M,1;chr19,+54584245,28M,1;chrY,+5218751,28M,1;chr4,+44370409,28M,1;chr6,+19294076,28M,1;chr19,+1191066,28M,1;chr5,+142819608,28M,1;chr13,+82093983,28M,1;chrX,+130954389,28M,1;chr6,+6847717,28M,1;chr11,+89143226,28M,1;chr2,+108524013,28M,1;chr5,+108771229,28M,1;chrX,+93364170,28M,1;chrX,+88234143,28M,1;chr17,+9723415,28M,1;chr6,+27707864,28M,1;chr3,+66057355,28M,1;chr3,+154005450,28M,1;chr15,+29887458,28M,1;chr14,+56232133,28M,1;chr2,+122434791,28M,1;chr8,+126235305,28M,1;chr16,+52177603,28M,1;chr4,+34178766,28M,1;chr8,+22882491,28M,1;chr18,+2552191,28M,1;chr17,+32715595,28M,1;chr16,+53061076,28M,1;chr2,+114903272,28M,1;chr4,+42337800,28M,1;chr6,+149777395,28M,1;chr1,+151096337,28M,1;chr6,+118477838,28M,1;chr3,+30600543,28M,1;chr19,+33567456,28M,1;chr8,+1217564,28M,1;chr4,+39872213,28M,1;chrX,+44688603,28M,1;chrX,+48314490,28M,1;chr1,+21650136,28M,1;chr21,+15675906,28M,1;chr9,+106120465,28M,1;chr13,+24047341,28M,1;chr2,+125770922,28M,1;chr22,+30263047,28M,1;chr2,+204843020,28M,1;chr12,+130100366,28M,1;chr10,+4068348,28M,1;chr17,+63322228,28M,1;chr11,+83019719,28M,1;chrX,+54143823,28M,1;chr7,+36425437,28M,1;chr16,+19178880,28M,1;chr18,+46417931,28M,1;chr6,+55717991,28M,1;chr3,+75664223,28M,1;chr1,+32452030,28M,1;chr15,+88159172,28M,1;chr2,+61851071,28M,1;chr7,+141613606,28M,1;chr17,+12596976,28M,1;chr19,+3414622,28M,1;chr7,+6890735,28M,1;chr20,+34272363,28M,1;chr9,+90994839,28M,1;chr18,+9638082,28M,1;chr1,+67650276,28M,1;chr1,+220568591,28M,1;chr4,+89058188,28M,1;chr4,+4140808,28M,1;chr1,+202088715,28M,1;chr11,+87269515,28M,1;chr11,+67474784,28M,1;chr4,+43167357,28M,1;chr7,+67457466,28M,1;chr16,+19891760,28M,1;chr20,+25234269,28M,1;chr12,+55369476,28M,1;chr4,+6141505,28M,1;chr10,+29354543,28M,1;chr5,+166192505,28M,1;chrX,+48884710,28M,1;chr6,+134330810,28M,1;chr4,+160376376,28M,1;chr4,+99817350,28M,1;chr10,+121317660,28M,1;chr12,+74218473,28M,1;chr9,+32910016,28M,1;chr8,+69378187,28M,1;chrY,+18963621,28M,1;chr5,+6914382,28M,1;chr2,+68235232,28M,1;chr10,+13942898,28M,1;chr2,+80178815,28M,1;chr17,+26736416,28M,1;chr20,+40349589,28M,1;chr15,+23140038,28M,1;chrX,+121086049,28M,1;chr3,+181657140,28M,1;chr15,+66492254,28M,1;chr10,+88050421,28M,1;chr5,+90017384,28M,1;chr17,+36256463,28M,1;chr7,+151013744,28M,1;chr8,+30617505,28M,1;chr6,+31902798,28M,1;chr6,+46224124,28M,1;chr6,+156992688,28M,1;chr11,+59390750,28M,1;chr13,+106355845,28M,1;chr20,+4185147,28M,1;chr9,+110284660,28M,1;chr10,+109112359,28M,1;chr14,+75178252,28M,1;chr10,+95667563,28M,1;chr2,+157160276,28M,1;chr4,+137463808,28M,1;chr4,+62742455,28M,1;chr21,+16861620,28M,1;chr13,+42603913,28M,1;chr5,+88099616,28M,1;chr18,+59093425,28M,1;chr7,+5592293,28M,1;chr2,+169057205,28M,1;chr2,+230616223,28M,1;chr17,+7532710,28M,1;chr11,+18249822,28M,1;chr11,+124575250,28M,1;chr17,+36208776,28M,1;chr12,+51408636,28M,1;chr3,+181394862,28M,1;chr8,+3343335,28M,1;chr4,+72726246,28M,1;chr4,+184703799,28M,1;chr9,+37367170,28M,1;chr3,+37229983,28M,1;chr18,+19786650,28M,1;chr3,+142855780,28M,1;chr16,+63684651,28M,1;chr2,+169863074,28M,1;chr5,+57467010,28M,1;chr16,+68641846,28M,1;chr1,+218080386,28M,1;chr3,+49931339,28M,1;chr8,+91965023,28M,1;chr1,+64882723,28M,1;chr10,+44040423,28M,1;chr1,+27841637,28M,1;chr3,+32964826,28M,1;chrX,-14075583,28M,1;chrY,-19735409,28M,1;chr3,-61210077,28M,1;chr12,-25148105,28M,1;chr6,-46827553,28M,1;chr8,-56057364,28M,1;chr5,-116062081,28M,1;chr6,-114038567,28M,1;chr1,-25697211,28M,1;chr2,-73266904,28M,1;chr5,-175028383,28M,1;chr8,-3051929,28M,1;chr22,-25543121,28M,1;chr6,-26792622,28M,1;chr17,-37194552,28M,1;chr17,-57538339,28M,1;chr1,-51140531,28M,1;chr13,-94647414,28M,1;chr20,-32448950,28M,1;chr1,-238865938,28M,1;chr6,-119062752,28M,1;chr20,-10852575,28M,1;chr11,-124936858,28M,1;chr11,-112719434,28M,1;chr8,-65050045,28M,1;chr11,-111428922,28M,1;chr3,-50585823,28M,1;chr17,-40620860,28M,1;chr9,-79518493,28M,1;chr6,-72507285,28M,1;chr12,-104465353,28M,1;chr2,-131394877,28M,1;chr2,-132001670,28M,1;chr8,-81578043,28M,1;chr20,-37724057,28M,1;chr22,-47141401,28M,1;chr6,-46531919,28M,1;chr9,-9009407,28M,1;chr11,-124465447,28M,1;chr21,-28931439,28M,1;chr18,-61702652,28M,1;chr4,-37711424,28M,1;chr1,-149741655,28M,1;chr13,-78712904,28M,1;chr14,-68009392,28M,1;chr2,-78892078,28M,1;chr1,-149356753,28M,1;chr5,-172533734,28M,1;chr2,-173762459,28M,1;chr2,-198549736,28M,1;chr2,-150821070,28M,1;chr11,-47699839,28M,1;chr17,-42866270,28M,1;chr5,-173490523,28M,1;chr6,-24001074,28M,1;chr1,-39682911,28M,1;chr4,-4222769,28M,1;chr10,-111743035,28M,1;chr11,-128684387,28M,1;chr20,-11257956,28M,1;chr20,-4149529,28M,1;chr5,-164974199,28M,1;chr3,-84991544,28M,1;chr5,-5908988,28M,1;chr2,-138324702,28M,1;chr5,-22429210,28M,1;chr15,-84551893,28M,1;chr6,-73756333,28M,1;chr14,-86022032,28M,1;chr12,-61162349,28M,1;chr13,-42155113,28M,1;chr16,-8376743,28M,1;chrX,-25947951,28M,1;chr13,-37707269,28M,1;chr20,-52341305,28M,1;chr8,-32439586,28M,1;chrX,-65037782,28M,1;chr15,-35588112,28M,1;chr6,-114826977,28M,1;chr16,-22957281,28M,1;chr2,-29152353,28M,1;chr11,-32021557,28M,1;chr14,-53067145,28M,1;chr15,-74660451,28M,1;chr9,-125814020,28M,1;chr2,-47888617,28M,1;chr6,-103141276,28M,1;chr2,-38287203,28M,1;chr14,-75792495,28M,1;chr3,-116403271,28M,1;chr12,-122920160,28M,1;chr1,-192176238,28M,1;chr17,-17438208,28M,1;chr2,-117287007,28M,1;chr11,-68195410,28M,1;chr16,-76921888,28M,1;chr1,-113847491,28M,1;chr5,-166230578,28M,1;chr12,-41106211,28M,1;chrX,-116017871,28M,1;chr6,-107154514,28M,1;chrX,-5600375,28M,1;chr5,-92345920,28M,1;chr5,-176706961,28M,1;chr11,-84337889,28M,1;chr14,-65707185,28M,1;chr7,-66648805,28M,1;chr7,-139066097,28M,1;chr10,-86865072,28M,1;chr3,-73488878,28M,1;chr5,-158663415,28M,1;chr2,-43545165,28M,1;chr6,-69160212,28M,1;chr20,-55152586,28M,1;chr3,-146595642,28M,1;chr10,-88376880,28M,1;chr8,-68384647,28M,1;chr16,-30821557,28M,1;chrX,-69242160,28M,1;chr8,-40818508,28M,1;chr3,-197716909,28M,1;chr2,-241964069,28M,1;chr1,-150748134,28M,1;chr17,-5098791,28M,1;chr2,-135759985,28M,1;chr8,-42470825,28M,1;chr1,-166779724,28M,1;chr16,-63793250,28M,1;chr10,-21864107,28M,1;chr18,-28817256,28M,1;chr17,-13910779,28M,1;chr17,-57348966,28M,1;chr7,-137391223,28M,1;chr19,-23655174,28M,1;chr17,-64986763,28M,1;chr16,-21167483,28M,1;chr11,-42817287,28M,1;chr11,-13533098,28M,1;chr22,-31622164,28M,1;chr4,-21126811,28M,1;chr18,-66802141,28M,1;chr10,-96291396,28M,1;chr4,-145004956,28M,1;chr1,-107823475,28M,1;chr11,-2255057,28M,1;chr19,-28323682,28M,1;chr5,-2777444,28M,1;chr4,-121847688,28M,1;chr13,-54002436,28M,1;chr4,-8970065,28M,1;chr13,-81895317,28M,1;chr6,-85079405,28M,1;chr4,-9504061,28M,1;chr2,-136295178,28M,1;chr3,-196067725,28M,1;chr8,-18303975,28M,1;chrX,-21470871,28M,1;chr3,-194098768,28M,1;chr22,-47888023,28M,1;chr19,-17652453,28M,1;chr3,-32034656,28M,1;chr1,-20438413,28M,1;chr11,-99259713,28M,1;chr3,-177057675,28M,1;chr9,-95123722,28M,1;chr18,-76417358,28M,1;chr6,-100247652,28M,1;chr3,-140933488,28M,1;chr19,-2486490,28M,1;chr15,-73938461,28M,1;chr13,-95995526,28M,1;chr11,-48289844,28M,1;chr5,-72218725,28M,1;chr18,-61103078,28M,1;chr1,-117442797,28M,1;chr7,-143195374,28M,1;chr14,-88665236,28M,1;chr10,-105896107,28M,1;chr12,-89971388,28M,1;chr19,-14741205,28M,1;chr1,-247103257,28M,1;chr13,-106746329,28M,1;chr17,-74646298,28M,1;chr22,-27259346,28M,1;chr8,-131520642,28M,1;chr18,-63913876,28M,1;chr1,-8696036,28M,1;chr3,-132074330,28M,1;chr8,-133889374,28M,1;chr14,-51395758,28M,1;chr4,-22649515,28M,1;chrX,-15236428,28M,1;chr2,-32796028,28M,1;chr19,-58872058,28M,1;chr11,-37627459,28M,1;chr20,-9564948,28M,1;chr8,-30080229,28M,1;chr13,-73402183,28M,1;chr17,-71119116,28M,1;chr8,-63170581,28M,1;chr9,-39465483,28M,1;chr9,-41610501,28M,1;chr9,-40793070,28M,1;chr12,-30506726,28M,1;chr16,-22438117,28M,1;chr12,-33319234,28M,1;chr21,-32371401,28M,1;chr5,-126791414,28M,1;chr8,-20355956,28M,1;chr15,-59301146,28M,1;chr2,-48648533,28M,1;chr7,-48022928,28M,1;chr5,-29797589,28M,1;chr12,-54092686,28M,1;chr16,-11434195,28M,1;chr17,-58971405,28M,1;chr19,-43931598,28M,1;chr7,-91707288,28M,1;chr3,-185465634,28M,1;chr8,-117592194,28M,1;chr4,-125205639,28M,1;chr6,-114161269,28M,1;chr13,-91715527,28M,1;chr10,-98692195,28M,1;chr7,-17789580,28M,1;chr2,-152298559,28M,1;chr19,-47866013,28M,1;chrX,-152022933,28M,1;chr6,-42355529,28M,1;chr7,-115116598,28M,1;chr4,-55514389,28M,1;chr1,-162526013,28M,1;chr6,-53169231,28M,1;chr8,-22225996,28M,1;chr4,-145044601,28M,1;chr1,-150288526,28M,1;chr12,-104184041,28M,1;chr10,-70469042,28M,1;chr8,-37870308,28M,1;chr7,-139506036,28M,1;chr19,-23655169,28M,1;chr1,-8943144,28M,1;chr9,-93078553,28M,1;chr16,-68274470,28M,1;chr1,-28021897,28M,1;chr17,-36306267,28M,1;chr17,-60297701,28M,1;chr4,-175699094,28M,1;chr3,-138640873,28M,1;chr14,-42606743,28M,1;chr10,-29007373,28M,1;chr8,-32366590,28M,1;chr4,-144977946,28M,1;chr3,-73413315,28M,1;chr5,-102654091,28M,1;
+++ /dev/null
-@SQ SN:chr1 LN:1575
-@SQ SN:chr2 LN:1584
-@PG ID:bwa PN:bwa VN:0.7.9a-r786 CL:bwa mem -p -t 8 -M -R @RG ID:None SM:None /mnt/data/hg19.fa /mnt/analysis/default-0.fastq
-EAS56_57:6:190:289:82 69 chr1 100 0 * = 100 0 CTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACAAA <<<7<<<;<<<<<<<<8;;<7;4<;<;;;;;94<; MF:i:192
-EAS56_57:6:190:289:82 137 chr1 100 73 35M = 100 0 AGGGGTGCAGAGCCGAGTCACGGGGTTGCCAGCAC <<<<<<;<<<<<<<<<<;<<;<<<<;8<6;9;;2; MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:3:190:727:308 99 chr1 103 99 35M = 263 195 GGTGCAGAGCCGAGTCACGGGGTTGCCAGCACAGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::<<<844 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:7:141:80:875 99 chr1 110 99 35M = 265 190 AGCCGAGTCACGGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<8;<<8+7;-7 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:3:40:1128:1940 163 chr1 112 99 35M = 291 214 CCGAGTCACGGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<5;;<<<9;;;;7: MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:5:290:319:736 69 chr1 113 0 * = 113 0 GTTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAAC <<<<<<:7:<.<<<<7<<.<.<<.9*<4<:<4%74 MF:i:192
-EAS51_62:5:290:319:736 137 chr1 113 73 35M = 113 0 CGAGTCACGGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCT ==;=======7====6=;==:;;====66=::27: MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:2:132:493:921 69 chr1 119 0 * = 119 0 GTTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<77;0<;;6777 MF:i:192
-B7_597:2:132:493:921 137 chr1 119 75 35M = 119 0 ACGGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTG <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<;;88: MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:7:283:799:560 163 chr1 121 66 35M = 283 197 GGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGAC <<<<+<<<<8<<<+<<<<<;<<:07;8;7402447 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:1:225:195:543 99 chr1 123 99 35M = 299 211 GGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<;::388998 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:6:114:714:317 99 chr1 126 99 35M = 311 220 TGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<5;<; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:1:70:147:84 163 chr1 128 73 35M = 285 192 CCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;(5<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:2:187:227:818 163 chr1 129 99 35M = 290 196 CAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<;<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:4:77:29:126 99 chr1 131 99 35M = 315 219 GCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCT <<<<<<<<<<3<<<<<<<;;;7<;<<449<-:977 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:4:327:795:103 99 chr1 133 99 35M = 302 204 ACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:3:139:117:262 69 chr1 135 0 * = 135 0 GTTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAAC <<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<37;3 MF:i:192
-EAS114_30:3:139:117:262 137 chr1 135 76 35M = 135 0 AGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTG <<<<;<<<<<<<<<<<<<:<<<<<:<<8<<<<:<: MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:5:29:817:854 73 chr1 135 77 35M = 135 0 AGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:5:29:817:854 133 chr1 135 0 * = 135 0 GTTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTTTATGTGAAC <<<<<<<<<<<<<<<1..;:;;;;1%407)07&7. MF:i:192
-EAS192_3:6:170:169:57 163 chr1 138 99 35M = 296 193 GGCTTGACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCC <<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<:<<<<<;;+% MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:2 UQ:i:30 H0:i:0 H1:i:1
-B7_595:4:84:802:737 99 chr1 140 68 35M = 284 179 CTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCAAG <<<<<<<<<<;9<9<<<;<<;73;<<<<<37;1+. MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_4:7:78:583:670 163 chr1 142 99 35M = 316 209 TAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCT <<<<<<<<<<;;;<;;<<<:7;5;<5;;<2--8-; MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:3:90:435:691 99 chr1 147 99 35M = 318 206 TCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAGT <<<<<<<<<<;<<<;<<<<:<<<;<81;<<1;784 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:3:13:122:187 163 chr1 153 99 35M = 343 225 GACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAGTCCCCTT <<<<<<<;<;<<<;<<<<:;6<<<<;;;;:<<%%< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:6:69:735:1915 99 chr1 154 99 35M = 321 202 ACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAGTCCCATTT <<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<;<8<<<<;1:<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:5:66:959:1311 163 chr1 159 95 35M = 336 212 CAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAGGCCCATCTGGAGC ;;4;;;+;;;-01;;&-;;4;;&;;73)(&**274 MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:2 UQ:i:12 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_57:6:325:759:288 99 chr1 163 99 35M = 341 213 GCTGCTGGCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCT 8<;<<<<81<<<<<;<<;<<<;9</;6;;809034 MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:7:82:926:112 99 chr1 164 99 35M = 328 199 CTGCTGGCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTC <;<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<;<<1:<4< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:324:728:956 99 chr1 165 99 35M = 322 192 TGCTGGCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<:<::;;;;<:< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:4:294:525:849 163 chr1 167 99 35M = 340 208 CTGGCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9+<:<<<<9;;15 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:7:159:125:297 163 chr1 170 99 35M = 337 202 GCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCACTCTAAGAC <<<<<<<<<<<<<<;<<<;<;<<6;)<:9;26;39 MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:2 UQ:i:26 H0:i:0 H1:i:1
-EAS54_65:6:164:797:930 99 chr1 173 99 35M = 332 194 AGCTAGAGACCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTT <<<<<<<<<<<<<<<;;;:<<<<<;<;<<<<<,:: MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS54_81:7:293:355:321 163 chr1 174 99 35M = 356 217 GCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTC <<<:<;<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<;4<<<:+:< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:1:209:653:400 163 chr1 175 99 35M = 340 200 CTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCT <;<9<<+<2<9<,;;64;<<<<;8<00*1<48:+8 MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:2:62:1109:804 163 chr1 176 99 35M = 350 209 TAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTA <<<<<<<<<<<<<:<<:<<<<<<:<:<<<<;;;;; MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_78:7:303:402:142 163 chr1 181 99 35M = 343 197 TCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGT <8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<46<648;;'; MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:8:321:642:388 163 chr1 181 99 35M = 357 209 TCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<8; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:2:1:1140:1206 163 chr1 181 99 35M = 368 222 TCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGT ;;;;;;;;;;;;;:9;;7;;:;:;97;:;:88888 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:6:155:68:326 99 chr1 182 99 36M = 332 186 CCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:7:19:886:279 99 chr1 182 99 35M = 337 190 CCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTA <9<<<<<<<<<<<<6<28:<<85<<<<<2<;<9<< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:4:143:69:578 147 chr1 185 98 35M = 36 -184 ATTGGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAATG 222&<21<<<<12<7<01<<<<<0<<<<<<<20<< MF:i:18 Aq:i:35 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:13:981:659 181 chr1 187 0 * = 188 0 CGGGACAATGGACGAGGTAAACCGCACATTGACAA +)---3&&3&--+0)&+3:7777).333:<06<<< MF:i:192
-EAS54_71:4:13:981:659 121 chr1 188 37 34M = 187 0 TGTAGCCCCTCTAAGGCGTTCTATTTGTAATGAA ()&)06636;;<664*6;<<<<<<<<<<<<<<<1 MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:2 UQ:i:14 H0:i:0 H1:i:1
-B7_610:1:37:652:403 163 chr1 193 99 35M = 347 189 CCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTAT <<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:1:282:274:50 163 chr1 193 99 35M = 371 213 CCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTAT <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<99<9<5909;5; MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:2:133:460:542 99 chr1 195 99 36M = 356 197 CCTATAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATT <<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS54_73:5:44:498:945 99 chr1 195 82 35M = 377 217 CCTATAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATAT ;<;<<<<<<<<<<9<;<:<<<<<<:<<<<;:;<3< MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-B7_610:1:139:152:856 99 chr1 198 99 35M = 392 229 CTAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTA <<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<;<<<;<<<<;<;;; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:2:323:639:311 163 chr1 200 99 36M = 357 193 AAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTAGGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<<<;<<<<<<81< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1 UQ:i:23 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:2:18:967:582 163 chr1 200 99 35M = 398 233 AAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<;<<<<<8 MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:8:186:850:838 99 chr1 205 99 35M = 389 219 GTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATT <<<<<;<<<<<<<<<<<:<<<<<;<<<;</<<;<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:3:126:558:408 163 chr1 206 99 35M = 368 197 TTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTC <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<7<;<<;; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:6:157:643:175 163 chr1 206 99 35M = 380 209 TTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTC <<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<)<<<<;< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:5:141:711:813 99 chr1 209 99 35M = 370 196 TATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGT <<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:+< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:6:115:538:276 163 chr1 209 99 35M = 360 186 TATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGT <<<<<<<<;<<<;;<<<;<:<<<:<<<<<<;;;7; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:7:51:1429:1043 83 chr1 209 99 35M = 59 -185 TATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGT 9<5<<<<<<<<<<<<<9<<<9<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:1:176:168:513 163 chr1 210 99 35M = 410 235 ATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTT <<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:&<<<<:;0;; MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:7:282:817:710 99 chr1 211 99 35M = 384 208 TTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<<:8,<<8 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:1:65:787:74 83 chr1 213 88 35M = 61 -187 TGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTA 44848=:1661/66==?:<=:?6><<<<1>><<<< MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:4:240:264:231 121 chr1 213 66 35M = 213 0 TGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTA 9;,;;62<9<)29<<<;96<<<;<<7<<<<<<;<< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:4:240:264:231 181 chr1 213 0 * = 213 0 CAACAGATCAAGAAGGAGGGGCAATGGACGAGTTA %15+5022))0&<<)0)+7:4+&<0<<:0<<<7<< MF:i:192
-EAS1_93:7:14:426:613 99 chr1 214 99 35M = 379 200 GTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAA ======;=;==========;;==3=;==-=<;<;< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:2:173:995:93 163 chr1 215 99 35M = 382 202 TAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<7:<<<<;:<:<<<<:7 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:6:195:348:703 163 chr1 215 99 35M = 353 173 TAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAA <<<<<<<;<<<<<;:<<<<<<<<<<<<:<1:<:7< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:62:879:264 163 chr1 216 99 35M = 396 215 AATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:4:83:452:970 99 chr1 216 99 35M = 379 198 AATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAAT ==========================;======== MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:2:64:1318:1711 99 chr1 218 99 35M = 389 206 TGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATAT <<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<:<<<<<2<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:8:113:968:19 83 chr1 219 99 35M = 50 -204 GAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATA 8;<;8;9<<<<<<<9<:<<<<<<<<<;<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:4:160:896:275 163 chr1 220 99 35M = 387 202 AAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAG ============<====<==<====<==<==;=:6 MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:6:181:191:418 163 chr1 221 99 36M = 387 202 AAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<988 MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:7:242:354:637 99 chr1 222 99 36M = 417 231 AACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<6<;; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:1:122:77:789 163 chr1 223 99 35M = 396 208 ACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAA <<<:<4<<9<:7<<<:<<<7<<<<<<<<<<9<9<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:5:42:540:501 147 chr1 224 99 36M = 60 -200 CTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATT ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:6:155:12:674 83 chr1 224 99 36M = 52 -208 CTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATT ;<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<8<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:4:106:316:452 147 chr1 224 99 36M = 49 -211 CTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATT :<<<<<;<<<<:<<:<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:5:89:525:113 163 chr1 227 78 40M = 397 210 TATTTATGCTATTCAGTTATAAATATAGAAATTGAAACAG <1<7<6;+0;7;7'<70;-<7<:<:<<5<<:9<5:7:%:7 MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1 UQ:i:12 H0:i:0 H1:i:1
-EAS54_65:3:321:311:983 147 chr1 228 99 35M = 51 -212 ATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAA ;;4;;<7<<<<<<77<<<<<<<<<<17<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:8:76:493:708 147 chr1 229 44 35M = 73 -191 TTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAA 5/)63.&1517(544(055(0454&7706566679 MF:i:18 Aq:i:44 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:2:125:628:79 163 chr1 229 99 35M = 400 205 TTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAA ==================<6<====<<:<==7;:: MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:5:78:583:499 83 chr1 229 74 35M = 37 -227 TTTACGCTATTCAGTACTAAATATAGAAATTGAAA &6&9774&<;67<44&-4<;<9<7<<<<<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:2 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS54_67:3:175:730:949 83 chr1 230 99 35M = 70 -195 TTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAAC <<<<;+<<<<7<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:1:84:275:1572 163 chr1 230 99 35M = 394 199 TTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAAC /6;;;4;;;;;;;;7;;4;.4;;;;;6;;;77077 MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:4:248:753:731 99 chr1 231 99 35M = 402 206 TATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACA <<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<:<<<<&<:<.: MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:1:9:1289:215 99 chr1 231 99 35M = 394 198 TATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACA ;;;;;;9;;;67;;;;;99;9;;;;;;;;977747 MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:7:188:802:71 163 chr1 232 99 35M = 415 218 ATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAG <<<<<<<<<;<<<<<9<<<:<<<:<<<<<<:<<<; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:7:252:171:323 83 chr1 234 99 35M = 43 -226 GCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCT ;8<;<=3=6==:====;;======;========== MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:5:223:142:410 147 chr1 235 99 35M = 60 -210 CTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTG 8;<<<;<<<<;<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<;<< MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:1:243:10:911 83 chr1 236 99 35M = 63 -208 TATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGT ;<;;;<4;9:<<<;<<;<<<<<;;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:6:5:730:1436 163 chr1 236 99 35M = 403 202 TATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGT ;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;;;;8;;;;;67777 MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:2:57:1672:1890 121 chr1 236 75 40M = 236 0 TATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTA :;;;9<8;;*<<<<<<:<<<<<<<<1:<<<<<<<<<<<7< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:2:57:1672:1890 181 chr1 236 0 * = 236 0 CCCCCCCCCCCCCCCCCAGCCACTGCGGCCCCCCCAGCCA -+)%)'-'+,,<066,))090+:&486083:5&&:<<5<0 MF:i:192
-EAS1_105:2:299:360:220 99 chr1 237 99 35M = 403 201 ATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTG <<<<<<<9<9<<<<<<<<<<<<<<<<<5<;<0<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:2:24:1037:84 163 chr1 238 99 35M = 415 212 TTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;:<57< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:3:86:823:683 163 chr1 240 99 35M = 408 203 CAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTT <<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;9<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:4:130:568:978 99 chr1 246 88 35M = 434 223 TAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGAC 7<<;<<;<7<:;<7<<<<<<<<);4;+<7+3+%;< MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:1 UQ:i:26 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:4:73:1208:495 163 chr1 246 99 35M = 431 220 TAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCC ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5;;;;;37377 MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:7:264:642:506 99 chr1 247 99 35M = 420 208 AAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTATTGTAT <<;<<<<<<;<<<;:;;:;;<<;<<<<;*+;*&.4 MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:3 UQ:i:28 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:5:104:350:749 163 chr1 247 99 36M = 415 204 AAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTT <<8<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<0;<<<9;<85;;; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:6:227:259:597 147 chr1 248 99 35M = 61 -222 AATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTT <8<;2;9;<;;-92<;;;<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_32:7:113:809:364 99 chr1 250 99 35M = 413 198 TATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;<;<<<4 MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:2:218:877:489 83 chr1 250 86 35M = 80 -205 TATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTG 9<<<8<<<;<9<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:7:20:979:96 83 chr1 254 99 35M = 79 -210 GAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCA '9996;(:;-<;1<<<<=<<<<=<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:2:259:219:114 99 chr1 254 99 35M = 411 192 GAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCA <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<7<7<<<<<0<<9< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:6:13:1034:1144 99 chr1 256 99 35M = 429 208 AATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<<;<<;<++ MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:2 UQ:i:48 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:2:29:1486:672 147 chr1 256 99 35M = 79 -212 AATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCACA <<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<++ MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:2 UQ:i:54 H0:i:0 H1:i:0
-EAS139_11:7:46:695:738 163 chr1 259 74 35M = 428 204 TGAAACAGCTGAGTTTAGCGCCTGTGTTCACATAG <;<<<<;<<),&4<3<<7&7<0;)).3;79;7<;0 MF:i:130 Aq:i:74 NM:i:3 UQ:i:18 H0:i:0 H1:i:0
-EAS139_11:8:26:1221:222 163 chr1 261 99 35M = 446 220 AAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:3:190:727:308 147 chr1 263 99 35M = 103 -195 ACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTG ;;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:3:284:261:124 83 chr1 263 99 35M = 79 -219 ACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTG ===27===.====&===========;;======== MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:7:141:80:875 147 chr1 265 99 35M = 110 -190 AGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCA 6/<;84<;<;<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:3:24:1135:563 163 chr1 266 99 40M = 446 220 GCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCAACAACC <<<<:<<<<:1:<<<<<<.<<<<<<<<;<;;;43+:30:: MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:2:90:986:1224 83 chr1 267 99 35M = 67 -235 CTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCAAC <7*37;;;;;;;9<<;<7<<<<<<<<<<<;;<<<< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:7:287:492:169 99 chr1 269 99 36M = 449 216 GTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCAACAAC <<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8;;<;6<<; MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:1:48:9:409 99 chr1 271 75 18M5I12M = 464 228 GTTTAGTGCCTTTGTTCACATAGACCCCCTTGCAA <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS139_19:1:87:1222:878 163 chr1 272 10 40M = 435 203 TATAGGGCCTTTGTTCAAACCCCTTGCAACAACCTTGAGA &+6<6&<:<<9<1112<<;)9227</);;;2-79;)/769 MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:3 UQ:i:41 H0:i:0 H1:i:0
-B7_591:7:200:192:373 163 chr1 275 75 14M5I17M = 451 212 AGTGCCTTTGTTCACATAGACCCCCTTGCAACAACC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<;5<<;<< MF:i:130 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS56_65:1:163:846:223 163 chr1 278 74 11M5I19M = 463 220 GCCTTTGTTCACATAGACCCCCTTGCAACAACCTT <<<<;<<;4<<<;;9<<<<<+<<;<</27;;47;. MF:i:130 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_30:7:283:799:560 83 chr1 283 66 35M = 121 -197 ACATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCA <4<6<8;;6<<<+;<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-B7_595:4:84:802:737 147 chr1 284 68 35M = 140 -179 CATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAG +<1<-;69;;;;8;:<<6<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS51_66:5:308:400:602 163 chr1 285 71 35M = 470 220 ATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGG ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;<<;<;76 MF:i:130 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS54_81:2:285:367:932 163 chr1 285 74 35M = 440 190 ATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGG ===========;======;=====;=======5== MF:i:130 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_39:1:70:147:84 83 chr1 285 73 35M = 128 -192 ATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGG <<<:<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:130 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS51_62:3:314:386:190 99 chr1 287 98 35M = 459 207 AGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGA ++<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<< MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:2 UQ:i:54 H0:i:0 H1:i:0
-EAS56_65:1:53:272:944 99 chr1 287 99 35M = 447 195 CAACCCCCTTGCAACAACCTTGCGAACCCCAGGGA <<<<<<<<<<<<.7<.<<<<<<-<-<<<<<&<222 MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:12 H0:i:0 H1:i:1
-EAS188_7:5:112:51:128 163 chr1 287 99 35M = 477 225 AGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGA ++<<<<<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<;<;<6 MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:2 UQ:i:54 H0:i:0 H1:i:0
-EAS56_57:6:44:280:641 163 chr1 288 99 35M = 454 201 AACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAA ;<<<<<<<<<<66<;<<<<<;<<2;;;<<;;;;,; MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:6:75:946:1035 99 chr1 288 99 35M = 480 227 AACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAA <<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<8;<6<<<<44<:4 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:2:187:227:818 83 chr1 290 99 35M = 129 -196 CCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATT <<9<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:3:40:1128:1940 83 chr1 291 99 35M = 112 -214 CCCCTTACAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTT <<<:///77:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1 UQ:i:14 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:72:63:435 99 chr1 293 99 34M = 490 232 CCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<;;39:7:7 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:6:271:244:568 99 chr1 294 99 35M = 481 222 CTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<.<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:7:82:902:868 99 chr1 295 99 35M = 471 211 TTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCA <<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:7:313:83:546 163 chr1 296 99 35M = 454 193 TGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAA <<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<4<<<:<;<<9 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:4:57:786:414 163 chr1 296 99 35M = 453 192 TGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:<<:;;7<7 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:7:260:985:520 163 chr1 296 99 35M = 468 207 TGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAA <<<<<<<<<<<<<<<<<;:;<<;<:<<<,:1;)<; MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:6:170:169:57 83 chr1 296 99 35M = 138 -193 TGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAA 778<:<<<9<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:6:199:327:965 163 chr1 297 91 35M = 494 232 NCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAAT !,+*+++++++++++*+++++++**)+*+**+(** MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:1 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:1
-B7_610:5:147:68:353 163 chr1 299 99 35M = 486 222 AACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGT <;<;<<7<<<<<<<7<<;;<7<4<8<<<8.;4;;; MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:1:225:195:543 147 chr1 299 99 35M = 123 -211 AACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGT ;;8;;+;(<<<<<<<<7;<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:1:303:184:14 163 chr1 301 99 35M = 479 213 CAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCA <<<<<<8<0<<<<-<-98<<--<<<6;076;75+& MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:6:326:309:149 163 chr1 301 99 35M = 467 201 CAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<;;;;: MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:4:327:795:103 147 chr1 302 99 35M = 133 -204 AACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAG ;::;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:7:110:355:323 99 chr1 303 99 35M = 477 209 ACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;;<<8; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:1:18:1418:237 99 chr1 304 99 35M = 503 234 CCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<7< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:7:112:203:90 163 chr1 305 99 35M = 470 200 CTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGA <<:<<<<<<<<.<<<<<<<<<<<<6<:867<8884 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:7:319:246:304 99 chr1 305 99 35M = 472 202 CTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;: MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:6:114:714:317 147 chr1 311 99 35M = 126 -220 AACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGC ;8<;:<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:5:327:991:508 99 chr1 312 99 35M = 495 218 ACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;:<7:47;:75; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:4:77:29:126 147 chr1 315 99 35M = 131 -219 ACAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTT ()9;;<<<<<<<<<<5<<<7<<<<<<;<<<;7<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1 UQ:i:7 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:1:37:1004:1136 99 chr1 315 99 35M = 473 193 CCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTT <<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<:<<;;369<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_4:7:78:583:670 83 chr1 316 99 35M = 142 -209 CAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTT 8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:3:90:435:691 147 chr1 318 99 35M = 147 -206 GGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGT ;;<;;;+<<:<<<:<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:6:69:735:1915 147 chr1 321 99 35M = 154 -202 AATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAG <<::<<<7<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:324:728:956 147 chr1 322 99 35M = 165 -192 ATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGT <;;;;5;<<0<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:5:269:280:716 99 chr1 323 99 35M = 490 202 TTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTTTCAGTT <<<<<<<<<2<<:2:1<<7/2/:3<<<<*<3($<< MF:i:18 Aq:i:58 NM:i:1 UQ:i:9 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:3:88:24:744 163 chr1 325 84 35M = 484 194 TGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTTGAAGTTTA <7*:<<::.'<<<<:<<:<<'<63'6+'303*%%+ MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:5 UQ:i:53 H0:i:0 H1:i:0
-EAS1_108:7:82:926:112 147 chr1 328 99 35M = 164 -199 CAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTGCCAA <1:/<*6<<6<<<<<6<<<<<<4<<<<82<+<<<< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_63:7:185:213:330 163 chr1 328 99 35M = 502 209 CAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAA <<<<<<<<<;<<;<<<<<;<<<<;;;<<;<<;<38 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:3:277:458:330 163 chr1 329 99 36M = 490 197 AATGTCAGGGAAGGAGCCTTTTGTCAGTTACCAAAT <<7<<<<<<<<<2<<<%,<6<&<<,<<<<:<<<<(7 MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:11 H0:i:0 H1:i:1
-B7_595:1:81:1000:375 163 chr1 329 90 35M = 524 230 NATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAA !.............................+.(+. MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:1 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:1
-EAS220_1:8:33:672:473 99 chr1 330 99 35M = 515 220 ATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAAT <<<<<<<<7<7<7<<62<<<<66<15*/99*5241 MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:6:164:797:930 147 chr1 332 99 35M = 173 -194 GTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGT ;;:;8<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:6:155:68:326 147 chr1 332 99 36M = 182 -186 GTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTG ;<<<:6<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:5:202:39:380 99 chr1 334 99 35M = 513 214 CAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGT <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<:;<<18<84:<&<+< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:7:42:1091:1726 99 chr1 334 99 35M = 502 203 CAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<8:<.<: MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:5:66:959:1311 83 chr1 336 95 35M = 159 -212 GGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTT 67.68:4::6;;;7:6:;:5;8;;<<:;;<;;;;< MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:1:200:559:765 99 chr1 337 99 36M = 521 220 GGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTAT <<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<;<<;;4<7<9;<<-; MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:328:669:662 99 chr1 337 99 34M = 512 210 GGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+9;<;;.<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:7:159:125:297 83 chr1 337 99 35M = 170 -202 GGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTA 89<;;8<<;<;<4<;<8<<<<;;8<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:7:19:886:279 147 chr1 337 99 35M = 182 -190 GAAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTA 9%<2)2.2::<;<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:1:209:653:400 83 chr1 340 99 35M = 175 -200 AGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTA <69<98<+<<6<<4<<<<</4<<:<4<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:4:294:525:849 83 chr1 340 99 35M = 167 -208 AGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTA ;<;:;:<;<;<<<3<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:4:87:1375:1303 163 chr1 340 99 35M = 529 224 AGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTA <<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:6:325:759:288 147 chr1 341 99 35M = 163 -213 GGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTAC 9;<9<;<;;<;<;<;<<<:<;<<<;<<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:7:76:786:458 163 chr1 341 99 35M = 502 196 GGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTAC <<.<<<<2<<:84<:<<<:<8<<)<)429<2<<8< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:1:210:880:606 163 chr1 341 99 35M = 518 212 GGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:<<<<3<<8& MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:3:257:611:440 99 chr1 341 99 35M = 524 218 GGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<;<<<<8<<+5 MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_78:7:303:402:142 83 chr1 343 99 35M = 181 -197 AGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCA ;;;;;<9<<8;<<<<7<<;<<<<;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:3:13:122:187 83 chr1 343 99 35M = 153 -225 AGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCA <<&<;;<<<;7<<<<;<;<<<<<<<<<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:3:80:885:513 163 chr1 344 99 35M = 507 198 GCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<2:<;<<75<7; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:7:90:1873:89 99 chr1 344 99 35M = 531 222 GCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<7<<<7 MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:1:37:652:403 83 chr1 347 99 35M = 193 -189 TTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGG <;<<<<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:8:28:701:724 163 chr1 347 99 35M = 521 209 TTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGG <<<<<<7<<<<<<7::<:<<-<<::::::<747:: MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:8:66:655:769 99 chr1 348 99 35M = 515 202 TTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGG 8;<<<<<8<<<<<;<<<7<;<<<<<;<7<27<;;7 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:5:231:339:551 163 chr1 350 99 35M = 527 212 TGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGAT <<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<;5<<46;<;:1 MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:6:129:694:359 163 chr1 350 88 35M = 525 210 TGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCCGAGGGAT ============+7=======:==;;;'=;==7;= MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:6 H0:i:0 H1:i:1
-EAS220_1:2:62:1109:804 83 chr1 350 99 35M = 176 -209 TGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGAT <<<<<:<<<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:8:157:935:374 99 chr1 353 99 35M = 512 194 CAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGA <<<<<<<<<<;<<;;<<<<<<<<<::8'5++;+11 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:4:103:111:720 99 chr1 353 99 36M = 512 195 CAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<5;<5<:; MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:7:311:100:539 163 chr1 353 99 35M = 508 190 CAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGA <<<<;<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<:<::;7;<0; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:6:195:348:703 83 chr1 353 99 35M = 215 -173 CAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGA <9<<9</<<<<<<<<<<<<<<2<8<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:6:72:308:839 163 chr1 354 99 40M = 517 203 AGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<;<99494416: MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:2:133:460:542 147 chr1 356 99 36M = 195 -197 TTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGA ;:;7;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:7:293:355:321 83 chr1 356 99 35M = 174 -217 TTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGG <<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:2:323:639:311 83 chr1 357 99 36M = 200 -193 TACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAA -94<<<<<<<4<<<<<<<<2<<<<<7<<<-<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:8:321:642:388 83 chr1 357 99 33M = 181 -209 TACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGG 19<<<<<8<<<<<<<<;<<<<<<<<<<7<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:4:262:456:74 99 chr1 357 99 35M = 504 182 TACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;:;7:<::7<7:3 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:8:95:426:791 99 chr1 359 99 35M = 547 223 CCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAG <<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<,<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:6:115:538:276 83 chr1 360 99 35M = 209 -186 CAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGA :<<<<<<<<;;<5<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:1:196:533:921 99 chr1 361 99 35M = 526 200 AAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAG =====1========8===:===7======971=3= MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:5:121:380:656 99 chr1 362 99 35M = 542 215 AATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<83<:<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:3:34:970:1374 99 chr1 363 99 35M = 520 192 ATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGG <<<<<<<<<<<<<<;7<77;<<;<;;9;;:86::: MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:4:29:1061:574 163 chr1 363 99 35M = 563 235 ATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<8<:<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:1:124:243:35 99 chr1 364 60 35M = 544 215 TGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGCGA <<<<<;;<<<<<<:<<<.<<<:++5+:1(;1;$<( MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:1 UQ:i:3 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:2:272:750:698 163 chr1 365 80 35M = 538 208 GTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGATGACGGAC <)<<<<<7;<<<4<;7<<<<78068:(%<3*861, MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:2 UQ:i:13 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_53:3:126:558:408 83 chr1 368 99 35M = 206 -197 TTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCT <:<<:;;<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:2:1:1140:1206 83 chr1 368 99 35M = 181 -222 TTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCT 77977::99;;;:;;<;;;:;;;<<;<;;;;<;;; MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:5:141:711:813 147 chr1 370 99 35M = 209 -196 TATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGA =<5<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:1:282:274:50 83 chr1 371 99 35M = 193 -213 ATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAA </7;/:<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:8:46:485:482 99 chr1 371 94 35M = 530 194 ATTACCAGAGGGATGAAGGGAAGAGGGACGCTGAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<:<:89< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_63:1:119:446:185 163 chr1 372 99 35M = 562 225 TTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAG <<<<<<<7<<<4<<<<9<<54<:<7<5:<::7-5; MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:3:168:69:605 163 chr1 373 67 36M = 565 228 TACCCGAGGGATGGAGGGTAGAGGGACGCTGAAGTG <<<4(<<<<<<<<<<<<<(1<6<-<2<<7<<6<<++ MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:4 UQ:i:59 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_32:6:78:909:394 163 chr1 373 81 35M = 554 216 TACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGA <<<<<<8<<<&<<<-<<<14,4;<<-0<2+<)/82 MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:5:41:118:1246 99 chr1 374 99 35M = 548 209 ACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<</<<<<<<1<<( MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:5:44:498:945 147 chr1 377 82 35M = 195 -217 ATAGGGATGGAGGGAAGAGGGCCGCTGAAGAACTT <%*50<7<4<<<7<,<<.<8/,9<:</<<<;<;<< MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:2 UQ:i:15 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_39:5:50:972:1286 163 chr1 377 99 35M = 559 217 AGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTT <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<6<<7:7:; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:6:82:164:1924 163 chr1 378 99 35M = 542 199 GAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<3<<'<7<8 MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:7:14:426:613 147 chr1 379 99 35M = 214 -200 AGGGAGGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTG :<<<<&<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:4:83:452:970 147 chr1 379 99 35M = 216 -198 AGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTG <<<39<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:6:157:643:175 83 chr1 380 99 35M = 206 -209 GGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGA ;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:8:61:1797:113 99 chr1 380 99 35M = 551 206 GGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGA <<<<<<;<<<<;:<3<<<<;;<<<8<<;:<<;3<. MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:5:90:828:633 163 chr1 381 99 36M = 537 192 GGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATG <<<<<<<<<<<8<;96<;<<<<<99<2<<;<96<8; MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:4:61:433:385 163 chr1 381 99 35M = 579 233 GGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGCACTTTGAT <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<6<<)91<<;;,; MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:8 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_93:2:173:995:93 83 chr1 382 99 35M = 215 -202 GCTGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATG <(0<<9<<<7<<<<<<7<<<<<<<<<7<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:1 UQ:i:7 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:3:254:32:275 99 chr1 382 99 34M = 575 228 GATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<:<::<:2*< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:7:282:817:710 147 chr1 384 99 35M = 211 -208 TGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCC 366=6;======8====:========;======== MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:75:217:337 163 chr1 386 99 35M = 568 217 GAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCT ;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;;;;;;;;;;88787 MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:6:181:191:418 83 chr1 387 99 36M = 221 -202 AGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:4:160:896:275 83 chr1 387 99 35M = 220 -202 AGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTC ;;;9;<<<<<<;<;;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:3:88:1656:896 99 chr1 387 99 40M = 538 191 AGGGAAGAGGGATGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTT <<<9<<<<<<<9<<<;<<<<<<<<<;6<<;7<<<<::9:; MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-B7_597:8:186:850:838 147 chr1 389 99 35M = 205 -219 GGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTT <;<;<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:2:64:1318:1711 147 chr1 389 99 35M = 218 -206 GGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:78:1478:1446 99 chr1 389 99 35M = 560 206 GGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<:<<<; MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:82:879:246 163 chr1 391 99 35M = 576 220 AAGAGGGACGCTGAAGAATTTTGATGCCCTCTTCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<&<<<77<<-<<<6<62< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-B7_610:1:139:152:856 147 chr1 392 99 35M = 198 -229 AGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTT <<<<<;<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:2:162:503:769 99 chr1 392 99 35M = 571 214 AGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTT ========================:========== MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:3:216:988:883 163 chr1 392 99 35M = 584 227 AGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTT <<<<<<<<<<<<8;<;88<;8;;;;828;8;8;;; MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:7:118:523:591 163 chr1 393 99 35M = 563 205 GAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<;;<; MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:3:168:741:680 163 chr1 394 99 35M = 562 203 AGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:79 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:1:9:1289:215 147 chr1 394 99 35M = 231 -198 AGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCC 7747*7;;;;+;;:2;7;:1;;9:;:;:;;:;::; MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:1:84:275:1572 83 chr1 394 99 35M = 230 -199 AGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCC 777777::7:;74;:;:7;:::;;;;:;;8;;;<; MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:1:122:77:789 83 chr1 396 99 35M = 223 -208 GGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAA 9<;<:<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:62:879:264 83 chr1 396 99 35M = 216 -215 GGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAA ====:=<============================ MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:5:89:525:113 83 chr1 397 78 40M = 227 -210 GACGCTGAAGAACTTTGATTCCCTCTTCTTCCAAAGATGA );:+4-&<<+<<:<+<)<<<7<8<8:<:<<:<82::<<2< MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_39:2:18:967:582 83 chr1 398 99 35M = 200 -233 ACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAG <:<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:3:140:522:212 163 chr1 399 99 35M = 568 204 CGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;<;95; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:2:125:628:79 83 chr1 400 99 34M = 229 -205 GCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGA 95&<<<<<<<63<<<6<<<<8<;<<8<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:6:185:312:167 163 chr1 401 99 35M = 562 196 CTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATG ===========================;855;=== MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:4:248:753:731 147 chr1 402 99 35M = 231 -206 TGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGA 7;55;=,=89=====3===9=======9======= MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:2:299:360:220 147 chr1 403 99 35M = 237 -201 GAAGAACTTAGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAA 66<;;4;<<()<<4<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:7 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_45:6:5:730:1436 83 chr1 403 99 35M = 236 -202 GAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAA 7977979;;;;;;;;;7;3<;2<;26;<;<<;;<< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:2:134:868:252 99 chr1 404 99 36M = 595 227 AAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<:<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:2:165:431:857 99 chr1 406 99 35M = 559 188 GAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6&:<7<:76,;; MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:3:86:823:683 83 chr1 408 99 35M = 240 -203 ACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCG <4<<<<<<<<:<<6<<7<<<8<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:1:176:168:513 83 chr1 410 99 35M = 210 -235 TTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTA ;0;;;7:<<<<<<<;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:2:259:219:114 147 chr1 411 99 35M = 254 -192 TTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAA 666<:6/:6::6::<:::<<<;<<<<<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:84:1013:1074 121 chr1 411 71 35M = 411 0 TTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAA 8;;<;8744<7<<4<<47<<<<<<7<<<<<<<<<< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:84:1013:1074 181 chr1 411 0 * = 411 0 GCAAGGGGGTCTATGTGAACAAAGGCACTAAACAC <7<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:192
-EAS54_81:7:325:150:465 99 chr1 412 99 35M = 598 221 TGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<3;;: MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:8:179:13:782 163 chr1 412 99 35M = 568 191 TGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAAC <<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:7<<<<::<7<:-:1 MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_32:7:113:809:364 147 chr1 413 99 35M = 250 -198 GATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACT ;<;;;<<<:<6<<<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:7:188:802:71 83 chr1 415 99 35M = 232 -218 TGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGC ;;;;<:::<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:2:204:264:413 99 chr1 415 96 34M = 593 213 TGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTG <<<<<<<<<<<<<;:59<+<<:<<<9<<;:62<) MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:5:104:350:749 83 chr1 415 99 36M = 247 -204 TGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCG ;<93;9;<3;<<<;<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:2:24:1037:84 83 chr1 415 99 35M = 238 -212 TGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGC <;<<;<<<7<<7&<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:7:242:354:637 147 chr1 417 99 36M = 222 -231 CCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCT 8<;;;;;<<<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:3:37:761:635 99 chr1 418 99 35M = 581 198 CCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCT <6<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<8<8<<4<4< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:44:1578:1674 99 chr1 418 99 35M = 573 190 CCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCT ;<<;<<;<<;;;;;9<;9;;<9:;;<:;9;76669 MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:3:120:63:653 99 chr1 420 99 35M = 598 213 TCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<9<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:7:264:642:506 147 chr1 420 99 35M = 247 -208 ACTTCATCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCT &;(-/)-1&:<<9<25<<<<2<1<';8<<<:888< MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:2 UQ:i:13 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:3:101:572:491 99 chr1 425 99 35M = 600 210 TTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<1<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:27:1881:486 163 chr1 427 99 35M = 607 215 CCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCAC ;;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;78;8;8;8878/ MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:6:120:14:944 163 chr1 428 99 35M = 621 228 CAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACT <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<<<<:;8;;7 MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:7:46:695:738 83 chr1 428 74 35M = 259 -204 CAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACT <<<<2<5<<-<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<3<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:6:13:1034:1144 147 chr1 429 99 35M = 256 -208 AAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTC <<:%<9)<<<<<<8<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:6:91:360:585 99 chr1 430 99 35M = 586 191 AAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCC <<<<9<<<<<;<<<;<<77<<<;<;;<;;<;<;;< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:4:73:1208:495 83 chr1 431 99 35M = 246 -220 AGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCA 8-889<<;<;;:<;<;;;;;;<<;;<;;;;<<;;; MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:8:16:1081:1894 163 chr1 431 99 35M = 624 228 AGATGAAACGCGTAACTGGGCTCTCATTCACTCCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<;<<;<<<<<<<+ MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:23 H0:i:0 H1:i:1
-EAS188_4:7:35:408:348 117 chr1 433 0 * = 433 0 GGTTCTCAAGGTTGTTGCAATGGGGTCTATGTGAA .73<;<<:77<<<<<<<<<<-<<;<<<<<<<<<<< MF:i:192
-EAS188_4:7:35:408:348 185 chr1 433 35 35M = 433 0 AAGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATACACTCCAGC 4,'3<6;)2);<3<-6<;<;7+7<5+<<<7<<<<< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:2 UQ:i:21 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_53:4:130:568:978 147 chr1 434 88 35M = 246 -223 TGAAACGCGAAACTGCACTCTCATTCACTCCAGCT --;066;;62<<<2&<+<+<2;<<2<<<;<<<7<< MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:2 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:0
-EAS139_19:1:87:1222:878 83 chr1 435 34 40M = 272 -203 TCAGCGCGTCACTCCGCTCTCATTCACCCCAGCTCCCTGT !!;*:885<&<<<)8&<:<<<8<8<::*<4<88<<<8<<< MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:6 UQ:i:42 H0:i:0 H1:i:0
-EAS51_64:6:143:763:480 117 chr1 436 0 * = 436 0 CTGAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACAAA ;<&-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:192
-EAS51_64:6:143:763:480 185 chr1 436 70 35M = 436 0 AAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCC ::3<:6<<<:<<<<7<<<<<<<<)6<<<1<<<<;< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:4:145:607:216 163 chr1 437 99 35M = 596 194 AACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCC <<<<<<<<8<<<<<<<<<<4<<<7<:<<1<<;;99 MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:6:46:285:790 121 chr1 437 72 35M = 437 0 AACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCC ;;<8<;<<<<88<8<<;;<;<<;<<<<<<<<;<<< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:6:46:285:790 181 chr1 437 0 * = 437 0 TCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACAAAG !!<<3<<<;;<<<<<<<<<;<;7<<7<<<<<<;<< MF:i:192
-EAS56_59:4:329:577:757 117 chr1 437 0 * = 437 0 TCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACAAAG !!<<<<9;<:<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<< MF:i:192
-EAS56_59:4:329:577:757 185 chr1 437 72 35M = 437 0 AACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCC ;;;888;<<<<<<6<<<2;<<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:7:57:722:347 163 chr1 439 99 35M = 599 195 CGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;; MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:2:285:367:932 83 chr1 440 74 35M = 285 -190 GCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGT 9=5==;=;7===;==;=================== MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:8:38:842:395 73 chr1 442 77 35M * 0 0 GTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<93<;9 MF:i:32 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:8:14:601:624 163 chr1 446 99 35M = 622 211 CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCAACCC <<1<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<::<<7<<1,<:( MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:2 UQ:i:18 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:3:1377:1663 99 chr1 446 99 35M = 626 215 CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCA <<;;;;<:;;:<;;<;;<;:;;<;9;;::977676 MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:8:26:1221:222 83 chr1 446 99 35M = 261 -220 CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCA <<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:8:82:566:1096 99 chr1 446 99 35M = 621 210 CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<;<; MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:3:24:1135:563 83 chr1 446 99 40M = 266 -220 CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGA 6+96:87<&8<<79:<;<<<<:<<;<<<<<<;;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:1:53:272:944 147 chr1 447 99 35M = 287 -195 TGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAA &94<4&8.6<6&;<:0:8;;:6;<;:<*<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:7:287:492:169 147 chr1 449 99 36M = 269 -216 CGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGG ;/;6<<<<4(<(<<<<6<<<<<<<<<<;<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:2:49:163:904 163 chr1 450 99 35M = 616 201 GCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGG ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;78958 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:7:200:192:373 83 chr1 451 75 36M = 275 -212 CTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGAC <<<8<<<4<4<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:4:253:285:104 163 chr1 451 99 35M = 627 211 CTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGA ======================:========7==; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:1:151:159:43 99 chr1 452 99 35M = 645 228 TCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGAC <<<<<<<;<<<8<<<;<;8<<<<7<77;;79<09+ MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:1:115:868:887 163 chr1 452 99 35M = 650 233 TCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGAC >>>>>>>>>>>>>>;<>>>>><<>>>;<+<</;;1 MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:4:57:786:414 83 chr1 453 99 35M = 296 -192 CTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACC ;;;8;1;:<<<<;<::;;<<<<;<;;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:2:197:170:559 121 chr1 453 71 35M = 453 0 CTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACC <:<;;:<5<5<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:2:197:170:559 181 chr1 453 0 * = 453 0 TTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACA :;;;;<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:192
-EAS1_103:7:313:83:546 83 chr1 454 99 35M = 296 -193 TCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCT ;)<994<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<5<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:6:44:280:641 83 chr1 454 99 35M = 288 -201 TCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCT 9;<<9;9;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:1:60:837:923 163 chr1 457 61 36M = 641 220 TTCACGCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTCTGA <<<<<4<<+<<*<<<<88<<<<<'*<4-+<<4&<40 MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:2 UQ:i:24 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_45:5:85:401:1190 163 chr1 458 99 35M = 652 229 TCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGA 4;;;1;;;;;;.6;;;(;;/;/;3;;;7;(3&063 MF:i:18 Aq:i:55 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:3:314:386:190 147 chr1 459 98 35M = 287 -207 CACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGAT 76;%;<<3<9;<69<<<7;;;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:1:2:831:692 99 chr1 462 99 35M = 634 207 TCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATC <<<<<<<<;<<<<<<<<<<9<<:9<<<;;96<796 MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:1:163:846:223 83 chr1 463 74 35M = 278 -220 CCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCT <7<5<*<<<<0<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:1:48:9:409 147 chr1 464 75 35M = 271 -228 CAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTG <<<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:5:134:751:831 99 chr1 465 99 36M = 651 222 AGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<948 MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:6:326:309:149 83 chr1 467 99 35M = 301 -201 CTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGAT ;;<<;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:7:260:985:520 83 chr1 468 99 35M = 296 -207 TCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATT ;9;7<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:7:112:203:90 83 chr1 470 99 35M = 305 -200 CCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCT ;<;:;<;;;<<<<<<<<<:<<<7<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:5:308:400:602 83 chr1 470 71 35M = 285 -220 CCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCT ;77;2<<;<7<<;<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:7:82:902:868 147 chr1 471 99 35M = 295 -211 CTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTG <<;;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:4:153:977:200 163 chr1 472 99 35M = 640 203 TGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGG ;<<;<<<<7<<;;;;;<<6<<<<<86;;8<;8;6; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:7:319:246:304 147 chr1 472 99 35M = 305 -202 TGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGG ;;<;;;<<<<8;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:1:37:1004:1136 147 chr1 473 99 35M = 315 -193 GTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGG </8<<<<7<+<<<<<<<,<<<<<<<<<6<<<<1<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:2:59:396:359 99 chr1 474 99 35M = 670 231 TCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGA <<9;;<;<;;;;<;;9;;;;;<;;;;;<;;77677 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:6:45:1769:1130 163 chr1 476 99 35M = 635 194 ACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAA ;;;;;;;;;;;;9;;;;;;19;;;9;;;;176777 MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:7:110:355:323 147 chr1 477 99 35M = 303 -209 CCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAAT 6069;1<<;4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:1:28:708:463 99 chr1 477 99 36M = 672 231 CCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<9;<:<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:5:112:51:128 83 chr1 477 99 35M = 287 -225 CCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAAT ;9<;;:<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:1:303:184:14 83 chr1 479 99 35M = 301 -213 CAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTC :<<.<;;7<:<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:3:84:101:328 163 chr1 480 99 35M = 673 228 AATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCT <<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<:<;;<44;;<;< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:6:228:354:203 99 chr1 480 99 34M = 643 198 AATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTC 88<<<8<<<<<<<<<8<<<<<<<<<4<<<4/9/; MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:8:38:856:336 99 chr1 480 99 33M = 656 211 AATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATT <<<<<<<<<<<;;<;<;<:69<<;<5-500373 MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:6:75:946:1035 147 chr1 480 99 35M = 288 -227 AATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCT <<)4</<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<66<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:6:271:244:568 147 chr1 481 99 35M = 294 -222 ATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTT ;<<<<<<;<;<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:8:129:477:427 99 chr1 481 99 35M = 652 206 ATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<::<9<;<<;<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:2:262:297:601 163 chr1 482 99 35M = 635 188 TGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTC <<<<;<<9<<57<<7<<<;<<;77-;;53<<;;<7 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:3:88:24:744 83 chr1 484 84 35M = 325 -194 GTCCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCAT 4%++88;-9<;<<<+8<<<:<;8:<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:5:147:68:353 83 chr1 486 99 35M = 299 -222 CCTTTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCC <<;;<<<<<<<<+;<<;<<0;<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1 UQ:i:26 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_78:7:316:961:576 99 chr1 488 65 35M = 666 213 TGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCCG <<<<<<<;<<<<;<<:<<;<;<<:;<9+34;;6%/ MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:8:7:171:402 99 chr1 489 99 35M = 682 228 GTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGG <<<<<<<<<<<<<<<;/<<<<;<<<<<;<<1<<<4 MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:3:277:458:330 83 chr1 490 99 36M = 329 -197 TGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGAC <<<<<8;<<<1<;7<<<;<<<<<<<<7<<7<<<<;7 MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:5:269:280:716 147 chr1 490 99 35M = 323 -202 TGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGA 6;<;;6:;<<<;64;<<<<<<<<;<<;<<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:58 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:72:63:435 147 chr1 490 99 35M = 293 -232 TGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGA ::<;<<<<;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:8:46:900:610 99 chr1 491 99 35M = 684 228 GATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGAC <<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;;4;< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:4:189:467:475 99 chr1 493 99 35M = 683 225 TATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCC <<<<<<<<<<<<;;;<<<<<<<<<:<<<<:+<<;; MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:7:201:959:19 99 chr1 493 99 35M = 681 223 TATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCC <<<<<<<<<<<<<<;<<<:<;<<;<<;+;+<3494 MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:240:593:842 99 chr1 494 99 35M = 660 201 ATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCT ============<================9===:= MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:3:29:381:169 163 chr1 494 99 35M = 641 182 ATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCT <<<<<<<<<<<2<288;<<;<<:4<:<<;&92929 MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:6:199:327:965 83 chr1 494 91 35M = 297 -232 ATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCT <5<:<<<58<:<<<<<<8<<<<<<<<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:4:87:323:895 99 chr1 494 99 35M = 671 212 ATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCT ;<<;;;;<<;<959;;;<;:<<;9<;;;4377788 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:5:327:991:508 147 chr1 495 99 35M = 312 -218 TCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTG 0:;::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:5:6:882:784 163 chr1 496 99 35M = 686 225 CTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGA <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<:6::::<,2 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:6:175:705:982 99 chr1 496 89 36M = 660 200 CTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAG <<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<;<<+<:;39;+<40< MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:5:30:92:753 99 chr1 497 99 35M = 673 211 TGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:7:245:323:744 163 chr1 499 99 35M = 679 215 GATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAG <;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<+<<<<<<<4< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:7:76:786:458 83 chr1 502 99 35M = 341 -196 TCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATT ;<;:7<.<<<<<8;<<<<<<<6<;8<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:7:185:213:330 83 chr1 502 99 35M = 328 -209 TCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATT ;4<<<;<<<<<<<<;<<;;;<<<<9<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:7:42:1091:1726 147 chr1 502 99 35M = 334 -203 TCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATT 4443838<4<8<87<<3</8<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:1:12:158:458 99 chr1 503 84 36M = 675 208 CTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCT <77<<<7<<<<<<<<<<<<5<4;<<;5<;;+2<+;; MF:i:18 Aq:i:15 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:6:277:590:364 163 chr1 503 99 35M = 681 213 CTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTC <<<<<8<<<<<<<<;<<<<<;;<7<<;;7858;;8 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:1:18:1418:237 147 chr1 503 99 35M = 304 -234 CTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTC <<:<<<<<<<<:<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<: MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:4:262:456:74 147 chr1 504 99 35M = 357 -182 TGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCT 862;<<<:;<;<<<;;;<<<<;;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:3:186:989:869 99 chr1 505 99 34M = 655 185 GGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;:<<<<<<<<<$< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:3:80:885:513 83 chr1 507 99 35M = 344 -198 GAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCA <7<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:7:311:100:539 83 chr1 508 99 35M = 353 -190 AAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAG ;<;<<;;<;<<;<<<<<;9<<<;<<<<<<<<9<<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:6:199:511:426 163 chr1 509 99 35M = 669 195 AATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGC <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:<<<<<<<<<;:<; MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:6:26:227:1053 99 chr1 510 99 35M = 663 188 ATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:2:172:622:707 99 chr1 511 99 35M = 685 209 TTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:<5:<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:8:157:935:374 147 chr1 512 99 35M = 353 -194 TCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCA 94988994.<:<+42::<<<<<:<:<4<<<<;<1< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:4:103:111:720 147 chr1 512 99 36M = 353 -195 TCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAG ;4<<<;)<<-<9<;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:328:669:662 147 chr1 512 99 35M = 337 -210 TCTTCATCCTGTACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCA 4<<;<<8<.<88.<<;4<<<<<<<4<.<<<<7<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:23 H0:i:0 H1:i:1
-EAS51_64:5:202:39:380 147 chr1 513 99 35M = 334 -214 CTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAG /92/;2<+2<<<<64<<<<<<<<<<<<<<<<7<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:8:66:655:769 147 chr1 515 99 35M = 348 -202 TCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCT 8<<;:69<;:;9<2<*9<;6<<<<<17<;<3+<;< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:4:7:526:343 99 chr1 515 99 35M = 698 218 TCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCT <<<<<<<<<<<<<<<:<<<5<<<<<<5;<<<+8<; MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:8:33:672:473 147 chr1 515 99 35M = 330 -220 TCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCT 5<70<<55<4<24.5<<<<<<<<<6<<<<<<2<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:6:72:308:839 83 chr1 517 99 40M = 354 -203 ATCGTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATT :8:.:<;<<5<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:2 UQ:i:40 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_61:1:210:880:606 83 chr1 518 99 35M = 341 -212 TCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCA .<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:7:80:760:490 99 chr1 520 99 34M = 686 201 CTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAG <<<<<<<<<<8<;<7<<<<<<;<;;<2<;<<<1, MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:3:34:970:1374 147 chr1 520 99 35M = 363 -192 CTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGA <6<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-B7_593:1:200:559:765 147 chr1 521 99 36M = 337 -220 TGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATT 8<;;4<3;<;<<<<<<5<<;;<<98;;<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_53:8:28:701:724 83 chr1 521 99 35M = 347 -209 TGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGAT .;..3;8.8<8;<<;9<9<<<7;<<<<<<<<7<<7 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:4:318:345:156 163 chr1 522 99 35M = 695 208 GGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATT <<<<<<<<:<<<<<<<<5<:5<<<3:'<72')*;9 MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1 UQ:i:6 H0:i:0 H1:i:1
-B7_595:1:81:1000:375 83 chr1 524 90 35M = 329 -230 ACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGC ;8<;+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:4:13:1155:631 163 chr1 524 99 40M = 668 184 ACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTG <<<<<<;<<;<<<<<<;<<<<<9<;<;94<<%<<<7:777 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:3:257:611:440 147 chr1 524 99 35M = 341 -218 ACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGC 2<;;8<;;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_26:6:129:694:359 83 chr1 525 88 35M = 350 -210 CCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCT 7777<7<7;77+<3<<;<<;<<<<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS139_11:6:11:285:1567 163 chr1 525 99 35M = 685 195 CCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_95:1:196:533:921 147 chr1 526 99 35M = 361 -200 CCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTT 7<<<<7<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS139_11:2:6:251:1557 163 chr1 526 99 35M = 700 209 CCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:6:20:492:850 99 chr1 526 78 35M = 694 203 CCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTT <7<<<<<<<<<<<.<54<7&<<<7<74<2<<<2<< MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:5:231:339:551 83 chr1 527 99 35M = 350 -212 CTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTG <;<<;<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS139_19:4:68:1122:79 99 chr1 528 99 40M = 687 199 TGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCT <<<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<;<<<4;<<4;99::; MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:4:87:1375:1303 83 chr1 529 99 35M = 340 -224 GAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTG :<;<(<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS220_1:8:46:485:482 147 chr1 530 94 35M = 371 -194 AGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGG <<<<<::<<<<<<<<6<<<<<<<<<6<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS218_4:7:90:1873:89 147 chr1 531 99 35M = 344 -222 GAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGT <<<<;49<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_26:5:238:31:968 99 chr1 534 99 35M = 717 218 ATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTG 9======8====*=====,=1=======<=7:::, MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:3:78:773:660 163 chr1 534 99 36M = 711 213 ATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGA <<<<<<<<;<<<<<<<<<8<8<<;<<<;<<;7<<4: MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:5:90:828:633 83 chr1 537 99 36M = 381 -192 CTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAG <<<;<;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_30:2:272:750:698 83 chr1 538 80 35M = 365 -208 TGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAG 0<;8;64;<<<;<;.<+;:<4;4<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS139_19:3:88:1656:896 147 chr1 538 99 40M = 387 -191 TGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGC 6/8::*9/*3*'<88<:9*<<<8<<<;<<<<<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:9 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:6:126:541:194 163 chr1 540 97 35M = 730 225 CAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGC <<<<<<<<8<<<<<8<<<<<<<<<8<<<428+<80 MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:23 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_28:4:9:55:730 163 chr1 540 99 36M = 722 218 CAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCT >>=>>+==>>==<==<=8=><:;8/;7</5724-2; MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:2:278:918:892 99 chr1 541 99 35M = 720 214 AGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCT =============:====================8 MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:7:243:876:758 99 chr1 541 99 35M = 712 206 AGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;78<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_65:5:121:380:656 147 chr1 542 99 35M = 362 -215 GCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTG :;<<;<<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:6:82:164:1924 83 chr1 542 99 35M = 378 -199 GCCCAGCACCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTG 6<<<<<<-<<<<<<<<<2<<06<9<<<<<1<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:12 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_30:6:163:312:891 99 chr1 543 99 35M = 709 201 CCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGC <<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<:;;<;;<;0 MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:1:124:243:35 147 chr1 544 60 35M = 364 -215 GCATATCCAGATTGCTGGTGGTCTGACAGGCAGCA &+<+;<694;+&99<<2<;423<26<-<<<<,<3< MF:i:130 Aq:i:60 NM:i:2 UQ:i:28 H0:i:0 H1:i:0
-B7_591:1:191:462:705 99 chr1 545 99 36M = 721 212 CAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<::<6 MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-B7_610:8:95:426:791 147 chr1 547 99 35M = 359 -223 GNTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACT !!!!<<<<<;;<<<<;<<;<;;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:1 UQ:i:23 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:5:41:118:1246 147 chr1 548 99 35M = 374 -209 CTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTG <<<<<<<<<<<<<<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:3:27:973:518 99 chr1 549 99 35M = 691 177 TCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGT <<<<<<<<<<<<<<;<<<<7<<<<<<<<88;0:8; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:4:679:110 99 chr1 549 99 35M = 705 191 TCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<::<;;:7 MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:1:297:283:948 163 chr1 550 99 35M = 727 212 CCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<9;)+1;19- MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:8:61:1797:113 147 chr1 551 99 35M = 380 -206 CAGATAGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGA <<0<<&<<<<;<<4;;3<;<:<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:6:205:873:464 99 chr1 552 99 35M = 743 226 AGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAG <<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<:<<,:<:<<<<:: MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:3:33:1168:1762 99 chr1 552 99 35M = 728 211 AGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAG <<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<;<<<<<<<<:;2:: MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:6:78:909:394 83 chr1 554 81 35M = 373 -216 ATTGCTTGGTGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCC 6167&+&&/&//734/3<<<9*<;;3<3<;9<<3< MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:2 UQ:i:19 H0:i:0 H1:i:0
-EAS1_103:2:226:302:758 163 chr1 556 99 35M = 751 230 TGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTTTGAGCGNT <<<<<<<;;;,<;<92;66<;))42<&2&(/1!!! MF:i:18 Aq:i:33 NM:i:2 UQ:i:9 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_28:5:206:671:49 163 chr1 557 99 36M = 719 198 GCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCA <<<<<<;<<<<8<<<;;<<<3<<8<8<35+,55;,3 MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:2:165:431:857 147 chr1 559 99 35M = 406 -188 TTGGGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCAC ''7'/;'1%0447<<<*<6<<<*<*<<<<6<<<<< MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:1 UQ:i:6 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:5:50:972:1286 83 chr1 559 99 35M = 377 -217 TTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCAC :;;7;7;;0<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:7:288:552:440 163 chr1 560 87 35M = 747 222 TGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCTTCCAT <<<<71<77<<<:<<<&<4<<77<16<88&36+%% MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:4 UQ:i:26 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:78:1478:1446 147 chr1 560 99 35M = 389 -206 TGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACA <8,8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:8:275:851:240 99 chr1 561 99 35M = 743 217 GTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<4<7<<<<<< MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:6:185:312:167 83 chr1 562 99 35M = 401 -196 TGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAAT <<8:<8<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:1:119:446:185 83 chr1 562 99 35M = 372 -225 TGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAAT +70730;<0<77;;<<<<<9<<<<<<9<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:3:168:741:680 83 chr1 562 99 35M = 394 -203 TGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAAT <<5<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:79 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:67:1797:1931 99 chr1 562 99 35M = 750 223 TGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:1:228:182:717 99 chr1 563 99 35M = 729 201 GGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCCCCATG <=9============5==5=<,59<=1=<&;&;;7 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:2 UQ:i:10 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:7:118:523:591 83 chr1 563 99 35M = 393 -205 GGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATG 4:--&0:67<<8:<<<<<<<<<<<:4<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:4:29:1061:574 83 chr1 563 99 35M = 363 -235 GGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATG <87<5<<9<<<66<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:3:168:69:605 83 chr1 565 67 36M = 373 -228 TCTGACAGGCGGCAACTGTGAGCCATCACAATGAAC '<'<144<0<&<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS221_3:4:90:247:212 99 chr1 567 99 35M = 733 201 TGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<8< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:3:140:522:212 83 chr1 568 99 35M = 399 -204 GACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAA :;8;:::<<:<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:8:179:13:782 83 chr1 568 99 35M = 412 -191 GACAGTCTACAACTGTGAGCCATCACAATGAACAA &37.3&;3'*<3<;9<9<<5<<<<<<<<<9<<<<< MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:2 UQ:i:11 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_45:3:75:217:337 83 chr1 568 99 35M = 386 -217 GACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAA 4779797;;;<;:4;;<<<77<;;;7<<;<;<;<< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:4:168:528:288 163 chr1 570 99 35M = 740 205 CAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<;<<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:2:162:503:769 147 chr1 571 99 35M = 392 -214 AGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAG ;:;1;=8=;:+=====;&==7============== MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:2:163:618:570 163 chr1 571 99 35M = 751 215 AGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAG <<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<+<.7<<..<;&;8; MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:2:251:121:479 163 chr1 572 99 35M = 750 213 GGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGG <<<<<<<<<<<;:<<<<;:;:<:<;:188;7:<+( MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:44:1578:1674 147 chr1 573 99 35M = 418 -190 GCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGA 62631;;4;;;8;;48;;7;8;;;;;;;;;8;;;; MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:3:263:74:407 163 chr1 574 99 35M = 754 215 CTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAA <<<<2<<<<<<:<<<9<<4<<<<:<<<<9<999.7 MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:3:254:32:275 147 chr1 575 99 35M = 382 -228 TGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAG (6+<;+6:9<<:7:<95<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:82:879:246 83 chr1 576 99 35M = 391 -220 ACAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGA %+=661;&===:&==1<5======1========== MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:165:397:25 163 chr1 576 99 35M = 759 217 GCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGA <<7<<<<<<)97<6<:3:60:3+37-37+<:33:3 MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:6:148:776:486 163 chr1 578 99 35M = 755 212 AACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;; MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:2:59:1576:946 99 chr1 578 99 35M = 761 218 AACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAA <:<<<<<<<<<<<<:<:<<<<<<<8<<::1<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:4:61:433:385 83 chr1 579 99 35M = 381 -233 ACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAA <*97<<<<&9<<;<&<<<<<<<<<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:3:37:761:635 147 chr1 581 99 35M = 418 -198 TGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGG +37:<088<+<<;<<;<<<<<;<<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:2:178:192:499 163 chr1 582 99 35M = 768 221 GTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGT <<<<<<<;<1<<<<<<;<<;6<<3666;;;;;/6/ MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:7:93:945:176 99 chr1 582 99 35M = 745 198 GTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;;<;:7;<3 MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:3:216:988:883 83 chr1 584 99 35M = 392 -227 AAGCCAACACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCT (=/1+=&:=&======<==<=============== MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:2 UQ:i:12 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:1:12:884:219 99 chr1 584 99 35M = 756 207 GAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<5:< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:6:61:628:681 163 chr1 586 99 36M = 746 196 GCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<:<<;;;;;; MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:6:91:360:585 147 chr1 586 99 35M = 430 -191 GACATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTT 5&&<<3:;<<<<<<)<<3<<<<<<<;;<<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:6:89:1151:1878 99 chr1 587 99 35M = 757 205 CCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTC <;;<<<<<;;;<<<<4;;::;<;8;;<;;8:<8<4 MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:1:40:1596:1433 99 chr1 587 99 40M = 756 209 CCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<1<<<<<::;:: MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:3:4:1620:413 99 chr1 588 99 35M = 768 215 CATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCA <<<<<<<<<<6<<<6<<<;<6<9-1<;<&66<<<2 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:65:1928:1125 99 chr1 588 99 35M = 784 231 CATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCA <<;<<<7<<7<;<7<<<<<<<7<<<<;<.-;<+88 MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:5:123:998:248 163 chr1 589 99 35M = 776 222 ATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;9<<<68< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:2:240:603:890 163 chr1 590 99 36M = 740 186 TCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<:<<;<<<<<8865 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:3:20:762:748 163 chr1 591 99 35M = 777 221 CACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAA =================================== MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:4:246:313:499 99 chr1 592 99 35M = 757 200 ACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAG <<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<;<<<<<;;<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:6:7:858:437 99 chr1 593 99 35M = 773 215 CAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<3<<<<<<<<<33 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:3:150:933:810 163 chr1 593 99 35M = 755 197 CAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGG =================================== MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:2:204:264:413 147 chr1 593 96 35M = 415 -213 CAATGAACAACAGAAAGAAAAGTTCTTTCAAAAGG 1==(4=::;/7::&===;====/=;===;;===== MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:2 UQ:i:19 H0:i:0 H1:i:0
-EAS139_11:3:65:556:1505 163 chr1 593 99 35M = 790 232 CAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:6:62:386:959 99 chr1 594 99 35M = 752 193 AATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGT <<8<<<<;<<<<-<<87;</<;<+<;5<+;;<3;+ MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:2:134:868:252 147 chr1 595 99 36M = 404 -227 ATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGA <;<<<8<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:1:252:19:955 99 chr1 596 84 35M = 771 210 TGAACAAAAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGA <<<<<<<<<<4<<<<9<<+9)9<<4:9+<<0<909 MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS54_67:4:145:607:216 83 chr1 596 99 35M = 437 -194 TGAAAAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGA /;<<&<<8<<<<<<<<<<<<<;872<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:8:140:924:923 163 chr1 597 99 35M = 767 205 GAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGAT <<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<5;<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:3:120:63:653 147 chr1 598 99 35M = 420 -213 AACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATG <<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:6:204:779:181 163 chr1 598 99 35M = 779 216 AACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATG <<<<<<5<<:<<<<<8<<,<<<<<<<<<<91<91< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:7:325:150:465 147 chr1 598 99 35M = 412 -221 AACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATG <<:<<<<<<<<;<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:7:57:722:347 83 chr1 599 99 35M = 439 -195 ACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:2:177:266:842 163 chr1 599 99 35M = 784 220 ACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGT =====)===========8=====7882855355'5 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:4:183:852:253 163 chr1 599 99 35M = 773 209 ACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<;;<8 MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:2:30:887:404 163 chr1 600 99 35M = 789 224 CAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTG <<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<:(<<<7;7 MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:3:101:572:491 147 chr1 600 99 35M = 425 -210 CAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTG 8<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:2:73:730:487 99 chr1 604 99 35M = 770 201 AGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<:<<<;<;<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:6:172:896:83 99 chr1 604 99 34M = 786 217 AGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGT <<<<<<<<<<<<<<<<<:;;+;<<<<<<<<9;;; MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:4:154:762:630 163 chr1 604 99 35M = 792 223 AGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:8:99:756:130 163 chr1 606 99 35M = 798 227 GAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCT ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<;< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:6:11:360:1577 99 chr1 606 99 35M = 781 210 GAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCT <<<<<<<<<<<<<<<<<4<;;<<;;<;<<<8<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:27:1881:486 83 chr1 607 99 35M = 427 -215 AAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTC 99797;;9:<:;;;<;;;;<<<;;;;<;<;;<<<< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:1:5:497:687 99 chr1 607 99 35M = 789 217 AAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:4:142:63:937 163 chr1 609 99 36M = 777 204 GAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATC <<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<;<<:<<:<: MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:1:36:485:632 163 chr1 610 99 36M = 784 210 AAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<;<18; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:8:36:927:478 99 chr1 610 99 35M = 798 223 AAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATC <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<:<:<<<<8<9;<8 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:169:862:829 163 chr1 611 99 35M = 772 195 AAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCA <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<;<<<<:<;;<78 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:5:63:424:1643 163 chr1 614 99 35M = 798 219 GGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACC ;;<<<<<<;<<<<<<<<<<5;9;<<<<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:4:20:41:138 99 chr1 615 99 35M = 774 194 GTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;<<<<<(<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:2:49:163:904 83 chr1 616 99 35M = 450 -201 TCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTC 79779<<<<<;;;;9;;<<7<;*9<<<7<<;<<;< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:3:135:543:760 99 chr1 619 99 35M = 787 203 TTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATA <<<<;;<;<<<<<<<9<<<<<<<<<<<;<<<<5<: MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:5:131:742:561 163 chr1 620 99 35M = 790 205 TCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:6:120:14:944 83 chr1 621 99 35M = 428 -228 CAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACA :;<<;<;<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:8:82:566:1096 147 chr1 621 99 35M = 446 -210 CAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACA <<<<<<<<<<:<<<<<<<:<<<<<<:<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:8:14:601:624 83 chr1 622 99 35M = 446 -211 AAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACAC 1;;;;==5===.(=9=5=========8====;=== MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:3:5:538:401 99 chr1 624 99 40M = 788 204 AAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATG <<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;<::7<<;<53:<98;;;;; MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:8:16:1081:1894 83 chr1 624 99 35M = 431 -228 AAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACAC ;5;;&<;<<<<<<<<;<;<<;<<<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:3:1377:1663 147 chr1 626 99 35M = 446 -215 GGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACAC 6-88663;8;81;;66;8;;89939;;;67;2;;; MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:4:253:285:104 83 chr1 627 99 35M = 451 -211 GTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACA 2<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:6:66:1282:1215 99 chr1 627 99 35M = 794 202 GTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;; MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:2:1200:1076 163 chr1 629 99 35M = 786 192 GATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATG ;;;;;;;;;;/;;;;;;;;6;;9;489;;;88888 MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:2:194:688:289 99 chr1 631 99 35M = 795 199 TGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<:; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:8:19:855:491 99 chr1 631 99 35M = 783 187 TGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGT <<<<<<<<<<<;<<.:<<<<;;;<4<:<:<7<;;; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:6:215:133:909 99 chr1 631 99 34M = 789 193 TGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<996( MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:7:35:378:681 99 chr1 632 99 35M = 812 215 GTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:5:40:758:116 163 chr1 632 99 40M = 814 222 GTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:7262 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:1:2:831:692 147 chr1 634 99 35M = 462 -207 GTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTA 2749'979<9<<<6;<<<0<;<<<<<3<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:6:162:594:858 99 chr1 634 99 35M = 818 219 GTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTA <<<<<<<<<<<<<<<<<9<;<<<<<<<<<<3<<<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:4:233:478:792 99 chr1 634 99 35M = 791 192 GTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<+<<<<<<<9<<<+;;; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:2:262:297:601 83 chr1 635 99 35M = 482 -188 TGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTAG ;;<26;;;<;<7;<<<<<99<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:6:45:1769:1130 83 chr1 635 99 35M = 476 -194 TGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTAG 88989;<;97;9<<;<;;;;9<98<<<<<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:4:153:977:200 83 chr1 640 99 35M = 472 -203 TCATCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTA 1:<83<<9;;9<<9;;<<;<<;;;;<;;<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:1:60:837:923 83 chr1 641 61 36M = 457 -220 CATCAACCGCATACACTCACATGGTTTAGGGGTATA 0<4<<<02.<99+<+&!<<<<+<<<<<<<<<<<<3< MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:2 UQ:i:13 H0:i:0 H1:i:0
-EAS51_66:3:29:381:169 83 chr1 641 99 35M = 494 -182 CATCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTAT 2<82<;66<:<;<:<;<;<8<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:7:96:836:737 99 chr1 642 99 35M = 841 234 ATCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATA <<<<<<71<<<<<<<<<<899<:5<<<96858<<. MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:6:228:354:203 147 chr1 643 99 35M = 480 -198 TCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAA %1<851<5<<<982<<<<<<<<::<<<<7<<<<3< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:1:151:159:43 147 chr1 645 99 35M = 452 -228 AACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATA ;;4;6<<;<<<<7<77<6;<6<<<<<;;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:3:182:404:693 163 chr1 646 99 35M = 812 201 ACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:::<6<;<94;77 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:8:4:841:339 163 chr1 646 99 35M = 793 182 ACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATAC <<<<<<<<<<<<<<<<<;<7<<&;;<5<+<;7<<; MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:4:156:857:494 163 chr1 648 99 35M = 838 225 CTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCT <<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<:<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:6:165:464:123 99 chr1 650 99 35M = 814 199 CATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCT ===============7==============8==== MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:1:115:868:887 83 chr1 650 99 35M = 452 -233 CATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCT ==;==8=;=;========================= MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:5:134:751:831 147 chr1 651 99 36M = 465 -222 ATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC ;:<4<8<<<;<;<<5<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:5:192:716:235 163 chr1 651 99 35M = 798 182 ATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTA ======================9==:<==:;;69; MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:3:40:594:752 99 chr1 651 99 35M = 831 215 ATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTA <<<<<<<<<<;<<<;<<<::;<:;<;:<;;;<;<: MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:4:184:17:636 121 chr1 652 76 35M = 652 0 TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC 8<89<<:<<<;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:4:184:17:636 181 chr1 652 0 * = 652 0 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCACAGGT !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!77777777 MF:i:192
-EAS1_108:8:129:477:427 147 chr1 652 99 35M = 481 -206 TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC <<<9;<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:8:130:912:658 163 chr1 652 99 35M = 841 224 TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC <<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;;< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:5:85:401:1190 83 chr1 652 99 35M = 458 -229 TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC 64778:;69739:;+9::7;;;<;6<;7;;;;;7< MF:i:18 Aq:i:55 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:3:4:1502:1911 163 chr1 652 99 40M = 802 190 TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGC <<<:4<<<<<<;<<<<;9;5<95<;<<;9+;1612:1::: MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:2:198:691:595 163 chr1 655 99 35M = 847 227 ACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATG ==============&===============;7;=1 MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:3:186:989:869 147 chr1 655 99 35M = 505 -185 ACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATG ;<<;:<<<7:<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:8:38:856:336 147 chr1 656 99 35M = 480 -211 CACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGG 2;4;4<:;6:5:<<;:;<<;<<;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:49:271:588 163 chr1 658 99 35M = 830 207 CACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCT <<<<<<<<<<<<<<5:<<<<<<:<<<<<<<:7%9< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:240:593:842 147 chr1 660 99 35M = 494 -201 CATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGA *<<<;<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:6:175:705:982 147 chr1 660 89 36M = 496 -200 CATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGAT ')'''''')'''''*')*)'*)')))+,'*)+'*,! MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:1 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:1
-EAS221_3:6:26:227:1053 147 chr1 663 99 35M = 510 -188 GGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_78:7:316:961:576 147 chr1 666 65 35M = 488 -213 TTACGGGTGTAATCTCTCTACATGGCTAATTATGA (++%%+++),+,+*++,+,,-,**+,-&-,+-+-- MF:i:130 Aq:i:65 NM:i:5 UQ:i:36 H0:i:0 H1:i:0
-EAS56_63:5:96:788:614 163 chr1 667 99 35M = 862 230 TAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;6;<<;;<;;7;9 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:4:13:1155:631 83 chr1 668 99 40M = 524 -184 AGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAAT ;:398<<;<<<<<;<3<;;<<<<;;<<<<<<<<<<;<<;< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:6:199:511:426 83 chr1 669 99 35M = 509 -195 GGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAA <:7:<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:5:124:241:608 99 chr1 670 99 35M = 856 221 GGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAAC <<<<<<<<<;<<<<<<<<<;;<<<;<<<<;;8;;: MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:2:59:396:359 147 chr1 670 99 35M = 474 -231 GGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAAC 28288;;;;;;;;;::;;;;:;;;;;;;;;;;;;; MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:4:87:323:895 147 chr1 671 99 35M = 494 -212 GGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACA 55777;;;939;9;;9;;;;9;;;;;;;;;;;;;; MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:1:28:708:463 147 chr1 672 99 36M = 477 -231 GTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAAT ;;<;<<====3=====5=================== MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:3:84:101:328 83 chr1 673 99 35M = 480 -228 TATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAAT <<<<<<<<:<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:5:30:92:753 147 chr1 673 99 35M = 497 -211 TATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAAT <<<<<<;<<<<<<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_32:8:88:90:59 73 chr1 674 37 35M = 674 0 ATAATACCTCTACATGTCTGATTATGAAAACAATG <<<<<<<4;7;<<<;;47;&9..1;6&4<755;1; MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:19 H0:i:0 H1:i:1
-EAS112_32:8:88:90:59 133 chr1 674 0 * = 674 0 TGCACCTCCCTGTTCACCTAGATGCTAGGAGGACA =7595=92=72.=+5(:4=9092((.2&(&%07%. MF:i:192
-B7_593:1:12:158:458 147 chr1 675 84 36M = 503 -208 TAATAATGCTACATGGATGATTATGAAATCAATGTT ++++++$((+*+++++++++++++&+++++++++++ MF:i:18 Aq:i:15 NM:i:5 UQ:i:40 H0:i:0 H1:i:0
-B7_593:4:28:781:723 99 chr1 676 99 36M = 855 215 AATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTC <<<<<<<<<7<<<;;<<;;<<;<5<4<7<;7<+:<9 MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:2:27:856:401 163 chr1 679 99 35M = 871 227 ACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCC ======6===;2==;===;=+=92=;5+=&556:6 MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:7:245:323:744 83 chr1 679 99 35M = 499 -215 ACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCC /.848299;&;9;9;=2.=7========;;===== MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:7:31:948:254 99 chr1 680 99 35M = 849 204 CCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<:<<8<;;;;< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:6:277:590:364 83 chr1 681 99 35M = 503 -213 CTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCA :::<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:7:201:959:19 147 chr1 681 99 35M = 493 -223 CTCTACATGGCTGATTATTAAAACAATGTTCCCCA ;4;.9<:0&/<5<::<<9/.<<<<<<<<<<<<;<< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:14 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_61:8:7:171:402 147 chr1 682 99 35M = 489 -228 TCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAG :086::::847:<7<<7<<<<<<;7<<;<<<<7<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:4:67:317:249 99 chr1 683 26 35M = 840 192 CTACATGGCTGATTATGAAATCTATGTTCCCCATA <<<<<<;<<<<;:;<<7;<<.<&3<;;<<(;;6.< MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:3 UQ:i:31 H0:i:0 H1:i:0
-EAS51_64:4:189:467:475 147 chr1 683 99 35M = 493 -225 CTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGA *.;*;7<75<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:8:46:900:610 147 chr1 684 99 35M = 491 -228 TACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGAT <;5<;<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<8<<<<<8<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:1:232:351:909 99 chr1 685 80 36M = 843 194 ACATGGCTGATTATGAAATCAATGTTCCCCAGATGC <<<<<99<<<<<<99<7<'<9<<<6<<+<;7;<<&; MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:2 UQ:i:11 H0:i:0 H1:i:1
-EAS139_11:6:11:285:1567 83 chr1 685 99 35M = 525 -195 ACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATA <8<4<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:2:172:622:707 147 chr1 685 99 35M = 511 -209 ACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATA 92<3996;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:5:6:882:784 83 chr1 686 99 35M = 496 -225 CATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATAC 4;7<;64<<:<<4<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:7:80:760:490 147 chr1 686 99 35M = 520 -201 CATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATAC %::::+<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:4:68:1122:79 147 chr1 687 99 40M = 528 -199 ATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCC ::77*:1<<<<<<<<<<<<<<<:;<<<;<<<<<<8<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:1:264:988:663 99 chr1 688 99 35M = 875 222 TGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCA <<<<<<<<<<<1<4<<<4<<0<;<-<74*(<&51- MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:5:3:233:911 163 chr1 688 99 35M = 868 215 TGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCA <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<;<<;< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:6:187:925:547 99 chr1 689 99 35M = 857 203 GGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCAAGATACCAT 43<<<:9<;;;:7<<<<6<:<8<-4-/,81<(48: MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1 UQ:i:12 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_65:5:75:637:650 163 chr1 691 99 35M = 868 212 CTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<: MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:3:27:973:518 147 chr1 691 99 35M = 549 -177 CTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCC +<<<<<<9<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:6:20:492:850 147 chr1 694 10 35M = 526 -203 AGTATGAAAACAATGTTCCCCAGATGCCGTCCCGG :.5:+.;;&91:;79:766:1:9+6&:1&&:+:)) MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:4 UQ:i:31 H0:i:0 H1:i:0
-EAS51_64:4:318:345:156 83 chr1 695 99 35M = 522 -208 TTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGT ;8<8<<<<<;<<:<<;<;77<<<<<;<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:3:5:863:302 99 chr1 698 99 35M = 866 203 TGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:4:7:526:343 147 chr1 698 99 35M = 515 -218 TGAAAACAGTGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTT (7:;;;<<;;;<1<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:26 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_26:2:73:513:102 99 chr1 698 99 35M = 868 205 TGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTT ===========================;======= MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:2:6:251:1557 83 chr1 700 99 35M = 526 -209 AAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTTAC <<<<<<<<<<<<6:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_78:7:147:64:416 99 chr1 701 99 35M = 870 204 AAACAATGTCCCCCAGATACCATCCCTGTCTTACT <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<;;:<;;;;; MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-B7_595:3:297:637:86 163 chr1 704 99 35M = 869 200 CAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCC <<<<<<<<<<<<;+<+;<;<:<<<<<9<<957<;( MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:6:160:272:398 163 chr1 705 99 35M = 891 221 AATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCA 9<<<3<<<<<<<<<<<9<<;8<<<<;<+.;;89.. MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:4:679:110 147 chr1 705 99 35M = 549 -191 AATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:6:163:312:891 147 chr1 709 99 35M = 543 -201 TTCCCCAGATACCGTCCCTGTCTTACTTCCAGCTC 0.<;;8<<<0<<<<<<<<<<6<<<<<<8<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_28:3:78:773:660 83 chr1 711 99 36M = 534 -213 CCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCC 7<;7<<<7;9<<8;<<<<<<;<<<<<<<<<<7<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:5:63:875:1339 163 chr1 711 99 35M = 879 203 CCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:7:243:876:758 147 chr1 712 99 35M = 541 -206 CCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCC 0%3<1;.70;3363;31;<<<<<<6<<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:4:104:153:698 163 chr1 713 99 36M = 896 219 CCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAG ;<<<<<<;6<<<<<<<<<<;<<<<;<;;;<.<::50 MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:7:86:498:373 163 chr1 716 99 35M = 894 213 GATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCACCAGAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5:<<<:<;7+67 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1 UQ:i:25 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:6:87:734:888 163 chr1 717 99 35M = 900 218 ATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGG ===========;8=========;;=;====;;3(; MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:5:238:31:968 147 chr1 717 99 35M = 534 -218 ACACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGG =(.7=5%===9:7==+==77=============== MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1 UQ:i:7 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:3:290:558:349 99 chr1 719 99 35M = 869 185 ACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGCGGGA <<<;<<;<;<188<<<8::<686+4:<<6:&3)*& MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:5:206:671:49 83 chr1 719 99 36M = 557 -198 ACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAA ;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:2:278:918:892 147 chr1 720 99 35M = 541 -214 CCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAA =6=3=<===&========================= MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:1:191:462:705 147 chr1 721 99 36M = 545 -212 CATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAG <<'<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:4:9:55:730 83 chr1 722 99 36M = 540 -218 ATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGC <:<;;<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:7:45:462:455 163 chr1 723 99 35M = 874 186 TCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGACGGAACGC <<<<<<8<<<;<;<<<;<<<<<<<6;8&:80;733 MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:2 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_28:2:149:650:44 163 chr1 726 99 36M = 902 212 CTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;6<<;<<7<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:1:297:283:948 83 chr1 727 99 35M = 550 -212 TGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTC 6;;3;6<<66<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:3:33:1168:1762 147 chr1 728 99 35M = 552 -211 GTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCA 79<9;3<<<4<<<97<;;<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:1:228:182:717 147 chr1 729 99 35M = 563 -201 TCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAA 778;8;474<<<;2;;<2<<<<<<<<;<;;9<<<< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:8:1351:1986 163 chr1 729 99 35M = 911 217 TCTTACTTCCAGATCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAA <<<<<<<<<<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:12 H0:i:0 H1:i:1
-EAS51_64:4:163:31:455 163 chr1 730 99 35M = 886 191 CTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGACAGCTNNCAAC <+<<<<<<<;0+<<<<;06070-9(0(9<!!5)05 MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:3 UQ:i:7 H0:i:0 H1:i:1
-EAS54_61:6:126:541:194 83 chr1 730 97 35M = 540 -225 AGTACGACCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAAC +%&:/+(46=47&71/2==;=;8====28212=== MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:4 UQ:i:40 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:7:178:286:414 163 chr1 731 99 35M = 907 211 TTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACG <<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<1<<<1;998 MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:3:35:361:546 163 chr1 731 99 35M = 892 196 TTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACG <<<<<<<<<<<<<<<<;<5<<<<<;<2<<<:<8<4 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:4:90:247:212 147 chr1 733 99 35M = 567 -201 ACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCT 7655:;87;<;;;8<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:7:149:354:667 99 chr1 734 99 35M = 888 189 CTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<><<<<<<<<;<:<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:2:240:603:890 83 chr1 740 99 36M = 590 -186 GCTCCCAAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCA ;+&+//&<<<<<<<<<<9<<<8<<<<9<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:7:129:956:115 163 chr1 740 99 36M = 927 223 GCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;877- MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:4:168:528:288 83 chr1 740 99 35M = 570 -205 GCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCC 8<%<31;<<;<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:8:275:851:240 147 chr1 743 99 35M = 561 -217 CCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGTTTCTAGCCATT 66614/&3616630666&66666&66666868666 MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS188_7:6:205:873:464 147 chr1 743 99 35M = 552 -226 CCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATT <-((+:+;289<--;<;-;<:;;<<<;;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:6:37:610:260 163 chr1 745 99 35M = 913 203 CCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTC <<<;<;<<7<<<<<<<<<<<<<<;6<963;;;3;1 MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:7:93:945:176 147 chr1 745 99 35M = 582 -198 CCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTC 6;;;8<<3<<8.<;6)<<<<<9<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:6:61:628:681 83 chr1 746 99 36M = 586 -196 CAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTT 95<<<<<<<<;<<<<;<<<:<<;;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:7:288:552:440 83 chr1 747 87 35M = 560 -222 AGAGGGAACGCTTTCAACTCTTCTAGCCATTTCTT 9<<%'%<<.2<<<<<<<<5:<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:2 UQ:i:33 H0:i:0 H1:i:0
-EAS56_53:2:170:265:818 163 chr1 748 10 35M = 920 207 GAGGGGAAGCTTTCAACGCTTCTAGCACTTTCTTT <<<<<(5/959<8.<9<8<<<2<&59&&:22:8+( MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:3 UQ:i:17 H0:i:0 H1:i:0
-B7_595:2:251:121:479 83 chr1 750 99 35M = 572 -213 GGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTG <<<<<6'..663;&<<;<<9<<<9<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:67:1797:1931 147 chr1 750 99 35M = 562 -223 GGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:2:226:302:758 83 chr1 751 99 35M = 556 -230 GGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGG ;<<<<9;<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:33 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:2:163:618:570 83 chr1 751 99 35M = 571 -215 GGAAAGCTGTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGG <9774<88&:8<:8<8:8<8<<<<<;88<88<<<< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_97:3:73:292:429 99 chr1 752 99 35M = 920 203 GAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTTGC <<<<<<<<<<7<<;<<<<<<<2<<<5<<<<<:%)< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:3:82:356:253 99 chr1 752 99 35M = 927 210 GAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGC ===================<========;===39= MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:6:62:386:959 147 chr1 752 99 35M = 594 -193 AAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGC %;71131((<<6<92(+<1<<;<-3<8<<;<;;<< MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:3:263:74:407 83 chr1 754 99 35M = 574 -215 AAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCAT ;;88<::+;<)<5<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:3:67:620:344 99 chr1 755 99 35M = 905 185 AGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATT <<<<2<:2<<<<<<7<<<<:<<*<<<<<<***3<< MF:i:18 Aq:i:33 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:6:148:776:486 83 chr1 755 99 35M = 578 -212 AGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATT ;:<<<;<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:3:150:933:810 83 chr1 755 99 35M = 593 -197 AGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATT :89===:=:=;;==;==================== MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:4:102:467:897 99 chr1 756 97 35M = 940 219 GCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGTCTTTT <<<<9<<<<9<2<<<&,/</<<<<7<<;&&<$;*< MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:2 UQ:i:8 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:1:12:884:219 147 chr1 756 99 35M = 584 -207 GCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTT 7;::<:<<<7<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:1:40:1596:1433 147 chr1 756 99 40M = 587 -209 GCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTT -:8:1841<4;<88<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:5:7:761:623 99 chr1 757 99 35M = 938 216 CTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTG <<<<<<<<<<<<<8<<<<;;<0<<<<<;;<;<;;& MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:4:246:313:499 147 chr1 757 99 35M = 592 -200 CTTTAAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTG +;77%;;;&:;:7;<<<<<6<:<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:6:89:1151:1878 147 chr1 757 99 35M = 587 -205 CTTTCAACGATTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTG 8<66,,<<<<<<:<<<<<9<<<:<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS54_71:4:165:397:25 83 chr1 759 99 34M = 576 -217 TTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGC &(33'60;-'+'<7;<<*3-<;;183<<<;<;<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:2:59:1576:946 147 chr1 761 99 35M = 578 -218 CAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTT 9<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:7:256:407:470 163 chr1 762 99 35M = 939 212 AACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTC <<<<<<<<;<;<<<<<<<<<;;<</<<;;83;7;9 MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:3:148:437:481 163 chr1 764 99 36M = 949 221 CGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<;0;8 MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:8:140:924:923 83 chr1 767 99 35M = 597 -205 TTTTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACC <<&<<;;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:4:143:560:194 99 chr1 768 99 35M = 946 213 TCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCC <<<<;;<<<<<<<<<<<6<;<<<<;;<<;9<999< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:2:178:192:499 83 chr1 768 99 35M = 582 -221 TCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCC 86<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:3:4:1620:413 147 chr1 768 99 35M = 588 -215 TCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCC -<<<7<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:2:73:730:487 147 chr1 770 99 35M = 604 -201 TAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTA <;;<<2;<;<<<;0<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:4:179:389:585 163 chr1 770 24 35M = 953 218 TGGCCACTTTTTATCGCATTTCCCTTTAGAACCTA <.4<9.4+.+'&-220<+<4<6<<20*6;<0(9<% MF:i:130 Aq:i:24 NM:i:7 UQ:i:103 H0:i:0 H1:i:0
-B7_595:1:252:19:955 147 chr1 771 84 35M = 596 -210 AGCCAGTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTCC <8<884<<<<<<68<<<<<<<2<;<<;<+<<<;<< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:2 UQ:i:46 H0:i:0 H1:i:1
-EAS54_71:4:169:862:829 83 chr1 772 99 34M = 611 -195 GCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTAC ,1<6<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:6:7:858:437 147 chr1 773 99 35M = 593 -215 CCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACAC 7;<4;;:;80<;<;<<<<<<:<<;<<<;;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:4:183:852:253 83 chr1 773 99 35M = 599 -209 CCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACAC ;<9<;<<<<<<<<;<<<<<;<<<;<<<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:4:20:41:138 147 chr1 774 99 35M = 615 -194 CATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACG ;;;<;<<<::<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:5:123:998:248 83 chr1 776 99 35M = 589 -222 TTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAA ;:;5;<;:<9<<<<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:4:142:63:937 83 chr1 777 99 36M = 609 -204 TTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATG ;;;<;<<<<;<<<<<;:<<<<<<<;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:3:20:762:748 83 chr1 777 99 35M = 591 -221 TTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAAT =:747;7=;;==7=;==7===7==7;========= MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:3:149:953:349 99 chr1 777 99 35M = 915 173 TTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAAT <<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;7:<:<<:<:;;::; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:3:46:981:766 163 chr1 778 99 35M = 933 190 TCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATG <<<<<<<<<<<<<;<<<<<-<;<<<<-<-<;-:6; MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:6:204:779:181 83 chr1 779 99 35M = 598 -216 CTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGC ;:;/*<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:6:11:360:1577 147 chr1 781 99 35M = 606 -210 TTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGT 1<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:2:5:491:391 99 chr1 782 99 35M = 917 170 TTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTC =========;===;==:4=========;3;==7;= MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_78:7:186:199:927 99 chr1 783 99 35M = 802 54 TGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCT <77<<<<2<;<<<<<06<<<<<<<<60<<684/6& MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:8:19:855:491 147 chr1 783 99 35M = 631 -187 TGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCT 8<<<<;:<<<<:<<<<<:<;;<<<<<<<;<<<;<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:1:36:485:632 83 chr1 784 99 36M = 610 -210 GGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCT 0;;;<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:2:177:266:842 83 chr1 784 99 35M = 599 -220 GGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTC <9<<6;9<;9;;<<<<;;;9<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:65:1928:1125 147 chr1 784 99 35M = 588 -231 GGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATACGTCTC <+<<<2<4<<<0<<4<<<<<6<<<6<<<'<<<<0< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:6 H0:i:0 H1:i:1
-EAS221_3:4:66:584:407 163 chr1 785 99 35M = 954 204 GCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCT <<<*9<9<<<1<<<<<<<<*<59<4<)<2<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:6:172:896:83 147 chr1 786 99 35M = 604 -217 CATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTA ;<.5.;;<+;<<<<<<<4<<<<<<<;<<<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:2:1200:1076 83 chr1 786 99 35M = 629 -192 CATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTA 7779779;9;:;;4;;9;;:7;<<<7;;;:<;<<; MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:3:135:543:760 147 chr1 787 99 35M = 619 -203 ATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTAC ;;.;;8;<8;<<32;<<<<<7<<<<<9<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:3:5:538:401 147 chr1 788 99 40M = 624 -204 TTTGCCTTCACACCCTACACGAATGCGTCTCTGCCACAGG 671&7::49:&0<<<(<::<&<<<:<<<<<<<&<<<<1<< MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:2 UQ:i:10 H0:i:0 H1:i:1
-EAS54_71:6:215:133:909 147 chr1 789 99 35M = 631 -193 TTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCA 7758;<;<;8<<<<;<;<<<<<:;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:2:30:887:404 83 chr1 789 99 35M = 600 -224 TTGCCTTCAGACCCTGCACGAATGCGTCTCTACCA <<<<5<;::<<<;<<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:13 H0:i:0 H1:i:1
-EAS219_1:1:5:497:687 147 chr1 789 99 35M = 607 -217 TTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCA <8<<8<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:5:131:742:561 83 chr1 790 99 35M = 620 -205 TGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCAC <:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:3:65:556:1505 83 chr1 790 99 35M = 593 -232 TGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCAC <6<8<<4<8;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:4:233:478:792 147 chr1 791 99 35M = 634 -192 GCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACA 6<;9:<<9-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:6:66:257:524 99 chr1 791 99 35M = 959 203 GCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<% MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:4:154:762:630 83 chr1 792 99 35M = 604 -223 CCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAG <<-::<91<<<<;<;<<<<;<<<<<<<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:8:4:841:339 83 chr1 793 99 35M = 646 -182 CTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGG 77-):22<<<33;<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:6:66:1282:1215 147 chr1 794 99 35M = 627 -202 TTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGG ::;<;<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:2:194:688:289 147 chr1 795 99 35M = 631 -199 TCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGG ;8;%28<;<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:8:36:927:478 147 chr1 798 99 35M = 610 -223 GACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCT ,6;;;3;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:8:99:756:130 83 chr1 798 99 35M = 606 -227 GACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCT ;;<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:5:192:716:235 83 chr1 798 99 35M = 651 -182 GACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCT <5<<<8<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:5:63:424:1643 83 chr1 798 99 35M = 614 -219 GACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCT 9+<<<+7<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:8:14:360:580 99 chr1 799 99 35M = 963 199 ACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCGG ===========3===;5<==8;====79==.=5'5 MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:1 UQ:i:6 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_78:7:186:199:927 147 chr1 802 99 35M = 783 -54 CTACGCGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGC -;++)6<*8+;&<&/<<<<7<<71<<<<<6<<<7< MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:1 UQ:i:8 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:3:4:1502:1911 83 chr1 802 99 40M = 652 -190 CTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTT :+:::5/;99<;<&<*<-9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:3:187:791:153 99 chr1 803 99 35M = 958 190 TACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:+;;<;<88*6;68 MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:4:63:527:1923 99 chr1 803 99 35M = 981 213 TACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCG <<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<3<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:2:31:98:804 99 chr1 805 99 35M = 982 212 CACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGC =======9===;============5=;9=;=;==& MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:7:89:1487:520 163 chr1 805 99 35M = 997 227 CACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGT 8<<<6/<<<<<<<<<:<<8<:<<3<<:668<86<3 MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:4:69:88:1154 99 chr1 805 99 35M = 992 222 CACGAATGCGTCTCTACCACAGGCGGCTGCGCGGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<:<<<<<7 MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:17 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_26:1:99:212:522 163 chr1 806 99 35M = 1002 231 ACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTT ================8==;====;=;===1==:8 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:7:35:378:681 147 chr1 812 99 35M = 632 -215 GCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCAT :<5-<);;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:3:182:404:693 83 chr1 812 99 35M = 646 -201 GCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCAT <;7;;4<<<<<<<7<<7<<<<<<<<<8<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:3:119:761:239 99 chr1 813 99 35M = 999 221 CGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATC <<<<<<<<<<<<6<<<<<<;<2<<<<;<<<<<;;< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:6:165:464:123 147 chr1 814 99 35M = 650 -199 GTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCA 9;<)<<%<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:5:40:758:116 83 chr1 814 99 40M = 632 -222 GTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAG 25/8/:<75:2<<<<<<7<<;<<<<<<<88;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:7:55:506:125 99 chr1 817 99 35M = 982 200 TCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGA <<<<<<<<<;<9<;<<;558<<<<5(5*<<<<<51 MF:i:18 Aq:i:35 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:6:162:594:858 147 chr1 818 99 35M = 634 -219 CTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAA 90;<99;==99==;4=:========;=====;=== MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:3:55:74:1040 99 chr1 818 99 35M = 975 192 CTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:7:100:708:1984 99 chr1 819 99 35M = 1015 231 TACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<7%: MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:7:92:367:1495 163 chr1 820 99 35M = 987 202 ACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<6<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:6:49:905:27 163 chr1 821 68 35M = 1000 214 CCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCCTGAAGCA <<;<.89<9.<2<9<:91+447.9,04&000(,+( MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS218_4:7:87:964:826 163 chr1 822 99 35M = 999 212 CACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<<8;4;;< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:8:38:1576:1923 163 chr1 822 99 35M = 987 200 CACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<:;<<;< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:1:122:337:968 99 chr1 823 85 35M = 981 193 ACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCACT <<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;<;;;; MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:3:187:294:947 99 chr1 823 99 35M = 1002 214 ACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCACT <<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<&<<%:<)7;7::4 MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:49:271:588 83 chr1 830 99 35M = 658 -207 GCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTC :0=:===:<===;;===;================= MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:3:40:594:752 147 chr1 831 99 35M = 651 -215 CTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTCC ;7;9<;;;<;<;:<<;;<<<<<<<<<;<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:8:163:757:432 99 chr1 837 99 35M = 1013 211 GGTTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCT <<<<<<<;<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<83:< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:4:156:857:494 83 chr1 838 99 35M = 648 -225 GTTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTC <<<8<:5<<;<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:5:84:91:614 163 chr1 839 99 35M = 1019 215 TTTCCCATCATGAAGCACTGATCTTCCACGTCTCA ;4<<<<<-84<<<;<<<<8<7.<4<<;77&:%<:: MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1 UQ:i:13 H0:i:0 H1:i:1
-EAS51_64:7:152:918:824 163 chr1 839 99 35M = 1033 229 TTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<8 MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:4:67:317:249 147 chr1 840 26 35M = 683 -192 TTCCCATCATGACGCACCGAACTTCCACGTCTCAT .5;7;++;<8.;&:7<<.5<<<<7<<7<<<<<<;7 MF:i:130 Aq:i:26 NM:i:2 UQ:i:18 H0:i:0 H1:i:0
-EAS51_62:7:96:836:737 147 chr1 841 99 35M = 642 -234 TCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATC 1<;<7;;1;8;;8:<<1<;<<;<<<<<<<<<<;<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:8:130:912:658 83 chr1 841 99 35M = 652 -224 TCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATC ;=;;;<<<<<=55=;==<=======<========= MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:3:75:934:439 163 chr1 842 99 35M = 1001 194 CCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:7:212:329:348 163 chr1 842 99 35M = 1020 212 CCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;;< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:6:49:183:435 163 chr1 843 99 35M = 1005 197 CCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;:;8;: MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:7:280:133:495 99 chr1 843 99 35M = 1015 207 CCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:1:232:351:909 147 chr1 843 80 36M = 685 -194 CCATCATGAAGCGCTGAACTTCCACGTCTCATCTAG :8%3<8====130=8==+===;=3=8===48==;3* MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1 UQ:i:15 H0:i:0 H1:i:1
-EAS221_1:8:77:781:676 163 chr1 846 99 35M = 1010 199 TCATGAAGCACTGAACTTCCACGTATCATCTAGGG <<<<<<<5<<5<<<<<<<<<<<<13<<2<<<<<,< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:18 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_95:2:198:691:595 83 chr1 847 99 35M = 655 -227 CATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGG :=:;=;===========;================= MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:7:31:948:254 147 chr1 849 99 35M = 680 -204 TGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAA 7;;;98<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:1:278:440:902 99 chr1 851 99 35M = 1032 216 AAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACA =========<==<==============:;;=;=;; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:8:74:674:124 163 chr1 854 99 35M = 1041 222 CACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGG <<<<<<<<<<<<:<;<<<<;<<<<;9;<<;;.;;; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:4:28:781:723 147 chr1 855 99 36M = 676 -215 ACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAG 8488<::;4;;<:;;;::<;7<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:2:28:474:566 163 chr1 855 99 36M = 1018 199 ACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<;<;;<<7;8;< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:5:124:241:608 147 chr1 856 99 35M = 670 -221 CTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAG 9;;<<;<<<;<<<;<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:6:187:925:547 147 chr1 857 99 35M = 689 -203 TGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGG ((988+&8<<;<09<;<<9<<4<<-<99<<;<9<; MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:9:512:826 99 chr1 859 99 35M = 1021 197 AACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTG 67<<<;;;<;;<<;;<;<:;9;;;9;;;;<59777 MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:6:194:696:490 99 chr1 862 99 35M = 1026 199 TTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;5<<<<<:<1<8<<<8 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:5:96:788:614 83 chr1 862 99 35M = 667 -230 TTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCAC ;9;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:3:81:786:340 163 chr1 863 99 35M = 1033 205 TCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGAGAGGTGCACT <<<<7<<<<<<<<<<<<<<7<<;<&<<;;7<7;;; MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS192_3:7:298:644:697 163 chr1 863 99 35M = 1035 207 TCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACT <<<<<<<<<<<<<<<::;;;6<8:;;9;98;668; MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:1:178:305:843 163 chr1 864 99 35M = 1037 208 CCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<;<<:<<:<;: MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:3:5:863:302 147 chr1 866 99 35M = 698 -203 ACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAAT :4:29:<<<9;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:30:788:376 99 chr1 866 99 35M = 1038 207 ACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAAT <<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<:<;<<(<7;7;:(; MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:3:143:310:958 163 chr1 868 99 35M = 1048 215 GTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGC <<<<<<<<<<<8<8<<<<<;;7<<<;6;<<+4;;; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:5:3:233:911 83 chr1 868 99 35M = 688 -215 GTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:5:75:637:650 83 chr1 868 99 35M = 691 -212 GTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGC <<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:2:73:513:102 147 chr1 868 99 35M = 698 -205 GTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGC ==::===8=>=====>=>=>>>=>>==>=>>>>>> MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:3:297:637:86 83 chr1 869 99 35M = 704 -200 TCTCAGCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCG <:75<;<;;<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:1 UQ:i:26 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:3:290:558:349 147 chr1 869 99 35M = 719 -185 TCTCAGCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCG 2;2;;'5&;<<5<<;5/<<<<<7<<;+;<<+1<8< MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:1 UQ:i:6 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:3:308:956:873 99 chr1 870 99 35M = 1068 233 CTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGC <<<<<<<<<<<<<;<;<;1<<<<<.<9<;<<<<+; MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_78:7:147:64:416 147 chr1 870 99 35M = 701 -204 CTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGC /;49;:6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:4:30:812:345 163 chr1 871 99 36M = 1036 201 TCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTC <<<<<<<7<;<<7<;77;3<&0-;<5<;6<1'13<: MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:7:134:243:630 163 chr1 871 99 35M = 1052 216 TCATCTAGGGGAACAGGGAGGCGCACTAATGAGCT <<<:<<<<</<<<-<<<<6/<-<:<5+<::-2</2 MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:2 UQ:i:29 H0:i:0 H1:i:1
-EAS54_81:2:27:856:401 83 chr1 871 99 35M = 679 -227 TCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCT .'=.93======;;====;======;===;=;=== MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:7:45:462:455 83 chr1 874 99 35M = 723 -186 TCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCA 62*<;;;;<<;<<9;;<<<<<<<<<<<<<<<<;<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:1:264:988:663 147 chr1 875 99 35M = 688 -222 CGAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCAC (%<:4<4<<7<<1-:<1766<66<<<<+<:<;8;< MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:1:145:71:26 163 chr1 875 99 35M = 1040 200 CTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCAC <<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;<<;<;<9<9;;99; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:1:101:825:28 163 chr1 879 99 35M = 1079 235 GGGAACAGGGGGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCC <<86<<;<78<<<)<;4<67<;<;<74-7;,;8,; MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS218_4:5:63:875:1339 83 chr1 879 99 35M = 711 -203 GGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCC ;;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:6:290:270:557 99 chr1 880 99 35M = 1052 207 GGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCA <<<<<<<<<<<<<;<<<<9<:;<<<<<<5<0<<;+ MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:6:134:853:558 163 chr1 880 99 35M = 1071 226 GGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCA ==========================9=9=;<;<5 MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_4:7:282:567:481 99 chr1 880 88 35M = 1064 219 GGAACAGGGAGGCGCACTAATGCGCTCCACGCCCA <<<<<<<<<<<<3<7<7<<<<;<<0)<<<<<<<<3 MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:18 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_30:1:154:818:165 163 chr1 881 99 35M = 1041 195 GAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<:7;:; MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:1:301:54:240 163 chr1 882 99 35M = 1061 214 AACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAG <<<<:<9<<<<:<<<<9<<<<<<690<<6</<(83 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:4:12:402:843 163 chr1 885 99 35M = 1072 222 AGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:4:262:965:756 99 chr1 885 99 35M = 1069 219 AGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<9;< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:8:30:816:90 163 chr1 885 99 35M = 1057 207 AGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCCAGCCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<::1&(1::7 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:4:171:104:398 163 chr1 885 99 35M = 1066 216 AGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCC =========)===97===3===4===4==,)=/)= MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:4:163:31:455 83 chr1 886 99 35M = 730 -191 GGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCT 8;<<;<<<78+<=</<<=;23<=<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:7:149:354:667 147 chr1 888 99 35M = 734 -189 GAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTC ;<;;;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:7:18:571:1110 99 chr1 888 99 35M = 1070 217 GAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTC 7<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<788<<<;6< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:6:312:837:406 163 chr1 889 99 35M = 1048 194 AGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:6:160:272:398 83 chr1 891 99 35M = 705 -221 GTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCA 3:,<,;;<<;<<1<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:4:228:587:504 99 chr1 891 65 35M = 1050 194 GTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCA <<<<7<<7;7<<3<<<<7<<<<<*3<<<<74<:<* MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:3:35:361:546 83 chr1 892 99 35M = 731 -196 TGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCAC :4;4;;<<;4<8<;;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:6:84:438:1505 99 chr1 893 99 40M = 1068 215 GCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTC 35<<:;9<;<;5<<<:<3<<7:<9/<)<<:::9<&5;;+1 MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:4:277:482:316 163 chr1 894 99 35M = 1098 239 CACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAG <<<<<<<<<<<<<<;<;<<<:<;<<<<;<<<1<1; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:7:86:498:373 83 chr1 894 99 35M = 716 -213 CACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAG ):)4:<5<<<<;89<<<969<<<:<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:5:236:498:526 163 chr1 895 99 35M = 1048 188 ACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGT =================================== MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:1:43:1120:878 99 chr1 895 99 35M = 1075 215 ACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<=7;7 MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:4:104:153:698 83 chr1 896 99 36M = 713 -219 CTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTT 69<<)9<<:5:6<<<16:<6/<6<1<<<<<:<:<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:7:166:42:147 99 chr1 898 99 35M = 1048 185 AATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTAACAGTTTC <<;<<<<<<<<<<<<<<<<;6<<64;)<<7;7;;; MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:8 H0:i:0 H1:i:1
-B7_595:2:178:77:424 99 chr1 900 99 35M = 1058 193 TGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTG <<<<<<<<<<<<<<<6<<;<<<<<<<<6<;<<<<6 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:6:87:734:888 83 chr1 900 99 35M = 717 -218 TGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTG 56<<86;:<<<4;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:2:149:650:44 83 chr1 902 99 36M = 726 -212 CGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCC ;8<<</<<:<<595<<9<<<<<<<<<<<<<<3<9<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:2:177:552:234 99 chr1 903 99 35M = 1094 226 GCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCC <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<9<969<<<<3<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:4:58:703:72 163 chr1 905 99 35M = 1088 218 TCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCC 2<7<<<<<<<<<<<8:<<<<8<(<8<:::8.::<3 MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:7:242:4:593 99 chr1 905 99 35M = 1086 216 TCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCC <<<<<<<<<<<8<<<<-<<<<<88;<;<<8<;88< MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:3:67:620:344 147 chr1 905 99 35M = 755 -185 CCCCCGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCC +++*+++#++++++,++++++++,,+,&+,,,,+, MF:i:18 Aq:i:33 NM:i:2 UQ:i:19 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:7:178:286:414 83 chr1 907 99 35M = 731 -211 CACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAG 68;38::<<;<<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:7:174:987:334 163 chr1 908 99 35M = 1082 209 ACACCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGC <<;4<<<<;;</4<4<+<<<<<;<<<<<</<93+2 MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:26 H0:i:0 H1:i:1
-EAS219_FC30151:1:55:8:1412 163 chr1 910 99 35M = 1072 197 GCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:8:1351:1986 83 chr1 911 99 35M = 729 -217 CCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATG <8;<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:6:37:610:260 83 chr1 913 99 35M = 745 -203 CAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGT /74<.<4.&<<<:<<<<::<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:5:228:189:826 99 chr1 914 99 35M = 1112 233 AAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCCGCATGGTT ;9=========;=1======9=====1;=<3=:6; MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:16 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_59:3:149:953:349 147 chr1 915 99 35M = 777 -173 AGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTG 2;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:24:1374:211 99 chr1 915 99 35M = 1064 184 AGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTG ;;:<<;<;:;;;;;;;;;;<::;;;6;;2+74917 MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:2:5:491:391 147 chr1 917 99 35M = 782 -170 CCCTGCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTA -/+5-.&&:5+:92=6===========9======= MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:1 UQ:i:12 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:2:306:119:56 99 chr1 919 99 35M = 1083 199 CTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:1:216:381:608 163 chr1 920 99 35M = 1075 190 TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;+<6:<;26; MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:3:73:292:429 147 chr1 920 99 35M = 752 -203 TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG ;6;6;<<<<<;<<<<;<<<<<<<<7<<<<<<5<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:2:170:265:818 83 chr1 920 73 35M = 748 -207 TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG 3+;%;.;;<<9+;3;;;<<<;57<1<;<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:1:278:906:933 99 chr1 920 99 35M = 1071 186 TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<. MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:7:190:95:706 99 chr1 920 99 35M = 1078 193 TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG <<<<<<<<<<<<<<9<<<<<;;<;<;;<<;<;;<, MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:5:278:848:765 99 chr1 920 99 35M = 1088 203 TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4 MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:6:29:249:878 163 chr1 921 99 35M = 1077 191 TCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<=<<:<<6& MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:2:259:467:737 163 chr1 923 99 36M = 1102 215 TCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCA <<<<<<<<<<<<7<<<<<<<'<<.<<<<<<;;;<67 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:3:24:195:604 163 chr1 923 99 35M = 1098 210 TCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGTGC <;<<<<<<<<<89<<<<<868<8;6<8;3(38&<8 MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:4:42:923:169 163 chr1 925 99 35M = 1099 209 ACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAA 9<<<;9<<<<<;<;<<.<<;<;6<<<<1;8<<-0; MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:1:29:529:379 163 chr1 926 99 35M = 1117 226 CAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAAT <<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<;<672;<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:8:26:785:882 163 chr1 926 99 35M = 1107 216 CAGTTTCTGCCCCAAGCATGGTTGTACTGGGCAAT <<<0<<<<<<<<<6,<<)<<<<<<<&<<0<<,<'< MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1 UQ:i:21 H0:i:0 H1:i:1
-B7_591:7:129:956:115 83 chr1 927 99 36M = 740 -223 AGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATAC <<:<9<4<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:3:82:356:253 147 chr1 927 99 35M = 752 -210 AGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATA 97;7<<;;<<<<<7;<<:<<<9<<;<<<9<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:1:134:379:893 99 chr1 927 99 35M = 1095 203 AGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATA <<<<<<<<<<<<<5<<<<;<<<<<;<:5;<<4+<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:8:256:404:584 99 chr1 928 99 35M = 1096 203 GTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<3;<:;;3:3:</ MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:3:76:333:905 163 chr1 929 99 35M = 1076 182 TTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACA <<<<<7;<;<<6<<6<<7<<7<)&<4+6)0+<;(0 MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:6:11:646:628 99 chr1 930 99 36M = 1106 212 TTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATG <<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<</<;<<<<<<6<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:136:389:320 99 chr1 930 99 35M = 1100 205 TTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACAT 7<<<<<;<<7<6<<;;<;<;;677<6;(27;<(97 MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:6:93:334:858 99 chr1 932 99 35M = 1106 209 CTGCCCCCAGCATGGTTGTACTTGGCAATACATGA <<<<<<<<;<<<<;;<<9<<<<&;&<<9<9;/;&; MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-B7_597:3:46:981:766 83 chr1 933 99 35M = 778 -190 TGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAG /<<<;/;<<316<<<3<<<<7<<<7<<<;<<<<<7 MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:209:159:130 99 chr1 934 99 34M = 1109 210 GCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAG <<<<<<8<<<<<<&<<+7<<4<<<22<;<<<<3< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:1:111:796:737 99 chr1 936 99 35M = 1112 211 CCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGTGATT <<<<<<<<<<<<<<<:<<;7;<<<<993<4%:%<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:4:15:856:340 99 chr1 936 99 35M = 1093 192 CCCCAGCATGGTTGCACTGGGCAATACATGAGATT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<77<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-B7_610:5:7:761:623 147 chr1 938 99 35M = 757 -216 CCGGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTAT ::';-8);<<<<;<1<<<<:<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1 UQ:i:6 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:5:84:927:843 99 chr1 938 99 35M = 1138 235 CCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTAT <<<<<<<<<<<<<;9;;4;<<0<<7<<9<;<:<5< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:3:273:901:459 99 chr1 938 99 35M = 1098 195 CCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTAT <<8<<<;<;8<;<;<;7+8<788<;;22<27;77; MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:7:256:407:470 83 chr1 939 99 35M = 762 -212 CAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATT 7.47;0;;5<4033*<<<<<9,<<<<<;<<<<<3< MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:1:77:251:446 163 chr1 939 99 35M = 1110 206 CAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATT <<9<<<<<<<<<<<<<97<<<<<<<<<96<<<+<< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:4:102:467:897 147 chr1 940 97 35M = 756 -219 AGCATGGTTGTACAGGGCAATACATGAGATTATTA 83333<+02<:<.&<+<.<::7<<::<<<<:<<<< MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS221_1:6:92:1807:1185 99 chr1 940 99 35M = 1119 214 AGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATTA <<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<:<<<<;<<<;<<; MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:8:142:858:903 99 chr1 943 99 35M = 1121 213 ATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATTAGGA ======;====5=======9======;===3=5=; MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:4:143:560:194 147 chr1 946 99 35M = 768 -213 GTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAAT 9:<;7<:::<:<;<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:3:148:437:481 83 chr1 949 99 36M = 764 -221 GTACTGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTT <<<;<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:6:75:917:886 163 chr1 951 99 35M = 1110 194 ACTGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTT <<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<71<<<:6<:8< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:3:118:851:285 163 chr1 953 99 35M = 1133 215 TGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;<:<<<<;; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:4:179:389:585 83 chr1 953 24 35M = 770 -218 TGTGAAATGAATGAGATTATTAGGAAATGCTTTAC ;<)<;*;9*+<;<<,,<,<4<4<<<<<;<4<9494 MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:4 UQ:i:53 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_30:7:269:944:220 163 chr1 953 99 35M = 1147 229 TGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTAC <<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<;81 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:3:93:1002:845 163 chr1 954 99 35M = 1129 210 GGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;<<<;<<<</< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:4:66:584:407 83 chr1 954 99 35M = 785 -204 GGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACT <<84<<<766<<<.6<<<<<<4<<7<<<<<<<7<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:6:63:48:631 163 chr1 957 99 35M = 1143 221 CAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTC <<<<<<;<<7</<<<<<<;;;<<<;<;<<7;;);< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:3:187:791:153 147 chr1 958 99 35M = 803 -190 AATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCA :;55&<99<<1<;<<8<<;<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:2:72:1809:1398 99 chr1 958 99 35M = 1145 222 AATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<::<9<<<<<<<<<6<<: MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:6:66:257:524 147 chr1 959 99 35M = 791 -203 ATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCAT <;<<<<<<<<3<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:7:247:522:670 163 chr1 960 99 35M = 1121 196 TACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATA <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<5;<<<; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:7:37:400:627 163 chr1 961 99 35M = 1154 228 ACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAA <<<<<<7+<<<<<<2615<<6<<<<5<<1<<;:74 MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:3:329:177:267 163 chr1 962 99 35M = 1139 212 CATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<9; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:7:166:203:416 163 chr1 963 99 35M = 1136 208 ATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACT <<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<97< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:8:14:360:580 147 chr1 963 99 35M = 799 -199 ATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACT <,1<;<;;<<<<<1<<<;<7<<6<:;;<<<<<<;; MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:4:193:38:987 163 chr1 964 99 35M = 1158 229 TGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<:;:;; MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:3:39:59:738 163 chr1 965 99 35M = 1142 212 GAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAATTAT 3<8.<<<<<<<-<<<<3<388;;880<0<0)-722 MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:12 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:4:209:92:210 163 chr1 965 99 35M = 1156 226 GAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTAT <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<5<7<<;;;<;< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:7:86:308:648 99 chr1 970 99 35M = 1161 226 TATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGA =8=====;=8======;=======35==;=;.;25 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:8:206:563:262 163 chr1 971 99 35M = 1137 201 ATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAG <<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<-;<4; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:6:82:822:767 99 chr1 972 99 35M = 1165 228 TTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<.<<.<,< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:207:926:427 163 chr1 973 99 35M = 1159 221 TAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGAC <<<<<<7<<<<<;<<<<<6:<;<6<&<58<<6::: MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:7:144:28:475 99 chr1 974 99 35M = 1167 228 AGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<::8< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:3:55:74:1040 147 chr1 975 99 35M = 818 -192 GGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTA ;;;;;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:1:274:176:479 99 chr1 976 99 35M = 1144 203 GAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTAT <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<9<59<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:1:122:337:968 147 chr1 981 10 35M = 823 -193 GCTTTACTGTCTAAACTATGAAGAGACTATTGCCA %454<75!7<+!990<9<6<<<<6<</<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:3 UQ:i:24 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_28:7:157:786:424 99 chr1 981 99 36M = 1171 226 GCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAG <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<;<<;<<<<+4:70 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:4:63:527:1923 147 chr1 981 99 35M = 803 -213 GCTTTACTGTCATAACCATGAAGAGACTATTGCCA 9<<<8<-8;;8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_95:7:55:506:125 147 chr1 982 99 35M = 817 -200 CTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTACTGCCAG 118%67;1;8,4:187<4>::1:818;;&::<>.; MF:i:18 Aq:i:35 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS54_81:2:31:98:804 147 chr1 982 99 35M = 805 -212 CTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAG ====;========7===================== MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:2:235:805:373 163 chr1 983 99 35M = 1146 198 TTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTTCCAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<;;<99; MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:1 UQ:i:26 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:5:11:868:62 99 chr1 983 99 36M = 1154 207 TTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<;<<<<(7:7039 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:2:280:512:316 163 chr1 984 99 35M = 1159 210 TTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGCT ==<========6==4==6;;==:===;=2/:+8%6 MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:5:292:122:666 99 chr1 985 99 35M = 1159 209 TACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGTCAGATG <<<<<<6<<<<<<<<8;<<<<<<<<<<3&9+;;(; MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:1:23:403:981 99 chr1 985 99 35M = 1151 201 TACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATG <8<<<;<<<<<<;<<<<<<8;<<<9<9,3;,6(91 MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:33:1566:588 99 chr1 985 76 35M = 1166 216 TACTGTCATAACTATGAAGAGCCTATTGCCAGATG <;.;;;;6;;;;6;;29;;;<+9;;;.3;;73797 MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:0 H1:i:1
-EAS139_11:7:92:367:1495 83 chr1 987 99 35M = 820 -202 CTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAA <8<88<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:8:38:1576:1923 83 chr1 987 99 35M = 822 -200 CTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAA 8;<98<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:7:190:481:295 163 chr1 990 99 35M = 1161 206 TCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<9<7<2:: MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_32:7:168:117:441 99 chr1 990 99 35M = 1151 196 TCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCA <<3<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+<<17;<;:<995 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:3:239:796:221 163 chr1 992 99 35M = 1160 203 ATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGCTGACCCCCC <<<7<<7<<7<<7<;<<<<<,;;,+'<+/+99%:' MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:4 UQ:i:26 H0:i:0 H1:i:1
-EAS220_1:4:69:88:1154 147 chr1 992 99 35M = 805 -222 ATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACA <<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:8:34:956:1309 99 chr1 994 99 35M = 1168 209 AACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACA <<<<<<7<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<:<8<8 MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:5:229:717:121 99 chr1 995 99 35M = 1150 190 ACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACAC =================<)=<4<0=.<<<71;41& MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:1:67:191:668 99 chr1 995 99 35M = 1134 174 ACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACCT <<<<<<<<<<<<<<<<<6<<;<;<;<<<<<<6;%2 MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:3:309:303:278 163 chr1 996 99 35M = 1178 217 CTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATT <<<<<<<<<<<<<<<<+<<+<<7<<<<<5<<<;;; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:60:1020:1259 99 chr1 996 99 35M = 1157 196 CTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATT <;<<<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<8<<<<<:<:<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:7:89:1487:520 83 chr1 997 99 35M = 805 -227 TATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTA 4;;/<<<<<:<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:4:15:805:420 163 chr1 998 35 35M = 1164 201 ATGAAGAGACTATTCACATGTGAACCACACATTTA ;73;;;;67.;1<<+*.;*&<4947<&474&*9*( MF:i:130 Aq:i:35 NM:i:4 UQ:i:33 H0:i:0 H1:i:0
-EAS56_57:3:119:761:239 147 chr1 999 99 35M = 813 -221 TGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAAT ;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:7:142:457:584 99 chr1 999 99 35M = 1160 196 TGAAGAGACTATTTCCAGATGAACCACACATTAAT <<<<<<<<<<<<</<<,6<66<<<;<;;<*4744. MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:14 H0:i:0 H1:i:1
-EAS218_4:7:87:964:826 83 chr1 999 99 35M = 822 -212 TGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAAT )6<<<<<<:;<6<<::<<<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:6:49:905:27 83 chr1 1000 68 35M = 821 -214 GAAGAGACTATTGCCAGTTGAACCACACATTAATA 99515<<&<<6595-56%;86&<;<<<6<<<<6;< MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_108:3:75:934:439 83 chr1 1001 99 35M = 842 -194 AAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATAC ==7=:=========================<==== MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:1:99:212:522 83 chr1 1002 99 35M = 806 -231 AGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACT <1<16<7<3<<;;<8<<<<<<<<<<<<;<<<<9<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:3:187:294:947 147 chr1 1002 99 35M = 823 -214 AGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACT <<:<<8181;<8<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<: MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:2:152:860:286 163 chr1 1004 99 35M = 1171 202 AGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTAT <;<<<;<<0:<3<:<<2<<<<<7+<7+47<9(999 MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:6:49:183:435 83 chr1 1005 99 35M = 843 -197 GACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATG 1<7<<<<;:<<<<<;<<<;<<<;<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:7:63:854:610 163 chr1 1005 99 35M = 1180 210 GACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:4:12:276:1797 99 chr1 1006 99 35M = 1190 219 ACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATGT <<<<<<<<<<<<:</<<9<:<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:6:190:42:671 163 chr1 1008 99 36M = 1192 220 TATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTC <<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:7:67:692:110 99 chr1 1009 99 35M = 1175 201 ATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:3:61:183:767 99 chr1 1010 99 35M = 1195 220 TTGCCAGATGAACCACACCTTAATACTATGTTTCT <<<<<<<<<<;<<<9<9<+<<<8<<<<<<;8<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:0 H1:i:1
-EAS221_1:8:77:781:676 83 chr1 1010 99 35M = 846 -199 TTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCT :<;<2<<<<<<26<<<<6<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:4:21:132:1423 99 chr1 1012 99 35M = 1178 201 GCCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:8:163:757:432 147 chr1 1013 99 35M = 837 -211 CCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTCAT 1+<8<<<<<<;<5<;<<<<<;5<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_30:3:302:288:657 99 chr1 1013 99 35M = 1173 195 CCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:97:1584:777 99 chr1 1013 99 35M = 1200 222 CCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTAT <<;<;;;;<;<;<<;;;;;;;;;;;;;;:;79979 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:7:280:133:495 147 chr1 1015 99 35M = 843 -207 AGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCT <:<9:<<7:<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:7:100:708:1984 147 chr1 1015 99 35M = 819 -231 AGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCT :8<(8<)9<;<<<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:5:182:313:319 99 chr1 1016 99 35M = 1180 199 GATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<;<; MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:3:41:474:283 99 chr1 1018 99 35M = 1182 199 TGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<+<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:2:28:474:566 83 chr1 1018 99 36M = 855 -199 TGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC ;<<<+<<<<5<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:5:84:91:614 83 chr1 1019 99 35M = 839 -215 GAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC <<;;<<<7<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:1:159:222:274 99 chr1 1019 99 35M = 1189 205 GAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC =;9====;=9==59=+==9========9===5;7= MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:3:62:603:1552 163 chr1 1019 99 35M = 1180 196 GAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<;< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:7:212:329:348 83 chr1 1020 99 34M = 842 -212 AACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC 8<6:<:<<<;<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:233:97:262 99 chr1 1021 99 34M = 1175 189 ACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCCCA <<<<<<<<<<<;<;<<:<<<<<<<<<<<<.<&77 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:9:512:826 147 chr1 1021 99 35M = 859 -197 ACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACAT 76777:;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;:;;; MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:4:29:794:282 163 chr1 1025 99 36M = 1196 207 CACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<&<<;:<<8<<8 MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:4:278:524:521 163 chr1 1025 99 35M = 1224 234 CACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACT <<<;<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<7;5;<<<;;< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:3:39:966:551 99 chr1 1026 99 35M = 1205 214 ACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<;<&<<&<<; MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:6:194:696:490 147 chr1 1026 99 35M = 862 -199 ACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTA ========;======;==========8==:===== MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:3:305:565:952 99 chr1 1030 99 36M = 1213 219 TAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTG 7<<<<<<<<<7<<<<<<<<<7<<<;;<;<;<<<<<+ MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:7:287:258:321 99 chr1 1030 99 35M = 1194 199 TAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCT <<<<<<<<<<<;<<<<<<<<42:<+<<<;<<;;;; MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:1:278:440:902 147 chr1 1032 99 35M = 851 -216 ATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGC <;7;4<;<;;;<<;<;;;<<<<<9<<<;<<<<;<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:5:180:905:36 99 chr1 1033 99 35M = 1212 214 TACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCA ==========8===;;=========;==77%41=; MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:7:152:918:824 83 chr1 1033 99 35M = 839 -229 TACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCA ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:3:81:786:340 83 chr1 1033 99 35M = 863 -205 TACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCA ;<;<<<;<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:3:196:11:27 163 chr1 1035 65 36M = 1198 199 CTATGTTTCTTATCTGCNCATTACTACCCTGCAATT <<<<<<<<;<<<<<<<8!4<<<;+<88;8<+2,8<; MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:1 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:1
-EAS192_3:7:298:644:697 83 chr1 1035 99 35M = 863 -207 CTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAAT 8:<8;<;:7;<<;4;:+<7<<<<;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:4:30:812:345 83 chr1 1036 99 36M = 871 -201 TATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTA ;<;<<<<5<<<:<;<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:1:178:305:843 83 chr1 1037 99 35M = 864 -208 ATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTA <<<<<<<4<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:30:788:376 147 chr1 1038 99 35M = 866 -207 TGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAA :5<<4:88;9<<<<<;<<<<;<8<;<<<<1<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:1:145:71:26 83 chr1 1040 99 35M = 875 -200 TTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATA 882;8;<;;887<<<;;<<<<;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:6:157:42:763 163 chr1 1040 99 35M = 1203 198 TTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTATTA <<;<;<<<<<;<:4<<<<<<<<<;;4<<<:;;+;+ MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:8:74:674:124 83 chr1 1041 99 35M = 854 -222 TTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATAT ;;;;;<<:<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:1:154:818:165 83 chr1 1041 99 35M = 881 -195 TTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATAT ;;;;<<<;<;;<;<<<<;<<;;;<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:3:319:174:811 99 chr1 1044 99 35M = 1242 233 TTATCTGCACATTTCTACCCTGCAATTAATATAAT <<<<<<<<<;<<<<<<<<<;;<<<<<<<8<<;9<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS139_19:3:87:133:930 163 chr1 1044 99 40M = 1198 194 TTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGT <<<7<<<<;<<;7<<7<<;;<<<;<5;<;;;5;;<:/48: MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:1:44:1466:425 163 chr1 1044 99 35M = 1213 204 TTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:5:236:498:526 83 chr1 1048 99 35M = 895 -188 CAGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTG <%88<;<:8<<<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:3:143:310:958 83 chr1 1048 99 35M = 868 -215 CTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTG 84<;<6<<<<;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:6:312:837:406 83 chr1 1048 99 35M = 889 -194 CTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTG ;<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:7:166:42:147 147 chr1 1048 99 35M = 898 -185 CTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTG 3.7;;;;:<<<77<<3<;<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:3:279:763:945 99 chr1 1048 99 36M = 1210 198 CTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<4:<<47<:<;<<</<9< MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:3:82:998:566 163 chr1 1050 99 35M = 1227 212 GCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTC <<<<<<<:<<0<<<<:<82<<::<4<<;<<4<4<; MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:4:228:587:504 147 chr1 1050 65 35M = 891 -194 GCACATTACGACCCGGCAAGGTGTATAATTGTGTC ;4;4;&&82&04+&&48;3&3&*<7<47<<;-<-8 MF:i:130 Aq:i:65 NM:i:6 UQ:i:47 H0:i:0 H1:i:0
-B7_595:6:290:270:557 147 chr1 1052 99 35M = 880 -207 ACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCA 87:9;;;<851+:5.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:7:134:243:630 83 chr1 1052 99 35M = 871 -216 ACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCA 63<;37:<*&:<<<,,*<<:7<<7<<<<<<<::<< MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:1:47:303:887 163 chr1 1052 96 35M = 1240 223 ACATTACTACCCTGCCATTAATATACTTGTGTCCA <<;;<+<9<<<<<9<(6<;//</<8(<<89;6084 MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:2 UQ:i:14 H0:i:0 H1:i:0
-EAS221_3:8:74:770:1712 163 chr1 1052 99 35M = 1208 191 ACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<7<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:6:29:575:453 163 chr1 1056 99 36M = 1228 208 TACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATTTAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<1<:<9<&<98 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:5:318:177:383 163 chr1 1056 99 35M = 1251 230 TACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTA ;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;1'<; MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:8:179:549:753 99 chr1 1056 99 35M = 1218 197 TACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<7<<<:<9<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:8:30:816:90 83 chr1 1057 99 35M = 885 -207 ACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTAC :<3:%9299<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:2:178:77:424 147 chr1 1058 99 35M = 900 -193 CTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTACA :5:8<;<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:1:301:54:240 83 chr1 1061 99 35M = 882 -214 CCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTACACAC &..*3===1=========5.5==5===4====:5= MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:4:91:521:517 99 chr1 1061 99 35M = 1239 213 CCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTACACAC <<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<8<<;;;<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:24:1374:211 147 chr1 1064 99 35M = 915 -184 TGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCT 77661;;;5;;:;;:;:;;;;;;8:;;;:;;;;;: MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_4:7:282:567:481 147 chr1 1064 88 35M = 880 -219 TGCAATTAATATAATTGTGTCCACGTACACACGCT <9<6<;<9<<<;<<<;<5<7<5</7<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:14 H0:i:0 H1:i:1
-EAS188_7:4:171:104:398 83 chr1 1066 99 35M = 885 -216 CAATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGT 79<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:8:9:80:353 163 chr1 1067 99 35M = 1233 201 AATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<;;<<5<<2;2 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:6:42:920:522 163 chr1 1067 99 35M = 1244 212 AATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTT <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<:<<<<<<<:;;::& MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:3:308:956:873 147 chr1 1068 99 35M = 870 -233 ATAAAAATAAGTGTGTCCATGTACACACGCTGTCC 91.97&9499&-1*98*19999839999.9&9799 MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:3 UQ:i:23 H0:i:0 H1:i:1
-EAS139_19:6:84:438:1505 147 chr1 1068 99 40M = 893 -215 ATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACTCTGTCCTATGT :0::413::;:::0:179::3<;<:<9<&6<<<;<019<< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS51_62:3:55:340:837 163 chr1 1069 99 35M = 1238 204 TTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCT <<;<<;<<<<<8<;<<<;<7<<<;<<<<<93+79( MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:4:262:965:756 147 chr1 1069 99 35M = 885 -219 TTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCT <<:<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:7:18:571:1110 147 chr1 1070 99 35M = 888 -217 TAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTA 9<<;<;==;;=;=<;<=================== MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:2:40:918:950 163 chr1 1071 99 35M = 1247 211 AATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTTTCCTTT =========,=9=====2=7===7=0==&=+3=-= MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:2 UQ:i:17 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:2:59:882:980 163 chr1 1071 99 35M = 1263 227 AATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTAT <<<<<<<<<8<<<<<9<+<<<9<<<1<<77889+6 MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:6:134:853:558 83 chr1 1071 99 35M = 880 -226 AATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTAT <<<<8<<<7<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:1:278:906:933 147 chr1 1071 99 35M = 920 -186 AATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTAT <88::<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:4:12:402:843 83 chr1 1072 99 35M = 885 -222 ATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATG <7<+<<11<9<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:5:160:434:853 163 chr1 1072 99 35M = 1259 222 ATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<,<<<<:<<<<,<: MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:1:55:8:1412 83 chr1 1072 99 35M = 910 -197 ATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATG <<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:1:219:294:861 163 chr1 1073 99 35M = 1244 206 TATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTCTGT <<<<<<<<<<<<<9<<<5<9<<<9<<544<<'<+: MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1 UQ:i:6 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:4:14:1665:1772 163 chr1 1073 84 35M = 1263 225 TATAATGGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGT <<<<<7*<<<<<<<<<78<5<<7<<5<556<(73( MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1 UQ:i:9 H0:i:0 H1:i:1
-B7_591:3:45:294:380 163 chr1 1074 80 36M = 1233 195 ATAATTGTGTCCATGTACACACGATGTCATATGTAC <<<<<<<<9<<<<<<<<<70<<7<6272&:3<+</% MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:2 UQ:i:32 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_108:7:222:538:267 99 chr1 1074 99 35M = 1228 189 ATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATTTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<74;;39%6+ MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:1:216:381:608 83 chr1 1075 99 35M = 920 -190 TAATTGTGTCCATGTACACTCGCTGTCCTATGTAC 55<99<<<99;<;<<(<39&7<<<<<<<<<<<<<9 MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS54_67:1:138:186:274 99 chr1 1075 99 35M = 1231 191 TAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTAC =39====9===;=;=;=9=;=====;===-=+=-7 MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:1:43:1120:878 147 chr1 1075 99 35M = 895 -215 TAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTAC <<<;<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_4:5:166:776:590 163 chr1 1075 99 35M = 1252 212 TAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTAC <<<<<</<<<<<<<<<<<<<'<=<:26.</79<:: MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:3:76:333:905 83 chr1 1076 99 35M = 929 -182 AATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACT <<;<<<<;7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:6:29:249:878 83 chr1 1077 99 35M = 921 -191 ATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTT <,;<9<;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<><<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:7:190:95:706 147 chr1 1078 99 35M = 920 -193 TTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTA 9;97437;<;;<<;<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:1:101:825:28 83 chr1 1079 99 35M = 879 -235 TGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTAT 0;0'0;<<<<<<8<;<<<<;;3<<;;<<<8<<<<< MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:4:188:460:1000 99 chr1 1080 99 35M = 1251 206 GTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATC <<<<<<<<<<<<<<<<7<<;:4;44<;;:8;;9;; MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:3:268:523:511 99 chr1 1081 99 35M = 1241 195 TGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<6<:9<<3<44 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:6:54:263:585 99 chr1 1081 99 36M = 1254 209 TGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;<<;<:;::<<;;:;4 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:7:174:987:334 83 chr1 1082 99 35M = 908 -209 GTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCAT ,;<;;<<<&<<<1<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:6:224:932:942 99 chr1 1082 99 34M = 1250 203 GTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<7<<(;3, MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:1:12:1296:358 99 chr1 1082 96 35M = 1252 205 GTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCAT ;;;6;7;7;;;;;7;9;;-*1;9;699/99/7477 MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:2:306:119:56 147 chr1 1083 99 35M = 919 -199 TCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATG ;;;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:4:66:179:118 163 chr1 1084 99 35M = 1262 213 CCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;<<6<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:2:110:584:649 99 chr1 1084 99 35M = 1266 217 CCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<::<38 MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:4:28:315:310 163 chr1 1085 99 35M = 1242 192 CATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<+.<<.<+7<*17 MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:7:242:4:593 147 chr1 1086 99 35M = 905 -216 ATATACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACT 1.%55877+8+88808887+7;7;18:8;;;.&;8 MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:1:131:946:353 163 chr1 1087 99 35M = 1249 197 TGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTC <<<<<<<<<<<<<;<<<<;;<<<<<<<;<:52;<2 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:4:4:1732:88 99 chr1 1087 99 35M = 1265 213 TGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTC <<<<<<<<<<<<<<<<<2<8;8<;<8;<2;2:<:< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:4:58:703:72 83 chr1 1088 99 35M = 905 -218 GTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCT 5&<<7;+95;7'6<<<<<.<<<<<;<<9<7<<<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:5:113:694:725 163 chr1 1088 99 35M = 1266 213 GTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCT <<<<<<<<<<<<9<<<<<:<<<<<<<<<<:;;<;; MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:5:278:848:765 147 chr1 1088 99 35M = 920 -203 GTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCT 7;;<;5<55<<;;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:6:234:787:12 163 chr1 1092 97 35M = 1257 200 ACACGCTGGCCTATGTACTTATAATGACTCTATCC <;<<<9<<&+9;3;<993;<9<+94;9&41;08%9 MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:2 UQ:i:15 H0:i:0 H1:i:0
-EAS218_1:4:15:856:340 147 chr1 1093 99 35M = 936 -192 CACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:2:258:266:101 163 chr1 1094 99 35M = 1285 226 ACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<5<;,<-2<<<<;68<<6 MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:2:177:552:234 147 chr1 1094 99 35M = 903 -226 ACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCA ::;:=;=99=====;;====;==========<=== MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:1:134:379:893 147 chr1 1095 99 35M = 927 -203 CGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAA 7137::;<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:8:256:404:584 147 chr1 1096 99 35M = 928 -203 ACTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAA &&326+23<3<<<+:<</<<8<<<:7:<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:4:317:378:535 163 chr1 1096 99 35M = 1258 197 GCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAA <<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<;<<;<8<;:7:1( MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:4:277:482:316 83 chr1 1098 99 35M = 894 -239 TGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATT 9998;<<<<<;;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:3:273:901:459 147 chr1 1098 99 35M = 938 -195 TGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATT 4;+/+7,;<8+&<;;82;;<8<8<2<;<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:3:316:25:230 163 chr1 1098 99 35M = 1273 210 TGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<);2;; MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:3:24:195:604 83 chr1 1098 99 35M = 923 -210 TGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATT ;6<02;<<<<59<<;<;<<<<9<3<<<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:4:42:923:169 83 chr1 1099 99 35M = 925 -209 TTCCTATGTACTTATCATGAATCTATCCCAAATTC &;972<;&<9<,;;;<<<;<&99<<;<;;3<<3<< MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:2 UQ:i:10 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_45:6:59:1548:1096 163 chr1 1099 99 35M = 1297 233 GTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTC ;.;;;;;;;;6;;;;;;;;;;;;;;;73;;77777 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:136:389:320 147 chr1 1100 99 35M = 930 -205 TCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCC .5:,666<)<8<:<<:66<<<<<<<<<<5<<7<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:6:122:342:296 99 chr1 1100 99 35M = 1256 191 TCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<*<<<<9< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:2:259:467:737 83 chr1 1102 99 36M = 923 -215 CTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAA 8<<<<<<<:<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:4:71:832:743 163 chr1 1102 99 35M = 1290 223 CTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<*<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:105:521:563 163 chr1 1103 72 35M = 1267 199 TATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAA ;<)<9995<9<<59<7<<<<7<7<35,0,544<3( MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:6:201:195:757 163 chr1 1103 99 35M = 1298 230 TATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAA <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;;;;8 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:7:6:585:132 163 chr1 1105 23 36M = 1276 207 TGTACTTATCATGTTTCTTTCCTAATTTTTCAATTA 6666166&6)+61))646+6&)&%&-44))1'144' MF:i:130 Aq:i:23 NM:i:7 UQ:i:59 H0:i:0 H1:i:0
-EAS1_105:2:179:532:82 99 chr1 1105 99 35M = 1285 215 TGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<;<;<<<<:<8<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:6:11:646:628 147 chr1 1106 99 36M = 930 -212 GTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTAC <<<3<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<6< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:6:93:334:858 147 chr1 1106 99 35M = 932 -209 GTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTA ;<;+;;<<;<<<<<;<<<<;;8<<<<8<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:8:26:785:882 83 chr1 1107 99 35M = 926 -216 TACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTAC <<&5&<<<<5.;5<'<<;.76<<<<<7<7<<<<<< MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:4:54:989:654 99 chr1 1108 99 35M = 1296 223 ACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACG <<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<9<<<<<1<<<88; MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_4:5:202:326:680 163 chr1 1108 78 35M = 1268 195 ACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCTCAATTACG <<<<<<<4<<<*<<<*<<<7..:7<3*:7.7<+.; MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1 UQ:i:9 H0:i:0 H1:i:1
-B7_597:3:53:616:842 163 chr1 1109 99 35M = 1288 214 CTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCACTTACGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;07<<<<<-&<<-<4; MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:209:159:130 147 chr1 1109 99 35M = 934 -210 CTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGT ;:6<:<8::;<<<;<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:6:75:917:886 83 chr1 1110 99 35M = 951 -194 TTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTC <<<<8<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:6:286:753:854 163 chr1 1110 99 35M = 1288 213 TTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<<<<<9999<;<<9; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:6:290:146:36 99 chr1 1110 99 35M = 1280 205 TTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<;;<;;< MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:6:93:1475:542 163 chr1 1110 99 35M = 1254 179 TTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTC ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;9;;;9;;;77777 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:1:77:251:446 83 chr1 1110 99 35M = 939 -206 TTATCATGACTCTATCCCAAATGCCCAATTACGTC <<24,:8<<<:1<<<:35<:<:,<<<<<<:5:<<< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:11 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_105:3:176:431:647 163 chr1 1112 99 35M = 1285 208 ATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCT <<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<<<<<6<<<<9<<6< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:1:111:796:737 147 chr1 1112 99 35M = 936 -211 ATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCT <3<<<<<<<<<<<7<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:5:228:189:826 147 chr1 1112 99 35M = 914 -233 ATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCT :74=:.==1========================== MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:1:35:631:594 163 chr1 1112 99 35M = 1271 194 ATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:1:29:529:379 83 chr1 1117 99 35M = 926 -226 GACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTT ;<<<:<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:7:74:596:137 99 chr1 1119 91 35M = 1294 210 CTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCT <<<<<<<<<</4<<<<<<*<:6<<<<<<<<;/3<< MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:6:92:1807:1185 147 chr1 1119 99 35M = 940 -214 CTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCT <<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<><<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:3:57:735:151 99 chr1 1121 94 35M = 1314 228 CTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTC <<<<<<<<8<<8<:<<*<:<<<4<<<;,<<<<:<: MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:8:142:858:903 147 chr1 1121 99 35M = 943 -213 CTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTC <<<<<;<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:7:247:522:670 83 chr1 1121 99 35M = 960 -196 CTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTC ;;;9;:<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:3:75:732:442 99 chr1 1121 99 40M = 1293 212 CTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGG <<<<<;<<<<<9<<<;<<;<<<5<<;8<<<<<<<<;:9%% MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:7:183:645:699 99 chr1 1122 86 35M = 1281 194 TATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCT <<9<9<<<<<<<<<;<<;<<*175;173<;;;<-/ MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:6:175:437:950 163 chr1 1126 99 35M = 1298 207 CCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:59 MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:3:93:1002:845 83 chr1 1129 99 35M = 954 -210 AATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAA <<::;;;<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:6:50:542:881 163 chr1 1132 99 35M = 1324 227 TCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGTAAGAA <<<<<4<09<<9<<2<<<<<<<<<<<2/.&2<%<7 MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:3:118:851:285 83 chr1 1133 99 35M = 953 -215 CCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAAC 3+7<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:1:67:191:668 147 chr1 1134 99 35M = 995 -174 CCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACA <<<<<7<<7<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:7:166:203:416 83 chr1 1136 99 35M = 963 -208 AATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGC <<<<<<<<::<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:2:15:1497:1530 99 chr1 1136 99 35M = 1314 213 AATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGC 0<;;;9;;86<;;;<<&<<.<<;)3;7;654-471 MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:8:206:563:262 83 chr1 1137 99 35M = 971 -201 ATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCT <<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7 MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:4:40:352:151 99 chr1 1137 99 35M = 1327 225 ATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCT <<<<<<<<<<<<<<<;<<9<<<<:<<<<;<99<3< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:7:67:302:762 99 chr1 1138 99 36M = 1313 211 TTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;65;<-<;<:8<<<3 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:5:84:927:843 147 chr1 1138 99 35M = 938 -235 TTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTT 588;<:<<<<<<<6<<<<;<<<:/<<3<:;<*<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:5:147:479:41 163 chr1 1139 99 35M = 1322 218 TACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::6<<;<<<;;9;;6 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:3:329:177:267 83 chr1 1139 99 35M = 962 -212 TACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:7:72:916:763 163 chr1 1142 99 35M = 1340 233 GTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGT </:8<8)<<<<:<<<<<;.89<:67<.;<<7+336 MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:6:124:128:489 99 chr1 1142 99 35M = 1348 241 GTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGT <<<<<<<<<<<<<<<<<6:6<<-4<::;;<<:48< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:3:39:59:738 83 chr1 1142 99 35M = 965 -212 GTCCTATGTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGT ;.;4;<;3<<9<<9<&<<9<<<<<;<9<;<<;9<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:18 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_99:6:63:48:631 83 chr1 1143 99 35M = 957 -221 TCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTA ;*:;;<2<<2779;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:1:274:176:479 147 chr1 1144 99 35M = 976 -203 CCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTAT 7)<<7<626<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:2:72:1809:1398 147 chr1 1145 99 35M = 958 -222 CTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATC ;:;;:<7:7<:<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:2:235:805:373 83 chr1 1146 99 35M = 983 -198 TATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCA <<;<<<<<<9<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:7:269:944:220 83 chr1 1147 99 35M = 953 -229 ATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAA <;<;8<<;7<<<<<;<<-<<<<<<;<<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:7:174:597:66 163 chr1 1148 99 35M = 1307 194 TCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;6;< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:5:229:717:121 147 chr1 1150 99 35M = 995 -190 TTCTTCTGAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTT 6;-;7<<(<<<<<8<18<7<<<<<<<<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:7 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_53:1:23:403:981 147 chr1 1151 99 35M = 985 -201 TCTTCATAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTG (;3+<&3<</7<<<<<<;<<<<<<<<<<<<</<2< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_32:7:168:117:441 147 chr1 1151 99 35M = 990 -196 TCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTG ;;;;3;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:6:52:1455:1212 99 chr1 1153 99 40M = 1304 191 TTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCT <9<<<99<;<<9<;<-<<<6<<75;;<*%<5<3+.8:*5; MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:7:37:400:627 83 chr1 1154 99 35M = 961 -228 TCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTG 474*;<<9<;<<<;<<:<<<<<<;<<<<<<;<<;< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:5:11:868:62 147 chr1 1154 99 36M = 983 -207 TCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGT ;;77;;7<<<<<<<<7<<<;<7<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:4:209:92:210 83 chr1 1156 99 35M = 965 -226 TTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTT ;9;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:2:128:394:455 163 chr1 1156 99 35M = 1313 192 TTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTT ======6==========;===9==;5===;==;== MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:1:316:949:122 99 chr1 1156 99 35M = 1321 200 TTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<0<:<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:60:1020:1259 147 chr1 1157 99 35M = 996 -196 TAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:4:193:38:987 83 chr1 1158 99 35M = 964 -229 AGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTTGTGTTCT <<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_93:5:292:122:666 147 chr1 1159 99 35M = 985 -209 GGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTG <;<;;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:2:280:512:316 83 chr1 1159 99 35M = 984 -210 GGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTG ;9===;======;7==;;======;=====;==== MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:207:926:427 83 chr1 1159 99 35M = 973 -221 GGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTG ;;7<<;4<<<2<<;<<<<<<<<<<7<;<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:3:239:796:221 83 chr1 1160 99 35M = 992 -203 GGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGT ;;<<;<<;<<<+:<<<4<4<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:7:142:457:584 147 chr1 1160 99 35M = 999 -196 GGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGT 8::<:<<9<<.<:<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:7:190:481:295 83 chr1 1161 99 35M = 990 -206 GAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTG ;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:7:86:308:648 147 chr1 1161 99 35M = 970 -226 GAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTG <7<<<;<<<<+;<<<2<5<<<77;<<2<;;<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:3:182:23:585 99 chr1 1163 99 35M = 1336 208 AGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:4:216:650:516 99 chr1 1164 99 36M = 1326 198 GAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:4:15:805:420 83 chr1 1164 35 35M = 998 -201 GAACAGTTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTTTGTAA <64<59&996<(64<)7).68<0<0<<7741<1:< MF:i:18 Aq:i:35 NM:i:2 UQ:i:24 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_65:6:82:822:767 147 chr1 1165 99 35M = 972 -228 AACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAA <<9<<<<<<<<<<;;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:33:1566:588 147 chr1 1166 76 35M = 985 -216 ACAGCTTAGGCATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAG -6246;;97;77;;97;;;;;;9;7;79;)&;37; MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1 UQ:i:22 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_93:1:20:635:509 163 chr1 1167 99 35M = 1333 201 CAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGT <<<<<<<<<;<<<<;<<<;<;;;<<<;<<<<<<(8 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:7:144:28:475 147 chr1 1167 99 35M = 974 -228 CAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGT ;;;9;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:4:36:1402:1709 163 chr1 1168 99 35M = 1326 193 AGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTC <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<:9<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:8:34:956:1309 147 chr1 1168 99 35M = 994 -209 AGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTC 9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:7:157:784:936 163 chr1 1169 99 35M = 1356 222 GCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCT <<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<;<<<<814<4< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:2:152:860:286 83 chr1 1171 99 35M = 1004 -202 TTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCA 2;5;8<<;5<<<;<2<8<<<<<<;8<;<<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:7:157:786:424 147 chr1 1171 99 36M = 981 -226 TTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAG ;<;2;;<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:1:33:1407:94 163 chr1 1172 99 35M = 1360 223 TAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAG ;;;;;;;6:;;:::7;:;;;;:::;;;;:;47771 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:3:302:288:657 147 chr1 1173 99 35M = 1013 -195 AGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGG <:5<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:233:97:262 147 chr1 1175 99 35M = 1021 -189 GTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGA --;;7<;<;;:;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:7:67:692:110 147 chr1 1175 99 35M = 1009 -201 GTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGA ;;<<8<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:2:68:692:347 163 chr1 1176 99 36M = 1351 211 TATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCATGGAGC <<<<<<<<<+6<;<<<<3<:<<<<6<8<<<&*/;*0 MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:3:309:303:278 83 chr1 1178 99 35M = 996 -217 TCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCC <:<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:4:21:132:1423 147 chr1 1178 99 35M = 1012 -201 TCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCC :<<<<<6<<;<<;<5<;<<<<<<;<6<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:7:63:854:610 83 chr1 1180 99 35M = 1005 -210 AATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGT :.5;2<:88<<72:<<;<<7<8;<;/<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:5:182:313:319 147 chr1 1180 99 35M = 1016 -199 AATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGT </<;185;8<;;87<;8<<<<8<;83<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:3:62:603:1552 83 chr1 1180 99 35M = 1019 -196 AATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGT 8::;:<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:6:145:144:796 99 chr1 1181 99 35M = 1372 226 ATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTC <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<4;4;<;/ MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:3:41:474:283 147 chr1 1182 99 35M = 1018 -199 TTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCC 6/;;;88;;<:;48<<<<<;<;<<<<<<<<<<;<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:2:329:458:365 99 chr1 1186 99 35M = 1364 213 GTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGT ==========================9======== MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:1:159:222:274 147 chr1 1189 99 35M = 1019 -205 GTCTGGGGAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCT ''7*<&<'<<<<.<2<<<<<<<<<<+<<<8<8<<; MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:3 UQ:i:17 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_32:6:88:162:587 99 chr1 1189 99 35M = 1372 218 TTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCT <;<<<<<<<<<;<5<;<;<<7<++<<2&*:322+7 MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:3:148:340:479 99 chr1 1190 99 35M = 1364 209 TCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTC <<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:4:12:276:1797 147 chr1 1190 99 35M = 1006 -219 TCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTC )9<02)<<<<<<<<<<<<<1<<<<&<<<<9<<<<< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:6:190:42:671 83 chr1 1192 99 36M = 1008 -220 TGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCA <<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:4:321:271:138 99 chr1 1193 99 35M = 1394 236 GTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;9<<;<<;;<88;& MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:5:154:669:853 163 chr1 1193 99 35M = 1371 213 GTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCA ============<===.====<:=<9=<<<9;:;2 MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:7:287:258:321 147 chr1 1194 99 35M = 1030 -199 TGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCAT :.<9<)<;<9<.<<:<:+5:<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:3:61:183:767 147 chr1 1195 99 35M = 1010 -220 GTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATC 6&.;;<3<363<<<<<<<<8<<<6<<<<3<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:4:29:794:282 83 chr1 1196 99 36M = 1025 -207 TAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTG 7<<<<45::-<<<<<;<<-;<<;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:3:313:827:992 99 chr1 1197 99 35M = 1379 217 AAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTG <<<<6<<<<:<<<<<66<<<:33:<<<80<;6<8+ MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:3:196:11:27 83 chr1 1198 65 36M = 1035 -199 AAGACCCAGTTAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGC 96&6<'<7:!!<,:;+7<<6:<<<<<<<<<7<7;:< MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:4 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:0
-EAS139_19:3:87:133:930 83 chr1 1198 99 40M = 1044 -194 CAGTCTCAGGGCGCCGTCCGTTTCCTCCCATCTGGCCTCG )8&)907)-;9&,<<9)<;<<0<;<<99<<<<<<;<<9<< MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:3 UQ:i:28 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_45:7:97:1584:777 147 chr1 1200 99 35M = 1013 -222 GTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCC 66746,9::9;;;;:;;;;;;;;;;;;;;;:;;;; MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:6:127:153:861 99 chr1 1202 99 35M = 1374 207 CTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<=<*<<<24;;:: MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:6:157:42:763 83 chr1 1203 99 35M = 1040 -198 TCTGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCG 4++;((2(5;24<./<:<<<<<<<<;<<88<<<<9 MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:4:91:267:655 99 chr1 1204 99 35M = 1365 196 CAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:;;7<9477<74; MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:3:39:966:551 147 chr1 1205 99 35M = 1026 -214 AGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTC 8;;;;;<<6'<<<+8<<<1<<<<4<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:5:61:38:1182 163 chr1 1205 99 35M = 1388 218 AGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:1:47:352:1492 99 chr1 1205 99 40M = 1385 220 AGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGCCCACTA :<<<::<24<04-&<;<<2<<<&<60)&<5<<6*8:)9+* MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:3 UQ:i:28 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:8:74:770:1712 83 chr1 1208 99 35M = 1052 -191 GAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCAC 3.&::6<<<9<6:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:3:279:763:945 147 chr1 1210 99 36M = 1048 -198 GCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACT +9:-+<:1-44<<':<;<+<-<<<;:<<;;<<<<<0 MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:4:306:388:342 163 chr1 1211 99 35M = 1398 222 CCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACT ================5====:=====;==1=4== MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:5:180:905:36 147 chr1 1212 99 35M = 1033 -214 CCTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTG 6%%<;<662<<*;<<<8<<:<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:2:19:752:816 99 chr1 1212 99 35M = 1394 217 CGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<7;<;<<767277;6 MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:3:305:565:952 147 chr1 1213 99 36M = 1030 -219 GTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGT 5(<1<147<81<*8--8<<<7<91<<<;+<+<<<<< MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:1:44:1466:425 83 chr1 1213 99 35M = 1044 -204 GTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGG 6-<<9<<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:4:68:64:783 163 chr1 1214 99 35M = 1402 223 TCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGT <<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<;<<<9:<<:9 MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:7:64:37:257 163 chr1 1215 99 35M = 1389 209 CCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTT ================<=====;===8;4====== MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:2:20:413:1334 99 chr1 1215 99 35M = 1370 190 CCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTT 7<<;<<<.;<;67;7;;;:;;3;<59+...77677 MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:8:179:549:753 147 chr1 1218 99 35M = 1056 -197 TGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTC :77<</<<<::<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:1:16:823:343 99 chr1 1223 99 35M = 1403 215 TCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAA ================================4== MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:7:266:556:252 99 chr1 1224 99 35M = 1392 203 CCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<4;;<;;;<7;; MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:4:278:524:521 83 chr1 1224 99 35M = 1025 -234 CCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAA 7777,<;<<7<<<<;;<<;;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:5:72:1426:1883 99 chr1 1226 99 35M = 1405 214 CATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:3:82:998:566 83 chr1 1227 99 35M = 1050 -212 ATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCT <9<9<<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:6:29:575:453 83 chr1 1228 99 36M = 1056 -208 TCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTG ;<<<;;<:<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:7:222:538:267 147 chr1 1228 99 35M = 1074 -189 TCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTT 52/8-<<7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:1:138:186:274 147 chr1 1231 99 35M = 1075 -191 GGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGG <;<<<<<6;<<<<<3<<36;3;<9<<<<<<3;<<< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:3:137:895:681 99 chr1 1232 99 35M = 1418 221 GCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<-8<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:1:71:636:533 99 chr1 1232 99 35M = 1398 201 GCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<5<<<-847 MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:3:45:294:380 83 chr1 1233 80 36M = 1074 -195 CCTCGTCCACACTGGTTCGCTTGAAAGCTTGGGCTG ;<+<7<<<<;7<,<7<<<+/7;<<;<<;7<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:0 H1:i:1
-EAS51_66:8:9:80:353 83 chr1 1233 99 35M = 1067 -201 CCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCT ;;5;:8<:<:;:;<<<<;<:<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:1:73:302:1574 99 chr1 1233 99 35M = 1429 231 CCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCT <<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<+:;<<;:8;<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:5:131:779:345 163 chr1 1237 99 35M = 1399 197 GTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAA ============================9====;= MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:8:159:71:155 99 chr1 1237 99 35M = 1428 226 GTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAA =========;=<======;=:=3;==;=6<==;=; MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:3:55:340:837 83 chr1 1238 99 35M = 1069 -204 TCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAAT 61378<::<<<5:<;;:<<<<<<<<<<<<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:4:91:521:517 147 chr1 1239 99 35M = 1061 -213 CCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATG 8;8<4=:===7===9=============<====== MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:1:47:303:887 83 chr1 1240 96 35M = 1052 -223 CACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGA <;<6<;<;<8<<<8<<<<;<<<.<<<<<<<8<8;< MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:4:74:570:695 163 chr1 1240 99 35M = 1436 231 CACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGA =========================7====;8<8; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:3:268:523:511 147 chr1 1241 99 35M = 1081 -195 ACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGAT 8<7<99<<<<<<<<<:<<<<<<4<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:3:319:174:811 147 chr1 1242 99 35M = 1044 -233 CACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATG ;7;3<<3.<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<0< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:4:28:315:310 83 chr1 1242 99 35M = 1085 -192 AAACTGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATG +%,768<<:<:<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:4 UQ:i:70 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:1:328:614:638 99 chr1 1243 99 35M = 1428 220 ACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4/;<<9<<<<7<<*: MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:8:63:930:152 163 chr1 1243 99 35M = 1410 202 ACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATTC <<<<;<<<<<<<7<<;::<<)726;)<99<)&;&+ MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:1:219:294:861 83 chr1 1244 99 35M = 1073 -206 CTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCC ;,;<;<<<;&<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:6:42:920:522 83 chr1 1244 99 35M = 1067 -212 CTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCC ;;;;;99<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:7:87:89:696 99 chr1 1245 99 36M = 1419 210 TGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:;<<<;<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:7:166:979:531 163 chr1 1245 99 35M = 1410 200 TGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCC <<</<<<<<<<<<9<<9<<;<7<<<<9<<<9<,)6 MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:2:40:918:950 83 chr1 1247 99 35M = 1071 -211 GTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCT =0=&&33======;=====.=============== MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:1:131:946:353 83 chr1 1249 99 35M = 1087 -197 TCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTG <<:<<66<<<6<<4<<<:8<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:6:224:932:942 147 chr1 1250 99 35M = 1082 -203 CTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGG <;<<;;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:5:318:177:383 83 chr1 1251 99 35M = 1056 -230 TCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGC 5:9;7;777<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:4:188:460:1000 147 chr1 1251 99 35M = 1080 -206 TCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGC +;+077<7;<57<;;8<<<<<<<<<<8<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:1:12:1296:358 147 chr1 1252 96 35M = 1082 -205 CTTGAAAGCTTGGTCTGTAATGATGCCCCTTGGCC -770074;;6;&42;:2;;;:;;;;:;;/:;;;;: MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1 UQ:i:17 H0:i:0 H1:i:1
-EAS188_4:5:166:776:590 83 chr1 1252 99 35M = 1075 -212 CTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCC <;:;<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:6:54:263:585 147 chr1 1254 99 36M = 1081 -209 TGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATC 1:::6<<<<;;;<4<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:6:93:1475:542 83 chr1 1254 99 35M = 1110 -179 TGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCAT 98987:9:<:;:;;;;;<<;<;<;;;;<<<;;;<< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:6:122:342:296 147 chr1 1256 99 35M = 1100 -191 AAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCA <:;:<<<;<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:6:234:787:12 83 chr1 1257 97 35M = 1092 -200 AAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCAC ;;.<;;994<;9<<;;;<<<<<<<7<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:4:317:378:535 83 chr1 1258 99 35M = 1096 -197 AGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACC ;7;':<77<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:5:160:434:853 83 chr1 1259 99 35M = 1072 -222 GCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCC ;;*4;<;<<<;<<<<<<<8<<<;<<<<<<<<8<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:2:18:1498:1475 163 chr1 1260 99 35M = 1427 202 CTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCG <<<<<7<<<<<<+<<-3<<3<:<2<1<<:<<<<<+ MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:2:104:744:280 99 chr1 1262 64 36M = 1421 195 TGGGCTGTAATGATGCCCCTTGTCCATCACCCGGTC <<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<:4<<4<<0<;80+;: MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:2 UQ:i:34 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_95:4:66:179:118 83 chr1 1262 99 35M = 1084 -213 TGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGT <<99<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<:<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:1:277:194:143 99 chr1 1262 99 35M = 1444 217 TGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGT <<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<9;<<<8</<<6<: MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1 UQ:i:21 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:2:59:882:980 83 chr1 1263 99 35M = 1071 -227 GGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTC 7339%<6<<<<<;<<9<<8<<<<;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS220_1:4:14:1665:1772 83 chr1 1263 84 35M = 1073 -225 GGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTC <&7<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_57:2:259:42:969 163 chr1 1265 99 35M = 1426 196 GCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCC <<<<<;<<;<<3<<<;9<36<<29;<<;;;</;<2 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1 UQ:i:26 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:4:4:1732:88 147 chr1 1265 99 35M = 1087 -213 GCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCC :<4<:<<:<::<<<<<::<<<<<:<:<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_105:2:110:584:649 147 chr1 1266 99 35M = 1084 -217 CTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCT ++:4686<<68<;<;<;<<<:<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_59:5:113:694:725 83 chr1 1266 99 35M = 1088 -213 CTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCT ;::<<:<:<<<<<<<<<<:<:<<<<<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS221_1:8:58:369:244 163 chr1 1266 99 35M = 1436 205 CTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:105:521:563 83 chr1 1267 10 35M = 1103 -199 TGTAATGCTGCCCCTTGGCCATCCCCCGGTCCCTG /8)-8/6(98<967<3<<979<<1<<<7<<<<7<< MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:3 UQ:i:45 H0:i:0 H1:i:0
-EAS188_4:5:202:326:680 83 chr1 1268 78 35M = 1108 -195 GTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCTGC +33<81<:*<;<;;30;<<<;<<<8<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS192_3:6:216:292:528 99 chr1 1269 99 35M = 1438 204 TAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCC <;<;<<<<<<<;<<<<<<<<;;;;:;;:<%<;1;: MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:2:67:1864:477 163 chr1 1270 99 35M = 1465 230 AATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:1:35:631:594 83 chr1 1271 99 35M = 1112 -194 ATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCTGCCCC <<<<4<<<<<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS112_34:8:103:812:255 99 chr1 1272 99 35M = 1461 224 TGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCC <<<<<<<<<<<<<<<9<<;<<<39;;<;32:7;7+ MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1 UQ:i:12 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:4:259:869:641 99 chr1 1272 99 35M = 1435 198 TGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<,;<:<<<<<<<<<1 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:3:316:25:230 83 chr1 1273 99 35M = 1098 -210 GATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCTGCCCCAT 8;8;<<;<;;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS221_1:6:38:1071:155 99 chr1 1274 99 35M = 1465 226 ATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCATC <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<8<<<:<<:;;8:; MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:7:6:585:132 83 chr1 1276 23 36M = 1105 -207 GCCCCTTGACCACCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCT :<473$'<+5;7*+<7<&<37<7<<<<7;;7<<:<7 MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:2 UQ:i:19 H0:i:0 H1:i:0
-B7_595:6:47:720:789 99 chr1 1278 90 35M = 1455 212 CCCTTGGCCATCACCCGGTCCCGGCCCCTTCTCTT <<72<<<<<<<<;;<7;,0<2;*7<2;<*;;<<64 MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:3 UQ:i:44 H0:i:0 H1:i:0
-EAS192_3:6:185:868:496 163 chr1 1278 99 35M = 1442 199 CCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTT <<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<9<<;<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:6:290:146:36 147 chr1 1280 99 35M = 1110 -205 CTTTCCCATCCCCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGT 7;%%%<8-4<(<<<7<<<:<:<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:4 UQ:i:37 H0:i:0 H1:i:0
-B7_593:5:267:71:603 99 chr1 1281 99 36M = 1446 201 TTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<9; MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:7:183:645:699 147 chr1 1281 86 35M = 1122 -194 GTGGCCCTCCCCCATTCCCTGCCCCATCTCTTGTA &)))2-&420<<<'--<6:6-<7<<<+:7<65<<< MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:4 UQ:i:37 H0:i:0 H1:i:0
-EAS1_105:2:179:532:82 147 chr1 1285 99 35M = 1105 -215 CCATCACCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCT <:96<6<<<<89<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_105:3:176:431:647 83 chr1 1285 99 35M = 1112 -208 CCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCT <(9(<<<7;<<7<<<<<<<7<<<<<<7<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:2:258:266:101 83 chr1 1285 99 35M = 1094 -226 CCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCT %==/7&8=======:===6================ MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:6:179:735:569 163 chr1 1286 99 35M = 1461 210 CATCACCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<<<<<<<4/<;<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS188_7:3:200:712:439 163 chr1 1286 99 35M = 1435 184 CGTCACCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTC <7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:2 UQ:i:49 H0:i:0 H1:i:0
-EAS1_103:5:319:165:698 99 chr1 1287 99 35M = 1485 233 ATCACCCAGTCCCTGCCCCATATCTTGTAATCTCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<9<<<<<<<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:24 H0:i:0 H1:i:1
-B7_597:3:53:616:842 83 chr1 1288 99 35M = 1109 -214 TCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTC ;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:6:286:753:854 83 chr1 1288 99 35M = 1110 -213 TCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTC ;<2<<<,57:<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:14:1256:204 99 chr1 1288 99 35M = 1467 214 TCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTC <<<<<;;;;;;<;;;;;;;<;<;;;;<:-;79697 MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:5:289:132:526 99 chr1 1289 99 36M = 1472 219 CACCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS218_1:4:71:832:743 83 chr1 1290 99 35M = 1102 -223 ACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:3:102:511:946 99 chr1 1291 26 35M = 1461 205 CCCAGTCCCTGCCCCATCTCGGGTAATCTCTCTCC <<9<<;<<<<;<<<<;<<7;%<5<<0<<<)<.<.+ MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:2 UQ:i:31 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_39:5:42:1223:1087 99 chr1 1293 99 35M = 1479 221 CAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTT <<<<<<<<<<<<<5<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:3:75:732:442 147 chr1 1293 99 40M = 1121 -212 CGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC 7,*&28<61:88<.7<:<<:6<1<85:<:1<5<&::<<&< MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:1 UQ:i:11 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:3:23:502:103 163 chr1 1294 99 35M = 1486 227 AGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTT <2<<<<<<<<<<.<<<<<<<:1&:<<<7<<<<<<: MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:7:74:596:137 147 chr1 1294 91 35M = 1119 -210 GGTCCCTGCCCCATCGCTTGTAATCTCTCGCCTTT +40778449779049'+*87489498949%89948 MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:3 UQ:i:32 H0:i:0 H1:i:0
-EAS51_66:8:36:688:722 99 chr1 1295 99 35M = 1469 209 GTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:8:60:182:718 163 chr1 1295 99 35M = 1485 225 GTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<;<;<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:4:54:989:654 147 chr1 1296 99 35M = 1108 -223 TCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTT ,<1<2<<<;9)9<<;<<;<<<4<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:2:9:203:653 163 chr1 1296 99 35M = 1488 227 TCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::<9<<<<<;;;< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:4:322:631:245 163 chr1 1297 99 36M = 1474 213 CCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC <<<<<<<<<<<<<<<<<0<<<<<<<<<<<<<<<<5; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:6:59:1548:1096 83 chr1 1297 99 35M = 1099 -233 CCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTG 88888;;88;;;;8;;9;;;<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:2:52:1779:1664 99 chr1 1297 99 35M = 1462 200 CCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<71<<<<<<<<<<<<<<% MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:8:218:173:667 99 chr1 1298 99 35M = 1448 185 CCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC <<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<.< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:6:175:437:950 83 chr1 1298 99 35M = 1126 -207 CCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC ;;5:;;9<<:<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:6:201:195:757 83 chr1 1298 99 35M = 1103 -230 CCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC :<':<:<<46<:<;:<;<;<<9<<<<<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_4:5:8:377:655 99 chr1 1299 99 35M = 1473 209 CTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:5:50:950:562 99 chr1 1301 99 35M = 1473 207 GCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGC <<<<<<<<<<<<<<<&<<8<<<<<<<5<:<+<:+; MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:5:153:543:671 99 chr1 1301 99 34M = 1465 199 GCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<<7 MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:2:33:1193:664 163 chr1 1301 99 40M = 1474 213 GCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTTCTGCATCCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<%:<'<9:::9 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:1:253:59:242 99 chr1 1302 99 35M = 1478 211 CCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<</<<9;< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:6:52:1455:1212 147 chr1 1304 99 40M = 1153 -191 CCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGT 6::4::;4%;9:<79)<:<;<<:4::7<<9<&+71<9;<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:316:176:543 99 chr1 1305 99 35M = 1469 199 CATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCC ====<=9===<<<=====9====<<=3==,96==9 MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:7:50:1339:1154 163 chr1 1305 99 35M = 1481 211 CATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCC ==========<<==============;==7<;<<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:3:169:292:652 99 chr1 1306 99 35M = 1510 239 ATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<-<<<<8< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:3:11:706:1030 99 chr1 1306 92 35M = 1469 198 ATCTCTTGTAATCTCTCTCATCTTTGCTGCATCCC <<<2<<2<<<<<<<<<<<<0<&<<<+<:2<4<<): MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:2 UQ:i:20 H0:i:0 H1:i:0
-EAS221_3:6:70:843:706 99 chr1 1306 99 35M = 1449 178 ATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<5<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:7:174:597:66 83 chr1 1307 99 35M = 1148 -194 TCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCT 9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:6:7:1547:1933 163 chr1 1308 99 35M = 1497 224 CTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<8<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:4:30:117:411 163 chr1 1309 99 36M = 1482 209 TCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<:<<<<<<<<<: MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:6:53:156:845 99 chr1 1311 99 35M = 1487 211 TTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCT <<<<<<8<<<.<<<<.6<<--<-<<<<<<<6<<<< MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:90:1403:1635 99 chr1 1311 99 35M = 1480 204 TTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCT <<;<;<<<<;<;<;;<<<<<9;<.;;<:;99.979 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:7:67:302:762 147 chr1 1313 99 36M = 1138 -211 GTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCC :8;88<;<<<;<<8<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_78:7:270:448:491 99 chr1 1313 99 35M = 1501 223 GTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<&<<.<<<<<<<:;;;<; MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:6:82:932:400 99 chr1 1313 97 34M = 1486 208 GTAATCTCTCTCCTCTTCGCTGCATCCCTGTCTT <<<<<<8<1<<<<8+<<&<<<8<<<<<<<+(,/8 MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:2 UQ:i:15 H0:i:0 H1:i:0
-EAS54_81:2:128:394:455 83 chr1 1313 99 35M = 1156 -192 GTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTC ;=;9.=5=;=9====;;================== MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:3:57:735:151 147 chr1 1314 94 35M = 1121 -228 TAAACTCTCACCTTATTGCTGCATCCCTGTCTTCC 07;+79:;<)<<9<+8<:<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:3 UQ:i:28 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_28:6:51:506:878 163 chr1 1314 99 36M = 1501 223 TAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCT <<<<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<0<<<<<:; MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:2:15:1497:1530 147 chr1 1314 99 35M = 1136 -213 TAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCC 77778:;;;:;;;;:9;:;;;;;;;;;9;:;;;;; MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:3:9:1595:1826 99 chr1 1316 99 35M = 1494 213 ATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:3:73:273:488 163 chr1 1318 99 35M = 1512 229 CTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTG <<<<<2<88<88<<<8<<1<<<<<<68<<<;<;<* MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:1:199:760:42 163 chr1 1318 24 35M = 1489 206 CTCTCTAATTTTTGCTGCTTCCATGTCTTACTCTG +2&2&2&22222220222&220-222-22-22-22 MF:i:130 Aq:i:24 NM:i:5 UQ:i:51 H0:i:0 H1:i:0
-EAS1_95:7:61:702:720 163 chr1 1320 99 35M = 1500 215 CTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTC ==============;=======&=========3:= MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:2:41:576:1016 163 chr1 1320 99 35M = 1503 218 CTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTC <<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<4<::< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:1:115:683:296 99 chr1 1320 99 35M = 1514 229 CTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTC <<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<6<<<<3<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:8:63:1265:820 99 chr1 1320 99 35M = 1480 195 CTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTC <<<<<<<<<<27<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<03< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:7:92:288:1354 163 chr1 1321 99 40M = 1480 199 TCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATT <<<<<<:<<<<<<<<<<<8<<:<<<<;;<8<<<8<:8+:: MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:1:316:949:122 147 chr1 1321 99 35M = 1156 -200 TCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCT 59899<<<<;;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:4:37:1626:862 163 chr1 1321 99 35M = 1489 203 TCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:5:147:479:41 83 chr1 1322 99 35M = 1139 -218 CTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTT ;:;:;<::<:<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:3:73:936:1509 163 chr1 1322 99 40M = 1502 220 CTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTTATTT <<<<<<<<<7<<7<<<<<<<;<<<<<<<<<:<:<;%8::: MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:6:50:542:881 83 chr1 1324 99 35M = 1132 -227 CCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGA +2<<<;<3;29<6<5;<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:6:71:85:629 163 chr1 1324 99 35M = 1484 195 CCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGA <<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<5<9<<+6 MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:6:191:948:257 163 chr1 1325 99 35M = 1493 203 CTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGAT :<<<<<<<<9<:<<<<<<:<<<<;<<<<8<<<<7< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:1:249:986:224 99 chr1 1325 99 35M = 1499 209 CTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGAT =========5======7878===98==7=9==.-= MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:5:6:1067:91 163 chr1 1325 99 35M = 1483 193 CTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<:8<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:4:216:650:516 147 chr1 1326 99 36M = 1164 -198 TTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT ;9;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:6:18:376:416 163 chr1 1326 99 35M = 1510 219 TTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGTTT <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<;:(<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1 UQ:i:7 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:5:209:778:588 163 chr1 1326 99 36M = 1514 224 TTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT <<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<;<8<8<<<<;7;;; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:4:36:1402:1709 83 chr1 1326 99 35M = 1168 -193 TTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATT ;;;:<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:4:40:352:151 147 chr1 1327 99 35M = 1137 -225 TTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT ;=;;5=:-=9=====;;================== MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:5:139:331:63 99 chr1 1327 99 35M = 1486 194 TTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT ====================<<============= MF:i:18 Aq:i:79 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:2:11:1274:1230 163 chr1 1327 99 35M = 1507 215 TTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;;;; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:5:36:678:316 99 chr1 1328 99 35M = 1500 207 TTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTA <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<,2<<<) MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:3:102:825:507 163 chr1 1330 99 35M = 1501 206 TGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;;< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:5:171:343:758 99 chr1 1331 99 36M = 1494 199 GCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<59<<<9;<<3 MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:6:85:1224:625 99 chr1 1331 99 35M = 1532 236 GCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTCCTT <<<<<<<<<;<<;<<7<<:<<7.<<<:&7<<.<;< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1 UQ:i:13 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:5:308:354:124 99 chr1 1331 99 35M = 1507 211 GCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:7:22:22:934 163 chr1 1332 99 35M = 1500 203 CTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTG <<<<<<<<<<<6<<<;<<<;84;<<48;<;6;<;) MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:4:71:707:568 163 chr1 1332 99 35M = 1518 221 CTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<;<;< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:7:123:610:472 99 chr1 1333 99 35M = 1504 206 TGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGT <<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<+:<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:1:20:635:509 83 chr1 1333 99 35M = 1167 -201 TGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGT 50<59<<9<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:1:92:213:217 99 chr1 1333 99 35M = 1515 217 TGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:3:47:471:858 163 chr1 1335 99 35M = 1487 187 CATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTG <<;<<<<<<<<9<<<4;;<<<<;<<<<<.<<4;<4 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:7:90:406:631 163 chr1 1335 99 35M = 1525 225 CATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTG <<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<:;<<<<;<<8;<8 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:3:81:1723:1820 99 chr1 1335 99 35M = 1524 224 CATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<: MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:3:182:23:585 147 chr1 1336 99 35M = 1163 -208 ATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGT 9:<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:8:150:508:757 163 chr1 1336 99 35M = 1483 182 ATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<8<<,< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:1:261:504:780 163 chr1 1337 99 35M = 1501 199 TCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<</2<<<9<<<5<<,<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:6:324:515:230 163 chr1 1339 99 35M = 1512 207 CCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGG <<;<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<8<<<4<<4<<34 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:7:72:916:763 83 chr1 1340 99 35M = 1142 -233 CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGT <;;:<<<<<<<;<<;;;<<<<<<<<<;;<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:3:194:168:684 99 chr1 1340 99 36M = 1512 208 CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<.<<6-<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_78:7:113:43:634 163 chr1 1340 99 35M = 1500 195 CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTTTT <<<<<<<<<<<<.<<<<<<<<<<<<</<<2;;%%; MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:2 UQ:i:8 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:5:16:434:204 163 chr1 1340 99 35M = 1522 216 CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGT =================;)===8===:==7;<+%; MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:7:246:205:734 73 chr1 1340 65 35M = 1340 0 CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGT <<<4<<6666<<6<:<<<3<<<:'<<:<<<<;6<+ MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:7:246:205:734 133 chr1 1340 0 * = 1340 0 CTCCAGGGAAGTTATCTCTCATCTAGANNNNNTTG <<<<<<:/<<<,6'</7;<-+9<<;<7!!!!!8<, MF:i:192
-EAS54_65:3:102:884:63 163 chr1 1341 99 35M = 1481 175 TGTCTTCCTCTGTCTTGATTTCCTTGTTGTTGGTT <<<<<<<<<<<<<<<<<3<<<%<<<9<<9<<7+;< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:0 H1:i:1
-EAS51_64:3:67:782:132 99 chr1 1343 99 35M = 1498 190 TCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;4<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:5:70:348:972 163 chr1 1343 99 35M = 1528 220 TCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTT <.<<3+.7<<7<<:78:<<7<:<7:<3<<7.:::< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:1:9:206:901 99 chr1 1344 99 35M = 1517 208 CTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<5<<%%:<<<7 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:4:21:443:404 99 chr1 1345 99 35M = 1529 219 TTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<;<<;+<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:1:148:286:316 163 chr1 1347 99 35M = 1531 219 CCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGT <<<<<<<<+<<7<<<<<<<6<<<6<142<<<6<2< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:6:77:48:860 99 chr1 1348 99 35M = 1521 208 CTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTTGTTTTCTGTT =========;===========9==*;5=;=;=,7= MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:9 H0:i:0 H1:i:1
-EAS51_64:6:124:128:489 147 chr1 1348 99 35M = 1142 -241 CTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTT ::55<<<8<<<6<<;<<<<<<<<7<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:6:213:54:878 137 chr1 1348 99 35M * 0 0 CTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTTTGTT <<<<<<<<<;<<<<<<<<:<<:<<++<<<<%<%<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:4:73:42:1038 163 chr1 1349 99 35M = 1513 199 TCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<.<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:3:320:505:814 99 chr1 1350 99 35M = 1515 200 CTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTTTTTC <<<<<<<<<<<<<<<<;<<8<<76<<<<;<&<<<7 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:2:68:692:347 83 chr1 1351 99 36M = 1176 -211 TGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTT 9<;;;;<<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:252:428:683 137 chr1 1351 99 35M * 0 0 TGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCT <<<<<<;<<<<<<<<7<<7<<&+<<<<:<&<<<4< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:73:182:444 99 chr1 1354 99 34M = 1533 214 CTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTT <<<<;;<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<:<<<<<7< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:2:63:267:545 163 chr1 1354 99 35M = 1524 205 CTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTG <<<<<<<<<<<<:<<<<<::<<<<<<.<<<;;;;5 MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:6:177:562:806 99 chr1 1356 99 35M = 1515 194 TGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTTTT <;<29<99<<;<<<9<20<9<<5;;<<<<<<<+.< MF:i:18 Aq:i:35 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:7:157:784:936 83 chr1 1356 99 35M = 1169 -222 TGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTT <:<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:1:209:345:87 163 chr1 1360 99 35M = 1513 188 TTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTTTTTGAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<-<<<6<<<+8< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1 UQ:i:21 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:1:33:1407:94 83 chr1 1360 99 35M = 1172 -223 TTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGAT 77477;4;;;;;44;;;;;;7;;;;;;;9;;;;;< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:8:2:434:715 163 chr1 1363 99 35M = 1527 199 CTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTT <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<0<<<68<<<+ MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:4:137:319:642 137 chr1 1363 99 35M * 0 0 CTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTTTTTGATTTT <<<<<<<<<27<<<<<<<<<<<<<<&;<<&3;;<% MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:2 UQ:i:9 H0:i:0 H1:i:1
-B7_610:3:148:340:479 147 chr1 1364 99 35M = 1190 -209 TTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGG <<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:2:329:458:365 147 chr1 1364 99 35M = 1186 -213 TTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGG ====:==9========>==7>==9>=7=>=>>=>> MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:4:91:267:655 147 chr1 1365 99 35M = 1204 -196 TGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGT ;,:;5:<6:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:2:91:856:504 99 chr1 1366 99 35M = 1520 189 GTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTT <<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<7<<<&;<<<&&<& MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:170:326:433 99 chr1 1367 99 35M = 1535 203 TTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGG =====<=9===:=<:==2=======2:===9==/5 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:6:132:717:233 99 chr1 1368 99 35M = 1529 196 TGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGA <<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<7<<<<&-<4<1 MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:1:14:420:712 99 chr1 1368 99 40M = 1525 197 TGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTTTTTGAAGACA <<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<-;<<<&,<&*8111:6 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:3 UQ:i:21 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:4:43:1047:1626 163 chr1 1369 99 35M = 1523 189 GTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<:<<<<:+;-4:( MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:2:20:413:1334 147 chr1 1370 99 35M = 1215 -190 TTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAG 88878777;:;:1:;9;;;6;;;6;9;;;;;296; MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:5:154:669:853 83 chr1 1371 99 35M = 1193 -213 TGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGA <::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:7:117:857:942 99 chr1 1372 99 35M = 1527 190 GGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:6<;;7;9<; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:6:145:144:796 147 chr1 1372 99 35M = 1181 -226 GGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGAC ;<<<;<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:6:88:162:587 147 chr1 1372 99 35M = 1189 -218 GGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGAC 386;;388-<8;<;68<<;;<;<6<<<8<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:73:108:1621 99 chr1 1373 99 35M = 1532 194 GTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACA <<<<<<<<71<<<<<<<<<+<<<<70:0<9<<61< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:6:127:153:861 147 chr1 1374 99 35M = 1202 -207 TTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACAT :;:6;9<<1;<<95<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:2:152:765:744 163 chr1 1374 99 35M = 1534 195 TTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<&<7293<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:3:313:827:992 147 chr1 1379 99 35M = 1197 -217 TGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACATAATCC '187:1'<75<.*<<:5<..<<*<<917<<7<<17 MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:3:7:268:263 121 chr1 1381 22 35M = 1381 0 TTGCGTTATTTGAGTTGGTGGAAGACATAATCCCA ',)*&2<$7+<<<'<-<7<<<<<<<7<<</4/;<< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:4 UQ:i:22 H0:i:0 H1:i:0
-EAS51_64:3:7:268:263 181 chr1 1381 0 * = 1381 0 TCGTACAGAAGTTTAATGGAGCCTTGGGACCTTAC !!66'&+/&'8+2''1+'611'&6&+/&+.&+1'& MF:i:192
-EAS139_19:1:47:352:1492 147 chr1 1385 99 40M = 1205 -220 TTTGTTTTGTATGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTA +7+/7+/%%1'6+3++1;:</<<5<)27<<9<)9<<9<7< MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:3 UQ:i:14 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:5:61:38:1182 83 chr1 1388 99 35M = 1205 -218 GTTTGATTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCC 9:;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:7:64:37:257 83 chr1 1389 99 35M = 1215 -209 TTTGATTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCT ;47<<47+9<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:7:266:556:252 147 chr1 1392 99 35M = 1224 -203 GATTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATG .8558<72<(<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:4:321:271:138 147 chr1 1394 99 35M = 1193 -236 TTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGA 261:5969==9=:=<==<================= MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:2:19:752:816 147 chr1 1394 99 35M = 1212 -217 TTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGA +<<+<--/<<<<4<2<<<<45<<<:<<<<<<+<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:4:306:388:342 83 chr1 1398 99 35M = 1211 -222 GGGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGG 9/<9;<<<;<;<<7<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1 UQ:i:14 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:1:71:636:533 147 chr1 1398 99 35M = 1232 -201 GTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGG ,51(<<8<:<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:5:131:779:345 83 chr1 1399 99 35M = 1237 -197 TGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGT <<7<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:4:68:64:783 83 chr1 1402 99 35M = 1214 -223 AAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGT <<9<8<6<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:1:16:823:343 147 chr1 1403 99 35M = 1223 -215 AGACATAACCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTT <<<:<<<;+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:0 H1:i:1
-EAS219_FC30151:5:72:1426:1883 147 chr1 1405 99 35M = 1226 -214 ACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTTGG ;9<;<;0<;<;<<<<;<<<;:<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:7:166:979:531 83 chr1 1410 99 35M = 1245 -200 ATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTTGGGAGAT 81<<<3<*<<:<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<:<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:8:63:930:152 83 chr1 1410 99 35M = 1243 -202 ATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTTGGGAGAT ;:4:8;:::;=:8;=;========;=:======== MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:3:137:895:681 147 chr1 1418 99 35M = 1232 -221 CTTCCTATGGAAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATG 4;5+6;<<<<<<<<<9;<4<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:7:87:89:696 147 chr1 1419 99 36M = 1245 -210 TTCCTATGGAAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGAT ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:2:104:744:280 147 chr1 1421 64 36M = 1262 -195 CATATGGAAAGGTTGTTGGGATTTTTTTAATGATTC '&+74*0<'/.47:8<<<<;<7''6/1<<<.<<68< MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:3 UQ:i:33 H0:i:0 H1:i:0
-EAS56_57:2:259:42:969 83 chr1 1426 99 35M = 1265 -196 GGAAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCA <<<6<<<<<<-<<<<<<;<<;<6<<<<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:2:18:1498:1475 83 chr1 1427 99 35M = 1260 -202 GAAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAA :<4<*7<<<<<<<:<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:1:328:614:638 147 chr1 1428 99 35M = 1243 -220 AAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAAT <<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:8:159:71:155 147 chr1 1428 99 35M = 1237 -226 AAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCGAT 5;;9<<:<;:<<<<7<<7;<3<<<:<<<;<<<<<; MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_39:1:73:302:1574 147 chr1 1429 99 35M = 1233 -231 AAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATG 7<88;;<;;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:3:200:712:439 83 chr1 1435 99 35M = 1286 -184 GTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAA <;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<7 MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:4:259:869:641 147 chr1 1435 99 35M = 1272 -198 GTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAA 99=:=9=99<=========<=<<============ MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:4:74:570:695 83 chr1 1436 99 35M = 1240 -231 TTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAAT .;:8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:58:369:244 83 chr1 1436 99 35M = 1266 -205 TTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:6:216:292:528 147 chr1 1438 99 35M = 1269 -204 GGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGT ;:;;8<<<<<<<<<<<<<:<<;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:6:185:868:496 83 chr1 1442 99 35M = 1278 -199 GATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTAT :;;<;;<<<<<<<<;4<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:1:277:194:143 147 chr1 1444 99 35M = 1262 -217 TTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTT ;<<;<<<;8;<0<7<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:5:267:71:603 147 chr1 1446 99 36M = 1281 -201 TTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTG 9;;<;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:8:218:173:667 147 chr1 1448 99 35M = 1298 -185 TAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTGT <<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:6:70:843:706 147 chr1 1449 99 35M = 1306 -178 AATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTGTC <<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:6:47:720:789 147 chr1 1455 90 35M = 1278 -212 TCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACA /)040<.878<<<<;8<;<9<9;<<<<<<<<<<93 MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:3:102:511:946 147 chr1 1461 26 35M = 1291 -205 ATGTAAAAGTGACTGTTATTGTCTTGACACCCAAC <%-4:6<:/&46;/*;<*84<0<'<&*<2<<<<<< MF:i:130 Aq:i:26 NM:i:5 UQ:i:78 H0:i:0 H1:i:0
-EAS112_34:8:103:812:255 147 chr1 1461 99 35M = 1272 -224 ATGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAAC 7:777:7<<::7<7<7<<:7<7<:<<<<<<<<<7< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:6:179:735:569 83 chr1 1461 99 35M = 1286 -210 ATGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAAC <5<3:<<<<5;8<<<55;<:</:<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:2:52:1779:1664 147 chr1 1462 99 35M = 1297 -200 TGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACT 6;;:;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:5:153:543:671 147 chr1 1465 99 35M = 1301 -199 TAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAAT ;;;;;=;==================;========= MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:6:38:1071:155 147 chr1 1465 99 35M = 1274 -226 TAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAAT <<62<<<<<<3<<<<</<<<<<<<%<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:2:67:1864:477 83 chr1 1465 99 35M = 1270 -230 TAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:14:1256:204 147 chr1 1467 99 35M = 1288 -214 AAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATAT 66777:;;37;;:;;0;:;;;;):;;:7;;;;;;; MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:316:176:543 147 chr1 1469 99 35M = 1305 -199 ATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTT <<)/3<<<&<*<<0<<8<<82</5<<<<<88<<<< MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:8:36:688:722 147 chr1 1469 99 35M = 1295 -209 ATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTT <;;<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:3:11:706:1030 147 chr1 1469 92 35M = 1306 -198 ATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTT +<5069+9<<<<+<;<<<<;<<77<7<<;<<;<<< MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:5:289:132:526 147 chr1 1472 99 36M = 1289 -219 TCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCT ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:5:50:950:562 147 chr1 1473 99 35M = 1301 -207 CTATTTTTGTCTTGACACCCTACTAATATTTGTCT <<3<<<8<;<<<<<<+<<8<&<<<<7<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS188_4:5:8:377:655 147 chr1 1473 99 35M = 1299 -209 CTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCT ;<8;;:<;<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:4:322:631:245 83 chr1 1474 99 36M = 1297 -213 TATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGA <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:2:33:1193:664 83 chr1 1474 99 40M = 1301 -213 TATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAA ;;;;;;<;;-9<<<:</+9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:1:253:59:242 147 chr1 1478 99 35M = 1302 -211 TTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCA <<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:5:42:1223:1087 147 chr1 1479 99 35M = 1293 -221 TTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAA ;:<<<:<7<<<;;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:90:1403:1635 147 chr1 1480 99 35M = 1311 -204 TGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAA 86878;;;8;788;;;;;;;;;;;;;8;5;;;;;; MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:7:92:288:1354 83 chr1 1480 99 40M = 1321 -199 TGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGT ::::;;;<<<<9;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:8:63:1265:820 147 chr1 1480 99 35M = 1320 -195 TGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAA <<<<<<3<<1<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<+< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:3:102:884:63 83 chr1 1481 99 35M = 1341 -175 GTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAA <;7;;<<8<;8;<<<8<<<<<<8<<<8;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:7:50:1339:1154 83 chr1 1481 99 35M = 1305 -211 GTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAA 7;7;8;<5<:86<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:4:30:117:411 83 chr1 1482 99 36M = 1309 -209 TCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACA ;88<<<<<:<7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:8:150:508:757 83 chr1 1483 99 35M = 1336 -182 CTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACA 6;;;<8<6;8<<8<<<<<;<<<<;<<<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:5:6:1067:91 83 chr1 1483 99 35M = 1325 -193 CTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACA 3<;<<:;9;<<7;;<;<<<;<<<;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:6:71:85:629 83 chr1 1484 99 35M = 1324 -195 TTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAG ,,1<1<7&%<9+:<<9<<9<<<<<<<<5<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:5:319:165:698 147 chr1 1485 99 35M = 1287 -233 TGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGT ;5;2;<:;<<:<<<<<<<<<;:;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:8:60:182:718 83 chr1 1485 99 35M = 1295 -225 TGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGT <<<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:6:82:932:400 147 chr1 1486 97 35M = 1313 -208 GACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTC <<;<<72<<7<<<<<<<<<<;<<<+7<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:3:23:502:103 83 chr1 1486 99 35M = 1294 -227 GACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTC 4:386:6<:::<:<:4:+<::4<<<6<<<<<<<66 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:5:139:331:63 147 chr1 1486 99 35M = 1327 -194 GACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTC 7===================:=:============ MF:i:18 Aq:i:79 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:6:53:156:845 147 chr1 1487 99 35M = 1311 -211 ACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCT 171(*00,0;;&;7=77=;5;;(;1:=5======= MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:3:47:471:858 83 chr1 1487 99 35M = 1335 -187 ACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCT /;9<<63<<<<3<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:2:9:203:653 83 chr1 1488 99 35M = 1296 -227 CACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTA 37))&<8<<<<<7<4<;<777<<:<<<<<<<<;<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:1:199:760:42 83 chr1 1489 24 35M = 1318 -206 ACCCAATTAATATTTTTCTTAGCAAAACAGTCTAG 58*5.<+<<<<,4<<**<90**9<<<<<<4<<<<< MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:3 UQ:i:34 H0:i:0 H1:i:0
-EAS218_1:4:37:1626:862 83 chr1 1489 99 35M = 1321 -203 ACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAG :663<<3<<<<<<<<<<:<<<<7<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:6:191:948:257 83 chr1 1493 99 35M = 1325 -203 AACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGA :;;;;<<<<<<5<5<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:5:171:343:758 147 chr1 1494 99 36M = 1331 -199 ACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGA :+;;<<<<<;<;:<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:3:9:1595:1826 147 chr1 1494 99 35M = 1316 -213 ACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAG ;76;;6:9<9<963;<<7<<<<<<<;<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:6:7:1547:1933 83 chr1 1497 99 35M = 1308 -224 AATATTTGACTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGA <<<<<<<<-<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:12 H0:i:0 H1:i:1
-EAS51_64:3:67:782:132 147 chr1 1498 99 35M = 1343 -190 ATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAG ;;<;;;<<;;<<<;<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:1:249:986:224 147 chr1 1499 99 35M = 1325 -209 TATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGA <<<3<;<;;<<;8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:7:61:702:720 83 chr1 1500 99 35M = 1320 -215 ATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAA <<<4<4+0;<<:<<<<<<<<-<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_78:7:113:43:634 83 chr1 1500 99 35M = 1340 -195 ATTTGTCTGAGAAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAA ;9;1;<5:<<<%<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_53:7:22:22:934 83 chr1 1500 99 35M = 1332 -203 ATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAA <+72::72<<60<<<<<<<96<<<<0<<<<1<<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:5:36:678:316 147 chr1 1500 99 35M = 1328 -207 ATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAA <<72.2,;;<)6<<<<:<<;;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:3:102:825:507 83 chr1 1501 99 35M = 1330 -206 TTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAAC <05<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:1:261:504:780 83 chr1 1501 99 35M = 1337 -199 TTTGTCTGAGAAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAAC 80;8(;0==8+====;==49=============== MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:0 H1:i:1
-EAS51_78:7:270:448:491 147 chr1 1501 99 35M = 1313 -223 TTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAAC 7;;;;+2;<<+<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:6:51:506:878 83 chr1 1501 99 36M = 1314 -223 TTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACT <970;49;<;+<<<:<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:3:73:936:1509 83 chr1 1502 99 40M = 1322 -220 TTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCT 99;66:<<;-<<<<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:2:41:576:1016 83 chr1 1503 99 35M = 1320 -218 TGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTT :<;<<<<<6<<<<;<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:7:123:610:472 147 chr1 1504 99 35M = 1333 -206 GTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTC :<::+<<9<<9<<<<=<<<<<=<<<<<<<<?<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:5:308:354:124 147 chr1 1507 99 35M = 1331 -211 TGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCT %+<)2<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:2:11:1274:1230 83 chr1 1507 99 35M = 1327 -215 TGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCT .<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<5<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:3:169:292:652 147 chr1 1510 99 35M = 1306 -239 GCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGA 79919-<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:6:18:376:416 83 chr1 1510 99 35M = 1326 -219 GCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGA 70<<<<<<<7<7<<<2<<<<<<<<<<8<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:3:194:168:684 147 chr1 1512 99 36M = 1340 -208 AAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGT ;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:3:73:273:488 83 chr1 1512 99 35M = 1318 -229 AAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGG </<<:<<9;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:6:324:515:230 83 chr1 1512 99 34M = 1339 -207 AAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAG 7<<1<<<7<+<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:1:209:345:87 83 chr1 1513 99 35M = 1360 -188 AAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGT <<;<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:4:73:42:1038 83 chr1 1513 99 35M = 1349 -199 AAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:5:209:778:588 83 chr1 1514 99 36M = 1326 -224 AACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCT ;8;98;;;<3<<<<<<<<<;<<;<<<<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:1:115:683:296 147 chr1 1514 99 35M = 1320 -229 AACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTC <<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:1:92:213:217 147 chr1 1515 99 35M = 1333 -217 ACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCT <<<<<:<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:6:177:562:806 147 chr1 1515 99 35M = 1356 -194 ACAGTGTAGATGAGAGAGACCTTCCCTGGAGGTCT )2<9;'/:<5<<<:<<:<:&5:&<8,<<+:<&<<< MF:i:18 Aq:i:35 NM:i:2 UQ:i:11 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_103:3:320:505:814 147 chr1 1515 99 35M = 1350 -200 ACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCT <2<;;5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:1:9:206:901 147 chr1 1517 99 35M = 1344 -208 AGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGA <<<<<<<<<<<<<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:4:71:707:568 83 chr1 1518 99 35M = 1332 -221 GTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGAT ;9;<;<<<<<;<<<<<;<<<:<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:2:91:856:504 147 chr1 1520 99 35M = 1366 -189 CTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGG :::<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:6:77:48:860 147 chr1 1521 99 35M = 1348 -208 TAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGC ;8;8;<9<9<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:5:16:434:204 83 chr1 1522 99 34M = 1340 -216 AGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGC <:7:<<<<<<<<<<<9<<<+<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:4:43:1047:1626 83 chr1 1523 99 35M = 1369 -189 GATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGT <<4<<<<<<<<<<<:<<<;<<<<<:<7<<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:3:81:1723:1820 147 chr1 1524 99 35M = 1335 -224 ATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTT ;6;;;<<<<<<<<<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:2:63:267:545 83 chr1 1524 99 35M = 1354 -205 ATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:7:90:406:631 83 chr1 1525 99 35M = 1335 -225 TGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTT <<<:<:<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:1:14:420:712 147 chr1 1525 99 40M = 1368 -197 TGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCC 1::::<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:8:2:434:715 83 chr1 1527 99 35M = 1363 -199 AGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCT <<<<<<<<<:;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:7:117:857:942 147 chr1 1527 99 35M = 1372 -190 AGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCT <<;<<<<<<<9<<<8<<<<<<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:5:70:348:972 83 chr1 1528 99 35M = 1343 -220 GAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTC <99<-7<<7<<<87<<<)<<<<<<8<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:6:132:717:233 147 chr1 1529 99 35M = 1368 -196 AGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGAGTTTCTCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS188_7:4:21:443:404 147 chr1 1529 99 35M = 1345 -219 AGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCC =9=9=9==:========================== MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:1:148:286:316 83 chr1 1531 99 35M = 1347 -219 AGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCT ;::::;9/:<9<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:6:85:1224:625 147 chr1 1532 99 35M = 1331 -236 GAACTCCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTC 17;;7&-;<;<;:<6<<:;<<<<<<<;<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:73:108:1621 147 chr1 1532 99 35M = 1373 -194 GAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTC <<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:73:182:444 147 chr1 1533 99 35M = 1354 -214 AACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTCG :1<4;;::<<;<<<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:2:152:765:744 83 chr1 1534 99 35M = 1374 -195 ACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTCGT 6<;6<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:170:326:433 147 chr1 1535 99 35M = 1367 -203 CTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTCGTC :44<<<<<<<<<<:6<<<<<<<:<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:8:4:841:340 73 chr2 1 99 36M * 0 0 TTCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAA <<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<;<;:<<<<<<<;; MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:4:142:943:582 73 chr2 1 99 35M * 0 0 TTCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTA <<<<<<;<<<<<<:<<;<<<<;<<<;<<<:;<<<5 MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:6:43:859:229 153 chr2 1 66 35M * 0 0 TTCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTA +37<=<.;<<7.;77<5<<0<<<;<<<27<<<<<< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:2:286:923:549 73 chr2 2 99 35M * 0 0 TCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:8:117:578:853 73 chr2 5 99 35M * 0 0 AATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAA <;<9<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<,<98;<;;&92 MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:7:289:472:86 137 chr2 6 99 35M * 0 0 ATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_4:5:302:997:951 73 chr2 6 69 35M * 0 0 ATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAA <<<<<<<<<<;<<:<<52<<:;;<6<<;<:<2:9/ MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:8:13:1729:1844 73 chr2 6 99 35M * 0 0 ATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAA <<<;;<;7<<<<4<<<<762;6<<<<<<<;6;618 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:2:43:239:977 137 chr2 7 99 36M * 0 0 TGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;7;<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:3:233:191:520 73 chr2 7 99 35M * 0 0 TGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<8<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:4:75:555:1591 137 chr2 7 99 35M * 0 0 TGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:2:43:656:1866 137 chr2 7 99 35M * 0 0 TGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;;:; MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:2:100:563:301 137 chr2 8 99 35M * 0 0 GAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;8;;; MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:1:126:526:276 137 chr2 8 84 35M * 0 0 GAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:3:161:366:544 137 chr2 11 99 35M * 0 0 CTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:3:326:652:890 73 chr2 12 99 35M * 0 0 TTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAA <<<<<<<<<<2<<<<<<<<<<<<<<+<8:<<9998 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:4:238:441:727 73 chr2 16 99 35M * 0 0 GTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<;;<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:8:64:507:478 137 chr2 17 99 35M * 0 0 TAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATAT <<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;;;<<<;<<8;<;< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:8:118:440:850 137 chr2 18 99 35M * 0 0 AATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATATA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<949<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:7:270:995:918 137 chr2 24 84 35M * 0 0 AAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAA <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<8<8<8<<<<:<;4;4 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:8:305:819:245 73 chr2 25 98 35M * 0 0 AAATTCATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAA 8<<<<8<;<<<<<;<8<<8<8<<<<8<<<899<<+ MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS114_26:7:13:172:720 73 chr2 26 99 35M * 0 0 AATTCATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAG ============:3<==:====<=9=3===;==83 MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS56_63:7:34:334:825 73 chr2 30 99 35M * 0 0 CATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3;<<<<6<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:32:1379:738 137 chr2 33 99 35M * 0 0 TTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAAC ;;;;;;;8;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;88888 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS139_19:5:70:318:1631 137 chr2 34 99 40M * 0 0 TAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGA <<<<<<;<<<<<<<<<<<<;9:<<<<<<<<<<<<<:::78 MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:5:285:241:560 163 chr2 37 99 35M = 200 198 GAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATA <<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<;<;;;<. MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:1:168:389:889 99 chr2 37 99 36M = 205 204 GAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;9;;<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:127:725:381 163 chr2 39 99 35M = 209 204 AATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;;;;;<<8: MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS1_93:5:66:372:343 163 chr2 40 99 35M = 228 223 ATTACAAAATATAGTTGAAAGATCTAACAATAGAC <<<<<<<<<<8<<<<<6<<<8&8<<<<<58<:<:: MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_65:6:67:800:450 99 chr2 41 99 35M = 221 215 TTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<< MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:3:90:1906:1528 163 chr2 41 99 35M = 222 216 TTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACT <<<<<<<<<<<<<<<:<<<:<<<<;<<<<<;:7:; MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:3:117:284:589 163 chr2 43 99 35M = 210 202 ACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAA ==================================0 MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:2:26:211:481 99 chr2 43 99 35M = 222 214 ACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<:<7<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:7:85:923:726 99 chr2 43 99 35M = 199 191 ACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAA <<<<<<<7<<<<<<<<<<<55<<<9<*<<<991<4 MF:i:18 Aq:i:44 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:6:107:395:312 163 chr2 44 99 35M = 224 215 CAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;<:<<<< MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-B7_597:7:5:753:806 163 chr2 45 99 35M = 197 187 AAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7:-<;;3;; MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS1_103:3:277:921:474 163 chr2 45 99 35M = 241 231 AAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAAC <<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<5<<;;;;; MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS56_63:4:38:28:122 163 chr2 46 99 35M = 227 216 AAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACC <<<<<<;<<<<<<<;<<<<6<<<<<<:<<<<;;<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS221_3:8:50:1203:1094 163 chr2 46 99 35M = 223 212 AAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-B7_591:2:223:583:968 99 chr2 47 88 36M = 215 204 AATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAA <<<<<<<29<<<<4<<<<<<<<<<<7<<7<..<<47 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS114_39:1:28:350:895 163 chr2 48 95 35M = 215 202 ATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAA <<<<<<<<;<;<<<<<<<<<;;<<;<<<<<;;<;8 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS114_45:7:69:1130:832 99 chr2 50 94 35M = 231 216 ATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGC ;;2<;<;;<;9;<;;;;;;;7;8;;7;;;;77437 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS188_7:3:296:224:724 163 chr2 50 99 35M = 234 219 ATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGC <<<<;<<<<<<7;<<<<<6<<<06<<<<<<2(<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-B7_595:4:319:250:718 163 chr2 52 99 35M = 240 223 AGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAG <<<<<<<<<<<;<<5<5;<851;85;)9;;8594; MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS54_73:3:203:419:243 163 chr2 54 99 35M = 237 218 TTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAA <<<<<<<<<<<<<<<9<;<8<<<;<<<;<<<4<77 MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:6:21:1601:1666 163 chr2 56 99 40M = 228 212 GAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAG 7<<<<<<<<:<<7<<<:<<<<<<4<<44<<914<;:5::: MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:7:158:943:467 163 chr2 57 99 35M = 225 203 AAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAA <<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<<;8<< MF:i:18 Aq:i:46 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:2:54:91:1232 99 chr2 57 99 35M = 246 224 AAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:3:29:833:612 163 chr2 58 99 35M = 224 201 AAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;<<;; MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS56_57:1:189:503:110 163 chr2 63 79 35M = 229 201 CTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:25 H0:i:2 H1:i:0
-EAS114_28:2:114:938:216 99 chr2 63 99 36M = 218 191 CTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:0
-EAS1_95:5:257:654:116 99 chr2 64 99 35M = 231 202 TAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<88 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:0
-EAS1_97:3:277:144:848 163 chr2 64 99 35M = 228 199 TAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTT <<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<9;;6; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:0
-EAS1_108:4:75:166:463 99 chr2 64 99 35M = 250 221 TAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<++3 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:4
-B7_610:5:102:915:87 99 chr2 65 99 35M = 222 192 AACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<3<<;<<<<; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:3 H1:i:0
-EAS54_71:3:78:855:352 163 chr2 65 99 35M = 240 209 AACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTC <<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<;<<:<: MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:3 H1:i:0
-EAS56_57:2:206:873:186 163 chr2 66 99 35M = 227 196 ACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;53 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:0
-EAS1_93:6:238:514:194 163 chr2 68 99 35M = 265 232 AATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<;<;< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS56_57:3:285:489:327 99 chr2 68 99 35M = 233 200 AATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS54_67:1:15:381:715 99 chr2 72 99 35M = 237 200 GACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTT ;=====;===9==;===9;;;=4;9=====;==== MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:6:199:818:124 99 chr2 73 99 35M = 266 228 ACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTG <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;7<<<<<<9<9; MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:3:182:1002:639 163 chr2 77 99 35M = 246 204 AACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9-<<<<4<;<;;<; MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:2:3:945:2005 163 chr2 77 99 35M = 262 220 AACCAAGCAGAAGAAAGAGGCTCAGAACTTGAAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<%<<<<<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:44 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:0 H1:i:1
-B7_591:5:254:542:848 99 chr2 79 99 36M = 233 190 CCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAA <<<;<<<<<<<<<<<<<<<;4<;8<<<;;9<9;8;9 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:4:71:517:742 99 chr2 81 99 35M = 266 220 AAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAG <<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<48:4<<<<3 MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:8:254:617:73 163 chr2 83 99 35M = 266 218 GCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<6;:;4% MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:2:13:1507:1146 99 chr2 84 99 35M = 278 229 CAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCT ;<9;;;;<<;;;;<<;<;;;;<;;<<;<;<99777 MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:5:32:686:735 99 chr2 84 78 35M = 255 206 CAGAAGAAAGAGGTTCANANNNTGANGACAAGTCT <<<<<<<<<<<<<<<<<!<!!!<<<!<<<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:78 NM:i:5 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS56_57:3:112:729:591 99 chr2 86 99 35M = 283 232 GAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:5:17:1222:783 163 chr2 87 99 35M = 251 199 AAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCGT <<<<<<<)<<<16<<;<<<6<4<:<4<+://<7)< MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:1 UQ:i:8 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:6:46:122:479 99 chr2 87 99 35M = 248 196 AAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:2:313:531:169 163 chr2 89 99 36M = 250 197 GAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATG <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<:<<:<;<<;<2 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:6:148:170:895 99 chr2 91 99 35M = 247 191 AAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGA <<<<<<<<<<9<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<6< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:6:34:380:815 163 chr2 91 99 35M = 283 227 AAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;: MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:6:210:809:735 163 chr2 93 99 35M = 291 233 GAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<5<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:8:40:925:442 163 chr2 93 99 35M = 271 213 GAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAAT ;<;<<<<<<<<<<<3;<7;:<;;<<<;<<:<32<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:169:256:888 163 chr2 94 99 35M = 270 210 AGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;<<;<<:;;< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:8:117:156:84 99 chr2 95 99 35M = 285 225 GGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:1:35:522:294 163 chr2 95 99 35M = 272 212 GGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTA ===============================:=:= MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:41:653:1568 163 chr2 95 99 35M = 266 206 GGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTA ;;;;;;;8;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;88888 MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:7:178:276:693 163 chr2 96 99 36M = 259 199 GTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;; MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:7:223:440:667 99 chr2 97 99 35M = 282 220 TTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<;; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:5:194:470:416 99 chr2 98 99 35M = 265 202 TCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:5:61:1000:1534 163 chr2 104 99 35M = 286 217 CTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCA <<<<4:<:<1)<<<<<<<+<:44<</7<<<)4:<) MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:145:383:182 163 chr2 105 99 35M = 291 221 TTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;;<; MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:2:63:816:921 163 chr2 106 99 35M = 291 220 TGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<4<846 MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:4:77:1780:693 99 chr2 106 99 40M = 276 210 TGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAA <<<<<<<<<<<<;<<:<<;<<<<<<<<<<<<;<<<;;:69 MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:1:215:861:605 163 chr2 107 94 36M = 262 191 NAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACA !+++++++++++++++++++++++++++++++++++ MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:1 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:1
-EAS221_3:2:22:1623:709 99 chr2 107 99 35M = 287 215 GAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGAC <<<<<<<<<7<<<<<<<:<<<<<<<<:85:<:2<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:1:54:436:1452 163 chr2 108 99 35M = 275 202 AAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:2:42:333:516 163 chr2 109 99 35M = 296 222 AGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAA <<<<<5<*<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<</ MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:6:119:730:190 99 chr2 114 99 35M = 301 222 AGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATA <<<9<;;<<<;<<<<<<<8<<<1<<918<;;;<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:7:63:727:203 99 chr2 114 99 35M = 278 199 AGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:5:27:577:849 163 chr2 114 99 35M = 316 237 AGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<;<<<<<<;;; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:5:5:259:250 99 chr2 115 99 35M = 269 189 GTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;5<<5<;7<:: MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:4:17:989:186 99 chr2 120 91 35M = 299 214 TTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;<7;:::: MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:5
-EAS114_45:2:33:1445:1357 99 chr2 121 85 35M = 299 213 TATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAA ;;<;<<<<<<;;;<9:;:;;;;;:;:;;;;99777 MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:7
-EAS221_3:4:30:1452:1563 163 chr2 122 94 35M = 313 226 ATGAATTAACCAAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAA <<<<<<<<<<<<<<:<<<<1<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_45:1:77:1000:1780 163 chr2 123 66 35M = 279 191 TGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAA ;;;:;;;;;;;/;;;7:4;;7;;;;;;;;;77777 MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:6 H1:i:47
-EAS114_45:4:48:310:473 99 chr2 123 66 35M = 298 210 TGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAA <<<;<<;;;<<;;<;;;;;;;;;;;;;;;;89799 MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:6 H1:i:47
-B7_591:2:279:124:41 99 chr2 124 69 36M = 307 219 GAATTAACCCAGTCAGACAAAAANNAAGAAAAAAGA <<<<<<<7/<8<<<<<<<<<<4*!!<<7<7<<5<<3 MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:2 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS112_32:8:89:254:332 163 chr2 124 76 35M = 291 202 GAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAAG ==================;=========;=7;;<; MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:4 H1:i:36
-B7_597:7:103:731:697 99 chr2 125 72 35M = 304 214 AATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<6<<<<<<<:<;: MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:9 H1:i:55
-EAS139_11:2:71:83:58 163 chr2 148 77 9M2I24M = 349 236 AAAGAAAAAAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS192_3:4:63:5:870 163 chr2 148 75 9M2I24M = 330 217 AAAGAAAAAAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTT <<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;;<<< MF:i:130 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS139_19:2:29:1822:1881 163 chr2 150 74 7M2I31M = 328 218 AGAAAAAAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAG <<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<:<<<:<<;::::: MF:i:130 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS221_3:2:100:1147:124 163 chr2 150 99 35M = 345 230 AAAAAAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<< MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:2 UQ:i:54 H0:i:0 H1:i:0
-EAS192_3:8:6:104:118 163 chr2 154 99 35M = 323 204 AAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<=<<<<<< MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-B7_593:6:185:96:948 99 chr2 160 99 36M = 324 200 TTTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGAT <<<<<<<<<;6<<<<<<<<<;<<<;;<<<<<<<;<; MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:7:213:309:373 163 chr2 161 99 35M = 317 191 TTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGAT <;<<<<<<;<7<<<<<-<<<<<<<<<<<<<<4<7< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:2:30:466:652 99 chr2 163 98 35M = 332 204 AAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<4;7<<<7 MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:4:156:21:69 163 chr2 163 99 35M = 362 234 AAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<4<<<:<;<;; MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:5:197:52:58 163 chr2 165 99 35M = 323 193 AAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATG <<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<2<<<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:3:214:946:229 163 chr2 165 99 35M = 339 209 AAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGATATTATG <<<<<<<<<<<<<<<<<::<;;;<;<;7<:<<7<2 MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:4:293:168:240 99 chr2 167 99 35M = 340 208 ATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATGTA <<<<;<<<;;;<;<<;;;<<;;<<::::<<;;+;7 MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:3:208:118:673 99 chr2 169 76 35M = 332 198 GAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATGTAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;; MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:3:71:478:175 163 chr2 171 99 35M = 317 181 ACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGT <<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:5:177:24:389 163 chr2 175 99 35M = 365 225 AGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;;<;9969; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:6:14:1211:1332 163 chr2 178 99 35M = 351 208 TTTCAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAA ;;.;;;;;;;3;;;;;6;;;;;;8;;;;;;63777 MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:1:324:238:736 163 chr2 180 99 35M = 367 222 TCAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACC =================================== MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:7:9:648:712 99 chr2 182 99 35M = 358 211 AAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTA <9<;<<<<<<<;<<<<<8<<<<9<<;<<8)<:1<: MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:4:41:1308:619 163 chr2 184 99 35M = 360 211 GAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATG <6+<*<<<<<<<:<<<<<<<:<<&<<<<1<6<11: MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:4:328:537:640 99 chr2 185 99 35M = 352 202 AAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGA <;<<<<<<;<<<<<<<<<:;<<8<<<;:<<<;<;9 MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:5:86:697:941 163 chr2 187 99 35M = 341 189 GTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGT =====================<=<==<<====;=5 MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:4:224:592:744 99 chr2 188 99 35M = 383 230 TATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTC <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<7<<<<<<<&<*<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:6:135:354:66 99 chr2 188 99 35M = 356 203 TATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTC <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<2<;;; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:7:71:311:202 163 chr2 188 99 35M = 379 226 TATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTC <<<<<<<<<<<<<<<<:4<<<<<<<<<<<<8;4;: MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:4:50:30:15 99 chr2 192 39 35M = 358 201 AGATTATGTAAAGTAACTTAACCTATGAGTCCAAG +:79.68872.:9&:92/.299169/5+/6/3/&2 MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:3 UQ:i:45 H0:i:0 H1:i:1
-EAS192_3:5:287:334:110 73 chr2 196 73 35M = 196 0 TATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<4;<<<<<<<::6<55:. MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:5:287:334:110 133 chr2 196 0 * = 196 0 GATGAATACTAAGATTGATGTAGCAGCTTTTGCAA .5+7)09<))&-&:33953<-./&&&)((;+3399 MF:i:192
-B7_597:7:5:753:806 83 chr2 197 99 35M = 45 -187 ATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATT ;:<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:4:149:572:877 163 chr2 197 99 36M = 334 173 ATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTC =>7><>;>+>>/;>>=>=>=:>><>=<<==;)<=8; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:7:85:923:726 147 chr2 199 99 35M = 43 -191 GTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCC <:<<<%3<<1<<86<<-<<<<<<<<<<<<6<<1<< MF:i:18 Aq:i:44 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:5:285:241:560 83 chr2 200 99 35M = 37 -198 TAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCT :<<<<;<<,<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:6:41:461:436 163 chr2 200 74 35M = 389 224 TAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<;<;;;:; MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:6:25:949:33 99 chr2 201 99 35M = 383 217 AAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTG =;===/8========*==&;6=&=&:=6&:=::67 MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:2:60:590:1760 99 chr2 201 99 35M = 376 210 AAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTG <:<<<<<2<<<<:<::<<<::<<<<<6<<<<<<<6 MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:6:86:693:234 163 chr2 202 82 35M = 388 221 AAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGA ;;;;;;;;;;;;;;;;9;;;;;;;;99;;&70777 MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:6:4:223:776 163 chr2 203 93 35M = 387 219 AGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<:;<;2< MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:3:88:84:1558 99 chr2 203 95 35M = 394 226 AGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGTG <<;<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<::<<<<<<7&< MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:2:168:829:88 163 chr2 205 99 35M = 369 199 TAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<9;4;2 MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:1:168:389:889 147 chr2 205 99 36M = 37 -204 TAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAA ;<<;;56;==================8========8 MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:5:81:685:141 99 chr2 207 85 34M = 382 210 ACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;<<<',7,7 MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:4:26:1312:1400 99 chr2 207 99 40M = 385 218 ACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAA <<<<;<<<:<<:<;<:<<<;:;<<<<<<:<8<1;;:::88 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:127:725:381 83 chr2 209 99 34M = 39 -204 TGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAA +<<.<<;<;<<<3;<;<<<<<<6<8;<<<<<<<1 MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:2:19:736:559 99 chr2 209 99 35M = 370 196 TGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:3:117:284:589 83 chr2 210 99 35M = 43 -202 GAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAG ==8==;==================;========== MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:5:120:596:847 163 chr2 211 83 35M = 410 234 AACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGA <<<<<<<<<<<<<;<<<9<<<<<<<;:<62;58;2 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-B7_610:5:51:904:391 163 chr2 212 97 35M = 401 224 ACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAA <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;:;<2<6;;;;; MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:8:96:1314:1448 163 chr2 213 93 35M = 388 210 CCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAATAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<4<<<<-<<< MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:1 UQ:i:12 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:3:73:1158:535 163 chr2 213 99 40M = 377 204 CCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<;;<<<<<9<<9::8:8 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:2:223:583:968 147 chr2 215 88 36M = 47 -204 TATGAGGCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAG 1<';<<&%-:<<<<<:66%<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:3:160:173:889 163 chr2 215 99 35M = 379 199 TATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;0<7<<;<<<;7<09 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:1:28:350:895 83 chr2 215 95 35M = 48 -202 TATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAA :<;<<<:;<-<<<<<4;77<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:4:45:707:147 163 chr2 216 99 35M = 424 243 ATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAG <<<<<<<<<<<<&<<<<:<<9<<<9<<<<75;;;< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:8:18:1757:95 99 chr2 216 45 35M = 374 193 ATGAGTCGCAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<:<<<<<<:<<<;:< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS51_66:6:310:747:415 163 chr2 217 99 35M = 387 205 TGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<;<<<<<;<;<; MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:2:114:938:216 147 chr2 218 99 36M = 63 -191 GAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGA <<<<7<6<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:1:179:629:513 163 chr2 220 99 35M = 409 224 GTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAG <<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:4:88:55:1187 99 chr2 220 66 35M = 391 206 GTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAG ;;<;;;<<99<<;;<;;;;;:;49;:;;;;87898 MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:5:119:38:945 99 chr2 221 99 35M = 428 242 TCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGA <<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<8<<<8<;<<7<:<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:6:67:800:450 147 chr2 221 99 35M = 41 -215 TCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGA 9-<9<;<<<<9;5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:5:102:915:87 147 chr2 222 99 35M = 65 -192 CACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAA ;<8<;;<<<<7;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:1:113:367:659 163 chr2 222 72 35M = 390 203 CACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGCGAGAA =9====8==========:=:=====9=:=&====5 MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:2:26:211:481 147 chr2 222 99 35M = 43 -214 CACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAA :<:<<<<<<9:5<<<<<<<<<<<<<<:<:<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:3:90:1906:1528 83 chr2 222 99 35M = 41 -216 CACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAA :<<<<<<<<<3:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:2:13:100:876 163 chr2 223 73 36M = 397 210 ACAGGGATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGT <8<<<*<2<7<<<6<<<<<<6<<8<<<<5<<<<4<9 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1 UQ:i:9 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_63:5:117:570:971 163 chr2 223 99 35M = 413 225 ACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAG <<<<<<<<<<<<<;;;<<<<6<7;9;<:;<;<;;< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:8:50:1203:1094 83 chr2 223 99 35M = 46 -212 ACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAG <7<<<<<5:+63<<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:6:107:395:312 83 chr2 224 99 35M = 44 -215 CAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGT ;<;;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:3:29:833:612 83 chr2 224 99 35M = 58 -201 CAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGT <<;<<<;<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:7:158:943:467 83 chr2 225 99 35M = 57 -203 AGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTT <:<<;;<:5<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:46 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:2:201:768:529 163 chr2 225 99 35M = 396 206 AGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTT ==========================1=======; MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:6:11:994:584 99 chr2 226 97 35M = 417 226 GGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTT <<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<3<6 MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:2:206:873:186 83 chr2 227 99 35M = 66 -196 GTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTG ;<<;--7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:4:38:28:122 83 chr2 227 99 35M = 46 -216 GTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTG ;9;9;-1<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:5:66:372:343 83 chr2 228 99 35M = 40 -223 TATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGG ;<1;89<<<<<;<9<<<<9<<<;8<9<;<<<<<;8 MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:3:277:144:848 83 chr2 228 99 35M = 64 -199 TATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGG <<<)63<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:6:21:1601:1666 83 chr2 228 99 40M = 56 -212 TATTACTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAA -;;3&1<<<<<<<<<<<<1<<<</<<<<<</<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:1:189:503:110 83 chr2 229 79 35M = 63 -201 ATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGA =;;6:============================== MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:5:257:654:116 147 chr2 231 99 35M = 64 -202 TCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAA 0+37<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:69:1130:832 147 chr2 231 94 35M = 50 -216 TCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAA 6)377;3;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:5:254:542:848 147 chr2 233 99 36M = 79 -190 CTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAAC ,:4<8<<<<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:3:285:489:327 147 chr2 233 99 35M = 68 -200 CTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAA 9;;<<8<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:4:163:611:211 163 chr2 234 99 35M = 405 206 TGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAAC ============8===============;=6;;<; MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:3:296:224:724 83 chr2 234 99 35M = 50 -219 TGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAAC 8<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<;<9< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:4:58:271:612 99 chr2 236 99 35M = 415 214 AGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTA <;<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<+47<<;<:: MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:1:15:381:715 147 chr2 237 99 35M = 72 -200 GGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTAT <<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<97;<<<<<<<<9<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:3:203:419:243 83 chr2 237 99 35M = 54 -218 GGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTAT ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:3:41:1281:1785 99 chr2 237 99 35M = 399 197 GGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<8< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:7:218:858:445 99 chr2 239 99 35M = 421 217 AAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTT ;===5=;=======;==3======9;,79==;=== MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:4:319:250:718 83 chr2 240 99 35M = 52 -223 AAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTG <;:<<<<;<<<:<<<<<<49:<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:7:92:493:891 99 chr2 240 99 35M = 408 203 AAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTG <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<8 MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:3:78:855:352 83 chr2 240 99 34M = 65 -209 AAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTT 2<<<<<<<9<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:3:277:921:474 83 chr2 241 99 35M = 45 -231 AAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:2:41:199:388 99 chr2 243 99 35M = 403 195 AGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGG ;;<<<<<;;<<<<<<;;<;;<<;;<<<<<<99999 MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:7:307:481:625 99 chr2 245 99 36M = 410 201 AAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;9<; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:3:134:126:465 99 chr2 245 99 35M = 434 224 AAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAA <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<5<<:<<41 MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:2:44:153:969 163 chr2 245 95 35M = 447 237 AAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAA *:::7<77<:<<<<:<<(597:<:<9//7<529/0 MF:i:18 Aq:i:36 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:3:182:1002:639 83 chr2 246 99 35M = 77 -204 AAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAG <<;;9;9<<<<<<;<7;<;<<<<;;<<<;<<7;<< MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:2:54:91:1232 147 chr2 246 99 35M = 57 -224 AAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAG ;;;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:204:737:61 163 chr2 247 99 35M = 437 225 AAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<9<+4:<0 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:6:148:170:895 147 chr2 247 99 35M = 91 -191 AAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGT <<9<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:6:46:122:479 147 chr2 248 99 35M = 87 -196 AAGTGAGAAGTTTGGAAGAACTATTTGAGGAAGTA <<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS219_1:7:16:1343:1621 99 chr2 248 99 35M = 426 213 AAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTA <<<<<<<<8<<<<;<<<;<;<<<<<<<:;4;71:; MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:2:313:531:169 83 chr2 250 99 36M = 89 -197 GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATT 98;<;;<<;8<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<8<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:4:75:166:463 147 chr2 250 99 35M = 64 -221 GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAAT <<<<<============================== MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:7:130:260:553 99 chr2 250 99 34M = 439 224 GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGCAC <<<<<1<<<<<<<<<<6<<81</<4*2;7:+90( MF:i:18 Aq:i:42 NM:i:2 UQ:i:31 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:2:60:677:921 99 chr2 250 96 35M = 393 178 GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:6:60:1037:1146 99 chr2 250 99 35M = 447 232 GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:;;;;;;< MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:5:17:1222:783 83 chr2 251 99 35M = 87 -199 TGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATT 6<<<8<69<8199<7<<<6<<<<<<<<<1:<:<<: MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:6:96:491:1891 163 chr2 253 99 35M = 409 191 AGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGG <:<<<<<::<<<<<<<<<<<<<<<<:<<::7<<:7 MF:i:18 Aq:i:46 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:6:75:615:555 99 chr2 255 99 35M = 416 196 AAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<29<;.484 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:5:32:686:735 147 chr2 255 78 35M = 84 -206 AAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGG <<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:3:65:85:1547 163 chr2 257 99 35M = 434 212 GTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<:<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:7:94:1655:1921 99 chr2 258 85 35M = 447 224 TTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAA <<<8<<<<<<<<<8<<8;8<;<;<;;<<9+868<; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-B7_610:7:177:469:800 99 chr2 259 99 35M = 433 209 TTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;<<<;<; MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:7:178:276:693 83 chr2 259 99 36M = 96 -199 TTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAAC :;<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:3:14:697:541 99 chr2 259 99 35M = 432 208 TTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<;;;;8;;< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:6:37:156:134 163 chr2 261 99 35M = 443 217 GGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACC ;;;;;;;;;;9;;;;;;;;;;;;;;;9;;;77679 MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:1:215:861:605 83 chr2 262 94 36M = 107 -191 GAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTC ;<<<<<;:<7:<<<;<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:2:3:945:2005 83 chr2 262 99 35M = 77 -220 GAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCT 7<<<<;;<<;<<<<<7<<<<<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:44 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:6:52:751:360 163 chr2 263 99 35M = 443 215 AAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:76<<<<;9:;: MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:6:238:514:194 83 chr2 265 99 35M = 68 -232 AAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTT <<6<<<<:9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:5:194:470:416 147 chr2 265 99 35M = 98 -202 AAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTT <<<7<<;<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:4:71:517:742 147 chr2 266 99 35M = 81 -220 AACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTT <<<<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:8:254:617:73 83 chr2 266 99 35M = 83 -218 AACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTT <<:<<<9;<<<;;<:<-<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:6:199:818:124 147 chr2 266 99 35M = 73 -228 AACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:41:653:1568 83 chr2 266 99 35M = 95 -206 AACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTT 977979;:;<;;;;;;<<5;<;<;<<<;;;;;;;; MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:5:211:84:84 99 chr2 268 99 35M = 440 207 CTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAG <<<<<<<<<<<<<<<<:<<:<<:<<<44<4<<9<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:2:152:355:962 163 chr2 269 99 35M = 456 222 TATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT <;<<<<<;8<<<<<<<<<;5;;88<<3<<<<<&0; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:5:285:395:450 99 chr2 269 99 35M = 458 224 TATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT <<<<<<<;<<<;<<<<<;:<:7<;<;7<7<<;;7< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:3:15:568:42 121 chr2 269 69 35M = 269 0 TTTTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT !!;:<8<;<<<8<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:2 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:3:15:568:42 181 chr2 269 0 * = 269 0 TTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATA !!!!!!!!!++++!!!!!!!!!!!!!!!!!!!,!, MF:i:192
-EAS192_3:8:6:237:885 99 chr2 269 99 35M = 433 199 TATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT <<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;<; MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:5:5:259:250 147 chr2 269 99 35M = 115 -189 TATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT 8<83;<<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:6:206:994:556 73 chr2 270 75 35M = 270 0 ATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<;<< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:6:206:994:556 133 chr2 270 0 * = 270 0 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!! MF:i:192
-EAS54_71:4:169:256:888 83 chr2 270 99 34M = 94 -210 ATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT &<<:<;<<;;<8<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:2:317:72:221 163 chr2 270 99 35M = 422 187 ATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTC ===========;=======;;:==6=;=====;== MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:8:40:925:442 83 chr2 271 99 35M = 93 -213 TTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCT =;================================= MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:2:158:909:321 163 chr2 271 99 35M = 453 217 TTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:1:35:522:294 83 chr2 272 99 35M = 95 -212 TTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:4:176:971:874 163 chr2 273 76 35M = 432 195 TGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTG <<<<<<<<<<<<<:<;<<<<<<<<<<<<<5<<<<7 MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:7:226:869:36 99 chr2 273 99 35M = 461 223 TGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTG :<<<<,:<;:.:<<:<<717,;2171717717116 MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:6:106:595:322 163 chr2 274 99 35M = 440 201 GAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<:: MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:1:54:436:1452 83 chr2 275 99 35M = 108 -202 AGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:4:77:1780:693 147 chr2 276 99 40M = 106 -210 GGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGAT :**::799<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:3:147:423:584 99 chr2 277 99 35M = 451 209 GAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;;96 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:2:188:782:483 163 chr2 277 99 35M = 431 189 GAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<7<;77 MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:4:78:1314:1275 99 chr2 277 99 35M = 469 227 GAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<8 MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:7:63:727:203 147 chr2 278 99 35M = 114 -199 AAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGA <<;7<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:2:13:1507:1146 147 chr2 278 99 35M = 84 -229 AAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGA 88788;,;:-:2;;;;;;;;:;:;;;;;;;;;;;; MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:1:77:1000:1780 83 chr2 279 66 35M = 123 -191 AGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAG 777774;;4-7;;;;;;:;;;:;;;<;;;;<<<<; MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:1:93:490:901 163 chr2 280 99 35M = 445 200 GTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGA <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<:<<1+4-8 MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:6:227:657:95 99 chr2 280 99 35M = 458 213 GTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<8<85 MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:7:57:324:546 163 chr2 281 99 36M = 458 213 TAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<8:8<<;::;;; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:7:223:440:667 147 chr2 282 99 35M = 97 -220 AATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATT <<;;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:4:26:274:1078 163 chr2 282 99 40M = 458 216 AATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGAC <<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;:;;;::::: MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:7:196:511:896 163 chr2 283 99 35M = 446 198 ATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<4<88;<< MF:i:18 Aq:i:52 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:3:112:729:591 147 chr2 283 99 35M = 86 -232 ATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTT ;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:6:34:380:815 83 chr2 283 99 35M = 91 -227 ATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTT ;;;;<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:8:117:156:84 147 chr2 285 99 35M = 95 -225 TGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAG <;;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:5:61:1000:1534 83 chr2 286 99 35M = 104 -217 GGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGA <<;<<<<;;<<;6;<<<;<4;<<7<<<<<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:2:22:1623:709 147 chr2 287 99 35M = 107 -215 GGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGAC <'<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:7:7:682:201 163 chr2 288 99 35M = 452 199 GGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACA <<<<<<<7<<7<<<<77&;-9<97<76<;<<993< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:5:91:89:666 153 chr2 289 60 35M * 0 0 GAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACAT 74752;;4;;;;;;;;7);;;4;;;;)4;;;;;13 MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:6:46:13:880 99 chr2 290 99 35M = 445 190 AAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<7<3<<<9<+;;<9 MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:1:187:715:521 163 chr2 291 99 35M = 451 195 AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<;<<;<;; MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:6:210:809:735 83 chr2 291 99 35M = 93 -233 AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:145:383:182 83 chr2 291 99 35M = 105 -221 AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT <<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_32:8:89:254:332 83 chr2 291 76 35M = 124 -202 AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT <<<<<<:<;<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:2:63:816:921 83 chr2 291 99 35M = 106 -220 AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT <<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:2:280:662:939 99 chr2 294 99 35M = 442 183 CCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAA <<<<<<<<<<<<<;<<<;;7<<<<<<<<<<<<:8< MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:3:250:628:423 163 chr2 295 99 36M = 489 230 CTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATG <<<<<<<<<<<<<<<<<<:;<<<<:<<<<;;;;;;4 MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:4:255:549:422 163 chr2 295 99 35M = 456 196 CTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAAT <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<:<<<<<<;;;< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:2:2:491:1886 89 chr2 295 75 35M * 0 0 CTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAAT <<:<8:<<<:<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<: MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:3:267:821:860 163 chr2 296 99 35M = 451 189 TCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATG ;<<<<<8<<<<<8<<;<8<<<<<5<;<<<<<2;<5 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:2:42:333:516 83 chr2 296 99 35M = 109 -222 TCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATG <<<<<<<<7<63<7<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:2:119:161:322 99 chr2 297 99 35M = 479 217 CTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGA <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<</6 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:4:48:310:473 147 chr2 298 66 35M = 123 -210 TTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAA 77999;;6;;;;;;;;;;;;;;;9;;;;;;;;;;; MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:6:159:273:253 153 chr2 299 76 35M * 0 0 TTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAA <<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:6:181:392:500 99 chr2 299 99 35M = 470 206 TTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAA <<<<<:<<<2<<<<;5<<<<29+<<)</65<7.24 MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:4:17:989:186 147 chr2 299 91 35M = 120 -214 TTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAA 87;38$<3=/<==============9========= MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:2:33:1445:1357 147 chr2 299 85 35M = 121 -213 TTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAA 88888;;;;;;;:;;;;;;;:;9;;;;;;;;;;;; MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:6:119:730:190 147 chr2 301 99 35M = 114 -222 AGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGA ;;;3;<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:5:62:969:12 99 chr2 303 99 35M = 464 196 TCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:7:103:731:697 147 chr2 304 72 35M = 125 -214 CTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGC :::;3:<<<<<<<:<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:2:111:142:21 163 chr2 304 99 35M = 479 210 CTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGC <<<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;9 MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:7:319:280:57 99 chr2 306 99 35M = 467 196 TGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTC ;==========;=====6;=========;=<;6;; MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:8:76:205:587 163 chr2 306 99 35M = 483 212 TGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:2:279:124:41 147 chr2 307 69 36M = 124 -219 GCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAA :17<8<<<:&<<<<<<:;'<<<<<<<<<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:3:10:349:1147 153 chr2 307 74 40M * 0 0 GCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAA :/:::<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:32 Aq:i:16 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:1:22:490:2011 99 chr2 307 99 35M = 485 213 GCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:6:46:173:214 163 chr2 308 99 35M = 487 214 CTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<3<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:2:283:577:398 99 chr2 308 99 35M = 488 215 CTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:2:27:280:592 99 chr2 310 99 36M = 484 210 AGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<5< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:3:11:1238:1728 163 chr2 310 99 35M = 475 200 AGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAG <<7<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<;;< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:6:118:121:760 89 chr2 311 77 36M * 0 0 GAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAA :<<<;;<<<<6<;<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:7:318:679:883 153 chr2 313 75 35M * 0 0 GATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAAT <<;4<<;<:<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:32 Aq:i:19 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:4:30:1452:1563 83 chr2 313 94 35M = 122 -226 GATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAAT <<39<<<59<<:<<+<<<6<<:<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:1:189:130:136 99 chr2 314 79 35M = 494 215 ATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATG ==<<=================<<====<<=;=6== MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:5:27:577:849 83 chr2 316 99 35M = 114 -237 TTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCC 5:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:3:71:478:175 83 chr2 317 99 35M = 171 -181 TAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCA <<<<;<96<<<<;<<<<<<<<<77<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:4:38:999:463 99 chr2 317 39 35M = 503 221 TAGACATCTAAATGAAAGNNGCNNNAAGAATGCCA 7<<<<<<<<:07<<:<<7!!<<!!!::<88<<<<4 MF:i:130 Aq:i:39 NM:i:5 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS54_71:8:215:830:609 89 chr2 317 71 33M * 0 0 AAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGC +<)<:<<:<<<<<<<<<9<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:11 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:7:213:309:373 83 chr2 317 99 35M = 161 -191 TAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCA <<<86<82<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:45:1339:1807 153 chr2 319 64 35M * 0 0 GACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGG 77797;;:;::&:;;0:;8;;4;;:;;6;;;;;;; MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:5:197:52:58 83 chr2 323 99 35M = 165 -193 TCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGA <7;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:8:6:104:118 83 chr2 323 99 35M = 154 -204 TCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGA ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:6:185:96:948 147 chr2 324 99 36M = 160 -200 CTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATA 6<;;<;<<;<<<<<747<<<<<<<<77<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:4:61:346:384 163 chr2 324 68 35M = 496 207 CTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGAT <<;<<<<<<<<9<;<<9;<6<2;<6<<<;9*558; MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:8:177:800:714 163 chr2 324 76 35M = 497 208 CTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<;<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:4:329:339:408 99 chr2 325 99 36M = 515 226 TAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<; MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:6:214:565:337 99 chr2 326 99 35M = 481 190 AAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATAC <;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<9<<<<<;;;;<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_4:7:296:401:60 89 chr2 327 68 35M * 0 0 AATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACA <<*<<<<7<<)<<3<<<9<<<<<<<<<<<<<<;<< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:6:88:1413:14 89 chr2 327 76 35M * 0 0 AATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACA <<<<<<<<<<<;;;<<<<<<;<;;<<<<<<<<<<< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:1:34:649:318 163 chr2 328 65 35M = 481 188 ATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACAT 9<<3<<<9<<<<<<<<<7<<9<<0<<.0<*:77,; MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:2:29:1822:1881 83 chr2 328 74 40M = 150 -218 ATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAA ;87;;<<<;<5<5<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<:<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:8:187:199:369 153 chr2 329 74 35M * 0 0 TGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATT ;<><<<<<<<<7<<<<<<<<=<<<<<<<<<<<<<< MF:i:32 Aq:i:19 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:2:23:268:529 153 chr2 329 71 35M * 0 0 TGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATT 7;<<<<<<57;-<<<<<<:<77<<<<<<<;<;<<< MF:i:32 Aq:i:28 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:2:315:219:7 153 chr2 330 69 35M * 0 0 GAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTG 7==::<2=8<<<=====>888<=2=>==>,>,>>8 MF:i:32 Aq:i:19 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:4:63:5:870 83 chr2 330 75 35M = 148 -217 GAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTG :<;<;<<<4:;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:5:243:557:560 163 chr2 331 75 36M = 499 204 AAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA <<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<89<<9<; MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:2:270:430:269 163 chr2 331 99 36M = 519 224 AAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;7;: MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:6:284:442:747 89 chr2 331 75 35M * 0 0 AAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGC <;<<<<<:<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:32 Aq:i:29 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:7:71:31:1973 89 chr2 331 76 35M * 0 0 AAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGC <<<<<7<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:32 Aq:i:29 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:2:30:466:652 147 chr2 332 98 35M = 163 -204 AAGAGGCTAAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA <<<<<;3;&<<<<<<<</6<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_61:3:208:118:673 147 chr2 332 76 35M = 169 -198 AAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA <<<<<;;<;<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:1:95:1530:28 163 chr2 332 74 35M = 490 193 AAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA ;;;;;;;;;;:;;;;;;;8;;;;;;;;;;;77747 MF:i:18 Aq:i:9 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:7:104:965:517 73 chr2 333 77 35M = 333 0 AGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<8<<;<< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:7:104:965:517 133 chr2 333 0 * = 333 0 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!! MF:i:192
-EAS54_65:7:155:629:357 163 chr2 333 99 35M = 521 223 AGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAA <<<<<<<<8<8<<6<<<<<<<<;<9<5<;<;;941 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:4:149:572:877 83 chr2 334 99 36M = 197 -173 GAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGA 6<94693<;<<<<;;<<<<<<<<<<;9<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:53:544:889 99 chr2 335 76 35M = 495 195 AGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGA <<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:6:226:370:91 99 chr2 335 99 35M = 482 182 AGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGA 8<<<;<8<8<;<<<8<<;7<7;8784<<,;864<& MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:4:119:651:88 163 chr2 337 99 35M = 527 225 GCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:6:20:592:496 163 chr2 338 75 35M = 498 195 CTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<==<<<<<<:< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:3:214:946:229 83 chr2 339 99 35M = 165 -209 ACAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGA )+<<<*<<77;8<;7<<8<4<;<88<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:1 UQ:i:8 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:5:163:982:695 99 chr2 339 77 35M = 499 195 TCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<; MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:4:14:1872:1521 163 chr2 339 62 35M = 500 196 TCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGTCAGA 7<<<<77<<<3<3<7.'<<<<<7<67<+.0%4*<4 MF:i:18 Aq:i:2 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:4:293:168:240 147 chr2 340 99 35M = 167 -208 CAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGAC +;;;;<8<<86<<<<<<<;;8;7;<;<8<8;<<<< MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:5:86:697:941 83 chr2 341 99 35M = 187 -189 AAAAAAATCCCGGAAGATACATTGCAAGACAGACT 1<<%<<<1:<58<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:4 UQ:i:67 H0:i:0 H1:i:0
-EAS54_71:4:14:88:306 99 chr2 341 99 34M = 521 215 AAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGAC <<<<<<8<<<<<<;<<<3<<<8<<;<;;<15<:6 MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:6:183:697:555 163 chr2 341 84 35M = 505 199 AAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCCAGACAGACT =====================:===&==:;==5;; MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_57:3:41:739:907 163 chr2 344 99 35M = 520 211 GAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<9<<<;;;;; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:2:100:1147:124 83 chr2 345 99 35M = 150 -230 AATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCAT <<<<96<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<< MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:5:127:828:697 99 chr2 346 99 35M = 552 241 ATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;<; MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:8:62:125:888 163 chr2 347 99 35M = 504 192 TGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<::<<<:7<::<:;<<: MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:1:1:1598:843 163 chr2 347 99 40M = 500 193 TGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATA <<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<4:8:: MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:2:71:83:58 83 chr2 349 77 35M = 148 -236 CCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAG 8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:1:88:1454:418 163 chr2 349 99 35M = 522 208 CCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAG :<<:<<<<<<<<<<<::::<:<:<9<5<<<<<<8: MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:5:36:649:554 163 chr2 350 99 35M = 523 208 CAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGA <<<<<4<<8<<<<<<8<6<<88<<<<<<<-;<;0; MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:2:189:831:878 163 chr2 351 99 35M = 555 239 AGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGAT :<<<2<<<<<<<<<<:8<8<<<<<<<<<<87489; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:6:14:1211:1332 83 chr2 351 99 35M = 178 -208 AGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGAT 978961;;991;97;<;;<;<<;;;;;<;;<:8:< MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:4:328:537:640 147 chr2 352 99 35M = 185 -202 GGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATA ;:<<;<<<<<::<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:1:85:361:418 99 chr2 353 99 36M = 517 200 GAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATG <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;4;<<<<3 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:2:329:437:643 99 chr2 354 99 36M = 540 222 AAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<<1 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:6:135:354:66 147 chr2 356 99 35M = 188 -203 GATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTA ;;;;7<<<<:<<<<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:7:9:648:712 147 chr2 358 99 35M = 182 -211 TACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGT *;0;;;95<<<<7<<<;;<<<;;<<<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:4:36:1184:994 163 chr2 358 99 35M = 518 195 TACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<8< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:4:50:30:15 147 chr2 358 10 35M = 192 -201 TACATTGCAAGACAGTCGTCAGCAAGATATGTAGT 1-%-22&&)&11,&/&&176<&<<<222<,6,<<< MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:3 UQ:i:26 H0:i:0 H1:i:0
-EAS51_66:4:322:350:374 163 chr2 360 99 35M = 546 221 CATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:7:41:745:603 163 chr2 360 99 35M = 536 211 CATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCA <<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<6<:8<<: MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:8:138:186:459 163 chr2 360 97 35M = 518 193 CATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCA <*<<7<<0<7<<+<-:<<&<:6:4:0-:<<2.:5< MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:4:41:1308:619 83 chr2 360 99 35M = 184 -211 CATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCA 0<9476<<<<<0<<<2<&<0<.<<<<<<<<<.<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:1:125:884:276 163 chr2 362 99 35M = 541 214 TTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATC <<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:4:156:21:69 83 chr2 362 99 35M = 163 -234 TTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATC <:3:<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:5:66:1381:181 163 chr2 362 99 40M = 544 222 TTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACT <<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<::4:7 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:7:11:1261:1200 163 chr2 362 99 35M = 558 231 TTGCAAGACAGACTTCATCAAGTTATGTAGTCATC <<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<;<:<<8<<:<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_99:5:191:885:623 163 chr2 363 99 35M = 551 223 TGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;;;; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:7:53:783:78 99 chr2 363 99 35M = 561 233 TGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<7;<:; MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:5:177:24:389 83 chr2 365 99 35M = 175 -225 CAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGA +<<;<9<<<9<<;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:5:58:684:520 99 chr2 367 99 35M = 538 206 AGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:6:71:187:824 99 chr2 367 99 35M = 534 202 AGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACT ;===;======3==;==========4=;=7;;3;6 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:1:324:238:736 83 chr2 367 99 35M = 180 -222 AGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACT <<<9<<<70,<<4<<<<<7<4<7<<<<<0<<<<<7 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:6:19:306:982 99 chr2 368 99 35M = 538 205 GACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:2:168:829:88 83 chr2 369 99 35M = 205 -199 ACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTAT <,,;<838883;;;<<<<<;<8<8;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:6:122:589:134 163 chr2 369 99 35M = 562 228 ACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTAT <<:<<:<:<<<<<:<8<<<<<<<:<::<<<4:<;; MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:3:303:970:243 163 chr2 370 99 35M = 564 229 CAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<<8<8< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:2:19:736:559 147 chr2 370 99 35M = 209 -196 AAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATC )<7<2;;4<<4<<<<;<<<<<<<<<<7<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1 UQ:i:8 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:3:246:711:981 99 chr2 371 99 35M = 559 223 AGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCT <<<<<<<<;<<<<:;<<;;<:<<<4<<:4;00<;< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:6:89:1164:573 99 chr2 371 99 35M = 560 224 AGACTTCATCAAGAGATGTAGTCATCAGACTATCT <:<<;<2<<<<<<<&:2<;<;<<<<;,+;:<<4:< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS220_1:8:18:1757:95 147 chr2 374 45 35M = 216 -193 CTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAA <<<6<&:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:2:284:597:682 99 chr2 375 99 35M = 557 217 TTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAG <<<<<<<9<<<<<;<<6<<<<<;<9<<<<<<1;;9 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:3:10:394:392 99 chr2 376 99 35M = 542 201 TCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAATT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<;<<;;:6&; MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:5:28:538:148 163 chr2 376 99 35M = 557 216 TCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<+771; MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:2:60:590:1760 147 chr2 376 99 35M = 201 -210 TCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGT <8<-<<<<<<<82<<<4<<<<<<<<<<<<<8<<<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:3:73:1158:535 83 chr2 377 99 40M = 213 -204 AATAAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT +;6+;<;<<<<<<<<<0<<;<<<;<<<8<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:2 UQ:i:20 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:3:182:104:921 99 chr2 378 99 35M = 575 232 ATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:3:160:173:889 83 chr2 379 99 35M = 215 -199 TCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAA ;)<</<8<<<<<<</<;<<<<;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:7:71:311:202 83 chr2 379 99 35M = 188 -226 TCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAA ;6<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:4:315:201:673 163 chr2 381 45 36M = 542 197 AAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<:; MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:2:228:915:631 163 chr2 381 66 35M = 547 201 AAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACA =================;==========4====== MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:1:228:736:747 163 chr2 381 68 35M = 542 196 AAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACA <<<<<<<<<;<<<<<<<;;<<;<<<<;::<;;7;7 MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:3:263:689:572 99 chr2 381 68 35M = 553 207 AAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACA <<<<;<<<<<;<<<<<<&;;<<<;<<:<+;;7;;7 MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:5:81:685:141 147 chr2 382 85 35M = 207 -210 AGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT ;+;(;)..=3.1=.7=;=8;==<4====;====== MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:2
-EAS114_32:1:208:971:600 163 chr2 382 99 35M = 559 212 AGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT <<<<<<<<<<<<<<<<<8<<:<<<0;44<<:4<:< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:8:7:1864:1569 99 chr2 382 99 35M = 561 214 AGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<8<<<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:4:224:592:744 147 chr2 383 99 35M = 188 -230 GATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATG 6<6<<<<<<9+<6-<<<:<:<:<<<<<:<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:6:25:949:33 147 chr2 383 99 35M = 201 -217 GATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATG -<4<666<<-7<5<<<<<(<<<<<<<<<<<<<<-< MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:1
-EAS54_73:5:271:874:367 163 chr2 384 99 35M = 560 211 ATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATTA <<<<<<<<<<<<<<4<;<;<:<;4<4<<99<7<+% MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:4:26:1312:1400 147 chr2 385 99 40M = 207 -218 TATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA ::77:<;:+6<+<<<;<<74<<<;<<;<<<<<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:2
-EAS51_66:6:310:747:415 83 chr2 387 99 35M = 217 -205 TGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGG ;<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:6
-EAS56_57:6:4:223:776 83 chr2 387 93 35M = 203 -219 TGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGG <;9<;<0<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:6
-EAS114_28:3:32:492:907 99 chr2 387 95 36M = 571 220 TGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:5
-EAS114_26:4:110:840:431 163 chr2 388 93 35M = 567 214 GTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGA =====================5:======54=+3+ MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:5
-EAS114_45:6:86:693:234 83 chr2 388 82 35M = 202 -221 GTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGA 83997;<;;;;98;;3*6<<;<:8;;;;;<;;<<< MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:3 H1:i:13
-EAS139_11:8:96:1314:1448 83 chr2 388 93 35M = 213 -210 GTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGA <<<<7<<:<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:3 H1:i:8
-EAS114_30:6:41:461:436 83 chr2 389 74 35M = 200 -224 TAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAA ;<986<;6<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:3 H1:i:13
-EAS221_3:8:55:932:613 163 chr2 389 77 35M = 568 214 TAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:3 H1:i:10
-EAS1_97:5:219:174:684 163 chr2 390 71 35M = 560 205 AGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA <<<<<<<<<<<8<8<<<7<<;<<<<<2<;&;;;;9 MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:14
-EAS56_57:5:24:284:360 163 chr2 390 76 35M = 567 212 AGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<9;<;99;; MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:14
-EAS114_26:1:113:367:659 83 chr2 390 72 35M = 222 -203 AGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA <<5<0&9;<3<<<<<9<<<<4<;<9<9<<<<7<3< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:3 H1:i:17
-EAS114_32:5:109:199:592 163 chr2 390 72 35M = 576 221 AGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA <<<<<<<<<<<;:<;;<<:;6<<;:;:<<+;;;<; MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:14
-EAS114_45:4:88:55:1187 147 chr2 391 66 35M = 220 -206 GTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAA 7769,7;;;;;;;;;;;;;;9;;;;;;;;;;;;;; MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:7
-EAS56_59:2:60:677:921 147 chr2 393 96 35M = 250 -178 CATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAA ========9==;======8==>============= MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:4 H1:i:13
-EAS114_39:3:88:84:1558 147 chr2 394 95 35M = 203 -226 ATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAA ;;<<;<<;<<5<<<<<<;<<:<<<;<<<<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:3
-EAS56_59:2:201:768:529 83 chr2 396 99 35M = 225 -206 CAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATT 3<:<9<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:2:13:100:876 83 chr2 397 73 36M = 223 -210 AGAATATATAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCT ;9<$<<<$<<<<<<<<75<<<<<<<9<9<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:2 UQ:i:6 H0:i:1 H1:i:1
-EAS139_11:4:26:137:1382 99 chr2 397 99 35M = 579 217 AGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTC <<<<<<7<<<77<<<<<<</<<+<<<<<<7<+<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS54_67:3:197:261:624 99 chr2 398 99 35M = 587 224 GACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCT <<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<;<<<<<<;<<<9< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS218_4:3:41:1281:1785 147 chr2 399 99 35M = 237 -197 ACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTA <6<<<6<<<<<<:<<6<:<<<<<<<<<<<<6<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:3
-B7_610:5:51:904:391 83 chr2 401 97 35M = 212 -224 TATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAA ;<96<<<<<<7<<7<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS56_63:7:137:139:248 163 chr2 401 97 35M = 569 203 TATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAA <<<<<<<<<9<<<<<<<<<<;<<<<<<<;;<;<;< MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:3 H1:i:2
-B7_610:7:15:696:693 163 chr2 403 34 35M = 570 202 TCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAAT 2:+:7<<3<<<<<6+36<<<<<<<6<<6&<<;<.7 MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:1
-EAS114_45:2:41:199:388 147 chr2 403 99 35M = 243 -195 TCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAAT 84898;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:4:163:611:211 83 chr2 405 99 35M = 234 -206 TAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCA <<<<9<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:1:114:19:769 163 chr2 405 90 35M = 572 202 TAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCA <<<<<*2;6;<<<4.;;<&;;<.<40)<);5-/7; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS51_64:7:92:493:891 147 chr2 408 99 35M = 240 -203 AGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCA <383<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:8:5:996:2000 163 chr2 408 99 35M = 575 202 AGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<: MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS1_93:1:179:629:513 83 chr2 409 99 35M = 220 -224 GTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAA <;,<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:1:84:1505:1037 99 chr2 409 99 35M = 586 212 GTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAA <<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<::) MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS221_1:6:96:491:1891 83 chr2 409 99 35M = 253 -191 GTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAA :;5<<7<;:<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:46 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:7:307:481:625 147 chr2 410 99 36M = 245 -201 TCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGA ;4<<4<;;<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:0
-B7_610:5:120:596:847 83 chr2 410 83 35M = 211 -234 TCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAG ;/<<:<;<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS114_45:3:3:864:1888 99 chr2 411 99 35M = 579 203 CAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGA ;<<;;<<;;;<;;<<;<;<<;<<;8<<:<;79799 MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:1:34:1614:558 99 chr2 411 99 35M = 569 193 CAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGA <<<<<<<<<<<7<<<<<8<<<<<<2<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:5:117:570:971 83 chr2 413 99 35M = 223 -225 ACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGA <,<9<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:1
-EAS112_34:8:45:800:733 163 chr2 413 99 35M = 607 229 ACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGA <<<</<<<<<<<<<<<<<<<2<9<<<<<5*5;599 MF:i:18 Aq:i:34 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS219_FC30151:7:87:1289:83 163 chr2 413 99 35M = 585 207 ACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<<<: MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS114_39:4:58:271:612 147 chr2 415 99 35M = 236 -214 ATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGCAA ;:2=<<;<<<<<<:67:<<:<<<<<<<<<<<<,<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1 UQ:i:11 H0:i:0 H1:i:2
-EAS1_108:1:33:779:821 163 chr2 416 99 35M = 579 198 TGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:3
-EAS112_34:6:75:615:555 147 chr2 416 99 35M = 255 -196 TGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAA ;<<<;<<<<<<<<<:;<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:0
-EAS188_7:6:11:994:584 147 chr2 417 97 35M = 226 -226 GAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAG <<<<;<<<<<<<;<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:0
-EAS114_26:7:218:858:445 147 chr2 421 99 35M = 239 -217 GAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATA ;<<<<<<<8;:<<<<<<;<<:<<<<<<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS54_81:2:317:72:221 83 chr2 422 99 35M = 270 -187 AAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATAC =========:======;==;=============== MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:4:70:766:2016 163 chr2 422 99 35M = 607 220 AAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:0
-EAS56_53:4:45:707:147 83 chr2 424 99 35M = 216 -243 AAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAG <<<<<<;3<<<<<4;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:7:16:1343:1621 147 chr2 426 99 35M = 248 -213 AAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTC ;<<9;7=====;;==<==================< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:5:184:912:258 99 chr2 428 99 35M = 582 189 ATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:5:119:38:945 147 chr2 428 99 35M = 221 -242 ATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCAT =;;8=====:========<================ MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:6:95:235:746 163 chr2 430 99 35M = 598 203 TCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGACATCT <<<<;<<<<<<<<79<<<<<<<<<<<<<<*;;;<9 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1 UQ:i:9 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:2:188:782:483 83 chr2 431 99 35M = 277 -189 CTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTA 7<<<<<<4<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:3:39:348:594 163 chr2 431 99 35M = 600 204 CTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTA <<;<<<<<<<<<;<;;<<<<<<<<<<;<<<:<:<: MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:4:176:971:874 83 chr2 432 76 9M1D26M = 273 -195 TAAAATCAGAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATA <<<<<:<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_30:3:14:697:541 147 chr2 432 99 35M = 259 -208 TAAAAGCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTAT 8<<<<&6<;8<<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<8 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:7:177:469:800 147 chr2 433 99 35M = 259 -209 AAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATA =<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:1:131:518:588 163 chr2 433 99 35M = 607 209 AAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<1<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:8:6:237:885 147 chr2 433 99 35M = 269 -199 AAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATA <<<<1:<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:3:134:126:465 147 chr2 434 99 35M = 245 -224 AAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAA <<;:&<3)<<7<:<<<<.:<<<<<8<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:2:104:402:732 163 chr2 434 99 35M = 610 211 AAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAA =========================7=;===;=:= MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:3:65:85:1547 83 chr2 434 99 35M = 257 -212 AAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAA <<<<<<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:2:85:686:696 163 chr2 435 99 35M = 594 193 AATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAA ==================<=====:==<=<;=:== MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:1:144:242:602 163 chr2 436 99 36M = 611 211 ATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGG ========================;=====<;;<<; MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:204:737:61 83 chr2 437 99 35M = 247 -225 TCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGG (7=72=;==2=====<===<<============== MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:7:124:253:889 163 chr2 437 99 35M = 598 196 TCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGG <<<<<<6<<:<<<<<<<<<<<<<;;<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:7:310:155:312 163 chr2 438 99 35M = 606 203 CAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGA ;<<<;<<<8<<<<<<<<<<<<;<<<<<8<<<<8<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:7:78:692:671 99 chr2 438 99 35M = 610 207 CAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGA <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<:<<:<<<:8<<0;; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:7:130:260:553 147 chr2 439 99 35M = 250 -224 AGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAA <*;<<7<);<<;9;<5<*<9<;<<;;<7<<<<<1< MF:i:18 Aq:i:42 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:7:60:163:1612 163 chr2 439 99 35M = 617 213 AGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAA <<<<<<<<<21<<<<<<<<<3<--<+<<<+<<63< MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:6:106:595:322 83 chr2 440 99 35M = 274 -201 GCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAA ;+<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<7<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:5:211:84:84 147 chr2 440 99 35M = 268 -207 GCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAA 6:<<:<<<<<<9<<<<<<<<<<<;<<<;;;<;<3; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:2:280:662:939 147 chr2 442 99 35M = 294 -183 AAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATC <<;<;<<<<<:<<<;<<<;<<;<<<<<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:6:52:751:360 83 chr2 443 99 35M = 263 -215 AGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCC <-<9<<<<<6<<<8<<;;<<9<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:2:234:167:381 163 chr2 443 99 35M = 625 217 AGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;;7<;; MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:6:37:156:134 83 chr2 443 99 35M = 261 -217 AGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCC 99998<<<<:<<<<<<<;<<><<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:1:93:490:901 83 chr2 445 99 35M = 280 -200 AGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCA <<<<<<<;<<<;<<<;<<;<<;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:7:96:489:453 99 chr2 445 99 35M = 625 215 AGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;: MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:6:46:13:880 147 chr2 445 99 35M = 290 -190 AGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCA =&====8==========0================= MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:2:167:905:852 163 chr2 445 99 36M = 647 238 AGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGAAAATCCCAT <<<7<<<<<<<<<<<<<<:<:<<:::&.<:<66:3< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS219_FC30151:3:13:674:1717 163 chr2 445 99 35M = 623 213 AGAAAAGCATGCAGTCATCTATAAAGGAAATCCCA <<<<<<<<<<%<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:;;; MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:0 H1:i:1
-EAS51_62:7:196:511:896 83 chr2 446 99 35M = 283 -198 GAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCAT 8<<<<<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:52 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:1:154:118:488 163 chr2 447 99 35M = 624 212 AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:7<<<<7<:;;:: MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:2:44:153:969 83 chr2 447 95 35M = 245 -237 AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATC <<5<:7<72<51<7<*79<<<<<5<<<<<<<<<2< MF:i:18 Aq:i:36 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:4:215:246:640 99 chr2 447 99 36M = 624 213 AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCA <<<<<<<<<<9<;<<<<<<<<<<9;<<<<<<3;<;3 MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:7:94:1655:1921 147 chr2 447 85 35M = 258 -224 AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATC <<<<;:===<==;<==<;================; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:6:60:1037:1146 147 chr2 447 99 35M = 250 -232 AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATC <<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:1:23:536:229 99 chr2 448 99 35M = 614 201 AAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCA <<<<<<<<<<<<<<<<<:<8<:<<;<<<<<<7<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:6:130:865:838 163 chr2 448 99 35M = 649 236 AAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;:<;3 MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:2:239:1001:406 99 chr2 450 99 35M = 634 219 AGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGA <<<<<<7<<<<<<<<8<;<<<7<<<<36<<3<:33 MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:3:147:423:584 147 chr2 451 99 35M = 277 -209 GCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAA 27<;<3<<<+<<;<<<;;-4<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:1:187:715:521 83 chr2 451 99 35M = 291 -195 GCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAA <7<:<9<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:3:172:196:746 99 chr2 451 99 35M = 620 204 GCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAA <<<<<<<<9<<<<9<<<<<<<<<;<<<<6<<<<;< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:3:267:821:860 83 chr2 451 99 34M = 296 -189 GCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGA $&<<<.<:;6<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:3
-EAS56_61:7:7:682:201 83 chr2 452 99 35M = 288 -199 CATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAAT 0:8;5<8<1:78<<<<<<<<<<<<:8<<2<<<<:< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:3:82:13:897 163 chr2 453 99 35M = 606 188 ATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCAGCAGAATA <<<<;<<<<<<;<;<;5<51;<1<<<<%<<<<,58 MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_53:6:180:695:621 99 chr2 453 99 35M = 637 219 ATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;::<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:2:158:909:321 83 chr2 453 99 35M = 271 -217 ATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:2:237:497:165 99 chr2 454 99 35M = 619 200 TACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAA 8===<8===========37=<===7=;7=8===== MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:2:152:355:962 83 chr2 456 99 35M = 269 -222 CAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACA &<.9.<;+;<;<<<<<<<<<<::<<:<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS192_3:4:255:549:422 83 chr2 456 99 35M = 295 -196 AAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACA &<;;+<;4;<<<<<<<<<<<;<;<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:2
-EAS220_1:4:100:20:1199 163 chr2 456 99 35M = 614 193 CAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACA 7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:5:71:408:741 163 chr2 457 99 35M = 637 215 AGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:5:285:395:450 147 chr2 458 99 35M = 269 -224 GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAAT 8)3<8+;<)<<<<<<<<97:7<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:3:4:854:140 99 chr2 458 72 35M = 638 215 GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAAT <<<6<<<:<6<<<:36:<<<<3<<8:.6<38::4< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:6:227:657:95 147 chr2 458 99 35M = 280 -213 GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAAT ;3;<);<<<<<<<<<<<<18<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:7:57:324:546 83 chr2 458 99 36M = 281 -213 GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATG ;;5<;,<<<;;<<<<<<<97<<<<<<<<<<9<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:4:26:274:1078 83 chr2 458 99 40M = 282 -216 GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCT 9:*:64<<;<<<<<<<<<;8;<<:<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:6:107:636:642 163 chr2 458 99 35M = 630 207 GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:7:226:869:36 147 chr2 461 99 35M = 273 -223 ATATATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGG <0/)</<<<:<<<<<)<<7<<<<<+55<<1<<<:< MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:1 UQ:i:14 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:4:312:915:751 99 chr2 461 99 35M = 621 195 ATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGG <2<<<<<<<8;<<<<<<<<:<<<<8<<<<<84,4: MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_4:7:96:899:106 99 chr2 462 99 35M = 636 209 TCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:5:62:969:12 147 chr2 464 99 35M = 303 -196 TATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTT <<;<;<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:6:67:56:806 99 chr2 464 99 35M = 637 208 TATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<:7: MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:5:37:611:267 99 chr2 464 99 35M = 610 181 TATAAAGGAAATCCCATAAGAATAACAATGGGCTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_93:7:319:280:57 147 chr2 467 99 35M = 306 -196 AAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTC <<<<<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:8:96:720:940 163 chr2 467 99 35M = 654 222 AAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTC <<<<<<;<<<<<<<<<<;9<<8<<6<;:;<;;.;; MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:2:59:286:290 99 chr2 467 99 35M = 628 196 AAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTC <<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<;;;<<;7;< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:2:236:841:20 163 chr2 467 99 35M = 652 220 AAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTC <<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<:<<9<<<<;<:<9 MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:6:49:656:507 99 chr2 468 99 35M = 637 204 AAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<;9 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:4:78:1314:1275 147 chr2 469 99 35M = 277 -227 AGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAG <<<<<<<<6:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:6:181:392:500 147 chr2 470 99 35M = 299 -206 GGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGC /5<<;(88<<<;<;<<6<<<<<7<<<<<<<7<<<< MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:2:133:8:379 163 chr2 470 99 35M = 653 218 GGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8;<<8<<<:6< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:5:198:929:684 163 chr2 471 99 35M = 624 188 GAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCA <7<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<:<<<<::<:7 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:3:181:582:435 99 chr2 471 99 35M = 629 193 GAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;:: MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:1:214:784:690 99 chr2 472 99 35M = 657 220 AAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<4<44 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1 UQ:i:19 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:3:11:1238:1728 83 chr2 475 99 35M = 310 -200 TCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAA :677<;<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS112_34:4:12:273:89 163 chr2 477 99 35M = 631 189 CCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACC ==========<====:=========+===4414;; MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1 UQ:i:28 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:2:119:161:322 147 chr2 479 99 35M = 297 -217 ATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTT <83<;<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS114_30:2:111:142:21 83 chr2 479 99 35M = 304 -210 ATCAGAATAACAATGGGCTTCACAGCGGAAACCTT ;88<:<;;<6<;;<<<:<<<<;<<<<<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:2 UQ:i:53 H0:i:0 H1:i:0
-EAS1_99:1:34:649:318 83 chr2 481 65 35M = 328 -188 AAGAATAACAATGGGCTTCACAGCGGAACCCTTAC )<7<<3<<<<<<+<1<;<8&<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:65 NM:i:3 UQ:i:59 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_30:6:214:565:337 147 chr2 481 99 35M = 326 -190 CAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTAC ;;<;<1<9<<<8<<<<<;<<<<<<8<<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:6:226:370:91 147 chr2 482 99 35M = 335 -182 AGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACA <':<6<;<<<;2<;<-7;;;<<<<<<<;;;<<7;< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS139_11:6:13:682:680 99 chr2 482 99 35M = 685 238 AGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACA <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-B7_593:2:273:348:37 163 chr2 483 99 36M = 688 241 GAATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACACG <<<<<<<9<49<<<;<<<<*<<19<15;<</5<;.5 MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:13 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:8:76:205:587 83 chr2 483 99 35M = 306 -212 GAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACGA 8<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<</< MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:2 UQ:i:41 H0:i:0 H1:i:0
-B7_591:2:27:280:592 147 chr2 484 99 36M = 310 -210 AATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGC <<<<<<<<<<<8<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_99:7:171:196:287 163 chr2 485 99 35M = 658 208 ATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;6<<<<<<2:8<0: MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:2:224:579:433 163 chr2 485 99 35M = 662 212 ATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGC <<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<8<+8;: MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:1:22:490:2011 147 chr2 485 99 35M = 307 -213 ATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGC <7<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_65:6:46:173:214 83 chr2 487 99 35M = 308 -214 AACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCA <<2<<<<<<<<<<<5<<5<7<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:4 H1:i:6
-EAS1_103:4:164:79:134 99 chr2 488 99 35M = 656 203 ACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_32:2:283:577:398 147 chr2 488 99 35M = 308 -215 ACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAG ;8;;&<<<;<;67<;<;<<<<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:2
-EAS54_67:5:149:639:910 163 chr2 489 99 35M = 669 215 CAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;;<<;<<;< MF:i:18 Aq:i:42 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:3:250:628:423 83 chr2 489 99 36M = 295 -230 CAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAA +<<4;;9;;7.;7<;7<;<<<;;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_108:1:242:419:512 163 chr2 490 94 35M = 672 217 AATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAA <<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<8<(<30 MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS114_45:1:95:1530:28 83 chr2 490 74 35M = 332 -193 AATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAA 77741(9;;994;5;;4;;1;;;;;1;<;<<<<;< MF:i:18 Aq:i:9 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:42 H1:i:45
-EAS192_3:6:326:887:180 163 chr2 492 73 35M = 672 215 TGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGC ;<<<<<;<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<0<;;<+ MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:25 H0:i:3 H1:i:7
-EAS1_99:1:86:871:319 99 chr2 494 71 35M = 651 192 GGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGA <<<<<:<<<:<:<<<<<<<<<<<<8<<:<1;<::) MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:25 H0:i:0 H1:i:4
-EAS56_57:1:189:130:136 147 chr2 494 79 35M = 314 -215 GGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGA 823;23<7<57<7<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:63 H1:i:85
-EAS51_64:7:140:752:822 99 chr2 495 76 35M = 667 207 GCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGAT <<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<;<:; MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:5
-EAS56_57:5:53:544:889 147 chr2 495 76 35M = 335 -195 GCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGAT ,<;<<<;<<<<<<<<<:;;<<<<<;;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:2 H1:i:32
-EAS54_65:4:61:346:384 83 chr2 496 68 35M = 324 -207 CAACTAAGAAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATT 7&$+&,<<+;;<;;<<6<<8<<<;<<;<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:3 UQ:i:19 H0:i:1 H1:i:53
-EAS54_81:8:177:800:714 83 chr2 497 76 35M = 324 -208 TTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTG =;3=+=<:=<========8================ MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:29 H1:i:85
-B7_597:6:20:592:496 83 chr2 498 75 35M = 338 -195 TCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGG 97<7;<;<;<<<<;<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:5 H1:i:48
-B7_591:5:243:557:560 83 chr2 499 75 36M = 331 -204 CTAAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGAT 69&<;&<&<<;6.<<<+<<<;;<<<<<<<<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:9
-EAS188_7:5:163:982:695 147 chr2 499 77 35M = 339 -195 CTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGA <:<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:7 H1:i:42
-EAS139_19:1:1:1598:843 83 chr2 500 99 40M = 347 -193 TCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAAT 1)::6::<<;<98<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:1 UQ:i:25 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:6:78:1029:512 163 chr2 500 99 40M = 656 196 TCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAAT <0:;<<<<<<<<<:<<:;<<<;<7<<;<7;;;:6;::672 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:4:14:1872:1521 83 chr2 500 62 35M = 339 -196 TCATCAAAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGAT /1<%73&7<1<3577,<<<7/733<<<<<<<<1<< MF:i:18 Aq:i:2 NM:i:2 UQ:i:9 H0:i:1 H1:i:8
-EAS221_3:6:51:1486:1131 163 chr2 500 77 35M = 685 220 TCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGAT <<<<<<<<<;<<<<<<<<<1<5<<8<<<'<;<<;1 MF:i:18 Aq:i:3 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:22 H1:i:22
-EAS192_3:6:45:183:25 163 chr2 501 95 35M = 672 206 CAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<86;<;:; MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:2
-B7_597:4:38:999:463 147 chr2 503 39 35M = 317 -221 GCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTA .*:&<<0<0!<<+<<<<<<<<<<<<<0<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:2 UQ:i:25 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_45:1:30:1882:1210 163 chr2 503 82 35M = 665 197 GCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTA ;;::;;;;:;;;;;:;;;;;;9;;:7;;8:77777 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:0
-EAS1_108:6:222:579:961 163 chr2 504 99 35M = 679 210 CAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<:7;;;68 MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:1:92:875:345 163 chr2 504 99 35M = 690 221 CGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_63:8:62:125:888 83 chr2 504 99 35M = 347 -192 CGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAA ,;3<<<8;;3<,<<<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1 UQ:i:26 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:2:23:127:880 99 chr2 504 99 35M = 686 217 CGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS51_66:8:43:972:506 163 chr2 505 99 35M = 686 216 AGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAAT <;<<<<<<<<<<<<6;<;<<<<<<<<<<:;;<;<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:6:183:697:555 83 chr2 505 84 35M = 341 -199 AGAAATCTTAGAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAAT <<<;&,.;);&96<84<<81<<&<<<9<<8<8<<1 MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:2 UQ:i:16 H0:i:0 H1:i:1
-EAS221_3:8:65:463:703 99 chr2 506 99 35M = 693 222 GAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:7:101:752:996 163 chr2 508 99 35M = 687 214 AACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTT <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<9<<<<<<;<<;;;; MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:6:267:953:459 99 chr2 509 99 35M = 667 193 ACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTT <<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:8:33:1240:846 99 chr2 509 99 35M = 685 211 ACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTT <<<<<<<<<<<<7<<2<;<<;<<<;<<<:6:<<<: MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_32:7:135:401:735 99 chr2 510 99 35M = 703 228 CCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<8<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:6:3:186:68 99 chr2 512 99 35M = 687 210 TTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGTA <<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;;<<<<<&%8 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_78:7:164:727:977 163 chr2 513 99 35M = 689 211 TACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTCGAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<;;79; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:1 UQ:i:26 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:1:110:543:934 163 chr2 514 99 35M = 700 221 ACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACT <<<<<<<<<<<<;<<<<<;;<<<;;<<<<<,,;<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:4:329:339:408 147 chr2 515 99 36M = 325 -226 CAATCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTC 7<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:5:325:544:349 163 chr2 515 99 35M = 716 236 CAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6;;;<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:1:3:903:957 99 chr2 516 99 35M = 661 180 AAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTC <<<<<<<<<<<<<<<<;;<;<;<<<<<<66<;<<; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:1:85:361:418 147 chr2 517 99 36M = 353 -200 AGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTT ;;;5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:8:138:186:459 83 chr2 518 97 35M = 360 -193 GCCAGAAGAGATTGGAGCTAATTTTTGGACTTCTT +/2/;<:<&7:7</<2&<<<&<<<<<<<<<8<<:3 MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS139_11:4:36:1184:994 83 chr2 518 99 35M = 358 -195 GCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTT <84<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:2:270:430:269 83 chr2 519 99 36M = 331 -224 CCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAA 28<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:5:295:882:282 163 chr2 520 99 35M = 691 206 CAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAA ========================<6<======8; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:3:41:739:907 83 chr2 520 99 35M = 344 -211 CAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAA ;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:5:272:240:950 163 chr2 520 97 35M = 696 211 CAGCAGAGCTTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTCA 6<<&:<<<&<::;&7<<<3<;<<;<:;:<8:<<(< MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:3 UQ:i:17 H0:i:0 H1:i:0
-EAS54_65:7:155:629:357 83 chr2 521 99 35M = 333 -223 AGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAA <<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:14:88:306 147 chr2 521 99 35M = 341 -215 AGAAGAGATTAGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAA <1;<;<;<4<&<<<:<<<:<<<<;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_108:5:115:193:231 163 chr2 522 99 35M = 684 197 GAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<6<7 MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:1:88:1454:418 83 chr2 522 99 35M = 349 -208 GAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAG <<<<<<<<<<6<96<<<1911<<<1<<<<<<<<<1 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:5:36:649:554 83 chr2 523 99 35M = 350 -208 AAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGA <<<<<888;<<<;<<<;<;<8<<<<8<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:4:119:651:88 83 chr2 527 99 35M = 337 -225 GATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAA <<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:7:57:826:977 163 chr2 528 99 35M = 693 200 ATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAA <<<<<<<<<<<<<<<<+<<<<<<<<6<9:6<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:3:285:417:147 99 chr2 529 99 35M = 712 218 TTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAA <<<<<<<<<<<<<<<;8<<<<<<<<<;6<:<;<<; MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:8:160:130:351 99 chr2 530 99 35M = 697 202 TGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAA <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<4<<<<<;<<<:<<:< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:3:287:665:495 163 chr2 530 99 35M = 702 207 TGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAA ==========================98====8=8 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:6:71:187:824 147 chr2 534 99 35M = 367 -202 TCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCT 0040;<7<<<<0<7<<<;<7*<<<<<7<<771<<< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:8:70:445:1289 99 chr2 535 99 35M = 702 202 CTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTG <<<<<<<<<<2<<<<<<<<<<:<<<<<<<;;;;<: MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:7:41:745:603 83 chr2 536 99 35M = 360 -211 TAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGT ;<<;;<;<8<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:6:197:759:975 163 chr2 537 99 35M = 698 196 AATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<; MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:6:140:253:322 99 chr2 537 99 35M = 689 187 AATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTC <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;;;<<; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:5:58:684:520 147 chr2 538 99 35M = 367 -206 ATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCA <85;;:<<<7<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:6:19:306:982 147 chr2 538 99 35M = 368 -205 ATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCA <<<<<<<<<9<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:7:273:562:954 99 chr2 539 99 35M = 722 218 TTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;:;;;; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:5:78:775:555 99 chr2 539 99 35M = 691 187 TTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAA 6:<<<<:<<<<6:<<)::8<6<<:<<)<::63832 MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:2:49:330:699 163 chr2 540 99 35M = 722 217 TTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAA ==;=================;======5;;;==5= MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:2:329:437:643 147 chr2 540 99 36M = 354 -222 TTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAAC 885<8;;<;3,8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:1:125:884:276 83 chr2 541 99 35M = 362 -214 TTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAAC ,;;3,<7<;7<<===;============;====== MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:4:315:201:673 83 chr2 542 45 36M = 381 -197 TTGGACTTATTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACAC ;;;;<-;;&;;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-B7_597:3:10:394:392 147 chr2 542 99 35M = 376 -201 TTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACA 28-:;0-<0<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:1:228:736:747 83 chr2 542 68 35M = 381 -196 TTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACA <07<<&<;+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:4:267:394:437 163 chr2 544 99 35M = 735 226 GGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACG <<<<<<<<<<;<;<<<<<;;<<<<<;<<:;8<;<8 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:5:66:1381:181 83 chr2 544 99 40M = 362 -222 GGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGT ;;;+;;&<7<<<+<<<<<<<;<;8<<<;<<<<8<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:5:74:668:424 99 chr2 545 99 40M = 707 202 GACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTT ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;::;; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:4:322:350:374 83 chr2 546 99 35M = 360 -221 ACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAA <+;8&84<<<:<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:6:307:208:477 163 chr2 546 99 35M = 710 199 ACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAA <<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<88; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:2:228:915:631 83 chr2 547 66 35M = 381 -201 ATTATTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAAT &-))-*===/=========9====4========== MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:2 UQ:i:13 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:5:246:177:525 99 chr2 549 98 35M = 738 224 TCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<<<<<<;;;<8;; MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:7:93:634:323 99 chr2 550 99 35M = 721 206 CTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<,<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:8:165:441:708 163 chr2 550 99 35M = 737 222 CTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTT =<===============================99 MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:5:191:885:623 83 chr2 551 99 35M = 363 -223 TTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTA 66<<<<<<<<<<<<<2<<<<9<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:5:127:828:697 147 chr2 552 99 35M = 346 -241 TAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTAT ;<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:5:115:249:673 163 chr2 552 99 35M = 743 226 TAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<6< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:3:263:689:572 147 chr2 553 68 35M = 381 -207 AAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATG <9<2<<<<<<<<<22;;02<<<9<<;9<9<<;<<3 MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:1:99:1632:76 99 chr2 553 99 40M = 705 192 AAAGAAAAAAAACCCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTG <<<<<<<<<<<<*<<<<8<9<<<<<<<<<9;;;;<18:;: MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:9 H0:i:0 H1:i:1
-EAS54_71:7:250:698:842 163 chr2 554 99 35M = 753 233 AAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<24 MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:5:41:314:1173 99 chr2 554 99 35M = 718 199 AAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGC <;<<<<<<<;;<<<<<-<<<;;;<;8<*;;<<<<' MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:2:189:831:878 83 chr2 555 99 35M = 351 -239 AGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCC <9<<<<<<<<<<;9<:<<<<<6<<<<<<<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:6:216:47:302 99 chr2 557 99 35M = 729 207 AAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCT <<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<+<<<<<//6;< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:5:28:538:148 83 chr2 557 99 35M = 376 -216 AAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCT <<<<<<<<<<7;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:2:284:597:682 147 chr2 557 99 35M = 375 -217 AAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCT <<<<<<<<9;;7<;:<<<:<;<<<<<<<<;<<<<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:7:11:1261:1200 83 chr2 558 99 35M = 362 -231 AAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTG <<<<<<<:<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:3:246:711:981 147 chr2 559 99 35M = 371 -223 AAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGC ;;:;7<<:5:<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:1:208:971:600 83 chr2 559 99 35M = 382 -212 AAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGC <<<<<<<3*+<4/<<<<7<<<<0<<:<8<<<<0<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:5:219:174:684 83 chr2 560 71 35M = 390 -205 AAAAAAACTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCT <<<<:;+9<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:7:4:234:610 163 chr2 560 84 35M = 729 204 AAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTCCT <<<<<<<<7;<<<;7<7;7;7<;-<-<&<<<0%06 MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:5:271:874:367 83 chr2 560 99 35M = 384 -211 AAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCT <<<<<<5;<<<:<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:2:168:1878 99 chr2 560 37 35M = 743 218 AAAAAACCTGGCAAACACGAATGTTATGACATGTN ;<:;;<:<;<;<;;;;:;<;:::&9:&:68&6&*! MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:5 UQ:i:61 H0:i:0 H1:i:1
-EAS221_1:6:89:1164:573 147 chr2 560 99 35M = 371 -224 AAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCT 3<<<6<%7<<08<<4<3<<103<1<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:7:53:783:78 147 chr2 561 99 35M = 363 -233 AAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTA <;;;;<<0<,<<<<<<<<<;<<<;<;<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:4:30:570:902 163 chr2 561 99 35M = 730 204 AAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTA <<<<<<<<<<<;4<<:<<44<<<<<<<<<<<4<<+ MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:8:7:1864:1569 147 chr2 561 99 35M = 382 -214 AAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:5:89:942:84 163 chr2 562 74 35M = 759 232 AAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<; MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:6:122:589:134 83 chr2 562 99 35M = 369 -228 AAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAA ;<;4<<538<<;<<;<<<<';,:<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:6:77:1529:522 99 chr2 562 99 35M = 722 195 AAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAA <<;<<<<<<<<<<<4<<4<;;:;2:7<<<2*<;;8 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:8:48:805:860 99 chr2 563 78 35M = 755 227 AAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAA <<<<<<<;<<<<<<<41;<<8<<<<<<<8+<4,+; MF:i:18 Aq:i:13 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:4:144:492:61 99 chr2 564 99 35M = 728 199 AACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAAC <<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<7:<<<<::;9;;6 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:3:303:970:243 83 chr2 564 99 35M = 370 -229 AACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAAC <<0+<<<,<4<:<:<<<<<<<<<<<::<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:4:78:806:800 163 chr2 564 99 40M = 717 193 AACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<:<1<0<;<9;<:78:::: MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:7:94:1440:2016 163 chr2 564 99 35M = 751 222 AACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;;<<:<8:::75 MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:3:103:443:166 163 chr2 565 99 35M = 747 217 ACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<1<-;;;< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:24:284:360 83 chr2 567 76 35M = 390 -212 CTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAA :;<;:<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:3:166:626:836 163 chr2 567 99 35M = 757 225 CTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<;<;;;9 MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:4:110:840:431 83 chr2 567 93 35M = 388 -214 CTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAA 77<;7<<<<<<<<<4<<<<<<<:<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:4:116:738:142 99 chr2 568 99 35M = 722 189 TGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<:;2 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:8:55:932:613 83 chr2 568 77 35M = 389 -214 TGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:7:137:139:248 83 chr2 569 97 35M = 401 -203 GTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGC ;;;99<<<;<;;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:1:34:1614:558 147 chr2 569 99 35M = 411 -193 GTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGC <<9<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:7:15:696:693 83 chr2 570 10 35M = 403 -202 TCAAACACGAATGTTAATCCCTGCTAAACTAATCA )6<:7<.7<6.<0&&<&3:&7<<7<0<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:3 UQ:i:50 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_28:3:32:492:907 147 chr2 571 95 36M = 387 -220 CAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATC 8<;<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:1:114:19:769 83 chr2 572 90 35M = 405 -202 AAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATC 5+;+3/6;<+;/8<8*/<7/59<97147<;;9<7< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:3:182:104:921 147 chr2 575 99 35M = 378 -232 CACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATA ;<;<<<<<<:<<<<<:<<:<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:8:5:996:2000 83 chr2 575 99 35M = 408 -202 CACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATA <<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:5:109:199:592 83 chr2 576 72 35M = 390 -221 ACGAATATTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAA ;9<9<:&:<<<<;;<;;<<<<<<<<<;<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:3:90:219:528 163 chr2 576 75 35M = 758 217 ACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<9 MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:6:94:294:387 163 chr2 578 99 35M = 736 193 GAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAAT <<<<<<<;<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<;)7;; MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:1:33:779:821 83 chr2 579 99 35M = 416 -198 AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATG <<730<<<<9<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:5:43:114:617 163 chr2 579 99 35M = 738 194 AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATG =============;=========;=========== MF:i:18 Aq:i:52 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:5:23:944:377 99 chr2 579 75 36M = 757 214 AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGA <<<<<<<<9<<<<;<<<<<<<<<;<7<<<<;8;<<; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:3:864:1888 147 chr2 579 99 35M = 411 -203 AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATG 888588;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;;;;;;; MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:4:26:137:1382 147 chr2 579 99 35M = 397 -217 AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATG <<-<8<<<<<<:<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:6:265:251:147 163 chr2 581 99 35M = 754 208 TGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAA <<<<<<<<<<<<<<88<<<80:;<<<<<;:4;;:4 MF:i:18 Aq:i:50 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:5:184:912:258 147 chr2 582 99 35M = 428 -189 GTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAG <;;<<<<;:<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:3:115:646:430 99 chr2 582 45 35M = 768 217 GTTATGCCCTGCTAAACTTAGCATCATAAATGAAG <7<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<7<<<<;5;<;67< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_108:3:24:319:429 163 chr2 582 99 35M = 740 193 GTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAG <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<1<<-6<<</< MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:8:49:182:192 99 chr2 582 99 35M = 750 203 GTTATGCCCTGCTAAACTGAGCATCATAAATGAAG =====================;============< MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:1 UQ:i:28 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_45:1:100:979:1863 99 chr2 583 85 35M = 757 209 TTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGG ;<;;;;;;;7;;;79;;77;9;;99;974;677-6 MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:7:53:458:581 73 chr2 583 77 35M = 583 0 TTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:7:53:458:581 133 chr2 583 0 * = 583 0 CTCAATTAATTGTTTTATAAAACCTGTGAGTTTTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<99<<<<< MF:i:192
-B7_589:6:108:958:42 163 chr2 584 81 35M = 755 206 TATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<<<<<<9<<;<5<: MF:i:18 Aq:i:9 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:6:89:457:591 99 chr2 585 69 35M = 770 216 ATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGG <<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<8<7/4<<<<4+ MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:7:87:1289:83 83 chr2 585 99 35M = 413 -207 ATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGG <<<::<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:1:84:1505:1037 147 chr2 586 99 35M = 409 -212 TGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGA <<966<<7<<<<7<<<<9<<;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:3:197:261:624 147 chr2 587 99 35M = 398 -224 GCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAA 866;2:/;<<<;:<<<;<;;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:6:118:41:489 163 chr2 588 76 35M = 779 226 CCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAA <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<95: MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:3:157:361:309 99 chr2 589 99 35M = 747 193 CCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<;<<;< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS114_39:6:71:644:1792 163 chr2 589 84 35M = 754 200 CCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAAT <<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<;:<:< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-B7_589:2:9:49:661 163 chr2 591 99 35M = 747 191 TGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGCGGAAATAA <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;:<<;;;7<9;9 MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS54_71:2:85:686:696 83 chr2 594 99 34M = 435 -193 TAAACTAAGCATCATAAATGAAGTGGAAATAAAG :<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS188_7:1:177:522:118 69 chr2 594 0 * = 594 0 TCTCAATTAATTGTTTTATAAAACCTGTGAGTTTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<57<<<< MF:i:192
-EAS188_7:1:177:522:118 137 chr2 594 49 35M = 594 0 TAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_4:5:103:870:105 99 chr2 595 44 35M = 778 214 AAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<;<<7; MF:i:18 Aq:i:44 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS51_62:8:52:967:804 73 chr2 596 76 35M = 596 0 AACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:8:52:967:804 133 chr2 596 0 * = 596 0 TTACCTAGTTGCTCTGTAGTCTCAATTAATTGTTT ===============<=======<<===<====== MF:i:192
-EAS1_108:6:95:235:746 83 chr2 598 99 35M = 430 -203 CTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAG ==&=;===7=3===8======;=;8===8=====; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:7:124:253:889 83 chr2 598 99 35M = 437 -196 CTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAG 8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:6:174:650:125 99 chr2 600 76 35M = 770 201 AAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:3:39:348:594 83 chr2 600 99 35M = 431 -204 AAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTC <<;;<;:<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:4:92:693:228 99 chr2 601 75 35M = 770 200 AGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;9<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:3:285:349:797 163 chr2 604 76 35M = 773 200 ATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:3:82:13:897 83 chr2 606 99 35M = 453 -188 CATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCT ,<2<;<<;<<<<;;;<<;<<<<<<<;;;;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:7:310:155:312 83 chr2 606 99 35M = 438 -203 CATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCT 2;<<;<<;<<;;/<<<<<<;<<<<8<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:8:45:178:1321 163 chr2 606 77 35M = 771 196 CATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:2:193:420:78 99 chr2 607 99 35M = 787 215 ATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<; MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:1:131:518:588 83 chr2 607 99 35M = 433 -209 ATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTG <.<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:8:45:800:733 83 chr2 607 99 35M = 413 -229 ATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTG <7<<7&<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:34 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:4:70:766:2016 83 chr2 607 99 35M = 422 -220 ATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:2:2:1217:398 163 chr2 608 99 40M = 780 212 TAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGC <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<7<<<3<<<<;<<<<9:7:: MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:3:73:1458:1337 163 chr2 609 99 35M = 806 232 AAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGAC <<<<<;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<7;;;; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:2:104:402:732 83 chr2 610 99 35M = 434 -211 AATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:5:37:611:267 147 chr2 610 99 35M = 464 -181 AATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACA <<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:7:78:692:671 147 chr2 610 99 35M = 438 -207 AATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACA <<);<<;;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:1:144:242:602 83 chr2 611 99 36M = 436 -211 ATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:5:6:1243:981 69 chr2 611 0 * = 611 0 TTACCTAGTTGCTCTGTAGTCTCAATTAATTGTTT <<<<8<<8<<<<2<<<<<<<<8<55<<8*<<8<<< MF:i:192
-EAS219_FC30151:5:6:1243:981 137 chr2 611 68 35M = 611 0 ATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAA <;<;;<<<;3;;3<<<;<<;<7%<<<.1<<<..<3 MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:3:291:404:199 163 chr2 612 76 36M = 777 197 TGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<: MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:266:994:429 99 chr2 612 76 35M = 769 188 TGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAG =====================9=======4===:= MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:7:159:253:353 163 chr2 613 67 35M = 778 196 GAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAGGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<0,%4(+, MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:1 UQ:i:7 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:5:175:149:296 163 chr2 614 99 35M = 811 232 AAGGGGAAATAAAGTCAAGCCTTTCCTGACAAGCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<49<<<<<<<<<<<<;4 MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:19 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_65:1:23:536:229 147 chr2 614 99 35M = 448 -201 AAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCA <<99<<<<<;<<<;2<<<<<<;<<<9<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:4:100:20:1199 83 chr2 614 99 35M = 456 -193 AAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCA :<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:5:181:713:140 99 chr2 615 84 35M = 793 213 AGGGGAAATAAAGTCAAGTATTTCCTGACAAGCAA <7<<<<<<<<<<<<7<7<6+<<<5;<;<2<;;+;; MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:0 H1:i:1
-EAS139_19:6:82:1051:921 163 chr2 616 99 40M = 800 224 GGGGAAATAAAGTCAAGGCTTTCCTGACAAGCAAATGCTA <<<<<9<799<<<<7::/<<<9<7:9:;2:7552+9''66 MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:14 H0:i:0 H1:i:1
-EAS192_3:3:309:187:267 163 chr2 616 99 35M = 786 205 GGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<;<;68;;8 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:3:115:649:259 99 chr2 617 99 36M = 782 201 GGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<9 MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:4:261:267:597 163 chr2 617 86 35M = 787 205 GGGTAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAAT <<<<<<<<<;<<<<<7<<<<<<<<<:7<7<;44:; MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_26:4:123:1001:580 163 chr2 617 43 35M = 771 185 GGGAANTAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAAT =====!=====================1.8131*= MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:1
-EAS139_11:7:60:163:1612 83 chr2 617 99 35M = 439 -213 GGGAACTAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAAT -<<<<)<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:1 UQ:i:8 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:4:325:795:213 163 chr2 618 99 35M = 790 207 GGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATG <<<<<<<;<<<<;;<<<<<<<<<<<<;:<</;/;; MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:3:165:665:220 163 chr2 618 76 35M = 779 196 GGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;<<<;;<;<<; MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:4:22:206:150 163 chr2 619 99 35M = 792 208 GAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGC ==========================::=5&;<2< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:2:237:497:165 147 chr2 619 99 35M = 454 -200 GAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGC 9=:=======2=27======<>&<=,==4>4=>>= MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:8:82:1540:77 163 chr2 619 99 35M = 786 202 GAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<:8 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:3:172:196:746 147 chr2 620 99 35M = 451 -204 AAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCT <<<;><<+<<<<:<<<<2<;<<<;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:7:97:892:419 163 chr2 621 99 35M = 800 214 AATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:4:312:915:751 147 chr2 621 99 35M = 461 -195 AATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAAAGCTA <:-<<<99:::);:7<4;8<<<<<<<;<2<+8<;< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_93:4:325:352:67 163 chr2 622 99 35M = 794 207 ATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAA ==================<========<=<;-=== MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:4:83:731:540 99 chr2 623 99 35M = 804 216 TAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAG <<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<:<7<*;&;<;;9 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:5:74:329:459 163 chr2 623 99 35M = 795 207 TAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;9;599 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:3:13:674:1717 83 chr2 623 99 35M = 445 -213 TAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:1:141:415:738 69 chr2 624 0 * = 624 0 TTACCTAGTTGCTCTGTAGTCTCAATTAATTGTTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<8<<< MF:i:192
-EAS1_105:1:141:415:738 137 chr2 624 76 35M = 624 0 AAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;<<;<<<<6: MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:1:154:118:488 83 chr2 624 99 35M = 447 -212 AAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGA <<<;58<<95:<<;<;<<<;<<<;;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:5:198:929:684 83 chr2 624 99 35M = 471 -188 AAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGA <<;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:4:215:246:640 147 chr2 624 99 36M = 447 -213 AAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGAT ;<<,<<<96<<:<:<9<6<97<<<<<9<<<<9<<9< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:2:234:167:381 83 chr2 625 99 35M = 443 -217 AAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGAT <<;<;<<<<;<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:7:96:489:453 147 chr2 625 99 35M = 445 -215 AAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGAT ;<;;;<<<<5:<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:3:79:879:15 99 chr2 626 99 35M = 790 199 AGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<;<<1< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:2:59:286:290 147 chr2 628 99 35M = 467 -196 TCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAAT 77<<<<7<<<97<<,7<<<;<<<;<9<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:5:263:511:936 99 chr2 629 99 35M = 801 207 CAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATT <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<:<:<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:3:181:582:435 147 chr2 629 99 35M = 471 -193 CAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATT <<<<<<<<;<<<<<;<<4<<<<<<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:6:107:636:642 83 chr2 630 99 35M = 458 -207 AAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTC <<<<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:4:12:273:89 83 chr2 631 99 35M = 477 -189 AGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCA <:737<288<<<7<<<<<<<<<:9<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:2:239:1001:406 147 chr2 634 99 35M = 450 -219 CTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCA 0':.71;;:9==9=;====;=;============= MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_4:7:96:899:106 147 chr2 636 99 35M = 462 -209 TTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATC ;;;;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:6:67:56:806 147 chr2 637 99 35M = 464 -208 TCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCA 844:8;7<88;8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:5:71:408:741 83 chr2 637 99 35M = 457 -215 TCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCA ;7;<;<0<<<<<<<<:;<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:6:180:695:621 147 chr2 637 99 35M = 453 -219 TACTGAAAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCA ;&377<&<<;7<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:2 UQ:i:10 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:6:49:656:507 147 chr2 637 99 35M = 468 -204 TCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCA %44;;<:<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:3:4:854:140 147 chr2 638 72 35M = 458 -215 CCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCAC :9':<;<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:1:85:1521:58 99 chr2 639 99 40M = 813 214 CTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACC <<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<;;:7: MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:2:57:1064:925 137 chr2 640 76 35M * 0 0 TGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<< MF:i:32 Aq:i:29 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:3:323:196:855 163 chr2 642 99 35M = 809 202 ACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAA <<<<<<<7<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<;7: MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:5:117:33:262 163 chr2 642 99 35M = 814 207 ACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAA <<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:1:59:742:549 99 chr2 642 99 35M = 816 209 ACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8< MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:2:55:562:403 163 chr2 643 99 36M = 825 218 CAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<<;<;: MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:7:97:743:602 163 chr2 644 99 35M = 821 211 AAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<: MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:2:167:905:852 83 chr2 647 99 36M = 445 -238 CAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTC +<<<9;7;<<+<<<<<39<;9<;9<<7<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:6:130:865:838 83 chr2 649 99 35M = 448 -236 AATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCC ;<:84<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:1:60:1420:660 163 chr2 649 99 35M = 808 194 AATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<8<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:3:180:89:582 99 chr2 650 99 36M = 809 195 ATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTA <<<<<<<<<7<<<<<<<<<7<<<:<<<:<<::77:< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:1:86:871:319 147 chr2 651 71 35M = 494 -192 TGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTA 7;+1;<:<<<<<<<<;<<;<<9<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:2:236:841:20 83 chr2 652 99 35M = 467 -220 GCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTAT 7;<<<;<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:2:133:8:379 83 chr2 653 99 35M = 470 -218 ATAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATA &=========='==7==0=2====28===00==== MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:8:96:720:940 83 chr2 654 99 35M = 467 -222 TAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAA *<<<<;<<<9<<;,<;0<;<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:71:994:576 99 chr2 655 99 35M = 805 185 AAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<5<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:4:164:79:134 147 chr2 656 99 35M = 488 -203 AGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGA <;<;<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:6:78:1029:512 83 chr2 656 99 40M = 500 -196 AGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGC ;;;;;<;;<<<.<<6;<<;<;8<<<<::<<<<<<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:1:214:784:690 147 chr2 657 99 35M = 472 -220 GATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAA -<7<<7<:<<2<<<<;<<<<<;<<<<3<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS220_1:4:6:1178:1105 99 chr2 657 93 35M = 830 208 GATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAA <<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:7:171:196:287 83 chr2 658 99 35M = 485 -208 ATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAA <;;;98;<;&<;;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:1:220:801:282 99 chr2 660 99 36M = 837 213 AATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<+<;<<<<<::<<: MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS221_1:2:73:955:728 163 chr2 660 44 35M = 823 198 AATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:14 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS1_105:1:3:903:957 147 chr2 661 99 35M = 516 -180 ATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGC <%12<&<<<;<:<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS56_65:2:224:579:433 83 chr2 662 99 35M = 485 -212 TTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCT '<08/8<+<</<<:<<<<<8<<9<38<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:5:209:824:866 163 chr2 665 73 35M = 828 198 ATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:1:30:1882:1210 83 chr2 665 82 35M = 503 -197 ATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAA 776778;5;;;;8;;7:8;;;;;;;<<<;;;;;<; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:4:181:476:394 163 chr2 666 99 35M = 847 216 TCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<:<<<:;; MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:6:267:953:459 147 chr2 667 99 35M = 509 -193 CATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAA %<07<94========<<================== MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:7:140:752:822 147 chr2 667 76 35M = 495 -207 CATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAA ;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_32:7:322:391:742 99 chr2 667 99 35M = 847 215 CATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:5:149:639:910 83 chr2 669 99 35M = 489 -215 TCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGA <;49;<<;;<<<<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:42 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:1:242:419:512 83 chr2 672 94 35M = 490 -217 CTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATT *:<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:6:45:183:25 83 chr2 672 95 35M = 501 -206 CTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATT ;1<<;<<<;;;;<<<<<+<<<<<<<<<9<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:6:326:887:180 83 chr2 672 73 35M = 492 -215 CTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATT 8:<<:<5<<<;7<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:5:145:635:390 163 chr2 673 99 35M = 860 222 TAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<8<<<::;;; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:2:31:628:1820 163 chr2 675 98 35M = 828 188 AACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:7:117:452:744 163 chr2 676 99 35M = 850 209 ACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAA <<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<:<<<<<<<;; MF:i:18 Aq:i:50 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:2:297:949:26 163 chr2 676 99 35M = 842 201 ACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:8:17:437:1378 163 chr2 676 99 35M = 847 206 ACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:6:222:579:961 83 chr2 679 99 35M = 504 -210 AGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAG =58====;==8=======;================ MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:5:98:995:929 163 chr2 680 99 35M = 844 199 GTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGT <;<;<8<;<<;1;<<<<<;<;;;08;<;<1&0+8< MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:2:76:1765:700 163 chr2 680 99 35M = 866 221 GTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGT ;;6;;;;;;;;;6;;;;6;;;;;;;;;;;;88878 MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:5:68:306:409 99 chr2 682 99 40M = 856 214 CCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;:;; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:5:115:193:231 83 chr2 684 99 35M = 522 -197 TATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAA =========7===========<============= MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:4:57:1675:720 99 chr2 684 99 35M = 841 192 TATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:6:13:682:680 147 chr2 685 99 35M = 482 -238 ATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAA <<<<<<<<<<:<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:6:51:1486:1131 83 chr2 685 77 35M = 500 -220 ATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAA <<<<<<<<<<,<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<< MF:i:18 Aq:i:3 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:8:33:1240:846 147 chr2 685 99 35M = 509 -211 ATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAA <<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:8:43:972:506 83 chr2 686 99 35M = 505 -216 TAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAAT ;<<<<<<<+;<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:2:23:127:880 147 chr2 686 99 35M = 504 -217 TAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAAT <<<<<<<<<%<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:7:101:752:996 83 chr2 687 99 35M = 508 -214 AAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATT <<<<<<<<7<7<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:6:3:186:68 147 chr2 687 99 35M = 512 -210 AAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATT <<;<<<<<&:,<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:2:273:348:37 83 chr2 688 99 36M = 483 -241 AGAAATGCGCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAA 9;7;;0<++1<<<;<7<+;;1<<<;<17<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:0 H1:i:1
-EAS51_78:7:164:727:977 83 chr2 689 99 35M = 513 -211 GAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAA ;<;<;<:<:<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:6:140:253:322 147 chr2 689 99 35M = 537 -187 GAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAA =;===;54:====================>>===> MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:2:146:374:692 99 chr2 690 99 35M = 874 219 AAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAA <<<<<<<<<<<<<<<</<<<<<<<<<<<<<<<<<: MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:1:92:875:345 83 chr2 690 99 35M = 504 -221 AAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAA <<<;<.;7<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:6:45:601:439 163 chr2 691 99 35M = 864 208 AATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAG <<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<4<<<<9<<<<<<;; MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:5:295:882:282 83 chr2 691 99 35M = 520 -206 AATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAG <<:<8<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:5:78:775:555 147 chr2 691 99 35M = 539 -187 AATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAG <<-<%4/<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<0<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:5:255:796:239 99 chr2 692 99 35M = 869 212 ATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGT <<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<;6<<<:<:<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:7:57:826:977 83 chr2 693 99 35M = 528 -200 TGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTT 875:6<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;8<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:6:187:996:432 99 chr2 693 99 36M = 860 203 TGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<; MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:8:65:463:703 147 chr2 693 99 35M = 506 -222 TGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTT <<3<9<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:1:288:384:444 163 chr2 696 99 35M = 855 194 TCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:5:272:240:950 83 chr2 696 97 35M = 520 -211 TCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAA 37<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:8:160:130:351 147 chr2 697 99 35M = 530 -202 CAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAAT 4<;;<;<<<-<<<<<<<<<<;;<<<<;<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:7:189:530:40 163 chr2 698 99 36M = 883 221 AAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATAC <<<<<<<<<<;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<;<<<; MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:7:168:247:414 99 chr2 698 99 35M = 876 213 AAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATA <<<<<<<<<<<<<<<<*<<<<<<<<<;:6<<<<<; MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:6:197:759:975 83 chr2 698 99 35M = 537 -196 AAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:5:29:411:1208 99 chr2 698 99 40M = 882 224 AAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCAC <<<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:1:110:543:934 83 chr2 700 99 35M = 514 -221 AAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACT <<<<<5<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:3:287:665:495 83 chr2 702 99 35M = 530 -207 GAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCA ===,9=;;====7=====5===;==1========= MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:8:70:445:1289 147 chr2 702 99 35M = 535 -202 GAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCA <<<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:6:172:827:592 163 chr2 703 99 35M = 899 231 AATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCAC =;=======;==;===:==========;==9<<.3 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_32:7:135:401:735 147 chr2 703 99 35M = 510 -228 AATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCAC <<::7<<<<<<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:39:208:644 99 chr2 704 99 35M = 859 190 ATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACC <;<<<<<;;:<<;;<<<<<<;;;;;;.<;<79997 MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:1:99:1632:76 147 chr2 705 99 40M = 553 -192 TTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATA 4641::<<4<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:2:52:1144:509 99 chr2 706 99 35M = 867 196 TGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<;<<;<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:7:116:157:612 99 chr2 707 99 35M = 889 217 GTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:1:36:481:1079 163 chr2 707 99 40M = 881 214 GTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::::8 MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:5:74:668:424 147 chr2 707 99 40M = 545 -202 GTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAA :::::<<96<<<<<;<<<;<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:7:122:398:994 163 chr2 708 99 35M = 871 198 TAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCA <:<9<<<<<<4<<<;9<<<<<98<;<<<:;<;<;7 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:4:36:1231:1381 99 chr2 708 99 35M = 891 218 TAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:5:57:366:844 163 chr2 708 99 40M = 877 209 TAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::::7: MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:6:307:208:477 83 chr2 710 99 35M = 546 -199 AAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATA <<<<<.<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:3:285:417:147 147 chr2 712 99 35M = 529 -218 AGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAA <..)<<<<;<<<<7<;-<<;<<<<<;8<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:5:325:544:349 83 chr2 716 99 35M = 515 -236 AAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACA <<<<57<<<7<;6<<<<;<7<7;<<7<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:2:33:357:858 163 chr2 716 99 35M = 870 189 AAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACA <<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<:<<<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:4:78:806:800 83 chr2 717 99 40M = 564 -193 AAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA ::;9:<<<;<<:<<<<:<.<1:<<1<<<<<<;<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:5:41:314:1173 147 chr2 718 99 35M = 554 -199 AATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACA <<2**<<82/<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:2:82:963:128 163 chr2 719 99 35M = 905 221 ATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;<<; MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:8:240:719:799 99 chr2 720 99 35M = 900 215 TTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:7:93:634:323 147 chr2 721 99 35M = 550 -206 TAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAA <<<<;<;<<<<;;<<2<:<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:2:12:1335:1372 163 chr2 721 99 40M = 906 225 TAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<99::.: MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:4:116:738:142 147 chr2 722 99 35M = 568 -189 AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA <:<7;+:<<:<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:2:49:330:699 83 chr2 722 99 35M = 540 -217 AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA ===/=;========;=;================== MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:7:273:562:954 147 chr2 722 99 35M = 539 -218 AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA ;<<+;95<<<;5;<<;:<<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:6:77:1529:522 147 chr2 722 99 35M = 562 -195 AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA <<<;7;,<<<<<<.<,6<<6<<<<<<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:2:67:1467:1447 163 chr2 722 99 35M = 898 211 AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:2:251:819:772 99 chr2 726 99 36M = 881 191 TTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTAC <3<<<9<9<3<</<<<<<<59<3<9<<</9/++*/' MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:4:144:492:61 147 chr2 728 99 35M = 564 -199 AAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACA +;;3;,:7<:;<<7<<<<<<<;;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1 UQ:i:11 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:7:200:65:291 99 chr2 728 99 35M = 930 237 CAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACA <<<<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<8<<<<:<;< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:2:130:609:467 99 chr2 728 99 35M = 877 184 CAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACA ==8=====;==8==;=4=;;8=====;6=177.== MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:6:216:47:302 147 chr2 729 99 35M = 557 -207 AATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACAA <<;<8<:<6<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:7:4:234:610 83 chr2 729 84 35M = 560 -204 AAAAATCAACATCACAAATACACACAAAAGTACAA <:+:'+&<+'<+'2&<:<7<2<':2<:<<7<7<<< MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:4 UQ:i:31 H0:i:0 H1:i:0
-EAS54_81:8:271:180:509 99 chr2 729 99 35M = 896 202 AATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACAA =============================='==== MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:8:41:530:663 163 chr2 730 99 35M = 908 213 ATACTCACCATCATAAATACACACAAAATTACAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;;;;<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:1 UQ:i:22 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:4:30:570:902 83 chr2 730 99 35M = 561 -204 ATACTCACCATCATAAATACGCACAAAAGTACAAA <:<6:6<&:<<6<<<<<<<<.<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:13 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_105:1:87:430:995 99 chr2 731 67 35M = 909 213 TACTCACCATCATAAATACACACAAAATTACAAAA <<;<<7;;;<;<<777;7(77;;1;7;%117;,7( MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_28:7:215:863:521 163 chr2 732 99 36M = 890 194 ACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<; MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:4:267:394:437 83 chr2 735 99 35M = 544 -226 AAACATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCA &<&,<8.<;<<<;<8<8<7<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:2 UQ:i:10 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:6:94:294:387 83 chr2 736 99 35M = 578 -193 ACCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCAC 779=53=9===;=:=;=========;========= MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:6:38:332:54 163 chr2 737 99 36M = 904 203 CCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAG <;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<0;;;<;; MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:8:165:441:708 83 chr2 737 99 35M = 550 -222 CCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACA 6+<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:5:246:177:525 147 chr2 738 98 35M = 549 -224 CATCATAAATACACACAAAAGTAAAAAACTCACAG %<(4<2<<<<<:<;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_26:5:43:114:617 83 chr2 738 99 35M = 579 -194 AATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAG +=22=6=================9=========== MF:i:18 Aq:i:52 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:8:152:778:228 163 chr2 739 99 35M = 915 211 ATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<; MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:3:24:319:429 83 chr2 740 99 35M = 582 -193 TAATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGT 0%=3%=3====<=9=====89==93==9=6===== MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:5:210:674:911 99 chr2 740 99 35M = 904 199 TCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<; MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:88:451:1773 99 chr2 742 99 35M = 902 195 ATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTT ;;:::<:;:<<;:6::;:;;:::;;<;;;367177 MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:2:168:1878 147 chr2 743 37 35M = 560 -218 TAAATACACACAAAAGTAGAAAACGCACCAGTTTT *3/6)9.;;;;;;;;5;;);;;3;(;;;+(;7.)3 MF:i:130 Aq:i:37 NM:i:4 UQ:i:32 H0:i:0 H1:i:0
-EAS188_7:5:115:249:673 83 chr2 743 99 35M = 552 -226 TAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTT :<<<;<<<;<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:8:178:187:610 99 chr2 744 99 35M = 903 194 AAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:2:9:49:661 83 chr2 747 99 35M = 591 -191 TACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAA <<6<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:3:157:361:309 147 chr2 747 99 35M = 589 -193 TACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAA :<-<5<0<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:3:103:443:166 83 chr2 747 99 35M = 565 -217 TACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAA 7<4<4<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:8:49:182:192 147 chr2 750 99 35M = 582 -203 ACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAAC <5<;<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:3:12:630:707 99 chr2 751 99 35M = 915 199 CACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:7:94:1440:2016 83 chr2 751 99 35M = 564 -222 CACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACA :<8<<<<9<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:206:741:810 163 chr2 753 99 35M = 929 210 CAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:-;<< MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:7:250:698:842 83 chr2 753 99 34M = 554 -233 AAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAA )<<<<<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1 UQ:i:8 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:6:265:251:147 83 chr2 754 99 35M = 581 -208 AAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATT <<<<::<8<<<;<;8<8<<<<<<<<:<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:50 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:6:71:644:1792 83 chr2 754 84 35M = 589 -200 AAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATT <<<<;<<<<<<:;/<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:6:108:958:42 83 chr2 755 81 35M = 584 -206 AAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTA <<<;;</<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+ MF:i:18 Aq:i:9 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:3
-B7_597:8:48:805:860 147 chr2 755 78 35M = 563 -227 AAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTA <<<;3<;7<<97<7<<<<7<4<<<<<<<<<<;8<+ MF:i:18 Aq:i:13 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:3
-B7_591:3:179:496:161 163 chr2 756 99 36M = 919 199 AAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+ MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:2 UQ:i:53 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:3:166:626:836 83 chr2 757 99 35M = 567 -225 AGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAAT <;;7<<<<<<;<7;<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<+ MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:2 UQ:i:54 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_28:5:23:944:377 147 chr2 757 75 36M = 579 -214 AGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATT <;7;8<<<<:<;<:<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<; MF:i:130 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_45:1:100:979:1863 147 chr2 757 85 35M = 583 -209 ATTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAAT 6&,*3;6;66;9(572692;;;79;4)9;96;59+ MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:3 UQ:i:51 H0:i:0 H1:i:0
-EAS219_1:3:90:219:528 83 chr2 758 75 35M = 576 -217 GTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATT ;:<5<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS1_108:5:89:942:84 83 chr2 759 74 35M = 562 -232 TACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATTG ===================>=>>>==>>===>==> MF:i:130 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS1_108:6:159:493:275 99 chr2 760 72 35M = 939 214 ACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGA =====3============================= MF:i:130 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS139_11:1:81:1019:558 163 chr2 760 77 35M = 926 201 ACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGA <<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7< MF:i:130 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS51_62:7:162:195:761 163 chr2 767 30 18M4I13M = 922 190 TCACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<<<;; MF:i:130 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-B7_597:3:115:646:430 147 chr2 768 45 17M4I14M = 582 -217 CACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAG 5;5<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_30:6:243:209:110 163 chr2 768 48 17M4I14M = 920 187 CACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAG <<<<<;<;<<<;<<<<<<<<<<<;<:;<<:;;+85 MF:i:130 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS1_108:2:266:994:429 147 chr2 769 76 16M4I15M = 612 -188 ACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGA </<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_30:5:32:461:154 99 chr2 769 71 16M4I15M = 945 211 ACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGA <<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<+<;; MF:i:130 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_39:6:7:492:1088 99 chr2 769 57 16M4I15M = 926 192 ACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<:<<<<<<6; MF:i:130 Aq:i:57 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS1_95:6:174:650:125 147 chr2 770 76 15M4I16M = 600 -201 CAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAG ===;=============================== MF:i:130 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS56_59:6:89:457:591 147 chr2 770 69 15M4I16M = 585 -216 CAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACATAG 797<<9<<<<<<<3<7<<<<<<<<<<)<<<<<07< MF:i:130 Aq:i:69 NM:i:1 UQ:i:15 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_39:2:38:670:564 99 chr2 770 73 15M4I16M = 930 195 CAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<<<;<5<; MF:i:130 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS188_7:4:92:693:228 147 chr2 770 75 14M4I17M = 601 -200 AAGGTTTTATAAAAAAATTAATTGAGACTACAGAG 6=77=<<=======&==================== MF:i:130 Aq:i:75 NM:i:1 UQ:i:28 H0:i:0 H1:i:0
-EAS218_1:4:61:1369:440 163 chr2 770 47 15M4I16M = 964 229 CAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<8 MF:i:130 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_26:4:123:1001:580 83 chr2 771 43 14M4I17M = 617 -185 AGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGC <.00..3<6<<<<<<<3;<<08<<<<<6<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_39:4:10:1312:1558 163 chr2 771 76 14M4I17M = 928 192 AGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGC 5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<;8;< MF:i:130 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS220_1:8:45:178:1321 83 chr2 771 77 14M4I17M = 606 -196 AGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGC <<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:<<<<<<<<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS56_59:5:125:137:58 163 chr2 772 76 13M4I18M = 932 195 GGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<9;< MF:i:130 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS192_3:3:285:349:797 83 chr2 773 76 12M4I19M = 604 -200 GTTTTAAAAAACCAATAATTGAGACTACAGAGCAA ;;<<<7.:<<<..<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:76 NM:i:1 UQ:i:13 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_45:5:56:1757:1319 163 chr2 775 67 10M4I21M = 957 217 TTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACT ;;;;9;;;;;;;;;;;;;4;9;98;;;;;9388&7 MF:i:130 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-B7_591:3:291:404:199 83 chr2 777 76 8M4I24M = 612 -197 TATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGG <<<<<<<7<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS54_65:7:159:253:353 83 chr2 778 67 7M4I24M = 613 -196 ATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGG <8<<<<:<<;;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS56_57:1:122:38:103 163 chr2 778 79 7M4I24M = 972 229 ATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGG <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<3<<<<9<8;< MF:i:130 Aq:i:79 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS188_4:5:103:870:105 147 chr2 778 44 7M4I24M = 595 -214 ATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGG <<<<<<<<<<<<<=<:<;<<<<<<<<<<*<<<<<< MF:i:130 Aq:i:44 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS1_105:8:24:718:322 163 chr2 779 23 35M = 953 209 ACAATTAATTGAGACTACAGACCAATTATGTAAAA 5/7<3+<;<1<<1<95<.&&.&&.<&)5)1)17<% MF:i:130 Aq:i:23 NM:i:3 UQ:i:18 H0:i:0 H1:i:0
-EAS51_64:6:118:41:489 83 chr2 779 76 35M = 588 -226 ACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAA <+<<;<<<38<<<<5<<3<<<<3<<8<<<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS56_61:3:165:665:220 83 chr2 779 76 35M = 618 -196 ACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAA <:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_30:6:238:803:383 99 chr2 779 75 35M = 954 210 ACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAA <<<<<<<<<<<<;<<<<<;<;<<;<<;<<<9<;<< MF:i:130 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS1_105:3:232:364:583 99 chr2 780 71 35M = 956 211 CAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS139_19:2:2:1217:398 83 chr2 780 99 40M = 608 -212 CAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAA +;;:9<<66<<<;+<<7<<<<;<<+;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:3 UQ:i:73 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:2:81:435:410 99 chr2 782 99 36M = 966 220 ATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<;<<;; MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:2 UQ:i:54 H0:i:0 H1:i:0
-B7_593:3:115:649:259 147 chr2 782 99 36M = 617 -201 ATTAATTGAGAATACAGAGCAACTAGGTAAAAAATT ;<;<<;<<<<;&<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:3 UQ:i:58 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_93:3:181:93:694 163 chr2 783 99 35M = 954 206 TTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATT ++<<<<<<;<<<<<<:;8<<;<<<5;<;<<<+<<< MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:2 UQ:i:54 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_30:1:188:863:790 163 chr2 783 98 35M = 969 221 TTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATT ++<;<<;;;:<<<<:<:<<:1<<1<<<6:6;4;;4 MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:2 UQ:i:54 H0:i:0 H1:i:0
-EAS1_93:2:313:711:530 163 chr2 784 99 35M = 968 219 TAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTA +<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<: MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-B7_589:7:154:26:712 99 chr2 786 99 35M = 959 208 ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAAC <<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:6:185:87:475 163 chr2 786 99 36M = 949 199 ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:4:69:1593:819 163 chr2 786 99 40M = 977 231 ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTAC <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;;<:<<<<<:<<<<<:777: MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:3:309:187:267 83 chr2 786 99 35M = 616 -205 ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAAC <:0;<;<4<<7<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:8:82:1540:77 83 chr2 786 99 35M = 619 -202 ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAAC <48;<;</;<<<<<<:<<0<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:2:193:420:78 147 chr2 787 99 35M = 607 -215 TTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA 81<<;<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:4:261:267:597 83 chr2 787 86 35M = 617 -205 TTGAGAATAAAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA *-1<9<+1<+<<<<:<<;9<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:2 UQ:i:20 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_59:4:262:928:237 99 chr2 787 99 35M = 971 219 TTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:5:262:53:888 163 chr2 787 99 35M = 965 213 TTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA <<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<;<;<;6<<;<;;< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:4:138:211:582 99 chr2 788 99 35M = 957 204 TGAGACTACAGAGCAAATAGGTAAAAAATTAACAT <<;<<<<<<<<<<<<<&;<;<7<<;<<<<<<<5<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-B7_597:7:113:408:211 99 chr2 789 99 35M = 952 198 GAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATT <<<<<<<<<<<<<<<:&<<<&:<<<<<<<<<<;:/ MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:3:79:879:15 147 chr2 790 99 35M = 626 -199 AGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTA <;;5;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:4:325:795:213 83 chr2 790 99 35M = 618 -207 AGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTA <<<0<<;<<<<;<<;:<<<<<<<<<<<;<<<<<9< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:4:22:206:150 83 chr2 792 99 35M = 619 -208 AAAAAAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACA 8&)<)<<<<+<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:3 UQ:i:21 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:5:181:713:140 147 chr2 793 84 35M = 615 -213 CTACAGAGCAACAAGGTAAAAAATTAACATTACAA 78<+<7<-7;;;&<5<7<<<<7<<<<<<<<<<<7< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-B7_589:7:76:306:561 163 chr2 794 89 35M = 987 228 TACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAAC <<)<<<<<<8<<8<<<<<<<;;;<<1<<3;=7<<9 MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:4:325:352:67 83 chr2 794 99 35M = 622 -207 TACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAAC ;<8<<<;;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:4:310:287:420 99 chr2 794 99 35M = 965 206 TACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:5:74:329:459 83 chr2 795 99 35M = 623 -207 ACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACA </<;<8/<<9<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:6:57:1342:1166 99 chr2 796 99 35M = 964 203 CAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<; MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:2:3:542:428 163 chr2 797 99 35M = 965 203 AGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGG 7<4<<<6<<,<9)<<<<6<,<<7<<7<<<<<<<<1 MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:7:97:892:419 83 chr2 800 99 35M = 621 -214 GCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAAC ;8<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:6:82:1051:921 83 chr2 800 99 40M = 616 -224 GCAAATAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAAC 3-::-7<;+:9<;<<<5<;9,::53-;:3<<<<9<<3<<< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:12 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:5:263:511:936 147 chr2 801 99 35M = 629 -207 CAAATAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACA +<<%<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:7:157:876:302 163 chr2 801 99 35M = 964 198 CAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACACGAACA 2<<;<<<22<<<<<<77<<<<22<7<<<<%-<<1< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:2:127:288:655 163 chr2 803 99 35M = 999 231 ACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<;; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:4:83:731:540 147 chr2 804 99 35M = 623 -216 CTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAA ;7<:+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:5:82:843:1838 99 chr2 804 99 35M = 999 230 CTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAA ;<<;:;;<<<;;<<<<;;<<;;;;;<;;;;68887 MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:71:994:576 147 chr2 805 99 35M = 655 -185 TAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAAC <<9;;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:8:24:415:944 99 chr2 805 99 35M = 974 204 TAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:3:73:1458:1337 83 chr2 806 99 35M = 609 -232 AGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACC <</<<<<<<<6:<::<<<1<<:<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:2:142:353:398 163 chr2 807 99 35M = 977 205 GGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCT =================================9= MF:i:18 Aq:i:79 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:7:46:522:426 163 chr2 807 99 35M = 964 192 GGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCT =======================:==;<===78== MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:7:59:871:351 163 chr2 808 99 35M = 963 190 GTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:6:235:505:553 163 chr2 808 99 35M = 987 214 GTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;:;: MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:1:60:1420:660 83 chr2 808 99 35M = 649 -194 GTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTC 99<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:3:180:89:582 147 chr2 809 99 36M = 650 -195 TAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCAT ;<<<<<<4<<<:<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:3:323:196:855 83 chr2 809 99 35M = 642 -202 TAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCA &<<<<<<09<<7<7;<;<<0<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_4:5:295:547:216 163 chr2 809 99 35M = 970 196 TAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:7:126:361:250 99 chr2 810 99 35M = 1002 227 AAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCAT <<<<<<;9<<<<<<<<<<<<<<;;;<<<;<664;; MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:266:133:789 99 chr2 810 99 35M = 988 213 AAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:5:175:149:296 83 chr2 811 99 35M = 614 -232 AAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATA =;==26==;==;================7====== MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:5:136:260:254 99 chr2 813 99 35M = 988 210 AAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATA <<<<<<<<<<<<<<<<<<><<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:1:85:1521:58 147 chr2 813 99 40M = 639 -214 AAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAAT :::86<<:<<8<<<<;<<8<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:4:164:719:947 99 chr2 813 99 35M = 1005 227 AAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:1:50:257:341 163 chr2 813 99 35M = 971 193 AAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<6<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:5:117:33:262 83 chr2 814 99 35M = 642 -207 AATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATAT <<;;<<;<:8<7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:8:90:706:1276 163 chr2 814 99 35M = 980 201 AATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<:<:< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:116:966:193 163 chr2 815 99 35M = 967 187 ATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:1:59:742:549 147 chr2 816 99 35M = 642 -209 TTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCA -<<<3<<<<6<<6<<<<<6<<<<6<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:7:74:213:877 99 chr2 816 99 35M = 996 215 TTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-B7_610:3:85:219:371 163 chr2 817 99 35M = 967 185 TAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<;<; MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:176:653:957 163 chr2 819 82 35M = 982 198 ACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATA ????????????<<???@<<<<<@<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:1:64:526:339 163 chr2 819 96 35M = 1019 235 ACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATA <<<<<<<<;<<<<<<<<<<7<:<<<<<<<<<8:<: MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:7:97:743:602 83 chr2 821 99 34M = 644 -211 ATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATAT <(&<:<<&<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:6
-B7_610:2:75:887:149 163 chr2 823 99 35M = 1004 216 TACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAA <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<;<;;; MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS221_1:2:73:955:728 83 chr2 823 44 35M = 660 -198 TACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAA ;<-<<6<;<<<6<<<<;7<6<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:14 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:3 H1:i:18
-EAS1_108:2:102:543:160 163 chr2 825 99 35M = 977 187 CAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<:< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS114_28:2:55:562:403 83 chr2 825 99 36M = 643 -218 CAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTT +<<&<<<<<<<<<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:5
-B7_593:1:19:695:59 99 chr2 826 99 36M = 988 198 AACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTT <<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<;;<;<<7<<<<; MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:3
-EAS221_1:2:8:327:522 163 chr2 826 99 35M = 1001 210 AACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTT <<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<:<<< MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:3
-EAS114_45:6:90:561:850 163 chr2 827 85 35M = 1004 212 ACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTT ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;9;9;6;77777 MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:25
-EAS56_61:5:209:824:866 83 chr2 828 73 35M = 665 -198 CAGCAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTG ;<:&<<:<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:7
-EAS139_11:2:31:628:1820 83 chr2 828 98 35M = 675 -188 CAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTG <<<<<<:<<<<:6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:5
-EAS220_1:4:6:1178:1105 147 chr2 830 93 35M = 657 -208 GGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAA <:<<9<<<<::7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:11
-EAS114_28:4:305:707:258 99 chr2 831 58 36M = 992 197 GAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATA 9<<<<<<<<<<<<;<<-<<;;<;<<9<<;<<+99;7 MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:9
-EAS54_67:3:114:736:433 163 chr2 832 63 35M = 998 201 AACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATA ;<<9<8;<<<<8<8<;<<;;;0<<8;<;<<47;;; MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:3
-B7_591:7:157:447:758 99 chr2 833 99 36M = 994 197 ACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-B7_591:4:159:508:571 99 chr2 834 84 36M = 989 191 CAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAA <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:3
-EAS54_65:7:68:825:405 163 chr2 835 30 35M = 1015 215 AAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;9 MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:5
-B7_593:3:102:856:670 99 chr2 836 99 36M = 1025 225 AAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAG <<<<<<<;<<<;<<;:<<<<<<<<<<:;;<<;<<<7 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:3:260:827:289 163 chr2 836 99 35M = 999 198 AAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAA <<<<2<<<<;<<<<;<<<<<<:<<<&-<8<<88<3 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:5
-EAS114_28:1:220:801:282 147 chr2 837 99 36M = 660 -213 AACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGG ;7;87;===;==;====:===<==7=========== MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:4:57:1675:720 147 chr2 841 99 35M = 684 -192 TCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGAT <,<<<<<<:<<<<<<<<:9<<<<<<<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:2:297:949:26 83 chr2 842 99 35M = 676 -201 CATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATT 5<;<;<;:<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:1:76:34:691 89 chr2 843 58 35M * 0 0 ATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTA <<<<<<16<<<<<916<<<499<966161919<<< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:5:98:995:929 83 chr2 844 99 35M = 680 -199 TATAACAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAA &<+<'7<<+<&<<<7+4<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:1 UQ:i:6 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:3:58:923:1915 163 chr2 846 99 40M = 1007 201 TATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<::::: MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:4:181:476:394 83 chr2 847 99 35M = 666 -216 AACAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATT <+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_32:7:322:391:742 147 chr2 847 99 35M = 667 -215 ATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATT <63<<<<9<<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:8:17:437:1378 83 chr2 847 99 35M = 676 -206 ATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATT <<7<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:3:155:375:623 163 chr2 849 99 35M = 1029 215 CAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCC 0<<<<<;<<<<<<<<<<<<<4<<8<<<<<<<<;<; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:2:29:729:70 163 chr2 850 51 35M = 1009 194 ANTATTANCTTTGANNAAAAAGGGATTAAATTCCC :!<:<<8!::::5:!!:.77::33888633:8777 MF:i:130 Aq:i:51 NM:i:3 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:0
-EAS54_65:7:117:452:744 83 chr2 850 99 35M = 676 -209 AATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCC <;;<;<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:50 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:1:288:384:444 83 chr2 855 99 35M = 696 -194 TAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACT ;=9;;<====<=;=/=9;<========<======= MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:7:133:514:754 163 chr2 855 63 36M = 1036 217 TAAATTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTT ***&,,,+(*,*********+*)*(***(**((*)( MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS139_19:5:68:306:409 147 chr2 856 99 40M = 682 -214 AACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAG ::2:7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:3:155:758:710 163 chr2 859 98 35M = 1048 224 TTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAG =======8================6=:7===:=:= MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:39:208:644 147 chr2 859 99 35M = 704 -190 TTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAG 78899;;;;4;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;8;;; MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:1:16:438:245 89 chr2 860 65 35M * 0 0 TTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGA 8*8<5'<77;;;;;7<7<<7-<;<<<;;<<<;;79 MF:i:32 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:5:145:635:390 83 chr2 860 99 35M = 673 -222 TTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGA +9;<<;<<<<<;;;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:6:187:996:432 147 chr2 860 99 36M = 693 -203 TTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAG ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:2:123:924:645 163 chr2 861 84 36M = 1045 220 TGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGA <<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<6:<7<1<+< MF:i:18 Aq:i:11 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:4:146:961:63 163 chr2 861 86 35M = 1041 215 TGAATAAAAAGGGCTTAAATTCCCCCACTTAAGGG <<+<<<<::+1<;&<<88<<<<;;.<0;;85(;(8 MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:2 UQ:i:12 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_30:6:4:665:771 69 chr2 862 0 * = 862 0 GTGCTTTATCTGATATCAATGCCGATAAACTGCCT <<<<<<<<<<<<%<8<3:7:77<(7,:3(:&2:(0 MF:i:192
-EAS114_30:6:4:665:771 137 chr2 862 71 35M = 862 0 GAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGA <;<<;<18<;<8<<<<;<;;<<<<1<<<<6;;;;; MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:6:45:601:439 83 chr2 864 99 35M = 691 -208 ATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATA <8<<<<<<1<<<<<<<<)<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:4:126:966:514 163 chr2 865 99 35M = 1027 197 TAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:2:76:1765:700 83 chr2 866 99 35M = 680 -221 AAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATA 77777;;;;7;7;<;;;;+;;<9<<<79;<1<<77 MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:1:155:807:19 99 chr2 867 99 35M = 1074 242 AAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAG <<<<<<<<<<<<<<<<9+<<<<<<9<<9;4<<<<: MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:2:226:885:729 99 chr2 867 98 35M = 1037 205 AAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAG <<<;<<<<<<;<;<<<<<<<:;<<;4;%;<<;<<. MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:4:1:156:196 99 chr2 867 77 40M = 1042 215 AAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<:;9:9 MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:2:52:1144:509 147 chr2 867 99 35M = 706 -196 AAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAG <<<<:<<<<<<<<<<;::;:<;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:6:73:735:329 99 chr2 868 99 35M = 1035 202 AAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGA ================;==;====;=;=======; MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:6:11:801:386 163 chr2 868 97 35M = 1061 228 AAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGA <<<<<<<<<<8<<<<<:4<::<854:5<:::;4+4 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:4:150:94:843 99 chr2 868 75 35M = 1050 217 AAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGA <<<<<<<<7<<<6<<<<<<<<<<<6<<62<<<<<2 MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:5:255:796:239 147 chr2 869 99 35M = 692 -212 AAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATAGAGAT <<3;;<7:<<<;(7<<7;<<;<<<<<<<<<7<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:22 H0:i:0 H1:i:1
-B7_589:5:147:405:738 163 chr2 870 99 35M = 1048 213 AGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;; MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:2:33:357:858 83 chr2 870 99 35M = 716 -189 AGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATT <;<:<<<<<<<<<;<9<<;<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:7:122:398:994 83 chr2 871 99 35M = 708 -198 GGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTG 95:<9<<<<:9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS1_105:2:146:374:692 147 chr2 874 99 35M = 690 -219 ATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCA <4:<<<1:<:<::<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:6:119:428:415 163 chr2 876 99 36M = 1037 197 TAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;;<;;; MF:i:18 Aq:i:46 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:7:168:247:414 147 chr2 876 99 35M = 698 -213 TAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGA ,;;;,146<6;6<<8<<<<1<8<<<<<<<<<<;1< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:2:130:609:467 147 chr2 877 99 35M = 728 -184 AAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAA ===:2===;<====>==>=>=>=>>>==>>>=>>> MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:5:57:366:844 83 chr2 877 99 40M = 708 -209 AAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGAT ;;;7:8&555<,;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:3:236:475:254 163 chr2 880 99 35M = 1051 206 TTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:::<:;</;/ MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:2:251:819:772 147 chr2 881 99 36M = 726 -191 TCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGAT 6+7++1<<%<<<<<<<+<+<9<<99<9<<<<<<9<< MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:1:36:481:1079 83 chr2 881 99 40M = 707 -214 TCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAA :11+)*<4;<<<<<<<<<;;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:5:29:411:1208 147 chr2 882 99 40M = 698 -224 CCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAA 766+6<996<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:7:62:1076:540 99 chr2 882 99 35M = 1066 219 CCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGAT <<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;<7; MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:7:189:530:40 83 chr2 883 99 36M = 698 -221 CCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTT 883;<<<<<<<<<:<<<<<<<<3<;<<<<<<<<;<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:8:113:856:319 163 chr2 884 99 35M = 1067 216 CCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:2:55:296:1457 99 chr2 884 99 35M = 1061 212 CCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:15:881:1932 99 chr2 886 92 35M = 1061 210 CACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAA <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<:<<<2<26<8<<;;. MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:7:116:157:612 147 chr2 889 99 35M = 707 -217 TTAAGAGATATAGATTGGCAGTACAGATTTAAAAA ;;<<<<<<<<<<<<<<<<;<</<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1 UQ:i:14 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_28:7:215:863:521 83 chr2 890 99 36M = 732 -194 TAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA ;<<<<<<<<<<<<<;<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:7:254:572:431 163 chr2 891 97 35M = 1048 192 AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<99;;;;; MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:6:273:424:207 163 chr2 891 99 35M = 1066 210 AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA <,<,<9<<9<<<<<<<<<<79<,599,<191<99+ MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:8:4:571:820 163 chr2 891 99 35M = 1071 215 AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA <<<<<<<<<<<9<<;9<;;;<;6;:<<<3:;;;:6 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:4:36:1231:1381 147 chr2 891 99 35M = 708 -218 AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA <<<<<<;<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:3:66:718:481 99 chr2 891 99 40M = 1072 221 AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAAC <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<:1:;: MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:7:22:632:176 163 chr2 894 99 36M = 1091 233 AGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAA <<<<<;<<<<<<;<<;<:<<<:<<:<<<;<<<;;;: MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:8:271:180:509 147 chr2 896 99 35M = 729 -202 ATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAAC <<<<<<<<<9<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:5:198:564:731 163 chr2 898 99 35M = 1089 226 ATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTA <<<<<;<<<<<<;<<:<<;9<<<<<<<<1;<<58< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:2:67:1467:1447 83 chr2 898 99 35M = 722 -211 ATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTA <<<<<::<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:6:172:827:592 83 chr2 899 99 35M = 703 -231 TAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAA 8<<<<;7;7<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:8:240:719:799 147 chr2 900 99 35M = 720 -215 AGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAAC <:<<<<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:7:24:1345:1627 73 chr2 900 78 35M = 900 0 AGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<8<3 MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:7:24:1345:1627 133 chr2 900 0 * = 900 0 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!! MF:i:192
-EAS139_19:1:58:726:1746 163 chr2 900 99 40M = 1061 201 AGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<8<<<<<<<<:8:8:88 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:88:451:1773 147 chr2 902 99 35M = 742 -195 ATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTA 973776;;;;;;;;;::;;;;;;;;;;;;;;3;;; MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:8:178:187:610 147 chr2 903 99 35M = 744 -194 TTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTAT 66:,:<7<<<<<<<1<<<<<<<<<<<<<<<2<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:6:38:332:54 83 chr2 904 99 36M = 737 -203 TGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATAT 8;;&<;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:5:210:674:911 147 chr2 904 99 35M = 740 -199 TGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATA 27;2<;<<5<<<<;;<<<<<;<<<<<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:2:82:963:128 83 chr2 905 99 35M = 719 -221 GGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATAT 585<;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:2:12:1335:1372 83 chr2 906 99 40M = 721 -225 GAAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTT :&;;;<*<<<9<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:1:98:641:1040 163 chr2 907 99 35M = 1085 213 CAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGC <<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:8:41:530:663 83 chr2 908 99 35M = 730 -213 AGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCT =8=;*=5==;;=====:=====;===;======== MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:1:87:430:995 147 chr2 909 67 35M = 731 -213 GAAAAGAGTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTG 1<4%81<..1<<<<<0<<<<<0.<<9<<(<6<<6< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:2 UQ:i:17 H0:i:0 H1:i:1
-B7_595:3:85:964:950 163 chr2 910 99 35M = 1095 220 AACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;: MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:8:68:570:705 99 chr2 910 99 35M = 1100 225 AACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<8< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:6:198:503:669 99 chr2 912 99 35M = 1107 230 CAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTT <<<<<<<<<<;8<<<<<;<<<<<<;<;<8<<8<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:5:273:545:1001 163 chr2 913 99 35M = 1088 210 AGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTA <<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<;<8;28<8;<<8 MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:8:152:778:228 83 chr2 915 99 35M = 739 -211 ATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACA <;;7=<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:1:53:463:1132 163 chr2 915 99 40M = 1109 234 ATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACANGAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<8<<<<<<<8<!1488 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:3:12:630:707 147 chr2 915 99 35M = 751 -199 ATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACA <:<<<<<<<;<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:8:179:119:876 163 chr2 917 60 35M = 1112 230 TTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACCAG <<<<<<<7<<<<<<<8<<<6<<<<<<7<<<:0&<0 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:1
-EAS1_97:6:308:667:658 99 chr2 918 10 35M = 1116 233 TAAAAACATGAACTAACTATATCCTTCTTACAATA 9<96<<<;<96<<9<51<<<<<1:9++<9*%4;*5 MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:4 UQ:i:45 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_28:5:163:832:715 163 chr2 918 99 36M = 1085 203 TAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA <<0;<9<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<;;;<6 MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:3:179:496:161 83 chr2 919 99 36M = 756 -199 AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAA <<<<<9<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:8:13:325:483 163 chr2 919 99 35M = 1101 217 AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<; MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS1_103:7:139:578:951 163 chr2 919 98 35M = 1095 211 AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA <<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<0;; MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS1_108:8:19:929:765 99 chr2 919 98 35M = 1069 185 AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;77< MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS56_57:5:214:644:390 163 chr2 919 72 35M = 1082 198 AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA <<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<; MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS114_30:6:243:209:110 83 chr2 920 48 35M = 768 -187 AAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAA ;<;;;:<:<:;<<;;<;<;<;7<<;<<;;<;<<<< MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:2:247:900:123 99 chr2 920 99 35M = 1123 238 AAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;<; MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS51_62:7:162:195:761 83 chr2 922 30 35M = 767 -190 AACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACT <<8<<:<<:<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:0
-EAS1_103:2:184:980:396 163 chr2 923 99 35M = 1092 204 ACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:2:162:272:415 99 chr2 923 83 35M = 1112 224 ACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<9;<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:4:184:237:476 163 chr2 925 99 35M = 1101 211 ATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<;;< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:1:202:341:984 99 chr2 926 99 35M = 1094 203 TGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATT =========================4;======== MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:3:107:738:484 99 chr2 926 75 35M = 1097 206 TGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:6:7:492:1088 147 chr2 926 57 35M = 769 -192 TGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATT 4;<<75<<::<:<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS139_11:1:81:1019:558 83 chr2 926 77 35M = 760 -201 TGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATT <<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:4:10:1312:1558 83 chr2 928 76 35M = 771 -192 AACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAA <<:<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:4:206:741:810 83 chr2 929 99 34M = 753 -210 ACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAA <3<<;5<<<<<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:7:200:65:291 147 chr2 930 99 35M = 728 -237 CTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATA ;9<;3<<9<7<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:2:38:670:564 147 chr2 930 73 35M = 770 -195 CTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATA 3<<<3:<<<<<:;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:7:57:1114:2032 99 chr2 931 99 35M = 1102 206 TAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAA <7<<<<<<<<<<<<<<<<<777<<<7<<<<<3<<7 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:5:125:137:58 83 chr2 932 76 35M = 772 -195 AACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAA <<9;<<<<<;<;<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:1:38:250:647 163 chr2 933 71 35M = 1100 202 ACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAT <<<<<<<9<<9<<<<<<<6<<<<<<<<<<8<779% MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:6:116:464:261 99 chr2 934 99 35M = 1107 208 CTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<;;8< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:1:168:69:249 163 chr2 936 99 35M = 1125 224 ATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:4:246:647:765 163 chr2 937 99 35M = 1119 217 TATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACAT ;<<<<<<<<<;<&<<3+3<<<3<<9&</:/87</8 MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:3:307:113:346 163 chr2 938 99 35M = 1123 220 ATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<8 MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:6:159:493:275 147 chr2 939 72 35M = 760 -214 TGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGA 4949;<<<<<<<<<<<6<;<<<<;<<<<<*<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:3:257:288:731 99 chr2 939 99 34M = 1131 227 TGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATG <<<<<<<<8<8<<;<;<<<;<<<5<;;88.8<6< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:4:231:815:626 163 chr2 940 99 35M = 1119 214 GCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAG <;<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;5<<<;:; MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:4:93:77:1338 163 chr2 940 10 35M = 1098 193 GCTGCTTACAAGAAGCGCATTAATAAAGACATGAG <<<<*<2<<<:<4<&<6<8<4<::<8<<<<82;;7 MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:3 UQ:i:35 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_45:2:54:1886:719 99 chr2 941 99 35M = 1125 219 CTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGT ;;;9;;<;;;9;;;;;:;<9;:;;;;9;;;99799 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:7:94:273:165 99 chr2 945 99 35M = 1128 218 TTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;:7 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:5:32:461:154 147 chr2 945 71 35M = 769 -211 TTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAG ;;</<<<<<;:<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:3:303:131:673 163 chr2 947 99 36M = 1112 201 ACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;;; MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:6:10:106:737 163 chr2 947 99 35M = 1106 194 ACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGT <<<;<1<;<<<<<<9<<<<;;<<<<<99<<94008 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:2:214:950:32 163 chr2 947 99 35M = 1132 220 ACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGT >>=>>>>==>=>>>==>=>=:=====;=:=6:::6 MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:2:10:686:1024 163 chr2 947 99 35M = 1103 191 ACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGT <:<<<<:<<<<<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<5<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:5:53:61:31 163 chr2 949 99 35M = 1122 208 AAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGATAA <<<7;<7<<<;7<;;<7<7<7<;5<73<<</%;/; MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:6:185:87:475 83 chr2 949 99 36M = 786 -199 AAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAA <<4<<<+<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:4:235:899:847 99 chr2 950 99 35M = 1112 197 AGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAA <<3<;<<<<<<<<<;;<<<<<<<+<<<+6<8<3/< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:6:193:661:771 163 chr2 952 99 35M = 1129 212 AAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGG <<<<<<<<<;<<<;;;<<<<<;<<<=;<:;5:9:: MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:7:113:408:211 147 chr2 952 99 35M = 789 -198 AAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGG <:;:;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:8:24:718:322 83 chr2 953 23 35M = 779 -209 AACTCATTAATAATGTCATGAGTTCAGGTAAAGGG 5:+:0;**&+<00&<&<<<5<28<<;;<83<<<<< MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:2 UQ:i:10 H0:i:0 H1:i:0
-EAS56_61:5:263:314:696 163 chr2 953 99 35M = 1117 199 AACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGG <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<:<<;<775 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:5:93:312:331 163 chr2 953 99 35M = 1145 227 AACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<=<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:3:181:93:694 83 chr2 954 99 35M = 783 -206 ACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGG <4;8<<+<<:<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:6:238:803:383 147 chr2 954 75 35M = 779 -210 ACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGG ;;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:6:44:77:1255 163 chr2 955 99 35M = 1113 193 CTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGT ;;;;;;;8;;;7;8;;;;;;;;;;886;;;76777 MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:3:232:364:583 147 chr2 956 71 35M = 780 -211 TCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTG ;%;7;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:7:256:354:173 163 chr2 957 99 36M = 1121 200 CATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:4:138:211:582 147 chr2 957 99 35M = 788 -204 CATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGG :<8;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:4:61:631:567 99 chr2 957 99 35M = 1131 209 CATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:5:56:1757:1319 83 chr2 957 67 35M = 775 -217 CATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGG &7778<<<<<8<;<<:::;<:<4<<:<:;8<8<;< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:7:154:26:712 147 chr2 959 99 35M = 786 -208 TTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAA ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:8:10:975:766 163 chr2 959 99 35M = 1166 242 TTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGAAA <<<<<<<<;<<<<;<:<<;<6;;<<<:6-:+1+;; MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:5:220:733:736 99 chr2 959 99 35M = 1143 219 TTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<5<<;9 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:4:46:1566:668 163 chr2 959 99 35M = 1148 224 TTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:7:59:871:351 83 chr2 963 99 35M = 808 -190 TAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAG ;<<<<<:<;<<<4;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:7:46:522:426 83 chr2 964 99 35M = 807 -192 AAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGA <<<<<:<<<<<<1/<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:7:157:876:302 83 chr2 964 99 35M = 801 -198 AAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGA ===:=8=;==:892=,28==88==28====8=;;8 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:4:61:1369:440 83 chr2 964 47 35M = 770 -229 AAAGACATGATTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGA <<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:23 H0:i:0 H1:i:1
-EAS221_1:6:57:1342:1166 147 chr2 964 99 35M = 796 -203 AAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGA <<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:4:310:287:420 147 chr2 965 99 35M = 794 -206 AAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGAT <<<<;<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:5:262:53:888 83 chr2 965 99 35M = 787 -213 AAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:2:3:542:428 83 chr2 965 99 35M = 797 -203 AAGACATGAGTTCAGGTACAGGGGTGGAAAAAGAT <<876</3<8874:<8:<)<5<<<;<<<<7<<<:< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:8 H0:i:0 H1:i:1
-B7_593:2:81:435:410 147 chr2 966 99 36M = 782 -220 AGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGT ;<;;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:3:85:219:371 83 chr2 967 99 35M = 817 -185 GACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGT <<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:116:966:193 83 chr2 967 99 35M = 815 -187 GACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGT =================================== MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:4:30:432:228 163 chr2 967 99 35M = 1145 213 GACATGAGTTCAGGGAAAGGGGTGGAAAAAGATGT <<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<:<<<<<;; MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:23 H0:i:0 H1:i:1
-B7_610:1:12:88:200 163 chr2 968 99 35M = 1133 200 ACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTT <<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<:<<<<<<9<<5< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:2:313:711:530 83 chr2 968 99 35M = 784 -219 ACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTT <7;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:7:74:866:49 163 chr2 969 99 35M = 1143 209 CATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTC ====================9==91==<=6==;:= MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:7:248:17:435 99 chr2 969 99 35M = 1139 205 CATGAGTTCAGGAAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTC <<<<8<<<888<+<<<<<;<:<<<<8<<<<<;3<3 MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_30:1:188:863:790 83 chr2 969 98 35M = 783 -221 CATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTC ;<7<<<55<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:6:75:1503:1399 163 chr2 969 99 40M = 1130 201 CATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<;<<<<<<;<<<<:::711 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:2:56:155:49 99 chr2 970 99 35M = 1145 210 ATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<;<9<9; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_4:5:295:547:216 83 chr2 970 99 35M = 809 -196 ATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:4:262:928:237 147 chr2 971 99 35M = 787 -219 TGAGTTCAGGTAAAGGTGTGGAAAAAGATGTTCTA ;<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:26 H0:i:0 H1:i:1
-EAS219_1:1:50:257:341 83 chr2 971 99 35M = 813 -193 TGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:1:122:38:103 83 chr2 972 79 35M = 778 -229 GAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTAC ===;3<===:=======<================= MF:i:18 Aq:i:79 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:1:82:670:302 99 chr2 973 99 35M = 1146 208 AGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:8:24:415:944 147 chr2 974 99 35M = 805 -204 GTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGC <;;<<<<:<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:7:108:440:208 99 chr2 975 99 35M = 1142 202 TTCAGGTAAAGGGGAGGAAAAAGATGTTCTACGCA <<<;<<<<<<<<<</<<<<;<<<;<<;<;<64/:+ MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:14 H0:i:0 H1:i:1
-B7_595:3:229:543:583 99 chr2 976 99 35M = 1139 198 TCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAA <<<<<<<<<<8<8<9<<<<8<<588<<<<*<2:2* MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:2:142:353:398 83 chr2 977 99 35M = 807 -205 CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAA =================================== MF:i:18 Aq:i:79 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:102:543:160 83 chr2 977 99 35M = 825 -187 CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAA 9==9=====;=====================<=== MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:4:191:40:536 163 chr2 977 66 35M = 1167 225 CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAA <<<<<<<<8<<;<<8<<;<;;<<8<<<<<</<74/ MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_32:7:272:328:400 163 chr2 977 99 35M = 1151 209 CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAA <<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;:7 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:4:69:1593:819 83 chr2 977 99 40M = 786 -231 CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAA );::7<<<<:;<<<<<<<<<<<<<<<9<<9<3<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-B7_597:3:133:707:886 99 chr2 978 99 35M = 1146 203 AGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAAC <<<<7;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<5<;66< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-B7_591:4:92:411:955 99 chr2 979 99 36M = 1149 206 GGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS56_61:8:60:358:494 99 chr2 979 44 35M = 1179 235 GGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<;;4; MF:i:18 Aq:i:14 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-B7_597:7:41:34:211 163 chr2 980 99 35M = 1164 219 GTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3:;5; MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:2:40:1291:1045 99 chr2 980 99 35M = 1167 222 GTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAACAAG <<<<<<<<<5<<5<<<<7<<<<<<<<<5<9<&%73 MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:2 UQ:i:9 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:8:90:706:1276 83 chr2 980 99 35M = 814 -201 GTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAG <;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS114_32:4:5:396:292 163 chr2 981 99 35M = 1155 209 TAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGA <<<<<<<<<<<<<<;;<<<<:<<<<;;<;;3/&+8 MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:176:653:957 83 chr2 982 82 35M = 819 -198 AAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAA ===::=============<==<====<======== MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS54_71:6:264:705:89 99 chr2 983 99 34M = 1155 207 AAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAA <<<<<<<<<<;8<<<<<<<<<<<<<<<&<<,;;( MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:2:66:757:918 163 chr2 985 99 35M = 1143 193 GGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACC =================================== MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:7:114:506:971 163 chr2 986 99 35M = 1150 199 GGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCA =================================== MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:6:220:809:850 99 chr2 986 60 35M = 1187 236 GGGGGGAAAAAGATGTGCTACACAAAAAGATTCCA <<;7;<<0::8<-6:<0624-*<&-93-,8+(&08 MF:i:130 Aq:i:60 NM:i:4 UQ:i:64 H0:i:0 H1:i:0
-B7_589:7:76:306:561 83 chr2 987 89 35M = 794 -228 GGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAA 9<7<<9<<<<<<7<<71<71*7<<<<<<<<<<1<< MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS192_3:6:235:505:553 83 chr2 987 99 35M = 808 -214 GGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAA ;8518<<<<<;<;<<<;<<;<.<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:1:19:695:59 147 chr2 988 99 36M = 826 -198 GTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAAT ;+;8<<<<<<<<<<<5<<+<:<<;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:5:136:260:254 147 chr2 988 99 35M = 813 -210 GTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAA ;:;;<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS56_57:5:266:133:789 147 chr2 988 99 35M = 810 -213 GTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAA 9;;<<<<<<<<<<<<5<<;<5<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-B7_591:4:159:508:571 147 chr2 989 84 36M = 834 -191 TGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATG 9<6<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:7:166:84:766 163 chr2 990 99 35M = 1167 212 GGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATG <<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<;<<<7<;::93 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS56_61:6:283:963:234 99 chr2 992 99 35M = 1157 200 AAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAG <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;<<;<<;< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:4:184:659:377 99 chr2 992 99 35M = 1173 216 AAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;; MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:4:305:707:258 147 chr2 992 58 36M = 831 -197 AAAAAGATGTTCTACGCAAGCAGAAACCAAATGAGA 3<<7<,;<<<<0<66<6+<%<<<.<<<<<<<<<9<< MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:0 H1:i:1
-EAS219_1:7:20:1444:328 99 chr2 993 99 35M = 1149 191 AAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGA <<<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<;<;;8:7 MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:7:157:447:758 147 chr2 994 99 36M = 833 -197 AAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGA <<<;<<5<</<<6<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:37:763:1437 163 chr2 994 99 35M = 1191 232 AAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAG ;;;;;6;;;;;;;;;:;6;5;5;;;;;76;767/7 MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:6:94:1273:1462 163 chr2 995 99 35M = 1166 206 AAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGA <<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<:<<<<:6:7;744; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:7:74:213:877 147 chr2 996 99 35M = 816 -215 AGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAA <<<<<<<&<<-<-<<<7<<<<<77<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:2:168:61:867 163 chr2 997 99 35M = 1188 226 GATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAG ====7====================7======6== MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:2:307:252:632 163 chr2 998 99 35M = 1142 179 ATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;<;; MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:4:37:604:389 99 chr2 998 99 35M = 1188 225 ATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGG <<<<<<<<<3<<<<<4<<<<<9<2;949<;35:95 MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:8:147:687:428 99 chr2 998 99 35M = 1159 196 ATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:36 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:3:114:736:433 83 chr2 998 63 35M = 832 -201 ATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAGTGAGAGAAGG <9<9+9;<6<9<<;9<<<<<;<<<99<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:1 UQ:i:24 H0:i:0 H1:i:1
-B7_597:8:35:118:589 163 chr2 999 99 35M = 1188 224 TGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<<<<9 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:2:127:288:655 83 chr2 999 99 35M = 803 -231 TGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGA <<:<3<<:<.<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:3:260:827:289 83 chr2 999 99 35M = 836 -198 TGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGA 6;99+<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<7<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:5:82:843:1838 147 chr2 999 99 35M = 804 -230 TGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGA 888829;;;;;;;;;;;;;;:;;;;;;;;;;;;;; MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:8:64:350:174 163 chr2 1000 99 35M = 1166 201 GTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<6<<<<<:< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:2:8:327:522 83 chr2 1001 99 35M = 826 -210 TTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGT ;;4;<-<-<<<7<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:7:126:361:250 147 chr2 1002 99 35M = 810 -227 TCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTA 72:;7</<<<:<-7<<:<<<<<<<:<6<+:<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:4:189:571:366 163 chr2 1002 99 35M = 1194 227 TCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<:<<99;;; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:3:202:275:776 163 chr2 1002 99 36M = 1196 230 TCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<9<;;<<<;<;<; MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:6:194:998:663 163 chr2 1002 99 35M = 1165 198 TCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTA <<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:5:30:599:589 99 chr2 1003 99 36M = 1188 221 CTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGCAGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;<&<<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:4:92:412:435 99 chr2 1003 89 35M = 1184 216 CTACGCAAACAGAAACCAANTGAGAGAAGGAGTAG <<<<<<<4<<<<<<<<<66!<<<<<<6<<77<<97 MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:0 H0:i:0 H1:i:1
-B7_610:2:75:887:149 83 chr2 1004 99 35M = 823 -216 TACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGC :<:<0<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:1:2:1422:1820 163 chr2 1004 99 35M = 1164 195 TACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGC ;7;;;;;;;;:;;;;;;;;;;;;;;;;;;;77777 MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:6:90:561:850 83 chr2 1004 85 35M = 827 -212 TACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGC 78376<;;9<;<<;:9<<<6;<;<;;8;;<;/;;; MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:4:164:719:947 147 chr2 1005 99 35M = 813 -227 ACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCT ===,=========6====)================ MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:5:154:952:558 99 chr2 1007 99 35M = 1173 201 GCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:3:58:923:1915 83 chr2 1007 99 40M = 846 -201 GCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTA :+;;;8<<<<<<,<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:3:253:175:31 99 chr2 1008 72 35M = 1187 214 CAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<:<;;; MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:2:29:729:70 83 chr2 1009 51 35M = 850 -194 AAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATAC <<<:<<<<<<7<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:4:174:157:573 163 chr2 1012 99 35M = 1191 214 CAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:7:197:399:319 163 chr2 1012 99 35M = 1189 212 TAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTA +<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;;<<; MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS54_65:7:68:825:405 83 chr2 1015 30 35M = 835 -215 AAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATAT <<<;<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:4:13:701:55 99 chr2 1015 99 36M = 1187 208 AAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATC <<<<<<<<<9<<<9<<<<<<6<<<<<<<6<<6<<6+ MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:2:128:555:941 153 chr2 1016 10 36M * 0 0 AACCAAAAGAGAGAAGGAGTAGTTATACACATATCA 55--555560355$55555555.57757$7555577 MF:i:32 Aq:i:10 NM:i:4 UQ:i:58 H0:i:0 H1:i:0
-EAS219_FC30151:1:53:140:421 163 chr2 1016 99 35M = 1185 204 AACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:1:64:526:339 83 chr2 1019 96 35M = 819 -235 CAAATGAGAGAAGGAGTATCTATACTTATATCAGA 3<<<7<<;<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS192_3:3:194:378:230 163 chr2 1022 99 35M = 1198 211 ATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAA <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:1:45:239:851 163 chr2 1023 61 35M = 1211 223 TGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAA <<88;<208<9<;6<<<6269;94<&401-662&2 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:6:39:956:676 163 chr2 1023 99 35M = 1191 203 TGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAA ;;;;;;;;;;;;9;;;;;;;;;;;;;;;9957777 MF:i:18 Aq:i:44 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:2:15:1763:1143 99 chr2 1023 99 35M = 1193 205 TGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:46 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:309:109:987 163 chr2 1024 99 35M = 1194 205 GAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<;<;;; MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-B7_593:3:102:856:670 147 chr2 1025 99 36M = 836 -225 AGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCA ;;<<<<:<<<:<<4<<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:4
-B7_610:6:107:252:533 163 chr2 1025 60 35M = 1173 183 AGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;9 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:3 H1:i:3
-EAS56_65:4:126:966:514 83 chr2 1027 99 35M = 865 -197 AGAAGAAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCAC <4<<<%<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:1
-EAS114_26:1:171:527:247 163 chr2 1027 67 35M = 1194 202 AGAAGGAGTAGCTAGACTTATATCAGATAAAGCAC =4==4===8==99=&=8+9=19+.2.6'=99+999 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:3
-EAS1_105:1:234:185:359 163 chr2 1029 46 35M = 1183 189 AAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;9--: MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:11
-EAS51_66:3:155:375:623 83 chr2 1029 99 35M = 849 -215 AAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACAC ;;;;<<:<<<<;<<;<<<<<<;<<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS139_19:5:4:939:2021 163 chr2 1031 99 40M = 1197 206 GGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<97<<<;<<;<7;<<:48:: MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:2
-EAS220_1:2:50:513:882 163 chr2 1031 99 35M = 1192 196 GGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;; MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:14
-EAS1_103:5:188:20:592 163 chr2 1032 95 35M = 1202 205 GAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<:<<<;<;;< MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:3 H1:i:16
-EAS114_45:3:35:896:1588 163 chr2 1032 91 35M = 1205 208 GAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTT ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;;;;8;;;88989 MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:3 H1:i:18
-EAS1_108:6:73:735:329 147 chr2 1035 99 35M = 868 -202 TAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAA ;;;9;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:7:133:514:754 83 chr2 1036 63 36M = 855 -217 AGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATC ;;4;<;<;<<<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS218_1:4:62:561:531 163 chr2 1036 99 35M = 1203 202 AGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-B7_593:6:119:428:415 83 chr2 1037 99 36M = 876 -197 GCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCA 84<<<<;;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:46 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS114_30:2:226:885:729 147 chr2 1037 98 35M = 867 -205 GCTGAACTTACATCAGATAAAGCACACTTTAAATC /*220%.(;<%<3.<<<4<<<<86;<8<<8<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:3 UQ:i:36 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_108:1:189:863:213 163 chr2 1039 99 35M = 1202 198 TATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<;7<9;< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-B7_597:4:146:961:63 83 chr2 1041 86 35M = 861 -215 TACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACA 7;;<<<<<;<<<7<<<<<<<<;;<<;<;<<;<<<7 MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:3:68:996:104 99 chr2 1041 70 35M = 1214 208 TACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<< MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:6:47:1791:444 163 chr2 1041 74 35M = 1213 207 TACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACA ;3;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;877977 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:4:1:156:196 147 chr2 1042 77 40M = 867 -215 ACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTA :::::<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:70:1349:1788 163 chr2 1043 99 35M = 1203 195 ATTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAAC &<8<<<85:580;<:0-><;>588>9<>7:<0<9; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-B7_589:2:30:644:942 99 chr2 1045 83 35M = 1229 219 TATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<9;<9< MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:3
-B7_591:2:123:924:645 83 chr2 1045 84 36M = 861 -220 TATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGT ;<<<<*<<<<<<</7<2<8<<<<<<<4<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:11 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-B7_589:5:147:405:738 83 chr2 1048 99 35M = 870 -213 ATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAA <9/<:<<<<<<<<7</<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS54_61:3:155:758:710 83 chr2 1048 98 35M = 859 -224 ATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAA =46=4=5===:========:=7=7======11=== MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS54_73:7:254:572:431 83 chr2 1048 97 35M = 891 -192 ATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAA <63<;<;<<<:7<:<7;<:<<<<:<<<<7<<<<:< MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS56_57:7:33:954:724 163 chr2 1049 97 35M = 1210 196 TCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAA ;<<<<<<<<<<<<<8<<<<:<;;<<;;<;<<;;;; MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS56_63:6:102:816:260 99 chr2 1049 99 35M = 1225 211 TCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAA <<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;; MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS192_3:5:197:914:256 99 chr2 1049 97 35M = 1204 190 TCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8;::: MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS56_65:4:150:94:843 147 chr2 1050 0 35M = 868 -217 CAGATACATCCCACTTTAAATCAACCACAGTAAAA 4<9<41*747*7<:9<:7:::<72;+<;::<7<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:4 UQ:i:47 H0:i:0 H1:i:0
-EAS1_108:5:321:712:224 163 chr2 1051 58 35M = 1220 204 AGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGAAAAAT <<<<<<<<2<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<(<<:<, MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:1 UQ:i:7 H0:i:1 H1:i:2
-EAS114_32:3:236:475:254 83 chr2 1051 99 35M = 880 -206 AGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAAT <:<<<<<;9<7<;<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:7:72:1288:1211 99 chr2 1052 84 35M = 1235 218 GATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS54_65:2:264:157:150 99 chr2 1054 30 35M = 1238 219 TAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAA <<<<<<9<9<<<<.9;<<9&<97<;9933309605 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS1_95:7:310:800:761 163 chr2 1055 99 35M = 1249 229 AAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAA ===========================+======= MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:3:88:465:1877 99 chr2 1055 99 35M = 1212 192 AAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAA <<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:7:66:891:294 163 chr2 1057 99 35M = 1233 211 AGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:3:100:735:530 163 chr2 1058 99 35M = 1257 234 GCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:5:68:440:424 99 chr2 1060 99 35M = 1237 212 ACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS220_1:8:66:1046:167 99 chr2 1060 99 35M = 1241 216 ACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAG <<<<<:<<<<<<<<<<<<<9<;77<9<7<<;<9;- MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS54_81:6:11:801:386 83 chr2 1061 97 35M = 868 -228 CACTATAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGG 5<2:$6<<<38<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1 UQ:i:3 H0:i:1 H1:i:1
-EAS114_28:2:141:7:963 163 chr2 1061 85 36M = 1240 215 CACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGA <<<<<<<<<<<<;<:<<<<<<1<<&<;<;<<;,<;5 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:2:55:296:1457 147 chr2 1061 99 35M = 884 -212 CACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGG -<%63<<<<<1<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<7<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS139_19:1:58:726:1746 83 chr2 1061 99 40M = 900 -201 CAATTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTC &:&::;<<<76<<:<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:15:881:1932 147 chr2 1061 92 35M = 886 -210 CACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGG )<4<<<<<<<4<<4<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS1_95:5:284:212:932 99 chr2 1063 10 35M = 1257 229 CTTTAAATCAACAACAATAAAAAAAAACAAAGGAG <<9<<<<<<<<<<<<<&&<<<<5<<<<8<<<1:<: MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:2 UQ:i:25 H0:i:0 H1:i:0
-EAS139_19:4:18:1335:1514 99 chr2 1063 99 40M = 1235 212 CTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCAT <<<;<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<;<<<<<<;<;<;;;9; MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:6:273:424:207 83 chr2 1066 99 35M = 891 -210 TAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTC ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:7:62:1076:540 147 chr2 1066 99 35M = 882 -219 TAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTC 6<<;:+=====5=:6===================2 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:8:113:856:319 83 chr2 1067 99 33M = 884 -216 AAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGT <<<77<<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:8:19:929:765 147 chr2 1069 98 35M = 919 -185 ATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATC <3+<<;<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:1:88:54:900 163 chr2 1069 68 35M = 1257 223 ATCAACAACAGAAAAATAAAACAAAGGAGGTCATC .....&.....,....................... MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:1 UQ:i:11 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_63:7:109:22:383 163 chr2 1071 99 35M = 1244 208 CAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<;<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:8:4:571:820 83 chr2 1071 99 35M = 891 -215 CAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCAT &<<7<<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:6:255:441:47 99 chr2 1072 99 35M = 1237 200 AACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<;:<;< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:3:66:718:481 147 chr2 1072 99 40M = 891 -221 AACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATG ::5::1<;;<<<<<<1<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:1:155:807:19 147 chr2 1074 99 35M = 867 -242 CAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACA :==4=5:====:============:========== MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:3:43:1229:1855 163 chr2 1074 99 35M = 1244 205 CAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:2:125:875:553 99 chr2 1075 99 36M = 1233 194 AACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<; MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:7:118:775:467 163 chr2 1075 99 35M = 1245 205 AACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:2:301:161:195 99 chr2 1076 75 35M = 1239 198 ACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:6:54:695:952 99 chr2 1076 99 35M = 1264 223 ACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:1:77:589:741 163 chr2 1078 99 35M = 1263 220 AGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:3:200:263:280 163 chr2 1078 99 35M = 1236 193 AGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;8<;1 MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:5:64:199:1288 99 chr2 1079 77 35M = 1240 196 GTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGAT <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;<<<;< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:8:27:228:31 99 chr2 1082 99 35M = 1264 217 AAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<;9<:;<<<<<<75<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:214:644:390 83 chr2 1082 72 35M = 919 -198 AAATAAAACAAAGGAGGTCATGATACAATGATAAA <<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<&<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_45:2:79:554:354 99 chr2 1082 63 35M = 1242 195 AAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAA 17;<;;+<<;;;;93;;:;3;;;;1;;;;<77744 MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:303:542:924 163 chr2 1083 76 35M = 1242 194 AATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAA <<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<; MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:8:26:242:35 99 chr2 1084 99 35M = 1251 202 ATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:5:163:832:715 83 chr2 1085 99 36M = 918 -203 TAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGA ;<<<<9<<<<<<<<;;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:1:98:641:1040 83 chr2 1085 99 35M = 907 -213 TAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAG 4<<<<7<<<<<<<<<:<<;<;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:7:32:562:1695 99 chr2 1085 76 35M = 1258 208 TAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAG <<<<<<<<<<<<<<8<<<<<:<<<<<<<:<8<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:6:758:988 163 chr2 1087 99 35M = 1253 201 AAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGAT 3+;0;0;;;0;;;;;;5;;;9;;;;90;;;57560 MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:5:273:545:1001 83 chr2 1088 99 35M = 913 -210 AACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATC <7(<<72;<2;27<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:2:74:656:272 163 chr2 1088 99 35M = 1245 192 AACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:5:198:564:731 83 chr2 1089 99 35M = 898 -226 ACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCA <6<;<<<<<<:7<<;<<<8<<+<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:6:23:885:274 99 chr2 1089 99 35M = 1289 235 ACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<;;< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:7:22:632:176 83 chr2 1091 99 36M = 894 -233 AAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATT <9<<<<<<<-;<;<<7;6;<<<<<<<<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:2:184:980:396 83 chr2 1092 99 35M = 923 -204 AAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATT <<;;<77;;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:3:110:984:98 99 chr2 1092 99 36M = 1270 214 AAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTC 98<<<<<<2<<<<<<;;<;;<<<5;5;<<;;<<<<+ MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:1:202:341:984 147 chr2 1094 99 35M = 926 -203 GGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCA <<<(<8&<92<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:7:219:40:833 163 chr2 1094 99 35M = 1278 219 GGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:7:23:1126:1886 99 chr2 1094 99 35M = 1268 209 GGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCA 7<<<7<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<;8<;<<5< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:3:85:964:950 83 chr2 1095 99 35M = 910 -220 GAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAG <<8::<<;;<<<;<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:7:139:578:951 83 chr2 1095 98 35M = 919 -211 GAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAG ;<0;:&<:9<<<7<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:3:107:738:484 147 chr2 1097 75 35M = 926 -206 GGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCA .8/<<<7<8<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS114_39:4:93:77:1338 83 chr2 1098 10 35M = 940 -193 GTCATCATACAATGAAAAAAAGATCAATTCAGCAA <<7<7<<<<<1<7<<&97;;<1<;1<<7<;7<<;< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-B7_610:8:68:570:705 147 chr2 1100 99 35M = 910 -225 CATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGA 4<;4<;;:<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:3
-EAS51_62:1:38:250:647 83 chr2 1100 71 35M = 933 -202 AATAATAAAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGA +<&+<1<,<<7<<7<<<<<<<1,<<<<7<<2<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:3 UQ:i:34 H0:i:0 H1:i:3
-EAS1_93:8:13:325:483 83 chr2 1101 99 35M = 919 -217 ATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAA ;:;<;=:========;==========;======== MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:1:128:584:952 163 chr2 1101 99 35M = 1277 211 ATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAA <<<<<<<<<<<<<<+<;<<<<<<;<<<;<<<+<66 MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:4:184:237:476 83 chr2 1101 99 35M = 925 -211 ATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAA <;2<;<4<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:4
-EAS51_64:6:300:622:86 163 chr2 1102 99 35M = 1264 197 TCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:7:57:1114:2032 147 chr2 1102 99 35M = 931 -206 TATTACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAG ;+!5<4<<<<<<<<<<<<<;<&<;7<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:2 UQ:i:10 H0:i:1 H1:i:6
-B7_593:3:310:193:629 163 chr2 1103 99 36M = 1267 200 CATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:2:6:529:366 99 chr2 1103 99 35M = 1291 223 CATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:2:10:686:1024 83 chr2 1103 99 35M = 947 -191 CATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGA &<<<3<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<7<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:3
-EAS114_45:7:14:978:1296 163 chr2 1104 90 35M = 1249 180 ATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGAT ;6;;;;;;;;;;;:;;;;;;;6;;;;;;;;77777 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:5
-EAS56_57:2:237:855:581 99 chr2 1105 87 35M = 1271 201 TACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATA <;4<7<<<;47<<74<:*<<2:<<7.799:2<<9: MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:4
-EAS139_19:7:85:262:751 163 chr2 1105 99 40M = 1305 240 TACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:::92 MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:6:10:106:737 83 chr2 1106 99 35M = 947 -194 ACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATAT <-<<;<<<<<<<<<<<;<<<<;<<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:6
-B7_610:6:143:620:158 163 chr2 1107 99 35M = 1283 211 CAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATA <<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:3
-EAS54_67:6:198:503:669 147 chr2 1107 99 35M = 912 -230 CAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATA 5<<:<<;<<<<<<<;;<<9<<<<<<<<;<<<<;<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS192_3:6:116:464:261 147 chr2 1107 99 35M = 934 -208 CAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATA ;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS54_73:5:263:557:988 99 chr2 1108 84 35M = 1289 216 AATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:8
-EAS139_19:1:53:463:1132 83 chr2 1109 99 40M = 915 -234 ATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCC ;::;:<<<<<<<<:<<;<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:8:46:1528:799 99 chr2 1109 96 35M = 1306 232 ATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<< MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:7
-EAS54_81:7:324:472:791 99 chr2 1110 89 35M = 1274 199 TGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACC <<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<:3 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:3
-EAS54_61:8:4:173:814 163 chr2 1111 99 35M = 1289 213 GATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCA =====================<==========;== MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:4
-B7_593:3:303:131:673 83 chr2 1112 99 36M = 947 -201 ATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATC <;<<<<<<<<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:4:235:899:847 147 chr2 1112 99 35M = 950 -197 ATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCAT <7<<<<<<<<:<<<<:<</<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS1_105:8:179:119:876 83 chr2 1112 60 35M = 917 -230 ATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCAT <<<<<<<7<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS56_59:2:162:272:415 147 chr2 1112 83 35M = 923 -224 ATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCAT =7=======;5==<<6==1==<============= MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS114_45:6:44:77:1255 83 chr2 1113 99 35M = 955 -193 TAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATC 79998;;;9:;<696<;.<;;<<;<;<;<;;;<8; MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:2:162:257:203 163 chr2 1114 99 35M = 1301 222 AAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:3:55:464:146 99 chr2 1114 99 35M = 1295 216 AAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:6:308:667:658 147 chr2 1116 34 35M = 918 -233 AAAGATCACTTCAGCAATAAGATATAACCATCCTA <9;;;45;&<;&.<5683;84+<;<;+8<;<<8;< MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:2 UQ:i:23 H0:i:0 H1:i:0
-EAS56_57:4:98:862:154 163 chr2 1116 99 35M = 1290 209 AAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<:99<; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS56_61:5:263:314:696 83 chr2 1117 99 35M = 953 -199 AAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTAC <<;<;:<<<<7<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:8:83:1456:1854 163 chr2 1117 99 35M = 1275 193 AAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:4:231:815:626 83 chr2 1119 99 35M = 940 -214 GATCAATACAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTA '<4%<<<22<<,<<;<<4;<<<<<<<<<<<<<<7< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:17 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_32:4:246:647:765 83 chr2 1119 99 35M = 937 -217 GATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTA 9<+,<<&,39<,<;<<<<<<<&<<<<;0<<3;<<< MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:7:256:354:173 83 chr2 1121 99 36M = 957 -200 TCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAAT -9<<:9<<;6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:5:53:61:31 83 chr2 1122 99 35M = 949 -208 CAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAAT 5;;<95<<5<<<<<<<<<<:5;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:3:308:509:948 99 chr2 1123 99 36M = 1298 211 AATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATAC <9<<<<<<<;<7<<;<<<<<<<;<<<<7<<;2;<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:2:247:900:123 147 chr2 1123 99 35M = 920 -238 AATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATA ;;;;.<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:3:307:113:346 83 chr2 1123 99 35M = 938 -220 AATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATA <<<<9<<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:1:168:69:249 83 chr2 1125 99 35M = 936 -224 TTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACA ;0;<;;<<<<<<<<<<<<<;<<<8<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:2:54:1886:719 147 chr2 1125 99 35M = 941 -219 TTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACA 883777;;:;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:7:94:273:165 147 chr2 1128 99 35M = 945 -218 AGAAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATAT ;3&;;:<<:<-<-<<8:<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:7:155:530:532 163 chr2 1128 99 35M = 1319 226 AGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATAT =================================== MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:5:61:1885:163 163 chr2 1128 99 40M = 1281 193 AGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACC <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<9::::4 MF:i:18 Aq:i:79 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:6:193:661:771 83 chr2 1129 99 35M = 952 -212 GCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATG :&<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:6:75:1503:1399 83 chr2 1130 99 40M = 969 -201 CAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTA &;;8;<<<;<<<<,6<<70<<7<<<<<<9<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:2:42:28:552 163 chr2 1131 99 35M = 1294 198 AAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<3<:;9;8 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:4:61:631:567 147 chr2 1131 99 35M = 957 -209 AAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCA <<7<<<<<<<<</<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:3:257:288:731 147 chr2 1131 99 35M = 939 -227 AAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCA <<:<<7<<<<<;<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:2:214:950:32 83 chr2 1132 99 35M = 947 -220 AGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCAC =&==4======:;==6<==:=============== MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:1:12:88:200 83 chr2 1133 99 35M = 968 -200 GAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACC 9<<;<<<;<;6;<;:<<<7<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:5:256:444:399 163 chr2 1133 99 35M = 1289 191 GAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<-;<<8 MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:4:174:753:617 99 chr2 1136 75 35M = 1299 198 GATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:1:115:226:443 99 chr2 1137 99 35M = 1314 212 ATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAAC <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:26:1867:162 163 chr2 1137 70 35M = 1299 197 ATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAAC ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;78698 MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:3:308:66:538 99 chr2 1138 99 35M = 1321 218 TATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:3:229:543:583 147 chr2 1139 99 35M = 976 -198 ATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACAC </<;+5<855;<6<<<<;<<<<<<9<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:1:17:595:863 163 chr2 1139 89 35M = 1289 185 ATAACCATCCTACTAAATACACATGCACCTAACTC :<4:<<1:<<<9<+<+1<%<7&&9-71<17)7</4 MF:i:18 Aq:i:33 NM:i:2 UQ:i:19 H0:i:0 H1:i:1
-EAS51_62:7:248:17:435 147 chr2 1139 99 35M = 969 -205 ATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACAC <1<<88++<:<<:;<;<<<:<<<;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:6:35:186:412 99 chr2 1139 99 35M = 1306 202 ATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACAC <<<<<<<<4<<<<<:<<<<<<:<<<<<<<<<;;<: MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:2:307:252:632 83 chr2 1142 99 35M = 998 -179 ACCATCCTGCTAAATACATATGCACCTAACACAAG <77<;,5<,9<<<<<<;<<<<<7<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:11 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_108:7:108:440:208 147 chr2 1142 99 35M = 975 -202 CCCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAG +35:486<<4<<<<<<<<<<<-<<<<<7<<)<<<- MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:12 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:7:74:866:49 83 chr2 1143 99 35M = 969 -209 CCAACCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGA :8<&<<<<7<<<<:<<<<<<8<5<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:2:66:757:918 83 chr2 1143 99 35M = 985 -193 CCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGA <9<45;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:5:220:733:736 147 chr2 1143 99 35M = 959 -219 CCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGA :;<77;<<9<<<<<9;<<<<<<;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:6:175:289:351 99 chr2 1144 99 35M = 1319 210 CATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGAC <<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<9<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:2:56:155:49 147 chr2 1145 99 35M = 970 -210 ATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACT ;:5;;<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<= MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:5:299:336:613 99 chr2 1145 99 35M = 1293 183 ATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:4:30:432:228 83 chr2 1145 99 35M = 967 -213 ATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACT <76<<<:<<<<<<<;<:<<<<<:<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:5:93:312:331 83 chr2 1145 99 35M = 953 -227 ATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACT <;;:;<6<<<<;<:<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:3:133:707:886 147 chr2 1146 99 35M = 978 -203 ACCTAATAAATACATATGCACCTAACACAAGACTA %5-2;&6<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:2 UQ:i:9 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:3:50:312:219 163 chr2 1146 99 35M = 1288 177 TCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTA <<<<<<<<<<<;<<<<<;<;<<<;<<<<<<;;;;; MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:1:82:670:302 147 chr2 1146 99 35M = 973 -208 TCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTA %448<7<<<<<<7<<<<<&<<7<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:2:47:591:698 99 chr2 1146 99 35M = 1313 202 TCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:8:122:430:882 99 chr2 1147 99 35M = 1338 226 CCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:4:46:1566:668 83 chr2 1148 99 35M = 959 -224 CTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACC 5<<:<<<<<<<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:4:92:411:955 147 chr2 1149 99 36M = 979 -206 TACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCA 2<+<<<<9<<<<<<<;+<;<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:2:96:419:327 99 chr2 1149 99 35M = 1331 217 TACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;;9<9 MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:7:20:1444:328 147 chr2 1149 99 35M = 993 -191 TACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCC 9<3<<==;=<===;=<=====<<===========< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:4:198:59:675 163 chr2 1150 99 35M = 1315 200 ACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTATCCT <.<<<<<<;<<<<<<<<<<<**<;<;2<;6;&*2& MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:2 UQ:i:10 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:7:114:506:971 83 chr2 1150 99 35M = 986 -199 ACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCA ;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:2:94:356:809 163 chr2 1151 99 35M = 1334 218 CTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:; MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:3:155:541:234 163 chr2 1151 99 35M = 1319 203 CTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAG <<7<<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<;;;08 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_32:7:272:328:400 83 chr2 1151 99 35M = 977 -209 CTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAG 4;<<<<<7<;<<<-<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:7:283:186:707 163 chr2 1154 99 36M = 1321 203 AATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<;<<<<8 MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:4:86:660:932 99 chr2 1154 99 35M = 1338 219 AATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATT ================================9:= MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:6:264:705:89 147 chr2 1155 99 35M = 983 -207 AAACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTC <(<2<&<)<<<7<8<<<<<<<<<<.<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:1 UQ:i:7 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:4:5:396:292 83 chr2 1155 99 35M = 981 -209 ATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTC <:<6<7<:<:;;;<<<;<7<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:6:178:342:866 163 chr2 1155 72 35M = 1311 191 ATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTC ;<<<<<;<<<8<<;<;<3<8/<<<<6<<</<8;<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:1:155:809:543 163 chr2 1156 99 35M = 1352 231 TACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCA <<<<<<<<<<<<<<<<7<;<<<<<<<<<<<1<;<; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:1:119:880:781 99 chr2 1157 99 35M = 1312 190 ACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+<<<<7<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:6:283:963:234 147 chr2 1157 99 35M = 992 -200 ACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCAT <5<;<;97;;:;<<7<;<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:1:28:745:352 99 chr2 1159 99 35M = 1329 205 ATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAA <<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:8:147:687:428 147 chr2 1159 99 35M = 998 -196 ATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAA ;1<''48;4)<<:<<<<;<<6;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:36 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:3:101:809:776 99 chr2 1160 99 35M = 1326 201 TATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:35:538:1882 163 chr2 1160 98 35M = 1337 212 TATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAA ;);43.50;3;93;;4;3;;;9-7.;*;;966*75 MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:7:41:34:211 83 chr2 1164 99 35M = 980 -219 CACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAA 7</::<<7<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:1:2:1422:1820 83 chr2 1164 99 35M = 1004 -195 CACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAA *4617;;4;1;;79;/7&,4;9;;;7<;;<<<;<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:6:194:998:663 83 chr2 1165 99 35M = 1002 -198 ACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAA ;</<<<7<<<<;<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:8:10:975:766 83 chr2 1166 99 35M = 959 -242 AATAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAAT ++4<<+<+<<<<8<<22;<<<<<2<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:2 UQ:i:24 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:6:94:1273:1462 83 chr2 1166 99 35M = 995 -206 CCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAAT 8.<<<;<:<<<<;<<;;;<<<;<;<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:8:64:350:174 83 chr2 1166 99 35M = 1000 -201 CCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAAT 709<<;<;<<<<<<<;7<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:7:166:84:766 83 chr2 1167 99 35M = 990 -212 ATAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATA %8<=+<-<<<</<<<<8<<<<<;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:85:580:481 163 chr2 1167 99 35M = 1359 227 CTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATA <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<;<<<<6:<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:4:191:40:536 83 chr2 1167 66 35M = 977 -225 ATAAAAAAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATA +1<<,<&<<:<.;<7/7<<<<;.<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:3 UQ:i:27 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:2:40:1291:1045 147 chr2 1167 99 35M = 980 -222 CTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATA *<<<9<<<<<<:0<9<<<<<<<;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:3:221:881:916 99 chr2 1168 96 35M = 1327 194 TAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATAC <<;<<8<<;<<<<<<<;<<<<28<:<8<:;<;;;< MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:7:35:392:2042 163 chr2 1168 99 35M = 1332 199 TAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACNAATAC ======;==========<<=======7=;!<7;;; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:4:192:714:341 163 chr2 1170 99 35M = 1346 211 ACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTA <<9<<<<<<<<<<<8<<<<<;<<;8<<<88;;;;9 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:1:189:876:833 163 chr2 1173 99 36M = 1349 212 CAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAG <<<<<<<<<<<8<8<<<<<;<;;<<;<<<<<;<<<6 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:5:299:743:762 163 chr2 1173 99 36M = 1345 208 CAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAG <<<;<<<<<<<<<:;<<<.<:<<<<<<<<<<;;;;; MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:6:107:252:533 83 chr2 1173 60 35M = 1025 -183 CAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTA 3<<<<+<<96<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:1
-EAS1_97:5:154:952:558 147 chr2 1173 99 35M = 1007 -201 AAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTA %<<9;;<<;;;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:4:184:659:377 147 chr2 1173 99 35M = 992 -216 CAAAACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTA 1;<+<;<6;66<<;<<<<;;<<<8<<<<8<<;<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:6:137:811:130 163 chr2 1175 99 35M = 1351 211 AGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;;; MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:4:124:367:72 163 chr2 1175 99 35M = 1377 237 AGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;; MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:8:60:358:494 147 chr2 1179 44 35M = 979 -235 TACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTA 7<77;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:14 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:6 H1:i:36
-EAS114_30:7:319:11:255 163 chr2 1179 92 35M = 1337 193 TACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<: MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:10
-B7_610:7:26:749:174 99 chr2 1183 78 35M = 1357 209 CAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<9<8<<<9<;94 MF:i:18 Aq:i:11 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:6 H1:i:31
-EAS1_103:7:112:578:782 99 chr2 1183 89 35M = 1366 218 CAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAG <;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<< MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:5 H1:i:25
-EAS1_105:1:234:185:359 83 chr2 1183 46 35M = 1029 -189 CAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAG <<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:9
-EAS112_34:4:92:412:435 147 chr2 1184 89 35M = 1003 -216 AGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGG <;<52:=,====:=========<============ MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:6:24:105:1046 99 chr2 1184 99 35M = 1377 228 AGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:4 H1:i:2
-EAS1_97:2:128:629:484 163 chr2 1185 96 35M = 1359 209 GATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGG <<49<<<<<9<<<<99<<<<<<<<<<<<+<-)7)) MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:4 H1:i:45
-EAS219_FC30151:1:53:140:421 83 chr2 1185 99 35M = 1016 -204 GATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGG <<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:6:99:557:427 163 chr2 1186 99 35M = 1342 191 ATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<+;<7:8:; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:3:253:175:31 147 chr2 1187 72 35M = 1008 -214 TTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGAT ;+;<;<<<<<<<<9<<9<<<<<;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:4:13:701:55 147 chr2 1187 99 36M = 1015 -208 TTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATG 0:+<7<;9<;<<<<<<<3<<<<<;;<<<:<<3<<<< MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:6:220:809:850 147 chr2 1187 60 35M = 986 -236 TTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGAT 9+5<;*<<<2:0<<8:<*00<<<:<*<<<<<<<<& MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:5:30:599:589 147 chr2 1188 99 36M = 1003 -221 TCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGA 90<;<<<<<<<<+<<<;;<;<;<<<<<<<<6<<8<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:8:35:118:589 83 chr2 1188 99 35M = 999 -224 TCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATG 67<<<<<;<<<<<<<:7<<<<:<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:4:37:604:389 147 chr2 1188 99 35M = 998 -225 TCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATG 00;:;========9========<9========<== MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:2:168:61:867 83 chr2 1188 99 35M = 997 -226 TCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATG ;7<<<<<<<<<<<<<7<<:<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:7:197:399:319 83 chr2 1189 99 35M = 1012 -212 CAAAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGA &<+==<<5<<<8<89;;<<<<<<8<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:5:267:170:250 163 chr2 1189 99 35M = 1377 223 CATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGA <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:4:174:157:573 83 chr2 1191 99 35M = 1012 -214 TAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGA 8<<<<4<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:6:39:956:676 83 chr2 1191 99 35M = 1023 -203 TAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGA 899985;;<;:9;;:9<;:9:5;<;;;<;<;<<<< MF:i:18 Aq:i:44 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:37:763:1437 83 chr2 1191 99 35M = 994 -232 TAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGA 79979;<;<;;;<;;;;;;6:;<:;<:8;<<<<;< MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:2:50:513:882 83 chr2 1192 99 35M = 1031 -196 AAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAA <<<<:<<<<<:<<:<<<<::<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:2:15:1763:1143 147 chr2 1193 99 35M = 1023 -205 AAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:46 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:4:189:571:366 83 chr2 1194 99 35M = 1002 -227 AACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAAT <<;<<<<<:<<<;<<<;;;<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:3:166:532:438 99 chr2 1194 99 35M = 1386 227 AACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAAT <<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;<<<<;<;:;;<;< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:309:109:987 83 chr2 1194 99 35M = 1024 -205 AACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAAT <<<<<<:<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:1:171:527:247 83 chr2 1194 67 35M = 1027 -202 AACAAATGCTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAAT <547*9)&&7+;+<<7<<<;<<<;3<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-B7_589:8:139:727:808 163 chr2 1195 99 35M = 1363 203 ACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATT <<<<<<<<<<<<<:<;<<<<<<<<9;<;9<6;<<9 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:3:202:275:776 83 chr2 1196 99 36M = 1002 -230 CAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTAC ;<<<<;;<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:6:12:484:836 163 chr2 1197 99 35M = 1372 210 AAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTAC <<<<<<<<<<<<<<<<<7<:<<<<<<9<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:6:21:553:57 99 chr2 1197 99 35M = 1358 196 AAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTAC <<<<<<<<<<<;;<<<;<<;<<;<<<;;9<;<;<9 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:5:4:939:2021 83 chr2 1197 99 40M = 1031 -206 AAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAAT ;;;;:8;<5:<<<7/<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:3:194:378:230 83 chr2 1198 99 35M = 1022 -211 AATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACC <<;<8<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:7:68:242:834 163 chr2 1200 99 36M = 1386 222 TACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:2:22:471:500 163 chr2 1200 99 35M = 1365 200 TACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTA =======<=<====:<2===9==;=;9;;=;;;;5 MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:4:139:989:144 163 chr2 1201 99 35M = 1387 221 ACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAA <<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<;<<<<<<<;;<;; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:5:188:20:592 83 chr2 1202 95 35M = 1032 -205 CTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAAT 2<<7;<<<<,;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:1:189:863:213 83 chr2 1202 99 35M = 1039 -198 CTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAAT 7:<7<<<<44;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_1:4:62:561:531 83 chr2 1203 99 35M = 1036 -202 TACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATT <<7<<<<:<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:8:70:1349:1788 83 chr2 1203 99 35M = 1043 -195 TACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATT <7;<<8<74;;<1<<71<;7<;;<;<7<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:5:197:914:256 147 chr2 1204 97 35M = 1049 -190 ACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTG <5;<8<5/;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:35:896:1588 83 chr2 1205 91 35M = 1032 -208 CTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGG 77999:.:<<;<;;;<<;<;<<<<<;<;;<<<<;; MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:6:43:47:279 163 chr2 1206 99 35M = 1405 234 TAGACCTAAGAGGGATGAGAAGTTACCTAATTGGT <<<<<<<<<<<<<;:<-<<<<<<<<<<<<:;;+7; MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_95:2:211:954:174 99 chr2 1207 99 35M = 1393 221 AGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTA ===============================777= MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:2:5:1219:137 99 chr2 1209 99 35M = 1384 210 ACCTAAGAGGGATGAGAAATTACATAATTGGTACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<(<<<<<<:9<;= MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:7 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_57:7:33:954:724 83 chr2 1210 97 35M = 1049 -196 CCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAA ;<;<;<<-7;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:3:176:402:458 163 chr2 1210 99 36M = 1376 202 CCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<;;<; MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:4:81:687:1379 163 chr2 1210 99 35M = 1366 191 CCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:1:45:239:851 83 chr2 1211 61 35M = 1023 -223 CTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAAT *2*0<<<<<<<<<<<<<<<<9<<3<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS56_65:5:312:985:871 163 chr2 1212 99 35M = 1369 192 TAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<9<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:4:38:557:1441 163 chr2 1212 99 35M = 1381 204 TAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:3:88:465:1877 147 chr2 1212 99 35M = 1055 -192 TAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATG <<<<<<<:<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<7;<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:7:149:123:265 163 chr2 1213 99 35M = 1395 217 AAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9 MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:6:47:1791:444 83 chr2 1213 74 35M = 1041 -207 AAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGT 978879;:;;<:;;<<;:<9<<<<;6;;;;<<<<; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:6
-EAS51_62:3:68:996:104 147 chr2 1214 70 35M = 1041 -208 AGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTA <1<8<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:4
-B7_593:2:68:140:542 99 chr2 1217 95 36M = 1398 217 GGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAAT <<<8;<<;<<<<<;<<;<<<<<8;<-<8<82;;;-8 MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:6
-EAS188_7:7:67:719:786 163 chr2 1218 43 35M = 1383 200 GGATGAGAAATTACCTAATTGGTACACTGTACAAT ;;<<<<<<&<<:13&<1<<<:<<<)/&/))<'6-< MF:i:18 Aq:i:13 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_108:5:321:712:224 83 chr2 1220 58 35M = 1051 -204 ATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATAT =;===7;===7=========;=:;=========;= MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS114_26:4:100:238:596 163 chr2 1220 56 35M = 1403 218 ATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATAT ======9=====;=======5===;====/=;=== MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:13
-EAS51_62:7:312:236:655 163 chr2 1222 99 35M = 1412 225 GAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTC <<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:5
-EAS56_63:6:102:816:260 147 chr2 1225 99 35M = 1049 -211 AAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGA <<<<<<::<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:7:34:144:868 163 chr2 1226 76 35M = 1412 221 AATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4;< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_78:7:215:516:299 99 chr2 1226 99 35M = 1406 215 AATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGAT <<<<<<;<<<<;;;;<;;<<<<;<<9<;<<1;7/; MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:3:81:12:1231 163 chr2 1228 99 35M = 1391 198 TTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGA <<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<6 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:2:30:644:942 147 chr2 1229 83 35M = 1045 -219 TACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGAT 85%+;<<9;<9<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:4:41:519:609 163 chr2 1229 99 35M = 1401 207 TACCTAATTGGTACAATGGACAATATTCTGATGAT 1<<<<<<<<<<<<<<<4<-:<+6<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:12 H0:i:0 H1:i:1
-B7_591:7:116:814:89 99 chr2 1231 99 36M = 1408 213 CCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<;<<;<<66< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:5:169:714:644 163 chr2 1231 99 35M = 1437 241 CCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:6:73:420:812 99 chr2 1232 66 35M = 1414 217 CTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGT <<<<<1<<<<::1<7<:<96<9<:<<:4<70:11< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:6:17:1179:393 99 chr2 1232 99 35M = 1412 215 CTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:4< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:8:118:829:36 99 chr2 1233 99 35M = 1417 219 TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTT <<<<<<<<<:<2<<<<<<:<<<<<<<<<<<<71;< MF:i:18 Aq:i:52 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:2:125:875:553 147 chr2 1233 99 36M = 1075 -194 TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTA -;<;:;<<;6<<<<<<6<;<:<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS114_32:4:7:282:424 99 chr2 1233 83 35M = 1397 199 TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTT <<<3<<<9<<<<3<<<<<9<<<9,<;;9;&*;3,. MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:6:107:447:488 163 chr2 1233 99 35M = 1412 214 TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTT <<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:7:66:891:294 83 chr2 1233 99 35M = 1057 -211 TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTT :<<5;;<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS56_57:8:72:44:435 99 chr2 1235 76 35M = 1392 192 ATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTAA <<<<<<<<<<<2;<;<<;<<<;<<8<82<;22<8& MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:4:18:1335:1514 147 chr2 1235 99 40M = 1063 -212 ATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAA ::/::<<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:7:72:1288:1211 147 chr2 1235 84 35M = 1052 -218 ATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTAC <);<:<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:3:200:263:280 83 chr2 1236 99 35M = 1078 -193 TTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACA )<<<8<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:5:68:440:424 147 chr2 1237 99 35M = 1060 -212 TGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACAC <<2<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:6:255:441:47 147 chr2 1237 99 35M = 1072 -200 TGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACAC ;;7<;:<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:8:174:557:872 163 chr2 1237 99 35M = 1423 221 TGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACAC <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<7<<;<<6:<<2117 MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS51_64:3:255:45:399 163 chr2 1238 99 35M = 1404 201 GGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACT <<3<8<<8<0<<;<<<0<<<</+8<611<<;71;7 MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:2:264:157:150 147 chr2 1238 30 35M = 1054 -219 GGAAAAATGGACAAGATTCTGATGAGGGTTACACT .3%:+<<*;*<2<<1<1*,*<<7<<+<<<&<<<<< MF:i:130 Aq:i:30 NM:i:3 UQ:i:35 H0:i:0 H1:i:0
-EAS139_19:5:95:944:247 99 chr2 1238 99 40M = 1424 226 GGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<:;::: MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:2:301:161:195 147 chr2 1239 75 35M = 1076 -198 GTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTA ''6%6<6<<<4<<<<<<<<)<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:2:141:7:963 83 chr2 1240 85 36M = 1061 -215 TACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAA 95+<<9<<5<;;<<;<<;'<<<<<;<<<7<9<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS114_39:6:76:282:1668 99 chr2 1240 99 35M = 1401 196 TACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<;<;<<<8 MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:5:64:199:1288 147 chr2 1240 77 35M = 1079 -196 TACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:1:49:911:980 163 chr2 1241 99 35M = 1434 228 ACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAA <<<<<<<<<<;<<<<<<<8<<<<;<;<<88-<;33 MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:8:66:1046:167 147 chr2 1241 99 35M = 1060 -216 ACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:5:303:542:924 83 chr2 1242 76 35M = 1083 -194 CAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAA +<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS114_45:2:79:554:354 147 chr2 1242 63 35M = 1082 -195 CAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAA 98988;7;;;;:;;;;;;;;;;:;;;:;;;;;9;; MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:1:248:122:558 163 chr2 1243 99 35M = 1436 228 AATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAG <<<<:<<<<<<<<<<<<<;<<<<:<6:4<<::6:6 MF:i:18 Aq:i:52 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:7:109:22:383 83 chr2 1244 99 35M = 1071 -208 ATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGC <;9;<8<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:3:43:1229:1855 83 chr2 1244 99 35M = 1074 -205 ATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGC 8<<<<;8<<<;;5<<28<<<<<<<<<<<<7;;<<; MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:2:74:656:272 83 chr2 1245 99 35M = 1088 -192 TGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCC ;;;</<<<<<5;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS56_65:7:118:775:467 83 chr2 1245 99 35M = 1075 -205 TGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-B7_593:7:15:244:876 99 chr2 1246 43 36M = 1440 230 GTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCA <<<<<<;<<<<<<<<;<<;;;<<<<<:<<<9;<<<; MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:1:63:28:1549 163 chr2 1247 77 35M = 1439 227 TACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;<<<<7 MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:7:310:800:761 83 chr2 1249 99 35M = 1055 -229 CAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATA 1<<:<:<:<<<<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:14:978:1296 83 chr2 1249 90 35M = 1104 -180 CAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATA 77177;9;2:;;:;;(;;9;<;;;;:;;;:7;<<; MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:8:26:242:35 147 chr2 1251 99 35M = 1084 -202 ATATTTTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACT <<<77!!7<;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:2 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:8
-EAS114_45:7:6:758:988 83 chr2 1253 99 35M = 1087 -201 ATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTT 3-7*73;;399:9;9;7<-(<;;<;;:;9::;;7; MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:2:315:412:921 99 chr2 1254 99 35M = 1424 205 TTCTGATGATGGTTACACTACAAGCCCATACTGTA <;<;<<<<<<<;<<<<<<<<8<<<;<<:<<;;+<8 MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:2 UQ:i:33 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_30:3:215:840:760 163 chr2 1256 99 35M = 1416 195 CTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTCCT <<<<<<<<<<<<<<<;<<<88<+<<:<;3585,+: MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:1 UQ:i:11 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:5:284:212:932 147 chr2 1257 10 35M = 1063 -229 TGATGATGGTTACGCTAAAAGTCCATGCTTTACTG 82%<8:<-:<<:**:<-<<8<)/2/<:/<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:3 UQ:i:42 H0:i:0 H1:i:0
-EAS1_97:4:290:121:79 163 chr2 1257 99 35M = 1420 198 TGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<7;<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:1:88:54:900 83 chr2 1257 68 35M = 1069 -223 TGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTCACTG ============;=================;9=== MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:1 UQ:i:26 H0:i:0 H1:i:1
-EAS188_7:3:100:735:530 83 chr2 1257 99 35M = 1058 -234 TGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:7:32:562:1695 147 chr2 1258 76 35M = 1085 -208 GATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGC :5:::<88/<:<<<<<<<<<7<9<<&<959<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:3:173:627:465 163 chr2 1260 99 36M = 1444 220 TGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<2;;4;;7 MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS1_95:1:77:589:741 83 chr2 1263 99 35M = 1078 -220 TGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTC 8=;;==606;========================= MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:8:27:228:31 147 chr2 1264 99 35M = 1082 -217 GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCA 99;;;<<<<<<:<<;<;<<;<<<<;<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:6:54:695:952 147 chr2 1264 99 35M = 1076 -223 GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCA 277%<9<4)<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:6:300:622:86 83 chr2 1264 99 35M = 1102 -197 GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCA <:<<<:<6;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:7:71:62:254 163 chr2 1264 99 35M = 1438 209 GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTCCTGCTACTCA <<<<<<7<<<<7<<<<<3<<<<<<&<<.<<::<:% MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_28:1:168:609:646 99 chr2 1264 99 36M = 1436 208 GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAA <<<<<<<<<<<;<<<<<:<8<<<<;<<<<<4<<<9< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:1:84:92:1246 163 chr2 1265 99 35M = 1437 207 GTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAA <<<<<<<<<<<<<<<<5<:<<5<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:3:310:193:629 83 chr2 1267 99 36M = 1103 -200 TACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATAT 9<9<6;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:6:111:379:700 73 chr2 1268 0 35M = 1268 0 ACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATAT 7<<:<<<<02<<6&<</<<</+9/98*<966/3/< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:6:111:379:700 133 chr2 1268 0 * = 1268 0 CGCACTGGCAATATTTGTGTGTTTACTTTTTTGCA :1+&;;6;:;918;);;):,19.9:).):::.&3( MF:i:192
-EAS114_30:6:137:741:866 163 chr2 1268 99 35M = 1429 196 ACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATAT <<<<8<<;;;<<<<;<<<;;;<;4<<8;<<;%<8; MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:7:23:1126:1886 147 chr2 1268 99 35M = 1094 -209 ACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATAT 5*.:.5<<::<<<<<<<<:5<<<<<<<<<<:2<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:3:21:423:169 99 chr2 1270 99 35M = 1468 233 ACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATAT <<<<<;<<<<<<;<<<<<;;<<<<<<<<9+:5<;; MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:3:110:984:98 147 chr2 1270 99 36M = 1092 -214 ACTAAAACCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATC :81<<<<+;;8<+<8<<<<<;<<<8;<<<<<<<<8; MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:5:54:1351:910 99 chr2 1270 99 35M = 1448 213 ACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATAT <<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<18<<:< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:2:237:855:581 147 chr2 1271 87 35M = 1105 -201 CTAAACGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATC /+<<<&)2;66;/;;+<;;3133<3<3;9;<999< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:8:80:542:549 163 chr2 1271 99 35M = 1443 207 CTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATC <<<<<<<<;<<<<<<<<:<<<<-<;;<;7<;3;9; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:4:7:1347:375 163 chr2 1271 99 35M = 1436 200 CTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATC ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;9;;;8;;;;;97777 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:6:191:540:493 99 chr2 1273 99 35M = 1432 194 AAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_81:7:324:472:791 147 chr2 1274 89 35M = 1110 -199 AAAGCCAATACTTTACTGCTACTCAATATATCCAT <<.)5*&;;11<<<,5<33:-<<6<<<<:<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:8:83:1456:1854 83 chr2 1275 99 35M = 1117 -193 AAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATG <<67<:<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:5:290:247:509 163 chr2 1276 99 35M = 1450 209 AGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGT <<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<92<;;;<;96;19 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:5:90:629:652 99 chr2 1276 99 35M = 1456 215 AGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:3:39:1671:1928 163 chr2 1276 99 35M = 1453 212 AGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGT <<<<<<<;<<<<;<<<<<4<<<;3<<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:1:128:584:952 83 chr2 1277 99 35M = 1101 -211 GCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTA 7<;9;0:<<<:<<:<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:7:28:979:519 163 chr2 1278 99 35M = 1439 196 CCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;9: MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:7:219:40:833 83 chr2 1278 99 35M = 1094 -219 CCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAA <<*<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:1:289:207:323 163 chr2 1279 99 35M = 1462 218 CCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAAC <<<:<<<<<:<<<<<<<<<<;<<899<<13)939; MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:3:45:758:616 163 chr2 1280 99 35M = 1473 228 CATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<;;< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_32:7:42:804:114 163 chr2 1281 99 35M = 1452 206 ATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<;;<;; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:5:61:1885:163 83 chr2 1281 99 40M = 1128 -193 ATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTG ;:;;;;<<8<<:<<:<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:79 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:4:282:962:46 99 chr2 1282 99 35M = 1437 190 TACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:6:143:620:158 83 chr2 1283 99 35M = 1107 -211 ACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAAT <4;<;<;<;6<<7<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:3:50:312:219 83 chr2 1288 99 35M = 1146 -177 ACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCG <,;83:<::6<<<<<<<;:<;<<<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_93:5:256:444:399 83 chr2 1289 99 35M = 1133 -191 CTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC ;+549<:<.<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:1:17:595:863 83 chr2 1289 89 35M = 1139 -185 AAGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC ))55))+2&<<,:5<,0657<<<<:<:<:<<<<<< MF:i:18 Aq:i:33 NM:i:2 UQ:i:16 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_105:6:23:885:274 147 chr2 1289 99 35M = 1089 -235 CTACTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC 2+*27==;;==<<.;:<=<=<============== MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:1 UQ:i:9 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_61:8:4:173:814 83 chr2 1289 99 35M = 1111 -213 CTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC <<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:5:263:557:988 147 chr2 1289 84 35M = 1108 -216 CTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC 1-41:<15+<<<<<<599<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:2:326:153:231 163 chr2 1290 43 35M = 1477 222 TGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCT <<<<<<<<<9<<<<<<<<<,<<<<<<8<<8.;.;4 MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:4:98:862:154 83 chr2 1290 99 35M = 1116 -209 TGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCT 856:;7<:<<9<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:2:6:529:366 147 chr2 1291 99 35M = 1103 -223 GCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTT 9;8;8<:<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:5:299:336:613 147 chr2 1293 99 35M = 1145 -183 TACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGT 1;4(+<<5<4<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:3
-B7_597:2:42:28:552 83 chr2 1294 99 35M = 1131 -198 ACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTA </8:<<:<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS114_39:3:55:464:146 147 chr2 1295 99 35M = 1114 -216 CTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTAC ;(;;;;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:2
-EAS54_67:6:109:953:668 99 chr2 1297 99 35M = 1485 223 CAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTT ;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<;<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:1
-EAS139_19:1:82:946:392 163 chr2 1297 99 40M = 1493 236 CAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCAAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<8<<8<<:4488 MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:1 UQ:i:19 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:3:308:509:948 147 chr2 1298 99 36M = 1123 -211 AATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCT ;;+;;;.8<<;;;<<<<<<<<<<<<<8<<<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:4:174:753:617 147 chr2 1299 75 35M = 1136 -198 ATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCT <;<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:3:26:1867:162 83 chr2 1299 70 35M = 1137 -197 ATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCT 97999:;<<9;;<:<<;;;<;;<<<<<<<;;<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:2:162:257:203 83 chr2 1301 99 35M = 1114 -222 ATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAA <;<;:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:5:62:841:1994 121 chr2 1301 70 35M = 1301 0 ATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAA 87878;;6:;;:<<<<:<:;;;<;<<<;<;;<;<< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:5:62:841:1994 181 chr2 1301 0 * = 1301 0 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!! MF:i:192
-EAS139_19:7:44:1807:833 99 chr2 1301 99 40M = 1449 188 ATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<;<<9<<<<<89;;;: MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:7:280:607:113 163 chr2 1303 99 35M = 1468 200 ATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAAT ===================;===;=====<=7=9: MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:2:260:147:818 163 chr2 1303 82 35M = 1497 229 ATCCATGTAACAAATCTGCGCTTTTACTTCTAAAT <<<<<<3<<<<<;<<<<)<1<<<&<7<<<;<4/9< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS54_71:7:194:867:616 99 chr2 1303 99 34M = 1481 213 ATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTATT <8<<<<<<<<<<<8<<4<<<<<<8<<3<<5<&(+ MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:2 UQ:i:23 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:7:85:262:751 83 chr2 1305 99 40M = 1105 -240 CCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAC 22;99;<<8<<<<<<<;<;<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<+ MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS54_81:6:35:186:412 147 chr2 1306 99 35M = 1139 -202 CATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTA <<4:6<;<&<:4<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:8:46:1528:799 147 chr2 1306 96 35M = 1109 -232 CATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:5:124:978:501 163 chr2 1307 99 36M = 1499 228 ATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:3:88:866:774 163 chr2 1307 99 35M = 1478 206 ATGTAACAAATCTGCTCTTGTACTTCTAAATCTAT <<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<68<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS221_1:6:4:1131:104 163 chr2 1307 99 35M = 1487 215 ATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<:: MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:6:178:342:866 83 chr2 1311 72 35M = 1155 -191 AACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAA <<9<<<&;;<<<<77<;<<<5;:<<<:<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:1:119:880:781 147 chr2 1312 99 35M = 1157 -190 ACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAA ;8<<;<<<<:<84<<<<:<<<<<<<<<<<<<5<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-B7_591:2:46:220:58 99 chr2 1313 99 36M = 1483 206 CAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<:<; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:2:47:591:698 147 chr2 1313 99 35M = 1146 -202 CAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAA 7;;;;:<<:<:<<<<<7<<:<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_105:1:115:226:443 147 chr2 1314 99 35M = 1137 -212 AAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAA <<;;<;<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:4:198:59:675 83 chr2 1315 99 35M = 1150 -200 AATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAAT <<<<<4<4<:<<<;7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS221_3:2:76:1729:813 163 chr2 1317 99 35M = 1506 224 TCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:36 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:8:147:360:141 99 chr2 1319 47 35M = 1501 218 TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAA <<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7 MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_95:7:155:530:532 83 chr2 1319 99 35M = 1128 -226 TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAA :<<<><<8<<<<<><<<<<><<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS51_62:4:308:614:911 99 chr2 1319 90 35M = 1493 209 TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<8< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS54_65:3:155:541:234 83 chr2 1319 99 35M = 1151 -203 TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAA 78;<7<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:6:175:289:351 147 chr2 1319 99 35M = 1144 -210 TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAA 9;;:+<<<<<;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:7:283:186:707 83 chr2 1321 99 36M = 1154 -203 CGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAAATT 889;<7;<7<<7<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_105:3:308:66:538 147 chr2 1321 99 35M = 1138 -218 CGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAAAT 996999;<9;<:<<<<<:<<7<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_108:5:11:555:330 163 chr2 1321 99 35M = 1492 206 CGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<4<;< MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:7:84:411:336 73 chr2 1322 75 35M * 0 0 GCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAATT <<<;<<<;<<<<<<<<<<<<:<<;<<<<<<;8<;< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:5:52:1278:1478 163 chr2 1322 47 35M = 1513 226 GCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAAATT <<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<9<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_53:3:101:809:776 147 chr2 1326 99 35M = 1160 -201 GTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAAC <<<-<;7;<<<<:;<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS192_3:3:221:881:916 147 chr2 1327 96 35M = 1168 -194 TAATTCTAAATCTAGAACAAAATTAAAATTTAACA 44%-4(5<;9/,:<68:1<:8<:<<84;<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:3 UQ:i:41 H0:i:0 H1:i:0
-EAS1_105:1:28:745:352 147 chr2 1329 99 35M = 1159 -205 CTTCTAAATCTATAACAAAATTAAAATTTAACAAA 4;;*;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_45:2:23:1754:796 99 chr2 1329 99 35M = 1488 194 CTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAA ;<<;<;<;<;<;<<;;;;;<<<<;;<<<<<97999 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:2:96:419:327 147 chr2 1331 99 35M = 1149 -217 TCTAAATCTATAACAAAATTAAAATTTAACAAAAG ;1<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_97:4:274:287:423 163 chr2 1332 75 35M = 1515 218 CTAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:7:35:392:2042 83 chr2 1332 99 35M = 1168 -199 ATAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGT +<<<<</<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:2:94:356:809 83 chr2 1334 99 35M = 1151 -218 AAATCTATAACAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAA <<<<3<<<<;;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:26 H0:i:0 H1:i:1
-EAS114_30:7:319:11:255 83 chr2 1337 92 35M = 1179 -193 TCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATA ;8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:7:35:538:1882 83 chr2 1337 98 35M = 1160 -212 TCTATAACAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATA 73797;;3<;;<6;;<<<;8:;:;<;:<:;<<;;; MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:18 H0:i:0 H1:i:1
-EAS51_66:1:64:182:741 153 chr2 1338 10 35M * 0 0 AAAAAAACAAATTAAACTCTAACAAAAGTAAATAA (+;1&(9*%0<*(*&<*5,/+<,&<&<<6<<<<<< MF:i:32 Aq:i:10 NM:i:6 UQ:i:63 H0:i:0 H1:i:0
-EAS54_61:4:86:660:932 147 chr2 1338 99 35M = 1154 -219 ATATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAA &<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_53:8:122:430:882 147 chr2 1338 99 35M = 1147 -226 CTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAA 0<<:<<<<<<<:3<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:6:99:557:427 83 chr2 1342 99 35M = 1186 -191 AACAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACA <<-<<<<9<<<<<:<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1 UQ:i:12 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:5:299:743:762 83 chr2 1345 99 36M = 1173 -208 AAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATA ;<<<1<<<<<+<;<;7<<;<<<<<<<<<;<<;;<<7 MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:2:303:428:326 99 chr2 1345 74 35M = 1515 205 AAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:4:192:714:341 83 chr2 1346 99 35M = 1170 -211 AAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATA <<<3;<<<<9:<<</<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:1:189:876:833 83 chr2 1349 99 36M = 1173 -212 TTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTA 7;<<<<:;;<</<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:7:37:79:581 163 chr2 1349 68 35M = 1533 219 TTAAAATTTAAAAAAAGTAAATAAAACACATAGCT <>4<>>>>;>>&>->9>9;4>->>>>,4>9>,<1> MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS139_19:2:82:154:1333 99 chr2 1349 77 40M = 1511 202 TTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACACAGCTAAAAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;;:;: MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:1:290:286:763 99 chr2 1349 75 35M = 1515 201 TTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCT <<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<8<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:4:3:248:1491 73 chr2 1349 99 35M * 0 0 TTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:8:< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:3:6:1064:1805 99 chr2 1350 99 35M = 1502 187 TAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:6:137:811:130 83 chr2 1351 99 35M = 1175 -211 AAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAA <<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:1:155:809:543 83 chr2 1352 99 35M = 1156 -231 AAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAA <<<+0<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_63:3:41:468:459 99 chr2 1352 75 35M = 1513 196 AAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;;7 MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:4:31:622:216 73 chr2 1354 99 35M * 0 0 ATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<96<7 MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:8:105:854:975 163 chr2 1354 71 35M = 1523 202 ATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAAC <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7:<;;;;5 MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:7:26:749:174 147 chr2 1357 78 35M = 1183 -209 TAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAA (<<)<<<<6<<<<<<<<<<&:<3<<<6<<<)<:<< MF:i:18 Aq:i:11 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:6:21:553:57 147 chr2 1358 99 35M = 1197 -196 AACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAA <<+<<<<<<<<<;<<<<8<<<<<<8<<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:2:128:629:484 83 chr2 1359 96 35M = 1185 -209 AAAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAA :(::<</*;<<99<<<-<;<<<<4<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1 UQ:i:7 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:2:85:580:481 83 chr2 1359 99 35M = 1167 -227 AAAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAA =)====77========8=3====3=========== MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1 UQ:i:8 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:8:139:727:808 83 chr2 1363 99 35M = 1195 -203 AAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGC <<;<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:2:22:471:500 83 chr2 1365 99 35M = 1200 -200 GTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAA =9===0====;=77<==8;====;=========== MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_103:7:112:578:782 147 chr2 1366 89 35M = 1183 -218 AAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAA +<<<%<<<<6<;<<<<6:<<<<:<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:4:81:687:1379 83 chr2 1366 99 35M = 1210 -191 TAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAA <<<<<<<<<<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_65:3:320:20:250 99 chr2 1367 77 35M = 1532 200 AAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAA <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;+:<;<<3 MF:i:18 Aq:i:6 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:5:312:985:871 83 chr2 1369 99 35M = 1212 -192 ATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAAC <8<<<<.<.<<<<:<<<<<.<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:6:12:484:836 83 chr2 1372 99 35M = 1197 -210 AAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAA <<<<</<4<<&7<<<<;<<<<<<<<<<<<<1<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:3:176:402:458 83 chr2 1376 99 36M = 1210 -202 AAATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTA </<+<4&;<<<<7<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1 UQ:i:14 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:7:50:1229:1313 163 chr2 1376 77 35M = 1528 187 ACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_65:4:124:367:72 83 chr2 1377 99 35M = 1175 -237 CATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTA ,<<<8,<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:5:267:170:250 83 chr2 1377 99 35M = 1189 -223 CATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTA -<;<5-:<<<<;<<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS220_1:6:24:105:1046 147 chr2 1377 99 35M = 1184 -228 CATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTA +<<<</<<<<<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:4:38:557:1441 83 chr2 1381 99 35M = 1212 -204 GATAAAAATAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCT <&<<<<<,<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:2 UQ:i:16 H0:i:0 H1:i:1
-EAS188_7:7:67:719:786 83 chr2 1383 43 35M = 1218 -200 TAAAAAAAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAA $<<;<-1<<<8<<*&<;<;,<<3<<<<33<<<33< MF:i:18 Aq:i:13 NM:i:2 UQ:i:28 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:2:5:1219:137 147 chr2 1384 99 35M = 1209 -210 AAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAG <<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:7:68:242:834 83 chr2 1386 99 36M = 1200 -222 AAATAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTAT <<68<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:1 UQ:i:21 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:3:166:532:438 147 chr2 1386 99 35M = 1194 -227 AACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTA <<&7<<<<<<<+<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:4:139:989:144 83 chr2 1387 99 35M = 1201 -221 ACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTAT <&<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:3:81:12:1231 83 chr2 1391 99 35M = 1228 -198 AAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGT <<<<<<<7<<<<<<<5<'<6/<<<5<<<<<<2<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_57:8:72:44:435 147 chr2 1392 76 35M = 1235 -192 AAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTA <<<<;7;<<<<;<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_95:2:211:954:174 147 chr2 1393 99 35M = 1207 -221 AAAGAAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAA ====*=====6======================== MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:1 UQ:i:9 H0:i:1 H1:i:0
-B7_595:7:149:123:265 83 chr2 1395 99 35M = 1213 -217 AGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAG <;&<<<<<:<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_32:4:7:282:424 147 chr2 1397 83 35M = 1233 -199 CAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGTTAAAGAT 1<<<<<9<<<<<31<77;;;;7<3<<2+;<3<<<< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:10 H0:i:0 H1:i:1
-B7_593:2:68:140:542 147 chr2 1398 95 36M = 1217 -217 AAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGT ;;<<;7<<<<<<:<<<:<<<:<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_39:6:76:282:1668 147 chr2 1401 99 35M = 1240 -196 AACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGG <<<<<:<<<8<8<<<<<::<<<<7<<<<<<2<<<8 MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:4:41:519:609 83 chr2 1401 99 35M = 1229 -207 AACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGG <4;<;<<<<<<<<;4:<<;<<<<<<<<<<<;<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_26:4:100:238:596 83 chr2 1403 56 35M = 1220 -218 CAAAAACTATTCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGG 4<<<<;<3<3&<3<1<5<31<<3<<<<<<2<<;<, MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1:i:1
-EAS51_64:3:255:45:399 83 chr2 1404 99 35M = 1238 -201 AAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGA <5<5<4$;;7/<<<177&7;<<<<<<;<<4<<<<< MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:6:43:47:279 83 chr2 1405 99 35M = 1206 -234 AAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAA <:<<79<<<19<<<1<<9<<+<<<<<3<3<<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_78:7:215:516:299 147 chr2 1406 99 35M = 1226 -215 AAGCTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAA ;;))7<8:855<<4<;:<<87<<<7<<;<<<*3<< MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:1 UQ:i:8 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:7:116:814:89 147 chr2 1408 99 36M = 1231 -213 ACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAA :38<;<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_610:7:34:144:868 83 chr2 1412 76 35M = 1226 -221 AGCTAAGGAATGGGAAAGGTGTGGGGAAAAAAGTA &9+&7<&&0&<6<.0<<7<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:76 NM:i:4 UQ:i:50 H0:i:0 H1:i:0
-EAS51_62:7:312:236:655 83 chr2 1412 99 35M = 1222 -225 TGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTA <<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:6:17:1179:393 147 chr2 1412 99 35M = 1232 -215 TGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:6:107:447:488 83 chr2 1412 99 35M = 1233 -214 TGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTA <<3<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:6:73:420:812 147 chr2 1414 66 35M = 1232 -217 CTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAA 5'<<<,<&,<<,<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:3:215:840:760 83 chr2 1416 99 35M = 1256 -195 AAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACT <<<8<::<;;<<<:<7<7<;;;<<<<<<<<<<;<< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_589:8:118:829:36 147 chr2 1417 99 35M = 1233 -219 AGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTC <8<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:52 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:4:290:121:79 83 chr2 1420 99 35M = 1257 -198 ATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCA <1<<:<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:8:174:557:872 83 chr2 1423 99 35M = 1237 -221 GGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAAT .77<:<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:2:315:412:921 147 chr2 1424 99 35M = 1254 -205 GTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATA 4-<79;<<<4:;:<<<<<<<<4<<<38<<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:5:95:944:247 147 chr2 1424 99 40M = 1238 -226 GTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCT :7::;<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_30:6:137:741:866 83 chr2 1429 99 35M = 1268 -196 GATGAGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCT <;0:%<:9<<<:<<<<;<<:<<;0;<<<<<::<<6 MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:1 H1:i:0
-EAS188_7:6:191:540:493 147 chr2 1432 99 35M = 1273 -194 GTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGT <<9<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:1:49:911:980 83 chr2 1434 99 35M = 1241 -228 GGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGG 44:7<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:1:248:122:558 83 chr2 1436 99 35M = 1243 -228 GGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGA <;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:52 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:1:168:609:646 147 chr2 1436 99 36M = 1264 -208 GGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAG ;;<<<<=======;;:;======;==<========= MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:4:7:1347:375 83 chr2 1436 99 35M = 1271 -200 GGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGA 47999<<<;;;;;;:5;:;<;;<;;;;;<;;;;;< MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:4:282:962:46 147 chr2 1437 99 35M = 1282 -190 GAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAG 69<<<<<:<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_73:5:169:714:644 83 chr2 1437 99 35M = 1231 -241 GAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAG ;<<<<<<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_11:1:84:92:1246 83 chr2 1437 99 35M = 1265 -207 GAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAG <<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<5<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_34:7:71:62:254 83 chr2 1438 99 35M = 1264 -209 AAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGT <<<<<<;8<<<<;<:<<<<<<<;<<;<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_97:7:28:979:519 83 chr2 1439 99 35M = 1278 -196 AAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTA <<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<6<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_1:1:63:28:1549 83 chr2 1439 77 35M = 1247 -227 AAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTA <<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_593:7:15:244:876 147 chr2 1440 43 36M = 1246 -230 AAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGTGAGTATA ;<<<7<<<<<.2<-<<<<<<<<<:<<<<<<<<<2<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:1
-EAS56_59:8:80:542:549 83 chr2 1443 99 35M = 1271 -207 AGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAA =9====7=;=======;;==;========<===== MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_28:3:173:627:465 83 chr2 1444 99 36M = 1260 -220 GTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATT :<<<<;<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS219_FC30151:5:54:1351:910 147 chr2 1448 99 35M = 1270 -213 ACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTT <7<7;;<<<<<;<<;;<<;<<<<<<<<<<<<<<;< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS139_19:7:44:1807:833 147 chr2 1449 99 40M = 1301 -188 CTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCCAC :6:9:<<<6<88<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:5:290:247:509 83 chr2 1450 99 35M = 1276 -209 TCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTT 49';<<<<<8;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS112_32:7:42:804:114 83 chr2 1452 99 35M = 1281 -206 TCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCC ;9<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS218_4:3:39:1671:1928 83 chr2 1453 99 35M = 1276 -212 CAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCCA <<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_59:5:90:629:652 147 chr2 1456 99 35M = 1276 -215 ATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCCACTT <:<7::<:<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_66:1:289:207:323 83 chr2 1462 99 35M = 1279 -218 CTAGTGGGAGTATAAATTGATTTCCACTTTGGAAA &</<7<<:<7::<<<<+3<-7<<:<7<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1 UQ:i:12 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_95:7:280:607:113 83 chr2 1468 99 35M = 1303 -200 GGAGTATAAATTGTTTTCCACTTTGGAAAACAATT 18<-<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_99:3:21:423:169 147 chr2 1468 99 35M = 1270 -233 GGAGTATAAATTGTTTTCCACTTTGGAAAACAATT ;376;0<<<<99<<<<<<-;<4<<<<<<<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS56_61:3:45:758:616 83 chr2 1473 99 35M = 1280 -228 ATAAATTGTTTTCCACTTTGGAAAACAATTTGGTA <<;<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_64:2:326:153:231 83 chr2 1477 43 35M = 1290 -222 ATTGTTTTCAACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTT ::6=68=<*$;*=========6============= MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:3 H0:i:0 H1:i:1
-EAS192_3:3:88:866:774 83 chr2 1478 99 35M = 1307 -206 TTGTTTTCCACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTC <<<;<<<<:<<<<<:<8<<<<<<<<<<8<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_71:7:194:867:616 147 chr2 1481 99 35M = 1303 -213 TTTTCCACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTT 38:;;:<:<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_591:2:46:220:58 147 chr2 1483 99 36M = 1313 -206 TTCCACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTT 98<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS54_67:6:109:953:668 147 chr2 1485 99 35M = 1297 -223 CCACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTT <:)9<<<<<<<<8:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_1:6:4:1131:104 83 chr2 1487 99 35M = 1307 -215 ACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTTTT 61;;;<<<<<<<<<;:<<<:<<;<<<<;<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS114_45:2:23:1754:796 147 chr2 1488 99 35M = 1329 -194 CTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTTTTT 88897;;;;:;:;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS1_108:5:11:555:330 83 chr2 1492 99 35M = 1321 -206 GGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTT 6;6;9766+<<<<9:2=<===6============= MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:4:308:614:911 147 chr2 1493 90 35M = 1319 -209 AAAAACAATTTGGTAATTTAGTTTTTTTTTTTTTC %<<<;:<::<6,<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:2 UQ:i:31 H0:i:0 H1:i:1
-EAS139_19:1:82:946:392 83 chr2 1493 99 40M = 1297 -236 GAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTC :;:;:,::<:;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS51_62:2:260:147:818 83 chr2 1497 82 35M = 1303 -229 AAAATTTGGTAATTTAGTTTTTTTTTTTTTCTTTT 6.=..++==6=76==&===========99====== MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:2 UQ:i:18 H0:i:0 H1:i:1
-B7_591:5:124:978:501 83 chr2 1499 99 36M = 1307 -228 AATTTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTC <9<;<<::<;<<;<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-B7_597:8:147:360:141 147 chr2 1501 47 13M1D22M = 1319 -218 TTTGGTAATTTAGTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTT <86<<<<73<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:130 Aq:i:47 NM:i:1 UQ:i:27 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_39:3:6:1064:1805 147 chr2 1502 99 35M = 1350 -187 TTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTT ;88<;<;;<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1:i:0
-EAS221_3:2:76:1729:813 83 chr2 1506 99 35M = 1317 -224 TAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTT <+6<<<&1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:36 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:2 H1:i:0
-EAS54_65:6:326:71:741 153 chr2 1509 0 35M * 0 0 TCTCGTTTTTTTTTCTTTCTTTTCTCTTTTTTTTT !!<66<<<<<<<<<&<<7&<<<<:<*<<<<<<<<1 MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:2 UQ:i:22 H0:i:1 H1:i:12
-EAS112_34:6:145:144:263 73 chr2 1509 0 35M * 0 0 TTTCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCCTTTCTTTT <<<<<<<<<<<<<<<<+4+4&+&(&&*2&8&&&)& MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:4 UQ:i:29 H0:i:0 H1:i:0
-EAS1_105:1:329:407:872 73 chr2 1510 0 35M * 0 0 TTCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTTTTTTTTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<6;<<&4::<++<(&;<< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:2 UQ:i:46 H0:i:0 H1:i:0
-EAS139_19:2:82:154:1333 147 chr2 1511 77 40M = 1349 -202 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT :5'::<<<;<<<<<<</3<<<&4&7<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:85 H1:i:85
-EAS56_63:3:41:468:459 147 chr2 1513 0 35M = 1352 -196 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTT +;<<<<<<<<<<<;&<<;;88&<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:85 H1:i:85
-EAS114_28:6:11:151:750 153 chr2 1513 5 36M * 0 0 GTTTTTATTTTTTTCCTCTCTCTTTTTTTTTTTTTT :'1:%4;4<<<+;6;&9+6;/<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:32 Aq:i:5 NM:i:3 UQ:i:41 H0:i:0 H1:i:3
-EAS139_11:5:52:1278:1478 83 chr2 1513 47 35M = 1322 -226 GTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTT .8::<<<<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:9 H1:i:85
-B7_591:2:309:798:997 153 chr2 1514 0 36M * 0 0 TTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT 466;<<744077+&7097&%&4<9<<<9<<<::<<< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:12 H1:i:85
-EAS1_93:6:218:144:794 121 chr2 1514 0 35M = 1514 0 TTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTT ;92/;5:<6)+<5)67</9<&<&<<<:<<<57<<< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:22 H1:i:85
-EAS1_93:6:218:144:794 181 chr2 1514 0 * = 1514 0 GGGTGCATTGCTATGTTGCGGTCGCTTTGCCTCCT ++(3:&)5<9035<3):-<53<+&&-+)<<&)&<6 MF:i:192
-EAS1_97:6:222:305:337 153 chr2 1514 0 35M * 0 0 TTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTTTTTTTTTTTTT ;;;;;<<';<<<<*;<<<78;7<7<;<<<<<<<<< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:2 UQ:i:32 H0:i:0 H1:i:37
-EAS1_105:3:7:35:528 89 chr2 1514 0 35M * 0 0 TTTTTTTTTTGTTCTTTACTCTTTTTTTTTTTTTT <<<<<<<<<<5<<<(<<%<<-8<<<<<<<<<8<<< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:2 UQ:i:24 H0:i:0 H1:i:0
-EAS54_65:2:182:924:833 137 chr2 1514 0 35M * 0 0 TTTTTTTTTTTTTATTTGCGCTTTTTTTTTTTTTT <<<<<<<<<<<<<)7<<)3/:07<<9<9<<==<7< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:3 UQ:i:30 H0:i:0 H1:i:0
-EAS54_81:8:78:735:536 153 chr2 1514 0 35M * 0 0 TTTTTTTTTTTTTCATTTCTCTTTTTTTTTTTTTT ;9<<<<<<<.7<9'%1<<)2::<<<<<<<<<<<<< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:0 H1:i:15
-EAS56_59:5:232:336:46 137 chr2 1514 0 35M * 0 0 ATTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTGTTTCTTTTTTT +<<<<<<<<<<<<6<<<<;<6<<&&<,3<<<<3,, MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:3 UQ:i:50 H0:i:0 H1:i:0
-EAS188_4:5:308:552:77 89 chr2 1514 0 35M * 0 0 TTTTCTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTT 1;-<%<;8<<<<<&<5-<58:5:<<<<<<<<<<<< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:30 H1:i:85
-B7_597:5:125:957:753 137 chr2 1515 0 35M * 0 0 TTTTTTTTTTTTCTCTCCTCTTTTTTTTTTTTTTT <8<<<;<8;8//++(,(+++&++(/+008880;;/ MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:2 UQ:i:14 H0:i:0 H1:i:1
-EAS1_97:4:274:287:423 83 chr2 1515 0 35M = 1332 -218 TTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT 7<<<<9<<9<<<.<<<<90-<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:12 H1:i:85
-EAS54_71:8:234:21:950 89 chr2 1515 0 33M * 0 0 TTTTTTTTTTTTCTCCTCTCTTTTTTTTTTTTT <<<<<<<<<&<;2;&-<,<+;<<<7<<<;<;<; MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:2 UQ:i:17 H0:i:0 H1:i:7
-EAS56_61:6:256:67:461 117 chr2 1515 0 * = 1515 0 TCATGTTTGTGTCTTTCTATGCATTTTTTTTTTTT !!7181!63:6-:!-163(-1%-18<<4<<<<<<< MF:i:192
-EAS56_61:6:256:67:461 185 chr2 1515 0 35M = 1515 0 TTGTTTTTTCTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT *.%53.:)1+9;3397;1795507+335;.&51)5 MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:2 UQ:i:14 H0:i:2 H1:i:85
-EAS56_65:8:317:83:500 153 chr2 1515 0 35M * 0 0 TTTTTTTTTTTTCTTTTCTCCTTTTTTTTTTGTTT ;;;;;<<<<<<<3<<<)-;31<<)97<;9<<:<<< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:2 UQ:i:41 H0:i:0 H1:i:0
-EAS114_30:2:303:428:326 147 chr2 1515 0 35M = 1345 -205 TTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT 4<;<<;<;<4<<8;;;;.8+;<<;<8<;<;<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:11 H1:i:85
-EAS188_7:1:290:286:763 147 chr2 1515 75 35M = 1349 -201 TTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT <<<<;<<<<<<<&<<<<&77<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:29 H1:i:85
-B7_591:7:89:67:709 89 chr2 1516 0 36M * 0 0 TTTTTTTTTTTGTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTT :7:::9:7:<<7<'<<477<<<<<<<<<:<<<<<:< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:2 UQ:i:28 H0:i:0 H1:i:17
-EAS56_65:3:47:64:359 89 chr2 1516 0 35M * 0 0 TTTTTTTTTTTCTCTCCTCTTTTTTTTTTTTTTTT <<<6<<<<<<<4<4</9<4@<<;<<<<<<<<<<<< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:2 UQ:i:33 H0:i:0 H1:i:6
-EAS56_65:4:296:78:421 121 chr2 1518 0 35M = 1518 0 TCTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT !!<<<:<<<<..<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:4 H0:i:85 H1:i:85
-EAS56_65:4:296:78:421 181 chr2 1518 0 * = 1518 0 TGTTGGTGTTCGTTTTTTCTCCTGTTTCTTTTTCT <<*<4<<<;:<0<<<<<<<<+;<9<<1<<;<<<+: MF:i:192
-EAS1_95:4:238:124:196 89 chr2 1519 0 35M * 0 0 TTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT <0<9.<5.5<<<<9<1<<5<<85<5<<<9<:<<<< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:85 H1:i:85
-EAS54_65:7:56:57:985 117 chr2 1519 0 * = 1519 0 TTCTGTCTTCTCTCCTGTCTTCTTTTCTCTTCTTT <9'<.<7<<2<<;77<7<<<<7<7<<<<7<<<2<< MF:i:192
-EAS54_65:7:56:57:985 185 chr2 1519 0 35M = 1519 0 TTTTTTCTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 666666*6&1666+64666666666&266666666 MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:9 H0:i:85 H1:i:85
-EAS56_61:3:5:45:441 89 chr2 1519 0 35M * 0 0 TTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT ;;58:<:<(:<<11<&<1<<;<<<<><<<<<<<<< MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:82 H1:i:85
-B7_589:6:33:356:636 73 chr2 1520 0 35M * 0 0 TTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT <<<<<<<8;<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<;;3&3 MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:14 H1:i:85
-EAS114_45:6:86:859:1779 137 chr2 1520 0 35M * 0 0 TTTTTTTCATTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;)7699 MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:26 H0:i:0 H1:i:15
-EAS54_71:8:105:854:975 83 chr2 1523 71 33M = 1354 -202 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG <<<<;<:<<;<&<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:85 H1:i:85
-EAS51_62:4:187:907:145 153 chr2 1524 28 35M * 0 0 TTTCTTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTATTGCAT <<<+;;,6<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:32 Aq:i:28 NM:i:3 UQ:i:59 H0:i:0 H1:i:0
-EAS54_71:4:284:269:882 73 chr2 1524 0 34M * 0 0 TTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTGCA <;<<<<<8<7<8;<<<;<7<<<<<;272;73&&) MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:17 H0:i:0 H1:i:85
-EAS56_63:4:141:9:811 137 chr2 1524 10 35M * 0 0 TTTCTTTTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTCTACAT <<<;<<<<<<<;<;<:<<<;<<<<<<<<..));;. MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:3 UQ:i:47 H0:i:2 H1:i:27
-EAS114_30:6:277:397:932 73 chr2 1524 0 35M * 0 0 TTTCTTTTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:8(,0%( MF:i:32 Aq:i:0 NM:i:3 UQ:i:42 H0:i:2 H1:i:85
-EAS139_11:7:50:1229:1313 83 chr2 1528 77 35M = 1376 -187 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATGCCA <<<<,<&<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:0 NM:i:1 UQ:i:11 H0:i:3 H1:i:7
-EAS54_65:3:320:20:250 147 chr2 1532 77 35M = 1367 -200 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATGCCAGAAA +'''/<<<<7:;+<;::<<<;;<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:6 NM:i:2 UQ:i:24 H0:i:1 H1:i:2
-EAS114_26:7:37:79:581 83 chr2 1533 68 35M = 1349 -219 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATGCCAGAAAA 3,,,===6===<===<;=====-============ MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:2 UQ:i:23 H0:i:0 H1:i:1
+++ /dev/null
-@HD VN:1.5 SO:coordinate
-@SQ SN:ref LN:45
-r001 0 ref 9 30 3S6M1P1I4M * 0 0 AAAAGATAAGGATA *
-r002 0 ref 9 30 5S6M * 0 0 GCCTAAGCTAA 01234567890
-r003 0 ref 9 30 6M5S * 0 0 GCCTAAGCTAA 01234567890
-r004 2064 ref 29 17 6H5M * 0 0 TAGGC 01234
+++ /dev/null
-@SQ SN:2L LN:23011544
-@SQ SN:2LHet LN:368872
-@SQ SN:2R LN:21146708
-@SQ SN:2RHet LN:3288761
-@SQ SN:3L LN:24543557
-@SQ SN:3LHet LN:2555491
-@SQ SN:3R LN:27905053
-@SQ SN:3RHet LN:2517507
-@SQ SN:4 LN:1351857
-@SQ SN:U LN:10049037
-@SQ SN:Uextra LN:29004656
-@SQ SN:X LN:22422827
-@SQ SN:XHet LN:204112
-@SQ SN:YHet LN:347038
-@SQ SN:dmel_mitochondrion_genome LN:19517
-HWI-EAS241:138:4:17:7389-21153#0 256 2L 8878 3 36M * 0 0 CGCTGGACTCGCAAAGTGGACTTGTTCAGCAAGGAC FEAAEDBEEFEDGDGGG@88GBEED:BB<BGDGG<F NM:i:0 NH:i:2 CC:A:X CP:f:1.90973e+07 HI:i:0 XC:i:1
+++ /dev/null
-X pseudogene exon 170410 170513 . + . gene_id "ENSG00000228572"; transcript_id "ENST00000431238"; exon_number "1"; gene_name "NCRNA00108"; transcript_name "NCRNA00108-001";
-X pseudogene exon 171604 171758 . + . gene_id "ENSG00000228572"; transcript_id "ENST00000431238"; exon_number "2"; gene_name "NCRNA00108"; transcript_name "NCRNA00108-001";
-X pseudogene exon 172682 172712 . + . gene_id "ENSG00000228572"; transcript_id "ENST00000431238"; exon_number "3"; gene_name "NCRNA00108"; transcript_name "NCRNA00108-001";
-X protein_coding exon 192989 193061 . + . gene_id "ENSG00000182378"; transcript_id "ENST00000399012"; exon_number "1"; gene_name "PLCXD1"; transcript_name "PLCXD1-001";
-X protein_coding exon 198149 198351 . + . gene_id "ENSG00000182378"; transcript_id "ENST00000399012"; exon_number "2"; gene_name "PLCXD1"; transcript_name "PLCXD1-001";
-X protein_coding exon 200834 200981 . + . gene_id "ENSG00000182378"; transcript_id "ENST00000399012"; exon_number "3"; gene_name "PLCXD1"; transcript_name "PLCXD1-001";
-X protein_coding CDS 200855 200981 . + 0 gene_id "ENSG00000182378"; transcript_id "ENST00000399012"; exon_number "3"; gene_name "PLCXD1"; transcript_name "PLCXD1-001"; protein_id "ENSP00000381976";
-X protein_coding start_codon 200855 200857 . + 0 gene_id "ENSG00000182378"; transcript_id "ENST00000399012"; exon_number "3"; gene_name "PLCXD1"; transcript_name "PLCXD1-001";
-X protein_coding exon 205400 205536 . + . gene_id "ENSG00000182378"; transcript_id "ENST00000399012"; exon_number "4"; gene_name "PLCXD1"; transcript_name "PLCXD1-001";
-X protein_coding CDS 205400 205536 . + 2 gene_id "ENSG00000182378"; transcript_id "ENST00000399012"; exon_number "4"; gene_name "PLCXD1"; transcript_name "PLCXD1-001"; protein_id "ENSP00000381976";
+++ /dev/null
-@HD VN:1.0 SO:queryname
-@RG ID:myid PL:illumina PU:P123456 LB:L123456 DT:2013-03-20T21:00:00-0700 SM:S123456 CN:MYCN
-B123456:6:1101:10000:137074 77 * 0 0 * * 0 0 CATGTGTATCACCCAGTACAATGCCTGACACACAGCAGTCACTTAAAGAGTGCTATTGCTATTATACAGTCATACT HHHHHHHHHHHHHHHHFHHHHHHHHHHGHHHHHHHBHHEFFHHHHHHHHHDHHHFHFHHHHHFHHEHFB@CDCCDE RG:Z:myid AM:i:0 SM:i:0
-B123456:6:1101:10000:137074 141 * 0 0 * * 0 0 CAAGGAACTTTACAGTTCAGGGGAGTTTTCCAGTGGCAGAAAGTGGGAAGATGATGCTCCCAAGGAAGAAGTAGAT HHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHFHGHFHDFEF?EFEDEFFHHHFHDFHHHFHHHEFBBHD@D=C# RG:Z:myid AM:i:0 SM:i:0
-B123456:6:1101:10000:171579 589 * 0 0 * * 0 0 GAAGCATAGGACATGTCAATGATGGCCAGGTGTGTGAGGAAGAAGTACATGGGGGTGTGAAGCTTAGAGTCCAGGC ############################################################################ RG:Z:myid AM:i:0 SM:i:0
-B123456:6:1101:10000:171579 653 * 0 0 * * 0 0 ACCCTGCTGGGGAATGGGGTCATCTTTGGGATTATCTGCCTGGACTCTAAGCTTCACACACCCATGTACTTCTTCC 8BBBB>6<C<53679<:6<@95>><937964@?:@@B;A@8>=<>CB=CD########################## RG:Z:myid AM:i:0 SM:i:23
+++ /dev/null
-import pysam
-
-is_paired = 0
-is_proper = 0
-
-for read in pysam.AlignmentFile("ex1.bam", "rb"):
- is_paired += read.is_paired
- is_proper += read.is_proper_pair
-
-print ("there are alignments of %i paired reads" % is_paired)
-print ("there are %i proper paired alignments" % is_proper)
-
-
+++ /dev/null
-while (<STDIN>) {
- # Samfile refactoring
- s/Samfile/AlignmentFile/g;
-
- # AlignedRead refactoring
- s/AlignedRead/AlignedSegment/g;
-
- # Do these patterns first as they match
- # the new names
- s/\.query/\.query_alignment_sequence/g;
- s/\.positions/\.getReferencePositions()/g;
-
- # Tabixfile, etc
- s/Tabixfile/TabixFile/g;
- s/Fastafile/FastaFile/g;
- s/Fastqfile/FastqFile/g;
-
- # basic attributes
- s/\.qname/\.query_name/g;
- s/\.tid/\.reference_id/g;
- s/\.pos/\.reference_start/g;
- s/\.mapq/\.mapping_quality/g;
- s/\.rnext/\.next_reference_id/g;
- s/\.pnext/\.next_reference_start/g;
- s/\.tlen/\.query_length/g;
- s/\.seq/\.query_sequence/g;
- if (/\.qual =/) {
- s/([[\].0-9a-zA-Z]*)\.qual = (\S*)/$1.query_qualities = pysam.fromQualityString($2)/g;
- } else {
- s/([[\].0-9a-zA-Z]*)\.qual/pysam.toQualityString($1\.query_qualities)/g;
- }
- s/\.alen/\.reference_length/g;
- s/\.aend/\.reference_end/g;
- s/\.rlen/\.query_alignment_length/g;
- s/([[\].0-9a-zA-Z]*)\.qqual/pysam.toQualityString($1\.query_alignment_qualities)/g;
- s/\.qstart/\.query_alignment_start/g;
- s/\.qend/\.query_alignment_end/g;
- s/\.qlen/\.query_alignment_length/g;
- s/\.mrnm/\.next_reference_id/g;
- s/\.rnext/\.next_reference_id/g;
- s/\.mpos/\.next_reference_start/g;
- s/\.rname/\.reference_id/g;
- s/\.isize/\.query_length/g;
- s/\.cigar/\.cigartuples/g unless (/\.cigarstring/);
-
- s/\.blocks/\.getBlocks()/g;
- s/\.aligned_pairs/\.getAlignedPairs()/g;
- s/\.inferred_length/\.getInferredQueryLength()/g;
-
- s/\.overlap()/\.getOverlap()/g;
-
- # PileupProxy
- s/\.n([^a-zA-Z])/\.nsegments$1/g;
-
- # if (/\.mrnm/ || /\.rnext/ || /\.mpos/ || /\.rname/)
- # {
- # warn "Deprecated tag $& at line $.\n";
- # }
- print;
-}
+++ /dev/null
-;; This buffer is for notes you don't want to save, and for Lisp evaluation.
-;; If you want to create a file, visit that file with C-x C-f,
-;; then enter the text in that file's own buffer.
-
-Samfile -> AlignmentFile
-AlignedRead -> AlignedSegment
-Tabixfile -> TabixFile
-Fastafile -> FastaFile
-Fastqfile -> FastqFile
-
-Changes to the AlignedSegment.API:
-
-Basic attributes
-================
-
-qname -> query_name
-tid -> reference_id
-pos -> reference_start
-mapq -> mapping_quality
-rnext -> next_reference_id
-pnext -> next_reference_start
-cigar = alignment (now returns CigarAlignment object)
-cigarstring = cigarstring
-tlen -> query_length
-seq -> query_sequence
-qual -> query_qualities, now returns array
-tags = tags (now returns Tags object)
-
-
-Derived simple attributes
-=========================
-
-alen -> reference_length, reference is always "alignment", so removed
-aend -> reference_end
-rlen -> query_length
-query -> query_alignment_sequence
-qqual -> query_alignment_qualities, now returns array
-qstart -> query_alignment_start
-qend -> query_alignment_end
-qlen -> query_alignment_length, kept, because can be computed without fetching the sequence
-mrnm -> next_reference_id
-mpos -> next_reference_start
-rname -> reference_id
-isize -> query_length
-
-
-Complex attributes - functions
-===============================
-
-blocks -> getBlocks()
-aligned_pairs -> getAlignedPairs()
-inferred_length -> inferQueryLength()
-positions -> getReferencePositions()
-overlap() -> getOverlap()
-
-
-Backwards incompatible changes:
-================================
-
-1. Empty cigarstring now returns None (intstead of '')
-
-2. Empty cigar now returns None (instead of [])
-
-3. When using the extension classes in cython modules, AlignedRead
- needs to be substituted with AlignedSegment. Automatic casting
- of the base class to the derived class seems not to work?
-
-4. fancy_str() has been removed
-
-
-=====================================================
-
-Kevin's suggestions:
-
-
-* smarter file opener
-* CRAM support
-* CSI index support (create and use)
-* better attribute and property names
-* remove deprecated names
-* add object oriented CIGAR and tag handling
-* fetch query that recruits mate pairs that overlap query region
-* other commonly re-invented functionality
-
- qname -> template_name
- pos -> reference_start
- aend -> reference_stop
- alen -> reference_length
- tid -> ref_id
- qname -> template_name (not a high priority, but would be clearer)
- qstart -> query_start (really segment_align_start)
- qend -> query_stop (really segment_align_stop)
- qlen -> query_length (really segment_align_length)
- qqual -> query_qual (really segment_align_qual)
- rlen -> drop in favor of len(align.seq)
- inferred_length -> inferred_query_length
- is_* -> replace with flag object that is a subclass of int
- cigarstring -> str(align.cigar)
- tags -> opts object with a mapping-like interface
- Non-backward compatible:
- rname, mrnm, mpos, isize -> remove
- cigar -> CigarSequence object (or something similar)
- All coordinate and length queries return None when a value is not available (currently some return None, some 0)
- Store qualities as an array or bytes type
-
-
-Marcel's suggestions:
-
- I recently sent in a pull request (which was merged) that improves the pysam doc a bit. While preparing that, I also wrote down some ways in which the API itself could be improved. I think the API is ok, but for someone like me who uses pysam not every day, some of the details are hard to remember and every time I do very basic things I end up looking them up again in the docs. I can recommend this article, written for C++, but many points still apply:
- http://qt-project.org/wiki/API_Design_Principles .
-
- Originally, I wanted to convert at least some of these suggestions to pull requests, but I'm not sure I have the time for that in the near future. So before I forget about this completely, I thought it's best to at least send this to the list. I'm concentrating on issues I found in Samfile and AlignedRead here.
-
- - The terminology is inconsistent - often two words are used
- to describe the same thing: opt vs. tag, query vs. read,
- reference vs. target. My suggestion is to consistently use
- the same terms as in the SAM spec: tag, query,
- reference. This applies both to documentation and
- function/property names.
-
- - In line with the document linked to above (see the
- section "The Art of Naming"): Do not abbreviate function
- and property names. For example, tlen -> template_length,
- pos -> position, mapq -> mapping_quality etc.
-
- - Be consistent with multiword function and variable names. I
- suggest to use the PEP8 convention. This isn't so visible
- to the user in Samfile and AlignedRead, it seems, but there
- are things like convertBinaryTagToList which could be
- renamed to convert_binary_tag_to_list.
-
- - Don't make functions that are not setters or getters a
- property. This applies to
- AlignedRead.positions/.inferred_length/.aligned_pairs/.blocks
- and currently also Samfile.references, for example. Making
- these a property implies to the user that access requires
- constant time. This is important in code like this:
-
- for i in range(n):
- do_something_with(read.positions[i])
-
- This looks inconspicuous, but is possibly inefficient since
- .positions actually builds up the result it returns each time
- it's accessed.
-
- - Update the examples in the docs to use context manager
- syntax.
-
- Particular to Samfile:
-
- - Deprecate Samfile.nreferences: propose to use
- len(samfile.references) instead. Cache Samfile.references
- so it's not re-created every time.
-
- - Move Samfile.mapped/.unmapped/.nocoordinate into a .stats
- attribute (Samfile.stats.mapped/.unmapped/.noocordinate).
-
- Particular to AlignedRead:
-
- - When read is an AlignedRead, print(read) should print out a
- properly formatted SAM line.
-
- - Force assignment to .qual/.seq to go through a function
- that sets both at the same time. This avoids the problem
- that they must be set in a particular order, which is easy
- to forget and only 'enforced' through documentation.
-
- - Deprecate rlen, use len(read.seq) instead.
-
- - Handling of tags is a little awkward. Would be cool if this
- worked:
-
- read.tags['XK'] = 'hello' # add a new tag if it doesn't exist
- read.tags['AS'] += 17 # update the value of a tag
- del read.tags['AS']
- if 'AS' in read.tags: ...
-
- - Add a property AlignedRead.qualities that behaves like a
- Py3-bytes object in both Py2 and Py3. That is, accessing
- read.qualities[0] gives you an int value that represents
- the quality. The fact that qualities are encoded as
- ASCII(q+33) is an implementation detail that can be hidden.
-
- Done
-
- - And finally: Add a Cigar class. I guess this is already
- what 'improved CIGAR string handling' refers to in the
- roadmap. AlignedRead.cigar would then return a Cigar object
- that can be printed, compared and concatenated to others,
- whose length can be measured etc. The .unclipped and
- .inferred length properties can also be moved here. Or
- perhaps: Make this an Alignment class that even knows about
- the two strings it is aligning. One could then also iterate
- over all columns of the alignment. But I guess this goes
- too far since that's what the AlignedRead itself should be.
-
- Regards,
- Marcel
+++ /dev/null
-#!/usr/bin/env python
-'''unit testing code for pysam.
-
-Execute in the :file:`tests` directory as it requires the Makefile
-and data files located there.
-'''
-
-import pysam
-import unittest
-import os
-import re
-import sys
-import subprocess
-import shutil
-from TestUtils import checkBinaryEqual
-
-IS_PYTHON3 = sys.version_info[0] >= 3
-
-SAMTOOLS = "samtools"
-WORKDIR = "pysam_test_work"
-DATADIR = "pysam_data"
-
-
-def runSamtools(cmd):
- '''run a samtools command'''
-
- try:
- retcode = subprocess.call(cmd, shell=True,
- stderr=subprocess.PIPE)
- if retcode < 0:
- print("Child was terminated by signal", -retcode)
- except OSError as e:
- print("Execution failed:", e)
-
-
-def getSamtoolsVersion():
- '''return samtools version'''
-
- with subprocess.Popen(SAMTOOLS, shell=True, stderr=subprocess.PIPE).stderr as pipe:
- lines = b"".join(pipe.readlines())
-
- if IS_PYTHON3:
- lines = lines.decode('ascii')
- return re.search("Version:\s+(\S+)", lines).groups()[0]
-
-
-class BinaryTest(unittest.TestCase):
-
- '''test samtools command line commands and compare
- against pysam commands.
-
- Tests fail, if the output is not binary identical.
- '''
-
- first_time = True
-
- # a dictionary of commands to test
- # first entry: (samtools output file, samtools command)
- # second entry: (pysam output file, (pysam function, pysam options) )
- commands = \
- {
- "view":
- (
- ("ex1.view", "view ex1.bam > ex1.view"),
- ("pysam_ex1.view", (pysam.view, "ex1.bam")),
- ),
- "view2":
- (
- ("ex1.view", "view -bT ex1.fa -o ex1.view2 ex1.sam"),
- # note that -o ex1.view2 throws exception.
- ("pysam_ex1.view",
- (pysam.view, "-bT ex1.fa -oex1.view2 ex1.sam")),
- ),
- "sort":
- (
- ("ex1.sort.bam", "sort ex1.bam ex1.sort"),
- ("pysam_ex1.sort.bam", (pysam.sort, "ex1.bam pysam_ex1.sort")),
- ),
- "mpileup":
- (
- ("ex1.pileup", "mpileup ex1.bam > ex1.pileup"),
- ("pysam_ex1.mpileup", (pysam.mpileup, "ex1.bam")),
- ),
- "depth":
- (
- ("ex1.depth", "depth ex1.bam > ex1.depth"),
- ("pysam_ex1.depth", (pysam.depth, "ex1.bam")),
- ),
- "faidx":
- (
- ("ex1.fa.fai", "faidx ex1.fa"),
- ("pysam_ex1.fa.fai", (pysam.faidx, "ex1.fa")),
- ),
- "index":
- (
- ("ex1.bam.bai", "index ex1.bam"),
- ("pysam_ex1.bam.bai", (pysam.index, "pysam_ex1.bam")),
- ),
- "idxstats":
- (
- ("ex1.idxstats", "idxstats ex1.bam > ex1.idxstats"),
- ("pysam_ex1.idxstats", (pysam.idxstats, "pysam_ex1.bam")),
- ),
- "fixmate":
- (
- ("ex1.fixmate", "fixmate ex1.bam ex1.fixmate"),
- ("pysam_ex1.fixmate",
- (pysam.fixmate, "pysam_ex1.bam pysam_ex1.fixmate")),
- ),
- "flagstat":
- (
- ("ex1.flagstat", "flagstat ex1.bam > ex1.flagstat"),
- ("pysam_ex1.flagstat", (pysam.flagstat, "pysam_ex1.bam")),
- ),
- "calmd":
- (
- ("ex1.calmd", "calmd ex1.bam ex1.fa > ex1.calmd"),
- ("pysam_ex1.calmd", (pysam.calmd, "pysam_ex1.bam ex1.fa")),
- ),
- "merge":
- (
- ("ex1.merge", "merge -f ex1.merge ex1.bam ex1.bam"),
- # -f option does not work - following command will cause the subsequent
- # command to fail
- ("pysam_ex1.merge",
- (pysam.merge, "pysam_ex1.merge pysam_ex1.bam pysam_ex1.bam")),
- ),
- "rmdup":
- (
- ("ex1.rmdup", "rmdup ex1.bam ex1.rmdup"),
- ("pysam_ex1.rmdup",
- (pysam.rmdup, "pysam_ex1.bam pysam_ex1.rmdup")),
- ),
- "reheader":
- (
- ("ex1.reheader", "reheader ex1.bam ex1.bam > ex1.reheader"),
- ("pysam_ex1.reheader", (pysam.reheader, "ex1.bam ex1.bam")),
- ),
- "cat":
- (
- ("ex1.cat", "cat ex1.bam ex1.bam > ex1.cat"),
- ("pysam_ex1.cat", (pysam.cat, "ex1.bam ex1.bam")),
- ),
- "targetcut":
- (
- ("ex1.targetcut", "targetcut ex1.bam > ex1.targetcut"),
- ("pysam_ex1.targetcut", (pysam.targetcut, "pysam_ex1.bam")),
- ),
- "phase":
- (
- ("ex1.phase", "phase ex1.bam > ex1.phase"),
- ("pysam_ex1.phase", (pysam.phase, "pysam_ex1.bam")),
- ),
- "import":
- (
- ("ex1.bam", "import ex1.fa.fai ex1.sam.gz ex1.bam"),
- ("pysam_ex1.bam",
- (pysam.samimport, "ex1.fa.fai ex1.sam.gz pysam_ex1.bam")),
- ),
- "bam2fq":
- (
- ("ex1.bam2fq", "bam2fq ex1.bam > ex1.bam2fq"),
- ("pysam_ex1.bam2fq", (pysam.bam2fq, "pysam_ex1.bam")),
- ),
- "pad2unpad":
- (
- ("ex2.unpad", "pad2unpad -T ex1.fa ex2.bam > ex2.unpad"),
- ("pysam_ex2.unpad", (pysam.pad2unpad, "-T ex1.fa ex2.bam")),
- ),
- "bamshuf":
- (
- ("ex1.bamshuf.bam", "bamshuf ex1.bam ex1.bamshuf"),
- ("pysam_ex1.bamshuf.bam",
- (pysam.bamshuf, "ex1.bam pysam_ex1.bamshuf")),
- ),
- "bedcov":
- (
- ("ex1.bedcov", "bedcov ex1.bed ex1.bam > ex1.bedcov"),
- ("pysam_ex1.bedcov", (pysam.bedcov, "ex1.bed ex1.bam")),
- ),
- }
-
- # some tests depend on others. The order specifies in which order
- # the samtools commands are executed.
- # The first three (faidx, import, index) need to be in that order,
- # the rest is arbitrary.
- order = ('faidx', 'import', 'index',
- # 'pileup1', 'pileup2', deprecated
- # 'glfview', deprecated
- 'view', 'view2',
- 'sort',
- 'mpileup',
- 'depth',
- 'idxstats',
- # 'fixmate',
- 'flagstat',
- # 'calmd',
- 'merge',
- # 'rmdup',
- 'reheader',
- 'cat',
- 'bedcov',
- 'targetcut',
- 'phase',
- # 'bamshuf',
- 'bam2fq',
- # 'pad2unpad',
- )
-
- def setUp(self):
- '''setup tests.
-
- For setup, all commands will be run before the first test is
- executed. Individual tests will then just compare the output
- files.
- '''
- if BinaryTest.first_time:
-
- # remove previous files
- if os.path.exists(WORKDIR):
- shutil.rmtree(WORKDIR)
- pass
-
- # copy the source files to WORKDIR
- os.makedirs(WORKDIR)
-
- shutil.copy(os.path.join(DATADIR, "ex1.fa"),
- os.path.join(WORKDIR, "pysam_ex1.fa"))
- shutil.copy(os.path.join(DATADIR, "ex1.fa"),
- os.path.join(WORKDIR, "ex1.fa"))
- shutil.copy(os.path.join(DATADIR, "ex1.sam.gz"),
- os.path.join(WORKDIR, "ex1.sam.gz"))
- shutil.copy(os.path.join(DATADIR, "ex1.sam"),
- os.path.join(WORKDIR, "ex1.sam"))
- shutil.copy(os.path.join(DATADIR, "ex2.bam"),
- os.path.join(WORKDIR, "ex2.bam"))
-
- # cd to workdir
- savedir = os.getcwd()
- os.chdir(WORKDIR)
- for label in self.order:
- # print ("command=", label)
- command = self.commands[label]
- # build samtools command and target and run
- samtools_target, samtools_command = command[0]
- runSamtools(" ".join((SAMTOOLS, samtools_command)))
-
- # get pysam command and run
- try:
- pysam_target, pysam_command = command[1]
- except ValueError as msg:
- raise ValueError("error while setting up %s=%s: %s" %
- (label, command, msg))
-
- pysam_method, pysam_options = pysam_command
-
- try:
- output = pysam_method(*pysam_options.split(" "), raw=True)
- except pysam.SamtoolsError as msg:
- raise pysam.SamtoolsError(
- "error while executing %s: options=%s: msg=%s" %
- (label, pysam_options, msg))
-
- if ">" in samtools_command:
- with open(pysam_target, "wb") as outfile:
- if type(output) == list:
- if IS_PYTHON3:
- for line in output:
- outfile.write(line.encode('ascii'))
- else:
- for line in output:
- outfile.write(line)
- else:
- outfile.write(output)
-
- os.chdir(savedir)
- BinaryTest.first_time = False
-
- samtools_version = getSamtoolsVersion()
-
- def _r(s):
- # patch - remove any of the alpha/beta suffixes, i.e., 0.1.12a ->
- # 0.1.12
- if s.count('-') > 0:
- s = s[0:s.find('-')]
- return re.sub("[^0-9.]", "", s)
-
- if _r(samtools_version) != _r(pysam.__samtools_version__):
- raise ValueError("versions of pysam/samtools and samtools differ: %s != %s" %
- (pysam.__samtools_version__,
- samtools_version))
-
- def checkCommand(self, command):
- if command:
- samtools_target, pysam_target = self.commands[
- command][0][0], self.commands[command][1][0]
- samtools_target = os.path.join(WORKDIR, samtools_target)
- pysam_target = os.path.join(WORKDIR, pysam_target)
- self.assertTrue(checkBinaryEqual(samtools_target, pysam_target),
- "%s failed: files %s and %s are not the same" % (command, samtools_target, pysam_target))
-
- def testImport(self):
- self.checkCommand("import")
-
- def testIndex(self):
- self.checkCommand("index")
-
- def testSort(self):
- self.checkCommand("sort")
-
- def testMpileup(self):
- self.checkCommand("mpileup")
-
- def testDepth(self):
- self.checkCommand("depth")
-
- def testIdxstats(self):
- self.checkCommand("idxstats")
-
- # def testFixmate(self):
- # self.checkCommand("fixmate")
-
- def testFlagstat(self):
- self.checkCommand("flagstat")
-
- def testMerge(self):
- self.checkCommand("merge")
-
- # def testRmdup(self):
- # self.checkCommand("rmdup")
-
- def testReheader(self):
- self.checkCommand("reheader")
-
- def testCat(self):
- self.checkCommand("cat")
-
- def testTargetcut(self):
- self.checkCommand("targetcut")
-
- def testPhase(self):
- self.checkCommand("phase")
-
- def testBam2fq(self):
- self.checkCommand("bam2fq")
-
- def testBedcov(self):
- self.checkCommand("bedcov")
-
- # def testBamshuf(self):
- # self.checkCommand("bamshuf")
-
- # def testPad2Unpad(self):
- # self.checkCommand("pad2unpad")
-
- # def testPileup1( self ):
- # self.checkCommand( "pileup1" )
-
- # def testPileup2( self ):
- # self.checkCommand( "pileup2" )
-
- # deprecated
- # def testGLFView( self ):
- # self.checkCommand( "glfview" )
-
- def testView(self):
- self.checkCommand("view")
-
- def testEmptyIndex(self):
- self.assertRaises(IOError, pysam.index, "exdoesntexist.bam")
-
- def __del__(self):
- if os.path.exists(WORKDIR):
- pass
- # shutil.rmtree( WORKDIR )
-
-if __name__ == "__main__":
- # build data files
- print ("building data files")
- subprocess.call("make -C %s" % DATADIR, shell=True)
- print ("starting tests")
- unittest.main()
- print ("completed tests")
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.0
-##fileDate=20090805
-##source=myImputationProgramV3.1
-##reference=1000GenomesPilot-NCBI36
-##phasing=partial
-##INFO=<ID=NS,Number=1,Type=Integer,Description="Number of Samples With Data">
-##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total Depth">
-##INFO=<ID=AF,Number=.,Type=Float,Description="Allele Frequency">
-##INFO=<ID=AA,Number=1,Type=String,Description="Ancestral Allele">
-##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP membership, build 129">
-##INFO=<ID=H2,Number=0,Type=Flag,Description="HapMap2 membership">
-##FILTER=<ID=q10,Description="Quality below 10">
-##FILTER=<ID=s50,Description="Less than 50% of samples have data">
-##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
-##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
-##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read Depth">
-##FORMAT=<ID=HQ,Number=2,Type=Integer,Description="Haplotype Quality">
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT NA00001 NA00002 NA00003
-M 1230237 . T . 47 PASS NS=3;DP=13;AA=T GT:GQ:DP:HQ 0|0:54:7:56,60 0|0:48:4:51,51 0/0:61:2
-17 14370 rs6054257 G A 29 PASS NS=3;DP=14;AF=0.5;DB;H2 GT:GQ:DP:HQ 0|0:48:1:51,51 1|0:48:8:51,51 1/1:43:5:.,.
-20 17330 . T A 3 q10 NS=3;DP=11;AF=0.017 GT:GQ:DP:HQ 0|0:49:3:58,50 0|1:3:5:65,3 0/0:41:3
-20 1110696 rs6040355 A G,T 67 PASS NS=2;DP=10;AF=0.333,0.667;AA=T;DB GT:GQ:DP:HQ 1|2:21:6:23,27 2|1:2:0:18,2 2/2:35:4
-20 1234567 microsat1 GTCT G,GTACT 50 PASS NS=3;DP=9;AA=G GT:GQ:DP 0/1:35:4 0/2:17:2 1/1:40:3
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.0
-##fileDate=20090805
-##source=myImputationProgramV3.1
-##reference=1000GenomesPilot-NCBI36
-##phasing=partial
-##INFO=<ID=NS,Number=1,Type=Integer,Description="Number of Samples With Data">
-##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total Depth">
-##INFO=<ID=AF,Number=.,Type=Float,Description="Allele Frequency">
-##INFO=<ID=AA,Number=1,Type=String,Description="Ancestral Allele">
-##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP membership, build 129">
-##INFO=<ID=H2,Number=0,Type=Flag,Description="HapMap2 membership">
-##FILTER=<ID=q10,Description="Quality below 10">
-##FILTER=<ID=s50,Description="Less than 50% of samples have data">
-##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
-##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
-##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read Depth">
-##FORMAT=<ID=HQ,Number=2,Type=Integer,Description="Haplotype Quality">
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT Reneé Grün Señor
-M 1230237 . T . 47 PASS NS=3;DP=13;AA=T GT:GQ:DP:HQ 0|0:54:7:56,60 0|0:48:4:51,51 0/0:61:2
-17 14370 Reneé G A 29 PASS NS=3;DP=14;AF=0.5;DB;H2 GT:GQ:DP:HQ 0|0:48:1:51,51 1|0:48:8:51,51 1/1:43:5:.,.
-20 17330 . T A 3 q10 NS=3;DP=11;AF=0.017 GT:GQ:DP:HQ 0|0:49:3:58,50 0|1:3:5:65,3 0/0:41:3
-20 1110696 Grün A G,T 67 PASS NS=2;DP=10;AF=0.333,0.667;AA=T;DB GT:GQ:DP:HQ 1|2:21:6:23,27 2|1:2:0:18,2 2/2:35:4
-20 1234567 Señor GTCT G,GTACT 50 PASS NS=3;DP=9;AA=G GT:GQ:DP 0/1:35:4 0/2:17:2 1/1:40:3
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.0
-##FILTER=<ID=HardyWeinbergViolation,Description="The validation is in Hardy-Weinberg violation">
-##FILTER=<ID=HighNoCallRate,Description="The validation no-call rate is too high">
-##FILTER=<ID=TooManyHomVars,Description="The validation homozygous variant rate is too high">
-##INFO=<ID=AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
-##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
-##INFO=<ID=HW,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled Hardy-Weinberg violation p-value">
-##INFO=<ID=HetPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of heterozygous genotypes">
-##INFO=<ID=HomRefPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of homozygous reference genotypes">
-##INFO=<ID=HomVarPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent homozygous variant genotypes">
-##INFO=<ID=NoCallPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of no-calls">
-##ValidationMetrics_HardyWeinbergViolations="25 (8%)"
-##ValidationMetrics_HomVarViolations="0 (0%)"
-##ValidationMetrics_NoCallViolations="13 (4%)"
-##ValidationMetrics_PolymorphicPassingRecords="195 (75%)"
-##ValidationMetrics_RecordsPassingFilters="258 (87%)"
-##ValidationMetrics_RecordsProcessed=296
-##ValidationMetrics_SamplesAssayed=383
-##VariantValidationAssessor="analysis_type=VariantValidationAssessor input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[rawData/plink.renamed.sorted.fixed.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub maxHardy=20.0 maxNoCall=0.05 maxHomVar=1.1"
-##source=PLINK
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT HG00127 HG00128 HG00136 HG00137 HG00138 HG00139 HG00152 HG00156 HG00234 HG00235 HG00237 HG00242 HG00244 HG00262 HG01055 HG01079 NA19138 NA18974 NA18523 NA12717 NA19209 NA18577 NA18973 NA18943 NA12873 NA18623 NA18622 NA18948 NA19171 NA19204 NA06994 NA18563 NA18547 NA18861 NA18608 NA18995 NA10851 NA18976 NA18603 NA19200 HG01204 HG01191 HG01101 HG00146 HG00306 NA18985 HG00160 HG00635 HG00372 HG00357 HG00634 NA18541 NA18950 NA19759 HG00351 HG00257 HG00118 HG00336 HG00448 HG01354 NA18609 HG00428 HG00326 NA11894 NA18956 HG00173 HG00117 NA11893 HG01251 HG01441 HG01437 HG00182 HG00330 HG01060 HG00329 NA18960 NA18856 NA07346 NA18871 NA19057 NA18868 NA18636 NA12830 NA19007 NA18910 NA18874 NA19056 NA19064 NA19066 NA18487 NA18642 NA19236 NA07056 NA18637 NA19235 NA19309 NA19311 NA19334 NA19346 NA19347 NA19372 NA19376 NA19383 NA19384 NA19394 NA19428 NA19430 NA19451 NA19466 NA19313 NA19321 NA19324 NA19332 NA19390 NA19436 NA19439 NA19440 NA19463 NA19470 NA19471 NA19472 NA19676 NA19660 NA19661 NA19663 NA19722 NA19725 NA19728 NA19729 NA19731 NA19749 NA19755 NA19756 NA19758 NA19770 NA19773 NA19777 NA19780 NA19783 NA20525 NA20589 NA20765 NA20802 NA20804 NA18544 NA18602 NA18546 NA18610 NA18957 NA18615 NA18616 NA19010 NA18638 NA18639 NA18627 NA19072 NA18630 NA19074 NA19080 NA19081 NA19083 NA19085 NA19088 NA20287 NA19835 NA20276 NA19818 NA20278 NA20282 NA20342 NA20296 NA20314 NA20346 NA19712 NA19198 NA19108 NA18934 NA18916 NA18907 NA18917 NA06989 NA12058 NA12341 NA12546 NA12489 HG01197 NA18983 NA11843 NA11892 NA12749 NA12282 NA12751 NA18959 NA19331 NA19453 NA20537 NA12046 NA20515 NA20516 NA20521 NA20524 NA20528 NA20759 NA20768 NA20769 NA20774 NA20775 NA20783 NA20787 NA20790 NA20800 NA20819 NA20812 NA20505 NA20530 NA20540 NA20538 NA20581 NA20815 NA20544 NA20810 NA20807 NA20816 NA20504 NA20753 NA20502 NA12342 NA19150 NA19468 NA20336 NA19395 NA19257 NA19360 NA19700 NA18867 NA20317 NA18968 NA19107 HG00111 HG00108 NA19077 NA19684 NA18511 NA12044 NA19382 NA19457 NA18933 NA18923 NA18965 HG00141 NA20341 NA18740 HG00537 HG00346 HG01173 HG00702 HG00313 HG00150 NA18612 HG00339 NA12273 HG00250 NA18593 NA18621 HG00478 HG00251 HG01070 NA19160 HG00479 HG00608 NA18573 HG00375 NA19248 NA19093 HG01170 HG00534 HG01171 HG01522 NA18624 HG00683 HG01521 NA19005 NA20412 NA18971 HG00446 NA12748 HG00530 HG00690 HG01356 HG01516 NA20532 HG00344 HG00328 NA18542 HG00254 HG00321 HG00577 HG00656 HG00342 HG00524 HG00650 HG00557 HG00319 HG00457 HG00125 HG00578 HG00543 HG00638 HG00171 HG00699 HG00595 HG00187 HG00704 HG00533 HG00596 HG00268 HG01083 HG00651 HG01133 HG00671 HG00327 HG01148 HG00246 HG00672 HG00556 HG00436 HG00554 NA18633 NA20344 NA11993 NA07037 NA11930 HG01366 HG01389 HG00620 NA19740 HG00190 HG00419 NA18535 HG01495 NA18592 HG01497 HG00174 HG01140 NA12287 HG00689 HG01550 HG00334 HG01375 HG00637 NA18507 HG01113 NA18550 NA19129 HG01551 HG01462 HG00331 NA12413 HG01456 HG01360 HG00708 HG01350 HG00684 NA19099 HG00284 NA12399 NA12286 NA12777 HG00277 HG00266 NA19985 HG00353 HG01102 NA07347 NA07051 NA19900 NA18984 NA07048 HG00640 HG01066 NA12812 HG01174 HG01188
-20 676148 . A AC . PASS AC=0;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1342549 . A AAGAT . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1366475 . CT C . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1550416 . C CT . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 3700705 . CTTTGGG C . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5724449 . T TC . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7942727 . A AC . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 9231138 . AT A . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 10090376 . T TG . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12094344 . TCAGGAGGC T . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12634463 . TGA T . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12837095 . G GA . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12928028 . TG T . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13365589 . T TG . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13926445 . TA T . PASS AC=0;AN=756;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 14287634 . AGT A . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 14983337 . AGCC A . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15037520 . A AG . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15141272 . T TC . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16192114 . AT A . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16259934 . C CAA . PASS AC=0;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17250858 . T TC . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17753474 . C CA . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18520672 . A ATT . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 19188693 . T TC . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 19437778 . GGCCTGGGATGTAAA G . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20434198 . TA T . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20990240 . TC T . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 24710482 . GT G . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 25905250 . GT G . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29589873 . CCTT C . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29628180 . C CCACAAGAAG . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29804699 . A AC . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30567910 . T TG . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 31760870 . CG C . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32456076 . GT G . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32968409 . GTC G . PASS AC=0;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 34313574 . A AT . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 35329008 . ATC A . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37954797 . A AGT . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 39607037 . C CA . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 39868369 . T TG . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 40006262 . TGAG T . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 40110981 . A AG . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 40742257 . TG T . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41964672 . A AT . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42145613 . TG T . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42930748 . A AG . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43606638 . T TC . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43826992 . GC G . PASS AC=0;AN=748;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=2.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 44470843 . GAGTGTCGT G . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 45300827 . CT C . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 46353646 . A AG . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 47428163 . C CA . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49451656 . T TG . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49561273 . A AG . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49765611 . A AC . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 50772065 . T TC . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 53538294 . T TG . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54262948 . A AC . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 55658161 . GT G . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59186675 . TATTA T . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 61531765 . AG A . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.0
-##FILTER=<ID=HardyWeinbergViolation,Description="The validation is in Hardy-Weinberg violation">
-##FILTER=<ID=HighNoCallRate,Description="The validation no-call rate is too high">
-##FILTER=<ID=TooManyHomVars,Description="The validation homozygous variant rate is too high">
-##INFO=<ID=AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
-##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
-##INFO=<ID=HW,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled Hardy-Weinberg violation p-value">
-##INFO=<ID=HetPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of heterozygous genotypes">
-##INFO=<ID=HomRefPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of homozygous reference genotypes">
-##INFO=<ID=HomVarPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent homozygous variant genotypes">
-##INFO=<ID=NoCallPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of no-calls">
-##ValidationMetrics_HardyWeinbergViolations="25 (8%)"
-##ValidationMetrics_HomVarViolations="0 (0%)"
-##ValidationMetrics_NoCallViolations="13 (4%)"
-##ValidationMetrics_PolymorphicPassingRecords="195 (75%)"
-##ValidationMetrics_RecordsPassingFilters="258 (87%)"
-##ValidationMetrics_RecordsProcessed=296
-##ValidationMetrics_SamplesAssayed=383
-##VariantValidationAssessor="analysis_type=VariantValidationAssessor input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[rawData/plink.renamed.sorted.fixed.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub maxHardy=20.0 maxNoCall=0.05 maxHomVar=1.1"
-##source=PLINK
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT HG00127 HG00128 HG00136 HG00137 HG00138 HG00139 HG00152 HG00156 HG00234 HG00235 HG00237 HG00242 HG00244 HG00262 HG01055 HG01079 NA19138 NA18974 NA18523 NA12717 NA19209 NA18577 NA18973 NA18943 NA12873 NA18623 NA18622 NA18948 NA19171 NA19204 NA06994 NA18563 NA18547 NA18861 NA18608 NA18995 NA10851 NA18976 NA18603 NA19200 HG01204 HG01191 HG01101 HG00146 HG00306 NA18985 HG00160 HG00635 HG00372 HG00357 HG00634 NA18541 NA18950 NA19759 HG00351 HG00257 HG00118 HG00336 HG00448 HG01354 NA18609 HG00428 HG00326 NA11894 NA18956 HG00173 HG00117 NA11893 HG01251 HG01441 HG01437 HG00182 HG00330 HG01060 HG00329 NA18960 NA18856 NA07346 NA18871 NA19057 NA18868 NA18636 NA12830 NA19007 NA18910 NA18874 NA19056 NA19064 NA19066 NA18487 NA18642 NA19236 NA07056 NA18637 NA19235 NA19309 NA19311 NA19334 NA19346 NA19347 NA19372 NA19376 NA19383 NA19384 NA19394 NA19428 NA19430 NA19451 NA19466 NA19313 NA19321 NA19324 NA19332 NA19390 NA19436 NA19439 NA19440 NA19463 NA19470 NA19471 NA19472 NA19676 NA19660 NA19661 NA19663 NA19722 NA19725 NA19728 NA19729 NA19731 NA19749 NA19755 NA19756 NA19758 NA19770 NA19773 NA19777 NA19780 NA19783 NA20525 NA20589 NA20765 NA20802 NA20804 NA18544 NA18602 NA18546 NA18610 NA18957 NA18615 NA18616 NA19010 NA18638 NA18639 NA18627 NA19072 NA18630 NA19074 NA19080 NA19081 NA19083 NA19085 NA19088 NA20287 NA19835 NA20276 NA19818 NA20278 NA20282 NA20342 NA20296 NA20314 NA20346 NA19712 NA19198 NA19108 NA18934 NA18916 NA18907 NA18917 NA06989 NA12058 NA12341 NA12546 NA12489 HG01197 NA18983 NA11843 NA11892 NA12749 NA12282 NA12751 NA18959 NA19331 NA19453 NA20537 NA12046 NA20515 NA20516 NA20521 NA20524 NA20528 NA20759 NA20768 NA20769 NA20774 NA20775 NA20783 NA20787 NA20790 NA20800 NA20819 NA20812 NA20505 NA20530 NA20540 NA20538 NA20581 NA20815 NA20544 NA20810 NA20807 NA20816 NA20504 NA20753 NA20502 NA12342 NA19150 NA19468 NA20336 NA19395 NA19257 NA19360 NA19700 NA18867 NA20317 NA18968 NA19107 HG00111 HG00108 NA19077 NA19684 NA18511 NA12044 NA19382 NA19457 NA18933 NA18923 NA18965 HG00141 NA20341 NA18740 HG00537 HG00346 HG01173 HG00702 HG00313 HG00150 NA18612 HG00339 NA12273 HG00250 NA18593 NA18621 HG00478 HG00251 HG01070 NA19160 HG00479 HG00608 NA18573 HG00375 NA19248 NA19093 HG01170 HG00534 HG01171 HG01522 NA18624 HG00683 HG01521 NA19005 NA20412 NA18971 HG00446 NA12748 HG00530 HG00690 HG01356 HG01516 NA20532 HG00344 HG00328 NA18542 HG00254 HG00321 HG00577 HG00656 HG00342 HG00524 HG00650 HG00557 HG00319 HG00457 HG00125 HG00578 HG00543 HG00638 HG00171 HG00699 HG00595 HG00187 HG00704 HG00533 HG00596 HG00268 HG01083 HG00651 HG01133 HG00671 HG00327 HG01148 HG00246 HG00672 HG00556 HG00436 HG00554 NA18633 NA20344 NA11993 NA07037 NA11930 HG01366 HG01389 HG00620 NA19740 HG00190 HG00419 NA18535 HG01495 NA18592 HG01497 HG00174 HG01140 NA12287 HG00689 HG01550 HG00334 HG01375 HG00637 NA18507 HG01113 NA18550 NA19129 HG01551 HG01462 HG00331 NA12413 HG01456 HG01360 HG00708 HG01350 HG00684 NA19099 HG00284 NA12399 NA12286 NA12777 HG00277 HG00266 NA19985 HG00353 HG01102 NA07347 NA07051 NA19900 NA18984 NA07048 HG00640 HG01066 NA12812 HG01174 HG01188
-20 669442 . TG T . PASS AC=54;AN=766;HW=6.74;HetPct=12.0;HomRefPct=86.9;HomVarPct=1.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 719486 . C CT . PASS AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 890696 . C CAT . PASS AC=6;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1102516 . CT C . PASS AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1149576 . CT C . PASS AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1195706 . AAG A . PASS AC=334;AN=764;HW=9.47;HetPct=44.9;HomRefPct=33.7;HomVarPct=21.1;NoCallPct=0.3 GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 . 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1
-20 1655540 . AT A . PASS AC=4;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 2889034 . AAAAT A . PASS AC=6;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 3203741 . CT C . PASS AC=4;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 4037626 . TC T . PASS AC=194;AN=764;HW=14.70;HetPct=33.4;HomRefPct=57.7;HomVarPct=8.6;NoCallPct=0.3 GT 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 . 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0
-20 4210074 . G GA . PASS AC=197;AN=762;HW=14.95;HetPct=33.7;HomRefPct=56.9;HomVarPct=8.9;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1
-20 4363519 . CATT C . PASS AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 4366806 . CAAAT C . PASS AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 4641550 . CCTTGA C . PASS AC=3;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5105482 . C CATTTTAGG . PASS AC=101;AN=762;HW=14.11;HetPct=20.1;HomRefPct=76.2;HomVarPct=3.1;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5289619 . GA G . PASS AC=377;AN=764;HW=5.70;HetPct=53.0;HomRefPct=24.0;HomVarPct=22.7;NoCallPct=0.3 GT 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 . 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0
-20 5416109 . CA C . PASS AC=2;AN=752;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5432262 . AGT A . PASS AC=4;AN=752;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=97.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 6877907 . CA C . PASS AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 6969412 . CAAAGAAT C . PASS AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7229260 . T TA . PASS AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7239075 . AG A . PASS AC=5;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7950562 . C CT . PASS AC=4;AN=760;HW=18.01;HetPct=0.5;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 8195466 . C CT . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 8233352 . TACTC T . PASS AC=56;AN=764;HW=1.84;HetPct=13.1;HomRefPct=85.9;HomVarPct=0.8;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 8504000 . TAG T . PASS AC=5;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 9921724 . AAAGT A . PASS AC=11;AN=758;HW=0.00;HetPct=2.9;HomRefPct=96.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 9925738 . T TG . PASS AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 11229169 . T TA . PASS AC=3;AN=756;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 11511920 . AC A . PASS AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 11893900 . ATTAG A . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12021825 . A AG . PASS AC=5;AN=756;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=97.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12063752 . CTT C . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12114989 . CTA C . PASS AC=4;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12371546 . GACA G . PASS AC=10;AN=762;HW=0.00;HetPct=2.6;HomRefPct=96.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12512723 . G GTT . PASS AC=6;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12692743 . TTATC T . PASS AC=8;AN=762;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=97.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13003323 . GGGA G . PASS AC=3;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13128894 . CT C . PASS AC=10;AN=764;HW=0.00;HetPct=2.6;HomRefPct=97.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13287841 . CAT C . PASS AC=134;AN=760;HW=0.21;HetPct=29.2;HomRefPct=67.1;HomVarPct=2.9;NoCallPct=0.8 GT 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-20 13566260 . AAATTG A . PASS AC=374;AN=764;HW=3.95;HetPct=47.5;HomRefPct=27.2;HomVarPct=25.1;NoCallPct=0.3 GT 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 . 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1
-20 13685184 . AT A . PASS AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13716193 . GAGAA G . PASS AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13960028 . TC T . PASS AC=188;AN=750;HW=2.44;HetPct=35.5;HomRefPct=55.6;HomVarPct=6.8;NoCallPct=2.1 GT 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 . 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . . 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0
-20 14159734 . T TA . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 14383135 . TA T . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 14669226 . G GA . PASS AC=121;AN=766;HW=1.68;HetPct=25.8;HomRefPct=71.3;HomVarPct=2.9;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-20 14697473 . TTC T . PASS AC=9;AN=764;HW=10.31;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15189597 . GA G . PASS AC=311;AN=760;HW=2.80;HetPct=46.2;HomRefPct=35.5;HomVarPct=17.5;NoCallPct=0.8 GT 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 . 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 . 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1
-20 15265098 . TG T . PASS AC=125;AN=766;HW=6.76;HetPct=25.3;HomRefPct=71.0;HomVarPct=3.7;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1
-20 15410763 . TGA T . PASS AC=29;AN=764;HW=0.00;HetPct=7.6;HomRefPct=92.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15543319 . AG A . PASS AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15550845 . TG T . PASS AC=34;AN=756;HW=0.00;HetPct=8.4;HomRefPct=90.1;HomVarPct=0.3;NoCallPct=1.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15703503 . TG T . PASS AC=87;AN=750;HW=3.63;HetPct=19.1;HomRefPct=77.0;HomVarPct=1.8;NoCallPct=2.1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15871330 . AG A . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16016504 . TA T . PASS AC=186;AN=764;HW=15.27;HetPct=32.4;HomRefPct=59.3;HomVarPct=8.1;NoCallPct=0.3 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-20 16312599 . CTA C . PASS AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16723642 . GGTT G . PASS AC=6;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16747221 . CA C . PASS AC=291;AN=764;HW=3.13;HetPct=45.2;HomRefPct=39.2;HomVarPct=15.4;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1
-20 16813850 . C CA . PASS AC=7;AN=758;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17331332 . TA T . PASS AC=80;AN=762;HW=15.60;HetPct=16.2;HomRefPct=80.9;HomVarPct=2.3;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17473782 . TGC T . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17607627 . A AGT . PASS AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18417481 . AC A . PASS AC=17;AN=766;HW=0.00;HetPct=4.4;HomRefPct=95.6;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18445795 . AAG A . PASS AC=5;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18522725 . ATTAAC A . PASS AC=1;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18915562 . TAA T . PASS AC=3;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 19111235 . C CT . PASS AC=4;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 19805154 . CCTT C . PASS AC=3;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20030869 . CT C . PASS AC=362;AN=766;HW=6.74;HetPct=46.5;HomRefPct=29.5;HomVarPct=24.0;NoCallPct=0.0 GT 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1
-20 20286529 . A AC . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20404656 . ATTACAGACT A . PASS AC=7;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20716329 . CA C . PASS AC=4;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20760474 . TG T . PASS AC=15;AN=764;HW=5.83;HetPct=3.4;HomRefPct=96.1;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20952825 . T TC . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21406859 . ACTT A . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21480245 . AG A . PASS AC=1;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21852048 . CA C . PASS AC=330;AN=762;HW=4.15;HetPct=46.5;HomRefPct=33.2;HomVarPct=19.8;NoCallPct=0.5 GT 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 . 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 . 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0
-20 21968507 . AC A . PASS AC=7;AN=762;HW=12.61;HetPct=1.3;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 22434333 . C CA . PASS AC=8;AN=766;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 22637424 . C CAGCCA . PASS AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 22655862 . TATC T . PASS AC=6;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23200197 . ATT A . PASS AC=1;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23293728 . CA C . PASS AC=8;AN=754;HW=11.33;HetPct=1.6;HomRefPct=96.6;HomVarPct=0.3;NoCallPct=1.6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23813095 . CT C . PASS AC=26;AN=762;HW=1.46;HetPct=6.3;HomRefPct=93.0;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23815381 . CT C . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23889003 . GA G . PASS AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 24855121 . CT C . PASS AC=6;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 25503211 . CATA C . PASS AC=1;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29913425 . TATATC T . PASS AC=15;AN=762;HW=5.82;HetPct=3.4;HomRefPct=95.8;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30390854 . TTATACTA T . PASS AC=3;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30534847 . ACAAT A . PASS AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 31412616 . CT C . PASS AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32015223 . CT C . PASS AC=5;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32158330 . CAG C . PASS AC=4;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32509752 . A AG . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32700247 . GGCGTCTGA G . PASS AC=3;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 33541746 . A AAG . PASS AC=4;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 34251969 . C CA . PASS AC=3;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 34633573 . TAA T . PASS AC=1;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 34831930 . CT C . PASS AC=7;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 35357903 . GA G . PASS AC=5;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 35847597 . CTT C . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 36658020 . TG T . PASS AC=6;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 36704724 . TC T . PASS AC=8;AN=756;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=96.6;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 36711544 . TAAAG T . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 36947086 . ATAC A . PASS AC=33;AN=766;HW=0.12;HetPct=8.6;HomRefPct=91.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37139725 . CAG C . PASS AC=5;AN=760;HW=15.80;HetPct=0.8;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37278654 . CAG C . PASS AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37391272 . TG T . PASS AC=4;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37608002 . CAT C . PASS AC=7;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37678954 . C CTGG . PASS AC=7;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37712193 . AAG A . PASS AC=29;AN=762;HW=0.00;HetPct=7.6;HomRefPct=91.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37836124 . AAAT A . PASS AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37962643 . T TAA . PASS AC=178;AN=764;HW=12.74;HetPct=31.9;HomRefPct=60.6;HomVarPct=7.3;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1
-20 38336199 . TA T . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 38495835 . T TA . PASS AC=14;AN=762;HW=0.00;HetPct=3.7;HomRefPct=95.8;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 38696054 . GAAGA G . PASS AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 38784318 . CCTT C . PASS AC=7;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 39042026 . T TG . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 39420665 . AG A . PASS AC=72;AN=760;HW=3.25;HetPct=16.2;HomRefPct=81.7;HomVarPct=1.3;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-20 40445967 . TG T . PASS AC=3;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41000677 . T TG . PASS AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41149621 . T TATCA . PASS AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41364251 . A AAG . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41543685 . CTAAGGAGGGAAAAAGATATAAT C . PASS AC=12;AN=764;HW=0.00;HetPct=3.1;HomRefPct=96.6;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41851636 . TA T . PASS AC=83;AN=764;HW=18.52;HetPct=16.4;HomRefPct=80.7;HomVarPct=2.6;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 42159695 . GC G . PASS AC=87;AN=762;HW=7.05;HetPct=18.5;HomRefPct=78.9;HomVarPct=2.1;NoCallPct=0.5 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-20 42261635 . C CATTT . PASS AC=24;AN=764;HW=2.06;HetPct=5.7;HomRefPct=93.7;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42470352 . CACTT C . PASS AC=19;AN=764;HW=3.87;HetPct=4.4;HomRefPct=95.0;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42585924 . T TA . PASS AC=1;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42856201 . CT C . PASS AC=3;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42909154 . T TGGGTC . PASS AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42918721 . AG A . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43245783 . AG A . PASS AC=8;AN=766;HW=11.40;HetPct=1.6;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43371647 . GGGCTGTAA G . PASS AC=80;AN=760;HW=6.79;HetPct=17.2;HomRefPct=80.2;HomVarPct=1.8;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 43434234 . AG A . PASS AC=4;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43539258 . T TAG . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43993933 . CA C . PASS AC=199;AN=764;HW=8.74;HetPct=35.2;HomRefPct=56.1;HomVarPct=8.4;NoCallPct=0.3 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1
-20 44071585 . C CT . PASS AC=132;AN=764;HW=8.50;HetPct=26.1;HomRefPct=69.5;HomVarPct=4.2;NoCallPct=0.3 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1
-20 44220528 . T TC . PASS AC=59;AN=766;HW=1.90;HetPct=14.9;HomRefPct=84.9;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 44340276 . AACAG A . PASS AC=37;AN=758;HW=17.93;HetPct=7.6;HomRefPct=90.3;HomVarPct=1.0;NoCallPct=1.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 44464600 . T TA . PASS AC=19;AN=762;HW=3.86;HetPct=4.4;HomRefPct=94.8;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 44572563 . GA G . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 44889286 . G GC . PASS AC=13;AN=766;HW=0.00;HetPct=3.4;HomRefPct=96.6;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 45092013 . GT G . PASS AC=4;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 45406096 . T TTC . PASS AC=4;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 45668403 . CTG C . PASS AC=86;AN=762;HW=16.06;HetPct=17.2;HomRefPct=79.6;HomVarPct=2.6;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 46051811 . T TAAGC . PASS AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 46413551 . TC T . PASS AC=2;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 46569465 . CTG C . PASS AC=10;AN=762;HW=0.00;HetPct=2.6;HomRefPct=96.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 46720983 . ATACTTGG A . PASS AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 47032179 . GC G . PASS AC=2;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 47136092 . A AGTC . PASS AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 47335386 . GC G . PASS AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 47988904 . CA C . PASS AC=187;AN=760;HW=17.08;HetPct=32.1;HomRefPct=58.7;HomVarPct=8.4;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 . 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 48262933 . CCTA C . PASS AC=7;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49438742 . G GT . PASS AC=8;AN=762;HW=11.37;HetPct=1.6;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49537420 . AG A . PASS AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 50136971 . TTTTC T . PASS AC=8;AN=764;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 50373155 . A AT . PASS AC=7;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 50806976 . G GAA . PASS AC=128;AN=760;HW=0.17;HetPct=28.2;HomRefPct=68.4;HomVarPct=2.6;NoCallPct=0.8 GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0
-20 50961401 . G GT . PASS AC=4;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 51547787 . AC A . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 51838824 . GA G . PASS AC=4;AN=756;HW=17.99;HetPct=0.5;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.3;NoCallPct=1.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 51961394 . ATTTG A . PASS AC=8;AN=760;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=97.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 53081927 . CATGA C . PASS AC=5;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 53602394 . T TA . PASS AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54124185 . T TC . PASS AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54150907 . CAG C . PASS AC=3;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54166824 . AC A . PASS AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54230743 . CAT C . PASS AC=2;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54309727 . TGAGC T . PASS AC=7;AN=762;HW=12.61;HetPct=1.3;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54379666 . GT G . PASS AC=172;AN=766;HW=14.43;HetPct=30.8;HomRefPct=62.1;HomVarPct=7.0;NoCallPct=0.0 GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0
-20 55264363 . AG A . PASS AC=232;AN=762;HW=15.89;HetPct=37.1;HomRefPct=50.7;HomVarPct=11.7;NoCallPct=0.5 GT 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1
-20 55608811 . CT C . PASS AC=35;AN=762;HW=19.90;HetPct=7.0;HomRefPct=91.4;HomVarPct=1.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 55611547 . CAA C . PASS AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 55989765 . CA C . PASS AC=208;AN=764;HW=5.71;HetPct=37.1;HomRefPct=54.0;HomVarPct=8.6;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 56249865 . T TGAGG . PASS AC=4;AN=756;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 56344957 . GT G . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 56419021 . T TG . PASS AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 56915853 . TG T . PASS AC=17;AN=764;HW=4.78;HetPct=3.9;HomRefPct=95.6;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 57676578 . CCTTT C . PASS AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 58288793 . TC T . PASS AC=44;AN=766;HW=12.53;HetPct=9.4;HomRefPct=89.6;HomVarPct=1.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59153061 . CTG C . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59349754 . CCT C . PASS AC=168;AN=762;HW=8.71;HetPct=31.3;HomRefPct=61.9;HomVarPct=6.3;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59365768 . TG T . PASS AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59769242 . C CT . PASS AC=4;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 60337932 . AC A . PASS AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 60925525 . GC G . PASS AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 61000018 . GC G . PASS AC=203;AN=762;HW=0.38;HetPct=39.4;HomRefPct=53.3;HomVarPct=6.8;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 . 0/1 . 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-20 61983510 . TCTGC T . PASS AC=75;AN=766;HW=0.03;HetPct=18.0;HomRefPct=81.2;HomVarPct=0.8;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 62154368 . G GA . PASS AC=2;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 62310426 . CTT C . PASS AC=1;AN=756;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 62871860 . C CCCGCA . PASS AC=27;AN=764;HW=17.87;HetPct=5.5;HomRefPct=93.5;HomVarPct=0.8;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.0
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT DNA_pool_A
-chr1 1281168 . A G 14 . DP=37;AF1=0.6243;CI95=0.5,1;DP4=4,0,6,0;MQ=15;PV4=1,0.027,1,1 PL:GT:GQ 43,0,4:0/1:6
-chr1 1281205 . T C 26 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ 58,9,0:1/1:63
-chr1 1281206 . G C 25 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ 57,9,0:1/1:63
-chr1 1922737 . G C 13.2 . DP=21;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,21;MQ=22 PL:GT:GQ 46,63,0:1/1:99
-chr1 21197513 . A G 55.1 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=41 PL:GT:GQ 88,21,0:1/1:84
-chr1 21343209 . T C 5.45 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=14 PL:GT:GQ 37,51,0:1/1:99
-chr1 22097362 . T C 4.75 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30 PL:GT:GQ 35,9,0:1/1:63
-chr1 22254012 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 22650927 . G A 48.1 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=24 PL:GT:GQ 81,21,0:1/1:84
-chr1 23535401 . C T 40.4 . DP=25;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,16,0,5;MQ=19;PV4=1,0.2,1,1 PL:GT:GQ 73,13,0:1/1:65
-chr1 23543855 . T C 49.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=44 PL:GT:GQ 82,18,0:1/1:90
-chr1 24245107 . C G 32 . DP=4;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=36;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,0,35:0/1:38
-chr1 24274412 . G C 39.5 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=32 PL:GT:GQ 72,12,0:1/1:72
-chr1 36529832 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr1 37788090 . A G 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr1 43120440 . C T 34 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=49;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 64,0,31:0/1:34
-chr1 43980466 . C T 43 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=19 PL:GT:GQ 76,45,0:1/1:99
-chr1 46047795 . T C 29.1 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=31 PL:GT:GQ 62,18,0:1/1:90
-chr1 48860309 . C T 99 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=46 PL:GT:GQ 141,18,0:1/1:90
-chr1 49415599 . T C 4.61 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
-chr1 51601816 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 51955459 . G C 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr1 68479569 . T G 12 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 43,6,0:1/1:49
-chr1 69032455 . A G 15.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ 47,9,0:1/1:63
-chr1 71888225 . G T 9.31 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 72381528 . T C 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr1 82004013 . A G 37.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50 PL:GT:GQ 70,12,0:1/1:72
-chr1 86289622 . C T 18 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42 PL:GT:GQ 50,9,0:1/1:63
-chr1 90267663 . A G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=45 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr1 92699542 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 94867317 . G A 26.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 58,6,0:1/1:49
-chr1 96428713 . C G 3.98 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=27 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr1 100466329 . G C 4.85 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=22 PL:GT:GQ 36,18,0:1/1:90
-chr1 101909281 . G A 70 . DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=46;PV4=1,1,0.096,1 PL:GT:GQ 100,0,88:0/1:91
-chr1 106216572 . T A 22 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,16,0;MQ=21 PL:GT:GQ 55,48,0:1/1:99
-chr1 107901770 . T C 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 108431179 . A G 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=41 PL:GT:GQ 155,24,0:1/1:96
-chr1 112005344 . C T 99 . DP=52;AF1=1;CI95=1,1;DP4=7,0,27,0;MQ=44;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 196,25,0:1/1:99
-chr1 116625452 . C T 36 . DP=44;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,23,0,20;MQ=49;PV4=1,2.3e-69,0.42,1 PL:GT:GQ 66,0,179:0/1:69
-chr1 118060710 . G T 6.98 . DP=8;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=47;PV4=1,0.0071,1,1 PL:GT:GQ 36,0,73:0/1:39
-chr1 118198177 . A G 15.9 . DP=23;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:GT:GQ 47,6,0:1/1:49
-chr1 118586346 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 120809555 . G A 20 . DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,2,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 50,0,106:0/1:53
-chr1 130723110 . C A 20.7 . DP=8;AF1=0.5939;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,2;MQ=26;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 50,0,5:0/1:7
-chr1 133979895 . T C 14.9 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr1 134977940 . C T 30 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=38;PV4=1,1,0.26,1 PL:GT:GQ 60,0,31:0/1:34
-chr1 141768589 . G A 18.1 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,4,0;MQ=51;PV4=1,2.7e-05,1,1 PL:GT:GQ 48,0,100:0/1:51
-chr1 141768590 . G A 22 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=50;PV4=1,0.0033,1,1 PL:GT:GQ 52,0,40:0/1:43
-chr1 146506051 . T C 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=43 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr1 150997009 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 162915612 . G C 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr1 168455400 . A G 4.12 . DP=28;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,27;MQ=10 PL:GT:GQ 35,81,0:1/1:99
-chr1 172784744 . T C 17.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 49,6,0:1/1:49
-chr1 183627307 . G A 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr1 185789457 . T C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr1 187081827 . T C 4.77 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=17 PL:GT:GQ 36,30,0:1/1:99
-chr1 188468339 . C T 33 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=24 PL:GT:GQ 66,39,0:1/1:99
-chr1 188595435 . C T 41.8 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr1 188670561 . G C 3.55 . DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=18 PL:GT:GQ 34,27,0:1/1:99
-chr1 188924877 . G A 6.2 . DP=10;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=21;PV4=1,1,1,0.3 PL:GT:GQ 35,3,0:1/1:41
-chr1 190536295 . G A 68 . DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,36,0;MQ=18 PL:GT:GQ 101,108,0:1/1:99
-chr1 191129408 . T A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 195937816 . T C 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr1 198857619 . T C 89 . DP=61;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,38,0,17;MQ=30;PV4=1,0.032,1,1 PL:GT:GQ 119,0,139:0/1:99
-chr1 199057483 . T C 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr1 200133619 . G C 5.83 . DP=49;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=2,0,8,0;MQ=17;PV4=1,0.059,1,0.2 PL:GT:GQ 37,12,0:1/1:72
-chr1 200729661 . A T 36 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=27 PL:GT:GQ 69,42,0:1/1:99
-chr1 201374519 . T C 69.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=39 PL:GT:GQ 102,12,0:1/1:72
-chr1 202811668 . G A 20.2 . DP=4;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,3;MQ=24;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 50,0,12:0/1:15
-chr1 202960650 . C T 16.6 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=27 PL:GT:GQ 49,12,0:1/1:72
-chr1 205686638 . C T 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr1 205949857 . A G 3.14 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=21 PL:GT:GQ 33,15,0:1/1:75
-chr1 209806643 . A G 13.2 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=21 PL:GT:GQ 46,24,0:1/1:96
-chr1 209871501 . C T 25 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,4,0;MQ=41;PV4=1,7.7e-06,1,1 PL:GT:GQ 55,0,84:0/1:58
-chr1 211051323 . G A 99 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=49 PL:GT:GQ 176,24,0:1/1:96
-chr1 211389716 . C T 12 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ 43,6,0:1/1:49
-chr1 211868415 . G A 3.54 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=14 PL:GT:GQ 34,33,0:1/1:99
-chr1 211914531 . C T 84.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,4;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 116,7,0:1/1:57
-chr1 214691313 . A G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr1 215184650 . C T 40.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ 72,6,0:1/1:49
-chr1 215995258 . A G 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr1 217031394 . G C 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr1 217986960 . T C 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr1 218086681 . A G 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=34 PL:GT:GQ 142,27,0:1/1:99
-chr1 218546019 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 218632417 . G T 17.1 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=26 PL:GT:GQ 50,21,0:1/1:84
-chr1 218833355 . C G 23 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,2,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 53,0,63:0/1:56
-chr1 219303186 . T C 7.79 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,25;MQ=12 PL:GT:GQ 40,75,0:1/1:99
-chr1 219517634 . G A 26.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=42 PL:GT:GQ 59,12,0:1/1:72
-chr1 219590158 . T C 3.27 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 33,12,0:1/1:72
-chr1 219709853 . A T 99 . DP=124;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=80,0,41,0;MQ=44;PV4=1,0.26,1,1 PL:GT:GQ 143,0,156:0/1:99
-chr1 222457988 . A G 11.1 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=23 PL:GT:GQ 42,6,0:1/1:49
-chr1 222477914 . A G 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr1 223010233 . A G 18.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr1 223796360 . G A 6.79 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=21 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr1 224273784 . A T 14.2 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=15 PL:GT:GQ 47,30,0:1/1:99
-chr1 224454685 . C T 46.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=32 PL:GT:GQ 79,15,0:1/1:75
-chr1 224514706 . G C 21 . DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,38,0;MQ=19 PL:GT:GQ 54,114,0:1/1:99
-chr1 224515793 . C T 99 . DP=26;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,26,0;MQ=45 PL:GT:GQ 211,78,0:1/1:99
-chr1 224692969 . C A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 225607249 . A G 34 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=45;PV4=1,1,0,1 PL:GT:GQ 64,0,31:0/1:34
-chr1 226923918 . C A 29.1 . DP=52;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,10;MQ=27;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,18,0:1/1:90
-chr1 227125189 . T C 56.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=41 PL:GT:GQ 89,12,0:1/1:72
-chr1 227133712 . A T 20.1 . DP=26;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,10,0;MQ=23;PV4=1,1,0.48,1 PL:GT:GQ 50,0,39:0/1:42
-chr1 227943954 . G C 47 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=37 PL:GT:GQ 79,9,0:1/1:63
-chr1 227943974 . G A 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=34 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr1 228067480 . A G 42.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=45 PL:GT:GQ 75,15,0:1/1:75
-chr1 228067510 . A G 99 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=45 PL:GT:GQ 140,15,0:1/1:75
-chr1 228088778 . C T 6.79 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=23 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr1 228117888 . A C 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr1 228139641 . T C 44.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 77,12,0:1/1:72
-chr1 228577146 . T C 26 . DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,14;MQ=22;PV4=1,1,1,0.027 PL:GT:GQ 56,0,77:0/1:59
-chr1 229001369 . C A 45 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ 77,9,0:1/1:63
-chr1 229001386 . C T 8.44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 39,6,0:1/1:49
-chr1 229348080 . T C 18.1 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=40;PV4=1,0.33,0.17,0.33 PL:GT:GQ 48,0,31:0/1:34
-chr1 229439710 . C T 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=32 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr1 229655149 . T C 30 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=30 PL:GT:GQ 63,24,0:1/1:96
-chr1 229660873 . C G 81 . DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,20,0,7;MQ=36;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 111,0,120:0/1:99
-chr2a 3661005 . C G 24 . DP=13;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,4,0;MQ=27;PV4=1,1.1e-05,1,1 PL:GT:GQ 54,0,34:0/1:37
-chr2a 4140063 . G A 81 . DP=26;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=18,0,8,0;MQ=24;PV4=1,8.3e-09,1,1 PL:GT:GQ 110,0,3:0/1:5
-chr2a 4248440 . T C 20 . DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,7,0;MQ=25;PV4=1,1,0.47,1 PL:GT:GQ 50,0,92:0/1:53
-chr2a 4707656 . A G 63 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 95,9,0:1/1:63
-chr2a 5194801 . G A 7.59 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=24 PL:GT:GQ 38,6,0:1/1:49
-chr2a 14111103 . A G 7.84 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=20 PL:GT:GQ 40,21,0:1/1:84
-chr2a 17799746 . A G 11.3 . DP=5;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 41,0,35:0/1:37
-chr2a 24728910 . G A 45.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=28 PL:GT:GQ 78,15,0:1/1:75
-chr2a 29627939 . G T 5.44 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=27 PL:GT:GQ 36,9,0:1/1:63
-chr2a 31373164 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr2a 33935228 . T C 41.8 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr2a 36311856 . G A 99 . DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,29;MQ=44 PL:GT:GQ 213,87,0:1/1:99
-chr2a 39281204 . T C 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr2a 41087565 . C T 74.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=38 PL:GT:GQ 107,12,0:1/1:72
-chr2a 45574768 . C A 11.3 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=18 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr2a 55464464 . T C 26.1 . DP=7;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=5,0,2,0;MQ=26;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 55,1,0:1/1:23
-chr2a 63107673 . T A 70.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=34 PL:GT:GQ 103,12,0:1/1:72
-chr2a 63141732 . A T 22.8 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 54,6,0:1/1:49
-chr2a 63141910 . G A 3.41 . DP=16;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ 32,6,0:1/1:49
-chr2a 63141911 . C T 9.55 . DP=16;AF1=0.5031;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,3;MQ=33;PV4=1,0.43,1,1 PL:GT:GQ 39,0,19:0/1:22
-chr2a 63143543 . C T 28 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,17;MQ=16;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 61,42,0:1/1:99
-chr2a 66419805 . G A 3.69 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 34,15,0:1/1:75
-chr2a 66563922 . C T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr2a 67719136 . C T 39.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 71,6,0:1/1:49
-chr2a 72781453 . A C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr2a 76733211 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr2a 78190502 . A C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr2a 85021209 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr2a 88554861 . A T 39 . DP=74;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,4;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 69,0,92:0/1:72
-chr2a 88554877 . A G 92 . DP=90;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,23,0,13;MQ=41;PV4=1,0.3,1,1 PL:GT:GQ 122,0,128:0/1:99
-chr2a 88824857 . G A 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=37 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr2a 93546675 . C T 26 . DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,2,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 56,0,87:0/1:59
-chr2a 94788853 . A G 34.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43 PL:GT:GQ 67,15,0:1/1:75
-chr2a 96738146 . T C 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr2a 102737384 . A G 12.3 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,18,0;MQ=11 PL:GT:GQ 45,54,0:1/1:99
-chr2a 103407172 . A G 35 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=19 PL:GT:GQ 68,24,0:1/1:96
-chr2a 105774580 . T G 99 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=30 PL:GT:GQ 135,39,0:1/1:99
-chr2a 106376301 . C G 24.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=19 PL:GT:GQ 57,18,0:1/1:90
-chr2a 106376315 . C T 8.75 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=19 PL:GT:GQ 41,18,0:1/1:90
-chr2a 112422267 . C T 30 . DP=20;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=14,0,5,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 60,0,131:0/1:63
-chr2b 3049384 . A C 14.9 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr2b 3049385 . G C 14.9 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr2b 3049406 . C G 99 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=36 PL:GT:GQ 135,18,0:1/1:90
-chr2b 4213802 . T C 89.5 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr2b 5022895 . G A 66 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=49 PL:GT:GQ 99,30,0:1/1:99
-chr2b 6037666 . G T 56 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=17 PL:GT:GQ 89,39,0:1/1:99
-chr2b 13656952 . G A 19.2 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=21 PL:GT:GQ 52,18,0:1/1:90
-chr2b 15026944 . A G 6.79 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr2b 23362613 . A G 5.64 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22 PL:GT:GQ 37,15,0:1/1:75
-chr2b 45947861 . C G 68 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=50 PL:GT:GQ 101,33,0:1/1:99
-chr2b 46597824 . T C 65.6 . DP=39;AF1=0.5939;CI95=0.5,1;DP4=23,0,10,0;MQ=22;PV4=1,0.014,1,1 PL:GT:GQ 95,0,5:0/1:7
-chr2b 49665191 . G T 34.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=37 PL:GT:GQ 67,21,0:1/1:84
-chr2b 61001546 . A G 48 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=26 PL:GT:GQ 81,24,0:1/1:96
-chr2b 88502851 . T C 4.77 . DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=37;PV4=1,1,0.46,1 PL:GT:GQ 33,0,34:0/1:33
-chr2b 91675431 . C T 30 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=27 PL:GT:GQ 63,24,0:1/1:96
-chr2b 91870148 . T G 67 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,13;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 100,31,0:1/1:99
-chr2b 97066826 . G A 20.1 . DP=9;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,2;MQ=31;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 50,0,35:0/1:38
-chr2b 97670822 . G A 4.85 . DP=6;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=18 PL:GT:GQ 36,18,0:1/1:90
-chr2b 102773175 . A G 17.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38 PL:GT:GQ 49,9,0:1/1:63
-chr2b 109805532 . T C 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=45 PL:GT:GQ 176,24,0:1/1:96
-chr2b 110841448 . A G 11.1 . DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 42,6,0:1/1:49
-chr2b 123217025 . T C 31.5 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=37 PL:GT:GQ 64,12,0:1/1:72
-chr2b 123263214 . A G 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr2b 127747292 . C T 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=52 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr2b 130121958 . A G 89.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43 PL:GT:GQ 122,15,0:1/1:75
-chr2b 130253633 . A G 14.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr2b 130692761 . C T 49.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=51 PL:GT:GQ 82,18,0:1/1:90
-chr2b 130743365 . A G 99 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=42 PL:GT:GQ 140,15,0:1/1:75
-chr2b 131553874 . A C 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=37 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr2b 131716894 . A G 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=40 PL:GT:GQ 137,24,0:1/1:96
-chr2b 131716936 . G A 99 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=36 PL:GT:GQ 173,36,0:1/1:99
-chr2b 131716952 . A G 99 . DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,14;MQ=36;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 152,0,43:0/1:46
-chr2b 133360184 . C T 99 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,20;MQ=32 PL:GT:GQ 163,60,0:1/1:99
-chr2b 133644741 . T A 16.4 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=27 PL:GT:GQ 49,15,0:1/1:75
-chr2b 133720595 . T C 41 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=29 PL:GT:GQ 74,36,0:1/1:99
-chr2b 133727192 . C T 19.3 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 52,15,0:1/1:75
-chr2b 133727260 . G A 3.56 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=18 PL:GT:GQ 34,24,0:1/1:95
-chr2b 133800294 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=23 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr2b 134582754 . A C 56.1 . DP=37;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=36 PL:GT:GQ 89,21,0:1/1:84
-chr2b 134582763 . G C 78 . DP=37;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,36;MQ=34 PL:GT:GQ 111,108,0:1/1:99
-chr2b 134809668 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr3 527814 . C G 46 . DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,3,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 76,0,106:0/1:79
-chr3 559510 . G A 38 . DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,0,17,0;MQ=28;PV4=1,1,0.014,1 PL:GT:GQ 68,0,111:0/1:71
-chr3 879433 . T G 32 . DP=4;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,0,34:0/1:37
-chr3 1809645 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr3 3235812 . C T 7.59 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 38,6,0:1/1:49
-chr3 3250176 . A G 83 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=32 PL:GT:GQ 116,24,0:1/1:96
-chr3 5049073 . T A 99 . DP=25;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,0,9,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 136,0,129:0/1:99
-chr3 5142874 . G A 99 . DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,38,0;MQ=28 PL:GT:GQ 179,114,0:1/1:99
-chr3 5554864 . T C 3.54 . DP=7;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,3;MQ=27;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 31,0,35:0/1:33
-chr3 5749648 . G A 21.2 . DP=26;AF1=0.7303;CI95=0.5,1;DP4=0,7,0,7;MQ=26;PV4=1,0.16,1,0.17 PL:GT:GQ 50,0,2:0/1:3
-chr3 16451708 . A T 71.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=38 PL:GT:GQ 104,15,0:1/1:75
-chr3 23410276 . G A 99 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45 PL:GT:GQ 140,15,0:1/1:75
-chr3 51368824 . A G 28 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ 60,9,0:1/1:63
-chr3 53000453 . A G 54 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=19 PL:GT:GQ 87,30,0:1/1:99
-chr3 53000463 . A G 54 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=19 PL:GT:GQ 87,30,0:1/1:99
-chr3 59077423 . C T 77.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=33 PL:GT:GQ 110,15,0:1/1:75
-chr3 60040501 . T C 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr3 64203481 . A G 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr3 67947441 . C T 17.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ 50,12,0:1/1:72
-chr3 76372631 . A G 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr3 80611316 . C G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr3 81554381 . G T 17.6 . DP=24;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=26 PL:GT:GQ 50,12,0:1/1:72
-chr3 87614647 . A G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr3 93900455 . A T 11.6 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=13 PL:GT:GQ 44,15,0:1/1:75
-chr3 96174457 . A G 4.11 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=24 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
-chr3 96215569 . A C 3.41 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ 32,6,0:1/1:49
-chr3 96587998 . A C 7.08 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,6,0;MQ=17 PL:GT:GQ 39,18,0:1/1:90
-chr3 99711220 . A C 12.8 . DP=11;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 42,2,0:1/1:37
-chr3 99789741 . C G 99 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=47 PL:GT:GQ 210,51,0:1/1:99
-chr3 103667651 . A C 3.98 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr3 104604896 . G C 55 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:GT:GQ 87,9,0:1/1:63
-chr3 104997217 . G A 33.1 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,16,0;MQ=34;PV4=1,3e-10,0.17,0.36 PL:GT:GQ 66,19,0:1/1:76
-chr3 106097816 . A G 28 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=26 PL:GT:GQ 61,45,0:1/1:99
-chr3 106822259 . G C 99 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=50 PL:GT:GQ 140,15,0:1/1:75
-chr3 109946413 . G A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr3 121238963 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr3 126248567 . A G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr3 129733836 . A G 6.2 . DP=4;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=43;PV4=1,0.02,0.31,1 PL:GT:GQ 35,0,28:0/1:30
-chr3 131372785 . C T 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=34 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr3 132290987 . C T 22 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=45 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr3 136054421 . C T 73 . DP=82;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,78,0;MQ=28 PL:GT:GQ 106,235,0:1/1:99
-chr3 141075246 . G A 30.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=41 PL:GT:GQ 62,6,0:1/1:49
-chr3 141075262 . T G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=41 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr3 141430649 . G T 81.8 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,4;MQ=41;PV4=1,0.34,1,0.25 PL:GT:GQ 113,6,0:1/1:49
-chr3 143617747 . G T 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr3 163576128 . C T 5.6 . DP=4;AF1=0.7302;CI95=0.5,1;DP4=2,0,2,0;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 33,0,2:0/1:3
-chr3 163839828 . A G 4.45 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=26 PL:GT:GQ 35,12,0:1/1:72
-chr3 175839340 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr3 190193258 . G T 3.98 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr3 190777007 . G A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr3 190970350 . A G 61 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=37 PL:GT:GQ 94,30,0:1/1:99
-chr3 198686408 . G A 36.6 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,16;MQ=25;PV4=1,1,0.026,1 PL:GT:GQ 69,11,0:1/1:66
-chr3 199277478 . T C 3.61 . DP=6;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=21 PL:GT:GQ 34,18,0:1/1:90
-chr3 199780181 . G T 77 . DP=45;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,35,0,10;MQ=33;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 107,0,114:0/1:99
-chr3 199889335 . A C 9.54 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=18 PL:GT:GQ 42,24,0:1/1:96
-chr3 200018161 . A G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr4 195475 . A G 13 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr4 639141 . C A 14.9 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr4 639152 . C T 15.2 . DP=17;AF1=0.5016;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=33;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 45,0,22:0/1:25
-chr4 986497 . G T 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=33 PL:GT:GQ 163,30,0:1/1:99
-chr4 986516 . C T 55.1 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=37 PL:GT:GQ 88,21,0:1/1:84
-chr4 1207485 . A C 14.9 . DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr4 1323502 . G A 13.2 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=22 PL:GT:GQ 46,33,0:1/1:99
-chr4 1613521 . G A 89 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,16,0;MQ=32 PL:GT:GQ 122,48,0:1/1:99
-chr4 1748790 . C T 38 . DP=21;AF1=0.5005;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,8,0;MQ=40;PV4=1,0.09,1,1 PL:GT:GQ 68,0,27:0/1:30
-chr4 2255732 . T C 99 . DP=29;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,28,0;MQ=31 PL:GT:GQ 186,84,0:1/1:99
-chr4 3010159 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr4 3545023 . A G 99 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=38 PL:GT:GQ 145,27,0:1/1:99
-chr4 3586344 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr4 3879337 . A G 16.6 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 49,12,0:1/1:72
-chr4 3940733 . A G 47.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ 80,15,0:1/1:75
-chr4 4410338 . T C 13.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=31 PL:GT:GQ 46,15,0:1/1:75
-chr4 4796408 . T C 41 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=17 PL:GT:GQ 74,48,0:1/1:99
-chr4 4796414 . A G 11.3 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=17 PL:GT:GQ 44,45,0:1/1:99
-chr4 6436959 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr4 9494256 . T C 3.41 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=37 PL:GT:GQ 32,6,0:1/1:49
-chr4 24881479 . G A 14.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ 46,9,0:1/1:63
-chr4 26128644 . A G 23 . DP=18;AF1=0.5006;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,10,0;MQ=22;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 53,0,26:0/1:29
-chr4 42109100 . G A 17.1 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ 49,9,0:1/1:63
-chr4 42309652 . C T 68 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=50 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr4 46913966 . C T 9.08 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=16 PL:GT:GQ 41,12,0:1/1:72
-chr4 50335142 . A G 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr4 51658550 . C A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr4 58258023 . T C 26 . DP=5;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=34;PV4=1,1,1,0.05 PL:GT:GQ 56,0,32:0/1:35
-chr4 59219112 . C A 42.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=50 PL:GT:GQ 75,12,0:1/1:72
-chr4 62746067 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr4 67404338 . G T 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=39 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr4 73353380 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr4 73946294 . G C 4.77 . DP=51;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,3;MQ=40;PV4=1,0.19,0.37,0.11 PL:GT:GQ 33,0,64:0/1:36
-chr4 79607484 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr4 82337365 . G C 90 . DP=54;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=28 PL:GT:GQ 123,48,0:1/1:99
-chr4 82653801 . A G 4.11 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
-chr4 87130164 . C T 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr4 87130176 . G A 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr4 91459729 . C A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr4 96130778 . G C 99 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,19;MQ=45 PL:GT:GQ 211,57,0:1/1:99
-chr4 100709417 . A G 45.1 . DP=16;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=12,0,4,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 75,0,17:0/1:20
-chr4 107276770 . C T 70 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,6;MQ=31;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 100,0,97:0/1:98
-chr4 115327550 . G C 42 . DP=67;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,66;MQ=35;PV4=1,3.2e-24,0.13,1 PL:GT:GQ 75,162,0:1/1:99
-chr4 136558502 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr4 159572459 . G A 15.1 . DP=126;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,69,0,57;MQ=39;PV4=1,4.1e-96,0.077,1 PL:GT:GQ 45,0,175:0/1:48
-chr4 174968484 . G C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr4 175030633 . T C 14.3 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=29 PL:GT:GQ 47,18,0:1/1:90
-chr4 183410027 . G T 6.2 . DP=31;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=45;PV4=1,0.035,1,0.21 PL:GT:GQ 35,0,28:0/1:30
-chr4 190907368 . T C 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=50 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr4 192175690 . A G 76.8 . DP=7;AF1=0.95;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,4;MQ=35;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 105,0,0:1/1:10
-chr4 192673268 . G A 14.2 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=22 PL:GT:GQ 47,27,0:1/1:99
-chr4 192943966 . T C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr4 195460104 . C G 23.1 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=19 PL:GT:GQ 56,24,0:1/1:96
-chr4 198277830 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr5 170098 . A G 13 . DP=12;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr5 395814 . T C 4.77 . DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=36;PV4=1,1,0.48,1 PL:GT:GQ 33,0,33:0/1:33
-chr5 414024 . T A 10.4 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=20 PL:GT:GQ 42,9,0:1/1:63
-chr5 496767 . T C 13.9 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr5 805676 . C G 45 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=32 PL:GT:GQ 78,51,0:1/1:99
-chr5 1252896 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr5 1418370 . G A 3.65 . DP=8;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=4,0,4,0;MQ=13;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 30,0,2:0/1:3
-chr5 1494911 . G C 62 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=46 PL:GT:GQ 95,24,0:1/1:96
-chr5 1494932 . C T 6.98 . DP=8;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=46;PV4=1,0.1,0.077,1 PL:GT:GQ 36,0,31:0/1:33
-chr5 1506037 . T C 24.1 . DP=24;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=11,0,13,0;MQ=16;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 55,5,0:1/1:46
-chr5 1509406 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr5 1733649 . A G 99 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,25;MQ=47 PL:GT:GQ 212,75,0:1/1:99
-chr5 1747304 . A G 12.3 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=19 PL:GT:GQ 45,36,0:1/1:99
-chr5 1747308 . C A 44 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=19 PL:GT:GQ 77,36,0:1/1:99
-chr5 3519783 . C T 21.1 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=18 PL:GT:GQ 54,24,0:1/1:96
-chr5 4101593 . A G 69.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=43 PL:GT:GQ 102,12,0:1/1:72
-chr5 7204332 . T A 4.61 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=24 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
-chr5 11510398 . A C 34 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=51;PV4=1,1,0,1 PL:GT:GQ 64,0,31:0/1:34
-chr5 15406720 . T C 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr5 25152417 . C A 10.9 . DP=28;AF1=0.5718;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,6;MQ=25;PV4=1,1,0.21,1 PL:GT:GQ 40,0,6:0/1:8
-chr5 39072637 . A G 35.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=50 PL:GT:GQ 68,15,0:1/1:75
-chr5 46022699 . G A 44 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr5 55664181 . C G 10.4 . DP=8;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=3,0,5,0;MQ=18;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 40,3,0:1/1:41
-chr5 56253386 . T C 50.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=36 PL:GT:GQ 83,21,0:1/1:84
-chr5 56253447 . C T 42.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=45 PL:GT:GQ 75,12,0:1/1:72
-chr5 71950166 . G T 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr5 72703090 . C T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr5 73570280 . G T 5.45 . DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,41,0;MQ=15 PL:GT:GQ 37,123,0:1/1:99
-chr5 73701762 . G T 40.8 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:GT:GQ 72,6,0:1/1:49
-chr5 76956867 . T C 10.2 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ 41,6,0:1/1:49
-chr5 79097961 . C G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr5 87026167 . T C 22 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr5 97680525 . T C 3.27 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=23 PL:GT:GQ 33,12,0:1/1:72
-chr5 100674737 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr5 105389966 . T C 3.52 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=15 PL:GT:GQ 33,9,0:1/1:63
-chr5 109998341 . A C 12.7 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 45,12,0:1/1:72
-chr5 120629105 . C T 6.79 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr5 128383954 . C T 23 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,5;MQ=48;PV4=1,3.3e-07,1,1 PL:GT:GQ 53,0,98:0/1:56
-chr5 133925142 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr5 135375404 . T C 11.8 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=31;PV4=1,0.03,1,1 PL:GT:GQ 42,4,0:1/1:45
-chr5 136498281 . T G 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr5 136717285 . A G 82.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ 115,12,0:1/1:72
-chr5 136910734 . G A 62 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,13;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 95,31,0:1/1:99
-chr5 141208149 . C G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr5 148056348 . C A 37.1 . DP=4;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=38;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 66,1,0:1/1:23
-chr5 151941534 . G T 46.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=34 PL:GT:GQ 79,12,0:1/1:72
-chr5 159967229 . G C 22.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ 55,12,0:1/1:72
-chr5 174024541 . T G 29.5 . DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 59,2,0:1/1:37
-chr5 175525290 . A G 3.27 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=20 PL:GT:GQ 33,12,0:1/1:72
-chr5 175988954 . A C 14.2 . DP=23;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,4;MQ=47;PV4=1,1,0.2,1 PL:GT:GQ 44,0,76:0/1:47
-chr5 176782226 . T C 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr5 179132834 . C G 99 . DP=28;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,28;MQ=41 PL:GT:GQ 207,84,0:1/1:99
-chr5 180155809 . G C 3.01 . DP=36;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=25,0,9,0;MQ=35;PV4=1,1e-15,1,1 PL:GT:GQ 30,0,121:0/1:33
-chr5 181282819 . T G 38.3 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,9;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 71,14,0:1/1:70
-chr5 182426125 . G C 29 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=26 PL:GT:GQ 61,9,0:1/1:63
-chr5 182443682 . G A 3.69 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=21 PL:GT:GQ 34,15,0:1/1:75
-chr5 183008993 . C T 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr5 183312016 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr6_cox_hap1 519146 . G A 17.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=30 PL:GT:GQ 49,9,0:1/1:63
-chr6_cox_hap1 687497 . A G 33 . DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,0.0016,1,1 PL:GT:GQ 63,3,0:1/1:41
-chr6_qbl_hap2 120066 . T C 99 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37 PL:GT:GQ 139,27,0:1/1:99
-chr6 277954 . C T 53 . DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=4,0,37,0;MQ=19;PV4=1,1,0.3,1 PL:GT:GQ 86,49,0:1/1:99
-chr6 593158 . A G 4.61 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
-chr6 2865562 . T G 25 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=23 PL:GT:GQ 58,27,0:1/1:99
-chr6 3751403 . G A 42.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=32 PL:GT:GQ 75,15,0:1/1:75
-chr6 3884989 . A G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr6 4127278 . A T 13.9 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr6 5887783 . C G 99 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=34 PL:GT:GQ 142,21,0:1/1:84
-chr6 5887811 . C T 55.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=34 PL:GT:GQ 88,21,0:1/1:84
-chr6 6937170 . G C 99 . DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,47;MQ=28 PL:GT:GQ 157,141,0:1/1:99
-chr6 7262317 . C T 13.2 . DP=50;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=21,0,9,0;MQ=36;PV4=1,4e-05,0.17,0.26 PL:GT:GQ 43,0,158:0/1:46
-chr6 7533214 . A G 10.4 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ 42,9,0:1/1:63
-chr6 20979907 . A G 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=38 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr6 22321632 . A G 41 . DP=5;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=46;PV4=1,0.24,0.19,0.33 PL:GT:GQ 71,0,28:0/1:31
-chr6 25352296 . G A 7.8 . DP=4;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=38;PV4=1,1,0.16,1 PL:GT:GQ 37,0,28:0/1:30
-chr6 26298040 . T A 34 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=48;PV4=1,1,0.21,0.33 PL:GT:GQ 64,0,31:0/1:34
-chr6 33428755 . G A 70 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=32 PL:GT:GQ 103,27,0:1/1:99
-chr6 39512099 . G A 55.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=50 PL:GT:GQ 88,21,0:1/1:84
-chr6 39961094 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr6 40452120 . A G 40.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 72,6,0:1/1:49
-chr6 43204766 . A G 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=51 PL:GT:GQ 176,24,0:1/1:96
-chr6 52696512 . C T 70 . DP=76;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,34,0,42;MQ=18;PV4=1,0.11,1,1 PL:GT:GQ 100,0,51:0/1:54
-chr6 53785550 . A G 99 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=46 PL:GT:GQ 190,30,0:1/1:99
-chr6 53897484 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr6 57038290 . C T 10.2 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 41,6,0:1/1:49
-chr6 62925087 . G C 35 . DP=5;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,4,0;MQ=36;PV4=1,1,0.2,1 PL:GT:GQ 65,0,25:0/1:28
-chr6 62925094 . T C 25.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=36 PL:GT:GQ 58,15,0:1/1:75
-chr6 70834405 . G A 72.1 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=29 PL:GT:GQ 105,21,0:1/1:84
-chr6 71026058 . C T 48.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=42 PL:GT:GQ 81,18,0:1/1:90
-chr6 74420752 . T C 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr6 77498624 . T C 16.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ 48,6,0:1/1:49
-chr6 80416836 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr6 113611590 . A G 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=46 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr6 119308431 . T C 38.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=40 PL:GT:GQ 71,12,0:1/1:72
-chr6 151758592 . T C 3.07 . DP=17;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,8,0,9;MQ=13;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 29,1,0:1/1:23
-chr6 151759358 . A G 99 . DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=12,0,15,0;MQ=44;PV4=1,1,1,0.19 PL:GT:GQ 171,0,128:0/1:99
-chr6 154741755 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr6 161061053 . C A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=52 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr6 161474189 . C T 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr6 164304657 . C T 10.4 . DP=63;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,29,0,19;MQ=22;PV4=1,7.7e-11,1,0.049 PL:GT:GQ 40,0,37:0/1:38
-chr6 164703105 . T C 99 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=40 PL:GT:GQ 165,30,0:1/1:99
-chr6 167518328 . A G 78 . DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=27,0,14,0;MQ=33;PV4=1,0.026,0.43,0.056 PL:GT:GQ 108,0,149:0/1:99
-chr6 169906323 . G A 41.8 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr6 171893912 . G A 69.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=33 PL:GT:GQ 102,15,0:1/1:75
-chr6 173631604 . A G 6.98 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=37;PV4=1,0.069,1,1 PL:GT:GQ 36,0,34:0/1:35
-chr7 835856 . C T 27.5 . DP=13;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=4,0,6,0;MQ=23;PV4=1,0.46,1,1 PL:GT:GQ 57,2,0:1/1:37
-chr7 1046005 . C T 11.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr7 1564339 . C T 71 . DP=66;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=36,0,24,0;MQ=29;PV4=1,1,0.35,1 PL:GT:GQ 101,0,134:0/1:99
-chr7 1806266 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr7 1936013 . G T 7.77 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=17 PL:GT:GQ 39,9,0:1/1:63
-chr7 2319532 . C A 4.11 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=14 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
-chr7 2682121 . C T 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr7 3248116 . T C 36.5 . DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=37;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 66,2,0:1/1:37
-chr7 3624766 . C T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr7 5291140 . G C 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr7 5314457 . C A 3.56 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=18 PL:GT:GQ 34,24,0:1/1:95
-chr7 5595072 . T A 79 . DP=13;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,5,0;MQ=31;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 109,0,57:0/1:60
-chr7 5646060 . G C 7.79 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=10 PL:GT:GQ 40,30,0:1/1:99
-chr7 6056816 . C G 7.08 . DP=6;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 35,1,0:1/1:23
-chr7 6412641 . C T 40 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=33 PL:GT:GQ 73,33,0:1/1:99
-chr7 6766874 . A G 34.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=43 PL:GT:GQ 67,15,0:1/1:75
-chr7 8482729 . C T 5.08 . DP=16;AF1=0.8276;CI95=0.5,1;DP4=3,0,3,0;MQ=22;PV4=1,1,1,0.19 PL:GT:GQ 32,0,1:1/1:5
-chr7 9238362 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr7 9687781 . G A 33 . DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,16,0,12;MQ=48;PV4=1,6.5e-38,1,1 PL:GT:GQ 63,0,170:0/1:66
-chr7 9752803 . A T 14.2 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=18 PL:GT:GQ 47,27,0:1/1:99
-chr7 10240910 . T C 45.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ 78,12,0:1/1:72
-chr7 11046187 . C T 86.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=47 PL:GT:GQ 119,12,0:1/1:72
-chr7 11548207 . C G 14.6 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=6,1,0,5;MQ=18;PV4=0.015,1,1,1 PL:GT:GQ 46,7,0:1/1:57
-chr7 11580317 . C T 42 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,10;MQ=22;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 75,23,0:1/1:92
-chr7 11585384 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr7 13498356 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr7 13500887 . G A 15.1 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=22 PL:GT:GQ 48,30,0:1/1:99
-chr7 13827079 . C T 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr7 14403976 . T G 59 . DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=39 PL:GT:GQ 92,24,0:1/1:96
-chr7 14756588 . A G 44 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,10,0;MQ=44;PV4=1,5.3e-18,1,1 PL:GT:GQ 74,0,70:0/1:72
-chr7 14756619 . T G 44 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,10,0;MQ=44;PV4=1,6.4e-10,1,1 PL:GT:GQ 74,0,70:0/1:72
-chr7 36734598 . A C 11.1 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ 42,6,0:1/1:49
-chr7 36734599 . A T 11.1 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ 42,6,0:1/1:49
-chr7 36734603 . G C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr7 40634921 . A C 55 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=39 PL:GT:GQ 88,39,0:1/1:99
-chr7 48271285 . A T 73 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=25 PL:GT:GQ 106,30,0:1/1:99
-chr7 56264700 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr7 62326003 . C A 26.1 . DP=35;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=28 PL:GT:GQ 59,18,0:1/1:90
-chr7 109468934 . T G 5.13 . DP=10;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=39;PV4=1,0.031,1,1 PL:GT:GQ 33,2,0:1/1:37
-chr7 110208327 . C G 16.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 48,6,0:1/1:49
-chr7 125654934 . A G 4.11 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=27 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
-chr7 125770209 . A C 32 . DP=31;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,13,0;MQ=34;PV4=1,0.00017,0.16,0.22 PL:GT:GQ 62,0,105:0/1:65
-chr7 125770265 . G C 36 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,5;MQ=48;PV4=1,0.0047,0.016,0.035 PL:GT:GQ 66,0,110:0/1:69
-chr7 126687042 . A G 21.1 . DP=36;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=22 PL:GT:GQ 54,21,0:1/1:84
-chr7 132292897 . G T 99 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=43 PL:GT:GQ 167,21,0:1/1:84
-chr7 132334562 . A C 23 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=23 PL:GT:GQ 56,30,0:1/1:99
-chr7 132431838 . C T 13.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,4,0;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 44,5,0:1/1:46
-chr7 136324945 . T C 13.7 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 46,12,0:1/1:72
-chr7 136957634 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr7 141746871 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr7 146831870 . C T 4.77 . DP=14;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=37;PV4=1,0.0029,0.28,1 PL:GT:GQ 33,0,28:0/1:30
-chr7 147142770 . T C 45 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=31 PL:GT:GQ 77,9,0:1/1:63
-chr7 147713906 . C T 4.77 . DP=8;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,8.9e-06,0.48,0.27 PL:GT:GQ 33,0,29:0/1:31
-chr7 148742642 . G A 68 . DP=14;AF1=0.5032;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,10,0;MQ=28;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 98,0,19:0/1:22
-chr7 148879148 . C T 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr7 149484407 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr7 152444478 . A G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr7 154106613 . C T 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=51 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr7 154776891 . G T 14.4 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ 47,15,0:1/1:75
-chr7 155882061 . A C 29 . DP=24;AF1=0.502;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,4;MQ=46;PV4=1,0.018,0.15,0.29 PL:GT:GQ 59,0,21:0/1:24
-chr7 155956844 . G C 23 . DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,4;MQ=38;PV4=1,1,0.38,1 PL:GT:GQ 53,0,103:0/1:56
-chr7 156277694 . G A 62 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=46 PL:GT:GQ 95,24,0:1/1:96
-chr7 156720588 . T C 16.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ 48,9,0:1/1:63
-chr7 156807649 . T C 3.01 . DP=30;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,3;MQ=43;PV4=1,0.16,0.15,1 PL:GT:GQ 30,0,72:0/1:33
-chr7 157331292 . G T 43.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=34 PL:GT:GQ 76,21,0:1/1:84
-chr7 157382957 . T C 33.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr8 556382 . A G 37.1 . DP=5;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=31;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 66,1,0:1/1:23
-chr8 1661673 . T C 9.31 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr8 7379751 . C A 6.24 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=19 PL:GT:GQ 38,21,0:1/1:84
-chr8 8160505 . A T 68.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 101,12,0:1/1:72
-chr8 8160508 . C T 24.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 57,12,0:1/1:72
-chr8 16781011 . A G 55.5 . DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=34 PL:GT:GQ 88,12,0:1/1:72
-chr8 18716499 . A T 20 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,2;MQ=29;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 50,0,52:0/1:51
-chr8 23326483 . A G 60 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=47 PL:GT:GQ 92,9,0:1/1:63
-chr8 25842819 . T A 12 . DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ 43,6,0:1/1:49
-chr8 26300279 . T C 34 . DP=44;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,41,0;MQ=21 PL:GT:GQ 67,123,0:1/1:99
-chr8 29673470 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr8 29673473 . C G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr8 31685466 . C T 34 . DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,0,5,0;MQ=28;PV4=1,0.072,1,0.36 PL:GT:GQ 64,0,50:0/1:53
-chr8 37378739 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=34 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr8 51325952 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr8 59221963 . G A 16.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ 48,9,0:1/1:63
-chr8 62764995 . T G 20 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=32 PL:GT:GQ 52,9,0:1/1:63
-chr8 63157426 . C G 41.6 . DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,7,0,15;MQ=19;PV4=1,1,1,0.25 PL:GT:GQ 74,11,0:1/1:66
-chr8 68710444 . G A 30 . DP=5;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=3,0,2,0;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 59,0,3:0/1:5
-chr8 76416560 . G A 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=46 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr8 81425275 . T G 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr8 89842286 . G C 4.61 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=30 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
-chr8 100926281 . G A 38 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ 70,9,0:1/1:63
-chr8 102746002 . G C 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr8 107850176 . C T 43.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=45 PL:GT:GQ 76,18,0:1/1:90
-chr8 109966441 . T C 27.3 . DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=38 PL:GT:GQ 60,15,0:1/1:75
-chr8 118811716 . G T 99 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=50 PL:GT:GQ 155,18,0:1/1:90
-chr8 119440254 . A T 58.5 . DP=5;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=34;PV4=1,1,1,0.14 PL:GT:GQ 87,0,1:1/1:5
-chr8 121236024 . G A 39.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 71,6,0:1/1:49
-chr8 125489079 . C T 13 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr8 128502549 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr8 128502551 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr8 130951113 . G A 4.61 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=19 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
-chr8 135307123 . G A 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr8 138814155 . C T 57.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:GT:GQ 90,18,0:1/1:90
-chr8 140566111 . A G 18.1 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=15 PL:GT:GQ 51,36,0:1/1:99
-chr8 141586480 . T G 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr8 143376712 . A G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr8 150662729 . T C 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr8 150741294 . A G 25.1 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=34 PL:GT:GQ 58,18,0:1/1:90
-chr8 150975618 . A G 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr8 151580103 . T C 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=20 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr8 151634410 . G T 48 . DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,12,0,5;MQ=39;PV4=1,0.072,1,1 PL:GT:GQ 78,0,125:0/1:81
-chr8 151709267 . G A 91.1 . DP=8;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,7;MQ=40;PV4=1,1,0.28,0.37 PL:GT:GQ 121,0,16:0/1:19
-chr8 152636420 . G A 8.75 . DP=3;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=30;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 37,1,0:1/1:23
-chr8 152706967 . G A 3.01 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=16 PL:GT:GQ 33,30,0:1/1:99
-chr8 152786522 . T C 80.1 . DP=16;AF1=0.5102;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,12;MQ=31;PV4=1,0.25,1,1 PL:GT:GQ 110,0,14:0/1:17
-chr8 152863132 . T G 5.44 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=30 PL:GT:GQ 36,9,0:1/1:63
-chr9 23235268 . C T 12 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ 43,6,0:1/1:49
-chr9 26391176 . T C 15.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 47,6,0:1/1:49
-chr9 26868232 . C G 63 . DP=20;AF1=0.5025;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,13,0;MQ=22;PV4=1,0.2,1,0.44 PL:GT:GQ 93,0,20:0/1:23
-chr9 34223668 . C T 22 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,7;MQ=27;PV4=1,0.14,0.34,1 PL:GT:GQ 52,0,79:0/1:55
-chr9 39696645 . G A 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr9 40654130 . T G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr9 41145321 . T G 46.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ 79,12,0:1/1:72
-chr9 42273483 . G A 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr9 55633192 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr9 58705807 . T C 70 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=24 PL:GT:GQ 103,30,0:1/1:99
-chr9 61697149 . C G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr9 63152790 . A C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr9 63703913 . C G 90.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=38 PL:GT:GQ 123,21,0:1/1:84
-chr9 65116068 . T C 70 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=49 PL:GT:GQ 103,39,0:1/1:99
-chr9 71266598 . C A 3.98 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr9 73188677 . G T 52 . DP=294;AF1=1;CI95=1,1;DP4=44,0,245,0;MQ=33;PV4=1,0.28,0.0092,1 PL:GT:GQ 85,147,0:1/1:99
-chr9 78854179 . G T 22 . DP=97;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=21,0,12,0;MQ=44;PV4=1,0.02,0.032,0.0033 PL:GT:GQ 52,0,158:0/1:55
-chr9 82964679 . A C 13.2 . DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=36 PL:GT:GQ 45,9,0:1/1:63
-chr9 84124545 . G T 57 . DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,3,0;MQ=49;PV4=1,1,0.024,1 PL:GT:GQ 87,0,59:0/1:62
-chr9 86552862 . C T 14.4 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=26 PL:GT:GQ 47,15,0:1/1:75
-chr9 87548941 . A G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr9 89021101 . G A 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr9 90447825 . G A 9.31 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr9 92462035 . C A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr9 93077294 . T G 5.44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=31 PL:GT:GQ 36,9,0:1/1:63
-chr9 93998137 . G A 68 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=46 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr9 93998148 . C T 21.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=36 PL:GT:GQ 54,15,0:1/1:75
-chr9 95028964 . C A 99 . DP=83;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,57,0,26;MQ=32;PV4=1,9.3e-08,1,0.092 PL:GT:GQ 134,0,120:0/1:99
-chr9 103829155 . A G 33 . DP=96;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,96,0;MQ=16 PL:GT:GQ 66,255,0:1/1:99
-chr9 104981331 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr9 111070656 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr9 117395657 . T C 16.4 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 49,15,0:1/1:75
-chr9 117718907 . A G 46.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=29 PL:GT:GQ 79,18,0:1/1:90
-chr9 119149161 . T C 3.14 . DP=65;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22 PL:GT:GQ 33,15,0:1/1:75
-chr9 124528802 . G A 78 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=25 PL:GT:GQ 111,39,0:1/1:99
-chr9 126707903 . G A 26 . DP=37;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,21,0,8;MQ=46;PV4=1,2.6e-07,0.21,0.42 PL:GT:GQ 56,0,175:0/1:59
-chr9 128700686 . C G 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr9 129084077 . G A 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr9 129116900 . A T 20 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30 PL:GT:GQ 52,9,0:1/1:63
-chr9 130290720 . C G 21.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 53,6,0:1/1:49
-chr9 130306057 . C G 71 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=28 PL:GT:GQ 104,42,0:1/1:99
-chr9 130528990 . G A 99 . DP=31;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,31,0;MQ=27 PL:GT:GQ 174,93,0:1/1:99
-chr9 130529002 . A T 7.79 . DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=15 PL:GT:GQ 40,33,0:1/1:99
-chr9 130639996 . A G 8.44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 39,6,0:1/1:49
-chr9 130704890 . A G 3.27 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=26 PL:GT:GQ 33,12,0:1/1:72
-chr9 130708345 . G A 13.3 . DP=11;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=38;PV4=1,0.096,1,1 PL:GT:GQ 42,1,0:1/1:23
-chr9 131001601 . T A 3.98 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr9 131058539 . T A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr9 131808965 . C T 42 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37 PL:GT:GQ 75,27,0:1/1:99
-chr9 132551867 . C T 17.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ 49,9,0:1/1:63
-chr9 132685120 . A G 4.75 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ 35,9,0:1/1:63
-chr9 133175050 . A G 18.1 . DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=20 PL:GT:GQ 51,51,0:1/1:99
-chr9 133584978 . A G 99 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,25,0;MQ=45 PL:GT:GQ 212,75,0:1/1:99
-chr9 133661895 . A G 99 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=31 PL:GT:GQ 138,42,0:1/1:99
-chr9 133670376 . T C 68 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,16;MQ=39;PV4=1,1.4e-20,1,1 PL:GT:GQ 101,39,0:1/1:99
-chr9 133843777 . T C 99 . DP=9;AF1=0.5129;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,8,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 154,0,13:0/1:16
-chr9 134017265 . G C 3.27 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=13 PL:GT:GQ 33,12,0:1/1:72
-chr9 134105563 . T C 34.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=39 PL:GT:GQ 67,18,0:1/1:90
-chr9 134608906 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr9 134861929 . T A 9.49 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30 PL:GT:GQ 41,9,0:1/1:63
-chr10 796662 . A G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr10 1216716 . T A 18.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr10 1220781 . G A 21 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=18 PL:GT:GQ 54,27,0:1/1:99
-chr10 1225208 . T C 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=47 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr10 1727946 . T C 14.2 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=27 PL:GT:GQ 47,21,0:1/1:84
-chr10 5986542 . T C 83 . DP=93;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=39 PL:GT:GQ 116,30,0:1/1:99
-chr10 6436277 . G A 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr10 7704114 . C A 35 . DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,4;MQ=29;PV4=1,0.27,1,0.27 PL:GT:GQ 65,3,0:1/1:41
-chr10 10881734 . A G 9.52 . DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=42;PV4=1,0.0026,0.14,1 PL:GT:GQ 39,0,91:0/1:42
-chr10 13099383 . G A 27.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ 60,12,0:1/1:72
-chr10 15764077 . G C 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=40 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr10 18091502 . T C 47 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38 PL:GT:GQ 79,9,0:1/1:63
-chr10 19645913 . A T 15.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ 47,6,0:1/1:49
-chr10 22845062 . C T 18.1 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=18 PL:GT:GQ 51,21,0:1/1:84
-chr10 28282802 . T C 69 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,12,0;MQ=42 PL:GT:GQ 102,36,0:1/1:99
-chr10 28496872 . T G 8.44 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 39,6,0:1/1:49
-chr10 32746793 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr10 41437604 . T G 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr10 43051239 . C T 6.98 . DP=3;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=40;PV4=1,0.33,0.33,1 PL:GT:GQ 36,0,31:0/1:33
-chr10 44455192 . C T 4.41 . DP=6;AF1=0.8276;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,3;MQ=21;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 31,0,1:1/1:5
-chr10 48387336 . A G 13 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr10 51561705 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr10 51561712 . C G 39.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 71,6,0:1/1:49
-chr10 55617954 . G A 8.44 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ 39,6,0:1/1:49
-chr10 55718281 . T A 3.41 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ 32,6,0:1/1:49
-chr10 55888771 . T C 23.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ 56,12,0:1/1:72
-chr10 56025569 . C G 34.1 . DP=3;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=39;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 64,0,16:0/1:19
-chr10 57384943 . G T 84 . DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,0,13,0;MQ=26;PV4=1,0.015,1,1 PL:GT:GQ 114,0,110:0/1:99
-chr10 59873077 . T G 49 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=42 PL:GT:GQ 82,24,0:1/1:96
-chr10 61329572 . C T 15.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 47,6,0:1/1:49
-chr10 63790636 . T G 32.1 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,10,0;MQ=28;PV4=1,0.14,1,1 PL:GT:GQ 65,22,0:1/1:88
-chr10 64466048 . C G 18.2 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=28 PL:GT:GQ 51,18,0:1/1:90
-chr10 65053440 . G T 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=39 PL:GT:GQ 153,30,0:1/1:99
-chr10 65407358 . C G 84.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45 PL:GT:GQ 117,15,0:1/1:75
-chr10 65605291 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr10 66104447 . T C 99 . DP=47;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,21;MQ=34;PV4=1,1,0.15,1 PL:GT:GQ 136,0,162:0/1:99
-chr10 82160859 . G C 99 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=36 PL:GT:GQ 153,39,0:1/1:99
-chr10 82198579 . C T 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr10 87086290 . A G 4.13 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=17 PL:GT:GQ 35,27,0:1/1:99
-chr10 89550621 . T G 74 . DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,45;MQ=45 PL:GT:GQ 107,135,0:1/1:99
-chr10 92325046 . G A 42.3 . DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45 PL:GT:GQ 75,15,0:1/1:75
-chr10 94488050 . A G 5.46 . DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=43;PV4=1,0.16,1,1 PL:GT:GQ 34,0,34:0/1:34
-chr10 95024815 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr10 95466306 . G A 53 . DP=7;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=0,4,0,3;MQ=33;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 82,0,3:0/1:5
-chr10 100256777 . T G 3.83 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=23 PL:GT:GQ 34,12,0:1/1:72
-chr10 101510485 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr10 101530760 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr10 101879744 . T C 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=44 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr10 102147276 . G C 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=33 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr10 102642248 . T G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr10 107666616 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr10 108319945 . C G 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr10 109734371 . G A 12.7 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,12,0:1/1:72
-chr10 112870604 . C T 46.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=36 PL:GT:GQ 79,12,0:1/1:72
-chr10 115304673 . T C 11.3 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr10 119380588 . G A 14.2 . DP=4;AF1=0.502;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=43;PV4=1,0.18,0.32,1 PL:GT:GQ 44,0,21:0/1:24
-chr10 123063756 . C T 14.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=23 PL:GT:GQ 46,9,0:1/1:63
-chr10 128424770 . T G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr10 131229204 . T C 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr10 132420570 . G C 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr10 132528066 . C T 99 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,19,0;MQ=42 PL:GT:GQ 213,57,0:1/1:99
-chr10 132644619 . G A 19.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=23 PL:GT:GQ 52,15,0:1/1:75
-chr10 132707581 . G C 9.11 . DP=51;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=25;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 38,2,0:1/1:37
-chr10 133026892 . T C 55.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=44 PL:GT:GQ 88,18,0:1/1:90
-chr11 768033 . T C 33.5 . DP=4;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,0,1:1/1:5
-chr11 768042 . T C 33.5 . DP=6;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,0,1:1/1:5
-chr11 874568 . G C 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr11 1009210 . T C 4 . DP=70;AF1=0.6241;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,8;MQ=24;PV4=1,1,0.5,1 PL:GT:GQ 31,0,4:0/1:6
-chr11 1016692 . C T 27 . DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,38;MQ=22 PL:GT:GQ 60,114,0:1/1:99
-chr11 1034477 . A G 66 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ 98,9,0:1/1:63
-chr11 1074037 . G A 4.13 . DP=9;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=24;PV4=1,1,0.43,1 PL:GT:GQ 32,0,30:0/1:31
-chr11 1556298 . G A 11.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ 44,12,0:1/1:72
-chr11 1824777 . T C 27 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=28 PL:GT:GQ 60,30,0:1/1:99
-chr11 3395801 . C T 22 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr11 3411901 . G A 4.75 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ 35,9,0:1/1:63
-chr11 3731606 . A C 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr11 3783855 . C T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr11 3967636 . A G 4.29 . DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=24 PL:GT:GQ 35,15,0:1/1:75
-chr11 4385618 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr11 4424365 . T A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr11 5295586 . C T 3.01 . DP=52;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=33,0,10,0;MQ=29;PV4=1,0.0045,0.3,0.17 PL:GT:GQ 30,0,131:0/1:33
-chr11 6157144 . C G 45.1 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=35 PL:GT:GQ 78,21,0:1/1:84
-chr11 6352044 . C T 18 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=31 PL:GT:GQ 50,9,0:1/1:63
-chr11 6767356 . T C 9.63 . DP=3;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=29;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 38,1,0:1/1:23
-chr11 6999404 . G C 21 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=37 PL:GT:GQ 53,9,0:1/1:63
-chr11 9120930 . C G 17.6 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ 50,12,0:1/1:72
-chr11 9373125 . T C 19.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 51,6,0:1/1:49
-chr11 9585101 . C T 67 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=45 PL:GT:GQ 100,42,0:1/1:99
-chr11 10266192 . A C 14.3 . DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=27 PL:GT:GQ 47,18,0:1/1:90
-chr11 10303263 . T C 8.64 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,17;MQ=18 PL:GT:GQ 41,51,0:1/1:99
-chr11 10420170 . T C 35 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,15;MQ=28;PV4=1,0.12,1,0.4 PL:GT:GQ 68,36,0:1/1:99
-chr11 10912169 . G A 99 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=49 PL:GT:GQ 155,18,0:1/1:90
-chr11 11315826 . T G 6.29 . DP=27;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=19 PL:GT:GQ 38,18,0:1/1:90
-chr11 11603859 . A C 22 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,6;MQ=34;PV4=1,9.5e-13,0.22,1 PL:GT:GQ 52,0,115:0/1:55
-chr11 11700034 . C T 33 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=30 PL:GT:GQ 66,27,0:1/1:99
-chr11 11822758 . G A 15.1 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,3;MQ=38;PV4=1,0.18,1,1 PL:GT:GQ 45,0,88:0/1:48
-chr11 11976636 . C T 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=24 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr11 14380517 . C G 16.1 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,5,0;MQ=48;PV4=1,2.1e-05,0.13,1 PL:GT:GQ 46,0,113:0/1:49
-chr11 14419212 . A G 91.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=38 PL:GT:GQ 124,18,0:1/1:90
-chr11 14846792 . A G 55 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=19 PL:GT:GQ 88,33,0:1/1:99
-chr11 15494556 . C T 99 . DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=22,0,14,0;MQ=34;PV4=1,0.0071,1,1 PL:GT:GQ 146,0,159:0/1:99
-chr11 16262879 . A C 16.1 . DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=43;PV4=1,0.061,0.24,0.33 PL:GT:GQ 46,0,28:0/1:31
-chr11 21514947 . T C 24.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=41 PL:GT:GQ 57,12,0:1/1:72
-chr11 22532576 . C G 28 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,17;MQ=17 PL:GT:GQ 61,51,0:1/1:99
-chr11 23529238 . G T 4.29 . DP=13;AF1=0.5334;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=37;PV4=1,1,0.34,0.21 PL:GT:GQ 32,0,9:0/1:12
-chr11 24249554 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr11 24853167 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr11 33353903 . T C 24.3 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=36 PL:GT:GQ 57,15,0:1/1:75
-chr11 35126569 . T C 24.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ 57,12,0:1/1:72
-chr11 35132248 . C T 18.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr11 35155482 . T C 68 . DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=46 PL:GT:GQ 101,66,0:1/1:99
-chr11 52494088 . T C 99 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37 PL:GT:GQ 140,27,0:1/1:99
-chr11 57899943 . C G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr11 62261460 . G T 19.1 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,5;MQ=27;PV4=1,1.1e-06,1,1 PL:GT:GQ 49,0,58:0/1:51
-chr11 67456049 . C T 39.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=19 PL:GT:GQ 72,18,0:1/1:90
-chr11 68509708 . C G 3.65 . DP=9;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=0,5,0,4;MQ=17;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 30,0,2:0/1:3
-chr11 70115115 . T A 99 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=49 PL:GT:GQ 140,15,0:1/1:75
-chr11 72643951 . T C 70 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=39 PL:GT:GQ 103,66,0:1/1:99
-chr11 72647930 . G A 36 . DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=41;PV4=1,1,0.3,1 PL:GT:GQ 66,0,28:0/1:31
-chr11 73330148 . C T 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr11 81720893 . A G 5.83 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=19 PL:GT:GQ 37,12,0:1/1:72
-chr11 83813797 . A G 23.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ 56,12,0:1/1:72
-chr11 85949488 . C A 54 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=37 PL:GT:GQ 87,42,0:1/1:99
-chr11 87634829 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr11 90913093 . A T 35.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 67,6,0:1/1:49
-chr11 93793348 . G A 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=31 PL:GT:GQ 139,24,0:1/1:96
-chr11 100802294 . T C 16.6 . DP=21;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ 49,12,0:1/1:72
-chr11 107455449 . C T 8.44 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=26 PL:GT:GQ 39,6,0:1/1:49
-chr11 111344355 . A G 69.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=43 PL:GT:GQ 102,12,0:1/1:72
-chr11 111611115 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr11 113050466 . G C 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr11 114332544 . T C 3.54 . DP=17;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,5;MQ=37;PV4=1,0.32,0.13,1 PL:GT:GQ 31,0,37:0/1:33
-chr11 114332549 . G A 3.54 . DP=17;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,8;MQ=36;PV4=1,3.1e-10,0.088,1 PL:GT:GQ 31,0,127:0/1:34
-chr11 114843578 . G C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr11 115580279 . A G 99 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,15,0;MQ=48 PL:GT:GQ 190,45,0:1/1:99
-chr11 116434328 . G A 17.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 50,12,0:1/1:72
-chr11 125914161 . A G 20.8 . DP=7;AF1=0.95;CI95=0.5,1;DP4=3,0,4,0;MQ=38;PV4=1,0.074,1,1 PL:GT:GQ 49,0,0:1/1:10
-chr11 125917089 . C T 12.3 . DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,28,0,12;MQ=44;PV4=1,4.7e-25,1,1 PL:GT:GQ 42,0,167:0/1:45
-chr11 127194100 . A G 60 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=49 PL:GT:GQ 93,24,0:1/1:96
-chr12 70856 . G A 27.5 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 60,12,0:1/1:72
-chr12 153693 . T C 52.3 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=38 PL:GT:GQ 85,15,0:1/1:75
-chr12 924547 . C G 37.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 69,6,0:1/1:49
-chr12 1555916 . G A 7.18 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 39,15,0:1/1:75
-chr12 1919860 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr12 2283756 . G A 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr12 2805983 . G C 12.7 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 45,12,0:1/1:72
-chr12 6088203 . T C 72.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=37 PL:GT:GQ 105,15,0:1/1:75
-chr12 7099460 . G C 10.8 . DP=6;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=3,0,3,0;MQ=26;PV4=1,0.027,1,1 PL:GT:GQ 39,0,1:1/1:5
-chr12 7099464 . G A 13.3 . DP=6;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=28;PV4=1,0.16,1,1 PL:GT:GQ 42,1,0:1/1:23
-chr12 7198516 . T G 4.61 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
-chr12 23331895 . C T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr12 28209020 . T G 14.4 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ 47,15,0:1/1:75
-chr12 30074073 . C T 32.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 64,6,0:1/1:49
-chr12 30563452 . T C 25 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ 57,9,0:1/1:63
-chr12 30563453 . A G 25 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ 57,9,0:1/1:63
-chr12 30563464 . C A 78.8 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,5;MQ=34;PV4=1,0.29,1,1 PL:GT:GQ 110,6,0:1/1:49
-chr12 31505085 . G A 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr12 34041336 . G A 5.46 . DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=36;PV4=1,1,0.48,0.21 PL:GT:GQ 34,0,34:0/1:34
-chr12 49003648 . C G 42 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=39 PL:GT:GQ 75,24,0:1/1:96
-chr12 51280690 . G A 69 . DP=98;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,18,0;MQ=45;PV4=1,1,0.051,1 PL:GT:GQ 99,0,84:0/1:87
-chr12 69206633 . T C 17.1 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=17 PL:GT:GQ 50,33,0:1/1:99
-chr12 80417253 . T C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr12 86633033 . C T 34 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=43;PV4=1,1,0.33,1 PL:GT:GQ 64,0,31:0/1:34
-chr12 98097274 . C T 47.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=31 PL:GT:GQ 80,15,0:1/1:75
-chr12 105269319 . C T 19 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=26 PL:GT:GQ 51,9,0:1/1:63
-chr12 109053425 . G A 9.53 . DP=8;AF1=0.5012;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,6,0;MQ=25;PV4=1,1,0.19,1 PL:GT:GQ 39,0,23:0/1:26
-chr12 111904540 . A G 3.41 . DP=65;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ 32,6,0:1/1:49
-chr12 115038686 . T C 15.2 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=27 PL:GT:GQ 48,21,0:1/1:84
-chr12 115039419 . A G 4.11 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
-chr12 115103890 . G A 66 . DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,38;MQ=49 PL:GT:GQ 99,114,0:1/1:99
-chr12 115833830 . G A 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr12 116361873 . T G 6.34 . DP=5;AF1=0.7302;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 34,0,2:0/1:3
-chr12 123583527 . G A 14.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ 46,9,0:1/1:63
-chr12 124115330 . A G 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr12 125062296 . G A 41.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr12 126718106 . A G 8.76 . DP=50;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=2,0,6,0;MQ=26;PV4=1,0.33,0.37,1 PL:GT:GQ 38,0,12:0/1:15
-chr12 133348311 . G A 24 . DP=18;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=14,0,3,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 54,0,118:0/1:57
-chr12 134494475 . C T 28 . DP=18;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=8,0,10,0;MQ=18;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 57,0,3:0/1:5
-chr12 134831761 . C T 41.3 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=27 PL:GT:GQ 74,15,0:1/1:75
-chr12 134992770 . A C,T 84 . DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,26,0;MQ=29 PL:GT:GQ 117,72,114,0,44,114:1/1:99
-chr12 135261117 . G A 49.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:GT:GQ 82,18,0:1/1:90
-chr12 135261144 . A G 99 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:GT:GQ 155,18,0:1/1:90
-chr12 135460302 . G A 99 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,23,0;MQ=40 PL:GT:GQ 198,69,0:1/1:99
-chr12 135463758 . A G 83 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=26 PL:GT:GQ 116,48,0:1/1:99
-chr12 135523325 . G A 99 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=26 PL:GT:GQ 136,66,0:1/1:99
-chr12 135782401 . T C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr12 135795472 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr13 18040027 . G C 42 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=33 PL:GT:GQ 74,9,0:1/1:63
-chr13 19494625 . G T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr13 20121126 . A G 15.1 . DP=36;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=25,0,9,0;MQ=36;PV4=1,1,0.13,1 PL:GT:GQ 45,0,153:0/1:48
-chr13 21536703 . A G 9.31 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr13 23160035 . G T 3.98 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr13 23476554 . C A 6.79 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=52 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr13 26632967 . C G 32 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=34 PL:GT:GQ 65,27,0:1/1:99
-chr13 26790010 . T C 89.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=35 PL:GT:GQ 122,15,0:1/1:75
-chr13 36083571 . T C 43 . DP=84;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,37,0;MQ=16;PV4=1,1,1,0.3 PL:GT:GQ 76,99,0:1/1:99
-chr13 44432419 . C T 3.58 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=19 PL:GT:GQ 34,21,0:1/1:84
-chr13 46592359 . T C 16.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 48,6,0:1/1:49
-chr13 52764657 . A T 3.14 . DP=32;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22 PL:GT:GQ 33,15,0:1/1:75
-chr13 53084193 . C T 9.11 . DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=29;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 38,2,0:1/1:37
-chr13 57763228 . C T 45 . DP=555;AF1=1;CI95=1,1;DP4=2,0,21,0;MQ=23;PV4=1,0.00021,1,0.3 PL:GT:GQ 78,45,0:1/1:99
-chr13 73857921 . G C 31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ 63,9,0:1/1:63
-chr13 76718001 . G A 59 . DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=45;PV4=1,1,0.12,1 PL:GT:GQ 89,0,28:0/1:31
-chr13 100912695 . A T 23 . DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,16,0,6;MQ=31;PV4=1,0.029,1,0.35 PL:GT:GQ 53,0,103:0/1:56
-chr13 101332001 . G C 21 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,23,0;MQ=21 PL:GT:GQ 54,69,0:1/1:99
-chr13 102637334 . C T 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr13 102895627 . C T 63 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=48 PL:GT:GQ 96,27,0:1/1:99
-chr13 103830322 . T C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr13 112842448 . G A 39 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=27 PL:GT:GQ 72,27,0:1/1:99
-chr13 113310291 . C T 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr13 114775162 . A G 80 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=21 PL:GT:GQ 113,51,0:1/1:99
-chr13 115267482 . A G 16.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ 48,9,0:1/1:63
-chr13 116068676 . C T 3.83 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=27 PL:GT:GQ 34,12,0:1/1:72
-chr13 116455918 . A G 33 . DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,15,0;MQ=42;PV4=1,1.8e-20,0.3,1 PL:GT:GQ 63,0,146:0/1:66
-chr13 116765012 . G A 30.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 62,6,0:1/1:49
-chr13 116779773 . C T 17.1 . DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=27,0,11,0;MQ=24;PV4=1,4.5e-35,1,1 PL:GT:GQ 47,0,106:0/1:50
-chr13 116779791 . C T 57 . DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=24,0,14,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 87,0,103:0/1:90
-chr14 20159250 . C T 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr14 23510676 . T C 52 . DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=32 PL:GT:GQ 85,66,0:1/1:99
-chr14 24735256 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr14 29525577 . G A 21 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=16 PL:GT:GQ 54,27,0:1/1:99
-chr14 36186389 . C T 6.79 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=20 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr14 36186394 . A G 6.79 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=20 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr14 37440609 . A G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr14 40432807 . A G 18.6 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=23 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr14 59466268 . T C 15.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=25 PL:GT:GQ 47,9,0:1/1:63
-chr14 61368162 . G T 7.18 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=17 PL:GT:GQ 39,15,0:1/1:75
-chr14 65152922 . G A 92 . DP=33;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,18,0,15;MQ=36;PV4=1,0.059,0.35,1 PL:GT:GQ 122,0,144:0/1:99
-chr14 69749148 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=25 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr14 74877658 . C T 45 . DP=48;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,12;MQ=36;PV4=1,0.02,1,0.39 PL:GT:GQ 78,28,0:1/1:99
-chr14 75546678 . C T 19.2 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=17 PL:GT:GQ 52,18,0:1/1:90
-chr14 76439185 . T C 67.1 . DP=7;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,6;MQ=33;PV4=1,1,0.056,0.29 PL:GT:GQ 97,0,17:0/1:20
-chr14 77313295 . T A 99 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=48 PL:GT:GQ 191,30,0:1/1:99
-chr14 77673422 . G A 11.5 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=24 PL:GT:GQ 44,18,0:1/1:90
-chr14 78646125 . T C 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=40 PL:GT:GQ 153,24,0:1/1:96
-chr14 91702449 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr14 91769842 . G A 63 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=47 PL:GT:GQ 95,9,0:1/1:63
-chr14 91775899 . C G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr14 91775924 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr14 93482918 . A C 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr14 93665819 . C T 75 . DP=7;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,4;MQ=42;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 105,0,31:0/1:34
-chr14 95422276 . A G 55.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=45 PL:GT:GQ 88,21,0:1/1:84
-chr14 95731986 . C T 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr14 96045464 . A G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr14 97172020 . C T 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=51 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr14 100515480 . A G 6.98 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=45;PV4=1,0.14,0.085,0.33 PL:GT:GQ 36,0,30:0/1:32
-chr14 100770214 . A T 8.69 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=16 PL:GT:GQ 41,21,0:1/1:84
-chr14 101258303 . G A 82 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,15,0;MQ=26 PL:GT:GQ 115,45,0:1/1:99
-chr14 101701492 . C G 66 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=49 PL:GT:GQ 99,30,0:1/1:99
-chr14 102113772 . T C 3.98 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=30 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr14 102751431 . A C 36.5 . DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 66,2,0:1/1:37
-chr14 103708033 . A G 99 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=27 PL:GT:GQ 141,36,0:1/1:99
-chr14 104744582 . G A 3.52 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ 33,9,0:1/1:63
-chr14 105989100 . C T 3.14 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 33,15,0:1/1:75
-chr14 105989162 . C T 3.65 . DP=12;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,6;MQ=15;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 30,0,2:0/1:3
-chr14 106234810 . G A 25.3 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=39 PL:GT:GQ 58,15,0:1/1:75
-chr14 106995572 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr14 107283057 . T C 5.5 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=20 PL:GT:GQ 37,21,0:1/1:84
-chr14 107285319 . T C 33 . DP=36;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,35;MQ=22 PL:GT:GQ 66,105,0:1/1:99
-chr14 107640449 . A G 11.8 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=36 PL:GT:GQ 44,12,0:1/1:72
-chr15 20082092 . T G 18.3 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=24 PL:GT:GQ 51,15,0:1/1:75
-chr15 22955884 . T C 67 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,12,0;MQ=48 PL:GT:GQ 100,36,0:1/1:99
-chr15 22971987 . A G 5.29 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=22 PL:GT:GQ 35,6,0:1/1:49
-chr15 23233324 . C A 47 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=31 PL:GT:GQ 80,42,0:1/1:99
-chr15 25175286 . C T 36.5 . DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=42;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 66,2,0:1/1:37
-chr15 25385709 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr15 27372396 . A G 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=40 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr15 35998093 . C T 9.53 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=17 PL:GT:GQ 42,27,0:1/1:99
-chr15 36716538 . C G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr15 36793360 . G T 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr15 53783097 . A G 10.5 . DP=31;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=16 PL:GT:GQ 43,21,0:1/1:84
-chr15 54180175 . C T 10.4 . DP=7;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=27;PV4=1,1.2e-05,1,1 PL:GT:GQ 40,0,32:0/1:34
-chr15 54939306 . C T 99 . DP=34;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,18,0,16;MQ=49;PV4=1,1,0.18,1 PL:GT:GQ 172,0,181:0/1:99
-chr15 59377916 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr15 59685961 . G C 68 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=36 PL:GT:GQ 101,33,0:1/1:99
-chr15 60306384 . A G 18.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr15 60345642 . G C 14.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr15 60367387 . G A 13.2 . DP=6;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,3,0;MQ=34;PV4=1,0.098,0.24,1 PL:GT:GQ 43,0,35:0/1:37
-chr15 60367446 . C T 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr15 61763755 . G A 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=45 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr15 61831362 . C G 11.3 . DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,3;MQ=30;PV4=1,0.00077,0.47,1 PL:GT:GQ 41,0,42:0/1:41
-chr15 63978880 . G C 60 . DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 90,3,0:1/1:41
-chr15 64342445 . A G 12.2 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=18 PL:GT:GQ 44,9,0:1/1:63
-chr15 65424859 . T C 11.3 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=21 PL:GT:GQ 44,30,0:1/1:99
-chr15 65603698 . C T 60 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 92,9,0:1/1:63
-chr15 67005078 . G A 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr15 71133512 . G C 22.3 . DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=25 PL:GT:GQ 55,15,0:1/1:75
-chr15 72619009 . A G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=48 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr15 73272688 . C T 70.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=39 PL:GT:GQ 103,15,0:1/1:75
-chr15 73699335 . T A 99 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=45 PL:GT:GQ 175,27,0:1/1:99
-chr15 74513352 . C T 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=37 PL:GT:GQ 139,30,0:1/1:99
-chr15 75540536 . G A 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr15 75822537 . C A 17.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=23 PL:GT:GQ 50,15,0:1/1:75
-chr15 78554005 . T C 12 . DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ 43,6,0:1/1:49
-chr15 80089369 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=28 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr15 83089149 . C G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr15 86839307 . T C 90.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43 PL:GT:GQ 123,15,0:1/1:75
-chr15 89836258 . T C 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=39 PL:GT:GQ 141,24,0:1/1:96
-chr15 89837706 . G A 4.13 . DP=8;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,4;MQ=30;PV4=1,1,0.25,1 PL:GT:GQ 32,0,59:0/1:35
-chr15 89857648 . T C 99 . DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,8,0;MQ=40;PV4=1,1,0.3,1 PL:GT:GQ 133,0,130:0/1:99
-chr15 89864228 . A C 32 . DP=4;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=42;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,0,31:0/1:34
-chr15 91261235 . G A 7.8 . DP=4;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=44;PV4=1,1,0.32,1 PL:GT:GQ 37,0,30:0/1:32
-chr16 256990 . A C 10.4 . DP=16;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=23;PV4=1,0.34,1,1 PL:GT:GQ 40,0,25:0/1:28
-chr16 260794 . T C 3.01 . DP=19;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,2,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 30,0,32:0/1:31
-chr16 419905 . A G 7.9 . DP=5;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=22;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 36,1,0:1/1:23
-chr16 824086 . T C 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr16 1085063 . C T 52 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,6,0;MQ=42;PV4=1,1,0.014,1 PL:GT:GQ 82,0,128:0/1:85
-chr16 1221305 . T C 54 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,3;MQ=40;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 84,0,60:0/1:63
-chr16 1411728 . A G 32.3 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=35 PL:GT:GQ 65,15,0:1/1:75
-chr16 1443197 . C G 64 . DP=26;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,25,0;MQ=36 PL:GT:GQ 97,75,0:1/1:99
-chr16 1478746 . A T 32 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=28 PL:GT:GQ 65,24,0:1/1:96
-chr16 1514438 . A C 45 . DP=49;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,48,0;MQ=26 PL:GT:GQ 78,144,0:1/1:99
-chr16 1601989 . T C 99 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=29 PL:GT:GQ 133,39,0:1/1:99
-chr16 2043883 . C T 30 . DP=33;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,33;MQ=14 PL:GT:GQ 63,99,0:1/1:99
-chr16 2137470 . A C 39 . DP=38;AF1=0.5016;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,6,0;MQ=34;PV4=1,0.02,1,1 PL:GT:GQ 69,0,22:0/1:25
-chr16 2537260 . A G 99 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=40 PL:GT:GQ 177,33,0:1/1:99
-chr16 2564737 . T C 99 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,22;MQ=41 PL:GT:GQ 199,66,0:1/1:99
-chr16 2612605 . A T 62.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=28 PL:GT:GQ 95,15,0:1/1:75
-chr16 2704518 . G A 41 . DP=48;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,17,0,12;MQ=48;PV4=1,1.9e-23,0.24,0.034 PL:GT:GQ 71,0,175:0/1:74
-chr16 3274307 . G T 68 . DP=39;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,30,0,8;MQ=37;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 98,0,138:0/1:99
-chr16 5467292 . G C 37.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 69,6,0:1/1:49
-chr16 10079145 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr16 11483702 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr16 12038227 . A T 23 . DP=47;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,22,0,23;MQ=32;PV4=1,4.4e-66,0.47,0.028 PL:GT:GQ 53,0,135:0/1:56
-chr16 21336880 . G C 55 . DP=35;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,12,0,19;MQ=47;PV4=1,5.6e-21,1,1 PL:GT:GQ 85,0,121:0/1:88
-chr16 21980241 . C T 16.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ 48,9,0:1/1:63
-chr16 23275383 . C G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr16 27546495 . G T 25 . DP=35;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=43 PL:GT:GQ 57,9,0:1/1:63
-chr16 27700399 . A T 17.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=17 PL:GT:GQ 50,12,0:1/1:72
-chr16 28021935 . A G 18.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 51,15,0:1/1:75
-chr16 29070016 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr16 29478618 . C T 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr16 29718140 . C T 46.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ 79,15,0:1/1:75
-chr16 30700759 . T C 17.1 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,14;MQ=14 PL:GT:GQ 50,42,0:1/1:99
-chr16 35139103 . A G 46.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=37 PL:GT:GQ 79,12,0:1/1:72
-chr16 35473348 . G A 3.83 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 34,12,0:1/1:72
-chr16 36213667 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr16 36705528 . G A 14.4 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=32 PL:GT:GQ 47,15,0:1/1:75
-chr16 43831353 . C T 69.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=42 PL:GT:GQ 102,12,0:1/1:72
-chr16 44715166 . A C 25 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=32 PL:GT:GQ 58,24,0:1/1:96
-chr16 44957661 . T C 7.03 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=18 PL:GT:GQ 39,21,0:1/1:84
-chr16 44958698 . C T 42.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=49 PL:GT:GQ 75,15,0:1/1:75
-chr16 44959163 . T C 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr16 45167959 . C T 4.45 . DP=16;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=24 PL:GT:GQ 35,12,0:1/1:72
-chr16 50254956 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr16 52383122 . A C 46.5 . DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=42 PL:GT:GQ 79,12,0:1/1:72
-chr16 55978159 . C T 10.7 . DP=20;AF1=0.5336;CI95=0.5,1;DP4=2,0,5,0;MQ=35;PV4=1,0.038,1,0.059 PL:GT:GQ 40,0,9:0/1:12
-chr16 61358878 . T A 15.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ 47,6,0:1/1:49
-chr16 61392487 . G A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr16 61621603 . G T 6.59 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=22 PL:GT:GQ 38,12,0:1/1:72
-chr16 69120890 . G C 51.3 . DP=36;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=42 PL:GT:GQ 84,15,0:1/1:75
-chr16 70778219 . A G 21.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=39 PL:GT:GQ 53,6,0:1/1:49
-chr16 71899519 . T C 40 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=33 PL:GT:GQ 73,33,0:1/1:99
-chr16 72079251 . A G 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr16 72093003 . G C 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr16 72672428 . A G 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr16 72864515 . A G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr16 72890560 . G A 47.1 . DP=10;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,7;MQ=49;PV4=1,0.0019,0.0033,1 PL:GT:GQ 77,0,16:0/1:19
-chr16 73048929 . A G 6.29 . DP=4;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=27;PV4=1,1,1,0.33 PL:GT:GQ 34,1,0:1/1:23
-chr16 73177179 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr16 73191468 . C T 69.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=40 PL:GT:GQ 102,12,0:1/1:72
-chr16 73367439 . A C 7.41 . DP=36;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,13;MQ=26;PV4=1,1,0.027,1 PL:GT:GQ 37,4,0:1/1:45
-chr16 74259316 . C T 89.5 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr16 75271450 . C G 6.99 . DP=15;AF1=0.5015;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=44;PV4=1,0.065,0.31,1 PL:GT:GQ 36,0,22:0/1:25
-chr16 76199870 . G A 26 . DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,6,0;MQ=47;PV4=1,1.2e-06,0.32,1 PL:GT:GQ 56,0,141:0/1:59
-chr16 77723692 . A G 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr17 165875 . G A 40.8 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42 PL:GT:GQ 72,6,0:1/1:49
-chr17 1443809 . C G 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr17 1618253 . C T 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=39 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr17 2815309 . T G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr17 3537486 . T G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr17 3734367 . C A 23.5 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=36 PL:GT:GQ 56,12,0:1/1:72
-chr17 5634764 . T C 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr17 6408090 . C G 3.54 . DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,2,0;MQ=40;PV4=1,1,0.36,1 PL:GT:GQ 31,0,66:0/1:34
-chr17 7089723 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr17 8731503 . G C 11.1 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 42,6,0:1/1:49
-chr17 9282935 . T C,G 24.5 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=40 PL:GT:GQ 57,12,61,0,3,61:1/1:72
-chr17 17284831 . T C 29 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ 61,9,0:1/1:63
-chr17 18439515 . G A 4.11 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=25 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
-chr17 18602146 . C T 4.76 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=16 PL:GT:GQ 36,33,0:1/1:99
-chr17 19427888 . C T 57 . DP=104;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=45,0,29,0;MQ=39;PV4=1,2.2e-12,1,1 PL:GT:GQ 87,0,131:0/1:90
-chr17 19604159 . T C 9.31 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr17 19610366 . C T 13 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr17 20484706 . C G 51 . DP=35;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,11,0,21;MQ=21;PV4=1,0.39,0.49,1 PL:GT:GQ 81,0,36:0/1:39
-chr17 20555720 . A G 26.3 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=28 PL:GT:GQ 59,15,0:1/1:75
-chr17 24328984 . A C 15.4 . DP=34;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=25 PL:GT:GQ 48,15,0:1/1:75
-chr17 26237090 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr17 28394766 . C A 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr17 31218277 . A G 3.62 . DP=38;AF1=0.5161;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=38;PV4=1,0.26,1,1 PL:GT:GQ 31,0,12:0/1:15
-chr17 31254021 . C T 15.1 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=35 PL:GT:GQ 47,9,0:1/1:63
-chr17 32516798 . G A 37.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 69,6,0:1/1:49
-chr17 32600253 . A G 16.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ 49,12,0:1/1:72
-chr17 34255214 . G C 19.2 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=21 PL:GT:GQ 52,18,0:1/1:90
-chr17 34365900 . T C 93.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=38 PL:GT:GQ 126,18,0:1/1:90
-chr17 35380386 . A T 6.79 . DP=44;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr17 41993344 . C T 64 . DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,41;MQ=16 PL:GT:GQ 97,123,0:1/1:99
-chr17 42128201 . A G 4.13 . DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=52;PV4=1,0.0041,1,1 PL:GT:GQ 32,0,62:0/1:35
-chr17 42984490 . C A 56 . DP=33;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,12,0;MQ=42;PV4=1,0.004,1,1 PL:GT:GQ 86,0,34:0/1:37
-chr17 43419457 . G A 99 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,14;MQ=45 PL:GT:GQ 185,42,0:1/1:99
-chr17 43421225 . A G 65.1 . DP=31;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,17;MQ=43;PV4=1,0.004,1,1 PL:GT:GQ 98,18,0:1/1:90
-chr17 45206897 . G A 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=47 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr17 45381302 . T C 18.6 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr17 45530812 . C A 3.54 . DP=6;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=40;PV4=1,1,0.37,1 PL:GT:GQ 31,0,58:0/1:34
-chr17 50242633 . G A 44 . DP=42;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,13;MQ=32;PV4=1,0.084,0.14,1 PL:GT:GQ 74,0,154:0/1:77
-chr17 51275317 . G A 14.9 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr17 52325530 . C T 29 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,18;MQ=24 PL:GT:GQ 62,54,0:1/1:99
-chr17 52411748 . T G 18.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr17 53190746 . C G 62.1 . DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=40 PL:GT:GQ 95,18,0:1/1:90
-chr17 58289916 . T C 18.2 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=22 PL:GT:GQ 51,18,0:1/1:90
-chr17 59796875 . C T 42 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=35 PL:GT:GQ 74,9,0:1/1:63
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.0
-##fileDate=2011-10-11
-##source=Platypus_Version_0.1.5
-##INFO=<ID=func,Number=1,Type=String,Description="Functional category: exnoic, intergenic etc">
-##INFO=<ID=gene,Number=2,Type=String,Description="RefSeq gene name">
-##INFO=<ID=exon_func,Number=1,Type=String,Description="Exonic function of the variant">
-##INFO=<ID=AAchange,Number=1,Type=String,Description="Amino Acid change">
-##INFO=<ID=cons46,Number=1,Type=String,Description="UCSC 46 species conservation score">
-##INFO=<ID=segdup,Number=1,Type=Float,Description="UCSC segment duplication score">
-##INFO=<ID=1000g,Number=1,Type=Float,Description="1000 genomes allelic frequency">
-##INFO=<ID=dbsnp,Number=1,Type=String,Description="dbSNP ID">
-##INFO=<ID=sift,Number=1,Type=Float,Description="SIFT score">
-##INFO=<ID=pp2,Number=1,Type=Float,Description="PolyPhen2 score">
-##INFO=<ID=phylop,Number=1,Type=Float,Description="Phylop score">
-##INFO=<ID=mutT,Number=1,Type=Float,Description="Mutation Taster score">
-##INFO=<ID=LRT,Number=1,Type=Float,Description="LRT score">
-##INFO=<ID=FR,Number=0,Type=Float,Description="Estimated population frequency">
-##INFO=<ID=RPV,Number=0,Type=Float,Description="Median minimum base quality for bases around variant">
-##INFO=<ID=RPV,Number=0,Type=Float,Description="Reverse strand p-value">
-##INFO=<ID=TCR,Number=0,Type=Integer,Description="Total reverse strand coverage at this locus">
-##INFO=<ID=HP,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolmer run length">
-##INFO=<ID=ABPV,Number=0,Type=Float,Description="Allele-bias p-value. Testing for low variant coverage">
-##INFO=<ID=TR,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of reads containing this variant">
-##INFO=<ID=PP,Number=0,Type=Float,Description="Posterior probability (phred scaled) that this variant segregates">
-##INFO=<ID=NF,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of forward reads containing this variant">
-##INFO=<ID=SC,Number=1,Type=String,Description="Genomic sequence 10 bases either side of variant position">
-##INFO=<ID=FPV,Number=0,Type=Float,Description="Forward strand p-value">
-##INFO=<ID=TCF,Number=0,Type=Integer,Description="Total forward strand coverage at this locus">
-##INFO=<ID=NR,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of reverse reads containing this variant">
-##INFO=<ID=RMP,Number=0,Type=Float,Description="RMS Position in reads of Variant">
-##INFO=<ID=TC,Number=0,Type=Integer,Description="Total coverage at this locus">
-##FILTER=<ID=sb,Description="Variant fails strand-bias filter">
-##FILTER=<ID=ab,Description="Variant fails allele-bias filter">
-##FILTER=<ID=badReads,Description="Variant supported only by reads with low quality bases close to variant position, and not present on both strands.">
-##FILTER=<ID=hp10,Description="Flanking sequence contains homopolymer of length 10 or greater">
-##FORMAT=<ID=GL,Number=.,Type=Float,Description="Genotype log-likelihoods (log10) for AA,AB and BB genotypes, where A = ref and B = variant. Only applicable for bi-allelic sites">
-##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Unphased genotypes">
-##FORMAT=<ID=NR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reads covering variant in this sample">
-##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype quality, as Phred score">
-##FORMAT=<ID=GT:GL:GQ:NR,Number=.,Type=String,Description="(Undefined tag)">
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT WTCHG_27173_05.bam WTCHG_27173_04.bam
-chr1 1451489 . T C 103 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=7.56e-01;FR=0.2501;HP=7;MMLQ=30;NF=2;NR=18;PP=103;RMP=57.54;RPV=1.00e-00;SC=CCGGTGTGGGTGGGGAGGCCG;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=20;func=intronic;gene=ATAD3A;segdup=0.91;1000g=0.36;dbsnp=rs76717221 GT:GL:GQ:NR 0/0:-43.28,-51.0,-125.34:35:18 1/0:-135.58,-103.29,-138.87:100:24
-chr1 1451490 . G A 73 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.29e-01;FR=0.2501;HP=3;MMLQ=30;NF=3;NR=16;PP=73;RMP=58.79;RPV=9.98e-01;SC=CGGTGTGGGTGGGGAGGCCGG;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=19;func=intronic;gene=ATAD3A;segdup=0.91;1000g=0.33;dbsnp=rs9439460 GT:GL:GQ:NR 0/0:-43.28,-50.99,-127.79:35:18 0/1:-135.58,-110.35,-146.87:100:24
-chr1 12939904 . A C 109 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=7.66e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=37;NF=22;NR=1;PP=109;RMP=45.66;RPV=4.46e-06;SC=ATTGTGAGGAACTTTAACGAG;TC=132;TCF=79;TCR=53;TR=23 GT:GL:GQ:NR 0/0:-40.31,-50.48,-301.89:45:53 0/1:-121.0,-87.39,-396.61:100:79
-chr1 16902943 . T C 50 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=2.90e-01;FR=0.2506;HP=2;MMLQ=34;NF=30;NR=18;PP=50;RMP=46.42;RPV=8.84e-01;SC=GGGTCAGCTCTCGTTCCTGAG;TC=191;TCF=133;TCR=58;TR=48 GT:GL:GQ:NR 0/0:-337.26,-342.92,-618.53:26:93 0/1:-428.71,-408.75,-668.15:84:98
-chr1 16902982 . G T 41 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=5.26e-02;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=36;NF=29;NR=10;PP=41;RMP=55.68;RPV=1.90e-02;SC=ATTGCCTAAGGTGAGACGGTA;TC=223;TCF=152;TCR=71;TR=39 GT:GL:GQ:NR 0/0:-282.16,-293.75,-760.18:52:108 0/1:-308.83,-290.99,-786.16:75:115
-chr1 16918180 . C T 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=7.60e-05;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=37;NF=8;NR=11;PP=200;RMP=57.84;RPV=6.15e-01;SC=TACTTTGGTACCTCTGTCTTC;TC=134;TCF=91;TCR=43;TR=19 GT:GL:GQ:NR 0/0:-48.3,-68.7,-289.28:90:47 0/1:-194.28,-132.13,-452.09:100:87
-chr1 17083652 . C T 200 PASS ABPV=3.06e-02;FPV=6.38e-13;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=36;NF=29;NR=3;PP=200;RMP=38.16;RPV=2.05e-02;SC=AAATCTCAACCTTGAGTACAA;TC=350;TCF=317;TCR=33;TR=32;func=ncRNA;gene=MST1P9;cons46=632 Name=lod=492;segdup=0.99;1000g=0.37;dbsnp=rs113710576 GT:GL:GQ:NR 0/0:-547.14,-559.85,-1017.76:56:159 0/1:-723.35,-656.42,-1167.76:100:191
-chr1 17083776 . C A 79 PASS ABPV=1.08e-01;FPV=7.38e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=35;NF=1;NR=22;PP=79;RMP=76.99;RPV=1.13e-09;SC=CACAGAGACACGCGTGAAGAC;TC=238;TCF=4;TCR=234;TR=23;func=ncRNA;gene=MST1P9;cons46=632 Name=lod=492;segdup=0.99;1000g=0.20;dbsnp=rs56318124 GT:GL:GQ:NR 0/0:-442.45,-455.85,-790.66:59:121 0/1:-451.84,-425.21,-717.41:100:117
-chr1 17575714 . G A 59 PASS ABPV=2.52e-01;FPV=3.10e-02;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=31;NF=1;NR=4;PP=59;RMP=43.35;RPV=1.94e-02;SC=GACCCTCGTGGACATTTATGG;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=5 GT:GL:GQ:NR 0/0:-14.49,-33.87,-234.95:85:32 0/1:-39.36,-17.32,-168.9:93:26
-chr1 21751228 . T TCGCGCCCGGC 66 PASS ABPV=3.86e-06;FPV=8.03e-37;FR=0.2500;HP=4;NF=1;NR=1;PP=66;RMP=15.56;RPV=1.98e-06;SC=CTCAAATGAGTAAAAGGCACT;TC=133;TCF=77;TCR=56;TR=2 GT:GL:GQ:NR 0/0:-178.34,-190.57,-398.5:54:72 0/1:-308.3,-271.14,-540.05:100:98
-chr1 21755539 . C A 27 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.84e-01;FR=0.2503;HP=1;MMLQ=31;NF=2;NR=1;PP=27;RMP=65.83;RPV=4.98e-02;SC=GGCCAACAACCGCCAGGTGCG;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=3;func=intergenic;gene=ECE1(dist=83505) NBPF3(dist=11092);cons46=807 Name=lod=2532;segdup=0.99;1000g=0.80;dbsnp=rs3855556 GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-6.22,-62.68:28:10 1/0:-21.51,-6.92,-52.98:61:10
-chr1 40798730 . A AT 59 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=6.06e-01;FR=0.2504;HP=10;NF=7;NR=1;PP=59;RMP=50.29;RPV=7.38e-01;SC=GAAGTCTTCTATTTTTTTTTA;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=8;func=intergenic;gene=COL9A2(dist=15791) SMAP2(dist=40648);dbsnp=rs34372767 GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-6.13,-39.37:28:12 0/1:-35.97,-10.49,-31.53:98:16
-chr1 142803580 . TA T 145 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=6.35e-02;FR=0.2500;HP=6;NF=1;NR=11;PP=145;RMP=65.89;RPV=8.29e-02;SC=TTCATAGATTTAAAAAATTAT;TC=81;TCF=16;TCR=65;TR=12 GT:GL:GQ:NR 0/0:-39.18,-49.93,-242.54:48:33 1/0:-80.12,-35.74,-249.72:100:48
-chr1 144854799 . C T 50 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.37e-01;FR=0.2504;HP=1;MMLQ=34;NF=1;NR=19;PP=50;RMP=60.89;RPV=9.86e-01;SC=GCCTCGGATACCTCCAGCTGA;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=20;func=intronic;gene=PDE4DIP;segdup=0.96;dbsnp=rs5004097 GT:GL:GQ:NR 0/0:-89.24,-95.22,-205.12:27:25 0/1:-177.25,-157.18,-246.67:85:27
-chr1 145116027 . T C 127 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e+00;FR=0.2501;HP=2;MMLQ=34;NF=0;NR=7;PP=127;RMP=54.07;RPV=5.14e-01;SC=AAAAGAGATGTCCTGAAAATG;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=7;func=UTR3;gene=SEC22B;cons46=340 Name=lod=32;1000g=0.45;dbsnp=rs7550440 GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-7.61,-92.94:34:11 0/1:-56.84,-19.14,-106.99:100:19
-chr1 146554532 . C T 57 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=5.18e-01;FR=0.2501;HP=12;MMLQ=31;NF=4;NR=5;PP=57;RMP=66.19;RPV=4.68e-01;SC=CTTCTTCTTTCTTTTTTTTTA;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=9;func=intergenic;gene=LOC728989(dist=39933) PRKAB2(dist=72153);segdup=0.93;dbsnp=rs9662613 GT:GL:GQ:NR 0/0:-13.82,-21.42,-95.53:34:13 0/1:-131.76,-110.18,-223.87:91:28
-chr1 148344564 . T C 34 PASS ABPV=3.69e-01;FPV=1.16e-03;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=36;NF=24;NR=1;PP=34;RMP=22.65;RPV=1.98e-06;SC=TTCGTTCTTATTTCTCCCCGC;TC=218;TCF=162;TCR=56;TR=25 GT:GL:GQ:NR 0/0:-210.1,-224.84,-651.44:65:104 0/1:-232.74,-216.41,-586.14:69:114
-chr1 148853862 . G T 37 PASS ABPV=3.79e-01;FPV=1.94e-02;FR=0.2500;HP=3;MMLQ=31;NF=6;NR=2;PP=37;RMP=50.34;RPV=2.58e-02;SC=CGCTCCTGGAGCCCAGCCCGG;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=8 GT:GL:GQ:NR 0/0:-247.75,-257.0,-317.61:41:35 1/0:-179.5,-162.62,-280.47:71:41
-chr1 148854004 . C T 32 PASS ABPV=1.83e-01;FPV=3.17e-02;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=34;NF=0;NR=3;PP=32;RMP=93.74;RPV=2.52e-02;SC=GCCCGCACTGCTGCAGCGCCC;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=3 GT:GL:GQ:NR 0/0:-75.02,-87.66,-197.34:56:26 1/0:-55.07,-39.25,-94.0:66:18
-chr1 152187606 . G A 200 PASS ABPV=3.64e-01;FPV=4.08e-07;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=32;NF=7;NR=16;PP=200;RMP=30.4;RPV=4.89e-02;SC=GAAGACTGACGGGAGCCAGAC;TC=202;TCF=109;TCR=93;TR=23;func=exonic;gene=HRNR;exon_func=nonsynonymous SNV;AAchange=NM_001009931:c.C6499T:p.R2167C;segdup=0.98;1000g=0.05;sift=0.2;pp2=0.269490;phylop=0.009549;mutT=0.062064;LRT=0.589002 GT:GL:GQ:NR 0/0:-190.82,-206.2,-650.62:68:98 0/1:-306.73,-239.37,-605.74:100:104
-chr1 152281007 . A G 38 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=2.01e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=31;NF=37;NR=62;PP=38;RMP=56.83;RPV=9.75e-01;SC=GCCTGATCATAATGGGATCCT;TC=370;TCF=169;TCR=201;TR=99 GT:GL:GQ:NR 0/0:-830.31,-842.03,-1695.93:52:178 0/1:-1104.87,-1087.65,-1851.72:72:192
-chr1 152281008 . A G 56 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=2.26e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=31;NF=37;NR=62;PP=56;RMP=57.69;RPV=9.75e-01;SC=CCTGATCATAATGGGATCCTT;TC=368;TCF=167;TCR=201;TR=99 GT:GL:GQ:NR 0/0:-836.29,-850.28,-1704.3:62:178 1/0:-1097.96,-1076.67,-1811.19:90:190
-chr1 152281466 . C T 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=3.99e-04;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=33;NF=26;NR=66;PP=200;RMP=66.62;RPV=7.23e-01;SC=TGCCCGTGACCGGCTCTGTCT;TC=430;TCF=180;TCR=250;TR=92 GT:GL:GQ:NR 0/0:-912.94,-966.99,-1954.85:100:223 1/0:-939.3,-872.22,-1720.42:100:207
-chr1 168549565 . T C 28 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e+00;FR=0.2504;HP=2;MMLQ=37;NF=0;NR=8;PP=28;RMP=72.28;RPV=1.34e-01;SC=TCCTTATCAATCATGTCTTTC;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=8 GT:GL:GQ:NR 0/0:-27.57,-33.72,-167.32:28:21 1/0:-34.62,-19.62,-182.0:63:26
-chr1 236647542 . G T 46 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.99e-01;FR=0.2500;HP=3;MMLQ=34;NF=16;NR=40;PP=46;RMP=62.31;RPV=1.00e-00;SC=GTGCAAGCTGGCCCAGGCCAA;TC=104;TCF=32;TCR=72;TR=56 GT:GL:GQ:NR 0/0:-318.17,-328.23,-521.3:45:54 1/0:-498.22,-479.17,-572.27:80:50
-chr1 236647562 . T C 73 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.95e-01;FR=0.2503;HP=2;MMLQ=37;NF=11;NR=36;PP=73;RMP=64.25;RPV=1.00e-00;SC=ATGGTTGGTGTGTCATGGTGC;TC=85;TCF=23;TCR=62;TR=47 GT:GL:GQ:NR 0/0:-240.39,-246.81,-405.51:29:42 0/1:-421.95,-396.59,-483.66:100:43
-chr1 236700807 . T A 130 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=5.12e-01;FR=0.2502;HP=2;MMLQ=33;NF=8;NR=7;PP=130;RMP=47.87;RPV=8.70e-01;SC=GTAATCCCGTTTGTTGGCACC;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=15;func=exonic;gene=LGALS8;exon_func=nonsynonymous SNV;AAchange=NM_201544:c.T56A:p.F19Y;cons46=463 Name=lod=102;1000g=0.62;dbsnp=rs2737713;pp2=0.0;phylop=0.983932;mutT=4.6E-5;LRT=0.999982 GT:GL:GQ:NR 0/0:-41.35,-48.14,-183.02:31:21 0/1:-204.57,-166.19,-295.14:100:34
-chr1 236700823 . T C 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=6.24e-01;FR=0.2504;HP=2;MMLQ=32;NF=9;NR=8;PP=200;RMP=58.62;RPV=8.49e-01;SC=GCACCATTCCTGATCAGCTGG;TC=60;TCF=35;TCR=25;TR=17;func=exonic;gene=LGALS8;exon_func=synonymous SNV;AAchange=NM_201544:c.T72C:p.P24P;cons46=463 Name=lod=102;1000g=0.61;dbsnp=rs1041934 GT:GL:GQ:NR 0/0:-41.35,-47.43,-173.43:28:22 1/0:-232.08,-183.12,-325.41:100:38
-chr1 241663902 . TGA T 37 PASS ABPV=2.57e-03;FPV=3.07e-05;FR=0.2507;HP=2;NF=0;NR=3;PP=37;RMP=44.45;RPV=2.39e-06;SC=TTTGAGTGAGTGAGAGAGAGA;TC=90;TCF=18;TCR=72;TR=3;func=intronic;gene=FH GT:GL:GQ:NR 0/0:-115.58,-120.99,-206.17:25:29 1/0:-208.1,-188.38,-347.52:83:62
-chr10 52420020 . G A 135 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=2.24e-01;FR=0.2502;HP=2;MMLQ=35;NF=3;NR=3;PP=135;RMP=58.04;RPV=7.75e-01;SC=GAGAACTTCCGGCTGCAGTAC;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=6 GT:GL:GQ:NR 0/0:-65.01,-71.52,-138.01:30:16 0/1:-83.86,-44.38,-74.93:100:14
-chr10 118380701 . G A 77 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=5.15e-01;FR=0.2503;HP=3;MMLQ=32;NF=5;NR=0;PP=77;RMP=22.32;RPV=5.62e-01;SC=CCGGGTTGCGGGGCGTCTGTT;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=5 GT:GL:GQ:NR 0/0:-4.14,-10.38,-77.71:28:10 0/1:-51.41,-25.11,-83.53:100:14
-chr11 1651169 . T C 84 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.98e-01;FR=0.2502;HP=2;MMLQ=33;NF=8;NR=26;PP=84;RMP=71.99;RPV=1.00e-00;SC=GCTGTGGCTCTGGCTGTGGGG;TC=71;TCF=14;TCR=57;TR=34;func=exonic;gene=KRTAP5-5;exon_func=synonymous SNV;AAchange=NM_001001480:c.T99C:p.S33S;1000g=0.29;dbsnp=rs71454095 GT:GL:GQ:NR 0/0:-199.38,-206.33,-365.55:31:38 0/1:-226.68,-198.86,-282.14:100:33
-chr11 3431576 . G A 33 PASS ABPV=4.46e-01;FPV=4.99e-05;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=30;NF=13;NR=10;PP=33;RMP=62.67;RPV=1.90e-02;SC=TCGTGTGTGAGTCCTACAGTG;TC=194;TCF=123;TCR=71;TR=23 GT:GL:GQ:NR 0/0:-71.93,-106.62,-693.75:100:102 1/0:-110.6,-94.58,-543.82:67:92
-chr11 43918703 . C CTTTTCATATTAT 36 PASS ABPV=4.61e-02;FPV=1.12e-04;FR=0.2500;HP=3;NF=2;NR=0;PP=36;RMP=5.0;RPV=1.00e+00;SC=CTGACAGTGGCTTTATATATA;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=2 GT:GL:GQ:NR 0/0:-14.5,-34.6,-394.96:89:42 1/0:-47.66,-15.24,-223.69:100:36
-chr11 48366812 . A C 48 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.80e-01;FR=0.2502;HP=1;MMLQ=35;NF=16;NR=2;PP=48;RMP=45.69;RPV=1.00e+00;SC=AGATAATTGAATGTCCCAAGT;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=18 GT:GL:GQ:NR 0/0:-92.79,-99.69,-183.18:31:18 0/1:-133.87,-114.4,-228.26:82:26
-chr11 48387506 . A G 48 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=6.15e-01;FR=0.2500;HP=3;MMLQ=34;NF=28;NR=52;PP=48;RMP=59.69;RPV=1.00e-00;SC=AAATCCCCCGACCCATGCCAT;TC=227;TCF=109;TCR=118;TR=80;func=intergenic;gene=OR4C45(dist=13507) OR4A47(dist=122839);dbsnp=rs72898882;sift=0.42 GT:GL:GQ:NR 0/0:-665.75,-691.04,-1124.95:100:117 0/1:-697.01,-677.56,-1037.3:82:110
-chr11 56143357 . G A 91 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.70e-04;FR=0.2500;HP=3;MMLQ=36;NF=7;NR=60;PP=91;RMP=66.63;RPV=1.00e-00;SC=GGAATTTCTTGTACAAACAAA;TC=221;TCF=72;TCR=149;TR=67;func=exonic;gene=OR8U1 OR8U8;exon_func=synonymous SNV;AAchange=NM_001005204:c.G258A:p.L86L;dbsnp=rs76949582 GT:GL:GQ:NR 0/0:-538.52,-560.54,-1080.28:97:104 1/0:-924.01,-894.57,-1497.61:100:131
-chr11 56468493 . A G 86 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.31e-03;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=30;NF=23;NR=16;PP=86;RMP=49.16;RPV=3.74e-01;SC=TCTGCCCCGCAGTGCTCATCC;TC=227;TCF=156;TCR=71;TR=39 GT:GL:GQ:NR 0/0:-212.22,-234.78,-819.52:99:105 0/1:-472.13,-443.86,-1063.46:100:122
-chr11 92592540 . T G 22 PASS ABPV=9.72e-03;FPV=5.62e-02;FR=0.2501;HP=3;MMLQ=35;NF=0;NR=3;PP=22;RMP=99.66;RPV=8.62e-06;SC=GTTAGTGTTTTGGCTCTTGGA;TC=77;TCF=10;TCR=67;TR=3 GT:GL:GQ:NR 0/0:-302.47,-309.64,-322.1:32:36 0/1:-338.7,-325.07,-335.6:52:41
-chr11 123504959 . C G 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=4.20e-01;FR=0.2508;HP=2;MMLQ=40;NF=0;NR=7;PP=200;RMP=63.62;RPV=9.72e-01;SC=CAGTGCCCAGCGTGGGAACAC;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=7;func=intronic;gene=SCN3B;1000g=0.72;dbsnp=rs1148110 GT:GL:GQ:NR 0/0:-1.61,-6.93,-61.43:24:8 1/0:-66.0,-7.62,-36.11:100:11
-chr12 92675 . C T 152 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=7.38e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=37;NF=1;NR=7;PP=152;RMP=66.0;RPV=3.57e-01;SC=GGACTGTTTCCTGCTTGTAGC;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=8 GT:GL:GQ:NR 0/0:-41.61,-49.75,-120.62:37:14 1/0:-68.65,-25.34,-113.9:100:24
-chr12 11183642 . A G 154 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=8.37e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=34;NF=47;NR=62;PP=154;RMP=57.25;RPV=1.00e-00;SC=GCTAGTAGCAAGCCAGTTGCT;TC=311;TCF=168;TCR=143;TR=109;func=exonic;gene=TAS2R31;exon_func=nonsynonymous SNV;AAchange=NM_176885:c.T293C:p.L98P;segdup=0.93;dbsnp=rs73049067 GT:GL:GQ:NR 0/0:-561.52,-579.71,-1246.3:80:152 0/1:-826.02,-782.04,-1401.37:100:159
-chr12 29908580 . A ATTGTT 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.78e-01;FR=0.2507;HP=3;NF=10;NR=0;PP=200;RMP=36.19;RPV=1.00e+00;SC=TTTGGAAACTATTAAGTAATT;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=10;func=intronic;gene=TMTC1;dbsnp=rs3830194 GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-5.55,-96.69:25:9 1/0:-151.5,-15.23,-76.28:100:17
-chr12 31282765 . A T 21 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=8.68e-01;FR=0.2502;HP=2;MMLQ=35;NF=12;NR=5;PP=21;RMP=46.72;RPV=8.51e-01;SC=AATGAATACAAATTTTTTCAT;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=17 GT:GL:GQ:NR 0/0:-83.08,-89.72,-221.87:30:27 1/0:-63.64,-50.39,-170.59:55:26
-chr12 52843779 . T C 52 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.21e-05;FR=0.2500;HP=4;MMLQ=20;NF=8;NR=16;PP=52;RMP=64.54;RPV=6.52e-01;SC=TTTGAACCCCTGGCTTCATCT;TC=161;TCF=100;TCR=61;TR=24;func=intronic;gene=KRT6B;segdup=0.93;dbsnp=rs380379 GT:GL:GQ:NR 0/0:-109.82,-139.81,-567.08:100:82 0/1:-186.27,-165.75,-481.84:87:79
-chr12 65471467 . A G 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=6.42e-01;FR=0.2501;HP=2;MMLQ=36;NF=7;NR=0;PP=200;RMP=38.97;RPV=4.22e-01;SC=TGCATCTTAAATATTCTTATC;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=7;func=intronic;gene=WIF1;1000g=0.27;dbsnp=rs2289936 GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-7.62,-98.02:34:12 1/0:-69.82,-23.48,-105.09:100:18
-chr12 99175091 . AAC A 86 PASS ABPV=3.61e-01;FPV=7.09e-04;FR=0.2503;HP=1;NF=4;NR=0;PP=86;RMP=34.87;RPV=9.95e-03;SC=AAACAACAACAACACACACAC;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=4;func=intronic;gene=ANKS1B GT:GL:GQ:NR 0/0:-4.37,-10.61,-100.0:28:17 0/1:-72.08,-41.09,-136.47:100:27
-chr12 104378526 . G GACACAGAAACT 200 PASS ABPV=2.37e-01;FPV=8.53e-03;FR=0.2500;HP=1;NF=5;NR=0;PP=200;RMP=8.25;RPV=5.63e-02;SC=TGTGATTCTAGCTCTGCTATG;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=5 GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-15.25,-297.25:67:32 1/0:-137.95,-64.82,-429.82:100:44
-chr13 25169091 . A G 41 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.23e-02;FR=0.2501;HP=3;MMLQ=35;NF=18;NR=1;PP=41;RMP=17.52;RPV=3.10e-02;SC=AATAACCAAAACAGTTTTTTA;TC=133;TCF=114;TCR=19;TR=19 GT:GL:GQ:NR 0/0:-140.13,-147.81,-405.22:35:57 0/1:-204.4,-186.51,-512.07:75:76
-chr13 37795039 . G T 20 PASS ABPV=5.69e-01;FPV=5.25e-01;FR=0.2502;HP=1;MMLQ=40;NF=2;NR=0;PP=20;RMP=33.0;RPV=7.49e-02;SC=TCCTTGGCCTGAGCTTCTTTG;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=2 GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-6.93,-89.94:31:11 1/0:-22.03,-9.0,-57.23:54:8
-chr13 100517209 . G A 21 PASS ABPV=2.00e-01;FPV=2.14e-03;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=35;NF=6;NR=7;PP=21;RMP=94.07;RPV=9.71e-04;SC=GTGTGTGTGTGTATATGTGTG;TC=134;TCF=62;TCR=72;TR=13 GT:GL:GQ:NR 0/0:-265.23,-279.13,-623.6:62:70 1/0:-308.0,-294.6,-524.58:56:64
-chr13 114540947 . C CTCTGCTCTT 45 PASS ABPV=1.42e-01;FPV=3.34e-03;FR=0.2500;HP=2;NF=2;NR=0;PP=45;RMP=1.0;RPV=5.62e-01;SC=CCACAGGAACCCAGCCAGCAG;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=2 GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-11.09,-214.96:49:19 1/0:-74.37,-43.34,-288.0:100:27
-chr14 19118192 . A G 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.32e-05;FR=0.2507;HP=2;MMLQ=32;NF=68;NR=76;PP=200;RMP=53.85;RPV=5.74e-02;SC=TGCTTGCCATATGTCATGGAT;TC=771;TCF=415;TCR=356;TR=144;func=intergenic;gene=NONE(dist=NONE) OR11H12(dist=259402);segdup=0.96;dbsnp=rs77434589 GT:GL:GQ:NR 0/0:-730.61,-736.03,-2441.78:25:349 1/0:-997.51,-891.65,-2847.93:100:422
-chr14 19500081 . A G 22 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.61e-01;FR=0.2505;HP=3;MMLQ=22;NF=3;NR=0;PP=22;RMP=47.77;RPV=1.00e+00;SC=GGTGCACACCACTGTGGACGT;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=3 GT:GL:GQ:NR 0/0:-15.46,-21.36,-64.18:27:10 0/1:-27.84,-14.25,-57.82:57:12
-chr14 20137380 . C T 33 PASS ABPV=1.24e-02;FPV=1.12e-09;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=31;NF=8;NR=17;PP=33;RMP=61.98;RPV=3.46e-06;SC=TCACTGCCCTCGCCGCATGCA;TC=303;TCF=142;TCR=161;TR=25 GT:GL:GQ:NR 0/0:-373.48,-389.86,-1035.03:72:144 0/1:-475.48,-459.41,-1121.57:68:159
-chr14 64496872 . G C 96 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e+00;FR=0.2503;HP=1;MMLQ=37;NF=0;NR=4;PP=96;RMP=55.12;RPV=5.17e-01;SC=AGAAATTCCAGTGGTATTCAG;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=4;func=intronic;gene=SYNE2;1000g=0.90;dbsnp=rs3866737 GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-6.24,-83.73:28:9 0/1:-36.8,-6.24,-45.77:100:9
-chr14 106881425 . A G 71 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.15e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=32;NF=4;NR=10;PP=71;RMP=49.71;RPV=2.88e-01;SC=CCATCCACTCAAGCCCTTGTC;TC=78;TCF=29;TCR=49;TR=14 GT:GL:GQ:NR 0/0:-39.35,-48.57,-258.02:41:30 1/0:-231.62,-206.72,-399.17:100:48
-chr14 106881452 . T C 66 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=3.03e-01;FR=0.2509;HP=1;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=66;RMP=65.33;RPV=1.89e-01;SC=CTGGTCACACTGAATTCATAC;TC=71;TCF=18;TCR=53;TR=13 GT:GL:GQ:NR 0/0:-57.13,-62.37,-258.3:24:30 0/1:-168.08,-144.38,-338.93:100:41
-chr14 107034967 . T C 105 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=6.54e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=34;NF=6;NR=9;PP=105;RMP=58.51;RPV=6.64e-01;SC=ACAGGAGATCTTCAGAGACTC;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=15 GT:GL:GQ:NR 0/0:-163.23,-172.19,-255.57:40:20 1/0:-379.46,-346.84,-445.34:100:39
-chr15 20083754 . G A 54 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=5.67e-01;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=36;NF=33;NR=5;PP=54;RMP=47.07;RPV=4.22e-01;SC=AAATCATTATGTGCTTTGAGA;TC=155;TCF=131;TCR=24;TR=38 GT:GL:GQ:NR 0/0:-122.79,-137.29,-483.11:64:64 1/0:-176.25,-155.43,-655.46:88:91
-chr15 20446256 . G C 57 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e+00;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=1;NR=7;PP=57;RMP=71.88;RPV=4.32e-01;SC=CATGCAAGAAGCTGGAAAGCC;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=8;func=intergenic;gene=NONE(dist=NONE) LOC646096(dist=41741);segdup=0.97;dbsnp=rs3907011 GT:GL:GQ:NR 0/0:-13.82,-23.14,-131.81:42:16 0/1:-45.04,-23.56,-104.26:91:17
-chr15 20875055 . C G 154 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=7.50e-01;FR=0.2504;HP=3;MMLQ=37;NF=0;NR=12;PP=154;RMP=60.19;RPV=1.71e-01;SC=AATTTAAACGCAAATTAGTAA;TC=64;TCF=1;TCR=63;TR=12;func=ncRNA;gene=NBEAP1;segdup=0.93;1000g=0.26;dbsnp=rs7496378 GT:GL:GQ:NR 0/0:-9.2,-15.25,-188.16:27:22 0/1:-137.96,-94.13,-342.43:100:42
-chr15 20875100 . A G 21 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=7.50e-01;FR=0.2502;HP=4;MMLQ=35;NF=0;NR=6;PP=21;RMP=81.39;RPV=2.77e-01;SC=AGAGGTTAAAAATAACTTTCT;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=6;func=ncRNA;gene=NBEAP1;cons46=243 Name=lod=13;segdup=0.93;1000g=0.28;dbsnp=rs7497715 GT:GL:GQ:NR 0/0:-7.83,-14.75,-92.12:31:10 1/0:-92.65,-79.35,-211.07:56:23
-chr15 21140945 . C T 26 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e-01;FR=0.2506;HP=2;MMLQ=33;NF=1;NR=3;PP=26;RMP=65.04;RPV=7.12e-01;SC=ACATGTACAGCGCCACACTTC;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=4;func=intergenic;gene=NF1P2(dist=6320) LOC348120(dist=4822);cons46=679 Name=lod=765;segdup=1.00;1000g=0.24;dbsnp=rs12324229 GT:GL:GQ:NR 0/0:-16.95,-22.6,-60.18:26:13 0/1:-36.66,-22.19,-44.85:61:12
-chr15 28900400 . G T 133 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=6.31e-01;FR=0.2502;HP=3;MMLQ=34;NF=14;NR=0;PP=133;RMP=36.99;RPV=4.21e-01;SC=GCTTGTCATTGTAAATTTTCT;TC=57;TCF=54;TCR=3;TR=14 GT:GL:GQ:NR 0/0:-26.38,-32.94,-192.24:30:27 1/0:-71.34,-32.36,-180.89:100:30
-chr15 75656200 . G A 75 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=6.28e-01;FR=0.2507;HP=6;MMLQ=37;NF=4;NR=0;PP=75;RMP=47.43;RPV=1.00e+00;SC=CCAGCCCCCCGGCCCCGTTTT;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=4 GT:GL:GQ:NR 0/0:-7.14,-12.68,-76.44:25:8 0/1:-34.75,-8.99,-31.71:100:8
-chr15 76075732 . A C 29 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.97e-01;FR=0.2501;HP=2;MMLQ=34;NF=11;NR=15;PP=29;RMP=61.41;RPV=9.58e-01;SC=ATCCCTATCTATCCAGGCCTT;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=26 GT:GL:GQ:NR 0/0:-89.15,-96.33,-237.9:32:31 1/0:-134.14,-119.09,-238.26:63:33
-chr15 100340178 . C G 52 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.76e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=31;NF=5;NR=5;PP=52;RMP=87.78;RPV=1.32e-01;SC=AGTGTCTTCTCGTTCCCACGC;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=10;func=ncRNA;gene=DNM1P46;cons46=699 Name=lod=923;segdup=0.97;sift=0.27 GT:GL:GQ:NR 0/0:-139.12,-149.96,-310.47:37:36 1/0:-206.67,-186.19,-317.68:87:38
-chr15 102303399 . C T 65 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=4.32e-02;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=5;NR=30;PP=65;RMP=65.58;RPV=1.00e-00;SC=AGAGCTGCTGCCCAACCTGCA;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=35;func=intergenic;gene=TARSL2(dist=38754) OR4F6(dist=42524);cons46=920 Name=lod=7327;segdup=0.98;1000g=0.50;dbsnp=rs71416239 GT:GL:GQ:NR 0/0:-129.26,-138.34,-250.21:41:46 0/1:-118.78,-95.27,-224.48:100:44
-chr15 102506389 . C T 50 PASS ABPV=6.29e-01;FPV=1.27e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=34;NF=1;NR=3;PP=50;RMP=67.19;RPV=2.63e-01;SC=GGATGCCCTGCAGTACCTGCA;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=4 GT:GL:GQ:NR 0/0:-3.9,-15.65,-133.88:52:17 0/1:-31.25,-11.29,-72.06:84:15
-chr16 9250260 . T G 22 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e-02;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=22;RMP=37.36;RPV=8.85e-01;SC=CACCTATTATTCCATGAATTC;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=4;func=intergenic;gene=C16orf72(dist=36705) MIR548X(dist=78514);cons46=749 Name=lod=1471;1000g=0.73;dbsnp=rs12929693 GT:GL:GQ:NR 0/0:-1.84,-10.83,-100.69:40:14 0/1:-25.85,-12.37,-70.66:56:13
-chr16 21747662 . G A 36 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=2.01e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=34;NF=16;NR=6;PP=36;RMP=40.34;RPV=5.40e-05;SC=CTGTCTTTCAGTCTGTTCGGA;TC=159;TCF=79;TCR=80;TR=22 GT:GL:GQ:NR 0/0:-69.29,-88.69,-470.14:85:75 1/0:-171.53,-154.82,-534.35:70:84
-chr16 28618446 . T C 36 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=8.61e-01;FR=0.2500;HP=3;MMLQ=32;NF=6;NR=14;PP=36;RMP=63.74;RPV=5.40e-01;SC=ACACAGCCTGTCCCAGGCCAG;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=20 GT:GL:GQ:NR 0/0:-33.24,-41.67,-205.86:38:27 0/1:-113.92,-97.17,-312.83:70:48
-chr16 33390329 . G C 24 PASS ABPV=6.16e-01;FPV=4.32e-02;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=5;NR=0;PP=24;RMP=54.47;RPV=1.00e+00;SC=TTAGAAACAGGTTCACAATTG;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=5;func=intergenic;gene=LOC390705(dist=91627) LINC00273(dist=570723);segdup=0.97;1000g=0.32;dbsnp=rs12232434 GT:GL:GQ:NR 0/0:-6.09,-14.55,-170.95:38:21 0/1:-47.14,-33.16,-147.34:58:19
-chr16 33401967 . G A 116 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.64e-02;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=16;NR=15;PP=116;RMP=51.2;RPV=2.96e-01;SC=GAGGTCTGCCGACAGCTGCAC;TC=172;TCF=102;TCR=70;TR=31;func=intergenic;gene=LOC390705(dist=103265) LINC00273(dist=559085);cons46=611 Name=lod=406;segdup=0.97;dbsnp=rs8047578 GT:GL:GQ:NR 0/0:-133.55,-144.14,-490.22:47:76 1/0:-209.17,-173.99,-648.51:100:96
-chr16 33407954 . C G 34 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=4.21e-01;FR=0.2507;HP=3;MMLQ=34;NF=0;NR=3;PP=34;RMP=61.08;RPV=5.19e-01;SC=GAAATTGTCTCGGGCCTGAAG;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=3 GT:GL:GQ:NR 0/0:-10.82,-16.36,-77.44:25:9 1/0:-63.55,-47.37,-59.15:58:8
-chr16 46405120 . C G 37 PASS ABPV=3.94e-02;FPV=4.07e-03;FR=0.2510;HP=2;MMLQ=40;NF=2;NR=1;PP=37;RMP=51.27;RPV=3.18e-03;SC=CGATTCCATTCGATAATGATT;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=3 GT:GL:GQ:NR 0/0:-129.24,-134.38,-161.33:24:28 0/1:-205.7,-188.69,-196.8:42:34
-chr16 58148083 . C CACACGCAGGTACA 31 PASS ABPV=1.69e-01;FPV=1.00e+00;FR=0.2500;HP=2;NF=0;NR=2;PP=31;RMP=88.0;RPV=3.34e-03;SC=CAGGGAAGCACCCACCCTTGT;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=2 GT:GL:GQ:NR 0/0:-11.28,-21.68,-223.8:46:16 0/1:-62.86,-30.44,-243.59:100:20
-chr17 5036281 . G C 48 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=8.00e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=32;NF=14;NR=49;PP=48;RMP=47.67;RPV=9.22e-01;SC=AAGCACAGTAGCAAAGTAATG;TC=214;TCF=48;TCR=166;TR=63 GT:GL:GQ:NR 0/0:-506.02,-514.23,-1090.2:37:117 0/1:-460.03,-440.62,-871.14:82:97
-chr17 6328747 . T G 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=8.77e-01;FR=0.2507;HP=4;MMLQ=32;NF=8;NR=5;PP=200;RMP=59.22;RPV=9.45e-01;SC=GGCCACTTGCTCCCTGCCTGG;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=13 GT:GL:GQ:NR 0/0:-4.84,-10.37,-69.24:25:8 0/1:-116.1,-23.7,-86.84:100:28
-chr17 14140191 . G A 125 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=3.98e-02;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=34;NF=2;NR=11;PP=125;RMP=71.76;RPV=3.84e-02;SC=AGCTGTTTACGGCGCTGACTC;TC=95;TCF=24;TCR=71;TR=13;func=upstream;gene=CDRT15;segdup=0.99;1000g=0.17;dbsnp=rs28533558 GT:GL:GQ:NR 0/0:-146.51,-156.3,-338.05:44:40 0/1:-162.79,-125.58,-384.62:100:55
-chr17 21904955 . G A 29 PASS ABPV=1.46e-01;FPV=3.00e-01;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=33;NF=1;NR=7;PP=29;RMP=77.08;RPV=5.90e-05;SC=GTGGCACGGCGCTGTATCCTG;TC=95;TCF=9;TCR=86;TR=8 GT:GL:GQ:NR 0/0:-95.23,-110.26,-302.39:67:42 0/1:-104.15,-88.94,-334.7:64:53
-chr17_gl000205_random 114392 . G GC 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e+00;FR=0.2503;HP=1;NF=1;NR=9;PP=200;RMP=62.13;RPV=8.86e-01;SC=GAGCTTCTATGAGGCGTGGGG;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=10;func=intergenic;gene=NONE(dist=NONE) MGC70870(dist=2231) GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-6.24,-93.01:28:9 0/1:-137.06,-63.68,-124.76:100:19
-chr17_gl000205_random 118186 . TCGC T 157 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=4.85e-02;FR=0.2506;HP=1;NF=4;NR=5;PP=157;RMP=51.77;RPV=1.51e-01;SC=CCATCATAAGTCGCATCCCGG;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=9;func=ncRNA;gene=MGC70870;cons46=824 Name=lod=2972;segdup=0.90 GT:GL:GQ:NR 0/0:-80.93,-86.51,-246.22:26:23 0/1:-151.92,-104.34,-309.99:100:34
-chr17_gl000205_random 118289 . G A 30 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=2.43e-02;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=38;NF=1;NR=4;PP=30;RMP=51.3;RPV=5.18e-01;SC=TGAGCTCAGTGGTGCTACCTA;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=5 GT:GL:GQ:NR 0/0:-92.27,-100.53,-170.2:37:15 0/1:-193.59,-178.31,-262.43:64:23
-chr17_gl000205_random 122791 . T C 124 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=6.72e-01;FR=0.2504;HP=1;MMLQ=34;NF=8;NR=0;PP=124;RMP=54.5;RPV=1.00e+00;SC=GATATAAACTTCTAAAATTCA;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=8;func=intergenic;gene=MGC70870(dist=3059) NONE(dist=NONE) GT:GL:GQ:NR 0/0:-33.82,-39.98,-100.64:28:10 1/0:-177.82,-140.79,-190.46:100:20
-chr18 14183747 . T C 115 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.72e-01;FR=0.2500;HP=5;MMLQ=36;NF=49;NR=88;PP=115;RMP=54.47;RPV=9.86e-01;SC=ACAAAGAAAATAGAACGCCTT;TC=444;TCF=156;TCR=288;TR=137 GT:GL:GQ:NR 0/0:-919.95,-948.86,-1765.89:100:211 0/1:-1189.4,-1154.37,-1918.79:100:233
-chr19 3611146 . A G 30 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=5.15e-01;FR=0.2501;HP=1;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=30;RMP=42.3;RPV=2.44e-01;SC=CCCTGTGCTCAGAGGTGGGGG;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=7;func=ncRNA;gene=C19orf29-AS1;1000g=0.56;dbsnp=rs2074786 GT:GL:GQ:NR 0/0:-27.63,-35.13,-121.04:34:15 0/1:-69.97,-54.53,-137.67:65:21
-chr19 12543121 . C G 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=7.14e-01;FR=0.2502;HP=7;MMLQ=40;NF=11;NR=0;PP=200;RMP=33.87;RPV=7.50e-01;SC=TTCTTTGCTTCTTTTTAAATT;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=11;func=intronic;gene=ZNF443;segdup=0.96;dbsnp=rs74181652 GT:GL:GQ:NR 0/0:-8.47,-15.46,-153.74:32:20 0/1:-71.21,-15.46,-97.4:100:21
-chr19 15014189 . T C 90 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.97e-01;FR=0.2500;HP=4;MMLQ=100;NF=2;NR=5;PP=90;RMP=90.56;RPV=4.68e-01;SC=GAGTGAGTTGTGGGTTGCAGC;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=7 GT:GL:GQ:NR 0/0:-190.71,-200.49,-255.11:44:24 1/0:-174.95,-145.84,-178.61:100:15
-chr19 41515263 . A G 88 PASS ABPV=3.76e-01;FPV=1.82e-01;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=33;NF=7;NR=3;PP=88;RMP=64.16;RPV=2.48e-04;SC=AGCGCCCCCAAGGACCTCATC;TC=93;TCF=40;TCR=53;TR=10;func=exonic;gene=CYP2B6;exon_func=nonsynonymous SNV;AAchange=NM_000767:c.A785G:p.K262R;segdup=0.92;1000g=0.20;dbsnp=rs2279343;pp2=0.0;phylop=0.086093;mutT=1.0E-6;LRT=0.999974 GT:GL:GQ:NR 0/0:-4.81,-28.32,-273.38:100:41 0/1:-65.82,-37.11,-263.4:100:52
-chr19 42188037 . C T 114 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=6.06e-02;FR=0.2500;HP=4;MMLQ=34;NF=2;NR=8;PP=114;RMP=98.9;RPV=1.54e-02;SC=GTGTGGCCCCCTTGGTTCCCC;TC=73;TCF=11;TCR=62;TR=10 GT:GL:GQ:NR 0/0:-205.49,-214.25,-251.15:29:29 0/1:-379.34,-343.91,-357.8:15:44
-chr19 50474708 . T G 61 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=7.17e-01;FR=0.2501;HP=2;MMLQ=30;NF=5;NR=1;PP=61;RMP=67.96;RPV=3.09e-02;SC=CTGGGCTCAGTGTCCCAGAGC;TC=37;TCF=18;TCR=19;TR=6 GT:GL:GQ:NR 0/0:-86.34,-93.74,-137.77:33:15 0/1:-129.81,-107.4,-147.05:95:22
-chr19 52977823 . A G 102 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=3.15e-01;FR=0.2507;HP=2;MMLQ=35;NF=0;NR=4;PP=102;RMP=41.58;RPV=8.84e-01;SC=GTTTCTCTCCAGTATGAATTC;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=4;func=intronic;gene=ZNF578;cons46=395 Name=lod=54;1000g=0.94;dbsnp=rs1673901 GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-5.54,-65.87:25:9 1/0:-36.12,-4.16,-18.86:71:6
-chr19 54726711 . G T 43 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e-00;FR=0.2504;HP=3;MMLQ=31;NF=22;NR=2;PP=43;RMP=52.84;RPV=6.78e-01;SC=GTCCCCGCCCGGGTGCCTCCT;TC=53;TCF=45;TCR=8;TR=24 GT:GL:GQ:NR 0/0:-47.88,-54.03,-95.64:28:18 1/0:-164.89,-146.64,-206.88:77:35
-chr2 905553 . G C 76 PASS ABPV=1.62e-02;FPV=5.75e-08;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=31;NF=1;NR=7;PP=76;RMP=95.73;RPV=1.04e-02;SC=GCCTGCACTGGGTCTGGTGTT;TC=128;TCF=69;TCR=59;TR=8 GT:GL:GQ:NR 0/0:-314.19,-325.21,-450.94:49:57 0/1:-390.34,-364.48,-513.78:100:71
-chr2 905595 . G C 24 PASS ABPV=1.21e-01;FPV=1.79e-02;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=35;NF=5;NR=1;PP=24;RMP=13.0;RPV=6.96e-04;SC=GCCTGCACTGGGTCTGGTGTT;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=6 GT:GL:GQ:NR 0/0:-210.22,-219.58,-290.19:42:42 1/0:-197.49,-183.47,-250.46:59:38
-chr2 91885842 . G A 37 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=2.46e-01;FR=0.2502;HP=1;MMLQ=36;NF=4;NR=0;PP=37;RMP=71.85;RPV=4.22e-01;SC=CCAACATTACGGAATTTGGAT;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=4 GT:GL:GQ:NR 0/0:-11.45,-18.39,-83.47:31:11 0/1:-59.01,-41.99,-86.53:72:16
-chr2 96525556 . C T 37 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e-00;FR=0.2503;HP=1;MMLQ=37;NF=60;NR=2;PP=37;RMP=45.25;RPV=9.49e-01;SC=TCTCCTTATACGTCTTTAATA;TC=91;TCF=87;TCR=4;TR=62 GT:GL:GQ:NR 0/0:-304.4,-310.82,-406.42:29:43 0/1:-411.62,-394.62,-459.09:72:48
-chr2 107042620 . C T 45 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=7.50e-01;FR=0.2500;HP=4;MMLQ=33;NF=0;NR=10;PP=45;RMP=77.64;RPV=2.94e-02;SC=GCAAGAGCTACAAATACAAAA;TC=69;TCF=1;TCR=68;TR=10;func=intronic;gene=RGPD3;cons46=333 Name=lod=30;segdup=0.99;dbsnp=rs2433787 GT:GL:GQ:NR 0/0:-9.17,-23.45,-154.19:63:21 1/0:-107.84,-88.96,-294.09:80:48
-chr2 132860931 . G A 113 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=5.61e-01;FR=0.2507;HP=1;MMLQ=38;NF=0;NR=8;PP=113;RMP=69.43;RPV=9.58e-01;SC=GAAGAATGTGGTAAAGCCTTT;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=8 GT:GL:GQ:NR 0/0:-12.66,-18.1,-56.72:25:9 1/0:-57.64,-23.24,-50.67:100:13
-chr2 133020074 . G A 33 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.94e-01;FR=0.2501;HP=2;MMLQ=36;NF=45;NR=12;PP=33;RMP=47.59;RPV=9.08e-01;SC=ATTTCAGAAGGGAAAATATCC;TC=167;TCF=131;TCR=36;TR=57;func=intergenic;gene=ANKRD30BL(dist=4532) GPR39(dist=154073);cons46=762 Name=lod=1662;segdup=0.91;dbsnp=rs111959326 GT:GL:GQ:NR 0/0:-698.84,-706.52,-798.38:35:80 1/0:-786.87,-770.7,-903.5:68:87
-chr2 133020186 . T C 66 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.55e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=34;NF=52;NR=51;PP=66;RMP=46.69;RPV=9.65e-01;SC=TAGCTTTGTGTTCATACCACT;TC=402;TCF=237;TCR=165;TR=103;func=intergenic;gene=ANKRD30BL(dist=4644) GPR39(dist=153961);cons46=762 Name=lod=1662;segdup=0.91;dbsnp=rs112259198 GT:GL:GQ:NR 0/0:-1712.52,-1737.48,-1975.72:100:192 1/0:-1974.59,-1950.96,-2276.74:100:211
-chr2 133020542 . G A 50 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.14e-01;FR=0.2503;HP=1;MMLQ=32;NF=3;NR=6;PP=50;RMP=53.94;RPV=7.08e-02;SC=CTATCCAAGTGGATCCAAATT;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=9;func=intergenic;gene=ANKRD30BL(dist=5000) GPR39(dist=153605);cons46=762 Name=lod=1662;segdup=0.93;dbsnp=rs2257591 GT:GL:GQ:NR 0/0:-181.04,-187.42,-271.44:29:29 1/0:-243.98,-224.07,-313.1:84:37
-chr2 166801924 . C G 78 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=5.71e-01;FR=0.2507;HP=3;MMLQ=34;NF=4;NR=0;PP=78;RMP=67.75;RPV=7.49e-01;SC=TATTTACAAACTGGCAATAGA;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=4;func=ncRNA;gene=LOC100506134;1000g=0.64;dbsnp=rs6432853 GT:GL:GQ:NR 0/0:-34.05,-39.57,-91.24:25:8 1/0:-42.79,-16.34,-58.89:100:10
-chr2 204055943 . T C 59 PASS ABPV=2.58e-01;FPV=8.29e-02;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=33;NF=11;NR=2;PP=59;RMP=61.13;RPV=3.22e-06;SC=ATGGCCGCCATCCTCATGACA;TC=128;TCF=65;TCR=63;TR=13;func=intronic;gene=NBEAL1;cons46=702 Name=lod=950;dbsnp=rs4561645 GT:GL:GQ:NR 0/0:-41.52,-53.03,-440.53:51:70 1/0:-89.56,-67.55,-350.54:93:58
-chr2 210594540 . A G 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.70e-01;FR=0.2507;HP=1;MMLQ=30;NF=10;NR=1;PP=200;RMP=52.61;RPV=9.37e-01;SC=CGAATGCAAGATATAGTTAAA;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=11;func=intronic;gene=MAP2;1000g=0.88;dbsnp=rs4673486 GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-5.54,-62.54:25:8 0/1:-93.19,-14.77,-63.29:100:19
-chr2 211444533 . GGT G 32 PASS ABPV=1.78e-01;FPV=1.96e-01;FR=0.2503;HP=2;NF=1;NR=3;PP=32;RMP=50.82;RPV=2.40e-03;SC=TGTTTCTTCGGGTGTGTGTGT;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=4 GT:GL:GQ:NR 0/0:-4.14,-10.38,-103.02:28:17 1/0:-41.6,-23.06,-172.26:78:37
-chr2 227659818 . T TCAAGTGAGGA 93 PASS ABPV=3.68e-02;FPV=2.37e-01;FR=0.2500;HP=1;NF=0;NR=3;PP=93;RMP=91.0;RPV=7.64e-05;SC=CTCTCACCGCTGCCCAGGGGT;TC=63;TCF=5;TCR=58;TR=3 GT:GL:GQ:NR 0/0:-17.96,-35.28,-330.9:77:30 0/1:-94.07,-50.73,-458.79:100:41
-chr2 227954599 . G A 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.19e-01;FR=0.2507;HP=2;MMLQ=31;NF=6;NR=4;PP=200;RMP=46.35;RPV=9.51e-01;SC=TCTCCTTTTGGGCCTCTTCCT;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=10;func=exonic;gene=COL4A4;exon_func=nonsynonymous SNV;AAchange=NM_000092:c.C1444T:p.P482S;1000g=0.55;dbsnp=rs2229814;sift=0.44;pp2=0.0;phylop=0.897442;mutT=9.0E-5;LRT=0.824593 GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-5.54,-68.56:25:9 0/1:-80.77,-11.53,-34.97:100:16
-chr2 233273018 . G A 32 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=3.62e-01;FR=0.2500;HP=3;MMLQ=34;NF=13;NR=4;PP=32;RMP=56.47;RPV=8.89e-03;SC=TTCCCATGGGGACCCCAGACC;TC=102;TCF=59;TCR=43;TR=17 GT:GL:GQ:NR 0/0:-50.24,-59.48,-309.03:41:45 0/1:-159.89,-144.07,-409.74:66:57
-chr20 29633938 . A G 28 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.27e-01;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=16;NR=24;PP=28;RMP=56.91;RPV=2.94e-01;SC=AAATGACTGGAATTTTTGTTT;TC=192;TCF=84;TCR=108;TR=40;func=ncRNA;gene=FRG1B;cons46=514 Name=lod=163;segdup=0.96;dbsnp=rs4006818 GT:GL:GQ:NR 0/0:-963.63,-978.07,-1139.59:64:101 1/0:-1046.34,-1031.41,-1112.07:63:91
-chr20 33356511 . C T 44 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=7.49e-01;FR=0.2507;HP=1;MMLQ=37;NF=0;NR=4;PP=44;RMP=57.46;RPV=6.28e-01;SC=AGTTTACCACCAGAAAAATGG;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=4;func=intronic;gene=NCOA6;cons46=243 Name=lod=13;1000g=0.36;dbsnp=rs2295353 GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-5.54,-70.65:25:8 0/1:-49.75,-31.07,-63.51:79:9
-chr21 14424170 . C G 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=7.37e-05;FR=0.2502;HP=1;MMLQ=31;NF=51;NR=68;PP=200;RMP=55.06;RPV=7.01e-02;SC=GGAAAGAACACCTGACACGGC;TC=637;TCF=318;TCR=319;TR=119 GT:GL:GQ:NR 0/0:-1068.97,-1075.78,-2090.04:31:272 1/0:-1608.82,-1559.51,-2814.14:100:365
-chr22 16256578 . G T 200 PASS ABPV=2.18e-01;FPV=6.87e-08;FR=0.2502;HP=4;MMLQ=34;NF=19;NR=8;PP=200;RMP=40.16;RPV=2.46e-02;SC=TGGCTCTGATGTTTCATTATG;TC=253;TCF=194;TCR=59;TR=27 GT:GL:GQ:NR 0/0:-139.12,-145.98,-745.94:31:118 0/1:-324.53,-220.54,-788.14:100:135
-chr22 24640438 . TCA T 58 PASS ABPV=5.57e-01;FPV=3.19e-02;FR=0.2503;HP=2;NF=2;NR=1;PP=58;RMP=48.68;RPV=9.37e-01;SC=ATACATTCACTCACACACACA;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=3 GT:GL:GQ:NR 0/0:-4.37,-10.61,-107.94:28:12 0/1:-47.48,-22.82,-120.6:100:15
-chr22 42524924 . A G 32 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.78e-02;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=35;NF=0;NR=4;PP=32;RMP=71.83;RPV=5.74e-01;SC=TGTCCAAGAGACCGTTGGGGC;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=4 GT:GL:GQ:NR 0/0:-1.84,-12.87,-112.28:49:17 1/0:-35.2,-19.47,-73.62:66:14
-chr3 6522043 . G A 62 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=5.16e-01;FR=0.2507;HP=3;MMLQ=37;NF=4;NR=0;PP=62;RMP=44.82;RPV=7.49e-01;SC=TAACTGCAAAGTAGGAACACG;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=4 GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-5.54,-65.36:25:9 1/0:-46.21,-23.49,-68.33:96:10
-chr3 135742089 . GAAAATA G 56 PASS ABPV=2.53e-02;FPV=5.62e-01;FR=0.2500;HP=4;NF=0;NR=2;PP=56;RMP=97.0;RPV=4.10e-05;SC=GTTTTGTTTTGAAAATATTTT;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=2 GT:GL:GQ:NR 0/0:-171.19,-180.69,-401.53:43:27 1/0:-163.7,-138.73,-368.83:100:28
-chr3 195453014 . G A 73 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.99e-01;FR=0.2500;HP=3;MMLQ=31;NF=44;NR=44;PP=73;RMP=52.04;RPV=1.00e-00;SC=GACAGCACCCGGGGCCACGAC;TC=210;TCF=115;TCR=95;TR=88 GT:GL:GQ:NR 0/0:-596.82,-608.68,-929.74:53:99 0/1:-825.59,-800.41,-1040.36:100:111
-chr3 195453412 . C T 21 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.25e-02;FR=0.2502;HP=2;MMLQ=25;NF=13;NR=52;PP=21;RMP=62.2;RPV=1.00e-00;SC=CCACGACTGCCCGGACGAGGC;TC=219;TCF=89;TCR=130;TR=65 GT:GL:GQ:NR 0/0:-275.62,-282.43,-681.47:31:103 0/1:-362.65,-349.41,-719.87:55:117
-chr3 195506775 . G A 87 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=8.81e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=34;NF=11;NR=4;PP=87;RMP=30.23;RPV=4.10e-02;SC=AGGAAGTGTCGGTGACAGGAA;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=15;func=exonic;gene=MUC4;exon_func=synonymous SNV;AAchange=NM_018406:c.C11676T:p.H3892H;cons46=381 Name=lod=47;segdup=0.92;1000g=0.48;dbsnp=rs79609066 GT:GL:GQ:NR 0/0:-215.78,-225.62,-329.97:44:31 0/1:-253.55,-225.09,-324.19:100:38
-chr3 195507372 . C A 72 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.50e-01;FR=0.2510;HP=1;MMLQ=31;NF=12;NR=10;PP=72;RMP=82.02;RPV=4.71e-01;SC=GAGGGGTGGCCTGACCTGTGG;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=22 GT:GL:GQ:NR 0/0:-85.59,-90.71,-175.03:23:27 0/1:-302.0,-277.02,-435.24:100:49
-chr3 195509974 . A G 107 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=4.52e-02;FR=0.2501;HP=1;MMLQ=33;NF=7;NR=15;PP=107;RMP=66.83;RPV=1.62e-01;SC=ATGACCTGTGAACACTGAGGA;TC=127;TCF=50;TCR=77;TR=22 GT:GL:GQ:NR 0/0:-281.04,-289.1,-469.31:36:51 0/1:-474.46,-441.44,-679.46:100:76
-chr4 3589510 . G A 82 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e-00;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=35;NF=28;NR=15;PP=82;RMP=39.79;RPV=1.00e-00;SC=ACTTCCAGATGAGACTTCCTG;TC=89;TCF=62;TCR=27;TR=43;func=ncRNA;gene=FLJ35424 GT:GL:GQ:NR 0/0:-202.17,-216.0,-372.38:61:36 0/1:-618.94,-591.66,-690.1:100:53
-chr4 5747131 . C A 40 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=6.32e-01;FR=0.2502;HP=2;MMLQ=33;NF=1;NR=19;PP=40;RMP=63.27;RPV=9.99e-01;SC=AAATTGGCTACATTAGAGAGA;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=20 GT:GL:GQ:NR 0/0:-175.23,-182.17,-227.63:31:19 1/0:-264.71,-246.95,-301.81:75:26
-chr4 70261725 . G A 25 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=8.43e-01;FR=0.2503;HP=3;MMLQ=36;NF=1;NR=5;PP=25;RMP=77.58;RPV=8.09e-01;SC=TGTGGCCCTGGGGTAGTTACT;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=6 GT:GL:GQ:NR 0/0:-25.09,-31.31,-100.1:28:11 1/0:-62.48,-48.33,-68.8:59:8
-chr5 837488 . C A 84 PASS ABPV=3.03e-01;FPV=2.26e-02;FR=0.2502;HP=2;MMLQ=35;NF=22;NR=3;PP=84;RMP=67.65;RPV=4.45e-09;SC=ACCTGGAGAACTCCTTTGTCC;TC=225;TCF=128;TCR=97;TR=25 GT:GL:GQ:NR 0/0:-71.02,-77.56,-596.34:30:92 0/1:-157.13,-129.33,-794.35:100:133
-chr5 34192944 . A G 136 PASS ABPV=3.53e-01;FPV=1.29e-04;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=31;NF=17;NR=13;PP=136;RMP=51.73;RPV=7.15e-05;SC=GCAGTGGATGAAGGCCCCTCA;TC=261;TCF=140;TCR=121;TR=30 GT:GL:GQ:NR 0/0:-120.41,-138.2,-806.35:79:120 0/1:-199.6,-159.91,-913.41:100:141
-chr5 36200413 . G A 33 PASS ABPV=1.25e-02;FPV=1.03e-02;FR=0.2511;HP=3;MMLQ=34;NF=2;NR=4;PP=33;RMP=98.68;RPV=2.69e-06;SC=GAAAATGTATGTTATAAATAT;TC=109;TCF=30;TCR=79;TR=6 GT:GL:GQ:NR 0/0:-295.77,-300.82,-490.03:23:53 1/0:-290.08,-274.08,-469.93:67:56
-chr5 41909830 . C T 27 PASS ABPV=5.28e-01;FPV=2.35e-03;FR=0.2504;HP=18;MMLQ=0;NF=0;NR=3;PP=27;RMP=14.14;RPV=9.29e-01;SC=AGATATCTTTCTTTTTTTTTT;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=3 GT:GL:GQ:NR 0/0:-4.61,-10.58,-40.73:26:11 0/1:-41.44,-26.72,-53.62:62:17
-chr5 54329850 . C CTGCTTTACTTA 68 PASS ABPV=5.01e-01;FPV=1.00e+00;FR=0.2503;HP=1;NF=0;NR=2;PP=68;RMP=90.0;RPV=7.41e-02;SC=CATATGGGGTCCATTTTTGCA;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=2 GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-6.24,-122.94:28:9 1/0:-45.59,-6.93,-110.5:100:12
-chr5 58121059 . G A 112 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=4.22e-01;FR=0.2501;HP=2;MMLQ=35;NF=0;NR=5;PP=112;RMP=75.51;RPV=4.68e-01;SC=TACAGAGTCCGAGCTAATTGT;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=5 GT:GL:GQ:NR 0/0:-31.77,-39.38,-124.25:34:12 0/1:-43.94,-9.7,-79.61:100:15
-chr5 169535734 . C A 20 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e+00;FR=0.2507;HP=1;MMLQ=34;NF=0;NR=2;PP=20;RMP=68.72;RPV=3.31e-01;SC=CAGGAGCCTCCGAGGAATCCA;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=2;func=UTR3;gene=FOXI1;1000g=0.35;dbsnp=rs6873124 GT:GL:GQ:NR 0/0:-5.3,-10.84,-76.27:25:8 1/0:-15.88,-2.77,-16.56:54:5
-chr5 175467765 . A C 34 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=6.86e-01;FR=0.2503;HP=3;MMLQ=37;NF=4;NR=7;PP=34;RMP=58.23;RPV=9.60e-01;SC=AGGAAAGCAGATTTGTACATC;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=11 GT:GL:GQ:NR 0/0:-48.25,-54.62,-116.89:29:16 0/1:-64.43,-48.26,-102.15:68:18
-chr5 180047739 . CGT C 40 PASS ABPV=3.01e-01;FPV=4.20e-02;FR=0.2503;HP=3;NF=0;NR=2;PP=40;RMP=66.37;RPV=1.63e-01;SC=AAGGGGCCGGCGTGTGTGTGT;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=2 GT:GL:GQ:NR 0/0:-15.43,-21.66,-115.16:28:17 0/1:-35.79,-15.44,-86.67:86:11
-chr6 26370657 . A G 26 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.98e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=34;NF=25;NR=18;PP=26;RMP=46.67;RPV=9.65e-01;SC=ACAGTGGAGCAACGCCAAGGG;TC=112;TCF=61;TCR=51;TR=43 GT:GL:GQ:NR 0/0:-408.78,-416.97,-671.27:37:70 1/0:-270.25,-255.76,-422.39:61:42
-chr6 26370659 . C T 32 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.98e-01;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=25;NR=17;PP=32;RMP=48.69;RPV=9.08e-01;SC=AGTGGAGCAACGCCAAGGGAG;TC=114;TCF=61;TCR=53;TR=42 GT:GL:GQ:NR 0/0:-408.78,-419.23,-664.68:47:70 1/0:-278.07,-262.18,-440.62:67:44
-chr6 35838820 . A ATTCTTACTTGG 44 PASS ABPV=1.42e-01;FPV=7.50e-01;FR=0.2500;HP=1;NF=0;NR=2;PP=44;RMP=90.0;RPV=2.64e-03;SC=CTCTACCAGAATGAAAAGTCT;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=2 GT:GL:GQ:NR 0/0:-22.8,-33.89,-243.84:49:19 1/0:-50.19,-17.08,-221.97:100:21
-chr6 58777098 . A T 42 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=2.57e-03;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=14;NR=25;PP=42;RMP=50.5;RPV=1.85e-01;SC=GTAACTCTAGATTGAAGAATT;TC=224;TCF=105;TCR=119;TR=39;func=intergenic;gene=GUSBP4(dist=489374) NONE(dist=NONE);dbsnp=rs4330557 GT:GL:GQ:NR 0/0:-1161.42,-1180.18,-1411.53:83:106 0/1:-1283.78,-1265.72,-1460.11:76:119
-chr6 116774635 . C G 38 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=3.66e-01;FR=0.2504;HP=1;MMLQ=36;NF=4;NR=12;PP=38;RMP=76.7;RPV=4.76e-01;SC=CTTTTTCCACCACAAATTCTT;TC=72;TCF=21;TCR=51;TR=16 GT:GL:GQ:NR 0/0:-45.72,-51.81,-228.46:28:30 0/1:-179.58,-162.43,-353.98:72:42
-chr6 136599000 . T TCATCTGTGA 73 PASS ABPV=2.21e-05;FPV=2.55e-09;FR=0.2505;HP=4;NF=2;NR=0;PP=73;RMP=1.41;RPV=3.11e-04;SC=TTTTAGTTTTTACCTTTTTAA;TC=118;TCF=90;TCR=28;TR=2;func=intronic;gene=BCLAF1;cons46=573 Name=lod=284;segdup=0.97 GT:GL:GQ:NR 0/0:-44.16,-49.89,-603.4:26:61 1/0:-105.25,-67.59,-750.95:100:79
-chr6 155757781 . T A 106 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=3.16e-01;FR=0.2504;HP=2;MMLQ=36;NF=0;NR=5;PP=106;RMP=66.42;RPV=6.16e-01;SC=TACAGTGAGCTCTGAAATATC;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=5;func=intronic;gene=NOX3;1000g=0.22;dbsnp=rs231961 GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-6.09,-69.03:28:9 0/1:-48.54,-15.69,-84.63:100:15
-chr7 65159983 . A G 128 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=5.13e-01;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=33;NF=9;NR=0;PP=128;RMP=42.05;RPV=1.33e-01;SC=TTGCTTAGTTACCAGGTAGAA;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=9;func=ncRNA;gene=INTS4L2 LOC441242;cons46=439 Name=lod=81;segdup=0.99;1000g=0.26;dbsnp=rs2949280 GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-9.67,-99.87:43:16 0/1:-63.32,-25.43,-98.84:100:29
-chr7 100552044 . T G 46 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e-00;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=33;NF=133;NR=185;PP=46;RMP=54.24;RPV=1.00e-00;SC=CTGTTCCTTCTTCACCATACA;TC=776;TCF=387;TCR=389;TR=318 GT:GL:GQ:NR 0/0:-2768.08,-2799.9,-3980.82:100:373 0/1:-3148.55,-3129.5,-4372.1:80:403
-chr7 102319079 . G A 34 PASS ABPV=4.40e-01;FPV=1.00e+00;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=38;NF=0;NR=6;PP=34;RMP=53.53;RPV=6.65e-03;SC=TGTGAGATGCGTGTGAAAATG;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=6;func=intergenic;gene=POLR2J2(dist=6903) FAM185A(dist=70320);segdup=1.00;1000g=0.17;dbsnp=rs62458736 GT:GL:GQ:NR 0/0:-9.39,-20.95,-166.2:51:26 0/1:-46.26,-30.07,-176.58:68:30
-chr7 106272259 . C T 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.51e-04;FR=0.2501;HP=2;MMLQ=31;NF=27;NR=25;PP=200;RMP=18.87;RPV=1.08e-05;SC=CTCATTCCAACCTCTGCTTCC;TC=391;TCF=192;TCR=199;TR=52 GT:GL:GQ:NR 0/0:-1599.11,-1606.25,-1841.06:32:195 0/1:-1703.84,-1621.18,-1787.33:100:196
-chr7 128492558 . G A 32 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.80e-01;FR=0.2501;HP=6;MMLQ=35;NF=15;NR=1;PP=32;RMP=45.11;RPV=5.34e-01;SC=TGAGTCCAGGGGGGGCTGCTC;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=16 GT:GL:GQ:NR 0/0:-82.82,-89.89,-214.44:32:24 0/1:-137.27,-121.35,-194.99:67:21
-chr7 142223942 . A G 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e-00;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=33;NF=86;NR=42;PP=200;RMP=48.5;RPV=9.93e-01;SC=ACTGTGAATCATCTACTACAC;TC=282;TCF=160;TCR=122;TR=128 GT:GL:GQ:NR 0/0:-840.21,-856.54,-1228.56:72:124 1/0:-1069.18,-1023.08,-1489.98:100:158
-chr7 142498735 . A C 51 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.39e-01;FR=0.2500;HP=4;MMLQ=34;NF=23;NR=20;PP=51;RMP=54.1;RPV=9.74e-01;SC=AGGACCTGAAAAACGTGTTCC;TC=127;TCF=71;TCR=56;TR=43;func=intergenic;gene=TRY6(dist=16336) EPHB6(dist=54057);sift=0.35 GT:GL:GQ:NR 0/0:-407.53,-415.97,-666.18:38:67 0/1:-407.94,-387.73,-626.55:86:62
-chr7 143295456 . A C 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=7.75e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=26;NF=24;NR=7;PP=200;RMP=70.65;RPV=6.11e-02;SC=GCCTCCTCGCAGTGGGGGGCA;TC=135;TCF=87;TCR=48;TR=31 GT:GL:GQ:NR 0/0:-28.78,-39.63,-253.37:48:66 0/1:-158.76,-57.73,-187.94:100:69
-chr7 143453710 . T A 66 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=5.62e-01;FR=0.2501;HP=3;MMLQ=36;NF=0;NR=15;PP=66;RMP=54.55;RPV=5.68e-01;SC=TCTTCCTTTGTTTTGTCCACT;TC=62;TCF=2;TCR=60;TR=15 GT:GL:GQ:NR 0/0:-65.41,-73.41,-216.2:36:31 0/1:-102.8,-79.18,-187.97:100:31
-chr7 143956461 . T C 37 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=8.34e-02;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=31;NF=5;NR=0;PP=37;RMP=48.38;RPV=1.00e+00;SC=TGGGCTTGGCTGGATGCAGGA;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=5 GT:GL:GQ:NR 0/0:-6.63,-15.42,-125.53:39:20 1/0:-33.93,-16.96,-77.4:71:16
-chr7 157367205 . TGA T 52 PASS ABPV=3.26e-01;FPV=5.62e-01;FR=0.2503;HP=2;NF=0;NR=2;PP=52;RMP=55.44;RPV=3.19e-02;SC=AGAGTAATAATGAGAGAGAGA;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=2;func=intronic;gene=PTPRN2 GT:GL:GQ:NR 0/0:-10.36,-16.59,-113.87:28:16 1/0:-39.42,-16.12,-59.64:99:12
-chr8 8095880 . C T 131 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=2.37e-01;FR=0.2500;HP=3;MMLQ=37;NF=0;NR=10;PP=131;RMP=64.63;RPV=8.71e-01;SC=GCCACATGGCCCCAGGCCCAA;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=10;func=ncRNA;gene=FLJ10661;segdup=0.98 GT:GL:GQ:NR 0/0:-78.8,-87.2,-171.27:38:18 0/1:-81.81,-43.3,-81.08:100:18
-chr8 12236123 . T G 111 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.38e-39;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=30;NF=16;NR=9;PP=111;RMP=18.14;RPV=9.45e-01;SC=GTATTTGTGTTTGTGTGTGTG;TC=103;TCF=79;TCR=24;TR=25 GT:GL:GQ:NR 0/0:-265.16,-270.76,-457.35:100:49 1/0:-317.4,-305.02,-585.97:25:76
-chr8 12428634 . C T 69 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=7.50e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=36;NF=0;NR=5;PP=69;RMP=63.98;RPV=2.03e-01;SC=TCTTAACAACCGCCATGGTGC;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=5 GT:GL:GQ:NR 0/0:-10.77,-21.63,-134.62:48:17 1/0:-41.03,-16.59,-80.89:100:14
-chr8 35608374 . T C 24 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=6.32e-01;FR=0.2502;HP=2;MMLQ=34;NF=1;NR=34;PP=24;RMP=69.53;RPV=1.00e-00;SC=TGAAAGTGTGTGTTTTCCAAA;TC=62;TCF=5;TCR=57;TR=35 GT:GL:GQ:NR 0/0:-248.65,-255.21,-376.27:30:35 1/0:-265.91,-251.92,-307.04:58:27
-chr8 121500323 . A AGTGGGATTGC 40 PASS ABPV=2.19e-01;FPV=8.43e-03;FR=0.2500;HP=2;NF=2;NR=0;PP=40;RMP=1.0;RPV=7.50e-01;SC=ATTATATCCTATGGATCAAAT;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=2 GT:GL:GQ:NR 0/0:-2.07,-11.08,-162.96:40:13 1/0:-47.66,-16.63,-264.67:100:25
-chr9 14510 . CTGT C 200 PASS ABPV=2.20e-01;FPV=4.66e-14;FR=0.2500;HP=1;NF=12;NR=0;PP=200;RMP=43.31;RPV=1.00e-02;SC=TAAAAGCACACTGTTGGTTTC;TC=123;TCF=107;TCR=16;TR=12 GT:GL:GQ:NR 0/0:-22.04,-38.67,-350.71:73:53 0/1:-133.83,-67.48,-425.73:100:75
-chr9 34724786 . G A 54 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=5.46e-01;FR=0.2503;HP=2;MMLQ=31;NF=10;NR=18;PP=54;RMP=64.11;RPV=9.71e-01;SC=GGATTTCCACGGGACTAGGCT;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=28 GT:GL:GQ:NR 0/0:-77.92,-84.2,-224.15:29:46 1/0:-101.32,-80.48,-207.58:88:45
-chr9 44118498 . G C 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=9.49e-01;FR=0.2503;HP=2;MMLQ=34;NF=2;NR=7;PP=200;RMP=65.44;RPV=6.41e-01;SC=GAGGGCAGCTGCCTGTCACCT;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=9;func=intergenic;gene=CNTNAP3B(dist=196025) FAM27C(dist=871738);segdup=0.98;1000g=0.77;dbsnp=rs28610048 GT:GL:GQ:NR 0/0:-11.97,-18.32,-91.33:29:13 0/1:-73.63,-27.61,-81.59:100:18
-chr9 67281836 . T G 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=3.12e-01;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=6;NR=21;PP=200;RMP=63.02;RPV=5.58e-01;SC=GTGGACCTGATACAGTGGCCC;TC=115;TCF=31;TCR=84;TR=27;func=ncRNA;gene=AQP7P1;segdup=0.99;1000g=0.26;dbsnp=rs75812522 GT:GL:GQ:NR 0/0:-227.43,-240.42,-365.47:58:50 0/1:-353.09,-303.78,-464.7:100:65
-chr9 67293649 . T G 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=2.40e-02;FR=0.2509;HP=2;MMLQ=32;NF=8;NR=20;PP=200;RMP=65.85;RPV=6.29e-01;SC=GTGTGCCAAGTGACTTCATCT;TC=136;TCF=59;TCR=77;TR=28 GT:GL:GQ:NR 0/0:-52.46,-57.7,-399.51:24:62 0/1:-141.44,-82.05,-400.07:100:74
-chr9 68358140 . T C 101 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=4.09e-01;FR=0.2501;HP=2;MMLQ=31;NF=10;NR=13;PP=101;RMP=52.55;RPV=9.14e-01;SC=CCGCTTCAGATAGTGAAGAAG;TC=84;TCF=45;TCR=39;TR=23;func=intergenic;gene=ANKRD20A3(dist=387847) LOC642236(dist=69643);cons46=780 Name=lod=1967;segdup=0.98;dbsnp=rs62544188 GT:GL:GQ:NR 0/0:-99.49,-107.4,-306.63:36:46 0/1:-122.69,-91.06,-221.21:100:38
-chr9 92995102 . C T 25 PASS ABPV=1.74e-02;FPV=2.34e-06;FR=0.2500;HP=3;MMLQ=33;NF=11;NR=10;PP=25;RMP=36.17;RPV=2.75e-07;SC=ATAAAATTGTCCCCTCCATTC;TC=258;TCF=127;TCR=131;TR=21;func=intergenic;gene=LOC286370(dist=191321) LOC340515(dist=229612);segdup=0.96 GT:GL:GQ:NR 0/0:-127.8,-170.89,-839.43:100:127 1/0:-164.37,-150.07,-829.28:60:131
-chr9 139572068 . C G 44 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=4.21e-01;FR=0.2507;HP=2;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=44;RMP=57.58;RPV=7.11e-01;SC=GGCTGGGGCGCGAAGGCCTGG;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=3;func=intronic;gene=AGPAT2;1000g=0.57;dbsnp=rs2236514 GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-5.54,-62.14:25:9 1/0:-29.67,-11.06,-23.48:61:5
-chr9 140777194 . A AGAGCGGCT 200 PASS ABPV=7.76e-05;FPV=4.77e-24;FR=0.2500;HP=2;NF=2;NR=1;PP=200;RMP=4.36;RPV=2.92e-05;SC=CGCTTCTCCTAGGACGACACG;TC=123;TCF=77;TCR=46;TR=3;func=splicing;gene=CACNA1B(NM_000718:c.390-2->CATGTCCGAGCGGCT NM_001243812:c.390-2->CATGTCCGAGCGGCT);cons46=573 Name=lod=285 GT:GL:GQ:NR 0/0:-260.4,-275.23,-819.04:71:85 0/1:-510.15,-408.95,-886.86:3:93
-chrUn_gl000214 53458 . T A 82 PASS ABPV=4.34e-01;FPV=7.36e-06;FR=0.2500;HP=4;MMLQ=34;NF=22;NR=0;PP=82;RMP=47.4;RPV=5.62e-01;SC=AAACACTATATAAATATAATT;TC=187;TCF=185;TCR=2;TR=22;func=intergenic;gene=NONE(dist=NONE) NONE(dist=NONE);segdup=0.98 GT:GL:GQ:NR 0/0:-154.3,-180.61,-694.01:100:88 1/0:-304.62,-277.18,-752.95:100:99
-chrUn_gl000214 61035 . A G 25 PASS ABPV=2.68e-01;FPV=1.27e-06;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=20;NR=0;PP=25;RMP=60.63;RPV=4.22e-01;SC=ATGTTTACCTATATAACAAAC;TC=187;TCF=184;TCR=3;TR=20 GT:GL:GQ:NR 0/0:-517.15,-538.58,-910.78:94:80 0/1:-812.82,-798.54,-1242.08:60:107
-chrUn_gl000214 74804 . T C 45 PASS ABPV=5.69e-01;FPV=4.33e-02;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=35;NF=5;NR=0;PP=45;RMP=36.66;RPV=5.62e-01;SC=ATCACTTGAATGCAGTAGGCA;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=5 GT:GL:GQ:NR 0/0:-65.35,-75.06,-177.61:43:16 0/1:-180.67,-161.94,-279.38:79:26
-chrUn_gl000220 121703 . T C 75 PASS ABPV=9.31e-02;FPV=1.94e-05;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=31;NF=5;NR=8;PP=75;RMP=52.13;RPV=2.81e-03;SC=GTGGGCACGGTACGCTCTGGT;TC=150;TCF=78;TCR=72;TR=13 GT:GL:GQ:NR 0/0:-64.92,-78.18,-505.13:59:80 1/0:-102.59,-76.78,-453.86:100:70
-chrUn_gl000220 128026 . C T 73 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=1.39e-05;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=37;NF=12;NR=5;PP=73;RMP=48.23;RPV=2.65e-03;SC=TCTCTGTCTCCGTCTCTGTCT;TC=117;TCF=62;TCR=55;TR=17 GT:GL:GQ:NR 0/0:-175.58,-193.94,-521.81:81:62 1/0:-151.61,-126.36,-397.61:100:57
-chrUn_gl000220 132074 . G A 200 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=2.39e-03;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=10;NR=11;PP=200;RMP=61.51;RPV=6.72e-03;SC=CTCTCTGTCCGTCTCTGTCTT;TC=167;TCF=84;TCR=83;TR=21;func=intergenic;gene=LOC100507412(dist=5378) RN5-8S1(dist=23923);segdup=0.95 GT:GL:GQ:NR 0/0:-248.2,-257.69,-615.12:42:77 0/1:-290.71,-234.79,-658.31:100:90
-chrUn_gl000220 145002 . C T 28 PASS ABPV=3.17e-02;FPV=7.56e-08;FR=0.2500;HP=4;MMLQ=31;NF=1;NR=3;PP=28;RMP=65.86;RPV=4.70e-03;SC=ACTAGCCGGGCGCGGTGGCAC;TC=76;TCF=36;TCR=40;TR=4 GT:GL:GQ:NR 0/0:-17.73,-43.17,-320.69:100:46 1/0:-67.96,-52.99,-236.43:63:37
-chrUn_gl000220 145368 . T C 30 PASS ABPV=1.09e-01;FPV=1.31e-02;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=29;NF=8;NR=2;PP=30;RMP=72.81;RPV=1.92e-05;SC=AGCCGGGCGCTGTGCTGTGCT;TC=119;TCF=63;TCR=56;TR=10;func=intergenic;gene=LOC100507412(dist=18672) RN5-8S1(dist=10629);dbsnp=rs3878955 GT:GL:GQ:NR 0/0:-48.56,-59.69,-409.13:50:53 0/1:-66.74,-51.46,-448.03:64:66
-chrUn_gl000225 30398 . C T 29 PASS ABPV=1.13e-01;FPV=3.15e-04;FR=0.2502;HP=1;MMLQ=33;NF=1;NR=5;PP=29;RMP=58.12;RPV=2.55e-02;SC=CCTGCTCCTCCGAGCCTTTGA;TC=80;TCF=37;TCR=43;TR=6 GT:GL:GQ:NR 0/0:-195.73,-202.53,-342.72:31:35 1/0:-230.45,-215.31,-371.74:63:45
-chrUn_gl000225 43193 . C T 46 PASS ABPV=1.00e+00;FPV=7.84e-02;FR=0.2507;HP=3;MMLQ=31;NF=8;NR=12;PP=46;RMP=44.42;RPV=4.19e-02;SC=GCCAGAGAGACGGGCCTCCCG;TC=126;TCF=51;TCR=75;TR=20 GT:GL:GQ:NR 0/0:-577.5,-583.01,-743.98:25:63 1/0:-604.31,-585.16,-703.98:81:63
-chrX 106390898 . G A 65 PASS ABPV=4.78e-01;FPV=1.49e-02;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=39;NF=5;NR=0;PP=65;RMP=43.16;RPV=1.00e+00;SC=GTTTGGTCATGGAGCATACAA;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=5 GT:GL:GQ:NR 0/0:0.0,-11.78,-148.84:52:17 1/0:-49.23,-25.85,-211.17:99:29
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.0
-##FILTER=<ID=HardyWeinbergViolation,Description="The validation is in Hardy-Weinberg violation">
-##FILTER=<ID=HighNoCallRate,Description="The validation no-call rate is too high">
-##FILTER=<ID=TooManyHomVars,Description="The validation homozygous variant rate is too high">
-##INFO=<ID=AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
-##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
-##INFO=<ID=HW,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled Hardy-Weinberg violation p-value">
-##INFO=<ID=HetPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of heterozygous genotypes">
-##INFO=<ID=HomRefPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of homozygous reference genotypes">
-##INFO=<ID=HomVarPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent homozygous variant genotypes">
-##INFO=<ID=NoCallPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of no-calls">
-##ValidationMetrics_HardyWeinbergViolations="25 (8%)"
-##ValidationMetrics_HomVarViolations="0 (0%)"
-##ValidationMetrics_NoCallViolations="13 (4%)"
-##ValidationMetrics_PolymorphicPassingRecords="195 (75%)"
-##ValidationMetrics_RecordsPassingFilters="258 (87%)"
-##ValidationMetrics_RecordsProcessed=296
-##ValidationMetrics_SamplesAssayed=383
-##VariantValidationAssessor="analysis_type=VariantValidationAssessor input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[rawData/plink.renamed.sorted.fixed.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub maxHardy=20.0 maxNoCall=0.05 maxHomVar=1.1"
-##source=PLINK
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT HG00127 HG00128 HG00136 HG00137 HG00138 HG00139 HG00152 HG00156 HG00234 HG00235 HG00237 HG00242 HG00244 HG00262 HG01055 HG01079 NA19138 NA18974 NA18523 NA12717 NA19209 NA18577 NA18973 NA18943 NA12873 NA18623 NA18622 NA18948 NA19171 NA19204 NA06994 NA18563 NA18547 NA18861 NA18608 NA18995 NA10851 NA18976 NA18603 NA19200 HG01204 HG01191 HG01101 HG00146 HG00306 NA18985 HG00160 HG00635 HG00372 HG00357 HG00634 NA18541 NA18950 NA19759 HG00351 HG00257 HG00118 HG00336 HG00448 HG01354 NA18609 HG00428 HG00326 NA11894 NA18956 HG00173 HG00117 NA11893 HG01251 HG01441 HG01437 HG00182 HG00330 HG01060 HG00329 NA18960 NA18856 NA07346 NA18871 NA19057 NA18868 NA18636 NA12830 NA19007 NA18910 NA18874 NA19056 NA19064 NA19066 NA18487 NA18642 NA19236 NA07056 NA18637 NA19235 NA19309 NA19311 NA19334 NA19346 NA19347 NA19372 NA19376 NA19383 NA19384 NA19394 NA19428 NA19430 NA19451 NA19466 NA19313 NA19321 NA19324 NA19332 NA19390 NA19436 NA19439 NA19440 NA19463 NA19470 NA19471 NA19472 NA19676 NA19660 NA19661 NA19663 NA19722 NA19725 NA19728 NA19729 NA19731 NA19749 NA19755 NA19756 NA19758 NA19770 NA19773 NA19777 NA19780 NA19783 NA20525 NA20589 NA20765 NA20802 NA20804 NA18544 NA18602 NA18546 NA18610 NA18957 NA18615 NA18616 NA19010 NA18638 NA18639 NA18627 NA19072 NA18630 NA19074 NA19080 NA19081 NA19083 NA19085 NA19088 NA20287 NA19835 NA20276 NA19818 NA20278 NA20282 NA20342 NA20296 NA20314 NA20346 NA19712 NA19198 NA19108 NA18934 NA18916 NA18907 NA18917 NA06989 NA12058 NA12341 NA12546 NA12489 HG01197 NA18983 NA11843 NA11892 NA12749 NA12282 NA12751 NA18959 NA19331 NA19453 NA20537 NA12046 NA20515 NA20516 NA20521 NA20524 NA20528 NA20759 NA20768 NA20769 NA20774 NA20775 NA20783 NA20787 NA20790 NA20800 NA20819 NA20812 NA20505 NA20530 NA20540 NA20538 NA20581 NA20815 NA20544 NA20810 NA20807 NA20816 NA20504 NA20753 NA20502 NA12342 NA19150 NA19468 NA20336 NA19395 NA19257 NA19360 NA19700 NA18867 NA20317 NA18968 NA19107 HG00111 HG00108 NA19077 NA19684 NA18511 NA12044 NA19382 NA19457 NA18933 NA18923 NA18965 HG00141 NA20341 NA18740 HG00537 HG00346 HG01173 HG00702 HG00313 HG00150 NA18612 HG00339 NA12273 HG00250 NA18593 NA18621 HG00478 HG00251 HG01070 NA19160 HG00479 HG00608 NA18573 HG00375 NA19248 NA19093 HG01170 HG00534 HG01171 HG01522 NA18624 HG00683 HG01521 NA19005 NA20412 NA18971 HG00446 NA12748 HG00530 HG00690 HG01356 HG01516 NA20532 HG00344 HG00328 NA18542 HG00254 HG00321 HG00577 HG00656 HG00342 HG00524 HG00650 HG00557 HG00319 HG00457 HG00125 HG00578 HG00543 HG00638 HG00171 HG00699 HG00595 HG00187 HG00704 HG00533 HG00596 HG00268 HG01083 HG00651 HG01133 HG00671 HG00327 HG01148 HG00246 HG00672 HG00556 HG00436 HG00554 NA18633 NA20344 NA11993 NA07037 NA11930 HG01366 HG01389 HG00620 NA19740 HG00190 HG00419 NA18535 HG01495 NA18592 HG01497 HG00174 HG01140 NA12287 HG00689 HG01550 HG00334 HG01375 HG00637 NA18507 HG01113 NA18550 NA19129 HG01551 HG01462 HG00331 NA12413 HG01456 HG01360 HG00708 HG01350 HG00684 NA19099 HG00284 NA12399 NA12286 NA12777 HG00277 HG00266 NA19985 HG00353 HG01102 NA07347 NA07051 NA19900 NA18984 NA07048 HG00640 HG01066 NA12812 HG01174 HG01188
-20 439104 . AG A . HighNoCallRate AC=0;AN=158;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=20.6;HomVarPct=0.0;NoCallPct=79.4 GT . 0/0 . . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . . . . . . 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . . . . . . 0/0 . . . . 0/0 . . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . . . . . . . . 0/0 . 0/0 . . . . . 0/0 0/0 . 0/0 . . . . 0/0 . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . . . . 0/0 0/0 . 0/0 . . . . . 0/0 . . 0/0 . 0/0 . . . . . . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 . . 0/0 . 0/0 . . 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . .
-20 669442 . TG T . PASS AC=54;AN=766;HW=6.74;HetPct=12.0;HomRefPct=86.9;HomVarPct=1.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 676148 . A AC . PASS AC=0;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 719486 . C CT . PASS AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 890696 . C CAT . PASS AC=6;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1102516 . CT C . PASS AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1149576 . CT C . PASS AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1195706 . AAG A . PASS AC=334;AN=764;HW=9.47;HetPct=44.9;HomRefPct=33.7;HomVarPct=21.1;NoCallPct=0.3 GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 . 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1
-20 1342549 . A AAGAT . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1366475 . CT C . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1390810 . T TTC . HighNoCallRate AC=0;AN=566;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=73.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=26.1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . . . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1550416 . C CT . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1655540 . AT A . PASS AC=4;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 2133769 . GA G . HardyWeinbergViolation AC=379;AN=766;HW=85.69;HetPct=34.7;HomRefPct=33.2;HomVarPct=32.1;NoCallPct=0.0 GT 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1
-20 2217137 . CT C . HighNoCallRate AC=0;AN=704;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=91.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=8.1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 2263095 . TG T . HardyWeinbergViolation AC=358;AN=766;HW=812.29;HetPct=93.5;HomRefPct=6.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1
-20 2426886 . G GAATT . HighNoCallRate AC=11;AN=680;HW=0.00;HetPct=2.9;HomRefPct=85.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=11.2 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/1 . 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 . . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/1 . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0
-20 2889034 . AAAAT A . PASS AC=6;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 3203741 . CT C . PASS AC=4;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 3327993 . CAA C . HardyWeinbergViolation AC=3;AN=766;HW=21.06;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 3700705 . CTTTGGG C . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 4037626 . TC T . PASS AC=194;AN=764;HW=14.70;HetPct=33.4;HomRefPct=57.7;HomVarPct=8.6;NoCallPct=0.3 GT 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 . 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0
-20 4210074 . G GA . PASS AC=197;AN=762;HW=14.95;HetPct=33.7;HomRefPct=56.9;HomVarPct=8.9;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1
-20 4363519 . CATT C . PASS AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 4366806 . CAAAT C . PASS AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 4641550 . CCTTGA C . PASS AC=3;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5105482 . C CATTTTAGG . PASS AC=101;AN=762;HW=14.11;HetPct=20.1;HomRefPct=76.2;HomVarPct=3.1;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5289619 . GA G . PASS AC=377;AN=764;HW=5.70;HetPct=53.0;HomRefPct=24.0;HomVarPct=22.7;NoCallPct=0.3 GT 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 . 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0
-20 5416109 . CA C . PASS AC=2;AN=752;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5432262 . AGT A . PASS AC=4;AN=752;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=97.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5724449 . T TC . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5928403 . T TA . HardyWeinbergViolation AC=196;AN=762;HW=47.13;HetPct=29.2;HomRefPct=59.3;HomVarPct=11.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 6877907 . CA C . PASS AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 6969412 . CAAAGAAT C . PASS AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7035110 . CT C . HardyWeinbergViolation AC=340;AN=758;HW=1038.45;HetPct=1.0;HomRefPct=54.0;HomVarPct=43.9;NoCallPct=1.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 . 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1
-20 7229260 . T TA . PASS AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7239075 . AG A . PASS AC=5;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7942727 . A AC . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7950562 . C CT . PASS AC=4;AN=760;HW=18.01;HetPct=0.5;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 8195466 . C CT . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 8233352 . TACTC T . PASS AC=56;AN=764;HW=1.84;HetPct=13.1;HomRefPct=85.9;HomVarPct=0.8;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 8504000 . TAG T . PASS AC=5;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 8779672 . TG T . HighNoCallRate AC=0;AN=86;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=11.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=88.8 GT . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 . . . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . . . . . . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 . . . . . 0/0 0/0 . . . . 0/0 . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . 0/0 . . . . . . . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . 0/0 . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 . . . 0/0 . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . .
-20 8794142 . AG A . HardyWeinbergViolation AC=52;AN=756;HW=57.86;HetPct=8.4;HomRefPct=87.7;HomVarPct=2.6;NoCallPct=1.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 9231138 . AT A . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 9900218 . C CT . HardyWeinbergViolation AC=3;AN=766;HW=21.06;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 9921724 . AAAGT A . PASS AC=11;AN=758;HW=0.00;HetPct=2.9;HomRefPct=96.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 9925738 . T TG . PASS AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 10090376 . T TG . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 10377174 . ATAAAAC A . HighNoCallRate AC=107;AN=514;HW=4.54;HetPct=20.6;HomRefPct=42.8;HomVarPct=3.7;NoCallPct=32.9 GT . . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 . 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 . . . . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/1 0/0 . . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 . . 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 . . . . . . 0/0 . 1/1 . 0/0 . 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 . . . . 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 . . 0/0 . . . . . 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/1 . . . . . 0/0 . 0/1 0/1 . . 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/1 0/1 . 0/1 0/1 0/0 . 0/1 0/0 . . 0/0 . . . . . 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/1 . . 0/1 . . . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/1 . . . . . . . . . . . 0/1 0/0 . 0/0 . 0/1 0/1 . . . . . . . . . . 0/0 0/1 . . 0/0 . 0/0 . . . 0/1 . . . 0/1 . . 0/1 . . . . 0/0 . 0/1 0/0 . 0/1 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 . . . 1/1 0/1 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/1 0/1 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-20 11229169 . T TA . PASS AC=3;AN=756;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 11511920 . AC A . PASS AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 11893900 . ATTAG A . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12021825 . A AG . PASS AC=5;AN=756;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=97.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12063752 . CTT C . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12094344 . TCAGGAGGC T . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12114989 . CTA C . PASS AC=4;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12371546 . GACA G . PASS AC=10;AN=762;HW=0.00;HetPct=2.6;HomRefPct=96.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12512723 . G GTT . PASS AC=6;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12634463 . TGA T . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12692743 . TTATC T . PASS AC=8;AN=762;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=97.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12837095 . G GA . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12928028 . TG T . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13003323 . GGGA G . PASS AC=3;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13128894 . CT C . PASS AC=10;AN=764;HW=0.00;HetPct=2.6;HomRefPct=97.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13287841 . CAT C . PASS AC=134;AN=760;HW=0.21;HetPct=29.2;HomRefPct=67.1;HomVarPct=2.9;NoCallPct=0.8 GT 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-20 13365589 . T TG . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13566260 . AAATTG A . PASS AC=374;AN=764;HW=3.95;HetPct=47.5;HomRefPct=27.2;HomVarPct=25.1;NoCallPct=0.3 GT 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 . 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1
-20 13685184 . AT A . PASS AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13716193 . GAGAA G . PASS AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13926445 . TA T . PASS AC=0;AN=756;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13960028 . TC T . PASS AC=188;AN=750;HW=2.44;HetPct=35.5;HomRefPct=55.6;HomVarPct=6.8;NoCallPct=2.1 GT 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 . 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . . 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0
-20 14159734 . T TA . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 14287634 . AGT A . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 14383135 . TA T . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 14420574 . GA G . HardyWeinbergViolation AC=3;AN=766;HW=21.06;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 14669226 . G GA . PASS AC=121;AN=766;HW=1.68;HetPct=25.8;HomRefPct=71.3;HomVarPct=2.9;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-20 14697473 . TTC T . PASS AC=9;AN=764;HW=10.31;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 14983337 . AGCC A . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15037520 . A AG . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15141272 . T TC . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15189597 . GA G . PASS AC=311;AN=760;HW=2.80;HetPct=46.2;HomRefPct=35.5;HomVarPct=17.5;NoCallPct=0.8 GT 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 . 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 . 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1
-20 15265098 . TG T . PASS AC=125;AN=766;HW=6.76;HetPct=25.3;HomRefPct=71.0;HomVarPct=3.7;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1
-20 15410763 . TGA T . PASS AC=29;AN=764;HW=0.00;HetPct=7.6;HomRefPct=92.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15543319 . AG A . PASS AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15550845 . TG T . PASS AC=34;AN=756;HW=0.00;HetPct=8.4;HomRefPct=90.1;HomVarPct=0.3;NoCallPct=1.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15703503 . TG T . PASS AC=87;AN=750;HW=3.63;HetPct=19.1;HomRefPct=77.0;HomVarPct=1.8;NoCallPct=2.1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15871330 . AG A . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16016504 . TA T . PASS AC=186;AN=764;HW=15.27;HetPct=32.4;HomRefPct=59.3;HomVarPct=8.1;NoCallPct=0.3 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-20 16172883 . G GTAGC . HardyWeinbergViolation AC=79;AN=762;HW=42.59;HetPct=13.8;HomRefPct=82.2;HomVarPct=3.4;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16192114 . AT A . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16259934 . C CAA . PASS AC=0;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16312599 . CTA C . PASS AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16723642 . GGTT G . PASS AC=6;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16747221 . CA C . PASS AC=291;AN=764;HW=3.13;HetPct=45.2;HomRefPct=39.2;HomVarPct=15.4;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1
-20 16769262 . TTTC T . HighNoCallRate AC=8;AN=600;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=76.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=21.7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/1 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/1 . 0/1 . . 0/1 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . 0/1 . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . . . . . 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16813850 . C CA . PASS AC=7;AN=758;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17250858 . T TC . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17331332 . TA T . PASS AC=80;AN=762;HW=15.60;HetPct=16.2;HomRefPct=80.9;HomVarPct=2.3;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17473782 . TGC T . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17607627 . A AGT . PASS AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17753474 . C CA . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18417481 . AC A . PASS AC=17;AN=766;HW=0.00;HetPct=4.4;HomRefPct=95.6;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18445795 . AAG A . PASS AC=5;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18520672 . A ATT . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18522725 . ATTAAC A . PASS AC=1;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18915562 . TAA T . PASS AC=3;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 19111235 . C CT . PASS AC=4;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 19157532 . T TC . HardyWeinbergViolation AC=3;AN=760;HW=21.02;HetPct=0.3;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 19188693 . T TC . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 19437778 . GGCCTGGGATGTAAA G . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 19805154 . CCTT C . PASS AC=3;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20030869 . CT C . PASS AC=362;AN=766;HW=6.74;HetPct=46.5;HomRefPct=29.5;HomVarPct=24.0;NoCallPct=0.0 GT 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1
-20 20286529 . A AC . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20404656 . ATTACAGACT A . PASS AC=7;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20434198 . TA T . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20716329 . CA C . PASS AC=4;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20760474 . TG T . PASS AC=15;AN=764;HW=5.83;HetPct=3.4;HomRefPct=96.1;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20952825 . T TC . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20990240 . TC T . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21406859 . ACTT A . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21480245 . AG A . PASS AC=1;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21852048 . CA C . PASS AC=330;AN=762;HW=4.15;HetPct=46.5;HomRefPct=33.2;HomVarPct=19.8;NoCallPct=0.5 GT 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 . 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 . 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0
-20 21968507 . AC A . PASS AC=7;AN=762;HW=12.61;HetPct=1.3;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 22411326 . CA C . HardyWeinbergViolation AC=321;AN=762;HW=136.49;HetPct=29.5;HomRefPct=42.8;HomVarPct=27.2;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 . 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1
-20 22434333 . C CA . PASS AC=8;AN=766;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 22637424 . C CAGCCA . PASS AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 22655862 . TATC T . PASS AC=6;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23169038 . TGTC T . HardyWeinbergViolation AC=380;AN=766;HW=1034.24;HetPct=98.7;HomRefPct=1.0;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.0 GT 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1
-20 23200197 . ATT A . PASS AC=1;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23293728 . CA C . PASS AC=8;AN=754;HW=11.33;HetPct=1.6;HomRefPct=96.6;HomVarPct=0.3;NoCallPct=1.6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23319459 . CAT C . HardyWeinbergViolation AC=10;AN=766;HW=26.72;HetPct=1.6;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.5;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23813095 . CT C . PASS AC=26;AN=762;HW=1.46;HetPct=6.3;HomRefPct=93.0;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23815381 . CT C . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23889003 . GA G . PASS AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 24541328 . TA T . HighNoCallRate AC=0;AN=430;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=56.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=43.9 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . . . 0/0 0/0 . . . 0/0 . . . . 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . . . 0/0 . . . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 . 0/0 . . . . . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . . . . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 . . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 . . 0/0 0/0 . . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0
-20 24710482 . GT G . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 24855121 . CT C . PASS AC=6;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 25283938 . A AG . HardyWeinbergViolation AC=326;AN=762;HW=30.59;HetPct=40.2;HomRefPct=36.8;HomVarPct=22.5;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 . 0/1 . 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1
-20 25503211 . CATA C . PASS AC=1;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 25905250 . GT G . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29589873 . CCTT C . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29628180 . C CCACAAGAAG . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29804699 . A AC . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29913425 . TATATC T . PASS AC=15;AN=762;HW=5.82;HetPct=3.4;HomRefPct=95.8;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30390854 . TTATACTA T . PASS AC=3;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30534847 . ACAAT A . PASS AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30567910 . T TG . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 31412616 . CT C . PASS AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 31760870 . CG C . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 31881479 . AG A . HardyWeinbergViolation AC=40;AN=764;HW=34.05;HetPct=7.3;HomRefPct=90.9;HomVarPct=1.6;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32015223 . CT C . PASS AC=5;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32158330 . CAG C . PASS AC=4;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32456076 . GT G . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32477286 . CA C . HardyWeinbergViolation AC=14;AN=766;HW=20.05;HetPct=2.6;HomRefPct=96.9;HomVarPct=0.5;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32509752 . A AG . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32700247 . GGCGTCTGA G . PASS AC=3;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32968409 . GTC G . PASS AC=0;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 33541746 . A AAG . PASS AC=4;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 34251969 . C CA . PASS AC=3;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 34313574 . A AT . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 34633573 . TAA T . PASS AC=1;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 34831930 . CT C . PASS AC=7;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 35329008 . ATC A . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 35357903 . GA G . PASS AC=5;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 35847597 . CTT C . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 36250348 . CG C . HighNoCallRate AC=0;AN=414;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=54.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=46.0 GT 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . . 0/0 . . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 . . . 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 . . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . . . 0/0 . . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 . . 0/0 . . . .
-20 36658020 . TG T . PASS AC=6;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 36704724 . TC T . PASS AC=8;AN=756;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=96.6;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 36711544 . TAAAG T . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 36947086 . ATAC A . PASS AC=33;AN=766;HW=0.12;HetPct=8.6;HomRefPct=91.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37139725 . CAG C . PASS AC=5;AN=760;HW=15.80;HetPct=0.8;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37278654 . CAG C . PASS AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37391272 . TG T . PASS AC=4;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37608002 . CAT C . PASS AC=7;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37678954 . C CTGG . PASS AC=7;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37712193 . AAG A . PASS AC=29;AN=762;HW=0.00;HetPct=7.6;HomRefPct=91.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37836124 . AAAT A . PASS AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37954797 . A AGT . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37962643 . T TAA . PASS AC=178;AN=764;HW=12.74;HetPct=31.9;HomRefPct=60.6;HomVarPct=7.3;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1
-20 38336199 . TA T . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 38495835 . T TA . PASS AC=14;AN=762;HW=0.00;HetPct=3.7;HomRefPct=95.8;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 38696054 . GAAGA G . PASS AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 38784318 . CCTT C . PASS AC=7;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 39042026 . T TG . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 39420665 . AG A . PASS AC=72;AN=760;HW=3.25;HetPct=16.2;HomRefPct=81.7;HomVarPct=1.3;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-20 39607037 . C CA . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 39868369 . T TG . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 40006262 . TGAG T . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 40110981 . A AG . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 40445967 . TG T . PASS AC=3;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 40742257 . TG T . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41000677 . T TG . PASS AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41149621 . T TATCA . PASS AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41364251 . A AAG . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41543685 . CTAAGGAGGGAAAAAGATATAAT C . PASS AC=12;AN=764;HW=0.00;HetPct=3.1;HomRefPct=96.6;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41851636 . TA T . PASS AC=83;AN=764;HW=18.52;HetPct=16.4;HomRefPct=80.7;HomVarPct=2.6;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 41918747 . TATC T . HighNoCallRate AC=3;AN=650;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=84.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=15.1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 . . . . . 0/0 . 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41964672 . A AT . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42145613 . TG T . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42159695 . GC G . PASS AC=87;AN=762;HW=7.05;HetPct=18.5;HomRefPct=78.9;HomVarPct=2.1;NoCallPct=0.5 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-20 42261635 . C CATTT . PASS AC=24;AN=764;HW=2.06;HetPct=5.7;HomRefPct=93.7;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42470352 . CACTT C . PASS AC=19;AN=764;HW=3.87;HetPct=4.4;HomRefPct=95.0;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42585924 . T TA . PASS AC=1;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42856201 . CT C . PASS AC=3;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42909154 . T TGGGTC . PASS AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42918721 . AG A . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42930748 . A AG . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43245783 . AG A . PASS AC=8;AN=766;HW=11.40;HetPct=1.6;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43371647 . GGGCTGTAA G . PASS AC=80;AN=760;HW=6.79;HetPct=17.2;HomRefPct=80.2;HomVarPct=1.8;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 43434234 . AG A . PASS AC=4;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43539258 . T TAG . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43606638 . T TC . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43826992 . GC G . PASS AC=0;AN=748;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=2.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43993933 . CA C . PASS AC=199;AN=764;HW=8.74;HetPct=35.2;HomRefPct=56.1;HomVarPct=8.4;NoCallPct=0.3 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1
-20 44071585 . C CT . PASS AC=132;AN=764;HW=8.50;HetPct=26.1;HomRefPct=69.5;HomVarPct=4.2;NoCallPct=0.3 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1
-20 44220528 . T TC . PASS AC=59;AN=766;HW=1.90;HetPct=14.9;HomRefPct=84.9;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 44340276 . AACAG A . PASS AC=37;AN=758;HW=17.93;HetPct=7.6;HomRefPct=90.3;HomVarPct=1.0;NoCallPct=1.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 44464600 . T TA . PASS AC=19;AN=762;HW=3.86;HetPct=4.4;HomRefPct=94.8;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 44470843 . GAGTGTCGT G . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 44572563 . GA G . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 44889286 . G GC . PASS AC=13;AN=766;HW=0.00;HetPct=3.4;HomRefPct=96.6;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 45092013 . GT G . PASS AC=4;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 45300827 . CT C . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 45406096 . T TTC . PASS AC=4;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 45668403 . CTG C . PASS AC=86;AN=762;HW=16.06;HetPct=17.2;HomRefPct=79.6;HomVarPct=2.6;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 46011017 . GAT G . HighNoCallRate AC=4;AN=706;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=91.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=7.8 GT . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 46051811 . T TAAGC . PASS AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 46353646 . A AG . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 46413551 . TC T . PASS AC=2;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 46569465 . CTG C . PASS AC=10;AN=762;HW=0.00;HetPct=2.6;HomRefPct=96.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 46720983 . ATACTTGG A . PASS AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 47032179 . GC G . PASS AC=2;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 47136092 . A AGTC . PASS AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 47239432 . T TA . HardyWeinbergViolation AC=3;AN=762;HW=21.03;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 47335386 . GC G . PASS AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 47428163 . C CA . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 47988904 . CA C . PASS AC=187;AN=760;HW=17.08;HetPct=32.1;HomRefPct=58.7;HomVarPct=8.4;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 . 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 48262933 . CCTA C . PASS AC=7;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49438742 . G GT . PASS AC=8;AN=762;HW=11.37;HetPct=1.6;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49451656 . T TG . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49537420 . AG A . PASS AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49561273 . A AG . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49765611 . A AC . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49823863 . ACTTTT A . HardyWeinbergViolation AC=14;AN=764;HW=20.03;HetPct=2.6;HomRefPct=96.6;HomVarPct=0.5;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 50136971 . TTTTC T . PASS AC=8;AN=764;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 50373155 . A AT . PASS AC=7;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 50772065 . T TC . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 50806976 . G GAA . PASS AC=128;AN=760;HW=0.17;HetPct=28.2;HomRefPct=68.4;HomVarPct=2.6;NoCallPct=0.8 GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0
-20 50961401 . G GT . PASS AC=4;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 51547787 . AC A . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 51758677 . A ATT . HardyWeinbergViolation AC=87;AN=762;HW=72.50;HetPct=13.3;HomRefPct=81.5;HomVarPct=4.7;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 51838824 . GA G . PASS AC=4;AN=756;HW=17.99;HetPct=0.5;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.3;NoCallPct=1.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 51961394 . ATTTG A . PASS AC=8;AN=760;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=97.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 53081927 . CATGA C . PASS AC=5;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 53538294 . T TG . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 53602394 . T TA . PASS AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54124185 . T TC . PASS AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54150907 . CAG C . PASS AC=3;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54166824 . AC A . PASS AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54230743 . CAT C . PASS AC=2;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54262948 . A AC . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54309727 . TGAGC T . PASS AC=7;AN=762;HW=12.61;HetPct=1.3;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54379666 . GT G . PASS AC=172;AN=766;HW=14.43;HetPct=30.8;HomRefPct=62.1;HomVarPct=7.0;NoCallPct=0.0 GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0
-20 55264363 . AG A . PASS AC=232;AN=762;HW=15.89;HetPct=37.1;HomRefPct=50.7;HomVarPct=11.7;NoCallPct=0.5 GT 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1
-20 55286852 . AAAC A . HardyWeinbergViolation AC=10;AN=764;HW=26.69;HetPct=1.6;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.5;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 55608811 . CT C . PASS AC=35;AN=762;HW=19.90;HetPct=7.0;HomRefPct=91.4;HomVarPct=1.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 55611547 . CAA C . PASS AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 55658161 . GT G . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 55989765 . CA C . PASS AC=208;AN=764;HW=5.71;HetPct=37.1;HomRefPct=54.0;HomVarPct=8.6;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 56249865 . T TGAGG . PASS AC=4;AN=756;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 56344957 . GT G . PASS AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 56419021 . T TG . PASS AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 56915853 . TG T . PASS AC=17;AN=764;HW=4.78;HetPct=3.9;HomRefPct=95.6;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 57125853 . GA G . HardyWeinbergViolation AC=137;AN=764;HW=48.09;HetPct=22.2;HomRefPct=70.8;HomVarPct=6.8;NoCallPct=0.3 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 57676578 . CCTTT C . PASS AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 57693627 . AG A . HighNoCallRate AC=12;AN=292;HW=71.95;HetPct=0.5;HomRefPct=36.3;HomVarPct=1.3;NoCallPct=61.9 GT . . 0/0 . . . 0/0 . . . . 0/0 . 1/1 . . 0/0 . 0/0 . 0/0 . . . . . . . 0/0 0/0 . . . 0/0 . . . . . 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 . . . . . . . . 0/0 . . . . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . . . . . . . . 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 . . . . . . . 0/0 . . . 0/0 . . . . . . 0/0 1/1 . . . 0/0 . . . . . . . . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 . 0/0 . . . . 0/0 . . 0/0 . . 1/1 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/1 . . 0/0 . 0/0 1/1 . . . . . . . 0/0 0/0 . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . . . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . . . 0/0 . . 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 . . . 0/0 0/0 . . . . 0/0 . . . 0/0 . . . 0/0 . . . 0/0 . . 0/0 . 0/0 . . . . . . 0/0 . . . . . . . 0/0 . . 0/1 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 . . 0/0 . . . . 0/0 . . . . . 0/0 . 0/0 . . 0/0 . 0/0 . . . 0/0
-20 57781799 . TGGG T . HardyWeinbergViolation AC=43;AN=764;HW=30.12;HetPct=8.1;HomRefPct=90.1;HomVarPct=1.6;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 58288793 . TC T . PASS AC=44;AN=766;HW=12.53;HetPct=9.4;HomRefPct=89.6;HomVarPct=1.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 58790761 . TG T . HardyWeinbergViolation AC=232;AN=762;HW=35.81;HetPct=33.9;HomRefPct=52.2;HomVarPct=13.3;NoCallPct=0.5 GT 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 . 0/1 . 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0
-20 59072457 . AAGG A . HardyWeinbergViolation AC=12;AN=756;HW=41.94;HetPct=1.6;HomRefPct=96.3;HomVarPct=0.8;NoCallPct=1.3 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59153061 . CTG C . PASS AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59186675 . TATTA T . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59349754 . CCT C . PASS AC=168;AN=762;HW=8.71;HetPct=31.3;HomRefPct=61.9;HomVarPct=6.3;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59365768 . TG T . PASS AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59769242 . C CT . PASS AC=4;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59955821 . TG T . HighNoCallRate AC=0;AN=712;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=93.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=7.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 60337932 . AC A . PASS AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 60925525 . GC G . PASS AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 60961768 . GA G . HardyWeinbergViolation AC=365;AN=766;HW=84.86;HetPct=34.7;HomRefPct=35.0;HomVarPct=30.3;NoCallPct=0.0 GT 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1
-20 61000018 . GC G . PASS AC=203;AN=762;HW=0.38;HetPct=39.4;HomRefPct=53.3;HomVarPct=6.8;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 . 0/1 . 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-20 61531765 . AG A . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 61983510 . TCTGC T . PASS AC=75;AN=766;HW=0.03;HetPct=18.0;HomRefPct=81.2;HomVarPct=0.8;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 62154368 . G GA . PASS AC=2;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 62310426 . CTT C . PASS AC=1;AN=756;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 62871860 . C CCCGCA . PASS AC=27;AN=764;HW=17.87;HetPct=5.5;HomRefPct=93.5;HomVarPct=0.8;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.0
-##ApplyRecalibration="analysis_type=ApplyRecalibration input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/combined.phase1.chr20.raw.indels.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false recal_file=/humgen/gsa-scr1/delangel/VQSRIndels/data/trainMills75_truthMills75_p15_12_12_pctb0.05_std12.0_mG8_QD_FS_HS_RP_IC.recal tranches_file=/humgen/gsa-scr1/delangel/VQSRIndels/data/trainMills75_truthMills75_p15_12_12_pctb0.05_std12.0_mG8_QD_FS_HS_RP_IC.tranches out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub ts_filter_level=93.0 ignore_filter=null mode=INDEL"
-##CombineVariants="analysis_type=CombineVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20:41000001-42000000] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AFR/AFR.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/ASN/ASN.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AMR/AMR.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/EUR/EUR.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AFR.admix/AFR.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/ASN.admix/ASN.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AMR.admix/AMR.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/EUR.admix/EUR.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub genotypemergeoption=PRIORITIZE filteredrecordsmergetype=KEEP_IF_ANY_UNFILTERED rod_priority_list=AFR.admix,AMR.admix,EUR.admix,ASN.admix,AFR,AMR,EUR,ASN printComplexMerges=false filteredAreUncalled=false minimalVCF=false setKey=set assumeIdenticalSamples=false minimumN=1 masterMerge=false mergeInfoWithMaxAC=true"
-##FILTER=<ID=BothStrands,Description="Variant not seen on both strands">
-##FILTER=<ID=HARD_TO_VALIDATE,Description="MQ0 >= 4 && (MQ0 / (1.0 * DP)) > 0.1">
-##FILTER=<ID=HP10,Description="Variant occurs in long homopolymer run (>10)">
-##FILTER=<ID=HaplotypeScore,Description="HaplotypeScore>20.0">
-##FILTER=<ID=HighCoverage,Description="Coverage at variant site is > 7500">
-##FILTER=<ID=HomopolymerRun,Description="HRun>=15">
-##FILTER=<ID=LongRepeat,Description="Variant occurs in long tandem repeat (as defined by 1kg phase one filters)">
-##FILTER=<ID=LowQual,Description="QUAL<30.0">
-##FILTER=<ID=PP20,Description="Variant posterior phred is < 20">
-##FILTER=<ID=QualByDepth,Description="QD<1.0">
-##FILTER=<ID=StrandBias,Description="SB>=-1.0">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche93.00to94.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 3.9628 <= x < 4.1824">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche94.00to95.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 3.7129 <= x < 3.9628">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche95.00to96.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 3.3717 <= x < 3.7129">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche96.00to97.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 2.8762 <= x < 3.3717">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche97.00to98.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 2.2618 <= x < 2.8762">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche98.00to99.00+,Description="Truth sensitivity tranche level at VQS Lod < 1.2907">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche98.00to99.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 1.2907 <= x < 2.2618">
-##FORMAT=<ID=AA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele observations">
-##FORMAT=<ID=AD,Number=.,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed">
-##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read Depth (only filtered reads used for calling)">
-##FORMAT=<ID=FT,Number=1,Type=String,Description="Sample Genotype Filter">
-##FORMAT=<ID=GL,Number=3,Type=Integer,Description="Genotype Likelihood, log-scaled likeilhoods of the data given the called genotype for each possible genotype generated from the reference and alternate alleles given the sample ploidy">
-##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Float,Description="Genotype Quality">
-##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
-##FORMAT=<ID=HQ,Number=.,Type=Integer,Description="Haplotype Quality">
-##FORMAT=<ID=PL,Number=3,Type=Float,Description="Normalized, Phred-scaled likelihoods for AA,AB,BB genotypes where A=ref and B=alt; not applicable if site is not biallelic">
-##FORMAT=<ID=RA,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele observations">
-##FORMAT=<ID=SA,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
-##FORMAT=<ID=SP,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled strand bias P-value">
-##FORMAT=<ID=SR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
-##INFO=<ID=AA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele observations">
-##INFO=<ID=AB,Number=1,Type=Float,Description="Allele balance at heterozygous sites: a number between 0 and 1 representing the ratio of reads showing the reference allele to all reads, considering only reads from individuals called as heterozygous">
-##INFO=<ID=ABA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele balance count: the number of sequence reads from apparent heterozygotes supporting the alternate allele">
-##INFO=<ID=ABP,Number=1,Type=Float,Description="Allele balance probability at heterozygous sites: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between ABR and ABA given E(ABR/ABA) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
-##INFO=<ID=ABR,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele balance count: the number of sequence reads from apparent heterozygotes supporting the reference allele">
-##INFO=<ID=AC,Number=.,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
-##INFO=<ID=AF,Number=.,Type=Float,Description="Allele Frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
-##INFO=<ID=AF1,Number=1,Type=Float,Description="Max-likelihood estimate of the site allele frequency of the first ALT allele">
-##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
-##INFO=<ID=BL,Number=1,Type=Integer,Description="Base Pairs Left: number of base pairs in reads supporting the alternate to the left (5') of the alternate allele">
-##INFO=<ID=BR,Number=1,Type=Integer,Description="Base Pairs Right: number of base pairs in reads supporting the alternate to the right (3') of the alternate allele">
-##INFO=<ID=BVAR,Number=0,Type=Flag,Description="The best genotype combination in the posterior is variant (non homozygous).">
-##INFO=<ID=BaseQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt Vs. Ref base qualities">
-##INFO=<ID=CI95,Number=2,Type=Float,Description="Equal-tail Bayesian credible interval of the site allele frequency at the 95% level">
-##INFO=<ID=CpG,Number=0,Type=Flag,Description="CpG site (either CpG, TpG or CpA)">
-##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP Membership">
-##INFO=<ID=DEL,Number=0,Type=Flag,Description="deletion allele">
-##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Filtered Depth">
-##INFO=<ID=DP4,Number=4,Type=Integer,Description="# high-quality ref-forward bases, ref-reverse, alt-forward and alt-reverse bases">
-##INFO=<ID=DS,Number=0,Type=Flag,Description="Were any of the samples downsampled?">
-##INFO=<ID=Dels,Number=1,Type=Float,Description="Fraction of Reads Containing Spanning Deletions">
-##INFO=<ID=EL,Number=1,Type=Integer,Description="Allele End Left: number of observations of the alternate where the alternate occurs in the left end of the read">
-##INFO=<ID=EPP,Number=1,Type=Float,Description="End Placement Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between EL and ER given E(EL/ER) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
-##INFO=<ID=ER,Number=1,Type=Integer,Description="Allele End Right: number of observations of the alternate where the alternate occurs in the right end of the read">
-##INFO=<ID=FQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred probability that sample chromosomes are not all the same">
-##INFO=<ID=FR,Number=0,Type=Float,Description="Estimated population frequency">
-##INFO=<ID=FS,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled p-value using Fisher's exact test to detect strand bias">
-##INFO=<ID=HETAR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of individuals heterozygous alternate / reference">
-##INFO=<ID=HOMA,Number=1,Type=Integer,Description="Number of individuals homozygous for the alternate">
-##INFO=<ID=HOMR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of individuals homozygous for the reference">
-##INFO=<ID=HP,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolmer run length">
-##INFO=<ID=HPLen,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer length">
-##INFO=<ID=HR,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length">
-##INFO=<ID=HRun,Number=1,Type=Integer,Description="Largest Contiguous Homopolymer Run of Variant Allele In Either Direction">
-##INFO=<ID=HU,Number=1,Type=String,Description="Homopolymer run unit (stranded)">
-##INFO=<ID=HaplotypeScore,Number=1,Type=Float,Description="Consistency of the site with at most two segregating haplotypes">
-##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Not provided in original VCF header">
-##INFO=<ID=INS,Number=0,Type=Flag,Description="insertion allele">
-##INFO=<ID=InbreedingCoeff,Number=1,Type=Float,Description="Inbreeding coefficient as estimated from the genotype likelihoods per-sample when compared against the Hardy-Weinberg expectation">
-##INFO=<ID=KGPilot123,Number=0,Type=Flag,Description="1000 Genome discovery all pilots 2010(1,2,3)">
-##INFO=<ID=LEN,Number=1,Type=Integer,Description="allele length">
-##INFO=<ID=LRB,Number=1,Type=Float,Description="((max(BR, BL) / (BR + BL)) - 0.5) * 2 : The proportion of base pairs in reads on one side of the alternate allele relative to total bases, scaled from [0.5,1] to [0,1]">
-##INFO=<ID=LRBP,Number=1,Type=Float,Description="Left-Right Balance Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between BL and BR given E(BR/BL) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
-##INFO=<ID=MNP,Number=0,Type=Flag,Description="MNP allele">
-##INFO=<ID=MQ,Number=1,Type=Float,Description="RMS Mapping Quality">
-##INFO=<ID=MQ0,Number=1,Type=Integer,Description="Total Mapping Quality Zero Reads">
-##INFO=<ID=MQ0Fraction,Number=1,Type=Float,Description="Fraction of Mapping Quality Zero Reads">
-##INFO=<ID=MQM,Number=1,Type=Float,Description="Mean mapping quality of observed alternate alleles">
-##INFO=<ID=MQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read mapping qualities">
-##INFO=<ID=NF,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of forward reads containing this variant">
-##INFO=<ID=NR,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of reads containing this variant">
-##INFO=<ID=NS,Number=1,Type=Integer,Description="Number of samples with data">
-##INFO=<ID=PP,Number=0,Type=Float,Description="Posterior probability (phred scaled) that this variant segregates">
-##INFO=<ID=PV4,Number=4,Type=Float,Description="P-values for strand bias, baseQ bias, mapQ bias and tail distance bias">
-##INFO=<ID=QD,Number=1,Type=Float,Description="Variant Confidence/Quality by Depth">
-##INFO=<ID=RA,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele observations">
-##INFO=<ID=RL,Number=1,Type=Integer,Description="Reads Placed Left: number of reads supporting the alternate balanced to the left (5') of the alternate allele">
-##INFO=<ID=RPP,Number=1,Type=Float,Description="Read Placement Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between RPL and RPR given E(RPL/RPR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
-##INFO=<ID=RR,Number=1,Type=Integer,Description="Reads Placed Right: number of reads supporting the alternate balanced to the right (3') of the alternate allele">
-##INFO=<ID=RUN,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length: the number of consecutive nucleotides in the reference genome matching the alternate allele prior to the current position">
-##INFO=<ID=ReadPosRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read position bias">
-##INFO=<ID=SAB,Number=1,Type=Float,Description="Strand bias for the alternate allele: SAF / ( SAF + SAR )">
-##INFO=<ID=SAF,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations on the forward strand">
-##INFO=<ID=SAP,Number=1,Type=Float,Description="Strand balance probability for the alternate allele: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between SAF and SAR given E(SAF/SAR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
-##INFO=<ID=SAR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations on the reverse strand">
-##INFO=<ID=SB,Number=1,Type=Float,Description="Strand Bias">
-##INFO=<ID=SC,Number=1,Type=String,Description="Genomic sequence 10 bases either side of variant position">
-##INFO=<ID=SNP,Number=0,Type=Flag,Description="SNP allele">
-##INFO=<ID=SRB,Number=1,Type=Float,Description="Strand bias for the reference allele: SRF / ( SRF + SRR )">
-##INFO=<ID=SRF,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations on the forward strand">
-##INFO=<ID=SRP,Number=1,Type=Float,Description="Strand balance probability for the reference allele: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between SRF and SRR given E(SRF/SRR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
-##INFO=<ID=SRR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations on the reverse strand">
-##INFO=<ID=TC,Number=0,Type=Integer,Description="Total coverage">
-##INFO=<ID=TR,Number=1,Type=Integer,Description="Tandem repeat run length (bp)">
-##INFO=<ID=TS,Number=0,Type=Flag,Description="transition SNP">
-##INFO=<ID=TU,Number=1,Type=String,Description="tandem repeat run unit (stranded)">
-##INFO=<ID=TV,Number=0,Type=Flag,Description="transversion SNP">
-##INFO=<ID=VLD,Number=0,Type=Flag,Description="Is Validated. This bit is set if the snp has 2+ minor allele count based on frequency or genotype data.">
-##INFO=<ID=VQSLOD,Number=1,Type=Float,Description="Log odds ratio of being a true variant versus being false under the trained gaussian mixture model">
-##INFO=<ID=dbSNP,Number=1,Type=Integer,Description="First SNP Build for RS">
-##INFO=<ID=set,Number=1,Type=String,Description="Source VCF for the merged record in CombineVariants">
-##LeftAlignVariants="analysis_type=LeftAlignVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20] excludeIntervals=null reference_sequence=/seq/references/Homo_sapiens_assembly19/v1/Homo_sapiens_assembly19.fasta rodBind=[/humgen/gsa-scr1/ebanks/ALL.chr20.Oxford.20110407.indels.genotypes.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub"
-##SelectVariants="analysis_type=SelectVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20] excludeIntervals=null reference_sequence=/seq/references/Homo_sapiens_assembly19/v1/Homo_sapiens_assembly19.fasta rodBind=[/humgen/gsa-scr1/delangel/officialCalls/20110201_chr20_phase1_indels/dindel/20110208.chr20.dindel2.ALL.sites.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sample=null select_expressions=[] excludeNonVariants=false excludeFiltered=false discordance= concordance= family_structure= mendelianViolation=false mendelianViolationQualThreshold=0.0 select_random_number=0 select_random_fraction=0.0 selectSNPs=false selectIndels=true"
-##UnifiedGenotyper="analysis_type=UnifiedGenotyper input_file=[/broad/shptmp/delangel/calls/chr20/CHB.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/CHS.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/CLM.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/JPT.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/MXL.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/PUR.phase1.chr20.42.cleaned.bam] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20:41000001-42000000] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/humgen/gsa-scr1/delangel/otherIndelCallerAnalysis/ALL.indels.combined.chr20.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/GATK/data/dbsnp_132_b37.leftAligned.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=50 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=8 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false genotype_likelihoods_model=INDEL p_nonref_model=EXACT heterozygosity=0.0010 pcr_error_rate=1.0E-4 genotyping_mode=GENOTYPE_GIVEN_ALLELES output_mode=EMIT_ALL_SITES standard_min_confidence_threshold_for_calling=4.0 standard_min_confidence_threshold_for_emitting=4.0 noSLOD=false assume_single_sample_reads=null abort_at_too_much_coverage=-1 min_base_quality_score=17 min_mapping_quality_score=20 max_deletion_fraction=0.05 min_indel_count_for_genotyping=5 indel_heterozygosity=1.25E-4 indelGapContinuationPenalty=10.0 indelGapOpenPenalty=45.0 indelHaplotypeSize=80 doContextDependentGapPenalties=true getGapPenaltiesFromData=false indel_recal_file=indel.recal_data.csv indelDebug=false dovit=false GSA_PRODUCTION_ONLY=false exactCalculation=LINEAR_EXPERIMENTAL ignoreSNPAlleles=true output_all_callable_bases=false genotype=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub debug_file=null metrics_file=null annotation=[MappingQualityZeroFraction]"
-##VariantFiltration="analysis_type=VariantFiltration input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[/humgen/1kg/processing/pipeline_test_bams/chr22_chunked.hg19.intervals] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/broad/shptmp/rpoplin/ALL.phase1.chr22.raw.indels.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false enable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null quiet_output_mode=false debug_mode=false help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub filterExpression=[MQ0 >= 4 && (MQ0 / (1.0 * DP)) > 0.1, QUAL<30.0, SB>=-1.0, QD<1.0, HRun>=15, HaplotypeScore>20.0] filterName=[HARD_TO_VALIDATE, LowQual, StrandBias, QualByDepth, HomopolymerRun, HaplotypeScore] genotypeFilterExpression=[] genotypeFilterName=[] clusterSize=3 clusterWindowSize=0 maskName=Mask missingValuesInExpressionsShouldEvaluateAsFailing=false"
-##commandline="/share/software/freebayes/bin/freebayes --stdin --min-alternate-count 2 --genotype-combo-step-max 20 --genotype-variant-threshold 4 --no-marginals --pvar 0.0001 --indels --mnps --no-filters --binomial-obs-priors --allele-balance-priors --region 20:0..100000 --vcf /d1/data/1000G/20101123/populations/finalised.phase1/integrated/including454/wg/ALL/Pipeline/none//freebayes/freebayes.20:0-100000.baq.20110328.vcf --fasta-reference /d2/data/references/build_37/human_reference_v37.fa"
-##fileDate=2011-03-28
-##filedate=2011-02-08
-##filter="( SNP | MNP ) & ( MQM > 65 | QUAL > 1 ) & ABP < 30 & AB < 0.9 | ( INS | DEL ) & QUAL > 500"
-##phasing=none
-##platypusOptions={'bamFiles': ['/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06984', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06985', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06986', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06989', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06994', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07000', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07037', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07048', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07051', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07056', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07346', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07347', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07357', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA10847', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA10851', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11829', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11830', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11831', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11832', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11843', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11881', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11892', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11893', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11894', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11918', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11919', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11920', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11930', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11931', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11932', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11933', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11992', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11993', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11994', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11995', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12003', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12004', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12005', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12006', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12043', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12044', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12045', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12046', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12058', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12144', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12154', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12155', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12156', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12234', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12249', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12272', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12273', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12275', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12282', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12283', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12286', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12287', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12340', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12341', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12342', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12347', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12348', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12383', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12399', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12400', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12413', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12414', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12489', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12546', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12716', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12717', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12718', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12748', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12749', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12750', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12751', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12761', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12763', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12775', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12776', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12777', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12778', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12813', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12827', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12828', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12829', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12830', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12842', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12843', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12889', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12890', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18486', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18487', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18488', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18489', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18498', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18499', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18501', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18502', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18504', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18505', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18507', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18508', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18510', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18511', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18516', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18517', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18519', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18520', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18522', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18523', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18526', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18530', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18532', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18533', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18534', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18535', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18536', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18537', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18538', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18539', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18541', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18542', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18543', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18544', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18545', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18546', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18547', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18548', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18549', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18550', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18552', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18553', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18555', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18557', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18558', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18559', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18560', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18561', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18562', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18563', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18564', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18565', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18566', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18567', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18570', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18571', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18572', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18573', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18574', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18576', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18577', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18579', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18582', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18592', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18593', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18595', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18596', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18597', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18599', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18602', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18603', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18605', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18606', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18608', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18609', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18610', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18611', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18612', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18613', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18614', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18615', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18616', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18617', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18618', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18619', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18620', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18621', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18622', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18623', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18624', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18625', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18626', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18627', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18628', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18630', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18631', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18632', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18633', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18634', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18635', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18636', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18637', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18638', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18853', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18856', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18858', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18861', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18867', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18868', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18870', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18871', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18873', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18874', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18907', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18908', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18909', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18910', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18912', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18916', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18917', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18923', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18924', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18933', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18934', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18940', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18941', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18942', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18943', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18944', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18945', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18947', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18948', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18949', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18950', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18951', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18952', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18953', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18956', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18959', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18960', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18961', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18963', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18964', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18965', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18967', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18968', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18971', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18972', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18973', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18974', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18975', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18976', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18977', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18980', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18981', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18982', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18983', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18984', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18985', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18986', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18987', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18988', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18989', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18990', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18991', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18999', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19000', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19002', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19003', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19004', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19005', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19007', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19009', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19010', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19012', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19054', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19055', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19056', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19057', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19058', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19059', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19060', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19062', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19063', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19064', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19065', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19066', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19067', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19068', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19070', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19072', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19074', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19075', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19076', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19077', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19078', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19079', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19080', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19081', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19082', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19083', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19084', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19085', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19087', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19088', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19092', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19093', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19098', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19099', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19102', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19107', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19108', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19114', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19116', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19119', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19129', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19130', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19131', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19137', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19138', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19144', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19147', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19152', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19153', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19159', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19160', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19171', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19172', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19189', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19190', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19197', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19198', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19200', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19201', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19204', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19207', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19209', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19210', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19213', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19223', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19225', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19235', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19236', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19247', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19248', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19256', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19257', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19311', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19312', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19313', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19315', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19316', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19317', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19318', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19319', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19321', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19324', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19327', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19328', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19331', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19332', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19334', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19338', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19346', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19347', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19350', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19355', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19359', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19360', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19371', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19372', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19373', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19374', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19375', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19376', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19377', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19379', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19380', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19381', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19382', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19383', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19384', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19385', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19390', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19391', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19393', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19394', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19395', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19396', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19397', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19398', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19399', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19401', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19403', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19404', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19428', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19429', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19430', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19431', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19434', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19435', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19436', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19437', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19438', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19439', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19440', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19443', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19444', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19445', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19446', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19448', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19449', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19451', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19452', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19453', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19455', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19456', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19457', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19461', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19462', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19463', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19466', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19467', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19468', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19469', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19470', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19471', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19472', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19473', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19474', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19625', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19648', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19649', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19651', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19652', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19654', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19655', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19657', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19658', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19660', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19661', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19663', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19664', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19670', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19675', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19676', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19678', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19679', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19681', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19682', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19684', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19685', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19700', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19701', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19703', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19704', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19707', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19711', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19712', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19713', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19716', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19717', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19719', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19720', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19722', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19723', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19725', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19726', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19728', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19729', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19731', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19732', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19746', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19747', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19749', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19750', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19755', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19756', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19758', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19759', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19761', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19762', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19770', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19771', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19773', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19774', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19776', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19777', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19779', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19780', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19782', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19783', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19785', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19786', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19788', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19789', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19818', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19819', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19834', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19835', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19900', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19901', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19904', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19908', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19909', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19914', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19916', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19917', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19920', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19921', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19982', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19985', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20126', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20127', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20276', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20278', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20281', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20282', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20287', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20289', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20291', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20294', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20296', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20299', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20314', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20317', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20322', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20332', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20334', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20336', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20340', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20341', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20342', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20344', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20346', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20348', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20356', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20502', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20503', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20504', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20505', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20506', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20507', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20508', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20509', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20510', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20512', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20513', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20514', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20515', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20516', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20517', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20518', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20519', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20520', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20521', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20522', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20524', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20525', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20526', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20527', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20528', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20529', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20530', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20531', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20532', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20533', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20534', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20535', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20536', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20537', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20538', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20539', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20540', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20541', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20542', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20543', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20544', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20581', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20582', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20585', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20586', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20588', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20589', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20752', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20753', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20754', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20755', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20756', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20757', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20758', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20759', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20760', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20761', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20765', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20766', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20768', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20769', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20770', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20771', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20772', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20773', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20774', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20775', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20778', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20783', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20785', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20786', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20787', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20790', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20792', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20795', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20796', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20797', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20798', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20799', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20800', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20801', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20802', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20803', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20804', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20805', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20806', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20807', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20808', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20809', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20810', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20811', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20812', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20813', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20814', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20815', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20816', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20818', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20819', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20826', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20828', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00096', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00098', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00100', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00103', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00106', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00108', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00111', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00112', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00114', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00115', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00116', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00117', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00118', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00119', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00120', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00122', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00123', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00124', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00125', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00126', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00127', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00131', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00133', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00136', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00137', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00138', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00139', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00140', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00141', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00142', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00143', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00144', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00145', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00146', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00147', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00148', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00149', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00150', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00151', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00152', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00153', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00154', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00155', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00156', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00157', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00158', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00159', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00160', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00171', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00173', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00174', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00176', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00177', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00178', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00179', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00180', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00181', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00182', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00183', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00185', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00186', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00187', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00188', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00189', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00190', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00231', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00232', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00233', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00236', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00237', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00239', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00242', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00243', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00244', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00245', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00246', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00247', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00249', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00250', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00251', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00252', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00253', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00254', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00256', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00257', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00258', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00259', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00260', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00261', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00262', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00263', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00264', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00265', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00266', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00267', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00268', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00269', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00270', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00271', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00272', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00273', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00274', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00275', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00276', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00277', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00278', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00280', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00281', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00282', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00284', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00285', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00306', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00308', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00309', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00310', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00311', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00312', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00313', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00315', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00318', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00319', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00320', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00321', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00323', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00324', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00325', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00326', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00327', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00328', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00329', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00330', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00331', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00334', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00335', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00336', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00337', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00338', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00339', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00342', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00343', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00344', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00345', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00346', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00353', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00357', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00361', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00366', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00367', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00368', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00369', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00372', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00373', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00375', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00377', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00380', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00403', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00404', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00418', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00419', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00421', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00422', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00427', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00428', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00436', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00437', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00442', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00443', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00448', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00449', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00463', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00464', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00472', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00473', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00475', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00476', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00478', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00479', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00500', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00501', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00512', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00513', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00524', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00525', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00530', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00531', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00533', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00534', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00536', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00537', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00542', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00543', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00551', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00553', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00554', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00556', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00557', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00559', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00560', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00565', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00566', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00577', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00578', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00580', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00581', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00583', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00584', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00589', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00590', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00592', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00593', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00595', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00596', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00607', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00608', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00610', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00611', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00613', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00614', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00619', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00620', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00625', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00626', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00628', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00629', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00634', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00635', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00637', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00638', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00640', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00641', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00650', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00651', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00653', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00654', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00656', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00657', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00662', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00663', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00671', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00672', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00683', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00684', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00689', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00690', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00692', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00693', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00698', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00699', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00701', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00702', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00704', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00705', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00707', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00708', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00731', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00732', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00734', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00736', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00737', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00739', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00740', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01047', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01048', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01051', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01052', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01055', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01060', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01061', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01066', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01067', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01069', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01070', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01072', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01073', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01075', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01079', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01080', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01082', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01083', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01094', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01095', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01097', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01098', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01101', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01102', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01107', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01108', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01110', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01111', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01112', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01113', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01124', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01125', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01133', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01134', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01136', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01137', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01140', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01148', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01149', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01167', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01168', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01170', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01171', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01173', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01174', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01176', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01177', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01182', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01183', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01187', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01188', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01190', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01191', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01197', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01198', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01204', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01250', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01251', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01253', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01254', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01334', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01342', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01350', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01351', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01353', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01354', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01356', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01357', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01359', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01360', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01365', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01366', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01374', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01375', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01377', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01378', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01383', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01384', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01389', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01390', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01437', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01440', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01441', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01455', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01456', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01461', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01462', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01464', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01465', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01488', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01489', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01491', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01492', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01494', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01495', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01497', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01498', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01515', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01516', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01518', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01519', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01521', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01522', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01550', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01551'], 'minReads': 2, 'refFile': '/scratch/rimmer/Genomes/human_g1k_v37_ebv.fa', 'maxHaplotypes': 64, 'maxSize': 100, 'ploidy': 2, 'maxRegionSize': 10000, 'nCPU': 1, 'minFlank': 3, 'logFileName': 'LogsAllPhaseOne/ThousandGenomesPhaseOneCalls_20:1-100001.log', 'regions': ['20:1-100001'], 'maxVariants': 6, 'genIndels': 1, 'labels': None, 'dataType': 'population', 'minMapQual': 20, 'rlen': 100, 'nInd': 994, 'getVariantsFromBAMs': 1, 'genSNPs': 1, 'minReadQual': 20, 'maxCoverage': 1000000.0, 'verbosity': 2, 'sourceFile': None, 'callOnlyIndels': 1, 'output': 'VariantCallsAllPhaseOne/ThousandGenomesPhaseOneCalls_20:1-100001.vcf'}
-##reference=/lustre/scratch105/projects/g1k/ref/main_project/human_g1k_v37.fasta
-##source=Dindel2
-##source=SelectVariants
-##source_20110031.1=/nfs/users/nfs_p/pd3/cvs/vcftools/perl/vcf-annotate -d /nfs/users/nfs_p/pd3/sandbox/hapmap/dbSNP-b132/non-1kg-vld.desc -a /nfs/users/nfs_p/pd3/sandbox/hapmap/dbSNP-b132/non-1kg-vld.tab.gz -c CHROM,FROM,INFO/VLD,INFO/KGPilot123,INFO/dbSNP
-##vcfCTools=filter
-##vcfCtools=merge freebayes.20:0-100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:100000-200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:200000-300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:300000-400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:400000-500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:500000-600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:600000-700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:700000-800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:800000-900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:900000-1000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1000000-1100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1100000-1200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1200000-1300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1300000-1400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1400000-1500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1500000-1600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1600000-1700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1700000-1800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1800000-1900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1900000-2000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2000000-2100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2100000-2200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2200000-2300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2300000-2400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2400000-2500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2500000-2600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2600000-2700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2700000-2800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2800000-2900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2900000-3000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3000000-3100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3100000-3200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3200000-3300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3300000-3400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3400000-3500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3500000-3600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3600000-3700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3700000-3800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3800000-3900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3900000-4000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4000000-4100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4100000-4200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4200000-4300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4300000-4400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4400000-4500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4500000-4600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4600000-4700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4700000-4800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4800000-4900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4900000-5000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5000000-5100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5100000-5200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5200000-5300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5300000-5400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5400000-5500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5500000-5600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5600000-5700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5700000-5800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5800000-5900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5900000-6000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6000000-6100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6100000-6200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6200000-6300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6300000-6400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6400000-6500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6500000-6600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6600000-6700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6700000-6800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6800000-6900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6900000-7000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7000000-7100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7100000-7200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7200000-7300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7300000-7400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7400000-7500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7500000-7600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7600000-7700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7700000-7800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7800000-7900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7900000-8000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8000000-8100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8100000-8200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8200000-8300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8300000-8400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8400000-8500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8500000-8600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8600000-8700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8700000-8800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8800000-8900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8900000-9000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9000000-9100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9100000-9200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9200000-9300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9300000-9400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9400000-9500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9500000-9600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9600000-9700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9700000-9800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9800000-9900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9900000-10000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10000000-10100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10100000-10200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10200000-10300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10300000-10400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10400000-10500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10500000-10600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10600000-10700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10700000-10800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10800000-10900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10900000-11000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11000000-11100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11100000-11200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11200000-11300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11300000-11400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11400000-11500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11500000-11600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11600000-11700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11700000-11800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11800000-11900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11900000-12000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12000000-12100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12100000-12200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12200000-12300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12300000-12400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12400000-12500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12500000-12600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12600000-12700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12700000-12800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12800000-12900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12900000-13000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13000000-13100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13100000-13200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13200000-13300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13300000-13400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13400000-13500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13500000-13600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13600000-13700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13700000-13800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13800000-13900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13900000-14000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14000000-14100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14100000-14200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14200000-14300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14300000-14400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14400000-14500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14500000-14600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14600000-14700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14700000-14800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14800000-14900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14900000-15000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15000000-15100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15100000-15200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15200000-15300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15300000-15400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15400000-15500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15500000-15600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15600000-15700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15700000-15800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15800000-15900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15900000-16000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16000000-16100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16100000-16200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16200000-16300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16300000-16400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16400000-16500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16500000-16600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16600000-16700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16700000-16800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16800000-16900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16900000-17000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17000000-17100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17100000-17200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17200000-17300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17300000-17400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17400000-17500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17500000-17600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17600000-17700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17700000-17800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17800000-17900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17900000-18000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18000000-18100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18100000-18200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18200000-18300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18300000-18400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18400000-18500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18500000-18600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18600000-18700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18700000-18800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18800000-18900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18900000-19000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19000000-19100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19100000-19200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19200000-19300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19300000-19400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19400000-19500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19500000-19600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19600000-19700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19700000-19800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19800000-19900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19900000-20000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20000000-20100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20100000-20200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20200000-20300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20300000-20400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20400000-20500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20500000-20600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20600000-20700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20700000-20800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20800000-20900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20900000-21000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21000000-21100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21100000-21200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21200000-21300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21300000-21400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21400000-21500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21500000-21600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21600000-21700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21700000-21800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21800000-21900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21900000-22000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22000000-22100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22100000-22200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22200000-22300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22300000-22400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22400000-22500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22500000-22600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22600000-22700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22700000-22800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22800000-22900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22900000-23000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23000000-23100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23100000-23200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23200000-23300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23300000-23400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23400000-23500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23500000-23600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23600000-23700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23700000-23800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23800000-23900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23900000-24000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24000000-24100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24100000-24200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24200000-24300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24300000-24400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24400000-24500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24500000-24600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24600000-24700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24700000-24800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24800000-24900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24900000-25000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25000000-25100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25100000-25200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25200000-25300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25300000-25400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25400000-25500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25500000-25600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25600000-25700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25700000-25800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25800000-25900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25900000-26000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26000000-26100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26100000-26200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26200000-26300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26300000-26400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26400000-26500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26500000-26600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26600000-26700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26700000-26800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26800000-26900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26900000-27000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27000000-27100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27100000-27200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27200000-27300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27300000-27400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27400000-27500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27500000-27600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27600000-27700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27700000-27800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27800000-27900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27900000-28000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28000000-28100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28100000-28200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28200000-28300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28300000-28400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28400000-28500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28500000-28600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28600000-28700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28700000-28800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28800000-28900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28900000-29000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29000000-29100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29100000-29200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29200000-29300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29300000-29400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29400000-29500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29500000-29600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29600000-29700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29700000-29800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29800000-29900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29900000-30000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30000000-30100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30100000-30200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30200000-30300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30300000-30400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30400000-30500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30500000-30600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30600000-30700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30700000-30800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30800000-30900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30900000-31000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31000000-31100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31100000-31200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31200000-31300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31300000-31400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31400000-31500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31500000-31600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31600000-31700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31700000-31800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31800000-31900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31900000-32000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32000000-32100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32100000-32200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32200000-32300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32300000-32400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32400000-32500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32500000-32600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32600000-32700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32700000-32800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32800000-32900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32900000-33000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33000000-33100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33100000-33200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33200000-33300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33300000-33400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33400000-33500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33500000-33600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33600000-33700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33700000-33800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33800000-33900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33900000-34000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34000000-34100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34100000-34200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34200000-34300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34300000-34400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34400000-34500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34500000-34600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34600000-34700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34700000-34800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34800000-34900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34900000-35000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35000000-35100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35100000-35200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35200000-35300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35300000-35400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35400000-35500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35500000-35600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35600000-35700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35700000-35800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35800000-35900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35900000-36000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36000000-36100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36100000-36200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36200000-36300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36300000-36400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36400000-36500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36500000-36600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36600000-36700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36700000-36800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36800000-36900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36900000-37000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37000000-37100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37100000-37200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37200000-37300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37300000-37400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37400000-37500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37500000-37600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37600000-37700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37700000-37800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37800000-37900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37900000-38000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38000000-38100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38100000-38200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38200000-38300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38300000-38400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38400000-38500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38500000-38600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38600000-38700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38700000-38800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38800000-38900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38900000-39000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39000000-39100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39100000-39200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39200000-39300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39300000-39400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39400000-39500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39500000-39600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39600000-39700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39700000-39800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39800000-39900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39900000-40000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40000000-40100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40100000-40200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40200000-40300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40300000-40400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40400000-40500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40500000-40600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40600000-40700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40700000-40800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40800000-40900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40900000-41000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41000000-41100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41100000-41200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41200000-41300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41300000-41400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41400000-41500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41500000-41600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41600000-41700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41700000-41800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41800000-41900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41900000-42000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42000000-42100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42100000-42200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42200000-42300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42300000-42400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42400000-42500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42500000-42600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42600000-42700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42700000-42800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42800000-42900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42900000-43000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43000000-43100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43100000-43200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43200000-43300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43300000-43400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43400000-43500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43500000-43600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43600000-43700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43700000-43800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43800000-43900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43900000-44000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44000000-44100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44100000-44200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44200000-44300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44300000-44400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44400000-44500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44500000-44600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44600000-44700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44700000-44800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44800000-44900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44900000-45000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45000000-45100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45100000-45200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45200000-45300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45300000-45400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45400000-45500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45500000-45600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45600000-45700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45700000-45800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45800000-45900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45900000-46000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46000000-46100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46100000-46200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46200000-46300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46300000-46400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46400000-46500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46500000-46600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46600000-46700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46700000-46800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46800000-46900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46900000-47000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47000000-47100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47100000-47200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47200000-47300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47300000-47400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47400000-47500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47500000-47600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47600000-47700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47700000-47800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47800000-47900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47900000-48000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48000000-48100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48100000-48200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48200000-48300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48300000-48400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48400000-48500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48500000-48600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48600000-48700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48700000-48800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48800000-48900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48900000-49000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49000000-49100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49100000-49200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49200000-49300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49300000-49400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49400000-49500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49500000-49600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49600000-49700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49700000-49800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49800000-49900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49900000-50000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50000000-50100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50100000-50200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50200000-50300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50300000-50400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50400000-50500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50500000-50600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50600000-50700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50700000-50800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50800000-50900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50900000-51000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51000000-51100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51100000-51200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51200000-51300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51300000-51400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51400000-51500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51500000-51600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51600000-51700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51700000-51800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51800000-51900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51900000-52000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52000000-52100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52100000-52200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52200000-52300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52300000-52400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52400000-52500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52500000-52600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52600000-52700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52700000-52800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52800000-52900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52900000-53000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53000000-53100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53100000-53200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53200000-53300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53300000-53400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53400000-53500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53500000-53600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53600000-53700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53700000-53800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53800000-53900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53900000-54000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54000000-54100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54100000-54200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54200000-54300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54300000-54400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54400000-54500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54500000-54600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54600000-54700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54700000-54800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54800000-54900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54900000-55000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55000000-55100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55100000-55200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55200000-55300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55300000-55400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55400000-55500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55500000-55600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55600000-55700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55700000-55800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55800000-55900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55900000-56000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56000000-56100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56100000-56200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56200000-56300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56300000-56400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56400000-56500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56500000-56600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56600000-56700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56700000-56800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56800000-56900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56900000-57000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57000000-57100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57100000-57200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57200000-57300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57300000-57400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57400000-57500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57500000-57600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57600000-57700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57700000-57800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57800000-57900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57900000-58000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58000000-58100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58100000-58200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58200000-58300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58300000-58400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58400000-58500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58500000-58600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58600000-58700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58700000-58800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58800000-58900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58900000-59000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59000000-59100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59100000-59200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59200000-59300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59300000-59400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59400000-59500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59500000-59600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59600000-59700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59700000-59800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59800000-59900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59900000-60000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60000000-60100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60100000-60200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60200000-60300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60300000-60400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60400000-60500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60500000-60600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60600000-60700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60700000-60800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60800000-60900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60900000-61000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61000000-61100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61100000-61200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61200000-61300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61300000-61400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61400000-61500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61500000-61600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61600000-61700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61700000-61800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61800000-61900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61900000-62000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62000000-62100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62100000-62200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62200000-62300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62300000-62400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62400000-62500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62500000-62600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62600000-62700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62700000-62800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62800000-62900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62900000-63000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:63000000-63025520.baq.20110328.vcf
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO
-20 458502 . G GA 4567.01 PASS AA=20;AB=0.61111;ABA=14;ABP=6.8707;ABR=22;AC=38;AF=0.0544;AN=698;BL=374;BR=1129;BVAR;BaseQRankSum=13.364;DP=15979;DP4=1882,2188,45,37;Dels=0.00;EL=5;EPP=13.868;ER=15;FR;FS=6.503;HETAR=11;HOMA=2;HOMR=985;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0157;LEN=1;LRB=0.50233;LRBP=826.56;MQ=66.16;MQ0Fraction=0.0110;MQM=70.5;MQRankSum=-3.158;NF;NR;NS=998;PP;PV4=0.15,1,0.42,0.15;RA=3173;RL=1;RPP=38.188;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.346;SAB=0.7;SAF=14;SAP=9.959;SAR=6;SC=GGGCGTGGTGGTGCATGTAAT;SRB=0.50047;SRF=1588;SRP=3.0165;SRR=1585;TC;TR=9;TU=GGT;VQSLOD=10.0079;set=Intersection;sumGLbyD=23.94
-20 539571 . TG T 18546 PASS AA=71;AB=0.92482;ABA=63;ABP=1316.6;ABR=775;AC=42;AF=0.03512;AN=1196;BL=3915;BR=252;BVAR;BaseQRankSum=0.556;DEL;DP=10073;Dels=0.01;EL=47;EPP=19.189;ER=24;FS=2.124;HETAR=290;HOMA=156;HOMR=570;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0620;LEN=1;LRB=0.87905;LRBP=6995.1;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=127.99;MQRankSum=0.410;NS=1016;RA=3090;RL=71;RPP=157.18;RR=0;RUN=1;ReadPosRankSum=-11.038;SAB=0.66197;SAF=47;SAP=19.189;SAR=24;SRB=0.55016;SRF=1700;SRP=70.544;SRR=1390;VQSLOD=2.6772;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.71
-20 573764 . TA T 591.51 PASS AC=91;AF=0.1987;AN=458;BaseQRankSum=0.137;DP=519;FS=3.153;HRun=1;HaplotypeScore=14.0744;InbreedingCoeff=0.1460;MQ=48.16;MQ0=26;MQ0Fraction=0.0501;MQRankSum=-1.636;QD=3.63;ReadPosRankSum=-4.140;SB=-408.14;VQSLOD=5.2458;set=VQSR
-20 766143 . C A,CATCTGGTA 5521.70 PASS AA=24;AB=0.5;ABA=18;ABP=3.0103;ABR=18;AC=14;AF=0.0289;AF1=0.02038;AN=484;BL=655;BR=1542;BVAR;BaseQRankSum=3.801;CI95=0.01549,0.02655;DP=11749;DP4=2222,1998,14,8;Dels=0.00;EL=9;EPP=6.2675;ER=15;FQ=999;FR;FS=2.941;HETAR=9;HOMA=4;HOMR=901;HP=2;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0515;LEN=8;LRB=0.40373;LRBP=780.64;MQ=56.81;MQ0Fraction=0.0253;MQM=22.167;MQRankSum=-4.809;NF;NR;NS=914;PP;PV4=0.39,1,5.8e-07,1;RA=3093;RL=6;RPP=16.039;RR=18;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.827;SAB=0.625;SAF=15;SAP=6.2675;SAR=9;SC=GCTTTAAATTCATCTGGTACT;SRB=0.61623;SRF=1906;SRP=365.95;SRR=1187;TC;TR=1;TU=A;VQSLOD=7.0268;set=Intersection;sumGLbyD=50.23
-20 997076 rs11467490 CTG C 15379.78 PASS AA=195;AB=0.59878;ABA=132;ABP=30.896;ABR=197;AC=173;AF=0.14562;AN=1188;BL=7664;BR=7309;BVAR;BaseQRankSum=21.853;DB;DEL;DP=27127;DP4=1801,2002,241,282;Dels=0.13;EL=100;EPP=3.2887;ER=95;FQ=999;FR;FS=6.591;HETAR=77;HOMA=42;HOMR=815;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1284;LEN=2;LRB=0.023709;LRBP=21.287;MQ=61.18;MQ0Fraction=0.0214;MQM=43.041;MQRankSum=6.886;NF;NR;NS=934;PP;PV4=0.61,1.5e-78,1,1;RA=2800;RL=120;RPP=25.56;RR=75;RUN=1;ReadPosRankSum=4.504;SAB=0.62051;SAF=121;SAP=27.609;SAR=74;SC=CAGCTAATTACTGTATTTTTA;SRB=0.49821;SRF=1395;SRP=3.0879;SRR=1405;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=8.9396;set=Intersection;sumGLbyD=16.76
-20 1042261 rs10597473 CCCTG C 168658.05 PASS AA=4481;AB=0.29043;ABA=2128;ABP=1147.1;ABR=871;AC=1172;AF=0.97830;AN=1198;BL=169975;BR=194027;BVAR;BaseQRankSum=4.599;DB;DEL;DP=29418;DP4=29,47,1441,2403;Dels=0.84;EL=2358;EPP=29.772;ER=2123;FR;FS=9.122;HETAR=482;HOMA=559;HOMR=30;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.0470;LEN=4;LRB=0.066077;LRBP=3454.1;MQ=104.58;MQ0=4;MQ0Fraction=0.0014;MQM=58.257;MQRankSum=-3.368;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=0.91,6.8e-09,2.8e-05,1;RA=1039;RL=2088;RPP=48.09;RR=2393;RUN=1;ReadPosRankSum=5.288;SAB=0.41442;SAF=1857;SAP=288.09;SAR=2624;SC=CCAAACCCAACCCTGCCTGGC;SRB=0.48893;SRF=508;SRP=4.1159;SRR=531;TC;TR=8;TU=CCTG;VQSLOD=8.5148;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=59.79
-20 1046297 rs33956316 C CT,CTT,CTTT 17698 PASS ABR=408;AC=432,79,230;AF=0.39779,0.07274,0.21179;BVAR;BaseQRankSum=-8.413;DB;DP=15649;DP4=147,199,534,436;FR;FS=11.580;HOMA=97;HOMR=457;HP=20;HR=16;HU=T;HaplotypeScore=16.0590;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.6018;KGPilot123;MQ0=19;MQ0Fraction=0.0093;MQRankSum=7.992;NF;NR;NS=767;PP;PV4=6e-05,1,1,1;QD=8.18;RA=1183;RUN=1;ReadPosRankSum=2.684;SB=-6384.08;SC=GGAAAATTTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.40913;SRF=484;SRP=87.859;SRR=699;TC;TR=16;TU=T;VQSLOD=8.4941;dbSNP=132;set=Intersection
-20 1405740 . T TA 257.28 PASS AF=0.0188;BaseQRankSum=-0.745;DP=3769;Dels=0.00;FS=0.742;HPLen=9;HRun=9;InbreedingCoeff=0.0462;MQ0Fraction=0.0151;MQRankSum=-0.090;ReadPosRankSum=-1.582;VQSLOD=5.6502;set=Intersection;sumGLbyD=6.94
-20 1690501 . TC T 27928 PASS AA=108;AB=0.91372;ABA=100;ABP=1726.1;ABR=1059;AC=35;AF=0.02966;AN=1180;BL=593;BR=6973;BVAR;BaseQRankSum=7.567;DEL;DP=10612;Dels=0.01;EL=50;EPP=4.2971;ER=58;FS=0.000;HETAR=378;HOMA=184;HOMR=477;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0495;LEN=1;LRB=0.84325;LRBP=11685;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=87.361;MQRankSum=4.088;NS=1045;RA=3125;RL=3;RPP=212.2;RR=105;RUN=1;ReadPosRankSum=-13.096;SAB=0.56481;SAF=61;SAP=6.9511;SAR=47;SRB=0.51776;SRF=1618;SRP=11.572;SRR=1507;VQSLOD=3.9824;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.07
-20 1948787 . GTC G,GTCTC 78.70 PASS AC=18,18;AF=0.01466,0.01466;AN=1228;BaseQRankSum=3.894;DP=19030;DP4=1874,1916,21,20;FR;FS=0.767;HP=2;HPLen=1;HR=1;HU=T;HaplotypeScore=16.5619;INDEL;InbreedingCoeff=0.2332;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=2.080;NF;NR;PP;PV4=0.88,1,0.094,0.47;QD=0.28;ReadPosRankSum=0.822;SB=-172.46;SC=CTCGACCCCTGTCTCTCTCTC;TC;TR=13;TU=CT;VQSLOD=3.7405;set=filterInVQSR-2of5
-20 1991285 rs113891396 TAA T,TA,TAAA,TAAAAA,TAAAAAA,TAAAAAAA,TAAAAAAAA 39235.36 PASS AC=5,251,20,39,188,52,79;AF=0.0056,0.2789,0.0222,0.0433,0.2089,0.0578,0.0878;AN=900;BVAR;BaseQRankSum=1.124;DB;DEL;DP=54393;DP4=906,772,824,579;Dels=0.21;FR;FS=37.525;HP=12;HR=12;HRun=12;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.6891;MQ=76.81;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-6.593;NF;NR;PP;PV4=0.0087,1,6.3e-19,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.184;SC=ATCTGCCACTTAAAAAAAAAA;TC;TR=12;TU=A;VQSLOD=9.0007;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=11.45
-20 2355911 . TA T 11723 PASS AA=79;AB=0.9393;ABA=57;ABP=1577;ABR=882;AC=38;AF=0.0411;AN=924;BL=644;BR=5536;BVAR;BaseQRankSum=2.434;DEL;DP=9687;Dels=0.00;EL=45;EPP=6.3362;ER=34;FS=3.043;HETAR=321;HOMA=182;HOMR=555;HRun=5;InbreedingCoeff=0.0412;LEN=1;LRB=0.79159;LRBP=8411.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=70.848;MQRankSum=0.137;NS=1058;RA=3415;RL=3;RPP=149.49;RR=76;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.116;SAB=0.44304;SAF=35;SAP=5.2367;SAR=44;SRB=0.43572;SRF=1488;SRP=125.55;SRR=1927;VQSLOD=3.8910;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.88
-20 2512346 . A AC 11046.11 PASS AC=673;AF=0.57034;AN=1180;BaseQRankSum=19.890;DP=2717;FS=26.809;HRun=0;HaplotypeScore=19.0575;InbreedingCoeff=0.3068;MQ=61.07;MQ0=25;MQ0Fraction=0.0092;MQRankSum=2.745;QD=5.80;ReadPosRankSum=3.139;SB=-4564.39;VQSLOD=4.3252;set=VQSR
-20 2597210 rs71329387 TAAAG T 32206.62 PASS AA=689;AB=0.5805;ABA=542;ABP=75.724;ABR=750;AC=253;AF=0.20738;BL=29921;BR=30215;BVAR;BaseQRankSum=20.638;DB;DEL;DP=29293;DP4=1750,1070,405,274;Dels=0.18;EL=345;EPP=3.0135;ER=344;FQ=999;FR;FS=1.827;HETAR=225;HOMA=55;HOMR=783;HP=7;HPLen=4;HR=3;HRun=0;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1419;LEN=4;LRB=0.0048889;LRBP=6.1314;MQ=66.96;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=42.925;MQRankSum=-7.105;NF;NR;NS=1063;PP;PV4=0.25,1,9e-20,1;RA=4619;RL=345;RPP=3.0135;RR=344;RUN=1;ReadPosRankSum=2.719;SAB=0.53556;SAF=369;SAP=10.577;SAR=320;SC=GAAAGGAAAATAAAGAAGGAG;SRB=0.52414;SRF=2421;SRP=26.389;SRR=2198;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=9.7974;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=33.30
-20 2771621 rs11479849 GT G,GTT 1605.60 PASS AA=80;AB=0.79825;ABA=69;ABP=267.24;ABR=273;AC=79,91;AF=0.06551,0.07546;AN=1206;BL=2593;BR=3805;BVAR;BaseQRankSum=7.825;DB;DP=9790;Dels=0.04;EL=37;EPP=3.9875;ER=43;FR;FS=4.751;HETAR=62;HOMA=5;HOMR=958;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2646;LEN=1;LRB=0.18943;LRBP=501.57;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=52.45;MQRankSum=-0.560;NF;NR;NS=1025;PP;RA=3949;RL=29;RPP=16.148;RR=51;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.397;SAB=0.525;SAF=42;SAP=3.4446;SAR=38;SC=TCATTTTAACGTTTTTTTTTT;SRB=0.54368;SRF=2147;SRP=68.46;SRR=1802;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=3.5989;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.92
-20 2891235 . G GT,GTTT 2869.87 PASS AC=236,246;AF=0.2803,0.2922;AN=842;BaseQRankSum=8.979;DP=1067;FS=3.911;HaplotypeScore=20.3595;InbreedingCoeff=0.6511;MQ=44.86;MQ0=114;MQ0Fraction=0.1068;MQRankSum=-2.273;QD=4.00;ReadPosRankSum=-6.601;SB=-991.85;VQSLOD=5.4379;set=VQSR
-20 3033550 . TGAG T 2005.90 PASS AA=34;AB=0.51429;ABA=34;ABP=3.1344;ABR=36;AC=22;AF=0.0332;AN=662;BL=1374;BR=1649;BVAR;BaseQRankSum=5.192;DEL;DP=14639;DP4=2271,1492,12,21;Dels=0.02;EL=19;EPP=4.0322;ER=15;FR;FS=16.657;HETAR=17;HOMA=0;HOMR=914;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0454;LEN=3;LRB=0.090969;LRBP=57.333;MQ=53.99;MQ0Fraction=0.0304;MQM=46.735;MQRankSum=1.938;NF;NR;NS=931;PP;PV4=0.0068,9.4e-05,1,1;RA=2985;RL=11;RPP=12.207;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.466;SAB=0.41176;SAF=14;SAP=5.3095;SAR=20;SC=CTTGGGAGGCTGAGGTGGGAG;SRB=0.62781;SRF=1874;SRP=426.52;SRR=1111;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=8.9194;set=Intersection;sumGLbyD=24.41
-20 3635363 . T TG 999 PASS AA=16;AB=0.61905;ABA=16;ABP=8.1805;ABR=26;AF=0.0141;AF1=0.01726;AN=708;BL=614;BR=523;BVAR;BaseQRankSum=2.337;CI95=0.01106,0.02434;DP=14594;DP4=2128,2038,6,10;Dels=0.00;EL=7;EPP=3.5532;ER=9;FQ=999;FR;FS=5.579;HETAR=8;HOMA=0;HOMR=1055;HP=3;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0633;LEN=1;LRB=0.080035;LRBP=18.826;MQ=100.74;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=51.312;MQRankSum=2.569;NF;NR;NS=1063;PP;PV4=0.32,1,1,1;RA=5628;RL=9;RPP=3.5532;RR=7;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.941;SAB=0.375;SAF=6;SAP=5.1818;SAR=10;SC=AAGGTTCGCTTGGGTGTGGAG;SRB=0.4984;SRF=2805;SRP=3.1353;SRR=2823;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=9.3275;set=Intersection;sumGLbyD=11.68
-20 3873327 rs61519218 A AAG 683.85 PASS AC=25;AF=0.0313;AN=800;BaseQRankSum=4.839;DB;DP=1718;FS=4.265;HRun=0;HaplotypeScore=20.5789;InbreedingCoeff=0.1055;MQ=53.70;MQ0=37;MQ0Fraction=0.0215;MQRankSum=2.468;QD=6.30;ReadPosRankSum=4.254;SB=-403.21;VQSLOD=6.1858;set=VQSR
-20 4028835 . GC G 2511.30 PASS AA=66;AB=0.56954;ABA=65;ABP=9.3521;ABR=86;AC=22;AF=0.01836;AN=1198;BL=2303;BR=2463;BVAR;BaseQRankSum=7.621;DEL;DP=22795;DP4=1714,2774,22,37;Dels=0.02;EL=34;EPP=3.1419;ER=32;FQ=999;FR;FS=2.095;HETAR=21;HOMA=0;HOMR=1050;HP=2;HPLen=2;HR=2;HRun=2;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.0125;LEN=1;LRB=0.033571;LRBP=14.674;MQ=108.09;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=53.318;MQRankSum=5.257;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=1,5.4e-13,1,0.075;RA=6185;RL=36;RPP=4.1947;RR=30;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.059;SAB=0.45455;SAF=30;SAP=4.1947;SAR=36;SC=TGCTGTCACTGCCTTCTCCTA;SRB=0.42118;SRF=2605;SRP=336.76;SRR=3580;TC;TR=2;TU=C;VQSLOD=10.2409;set=Intersection;sumGLbyD=12.71
-20 4039609 rs67812039 G GA 43457 PASS AA=909;AB=0.54639;ABA=572;ABP=26.583;ABR=689;AC=302;AF=0.3455;AN=874;BL=37070;BR=38211;BVAR;BaseQRankSum=20.147;DB;DP=25595;DP4=1483,1374,528,542;Dels=0.00;EL=467;EPP=4.5033;ER=442;FQ=999;FR;FS=5.441;HETAR=243;HOMA=127;HOMR=608;HP=4;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1388;LEN=1;LRB=0.015157;LRBP=40.563;MQ=119.50;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=83.197;MQRankSum=1.080;NF;NR;NS=978;PP;PV4=0.16,1,3.6e-12,1;RA=3033;RL=443;RPP=4.274;RR=466;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.000;SAB=0.32233;SAF=293;SAP=252.24;SAR=616;SC=TATGTTGGGAGAAATATCAGT;SRB=0.38378;SRF=1164;SRP=358.85;SRR=1869;TC;TR=4;TU=AG;VQSLOD=9.9146;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=16.79
-20 4390056 . TC T 49312 PASS AA=91;AB=0.94353;ABA=86;ABP=2605.4;ABR=1437;AC=39;AF=0.03160;AN=1234;BL=6823;BR=731;BVAR;BaseQRankSum=2.727;DEL;DP=13149;Dels=0.00;EL=41;EPP=4.9431;ER=50;FS=4.002;HETAR=465;HOMA=313;HOMR=292;HRun=3;InbreedingCoeff=0.0326;LEN=1;LRB=0.80646;LRBP=10671;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=69.824;MQRankSum=-0.903;NS=1073;RA=3078;RL=89;RPP=183.62;RR=2;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.526;SAB=0.45055;SAF=41;SAP=4.9431;SAR=50;SRB=0.52567;SRF=1618;SRP=20.622;SRR=1460;VQSLOD=4.3235;set=Intersection;sumGLbyD=3.53
-20 4474622 . TA AA,T,TAA,TAAA,TAAAA 94522.28 PASS ABR=114;AC=38,68,16,900;AF=0.03333,0.05965,0.01404,0.78947;AN=1140;BVAR;BaseQRankSum=9.741;DB;DP=16656;Dels=0.00;FR;FS=2.355;HOMA=3;HOMR=936;HP=10;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.4516;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0008;MQRankSum=-4.096;NF;NR;NS=980;PP;RA=3766;RUN=1;ReadPosRankSum=2.380;SC=AGAAAAAAATTAAAAAAAAAA;SRB=0.49734;SRF=1873;SRP=3.2409;SRR=1893;TC;TR=10;TU=A;VQSLOD=8.8186;set=Intersection;sumGLbyD=38.79
-20 4824911 . AC A 41998.70 PASS AC=1172;AF=0.97342;AN=1204;BaseQRankSum=8.604;DP=3615;FS=9.934;HRun=1;HaplotypeScore=39.6843;InbreedingCoeff=0.0980;MQ=129.80;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=3.378;QD=11.62;ReadPosRankSum=6.967;SB=-16955.28;VQSLOD=4.2689;set=VQSR
-20 4839897 rs35881880 TAA T,TA,TAAA,TAAAAA 3906.80 PASS AC=12,95,137,189;AF=0.01024,0.08106,0.11689,0.16126;AN=1172;BVAR;BaseQRankSum=15.271;DB;DEL;DP=15105;Dels=0.04;FR;FS=43.567;HP=19;HR=13;HRun=13;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.5716;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.569;NF;NR;PP;RUN=1;ReadPosRankSum=-13.794;SC=TGTTAAAAAATAAAAAAAAAA;TC;TR=13;TU=A;VQSLOD=8.1773;set=Intersection;sumGLbyD=3.77
-20 5071386 . AT A 45200.27 PASS AC=685;AF=0.7495;AN=914;BaseQRankSum=11.006;DP=2725;FS=8.133;HRun=3;HaplotypeScore=50.5496;InbreedingCoeff=0.2364;MQ=81.40;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=2.411;QD=18.51;ReadPosRankSum=3.429;SB=-22405.85;VQSLOD=4.2872;set=VQSR
-20 5507414 . G GCC 439.08 PASS AC=23;AF=0.01876;AN=1226;BaseQRankSum=3.051;DP=3023;FS=3.636;HRun=1;HaplotypeScore=30.3104;InbreedingCoeff=0.0204;MQ=112.09;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.065;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.709;SB=-302.22;VQSLOD=4.4311;set=VQSR
-20 5609676 . GA G,GAA 799.89 PASS AA=42;AB=0.79096;ABA=37;ABP=133.16;ABR=140;AC=43,65;AF=0.03607,0.05453;AF1=0.02826;AN=1192;BL=1360;BR=2334;BVAR;BaseQRankSum=5.069;CI95=0.01242,0.04037;DP=15610;DP4=1548,2441,21,30;Dels=0.02;EL=18;EPP=4.8716;ER=24;FQ=12.1;FR;FS=0.000;HETAR=36;HOMA=1;HOMR=991;HP=13;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2001;LEN=1;LRB=0.26367;LRBP=560.68;MQ=63.29;MQ0Fraction=0.0003;MQM=44.143;MQRankSum=1.755;NF;NR;NS=1028;PP;PV4=0.77,1,0.0087,0.0053;RA=4114;RL=15;RPP=10.455;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.978;SAB=0.5;SAF=21;SAP=3.0103;SAR=21;SC=AAAAAAGAAAGAAAAAAAAAA;SRB=0.39742;SRF=1635;SRP=379;SRR=2479;TC;TR=11;TU=AAAG;VQSLOD=4.1229;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=7.95
-20 5736211 rs35303106 CT C,CTT 4384.40 PASS AA=117;AB=0.71499;ABA=116;ABP=166.4;ABR=291;AC=32,145;AF=0.02712,0.12288;AN=1180;BL=5556;BR=4901;BVAR;BaseQRankSum=2.708;DB;DP=9157;Dels=0.01;EL=54;EPP=4.5136;ER=63;FR;FS=2.802;HETAR=79;HOMA=1;HOMR=837;HP=16;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.1903;LEN=1;LRB=0.062637;LRBP=92.1;MQ0Fraction=0.0273;MQM=48.932;MQRankSum=3.654;NF;NR;NS=917;PP;RA=2785;RL=79;RPP=34.209;RR=38;RUN=1;ReadPosRankSum=0.795;SAB=0.5641;SAF=66;SAP=7.1862;SAR=51;SC=TTTTCTTTTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.41795;SRF=1164;SRP=165.85;SRR=1621;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=5.0895;set=Intersection;sumGLbyD=4.66
-20 5898626 rs34483659 CAAA C,CA,CAA,CAAAAA 1140.16 PASS ABR=34;AC=19,98,56,199;AF=0.0227,0.1172,0.0670,0.2380;AF1=0.08519;BVAR;BaseQRankSum=5.049;CI95=0.03727,0.1273;DB;DEL;DP=5091;DP4=539,408,121,123;FQ=4.43;FR;FS=5.701;HOMA=64;HOMR=156;HP=19;HR=18;HU=A;HaplotypeScore=11.5333;INDEL;InbreedingCoeff=0.7405;MQ0=117;MQ0Fraction=0.0986;MQRankSum=6.290;NF;NR;NS=240;PP;PV4=0.043,1,1,0.0087;QD=1.22;RA=204;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.684;SB=-1015.09;SC=ACTAAAAATACAAAAAAAAAA;SRB=0.35294;SRF=72;SRP=41.33;SRR=132;TC;TR=18;TU=A;VQSLOD=4.1696;set=filterInVQSR-2of5
-20 5975126 rs10541892 C CAG 504.78 PASS AC=79;AF=0.07004;AN=1128;BaseQRankSum=10.498;DB;DP=2050;FS=38.228;HRun=0;HaplotypeScore=14.1426;InbreedingCoeff=-0.0053;MQ=60.40;MQ0=80;MQ0Fraction=0.0390;MQRankSum=5.098;QD=1.63;ReadPosRankSum=-4.851;SB=-590.69;VQSLOD=4.8517;set=VQSR
-20 5992611 . G GT 799.56 PASS AA=39;AB=0.8301;ABA=35;ABP=197.98;ABR=171;AC=13;AF=0.0183;AN=712;BL=1164;BR=1566;BVAR;BaseQRankSum=1.914;DP=9561;Dels=0.01;EL=16;EPP=5.7386;ER=23;FS=0.739;HETAR=32;HOMA=0;HOMR=1024;HRun=9;INS;InbreedingCoeff=0.0339;LEN=1;LRB=0.14725;LRBP=131.55;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=97.231;MQRankSum=0.764;NS=1056;RA=5204;RL=16;RPP=5.7386;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.169;SAB=0.69231;SAF=27;SAP=15.538;SAR=12;SRB=0.56399;SRF=2935;SRP=188.09;SRR=2269;VQSLOD=4.6516;set=Intersection;sumGLbyD=5.96
-20 6040983 rs11087710 A AAAAAAGAG,AAAAAGAG,AAAAGAG,AAAAGAGAG,AAAGAG,AAAGAGAG,AAGAG,AAGAGAG,AG,AGAG,AGAGAG 66894.55 PASS ABR=468;AC=80,9,20,136,31,91,33,29,9,3,5;AF=0.0980,0.0110,0.0245,0.1667,0.0380,0.1115,0.0404,0.0355,0.0110,0.0037,0.0061;AN=816;BVAR;BaseQRankSum=-12.470;DB;DP=38726;DP4=426,611,310,472;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=6.635;HOMA=110;HOMR=506;HP=14;HR=15;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.8291;KGPilot123;MQ=54.22;MQ0Fraction=0.0168;MQRankSum=-5.329;NF;NR;NS=861;PP;PV4=0.56,1,6.9e-09,0.31;RA=1828;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.857;SC=AAAAAAAAAAAAGAGAGAGAG;SRB=0.62418;SRF=1141;SRP=247.85;SRR=687;TC;TR=15;TU=A;VQSLOD=9.0574;dbSNP=131;set=Intersection;sumGLbyD=36.72
-20 6903392 . TC CC,T 999 PASS AF=0.0000;AF1=0.01192;CI95=0.008547,0.01709;DP=10440;DP4=2544,2062,9,11;Dels=0.01;FQ=999;FR;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=2;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0324;MQ=62.78;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0009;NF;NR;PP;PV4=0.38,0.0069,0.36,0.41;QD=8.05;SB=-320.13;SC=TTATTTTCTTTCCAATTTTTA;TC;TR=8;TU=CTTT;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=13.22
-20 7024548 . G GAT 5041.27 PASS AC=123;AF=0.10336;AN=1190;BaseQRankSum=23.097;DP=3045;FS=7.979;HRun=0;HaplotypeScore=15.6967;InbreedingCoeff=0.1062;MQ=119.29;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0007;MQRankSum=-3.725;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.636;SB=-2257.45;VQSLOD=5.9332;set=VQSR
-20 7484554 . A AT 5.09 PASS AC=0;AF=0.0000;AN=710;BaseQRankSum=-0.696;DP=1862;FS=2.835;HRun=9;HaplotypeScore=13.5425;InbreedingCoeff=0.0567;MQ=76.92;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.932;ReadPosRankSum=-1.701;VQSLOD=4.3156;set=VQSR
-20 7632194 rs77286341 GAA AAA,G 5324 PASS AC=0;AF=0.0000;AN=700;BaseQRankSum=-1.741;DB;DP=1772;FR;HP=4;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=A;HaplotypeScore=60.1795;InbreedingCoeff=0.0017;MQ=70.69;MQ0=13;MQ0Fraction=0.0073;MQRankSum=-1.315;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-3.650;SC=GAGAGAGAGAGAAAGGTGTAA;TC;TR=13;TU=AG;set=filterInVQSR-2of5
-20 7767508 rs71329674 G GA 17914 PASS AA=415;AB=0.61617;ABA=337;ABP=105.94;ABR=541;AC=141;AF=0.11614;AN=1214;BL=15187;BR=20323;BVAR;BaseQRankSum=-13.946;DB;DP=28222;Dels=0.00;EL=184;EPP=14.569;ER=231;FQ=999;FR;FS=13.296;HETAR=178;HOMA=35;HOMR=822;HP=14;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0714;LEN=1;LRB=0.14464;LRBP=1616.1;MQ=89.69;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=51.667;MQRankSum=0.664;NF;NR;NS=1035;PP;RA=3707;RL=171;RPP=30.894;RR=244;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.120;SAB=0.45301;SAF=188;SAP=10.969;SAR=227;SC=ATTCTAAAAAGAAAAAAAAAT;SRB=0.38495;SRF=1427;SRP=429.23;SRR=2280;TC;TR=9;TU=A;VQSLOD=9.0748;set=Intersection;sumGLbyD=11.09
-20 7920261 . TA T,TAA 802.15 PASS AA=28;AB=0.8;ABA=28;ABP=112.45;ABR=112;AC=22,39;AF=0.01836,0.03255;AN=1198;BL=943;BR=1487;BVAR;BaseQRankSum=2.233;DP=10645;Dels=0.01;EL=11;EPP=5.8022;ER=17;FR;FS=1.691;HETAR=20;HOMA=0;HOMR=1007;HP=10;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.2256;LEN=1;LRB=0.22387;LRBP=267.46;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=57.571;MQRankSum=0.940;NF;NR;NS=1027;PP;RA=4776;RL=8;RPP=14.178;RR=20;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.567;SAB=0.53571;SAF=15;SAP=3.3205;SAR=13;SC=GTAACTGCTATAAAAAAAAAC;SRB=0.48576;SRF=2320;SRP=11.42;SRR=2456;TC;TR=9;TU=A;VQSLOD=4.0815;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.37
-20 8012465 rs10595338 TATGA T 2104.41 PASS AF=0.03339;BaseQRankSum=10.662;DB;DP=11772;DS;Dels=0.01;FR;FS=7.678;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;InbreedingCoeff=0.0266;MQ0Fraction=0.0731;MQRankSum=0.603;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=1.276;SC=TGTATGTATGTATGATGTATG;TC;TR=19;TU=ATGT;VQSLOD=4.1376;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.53
-20 8573999 . CGTGT C,CGT,CGTGTGT,TGTGT 45865.96 PASS AC=458,0,731;AF=0.37727,0.00000,0.60214;AN=1214;BVAR;BaseQRankSum=-6.703;DEL;DP=37714;Dels=0.03;FR;FS=11.079;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.7632;LEN=2;MQ0Fraction=0.0026;MQRankSum=-1.394;NF;NR;PP;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.102;SC=TGTGTGTGCGCGTGTGTGTGT;TC;TR=18;TU=GT;VQSLOD=6.1435;set=Intersection;sumGLbyD=3.53
-20 8610455 rs10571111 TTTTC T 11763.51 PASS AC=190;AF=0.17056;AN=1114;BaseQRankSum=-14.397;DB;DP=2323;FS=2.321;HRun=0;HaplotypeScore=39.8020;InbreedingCoeff=0.2502;MQ=53.39;MQ0=104;MQ0Fraction=0.0448;MQRankSum=3.519;QD=19.07;ReadPosRankSum=4.150;SB=-4067.02;VQSLOD=5.0554;set=VQSR
-20 9139079 . ATT A,AT,ATTT,ATTTT,ATTTTT 8777.90 PASS AC=23,140,114,69,113;AF=0.01993,0.12132,0.09879,0.05979,0.09792;AN=1154;BVAR;BaseQRankSum=-0.022;DEL;DP=25109;DP4=502,657,278,313;FR;FS=11.929;HP=16;HR=16;HU=T;HaplotypeScore=20.2361;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.5704;MQ0=16;MQ0Fraction=0.0067;MQRankSum=2.624;NF;NR;PP;PV4=0.14,1,1,1;QD=1.48;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-2354.28;SC=CACCTGGCTAATTTTTTTTTT;TC;TR=16;TU=T;VQSLOD=6.9180;set=Intersection
-20 9862448 . CT C 49312 PASS AA=60;AB=0.96003;ABA=53;ABP=2440.4;ABR=1273;AC=18;AF=0.01461;AN=1232;BL=3516;BR=140;BVAR;BaseQRankSum=-2.056;DEL;DP=11893;Dels=0.01;EL=35;EPP=6.6294;ER=25;FS=1.787;HETAR=396;HOMA=344;HOMR=334;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0379;LEN=1;LRB=0.92341;LRBP=6772.5;MQ0Fraction=0.0006;MQM=54.267;MQRankSum=-0.907;NS=1074;RA=2990;RL=60;RPP=133.3;RR=0;RUN=1;ReadPosRankSum=-10.579;SAB=0.58333;SAF=35;SAP=6.6294;SAR=25;SRB=0.47826;SRF=1430;SRP=15.284;SRR=1560;VQSLOD=3.0237;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.84
-20 9863736 rs73618103 G GT 50570.21 PASS AA=2247;AB=0.48878;ABA=1412;ABP=6.0324;ABR=1350;AC=546;AF=0.44463;AN=1228;BL=86886;BR=95862;BVAR;BaseQRankSum=-23.978;DB;DP=32517;DP4=1125,1133,1017,1048;Dels=0.00;EL=1089;EPP=7.6113;ER=1158;FQ=999;FR;FS=2.529;HETAR=445;HOMA=201;HOMR=393;HP=4;HPLen=4;HR=4;HRun=4;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1393;KGPilot123;LEN=1;LRB=0.049117;LRBP=960.35;MQ=68.10;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0006;MQM=50.931;MQRankSum=-1.580;NF;NR;NS=1039;PP;PV4=0.71,1,0.11,1;RA=3139;RL=1089;RPP=7.6113;RR=1158;RUN=1;ReadPosRankSum=0.846;SAB=0.54161;SAF=1217;SAP=36.804;SAR=1030;SC=TGATTGTATGGTTTTGTCCTT;SRB=0.53425;SRF=1677;SRP=34.987;SRR=1462;TC;TR=4;TU=T;VLD;VQSLOD=10.1800;dbSNP=131;set=Intersection;sumGLbyD=18.20
-20 10640876 . TA T 42819 PASS AA=86;AB=0.92316;ABA=75;ABP=1521;ABR=901;AC=40;AF=0.0447;AN=894;BL=6265;BR=415;BVAR;BaseQRankSum=-0.850;DEL;DP=8223;Dels=0.00;EL=41;EPP=3.4143;ER=45;FS=3.190;HETAR=336;HOMA=384;HOMR=290;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0173;LEN=1;LRB=0.87575;LRBP=11128;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=76.163;MQRankSum=1.314;NS=1034;RA=2046;RL=83;RPP=164.61;RR=3;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.060;SAB=0.46512;SAF=40;SAP=3.9193;SAR=46;SRB=0.5523;SRF=1130;SRP=51.615;SRR=916;VQSLOD=3.9183;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.00
-20 10926959 . AG A 12239 PASS AA=65;AB=0.92801;ABA=64;ABP=1417.6;ABR=825;AC=24;AF=0.0264;AN=908;BL=616;BR=3782;BVAR;BaseQRankSum=9.990;DEL;DP=10708;Dels=0.01;EL=37;EPP=5.7163;ER=28;FS=1.652;HETAR=275;HOMA=70;HOMR=724;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0102;LEN=1;LRB=0.71987;LRBP=4952;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQM=118.82;MQRankSum=1.018;NS=1069;RA=4746;RL=5;RPP=104.07;RR=60;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.039;SAB=0.41538;SAF=27;SAP=7.0526;SAR=38;SRB=0.4764;SRF=2261;SRP=25.968;SRR=2485;VQSLOD=2.9713;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.10
-20 11299648 . TG T 49315 PASS AA=62;AB=0.95292;ABA=54;ABP=2046.7;ABR=1093;AC=28;AF=0.0373;AN=750;BL=3126;BR=528;BVAR;BaseQRankSum=-4.929;DEL;DP=10764;Dels=0.01;EL=26;EPP=6.5127;ER=36;FS=3.851;HETAR=366;HOMA=383;HOMR=304;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0267;LEN=1;LRB=0.711;LRBP=4014.1;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0005;MQM=76.468;MQRankSum=1.327;NS=1070;RA=2588;RL=54;RPP=77.121;RR=8;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.507;SAB=0.48387;SAF=30;SAP=3.1504;SAR=32;SRB=0.47643;SRF=1233;SRP=15.499;SRR=1355;VQSLOD=3.8673;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.00
-20 11561096 . CTA C 999 PASS AC=2;AF=0.0029;AF1=0.005602;BaseQRankSum=3.190;CI95=0.004425,0.01106;DP=7521;DP4=1998,1794,2,4;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=5.422;HP=3;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0056;MQ=113.88;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.297;NF;NR;PP;PV4=0.43,0.024,1,1;ReadPosRankSum=1.406;SC=CAATAGTATTCTATGTCAGTC;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=8.6243;set=Intersection;sumGLbyD=21.89
-20 11723671 . C CA 1096.60 PASS AA=35;AB=0.69565;ABA=35;ABP=41.247;ABR=80;AC=10;AF=0.0141;AN=710;BL=2005;BR=1702;BVAR;BaseQRankSum=-3.427;DP=9819;Dels=0.00;EL=20;EPP=4.5614;ER=15;FR;FS=3.814;HETAR=20;HOMA=0;HOMR=1034;HP=8;HPLen=7;HR=7;HRun=7;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0323;LEN=1;LRB=0.081737;LRBP=56.79;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=81.057;MQRankSum=0.050;NF;NR;NS=1054;PP;RA=5562;RL=22;RPP=8.0357;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.012;SAB=0.71429;SAF=25;SAP=16.97;SAR=10;SC=ATATTGAAGACAAAAAAACAG;SRB=0.49371;SRF=2746;SRP=4.9233;SRR=2816;TC;TR=7;TU=A;VQSLOD=7.4342;set=Intersection;sumGLbyD=8.30
-20 11767787 . CA C 1382.10 PASS AA=24;AB=0.56667;ABA=13;ABP=4.1684;ABR=17;AC=10;AF=0.00810;AN=1234;BL=967;BR=819;BVAR;BaseQRankSum=1.629;DEL;DP=22318;DP4=2190,2491,8,14;Dels=0.01;EL=16;EPP=8.8009;ER=8;FQ=999;FR;FS=2.536;HETAR=6;HOMA=3;HOMR=1051;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=1;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0823;LEN=1;LRB=0.082867;LRBP=29.642;MQ=65.44;MQ0Fraction=0.0032;MQM=50.583;MQRankSum=0.931;NF;NR;NS=1060;PP;PV4=0.39,0.018,1,0.37;RA=5568;RL=11;RPP=3.3722;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.694;SAB=0.375;SAF=9;SAP=6.2675;SAR=15;SC=TGAACATGTACAGACTTGGTT;SRB=0.44325;SRF=2468;SRP=158.78;SRR=3100;TC;TR=1;TU=A;VQSLOD=9.9622;set=Intersection;sumGLbyD=15.42
-20 12021825 . A AG 1063.30 PASS AA=26;AB=0.53704;ABA=25;ABP=3.6537;ABR=29;AC=12;AF=0.0214;AN=562;BL=1077;BR=815;BVAR;BaseQRankSum=-3.787;DP=22049;DP4=2650,2464,13,12;Dels=0.00;EL=18;EPP=11.362;ER=8;FR;FS=0.735;HETAR=12;HOMA=1;HOMR=1064;HP=1;HR=1;HRun=1;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0876;LEN=1;LRB=0.13848;LRBP=81.794;MQ=102.78;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=85.538;MQRankSum=-0.126;NF;NR;NS=1077;PP;PV4=1,1,0.19,0.2;RA=6457;RL=17;RPP=8.3555;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.941;SAB=0.57692;SAF=15;SAP=4.3466;SAR=11;SC=GTAGTTTAACAGTTTATCAGG;SRB=0.5182;SRF=3346;SRP=21.582;SRR=3111;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=8.0483;set=Intersection;sumGLbyD=13.94
-20 12238835 rs113904674 CTCTTCATGGTCT C 1813.44 PASS AA=7;AB=0.73077;ABA=7;ABP=15.037;ABR=19;AC=4;AF=0.0056;AN=712;BL=360;BR=368;BVAR;BaseQRankSum=3.891;DB;DEL;DP=10309;Dels=0.00;EL=4;EPP=3.3205;ER=3;FR;FS=0.000;HETAR=3;HOMA=0;HOMR=1076;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=C;InbreedingCoeff=-0.0381;LEN=12;LRB=0.010989;LRBP=3.2012;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=37;MQRankSum=-3.793;NF;NR;NS=1079;PP;RA=6085;RL=4;RPP=3.3205;RR=3;RUN=1;ReadPosRankSum=1.319;SAB=0.42857;SAF=3;SAP=3.3205;SAR=4;SC=CTTAATGCTCCTCTTCATGGT;SRB=0.51257;SRF=3119;SRP=11.364;SRR=2966;TC;TR=6;TU=CCT;VQSLOD=5.7551;set=Intersection;sumGLbyD=69.48
-20 12602812 . AT A 12344 PASS AA=47;AB=0.94372;ABA=43;ABP=1309.5;ABR=721;AC=14;AF=0.0196;AN=716;BL=2714;BR=217;BVAR;BaseQRankSum=1.424;DEL;DP=10743;Dels=0.00;EL=24;EPP=3.0565;ER=23;FS=0.629;HETAR=228;HOMA=65;HOMR=769;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0233;LEN=1;LRB=0.85193;LRBP=4622.3;MQ0Fraction=0.0000;MQM=99.574;MQRankSum=1.901;NS=1080;RA=4839;RL=46;RPP=96.568;RR=1;RUN=1;ReadPosRankSum=-9.906;SAB=0.53191;SAF=25;SAP=3.4261;SAR=22;SRB=0.51106;SRF=2473;SRP=8.148;SRR=2366;VQSLOD=2.8161;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.67
-20 13600884 . CTG C,CTGTG 1278.10 PASS AA=85;AB=0.77994;ABA=79;ABP=247.38;ABR=280;AC=71,22;AF=0.05907,0.01830;AN=1202;BL=3279;BR=3205;BVAR;BaseQRankSum=8.852;DEL;DP=24185;DP4=1317,931,52,49;Dels=0.03;EL=45;EPP=3.649;ER=40;FQ=999;FR;FS=31.826;HETAR=75;HOMA=4;HOMR=926;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1566;LEN=2;LRB=0.011413;LRBP=4.8442;MQ=65.06;MQ0Fraction=0.0012;MQM=48.671;MQRankSum=-0.511;NF;NR;NS=1005;PP;PV4=0.18,1,0.39,0.27;RA=3342;RL=35;RPP=8.7583;RR=50;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.329;SAB=0.43529;SAF=37;SAP=6.1015;SAR=48;SC=TCCCTTTACTCTGTGTGTGTG;SRB=0.59066;SRF=1974;SRP=241.62;SRR=1368;TC;TR=15;TU=GT;VQSLOD=3.8635;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.23
-20 13666265 . T TATAG 556.88 PASS AC=21;AF=0.01959;AN=1072;BaseQRankSum=24.958;DP=2706;FS=2.581;HRun=0;HaplotypeScore=25.9952;InbreedingCoeff=0.1419;MQ=72.43;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=2.888;QD=4.38;ReadPosRankSum=2.552;SB=-417.04;VQSLOD=7.3380;set=VQSR
-20 13861245 rs72422273 C CTCA 2685.46 PASS AC=140;AF=0.11589;AN=1208;BaseQRankSum=24.355;DB;DP=2910;FS=6.808;HRun=0;HaplotypeScore=19.3095;InbreedingCoeff=-0.0991;MQ=78.25;MQ0=22;MQ0Fraction=0.0076;MQRankSum=3.225;QD=3.64;ReadPosRankSum=2.607;SB=-1861.38;VQSLOD=4.1974;set=VQSR
-20 13865746 . T TA,TAA 1416.23 PASS AA=63;AB=0.80417;ABA=47;ABP=195.87;ABR=193;AC=122,21;AF=0.10133,0.01744;AN=1204;BL=3673;BR=1145;BVAR;BaseQRankSum=-3.336;DP=10513;Dels=0.00;EL=62;EPP=131.27;ER=1;FR;FS=716.583;HETAR=45;HOMA=1;HOMR=998;HP=2;HR=1;HRun=1;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0814;LEN=1;LRB=0.5247;LRBP=2883.3;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.143;MQRankSum=-1.197;NF;NR;NS=1044;PP;RA=4529;RL=62;RPP=131.27;RR=1;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.295;SAB=1;SAF=63;SAP=139.81;SAR=0;SC=GGAACATGGATACCCCCCTGC;SRB=0.52462;SRF=2376;SRP=26.853;SRR=2153;TC;TR=1;TU=A;VQSLOD=-4.2308;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.77
-20 13881703 . CTT C 152.85 PASS AC=8;AF=0.0093;AN=862;BaseQRankSum=3.941;DP=2063;FS=0.962;HRun=5;HaplotypeScore=24.0313;InbreedingCoeff=0.0790;MQ=55.05;MQ0=49;MQ0Fraction=0.0238;MQRankSum=-1.418;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-93.04;VQSLOD=5.3874;set=VQSR
-20 14033345 . A AT 2718.30 PASS AA=91;AB=0.80899;ABA=85;ABP=372.04;ABR=360;AC=43;AF=0.03895;AN=1104;BL=3916;BR=4753;BVAR;BaseQRankSum=-6.609;DP=8350;Dels=0.02;EL=46;EPP=3.0342;ER=45;FR;FS=0.498;HETAR=70;HOMA=1;HOMR=871;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.0952;LEN=1;LRB=0.096551;LRBP=178.49;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=54.879;MQRankSum=2.164;NF;NR;NS=942;PP;RA=3717;RL=37;RPP=9.9065;RR=54;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.447;SAB=0.48352;SAF=44;SAP=3.2251;SAR=47;SC=TTGCAAACAGATTTTTTTTTT;SRB=0.45252;SRF=1682;SRP=75.807;SRR=2035;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=3.8299;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.88
-20 14260090 rs73619828 A AT 27935 PASS AA=596;AB=0.59484;ABA=487;ABP=96.922;ABR=715;AC=204;AF=0.17000;AN=1200;BL=21718;BR=28458;BVAR;BaseQRankSum=0.756;DB;DP=23629;DP4=1385,1492,287,328;Dels=0.00;EL=299;EPP=3.0249;ER=297;FQ=999;FR;FS=6.187;HETAR=218;HOMA=38;HOMR=788;HP=9;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0797;LEN=1;LRB=0.13433;LRBP=1969;MQ=100.81;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=57.084;MQRankSum=2.224;NF;NR;NS=1044;PP;PV4=0.53,1,1.2e-11,1;RA=4143;RL=238;RPP=55.475;RR=358;RUN=1;ReadPosRankSum=0.198;SAB=0.46812;SAF=279;SAP=8.2714;SAR=317;SC=CCTTAAGTTGATTTTTTTTTC;SRB=0.50374;SRF=2087;SRP=3.514;SRR=2056;TC;TR=9;TU=T;VQSLOD=9.0018;set=Intersection;sumGLbyD=10.82
-20 14260558 . AC A 238 PASS AC=1;AF=0.0014;AF1=0.003368;BaseQRankSum=2.868;CI95=0.003106,0.006211;DP=9724;DP4=2075,2329,1,7;Dels=0.00;FQ=106;FR;FS=10.678;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=1;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0406;MQ=114.37;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.862;NF;NR;PP;PV4=0.074,0.0096,0.017,1;ReadPosRankSum=-0.042;SC=ATCAGGAATAACTGTGTGACC;TC;TR=2;TU=A;VQSLOD=8.1618;set=Intersection;sumGLbyD=18.65
-20 14425481 . GTA G,GTATA 148.85 PASS AC=43,23;AF=0.03473,0.01858;AN=1238;BaseQRankSum=6.289;DP=25167;DP4=1800,2021,38,49;FR;FS=9.416;HP=2;HPLen=1;HR=1;HU=T;HaplotypeScore=17.7453;INDEL;InbreedingCoeff=0.0995;MQ0=21;MQ0Fraction=0.0058;MQRankSum=-0.200;NF;NR;PP;PV4=0.59,1,0.04,0.023;QD=0.35;ReadPosRankSum=-1.689;SB=-367.50;SC=CTGTGTGTGTGTATATATATA;TC;TR=13;TU=AT;VQSLOD=3.5796;set=filterInVQSR-2of5
-20 14943522 rs11478299 GA AA,G 1761.24 PASS AA=117;AB=0.68142;ABA=108;ABP=99.919;ABR=231;AC=0;AF=0.0000;AF1=0.04204;AN=712;BL=4931;BR=5802;BVAR;BaseQRankSum=9.118;CI95=0.02876,0.05752;DB;DEL;DP=13717;DP4=1908,1684,59,58;Dels=0.05;EL=60;EPP=3.1773;ER=57;FQ=81.9;FR;HETAR=56;HOMA=1;HOMR=1011;HP=8;HPLen=8;HR=8;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1264;LEN=1;LRB=0.081152;LRBP=156.5;MQ=106.93;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=96.855;MQRankSum=1.619;NF;NR;NS=1068;PP;PV4=0.57,1,0.0003,1;QD=7.40;RA=5080;RL=56;RPP=3.4743;RR=61;RUN=1;ReadPosRankSum=0.814;SAB=0.52137;SAF=61;SAP=3.4743;SAR=56;SB=-1122.51;SC=GTTGTTTGGGGAAAAAAAACT;SRB=0.51083;SRF=2595;SRP=8.1825;SRR=2485;TC;TR=8;TU=A;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=9.81
-20 14974486 . A AG 4101.40 PASS AA=57;AB=0.57143;ABA=51;ABP=8.2839;ABR=68;AC=22;AF=0.01846;AN=1192;BL=2286;BR=2834;BVAR;BaseQRankSum=8.711;DP=20538;DP4=2172,2100,19,13;Dels=0.00;EL=32;EPP=4.877;ER=25;FS=0.517;HETAR=20;HOMA=4;HOMR=1027;HRun=1;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0677;LEN=1;LRB=0.10703;LRBP=130.37;MQ=126.07;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.088;MQRankSum=-10.756;NS=1051;PV4=0.38,3.5e-51,7.9e-34,1;RA=5203;RL=26;RPP=3.9627;RR=31;RUN=1;ReadPosRankSum=1.283;SAB=0.54386;SAF=31;SAP=3.9627;SAR=26;SRB=0.51816;SRF=2696;SRP=17.918;SRR=2507;VQSLOD=8.0072;set=Intersection;sumGLbyD=25.60
-20 15111137 . GA G 13533 PASS AA=98;AB=0.84864;ABA=89;ABP=623.8;ABR=499;AC=47;AF=0.03796;AN=1238;BL=5324;BR=856;BVAR;BaseQRankSum=-11.577;DEL;DP=13384;Dels=0.01;EL=53;EPP=4.4284;ER=45;FS=6.099;HETAR=219;HOMA=845;HOMR=18;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0056;LEN=1;LRB=0.72298;LRBP=7017.4;MQ0Fraction=0.0003;MQM=90.449;MQRankSum=1.408;NS=1083;RA=590;RL=87;RPP=130.99;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-18.074;SAB=0.55102;SAF=54;SAP=5.2261;SAR=44;SRB=0.52373;SRF=309;SRP=5.8958;SRR=281;VQSLOD=4.1054;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.06
-20 15283028 . A AC,ACACACACACACAC 140844.83 PASS AA=180;AB=0.61442;ABA=123;ABP=39.285;ABR=196;AC=13,817;AF=0.01111,0.69829;AN=1170;BL=4453;BR=11407;BVAR;BaseQRankSum=24.686;DP=6365;Dels=0.00;EL=124;EPP=58.793;ER=56;FR;FS=10.912;HETAR=87;HOMA=48;HOMR=683;HP=1;HR=1;HRun=1;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2074;LEN=1;LRB=0.43846;LRBP=6624;MQ0Fraction=0.0558;MQM=38.211;MQRankSum=-21.111;NF;NR;NS=818;PP;RA=1732;RL=0;RPP=393.88;RR=180;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.620;SAB=0.31111;SAF=56;SAP=58.793;SAR=124;SC=ACACACACACATACACACATA;SRB=0.54042;SRF=936;SRP=27.584;SRR=796;TC;TR=21;TU=AC;VQSLOD=4.7569;set=Intersection;sumGLbyD=18.36
-20 15361056 . ATAACT A 4892.81 PASS AA=59;AB=0.63576;ABA=55;ABP=27.184;ABR=96;AC=34;AF=0.0487;AN=698;BL=3164;BR=1999;BVAR;BaseQRankSum=3.391;DEL;DP=7080;Dels=0.03;EL=27;EPP=3.9304;ER=32;FR;FS=4.816;HETAR=35;HOMA=6;HOMR=966;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=A;InbreedingCoeff=0.0785;LEN=5;LRB=0.22564;LRBP=573.84;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=70.034;MQRankSum=-8.732;NF;NR;NS=1008;PP;RA=3915;RL=42;RPP=26.013;RR=17;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.735;SAB=0.44068;SAF=26;SAP=4.8137;SAR=33;SC=AGATTAGGAAATAACTTAGGG;SRB=0.42682;SRF=1671;SRP=185.12;SRR=2244;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=7.0900;set=Intersection;sumGLbyD=43.38
-20 15579507 . AATTAGTC A,TATTAGTC 1936.38 PASS AA=16;AB=0.58974;ABA=16;ABP=5.7386;ABR=23;AC=64;AF=0.05229;AN=1224;BL=699;BR=775;BVAR;BaseQRankSum=-21.390;DEL;DP=21920;DP4=2099,2403,6,6;Dels=0.00;EL=8;EPP=3.0103;ER=8;FR;FS=2.920;HETAR=5;HOMA=0;HOMR=1063;HP=3;HPLen=4;HR=4;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0143;LEN=7;LRB=0.05156;LRBP=11.519;MQ=129.49;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=51.938;MQRankSum=3.331;NF;NR;NS=1068;PP;PV4=1,0.019,1.3e-07,1;RA=5334;RL=5;RPP=7.8961;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-16.901;SAB=0.4375;SAF=7;SAP=3.5532;SAR=9;SC=CATACTACAAAATTAGTCATT;SRB=0.41695;SRF=2224;SRP=322.58;SRR=3110;TC;TR=4;TU=A;VQSLOD=3.2237;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=43.57
-20 15752535 . CT C,GT 3775.20 PASS AA=92;AB=0.78636;ABA=47;ABP=159.71;ABR=173;AC=0;AF=0.0000;AN=608;BL=4955;BR=2380;BVAR;BaseQRankSum=2.910;DEL;DP=3429;Dels=0.04;EL=13;EPP=105.82;ER=79;FR;HETAR=92;HOMA=95;HOMR=544;HP=2;HPLen=2;HR=2;HU=T;InbreedingCoeff=0.0483;LEN=1;LRB=0.35106;LRBP=1966;MQ0Fraction=0.0232;MQM=35.293;MQRankSum=-2.199;NF;NR;NS=732;PP;QD=4.91;RA=1272;RL=81;RPP=118.66;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.077;SAB=0.021739;SAF=2;SAP=185.79;SAR=90;SB=-59.51;SC=CAAGACCATCCTTGGCTAACA;SRB=0.14623;SRF=186;SRP=1385.8;SRR=1086;TC;TR=2;TU=T;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=9.70
-20 15883060 rs73619850 A AT 1325.60 PASS AA=38;AB=0.59302;ABA=35;ABP=9.4742;ABR=51;AC=14;AF=0.0156;AN=896;BL=1078;BR=1638;BVAR;BaseQRankSum=-4.526;DB;DP=19854;DP4=1632,1800,15,20;Dels=0.00;EL=18;EPP=3.2389;ER=20;FR;FS=0.000;HETAR=14;HOMA=1;HOMR=1014;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=1;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=-0.0131;LEN=1;LRB=0.20619;LRBP=253.74;MQ=118.40;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.526;MQRankSum=0.892;NF;NR;NS=1029;PP;PV4=0.61,1,0.25,0.14;RA=4439;RL=14;RPP=8.7247;RR=24;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.061;SAB=0.42105;SAF=16;SAP=5.0675;SAR=22;SC=GGATTGGCAGATAAAAAATGG;SRB=0.46429;SRF=2061;SRP=52.168;SRR=2378;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=9.7576;set=Intersection;sumGLbyD=15.69
-20 16073315 rs111824749 GA G,GAA,GAAA 6400.63 PASS AC=138,47,20;AF=0.11577,0.03943,0.01678;AN=1192;BVAR;BaseQRankSum=11.377;DB;DEL;DP=35284;DP4=1695,1547,60,56;Dels=0.08;FR;FS=9.576;HP=11;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2137;MQ=106.87;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=0.773;NF;NR;PP;PV4=0.92,1,0.024,0.45;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.224;SC=TATTTGAGGAGAAAAAAAAAA;TC;TR=10;TU=A;VQSLOD=9.3264;set=Intersection;sumGLbyD=8.64
-20 16122099 . GA G 12914 PASS AA=85;AB=0.85915;ABA=80;ABP=639.4;ABR=488;AC=19;AF=0.01542;AN=1232;BL=805;BR=5457;BVAR;BaseQRankSum=-6.084;DEL;DP=13592;Dels=0.00;EL=45;EPP=3.649;ER=40;FS=0.935;HETAR=218;HOMA=841;HOMR=14;HRun=2;InbreedingCoeff=0.0250;LEN=1;LRB=0.74289;LRBP=7507.5;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=103.01;MQRankSum=2.843;NS=1075;RA=541;RL=2;RPP=170.62;RR=83;RUN=1;ReadPosRankSum=-16.222;SAB=0.49412;SAF=42;SAP=3.0358;SAR=43;SRB=0.44917;SRF=243;SRP=15.152;SRR=298;VQSLOD=3.9745;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.97
-20 16828509 . G GT 843.62 PASS AA=30;AB=0.70103;ABA=29;ABP=37.06;ABR=68;AC=10;AF=0.0140;AN=714;BL=1368;BR=1786;BVAR;BaseQRankSum=-4.061;DP=8682;Dels=0.01;EL=14;EPP=3.2998;ER=16;FR;FS=2.681;HETAR=22;HOMA=1;HOMR=1020;HP=8;HPLen=8;HR=8;HRun=8;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.1389;LEN=1;LRB=0.13253;LRBP=123.3;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=62.8;MQRankSum=-1.491;NF;NR;NS=1043;PP;RA=4416;RL=11;RPP=7.6428;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.718;SAB=0.76667;SAF=23;SAP=21.54;SAR=7;SC=CCTTCAAAAGGTTTTTTTTGG;SRB=0.5745;SRF=2537;SRP=215.91;SRR=1879;TC;TR=8;TU=T;VQSLOD=7.6258;set=Intersection;sumGLbyD=10.77
-20 17470034 . GC G 46975 PASS AA=57;AB=0.96043;ABA=52;ABP=2422.5;ABR=1262;AC=34;AF=0.02773;AN=1226;BL=418;BR=3446;BVAR;BaseQRankSum=-6.250;DEL;DP=12035;Dels=0.00;EL=22;EPP=9.4485;ER=35;FS=1.350;HETAR=416;HOMA=409;HOMR=244;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0083;LEN=1;LRB=0.78364;LRBP=5155.6;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=99.509;MQRankSum=2.192;NS=1076;RA=2396;RL=5;RPP=87.164;RR=52;RUN=1;ReadPosRankSum=-15.199;SAB=0.5614;SAF=32;SAP=4.877;SAR=25;SRB=0.52963;SRF=1269;SRP=21.285;SRR=1127;VQSLOD=3.8440;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.06
-20 17471374 . AGCGGC A 850.03 PASS AC=6;AF=0.0085;AF1=0.01301;AN=704;BaseQRankSum=6.259;CI95=0.00885,0.01991;DP=8180;DP4=2215,1878,4,5;Dels=0.01;FQ=131;FS=0.000;HRun=0;INDEL;InbreedingCoeff=0.0009;MQ=104.41;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-5.521;PV4=0.74,0.37,0.0005,1;ReadPosRankSum=2.468;VQSLOD=6.8773;set=Intersection;sumGLbyD=30.85
-20 18433202 rs35582929 G GA 2506.90 PASS AA=55;AB=0.5812;ABA=49;ABP=9.7103;ABR=68;AC=20;AF=0.0218;AN=918;BL=2263;BR=2175;BVAR;BaseQRankSum=-6.639;DB;DP=19467;DP4=1845,2365,27,26;Dels=0.00;EL=21;EPP=9.6826;ER=34;FQ=999;FR;FS=5.633;HETAR=16;HOMA=3;HOMR=1045;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=1;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0700;LEN=1;LRB=0.019829;LRBP=6.7994;MQ=114.03;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=83.345;MQRankSum=1.610;NF;NR;NS=1064;PP;PV4=0.33,1,1,1;RA=5380;RL=28;RPP=3.0498;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=0.873;SAB=0.47273;SAF=26;SAP=3.3656;SAR=29;SC=TATTTCATGGGAGCATTAAAA;SRB=0.42862;SRF=2306;SRP=241.07;SRR=3074;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=10.0372;dbSNP=126;set=Intersection;sumGLbyD=13.10
-20 18551314 rs10659122 CA C,CAA,CAAA,CAAAA,CAAAAA 18810.74 PASS ABR=243;AC=19,169,216,164,188;AF=0.01816,0.16157,0.20650,0.15679,0.17973;BVAR;BaseQRankSum=-5.742;DB;DP=17637;DP4=136,77,560,237;FR;FS=2.693;HOMA=177;HOMR=299;HP=17;HR=17;HU=A;HaplotypeScore=15.5048;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.8901;MQ0=11;MQ0Fraction=0.0069;MQRankSum=1.845;NF;NR;NS=658;PP;PV4=0.08,1,1,1;QD=12.66;RA=673;RUN=1;ReadPosRankSum=0.283;SB=-3514.45;SC=GATTCCATCTCAAAAAAAAAA;SRB=0.63596;SRF=428;SRP=111.06;SRR=245;TC;TR=17;TU=A;VQSLOD=10.6964;dbSNP=130;set=Intersection
-20 18785519 . G GTC 415.55 PASS AC=28;AF=0.0400;AN=700;BaseQRankSum=10.889;DP=1929;FS=8.778;HRun=0;HaplotypeScore=27.6448;InbreedingCoeff=0.0510;MQ=61.99;MQ0=36;MQ0Fraction=0.0187;MQRankSum=4.508;QD=3.08;ReadPosRankSum=8.080;SB=-437.03;VQSLOD=4.9313;set=VQSR
-20 19149501 . A AG 17.85 PASS AC=1;AF=0.0015;AN=670;BaseQRankSum=0.769;DP=1635;FS=9.858;HRun=0;HaplotypeScore=12.1949;InbreedingCoeff=-0.0381;MQ=102.63;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.200;QD=3.23;ReadPosRankSum=0.292;SB=-7.06;VQSLOD=4.4695;set=VQSR
-20 19540281 . AC A 19710 PASS AA=145;AB=0.81843;ABA=134;ABP=652.98;ABR=604;AC=115;AF=0.09583;AN=1200;BL=9637;BR=817;BVAR;BaseQRankSum=-13.669;DEL;DP=10963;Dels=0.01;EL=66;EPP=5.5412;ER=79;FS=1.252;HETAR=305;HOMA=681;HOMR=59;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0298;LEN=1;LRB=0.8437;LRBP=16162;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=118.51;MQRankSum=-2.194;NS=1046;RA=823;RL=141;RPP=284.09;RR=4;RUN=1;ReadPosRankSum=-20.775;SAB=0.45517;SAF=66;SAP=5.5412;SAR=79;SRB=0.452;SRF=372;SRP=19.477;SRR=451;VQSLOD=3.9584;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.29
-20 20015051 . TGAGGGTGG T 1820.73 PASS AF=0.0112;AF1=0.01638;AN=714;BaseQRankSum=6.652;CI95=0.01106,0.02212;DP=9910;DP4=2812,1912,6,11;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=6.147;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0077;MQ=129.13;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-3.195;NF;NR;PP;PV4=0.049,1,5.5e-05,0.006;ReadPosRankSum=-1.989;SC=TTGGTGGAGTTGAGGGTGGGA;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=6.5963;set=Intersection;sumGLbyD=33.49
-20 20301041 rs35451634 ATATG A 200.42 PASS AC=21;AF=0.0449;AN=468;BaseQRankSum=5.251;DB;DP=579;FS=24.013;HRun=0;HaplotypeScore=27.8977;InbreedingCoeff=0.0113;MQ=78.47;MQ0=26;MQ0Fraction=0.0449;MQRankSum=-5.284;QD=3.06;ReadPosRankSum=1.793;SB=-55.76;VQSLOD=5.0981;set=VQSR
-20 20378174 . TC T 245.55 PASS AC=23;AF=0.01879;AN=1224;BaseQRankSum=0.990;DP=3225;FS=10.413;HRun=1;HaplotypeScore=22.6109;InbreedingCoeff=0.0244;MQ=93.70;MQ0=3;MQ0Fraction=0.0009;MQRankSum=-3.349;QD=1.86;ReadPosRankSum=-7.227;SB=-188.62;VQSLOD=4.2553;set=VQSR
-20 20809160 rs10571503 TAA AAA,T 3496 PASS AC=0;AF=0.0000;AN=612;BaseQRankSum=1.968;DB;DP=1092;FR;HP=4;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=A;HaplotypeScore=26.1253;InbreedingCoeff=0.0603;MQ=68.98;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0009;MQRankSum=1.520;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-4.042;SC=TATATATATATAAATTTAAAT;TC;TR=13;TU=AT;set=filterInVQSR-2of5
-20 22508765 . CT C 53877.84 PASS AA=187;AB=0.78077;ABA=171;ABP=537.09;ABR=609;AC=1017;AF=0.91787;AN=1108;BL=12690;BR=1718;BVAR;BaseQRankSum=13.773;DEL;DP=7430;Dels=0.02;EL=73;EPP=22.53;ER=114;FR;FS=16.352;HETAR=152;HOMA=9;HOMR=786;HP=8;HR=4;HRun=4;HU=T;InbreedingCoeff=0.3885;LEN=1;LRB=0.76152;LRBP=18147;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=46.086;MQRankSum=0.971;NF;NR;NS=947;PP;RA=2868;RL=177;RPP=326.86;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=9.951;SAB=0.34759;SAF=65;SAP=40.738;SAR=122;SC=AAAAAATTTTCTTTTGAACTG;SRB=0.46269;SRF=1327;SRP=37.684;SRR=1541;TC;TR=4;TU=T;VQSLOD=5.1182;set=Intersection;sumGLbyD=25.15
-20 22555082 rs11477526 AT A 11503 PASS AA=530;AB=0.50816;ABA=422;ABP=3.5063;ABR=436;AF=0.1614;AN=700;BL=21453;BR=23313;BVAR;BaseQRankSum=17.562;DB;DEL;DP=25587;DP4=1869,1600,283,201;Dels=0.14;EL=259;EPP=3.6003;ER=271;FQ=999;FR;FS=14.595;HETAR=159;HOMA=41;HOMR=846;HP=3;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0995;LEN=1;LRB=0.041549;LRBP=170.83;MQ=95.89;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=72.162;MQRankSum=2.564;NF;NR;NS=1046;PP;PV4=0.058,6.6e-129,0.04,1;RA=4303;RL=264;RPP=3.0267;RR=266;RUN=1;ReadPosRankSum=0.176;SAB=0.58679;SAF=311;SAP=37.688;SAR=219;SC=GGGAAAGCTGATTTACTGATT;SRB=0.54892;SRF=2362;SRP=92.453;SRR=1941;TC;TR=3;TU=T;VQSLOD=8.7746;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=15.27
-20 22590907 . A AC 4204.88 PASS AA=67;AB=0.592;ABA=51;ABP=12.2;ABR=74;AF=0.0554;AF1=0.0468;AN=560;BL=2277;BR=2389;BVAR;BaseQRankSum=10.968;CI95=0.03759,0.05639;DP=14380;DP4=2514,2018,33,33;Dels=0.00;EL=22;EPP=20.155;ER=45;FQ=999;FR;FS=3.846;HETAR=25;HOMA=4;HOMR=1049;HP=4;HPLen=5;HR=5;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0719;LEN=1;LRB=0.024003;LRBP=8.8481;MQ=110.68;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=96.149;MQRankSum=2.668;NF;NR;NS=1078;PP;PV4=0.39,1,0.46,0.36;RA=5468;RL=33;RPP=3.0427;RR=34;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.097;SAB=0.50746;SAF=34;SAP=3.0427;SAR=33;SC=TCATATCAAAAACATTACGTT;SRB=0.54389;SRF=2974;SRP=94.508;SRR=2494;TC;TR=5;TU=A;VQSLOD=10.0712;set=Intersection;sumGLbyD=27.69
-20 22806326 rs11468890 ATTCCATCAC A 105320.99 PASS AC=567;AF=0.48795;AN=1162;BVAR;BaseQRankSum=32.858;DB;DEL;DP=26278;DP4=727,796,554,587;Dels=0.30;FQ=999;FR;FS=1.923;HP=3;HPLen=3;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.2548;LEN=9;MQ=89.42;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-23.545;NF;NR;PP;PV4=0.7,1,1.3e-167,1;RUN=1;ReadPosRankSum=4.384;SC=GGCTGCTCCCATTCCATCACT;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=8.2594;set=Intersection;sumGLbyD=69.81
-20 22999898 rs55966257 CAGGA C 8019.97 PASS AA=23;AB=0.57778;ABA=19;ABP=5.3748;ABR=26;AC=214;AF=0.18838;AN=1136;BL=1143;BR=1040;BVAR;BaseQRankSum=29.294;DB;DEL;DP=8216;Dels=0.02;EL=11;EPP=3.1047;ER=12;FS=14.938;HETAR=14;HOMA=2;HOMR=948;HRun=0;InbreedingCoeff=0.0797;LEN=4;LRB=0.047183;LRBP=13.563;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=34.783;MQRankSum=-20.301;NS=964;RA=3637;RL=13;RPP=3.86;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=-24.607;SAB=0.47826;SAF=11;SAP=3.1047;SAR=12;SRB=0.49024;SRF=1783;SRP=6.02;SRR=1854;VQSLOD=7.9163;set=Intersection;sumGLbyD=9.43
-20 23385964 rs57723772 GAA G 8170.95 PASS AC=257;AF=0.20928;AN=1228;BaseQRankSum=32.220;DB;DP=3291;FS=1.688;HRun=3;HaplotypeScore=22.6739;InbreedingCoeff=0.0171;MQ=58.44;MQ0=32;MQ0Fraction=0.0097;MQRankSum=-4.893;QD=6.55;ReadPosRankSum=-35.524;SB=-3631.67;VQSLOD=5.6549;set=VQSR
-20 23534530 . TA T 3542.10 PASS AA=45;AB=0.75658;ABA=37;ABP=89.926;ABR=115;AC=35;AF=0.02991;AN=1170;BL=3090;BR=270;BVAR;BaseQRankSum=-6.892;DEL;DP=8108;Dels=0.00;EL=19;EPP=5.3748;ER=26;FS=1.026;HETAR=76;HOMA=896;HOMR=18;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0551;LEN=1;LRB=0.83929;LRBP=5142.4;MQ0Fraction=0.0017;MQM=41.578;MQRankSum=0.818;NS=991;RA=203;RL=43;RPP=84.127;RR=2;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.923;SAB=0.37778;SAF=17;SAP=8.8491;SAR=28;SRB=0.5665;SRF=115;SRP=10.808;SRR=88;VQSLOD=4.2093;set=Intersection;sumGLbyD=3.49
-20 23976810 rs5841018 A ATATTAAT 1782.38 PASS AF=0.1387;AF1=0.01507;BaseQRankSum=3.717;CI95=0.00188,0.03947;DB;DP=1712;DP4=357,376,7,2;Dels=0.00;FQ=31.1;FS=14.489;HPLen=2;HRun=0;INDEL;InbreedingCoeff=0.1123;MQ=49.53;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0055;MQRankSum=-4.928;PV4=0.1,1,0.00085,0.016;ReadPosRankSum=-4.456;VQSLOD=5.3140;dbSNP=116;set=Intersection;sumGLbyD=19.98
-20 24222100 . CTTTTA C 4219.36 PASS AA=57;AB=0.59434;ABA=43;ABP=11.205;ABR=63;AF=0.01803;AF1=0.01547;AN=1220;BL=2073;BR=2345;BVAR;BaseQRankSum=7.990;CI95=0.0114,0.02137;DEL;DP=17536;DP4=2140,2346,7,12;Dels=0.01;EL=32;EPP=4.877;ER=25;FQ=104;FS=0.614;HETAR=21;HOMA=4;HOMR=1042;HRun=0;INDEL;InbreedingCoeff=0.1941;LEN=5;LRB=0.061566;LRBP=39.374;MQ=73.32;MQ0Fraction=0.0021;MQM=39.614;MQRankSum=-5.728;NS=1067;PV4=0.37,1.1e-39,3.5e-09,1;RA=5527;RL=28;RPP=3.0484;RR=29;RUN=1;ReadPosRankSum=0.214;SAB=0.54386;SAF=31;SAP=3.9627;SAR=26;SRB=0.49267;SRF=2723;SRP=5.588;SRR=2804;VQSLOD=7.5428;set=Intersection;sumGLbyD=38.08
-20 24395018 . AT A 49310 PASS AA=146;AB=0.91198;ABA=130;ABP=2180.5;ABR=1347;AC=50;AF=0.04045;AN=1236;BL=587;BR=9625;BVAR;BaseQRankSum=-4.610;DEL;DP=12793;Dels=0.01;EL=54;EPP=24.487;ER=92;FS=22.108;HETAR=485;HOMA=384;HOMR=210;HRun=2;InbreedingCoeff=0.0374;LEN=1;LRB=0.88504;LRBP=17373;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=102.26;MQRankSum=2.256;NS=1080;RA=2377;RL=1;RPP=311.42;RR=145;RUN=1;ReadPosRankSum=-16.347;SAB=0.63699;SAF=93;SAP=26.807;SAR=53;SRB=0.52167;SRF=1240;SRP=12.702;SRR=1137;VQSLOD=3.2421;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.80
-20 24411517 . C CA 246.18 PASS AF=0.01546;AF1=0.01095;BaseQRankSum=7.832;CI95=0.005698,0.01709;DP=7981;DP4=983,2037,7,7;Dels=0.00;FQ=27.9;FS=18.815;HPLen=3;HRun=3;INDEL;InbreedingCoeff=0.0175;MQ=60.28;MQ0Fraction=0.0137;MQRankSum=-7.243;PV4=0.25,1,2.7e-05,1;ReadPosRankSum=-0.143;VQSLOD=4.3701;set=Intersection;sumGLbyD=6.56
-20 24421169 . AG A 27480 PASS AA=182;AB=0.8303;ABA=149;ABP=835;ABR=729;AC=89;AF=0.07224;AN=1232;BL=11276;BR=2214;BVAR;BaseQRankSum=-5.447;DEL;DP=11717;Dels=0.01;EL=103;EPP=9.8827;ER=79;FR;FS=15.492;HETAR=343;HOMA=607;HOMR=114;HP=4;HR=1;HRun=1;HU=G;InbreedingCoeff=0.0353;LEN=1;LRB=0.67176;LRBP=13222;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=88.324;MQRankSum=2.221;NF;NR;NS=1071;PP;RA=1226;RL=169;RPP=293.37;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-19.711;SAB=0.54945;SAF=100;SAP=6.876;SAR=82;SC=CCTTAGCCCCAGAAAACATCT;SRB=0.44535;SRF=546;SRP=34.814;SRR=680;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=4.2669;set=Intersection;sumGLbyD=3.91
-20 24765537 rs71841337 ATTT A,AT,ATT,ATTTT,ATTTTT 37852 PASS AC=13,120,527,51,92;AF=0.01102,0.10169,0.44661,0.04322,0.07797;AN=1180;BVAR;BaseQRankSum=8.172;DB;DEL;DP=39116;DP4=200,331,851,1169;FR;FS=2.394;HP=15;HR=15;HU=T;HaplotypeScore=20.8091;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.4815;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=4.344;NF;NR;PP;PV4=0.067,1,1,0.1;QD=7.90;RUN=1;ReadPosRankSum=1.798;SB=-8371.96;SC=CTCTGCAACAATTTTTTTTTT;TC;TR=15;TU=T;VQSLOD=9.9679;dbSNP=120;set=Intersection
-20 25500689 . A AATTT 84980.72 PASS AC=1005;AF=0.89096;AN=1128;BaseQRankSum=17.400;DP=2324;FS=6.721;HRun=0;HaplotypeScore=25.3376;InbreedingCoeff=0.2148;MQ=75.19;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQRankSum=-8.221;QD=38.28;ReadPosRankSum=4.504;SB=-34833.07;VQSLOD=4.6038;set=VQSR
-20 25550373 . GA G 11251.31 PASS AA=246;AB=0.42963;ABA=154;ABP=14.624;ABR=116;AC=566;AF=0.6521;AN=868;BL=5230;BR=11845;BVAR;BaseQRankSum=7.418;DEL;DP=8885;Dels=0.02;EL=99;EPP=23.348;ER=147;FR;FS=50.357;HETAR=150;HOMA=849;HOMR=14;HP=1;HR=2;HRun=1;HU=G;InbreedingCoeff=0.1365;LEN=1;LRB=0.38741;LRBP=5567.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=97.561;MQRankSum=0.050;NF;NR;NS=1013;PP;RA=269;RL=75;RPP=84.361;RR=171;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.128;SAB=0.52846;SAF=130;SAP=4.7404;SAR=116;SC=CACGGAGGCGGAGGAAGCAGC;SRB=0.42379;SRF=114;SRP=16.58;SRR=155;TC;TR=6;TU=AGG;VQSLOD=4.0103;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.58
-20 25903865 . TTC T 7459.23 PASS AC=277;AF=0.23316;AN=1188;BaseQRankSum=31.479;DP=2969;FS=137.723;HRun=0;HaplotypeScore=37.3300;InbreedingCoeff=-0.1755;MQ=53.49;MQ0=50;MQ0Fraction=0.0168;MQRankSum=-25.506;QD=4.70;ReadPosRankSum=-5.913;SB=-1747.98;VQSLOD=5.4731;set=VQSR
-20 25934237 . C CCACTT 771.36 PASS AC=37;AF=0.0426;AN=868;BaseQRankSum=16.331;DP=2253;FS=4.545;HRun=0;HaplotypeScore=29.9764;InbreedingCoeff=-0.0685;MQ=48.12;MQ0=87;MQ0Fraction=0.0386;MQRankSum=-12.497;QD=3.37;ReadPosRankSum=-8.428;SB=-297.70;VQSLOD=4.2324;set=VQSR
-20 26054751 rs112967123 TATC T 33244 PASS AA=1863;AB=0.79012;ABA=1788;ABP=6231;ABR=6731;AC=227;AF=0.18218;AN=1246;BL=74924;BR=72452;BVAR;BaseQRankSum=32.258;DB;DEL;DP=36404;DS;Dels=0.05;EL=931;EPP=3.0115;ER=932;FR;FS=265.752;HETAR=527;HOMA=2;HOMR=565;HP=1;HR=2;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=-0.2137;LEN=3;LRB=0.016773;LRBP=93.048;MQ0Fraction=0.0127;MQM=28.797;MQRankSum=-5.329;NF;NR;NS=1094;PP;RA=14604;RL=1014;RPP=34.743;RR=849;RUN=1;ReadPosRankSum=8.394;SAB=0.65486;SAF=1220;SAP=391.07;SAR=643;SC=TCACCATCATTATCATCATTA;SRB=0.56717;SRF=8283;SRP=575.39;SRR=6321;TC;TR=8;TU=ATC;VQSLOD=1.0486;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.54
-20 26075169 . CTTCATT C 34603 PASS AA=311;AB=0.88905;ABA=298;ABP=3534.4;ABR=2388;AC=235;AF=0.18921;AN=1242;BL=17537;BR=5525;BVAR;BaseQRankSum=33.761;DEL;DP=20706;DS;Dels=0.01;EL=206;EPP=74.236;ER=105;FR;FS=94.549;HETAR=596;HOMA=99;HOMR=336;HP=3;HR=2;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=-0.2083;LEN=6;LRB=0.52086;LRBP=13589;MQ0Fraction=0.0426;MQM=14.524;MQRankSum=-37.199;NF;NR;NS=1038;PP;RA=3600;RL=311;RPP=678.34;RR=0;RUN=1;ReadPosRankSum=-27.333;SAB=0.66238;SAF=206;SAP=74.236;SAR=105;SC=TCACCATCATCTTCATTATCA;SRB=0.55833;SRF=2010;SRP=109.41;SRR=1590;TC;TR=7;TU=ATC;VQSLOD=1.4394;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.96
-20 26120452 . CAG C 7863.19 PASS AA=163;AB=0.70489;ABA=157;ABP=196.99;ABR=375;AC=171;AF=0.1908;AN=896;BL=3455;BR=4877;BVAR;BaseQRankSum=25.536;DEL;DP=7014;Dels=0.10;EL=58;EPP=32.438;ER=105;FS=231.723;HETAR=90;HOMA=5;HOMR=387;HRun=0;InbreedingCoeff=-0.1966;LEN=2;LRB=0.17067;LRBP=530;MQ0Fraction=0.0470;MQM=21.951;MQRankSum=-23.449;NS=482;RA=1117;RL=62;RPP=23.273;RR=101;RUN=1;ReadPosRankSum=1.904;SAB=0.37423;SAF=61;SAP=25.404;SAR=102;SRB=0.41719;SRF=466;SRP=69.544;SRR=651;VQSLOD=-0.9395;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.06
-20 26136208 . A AT 17172.04 PASS AA=252;AB=0.73593;ABA=183;ABP=338.07;ABR=510;AC=381;AF=0.30775;AN=1238;BL=8304;BR=14158;BVAR;BaseQRankSum=41.520;DP=40036;DP4=2448,2564,317,366;Dels=0.00;EL=163;EPP=50.197;ER=89;FQ=999;FS=6.531;HETAR=149;HOMA=52;HOMR=708;HRun=1;INDEL;INS;InbreedingCoeff=-0.3996;LEN=1;LRB=0.26062;LRBP=3315.9;MQ=64.20;MQ0=22;MQ0Fraction=0.0048;MQM=25.706;MQRankSum=-29.318;NS=909;PV4=0.24,1.1e-119,3.2e-281,1;RA=2939;RL=58;RPP=162.39;RR=194;RUN=1;ReadPosRankSum=0.592;SAB=0.24206;SAF=61;SAP=148.64;SAR=191;SRB=0.4852;SRF=1426;SRP=8.6026;SRR=1513;VQSLOD=0.5981;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.77
-20 26185812 . AG A 322.58 PASS AF=0.0342;BaseQRankSum=3.668;DP=3014;Dels=0.01;FR;FS=10.238;HP=8;HPLen=6;HR=6;HRun=6;HU=G;InbreedingCoeff=0.1504;MQ0Fraction=0.0473;MQRankSum=-5.464;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=0.536;SC=GGGTGGGTGGAGGGGGGAGGG;TC;TR=6;TU=G;VQSLOD=5.0767;set=Intersection;sumGLbyD=8.46
-20 30963468 . AGTTT A 2041.12 PASS AA=38;AB=0.75694;ABA=35;ABP=85.587;ABR=109;AC=34;AF=0.0377;AN=902;BL=1974;BR=668;BVAR;BaseQRankSum=3.060;DEL;DP=22806;DP4=1997,1747,28,36;Dels=0.02;EL=17;EPP=3.9246;ER=21;FR;FS=16.034;HETAR=29;HOMA=1;HOMR=1009;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.0752;LEN=4;LRB=0.49432;LRBP=1404.9;MQ=87.17;MQ0Fraction=0.0013;MQM=98.079;MQRankSum=6.021;NF;NR;NS=1039;PP;PV4=0.13,1.5e-07,1,0.051;RA=4052;RL=36;RPP=69.069;RR=2;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.847;SAB=0.5;SAF=19;SAP=3.0103;SAR=19;SC=AGAAGTAAGTAGTTTGTTTTT;SRB=0.53776;SRF=2179;SRP=53.19;SRR=1873;TC;TR=9;TU=AAGT;VQSLOD=7.3578;set=Intersection;sumGLbyD=14.03
-20 31963212 . AAAAAAAAAAAAG A 727.15 PASS AC=5;AF=0.0080;AN=622;BaseQRankSum=4.037;DP=1480;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=43.3793;InbreedingCoeff=0.0350;MQ=51.77;MQ0=59;MQ0Fraction=0.0399;MQRankSum=-1.799;QD=22.72;ReadPosRankSum=3.591;SB=-364.04;VQSLOD=5.3166;set=VQSR
-20 31997272 . CT C,CTT,CTTT 1837.10 PASS AA=63;AB=0.77559;ABA=57;ABP=170.57;ABR=197;AC=79,49,30;AF=0.06594,0.04090,0.02504;AN=1198;BL=2372;BR=2640;BVAR;BaseQRankSum=3.277;DP=9050;Dels=0.03;EL=24;EPP=10.766;ER=39;FR;FS=0.303;HETAR=45;HOMA=1;HOMR=981;HP=10;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2796;LEN=1;LRB=0.053472;LRBP=34.128;MQ0Fraction=0.0000;MQM=50.889;MQRankSum=0.610;NF;NR;NS=1027;PP;RA=3776;RL=30;RPP=3.3205;RR=33;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.800;SAB=0.39683;SAF=25;SAP=8.8354;SAR=38;SC=ACCCAACTTCCTTTTTTTTTT;SRB=0.46213;SRF=1745;SRP=50.049;SRR=2031;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=4.1189;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.66
-20 33446974 rs113250263 TAA T,TA,TAAA 17130.16 PASS AC=65,417,184;AF=0.05941,0.38117,0.16819;AN=1094;BVAR;BaseQRankSum=3.400;DB;DEL;DP=22362;DP4=221,247,418,524;Dels=0.33;FR;FS=15.409;HP=15;HR=14;HRun=14;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.5215;MQ=61.32;MQ0Fraction=0.0021;MQRankSum=0.481;NF;NR;PP;PV4=0.33,1,1,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.056;SC=CTCCGTCTCATAAAAAAAAAA;TC;TR=14;TU=A;VQSLOD=8.0974;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=12.78
-20 33877149 . C CT 1784.40 PASS AA=58;AB=0.73096;ABA=53;ABP=94.289;ABR=144;AC=65;AF=0.05682;AN=1144;BL=3298;BR=1935;BVAR;BaseQRankSum=-2.066;DP=8074;Dels=0.02;EL=22;EPP=10.348;ER=36;FR;FS=11.452;HETAR=47;HOMA=3;HOMR=754;HP=16;HR=12;HRun=12;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.1178;LEN=1;LRB=0.26046;LRBP=773.91;MQ0Fraction=0.0165;MQM=52.259;MQRankSum=0.734;NF;NR;NS=804;PP;RA=2141;RL=43;RPP=32.363;RR=15;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.273;SAB=0.46552;SAF=27;SAP=3.6093;SAR=31;SC=ATTTTCTTTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.37553;SRF=804;SRP=291.14;SRR=1337;TC;TR=12;TU=T;VQSLOD=3.1540;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.84
-20 34358698 . A AAAAAAT 583.61 PASS AC=27;AF=0.02542;AN=1062;BaseQRankSum=5.228;DP=1997;FS=3.765;HRun=0;HaplotypeScore=27.7123;InbreedingCoeff=0.0566;MQ=55.50;MQ0=14;MQ0Fraction=0.0070;MQRankSum=-3.961;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.862;SB=-399.69;VQSLOD=4.3826;set=VQSR
-20 34387589 rs112431805 CT C,CTT 4039.10 PASS AA=121;AB=0.75368;ABA=117;ABP=268.53;ABR=358;AC=84,139;AF=0.07047,0.11661;AN=1192;BL=5557;BR=3901;BVAR;BaseQRankSum=2.693;DB;DP=10157;Dels=0.03;EL=47;EPP=16.093;ER=74;FR;FS=7.639;HETAR=89;HOMA=2;HOMR=913;HP=13;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2097;LEN=1;LRB=0.17509;LRBP=632.63;MQ0Fraction=0.0000;MQM=49.802;MQRankSum=-0.801;NF;NR;NS=1004;PP;RA=3789;RL=77;RPP=22.554;RR=44;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.691;SAB=0.3719;SAF=45;SAP=20.256;SAR=76;SC=AAGAAGTGTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.40987;SRF=1553;SRP=270.35;SRR=2236;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=4.0473;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.64
-20 34493409 rs73621682 C CAG 62288.93 PASS AA=1069;AB=0.54863;ABA=826;ABP=40.606;ABR=1004;AC=257;AF=0.3640;AN=706;BL=41524;BR=47039;BVAR;BaseQRankSum=-24.248;DB;DP=30195;DP4=1743,1636,614,487;Dels=0.00;EL=582;EPP=21.343;ER=487;FQ=999;FR;FS=5.080;HETAR=298;HOMA=63;HOMR=712;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1437;LEN=2;LRB=0.062272;LRBP=748.76;MQ=77.99;MQ0=3;MQ0Fraction=0.0015;MQM=54.446;MQRankSum=0.160;NF;NR;NS=1073;PP;PV4=0.016,1,0.01,1;RA=4461;RL=526;RPP=3.5973;RR=543;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.716;SAB=0.57343;SAF=613;SAP=53.08;SAR=456;SC=AGGAAGAGATCAGAGCTCCCC;SRB=0.52634;SRF=2348;SRP=29.892;SRR=2113;TC;TR=4;TU=AG;VQSLOD=8.7047;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=49.82
-20 35086229 rs112534255 G GAT 6109.24 PASS AA=14;AB=0.71795;ABA=11;ABP=19.101;ABR=28;AC=35;AF=0.0509;AN=688;BL=846;BR=517;BVAR;BaseQRankSum=-7.153;DB;DP=15775;DP4=2064,2212,31,22;Dels=0.00;EL=7;EPP=3.0103;ER=7;FR;FS=0.000;HETAR=10;HOMA=2;HOMR=914;HP=3;HPLen=4;HR=4;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1170;LEN=2;LRB=0.24138;LRBP=175.46;MQ=54.65;MQ0Fraction=0.0118;MQM=45.643;MQRankSum=1.614;NF;NR;NS=926;PP;PV4=0.17,1,1,1;RA=2867;RL=11;RPP=12.937;RR=3;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.520;SAB=0.71429;SAF=10;SAP=8.5941;SAR=4;SC=TTTTAGTAAAGGGGATTTCAC;SRB=0.58249;SRF=1670;SRP=172.46;SRR=1197;TC;TR=4;TU=G;VQSLOD=10.3126;set=Intersection;sumGLbyD=42.13
-20 35575895 rs67189278 AGTGT A,AGT,AGTGTGT,TGTGT 43809.26 PASS AC=593,3,481;AF=0.53327,0.00270,0.43255;AN=1112;BVAR;BaseQRankSum=-8.327;DB;DEL;DP=8989;Dels=0.04;FR;FS=9.400;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INS;InbreedingCoeff=0.7735;LEN=2;MQ0Fraction=0.0400;MQRankSum=-2.719;NF;NR;PP;RUN=1;ReadPosRankSum=-9.301;SC=TGTGTGTGTGAGTGTGTGTGT;TC;TR=22;TU=GT;VQSLOD=8.6440;set=Intersection;sumGLbyD=6.01
-20 35957317 . CTGACT C,CGACT 4370.96 PASS ABR=81;AC=22,1;AF=0.0321,0.0015;AF1=0.04523;AN=686;BVAR;BaseQRankSum=7.969;CI95=0.0354,0.05752;DEL;DP=16632;DP4=1942,1815,17,21;Dels=0.03;FQ=999;FR;FS=0.531;HOMA=1;HOMR=998;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0587;MQ=83.38;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-7.201;NF;NR;NS=1020;PP;PV4=0.42,0.00017,4.5e-12,1;RA=4620;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.007;SC=CCTCTCAGCTCTGACTGAGTC;SRB=0.50043;SRF=2312;SRP=3.0178;SRR=2308;TC;TR=8;TU=ACTG;VQSLOD=9.9778;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=36.45
-20 36136198 . GTGTC G 2078.76 PASS AA=35;AB=0.54167;ABA=33;ABP=4.096;ABR=39;AC=17;AF=0.01384;AN=1228;BL=1212;BR=1523;BVAR;BaseQRankSum=6.900;DEL;DP=22483;DP4=1696,2291,9,16;Dels=0.01;EL=9;EPP=20.94;ER=26;FQ=999;FR;FS=3.023;HETAR=13;HOMA=1;HOMR=1061;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1113;LEN=4;LRB=0.11371;LRBP=79.803;MQ=93.98;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=83.686;MQRankSum=-1.683;NF;NR;NS=1075;PP;PV4=0.55,1,0.0083,1;RA=5771;RL=19;RPP=3.5687;RR=16;RUN=1;ReadPosRankSum=0.618;SAB=0.37143;SAF=13;SAP=8.0357;SAR=22;SC=TATCATTTTAGTGTCTGTCTG;SRB=0.44966;SRF=2595;SRP=130.03;SRR=3176;TC;TR=11;TU=CTGT;VQSLOD=10.1935;set=Intersection;sumGLbyD=31.66
-20 36250522 . CA C 37933 PASS AA=51;AB=0.95582;ABA=44;ABP=1800.5;ABR=952;AC=23;AF=0.01885;AN=1220;BL=691;BR=3464;BVAR;BaseQRankSum=-2.418;DEL;DP=11998;Dels=0.00;EL=18;EPP=12.59;ER=33;FS=2.307;HETAR=348;HOMA=534;HOMR=164;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0763;LEN=1;LRB=0.66739;LRBP=4021.7;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0006;MQM=53.647;MQRankSum=1.083;NS=1047;RA=1663;RL=2;RPP=97.065;RR=49;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.726;SAB=0.68627;SAF=35;SAP=18.381;SAR=16;SRB=0.59651;SRF=992;SRP=137.56;SRR=671;VQSLOD=4.1346;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.29
-20 36285033 rs34715186 AT A 39417 PASS AA=530;AB=0.5406;ABA=447;ABP=16.939;ABR=526;AC=88;AF=0.0950;AN=926;BL=20722;BR=20406;BVAR;BaseQRankSum=15.611;DB;DEL;DP=36713;DP4=2551,2475,236,218;Dels=0.09;EL=241;EPP=12.45;ER=289;FQ=999;FR;FS=1.290;HETAR=141;HOMA=16;HOMR=926;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=1;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0742;LEN=1;LRB=0.0076833;LRBP=8.2825;MQ=104.81;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=84.285;MQRankSum=-0.702;NF;NR;NS=1083;PP;PV4=0.62,1,1,1;RA=6562;RL=263;RPP=3.0759;RR=267;RUN=1;ReadPosRankSum=0.090;SAB=0.55849;SAF=296;SAP=18.76;SAR=234;SC=AAAAACACAAATCAGATCGTG;SRB=0.51707;SRF=3393;SRP=19.614;SRR=3169;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=10.5533;dbSNP=126;set=Intersection;sumGLbyD=14.15
-20 36384872 . CTG C 43532.41 PASS AC=1213;AF=0.99589;AN=1218;BaseQRankSum=0.802;DP=3208;FS=9.727;HRun=0;HaplotypeScore=46.6153;InbreedingCoeff=0.1085;MQ=58.37;MQ0=50;MQ0Fraction=0.0156;MQRankSum=-1.672;QD=13.57;ReadPosRankSum=2.063;SB=-18894.12;VQSLOD=4.7353;set=VQSR
-20 36542802 . GTA G 31310.15 PASS AA=1481;AB=0.67546;ABA=1378;ABP=1138.4;ABR=2868;AC=437;AF=0.35938;AN=1216;BL=25719;BR=95500;BVAR;BaseQRankSum=9.478;DEL;DP=18068;DS;Dels=0.10;EL=889;EPP=132.34;ER=592;FS=320.726;HETAR=591;HOMA=44;HOMR=378;HRun=0;InbreedingCoeff=-0.4197;LEN=2;LRB=0.57566;LRBP=87231;MQ0Fraction=0.0091;MQM=29.319;MQRankSum=-3.409;NS=1013;RA=4037;RL=3;RPP=3193;RR=1478;RUN=1;ReadPosRankSum=-6.687;SAB=0.40041;SAF=593;SAP=130.61;SAR=888;SRB=0.39014;SRF=1575;SRP=426.21;SRR=2462;VQSLOD=-1.6586;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.49
-20 36985025 . CCA C 4.57 PASS AC=0;AF=0.0000;AN=682;BaseQRankSum=4.199;DP=1504;FS=1.036;HRun=0;HaplotypeScore=18.5241;InbreedingCoeff=0.0460;MQ=57.04;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.774;ReadPosRankSum=-2.105;VQSLOD=6.7455;set=VQSR
-20 37139725 . CAG C 250.77 PASS AF=0.0084;AF1=0.0139;BaseQRankSum=4.131;CI95=0.00885,0.01991;DP=7973;DP4=1808,1990,2,7;Dels=0.01;FQ=104;FR;FS=11.160;HP=3;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0001;MQ=103.71;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-3.378;NF;NR;PP;PV4=0.18,0.0011,0.041,1;ReadPosRankSum=0.605;SC=AGATGGGGAACAGAGAGCAAG;TC;TR=6;TU=AG;VQSLOD=7.0630;set=Intersection;sumGLbyD=12.13
-20 37213224 . G GTA 3230.05 PASS AA=32;AB=0.50769;ABA=32;ABP=3.0437;ABR=33;AC=12;AF=0.0168;AF1=0.02635;AN=714;BL=1271;BR=1743;BVAR;BaseQRankSum=-7.288;CI95=0.02212,0.03319;DP=14304;DP4=2180,2256,13,21;Dels=0.00;EL=20;EPP=7.3532;ER=12;FQ=999;FR;FS=7.863;HETAR=9;HOMA=0;HOMR=1043;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0410;LEN=2;LRB=0.1566;LRBP=163.52;MQ=95.56;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0005;MQM=51.562;MQRankSum=0.420;NF;NR;NS=1052;PP;PV4=0.23,1,0.03,0.33;RA=5138;RL=11;RPP=9.7962;RR=21;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.122;SAB=0.28125;SAF=9;SAP=16.311;SAR=23;SC=TTTGCATCCAGTAGCACCACT;SRB=0.42293;SRF=2173;SRP=268.11;SRR=2965;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=9.7315;set=Intersection;sumGLbyD=36.69
-20 37282014 . ATGG A 2518.52 PASS AF=0.03519;BaseQRankSum=11.994;DP=24592;DP4=415,3804,8,49;DS;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=2.049;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1028;MQ=51.01;MQ0Fraction=0.0139;MQRankSum=-5.912;NF;NR;PP;PV4=0.27,1,0.22,0.015;ReadPosRankSum=1.781;SC=GGTGGTGATGATGGTGGTGGT;TC;TR=17;TU=GGT;VQSLOD=2.1183;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=9.05
-20 37532218 . GTCCGTCCA ATCCGTCCA,G 76120.88 PASS AC=998;AF=0.92924;AN=1074;BaseQRankSum=-2.877;DP=3087;FR;FS=9.889;HP=2;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=T;HaplotypeScore=71.6244;InbreedingCoeff=-0.0027;MQ=52.68;MQ0=543;MQ0Fraction=0.1759;MQRankSum=-1.750;NF;NR;PP;QD=24.98;ReadPosRankSum=-0.850;SB=-36635.43;SC=CCGTCCGTCCGTCCGTCCATC;TC;TR=19;TU=CCGT;VQSLOD=5.3068;set=Intersection
-20 37712193 . AAG A 2670.33 PASS AA=106;AB=0.62821;ABA=87;ABP=36.418;ABR=147;AC=53;AF=0.0759;AN=698;BL=4672;BR=4303;BVAR;BaseQRankSum=13.696;DEL;DP=15155;DP4=1340,1852,32,52;Dels=0.06;EL=57;EPP=4.3214;ER=49;FR;FS=0.824;HETAR=43;HOMA=7;HOMR=982;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0861;LEN=2;LRB=0.041114;LRBP=35.954;MQ=86.12;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=54.236;MQRankSum=-5.745;NF;NR;NS=1034;PP;PV4=0.5,7.3e-26,1.1e-10,1;RA=4423;RL=58;RPP=5.0589;RR=48;RUN=1;ReadPosRankSum=2.617;SAB=0.38679;SAF=41;SAP=14.81;SAR=65;SC=GAAAATTCTGAAGAGAGTCAG;SRB=0.43093;SRF=1906;SRP=186.29;SRR=2517;TC;TR=6;TU=AG;VQSLOD=9.8131;set=Intersection;sumGLbyD=14.20
-20 37739002 . T TCA 1395.38 PASS AA=16;AB=0.48387;ABA=16;ABP=3.0803;ABR=15;AC=11;AF=0.00950;AN=1158;BL=504;BR=630;BVAR;BaseQRankSum=-3.257;DP=13617;DP4=1660,883,7,5;Dels=0.00;EL=7;EPP=3.5532;ER=9;FR;FS=1.114;HETAR=9;HOMA=0;HOMR=991;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0527;LEN=2;LRB=0.11111;LRBP=33.411;MQ=88.41;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=83.75;MQRankSum=1.713;NF;NR;NS=1000;PP;PV4=0.76,1,1,0.5;RA=3257;RL=6;RPP=5.1818;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=1.190;SAB=0.6875;SAF=11;SAP=7.8961;SAR=5;SC=CCTTTTTTGTTCATTTCTGCA;SRB=0.68806;SRF=2241;SRP=1003.5;SRR=1016;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=10.2220;set=Intersection;sumGLbyD=41.32
-20 38122459 . T TG,TGG 1346.40 PASS ABR=339;AC=37,26;AF=0.02989,0.02100;BVAR;BaseQRankSum=10.222;DP=16425;FS=601.551;HOMA=0;HOMR=1008;HaplotypeScore=20.6522;INS;InbreedingCoeff=0.0829;MQ=105.78;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-4.295;NS=1079;QD=0.40;RA=6208;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.427;SAB=1;SAR=0;SB=-368.88;SRB=0.34907;SRF=2167;SRP=1231.4;SRR=4041;VQSLOD=-3.3455;set=filterInVQSR-2of5
-20 38395256 . TTGAG T 633.19 PASS AF=0.0028;BaseQRankSum=5.667;DP=3839;Dels=0.00;FR;FS=10.238;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=-0.0097;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.276;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-1.016;SC=ATGTGTTTGTTTGAGTATGTT;TC;TR=10;TU=GTTT;VQSLOD=6.4906;set=Intersection;sumGLbyD=10.83
-20 38882632 rs72004513 AGTGTGTGTGT A,AGT,AGTGT,AGTGTGT,AGTGTGTGT,AGTGTGTGTGTGT 12304.47 PASS AC=57,24,51,78,89,186;AF=0.04664,0.01964,0.04173,0.06383,0.07283,0.15221;AN=1222;BVAR;BaseQRankSum=3.183;DB;DEL;DP=49261;DP4=144,106,104,101;Dels=0.05;FQ=999;FR;FS=5.209;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.9090;MQ=87.48;MQ0Fraction=0.0071;MQRankSum=-0.897;NF;NR;PP;PV4=0.16,1,0.19,1;RUN=1;ReadPosRankSum=3.551;SC=TAACTCCTCAAGTGTGTGTGT;TC;TR=47;TU=GT;VQSLOD=9.9069;set=Intersection;sumGLbyD=5.30
-20 39345038 . CTGAACCATAATGTG C,CCCATAATGTG 60744.52 PASS AA=23;AB=0.67143;ABA=23;ABP=20.878;ABR=47;AC=232,2;AF=0.19366,0.00167;AN=1198;BL=1607;BR=1843;BVAR;BaseQRankSum=30.955;DEL;DP=31490;DP4=1729,2100,265,278;Dels=0.13;EL=6;EPP=14.434;ER=17;FQ=999;FR;FS=1.767;HETAR=18;HOMA=0;HOMR=1015;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.1991;LEN=14;LRB=0.068406;LRBP=38.066;MQ=104.60;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=189.83;MQRankSum=-16.579;NF;NR;NS=1033;PP;PV4=0.12,1,5.5e-137,1;RA=5286;RL=14;RPP=5.3706;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=4.323;SAB=0.56522;SAF=13;SAP=3.86;SAR=10;SC=TGGGCTGGACCTGAACCATAA;SRB=0.46311;SRF=2448;SRP=65.493;SRR=2838;TC;TR=2;TU=C;VQSLOD=6.2643;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=65.43
-20 39418008 . AG A 46796 PASS AA=113;AB=0.9511;ABA=80;ABP=2894.6;ABR=1556;AC=30;AF=0.02412;AN=1244;BL=638;BR=6936;BVAR;BaseQRankSum=7.280;DEL;DP=14307;Dels=0.00;EL=50;EPP=6.2579;ER=63;FR;FS=5.707;HETAR=473;HOMA=361;HOMR=246;HP=3;HR=3;HRun=3;HU=G;InbreedingCoeff=0.0272;LEN=1;LRB=0.83153;LRBP=11375;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=62.398;MQRankSum=3.530;NF;NR;NS=1089;PP;RA=3000;RL=3;RPP=223.02;RR=110;RUN=1;ReadPosRankSum=-18.601;SAB=0.58407;SAF=66;SAP=9.9475;SAR=47;SC=ACTGGGGGAAAGGGATTCTAG;SRB=0.494;SRF=1482;SRP=3.9484;SRR=1518;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=4.5834;set=Intersection;sumGLbyD=3.06
-20 39876961 . GT G,GTT,GTTT 2302.10 PASS ABR=496;AC=45,51,45;AF=0.03664,0.04153,0.03664;AN=1228;BVAR;BaseQRankSum=4.462;DP=37649;DP4=1457,1975,57,59;Dels=0.02;FR;FS=9.938;HOMA=0;HOMR=978;HP=10;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2583;MQ=97.28;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.246;NF;NR;NS=1063;PP;PV4=0.15,1,1.9e-09,0.016;RA=5185;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.954;SC=AGTTTCTCCGGTTTTTTTTTT;SRB=0.47464;SRF=2461;SRP=31.978;SRR=2724;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=4.9752;set=Intersection;sumGLbyD=4.39
-20 41013333 . TC T 20681 PASS AA=137;AB=0.89211;ABA=134;ABP=1661.6;ABR=1108;AC=68;AF=0.05601;AN=1214;BL=1091;BR=8981;BVAR;BaseQRankSum=1.354;DEL;DP=12998;Dels=0.01;EL=57;EPP=11.395;ER=80;FS=0.758;HETAR=359;HOMA=100;HOMR=610;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0104;LEN=1;LRB=0.78336;LRBP=13424;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=67.745;MQRankSum=2.563;NS=1072;RA=4447;RL=5;RPP=258.66;RR=132;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.092;SAB=0.59124;SAF=81;SAP=12.917;SAR=56;SRB=0.54194;SRF=2410;SRP=70.947;SRR=2037;VQSLOD=3.7531;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.14
-20 41453533 rs112736557 T TA 1734.60 PASS AA=44;AB=0.58025;ABA=34;ABP=7.5409;ABR=47;AC=23;AF=0.0345;AN=666;BL=2061;BR=2408;BVAR;BaseQRankSum=5.768;DB;DP=7437;Dels=0.00;EL=25;EPP=4.787;ER=19;FR;FS=3.680;HETAR=17;HOMA=5;HOMR=975;HP=7;HPLen=6;HR=6;HRun=6;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.1712;LEN=1;LRB=0.077646;LRBP=61.517;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.614;MQRankSum=-4.976;NF;NR;NS=997;PP;RA=4229;RL=21;RPP=3.2077;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.039;SAB=0.5;SAF=22;SAP=3.0103;SAR=22;SC=CCTTTCTCCATAAAAAAGCTT;SRB=0.46299;SRF=1958;SRP=53.315;SRR=2271;TC;TR=6;TU=A;VQSLOD=7.8972;set=Intersection;sumGLbyD=13.16
-20 41659532 . GC G 40544 PASS AA=42;AB=0.97149;ABA=39;ABP=2644.5;ABR=1329;AC=15;AF=0.0209;AN=716;BL=2531;BR=135;BVAR;BaseQRankSum=-2.537;DEL;DP=12219;Dels=0.00;EL=25;EPP=6.3192;ER=17;FS=2.656;HETAR=374;HOMA=155;HOMR=551;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0270;LEN=1;LRB=0.89872;LRBP=4678.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=103.31;MQRankSum=2.828;NS=1088;RA=4736;RL=41;RPP=85.733;RR=1;RUN=1;ReadPosRankSum=-9.702;SAB=0.57143;SAF=24;SAP=4.8716;SAR=18;SRB=0.5625;SRF=2664;SRP=163.7;SRR=2072;VQSLOD=4.3267;set=Intersection;sumGLbyD=3.22
-20 41687456 . A AT 19682 PASS AA=446;AB=0.61202;ABA=426;ABP=122.69;ABR=672;AC=162;AF=0.13214;AN=1226;BL=15293;BR=20484;BVAR;BaseQRankSum=2.364;DP=29324;DP4=1993,1785,261,252;Dels=0.01;EL=214;EPP=4.5878;ER=232;FQ=999;FR;FS=1.923;HETAR=170;HOMA=7;HOMR=897;HP=11;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0769;LEN=1;LRB=0.14509;LRBP=1638.5;MQ=91.55;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=57.168;MQRankSum=-0.764;NF;NR;NS=1074;PP;PV4=0.45,1,3.5e-08,1;RA=5437;RL=179;RPP=40.714;RR=267;RUN=1;ReadPosRankSum=0.356;SAB=0.51794;SAF=231;SAP=4.2567;SAR=215;SC=AGAAAACCTTATTTTTTTTTC;SRB=0.51094;SRF=2778;SRP=8.666;SRR=2659;TC;TR=9;TU=T;VQSLOD=9.6786;set=Intersection;sumGLbyD=10.93
-20 41845580 . GA G 49310 PASS AA=83;AB=0.95258;ABA=69;ABP=2591.6;ABR=1386;AC=46;AF=0.03740;AN=1230;BL=1320;BR=5150;BVAR;BaseQRankSum=-1.121;DEL;DP=13336;Dels=0.00;EL=36;EPP=6.1759;ER=47;FR;FS=0.372;HETAR=442;HOMA=341;HOMR=295;HP=2;HR=3;HRun=1;HU=G;InbreedingCoeff=0.0238;LEN=1;LRB=0.59196;LRBP=4926.2;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=89.048;MQRankSum=0.897;NF;NR;NS=1080;PP;RA=3006;RL=5;RPP=142.43;RR=78;RUN=1;ReadPosRankSum=-15.412;SAB=0.55422;SAF=46;SAP=5.1294;SAR=37;SC=CCAGCTGTGGGAGAGAAACAT;SRB=0.47971;SRF=1442;SRP=13.762;SRR=1564;TC;TR=6;TU=AG;VQSLOD=4.4669;set=Intersection;sumGLbyD=3.65
-20 42209428 . GC G 13163 PASS AA=89;AB=0.86677;ABA=83;ABP=730.96;ABR=540;AC=39;AF=0.03218;AN=1212;BL=950;BR=5334;BVAR;BaseQRankSum=-10.119;DEL;DP=10692;Dels=0.01;EL=48;EPP=4.2058;ER=41;FS=0.000;HETAR=259;HOMA=727;HOMR=54;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0448;LEN=1;LRB=0.69764;LRBP=6644.4;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=126.55;MQRankSum=4.223;NS=1040;RA=723;RL=12;RPP=106.09;RR=77;RUN=1;ReadPosRankSum=-17.362;SAB=0.39326;SAF=35;SAP=11.818;SAR=54;SRB=0.37898;SRF=274;SRP=94.99;SRR=449;VQSLOD=3.7157;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.48
-20 42281109 . T TAG 2321.12 PASS AC=181;AF=0.3740;AN=484;BaseQRankSum=8.977;DP=435;FS=17.001;HRun=0;HaplotypeScore=14.6734;InbreedingCoeff=0.2340;MQ=53.88;MQ0=47;MQ0Fraction=0.1080;MQRankSum=0.762;QD=12.41;ReadPosRankSum=3.399;SB=-1299.73;VQSLOD=4.8926;set=VQSR
-20 42436117 . TC T 38933 PASS AA=18;AB=0.98435;ABA=17;ABP=2215.9;ABR=1069;AC=15;AF=0.01223;AN=1226;BL=498;BR=428;BVAR;BaseQRankSum=-7.224;DEL;DP=12436;Dels=0.00;EL=1;EPP=33.893;ER=17;FS=2.469;HETAR=303;HOMA=614;HOMR=123;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0439;LEN=1;LRB=0.075594;LRBP=14.501;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=98.611;MQRankSum=1.086;NS=1075;RA=1656;RL=10;RPP=3.4928;RR=8;RUN=1;ReadPosRankSum=-17.765;SAB=0.5;SAF=9;SAP=3.0103;SAR=9;SRB=0.49879;SRF=826;SRP=3.0313;SRR=830;VQSLOD=4.0821;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.04
-20 42682214 . C A,CAT 3904.51 PASS AA=24;AB=0.6383;ABA=17;ABP=10.818;ABR=30;AC=0;AF=0.0000;AN=636;BL=1119;BR=949;BVAR;BaseQRankSum=1.426;DP=6509;Dels=0.00;EL=9;EPP=6.2675;ER=15;FR;HETAR=12;HOMA=3;HOMR=876;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0006;LEN=2;LRB=0.082205;LRBP=33.356;MQ0Fraction=0.0046;MQM=40.792;MQRankSum=-0.296;NF;NR;NS=891;PP;QD=32.81;RA=2679;RL=15;RPP=6.2675;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.806;SAB=0.75;SAF=18;SAP=16.039;SAR=6;SB=-924.23;SC=TATACACACACATATATATAC;SRB=0.66293;SRF=1776;SRP=620.76;SRR=903;TC;TR=9;TU=AC;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=32.75
-20 42973456 . CA C,CAA,CAAA 2675 PASS AA=90;AB=0.79177;ABA=86;ABP=308.39;ABR=327;AC=77,61,39;AF=0.06492,0.05143,0.03288;AN=1186;BL=2983;BR=4446;BVAR;BaseQRankSum=2.422;DP=9416;Dels=0.03;EL=39;EPP=6.4847;ER=51;FR;FS=31.555;HETAR=75;HOMA=1;HOMR=888;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.2696;LEN=1;LRB=0.19693;LRBP=628.63;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=55.567;MQRankSum=1.777;NF;NR;NS=964;PP;RA=3601;RL=37;RPP=9.1869;RR=53;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.991;SAB=0.55556;SAF=50;SAP=5.423;SAR=40;SC=TAGTGACTGTCAAAAAAAAAA;SRB=0.60622;SRF=2183;SRP=355.91;SRR=1418;TC;TR=11;TU=A;VQSLOD=1.0763;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.05
-20 43091870 . TC T 2455.60 PASS AA=120;AB=0.10619;ABA=101;ABP=155.22;ABR=12;AC=42;AF=0.03825;AN=1098;BL=573;BR=8744;BVAR;BaseQRankSum=-13.513;DEL;DP=9139;Dels=0.00;EL=64;EPP=4.1684;ER=56;FS=9.856;HETAR=118;HOMA=820;HOMR=0;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0833;LEN=1;LRB=0.877;LRBP=15564;MQ0Fraction=0.0017;MQM=45.1;MQRankSum=2.266;NS=938;RA=24;RL=1;RPP=254.97;RR=119;RUN=1;ReadPosRankSum=-15.803;SAB=0.475;SAF=57;SAP=3.6617;SAR=63;SRB=0.54167;SRF=13;SRP=3.3722;SRR=11;VQSLOD=3.9930;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.09
-20 43233648 rs74585029 GA G,GAA 1504.40 PASS AA=113;AB=0.78652;ABA=95;ABP=320.31;ABR=350;AC=41,65;AF=0.03394,0.05381;AF1=0.0115;AN=1208;BL=4677;BR=5548;BVAR;BaseQRankSum=6.744;CI95=0.004274,0.01852;DB;DEL;DP=13996;DP4=1736,1549,15,17;Dels=0.03;EL=69;EPP=15.021;ER=44;FQ=14;FR;FS=12.174;HETAR=119;HOMA=15;HOMR=892;HP=11;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.2359;LEN=1;LRB=0.085183;LRBP=164.12;MQ=89.12;MQ0Fraction=0.0000;MQM=69.867;MQRankSum=2.513;NF;NR;NS=1027;PP;PV4=0.59,1,0.065,0.33;RA=3845;RL=46;RPP=11.485;RR=67;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.957;SAB=0.33628;SAF=38;SAP=29.318;SAR=75;SC=AAAACAGCCAGAAAAAAAAAA;SRB=0.43667;SRF=1679;SRP=136.95;SRR=2166;TC;TR=10;TU=A;VQSLOD=4.5121;set=Intersection;sumGLbyD=8.22
-20 43246548 . AC A,CC 41579.13 PASS AA=382;AB=0.72402;ABA=316;ABP=502.11;ABR=829;AC=1197;AF=0.99254;AN=1206;BL=9889;BR=14293;BVAR;BaseQRankSum=1.373;DEL;DP=10477;DS;Dels=0.05;EL=243;EPP=64.494;ER=139;FS=29.162;HETAR=291;HOMA=85;HOMR=624;HPLen=10;InbreedingCoeff=0.1392;LEN=1;LRB=0.18212;LRBP=1744.6;MQ0Fraction=0.0024;MQM=48.471;MQRankSum=5.726;NS=1001;RA=3138;RL=174;RPP=9.5816;RR=208;RUN=1;ReadPosRankSum=5.755;SAB=0.79843;SAF=305;SAP=298.51;SAR=77;SRB=0.70363;SRF=2208;SRP=1133.2;SRR=930;VQSLOD=5.6318;set=Intersection;sumGLbyD=5.22
-20 43258646 . T TT 1107.17 PASS AC=97;AF=0.08420;AN=1152;BaseQRankSum=4.525;DP=2345;FS=19.308;HRun=9;HaplotypeScore=13.6276;InbreedingCoeff=0.1299;MQ=76.70;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.395;QD=2.67;ReadPosRankSum=-4.696;SB=-899.41;VQSLOD=5.4523;set=VQSR
-20 43718299 . ATTACT A 5497.06 PASS AA=56;AB=0.51818;ABA=53;ABP=3.3262;ABR=57;AC=18;AF=0.0251;AF1=0.03729;AN=718;BL=2321;BR=2591;BVAR;BaseQRankSum=11.142;CI95=0.03319,0.04425;DEL;DP=17576;DP4=2460,2692,31,22;Dels=0.02;EL=28;EPP=3.0103;ER=28;FQ=999;FR;FS=9.689;HETAR=15;HOMA=1;HOMR=1068;HP=2;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0448;LEN=5;LRB=0.054967;LRBP=35.238;MQ=96.55;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=50.286;MQRankSum=-5.149;NF;NR;NS=1084;PP;PV4=0.13,1,1.2e-12,1;RA=6745;RL=28;RPP=3.0103;RR=28;RUN=1;ReadPosRankSum=0.828;SAB=0.5;SAF=28;SAP=3.0103;SAR=28;SC=ATGACAGTGGATTACTTTAGT;SRB=0.46835;SRF=3159;SRP=61.709;SRR=3586;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=7.8832;set=Intersection;sumGLbyD=46.60
-20 43981749 . A AAAAAAC,AC 20899.71 PASS ABR=192;AC=91,0;AF=0.1285,0.0000;AN=708;BVAR;BaseQRankSum=7.858;DP=23372;DP4=1554,1457,55,42;Dels=0.00;FR;FS=0.000;HOMA=4;HOMR=995;HP=6;HPLen=7;HR=7;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2109;MQ=95.59;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-12.081;NF;NR;NS=1051;PP;PV4=0.35,1,8.9e-73,1;RA=5027;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.359;SC=TACACTAGCAAAAAAACAAAA;SRB=0.48518;SRF=2439;SRP=12.6;SRR=2588;TC;TR=7;TU=A;VQSLOD=8.0916;set=Intersection;sumGLbyD=54.33
-20 43999274 . TCAAA T 2948.85 PASS AA=59;AB=0.59441;ABA=58;ABP=14.08;ABR=85;AC=20;AF=0.0290;AF1=0.04249;AN=690;BL=2277;BR=2436;BVAR;BaseQRankSum=9.320;CI95=0.0354,0.05088;DEL;DP=14599;DP4=2052,2303,21,22;Dels=0.03;EL=32;EPP=3.9304;ER=27;FQ=999;FR;FS=0.000;HETAR=21;HOMA=0;HOMR=1043;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0037;LEN=4;LRB=0.033736;LRBP=14.658;MQ=90.05;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.339;MQRankSum=-1.294;NF;NR;NS=1064;PP;PV4=0.88,1,0.0026,1;RA=5732;RL=27;RPP=3.9304;RR=32;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.915;SAB=0.47458;SAF=28;SAP=3.3415;SAR=31;SC=GGTACACAGCTCAAACAGTCT;SRB=0.4836;SRF=2772;SRP=16.4;SRR=2960;TC;TR=1;TU=C;VQSLOD=9.8086;set=Intersection;sumGLbyD=27.09
-20 44098622 . C CG 1092.40 PASS AA=129;AB=0.77301;ABA=74;ABP=214.06;ABR=252;AC=45;AF=0.0455;AN=988;BL=6586;BR=3029;BVAR;BaseQRankSum=2.802;DP=5177;Dels=0.00;EL=122;EPP=225.63;ER=7;FR;FS=355.273;HETAR=66;HOMA=11;HOMR=734;HP=6;HR=4;HRun=4;HU=G;INS;InbreedingCoeff=0.1759;LEN=1;LRB=0.36994;LRBP=2860.4;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=52.395;MQRankSum=1.946;NF;NR;NS=811;PP;RA=1981;RL=121;RPP=217.95;RR=8;RUN=1;ReadPosRankSum=-6.413;SAB=0.99225;SAF=128;SAP=274.51;SAR=1;SC=GCGGAAGTGGCGGGGACCCTT;SRB=0.41242;SRF=817;SRP=135;SRR=1164;TC;TR=4;TU=G;VQSLOD=-2.2690;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.04
-20 44327637 . A AG,AGGGGGG 14351.23 PASS AC=9,211;AF=0.0103,0.2409;AN=876;BaseQRankSum=15.517;DP=1704;FS=6.768;HaplotypeScore=31.5906;InbreedingCoeff=0.1538;MQ=54.64;MQ0=4;MQ0Fraction=0.0023;MQRankSum=-12.691;QD=20.83;ReadPosRankSum=-3.583;SB=-6278.99;VQSLOD=5.1556;set=VQSR
-20 45202636 . GA G 13269 PASS AA=25;AB=0.96162;ABA=18;ABP=871.09;ABR=451;AC=24;AF=0.02013;AN=1192;BL=567;BR=1728;BVAR;BaseQRankSum=-5.361;DEL;DP=10873;Dels=0.00;EL=10;EPP=5.1818;ER=15;FS=0.928;HETAR=169;HOMA=831;HOMR=45;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0999;LEN=1;LRB=0.50588;LRBP=1278.4;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=170.56;MQRankSum=0.161;NS=1049;RA=632;RL=2;RPP=41.315;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.760;SAB=0.68;SAF=17;SAP=10.046;SAR=8;SRB=0.51424;SRF=325;SRP=4.1235;SRR=307;VQSLOD=3.9290;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.90
-20 45417828 . TGAGC T,TGC 4672.90 PASS ABR=317;AC=69,104;AF=0.05712,0.08609;BVAR;BaseQRankSum=18.527;DEL;DP=11835;DS;FS=184.873;HOMA=48;HOMR=575;HaplotypeScore=65.5875;InbreedingCoeff=0.0599;MQ=29.78;MQ0=2988;MQ0Fraction=0.3629;MQRankSum=5.052;NS=713;QD=1.11;RA=1581;RUN=1;ReadPosRankSum=6.574;SB=-2116.87;SRB=0.47502;SRF=751;SRP=11.582;SRR=830;VQSLOD=0.0651;set=filterInVQSR-2of5
-20 45525657 rs66759083 TA AA,T 49315 PASS AA=2361;AB=0.45241;ABA=1398;ABP=53.235;ABR=1155;AC=20;AF=0.01701;AN=1176;BL=94913;BR=100886;BVAR;BaseQRankSum=0.740;DB;DEL;DP=30636;DP4=1258,881,1206,999;Dels=0.48;EL=1133;EPP=11.311;ER=1228;FQ=999;FR;FS=7.072;HETAR=503;HOMA=310;HOMR=218;HP=6;HPLen=7;HR=7;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.2271;LEN=1;LRB=0.030506;LRBP=398.68;MQ=102.24;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.359;MQRankSum=0.148;NF;NR;NS=1031;PP;PV4=0.0064,0,4.6e-23,0.47;RA=2042;RL=1183;RPP=3.0333;RR=1178;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.999;SAB=0.52139;SAF=1231;SAP=12.392;SAR=1130;SC=AGGATTTTTTTAAAAAGTTTT;SRB=0.55093;SRF=1125;SRP=49.017;SRR=917;TC;TR=7;TU=T;VQSLOD=7.1651;dbSNP=114;set=Intersection;sumGLbyD=18.51
-20 45783456 . T TG 2355.68 PASS AA=64;AB=0.78521;ABA=61;ABP=203.67;ABR=223;AC=15;AF=0.0165;AN=910;BL=815;BR=5486;BVAR;BaseQRankSum=8.593;DP=10348;Dels=0.00;EL=48;EPP=37.754;ER=16;FS=77.861;HETAR=56;HOMA=1;HOMR=970;HRun=1;INS;InbreedingCoeff=-0.0549;LEN=1;LRB=0.74131;LRBP=7522.1;MQ0Fraction=0.0122;MQM=44.562;MQRankSum=-1.258;NS=1027;RA=4750;RL=0;RPP=141.98;RR=64;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.047;SAB=0.25;SAF=16;SAP=37.754;SAR=48;SRB=0.6;SRF=2850;SRP=415.59;SRR=1900;VQSLOD=1.3146;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.03
-20 46384744 . CT C 17791 PASS AA=51;AB=0.94826;ABA=49;ABP=1655.8;ABR=898;AC=23;AF=0.01867;AN=1232;BL=120;BR=3678;BVAR;BaseQRankSum=-0.185;DEL;DP=13879;Dels=0.00;EL=23;EPP=4.0747;ER=28;FS=2.864;HETAR=262;HOMA=78;HOMR=722;HRun=2;InbreedingCoeff=0.0193;LEN=1;LRB=0.93681;LRBP=7240.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=66.667;MQRankSum=1.031;NS=1079;RA=5295;RL=0;RPP=113.76;RR=51;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.934;SAB=0.54902;SAF=28;SAP=4.0747;SAR=23;SRB=0.54674;SRF=2895;SRP=103.49;SRR=2400;VQSLOD=3.0419;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.47
-20 46517110 . C CT 868.55 PASS AC=15;AF=0.0218;AN=688;BaseQRankSum=8.522;DP=1752;FS=6.570;HRun=0;HaplotypeScore=14.9548;InbreedingCoeff=0.0452;MQ=77.73;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=3.874;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-396.78;VQSLOD=6.7740;set=VQSR
-20 46629361 . TTTCTTTC T,TTTTC 13000.91 PASS AC=188,107;AF=0.2212,0.1259;AN=850;BaseQRankSum=7.214;DP=1846;FS=14.502;HaplotypeScore=40.8481;InbreedingCoeff=0.3210;MQ=50.74;MQ0=79;MQ0Fraction=0.0428;MQRankSum=-6.348;QD=13.59;ReadPosRankSum=3.943;SB=-3581.20;VQSLOD=5.9412;set=VQSR
-20 46951099 . G GT 1662.30 PASS AA=55;AB=0.7713;ABA=51;ABP=145.58;ABR=172;AC=47;AF=0.03923;AN=1198;BL=3288;BR=2434;BVAR;BaseQRankSum=-4.014;DP=27423;DP4=1483,1590,58,42;Dels=0.01;EL=21;EPP=9.6826;ER=34;FR;FS=9.565;HETAR=48;HOMA=0;HOMR=913;HP=16;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0952;LEN=1;LRB=0.14925;LRBP=279.78;MQ=70.36;MQ0Fraction=0.0124;MQM=52.545;MQRankSum=0.717;NF;NR;NS=961;PP;PV4=0.067,1,1,0.17;RA=3035;RL=38;RPP=20.422;RR=17;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.014;SAB=0.47273;SAF=26;SAP=3.3656;SAR=29;SC=TTTGTTTTTTGTTTTTTTTTT;SRB=0.36013;SRF=1093;SRP=518.73;SRR=1942;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=5.4779;set=Intersection;sumGLbyD=3.49
-20 47201076 rs58052846 C CT 982.16 PASS AC=50;AF=0.0551;AN=908;BaseQRankSum=12.598;DB;DP=2449;FS=35.648;HRun=0;HaplotypeScore=29.4602;InbreedingCoeff=-0.0542;MQ=63.54;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=2.196;QD=3.16;ReadPosRankSum=-13.833;SB=-488.19;VQSLOD=6.0429;set=VQSR
-20 47965974 rs60011158 G GA 999 PASS AA=21;AB=0.57143;ABA=21;ABP=5.1818;ABR=28;AC=7;AF=0.0101;AF1=0.02061;AN=690;BL=1043;BR=577;BVAR;BaseQRankSum=-3.087;CI95=0.01549,0.02655;DB;DP=14578;DP4=1554,3055,6,17;Dels=0.00;EL=11;EPP=3.1137;ER=10;FQ=999;FR;FS=5.982;HETAR=7;HOMA=0;HOMR=1041;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=1;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0356;LEN=1;LRB=0.28765;LRBP=294.09;MQ=80.17;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=64.19;MQRankSum=2.137;NF;NR;NS=1048;PP;PV4=0.51,1,1,1;RA=5224;RL=16;RPP=15.522;RR=5;RUN=1;ReadPosRankSum=0.236;SAB=0.38095;SAF=8;SAP=5.5954;SAR=13;SC=TTCATGTACAGAGCTGCTGTG;SRB=0.31183;SRF=1629;SRP=1609.6;SRR=3595;TC;TR=4;TU=AG;VQSLOD=9.5466;dbSNP=129;set=Intersection;sumGLbyD=13.83
-20 48402974 rs57331436 GA G 27741 PASS AA=401;AB=0.5372;ABA=311;ABP=11.089;ABR=361;AC=84;AF=0.1186;AN=708;BL=16591;BR=14776;BVAR;BaseQRankSum=14.621;DB;DEL;DP=30607;DP4=1928,2310,195,225;Dels=0.11;EL=189;EPP=5.8749;ER=212;FQ=999;FR;FS=15.568;HETAR=110;HOMA=30;HOMR=923;HP=4;HPLen=3;HR=1;HRun=3;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1263;KGPilot123;LEN=1;LRB=0.057863;LRBP=231.06;MQ=106.68;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=63.005;MQRankSum=-2.010;NF;NR;NS=1063;PP;PV4=0.72,1,0.001,1;RA=5258;RL=223;RPP=13.976;RR=178;RUN=1;ReadPosRankSum=1.337;SAB=0.37656;SAF=151;SAP=56.084;SAR=250;SC=TGCCCTCAAAGAGAAAAAGGA;SRB=0.38075;SRF=2002;SRP=652.44;SRR=3256;TC;TR=5;TU=AG;VQSLOD=8.7259;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=15.86
-20 48519434 rs56747320 TA T,TAA 26754 PASS AC=91,355;AF=0.07738,0.30187;AN=1176;BVAR;BaseQRankSum=-5.499;DB;DEL;DP=24872;DP4=726,883,443,502;Dels=0.04;FR;FS=1.430;HP=12;HR=12;HRun=12;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2576;LEN=1;MQ=71.86;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQRankSum=-0.526;NF;NR;PP;PV4=0.41,1,0.00077,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.130;SC=CGTCTTAAACTAAAAAAAAAA;TC;TR=12;TU=A;VQSLOD=7.3200;set=Intersection;sumGLbyD=10.43
-20 49086519 rs111404890 CA C,CAA 1379.10 PASS AA=43;AB=0.672;ABA=41;ABP=35.131;ABR=84;AC=7,14;AF=0.0100,0.0201;AN=698;BL=1097;BR=2286;BVAR;BaseQRankSum=-2.656;DB;DP=9319;Dels=0.00;EL=22;EPP=3.0608;ER=21;FR;FS=1.147;HETAR=20;HOMA=0;HOMR=1029;HP=11;HPLen=8;HR=8;HRun=8;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0760;LEN=1;LRB=0.35146;LRBP=910.45;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=47.674;MQRankSum=2.682;NF;NR;NS=1049;PP;RA=5237;RL=10;RPP=29.724;RR=33;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.367;SAB=0.48837;SAF=21;SAP=3.0608;SAR=22;SC=GTAAAACAAACAAAAAAAATG;SRB=0.48635;SRF=2547;SRP=11.489;SRR=2690;TC;TR=11;TU=AAAC;VQSLOD=7.3084;set=Intersection;sumGLbyD=9.84
-20 49101936 . C CT 404.46 PASS AC=40;AF=0.03559;AN=1124;BaseQRankSum=0.750;DP=2162;FS=14.291;HRun=2;HaplotypeScore=30.9513;InbreedingCoeff=-0.0082;MQ=49.78;MQ0=113;MQ0Fraction=0.0523;MQRankSum=-1.289;QD=1.94;ReadPosRankSum=-2.041;SB=-385.48;VQSLOD=4.6365;set=VQSR
-20 49681276 . TC T 40042 PASS AA=72;AB=0.93908;ABA=70;ABP=1927.1;ABR=1079;AC=18;AF=0.0196;AN=918;BL=514;BR=4340;BVAR;BaseQRankSum=0.869;DEL;DP=10368;Dels=0.00;EL=33;EPP=4.096;ER=39;FS=17.302;HETAR=389;HOMA=269;HOMR=405;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0626;LEN=1;LRB=0.78822;LRBP=6551.6;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=123.06;MQRankSum=-1.047;NS=1064;RA=3095;RL=3;RPP=134.38;RR=69;RUN=1;ReadPosRankSum=-10.928;SAB=0.58333;SAF=42;SAP=7.3532;SAR=30;SRB=0.57738;SRF=1787;SRP=163.99;SRR=1308;VQSLOD=2.8517;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.69
-20 49690436 . GT G 473.74 PASS AF=0.0263;AF1=0.02287;BaseQRankSum=3.830;CI95=0.01327,0.03319;DP=7473;DP4=2241,1740,14,12;Dels=0.01;FQ=129;FR;FS=0.000;HP=4;HPLen=4;HR=4;HRun=4;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1310;MQ=51.71;MQ0Fraction=0.0407;MQRankSum=1.792;NF;NR;PP;PV4=0.84,5.7e-10,0.22,1;ReadPosRankSum=0.973;SC=GTAGGACGGGGTTTTACCATG;TC;TR=4;TU=T;VQSLOD=7.4809;set=Intersection;sumGLbyD=10.96
-20 49731218 . ATTTTATTTTTTATT A,ATTTTATT 8398.93 PASS AF=0.0656,0.0156;AF1=0.0996;BaseQRankSum=13.996;CI95=0.07743,0.1239;DP=6308;DP4=951,1311,23,35;Dels=0.05;FQ=999;FR;FS=12.503;HP=7;HPLen=4;HR=4;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1892;MQ=57.61;MQ0Fraction=0.0145;MQRankSum=-5.208;NF;NR;PP;PV4=0.79,1,6.3e-06,0.16;ReadPosRankSum=-2.239;SC=TATTTTATTTATTTTATTTTT;TC;TR=11;TU=ATTT;VQSLOD=4.3191;set=Intersection;sumGLbyD=42.27
-20 49894989 . TA T 172.25 PASS AF=0.0140;BaseQRankSum=7.220;DP=3882;Dels=0.00;FS=17.217;HPLen=2;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0531;MQ0Fraction=0.0214;MQRankSum=-0.661;ReadPosRankSum=-0.592;VQSLOD=3.0905;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.60
-20 50010923 rs66516522 C CT,CTGG 35851 PASS ABR=555;AC=310,11;AF=0.26451,0.00939;BVAR;BaseQRankSum=10.662;DB;DP=8188;FR;FS=34.411;HOMA=261;HOMR=399;HP=5;HR=6;HU=C;HaplotypeScore=45.1715;INS;InbreedingCoeff=0.2090;MQ=72.80;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=9.015;NF;NR;NS=831;PP;QD=9.69;RA=1986;RUN=1;ReadPosRankSum=-24.284;SB=-6038.55;SC=TGTCTGTCCCCCCTCAGCACT;SRB=0.45972;SRF=913;SRP=31.001;SRR=1073;TC;TR=6;TU=C;VQSLOD=6.1824;set=Intersection
-20 50059710 . C CCA 4175.86 PASS AA=28;AB=0.62963;ABA=20;ABP=10.892;ABR=34;AC=36;AF=0.0738;AN=488;BL=1050;BR=1273;BVAR;BaseQRankSum=3.198;DP=9138;Dels=0.00;EL=10;EPP=7.9737;ER=18;FR;FS=19.190;HETAR=10;HOMA=2;HOMR=1053;HP=6;HPLen=7;HR=7;HRun=0;HU=C;INS;InbreedingCoeff=0.1390;LEN=2;LRB=0.095997;LRBP=49.496;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=57.464;MQRankSum=-1.875;NF;NR;NS=1065;PP;RA=5745;RL=12;RPP=4.2511;RR=16;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.894;SAB=0.5;SAF=14;SAP=3.0103;SAR=14;SC=GGAGACCCCCCCTTCATCCTA;SRB=0.48129;SRF=2765;SRP=20.482;SRR=2980;TC;TR=7;TU=C;VQSLOD=5.1567;set=Intersection;sumGLbyD=11.49
-20 50228709 rs71192536 TG T 20517 PASS AA=924;AB=0.50203;ABA=735;ABP=3.0633;ABR=741;AC=200;AF=0.16502;AN=1212;BL=35460;BR=34197;BVAR;BaseQRankSum=13.810;DB;DEL;DP=32402;DP4=1760,2065,395,449;Dels=0.16;EL=439;EPP=7.9831;ER=485;FQ=999;FR;FS=0.558;HETAR=242;HOMA=63;HOMR=764;HP=5;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.1050;LEN=1;LRB=0.018132;LRBP=52.738;MQ=105.83;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.87;MQRankSum=3.895;NF;NR;NS=1069;PP;PV4=0.7,1.5e-173,1,1;RA=4708;RL=486;RPP=8.4249;RR=438;RUN=1;ReadPosRankSum=1.586;SAB=0.43615;SAF=403;SAP=35.733;SAR=521;SC=GTTTTCCAGGTGGGAAGACCG;SRB=0.44074;SRF=2075;SRP=146.62;SRR=2633;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=10.4820;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=15.35
-20 50236115 . AGG A,ACGGG,AG,AGGG 7429.57 PASS AC=192,13,221,183;AF=0.2115,0.0143,0.2434,0.2015;AN=908;BaseQRankSum=1.045;DP=1177;FS=13.479;HaplotypeScore=11.8294;InbreedingCoeff=0.7959;MQ=52.98;MQ0=6;MQ0Fraction=0.0051;MQRankSum=-1.482;QD=7.28;ReadPosRankSum=-2.380;SB=-1229.31;VQSLOD=8.3762;set=VQSR
-20 51589568 . TAAAC AAAAC,T 12477.52 PASS AF=0.27949;BaseQRankSum=-28.122;DP=3777;Dels=0.00;FR;FS=31.799;HP=7;HPLen=4;HR=3;HRun=0;HU=A;InbreedingCoeff=-0.1429;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.196;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-16.483;SC=AAATTCAAAATAAACAAACAA;TC;TR=18;TU=AAAC;VQSLOD=3.9201;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=52.43
-20 51617742 . TGC T,TGCGC 1374.91 PASS AF=0.06000,0.02000;BaseQRankSum=12.051;DP=6231;Dels=0.00;FS=189.609;HPLen=1;HRun=0;InbreedingCoeff=0.0862;MQ0Fraction=0.0180;MQRankSum=-2.959;ReadPosRankSum=-5.090;VQSLOD=-2.8715;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.97
-20 51770354 . AG A 1010.90 PASS AA=26;AB=0.52727;ABA=26;ABP=3.3656;ABR=29;AC=7;AF=0.0097;AF1=0.01637;AN=718;BL=1034;BR=964;BVAR;BaseQRankSum=5.588;CI95=0.01327,0.02212;DEL;DP=16259;DP4=2785,2239,15,10;Dels=0.01;EL=11;EPP=4.3466;ER=15;FQ=999;FR;FS=3.367;HETAR=8;HOMA=0;HOMR=1064;HP=2;HPLen=2;HR=2;HRun=2;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.0557;LEN=1;LRB=0.035035;LRBP=8.3357;MQ=90.48;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=61.346;MQRankSum=-0.019;NF;NR;NS=1072;PP;PV4=0.69,2.1e-08,0.078,1;RA=6173;RL=13;RPP=3.0103;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.460;SAB=0.61538;SAF=16;SAP=6.017;SAR=10;SC=GTGGTCCTGCAGGTCAATAAT;SRB=0.56342;SRF=3478;SRP=218.68;SRR=2695;TC;TR=2;TU=G;VQSLOD=10.1601;set=Intersection;sumGLbyD=14.60
-20 51848430 . AT A,ATT 999 PASS AA=39;AB=0.83408;ABA=37;ABP=219.19;ABR=186;AC=14,33;AF=0.0153,0.0359;AF1=0.03062;AN=918;BL=1676;BR=1732;BVAR;BaseQRankSum=3.338;CI95=0.02212,0.03982;DP=14886;DP4=1970,1762,22,31;Dels=0.01;EL=18;EPP=3.5114;ER=21;FQ=999;FR;FS=3.004;HETAR=31;HOMA=0;HOMR=1040;HP=10;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1629;LEN=1;LRB=0.016432;LRBP=5.0085;MQ=80.05;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.667;MQRankSum=0.325;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=0.13,1,0.0095,0.064;RA=5318;RL=21;RPP=3.5114;RR=18;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.493;SAB=0.46154;SAF=18;SAP=3.5114;SAR=21;SC=ACAAAACAATATTTTTTTTTC;SRB=0.4968;SRF=2642;SRP=3.4823;SRR=2676;TC;TR=9;TU=T;VQSLOD=5.7417;set=Intersection;sumGLbyD=7.57
-20 51897203 . T TG 8427.20 PASS AA=237;AB=0.69846;ABA=215;ABP=246.92;ABR=498;AC=117;AF=0.1662;AN=704;BL=14961;BR=5990;BVAR;BaseQRankSum=22.203;DP=9710;Dels=0.00;EL=83;EPP=49.198;ER=154;FR;FS=9.450;HETAR=123;HOMA=9;HOMR=895;HP=5;HPLen=6;HR=6;HRun=0;HU=T;INS;InbreedingCoeff=-0.0513;LEN=1;LRB=0.42819;LRBP=8344.3;MQ0Fraction=0.0291;MQM=45.861;MQRankSum=-10.426;NF;NR;NS=1027;PP;RA=4919;RL=210;RPP=309.85;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.843;SAB=0.29536;SAF=70;SAP=89.219;SAR=167;SC=TTTGTTTGTTTTTTGTTGTTG;SRB=0.47794;SRF=2351;SRP=23.798;SRR=2568;TC;TR=23;TU=GTTT;VQSLOD=6.2670;set=Intersection;sumGLbyD=8.99
-20 52274070 . AAG A 1400.37 PASS AA=30;AB=0.74227;ABA=25;ABP=52.462;ABR=72;AC=21;AF=0.01756;AN=1196;BL=412;BR=1966;BVAR;BaseQRankSum=6.660;DEL;DP=9362;Dels=0.01;EL=16;EPP=3.2998;ER=14;FS=1.485;HETAR=18;HOMA=2;HOMR=1004;HRun=0;InbreedingCoeff=0.0317;LEN=2;LRB=0.65349;LRBP=2208.2;MQ0Fraction=0.0022;MQM=46.133;MQRankSum=-4.743;NS=1024;RA=3931;RL=2;RPP=51.941;RR=28;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.152;SAB=0.4;SAF=12;SAP=5.6161;SAR=18;SRB=0.49784;SRF=1957;SRP=3.1699;SRR=1974;VQSLOD=5.6452;set=Intersection;sumGLbyD=11.11
-20 52351501 . TAC T 199.59 PASS AC=22;AF=0.0238;AN=926;BaseQRankSum=7.874;DP=22911;DP4=2146,1691,26,22;FR;FS=2.898;HP=4;HPLen=3;HR=1;HRun=0;HU=A;HaplotypeScore=18.6111;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0326;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0007;MQRankSum=1.011;NF;NR;PP;PV4=0.88,0.14,0.16,0.24;QD=1.10;ReadPosRankSum=-1.053;SB=-306.09;SC=GACACACAAATACACACACAC;TC;TR=13;TU=AC;VQSLOD=4.0486;set=filterInVQSR-2of5
-20 52447173 . CA C 503.89 PASS AC=23;AF=0.01891;AN=1216;BaseQRankSum=0.801;DP=3266;FS=2.606;HRun=2;HaplotypeScore=22.1543;InbreedingCoeff=-0.0097;MQ=118.02;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.309;QD=2.65;ReadPosRankSum=-7.872;SB=-279.27;VQSLOD=4.1900;set=VQSR
-20 52498650 . GT G 24069 PASS AA=74;AB=0.90594;ABA=57;ABP=870.4;ABR=549;AC=28;AF=0.02333;AN=1200;BL=505;BR=4514;BVAR;BaseQRankSum=-3.837;DEL;DP=9798;Dels=0.01;EL=41;EPP=4.8883;ER=33;FS=4.085;HETAR=209;HOMA=663;HOMR=121;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0334;LEN=1;LRB=0.79876;LRBP=6956.6;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0007;MQM=57.784;MQRankSum=-2.951;NS=995;RA=957;RL=8;RPP=101.72;RR=66;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.806;SAB=0.39189;SAF=29;SAP=10.522;SAR=45;SRB=0.39916;SRF=382;SRP=87.53;SRR=575;VQSLOD=3.8710;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.90
-20 52823602 rs11469056 CAAA C,CA,CAA,CAAAA,CAAAAA,CAAAAAA,CAAAAAAA,CAAAAAAAA,CAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAA 14515.17 PASS AC=24,83,246,109,83,19,10,16,22,59;AF=0.02128,0.07358,0.21809,0.09663,0.07358,0.01684,0.00887,0.01418,0.01950,0.05230;AN=1128;BVAR;BaseQRankSum=4.150;DB;DEL;DP=28279;FR;FS=2.021;HP=17;HR=17;HU=A;HaplotypeScore=27.8032;INS;InbreedingCoeff=0.7740;MQ=69.00;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.418;NF;NR;PP;QD=7.90;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.864;SB=-3244.40;SC=GGTCCTAAGGCAAAAAAAAAA;TC;TR=17;TU=A;VQSLOD=14.1033;set=Intersection
-20 53308906 . CT C,CTT 2276 PASS AA=92;AB=0.84453;ABA=81;ABP=540.17;ABR=440;AC=53,81;AF=0.04351,0.06650;AN=1218;BL=3561;BR=4796;BVAR;BaseQRankSum=3.000;DP=11804;Dels=0.02;EL=48;EPP=3.3879;ER=44;FR;FS=13.197;HETAR=69;HOMA=3;HOMR=993;HP=11;HR=10;HRun=10;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2297;LEN=1;LRB=0.14778;LRBP=399.32;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=56.348;MQRankSum=3.154;NF;NR;NS=1065;PP;RA=5520;RL=39;RPP=7.6365;RR=53;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.140;SAB=0.57609;SAF=53;SAP=7.6365;SAR=39;SC=AATCCAAAGTCTTTTTTTTTT;SRB=0.51576;SRF=2847;SRP=14.92;SRR=2673;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=2.4753;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.42
-20 53334602 . T TG,TGG 905.13 PASS ABR=325;AC=44,22;AF=0.03624,0.01812;BVAR;BaseQRankSum=-4.608;DP=15015;FR;FS=494.901;HOMA=0;HOMR=1004;HP=1;HR=1;HU=G;HaplotypeScore=20.5023;INS;InbreedingCoeff=0.0799;MQ=116.70;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=8.022;NF;NR;NS=1064;PP;QD=0.35;RA=5690;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.522;SB=-311.57;SC=AGCCATTGGCTGTTTCACTGA;SRB=0.40738;SRF=2318;SRP=426.97;SRR=3372;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=-2.3042;set=filterInVQSR-2of5
-20 53729115 . T TG 15.48 PASS AC=1;AF=0.0015;AN=668;BaseQRankSum=-1.001;DP=1711;FS=9.048;HRun=2;HaplotypeScore=12.4681;InbreedingCoeff=-0.0320;MQ=131.36;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.193;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.407;SB=-5.35;VQSLOD=4.8071;set=VQSR
-20 53960980 . GC G 588.40 PASS AA=32;AB=0.78632;ABA=25;ABP=86.324;ABR=92;AF=0.0275;AF1=0.01689;AN=690;BL=1047;BR=1108;BVAR;BaseQRankSum=3.049;CI95=0.006637,0.02876;DEL;DP=11389;DP4=1514,1481,16,12;Dels=0.02;EL=27;EPP=35.854;ER=5;FQ=17.6;FS=0.652;HETAR=27;HOMA=3;HOMR=1006;HRun=1;INDEL;InbreedingCoeff=0.0473;LEN=1;LRB=0.028306;LRBP=6.7597;MQ=106.54;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=115.53;MQRankSum=1.395;NS=1036;PV4=0.57,0.0057,0.46,0.22;RA=4207;RL=14;RPP=4.096;RR=18;RUN=1;ReadPosRankSum=-5.581;SAB=0.40625;SAF=13;SAP=5.4532;SAR=19;SRB=0.48586;SRF=2044;SRP=10.32;SRR=2163;VQSLOD=6.0155;set=Intersection;sumGLbyD=7.94
-20 54033830 . GTATTTTAAAATCA G 2220.86 PASS AF=0.0113;BaseQRankSum=5.506;DP=2577;Dels=0.01;FR;FS=6.533;HP=5;HPLen=4;HR=1;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=0.0032;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.969;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=1.322;SC=TCAATATTTTGTATTTTAAAA;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=5.5145;set=Intersection;sumGLbyD=95.65
-20 54375236 . GT G 626.13 PASS AA=40;AB=0.63551;ABA=39;ABP=20.078;ABR=68;AC=18;AF=0.0256;AN=702;BL=1331;BR=1743;BVAR;BaseQRankSum=9.346;DEL;DP=8568;Dels=0.02;EL=26;EPP=10.828;ER=14;FS=0.610;HETAR=21;HOMA=1;HOMR=1035;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0056;LEN=1;LRB=0.13403;LRBP=122.92;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=67.125;MQRankSum=-2.537;NS=1058;RA=4870;RL=17;RPP=4.9646;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.229;SAB=0.525;SAF=21;SAP=3.2274;SAR=19;SRB=0.5271;SRF=2567;SRP=34.087;SRR=2303;VQSLOD=7.9228;set=Intersection;sumGLbyD=10.77
-20 54457331 . G GA 1793.40 PASS AA=77;AB=0.66667;ABA=74;ABP=56.573;ABR=148;AC=33;AF=0.02687;AN=1228;BL=3834;BR=1154;BVAR;BaseQRankSum=10.572;DP=10230;Dels=0.00;EL=77;EPP=170.21;ER=0;FS=139.433;HETAR=44;HOMA=1;HOMR=1001;HRun=1;INS;InbreedingCoeff=0.0023;LEN=1;LRB=0.53729;LRBP=3129.8;MQ0Fraction=0.0095;MQM=4.7013;MQRankSum=-8.116;NS=1046;RA=4009;RL=77;RPP=170.21;RR=0;RUN=1;ReadPosRankSum=-6.026;SAB=1;SAF=77;SAP=170.21;SAR=0;SRB=0.57022;SRF=2286;SRP=174.7;SRR=1723;VQSLOD=1.1887;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.90
-20 54469810 . CA C 1697.62 PASS AA=93;AB=0.63855;ABA=90;ABP=44.53;ABR=159;AC=34;AF=0.0374;AF1=0.01719;AN=908;BL=3242;BR=5839;BVAR;BaseQRankSum=10.425;CI95=0.009317,0.02795;DEL;DP=15197;DP4=2134,1896,56,46;Dels=0.03;EL=34;EPP=17.604;ER=59;FQ=16;FR;FS=9.985;HETAR=41;HOMA=1;HOMR=1011;HP=9;HPLen=8;HR=8;HRun=8;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0472;LEN=1;LRB=0.28598;LRBP=1615.8;MQ=83.37;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQM=64.075;MQRankSum=3.036;NF;NR;NS=1053;PP;PV4=0.76,1,0.31,0.22;RA=5150;RL=28;RPP=34.975;RR=65;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.252;SAB=0.5914;SAF=55;SAP=9.7582;SAR=38;SC=ATTGCTAAGACAAAAAAAAGA;SRB=0.50621;SRF=2607;SRP=4.7374;SRR=2543;TC;TR=8;TU=A;VQSLOD=8.3677;set=Intersection;sumGLbyD=9.90
-20 54542453 . GTATA G,GTA 5109.66 PASS ABR=112;AC=66,56;AF=0.0682,0.0579;AN=968;BVAR;BaseQRankSum=17.089;DB;DEL;DP=5519;DS;Dels=0.06;FS=99.502;HOMA=15;HOMR=409;HRun=0;InbreedingCoeff=0.1584;MQ0Fraction=0.0178;MQRankSum=-6.854;NS=460;RA=864;RUN=1;ReadPosRankSum=0.855;SRB=0.79282;SRF=685;SRP=646.5;SRR=179;VQSLOD=0.6375;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=8.53
-20 54629773 . CA C 1799.50 PASS AA=49;AB=0.82707;ABA=46;ABP=250.17;ABR=220;AC=9;AF=0.00746;AN=1206;BL=173;BR=2277;BVAR;BaseQRankSum=5.240;DEL;DP=8557;Dels=0.01;EL=49;EPP=109.41;ER=0;FS=32.359;HETAR=35;HOMA=1;HOMR=325;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0892;LEN=1;LRB=0.85878;LRBP=3926.6;MQ0Fraction=0.0602;MQM=32.163;MQRankSum=-3.926;NS=361;RA=1091;RL=0;RPP=109.41;RR=49;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.512;SAB=0;SAF=0;SAP=109.41;SAR=49;SRB=0.49404;SRF=539;SRP=3.3467;SRR=552;VQSLOD=1.1233;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.54
-20 54710245 . TA T 999 PASS AF=0.0084;AF1=0.0148;BaseQRankSum=3.954;CI95=0.00885,0.02212;DP=8043;DP4=2000,1849,10,7;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=0.000;HP=9;HPLen=6;HR=3;HRun=6;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1181;MQ=78.51;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.095;NF;NR;PP;PV4=0.63,0.00056,1,1;ReadPosRankSum=-0.448;SC=CAACAAAAAATAAATAAATAA;TC;TR=15;TU=AAAT;VQSLOD=7.8129;set=Intersection;sumGLbyD=19.02
-20 54968173 . A AAT,AATAT,AT,ATAT 89535.82 PASS ABR=994;AC=561,278,2,3;AF=0.50179,0.24866,0.00179,0.00268;AN=1118;BVAR;BaseQRankSum=-2.699;DB;DP=27837;DP4=168,177,1045,866;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=12.472;HOMA=71;HOMR=455;HP=3;HPLen=4;HR=4;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.6391;KGPilot123;MQ=80.36;MQ0Fraction=0.0055;MQRankSum=-1.512;NF;NR;NS=913;PP;PV4=0.046,1,1,1;RA=2015;RUN=1;ReadPosRankSum=1.015;SC=GGCCACTTAAAATATATATAT;SRB=0.44864;SRF=904;SRP=49.187;SRR=1111;TC;TR=15;TU=AT;VQSLOD=9.0092;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=42.33
-20 55176688 . TA T 421.84 PASS AF=0.01322;AF1=0.01845;BaseQRankSum=5.383;CI95=0.01282,0.02564;DP=10531;DP4=1975,2017,16,14;Dels=0.01;FQ=91.2;FR;FS=7.401;HP=6;HPLen=5;HR=5;HRun=5;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0829;MQ=75.80;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=-0.471;NF;NR;PP;PV4=0.72,1,1,1;ReadPosRankSum=0.223;SC=CTGCAAAATATAAAAATTAGG;TC;TR=5;TU=A;VQSLOD=6.6000;set=Intersection;sumGLbyD=12.15
-20 55664086 . GTT ATT,G,GT,GTTT 5622.44 PASS AC=6,71,136;AF=0.00498,0.05887,0.11277;AN=1206;BVAR;BaseQRankSum=3.173;DB;DEL;DP=40384;DP4=1567,1317,54,29;Dels=0.05;FR;FS=1.949;HP=14;HR=11;HRun=11;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.3490;MQ=77.90;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.052;NF;NR;PP;PV4=0.057,1,0.2,1.2e-05;RUN=1;ReadPosRankSum=-13.646;SC=AATTTTATTTGTTTTTTTTTT;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=11.7964;set=Intersection;sumGLbyD=8.09
-20 56045006 . TG T 342.15 PASS AC=72;AF=0.0940;AN=766;BaseQRankSum=4.992;DP=1238;FS=1.460;HRun=7;HaplotypeScore=20.2784;InbreedingCoeff=0.1795;MQ=66.42;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0008;MQRankSum=-0.937;QD=1.84;ReadPosRankSum=-4.385;SB=-320.83;VQSLOD=5.2383;set=VQSR
-20 56158711 . AG A 922.47 PASS AA=18;AB=0.575;ABA=17;ABP=4.9646;ABR=23;AC=2;AF=0.0028;AN=714;BL=953;BR=808;BVAR;BaseQRankSum=3.129;DEL;DP=10462;Dels=0.01;EL=9;EPP=3.0103;ER=9;FR;FS=8.724;HETAR=4;HOMA=0;HOMR=1058;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=1;HU=A;InbreedingCoeff=0.0262;LEN=1;LRB=0.08234;LRBP=28.936;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=55.889;MQRankSum=2.052;NF;NR;NS=1062;PP;RA=6300;RL=9;RPP=3.0103;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.317;SAB=0.66667;SAF=12;SAP=7.3532;SAR=6;SC=TGGCCTAGCAAGCATCGTGAC;SRB=0.48143;SRF=3033;SRP=21.883;SRR=3267;TC;TR=8;TU=AAGC;VQSLOD=8.3252;set=Intersection;sumGLbyD=13.22
-20 56258618 rs113670927 T C,TGC,TGTGC,TGTGTGC 37834.99 PASS ABR=441;AC=11,100,43;AF=0.0123,0.1119,0.0481;AN=894;BVAR;BaseQRankSum=19.514;DB;DP=23173;DP4=541,920,413,579;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=1.238;HOMA=28;HOMR=808;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2154;MQ=57.25;MQ0Fraction=0.0275;MQRankSum=-6.684;NF;NR;NS=976;PP;PV4=0.023,1,1,1;RA=3294;RUN=1;ReadPosRankSum=11.873;SC=TGCGTGTGTGTGTGTGTGTGT;SRB=0.42441;SRF=1398;SRP=166.5;SRR=1896;TC;TR=30;TU=GT;VQSLOD=6.7457;dbSNP=114;set=Intersection;sumGLbyD=21.27
-20 56395857 . T TAGGCAG 6614.22 PASS AA=30;AB=0.63415;ABA=30;ABP=15.827;ABR=52;AC=14;AF=0.0197;AF1=0.03154;AN=710;BL=991;BR=1813;BVAR;BaseQRankSum=-4.589;CI95=0.02434,0.04204;DP=13879;DP4=1543,1833,12,14;Dels=0.00;EL=14;EPP=3.2998;ER=16;FQ=999;FR;FS=1.482;HETAR=11;HOMA=0;HOMR=1051;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0774;LEN=6;LRB=0.29315;LRBP=526.27;MQ=90.42;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=39.433;MQRankSum=-7.011;NF;NR;NS=1062;PP;PV4=1,1,3.7e-09,1;RA=5322;RL=9;RPP=13.433;RR=21;RUN=1;ReadPosRankSum=0.679;SAB=0.43333;SAF=13;SAP=4.1684;SAR=17;SC=AAGAGCATCTTAGGCAGAGGC;SRB=0.47294;SRF=2517;SRP=36.853;SRR=2805;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=8.3045;set=Intersection;sumGLbyD=68.22
-20 56969289 . GTTTGT G 600.69 PASS AF=0.0056;AF1=0.007726;BaseQRankSum=2.907;CI95=0.004425,0.01327;DP=9643;DP4=1892,1749,6,3;Dels=0.00;FQ=117;FR;FS=16.601;HP=5;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0236;MQ=92.59;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.134;NF;NR;PP;PV4=0.51,1,0.07,0.3;ReadPosRankSum=0.236;SC=TAAGGACGTTGTTTGTTTTGT;TC;TR=10;TU=GTTT;VQSLOD=5.8458;set=Intersection;sumGLbyD=39.51
-20 57187557 . AG A,AGG 1486.69 PASS AA=130;AB=0.55446;ABA=90;ABP=8.2132;ABR=112;AC=56,26;AF=0.0574,0.0266;AN=976;BL=3817;BR=5968;BVAR;BaseQRankSum=5.517;DEL;DP=14174;DP4=925,721,59,48;Dels=0.05;EL=52;EPP=14.302;ER=78;FR;FS=0.917;HETAR=44;HOMA=17;HOMR=864;HP=4;HPLen=4;HR=4;HRun=4;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.2856;LEN=1;LRB=0.21983;LRBP=1029.8;MQ=91.56;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=63.631;MQRankSum=1.900;NF;NR;NS=925;PP;PV4=0.84,1,1,0.39;RA=2746;RL=44;RPP=32.476;RR=86;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.639;SAB=0.44615;SAF=58;SAP=6.2842;SAR=72;SC=TCAGGCCCGCAGGGGTCAGGG;SRB=0.5772;SRF=1585;SRP=145.17;SRR=1161;TC;TR=4;TU=G;VQSLOD=7.7167;set=Intersection;sumGLbyD=14.85
-20 57282771 . T TG 506.43 PASS AA=34;AB=0.70312;ABA=19;ABP=25.946;ABR=45;AC=34;AF=0.0373;AN=912;BL=886;BR=1938;BVAR;BaseQRankSum=3.744;DP=4276;Dels=0.00;EL=18;EPP=3.2658;ER=16;FR;FS=0.639;HETAR=17;HOMA=9;HOMR=737;HP=9;HR=8;HRun=8;HU=G;INS;InbreedingCoeff=0.2149;LEN=1;LRB=0.37252;LRBP=853.99;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=49.706;MQRankSum=-0.051;NF;NR;NS=763;PP;RA=1822;RL=9;RPP=19.36;RR=25;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.111;SAB=0.55882;SAF=19;SAP=4.0322;SAR=15;SC=TCGGGGGGCGTGGGGGGGGTG;SRB=0.51098;SRF=931;SRP=4.9172;SRR=891;TC;TR=8;TU=G;VQSLOD=5.7772;set=Intersection;sumGLbyD=7.95
-20 57419740 rs11481507 A AT 82613.57 PASS AA=3850;AB=0.41404;ABA=1786;ABP=198.63;ABR=1262;AC=919;AF=0.75328;AN=1220;BL=140665;BR=151383;BVAR;BaseQRankSum=-27.490;DB;DP=31794;DP4=588,585,1571,1721;Dels=0.00;EL=1924;EPP=3.0126;ER=1926;FQ=999;FR;FS=2.191;HETAR=482;HOMA=454;HOMR=135;HP=3;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0861;LEN=1;LRB=0.036699;LRBP=857.15;MQ=123.92;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=91.654;MQRankSum=3.016;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=0.16,1,0.12,1;RA=1850;RL=1874;RPP=8.8784;RR=1976;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.685;SAB=0.47636;SAF=1834;SAP=21.693;SAR=2016;SC=TACACTAGTGATTTAACCCTA;SRB=0.49027;SRF=907;SRP=4.5315;SRR=943;TC;TR=3;TU=T;VQSLOD=9.2768;dbSNP=126;set=Intersection;sumGLbyD=22.78
-20 57529209 . TA AA,T 1285.20 PASS AA=52;AB=0.89572;ABA=39;ABP=511.72;ABR=335;AC=0;AF=0.0000;AN=694;BL=1317;BR=3667;BVAR;BaseQRankSum=1.788;DEL;DP=8008;Dels=0.00;EL=30;EPP=5.6829;ER=22;FR;HETAR=151;HOMA=83;HOMR=752;HP=7;HR=7;HU=A;InbreedingCoeff=0.1368;LEN=1;LRB=0.47151;LRBP=2409.1;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=58.288;MQRankSum=-0.490;NF;NR;NS=987;PP;QD=2.29;RA=2909;RL=4;RPP=83.856;RR=48;RUN=1;ReadPosRankSum=0.513;SAB=0.46154;SAF=24;SAP=3.6784;SAR=28;SB=-361.38;SC=CATAATTTTTTAAAAAAATAG;SRB=0.46855;SRF=1363;SRP=28.009;SRR=1546;TC;TR=7;TU=A;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.59
-20 57558194 . CT C,CTT,CTTT 6470.30 PASS ABR=451;AC=104,161,177;AF=0.08919,0.13808,0.15180;BVAR;BaseQRankSum=1.172;DP=7985;FR;FS=2.202;HOMA=19;HOMR=778;HP=22;HR=15;HU=T;HaplotypeScore=16.1921;INS;InbreedingCoeff=0.6440;MQ=69.24;MQ0=27;MQ0Fraction=0.0109;MQRankSum=-0.003;NF;NR;NS=943;PP;QD=2.22;RA=2531;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-2096.85;SC=GCCTTTTTTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.34848;SRF=882;SRP=507.73;SRR=1649;TC;TR=15;TU=T;VQSLOD=6.5151;set=Intersection
-20 57693627 . AG A 1991.90 PASS AA=52;AB=0.49462;ABA=47;ABP=3.0336;ABR=46;AC=15;AF=0.01227;AN=1222;BL=1902;BR=1478;BVAR;BaseQRankSum=-6.121;DEL;DP=26459;DP4=2647,2873,16,20;Dels=0.01;EL=25;EPP=3.1773;ER=27;FR;FS=3.135;HETAR=15;HOMA=1;HOMR=1064;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=2;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0866;LEN=1;LRB=0.12544;LRBP=118.51;MQ=116.26;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=114.65;MQRankSum=1.942;NF;NR;NS=1080;PP;PV4=0.74,6.9e-08,1,0.38;RA=6781;RL=33;RPP=11.195;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.795;SAB=0.5;SAF=26;SAP=3.0103;SAR=26;SC=ATTGGAGGAAAGGCTTTTTCA;SRB=0.46247;SRF=3136;SRP=85.976;SRR=3645;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=8.6672;set=Intersection;sumGLbyD=13.55
-20 57716287 . A AT 66.47 PASS AC=6;AF=0.00506;AN=1186;BaseQRankSum=1.369;DP=2744;FS=3.834;HRun=8;HaplotypeScore=11.2046;InbreedingCoeff=0.1196;MQ=73.00;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-0.086;QD=2.14;ReadPosRankSum=-2.588;SB=-53.80;VQSLOD=4.2080;set=VQSR
-20 58121928 rs73625057 T TGG 6649.17 PASS AA=132;AB=0.57854;ABA=110;ABP=16.996;ABR=151;AC=57;AF=0.0617;AN=924;BL=4530;BR=4790;BVAR;BaseQRankSum=-13.456;DB;DP=30353;DP4=2107,2168,61,66;Dels=0.00;EL=67;EPP=3.0761;ER=65;FR;FS=0.708;HETAR=46;HOMA=8;HOMR=1023;HP=3;HPLen=2;HR=2;HRun=2;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1241;LEN=2;LRB=0.027897;LRBP=18.76;MQ=109.61;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQM=79.833;MQRankSum=-0.699;NF;NR;NS=1077;PP;PV4=0.79,1,0.49,0.036;RA=5754;RL=61;RPP=4.6554;RR=71;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.309;SAB=0.45455;SAF=60;SAP=5.3792;SAR=72;SC=GATTAGAATGTGGATATCTTT;SRB=0.48836;SRF=2810;SRP=9.7866;SRR=2944;TC;TR=4;TU=GT;VQSLOD=8.5770;set=Intersection;sumGLbyD=27.19
-20 58287008 . T TC 23.57 PASS AC=1;AF=0.0015;AN=678;BaseQRankSum=1.500;DP=1783;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=13.0585;InbreedingCoeff=0.0243;MQ=98.37;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.259;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.115;SB=-40.33;VQSLOD=4.9523;set=VQSR
-20 58418087 . TAC T 1908.26 PASS AA=64;AB=0.58667;ABA=62;ABP=12.796;ABR=88;AC=24;AF=0.0337;AN=712;BL=2841;BR=2706;BVAR;BaseQRankSum=12.276;DEL;DP=21427;DP4=2243,2398,22,31;Dels=0.03;EL=29;EPP=4.2318;ER=35;FQ=999;FR;FS=0.961;HETAR=21;HOMA=1;HOMR=1050;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0008;LEN=2;LRB=0.024337;LRBP=10.145;MQ=93.02;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=51.109;MQRankSum=-3.746;NF;NR;NS=1072;PP;PV4=0.34,1.8e-11,2.3e-08,1;RA=6247;RL=37;RPP=6.4032;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=0.418;SAB=0.4375;SAF=28;SAP=5.1818;SAR=36;SC=AGCCATAGGATACACAAAATC;SRB=0.47911;SRF=2993;SRP=26.689;SRR=3254;TC;TR=5;TU=AC;VQSLOD=10.5463;set=Intersection;sumGLbyD=12.25
-20 58468826 . ACAAG A 999 PASS AF=0.0014;AF1=0.003429;BaseQRankSum=4.082;CI95=0.003106,0.006211;DP=8461;DP4=2500,1817,8,2;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=5.034;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0183;MQ=120.69;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.141;NF;NR;PP;PV4=0.21,1,0.054,1;ReadPosRankSum=2.096;SC=ATCCTGAAACACAAGAAGAAA;TC;TR=5;TU=AC;VQSLOD=7.4928;set=Intersection;sumGLbyD=29.17
-20 58731262 . TC T 999 PASS AA=21;AB=0.48649;ABA=19;ABP=3.069;ABR=18;AC=7;AF=0.0101;AF1=0.01493;AN=694;BL=939;BR=848;BVAR;BaseQRankSum=4.205;CI95=0.01106,0.02212;DEL;DP=12598;DP4=1766,1428,11,15;Dels=0.01;EL=13;EPP=5.5954;ER=8;FQ=999;FR;FS=1.796;HETAR=8;HOMA=1;HOMR=1031;HP=7;HPLen=8;HR=8;HRun=2;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0030;LEN=1;LRB=0.050923;LRBP=13.073;MQ=124.57;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=67.905;MQRankSum=1.103;NF;NR;NS=1040;PP;PV4=0.23,1,1,1;RA=4884;RL=10;RPP=3.1137;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.091;SAB=0.47619;SAF=10;SAP=3.1137;SAR=11;SC=TCATTTTTTTTCCTTGAAACT;SRB=0.58006;SRF=2833;SRP=274.9;SRR=2051;TC;TR=8;TU=T;VQSLOD=10.8783;set=Intersection;sumGLbyD=15.11
-20 59181229 rs11476579 CTT C,CT,CTTT,CTTTT 7787.17 PASS AC=19,195,104,91;AF=0.01599,0.16414,0.08754,0.07660;AF1=0.2124;AN=1188;BVAR;BaseQRankSum=6.347;CI95=0.146,0.2743;DB;DEL;DP=26140;DP4=932,880,352,375;Dels=0.13;FQ=85.6;FR;FS=11.914;HP=14;HR=14;HRun=14;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.4183;MQ=86.88;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.469;NF;NR;PP;PV4=0.17,1,1,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.055;SC=GGTGAGAAAGCTTTTTTTTTT;TC;TR=14;TU=T;VQSLOD=7.4340;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=7.02
-20 59213979 rs112141381 G GC 9068 PASS AA=131;AB=0.47115;ABA=110;ABP=4.5136;ABR=98;AF=0.0586;AN=700;BL=5395;BR=5816;BVAR;BaseQRankSum=15.453;DB;DP=23381;DP4=2191,2184,71,49;Dels=0.00;EL=66;EPP=3.0269;ER=65;FR;FS=7.907;HETAR=35;HOMA=5;HOMR=1019;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0283;LEN=1;LRB=0.037552;LRBP=37.34;MQ=72.13;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=54.496;MQRankSum=0.897;NF;NR;NS=1059;PP;PV4=0.052,1,0.066,1;RA=4976;RL=59;RPP=5.8117;RR=72;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.811;SAB=0.58015;SAF=76;SAP=10.32;SAR=55;SC=GATGGACTGGGACAGTGACTC;SRB=0.49457;SRF=2461;SRP=4.2828;SRR=2515;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=9.3917;set=Intersection;sumGLbyD=28.58
-20 59252945 . CT C,CTT 557.18 PASS AA=24;AB=0.84868;ABA=23;ABP=163.53;ABR=129;AC=21,29;AF=0.01759,0.02429;BL=1217;BR=1336;BVAR;BaseQRankSum=5.135;DP=9970;Dels=0.01;EL=13;EPP=3.3722;ER=11;FS=2.302;HETAR=21;HOMA=1;HOMR=1012;HRun=9;INS;InbreedingCoeff=0.1549;LEN=1;LRB=0.046612;LRBP=15.055;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=67.208;MQRankSum=0.086;NS=1034;RA=4421;RL=11;RPP=3.3722;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.826;SAB=0.41667;SAF=10;SAP=4.4579;SAR=14;SRB=0.49649;SRF=2195;SRP=3.4823;SRR=2226;VQSLOD=2.8923;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.47
-20 60016966 . CT C 42650 PASS AA=37;AB=0.97834;ABA=31;ABP=2847;ABR=1400;AC=15;AF=0.0163;AN=920;BL=2596;BR=778;BVAR;BaseQRankSum=-0.632;DEL;DP=10967;Dels=0.00;EL=14;EPP=7.7641;ER=23;FS=4.094;HETAR=421;HOMA=256;HOMR=385;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0051;LEN=1;LRB=0.53883;LRBP=2130.2;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=120.3;MQRankSum=-0.911;NS=1072;RA=3413;RL=31;RPP=39.691;RR=6;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.062;SAB=0.48649;SAF=18;SAP=3.069;SAR=19;SRB=0.47407;SRF=1618;SRP=22.943;SRR=1795;VQSLOD=3.3758;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.27
-20 60188651 . AG A 17624.52 PASS AA=462;AB=0.76548;ABA=409;ABP=1070.7;ABR=1335;AC=403;AF=0.34444;AN=1170;BL=13877;BR=25909;BVAR;BaseQRankSum=6.180;DEL;DP=9900;Dels=0.08;EL=353;EPP=282.84;ER=109;FR;FS=2699.057;HETAR=346;HOMA=26;HOMR=633;HP=3;HR=4;HRun=1;HU=A;InbreedingCoeff=-0.2900;LEN=1;LRB=0.30242;LRBP=7904.3;MQ0Fraction=0.0004;MQM=56.119;MQRankSum=1.644;NF;NR;NS=1005;PP;RA=3521;RL=112;RPP=269.25;RR=350;RUN=1;ReadPosRankSum=2.490;SAB=0.0064935;SAF=3;SAP=980.34;SAR=459;SC=AGGCTTCAAAAGAAAAAAAAA;SRB=0.55978;SRF=1971;SRP=112.32;SRR=1550;TC;TR=4;TU=A;VQSLOD=-34.0667;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=7.81
-20 60195570 . GTACATACATACA ATACATACATACA,G,GTACATACA 20140 PASS ABR=102;AC=105,2;AF=0.08794,0.00168;AN=1194;BVAR;BaseQRankSum=-28.899;DB;DEL;DP=14347;Dels=0.02;FR;FS=52.125;HOMA=1;HOMR=1006;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=0.0695;MQ0Fraction=0.0007;MQRankSum=1.957;NF;NR;NS=1035;PP;RA=4759;RUN=1;ReadPosRankSum=-22.252;SAB=0.5;SAP=3.0103;SC=TGATAGATTCGTACATACATA;SRB=0.47615;SRF=2266;SRP=26.522;SRR=2493;TC;TR=21;TU=ACAT;VQSLOD=2.7673;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=19.14
-20 60670601 rs72127450 AT A,ATT 6401.59 PASS AC=177,79;AF=0.16239,0.07248;AF1=0.1602;AN=1090;BVAR;BaseQRankSum=8.618;CI95=0.1106,0.2058;DB;DEL;DP=17508;DP4=1285,1094,313,259;Dels=0.10;FQ=94.1;FR;FS=0.000;HP=12;HR=12;HRun=12;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1076;LEN=1;MQ=64.73;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.620;NF;NR;PP;PV4=0.78,1,0.012,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.294;SC=AGCCAGGCACATTTTTTTTTT;TC;TR=12;TU=T;VQSLOD=6.1650;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=5.80
-20 60685780 . TC T 1123.58 PASS AC=79;AF=0.07655;AN=1032;BaseQRankSum=14.949;DP=2084;FS=23.521;HRun=1;HaplotypeScore=19.7117;InbreedingCoeff=0.1356;MQ=53.57;MQ0=61;MQ0Fraction=0.0293;MQRankSum=-7.958;QD=4.35;ReadPosRankSum=-13.757;SB=-791.28;VQSLOD=6.3549;set=VQSR
-20 60744906 rs113528167 CG C 422.53 PASS AC=48;AF=0.0732;AN=656;BaseQRankSum=17.669;DB;DP=1189;FS=0.356;HRun=1;HaplotypeScore=15.1808;InbreedingCoeff=0.2111;MQ=82.83;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-10.455;QD=2.71;ReadPosRankSum=-16.887;SB=-326.46;VQSLOD=7.1707;set=VQSR
-20 60848742 . CGT C,CGTGT 999 PASS AF=0.00980,0.01225;BaseQRankSum=5.597;DP=17065;DP4=1928,2188,17,13;Dels=0.01;FR;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.2094;MQ=115.78;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.281;NF;NR;PP;PV4=0.36,0.4,0.12,0.12;ReadPosRankSum=-1.465;SB=-157.35;SC=TAGACGCTTCCGTGTGTGTGT;TC;TR=11;TU=GT;VQSLOD=1.7100;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=16.39
-20 61023668 rs57452309 G GAGC 6896.67 PASS AC=115;AF=0.1445;AN=796;BaseQRankSum=12.146;DB;DP=1423;FS=5.070;HRun=0;HaplotypeScore=29.8897;InbreedingCoeff=0.0740;MQ=77.02;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-9.005;QD=19.16;ReadPosRankSum=-17.440;SB=-3045.82;VQSLOD=4.5788;set=VQSR
-20 61180519 . C CA,CT 1774.30 PASS ABR=135;AC=27,15;AF=0.02538,0.01410;BVAR;BaseQRankSum=-2.189;DP=8393;FR;FS=27.692;HOMA=2;HOMR=825;HP=6;HPLen=3;HR=3;HU=T;HaplotypeScore=19.5313;INS;InbreedingCoeff=0.0868;LEN=1;MQ=56.11;MQ0=172;MQ0Fraction=0.0667;MQRankSum=2.605;NF;NR;NS=854;PP;QD=1.99;RA=2868;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.324;SB=-385.54;SC=TTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT;SRB=0.32741;SRF=939;SRP=745.08;SRR=1929;TC;TR=69;TU=CTTT;VQSLOD=3.4398;set=filterInVQSR-2of5
-20 61184281 . AC A 9798.10 PASS AA=24;AB=0.96507;ABA=16;ABP=863.43;ABR=442;AC=4;AF=0.00341;AN=1174;BL=349;BR=1039;BVAR;BaseQRankSum=2.048;DEL;DP=10073;Dels=0.00;EL=11;EPP=3.3722;ER=13;FS=2.097;HETAR=141;HOMA=69;HOMR=829;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0697;LEN=1;LRB=0.49712;LRBP=747.85;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=98.042;MQRankSum=1.881;NS=1042;RA=3625;RL=5;RPP=20.744;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-8.009;SAB=0.75;SAF=18;SAP=16.039;SAR=6;SRB=0.52662;SRF=1909;SRP=25.323;SRR=1716;VQSLOD=1.8117;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.55
-20 62067246 . T TCGA 60869.60 PASS AC=1024;AF=0.88889;AN=1152;BaseQRankSum=17.328;DP=2144;FS=2.378;HRun=0;HaplotypeScore=22.0069;InbreedingCoeff=0.1400;MQ=86.75;MQ0=6;MQ0Fraction=0.0028;MQRankSum=-5.536;QD=29.45;ReadPosRankSum=1.266;SB=-24220.18;VQSLOD=6.4647;set=VQSR
-20 62074219 . C CTAT,CTGT 2328 PASS ABR=99;AC=20,6;AF=0.01754,0.00526;BVAR;BaseQRankSum=11.221;DP=9498;DS;FS=4.510;HOMA=15;HOMR=645;HaplotypeScore=82.8868;INS;InbreedingCoeff=0.0880;LEN=3;MQ=29.88;MQ0=1378;MQ0Fraction=0.2286;MQRankSum=-5.309;NS=689;QD=0.77;RA=1679;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.510;SAR=1;SB=-93.21;SRB=0.70697;SRF=1187;SRP=627.71;SRR=492;VQSLOD=1.8325;set=filterInVQSR-2of5
-20 62304449 . CA C,CAA 6680.17 PASS AC=141,69;AF=0.12567,0.06150;AF1=0.08178;AN=1122;BVAR;BaseQRankSum=9.754;CI95=0.05088,0.1128;DEL;DP=15867;DP4=1252,1289,232,208;Dels=0.10;FQ=52.6;FR;FS=6.576;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1950;LEN=1;MQ=60.48;MQ0Fraction=0.0004;MQRankSum=-0.049;NF;NR;PP;PV4=0.2,1,1,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.137;SC=GATTCTGTGTCAAAAAAAAAA;TC;TR=11;TU=A;VQSLOD=7.4714;set=Intersection;sumGLbyD=8.36
-20 62804895 rs57769591 CCTT C 1148 PASS AC=8;AF=0.0085;AF1=0.002839;AN=938;BaseQRankSum=4.952;CI95=0.002212,0.006637;DB;DP=8889;DP4=2574,1668,4,8;FQ=12.3;FS=2.289;HPLen=3;HRun=0;HaplotypeScore=29.4184;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0270;MQ0=876;MQ0Fraction=0.2674;MQRankSum=-0.641;PV4=0.074,1,1,1;QD=1.03;ReadPosRankSum=0.118;SB=-65.30;VQSLOD=6.4881;dbSNP=126;set=Intersection
-20 62907688 . AAT A 6629.57 PASS AC=164;AF=0.13735;AN=1194;BaseQRankSum=27.368;DP=2746;FS=5.985;HRun=0;HaplotypeScore=14.7748;InbreedingCoeff=0.1433;MQ=96.65;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-3.318;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.789;SB=-2662.16;VQSLOD=6.1473;set=VQSR
-20 62952465 . G GT 9149.70 PASS AA=156;AB=0.66667;ABA=110;ABP=82.631;ABR=220;AC=8;AF=0.00768;AN=1042;BL=6618;BR=3296;BVAR;BaseQRankSum=-0.466;DP=6244;Dels=0.00;EL=70;EPP=6.5737;ER=86;FS=2.927;HETAR=88;HOMA=34;HOMR=664;HRun=0;INS;InbreedingCoeff=0.0711;LEN=1;LRB=0.33508;LRBP=2420.2;MQ0Fraction=0.0431;MQM=29.506;MQRankSum=-3.251;NS=786;RA=1722;RL=146;RPP=260.47;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.554;SAB=0.47436;SAF=74;SAP=3.9012;SAR=82;SRB=0.50523;SRF=870;SRP=3.4189;SRR=852;VQSLOD=6.1217;set=Intersection;sumGLbyD=16.58
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.0
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT DNA_pool_A
-chr1 1281168 . A G 14 . DP=37;AF1=0.6243;CI95=0.5,1;DP4=4,0,6,0;MQ=15;PV4=1,0.027,1,1 PL:GT:GQ 43,0,4:0/1:6
-chr1 1281205 . T C 26 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ 58,9,0:1/1:63
-chr1 1281206 . G C 25 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ 57,9,0:1/1:63
-chr1 1922737 . G C 13.2 . DP=21;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,21;MQ=22 PL:GT:GQ 46,63,0:1/1:99
-chr1 21197513 . A G 55.1 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=41 PL:GT:GQ 88,21,0:1/1:84
-chr1 21343209 . T C 5.45 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=14 PL:GT:GQ 37,51,0:1/1:99
-chr1 22097362 . T C 4.75 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30 PL:GT:GQ 35,9,0:1/1:63
-chr1 22254012 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 22650927 . G A 48.1 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=24 PL:GT:GQ 81,21,0:1/1:84
-chr1 23535401 . C T 40.4 . DP=25;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,16,0,5;MQ=19;PV4=1,0.2,1,1 PL:GT:GQ 73,13,0:1/1:65
-chr1 23543855 . T C 49.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=44 PL:GT:GQ 82,18,0:1/1:90
-chr1 24245107 . C G 32 . DP=4;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=36;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,0,35:0/1:38
-chr1 24274412 . G C 39.5 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=32 PL:GT:GQ 72,12,0:1/1:72
-chr1 36529832 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr1 37788090 . A G 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr1 43120440 . C T 34 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=49;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 64,0,31:0/1:34
-chr1 43980466 . C T 43 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=19 PL:GT:GQ 76,45,0:1/1:99
-chr1 46047795 . T C 29.1 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=31 PL:GT:GQ 62,18,0:1/1:90
-chr1 48860309 . C T 99 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=46 PL:GT:GQ 141,18,0:1/1:90
-chr1 49415599 . T C 4.61 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
-chr1 51601816 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 51955459 . G C 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr1 68479569 . T G 12 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 43,6,0:1/1:49
-chr1 69032455 . A G 15.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ 47,9,0:1/1:63
-chr1 71888225 . G T 9.31 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 72381528 . T C 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr1 82004013 . A G 37.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50 PL:GT:GQ 70,12,0:1/1:72
-chr1 86289622 . C T 18 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42 PL:GT:GQ 50,9,0:1/1:63
-chr1 90267663 . A G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=45 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr1 92699542 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 94867317 . G A 26.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 58,6,0:1/1:49
-chr1 96428713 . C G 3.98 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=27 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr1 100466329 . G C 4.85 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=22 PL:GT:GQ 36,18,0:1/1:90
-chr1 101909281 . G A 70 . DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=46;PV4=1,1,0.096,1 PL:GT:GQ 100,0,88:0/1:91
-chr1 106216572 . T A 22 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,16,0;MQ=21 PL:GT:GQ 55,48,0:1/1:99
-chr1 107901770 . T C 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 108431179 . A G 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=41 PL:GT:GQ 155,24,0:1/1:96
-chr1 112005344 . C T 99 . DP=52;AF1=1;CI95=1,1;DP4=7,0,27,0;MQ=44;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 196,25,0:1/1:99
-chr1 116625452 . C T 36 . DP=44;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,23,0,20;MQ=49;PV4=1,2.3e-69,0.42,1 PL:GT:GQ 66,0,179:0/1:69
-chr1 118060710 . G T 6.98 . DP=8;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=47;PV4=1,0.0071,1,1 PL:GT:GQ 36,0,73:0/1:39
-chr1 118198177 . A G 15.9 . DP=23;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:GT:GQ 47,6,0:1/1:49
-chr1 118586346 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 120809555 . G A 20 . DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,2,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 50,0,106:0/1:53
-chr1 130723110 . C A 20.7 . DP=8;AF1=0.5939;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,2;MQ=26;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 50,0,5:0/1:7
-chr1 133979895 . T C 14.9 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr1 134977940 . C T 30 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=38;PV4=1,1,0.26,1 PL:GT:GQ 60,0,31:0/1:34
-chr1 141768589 . G A 18.1 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,4,0;MQ=51;PV4=1,2.7e-05,1,1 PL:GT:GQ 48,0,100:0/1:51
-chr1 141768590 . G A 22 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=50;PV4=1,0.0033,1,1 PL:GT:GQ 52,0,40:0/1:43
-chr1 146506051 . T C 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=43 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr1 150997009 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 162915612 . G C 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr1 168455400 . A G 4.12 . DP=28;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,27;MQ=10 PL:GT:GQ 35,81,0:1/1:99
-chr1 172784744 . T C 17.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 49,6,0:1/1:49
-chr1 183627307 . G A 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr1 185789457 . T C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr1 187081827 . T C 4.77 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=17 PL:GT:GQ 36,30,0:1/1:99
-chr1 188468339 . C T 33 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=24 PL:GT:GQ 66,39,0:1/1:99
-chr1 188595435 . C T 41.8 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr1 188670561 . G C 3.55 . DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=18 PL:GT:GQ 34,27,0:1/1:99
-chr1 188924877 . G A 6.2 . DP=10;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=21;PV4=1,1,1,0.3 PL:GT:GQ 35,3,0:1/1:41
-chr1 190536295 . G A 68 . DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,36,0;MQ=18 PL:GT:GQ 101,108,0:1/1:99
-chr1 191129408 . T A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 195937816 . T C 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr1 198857619 . T C 89 . DP=61;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,38,0,17;MQ=30;PV4=1,0.032,1,1 PL:GT:GQ 119,0,139:0/1:99
-chr1 199057483 . T C 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr1 200133619 . G C 5.83 . DP=49;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=2,0,8,0;MQ=17;PV4=1,0.059,1,0.2 PL:GT:GQ 37,12,0:1/1:72
-chr1 200729661 . A T 36 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=27 PL:GT:GQ 69,42,0:1/1:99
-chr1 201374519 . T C 69.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=39 PL:GT:GQ 102,12,0:1/1:72
-chr1 202811668 . G A 20.2 . DP=4;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,3;MQ=24;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 50,0,12:0/1:15
-chr1 202960650 . C T 16.6 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=27 PL:GT:GQ 49,12,0:1/1:72
-chr1 205686638 . C T 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr1 205949857 . A G 3.14 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=21 PL:GT:GQ 33,15,0:1/1:75
-chr1 209806643 . A G 13.2 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=21 PL:GT:GQ 46,24,0:1/1:96
-chr1 209871501 . C T 25 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,4,0;MQ=41;PV4=1,7.7e-06,1,1 PL:GT:GQ 55,0,84:0/1:58
-chr1 211051323 . G A 99 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=49 PL:GT:GQ 176,24,0:1/1:96
-chr1 211389716 . C T 12 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ 43,6,0:1/1:49
-chr1 211868415 . G A 3.54 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=14 PL:GT:GQ 34,33,0:1/1:99
-chr1 211914531 . C T 84.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,4;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 116,7,0:1/1:57
-chr1 214691313 . A G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr1 215184650 . C T 40.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ 72,6,0:1/1:49
-chr1 215995258 . A G 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr1 217031394 . G C 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr1 217986960 . T C 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr1 218086681 . A G 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=34 PL:GT:GQ 142,27,0:1/1:99
-chr1 218546019 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 218632417 . G T 17.1 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=26 PL:GT:GQ 50,21,0:1/1:84
-chr1 218833355 . C G 23 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,2,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 53,0,63:0/1:56
-chr1 219303186 . T C 7.79 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,25;MQ=12 PL:GT:GQ 40,75,0:1/1:99
-chr1 219517634 . G A 26.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=42 PL:GT:GQ 59,12,0:1/1:72
-chr1 219590158 . T C 3.27 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 33,12,0:1/1:72
-chr1 219709853 . A T 99 . DP=124;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=80,0,41,0;MQ=44;PV4=1,0.26,1,1 PL:GT:GQ 143,0,156:0/1:99
-chr1 222457988 . A G 11.1 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=23 PL:GT:GQ 42,6,0:1/1:49
-chr1 222477914 . A G 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr1 223010233 . A G 18.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr1 223796360 . G A 6.79 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=21 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr1 224273784 . A T 14.2 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=15 PL:GT:GQ 47,30,0:1/1:99
-chr1 224454685 . C T 46.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=32 PL:GT:GQ 79,15,0:1/1:75
-chr1 224514706 . G C 21 . DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,38,0;MQ=19 PL:GT:GQ 54,114,0:1/1:99
-chr1 224515793 . C T 99 . DP=26;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,26,0;MQ=45 PL:GT:GQ 211,78,0:1/1:99
-chr1 224692969 . C A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 225607249 . A G 34 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=45;PV4=1,1,0,1 PL:GT:GQ 64,0,31:0/1:34
-chr1 226923918 . C A 29.1 . DP=52;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,10;MQ=27;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,18,0:1/1:90
-chr1 227125189 . T C 56.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=41 PL:GT:GQ 89,12,0:1/1:72
-chr1 227133712 . A T 20.1 . DP=26;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,10,0;MQ=23;PV4=1,1,0.48,1 PL:GT:GQ 50,0,39:0/1:42
-chr1 227943954 . G C 47 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=37 PL:GT:GQ 79,9,0:1/1:63
-chr1 227943974 . G A 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=34 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr1 228067480 . A G 42.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=45 PL:GT:GQ 75,15,0:1/1:75
-chr1 228067510 . A G 99 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=45 PL:GT:GQ 140,15,0:1/1:75
-chr1 228088778 . C T 6.79 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=23 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr1 228117888 . A C 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr1 228139641 . T C 44.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 77,12,0:1/1:72
-chr1 228577146 . T C 26 . DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,14;MQ=22;PV4=1,1,1,0.027 PL:GT:GQ 56,0,77:0/1:59
-chr1 229001369 . C A 45 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ 77,9,0:1/1:63
-chr1 229001386 . C T 8.44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 39,6,0:1/1:49
-chr1 229348080 . T C 18.1 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=40;PV4=1,0.33,0.17,0.33 PL:GT:GQ 48,0,31:0/1:34
-chr1 229439710 . C T 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=32 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr1 229655149 . T C 30 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=30 PL:GT:GQ 63,24,0:1/1:96
-chr1 229660873 . C G 81 . DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,20,0,7;MQ=36;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 111,0,120:0/1:99
-chr2a 3661005 . C G 24 . DP=13;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,4,0;MQ=27;PV4=1,1.1e-05,1,1 PL:GT:GQ 54,0,34:0/1:37
-chr2a 4140063 . G A 81 . DP=26;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=18,0,8,0;MQ=24;PV4=1,8.3e-09,1,1 PL:GT:GQ 110,0,3:0/1:5
-chr2a 4248440 . T C 20 . DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,7,0;MQ=25;PV4=1,1,0.47,1 PL:GT:GQ 50,0,92:0/1:53
-chr2a 4707656 . A G 63 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 95,9,0:1/1:63
-chr2a 5194801 . G A 7.59 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=24 PL:GT:GQ 38,6,0:1/1:49
-chr2a 14111103 . A G 7.84 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=20 PL:GT:GQ 40,21,0:1/1:84
-chr2a 17799746 . A G 11.3 . DP=5;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 41,0,35:0/1:37
-chr2a 24728910 . G A 45.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=28 PL:GT:GQ 78,15,0:1/1:75
-chr2a 29627939 . G T 5.44 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=27 PL:GT:GQ 36,9,0:1/1:63
-chr2a 31373164 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr2a 33935228 . T C 41.8 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr2a 36311856 . G A 99 . DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,29;MQ=44 PL:GT:GQ 213,87,0:1/1:99
-chr2a 39281204 . T C 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr2a 41087565 . C T 74.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=38 PL:GT:GQ 107,12,0:1/1:72
-chr2a 45574768 . C A 11.3 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=18 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr2a 55464464 . T C 26.1 . DP=7;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=5,0,2,0;MQ=26;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 55,1,0:1/1:23
-chr2a 63107673 . T A 70.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=34 PL:GT:GQ 103,12,0:1/1:72
-chr2a 63141732 . A T 22.8 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 54,6,0:1/1:49
-chr2a 63141910 . G A 3.41 . DP=16;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ 32,6,0:1/1:49
-chr2a 63141911 . C T 9.55 . DP=16;AF1=0.5031;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,3;MQ=33;PV4=1,0.43,1,1 PL:GT:GQ 39,0,19:0/1:22
-chr2a 63143543 . C T 28 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,17;MQ=16;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 61,42,0:1/1:99
-chr2a 66419805 . G A 3.69 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 34,15,0:1/1:75
-chr2a 66563922 . C T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr2a 67719136 . C T 39.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 71,6,0:1/1:49
-chr2a 72781453 . A C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr2a 76733211 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr2a 78190502 . A C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr2a 85021209 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr2a 88554861 . A T 39 . DP=74;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,4;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 69,0,92:0/1:72
-chr2a 88554877 . A G 92 . DP=90;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,23,0,13;MQ=41;PV4=1,0.3,1,1 PL:GT:GQ 122,0,128:0/1:99
-chr2a 88824857 . G A 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=37 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr2a 93546675 . C T 26 . DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,2,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 56,0,87:0/1:59
-chr2a 94788853 . A G 34.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43 PL:GT:GQ 67,15,0:1/1:75
-chr2a 96738146 . T C 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr2a 102737384 . A G 12.3 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,18,0;MQ=11 PL:GT:GQ 45,54,0:1/1:99
-chr2a 103407172 . A G 35 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=19 PL:GT:GQ 68,24,0:1/1:96
-chr2a 105774580 . T G 99 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=30 PL:GT:GQ 135,39,0:1/1:99
-chr2a 106376301 . C G 24.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=19 PL:GT:GQ 57,18,0:1/1:90
-chr2a 106376315 . C T 8.75 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=19 PL:GT:GQ 41,18,0:1/1:90
-chr2a 112422267 . C T 30 . DP=20;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=14,0,5,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 60,0,131:0/1:63
-chr2b 3049384 . A C 14.9 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr2b 3049385 . G C 14.9 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr2b 3049406 . C G 99 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=36 PL:GT:GQ 135,18,0:1/1:90
-chr2b 4213802 . T C 89.5 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr2b 5022895 . G A 66 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=49 PL:GT:GQ 99,30,0:1/1:99
-chr2b 6037666 . G T 56 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=17 PL:GT:GQ 89,39,0:1/1:99
-chr2b 13656952 . G A 19.2 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=21 PL:GT:GQ 52,18,0:1/1:90
-chr2b 15026944 . A G 6.79 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr2b 23362613 . A G 5.64 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22 PL:GT:GQ 37,15,0:1/1:75
-chr2b 45947861 . C G 68 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=50 PL:GT:GQ 101,33,0:1/1:99
-chr2b 46597824 . T C 65.6 . DP=39;AF1=0.5939;CI95=0.5,1;DP4=23,0,10,0;MQ=22;PV4=1,0.014,1,1 PL:GT:GQ 95,0,5:0/1:7
-chr2b 49665191 . G T 34.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=37 PL:GT:GQ 67,21,0:1/1:84
-chr2b 61001546 . A G 48 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=26 PL:GT:GQ 81,24,0:1/1:96
-chr2b 88502851 . T C 4.77 . DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=37;PV4=1,1,0.46,1 PL:GT:GQ 33,0,34:0/1:33
-chr2b 91675431 . C T 30 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=27 PL:GT:GQ 63,24,0:1/1:96
-chr2b 91870148 . T G 67 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,13;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 100,31,0:1/1:99
-chr2b 97066826 . G A 20.1 . DP=9;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,2;MQ=31;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 50,0,35:0/1:38
-chr2b 97670822 . G A 4.85 . DP=6;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=18 PL:GT:GQ 36,18,0:1/1:90
-chr2b 102773175 . A G 17.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38 PL:GT:GQ 49,9,0:1/1:63
-chr2b 109805532 . T C 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=45 PL:GT:GQ 176,24,0:1/1:96
-chr2b 110841448 . A G 11.1 . DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 42,6,0:1/1:49
-chr2b 123217025 . T C 31.5 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=37 PL:GT:GQ 64,12,0:1/1:72
-chr2b 123263214 . A G 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr2b 127747292 . C T 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=52 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr2b 130121958 . A G 89.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43 PL:GT:GQ 122,15,0:1/1:75
-chr2b 130253633 . A G 14.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr2b 130692761 . C T 49.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=51 PL:GT:GQ 82,18,0:1/1:90
-chr2b 130743365 . A G 99 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=42 PL:GT:GQ 140,15,0:1/1:75
-chr2b 131553874 . A C 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=37 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr2b 131716894 . A G 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=40 PL:GT:GQ 137,24,0:1/1:96
-chr2b 131716936 . G A 99 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=36 PL:GT:GQ 173,36,0:1/1:99
-chr2b 131716952 . A G 99 . DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,14;MQ=36;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 152,0,43:0/1:46
-chr2b 133360184 . C T 99 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,20;MQ=32 PL:GT:GQ 163,60,0:1/1:99
-chr2b 133644741 . T A 16.4 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=27 PL:GT:GQ 49,15,0:1/1:75
-chr2b 133720595 . T C 41 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=29 PL:GT:GQ 74,36,0:1/1:99
-chr2b 133727192 . C T 19.3 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 52,15,0:1/1:75
-chr2b 133727260 . G A 3.56 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=18 PL:GT:GQ 34,24,0:1/1:95
-chr2b 133800294 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=23 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr2b 134582754 . A C 56.1 . DP=37;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=36 PL:GT:GQ 89,21,0:1/1:84
-chr2b 134582763 . G C 78 . DP=37;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,36;MQ=34 PL:GT:GQ 111,108,0:1/1:99
-chr2b 134809668 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr3 527814 . C G 46 . DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,3,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 76,0,106:0/1:79
-chr3 559510 . G A 38 . DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,0,17,0;MQ=28;PV4=1,1,0.014,1 PL:GT:GQ 68,0,111:0/1:71
-chr3 879433 . T G 32 . DP=4;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,0,34:0/1:37
-chr3 1809645 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr3 3235812 . C T 7.59 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 38,6,0:1/1:49
-chr3 3250176 . A G 83 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=32 PL:GT:GQ 116,24,0:1/1:96
-chr3 5049073 . T A 99 . DP=25;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,0,9,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 136,0,129:0/1:99
-chr3 5142874 . G A 99 . DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,38,0;MQ=28 PL:GT:GQ 179,114,0:1/1:99
-chr3 5554864 . T C 3.54 . DP=7;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,3;MQ=27;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 31,0,35:0/1:33
-chr3 5749648 . G A 21.2 . DP=26;AF1=0.7303;CI95=0.5,1;DP4=0,7,0,7;MQ=26;PV4=1,0.16,1,0.17 PL:GT:GQ 50,0,2:0/1:3
-chr3 16451708 . A T 71.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=38 PL:GT:GQ 104,15,0:1/1:75
-chr3 23410276 . G A 99 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45 PL:GT:GQ 140,15,0:1/1:75
-chr3 51368824 . A G 28 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ 60,9,0:1/1:63
-chr3 53000453 . A G 54 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=19 PL:GT:GQ 87,30,0:1/1:99
-chr3 53000463 . A G 54 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=19 PL:GT:GQ 87,30,0:1/1:99
-chr3 59077423 . C T 77.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=33 PL:GT:GQ 110,15,0:1/1:75
-chr3 60040501 . T C 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr3 64203481 . A G 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr3 67947441 . C T 17.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ 50,12,0:1/1:72
-chr3 76372631 . A G 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr3 80611316 . C G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr3 81554381 . G T 17.6 . DP=24;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=26 PL:GT:GQ 50,12,0:1/1:72
-chr3 87614647 . A G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr3 93900455 . A T 11.6 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=13 PL:GT:GQ 44,15,0:1/1:75
-chr3 96174457 . A G 4.11 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=24 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
-chr3 96215569 . A C 3.41 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ 32,6,0:1/1:49
-chr3 96587998 . A C 7.08 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,6,0;MQ=17 PL:GT:GQ 39,18,0:1/1:90
-chr3 99711220 . A C 12.8 . DP=11;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 42,2,0:1/1:37
-chr3 99789741 . C G 99 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=47 PL:GT:GQ 210,51,0:1/1:99
-chr3 103667651 . A C 3.98 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr3 104604896 . G C 55 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:GT:GQ 87,9,0:1/1:63
-chr3 104997217 . G A 33.1 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,16,0;MQ=34;PV4=1,3e-10,0.17,0.36 PL:GT:GQ 66,19,0:1/1:76
-chr3 106097816 . A G 28 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=26 PL:GT:GQ 61,45,0:1/1:99
-chr3 106822259 . G C 99 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=50 PL:GT:GQ 140,15,0:1/1:75
-chr3 109946413 . G A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr3 121238963 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr3 126248567 . A G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr3 129733836 . A G 6.2 . DP=4;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=43;PV4=1,0.02,0.31,1 PL:GT:GQ 35,0,28:0/1:30
-chr3 131372785 . C T 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=34 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr3 132290987 . C T 22 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=45 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr3 136054421 . C T 73 . DP=82;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,78,0;MQ=28 PL:GT:GQ 106,235,0:1/1:99
-chr3 141075246 . G A 30.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=41 PL:GT:GQ 62,6,0:1/1:49
-chr3 141075262 . T G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=41 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr3 141430649 . G T 81.8 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,4;MQ=41;PV4=1,0.34,1,0.25 PL:GT:GQ 113,6,0:1/1:49
-chr3 143617747 . G T 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr3 163576128 . C T 5.6 . DP=4;AF1=0.7302;CI95=0.5,1;DP4=2,0,2,0;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 33,0,2:0/1:3
-chr3 163839828 . A G 4.45 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=26 PL:GT:GQ 35,12,0:1/1:72
-chr3 175839340 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr3 190193258 . G T 3.98 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr3 190777007 . G A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr3 190970350 . A G 61 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=37 PL:GT:GQ 94,30,0:1/1:99
-chr3 198686408 . G A 36.6 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,16;MQ=25;PV4=1,1,0.026,1 PL:GT:GQ 69,11,0:1/1:66
-chr3 199277478 . T C 3.61 . DP=6;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=21 PL:GT:GQ 34,18,0:1/1:90
-chr3 199780181 . G T 77 . DP=45;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,35,0,10;MQ=33;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 107,0,114:0/1:99
-chr3 199889335 . A C 9.54 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=18 PL:GT:GQ 42,24,0:1/1:96
-chr3 200018161 . A G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr4 195475 . A G 13 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr4 639141 . C A 14.9 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr4 639152 . C T 15.2 . DP=17;AF1=0.5016;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=33;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 45,0,22:0/1:25
-chr4 986497 . G T 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=33 PL:GT:GQ 163,30,0:1/1:99
-chr4 986516 . C T 55.1 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=37 PL:GT:GQ 88,21,0:1/1:84
-chr4 1207485 . A C 14.9 . DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr4 1323502 . G A 13.2 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=22 PL:GT:GQ 46,33,0:1/1:99
-chr4 1613521 . G A 89 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,16,0;MQ=32 PL:GT:GQ 122,48,0:1/1:99
-chr4 1748790 . C T 38 . DP=21;AF1=0.5005;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,8,0;MQ=40;PV4=1,0.09,1,1 PL:GT:GQ 68,0,27:0/1:30
-chr4 2255732 . T C 99 . DP=29;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,28,0;MQ=31 PL:GT:GQ 186,84,0:1/1:99
-chr4 3010159 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr4 3545023 . A G 99 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=38 PL:GT:GQ 145,27,0:1/1:99
-chr4 3586344 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr4 3879337 . A G 16.6 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 49,12,0:1/1:72
-chr4 3940733 . A G 47.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ 80,15,0:1/1:75
-chr4 4410338 . T C 13.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=31 PL:GT:GQ 46,15,0:1/1:75
-chr4 4796408 . T C 41 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=17 PL:GT:GQ 74,48,0:1/1:99
-chr4 4796414 . A G 11.3 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=17 PL:GT:GQ 44,45,0:1/1:99
-chr4 6436959 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr4 9494256 . T C 3.41 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=37 PL:GT:GQ 32,6,0:1/1:49
-chr4 24881479 . G A 14.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ 46,9,0:1/1:63
-chr4 26128644 . A G 23 . DP=18;AF1=0.5006;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,10,0;MQ=22;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 53,0,26:0/1:29
-chr4 42109100 . G A 17.1 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ 49,9,0:1/1:63
-chr4 42309652 . C T 68 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=50 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr4 46913966 . C T 9.08 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=16 PL:GT:GQ 41,12,0:1/1:72
-chr4 50335142 . A G 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr4 51658550 . C A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr4 58258023 . T C 26 . DP=5;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=34;PV4=1,1,1,0.05 PL:GT:GQ 56,0,32:0/1:35
-chr4 59219112 . C A 42.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=50 PL:GT:GQ 75,12,0:1/1:72
-chr4 62746067 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr4 67404338 . G T 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=39 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr4 73353380 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr4 73946294 . G C 4.77 . DP=51;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,3;MQ=40;PV4=1,0.19,0.37,0.11 PL:GT:GQ 33,0,64:0/1:36
-chr4 79607484 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr4 82337365 . G C 90 . DP=54;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=28 PL:GT:GQ 123,48,0:1/1:99
-chr4 82653801 . A G 4.11 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
-chr4 87130164 . C T 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr4 87130176 . G A 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr4 91459729 . C A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr4 96130778 . G C 99 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,19;MQ=45 PL:GT:GQ 211,57,0:1/1:99
-chr4 100709417 . A G 45.1 . DP=16;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=12,0,4,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 75,0,17:0/1:20
-chr4 107276770 . C T 70 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,6;MQ=31;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 100,0,97:0/1:98
-chr4 115327550 . G C 42 . DP=67;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,66;MQ=35;PV4=1,3.2e-24,0.13,1 PL:GT:GQ 75,162,0:1/1:99
-chr4 136558502 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr4 159572459 . G A 15.1 . DP=126;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,69,0,57;MQ=39;PV4=1,4.1e-96,0.077,1 PL:GT:GQ 45,0,175:0/1:48
-chr4 174968484 . G C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr4 175030633 . T C 14.3 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=29 PL:GT:GQ 47,18,0:1/1:90
-chr4 183410027 . G T 6.2 . DP=31;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=45;PV4=1,0.035,1,0.21 PL:GT:GQ 35,0,28:0/1:30
-chr4 190907368 . T C 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=50 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr4 192175690 . A G 76.8 . DP=7;AF1=0.95;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,4;MQ=35;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 105,0,0:1/1:10
-chr4 192673268 . G A 14.2 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=22 PL:GT:GQ 47,27,0:1/1:99
-chr4 192943966 . T C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr4 195460104 . C G 23.1 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=19 PL:GT:GQ 56,24,0:1/1:96
-chr4 198277830 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr5 170098 . A G 13 . DP=12;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr5 395814 . T C 4.77 . DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=36;PV4=1,1,0.48,1 PL:GT:GQ 33,0,33:0/1:33
-chr5 414024 . T A 10.4 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=20 PL:GT:GQ 42,9,0:1/1:63
-chr5 496767 . T C 13.9 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr5 805676 . C G 45 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=32 PL:GT:GQ 78,51,0:1/1:99
-chr5 1252896 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr5 1418370 . G A 3.65 . DP=8;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=4,0,4,0;MQ=13;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 30,0,2:0/1:3
-chr5 1494911 . G C 62 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=46 PL:GT:GQ 95,24,0:1/1:96
-chr5 1494932 . C T 6.98 . DP=8;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=46;PV4=1,0.1,0.077,1 PL:GT:GQ 36,0,31:0/1:33
-chr5 1506037 . T C 24.1 . DP=24;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=11,0,13,0;MQ=16;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 55,5,0:1/1:46
-chr5 1509406 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr5 1733649 . A G 99 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,25;MQ=47 PL:GT:GQ 212,75,0:1/1:99
-chr5 1747304 . A G 12.3 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=19 PL:GT:GQ 45,36,0:1/1:99
-chr5 1747308 . C A 44 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=19 PL:GT:GQ 77,36,0:1/1:99
-chr5 3519783 . C T 21.1 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=18 PL:GT:GQ 54,24,0:1/1:96
-chr5 4101593 . A G 69.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=43 PL:GT:GQ 102,12,0:1/1:72
-chr5 7204332 . T A 4.61 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=24 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
-chr5 11510398 . A C 34 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=51;PV4=1,1,0,1 PL:GT:GQ 64,0,31:0/1:34
-chr5 15406720 . T C 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr5 25152417 . C A 10.9 . DP=28;AF1=0.5718;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,6;MQ=25;PV4=1,1,0.21,1 PL:GT:GQ 40,0,6:0/1:8
-chr5 39072637 . A G 35.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=50 PL:GT:GQ 68,15,0:1/1:75
-chr5 46022699 . G A 44 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr5 55664181 . C G 10.4 . DP=8;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=3,0,5,0;MQ=18;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 40,3,0:1/1:41
-chr5 56253386 . T C 50.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=36 PL:GT:GQ 83,21,0:1/1:84
-chr5 56253447 . C T 42.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=45 PL:GT:GQ 75,12,0:1/1:72
-chr5 71950166 . G T 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr5 72703090 . C T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr5 73570280 . G T 5.45 . DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,41,0;MQ=15 PL:GT:GQ 37,123,0:1/1:99
-chr5 73701762 . G T 40.8 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:GT:GQ 72,6,0:1/1:49
-chr5 76956867 . T C 10.2 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ 41,6,0:1/1:49
-chr5 79097961 . C G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr5 87026167 . T C 22 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr5 97680525 . T C 3.27 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=23 PL:GT:GQ 33,12,0:1/1:72
-chr5 100674737 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr5 105389966 . T C 3.52 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=15 PL:GT:GQ 33,9,0:1/1:63
-chr5 109998341 . A C 12.7 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 45,12,0:1/1:72
-chr5 120629105 . C T 6.79 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr5 128383954 . C T 23 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,5;MQ=48;PV4=1,3.3e-07,1,1 PL:GT:GQ 53,0,98:0/1:56
-chr5 133925142 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr5 135375404 . T C 11.8 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=31;PV4=1,0.03,1,1 PL:GT:GQ 42,4,0:1/1:45
-chr5 136498281 . T G 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr5 136717285 . A G 82.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ 115,12,0:1/1:72
-chr5 136910734 . G A 62 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,13;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 95,31,0:1/1:99
-chr5 141208149 . C G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr5 148056348 . C A 37.1 . DP=4;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=38;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 66,1,0:1/1:23
-chr5 151941534 . G T 46.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=34 PL:GT:GQ 79,12,0:1/1:72
-chr5 159967229 . G C 22.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ 55,12,0:1/1:72
-chr5 174024541 . T G 29.5 . DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 59,2,0:1/1:37
-chr5 175525290 . A G 3.27 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=20 PL:GT:GQ 33,12,0:1/1:72
-chr5 175988954 . A C 14.2 . DP=23;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,4;MQ=47;PV4=1,1,0.2,1 PL:GT:GQ 44,0,76:0/1:47
-chr5 176782226 . T C 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr5 179132834 . C G 99 . DP=28;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,28;MQ=41 PL:GT:GQ 207,84,0:1/1:99
-chr5 180155809 . G C 3.01 . DP=36;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=25,0,9,0;MQ=35;PV4=1,1e-15,1,1 PL:GT:GQ 30,0,121:0/1:33
-chr5 181282819 . T G 38.3 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,9;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 71,14,0:1/1:70
-chr5 182426125 . G C 29 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=26 PL:GT:GQ 61,9,0:1/1:63
-chr5 182443682 . G A 3.69 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=21 PL:GT:GQ 34,15,0:1/1:75
-chr5 183008993 . C T 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr5 183312016 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr6_cox_hap1 519146 . G A 17.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=30 PL:GT:GQ 49,9,0:1/1:63
-chr6_cox_hap1 687497 . A G 33 . DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,0.0016,1,1 PL:GT:GQ 63,3,0:1/1:41
-chr6_qbl_hap2 120066 . T C 99 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37 PL:GT:GQ 139,27,0:1/1:99
-chr6 277954 . C T 53 . DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=4,0,37,0;MQ=19;PV4=1,1,0.3,1 PL:GT:GQ 86,49,0:1/1:99
-chr6 593158 . A G 4.61 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
-chr6 2865562 . T G 25 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=23 PL:GT:GQ 58,27,0:1/1:99
-chr6 3751403 . G A 42.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=32 PL:GT:GQ 75,15,0:1/1:75
-chr6 3884989 . A G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr6 4127278 . A T 13.9 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr6 5887783 . C G 99 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=34 PL:GT:GQ 142,21,0:1/1:84
-chr6 5887811 . C T 55.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=34 PL:GT:GQ 88,21,0:1/1:84
-chr6 6937170 . G C 99 . DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,47;MQ=28 PL:GT:GQ 157,141,0:1/1:99
-chr6 7262317 . C T 13.2 . DP=50;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=21,0,9,0;MQ=36;PV4=1,4e-05,0.17,0.26 PL:GT:GQ 43,0,158:0/1:46
-chr6 7533214 . A G 10.4 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ 42,9,0:1/1:63
-chr6 20979907 . A G 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=38 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr6 22321632 . A G 41 . DP=5;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=46;PV4=1,0.24,0.19,0.33 PL:GT:GQ 71,0,28:0/1:31
-chr6 25352296 . G A 7.8 . DP=4;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=38;PV4=1,1,0.16,1 PL:GT:GQ 37,0,28:0/1:30
-chr6 26298040 . T A 34 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=48;PV4=1,1,0.21,0.33 PL:GT:GQ 64,0,31:0/1:34
-chr6 33428755 . G A 70 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=32 PL:GT:GQ 103,27,0:1/1:99
-chr6 39512099 . G A 55.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=50 PL:GT:GQ 88,21,0:1/1:84
-chr6 39961094 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr6 40452120 . A G 40.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 72,6,0:1/1:49
-chr6 43204766 . A G 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=51 PL:GT:GQ 176,24,0:1/1:96
-chr6 52696512 . C T 70 . DP=76;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,34,0,42;MQ=18;PV4=1,0.11,1,1 PL:GT:GQ 100,0,51:0/1:54
-chr6 53785550 . A G 99 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=46 PL:GT:GQ 190,30,0:1/1:99
-chr6 53897484 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr6 57038290 . C T 10.2 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 41,6,0:1/1:49
-chr6 62925087 . G C 35 . DP=5;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,4,0;MQ=36;PV4=1,1,0.2,1 PL:GT:GQ 65,0,25:0/1:28
-chr6 62925094 . T C 25.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=36 PL:GT:GQ 58,15,0:1/1:75
-chr6 70834405 . G A 72.1 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=29 PL:GT:GQ 105,21,0:1/1:84
-chr6 71026058 . C T 48.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=42 PL:GT:GQ 81,18,0:1/1:90
-chr6 74420752 . T C 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr6 77498624 . T C 16.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ 48,6,0:1/1:49
-chr6 80416836 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr6 113611590 . A G 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=46 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr6 119308431 . T C 38.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=40 PL:GT:GQ 71,12,0:1/1:72
-chr6 151758592 . T C 3.07 . DP=17;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,8,0,9;MQ=13;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 29,1,0:1/1:23
-chr6 151759358 . A G 99 . DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=12,0,15,0;MQ=44;PV4=1,1,1,0.19 PL:GT:GQ 171,0,128:0/1:99
-chr6 154741755 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr6 161061053 . C A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=52 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr6 161474189 . C T 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr6 164304657 . C T 10.4 . DP=63;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,29,0,19;MQ=22;PV4=1,7.7e-11,1,0.049 PL:GT:GQ 40,0,37:0/1:38
-chr6 164703105 . T C 99 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=40 PL:GT:GQ 165,30,0:1/1:99
-chr6 167518328 . A G 78 . DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=27,0,14,0;MQ=33;PV4=1,0.026,0.43,0.056 PL:GT:GQ 108,0,149:0/1:99
-chr6 169906323 . G A 41.8 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr6 171893912 . G A 69.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=33 PL:GT:GQ 102,15,0:1/1:75
-chr6 173631604 . A G 6.98 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=37;PV4=1,0.069,1,1 PL:GT:GQ 36,0,34:0/1:35
-chr7 835856 . C T 27.5 . DP=13;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=4,0,6,0;MQ=23;PV4=1,0.46,1,1 PL:GT:GQ 57,2,0:1/1:37
-chr7 1046005 . C T 11.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr7 1564339 . C T 71 . DP=66;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=36,0,24,0;MQ=29;PV4=1,1,0.35,1 PL:GT:GQ 101,0,134:0/1:99
-chr7 1806266 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr7 1936013 . G T 7.77 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=17 PL:GT:GQ 39,9,0:1/1:63
-chr7 2319532 . C A 4.11 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=14 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
-chr7 2682121 . C T 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr7 3248116 . T C 36.5 . DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=37;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 66,2,0:1/1:37
-chr7 3624766 . C T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr7 5291140 . G C 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr7 5314457 . C A 3.56 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=18 PL:GT:GQ 34,24,0:1/1:95
-chr7 5595072 . T A 79 . DP=13;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,5,0;MQ=31;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 109,0,57:0/1:60
-chr7 5646060 . G C 7.79 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=10 PL:GT:GQ 40,30,0:1/1:99
-chr7 6056816 . C G 7.08 . DP=6;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 35,1,0:1/1:23
-chr7 6412641 . C T 40 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=33 PL:GT:GQ 73,33,0:1/1:99
-chr7 6766874 . A G 34.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=43 PL:GT:GQ 67,15,0:1/1:75
-chr7 8482729 . C T 5.08 . DP=16;AF1=0.8276;CI95=0.5,1;DP4=3,0,3,0;MQ=22;PV4=1,1,1,0.19 PL:GT:GQ 32,0,1:1/1:5
-chr7 9238362 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr7 9687781 . G A 33 . DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,16,0,12;MQ=48;PV4=1,6.5e-38,1,1 PL:GT:GQ 63,0,170:0/1:66
-chr7 9752803 . A T 14.2 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=18 PL:GT:GQ 47,27,0:1/1:99
-chr7 10240910 . T C 45.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ 78,12,0:1/1:72
-chr7 11046187 . C T 86.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=47 PL:GT:GQ 119,12,0:1/1:72
-chr7 11548207 . C G 14.6 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=6,1,0,5;MQ=18;PV4=0.015,1,1,1 PL:GT:GQ 46,7,0:1/1:57
-chr7 11580317 . C T 42 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,10;MQ=22;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 75,23,0:1/1:92
-chr7 11585384 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr7 13498356 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr7 13500887 . G A 15.1 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=22 PL:GT:GQ 48,30,0:1/1:99
-chr7 13827079 . C T 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr7 14403976 . T G 59 . DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=39 PL:GT:GQ 92,24,0:1/1:96
-chr7 14756588 . A G 44 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,10,0;MQ=44;PV4=1,5.3e-18,1,1 PL:GT:GQ 74,0,70:0/1:72
-chr7 14756619 . T G 44 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,10,0;MQ=44;PV4=1,6.4e-10,1,1 PL:GT:GQ 74,0,70:0/1:72
-chr7 36734598 . A C 11.1 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ 42,6,0:1/1:49
-chr7 36734599 . A T 11.1 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ 42,6,0:1/1:49
-chr7 36734603 . G C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr7 40634921 . A C 55 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=39 PL:GT:GQ 88,39,0:1/1:99
-chr7 48271285 . A T 73 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=25 PL:GT:GQ 106,30,0:1/1:99
-chr7 56264700 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr7 62326003 . C A 26.1 . DP=35;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=28 PL:GT:GQ 59,18,0:1/1:90
-chr7 109468934 . T G 5.13 . DP=10;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=39;PV4=1,0.031,1,1 PL:GT:GQ 33,2,0:1/1:37
-chr7 110208327 . C G 16.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 48,6,0:1/1:49
-chr7 125654934 . A G 4.11 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=27 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
-chr7 125770209 . A C 32 . DP=31;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,13,0;MQ=34;PV4=1,0.00017,0.16,0.22 PL:GT:GQ 62,0,105:0/1:65
-chr7 125770265 . G C 36 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,5;MQ=48;PV4=1,0.0047,0.016,0.035 PL:GT:GQ 66,0,110:0/1:69
-chr7 126687042 . A G 21.1 . DP=36;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=22 PL:GT:GQ 54,21,0:1/1:84
-chr7 132292897 . G T 99 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=43 PL:GT:GQ 167,21,0:1/1:84
-chr7 132334562 . A C 23 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=23 PL:GT:GQ 56,30,0:1/1:99
-chr7 132431838 . C T 13.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,4,0;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 44,5,0:1/1:46
-chr7 136324945 . T C 13.7 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 46,12,0:1/1:72
-chr7 136957634 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr7 141746871 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr7 146831870 . C T 4.77 . DP=14;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=37;PV4=1,0.0029,0.28,1 PL:GT:GQ 33,0,28:0/1:30
-chr7 147142770 . T C 45 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=31 PL:GT:GQ 77,9,0:1/1:63
-chr7 147713906 . C T 4.77 . DP=8;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,8.9e-06,0.48,0.27 PL:GT:GQ 33,0,29:0/1:31
-chr7 148742642 . G A 68 . DP=14;AF1=0.5032;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,10,0;MQ=28;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 98,0,19:0/1:22
-chr7 148879148 . C T 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr7 149484407 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr7 152444478 . A G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr7 154106613 . C T 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=51 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr7 154776891 . G T 14.4 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ 47,15,0:1/1:75
-chr7 155882061 . A C 29 . DP=24;AF1=0.502;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,4;MQ=46;PV4=1,0.018,0.15,0.29 PL:GT:GQ 59,0,21:0/1:24
-chr7 155956844 . G C 23 . DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,4;MQ=38;PV4=1,1,0.38,1 PL:GT:GQ 53,0,103:0/1:56
-chr7 156277694 . G A 62 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=46 PL:GT:GQ 95,24,0:1/1:96
-chr7 156720588 . T C 16.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ 48,9,0:1/1:63
-chr7 156807649 . T C 3.01 . DP=30;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,3;MQ=43;PV4=1,0.16,0.15,1 PL:GT:GQ 30,0,72:0/1:33
-chr7 157331292 . G T 43.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=34 PL:GT:GQ 76,21,0:1/1:84
-chr7 157382957 . T C 33.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr8 556382 . A G 37.1 . DP=5;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=31;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 66,1,0:1/1:23
-chr8 1661673 . T C 9.31 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr8 7379751 . C A 6.24 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=19 PL:GT:GQ 38,21,0:1/1:84
-chr8 8160505 . A T 68.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 101,12,0:1/1:72
-chr8 8160508 . C T 24.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 57,12,0:1/1:72
-chr8 16781011 . A G 55.5 . DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=34 PL:GT:GQ 88,12,0:1/1:72
-chr8 18716499 . A T 20 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,2;MQ=29;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 50,0,52:0/1:51
-chr8 23326483 . A G 60 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=47 PL:GT:GQ 92,9,0:1/1:63
-chr8 25842819 . T A 12 . DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ 43,6,0:1/1:49
-chr8 26300279 . T C 34 . DP=44;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,41,0;MQ=21 PL:GT:GQ 67,123,0:1/1:99
-chr8 29673470 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr8 29673473 . C G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr8 31685466 . C T 34 . DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,0,5,0;MQ=28;PV4=1,0.072,1,0.36 PL:GT:GQ 64,0,50:0/1:53
-chr8 37378739 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=34 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr8 51325952 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr8 59221963 . G A 16.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ 48,9,0:1/1:63
-chr8 62764995 . T G 20 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=32 PL:GT:GQ 52,9,0:1/1:63
-chr8 63157426 . C G 41.6 . DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,7,0,15;MQ=19;PV4=1,1,1,0.25 PL:GT:GQ 74,11,0:1/1:66
-chr8 68710444 . G A 30 . DP=5;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=3,0,2,0;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 59,0,3:0/1:5
-chr8 76416560 . G A 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=46 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr8 81425275 . T G 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr8 89842286 . G C 4.61 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=30 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
-chr8 100926281 . G A 38 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ 70,9,0:1/1:63
-chr8 102746002 . G C 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr8 107850176 . C T 43.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=45 PL:GT:GQ 76,18,0:1/1:90
-chr8 109966441 . T C 27.3 . DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=38 PL:GT:GQ 60,15,0:1/1:75
-chr8 118811716 . G T 99 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=50 PL:GT:GQ 155,18,0:1/1:90
-chr8 119440254 . A T 58.5 . DP=5;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=34;PV4=1,1,1,0.14 PL:GT:GQ 87,0,1:1/1:5
-chr8 121236024 . G A 39.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 71,6,0:1/1:49
-chr8 125489079 . C T 13 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr8 128502549 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr8 128502551 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr8 130951113 . G A 4.61 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=19 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
-chr8 135307123 . G A 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr8 138814155 . C T 57.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:GT:GQ 90,18,0:1/1:90
-chr8 140566111 . A G 18.1 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=15 PL:GT:GQ 51,36,0:1/1:99
-chr8 141586480 . T G 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr8 143376712 . A G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr8 150662729 . T C 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr8 150741294 . A G 25.1 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=34 PL:GT:GQ 58,18,0:1/1:90
-chr8 150975618 . A G 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr8 151580103 . T C 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=20 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr8 151634410 . G T 48 . DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,12,0,5;MQ=39;PV4=1,0.072,1,1 PL:GT:GQ 78,0,125:0/1:81
-chr8 151709267 . G A 91.1 . DP=8;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,7;MQ=40;PV4=1,1,0.28,0.37 PL:GT:GQ 121,0,16:0/1:19
-chr8 152636420 . G A 8.75 . DP=3;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=30;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 37,1,0:1/1:23
-chr8 152706967 . G A 3.01 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=16 PL:GT:GQ 33,30,0:1/1:99
-chr8 152786522 . T C 80.1 . DP=16;AF1=0.5102;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,12;MQ=31;PV4=1,0.25,1,1 PL:GT:GQ 110,0,14:0/1:17
-chr8 152863132 . T G 5.44 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=30 PL:GT:GQ 36,9,0:1/1:63
-chr9 23235268 . C T 12 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ 43,6,0:1/1:49
-chr9 26391176 . T C 15.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 47,6,0:1/1:49
-chr9 26868232 . C G 63 . DP=20;AF1=0.5025;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,13,0;MQ=22;PV4=1,0.2,1,0.44 PL:GT:GQ 93,0,20:0/1:23
-chr9 34223668 . C T 22 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,7;MQ=27;PV4=1,0.14,0.34,1 PL:GT:GQ 52,0,79:0/1:55
-chr9 39696645 . G A 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr9 40654130 . T G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr9 41145321 . T G 46.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ 79,12,0:1/1:72
-chr9 42273483 . G A 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr9 55633192 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr9 58705807 . T C 70 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=24 PL:GT:GQ 103,30,0:1/1:99
-chr9 61697149 . C G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr9 63152790 . A C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr9 63703913 . C G 90.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=38 PL:GT:GQ 123,21,0:1/1:84
-chr9 65116068 . T C 70 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=49 PL:GT:GQ 103,39,0:1/1:99
-chr9 71266598 . C A 3.98 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr9 73188677 . G T 52 . DP=294;AF1=1;CI95=1,1;DP4=44,0,245,0;MQ=33;PV4=1,0.28,0.0092,1 PL:GT:GQ 85,147,0:1/1:99
-chr9 78854179 . G T 22 . DP=97;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=21,0,12,0;MQ=44;PV4=1,0.02,0.032,0.0033 PL:GT:GQ 52,0,158:0/1:55
-chr9 82964679 . A C 13.2 . DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=36 PL:GT:GQ 45,9,0:1/1:63
-chr9 84124545 . G T 57 . DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,3,0;MQ=49;PV4=1,1,0.024,1 PL:GT:GQ 87,0,59:0/1:62
-chr9 86552862 . C T 14.4 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=26 PL:GT:GQ 47,15,0:1/1:75
-chr9 87548941 . A G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr9 89021101 . G A 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr9 90447825 . G A 9.31 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr9 92462035 . C A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr9 93077294 . T G 5.44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=31 PL:GT:GQ 36,9,0:1/1:63
-chr9 93998137 . G A 68 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=46 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr9 93998148 . C T 21.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=36 PL:GT:GQ 54,15,0:1/1:75
-chr9 95028964 . C A 99 . DP=83;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,57,0,26;MQ=32;PV4=1,9.3e-08,1,0.092 PL:GT:GQ 134,0,120:0/1:99
-chr9 103829155 . A G 33 . DP=96;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,96,0;MQ=16 PL:GT:GQ 66,255,0:1/1:99
-chr9 104981331 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr9 111070656 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr9 117395657 . T C 16.4 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 49,15,0:1/1:75
-chr9 117718907 . A G 46.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=29 PL:GT:GQ 79,18,0:1/1:90
-chr9 119149161 . T C 3.14 . DP=65;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22 PL:GT:GQ 33,15,0:1/1:75
-chr9 124528802 . G A 78 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=25 PL:GT:GQ 111,39,0:1/1:99
-chr9 126707903 . G A 26 . DP=37;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,21,0,8;MQ=46;PV4=1,2.6e-07,0.21,0.42 PL:GT:GQ 56,0,175:0/1:59
-chr9 128700686 . C G 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr9 129084077 . G A 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr9 129116900 . A T 20 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30 PL:GT:GQ 52,9,0:1/1:63
-chr9 130290720 . C G 21.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 53,6,0:1/1:49
-chr9 130306057 . C G 71 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=28 PL:GT:GQ 104,42,0:1/1:99
-chr9 130528990 . G A 99 . DP=31;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,31,0;MQ=27 PL:GT:GQ 174,93,0:1/1:99
-chr9 130529002 . A T 7.79 . DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=15 PL:GT:GQ 40,33,0:1/1:99
-chr9 130639996 . A G 8.44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 39,6,0:1/1:49
-chr9 130704890 . A G 3.27 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=26 PL:GT:GQ 33,12,0:1/1:72
-chr9 130708345 . G A 13.3 . DP=11;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=38;PV4=1,0.096,1,1 PL:GT:GQ 42,1,0:1/1:23
-chr9 131001601 . T A 3.98 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr9 131058539 . T A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr9 131808965 . C T 42 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37 PL:GT:GQ 75,27,0:1/1:99
-chr9 132551867 . C T 17.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ 49,9,0:1/1:63
-chr9 132685120 . A G 4.75 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ 35,9,0:1/1:63
-chr9 133175050 . A G 18.1 . DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=20 PL:GT:GQ 51,51,0:1/1:99
-chr9 133584978 . A G 99 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,25,0;MQ=45 PL:GT:GQ 212,75,0:1/1:99
-chr9 133661895 . A G 99 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=31 PL:GT:GQ 138,42,0:1/1:99
-chr9 133670376 . T C 68 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,16;MQ=39;PV4=1,1.4e-20,1,1 PL:GT:GQ 101,39,0:1/1:99
-chr9 133843777 . T C 99 . DP=9;AF1=0.5129;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,8,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 154,0,13:0/1:16
-chr9 134017265 . G C 3.27 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=13 PL:GT:GQ 33,12,0:1/1:72
-chr9 134105563 . T C 34.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=39 PL:GT:GQ 67,18,0:1/1:90
-chr9 134608906 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr9 134861929 . T A 9.49 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30 PL:GT:GQ 41,9,0:1/1:63
-chr10 796662 . A G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr10 1216716 . T A 18.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr10 1220781 . G A 21 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=18 PL:GT:GQ 54,27,0:1/1:99
-chr10 1225208 . T C 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=47 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr10 1727946 . T C 14.2 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=27 PL:GT:GQ 47,21,0:1/1:84
-chr10 5986542 . T C 83 . DP=93;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=39 PL:GT:GQ 116,30,0:1/1:99
-chr10 6436277 . G A 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr10 7704114 . C A 35 . DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,4;MQ=29;PV4=1,0.27,1,0.27 PL:GT:GQ 65,3,0:1/1:41
-chr10 10881734 . A G 9.52 . DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=42;PV4=1,0.0026,0.14,1 PL:GT:GQ 39,0,91:0/1:42
-chr10 13099383 . G A 27.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ 60,12,0:1/1:72
-chr10 15764077 . G C 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=40 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr10 18091502 . T C 47 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38 PL:GT:GQ 79,9,0:1/1:63
-chr10 19645913 . A T 15.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ 47,6,0:1/1:49
-chr10 22845062 . C T 18.1 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=18 PL:GT:GQ 51,21,0:1/1:84
-chr10 28282802 . T C 69 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,12,0;MQ=42 PL:GT:GQ 102,36,0:1/1:99
-chr10 28496872 . T G 8.44 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 39,6,0:1/1:49
-chr10 32746793 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr10 41437604 . T G 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr10 43051239 . C T 6.98 . DP=3;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=40;PV4=1,0.33,0.33,1 PL:GT:GQ 36,0,31:0/1:33
-chr10 44455192 . C T 4.41 . DP=6;AF1=0.8276;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,3;MQ=21;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 31,0,1:1/1:5
-chr10 48387336 . A G 13 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr10 51561705 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr10 51561712 . C G 39.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 71,6,0:1/1:49
-chr10 55617954 . G A 8.44 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ 39,6,0:1/1:49
-chr10 55718281 . T A 3.41 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ 32,6,0:1/1:49
-chr10 55888771 . T C 23.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ 56,12,0:1/1:72
-chr10 56025569 . C G 34.1 . DP=3;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=39;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 64,0,16:0/1:19
-chr10 57384943 . G T 84 . DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,0,13,0;MQ=26;PV4=1,0.015,1,1 PL:GT:GQ 114,0,110:0/1:99
-chr10 59873077 . T G 49 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=42 PL:GT:GQ 82,24,0:1/1:96
-chr10 61329572 . C T 15.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 47,6,0:1/1:49
-chr10 63790636 . T G 32.1 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,10,0;MQ=28;PV4=1,0.14,1,1 PL:GT:GQ 65,22,0:1/1:88
-chr10 64466048 . C G 18.2 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=28 PL:GT:GQ 51,18,0:1/1:90
-chr10 65053440 . G T 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=39 PL:GT:GQ 153,30,0:1/1:99
-chr10 65407358 . C G 84.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45 PL:GT:GQ 117,15,0:1/1:75
-chr10 65605291 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr10 66104447 . T C 99 . DP=47;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,21;MQ=34;PV4=1,1,0.15,1 PL:GT:GQ 136,0,162:0/1:99
-chr10 82160859 . G C 99 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=36 PL:GT:GQ 153,39,0:1/1:99
-chr10 82198579 . C T 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr10 87086290 . A G 4.13 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=17 PL:GT:GQ 35,27,0:1/1:99
-chr10 89550621 . T G 74 . DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,45;MQ=45 PL:GT:GQ 107,135,0:1/1:99
-chr10 92325046 . G A 42.3 . DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45 PL:GT:GQ 75,15,0:1/1:75
-chr10 94488050 . A G 5.46 . DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=43;PV4=1,0.16,1,1 PL:GT:GQ 34,0,34:0/1:34
-chr10 95024815 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr10 95466306 . G A 53 . DP=7;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=0,4,0,3;MQ=33;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 82,0,3:0/1:5
-chr10 100256777 . T G 3.83 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=23 PL:GT:GQ 34,12,0:1/1:72
-chr10 101510485 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr10 101530760 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr10 101879744 . T C 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=44 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr10 102147276 . G C 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=33 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr10 102642248 . T G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr10 107666616 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr10 108319945 . C G 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr10 109734371 . G A 12.7 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,12,0:1/1:72
-chr10 112870604 . C T 46.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=36 PL:GT:GQ 79,12,0:1/1:72
-chr10 115304673 . T C 11.3 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr10 119380588 . G A 14.2 . DP=4;AF1=0.502;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=43;PV4=1,0.18,0.32,1 PL:GT:GQ 44,0,21:0/1:24
-chr10 123063756 . C T 14.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=23 PL:GT:GQ 46,9,0:1/1:63
-chr10 128424770 . T G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr10 131229204 . T C 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr10 132420570 . G C 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr10 132528066 . C T 99 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,19,0;MQ=42 PL:GT:GQ 213,57,0:1/1:99
-chr10 132644619 . G A 19.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=23 PL:GT:GQ 52,15,0:1/1:75
-chr10 132707581 . G C 9.11 . DP=51;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=25;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 38,2,0:1/1:37
-chr10 133026892 . T C 55.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=44 PL:GT:GQ 88,18,0:1/1:90
-chr11 768033 . T C 33.5 . DP=4;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,0,1:1/1:5
-chr11 768042 . T C 33.5 . DP=6;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,0,1:1/1:5
-chr11 874568 . G C 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr11 1009210 . T C 4 . DP=70;AF1=0.6241;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,8;MQ=24;PV4=1,1,0.5,1 PL:GT:GQ 31,0,4:0/1:6
-chr11 1016692 . C T 27 . DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,38;MQ=22 PL:GT:GQ 60,114,0:1/1:99
-chr11 1034477 . A G 66 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ 98,9,0:1/1:63
-chr11 1074037 . G A 4.13 . DP=9;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=24;PV4=1,1,0.43,1 PL:GT:GQ 32,0,30:0/1:31
-chr11 1556298 . G A 11.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ 44,12,0:1/1:72
-chr11 1824777 . T C 27 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=28 PL:GT:GQ 60,30,0:1/1:99
-chr11 3395801 . C T 22 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr11 3411901 . G A 4.75 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ 35,9,0:1/1:63
-chr11 3731606 . A C 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr11 3783855 . C T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr11 3967636 . A G 4.29 . DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=24 PL:GT:GQ 35,15,0:1/1:75
-chr11 4385618 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr11 4424365 . T A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr11 5295586 . C T 3.01 . DP=52;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=33,0,10,0;MQ=29;PV4=1,0.0045,0.3,0.17 PL:GT:GQ 30,0,131:0/1:33
-chr11 6157144 . C G 45.1 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=35 PL:GT:GQ 78,21,0:1/1:84
-chr11 6352044 . C T 18 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=31 PL:GT:GQ 50,9,0:1/1:63
-chr11 6767356 . T C 9.63 . DP=3;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=29;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 38,1,0:1/1:23
-chr11 6999404 . G C 21 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=37 PL:GT:GQ 53,9,0:1/1:63
-chr11 9120930 . C G 17.6 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ 50,12,0:1/1:72
-chr11 9373125 . T C 19.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 51,6,0:1/1:49
-chr11 9585101 . C T 67 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=45 PL:GT:GQ 100,42,0:1/1:99
-chr11 10266192 . A C 14.3 . DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=27 PL:GT:GQ 47,18,0:1/1:90
-chr11 10303263 . T C 8.64 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,17;MQ=18 PL:GT:GQ 41,51,0:1/1:99
-chr11 10420170 . T C 35 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,15;MQ=28;PV4=1,0.12,1,0.4 PL:GT:GQ 68,36,0:1/1:99
-chr11 10912169 . G A 99 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=49 PL:GT:GQ 155,18,0:1/1:90
-chr11 11315826 . T G 6.29 . DP=27;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=19 PL:GT:GQ 38,18,0:1/1:90
-chr11 11603859 . A C 22 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,6;MQ=34;PV4=1,9.5e-13,0.22,1 PL:GT:GQ 52,0,115:0/1:55
-chr11 11700034 . C T 33 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=30 PL:GT:GQ 66,27,0:1/1:99
-chr11 11822758 . G A 15.1 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,3;MQ=38;PV4=1,0.18,1,1 PL:GT:GQ 45,0,88:0/1:48
-chr11 11976636 . C T 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=24 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr11 14380517 . C G 16.1 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,5,0;MQ=48;PV4=1,2.1e-05,0.13,1 PL:GT:GQ 46,0,113:0/1:49
-chr11 14419212 . A G 91.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=38 PL:GT:GQ 124,18,0:1/1:90
-chr11 14846792 . A G 55 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=19 PL:GT:GQ 88,33,0:1/1:99
-chr11 15494556 . C T 99 . DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=22,0,14,0;MQ=34;PV4=1,0.0071,1,1 PL:GT:GQ 146,0,159:0/1:99
-chr11 16262879 . A C 16.1 . DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=43;PV4=1,0.061,0.24,0.33 PL:GT:GQ 46,0,28:0/1:31
-chr11 21514947 . T C 24.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=41 PL:GT:GQ 57,12,0:1/1:72
-chr11 22532576 . C G 28 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,17;MQ=17 PL:GT:GQ 61,51,0:1/1:99
-chr11 23529238 . G T 4.29 . DP=13;AF1=0.5334;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=37;PV4=1,1,0.34,0.21 PL:GT:GQ 32,0,9:0/1:12
-chr11 24249554 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr11 24853167 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr11 33353903 . T C 24.3 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=36 PL:GT:GQ 57,15,0:1/1:75
-chr11 35126569 . T C 24.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ 57,12,0:1/1:72
-chr11 35132248 . C T 18.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr11 35155482 . T C 68 . DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=46 PL:GT:GQ 101,66,0:1/1:99
-chr11 52494088 . T C 99 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37 PL:GT:GQ 140,27,0:1/1:99
-chr11 57899943 . C G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr11 62261460 . G T 19.1 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,5;MQ=27;PV4=1,1.1e-06,1,1 PL:GT:GQ 49,0,58:0/1:51
-chr11 67456049 . C T 39.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=19 PL:GT:GQ 72,18,0:1/1:90
-chr11 68509708 . C G 3.65 . DP=9;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=0,5,0,4;MQ=17;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 30,0,2:0/1:3
-chr11 70115115 . T A 99 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=49 PL:GT:GQ 140,15,0:1/1:75
-chr11 72643951 . T C 70 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=39 PL:GT:GQ 103,66,0:1/1:99
-chr11 72647930 . G A 36 . DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=41;PV4=1,1,0.3,1 PL:GT:GQ 66,0,28:0/1:31
-chr11 73330148 . C T 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr11 81720893 . A G 5.83 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=19 PL:GT:GQ 37,12,0:1/1:72
-chr11 83813797 . A G 23.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ 56,12,0:1/1:72
-chr11 85949488 . C A 54 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=37 PL:GT:GQ 87,42,0:1/1:99
-chr11 87634829 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr11 90913093 . A T 35.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 67,6,0:1/1:49
-chr11 93793348 . G A 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=31 PL:GT:GQ 139,24,0:1/1:96
-chr11 100802294 . T C 16.6 . DP=21;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ 49,12,0:1/1:72
-chr11 107455449 . C T 8.44 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=26 PL:GT:GQ 39,6,0:1/1:49
-chr11 111344355 . A G 69.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=43 PL:GT:GQ 102,12,0:1/1:72
-chr11 111611115 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr11 113050466 . G C 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr11 114332544 . T C 3.54 . DP=17;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,5;MQ=37;PV4=1,0.32,0.13,1 PL:GT:GQ 31,0,37:0/1:33
-chr11 114332549 . G A 3.54 . DP=17;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,8;MQ=36;PV4=1,3.1e-10,0.088,1 PL:GT:GQ 31,0,127:0/1:34
-chr11 114843578 . G C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr11 115580279 . A G 99 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,15,0;MQ=48 PL:GT:GQ 190,45,0:1/1:99
-chr11 116434328 . G A 17.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 50,12,0:1/1:72
-chr11 125914161 . A G 20.8 . DP=7;AF1=0.95;CI95=0.5,1;DP4=3,0,4,0;MQ=38;PV4=1,0.074,1,1 PL:GT:GQ 49,0,0:1/1:10
-chr11 125917089 . C T 12.3 . DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,28,0,12;MQ=44;PV4=1,4.7e-25,1,1 PL:GT:GQ 42,0,167:0/1:45
-chr11 127194100 . A G 60 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=49 PL:GT:GQ 93,24,0:1/1:96
-chr12 70856 . G A 27.5 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 60,12,0:1/1:72
-chr12 153693 . T C 52.3 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=38 PL:GT:GQ 85,15,0:1/1:75
-chr12 924547 . C G 37.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 69,6,0:1/1:49
-chr12 1555916 . G A 7.18 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 39,15,0:1/1:75
-chr12 1919860 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr12 2283756 . G A 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr12 2805983 . G C 12.7 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 45,12,0:1/1:72
-chr12 6088203 . T C 72.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=37 PL:GT:GQ 105,15,0:1/1:75
-chr12 7099460 . G C 10.8 . DP=6;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=3,0,3,0;MQ=26;PV4=1,0.027,1,1 PL:GT:GQ 39,0,1:1/1:5
-chr12 7099464 . G A 13.3 . DP=6;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=28;PV4=1,0.16,1,1 PL:GT:GQ 42,1,0:1/1:23
-chr12 7198516 . T G 4.61 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
-chr12 23331895 . C T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr12 28209020 . T G 14.4 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ 47,15,0:1/1:75
-chr12 30074073 . C T 32.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 64,6,0:1/1:49
-chr12 30563452 . T C 25 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ 57,9,0:1/1:63
-chr12 30563453 . A G 25 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ 57,9,0:1/1:63
-chr12 30563464 . C A 78.8 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,5;MQ=34;PV4=1,0.29,1,1 PL:GT:GQ 110,6,0:1/1:49
-chr12 31505085 . G A 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr12 34041336 . G A 5.46 . DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=36;PV4=1,1,0.48,0.21 PL:GT:GQ 34,0,34:0/1:34
-chr12 49003648 . C G 42 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=39 PL:GT:GQ 75,24,0:1/1:96
-chr12 51280690 . G A 69 . DP=98;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,18,0;MQ=45;PV4=1,1,0.051,1 PL:GT:GQ 99,0,84:0/1:87
-chr12 69206633 . T C 17.1 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=17 PL:GT:GQ 50,33,0:1/1:99
-chr12 80417253 . T C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr12 86633033 . C T 34 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=43;PV4=1,1,0.33,1 PL:GT:GQ 64,0,31:0/1:34
-chr12 98097274 . C T 47.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=31 PL:GT:GQ 80,15,0:1/1:75
-chr12 105269319 . C T 19 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=26 PL:GT:GQ 51,9,0:1/1:63
-chr12 109053425 . G A 9.53 . DP=8;AF1=0.5012;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,6,0;MQ=25;PV4=1,1,0.19,1 PL:GT:GQ 39,0,23:0/1:26
-chr12 111904540 . A G 3.41 . DP=65;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ 32,6,0:1/1:49
-chr12 115038686 . T C 15.2 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=27 PL:GT:GQ 48,21,0:1/1:84
-chr12 115039419 . A G 4.11 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
-chr12 115103890 . G A 66 . DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,38;MQ=49 PL:GT:GQ 99,114,0:1/1:99
-chr12 115833830 . G A 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr12 116361873 . T G 6.34 . DP=5;AF1=0.7302;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 34,0,2:0/1:3
-chr12 123583527 . G A 14.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ 46,9,0:1/1:63
-chr12 124115330 . A G 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr12 125062296 . G A 41.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr12 126718106 . A G 8.76 . DP=50;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=2,0,6,0;MQ=26;PV4=1,0.33,0.37,1 PL:GT:GQ 38,0,12:0/1:15
-chr12 133348311 . G A 24 . DP=18;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=14,0,3,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 54,0,118:0/1:57
-chr12 134494475 . C T 28 . DP=18;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=8,0,10,0;MQ=18;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 57,0,3:0/1:5
-chr12 134831761 . C T 41.3 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=27 PL:GT:GQ 74,15,0:1/1:75
-chr12 134992770 . A C,T 84 . DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,26,0;MQ=29 PL:GT:GQ 117,72,114,0,44,114:1/1:99
-chr12 135261117 . G A 49.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:GT:GQ 82,18,0:1/1:90
-chr12 135261144 . A G 99 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:GT:GQ 155,18,0:1/1:90
-chr12 135460302 . G A 99 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,23,0;MQ=40 PL:GT:GQ 198,69,0:1/1:99
-chr12 135463758 . A G 83 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=26 PL:GT:GQ 116,48,0:1/1:99
-chr12 135523325 . G A 99 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=26 PL:GT:GQ 136,66,0:1/1:99
-chr12 135782401 . T C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr12 135795472 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr13 18040027 . G C 42 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=33 PL:GT:GQ 74,9,0:1/1:63
-chr13 19494625 . G T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr13 20121126 . A G 15.1 . DP=36;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=25,0,9,0;MQ=36;PV4=1,1,0.13,1 PL:GT:GQ 45,0,153:0/1:48
-chr13 21536703 . A G 9.31 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr13 23160035 . G T 3.98 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr13 23476554 . C A 6.79 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=52 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr13 26632967 . C G 32 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=34 PL:GT:GQ 65,27,0:1/1:99
-chr13 26790010 . T C 89.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=35 PL:GT:GQ 122,15,0:1/1:75
-chr13 36083571 . T C 43 . DP=84;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,37,0;MQ=16;PV4=1,1,1,0.3 PL:GT:GQ 76,99,0:1/1:99
-chr13 44432419 . C T 3.58 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=19 PL:GT:GQ 34,21,0:1/1:84
-chr13 46592359 . T C 16.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 48,6,0:1/1:49
-chr13 52764657 . A T 3.14 . DP=32;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22 PL:GT:GQ 33,15,0:1/1:75
-chr13 53084193 . C T 9.11 . DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=29;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 38,2,0:1/1:37
-chr13 57763228 . C T 45 . DP=555;AF1=1;CI95=1,1;DP4=2,0,21,0;MQ=23;PV4=1,0.00021,1,0.3 PL:GT:GQ 78,45,0:1/1:99
-chr13 73857921 . G C 31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ 63,9,0:1/1:63
-chr13 76718001 . G A 59 . DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=45;PV4=1,1,0.12,1 PL:GT:GQ 89,0,28:0/1:31
-chr13 100912695 . A T 23 . DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,16,0,6;MQ=31;PV4=1,0.029,1,0.35 PL:GT:GQ 53,0,103:0/1:56
-chr13 101332001 . G C 21 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,23,0;MQ=21 PL:GT:GQ 54,69,0:1/1:99
-chr13 102637334 . C T 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr13 102895627 . C T 63 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=48 PL:GT:GQ 96,27,0:1/1:99
-chr13 103830322 . T C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr13 112842448 . G A 39 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=27 PL:GT:GQ 72,27,0:1/1:99
-chr13 113310291 . C T 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr13 114775162 . A G 80 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=21 PL:GT:GQ 113,51,0:1/1:99
-chr13 115267482 . A G 16.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ 48,9,0:1/1:63
-chr13 116068676 . C T 3.83 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=27 PL:GT:GQ 34,12,0:1/1:72
-chr13 116455918 . A G 33 . DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,15,0;MQ=42;PV4=1,1.8e-20,0.3,1 PL:GT:GQ 63,0,146:0/1:66
-chr13 116765012 . G A 30.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 62,6,0:1/1:49
-chr13 116779773 . C T 17.1 . DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=27,0,11,0;MQ=24;PV4=1,4.5e-35,1,1 PL:GT:GQ 47,0,106:0/1:50
-chr13 116779791 . C T 57 . DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=24,0,14,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 87,0,103:0/1:90
-chr14 20159250 . C T 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr14 23510676 . T C 52 . DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=32 PL:GT:GQ 85,66,0:1/1:99
-chr14 24735256 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr14 29525577 . G A 21 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=16 PL:GT:GQ 54,27,0:1/1:99
-chr14 36186389 . C T 6.79 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=20 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr14 36186394 . A G 6.79 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=20 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr14 37440609 . A G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr14 40432807 . A G 18.6 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=23 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr14 59466268 . T C 15.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=25 PL:GT:GQ 47,9,0:1/1:63
-chr14 61368162 . G T 7.18 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=17 PL:GT:GQ 39,15,0:1/1:75
-chr14 65152922 . G A 92 . DP=33;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,18,0,15;MQ=36;PV4=1,0.059,0.35,1 PL:GT:GQ 122,0,144:0/1:99
-chr14 69749148 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=25 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr14 74877658 . C T 45 . DP=48;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,12;MQ=36;PV4=1,0.02,1,0.39 PL:GT:GQ 78,28,0:1/1:99
-chr14 75546678 . C T 19.2 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=17 PL:GT:GQ 52,18,0:1/1:90
-chr14 76439185 . T C 67.1 . DP=7;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,6;MQ=33;PV4=1,1,0.056,0.29 PL:GT:GQ 97,0,17:0/1:20
-chr14 77313295 . T A 99 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=48 PL:GT:GQ 191,30,0:1/1:99
-chr14 77673422 . G A 11.5 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=24 PL:GT:GQ 44,18,0:1/1:90
-chr14 78646125 . T C 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=40 PL:GT:GQ 153,24,0:1/1:96
-chr14 91702449 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr14 91769842 . G A 63 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=47 PL:GT:GQ 95,9,0:1/1:63
-chr14 91775899 . C G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr14 91775924 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr14 93482918 . A C 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr14 93665819 . C T 75 . DP=7;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,4;MQ=42;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 105,0,31:0/1:34
-chr14 95422276 . A G 55.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=45 PL:GT:GQ 88,21,0:1/1:84
-chr14 95731986 . C T 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr14 96045464 . A G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr14 97172020 . C T 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=51 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr14 100515480 . A G 6.98 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=45;PV4=1,0.14,0.085,0.33 PL:GT:GQ 36,0,30:0/1:32
-chr14 100770214 . A T 8.69 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=16 PL:GT:GQ 41,21,0:1/1:84
-chr14 101258303 . G A 82 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,15,0;MQ=26 PL:GT:GQ 115,45,0:1/1:99
-chr14 101701492 . C G 66 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=49 PL:GT:GQ 99,30,0:1/1:99
-chr14 102113772 . T C 3.98 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=30 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr14 102751431 . A C 36.5 . DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 66,2,0:1/1:37
-chr14 103708033 . A G 99 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=27 PL:GT:GQ 141,36,0:1/1:99
-chr14 104744582 . G A 3.52 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ 33,9,0:1/1:63
-chr14 105989100 . C T 3.14 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 33,15,0:1/1:75
-chr14 105989162 . C T 3.65 . DP=12;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,6;MQ=15;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 30,0,2:0/1:3
-chr14 106234810 . G A 25.3 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=39 PL:GT:GQ 58,15,0:1/1:75
-chr14 106995572 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr14 107283057 . T C 5.5 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=20 PL:GT:GQ 37,21,0:1/1:84
-chr14 107285319 . T C 33 . DP=36;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,35;MQ=22 PL:GT:GQ 66,105,0:1/1:99
-chr14 107640449 . A G 11.8 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=36 PL:GT:GQ 44,12,0:1/1:72
-chr15 20082092 . T G 18.3 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=24 PL:GT:GQ 51,15,0:1/1:75
-chr15 22955884 . T C 67 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,12,0;MQ=48 PL:GT:GQ 100,36,0:1/1:99
-chr15 22971987 . A G 5.29 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=22 PL:GT:GQ 35,6,0:1/1:49
-chr15 23233324 . C A 47 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=31 PL:GT:GQ 80,42,0:1/1:99
-chr15 25175286 . C T 36.5 . DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=42;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 66,2,0:1/1:37
-chr15 25385709 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr15 27372396 . A G 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=40 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr15 35998093 . C T 9.53 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=17 PL:GT:GQ 42,27,0:1/1:99
-chr15 36716538 . C G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr15 36793360 . G T 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr15 53783097 . A G 10.5 . DP=31;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=16 PL:GT:GQ 43,21,0:1/1:84
-chr15 54180175 . C T 10.4 . DP=7;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=27;PV4=1,1.2e-05,1,1 PL:GT:GQ 40,0,32:0/1:34
-chr15 54939306 . C T 99 . DP=34;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,18,0,16;MQ=49;PV4=1,1,0.18,1 PL:GT:GQ 172,0,181:0/1:99
-chr15 59377916 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr15 59685961 . G C 68 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=36 PL:GT:GQ 101,33,0:1/1:99
-chr15 60306384 . A G 18.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr15 60345642 . G C 14.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr15 60367387 . G A 13.2 . DP=6;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,3,0;MQ=34;PV4=1,0.098,0.24,1 PL:GT:GQ 43,0,35:0/1:37
-chr15 60367446 . C T 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr15 61763755 . G A 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=45 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr15 61831362 . C G 11.3 . DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,3;MQ=30;PV4=1,0.00077,0.47,1 PL:GT:GQ 41,0,42:0/1:41
-chr15 63978880 . G C 60 . DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 90,3,0:1/1:41
-chr15 64342445 . A G 12.2 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=18 PL:GT:GQ 44,9,0:1/1:63
-chr15 65424859 . T C 11.3 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=21 PL:GT:GQ 44,30,0:1/1:99
-chr15 65603698 . C T 60 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 92,9,0:1/1:63
-chr15 67005078 . G A 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr15 71133512 . G C 22.3 . DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=25 PL:GT:GQ 55,15,0:1/1:75
-chr15 72619009 . A G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=48 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr15 73272688 . C T 70.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=39 PL:GT:GQ 103,15,0:1/1:75
-chr15 73699335 . T A 99 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=45 PL:GT:GQ 175,27,0:1/1:99
-chr15 74513352 . C T 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=37 PL:GT:GQ 139,30,0:1/1:99
-chr15 75540536 . G A 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr15 75822537 . C A 17.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=23 PL:GT:GQ 50,15,0:1/1:75
-chr15 78554005 . T C 12 . DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ 43,6,0:1/1:49
-chr15 80089369 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=28 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr15 83089149 . C G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr15 86839307 . T C 90.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43 PL:GT:GQ 123,15,0:1/1:75
-chr15 89836258 . T C 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=39 PL:GT:GQ 141,24,0:1/1:96
-chr15 89837706 . G A 4.13 . DP=8;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,4;MQ=30;PV4=1,1,0.25,1 PL:GT:GQ 32,0,59:0/1:35
-chr15 89857648 . T C 99 . DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,8,0;MQ=40;PV4=1,1,0.3,1 PL:GT:GQ 133,0,130:0/1:99
-chr15 89864228 . A C 32 . DP=4;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=42;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,0,31:0/1:34
-chr15 91261235 . G A 7.8 . DP=4;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=44;PV4=1,1,0.32,1 PL:GT:GQ 37,0,30:0/1:32
-chr16 256990 . A C 10.4 . DP=16;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=23;PV4=1,0.34,1,1 PL:GT:GQ 40,0,25:0/1:28
-chr16 260794 . T C 3.01 . DP=19;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,2,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 30,0,32:0/1:31
-chr16 419905 . A G 7.9 . DP=5;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=22;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 36,1,0:1/1:23
-chr16 824086 . T C 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr16 1085063 . C T 52 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,6,0;MQ=42;PV4=1,1,0.014,1 PL:GT:GQ 82,0,128:0/1:85
-chr16 1221305 . T C 54 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,3;MQ=40;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 84,0,60:0/1:63
-chr16 1411728 . A G 32.3 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=35 PL:GT:GQ 65,15,0:1/1:75
-chr16 1443197 . C G 64 . DP=26;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,25,0;MQ=36 PL:GT:GQ 97,75,0:1/1:99
-chr16 1478746 . A T 32 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=28 PL:GT:GQ 65,24,0:1/1:96
-chr16 1514438 . A C 45 . DP=49;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,48,0;MQ=26 PL:GT:GQ 78,144,0:1/1:99
-chr16 1601989 . T C 99 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=29 PL:GT:GQ 133,39,0:1/1:99
-chr16 2043883 . C T 30 . DP=33;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,33;MQ=14 PL:GT:GQ 63,99,0:1/1:99
-chr16 2137470 . A C 39 . DP=38;AF1=0.5016;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,6,0;MQ=34;PV4=1,0.02,1,1 PL:GT:GQ 69,0,22:0/1:25
-chr16 2537260 . A G 99 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=40 PL:GT:GQ 177,33,0:1/1:99
-chr16 2564737 . T C 99 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,22;MQ=41 PL:GT:GQ 199,66,0:1/1:99
-chr16 2612605 . A T 62.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=28 PL:GT:GQ 95,15,0:1/1:75
-chr16 2704518 . G A 41 . DP=48;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,17,0,12;MQ=48;PV4=1,1.9e-23,0.24,0.034 PL:GT:GQ 71,0,175:0/1:74
-chr16 3274307 . G T 68 . DP=39;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,30,0,8;MQ=37;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 98,0,138:0/1:99
-chr16 5467292 . G C 37.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 69,6,0:1/1:49
-chr16 10079145 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr16 11483702 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr16 12038227 . A T 23 . DP=47;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,22,0,23;MQ=32;PV4=1,4.4e-66,0.47,0.028 PL:GT:GQ 53,0,135:0/1:56
-chr16 21336880 . G C 55 . DP=35;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,12,0,19;MQ=47;PV4=1,5.6e-21,1,1 PL:GT:GQ 85,0,121:0/1:88
-chr16 21980241 . C T 16.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ 48,9,0:1/1:63
-chr16 23275383 . C G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr16 27546495 . G T 25 . DP=35;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=43 PL:GT:GQ 57,9,0:1/1:63
-chr16 27700399 . A T 17.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=17 PL:GT:GQ 50,12,0:1/1:72
-chr16 28021935 . A G 18.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 51,15,0:1/1:75
-chr16 29070016 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr16 29478618 . C T 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr16 29718140 . C T 46.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ 79,15,0:1/1:75
-chr16 30700759 . T C 17.1 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,14;MQ=14 PL:GT:GQ 50,42,0:1/1:99
-chr16 35139103 . A G 46.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=37 PL:GT:GQ 79,12,0:1/1:72
-chr16 35473348 . G A 3.83 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 34,12,0:1/1:72
-chr16 36213667 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr16 36705528 . G A 14.4 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=32 PL:GT:GQ 47,15,0:1/1:75
-chr16 43831353 . C T 69.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=42 PL:GT:GQ 102,12,0:1/1:72
-chr16 44715166 . A C 25 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=32 PL:GT:GQ 58,24,0:1/1:96
-chr16 44957661 . T C 7.03 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=18 PL:GT:GQ 39,21,0:1/1:84
-chr16 44958698 . C T 42.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=49 PL:GT:GQ 75,15,0:1/1:75
-chr16 44959163 . T C 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr16 45167959 . C T 4.45 . DP=16;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=24 PL:GT:GQ 35,12,0:1/1:72
-chr16 50254956 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr16 52383122 . A C 46.5 . DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=42 PL:GT:GQ 79,12,0:1/1:72
-chr16 55978159 . C T 10.7 . DP=20;AF1=0.5336;CI95=0.5,1;DP4=2,0,5,0;MQ=35;PV4=1,0.038,1,0.059 PL:GT:GQ 40,0,9:0/1:12
-chr16 61358878 . T A 15.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ 47,6,0:1/1:49
-chr16 61392487 . G A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr16 61621603 . G T 6.59 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=22 PL:GT:GQ 38,12,0:1/1:72
-chr16 69120890 . G C 51.3 . DP=36;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=42 PL:GT:GQ 84,15,0:1/1:75
-chr16 70778219 . A G 21.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=39 PL:GT:GQ 53,6,0:1/1:49
-chr16 71899519 . T C 40 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=33 PL:GT:GQ 73,33,0:1/1:99
-chr16 72079251 . A G 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr16 72093003 . G C 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr16 72672428 . A G 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr16 72864515 . A G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr16 72890560 . G A 47.1 . DP=10;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,7;MQ=49;PV4=1,0.0019,0.0033,1 PL:GT:GQ 77,0,16:0/1:19
-chr16 73048929 . A G 6.29 . DP=4;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=27;PV4=1,1,1,0.33 PL:GT:GQ 34,1,0:1/1:23
-chr16 73177179 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr16 73191468 . C T 69.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=40 PL:GT:GQ 102,12,0:1/1:72
-chr16 73367439 . A C 7.41 . DP=36;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,13;MQ=26;PV4=1,1,0.027,1 PL:GT:GQ 37,4,0:1/1:45
-chr16 74259316 . C T 89.5 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr16 75271450 . C G 6.99 . DP=15;AF1=0.5015;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=44;PV4=1,0.065,0.31,1 PL:GT:GQ 36,0,22:0/1:25
-chr16 76199870 . G A 26 . DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,6,0;MQ=47;PV4=1,1.2e-06,0.32,1 PL:GT:GQ 56,0,141:0/1:59
-chr16 77723692 . A G 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr17 165875 . G A 40.8 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42 PL:GT:GQ 72,6,0:1/1:49
-chr17 1443809 . C G 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr17 1618253 . C T 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=39 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr17 2815309 . T G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr17 3537486 . T G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr17 3734367 . C A 23.5 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=36 PL:GT:GQ 56,12,0:1/1:72
-chr17 5634764 . T C 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr17 6408090 . C G 3.54 . DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,2,0;MQ=40;PV4=1,1,0.36,1 PL:GT:GQ 31,0,66:0/1:34
-chr17 7089723 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr17 8731503 . G C 11.1 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 42,6,0:1/1:49
-chr17 9282935 . T C,G 24.5 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=40 PL:GT:GQ 57,12,61,0,3,61:1/1:72
-chr17 17284831 . T C 29 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ 61,9,0:1/1:63
-chr17 18439515 . G A 4.11 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=25 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
-chr17 18602146 . C T 4.76 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=16 PL:GT:GQ 36,33,0:1/1:99
-chr17 19427888 . C T 57 . DP=104;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=45,0,29,0;MQ=39;PV4=1,2.2e-12,1,1 PL:GT:GQ 87,0,131:0/1:90
-chr17 19604159 . T C 9.31 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr17 19610366 . C T 13 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr17 20484706 . C G 51 . DP=35;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,11,0,21;MQ=21;PV4=1,0.39,0.49,1 PL:GT:GQ 81,0,36:0/1:39
-chr17 20555720 . A G 26.3 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=28 PL:GT:GQ 59,15,0:1/1:75
-chr17 24328984 . A C 15.4 . DP=34;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=25 PL:GT:GQ 48,15,0:1/1:75
-chr17 26237090 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr17 28394766 . C A 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr17 31218277 . A G 3.62 . DP=38;AF1=0.5161;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=38;PV4=1,0.26,1,1 PL:GT:GQ 31,0,12:0/1:15
-chr17 31254021 . C T 15.1 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=35 PL:GT:GQ 47,9,0:1/1:63
-chr17 32516798 . G A 37.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 69,6,0:1/1:49
-chr17 32600253 . A G 16.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ 49,12,0:1/1:72
-chr17 34255214 . G C 19.2 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=21 PL:GT:GQ 52,18,0:1/1:90
-chr17 34365900 . T C 93.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=38 PL:GT:GQ 126,18,0:1/1:90
-chr17 35380386 . A T 6.79 . DP=44;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr17 41993344 . C T 64 . DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,41;MQ=16 PL:GT:GQ 97,123,0:1/1:99
-chr17 42128201 . A G 4.13 . DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=52;PV4=1,0.0041,1,1 PL:GT:GQ 32,0,62:0/1:35
-chr17 42984490 . C A 56 . DP=33;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,12,0;MQ=42;PV4=1,0.004,1,1 PL:GT:GQ 86,0,34:0/1:37
-chr17 43419457 . G A 99 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,14;MQ=45 PL:GT:GQ 185,42,0:1/1:99
-chr17 43421225 . A G 65.1 . DP=31;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,17;MQ=43;PV4=1,0.004,1,1 PL:GT:GQ 98,18,0:1/1:90
-chr17 45206897 . G A 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=47 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr17 45381302 . T C 18.6 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr17 45530812 . C A 3.54 . DP=6;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=40;PV4=1,1,0.37,1 PL:GT:GQ 31,0,58:0/1:34
-chr17 50242633 . G A 44 . DP=42;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,13;MQ=32;PV4=1,0.084,0.14,1 PL:GT:GQ 74,0,154:0/1:77
-chr17 51275317 . G A 14.9 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr17 52325530 . C T 29 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,18;MQ=24 PL:GT:GQ 62,54,0:1/1:99
-chr17 52411748 . T G 18.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr17 53190746 . C G 62.1 . DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=40 PL:GT:GQ 95,18,0:1/1:90
-chr17 58289916 . T C 18.2 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=22 PL:GT:GQ 51,18,0:1/1:90
-chr17 59796875 . C T 42 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=35 PL:GT:GQ 74,9,0:1/1:63
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.0
-##ApplyRecalibration="analysis_type=ApplyRecalibration input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/combined.phase1.chr20.raw.indels.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false recal_file=/humgen/gsa-scr1/delangel/VQSRIndels/data/trainMills75_truthMills75_p15_12_12_pctb0.05_std12.0_mG8_QD_FS_HS_RP_IC.recal tranches_file=/humgen/gsa-scr1/delangel/VQSRIndels/data/trainMills75_truthMills75_p15_12_12_pctb0.05_std12.0_mG8_QD_FS_HS_RP_IC.tranches out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub ts_filter_level=93.0 ignore_filter=null mode=INDEL"
-##CombineVariants="analysis_type=CombineVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20:41000001-42000000] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AFR/AFR.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/ASN/ASN.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AMR/AMR.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/EUR/EUR.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AFR.admix/AFR.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/ASN.admix/ASN.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AMR.admix/AMR.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/EUR.admix/EUR.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub genotypemergeoption=PRIORITIZE filteredrecordsmergetype=KEEP_IF_ANY_UNFILTERED rod_priority_list=AFR.admix,AMR.admix,EUR.admix,ASN.admix,AFR,AMR,EUR,ASN printComplexMerges=false filteredAreUncalled=false minimalVCF=false setKey=set assumeIdenticalSamples=false minimumN=1 masterMerge=false mergeInfoWithMaxAC=true"
-##FILTER=<ID=BothStrands,Description="Variant not seen on both strands">
-##FILTER=<ID=HARD_TO_VALIDATE,Description="MQ0 >= 4 && (MQ0 / (1.0 * DP)) > 0.1">
-##FILTER=<ID=HP10,Description="Variant occurs in long homopolymer run (>10)">
-##FILTER=<ID=HaplotypeScore,Description="HaplotypeScore>20.0">
-##FILTER=<ID=HighCoverage,Description="Coverage at variant site is > 7500">
-##FILTER=<ID=HomopolymerRun,Description="HRun>=15">
-##FILTER=<ID=LongRepeat,Description="Variant occurs in long tandem repeat (as defined by 1kg phase one filters)">
-##FILTER=<ID=LowQual,Description="QUAL<30.0">
-##FILTER=<ID=PP20,Description="Variant posterior phred is < 20">
-##FILTER=<ID=QualByDepth,Description="QD<1.0">
-##FILTER=<ID=StrandBias,Description="SB>=-1.0">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche93.00to94.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 3.9628 <= x < 4.1824">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche94.00to95.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 3.7129 <= x < 3.9628">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche95.00to96.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 3.3717 <= x < 3.7129">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche96.00to97.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 2.8762 <= x < 3.3717">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche97.00to98.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 2.2618 <= x < 2.8762">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche98.00to99.00+,Description="Truth sensitivity tranche level at VQS Lod < 1.2907">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche98.00to99.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 1.2907 <= x < 2.2618">
-##FORMAT=<ID=AA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele observations">
-##FORMAT=<ID=AD,Number=.,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed">
-##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read Depth (only filtered reads used for calling)">
-##FORMAT=<ID=FT,Number=1,Type=String,Description="Sample Genotype Filter">
-##FORMAT=<ID=GL,Number=3,Type=Integer,Description="Genotype Likelihood, log-scaled likeilhoods of the data given the called genotype for each possible genotype generated from the reference and alternate alleles given the sample ploidy">
-##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Float,Description="Genotype Quality">
-##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
-##FORMAT=<ID=HQ,Number=.,Type=Integer,Description="Haplotype Quality">
-##FORMAT=<ID=PL,Number=3,Type=Float,Description="Normalized, Phred-scaled likelihoods for AA,AB,BB genotypes where A=ref and B=alt; not applicable if site is not biallelic">
-##FORMAT=<ID=RA,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele observations">
-##FORMAT=<ID=SA,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
-##FORMAT=<ID=SP,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled strand bias P-value">
-##FORMAT=<ID=SR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
-##INFO=<ID=AA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele observations">
-##INFO=<ID=AB,Number=1,Type=Float,Description="Allele balance at heterozygous sites: a number between 0 and 1 representing the ratio of reads showing the reference allele to all reads, considering only reads from individuals called as heterozygous">
-##INFO=<ID=ABA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele balance count: the number of sequence reads from apparent heterozygotes supporting the alternate allele">
-##INFO=<ID=ABP,Number=1,Type=Float,Description="Allele balance probability at heterozygous sites: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between ABR and ABA given E(ABR/ABA) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
-##INFO=<ID=ABR,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele balance count: the number of sequence reads from apparent heterozygotes supporting the reference allele">
-##INFO=<ID=AC,Number=.,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
-##INFO=<ID=AF,Number=.,Type=Float,Description="Allele Frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
-##INFO=<ID=AF1,Number=1,Type=Float,Description="Max-likelihood estimate of the site allele frequency of the first ALT allele">
-##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
-##INFO=<ID=BL,Number=1,Type=Integer,Description="Base Pairs Left: number of base pairs in reads supporting the alternate to the left (5') of the alternate allele">
-##INFO=<ID=BR,Number=1,Type=Integer,Description="Base Pairs Right: number of base pairs in reads supporting the alternate to the right (3') of the alternate allele">
-##INFO=<ID=BVAR,Number=0,Type=Flag,Description="The best genotype combination in the posterior is variant (non homozygous).">
-##INFO=<ID=BaseQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt Vs. Ref base qualities">
-##INFO=<ID=CI95,Number=2,Type=Float,Description="Equal-tail Bayesian credible interval of the site allele frequency at the 95% level">
-##INFO=<ID=CpG,Number=0,Type=Flag,Description="CpG site (either CpG, TpG or CpA)">
-##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP Membership">
-##INFO=<ID=DEL,Number=0,Type=Flag,Description="deletion allele">
-##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Filtered Depth">
-##INFO=<ID=DP4,Number=4,Type=Integer,Description="# high-quality ref-forward bases, ref-reverse, alt-forward and alt-reverse bases">
-##INFO=<ID=DS,Number=0,Type=Flag,Description="Were any of the samples downsampled?">
-##INFO=<ID=Dels,Number=1,Type=Float,Description="Fraction of Reads Containing Spanning Deletions">
-##INFO=<ID=EL,Number=1,Type=Integer,Description="Allele End Left: number of observations of the alternate where the alternate occurs in the left end of the read">
-##INFO=<ID=EPP,Number=1,Type=Float,Description="End Placement Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between EL and ER given E(EL/ER) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
-##INFO=<ID=ER,Number=1,Type=Integer,Description="Allele End Right: number of observations of the alternate where the alternate occurs in the right end of the read">
-##INFO=<ID=FQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred probability that sample chromosomes are not all the same">
-##INFO=<ID=FR,Number=0,Type=Float,Description="Estimated population frequency">
-##INFO=<ID=FS,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled p-value using Fisher's exact test to detect strand bias">
-##INFO=<ID=HETAR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of individuals heterozygous alternate / reference">
-##INFO=<ID=HOMA,Number=1,Type=Integer,Description="Number of individuals homozygous for the alternate">
-##INFO=<ID=HOMR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of individuals homozygous for the reference">
-##INFO=<ID=HP,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolmer run length">
-##INFO=<ID=HPLen,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer length">
-##INFO=<ID=HR,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length">
-##INFO=<ID=HRun,Number=1,Type=Integer,Description="Largest Contiguous Homopolymer Run of Variant Allele In Either Direction">
-##INFO=<ID=HU,Number=1,Type=String,Description="Homopolymer run unit (stranded)">
-##INFO=<ID=HaplotypeScore,Number=1,Type=Float,Description="Consistency of the site with at most two segregating haplotypes">
-##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Not provided in original VCF header">
-##INFO=<ID=INS,Number=0,Type=Flag,Description="insertion allele">
-##INFO=<ID=InbreedingCoeff,Number=1,Type=Float,Description="Inbreeding coefficient as estimated from the genotype likelihoods per-sample when compared against the Hardy-Weinberg expectation">
-##INFO=<ID=IndelType,Number=1,Type=String,Description="Indel type description">
-##INFO=<ID=KGPilot123,Number=0,Type=Flag,Description="1000 Genome discovery all pilots 2010(1,2,3)">
-##INFO=<ID=LEN,Number=1,Type=Integer,Description="allele length">
-##INFO=<ID=LRB,Number=1,Type=Float,Description="((max(BR, BL) / (BR + BL)) - 0.5) * 2 : The proportion of base pairs in reads on one side of the alternate allele relative to total bases, scaled from [0.5,1] to [0,1]">
-##INFO=<ID=LRBP,Number=1,Type=Float,Description="Left-Right Balance Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between BL and BR given E(BR/BL) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
-##INFO=<ID=MNP,Number=0,Type=Flag,Description="MNP allele">
-##INFO=<ID=MQ,Number=1,Type=Float,Description="RMS Mapping Quality">
-##INFO=<ID=MQ0,Number=1,Type=Integer,Description="Total Mapping Quality Zero Reads">
-##INFO=<ID=MQ0Fraction,Number=1,Type=Float,Description="Fraction of Mapping Quality Zero Reads">
-##INFO=<ID=MQM,Number=1,Type=Float,Description="Mean mapping quality of observed alternate alleles">
-##INFO=<ID=MQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read mapping qualities">
-##INFO=<ID=NF,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of forward reads containing this variant">
-##INFO=<ID=NR,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of reads containing this variant">
-##INFO=<ID=NS,Number=1,Type=Integer,Description="Number of samples with data">
-##INFO=<ID=PP,Number=0,Type=Float,Description="Posterior probability (phred scaled) that this variant segregates">
-##INFO=<ID=PV4,Number=4,Type=Float,Description="P-values for strand bias, baseQ bias, mapQ bias and tail distance bias">
-##INFO=<ID=QD,Number=1,Type=Float,Description="Variant Confidence/Quality by Depth">
-##INFO=<ID=RA,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele observations">
-##INFO=<ID=RL,Number=1,Type=Integer,Description="Reads Placed Left: number of reads supporting the alternate balanced to the left (5') of the alternate allele">
-##INFO=<ID=RPP,Number=1,Type=Float,Description="Read Placement Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between RPL and RPR given E(RPL/RPR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
-##INFO=<ID=RR,Number=1,Type=Integer,Description="Reads Placed Right: number of reads supporting the alternate balanced to the right (3') of the alternate allele">
-##INFO=<ID=RUN,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length: the number of consecutive nucleotides in the reference genome matching the alternate allele prior to the current position">
-##INFO=<ID=ReadPosRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read position bias">
-##INFO=<ID=SAB,Number=1,Type=Float,Description="Strand bias for the alternate allele: SAF / ( SAF + SAR )">
-##INFO=<ID=SAF,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations on the forward strand">
-##INFO=<ID=SAP,Number=1,Type=Float,Description="Strand balance probability for the alternate allele: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between SAF and SAR given E(SAF/SAR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
-##INFO=<ID=SAR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations on the reverse strand">
-##INFO=<ID=SB,Number=1,Type=Float,Description="Strand Bias">
-##INFO=<ID=SC,Number=1,Type=String,Description="Genomic sequence 10 bases either side of variant position">
-##INFO=<ID=SNP,Number=0,Type=Flag,Description="SNP allele">
-##INFO=<ID=SRB,Number=1,Type=Float,Description="Strand bias for the reference allele: SRF / ( SRF + SRR )">
-##INFO=<ID=SRF,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations on the forward strand">
-##INFO=<ID=SRP,Number=1,Type=Float,Description="Strand balance probability for the reference allele: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between SRF and SRR given E(SRF/SRR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
-##INFO=<ID=SRR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations on the reverse strand">
-##INFO=<ID=TC,Number=0,Type=Integer,Description="Total coverage">
-##INFO=<ID=TR,Number=1,Type=Integer,Description="Tandem repeat run length (bp)">
-##INFO=<ID=TS,Number=0,Type=Flag,Description="transition SNP">
-##INFO=<ID=TU,Number=1,Type=String,Description="tandem repeat run unit (stranded)">
-##INFO=<ID=TV,Number=0,Type=Flag,Description="transversion SNP">
-##INFO=<ID=VLD,Number=0,Type=Flag,Description="Is Validated. This bit is set if the snp has 2+ minor allele count based on frequency or genotype data.">
-##INFO=<ID=VQSLOD,Number=1,Type=Float,Description="Log odds ratio of being a true variant versus being false under the trained gaussian mixture model">
-##INFO=<ID=dbSNP,Number=1,Type=Integer,Description="First SNP Build for RS">
-##INFO=<ID=set,Number=1,Type=String,Description="Source VCF for the merged record in CombineVariants">
-##LeftAlignVariants="analysis_type=LeftAlignVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20] excludeIntervals=null reference_sequence=/seq/references/Homo_sapiens_assembly19/v1/Homo_sapiens_assembly19.fasta rodBind=[/humgen/gsa-scr1/ebanks/ALL.chr20.Oxford.20110407.indels.genotypes.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub"
-##SelectVariants="analysis_type=SelectVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20] excludeIntervals=null reference_sequence=/seq/references/Homo_sapiens_assembly19/v1/Homo_sapiens_assembly19.fasta rodBind=[/humgen/gsa-scr1/delangel/officialCalls/20110201_chr20_phase1_indels/dindel/20110208.chr20.dindel2.ALL.sites.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sample=null select_expressions=[] excludeNonVariants=false excludeFiltered=false discordance= concordance= family_structure= mendelianViolation=false mendelianViolationQualThreshold=0.0 select_random_number=0 select_random_fraction=0.0 selectSNPs=false selectIndels=true"
-##UnifiedGenotyper="analysis_type=UnifiedGenotyper input_file=[/broad/shptmp/delangel/calls/chr20/CHB.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/CHS.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/CLM.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/JPT.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/MXL.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/PUR.phase1.chr20.42.cleaned.bam] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20:41000001-42000000] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/humgen/gsa-scr1/delangel/otherIndelCallerAnalysis/ALL.indels.combined.chr20.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/GATK/data/dbsnp_132_b37.leftAligned.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=50 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=8 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false genotype_likelihoods_model=INDEL p_nonref_model=EXACT heterozygosity=0.0010 pcr_error_rate=1.0E-4 genotyping_mode=GENOTYPE_GIVEN_ALLELES output_mode=EMIT_ALL_SITES standard_min_confidence_threshold_for_calling=4.0 standard_min_confidence_threshold_for_emitting=4.0 noSLOD=false assume_single_sample_reads=null abort_at_too_much_coverage=-1 min_base_quality_score=17 min_mapping_quality_score=20 max_deletion_fraction=0.05 min_indel_count_for_genotyping=5 indel_heterozygosity=1.25E-4 indelGapContinuationPenalty=10.0 indelGapOpenPenalty=45.0 indelHaplotypeSize=80 doContextDependentGapPenalties=true getGapPenaltiesFromData=false indel_recal_file=indel.recal_data.csv indelDebug=false dovit=false GSA_PRODUCTION_ONLY=false exactCalculation=LINEAR_EXPERIMENTAL ignoreSNPAlleles=true output_all_callable_bases=false genotype=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub debug_file=null metrics_file=null annotation=[MappingQualityZeroFraction]"
-##VariantAnnotator="analysis_type=VariantAnnotator input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[./ALL.chr20.vqsr_2of5_union_sites_for_validation_boosted.vcf] rodToIntervalTrackName=variant BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sampleName=null annotation=[IndelType] group=[] expression=[] useAllAnnotations=false list=false assume_single_sample_reads=null vcfContainsOnlyIndels=false"
-##VariantFiltration="analysis_type=VariantFiltration input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[/humgen/1kg/processing/pipeline_test_bams/chr22_chunked.hg19.intervals] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/broad/shptmp/rpoplin/ALL.phase1.chr22.raw.indels.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false enable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null quiet_output_mode=false debug_mode=false help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub filterExpression=[MQ0 >= 4 && (MQ0 / (1.0 * DP)) > 0.1, QUAL<30.0, SB>=-1.0, QD<1.0, HRun>=15, HaplotypeScore>20.0] filterName=[HARD_TO_VALIDATE, LowQual, StrandBias, QualByDepth, HomopolymerRun, HaplotypeScore] genotypeFilterExpression=[] genotypeFilterName=[] clusterSize=3 clusterWindowSize=0 maskName=Mask missingValuesInExpressionsShouldEvaluateAsFailing=false"
-##commandline="/share/software/freebayes/bin/freebayes --stdin --min-alternate-count 2 --genotype-combo-step-max 20 --genotype-variant-threshold 4 --no-marginals --pvar 0.0001 --indels --mnps --no-filters --binomial-obs-priors --allele-balance-priors --region 20:0..100000 --vcf /d1/data/1000G/20101123/populations/finalised.phase1/integrated/including454/wg/ALL/Pipeline/none//freebayes/freebayes.20:0-100000.baq.20110328.vcf --fasta-reference /d2/data/references/build_37/human_reference_v37.fa"
-##fileDate=2011-03-28
-##filedate=2011-02-08
-##filter="( SNP | MNP ) & ( MQM > 65 | QUAL > 1 ) & ABP < 30 & AB < 0.9 | ( INS | DEL ) & QUAL > 500"
-##phasing=none
-##platypusOptions={'bamFiles': ['/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06984', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06985', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06986', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06989', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06994', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07000', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07037', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07048', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07051', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07056', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07346', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07347', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07357', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA10847', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA10851', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11829', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11830', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11831', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11832', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11843', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11881', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11892', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11893', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11894', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11918', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11919', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11920', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11930', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11931', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11932', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11933', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11992', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11993', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11994', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11995', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12003', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12004', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12005', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12006', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12043', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12044', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12045', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12046', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12058', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12144', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12154', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12155', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12156', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12234', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12249', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12272', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12273', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12275', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12282', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12283', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12286', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12287', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12340', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12341', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12342', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12347', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12348', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12383', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12399', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12400', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12413', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12414', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12489', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12546', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12716', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12717', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12718', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12748', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12749', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12750', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12751', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12761', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12763', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12775', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12776', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12777', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12778', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12813', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12827', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12828', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12829', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12830', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12842', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12843', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12889', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12890', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18486', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18487', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18488', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18489', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18498', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18499', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18501', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18502', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18504', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18505', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18507', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18508', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18510', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18511', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18516', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18517', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18519', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18520', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18522', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18523', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18526', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18530', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18532', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18533', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18534', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18535', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18536', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18537', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18538', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18539', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18541', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18542', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18543', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18544', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18545', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18546', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18547', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18548', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18549', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18550', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18552', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18553', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18555', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18557', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18558', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18559', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18560', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18561', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18562', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18563', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18564', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18565', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18566', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18567', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18570', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18571', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18572', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18573', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18574', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18576', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18577', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18579', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18582', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18592', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18593', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18595', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18596', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18597', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18599', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18602', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18603', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18605', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18606', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18608', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18609', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18610', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18611', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18612', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18613', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18614', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18615', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18616', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18617', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18618', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18619', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18620', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18621', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18622', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18623', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18624', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18625', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18626', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18627', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18628', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18630', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18631', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18632', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18633', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18634', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18635', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18636', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18637', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18638', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18853', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18856', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18858', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18861', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18867', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18868', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18870', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18871', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18873', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18874', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18907', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18908', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18909', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18910', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18912', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18916', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18917', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18923', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18924', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18933', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18934', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18940', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18941', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18942', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18943', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18944', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18945', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18947', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18948', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18949', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18950', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18951', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18952', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18953', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18956', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18959', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18960', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18961', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18963', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18964', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18965', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18967', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18968', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18971', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18972', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18973', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18974', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18975', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18976', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18977', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18980', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18981', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18982', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18983', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18984', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18985', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18986', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18987', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18988', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18989', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18990', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18991', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18999', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19000', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19002', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19003', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19004', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19005', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19007', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19009', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19010', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19012', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19054', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19055', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19056', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19057', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19058', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19059', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19060', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19062', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19063', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19064', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19065', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19066', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19067', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19068', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19070', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19072', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19074', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19075', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19076', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19077', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19078', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19079', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19080', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19081', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19082', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19083', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19084', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19085', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19087', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19088', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19092', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19093', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19098', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19099', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19102', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19107', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19108', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19114', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19116', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19119', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19129', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19130', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19131', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19137', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19138', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19144', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19147', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19152', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19153', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19159', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19160', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19171', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19172', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19189', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19190', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19197', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19198', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19200', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19201', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19204', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19207', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19209', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19210', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19213', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19223', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19225', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19235', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19236', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19247', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19248', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19256', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19257', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19311', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19312', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19313', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19315', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19316', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19317', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19318', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19319', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19321', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19324', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19327', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19328', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19331', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19332', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19334', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19338', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19346', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19347', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19350', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19355', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19359', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19360', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19371', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19372', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19373', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19374', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19375', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19376', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19377', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19379', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19380', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19381', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19382', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19383', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19384', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19385', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19390', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19391', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19393', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19394', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19395', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19396', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19397', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19398', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19399', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19401', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19403', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19404', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19428', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19429', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19430', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19431', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19434', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19435', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19436', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19437', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19438', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19439', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19440', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19443', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19444', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19445', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19446', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19448', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19449', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19451', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19452', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19453', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19455', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19456', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19457', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19461', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19462', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19463', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19466', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19467', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19468', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19469', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19470', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19471', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19472', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19473', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19474', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19625', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19648', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19649', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19651', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19652', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19654', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19655', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19657', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19658', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19660', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19661', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19663', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19664', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19670', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19675', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19676', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19678', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19679', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19681', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19682', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19684', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19685', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19700', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19701', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19703', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19704', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19707', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19711', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19712', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19713', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19716', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19717', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19719', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19720', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19722', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19723', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19725', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19726', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19728', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19729', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19731', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19732', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19746', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19747', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19749', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19750', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19755', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19756', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19758', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19759', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19761', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19762', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19770', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19771', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19773', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19774', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19776', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19777', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19779', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19780', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19782', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19783', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19785', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19786', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19788', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19789', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19818', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19819', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19834', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19835', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19900', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19901', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19904', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19908', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19909', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19914', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19916', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19917', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19920', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19921', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19982', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19985', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20126', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20127', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20276', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20278', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20281', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20282', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20287', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20289', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20291', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20294', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20296', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20299', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20314', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20317', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20322', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20332', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20334', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20336', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20340', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20341', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20342', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20344', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20346', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20348', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20356', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20502', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20503', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20504', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20505', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20506', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20507', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20508', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20509', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20510', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20512', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20513', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20514', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20515', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20516', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20517', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20518', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20519', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20520', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20521', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20522', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20524', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20525', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20526', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20527', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20528', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20529', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20530', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20531', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20532', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20533', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20534', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20535', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20536', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20537', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20538', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20539', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20540', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20541', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20542', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20543', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20544', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20581', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20582', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20585', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20586', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20588', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20589', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20752', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20753', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20754', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20755', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20756', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20757', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20758', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20759', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20760', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20761', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20765', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20766', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20768', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20769', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20770', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20771', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20772', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20773', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20774', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20775', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20778', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20783', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20785', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20786', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20787', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20790', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20792', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20795', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20796', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20797', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20798', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20799', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20800', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20801', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20802', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20803', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20804', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20805', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20806', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20807', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20808', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20809', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20810', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20811', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20812', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20813', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20814', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20815', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20816', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20818', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20819', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20826', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20828', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00096', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00098', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00100', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00103', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00106', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00108', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00111', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00112', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00114', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00115', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00116', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00117', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00118', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00119', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00120', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00122', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00123', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00124', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00125', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00126', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00127', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00131', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00133', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00136', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00137', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00138', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00139', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00140', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00141', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00142', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00143', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00144', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00145', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00146', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00147', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00148', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00149', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00150', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00151', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00152', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00153', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00154', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00155', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00156', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00157', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00158', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00159', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00160', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00171', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00173', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00174', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00176', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00177', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00178', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00179', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00180', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00181', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00182', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00183', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00185', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00186', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00187', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00188', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00189', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00190', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00231', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00232', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00233', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00236', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00237', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00239', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00242', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00243', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00244', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00245', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00246', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00247', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00249', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00250', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00251', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00252', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00253', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00254', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00256', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00257', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00258', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00259', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00260', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00261', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00262', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00263', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00264', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00265', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00266', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00267', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00268', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00269', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00270', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00271', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00272', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00273', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00274', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00275', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00276', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00277', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00278', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00280', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00281', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00282', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00284', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00285', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00306', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00308', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00309', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00310', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00311', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00312', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00313', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00315', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00318', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00319', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00320', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00321', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00323', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00324', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00325', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00326', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00327', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00328', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00329', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00330', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00331', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00334', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00335', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00336', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00337', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00338', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00339', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00342', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00343', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00344', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00345', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00346', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00353', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00357', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00361', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00366', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00367', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00368', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00369', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00372', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00373', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00375', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00377', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00380', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00403', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00404', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00418', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00419', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00421', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00422', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00427', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00428', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00436', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00437', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00442', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00443', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00448', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00449', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00463', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00464', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00472', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00473', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00475', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00476', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00478', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00479', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00500', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00501', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00512', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00513', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00524', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00525', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00530', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00531', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00533', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00534', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00536', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00537', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00542', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00543', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00551', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00553', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00554', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00556', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00557', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00559', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00560', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00565', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00566', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00577', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00578', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00580', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00581', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00583', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00584', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00589', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00590', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00592', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00593', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00595', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00596', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00607', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00608', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00610', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00611', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00613', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00614', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00619', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00620', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00625', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00626', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00628', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00629', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00634', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00635', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00637', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00638', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00640', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00641', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00650', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00651', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00653', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00654', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00656', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00657', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00662', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00663', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00671', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00672', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00683', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00684', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00689', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00690', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00692', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00693', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00698', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00699', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00701', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00702', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00704', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00705', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00707', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00708', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00731', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00732', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00734', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00736', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00737', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00739', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00740', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01047', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01048', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01051', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01052', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01055', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01060', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01061', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01066', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01067', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01069', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01070', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01072', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01073', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01075', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01079', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01080', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01082', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01083', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01094', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01095', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01097', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01098', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01101', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01102', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01107', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01108', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01110', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01111', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01112', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01113', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01124', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01125', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01133', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01134', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01136', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01137', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01140', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01148', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01149', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01167', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01168', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01170', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01171', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01173', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01174', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01176', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01177', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01182', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01183', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01187', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01188', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01190', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01191', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01197', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01198', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01204', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01250', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01251', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01253', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01254', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01334', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01342', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01350', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01351', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01353', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01354', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01356', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01357', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01359', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01360', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01365', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01366', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01374', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01375', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01377', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01378', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01383', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01384', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01389', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01390', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01437', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01440', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01441', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01455', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01456', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01461', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01462', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01464', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01465', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01488', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01489', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01491', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01492', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01494', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01495', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01497', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01498', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01515', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01516', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01518', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01519', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01521', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01522', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01550', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01551'], 'minReads': 2, 'refFile': '/scratch/rimmer/Genomes/human_g1k_v37_ebv.fa', 'maxHaplotypes': 64, 'maxSize': 100, 'ploidy': 2, 'maxRegionSize': 10000, 'nCPU': 1, 'minFlank': 3, 'logFileName': 'LogsAllPhaseOne/ThousandGenomesPhaseOneCalls_20:1-100001.log', 'regions': ['20:1-100001'], 'maxVariants': 6, 'genIndels': 1, 'labels': None, 'dataType': 'population', 'minMapQual': 20, 'rlen': 100, 'nInd': 994, 'getVariantsFromBAMs': 1, 'genSNPs': 1, 'minReadQual': 20, 'maxCoverage': 1000000.0, 'verbosity': 2, 'sourceFile': None, 'callOnlyIndels': 1, 'output': 'VariantCallsAllPhaseOne/ThousandGenomesPhaseOneCalls_20:1-100001.vcf'}
-##reference=/lustre/scratch105/projects/g1k/ref/main_project/human_g1k_v37.fasta
-##source=Dindel2
-##source=SelectVariants
-##source_20110031.1=/nfs/users/nfs_p/pd3/cvs/vcftools/perl/vcf-annotate -d /nfs/users/nfs_p/pd3/sandbox/hapmap/dbSNP-b132/non-1kg-vld.desc -a /nfs/users/nfs_p/pd3/sandbox/hapmap/dbSNP-b132/non-1kg-vld.tab.gz -c CHROM,FROM,INFO/VLD,INFO/KGPilot123,INFO/dbSNP
-##vcfCTools=filter
-##vcfCtools=merge freebayes.20:0-100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:100000-200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:200000-300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:300000-400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:400000-500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:500000-600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:600000-700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:700000-800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:800000-900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:900000-1000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1000000-1100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1100000-1200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1200000-1300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1300000-1400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1400000-1500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1500000-1600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1600000-1700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1700000-1800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1800000-1900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1900000-2000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2000000-2100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2100000-2200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2200000-2300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2300000-2400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2400000-2500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2500000-2600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2600000-2700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2700000-2800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2800000-2900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2900000-3000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3000000-3100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3100000-3200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3200000-3300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3300000-3400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3400000-3500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3500000-3600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3600000-3700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3700000-3800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3800000-3900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3900000-4000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4000000-4100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4100000-4200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4200000-4300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4300000-4400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4400000-4500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4500000-4600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4600000-4700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4700000-4800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4800000-4900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4900000-5000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5000000-5100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5100000-5200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5200000-5300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5300000-5400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5400000-5500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5500000-5600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5600000-5700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5700000-5800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5800000-5900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5900000-6000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6000000-6100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6100000-6200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6200000-6300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6300000-6400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6400000-6500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6500000-6600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6600000-6700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6700000-6800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6800000-6900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6900000-7000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7000000-7100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7100000-7200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7200000-7300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7300000-7400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7400000-7500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7500000-7600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7600000-7700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7700000-7800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7800000-7900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7900000-8000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8000000-8100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8100000-8200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8200000-8300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8300000-8400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8400000-8500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8500000-8600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8600000-8700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8700000-8800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8800000-8900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8900000-9000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9000000-9100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9100000-9200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9200000-9300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9300000-9400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9400000-9500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9500000-9600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9600000-9700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9700000-9800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9800000-9900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9900000-10000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10000000-10100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10100000-10200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10200000-10300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10300000-10400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10400000-10500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10500000-10600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10600000-10700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10700000-10800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10800000-10900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10900000-11000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11000000-11100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11100000-11200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11200000-11300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11300000-11400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11400000-11500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11500000-11600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11600000-11700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11700000-11800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11800000-11900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11900000-12000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12000000-12100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12100000-12200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12200000-12300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12300000-12400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12400000-12500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12500000-12600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12600000-12700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12700000-12800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12800000-12900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12900000-13000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13000000-13100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13100000-13200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13200000-13300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13300000-13400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13400000-13500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13500000-13600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13600000-13700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13700000-13800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13800000-13900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13900000-14000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14000000-14100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14100000-14200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14200000-14300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14300000-14400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14400000-14500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14500000-14600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14600000-14700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14700000-14800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14800000-14900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14900000-15000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15000000-15100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15100000-15200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15200000-15300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15300000-15400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15400000-15500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15500000-15600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15600000-15700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15700000-15800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15800000-15900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15900000-16000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16000000-16100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16100000-16200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16200000-16300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16300000-16400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16400000-16500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16500000-16600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16600000-16700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16700000-16800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16800000-16900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16900000-17000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17000000-17100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17100000-17200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17200000-17300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17300000-17400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17400000-17500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17500000-17600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17600000-17700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17700000-17800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17800000-17900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17900000-18000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18000000-18100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18100000-18200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18200000-18300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18300000-18400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18400000-18500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18500000-18600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18600000-18700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18700000-18800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18800000-18900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18900000-19000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19000000-19100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19100000-19200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19200000-19300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19300000-19400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19400000-19500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19500000-19600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19600000-19700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19700000-19800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19800000-19900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19900000-20000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20000000-20100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20100000-20200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20200000-20300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20300000-20400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20400000-20500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20500000-20600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20600000-20700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20700000-20800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20800000-20900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20900000-21000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21000000-21100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21100000-21200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21200000-21300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21300000-21400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21400000-21500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21500000-21600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21600000-21700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21700000-21800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21800000-21900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21900000-22000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22000000-22100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22100000-22200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22200000-22300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22300000-22400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22400000-22500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22500000-22600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22600000-22700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22700000-22800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22800000-22900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22900000-23000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23000000-23100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23100000-23200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23200000-23300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23300000-23400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23400000-23500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23500000-23600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23600000-23700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23700000-23800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23800000-23900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23900000-24000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24000000-24100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24100000-24200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24200000-24300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24300000-24400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24400000-24500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24500000-24600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24600000-24700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24700000-24800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24800000-24900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24900000-25000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25000000-25100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25100000-25200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25200000-25300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25300000-25400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25400000-25500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25500000-25600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25600000-25700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25700000-25800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25800000-25900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25900000-26000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26000000-26100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26100000-26200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26200000-26300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26300000-26400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26400000-26500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26500000-26600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26600000-26700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26700000-26800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26800000-26900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26900000-27000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27000000-27100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27100000-27200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27200000-27300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27300000-27400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27400000-27500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27500000-27600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27600000-27700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27700000-27800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27800000-27900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27900000-28000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28000000-28100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28100000-28200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28200000-28300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28300000-28400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28400000-28500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28500000-28600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28600000-28700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28700000-28800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28800000-28900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28900000-29000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29000000-29100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29100000-29200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29200000-29300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29300000-29400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29400000-29500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29500000-29600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29600000-29700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29700000-29800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29800000-29900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29900000-30000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30000000-30100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30100000-30200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30200000-30300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30300000-30400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30400000-30500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30500000-30600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30600000-30700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30700000-30800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30800000-30900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30900000-31000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31000000-31100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31100000-31200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31200000-31300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31300000-31400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31400000-31500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31500000-31600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31600000-31700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31700000-31800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31800000-31900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31900000-32000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32000000-32100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32100000-32200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32200000-32300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32300000-32400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32400000-32500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32500000-32600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32600000-32700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32700000-32800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32800000-32900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32900000-33000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33000000-33100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33100000-33200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33200000-33300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33300000-33400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33400000-33500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33500000-33600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33600000-33700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33700000-33800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33800000-33900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33900000-34000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34000000-34100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34100000-34200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34200000-34300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34300000-34400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34400000-34500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34500000-34600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34600000-34700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34700000-34800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34800000-34900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34900000-35000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35000000-35100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35100000-35200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35200000-35300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35300000-35400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35400000-35500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35500000-35600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35600000-35700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35700000-35800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35800000-35900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35900000-36000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36000000-36100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36100000-36200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36200000-36300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36300000-36400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36400000-36500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36500000-36600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36600000-36700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36700000-36800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36800000-36900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36900000-37000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37000000-37100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37100000-37200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37200000-37300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37300000-37400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37400000-37500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37500000-37600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37600000-37700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37700000-37800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37800000-37900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37900000-38000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38000000-38100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38100000-38200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38200000-38300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38300000-38400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38400000-38500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38500000-38600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38600000-38700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38700000-38800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38800000-38900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38900000-39000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39000000-39100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39100000-39200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39200000-39300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39300000-39400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39400000-39500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39500000-39600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39600000-39700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39700000-39800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39800000-39900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39900000-40000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40000000-40100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40100000-40200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40200000-40300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40300000-40400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40400000-40500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40500000-40600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40600000-40700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40700000-40800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40800000-40900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40900000-41000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41000000-41100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41100000-41200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41200000-41300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41300000-41400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41400000-41500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41500000-41600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41600000-41700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41700000-41800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41800000-41900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41900000-42000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42000000-42100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42100000-42200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42200000-42300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42300000-42400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42400000-42500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42500000-42600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42600000-42700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42700000-42800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42800000-42900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42900000-43000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43000000-43100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43100000-43200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43200000-43300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43300000-43400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43400000-43500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43500000-43600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43600000-43700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43700000-43800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43800000-43900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43900000-44000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44000000-44100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44100000-44200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44200000-44300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44300000-44400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44400000-44500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44500000-44600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44600000-44700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44700000-44800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44800000-44900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44900000-45000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45000000-45100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45100000-45200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45200000-45300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45300000-45400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45400000-45500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45500000-45600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45600000-45700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45700000-45800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45800000-45900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45900000-46000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46000000-46100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46100000-46200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46200000-46300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46300000-46400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46400000-46500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46500000-46600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46600000-46700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46700000-46800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46800000-46900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46900000-47000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47000000-47100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47100000-47200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47200000-47300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47300000-47400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47400000-47500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47500000-47600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47600000-47700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47700000-47800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47800000-47900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47900000-48000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48000000-48100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48100000-48200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48200000-48300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48300000-48400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48400000-48500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48500000-48600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48600000-48700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48700000-48800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48800000-48900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48900000-49000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49000000-49100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49100000-49200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49200000-49300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49300000-49400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49400000-49500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49500000-49600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49600000-49700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49700000-49800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49800000-49900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49900000-50000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50000000-50100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50100000-50200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50200000-50300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50300000-50400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50400000-50500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50500000-50600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50600000-50700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50700000-50800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50800000-50900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50900000-51000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51000000-51100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51100000-51200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51200000-51300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51300000-51400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51400000-51500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51500000-51600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51600000-51700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51700000-51800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51800000-51900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51900000-52000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52000000-52100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52100000-52200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52200000-52300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52300000-52400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52400000-52500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52500000-52600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52600000-52700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52700000-52800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52800000-52900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52900000-53000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53000000-53100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53100000-53200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53200000-53300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53300000-53400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53400000-53500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53500000-53600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53600000-53700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53700000-53800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53800000-53900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53900000-54000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54000000-54100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54100000-54200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54200000-54300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54300000-54400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54400000-54500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54500000-54600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54600000-54700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54700000-54800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54800000-54900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54900000-55000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55000000-55100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55100000-55200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55200000-55300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55300000-55400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55400000-55500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55500000-55600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55600000-55700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55700000-55800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55800000-55900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55900000-56000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56000000-56100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56100000-56200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56200000-56300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56300000-56400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56400000-56500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56500000-56600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56600000-56700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56700000-56800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56800000-56900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56900000-57000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57000000-57100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57100000-57200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57200000-57300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57300000-57400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57400000-57500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57500000-57600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57600000-57700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57700000-57800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57800000-57900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57900000-58000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58000000-58100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58100000-58200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58200000-58300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58300000-58400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58400000-58500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58500000-58600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58600000-58700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58700000-58800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58800000-58900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58900000-59000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59000000-59100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59100000-59200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59200000-59300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59300000-59400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59400000-59500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59500000-59600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59600000-59700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59700000-59800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59800000-59900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59900000-60000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60000000-60100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60100000-60200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60200000-60300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60300000-60400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60400000-60500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60500000-60600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60600000-60700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60700000-60800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60800000-60900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60900000-61000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61000000-61100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61100000-61200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61200000-61300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61300000-61400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61400000-61500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61500000-61600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61600000-61700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61700000-61800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61800000-61900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61900000-62000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62000000-62100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62100000-62200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62200000-62300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62300000-62400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62400000-62500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62500000-62600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62600000-62700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62700000-62800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62800000-62900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62900000-63000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:63000000-63025520.baq.20110328.vcf
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO
-20 458502 . G GA 4567.01 PASS AA=20;AB=0.61111;ABA=14;ABP=6.8707;ABR=22;AC=38;AF=0.0544;AN=698;BL=374;BR=1129;BVAR;BaseQRankSum=13.364;DP=15979;DP4=1882,2188,45,37;Dels=0.00;EL=5;EPP=13.868;ER=15;FR;FS=6.503;HETAR=11;HOMA=2;HOMR=985;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0157;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_A.;LEN=1;LRB=0.50233;LRBP=826.56;MQ=66.16;MQ0Fraction=0.0110;MQM=70.5;MQRankSum=-3.158;NF;NR;NS=998;PP;PV4=0.15,1,0.42,0.15;RA=3173;RL=1;RPP=38.188;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.346;SAB=0.7;SAF=14;SAP=9.959;SAR=6;SC=GGGCGTGGTGGTGCATGTAAT;SRB=0.50047;SRF=1588;SRP=3.0165;SRR=1585;TC;TR=9;TU=GGT;VQSLOD=10.0079;set=Intersection;sumGLbyD=23.94
-20 573764 . TA T 591.51 PASS AC=91;AF=0.1987;AN=458;BaseQRankSum=0.137;DP=519;FS=3.153;HRun=1;HaplotypeScore=14.0744;InbreedingCoeff=0.1460;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=48.16;MQ0=26;MQ0Fraction=0.0501;MQRankSum=-1.636;QD=3.63;ReadPosRankSum=-4.140;SB=-408.14;VQSLOD=5.2458;set=VQSR
-20 766143 . C CATCTGGTA 5521.70 PASS AA=24;AB=0.5;ABA=18;ABP=3.0103;ABR=18;AC=14;AF=0.0289;AF1=0.02038;AN=484;BL=655;BR=1542;BVAR;BaseQRankSum=3.801;CI95=0.01549,0.02655;DP=11749;DP4=2222,1998,14,8;Dels=0.00;EL=9;EPP=6.2675;ER=15;FQ=999;FR;FS=2.941;HETAR=9;HOMA=4;HOMR=901;HP=2;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0515;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_8.;LEN=8;LRB=0.40373;LRBP=780.64;MQ=56.81;MQ0Fraction=0.0253;MQM=22.167;MQRankSum=-4.809;NF;NR;NS=914;PP;PV4=0.39,1,5.8e-07,1;RA=3093;RL=6;RPP=16.039;RR=18;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.827;SAB=0.625;SAF=15;SAP=6.2675;SAR=9;SC=GCTTTAAATTCATCTGGTACT;SRB=0.61623;SRF=1906;SRP=365.95;SRR=1187;TC;TR=1;TU=A;VQSLOD=7.0268;set=Intersection;sumGLbyD=50.23
-20 997076 rs11467490 CTG C 15379.78 PASS AA=195;AB=0.59878;ABA=132;ABP=30.896;ABR=197;AC=173;AF=0.14562;AN=1188;BL=7664;BR=7309;BVAR;BaseQRankSum=21.853;DB;DEL;DP=27127;DP4=1801,2002,241,282;Dels=0.13;EL=100;EPP=3.2887;ER=95;FQ=999;FR;FS=6.591;HETAR=77;HOMA=42;HOMR=815;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1284;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TG.;LEN=2;LRB=0.023709;LRBP=21.287;MQ=61.18;MQ0Fraction=0.0214;MQM=43.041;MQRankSum=6.886;NF;NR;NS=934;PP;PV4=0.61,1.5e-78,1,1;RA=2800;RL=120;RPP=25.56;RR=75;RUN=1;ReadPosRankSum=4.504;SAB=0.62051;SAF=121;SAP=27.609;SAR=74;SC=CAGCTAATTACTGTATTTTTA;SRB=0.49821;SRF=1395;SRP=3.0879;SRR=1405;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=8.9396;set=Intersection;sumGLbyD=16.76
-20 1042261 rs10597473 CCCTG C 168658.05 PASS AA=4481;AB=0.29043;ABA=2128;ABP=1147.1;ABR=871;AC=1172;AF=0.97830;AN=1198;BL=169975;BR=194027;BVAR;BaseQRankSum=4.599;DB;DEL;DP=29418;DP4=29,47,1441,2403;Dels=0.84;EL=2358;EPP=29.772;ER=2123;FR;FS=9.122;HETAR=482;HOMA=559;HOMR=30;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.0470;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.066077;LRBP=3454.1;MQ=104.58;MQ0=4;MQ0Fraction=0.0014;MQM=58.257;MQRankSum=-3.368;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=0.91,6.8e-09,2.8e-05,1;RA=1039;RL=2088;RPP=48.09;RR=2393;RUN=1;ReadPosRankSum=5.288;SAB=0.41442;SAF=1857;SAP=288.09;SAR=2624;SC=CCAAACCCAACCCTGCCTGGC;SRB=0.48893;SRF=508;SRP=4.1159;SRR=531;TC;TR=8;TU=CCTG;VQSLOD=8.5148;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=59.79
-20 1046297 rs33956316 C CT,CTT,CTTT 17698 PASS ABR=408;AC=432,79,230;AF=0.39779,0.07274,0.21179;BVAR;BaseQRankSum=-8.413;DB;DP=15649;DP4=147,199,534,436;FR;FS=11.580;HOMA=97;HOMR=457;HP=20;HR=16;HU=T;HaplotypeScore=16.0590;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.6018;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;KGPilot123;MQ0=19;MQ0Fraction=0.0093;MQRankSum=7.992;NF;NR;NS=767;PP;PV4=6e-05,1,1,1;QD=8.18;RA=1183;RUN=1;ReadPosRankSum=2.684;SB=-6384.08;SC=GGAAAATTTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.40913;SRF=484;SRP=87.859;SRR=699;TC;TR=16;TU=T;VQSLOD=8.4941;dbSNP=132;set=Intersection
-20 1405740 . T TA 257.28 PASS AF=0.0188;BaseQRankSum=-0.745;DP=3769;Dels=0.00;FS=0.742;HPLen=9;HRun=9;InbreedingCoeff=0.0462;IndelType=INS.NumRepetitions_9.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ0Fraction=0.0151;MQRankSum=-0.090;ReadPosRankSum=-1.582;VQSLOD=5.6502;set=Intersection;sumGLbyD=6.94
-20 1690501 . TC T 27928 PASS AA=108;AB=0.91372;ABA=100;ABP=1726.1;ABR=1059;AC=35;AF=0.02966;AN=1180;BL=593;BR=6973;BVAR;BaseQRankSum=7.567;DEL;DP=10612;Dels=0.01;EL=50;EPP=4.2971;ER=58;FS=0.000;HETAR=378;HOMA=184;HOMR=477;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0495;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.84325;LRBP=11685;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=87.361;MQRankSum=4.088;NS=1045;RA=3125;RL=3;RPP=212.2;RR=105;RUN=1;ReadPosRankSum=-13.096;SAB=0.56481;SAF=61;SAP=6.9511;SAR=47;SRB=0.51776;SRF=1618;SRP=11.572;SRR=1507;VQSLOD=3.9824;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.07
-20 1991285 rs113891396 TAA T,TA,TAAA,TAAAAA,TAAAAAA,TAAAAAAA,TAAAAAAAA 39235.36 PASS AC=5,251,20,39,188,52,79;AF=0.0056,0.2789,0.0222,0.0433,0.2089,0.0578,0.0878;AN=900;BVAR;BaseQRankSum=1.124;DB;DEL;DP=54393;DP4=906,772,824,579;Dels=0.21;FR;FS=37.525;HP=12;HR=12;HRun=12;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.6891;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=76.81;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-6.593;NF;NR;PP;PV4=0.0087,1,6.3e-19,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.184;SC=ATCTGCCACTTAAAAAAAAAA;TC;TR=12;TU=A;VQSLOD=9.0007;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=11.45
-20 2355911 . TA T 11723 PASS AA=79;AB=0.9393;ABA=57;ABP=1577;ABR=882;AC=38;AF=0.0411;AN=924;BL=644;BR=5536;BVAR;BaseQRankSum=2.434;DEL;DP=9687;Dels=0.00;EL=45;EPP=6.3362;ER=34;FS=3.043;HETAR=321;HOMA=182;HOMR=555;HRun=5;InbreedingCoeff=0.0412;IndelType=DEL.NumRepetitions_5.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.79159;LRBP=8411.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=70.848;MQRankSum=0.137;NS=1058;RA=3415;RL=3;RPP=149.49;RR=76;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.116;SAB=0.44304;SAF=35;SAP=5.2367;SAR=44;SRB=0.43572;SRF=1488;SRP=125.55;SRR=1927;VQSLOD=3.8910;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.88
-20 2771621 rs11479849 GT G,GTT 1605.60 PASS AA=80;AB=0.79825;ABA=69;ABP=267.24;ABR=273;AC=79,91;AF=0.06551,0.07546;AN=1206;BL=2593;BR=3805;BVAR;BaseQRankSum=7.825;DB;DP=9790;Dels=0.04;EL=37;EPP=3.9875;ER=43;FR;FS=4.751;HETAR=62;HOMA=5;HOMR=958;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2646;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.18943;LRBP=501.57;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=52.45;MQRankSum=-0.560;NF;NR;NS=1025;PP;RA=3949;RL=29;RPP=16.148;RR=51;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.397;SAB=0.525;SAF=42;SAP=3.4446;SAR=38;SC=TCATTTTAACGTTTTTTTTTT;SRB=0.54368;SRF=2147;SRP=68.46;SRR=1802;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=3.5989;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.92
-20 2891235 . G GT,GTTT 2869.87 PASS AC=236,246;AF=0.2803,0.2922;AN=842;BaseQRankSum=8.979;DP=1067;FS=3.911;HaplotypeScore=20.3595;InbreedingCoeff=0.6511;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=44.86;MQ0=114;MQ0Fraction=0.1068;MQRankSum=-2.273;QD=4.00;ReadPosRankSum=-6.601;SB=-991.85;VQSLOD=5.4379;set=VQSR
-20 3033550 . TGAG T 2005.90 PASS AA=34;AB=0.51429;ABA=34;ABP=3.1344;ABR=36;AC=22;AF=0.0332;AN=662;BL=1374;BR=1649;BVAR;BaseQRankSum=5.192;DEL;DP=14639;DP4=2271,1492,12,21;Dels=0.02;EL=19;EPP=4.0322;ER=15;FR;FS=16.657;HETAR=17;HOMA=0;HOMR=914;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0454;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_3.;LEN=3;LRB=0.090969;LRBP=57.333;MQ=53.99;MQ0Fraction=0.0304;MQM=46.735;MQRankSum=1.938;NF;NR;NS=931;PP;PV4=0.0068,9.4e-05,1,1;RA=2985;RL=11;RPP=12.207;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.466;SAB=0.41176;SAF=14;SAP=5.3095;SAR=20;SC=CTTGGGAGGCTGAGGTGGGAG;SRB=0.62781;SRF=1874;SRP=426.52;SRR=1111;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=8.9194;set=Intersection;sumGLbyD=24.41
-20 3873327 rs61519218 A AAG 683.85 PASS AC=25;AF=0.0313;AN=800;BaseQRankSum=4.839;DB;DP=1718;FS=4.265;HRun=0;HaplotypeScore=20.5789;InbreedingCoeff=0.1055;IndelType=INS.NOVEL_2.;MQ=53.70;MQ0=37;MQ0Fraction=0.0215;MQRankSum=2.468;QD=6.30;ReadPosRankSum=4.254;SB=-403.21;VQSLOD=6.1858;set=VQSR
-20 4028835 . GC G 2511.30 PASS AA=66;AB=0.56954;ABA=65;ABP=9.3521;ABR=86;AC=22;AF=0.01836;AN=1198;BL=2303;BR=2463;BVAR;BaseQRankSum=7.621;DEL;DP=22795;DP4=1714,2774,22,37;Dels=0.02;EL=34;EPP=3.1419;ER=32;FQ=999;FR;FS=2.095;HETAR=21;HOMA=0;HOMR=1050;HP=2;HPLen=2;HR=2;HRun=2;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.0125;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.033571;LRBP=14.674;MQ=108.09;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=53.318;MQRankSum=5.257;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=1,5.4e-13,1,0.075;RA=6185;RL=36;RPP=4.1947;RR=30;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.059;SAB=0.45455;SAF=30;SAP=4.1947;SAR=36;SC=TGCTGTCACTGCCTTCTCCTA;SRB=0.42118;SRF=2605;SRP=336.76;SRR=3580;TC;TR=2;TU=C;VQSLOD=10.2409;set=Intersection;sumGLbyD=12.71
-20 4039609 rs67812039 G GA 43457 PASS AA=909;AB=0.54639;ABA=572;ABP=26.583;ABR=689;AC=302;AF=0.3455;AN=874;BL=37070;BR=38211;BVAR;BaseQRankSum=20.147;DB;DP=25595;DP4=1483,1374,528,542;Dels=0.00;EL=467;EPP=4.5033;ER=442;FQ=999;FR;FS=5.441;HETAR=243;HOMA=127;HOMR=608;HP=4;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1388;IndelType=INS.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.015157;LRBP=40.563;MQ=119.50;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=83.197;MQRankSum=1.080;NF;NR;NS=978;PP;PV4=0.16,1,3.6e-12,1;RA=3033;RL=443;RPP=4.274;RR=466;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.000;SAB=0.32233;SAF=293;SAP=252.24;SAR=616;SC=TATGTTGGGAGAAATATCAGT;SRB=0.38378;SRF=1164;SRP=358.85;SRR=1869;TC;TR=4;TU=AG;VQSLOD=9.9146;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=16.79
-20 4390056 . TC T 49312 PASS AA=91;AB=0.94353;ABA=86;ABP=2605.4;ABR=1437;AC=39;AF=0.03160;AN=1234;BL=6823;BR=731;BVAR;BaseQRankSum=2.727;DEL;DP=13149;Dels=0.00;EL=41;EPP=4.9431;ER=50;FS=4.002;HETAR=465;HOMA=313;HOMR=292;HRun=3;InbreedingCoeff=0.0326;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.80646;LRBP=10671;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=69.824;MQRankSum=-0.903;NS=1073;RA=3078;RL=89;RPP=183.62;RR=2;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.526;SAB=0.45055;SAF=41;SAP=4.9431;SAR=50;SRB=0.52567;SRF=1618;SRP=20.622;SRR=1460;VQSLOD=4.3235;set=Intersection;sumGLbyD=3.53
-20 4474622 . TA T,TAA,TAAA,TAAAA 94522.28 PASS ABR=114;AC=38,68,16,900;AF=0.03333,0.05965,0.01404,0.78947;AN=1140;BVAR;BaseQRankSum=9.741;DB;DP=16656;Dels=0.00;FR;FS=2.355;HOMA=3;HOMR=936;HP=10;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.4516;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0008;MQRankSum=-4.096;NF;NR;NS=980;PP;RA=3766;RUN=1;ReadPosRankSum=2.380;SC=AGAAAAAAATTAAAAAAAAAA;SRB=0.49734;SRF=1873;SRP=3.2409;SRR=1893;TC;TR=10;TU=A;VQSLOD=8.8186;set=Intersection;sumGLbyD=38.79
-20 4824911 . AC A 41998.70 PASS AC=1172;AF=0.97342;AN=1204;BaseQRankSum=8.604;DP=3615;FS=9.934;HRun=1;HaplotypeScore=39.6843;InbreedingCoeff=0.0980;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=129.80;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=3.378;QD=11.62;ReadPosRankSum=6.967;SB=-16955.28;VQSLOD=4.2689;set=VQSR
-20 4839897 rs35881880 TAA T,TA,TAAA,TAAAAA 3906.80 PASS AC=12,95,137,189;AF=0.01024,0.08106,0.11689,0.16126;AN=1172;BVAR;BaseQRankSum=15.271;DB;DEL;DP=15105;Dels=0.04;FR;FS=43.567;HP=19;HR=13;HRun=13;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.5716;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.569;NF;NR;PP;RUN=1;ReadPosRankSum=-13.794;SC=TGTTAAAAAATAAAAAAAAAA;TC;TR=13;TU=A;VQSLOD=8.1773;set=Intersection;sumGLbyD=3.77
-20 5507414 . G GCC 439.08 PASS AC=23;AF=0.01876;AN=1226;BaseQRankSum=3.051;DP=3023;FS=3.636;HRun=1;HaplotypeScore=30.3104;InbreedingCoeff=0.0204;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=112.09;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.065;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.709;SB=-302.22;VQSLOD=4.4311;set=VQSR
-20 5609676 . GA G,GAA 799.89 PASS AA=42;AB=0.79096;ABA=37;ABP=133.16;ABR=140;AC=43,65;AF=0.03607,0.05453;AF1=0.02826;AN=1192;BL=1360;BR=2334;BVAR;BaseQRankSum=5.069;CI95=0.01242,0.04037;DP=15610;DP4=1548,2441,21,30;Dels=0.02;EL=18;EPP=4.8716;ER=24;FQ=12.1;FR;FS=0.000;HETAR=36;HOMA=1;HOMR=991;HP=13;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2001;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.26367;LRBP=560.68;MQ=63.29;MQ0Fraction=0.0003;MQM=44.143;MQRankSum=1.755;NF;NR;NS=1028;PP;PV4=0.77,1,0.0087,0.0053;RA=4114;RL=15;RPP=10.455;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.978;SAB=0.5;SAF=21;SAP=3.0103;SAR=21;SC=AAAAAAGAAAGAAAAAAAAAA;SRB=0.39742;SRF=1635;SRP=379;SRR=2479;TC;TR=11;TU=AAAG;VQSLOD=4.1229;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=7.95
-20 5736211 rs35303106 CT C,CTT 4384.40 PASS AA=117;AB=0.71499;ABA=116;ABP=166.4;ABR=291;AC=32,145;AF=0.02712,0.12288;AN=1180;BL=5556;BR=4901;BVAR;BaseQRankSum=2.708;DB;DP=9157;Dels=0.01;EL=54;EPP=4.5136;ER=63;FR;FS=2.802;HETAR=79;HOMA=1;HOMR=837;HP=16;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.1903;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.062637;LRBP=92.1;MQ0Fraction=0.0273;MQM=48.932;MQRankSum=3.654;NF;NR;NS=917;PP;RA=2785;RL=79;RPP=34.209;RR=38;RUN=1;ReadPosRankSum=0.795;SAB=0.5641;SAF=66;SAP=7.1862;SAR=51;SC=TTTTCTTTTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.41795;SRF=1164;SRP=165.85;SRR=1621;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=5.0895;set=Intersection;sumGLbyD=4.66
-20 5898626 rs34483659 CAAA C,CA,CAA,CAAAAA 1140.16 PASS ABR=34;AC=19,98,56,199;AF=0.0227,0.1172,0.0670,0.2380;AF1=0.08519;BVAR;BaseQRankSum=5.049;CI95=0.03727,0.1273;DB;DEL;DP=5091;DP4=539,408,121,123;FQ=4.43;FR;FS=5.701;HOMA=64;HOMR=156;HP=19;HR=18;HU=A;HaplotypeScore=11.5333;INDEL;InbreedingCoeff=0.7405;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=117;MQ0Fraction=0.0986;MQRankSum=6.290;NF;NR;NS=240;PP;PV4=0.043,1,1,0.0087;QD=1.22;RA=204;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.684;SB=-1015.09;SC=ACTAAAAATACAAAAAAAAAA;SRB=0.35294;SRF=72;SRP=41.33;SRR=132;TC;TR=18;TU=A;VQSLOD=4.1696;set=filterInVQSR-2of5
-20 5975126 rs10541892 C CAG 504.78 PASS AC=79;AF=0.07004;AN=1128;BaseQRankSum=10.498;DB;DP=2050;FS=38.228;HRun=0;HaplotypeScore=14.1426;InbreedingCoeff=-0.0053;IndelType=INS.NOVEL_2.;MQ=60.40;MQ0=80;MQ0Fraction=0.0390;MQRankSum=5.098;QD=1.63;ReadPosRankSum=-4.851;SB=-590.69;VQSLOD=4.8517;set=VQSR
-20 6040983 rs11087710 A AAAAAAGAG,AAAAAGAG,AAAAGAG,AAAAGAGAG,AAAGAG,AAAGAGAG,AAGAG,AAGAGAG,AG,AGAG,AGAGAG 66894.55 PASS ABR=468;AC=80,9,20,136,31,91,33,29,9,3,5;AF=0.0980,0.0110,0.0245,0.1667,0.0380,0.1115,0.0404,0.0355,0.0110,0.0037,0.0061;AN=816;BVAR;BaseQRankSum=-12.470;DB;DP=38726;DP4=426,611,310,472;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=6.635;HOMA=110;HOMR=506;HP=14;HR=15;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.8291;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;KGPilot123;MQ=54.22;MQ0Fraction=0.0168;MQRankSum=-5.329;NF;NR;NS=861;PP;PV4=0.56,1,6.9e-09,0.31;RA=1828;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.857;SC=AAAAAAAAAAAAGAGAGAGAG;SRB=0.62418;SRF=1141;SRP=247.85;SRR=687;TC;TR=15;TU=A;VQSLOD=9.0574;dbSNP=131;set=Intersection;sumGLbyD=36.72
-20 7024548 . G GAT 5041.27 PASS AC=123;AF=0.10336;AN=1190;BaseQRankSum=23.097;DP=3045;FS=7.979;HRun=0;HaplotypeScore=15.6967;InbreedingCoeff=0.1062;IndelType=INS.NumRepetitions_5.EventLength_2.RepeatExpansion_AT.;MQ=119.29;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0007;MQRankSum=-3.725;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.636;SB=-2257.45;VQSLOD=5.9332;set=VQSR
-20 7484554 . A AT 5.09 PASS AC=0;AF=0.0000;AN=710;BaseQRankSum=-0.696;DP=1862;FS=2.835;HRun=9;HaplotypeScore=13.5425;InbreedingCoeff=0.0567;IndelType=INS.NumRepetitions_9.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=76.92;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.932;ReadPosRankSum=-1.701;VQSLOD=4.3156;set=VQSR
-20 7632194 rs77286341 GAA AAA,G 5324 PASS AC=0;AF=0.0000;AN=700;BaseQRankSum=-1.741;DB;DP=1772;FR;HP=4;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=A;HaplotypeScore=60.1795;InbreedingCoeff=0.0017;IndelType=MIXED;MQ=70.69;MQ0=13;MQ0Fraction=0.0073;MQRankSum=-1.315;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-3.650;SC=GAGAGAGAGAGAAAGGTGTAA;TC;TR=13;TU=AG;set=filterInVQSR-2of5
-20 7767508 rs71329674 G GA 17914 PASS AA=415;AB=0.61617;ABA=337;ABP=105.94;ABR=541;AC=141;AF=0.11614;AN=1214;BL=15187;BR=20323;BVAR;BaseQRankSum=-13.946;DB;DP=28222;Dels=0.00;EL=184;EPP=14.569;ER=231;FQ=999;FR;FS=13.296;HETAR=178;HOMA=35;HOMR=822;HP=14;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0714;IndelType=INS.NumRepetitions_9.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.14464;LRBP=1616.1;MQ=89.69;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=51.667;MQRankSum=0.664;NF;NR;NS=1035;PP;RA=3707;RL=171;RPP=30.894;RR=244;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.120;SAB=0.45301;SAF=188;SAP=10.969;SAR=227;SC=ATTCTAAAAAGAAAAAAAAAT;SRB=0.38495;SRF=1427;SRP=429.23;SRR=2280;TC;TR=9;TU=A;VQSLOD=9.0748;set=Intersection;sumGLbyD=11.09
-20 7920261 . TA T,TAA 802.15 PASS AA=28;AB=0.8;ABA=28;ABP=112.45;ABR=112;AC=22,39;AF=0.01836,0.03255;AN=1198;BL=943;BR=1487;BVAR;BaseQRankSum=2.233;DP=10645;Dels=0.01;EL=11;EPP=5.8022;ER=17;FR;FS=1.691;HETAR=20;HOMA=0;HOMR=1007;HP=10;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.2256;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.22387;LRBP=267.46;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=57.571;MQRankSum=0.940;NF;NR;NS=1027;PP;RA=4776;RL=8;RPP=14.178;RR=20;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.567;SAB=0.53571;SAF=15;SAP=3.3205;SAR=13;SC=GTAACTGCTATAAAAAAAAAC;SRB=0.48576;SRF=2320;SRP=11.42;SRR=2456;TC;TR=9;TU=A;VQSLOD=4.0815;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.37
-20 8012465 rs10595338 TATGA T 2104.41 PASS AF=0.03339;BaseQRankSum=10.662;DB;DP=11772;DS;Dels=0.01;FR;FS=7.678;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;InbreedingCoeff=0.0266;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ0Fraction=0.0731;MQRankSum=0.603;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=1.276;SC=TGTATGTATGTATGATGTATG;TC;TR=19;TU=ATGT;VQSLOD=4.1376;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.53
-20 8573999 . CGTGT C,CGT,CGTGTGT,TGTGT 45865.96 PASS AC=458,0,731;AF=0.37727,0.00000,0.60214;AN=1214;BVAR;BaseQRankSum=-6.703;DEL;DP=37714;Dels=0.03;FR;FS=11.079;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.7632;IndelType=MIXED;LEN=2;MQ0Fraction=0.0026;MQRankSum=-1.394;NF;NR;PP;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.102;SC=TGTGTGTGCGCGTGTGTGTGT;TC;TR=18;TU=GT;VQSLOD=6.1435;set=Intersection;sumGLbyD=3.53
-20 8610455 rs10571111 TTTTC T 11763.51 PASS AC=190;AF=0.17056;AN=1114;BaseQRankSum=-14.397;DB;DP=2323;FS=2.321;HRun=0;HaplotypeScore=39.8020;InbreedingCoeff=0.2502;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_4.;MQ=53.39;MQ0=104;MQ0Fraction=0.0448;MQRankSum=3.519;QD=19.07;ReadPosRankSum=4.150;SB=-4067.02;VQSLOD=5.0554;set=VQSR
-20 9139079 . ATT A,AT,ATTT,ATTTT,ATTTTT 8777.90 PASS AC=23,140,114,69,113;AF=0.01993,0.12132,0.09879,0.05979,0.09792;AN=1154;BVAR;BaseQRankSum=-0.022;DEL;DP=25109;DP4=502,657,278,313;FR;FS=11.929;HP=16;HR=16;HU=T;HaplotypeScore=20.2361;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.5704;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=16;MQ0Fraction=0.0067;MQRankSum=2.624;NF;NR;PP;PV4=0.14,1,1,1;QD=1.48;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-2354.28;SC=CACCTGGCTAATTTTTTTTTT;TC;TR=16;TU=T;VQSLOD=6.9180;set=Intersection
-20 9862448 . CT C 49312 PASS AA=60;AB=0.96003;ABA=53;ABP=2440.4;ABR=1273;AC=18;AF=0.01461;AN=1232;BL=3516;BR=140;BVAR;BaseQRankSum=-2.056;DEL;DP=11893;Dels=0.01;EL=35;EPP=6.6294;ER=25;FS=1.787;HETAR=396;HOMA=344;HOMR=334;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0379;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.92341;LRBP=6772.5;MQ0Fraction=0.0006;MQM=54.267;MQRankSum=-0.907;NS=1074;RA=2990;RL=60;RPP=133.3;RR=0;RUN=1;ReadPosRankSum=-10.579;SAB=0.58333;SAF=35;SAP=6.6294;SAR=25;SRB=0.47826;SRF=1430;SRP=15.284;SRR=1560;VQSLOD=3.0237;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.84
-20 9863736 rs73618103 G GT 50570.21 PASS AA=2247;AB=0.48878;ABA=1412;ABP=6.0324;ABR=1350;AC=546;AF=0.44463;AN=1228;BL=86886;BR=95862;BVAR;BaseQRankSum=-23.978;DB;DP=32517;DP4=1125,1133,1017,1048;Dels=0.00;EL=1089;EPP=7.6113;ER=1158;FQ=999;FR;FS=2.529;HETAR=445;HOMA=201;HOMR=393;HP=4;HPLen=4;HR=4;HRun=4;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1393;IndelType=INS.NumRepetitions_4.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;KGPilot123;LEN=1;LRB=0.049117;LRBP=960.35;MQ=68.10;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0006;MQM=50.931;MQRankSum=-1.580;NF;NR;NS=1039;PP;PV4=0.71,1,0.11,1;RA=3139;RL=1089;RPP=7.6113;RR=1158;RUN=1;ReadPosRankSum=0.846;SAB=0.54161;SAF=1217;SAP=36.804;SAR=1030;SC=TGATTGTATGGTTTTGTCCTT;SRB=0.53425;SRF=1677;SRP=34.987;SRR=1462;TC;TR=4;TU=T;VLD;VQSLOD=10.1800;dbSNP=131;set=Intersection;sumGLbyD=18.20
-20 10926959 . AG A 12239 PASS AA=65;AB=0.92801;ABA=64;ABP=1417.6;ABR=825;AC=24;AF=0.0264;AN=908;BL=616;BR=3782;BVAR;BaseQRankSum=9.990;DEL;DP=10708;Dels=0.01;EL=37;EPP=5.7163;ER=28;FS=1.652;HETAR=275;HOMA=70;HOMR=724;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0102;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.71987;LRBP=4952;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQM=118.82;MQRankSum=1.018;NS=1069;RA=4746;RL=5;RPP=104.07;RR=60;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.039;SAB=0.41538;SAF=27;SAP=7.0526;SAR=38;SRB=0.4764;SRF=2261;SRP=25.968;SRR=2485;VQSLOD=2.9713;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.10
-20 11299648 . TG T 49315 PASS AA=62;AB=0.95292;ABA=54;ABP=2046.7;ABR=1093;AC=28;AF=0.0373;AN=750;BL=3126;BR=528;BVAR;BaseQRankSum=-4.929;DEL;DP=10764;Dels=0.01;EL=26;EPP=6.5127;ER=36;FS=3.851;HETAR=366;HOMA=383;HOMR=304;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0267;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.711;LRBP=4014.1;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0005;MQM=76.468;MQRankSum=1.327;NS=1070;RA=2588;RL=54;RPP=77.121;RR=8;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.507;SAB=0.48387;SAF=30;SAP=3.1504;SAR=32;SRB=0.47643;SRF=1233;SRP=15.499;SRR=1355;VQSLOD=3.8673;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.00
-20 11561096 . CTA C 999 PASS AC=2;AF=0.0029;AF1=0.005602;BaseQRankSum=3.190;CI95=0.004425,0.01106;DP=7521;DP4=1998,1794,2,4;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=5.422;HP=3;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0056;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TA.;MQ=113.88;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.297;NF;NR;PP;PV4=0.43,0.024,1,1;ReadPosRankSum=1.406;SC=CAATAGTATTCTATGTCAGTC;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=8.6243;set=Intersection;sumGLbyD=21.89
-20 11723671 . C CA 1096.60 PASS AA=35;AB=0.69565;ABA=35;ABP=41.247;ABR=80;AC=10;AF=0.0141;AN=710;BL=2005;BR=1702;BVAR;BaseQRankSum=-3.427;DP=9819;Dels=0.00;EL=20;EPP=4.5614;ER=15;FR;FS=3.814;HETAR=20;HOMA=0;HOMR=1034;HP=8;HPLen=7;HR=7;HRun=7;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0323;IndelType=INS.NumRepetitions_7.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.081737;LRBP=56.79;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=81.057;MQRankSum=0.050;NF;NR;NS=1054;PP;RA=5562;RL=22;RPP=8.0357;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.012;SAB=0.71429;SAF=25;SAP=16.97;SAR=10;SC=ATATTGAAGACAAAAAAACAG;SRB=0.49371;SRF=2746;SRP=4.9233;SRR=2816;TC;TR=7;TU=A;VQSLOD=7.4342;set=Intersection;sumGLbyD=8.30
-20 12238835 rs113904674 CTCTTCATGGTCT C 1813.44 PASS AA=7;AB=0.73077;ABA=7;ABP=15.037;ABR=19;AC=4;AF=0.0056;AN=712;BL=360;BR=368;BVAR;BaseQRankSum=3.891;DB;DEL;DP=10309;Dels=0.00;EL=4;EPP=3.3205;ER=3;FR;FS=0.000;HETAR=3;HOMA=0;HOMR=1076;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=C;InbreedingCoeff=-0.0381;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_10orMore.;LEN=12;LRB=0.010989;LRBP=3.2012;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=37;MQRankSum=-3.793;NF;NR;NS=1079;PP;RA=6085;RL=4;RPP=3.3205;RR=3;RUN=1;ReadPosRankSum=1.319;SAB=0.42857;SAF=3;SAP=3.3205;SAR=4;SC=CTTAATGCTCCTCTTCATGGT;SRB=0.51257;SRF=3119;SRP=11.364;SRR=2966;TC;TR=6;TU=CCT;VQSLOD=5.7551;set=Intersection;sumGLbyD=69.48
-20 12602812 . AT A 12344 PASS AA=47;AB=0.94372;ABA=43;ABP=1309.5;ABR=721;AC=14;AF=0.0196;AN=716;BL=2714;BR=217;BVAR;BaseQRankSum=1.424;DEL;DP=10743;Dels=0.00;EL=24;EPP=3.0565;ER=23;FS=0.629;HETAR=228;HOMA=65;HOMR=769;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0233;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.85193;LRBP=4622.3;MQ0Fraction=0.0000;MQM=99.574;MQRankSum=1.901;NS=1080;RA=4839;RL=46;RPP=96.568;RR=1;RUN=1;ReadPosRankSum=-9.906;SAB=0.53191;SAF=25;SAP=3.4261;SAR=22;SRB=0.51106;SRF=2473;SRP=8.148;SRR=2366;VQSLOD=2.8161;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.67
-20 13600884 . CTG C,CTGTG 1278.10 PASS AA=85;AB=0.77994;ABA=79;ABP=247.38;ABR=280;AC=71,22;AF=0.05907,0.01830;AN=1202;BL=3279;BR=3205;BVAR;BaseQRankSum=8.852;DEL;DP=24185;DP4=1317,931,52,49;Dels=0.03;EL=45;EPP=3.649;ER=40;FQ=999;FR;FS=31.826;HETAR=75;HOMA=4;HOMR=926;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1566;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=2;LRB=0.011413;LRBP=4.8442;MQ=65.06;MQ0Fraction=0.0012;MQM=48.671;MQRankSum=-0.511;NF;NR;NS=1005;PP;PV4=0.18,1,0.39,0.27;RA=3342;RL=35;RPP=8.7583;RR=50;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.329;SAB=0.43529;SAF=37;SAP=6.1015;SAR=48;SC=TCCCTTTACTCTGTGTGTGTG;SRB=0.59066;SRF=1974;SRP=241.62;SRR=1368;TC;TR=15;TU=GT;VQSLOD=3.8635;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.23
-20 13666265 . T TATAG 556.88 PASS AC=21;AF=0.01959;AN=1072;BaseQRankSum=24.958;DP=2706;FS=2.581;HRun=0;HaplotypeScore=25.9952;InbreedingCoeff=0.1419;IndelType=INS.NOVEL_4.;MQ=72.43;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=2.888;QD=4.38;ReadPosRankSum=2.552;SB=-417.04;VQSLOD=7.3380;set=VQSR
-20 13861245 rs72422273 C CTCA 2685.46 PASS AC=140;AF=0.11589;AN=1208;BaseQRankSum=24.355;DB;DP=2910;FS=6.808;HRun=0;HaplotypeScore=19.3095;InbreedingCoeff=-0.0991;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_3.;MQ=78.25;MQ0=22;MQ0Fraction=0.0076;MQRankSum=3.225;QD=3.64;ReadPosRankSum=2.607;SB=-1861.38;VQSLOD=4.1974;set=VQSR
-20 13865746 . T TA,TAA 1416.23 PASS AA=63;AB=0.80417;ABA=47;ABP=195.87;ABR=193;AC=122,21;AF=0.10133,0.01744;AN=1204;BL=3673;BR=1145;BVAR;BaseQRankSum=-3.336;DP=10513;Dels=0.00;EL=62;EPP=131.27;ER=1;FR;FS=716.583;HETAR=45;HOMA=1;HOMR=998;HP=2;HR=1;HRun=1;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0814;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.5247;LRBP=2883.3;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.143;MQRankSum=-1.197;NF;NR;NS=1044;PP;RA=4529;RL=62;RPP=131.27;RR=1;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.295;SAB=1;SAF=63;SAP=139.81;SAR=0;SC=GGAACATGGATACCCCCCTGC;SRB=0.52462;SRF=2376;SRP=26.853;SRR=2153;TC;TR=1;TU=A;VQSLOD=-4.2308;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.77
-20 13881703 . CTT C 152.85 PASS AC=8;AF=0.0093;AN=862;BaseQRankSum=3.941;DP=2063;FS=0.962;HRun=5;HaplotypeScore=24.0313;InbreedingCoeff=0.0790;IndelType=DEL.NumRepetitions_5.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=55.05;MQ0=49;MQ0Fraction=0.0238;MQRankSum=-1.418;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-93.04;VQSLOD=5.3874;set=VQSR
-20 14260090 rs73619828 A AT 27935 PASS AA=596;AB=0.59484;ABA=487;ABP=96.922;ABR=715;AC=204;AF=0.17000;AN=1200;BL=21718;BR=28458;BVAR;BaseQRankSum=0.756;DB;DP=23629;DP4=1385,1492,287,328;Dels=0.00;EL=299;EPP=3.0249;ER=297;FQ=999;FR;FS=6.187;HETAR=218;HOMA=38;HOMR=788;HP=9;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0797;IndelType=INS.NumRepetitions_9.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.13433;LRBP=1969;MQ=100.81;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=57.084;MQRankSum=2.224;NF;NR;NS=1044;PP;PV4=0.53,1,1.2e-11,1;RA=4143;RL=238;RPP=55.475;RR=358;RUN=1;ReadPosRankSum=0.198;SAB=0.46812;SAF=279;SAP=8.2714;SAR=317;SC=CCTTAAGTTGATTTTTTTTTC;SRB=0.50374;SRF=2087;SRP=3.514;SRR=2056;TC;TR=9;TU=T;VQSLOD=9.0018;set=Intersection;sumGLbyD=10.82
-20 14260558 . AC A 238 PASS AC=1;AF=0.0014;AF1=0.003368;BaseQRankSum=2.868;CI95=0.003106,0.006211;DP=9724;DP4=2075,2329,1,7;Dels=0.00;FQ=106;FR;FS=10.678;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=1;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0406;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=114.37;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.862;NF;NR;PP;PV4=0.074,0.0096,0.017,1;ReadPosRankSum=-0.042;SC=ATCAGGAATAACTGTGTGACC;TC;TR=2;TU=A;VQSLOD=8.1618;set=Intersection;sumGLbyD=18.65
-20 14425481 . GTA G,GTATA 148.85 PASS AC=43,23;AF=0.03473,0.01858;AN=1238;BaseQRankSum=6.289;DP=25167;DP4=1800,2021,38,49;FR;FS=9.416;HP=2;HPLen=1;HR=1;HU=T;HaplotypeScore=17.7453;INDEL;InbreedingCoeff=0.0995;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=21;MQ0Fraction=0.0058;MQRankSum=-0.200;NF;NR;PP;PV4=0.59,1,0.04,0.023;QD=0.35;ReadPosRankSum=-1.689;SB=-367.50;SC=CTGTGTGTGTGTATATATATA;TC;TR=13;TU=AT;VQSLOD=3.5796;set=filterInVQSR-2of5
-20 14943522 rs11478299 GA AA,G 1761.24 PASS AA=117;AB=0.68142;ABA=108;ABP=99.919;ABR=231;AC=0;AF=0.0000;AF1=0.04204;AN=712;BL=4931;BR=5802;BVAR;BaseQRankSum=9.118;CI95=0.02876,0.05752;DB;DEL;DP=13717;DP4=1908,1684,59,58;Dels=0.05;EL=60;EPP=3.1773;ER=57;FQ=81.9;FR;HETAR=56;HOMA=1;HOMR=1011;HP=8;HPLen=8;HR=8;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1264;IndelType=MIXED;LEN=1;LRB=0.081152;LRBP=156.5;MQ=106.93;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=96.855;MQRankSum=1.619;NF;NR;NS=1068;PP;PV4=0.57,1,0.0003,1;QD=7.40;RA=5080;RL=56;RPP=3.4743;RR=61;RUN=1;ReadPosRankSum=0.814;SAB=0.52137;SAF=61;SAP=3.4743;SAR=56;SB=-1122.51;SC=GTTGTTTGGGGAAAAAAAACT;SRB=0.51083;SRF=2595;SRP=8.1825;SRR=2485;TC;TR=8;TU=A;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=9.81
-20 14974486 . A AG 4101.40 PASS AA=57;AB=0.57143;ABA=51;ABP=8.2839;ABR=68;AC=22;AF=0.01846;AN=1192;BL=2286;BR=2834;BVAR;BaseQRankSum=8.711;DP=20538;DP4=2172,2100,19,13;Dels=0.00;EL=32;EPP=4.877;ER=25;FS=0.517;HETAR=20;HOMA=4;HOMR=1027;HRun=1;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0677;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_G.;LEN=1;LRB=0.10703;LRBP=130.37;MQ=126.07;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.088;MQRankSum=-10.756;NS=1051;PV4=0.38,3.5e-51,7.9e-34,1;RA=5203;RL=26;RPP=3.9627;RR=31;RUN=1;ReadPosRankSum=1.283;SAB=0.54386;SAF=31;SAP=3.9627;SAR=26;SRB=0.51816;SRF=2696;SRP=17.918;SRR=2507;VQSLOD=8.0072;set=Intersection;sumGLbyD=25.60
-20 15111137 . GA G 13533 PASS AA=98;AB=0.84864;ABA=89;ABP=623.8;ABR=499;AC=47;AF=0.03796;AN=1238;BL=5324;BR=856;BVAR;BaseQRankSum=-11.577;DEL;DP=13384;Dels=0.01;EL=53;EPP=4.4284;ER=45;FS=6.099;HETAR=219;HOMA=845;HOMR=18;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0056;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.72298;LRBP=7017.4;MQ0Fraction=0.0003;MQM=90.449;MQRankSum=1.408;NS=1083;RA=590;RL=87;RPP=130.99;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-18.074;SAB=0.55102;SAF=54;SAP=5.2261;SAR=44;SRB=0.52373;SRF=309;SRP=5.8958;SRR=281;VQSLOD=4.1054;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.06
-20 15283028 . A AC,ACACACACACACAC 140844.83 PASS AA=180;AB=0.61442;ABA=123;ABP=39.285;ABR=196;AC=13,817;AF=0.01111,0.69829;AN=1170;BL=4453;BR=11407;BVAR;BaseQRankSum=24.686;DP=6365;Dels=0.00;EL=124;EPP=58.793;ER=56;FR;FS=10.912;HETAR=87;HOMA=48;HOMR=683;HP=1;HR=1;HRun=1;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2074;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.43846;LRBP=6624;MQ0Fraction=0.0558;MQM=38.211;MQRankSum=-21.111;NF;NR;NS=818;PP;RA=1732;RL=0;RPP=393.88;RR=180;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.620;SAB=0.31111;SAF=56;SAP=58.793;SAR=124;SC=ACACACACACATACACACATA;SRB=0.54042;SRF=936;SRP=27.584;SRR=796;TC;TR=21;TU=AC;VQSLOD=4.7569;set=Intersection;sumGLbyD=18.36
-20 15361056 . ATAACT A 4892.81 PASS AA=59;AB=0.63576;ABA=55;ABP=27.184;ABR=96;AC=34;AF=0.0487;AN=698;BL=3164;BR=1999;BVAR;BaseQRankSum=3.391;DEL;DP=7080;Dels=0.03;EL=27;EPP=3.9304;ER=32;FR;FS=4.816;HETAR=35;HOMA=6;HOMR=966;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=A;InbreedingCoeff=0.0785;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_5.;LEN=5;LRB=0.22564;LRBP=573.84;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=70.034;MQRankSum=-8.732;NF;NR;NS=1008;PP;RA=3915;RL=42;RPP=26.013;RR=17;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.735;SAB=0.44068;SAF=26;SAP=4.8137;SAR=33;SC=AGATTAGGAAATAACTTAGGG;SRB=0.42682;SRF=1671;SRP=185.12;SRR=2244;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=7.0900;set=Intersection;sumGLbyD=43.38
-20 15579507 . AATTAGTC A,TATTAGTC 1936.38 PASS AA=16;AB=0.58974;ABA=16;ABP=5.7386;ABR=23;AC=64;AF=0.05229;AN=1224;BL=699;BR=775;BVAR;BaseQRankSum=-21.390;DEL;DP=21920;DP4=2099,2403,6,6;Dels=0.00;EL=8;EPP=3.0103;ER=8;FR;FS=2.920;HETAR=5;HOMA=0;HOMR=1063;HP=3;HPLen=4;HR=4;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0143;IndelType=MIXED;LEN=7;LRB=0.05156;LRBP=11.519;MQ=129.49;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=51.938;MQRankSum=3.331;NF;NR;NS=1068;PP;PV4=1,0.019,1.3e-07,1;RA=5334;RL=5;RPP=7.8961;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-16.901;SAB=0.4375;SAF=7;SAP=3.5532;SAR=9;SC=CATACTACAAAATTAGTCATT;SRB=0.41695;SRF=2224;SRP=322.58;SRR=3110;TC;TR=4;TU=A;VQSLOD=3.2237;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=43.57
-20 15752535 . CT C,GT 3775.20 PASS AA=92;AB=0.78636;ABA=47;ABP=159.71;ABR=173;AC=0;AF=0.0000;AN=608;BL=4955;BR=2380;BVAR;BaseQRankSum=2.910;DEL;DP=3429;Dels=0.04;EL=13;EPP=105.82;ER=79;FR;HETAR=92;HOMA=95;HOMR=544;HP=2;HPLen=2;HR=2;HU=T;InbreedingCoeff=0.0483;IndelType=MIXED;LEN=1;LRB=0.35106;LRBP=1966;MQ0Fraction=0.0232;MQM=35.293;MQRankSum=-2.199;NF;NR;NS=732;PP;QD=4.91;RA=1272;RL=81;RPP=118.66;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.077;SAB=0.021739;SAF=2;SAP=185.79;SAR=90;SB=-59.51;SC=CAAGACCATCCTTGGCTAACA;SRB=0.14623;SRF=186;SRP=1385.8;SRR=1086;TC;TR=2;TU=T;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=9.70
-20 15883060 rs73619850 A AT 1325.60 PASS AA=38;AB=0.59302;ABA=35;ABP=9.4742;ABR=51;AC=14;AF=0.0156;AN=896;BL=1078;BR=1638;BVAR;BaseQRankSum=-4.526;DB;DP=19854;DP4=1632,1800,15,20;Dels=0.00;EL=18;EPP=3.2389;ER=20;FR;FS=0.000;HETAR=14;HOMA=1;HOMR=1014;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=1;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=-0.0131;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.20619;LRBP=253.74;MQ=118.40;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.526;MQRankSum=0.892;NF;NR;NS=1029;PP;PV4=0.61,1,0.25,0.14;RA=4439;RL=14;RPP=8.7247;RR=24;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.061;SAB=0.42105;SAF=16;SAP=5.0675;SAR=22;SC=GGATTGGCAGATAAAAAATGG;SRB=0.46429;SRF=2061;SRP=52.168;SRR=2378;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=9.7576;set=Intersection;sumGLbyD=15.69
-20 16122099 . GA G 12914 PASS AA=85;AB=0.85915;ABA=80;ABP=639.4;ABR=488;AC=19;AF=0.01542;AN=1232;BL=805;BR=5457;BVAR;BaseQRankSum=-6.084;DEL;DP=13592;Dels=0.00;EL=45;EPP=3.649;ER=40;FS=0.935;HETAR=218;HOMA=841;HOMR=14;HRun=2;InbreedingCoeff=0.0250;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.74289;LRBP=7507.5;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=103.01;MQRankSum=2.843;NS=1075;RA=541;RL=2;RPP=170.62;RR=83;RUN=1;ReadPosRankSum=-16.222;SAB=0.49412;SAF=42;SAP=3.0358;SAR=43;SRB=0.44917;SRF=243;SRP=15.152;SRR=298;VQSLOD=3.9745;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.97
-20 16828509 . G GT 843.62 PASS AA=30;AB=0.70103;ABA=29;ABP=37.06;ABR=68;AC=10;AF=0.0140;AN=714;BL=1368;BR=1786;BVAR;BaseQRankSum=-4.061;DP=8682;Dels=0.01;EL=14;EPP=3.2998;ER=16;FR;FS=2.681;HETAR=22;HOMA=1;HOMR=1020;HP=8;HPLen=8;HR=8;HRun=8;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.1389;IndelType=INS.NumRepetitions_8.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.13253;LRBP=123.3;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=62.8;MQRankSum=-1.491;NF;NR;NS=1043;PP;RA=4416;RL=11;RPP=7.6428;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.718;SAB=0.76667;SAF=23;SAP=21.54;SAR=7;SC=CCTTCAAAAGGTTTTTTTTGG;SRB=0.5745;SRF=2537;SRP=215.91;SRR=1879;TC;TR=8;TU=T;VQSLOD=7.6258;set=Intersection;sumGLbyD=10.77
-20 17470034 . GC G 46975 PASS AA=57;AB=0.96043;ABA=52;ABP=2422.5;ABR=1262;AC=34;AF=0.02773;AN=1226;BL=418;BR=3446;BVAR;BaseQRankSum=-6.250;DEL;DP=12035;Dels=0.00;EL=22;EPP=9.4485;ER=35;FS=1.350;HETAR=416;HOMA=409;HOMR=244;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0083;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.78364;LRBP=5155.6;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=99.509;MQRankSum=2.192;NS=1076;RA=2396;RL=5;RPP=87.164;RR=52;RUN=1;ReadPosRankSum=-15.199;SAB=0.5614;SAF=32;SAP=4.877;SAR=25;SRB=0.52963;SRF=1269;SRP=21.285;SRR=1127;VQSLOD=3.8440;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.06
-20 17471374 . AGCGGC A 850.03 PASS AC=6;AF=0.0085;AF1=0.01301;AN=704;BaseQRankSum=6.259;CI95=0.00885,0.01991;DP=8180;DP4=2215,1878,4,5;Dels=0.01;FQ=131;FS=0.000;HRun=0;INDEL;InbreedingCoeff=0.0009;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_5.;MQ=104.41;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-5.521;PV4=0.74,0.37,0.0005,1;ReadPosRankSum=2.468;VQSLOD=6.8773;set=Intersection;sumGLbyD=30.85
-20 18433202 rs35582929 G GA 2506.90 PASS AA=55;AB=0.5812;ABA=49;ABP=9.7103;ABR=68;AC=20;AF=0.0218;AN=918;BL=2263;BR=2175;BVAR;BaseQRankSum=-6.639;DB;DP=19467;DP4=1845,2365,27,26;Dels=0.00;EL=21;EPP=9.6826;ER=34;FQ=999;FR;FS=5.633;HETAR=16;HOMA=3;HOMR=1045;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=1;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0700;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.019829;LRBP=6.7994;MQ=114.03;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=83.345;MQRankSum=1.610;NF;NR;NS=1064;PP;PV4=0.33,1,1,1;RA=5380;RL=28;RPP=3.0498;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=0.873;SAB=0.47273;SAF=26;SAP=3.3656;SAR=29;SC=TATTTCATGGGAGCATTAAAA;SRB=0.42862;SRF=2306;SRP=241.07;SRR=3074;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=10.0372;dbSNP=126;set=Intersection;sumGLbyD=13.10
-20 18551314 rs10659122 CA C,CAA,CAAA,CAAAA,CAAAAA 18810.74 PASS ABR=243;AC=19,169,216,164,188;AF=0.01816,0.16157,0.20650,0.15679,0.17973;BVAR;BaseQRankSum=-5.742;DB;DP=17637;DP4=136,77,560,237;FR;FS=2.693;HOMA=177;HOMR=299;HP=17;HR=17;HU=A;HaplotypeScore=15.5048;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.8901;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=11;MQ0Fraction=0.0069;MQRankSum=1.845;NF;NR;NS=658;PP;PV4=0.08,1,1,1;QD=12.66;RA=673;RUN=1;ReadPosRankSum=0.283;SB=-3514.45;SC=GATTCCATCTCAAAAAAAAAA;SRB=0.63596;SRF=428;SRP=111.06;SRR=245;TC;TR=17;TU=A;VQSLOD=10.6964;dbSNP=130;set=Intersection
-20 18785519 . G GTC 415.55 PASS AC=28;AF=0.0400;AN=700;BaseQRankSum=10.889;DP=1929;FS=8.778;HRun=0;HaplotypeScore=27.6448;InbreedingCoeff=0.0510;IndelType=INS.NOVEL_2.;MQ=61.99;MQ0=36;MQ0Fraction=0.0187;MQRankSum=4.508;QD=3.08;ReadPosRankSum=8.080;SB=-437.03;VQSLOD=4.9313;set=VQSR
-20 20301041 rs35451634 ATATG A 200.42 PASS AC=21;AF=0.0449;AN=468;BaseQRankSum=5.251;DB;DP=579;FS=24.013;HRun=0;HaplotypeScore=27.8977;InbreedingCoeff=0.0113;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ=78.47;MQ0=26;MQ0Fraction=0.0449;MQRankSum=-5.284;QD=3.06;ReadPosRankSum=1.793;SB=-55.76;VQSLOD=5.0981;set=VQSR
-20 20378174 . TC T 245.55 PASS AC=23;AF=0.01879;AN=1224;BaseQRankSum=0.990;DP=3225;FS=10.413;HRun=1;HaplotypeScore=22.6109;InbreedingCoeff=0.0244;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=93.70;MQ0=3;MQ0Fraction=0.0009;MQRankSum=-3.349;QD=1.86;ReadPosRankSum=-7.227;SB=-188.62;VQSLOD=4.2553;set=VQSR
-20 20809160 rs10571503 TAA AAA,T 3496 PASS AC=0;AF=0.0000;AN=612;BaseQRankSum=1.968;DB;DP=1092;FR;HP=4;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=A;HaplotypeScore=26.1253;InbreedingCoeff=0.0603;IndelType=MIXED;MQ=68.98;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0009;MQRankSum=1.520;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-4.042;SC=TATATATATATAAATTTAAAT;TC;TR=13;TU=AT;set=filterInVQSR-2of5
-20 22508765 . CT C 53877.84 PASS AA=187;AB=0.78077;ABA=171;ABP=537.09;ABR=609;AC=1017;AF=0.91787;AN=1108;BL=12690;BR=1718;BVAR;BaseQRankSum=13.773;DEL;DP=7430;Dels=0.02;EL=73;EPP=22.53;ER=114;FR;FS=16.352;HETAR=152;HOMA=9;HOMR=786;HP=8;HR=4;HRun=4;HU=T;InbreedingCoeff=0.3885;IndelType=DEL.NumRepetitions_4.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.76152;LRBP=18147;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=46.086;MQRankSum=0.971;NF;NR;NS=947;PP;RA=2868;RL=177;RPP=326.86;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=9.951;SAB=0.34759;SAF=65;SAP=40.738;SAR=122;SC=AAAAAATTTTCTTTTGAACTG;SRB=0.46269;SRF=1327;SRP=37.684;SRR=1541;TC;TR=4;TU=T;VQSLOD=5.1182;set=Intersection;sumGLbyD=25.15
-20 22555082 rs11477526 AT A 11503 PASS AA=530;AB=0.50816;ABA=422;ABP=3.5063;ABR=436;AF=0.1614;AN=700;BL=21453;BR=23313;BVAR;BaseQRankSum=17.562;DB;DEL;DP=25587;DP4=1869,1600,283,201;Dels=0.14;EL=259;EPP=3.6003;ER=271;FQ=999;FR;FS=14.595;HETAR=159;HOMA=41;HOMR=846;HP=3;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0995;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.041549;LRBP=170.83;MQ=95.89;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=72.162;MQRankSum=2.564;NF;NR;NS=1046;PP;PV4=0.058,6.6e-129,0.04,1;RA=4303;RL=264;RPP=3.0267;RR=266;RUN=1;ReadPosRankSum=0.176;SAB=0.58679;SAF=311;SAP=37.688;SAR=219;SC=GGGAAAGCTGATTTACTGATT;SRB=0.54892;SRF=2362;SRP=92.453;SRR=1941;TC;TR=3;TU=T;VQSLOD=8.7746;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=15.27
-20 22590907 . A AC 4204.88 PASS AA=67;AB=0.592;ABA=51;ABP=12.2;ABR=74;AF=0.0554;AF1=0.0468;AN=560;BL=2277;BR=2389;BVAR;BaseQRankSum=10.968;CI95=0.03759,0.05639;DP=14380;DP4=2514,2018,33,33;Dels=0.00;EL=22;EPP=20.155;ER=45;FQ=999;FR;FS=3.846;HETAR=25;HOMA=4;HOMR=1049;HP=4;HPLen=5;HR=5;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0719;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_C.;LEN=1;LRB=0.024003;LRBP=8.8481;MQ=110.68;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=96.149;MQRankSum=2.668;NF;NR;NS=1078;PP;PV4=0.39,1,0.46,0.36;RA=5468;RL=33;RPP=3.0427;RR=34;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.097;SAB=0.50746;SAF=34;SAP=3.0427;SAR=33;SC=TCATATCAAAAACATTACGTT;SRB=0.54389;SRF=2974;SRP=94.508;SRR=2494;TC;TR=5;TU=A;VQSLOD=10.0712;set=Intersection;sumGLbyD=27.69
-20 22806326 rs11468890 ATTCCATCAC A 105320.99 PASS AC=567;AF=0.48795;AN=1162;BVAR;BaseQRankSum=32.858;DB;DEL;DP=26278;DP4=727,796,554,587;Dels=0.30;FQ=999;FR;FS=1.923;HP=3;HPLen=3;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.2548;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_9.;LEN=9;MQ=89.42;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-23.545;NF;NR;PP;PV4=0.7,1,1.3e-167,1;RUN=1;ReadPosRankSum=4.384;SC=GGCTGCTCCCATTCCATCACT;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=8.2594;set=Intersection;sumGLbyD=69.81
-20 22999898 rs55966257 CAGGA C 8019.97 PASS AA=23;AB=0.57778;ABA=19;ABP=5.3748;ABR=26;AC=214;AF=0.18838;AN=1136;BL=1143;BR=1040;BVAR;BaseQRankSum=29.294;DB;DEL;DP=8216;Dels=0.02;EL=11;EPP=3.1047;ER=12;FS=14.938;HETAR=14;HOMA=2;HOMR=948;HRun=0;InbreedingCoeff=0.0797;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.047183;LRBP=13.563;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=34.783;MQRankSum=-20.301;NS=964;RA=3637;RL=13;RPP=3.86;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=-24.607;SAB=0.47826;SAF=11;SAP=3.1047;SAR=12;SRB=0.49024;SRF=1783;SRP=6.02;SRR=1854;VQSLOD=7.9163;set=Intersection;sumGLbyD=9.43
-20 23385964 rs57723772 GAA G 8170.95 PASS AC=257;AF=0.20928;AN=1228;BaseQRankSum=32.220;DB;DP=3291;FS=1.688;HRun=3;HaplotypeScore=22.6739;InbreedingCoeff=0.0171;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=58.44;MQ0=32;MQ0Fraction=0.0097;MQRankSum=-4.893;QD=6.55;ReadPosRankSum=-35.524;SB=-3631.67;VQSLOD=5.6549;set=VQSR
-20 23534530 . TA T 3542.10 PASS AA=45;AB=0.75658;ABA=37;ABP=89.926;ABR=115;AC=35;AF=0.02991;AN=1170;BL=3090;BR=270;BVAR;BaseQRankSum=-6.892;DEL;DP=8108;Dels=0.00;EL=19;EPP=5.3748;ER=26;FS=1.026;HETAR=76;HOMA=896;HOMR=18;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0551;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.83929;LRBP=5142.4;MQ0Fraction=0.0017;MQM=41.578;MQRankSum=0.818;NS=991;RA=203;RL=43;RPP=84.127;RR=2;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.923;SAB=0.37778;SAF=17;SAP=8.8491;SAR=28;SRB=0.5665;SRF=115;SRP=10.808;SRR=88;VQSLOD=4.2093;set=Intersection;sumGLbyD=3.49
-20 23976810 rs5841018 A ATATTAAT 1782.38 PASS AF=0.1387;AF1=0.01507;BaseQRankSum=3.717;CI95=0.00188,0.03947;DB;DP=1712;DP4=357,376,7,2;Dels=0.00;FQ=31.1;FS=14.489;HPLen=2;HRun=0;INDEL;InbreedingCoeff=0.1123;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_7.;MQ=49.53;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0055;MQRankSum=-4.928;PV4=0.1,1,0.00085,0.016;ReadPosRankSum=-4.456;VQSLOD=5.3140;dbSNP=116;set=Intersection;sumGLbyD=19.98
-20 24222100 . CTTTTA C 4219.36 PASS AA=57;AB=0.59434;ABA=43;ABP=11.205;ABR=63;AF=0.01803;AF1=0.01547;AN=1220;BL=2073;BR=2345;BVAR;BaseQRankSum=7.990;CI95=0.0114,0.02137;DEL;DP=17536;DP4=2140,2346,7,12;Dels=0.01;EL=32;EPP=4.877;ER=25;FQ=104;FS=0.614;HETAR=21;HOMA=4;HOMR=1042;HRun=0;INDEL;InbreedingCoeff=0.1941;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_5.;LEN=5;LRB=0.061566;LRBP=39.374;MQ=73.32;MQ0Fraction=0.0021;MQM=39.614;MQRankSum=-5.728;NS=1067;PV4=0.37,1.1e-39,3.5e-09,1;RA=5527;RL=28;RPP=3.0484;RR=29;RUN=1;ReadPosRankSum=0.214;SAB=0.54386;SAF=31;SAP=3.9627;SAR=26;SRB=0.49267;SRF=2723;SRP=5.588;SRR=2804;VQSLOD=7.5428;set=Intersection;sumGLbyD=38.08
-20 24395018 . AT A 49310 PASS AA=146;AB=0.91198;ABA=130;ABP=2180.5;ABR=1347;AC=50;AF=0.04045;AN=1236;BL=587;BR=9625;BVAR;BaseQRankSum=-4.610;DEL;DP=12793;Dels=0.01;EL=54;EPP=24.487;ER=92;FS=22.108;HETAR=485;HOMA=384;HOMR=210;HRun=2;InbreedingCoeff=0.0374;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.88504;LRBP=17373;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=102.26;MQRankSum=2.256;NS=1080;RA=2377;RL=1;RPP=311.42;RR=145;RUN=1;ReadPosRankSum=-16.347;SAB=0.63699;SAF=93;SAP=26.807;SAR=53;SRB=0.52167;SRF=1240;SRP=12.702;SRR=1137;VQSLOD=3.2421;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.80
-20 24411517 . C CA 246.18 PASS AF=0.01546;AF1=0.01095;BaseQRankSum=7.832;CI95=0.005698,0.01709;DP=7981;DP4=983,2037,7,7;Dels=0.00;FQ=27.9;FS=18.815;HPLen=3;HRun=3;INDEL;InbreedingCoeff=0.0175;IndelType=INS.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=60.28;MQ0Fraction=0.0137;MQRankSum=-7.243;PV4=0.25,1,2.7e-05,1;ReadPosRankSum=-0.143;VQSLOD=4.3701;set=Intersection;sumGLbyD=6.56
-20 24421169 . AG A 27480 PASS AA=182;AB=0.8303;ABA=149;ABP=835;ABR=729;AC=89;AF=0.07224;AN=1232;BL=11276;BR=2214;BVAR;BaseQRankSum=-5.447;DEL;DP=11717;Dels=0.01;EL=103;EPP=9.8827;ER=79;FR;FS=15.492;HETAR=343;HOMA=607;HOMR=114;HP=4;HR=1;HRun=1;HU=G;InbreedingCoeff=0.0353;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.67176;LRBP=13222;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=88.324;MQRankSum=2.221;NF;NR;NS=1071;PP;RA=1226;RL=169;RPP=293.37;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-19.711;SAB=0.54945;SAF=100;SAP=6.876;SAR=82;SC=CCTTAGCCCCAGAAAACATCT;SRB=0.44535;SRF=546;SRP=34.814;SRR=680;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=4.2669;set=Intersection;sumGLbyD=3.91
-20 24765537 rs71841337 ATTT A,AT,ATT,ATTTT,ATTTTT 37852 PASS AC=13,120,527,51,92;AF=0.01102,0.10169,0.44661,0.04322,0.07797;AN=1180;BVAR;BaseQRankSum=8.172;DB;DEL;DP=39116;DP4=200,331,851,1169;FR;FS=2.394;HP=15;HR=15;HU=T;HaplotypeScore=20.8091;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.4815;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=4.344;NF;NR;PP;PV4=0.067,1,1,0.1;QD=7.90;RUN=1;ReadPosRankSum=1.798;SB=-8371.96;SC=CTCTGCAACAATTTTTTTTTT;TC;TR=15;TU=T;VQSLOD=9.9679;dbSNP=120;set=Intersection
-20 25500689 . A AATTT 84980.72 PASS AC=1005;AF=0.89096;AN=1128;BaseQRankSum=17.400;DP=2324;FS=6.721;HRun=0;HaplotypeScore=25.3376;InbreedingCoeff=0.2148;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ=75.19;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQRankSum=-8.221;QD=38.28;ReadPosRankSum=4.504;SB=-34833.07;VQSLOD=4.6038;set=VQSR
-20 25550373 . GA G 11251.31 PASS AA=246;AB=0.42963;ABA=154;ABP=14.624;ABR=116;AC=566;AF=0.6521;AN=868;BL=5230;BR=11845;BVAR;BaseQRankSum=7.418;DEL;DP=8885;Dels=0.02;EL=99;EPP=23.348;ER=147;FR;FS=50.357;HETAR=150;HOMA=849;HOMR=14;HP=1;HR=2;HRun=1;HU=G;InbreedingCoeff=0.1365;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.38741;LRBP=5567.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=97.561;MQRankSum=0.050;NF;NR;NS=1013;PP;RA=269;RL=75;RPP=84.361;RR=171;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.128;SAB=0.52846;SAF=130;SAP=4.7404;SAR=116;SC=CACGGAGGCGGAGGAAGCAGC;SRB=0.42379;SRF=114;SRP=16.58;SRR=155;TC;TR=6;TU=AGG;VQSLOD=4.0103;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.58
-20 25903865 . TTC T 7459.23 PASS AC=277;AF=0.23316;AN=1188;BaseQRankSum=31.479;DP=2969;FS=137.723;HRun=0;HaplotypeScore=37.3300;InbreedingCoeff=-0.1755;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TC.;MQ=53.49;MQ0=50;MQ0Fraction=0.0168;MQRankSum=-25.506;QD=4.70;ReadPosRankSum=-5.913;SB=-1747.98;VQSLOD=5.4731;set=VQSR
-20 25934237 . C CCACTT 771.36 PASS AC=37;AF=0.0426;AN=868;BaseQRankSum=16.331;DP=2253;FS=4.545;HRun=0;HaplotypeScore=29.9764;InbreedingCoeff=-0.0685;IndelType=INS.NOVEL_5.;MQ=48.12;MQ0=87;MQ0Fraction=0.0386;MQRankSum=-12.497;QD=3.37;ReadPosRankSum=-8.428;SB=-297.70;VQSLOD=4.2324;set=VQSR
-20 26054751 rs112967123 TATC T 33244 PASS AA=1863;AB=0.79012;ABA=1788;ABP=6231;ABR=6731;AC=227;AF=0.18218;AN=1246;BL=74924;BR=72452;BVAR;BaseQRankSum=32.258;DB;DEL;DP=36404;DS;Dels=0.05;EL=931;EPP=3.0115;ER=932;FR;FS=265.752;HETAR=527;HOMA=2;HOMR=565;HP=1;HR=2;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=-0.2137;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_3.;LEN=3;LRB=0.016773;LRBP=93.048;MQ0Fraction=0.0127;MQM=28.797;MQRankSum=-5.329;NF;NR;NS=1094;PP;RA=14604;RL=1014;RPP=34.743;RR=849;RUN=1;ReadPosRankSum=8.394;SAB=0.65486;SAF=1220;SAP=391.07;SAR=643;SC=TCACCATCATTATCATCATTA;SRB=0.56717;SRF=8283;SRP=575.39;SRR=6321;TC;TR=8;TU=ATC;VQSLOD=1.0486;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.54
-20 26120452 . CAG C 7863.19 PASS AA=163;AB=0.70489;ABA=157;ABP=196.99;ABR=375;AC=171;AF=0.1908;AN=896;BL=3455;BR=4877;BVAR;BaseQRankSum=25.536;DEL;DP=7014;Dels=0.10;EL=58;EPP=32.438;ER=105;FS=231.723;HETAR=90;HOMA=5;HOMR=387;HRun=0;InbreedingCoeff=-0.1966;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;LEN=2;LRB=0.17067;LRBP=530;MQ0Fraction=0.0470;MQM=21.951;MQRankSum=-23.449;NS=482;RA=1117;RL=62;RPP=23.273;RR=101;RUN=1;ReadPosRankSum=1.904;SAB=0.37423;SAF=61;SAP=25.404;SAR=102;SRB=0.41719;SRF=466;SRP=69.544;SRR=651;VQSLOD=-0.9395;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.06
-20 26185812 . AG A 322.58 PASS AF=0.0342;BaseQRankSum=3.668;DP=3014;Dels=0.01;FR;FS=10.238;HP=8;HPLen=6;HR=6;HRun=6;HU=G;InbreedingCoeff=0.1504;IndelType=DEL.NumRepetitions_6.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;MQ0Fraction=0.0473;MQRankSum=-5.464;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=0.536;SC=GGGTGGGTGGAGGGGGGAGGG;TC;TR=6;TU=G;VQSLOD=5.0767;set=Intersection;sumGLbyD=8.46
-20 30963468 . AGTTT A 2041.12 PASS AA=38;AB=0.75694;ABA=35;ABP=85.587;ABR=109;AC=34;AF=0.0377;AN=902;BL=1974;BR=668;BVAR;BaseQRankSum=3.060;DEL;DP=22806;DP4=1997,1747,28,36;Dels=0.02;EL=17;EPP=3.9246;ER=21;FR;FS=16.034;HETAR=29;HOMA=1;HOMR=1009;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.0752;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.49432;LRBP=1404.9;MQ=87.17;MQ0Fraction=0.0013;MQM=98.079;MQRankSum=6.021;NF;NR;NS=1039;PP;PV4=0.13,1.5e-07,1,0.051;RA=4052;RL=36;RPP=69.069;RR=2;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.847;SAB=0.5;SAF=19;SAP=3.0103;SAR=19;SC=AGAAGTAAGTAGTTTGTTTTT;SRB=0.53776;SRF=2179;SRP=53.19;SRR=1873;TC;TR=9;TU=AAGT;VQSLOD=7.3578;set=Intersection;sumGLbyD=14.03
-20 31963212 . AAAAAAAAAAAAG A 727.15 PASS AC=5;AF=0.0080;AN=622;BaseQRankSum=4.037;DP=1480;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=43.3793;InbreedingCoeff=0.0350;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_10orMore.;MQ=51.77;MQ0=59;MQ0Fraction=0.0399;MQRankSum=-1.799;QD=22.72;ReadPosRankSum=3.591;SB=-364.04;VQSLOD=5.3166;set=VQSR
-20 31997272 . CT C,CTT,CTTT 1837.10 PASS AA=63;AB=0.77559;ABA=57;ABP=170.57;ABR=197;AC=79,49,30;AF=0.06594,0.04090,0.02504;AN=1198;BL=2372;BR=2640;BVAR;BaseQRankSum=3.277;DP=9050;Dels=0.03;EL=24;EPP=10.766;ER=39;FR;FS=0.303;HETAR=45;HOMA=1;HOMR=981;HP=10;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2796;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.053472;LRBP=34.128;MQ0Fraction=0.0000;MQM=50.889;MQRankSum=0.610;NF;NR;NS=1027;PP;RA=3776;RL=30;RPP=3.3205;RR=33;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.800;SAB=0.39683;SAF=25;SAP=8.8354;SAR=38;SC=ACCCAACTTCCTTTTTTTTTT;SRB=0.46213;SRF=1745;SRP=50.049;SRR=2031;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=4.1189;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.66
-20 33446974 rs113250263 TAA T,TA,TAAA 17130.16 PASS AC=65,417,184;AF=0.05941,0.38117,0.16819;AN=1094;BVAR;BaseQRankSum=3.400;DB;DEL;DP=22362;DP4=221,247,418,524;Dels=0.33;FR;FS=15.409;HP=15;HR=14;HRun=14;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.5215;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=61.32;MQ0Fraction=0.0021;MQRankSum=0.481;NF;NR;PP;PV4=0.33,1,1,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.056;SC=CTCCGTCTCATAAAAAAAAAA;TC;TR=14;TU=A;VQSLOD=8.0974;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=12.78
-20 33877149 . C CT 1784.40 PASS AA=58;AB=0.73096;ABA=53;ABP=94.289;ABR=144;AC=65;AF=0.05682;AN=1144;BL=3298;BR=1935;BVAR;BaseQRankSum=-2.066;DP=8074;Dels=0.02;EL=22;EPP=10.348;ER=36;FR;FS=11.452;HETAR=47;HOMA=3;HOMR=754;HP=16;HR=12;HRun=12;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.1178;IndelType=INS.NumRepetitions_10orMore.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.26046;LRBP=773.91;MQ0Fraction=0.0165;MQM=52.259;MQRankSum=0.734;NF;NR;NS=804;PP;RA=2141;RL=43;RPP=32.363;RR=15;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.273;SAB=0.46552;SAF=27;SAP=3.6093;SAR=31;SC=ATTTTCTTTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.37553;SRF=804;SRP=291.14;SRR=1337;TC;TR=12;TU=T;VQSLOD=3.1540;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.84
-20 34387589 rs112431805 CT C,CTT 4039.10 PASS AA=121;AB=0.75368;ABA=117;ABP=268.53;ABR=358;AC=84,139;AF=0.07047,0.11661;AN=1192;BL=5557;BR=3901;BVAR;BaseQRankSum=2.693;DB;DP=10157;Dels=0.03;EL=47;EPP=16.093;ER=74;FR;FS=7.639;HETAR=89;HOMA=2;HOMR=913;HP=13;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2097;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.17509;LRBP=632.63;MQ0Fraction=0.0000;MQM=49.802;MQRankSum=-0.801;NF;NR;NS=1004;PP;RA=3789;RL=77;RPP=22.554;RR=44;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.691;SAB=0.3719;SAF=45;SAP=20.256;SAR=76;SC=AAGAAGTGTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.40987;SRF=1553;SRP=270.35;SRR=2236;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=4.0473;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.64
-20 34493409 rs73621682 C CAG 62288.93 PASS AA=1069;AB=0.54863;ABA=826;ABP=40.606;ABR=1004;AC=257;AF=0.3640;AN=706;BL=41524;BR=47039;BVAR;BaseQRankSum=-24.248;DB;DP=30195;DP4=1743,1636,614,487;Dels=0.00;EL=582;EPP=21.343;ER=487;FQ=999;FR;FS=5.080;HETAR=298;HOMA=63;HOMR=712;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1437;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;LEN=2;LRB=0.062272;LRBP=748.76;MQ=77.99;MQ0=3;MQ0Fraction=0.0015;MQM=54.446;MQRankSum=0.160;NF;NR;NS=1073;PP;PV4=0.016,1,0.01,1;RA=4461;RL=526;RPP=3.5973;RR=543;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.716;SAB=0.57343;SAF=613;SAP=53.08;SAR=456;SC=AGGAAGAGATCAGAGCTCCCC;SRB=0.52634;SRF=2348;SRP=29.892;SRR=2113;TC;TR=4;TU=AG;VQSLOD=8.7047;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=49.82
-20 35957317 . CTGACT C,CGACT 4370.96 PASS ABR=81;AC=22,1;AF=0.0321,0.0015;AF1=0.04523;AN=686;BVAR;BaseQRankSum=7.969;CI95=0.0354,0.05752;DEL;DP=16632;DP4=1942,1815,17,21;Dels=0.03;FQ=999;FR;FS=0.531;HOMA=1;HOMR=998;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0587;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=83.38;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-7.201;NF;NR;NS=1020;PP;PV4=0.42,0.00017,4.5e-12,1;RA=4620;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.007;SC=CCTCTCAGCTCTGACTGAGTC;SRB=0.50043;SRF=2312;SRP=3.0178;SRR=2308;TC;TR=8;TU=ACTG;VQSLOD=9.9778;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=36.45
-20 36136198 . GTGTC G 2078.76 PASS AA=35;AB=0.54167;ABA=33;ABP=4.096;ABR=39;AC=17;AF=0.01384;AN=1228;BL=1212;BR=1523;BVAR;BaseQRankSum=6.900;DEL;DP=22483;DP4=1696,2291,9,16;Dels=0.01;EL=9;EPP=20.94;ER=26;FQ=999;FR;FS=3.023;HETAR=13;HOMA=1;HOMR=1061;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1113;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.11371;LRBP=79.803;MQ=93.98;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=83.686;MQRankSum=-1.683;NF;NR;NS=1075;PP;PV4=0.55,1,0.0083,1;RA=5771;RL=19;RPP=3.5687;RR=16;RUN=1;ReadPosRankSum=0.618;SAB=0.37143;SAF=13;SAP=8.0357;SAR=22;SC=TATCATTTTAGTGTCTGTCTG;SRB=0.44966;SRF=2595;SRP=130.03;SRR=3176;TC;TR=11;TU=CTGT;VQSLOD=10.1935;set=Intersection;sumGLbyD=31.66
-20 36250522 . CA C 37933 PASS AA=51;AB=0.95582;ABA=44;ABP=1800.5;ABR=952;AC=23;AF=0.01885;AN=1220;BL=691;BR=3464;BVAR;BaseQRankSum=-2.418;DEL;DP=11998;Dels=0.00;EL=18;EPP=12.59;ER=33;FS=2.307;HETAR=348;HOMA=534;HOMR=164;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0763;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.66739;LRBP=4021.7;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0006;MQM=53.647;MQRankSum=1.083;NS=1047;RA=1663;RL=2;RPP=97.065;RR=49;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.726;SAB=0.68627;SAF=35;SAP=18.381;SAR=16;SRB=0.59651;SRF=992;SRP=137.56;SRR=671;VQSLOD=4.1346;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.29
-20 36285033 rs34715186 AT A 39417 PASS AA=530;AB=0.5406;ABA=447;ABP=16.939;ABR=526;AC=88;AF=0.0950;AN=926;BL=20722;BR=20406;BVAR;BaseQRankSum=15.611;DB;DEL;DP=36713;DP4=2551,2475,236,218;Dels=0.09;EL=241;EPP=12.45;ER=289;FQ=999;FR;FS=1.290;HETAR=141;HOMA=16;HOMR=926;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=1;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0742;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.0076833;LRBP=8.2825;MQ=104.81;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=84.285;MQRankSum=-0.702;NF;NR;NS=1083;PP;PV4=0.62,1,1,1;RA=6562;RL=263;RPP=3.0759;RR=267;RUN=1;ReadPosRankSum=0.090;SAB=0.55849;SAF=296;SAP=18.76;SAR=234;SC=AAAAACACAAATCAGATCGTG;SRB=0.51707;SRF=3393;SRP=19.614;SRR=3169;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=10.5533;dbSNP=126;set=Intersection;sumGLbyD=14.15
-20 36384872 . CTG C 43532.41 PASS AC=1213;AF=0.99589;AN=1218;BaseQRankSum=0.802;DP=3208;FS=9.727;HRun=0;HaplotypeScore=46.6153;InbreedingCoeff=0.1085;IndelType=DEL.NumRepetitions_7.EventLength_2.RepeatExpansion_TG.;MQ=58.37;MQ0=50;MQ0Fraction=0.0156;MQRankSum=-1.672;QD=13.57;ReadPosRankSum=2.063;SB=-18894.12;VQSLOD=4.7353;set=VQSR
-20 36542802 . GTA G 31310.15 PASS AA=1481;AB=0.67546;ABA=1378;ABP=1138.4;ABR=2868;AC=437;AF=0.35938;AN=1216;BL=25719;BR=95500;BVAR;BaseQRankSum=9.478;DEL;DP=18068;DS;Dels=0.10;EL=889;EPP=132.34;ER=592;FS=320.726;HETAR=591;HOMA=44;HOMR=378;HRun=0;InbreedingCoeff=-0.4197;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TA.;LEN=2;LRB=0.57566;LRBP=87231;MQ0Fraction=0.0091;MQM=29.319;MQRankSum=-3.409;NS=1013;RA=4037;RL=3;RPP=3193;RR=1478;RUN=1;ReadPosRankSum=-6.687;SAB=0.40041;SAF=593;SAP=130.61;SAR=888;SRB=0.39014;SRF=1575;SRP=426.21;SRR=2462;VQSLOD=-1.6586;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.49
-20 36985025 . CCA C 4.57 PASS AC=0;AF=0.0000;AN=682;BaseQRankSum=4.199;DP=1504;FS=1.036;HRun=0;HaplotypeScore=18.5241;InbreedingCoeff=0.0460;IndelType=DEL.NumRepetitions_6.EventLength_2.RepeatExpansion_CA.;MQ=57.04;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.774;ReadPosRankSum=-2.105;VQSLOD=6.7455;set=VQSR
-20 37139725 . CAG C 250.77 PASS AF=0.0084;AF1=0.0139;BaseQRankSum=4.131;CI95=0.00885,0.01991;DP=7973;DP4=1808,1990,2,7;Dels=0.01;FQ=104;FR;FS=11.160;HP=3;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0001;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;MQ=103.71;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-3.378;NF;NR;PP;PV4=0.18,0.0011,0.041,1;ReadPosRankSum=0.605;SC=AGATGGGGAACAGAGAGCAAG;TC;TR=6;TU=AG;VQSLOD=7.0630;set=Intersection;sumGLbyD=12.13
-20 37213224 . G GTA 3230.05 PASS AA=32;AB=0.50769;ABA=32;ABP=3.0437;ABR=33;AC=12;AF=0.0168;AF1=0.02635;AN=714;BL=1271;BR=1743;BVAR;BaseQRankSum=-7.288;CI95=0.02212,0.03319;DP=14304;DP4=2180,2256,13,21;Dels=0.00;EL=20;EPP=7.3532;ER=12;FQ=999;FR;FS=7.863;HETAR=9;HOMA=0;HOMR=1043;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0410;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TA.;LEN=2;LRB=0.1566;LRBP=163.52;MQ=95.56;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0005;MQM=51.562;MQRankSum=0.420;NF;NR;NS=1052;PP;PV4=0.23,1,0.03,0.33;RA=5138;RL=11;RPP=9.7962;RR=21;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.122;SAB=0.28125;SAF=9;SAP=16.311;SAR=23;SC=TTTGCATCCAGTAGCACCACT;SRB=0.42293;SRF=2173;SRP=268.11;SRR=2965;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=9.7315;set=Intersection;sumGLbyD=36.69
-20 37282014 . ATGG A 2518.52 PASS AF=0.03519;BaseQRankSum=11.994;DP=24592;DP4=415,3804,8,49;DS;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=2.049;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1028;IndelType=DEL.NumRepetitions_5.EventLength_3.;MQ=51.01;MQ0Fraction=0.0139;MQRankSum=-5.912;NF;NR;PP;PV4=0.27,1,0.22,0.015;ReadPosRankSum=1.781;SC=GGTGGTGATGATGGTGGTGGT;TC;TR=17;TU=GGT;VQSLOD=2.1183;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=9.05
-20 37532218 . GTCCGTCCA ATCCGTCCA,G 76120.88 PASS AC=998;AF=0.92924;AN=1074;BaseQRankSum=-2.877;DP=3087;FR;FS=9.889;HP=2;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=T;HaplotypeScore=71.6244;InbreedingCoeff=-0.0027;IndelType=MIXED;MQ=52.68;MQ0=543;MQ0Fraction=0.1759;MQRankSum=-1.750;NF;NR;PP;QD=24.98;ReadPosRankSum=-0.850;SB=-36635.43;SC=CCGTCCGTCCGTCCGTCCATC;TC;TR=19;TU=CCGT;VQSLOD=5.3068;set=Intersection
-20 37712193 . AAG A 2670.33 PASS AA=106;AB=0.62821;ABA=87;ABP=36.418;ABR=147;AC=53;AF=0.0759;AN=698;BL=4672;BR=4303;BVAR;BaseQRankSum=13.696;DEL;DP=15155;DP4=1340,1852,32,52;Dels=0.06;EL=57;EPP=4.3214;ER=49;FR;FS=0.824;HETAR=43;HOMA=7;HOMR=982;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0861;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;LEN=2;LRB=0.041114;LRBP=35.954;MQ=86.12;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=54.236;MQRankSum=-5.745;NF;NR;NS=1034;PP;PV4=0.5,7.3e-26,1.1e-10,1;RA=4423;RL=58;RPP=5.0589;RR=48;RUN=1;ReadPosRankSum=2.617;SAB=0.38679;SAF=41;SAP=14.81;SAR=65;SC=GAAAATTCTGAAGAGAGTCAG;SRB=0.43093;SRF=1906;SRP=186.29;SRR=2517;TC;TR=6;TU=AG;VQSLOD=9.8131;set=Intersection;sumGLbyD=14.20
-20 37739002 . T TCA 1395.38 PASS AA=16;AB=0.48387;ABA=16;ABP=3.0803;ABR=15;AC=11;AF=0.00950;AN=1158;BL=504;BR=630;BVAR;BaseQRankSum=-3.257;DP=13617;DP4=1660,883,7,5;Dels=0.00;EL=7;EPP=3.5532;ER=9;FR;FS=1.114;HETAR=9;HOMA=0;HOMR=991;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0527;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_CA.;LEN=2;LRB=0.11111;LRBP=33.411;MQ=88.41;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=83.75;MQRankSum=1.713;NF;NR;NS=1000;PP;PV4=0.76,1,1,0.5;RA=3257;RL=6;RPP=5.1818;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=1.190;SAB=0.6875;SAF=11;SAP=7.8961;SAR=5;SC=CCTTTTTTGTTCATTTCTGCA;SRB=0.68806;SRF=2241;SRP=1003.5;SRR=1016;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=10.2220;set=Intersection;sumGLbyD=41.32
-20 38395256 . TTGAG T 633.19 PASS AF=0.0028;BaseQRankSum=5.667;DP=3839;Dels=0.00;FR;FS=10.238;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=-0.0097;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.276;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-1.016;SC=ATGTGTTTGTTTGAGTATGTT;TC;TR=10;TU=GTTT;VQSLOD=6.4906;set=Intersection;sumGLbyD=10.83
-20 39345038 . CTGAACCATAATGTG C,CCCATAATGTG 60744.52 PASS AA=23;AB=0.67143;ABA=23;ABP=20.878;ABR=47;AC=232,2;AF=0.19366,0.00167;AN=1198;BL=1607;BR=1843;BVAR;BaseQRankSum=30.955;DEL;DP=31490;DP4=1729,2100,265,278;Dels=0.13;EL=6;EPP=14.434;ER=17;FQ=999;FR;FS=1.767;HETAR=18;HOMA=0;HOMR=1015;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.1991;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=14;LRB=0.068406;LRBP=38.066;MQ=104.60;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=189.83;MQRankSum=-16.579;NF;NR;NS=1033;PP;PV4=0.12,1,5.5e-137,1;RA=5286;RL=14;RPP=5.3706;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=4.323;SAB=0.56522;SAF=13;SAP=3.86;SAR=10;SC=TGGGCTGGACCTGAACCATAA;SRB=0.46311;SRF=2448;SRP=65.493;SRR=2838;TC;TR=2;TU=C;VQSLOD=6.2643;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=65.43
-20 39418008 . AG A 46796 PASS AA=113;AB=0.9511;ABA=80;ABP=2894.6;ABR=1556;AC=30;AF=0.02412;AN=1244;BL=638;BR=6936;BVAR;BaseQRankSum=7.280;DEL;DP=14307;Dels=0.00;EL=50;EPP=6.2579;ER=63;FR;FS=5.707;HETAR=473;HOMA=361;HOMR=246;HP=3;HR=3;HRun=3;HU=G;InbreedingCoeff=0.0272;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.83153;LRBP=11375;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=62.398;MQRankSum=3.530;NF;NR;NS=1089;PP;RA=3000;RL=3;RPP=223.02;RR=110;RUN=1;ReadPosRankSum=-18.601;SAB=0.58407;SAF=66;SAP=9.9475;SAR=47;SC=ACTGGGGGAAAGGGATTCTAG;SRB=0.494;SRF=1482;SRP=3.9484;SRR=1518;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=4.5834;set=Intersection;sumGLbyD=3.06
-20 39876961 . GT G,GTT,GTTT 2302.10 PASS ABR=496;AC=45,51,45;AF=0.03664,0.04153,0.03664;AN=1228;BVAR;BaseQRankSum=4.462;DP=37649;DP4=1457,1975,57,59;Dels=0.02;FR;FS=9.938;HOMA=0;HOMR=978;HP=10;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2583;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=97.28;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.246;NF;NR;NS=1063;PP;PV4=0.15,1,1.9e-09,0.016;RA=5185;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.954;SC=AGTTTCTCCGGTTTTTTTTTT;SRB=0.47464;SRF=2461;SRP=31.978;SRR=2724;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=4.9752;set=Intersection;sumGLbyD=4.39
-20 41013333 . TC T 20681 PASS AA=137;AB=0.89211;ABA=134;ABP=1661.6;ABR=1108;AC=68;AF=0.05601;AN=1214;BL=1091;BR=8981;BVAR;BaseQRankSum=1.354;DEL;DP=12998;Dels=0.01;EL=57;EPP=11.395;ER=80;FS=0.758;HETAR=359;HOMA=100;HOMR=610;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0104;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.78336;LRBP=13424;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=67.745;MQRankSum=2.563;NS=1072;RA=4447;RL=5;RPP=258.66;RR=132;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.092;SAB=0.59124;SAF=81;SAP=12.917;SAR=56;SRB=0.54194;SRF=2410;SRP=70.947;SRR=2037;VQSLOD=3.7531;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.14
-20 41659532 . GC G 40544 PASS AA=42;AB=0.97149;ABA=39;ABP=2644.5;ABR=1329;AC=15;AF=0.0209;AN=716;BL=2531;BR=135;BVAR;BaseQRankSum=-2.537;DEL;DP=12219;Dels=0.00;EL=25;EPP=6.3192;ER=17;FS=2.656;HETAR=374;HOMA=155;HOMR=551;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0270;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.89872;LRBP=4678.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=103.31;MQRankSum=2.828;NS=1088;RA=4736;RL=41;RPP=85.733;RR=1;RUN=1;ReadPosRankSum=-9.702;SAB=0.57143;SAF=24;SAP=4.8716;SAR=18;SRB=0.5625;SRF=2664;SRP=163.7;SRR=2072;VQSLOD=4.3267;set=Intersection;sumGLbyD=3.22
-20 41845580 . GA G 49310 PASS AA=83;AB=0.95258;ABA=69;ABP=2591.6;ABR=1386;AC=46;AF=0.03740;AN=1230;BL=1320;BR=5150;BVAR;BaseQRankSum=-1.121;DEL;DP=13336;Dels=0.00;EL=36;EPP=6.1759;ER=47;FR;FS=0.372;HETAR=442;HOMA=341;HOMR=295;HP=2;HR=3;HRun=1;HU=G;InbreedingCoeff=0.0238;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.59196;LRBP=4926.2;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=89.048;MQRankSum=0.897;NF;NR;NS=1080;PP;RA=3006;RL=5;RPP=142.43;RR=78;RUN=1;ReadPosRankSum=-15.412;SAB=0.55422;SAF=46;SAP=5.1294;SAR=37;SC=CCAGCTGTGGGAGAGAAACAT;SRB=0.47971;SRF=1442;SRP=13.762;SRR=1564;TC;TR=6;TU=AG;VQSLOD=4.4669;set=Intersection;sumGLbyD=3.65
-20 42209428 . GC G 13163 PASS AA=89;AB=0.86677;ABA=83;ABP=730.96;ABR=540;AC=39;AF=0.03218;AN=1212;BL=950;BR=5334;BVAR;BaseQRankSum=-10.119;DEL;DP=10692;Dels=0.01;EL=48;EPP=4.2058;ER=41;FS=0.000;HETAR=259;HOMA=727;HOMR=54;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0448;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.69764;LRBP=6644.4;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=126.55;MQRankSum=4.223;NS=1040;RA=723;RL=12;RPP=106.09;RR=77;RUN=1;ReadPosRankSum=-17.362;SAB=0.39326;SAF=35;SAP=11.818;SAR=54;SRB=0.37898;SRF=274;SRP=94.99;SRR=449;VQSLOD=3.7157;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.48
-20 42281109 . T TAG 2321.12 PASS AC=181;AF=0.3740;AN=484;BaseQRankSum=8.977;DP=435;FS=17.001;HRun=0;HaplotypeScore=14.6734;InbreedingCoeff=0.2340;IndelType=INS.NOVEL_2.;MQ=53.88;MQ0=47;MQ0Fraction=0.1080;MQRankSum=0.762;QD=12.41;ReadPosRankSum=3.399;SB=-1299.73;VQSLOD=4.8926;set=VQSR
-20 42436117 . TC T 38933 PASS AA=18;AB=0.98435;ABA=17;ABP=2215.9;ABR=1069;AC=15;AF=0.01223;AN=1226;BL=498;BR=428;BVAR;BaseQRankSum=-7.224;DEL;DP=12436;Dels=0.00;EL=1;EPP=33.893;ER=17;FS=2.469;HETAR=303;HOMA=614;HOMR=123;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0439;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.075594;LRBP=14.501;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=98.611;MQRankSum=1.086;NS=1075;RA=1656;RL=10;RPP=3.4928;RR=8;RUN=1;ReadPosRankSum=-17.765;SAB=0.5;SAF=9;SAP=3.0103;SAR=9;SRB=0.49879;SRF=826;SRP=3.0313;SRR=830;VQSLOD=4.0821;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.04
-20 42682214 . C A,CAT 3904.51 PASS AA=24;AB=0.6383;ABA=17;ABP=10.818;ABR=30;AC=0;AF=0.0000;AN=636;BL=1119;BR=949;BVAR;BaseQRankSum=1.426;DP=6509;Dels=0.00;EL=9;EPP=6.2675;ER=15;FR;HETAR=12;HOMA=3;HOMR=876;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0006;IndelType=MIXED;LEN=2;LRB=0.082205;LRBP=33.356;MQ0Fraction=0.0046;MQM=40.792;MQRankSum=-0.296;NF;NR;NS=891;PP;QD=32.81;RA=2679;RL=15;RPP=6.2675;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.806;SAB=0.75;SAF=18;SAP=16.039;SAR=6;SB=-924.23;SC=TATACACACACATATATATAC;SRB=0.66293;SRF=1776;SRP=620.76;SRR=903;TC;TR=9;TU=AC;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=32.75
-20 42973456 . CA C,CAA,CAAA 2675 PASS AA=90;AB=0.79177;ABA=86;ABP=308.39;ABR=327;AC=77,61,39;AF=0.06492,0.05143,0.03288;AN=1186;BL=2983;BR=4446;BVAR;BaseQRankSum=2.422;DP=9416;Dels=0.03;EL=39;EPP=6.4847;ER=51;FR;FS=31.555;HETAR=75;HOMA=1;HOMR=888;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.2696;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.19693;LRBP=628.63;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=55.567;MQRankSum=1.777;NF;NR;NS=964;PP;RA=3601;RL=37;RPP=9.1869;RR=53;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.991;SAB=0.55556;SAF=50;SAP=5.423;SAR=40;SC=TAGTGACTGTCAAAAAAAAAA;SRB=0.60622;SRF=2183;SRP=355.91;SRR=1418;TC;TR=11;TU=A;VQSLOD=1.0763;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.05
-20 43091870 . TC T 2455.60 PASS AA=120;AB=0.10619;ABA=101;ABP=155.22;ABR=12;AC=42;AF=0.03825;AN=1098;BL=573;BR=8744;BVAR;BaseQRankSum=-13.513;DEL;DP=9139;Dels=0.00;EL=64;EPP=4.1684;ER=56;FS=9.856;HETAR=118;HOMA=820;HOMR=0;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0833;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.877;LRBP=15564;MQ0Fraction=0.0017;MQM=45.1;MQRankSum=2.266;NS=938;RA=24;RL=1;RPP=254.97;RR=119;RUN=1;ReadPosRankSum=-15.803;SAB=0.475;SAF=57;SAP=3.6617;SAR=63;SRB=0.54167;SRF=13;SRP=3.3722;SRR=11;VQSLOD=3.9930;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.09
-20 43233648 rs74585029 GA G,GAA 1504.40 PASS AA=113;AB=0.78652;ABA=95;ABP=320.31;ABR=350;AC=41,65;AF=0.03394,0.05381;AF1=0.0115;AN=1208;BL=4677;BR=5548;BVAR;BaseQRankSum=6.744;CI95=0.004274,0.01852;DB;DEL;DP=13996;DP4=1736,1549,15,17;Dels=0.03;EL=69;EPP=15.021;ER=44;FQ=14;FR;FS=12.174;HETAR=119;HOMA=15;HOMR=892;HP=11;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.2359;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.085183;LRBP=164.12;MQ=89.12;MQ0Fraction=0.0000;MQM=69.867;MQRankSum=2.513;NF;NR;NS=1027;PP;PV4=0.59,1,0.065,0.33;RA=3845;RL=46;RPP=11.485;RR=67;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.957;SAB=0.33628;SAF=38;SAP=29.318;SAR=75;SC=AAAACAGCCAGAAAAAAAAAA;SRB=0.43667;SRF=1679;SRP=136.95;SRR=2166;TC;TR=10;TU=A;VQSLOD=4.5121;set=Intersection;sumGLbyD=8.22
-20 43246548 . AC A,CC 41579.13 PASS AA=382;AB=0.72402;ABA=316;ABP=502.11;ABR=829;AC=1197;AF=0.99254;AN=1206;BL=9889;BR=14293;BVAR;BaseQRankSum=1.373;DEL;DP=10477;DS;Dels=0.05;EL=243;EPP=64.494;ER=139;FS=29.162;HETAR=291;HOMA=85;HOMR=624;HPLen=10;InbreedingCoeff=0.1392;IndelType=MIXED;LEN=1;LRB=0.18212;LRBP=1744.6;MQ0Fraction=0.0024;MQM=48.471;MQRankSum=5.726;NS=1001;RA=3138;RL=174;RPP=9.5816;RR=208;RUN=1;ReadPosRankSum=5.755;SAB=0.79843;SAF=305;SAP=298.51;SAR=77;SRB=0.70363;SRF=2208;SRP=1133.2;SRR=930;VQSLOD=5.6318;set=Intersection;sumGLbyD=5.22
-20 43258646 . T TT 1107.17 PASS AC=97;AF=0.08420;AN=1152;BaseQRankSum=4.525;DP=2345;FS=19.308;HRun=9;HaplotypeScore=13.6276;InbreedingCoeff=0.1299;IndelType=INS.NumRepetitions_10orMore.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=76.70;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.395;QD=2.67;ReadPosRankSum=-4.696;SB=-899.41;VQSLOD=5.4523;set=VQSR
-20 43718299 . ATTACT A 5497.06 PASS AA=56;AB=0.51818;ABA=53;ABP=3.3262;ABR=57;AC=18;AF=0.0251;AF1=0.03729;AN=718;BL=2321;BR=2591;BVAR;BaseQRankSum=11.142;CI95=0.03319,0.04425;DEL;DP=17576;DP4=2460,2692,31,22;Dels=0.02;EL=28;EPP=3.0103;ER=28;FQ=999;FR;FS=9.689;HETAR=15;HOMA=1;HOMR=1068;HP=2;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0448;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_5.;LEN=5;LRB=0.054967;LRBP=35.238;MQ=96.55;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=50.286;MQRankSum=-5.149;NF;NR;NS=1084;PP;PV4=0.13,1,1.2e-12,1;RA=6745;RL=28;RPP=3.0103;RR=28;RUN=1;ReadPosRankSum=0.828;SAB=0.5;SAF=28;SAP=3.0103;SAR=28;SC=ATGACAGTGGATTACTTTAGT;SRB=0.46835;SRF=3159;SRP=61.709;SRR=3586;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=7.8832;set=Intersection;sumGLbyD=46.60
-20 43981749 . A AAAAAAC,AC 20899.71 PASS ABR=192;AC=91,0;AF=0.1285,0.0000;AN=708;BVAR;BaseQRankSum=7.858;DP=23372;DP4=1554,1457,55,42;Dels=0.00;FR;FS=0.000;HOMA=4;HOMR=995;HP=6;HPLen=7;HR=7;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2109;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=95.59;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-12.081;NF;NR;NS=1051;PP;PV4=0.35,1,8.9e-73,1;RA=5027;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.359;SC=TACACTAGCAAAAAAACAAAA;SRB=0.48518;SRF=2439;SRP=12.6;SRR=2588;TC;TR=7;TU=A;VQSLOD=8.0916;set=Intersection;sumGLbyD=54.33
-20 43999274 . TCAAA T 2948.85 PASS AA=59;AB=0.59441;ABA=58;ABP=14.08;ABR=85;AC=20;AF=0.0290;AF1=0.04249;AN=690;BL=2277;BR=2436;BVAR;BaseQRankSum=9.320;CI95=0.0354,0.05088;DEL;DP=14599;DP4=2052,2303,21,22;Dels=0.03;EL=32;EPP=3.9304;ER=27;FQ=999;FR;FS=0.000;HETAR=21;HOMA=0;HOMR=1043;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0037;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.033736;LRBP=14.658;MQ=90.05;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.339;MQRankSum=-1.294;NF;NR;NS=1064;PP;PV4=0.88,1,0.0026,1;RA=5732;RL=27;RPP=3.9304;RR=32;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.915;SAB=0.47458;SAF=28;SAP=3.3415;SAR=31;SC=GGTACACAGCTCAAACAGTCT;SRB=0.4836;SRF=2772;SRP=16.4;SRR=2960;TC;TR=1;TU=C;VQSLOD=9.8086;set=Intersection;sumGLbyD=27.09
-20 44098622 . C CG 1092.40 PASS AA=129;AB=0.77301;ABA=74;ABP=214.06;ABR=252;AC=45;AF=0.0455;AN=988;BL=6586;BR=3029;BVAR;BaseQRankSum=2.802;DP=5177;Dels=0.00;EL=122;EPP=225.63;ER=7;FR;FS=355.273;HETAR=66;HOMA=11;HOMR=734;HP=6;HR=4;HRun=4;HU=G;INS;InbreedingCoeff=0.1759;IndelType=INS.NumRepetitions_4.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.36994;LRBP=2860.4;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=52.395;MQRankSum=1.946;NF;NR;NS=811;PP;RA=1981;RL=121;RPP=217.95;RR=8;RUN=1;ReadPosRankSum=-6.413;SAB=0.99225;SAF=128;SAP=274.51;SAR=1;SC=GCGGAAGTGGCGGGGACCCTT;SRB=0.41242;SRF=817;SRP=135;SRR=1164;TC;TR=4;TU=G;VQSLOD=-2.2690;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.04
-20 44327637 . A AG,AGGGGGG 14351.23 PASS AC=9,211;AF=0.0103,0.2409;AN=876;BaseQRankSum=15.517;DP=1704;FS=6.768;HaplotypeScore=31.5906;InbreedingCoeff=0.1538;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=54.64;MQ0=4;MQ0Fraction=0.0023;MQRankSum=-12.691;QD=20.83;ReadPosRankSum=-3.583;SB=-6278.99;VQSLOD=5.1556;set=VQSR
-20 45202636 . GA G 13269 PASS AA=25;AB=0.96162;ABA=18;ABP=871.09;ABR=451;AC=24;AF=0.02013;AN=1192;BL=567;BR=1728;BVAR;BaseQRankSum=-5.361;DEL;DP=10873;Dels=0.00;EL=10;EPP=5.1818;ER=15;FS=0.928;HETAR=169;HOMA=831;HOMR=45;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0999;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.50588;LRBP=1278.4;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=170.56;MQRankSum=0.161;NS=1049;RA=632;RL=2;RPP=41.315;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.760;SAB=0.68;SAF=17;SAP=10.046;SAR=8;SRB=0.51424;SRF=325;SRP=4.1235;SRR=307;VQSLOD=3.9290;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.90
-20 45417828 . TGAGC T,TGC 4672.90 PASS ABR=317;AC=69,104;AF=0.05712,0.08609;BVAR;BaseQRankSum=18.527;DEL;DP=11835;DS;FS=184.873;HOMA=48;HOMR=575;HaplotypeScore=65.5875;InbreedingCoeff=0.0599;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=29.78;MQ0=2988;MQ0Fraction=0.3629;MQRankSum=5.052;NS=713;QD=1.11;RA=1581;RUN=1;ReadPosRankSum=6.574;SB=-2116.87;SRB=0.47502;SRF=751;SRP=11.582;SRR=830;VQSLOD=0.0651;set=filterInVQSR-2of5
-20 45525657 rs66759083 TA AA,T 49315 PASS AA=2361;AB=0.45241;ABA=1398;ABP=53.235;ABR=1155;AC=20;AF=0.01701;AN=1176;BL=94913;BR=100886;BVAR;BaseQRankSum=0.740;DB;DEL;DP=30636;DP4=1258,881,1206,999;Dels=0.48;EL=1133;EPP=11.311;ER=1228;FQ=999;FR;FS=7.072;HETAR=503;HOMA=310;HOMR=218;HP=6;HPLen=7;HR=7;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.2271;IndelType=MIXED;LEN=1;LRB=0.030506;LRBP=398.68;MQ=102.24;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.359;MQRankSum=0.148;NF;NR;NS=1031;PP;PV4=0.0064,0,4.6e-23,0.47;RA=2042;RL=1183;RPP=3.0333;RR=1178;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.999;SAB=0.52139;SAF=1231;SAP=12.392;SAR=1130;SC=AGGATTTTTTTAAAAAGTTTT;SRB=0.55093;SRF=1125;SRP=49.017;SRR=917;TC;TR=7;TU=T;VQSLOD=7.1651;dbSNP=114;set=Intersection;sumGLbyD=18.51
-20 45783456 . T TG 2355.68 PASS AA=64;AB=0.78521;ABA=61;ABP=203.67;ABR=223;AC=15;AF=0.0165;AN=910;BL=815;BR=5486;BVAR;BaseQRankSum=8.593;DP=10348;Dels=0.00;EL=48;EPP=37.754;ER=16;FS=77.861;HETAR=56;HOMA=1;HOMR=970;HRun=1;INS;InbreedingCoeff=-0.0549;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_G.;LEN=1;LRB=0.74131;LRBP=7522.1;MQ0Fraction=0.0122;MQM=44.562;MQRankSum=-1.258;NS=1027;RA=4750;RL=0;RPP=141.98;RR=64;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.047;SAB=0.25;SAF=16;SAP=37.754;SAR=48;SRB=0.6;SRF=2850;SRP=415.59;SRR=1900;VQSLOD=1.3146;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.03
-20 46517110 . C CT 868.55 PASS AC=15;AF=0.0218;AN=688;BaseQRankSum=8.522;DP=1752;FS=6.570;HRun=0;HaplotypeScore=14.9548;InbreedingCoeff=0.0452;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_T.;MQ=77.73;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=3.874;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-396.78;VQSLOD=6.7740;set=VQSR
-20 46629361 . TTTCTTTC T,TTTTC 13000.91 PASS AC=188,107;AF=0.2212,0.1259;AN=850;BaseQRankSum=7.214;DP=1846;FS=14.502;HaplotypeScore=40.8481;InbreedingCoeff=0.3210;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=50.74;MQ0=79;MQ0Fraction=0.0428;MQRankSum=-6.348;QD=13.59;ReadPosRankSum=3.943;SB=-3581.20;VQSLOD=5.9412;set=VQSR
-20 46951099 . G GT 1662.30 PASS AA=55;AB=0.7713;ABA=51;ABP=145.58;ABR=172;AC=47;AF=0.03923;AN=1198;BL=3288;BR=2434;BVAR;BaseQRankSum=-4.014;DP=27423;DP4=1483,1590,58,42;Dels=0.01;EL=21;EPP=9.6826;ER=34;FR;FS=9.565;HETAR=48;HOMA=0;HOMR=913;HP=16;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0952;IndelType=INS.NumRepetitions_10orMore.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.14925;LRBP=279.78;MQ=70.36;MQ0Fraction=0.0124;MQM=52.545;MQRankSum=0.717;NF;NR;NS=961;PP;PV4=0.067,1,1,0.17;RA=3035;RL=38;RPP=20.422;RR=17;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.014;SAB=0.47273;SAF=26;SAP=3.3656;SAR=29;SC=TTTGTTTTTTGTTTTTTTTTT;SRB=0.36013;SRF=1093;SRP=518.73;SRR=1942;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=5.4779;set=Intersection;sumGLbyD=3.49
-20 47201076 rs58052846 C CT 982.16 PASS AC=50;AF=0.0551;AN=908;BaseQRankSum=12.598;DB;DP=2449;FS=35.648;HRun=0;HaplotypeScore=29.4602;InbreedingCoeff=-0.0542;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_T.;MQ=63.54;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=2.196;QD=3.16;ReadPosRankSum=-13.833;SB=-488.19;VQSLOD=6.0429;set=VQSR
-20 47965974 rs60011158 G GA 999 PASS AA=21;AB=0.57143;ABA=21;ABP=5.1818;ABR=28;AC=7;AF=0.0101;AF1=0.02061;AN=690;BL=1043;BR=577;BVAR;BaseQRankSum=-3.087;CI95=0.01549,0.02655;DB;DP=14578;DP4=1554,3055,6,17;Dels=0.00;EL=11;EPP=3.1137;ER=10;FQ=999;FR;FS=5.982;HETAR=7;HOMA=0;HOMR=1041;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=1;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0356;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.28765;LRBP=294.09;MQ=80.17;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=64.19;MQRankSum=2.137;NF;NR;NS=1048;PP;PV4=0.51,1,1,1;RA=5224;RL=16;RPP=15.522;RR=5;RUN=1;ReadPosRankSum=0.236;SAB=0.38095;SAF=8;SAP=5.5954;SAR=13;SC=TTCATGTACAGAGCTGCTGTG;SRB=0.31183;SRF=1629;SRP=1609.6;SRR=3595;TC;TR=4;TU=AG;VQSLOD=9.5466;dbSNP=129;set=Intersection;sumGLbyD=13.83
-20 48402974 rs57331436 GA G 27741 PASS AA=401;AB=0.5372;ABA=311;ABP=11.089;ABR=361;AC=84;AF=0.1186;AN=708;BL=16591;BR=14776;BVAR;BaseQRankSum=14.621;DB;DEL;DP=30607;DP4=1928,2310,195,225;Dels=0.11;EL=189;EPP=5.8749;ER=212;FQ=999;FR;FS=15.568;HETAR=110;HOMA=30;HOMR=923;HP=4;HPLen=3;HR=1;HRun=3;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1263;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;KGPilot123;LEN=1;LRB=0.057863;LRBP=231.06;MQ=106.68;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=63.005;MQRankSum=-2.010;NF;NR;NS=1063;PP;PV4=0.72,1,0.001,1;RA=5258;RL=223;RPP=13.976;RR=178;RUN=1;ReadPosRankSum=1.337;SAB=0.37656;SAF=151;SAP=56.084;SAR=250;SC=TGCCCTCAAAGAGAAAAAGGA;SRB=0.38075;SRF=2002;SRP=652.44;SRR=3256;TC;TR=5;TU=AG;VQSLOD=8.7259;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=15.86
-20 49101936 . C CT 404.46 PASS AC=40;AF=0.03559;AN=1124;BaseQRankSum=0.750;DP=2162;FS=14.291;HRun=2;HaplotypeScore=30.9513;InbreedingCoeff=-0.0082;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=49.78;MQ0=113;MQ0Fraction=0.0523;MQRankSum=-1.289;QD=1.94;ReadPosRankSum=-2.041;SB=-385.48;VQSLOD=4.6365;set=VQSR
-20 49731218 . ATTTTATTTTTTATT A,ATTTTATT 8398.93 PASS AF=0.0656,0.0156;AF1=0.0996;BaseQRankSum=13.996;CI95=0.07743,0.1239;DP=6308;DP4=951,1311,23,35;Dels=0.05;FQ=999;FR;FS=12.503;HP=7;HPLen=4;HR=4;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1892;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=57.61;MQ0Fraction=0.0145;MQRankSum=-5.208;NF;NR;PP;PV4=0.79,1,6.3e-06,0.16;ReadPosRankSum=-2.239;SC=TATTTTATTTATTTTATTTTT;TC;TR=11;TU=ATTT;VQSLOD=4.3191;set=Intersection;sumGLbyD=42.27
-20 49894989 . TA T 172.25 PASS AF=0.0140;BaseQRankSum=7.220;DP=3882;Dels=0.00;FS=17.217;HPLen=2;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0531;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ0Fraction=0.0214;MQRankSum=-0.661;ReadPosRankSum=-0.592;VQSLOD=3.0905;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.60
-20 50010923 rs66516522 C CT,CTGG 35851 PASS ABR=555;AC=310,11;AF=0.26451,0.00939;BVAR;BaseQRankSum=10.662;DB;DP=8188;FR;FS=34.411;HOMA=261;HOMR=399;HP=5;HR=6;HU=C;HaplotypeScore=45.1715;INS;InbreedingCoeff=0.2090;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=72.80;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=9.015;NF;NR;NS=831;PP;QD=9.69;RA=1986;RUN=1;ReadPosRankSum=-24.284;SB=-6038.55;SC=TGTCTGTCCCCCCTCAGCACT;SRB=0.45972;SRF=913;SRP=31.001;SRR=1073;TC;TR=6;TU=C;VQSLOD=6.1824;set=Intersection
-20 50228709 rs71192536 TG T 20517 PASS AA=924;AB=0.50203;ABA=735;ABP=3.0633;ABR=741;AC=200;AF=0.16502;AN=1212;BL=35460;BR=34197;BVAR;BaseQRankSum=13.810;DB;DEL;DP=32402;DP4=1760,2065,395,449;Dels=0.16;EL=439;EPP=7.9831;ER=485;FQ=999;FR;FS=0.558;HETAR=242;HOMA=63;HOMR=764;HP=5;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.1050;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.018132;LRBP=52.738;MQ=105.83;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.87;MQRankSum=3.895;NF;NR;NS=1069;PP;PV4=0.7,1.5e-173,1,1;RA=4708;RL=486;RPP=8.4249;RR=438;RUN=1;ReadPosRankSum=1.586;SAB=0.43615;SAF=403;SAP=35.733;SAR=521;SC=GTTTTCCAGGTGGGAAGACCG;SRB=0.44074;SRF=2075;SRP=146.62;SRR=2633;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=10.4820;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=15.35
-20 50236115 . AGG A,ACGGG,AG,AGGG 7429.57 PASS AC=192,13,221,183;AF=0.2115,0.0143,0.2434,0.2015;AN=908;BaseQRankSum=1.045;DP=1177;FS=13.479;HaplotypeScore=11.8294;InbreedingCoeff=0.7959;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=52.98;MQ0=6;MQ0Fraction=0.0051;MQRankSum=-1.482;QD=7.28;ReadPosRankSum=-2.380;SB=-1229.31;VQSLOD=8.3762;set=VQSR
-20 51589568 . TAAAC AAAAC,T 12477.52 PASS AF=0.27949;BaseQRankSum=-28.122;DP=3777;Dels=0.00;FR;FS=31.799;HP=7;HPLen=4;HR=3;HRun=0;HU=A;InbreedingCoeff=-0.1429;IndelType=MIXED;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.196;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-16.483;SC=AAATTCAAAATAAACAAACAA;TC;TR=18;TU=AAAC;VQSLOD=3.9201;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=52.43
-20 51617742 . TGC T,TGCGC 1374.91 PASS AF=0.06000,0.02000;BaseQRankSum=12.051;DP=6231;Dels=0.00;FS=189.609;HPLen=1;HRun=0;InbreedingCoeff=0.0862;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0Fraction=0.0180;MQRankSum=-2.959;ReadPosRankSum=-5.090;VQSLOD=-2.8715;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.97
-20 51770354 . AG A 1010.90 PASS AA=26;AB=0.52727;ABA=26;ABP=3.3656;ABR=29;AC=7;AF=0.0097;AF1=0.01637;AN=718;BL=1034;BR=964;BVAR;BaseQRankSum=5.588;CI95=0.01327,0.02212;DEL;DP=16259;DP4=2785,2239,15,10;Dels=0.01;EL=11;EPP=4.3466;ER=15;FQ=999;FR;FS=3.367;HETAR=8;HOMA=0;HOMR=1064;HP=2;HPLen=2;HR=2;HRun=2;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.0557;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.035035;LRBP=8.3357;MQ=90.48;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=61.346;MQRankSum=-0.019;NF;NR;NS=1072;PP;PV4=0.69,2.1e-08,0.078,1;RA=6173;RL=13;RPP=3.0103;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.460;SAB=0.61538;SAF=16;SAP=6.017;SAR=10;SC=GTGGTCCTGCAGGTCAATAAT;SRB=0.56342;SRF=3478;SRP=218.68;SRR=2695;TC;TR=2;TU=G;VQSLOD=10.1601;set=Intersection;sumGLbyD=14.60
-20 51848430 . AT A,ATT 999 PASS AA=39;AB=0.83408;ABA=37;ABP=219.19;ABR=186;AC=14,33;AF=0.0153,0.0359;AF1=0.03062;AN=918;BL=1676;BR=1732;BVAR;BaseQRankSum=3.338;CI95=0.02212,0.03982;DP=14886;DP4=1970,1762,22,31;Dels=0.01;EL=18;EPP=3.5114;ER=21;FQ=999;FR;FS=3.004;HETAR=31;HOMA=0;HOMR=1040;HP=10;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1629;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.016432;LRBP=5.0085;MQ=80.05;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.667;MQRankSum=0.325;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=0.13,1,0.0095,0.064;RA=5318;RL=21;RPP=3.5114;RR=18;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.493;SAB=0.46154;SAF=18;SAP=3.5114;SAR=21;SC=ACAAAACAATATTTTTTTTTC;SRB=0.4968;SRF=2642;SRP=3.4823;SRR=2676;TC;TR=9;TU=T;VQSLOD=5.7417;set=Intersection;sumGLbyD=7.57
-20 51897203 . T TG 8427.20 PASS AA=237;AB=0.69846;ABA=215;ABP=246.92;ABR=498;AC=117;AF=0.1662;AN=704;BL=14961;BR=5990;BVAR;BaseQRankSum=22.203;DP=9710;Dels=0.00;EL=83;EPP=49.198;ER=154;FR;FS=9.450;HETAR=123;HOMA=9;HOMR=895;HP=5;HPLen=6;HR=6;HRun=0;HU=T;INS;InbreedingCoeff=-0.0513;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_G.;LEN=1;LRB=0.42819;LRBP=8344.3;MQ0Fraction=0.0291;MQM=45.861;MQRankSum=-10.426;NF;NR;NS=1027;PP;RA=4919;RL=210;RPP=309.85;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.843;SAB=0.29536;SAF=70;SAP=89.219;SAR=167;SC=TTTGTTTGTTTTTTGTTGTTG;SRB=0.47794;SRF=2351;SRP=23.798;SRR=2568;TC;TR=23;TU=GTTT;VQSLOD=6.2670;set=Intersection;sumGLbyD=8.99
-20 52274070 . AAG A 1400.37 PASS AA=30;AB=0.74227;ABA=25;ABP=52.462;ABR=72;AC=21;AF=0.01756;AN=1196;BL=412;BR=1966;BVAR;BaseQRankSum=6.660;DEL;DP=9362;Dels=0.01;EL=16;EPP=3.2998;ER=14;FS=1.485;HETAR=18;HOMA=2;HOMR=1004;HRun=0;InbreedingCoeff=0.0317;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;LEN=2;LRB=0.65349;LRBP=2208.2;MQ0Fraction=0.0022;MQM=46.133;MQRankSum=-4.743;NS=1024;RA=3931;RL=2;RPP=51.941;RR=28;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.152;SAB=0.4;SAF=12;SAP=5.6161;SAR=18;SRB=0.49784;SRF=1957;SRP=3.1699;SRR=1974;VQSLOD=5.6452;set=Intersection;sumGLbyD=11.11
-20 52351501 . TAC T 199.59 PASS AC=22;AF=0.0238;AN=926;BaseQRankSum=7.874;DP=22911;DP4=2146,1691,26,22;FR;FS=2.898;HP=4;HPLen=3;HR=1;HRun=0;HU=A;HaplotypeScore=18.6111;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0326;IndelType=DEL.NumRepetitions_6.EventLength_2.RepeatExpansion_AC.;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0007;MQRankSum=1.011;NF;NR;PP;PV4=0.88,0.14,0.16,0.24;QD=1.10;ReadPosRankSum=-1.053;SB=-306.09;SC=GACACACAAATACACACACAC;TC;TR=13;TU=AC;VQSLOD=4.0486;set=filterInVQSR-2of5
-20 52447173 . CA C 503.89 PASS AC=23;AF=0.01891;AN=1216;BaseQRankSum=0.801;DP=3266;FS=2.606;HRun=2;HaplotypeScore=22.1543;InbreedingCoeff=-0.0097;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=118.02;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.309;QD=2.65;ReadPosRankSum=-7.872;SB=-279.27;VQSLOD=4.1900;set=VQSR
-20 52498650 . GT G 24069 PASS AA=74;AB=0.90594;ABA=57;ABP=870.4;ABR=549;AC=28;AF=0.02333;AN=1200;BL=505;BR=4514;BVAR;BaseQRankSum=-3.837;DEL;DP=9798;Dels=0.01;EL=41;EPP=4.8883;ER=33;FS=4.085;HETAR=209;HOMA=663;HOMR=121;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0334;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.79876;LRBP=6956.6;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0007;MQM=57.784;MQRankSum=-2.951;NS=995;RA=957;RL=8;RPP=101.72;RR=66;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.806;SAB=0.39189;SAF=29;SAP=10.522;SAR=45;SRB=0.39916;SRF=382;SRP=87.53;SRR=575;VQSLOD=3.8710;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.90
-20 52823602 rs11469056 CAAA C,CA,CAA,CAAAA,CAAAAA,CAAAAAA,CAAAAAAA,CAAAAAAAA,CAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAA 14515.17 PASS AC=24,83,246,109,83,19,10,16,22,59;AF=0.02128,0.07358,0.21809,0.09663,0.07358,0.01684,0.00887,0.01418,0.01950,0.05230;AN=1128;BVAR;BaseQRankSum=4.150;DB;DEL;DP=28279;FR;FS=2.021;HP=17;HR=17;HU=A;HaplotypeScore=27.8032;INS;InbreedingCoeff=0.7740;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=69.00;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.418;NF;NR;PP;QD=7.90;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.864;SB=-3244.40;SC=GGTCCTAAGGCAAAAAAAAAA;TC;TR=17;TU=A;VQSLOD=14.1033;set=Intersection
-20 53308906 . CT C,CTT 2276 PASS AA=92;AB=0.84453;ABA=81;ABP=540.17;ABR=440;AC=53,81;AF=0.04351,0.06650;AN=1218;BL=3561;BR=4796;BVAR;BaseQRankSum=3.000;DP=11804;Dels=0.02;EL=48;EPP=3.3879;ER=44;FR;FS=13.197;HETAR=69;HOMA=3;HOMR=993;HP=11;HR=10;HRun=10;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2297;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.14778;LRBP=399.32;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=56.348;MQRankSum=3.154;NF;NR;NS=1065;PP;RA=5520;RL=39;RPP=7.6365;RR=53;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.140;SAB=0.57609;SAF=53;SAP=7.6365;SAR=39;SC=AATCCAAAGTCTTTTTTTTTT;SRB=0.51576;SRF=2847;SRP=14.92;SRR=2673;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=2.4753;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.42
-20 53334602 . T TG,TGG 905.13 PASS ABR=325;AC=44,22;AF=0.03624,0.01812;BVAR;BaseQRankSum=-4.608;DP=15015;FR;FS=494.901;HOMA=0;HOMR=1004;HP=1;HR=1;HU=G;HaplotypeScore=20.5023;INS;InbreedingCoeff=0.0799;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=116.70;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=8.022;NF;NR;NS=1064;PP;QD=0.35;RA=5690;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.522;SB=-311.57;SC=AGCCATTGGCTGTTTCACTGA;SRB=0.40738;SRF=2318;SRP=426.97;SRR=3372;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=-2.3042;set=filterInVQSR-2of5
-20 53729115 . T TG 15.48 PASS AC=1;AF=0.0015;AN=668;BaseQRankSum=-1.001;DP=1711;FS=9.048;HRun=2;HaplotypeScore=12.4681;InbreedingCoeff=-0.0320;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;MQ=131.36;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.193;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.407;SB=-5.35;VQSLOD=4.8071;set=VQSR
-20 54033830 . GTATTTTAAAATCA G 2220.86 PASS AF=0.0113;BaseQRankSum=5.506;DP=2577;Dels=0.01;FR;FS=6.533;HP=5;HPLen=4;HR=1;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=0.0032;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_10orMore.;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.969;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=1.322;SC=TCAATATTTTGTATTTTAAAA;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=5.5145;set=Intersection;sumGLbyD=95.65
-20 54375236 . GT G 626.13 PASS AA=40;AB=0.63551;ABA=39;ABP=20.078;ABR=68;AC=18;AF=0.0256;AN=702;BL=1331;BR=1743;BVAR;BaseQRankSum=9.346;DEL;DP=8568;Dels=0.02;EL=26;EPP=10.828;ER=14;FS=0.610;HETAR=21;HOMA=1;HOMR=1035;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0056;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.13403;LRBP=122.92;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=67.125;MQRankSum=-2.537;NS=1058;RA=4870;RL=17;RPP=4.9646;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.229;SAB=0.525;SAF=21;SAP=3.2274;SAR=19;SRB=0.5271;SRF=2567;SRP=34.087;SRR=2303;VQSLOD=7.9228;set=Intersection;sumGLbyD=10.77
-20 54457331 . G GA 1793.40 PASS AA=77;AB=0.66667;ABA=74;ABP=56.573;ABR=148;AC=33;AF=0.02687;AN=1228;BL=3834;BR=1154;BVAR;BaseQRankSum=10.572;DP=10230;Dels=0.00;EL=77;EPP=170.21;ER=0;FS=139.433;HETAR=44;HOMA=1;HOMR=1001;HRun=1;INS;InbreedingCoeff=0.0023;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_A.;LEN=1;LRB=0.53729;LRBP=3129.8;MQ0Fraction=0.0095;MQM=4.7013;MQRankSum=-8.116;NS=1046;RA=4009;RL=77;RPP=170.21;RR=0;RUN=1;ReadPosRankSum=-6.026;SAB=1;SAF=77;SAP=170.21;SAR=0;SRB=0.57022;SRF=2286;SRP=174.7;SRR=1723;VQSLOD=1.1887;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.90
-20 54469810 . CA C 1697.62 PASS AA=93;AB=0.63855;ABA=90;ABP=44.53;ABR=159;AC=34;AF=0.0374;AF1=0.01719;AN=908;BL=3242;BR=5839;BVAR;BaseQRankSum=10.425;CI95=0.009317,0.02795;DEL;DP=15197;DP4=2134,1896,56,46;Dels=0.03;EL=34;EPP=17.604;ER=59;FQ=16;FR;FS=9.985;HETAR=41;HOMA=1;HOMR=1011;HP=9;HPLen=8;HR=8;HRun=8;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0472;IndelType=DEL.NumRepetitions_8.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.28598;LRBP=1615.8;MQ=83.37;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQM=64.075;MQRankSum=3.036;NF;NR;NS=1053;PP;PV4=0.76,1,0.31,0.22;RA=5150;RL=28;RPP=34.975;RR=65;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.252;SAB=0.5914;SAF=55;SAP=9.7582;SAR=38;SC=ATTGCTAAGACAAAAAAAAGA;SRB=0.50621;SRF=2607;SRP=4.7374;SRR=2543;TC;TR=8;TU=A;VQSLOD=8.3677;set=Intersection;sumGLbyD=9.90
-20 54542453 . GTATA G,GTA 5109.66 PASS ABR=112;AC=66,56;AF=0.0682,0.0579;AN=968;BVAR;BaseQRankSum=17.089;DB;DEL;DP=5519;DS;Dels=0.06;FS=99.502;HOMA=15;HOMR=409;HRun=0;InbreedingCoeff=0.1584;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0Fraction=0.0178;MQRankSum=-6.854;NS=460;RA=864;RUN=1;ReadPosRankSum=0.855;SRB=0.79282;SRF=685;SRP=646.5;SRR=179;VQSLOD=0.6375;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=8.53
-20 54629773 . CA C 1799.50 PASS AA=49;AB=0.82707;ABA=46;ABP=250.17;ABR=220;AC=9;AF=0.00746;AN=1206;BL=173;BR=2277;BVAR;BaseQRankSum=5.240;DEL;DP=8557;Dels=0.01;EL=49;EPP=109.41;ER=0;FS=32.359;HETAR=35;HOMA=1;HOMR=325;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0892;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.85878;LRBP=3926.6;MQ0Fraction=0.0602;MQM=32.163;MQRankSum=-3.926;NS=361;RA=1091;RL=0;RPP=109.41;RR=49;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.512;SAB=0;SAF=0;SAP=109.41;SAR=49;SRB=0.49404;SRF=539;SRP=3.3467;SRR=552;VQSLOD=1.1233;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.54
-20 54710245 . TA T 999 PASS AF=0.0084;AF1=0.0148;BaseQRankSum=3.954;CI95=0.00885,0.02212;DP=8043;DP4=2000,1849,10,7;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=0.000;HP=9;HPLen=6;HR=3;HRun=6;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1181;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=78.51;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.095;NF;NR;PP;PV4=0.63,0.00056,1,1;ReadPosRankSum=-0.448;SC=CAACAAAAAATAAATAAATAA;TC;TR=15;TU=AAAT;VQSLOD=7.8129;set=Intersection;sumGLbyD=19.02
-20 54968173 . A AAT,AATAT,AT,ATAT 89535.82 PASS ABR=994;AC=561,278,2,3;AF=0.50179,0.24866,0.00179,0.00268;AN=1118;BVAR;BaseQRankSum=-2.699;DB;DP=27837;DP4=168,177,1045,866;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=12.472;HOMA=71;HOMR=455;HP=3;HPLen=4;HR=4;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.6391;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;KGPilot123;MQ=80.36;MQ0Fraction=0.0055;MQRankSum=-1.512;NF;NR;NS=913;PP;PV4=0.046,1,1,1;RA=2015;RUN=1;ReadPosRankSum=1.015;SC=GGCCACTTAAAATATATATAT;SRB=0.44864;SRF=904;SRP=49.187;SRR=1111;TC;TR=15;TU=AT;VQSLOD=9.0092;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=42.33
-20 55176688 . TA T 421.84 PASS AF=0.01322;AF1=0.01845;BaseQRankSum=5.383;CI95=0.01282,0.02564;DP=10531;DP4=1975,2017,16,14;Dels=0.01;FQ=91.2;FR;FS=7.401;HP=6;HPLen=5;HR=5;HRun=5;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0829;IndelType=DEL.NumRepetitions_5.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=75.80;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=-0.471;NF;NR;PP;PV4=0.72,1,1,1;ReadPosRankSum=0.223;SC=CTGCAAAATATAAAAATTAGG;TC;TR=5;TU=A;VQSLOD=6.6000;set=Intersection;sumGLbyD=12.15
-20 55664086 . GTT ATT,G,GT,GTTT 5622.44 PASS AC=6,71,136;AF=0.00498,0.05887,0.11277;AN=1206;BVAR;BaseQRankSum=3.173;DB;DEL;DP=40384;DP4=1567,1317,54,29;Dels=0.05;FR;FS=1.949;HP=14;HR=11;HRun=11;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.3490;IndelType=MIXED;MQ=77.90;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.052;NF;NR;PP;PV4=0.057,1,0.2,1.2e-05;RUN=1;ReadPosRankSum=-13.646;SC=AATTTTATTTGTTTTTTTTTT;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=11.7964;set=Intersection;sumGLbyD=8.09
-20 56045006 . TG T 342.15 PASS AC=72;AF=0.0940;AN=766;BaseQRankSum=4.992;DP=1238;FS=1.460;HRun=7;HaplotypeScore=20.2784;InbreedingCoeff=0.1795;IndelType=DEL.NumRepetitions_7.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;MQ=66.42;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0008;MQRankSum=-0.937;QD=1.84;ReadPosRankSum=-4.385;SB=-320.83;VQSLOD=5.2383;set=VQSR
-20 56158711 . AG A 922.47 PASS AA=18;AB=0.575;ABA=17;ABP=4.9646;ABR=23;AC=2;AF=0.0028;AN=714;BL=953;BR=808;BVAR;BaseQRankSum=3.129;DEL;DP=10462;Dels=0.01;EL=9;EPP=3.0103;ER=9;FR;FS=8.724;HETAR=4;HOMA=0;HOMR=1058;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=1;HU=A;InbreedingCoeff=0.0262;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.08234;LRBP=28.936;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=55.889;MQRankSum=2.052;NF;NR;NS=1062;PP;RA=6300;RL=9;RPP=3.0103;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.317;SAB=0.66667;SAF=12;SAP=7.3532;SAR=6;SC=TGGCCTAGCAAGCATCGTGAC;SRB=0.48143;SRF=3033;SRP=21.883;SRR=3267;TC;TR=8;TU=AAGC;VQSLOD=8.3252;set=Intersection;sumGLbyD=13.22
-20 56258618 rs113670927 T C,TGC,TGTGC,TGTGTGC 37834.99 PASS ABR=441;AC=11,100,43;AF=0.0123,0.1119,0.0481;AN=894;BVAR;BaseQRankSum=19.514;DB;DP=23173;DP4=541,920,413,579;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=1.238;HOMA=28;HOMR=808;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2154;IndelType=MIXED;MQ=57.25;MQ0Fraction=0.0275;MQRankSum=-6.684;NF;NR;NS=976;PP;PV4=0.023,1,1,1;RA=3294;RUN=1;ReadPosRankSum=11.873;SC=TGCGTGTGTGTGTGTGTGTGT;SRB=0.42441;SRF=1398;SRP=166.5;SRR=1896;TC;TR=30;TU=GT;VQSLOD=6.7457;dbSNP=114;set=Intersection;sumGLbyD=21.27
-20 56395857 . T TAGGCAG 6614.22 PASS AA=30;AB=0.63415;ABA=30;ABP=15.827;ABR=52;AC=14;AF=0.0197;AF1=0.03154;AN=710;BL=991;BR=1813;BVAR;BaseQRankSum=-4.589;CI95=0.02434,0.04204;DP=13879;DP4=1543,1833,12,14;Dels=0.00;EL=14;EPP=3.2998;ER=16;FQ=999;FR;FS=1.482;HETAR=11;HOMA=0;HOMR=1051;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0774;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_6.;LEN=6;LRB=0.29315;LRBP=526.27;MQ=90.42;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=39.433;MQRankSum=-7.011;NF;NR;NS=1062;PP;PV4=1,1,3.7e-09,1;RA=5322;RL=9;RPP=13.433;RR=21;RUN=1;ReadPosRankSum=0.679;SAB=0.43333;SAF=13;SAP=4.1684;SAR=17;SC=AAGAGCATCTTAGGCAGAGGC;SRB=0.47294;SRF=2517;SRP=36.853;SRR=2805;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=8.3045;set=Intersection;sumGLbyD=68.22
-20 56969289 . GTTTGT G 600.69 PASS AF=0.0056;AF1=0.007726;BaseQRankSum=2.907;CI95=0.004425,0.01327;DP=9643;DP4=1892,1749,6,3;Dels=0.00;FQ=117;FR;FS=16.601;HP=5;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0236;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_5.;MQ=92.59;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.134;NF;NR;PP;PV4=0.51,1,0.07,0.3;ReadPosRankSum=0.236;SC=TAAGGACGTTGTTTGTTTTGT;TC;TR=10;TU=GTTT;VQSLOD=5.8458;set=Intersection;sumGLbyD=39.51
-20 57187557 . AG A,AGG 1486.69 PASS AA=130;AB=0.55446;ABA=90;ABP=8.2132;ABR=112;AC=56,26;AF=0.0574,0.0266;AN=976;BL=3817;BR=5968;BVAR;BaseQRankSum=5.517;DEL;DP=14174;DP4=925,721,59,48;Dels=0.05;EL=52;EPP=14.302;ER=78;FR;FS=0.917;HETAR=44;HOMA=17;HOMR=864;HP=4;HPLen=4;HR=4;HRun=4;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.2856;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.21983;LRBP=1029.8;MQ=91.56;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=63.631;MQRankSum=1.900;NF;NR;NS=925;PP;PV4=0.84,1,1,0.39;RA=2746;RL=44;RPP=32.476;RR=86;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.639;SAB=0.44615;SAF=58;SAP=6.2842;SAR=72;SC=TCAGGCCCGCAGGGGTCAGGG;SRB=0.5772;SRF=1585;SRP=145.17;SRR=1161;TC;TR=4;TU=G;VQSLOD=7.7167;set=Intersection;sumGLbyD=14.85
-20 57282771 . T TG 506.43 PASS AA=34;AB=0.70312;ABA=19;ABP=25.946;ABR=45;AC=34;AF=0.0373;AN=912;BL=886;BR=1938;BVAR;BaseQRankSum=3.744;DP=4276;Dels=0.00;EL=18;EPP=3.2658;ER=16;FR;FS=0.639;HETAR=17;HOMA=9;HOMR=737;HP=9;HR=8;HRun=8;HU=G;INS;InbreedingCoeff=0.2149;IndelType=INS.NumRepetitions_8.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.37252;LRBP=853.99;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=49.706;MQRankSum=-0.051;NF;NR;NS=763;PP;RA=1822;RL=9;RPP=19.36;RR=25;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.111;SAB=0.55882;SAF=19;SAP=4.0322;SAR=15;SC=TCGGGGGGCGTGGGGGGGGTG;SRB=0.51098;SRF=931;SRP=4.9172;SRR=891;TC;TR=8;TU=G;VQSLOD=5.7772;set=Intersection;sumGLbyD=7.95
-20 57419740 rs11481507 A AT 82613.57 PASS AA=3850;AB=0.41404;ABA=1786;ABP=198.63;ABR=1262;AC=919;AF=0.75328;AN=1220;BL=140665;BR=151383;BVAR;BaseQRankSum=-27.490;DB;DP=31794;DP4=588,585,1571,1721;Dels=0.00;EL=1924;EPP=3.0126;ER=1926;FQ=999;FR;FS=2.191;HETAR=482;HOMA=454;HOMR=135;HP=3;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0861;IndelType=INS.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.036699;LRBP=857.15;MQ=123.92;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=91.654;MQRankSum=3.016;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=0.16,1,0.12,1;RA=1850;RL=1874;RPP=8.8784;RR=1976;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.685;SAB=0.47636;SAF=1834;SAP=21.693;SAR=2016;SC=TACACTAGTGATTTAACCCTA;SRB=0.49027;SRF=907;SRP=4.5315;SRR=943;TC;TR=3;TU=T;VQSLOD=9.2768;dbSNP=126;set=Intersection;sumGLbyD=22.78
-20 57558194 . CT C,CTT,CTTT 6470.30 PASS ABR=451;AC=104,161,177;AF=0.08919,0.13808,0.15180;BVAR;BaseQRankSum=1.172;DP=7985;FR;FS=2.202;HOMA=19;HOMR=778;HP=22;HR=15;HU=T;HaplotypeScore=16.1921;INS;InbreedingCoeff=0.6440;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=69.24;MQ0=27;MQ0Fraction=0.0109;MQRankSum=-0.003;NF;NR;NS=943;PP;QD=2.22;RA=2531;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-2096.85;SC=GCCTTTTTTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.34848;SRF=882;SRP=507.73;SRR=1649;TC;TR=15;TU=T;VQSLOD=6.5151;set=Intersection
-20 57693627 . AG A 1991.90 PASS AA=52;AB=0.49462;ABA=47;ABP=3.0336;ABR=46;AC=15;AF=0.01227;AN=1222;BL=1902;BR=1478;BVAR;BaseQRankSum=-6.121;DEL;DP=26459;DP4=2647,2873,16,20;Dels=0.01;EL=25;EPP=3.1773;ER=27;FR;FS=3.135;HETAR=15;HOMA=1;HOMR=1064;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=2;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0866;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.12544;LRBP=118.51;MQ=116.26;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=114.65;MQRankSum=1.942;NF;NR;NS=1080;PP;PV4=0.74,6.9e-08,1,0.38;RA=6781;RL=33;RPP=11.195;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.795;SAB=0.5;SAF=26;SAP=3.0103;SAR=26;SC=ATTGGAGGAAAGGCTTTTTCA;SRB=0.46247;SRF=3136;SRP=85.976;SRR=3645;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=8.6672;set=Intersection;sumGLbyD=13.55
-20 57716287 . A AT 66.47 PASS AC=6;AF=0.00506;AN=1186;BaseQRankSum=1.369;DP=2744;FS=3.834;HRun=8;HaplotypeScore=11.2046;InbreedingCoeff=0.1196;IndelType=INS.NumRepetitions_8.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=73.00;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-0.086;QD=2.14;ReadPosRankSum=-2.588;SB=-53.80;VQSLOD=4.2080;set=VQSR
-20 58121928 rs73625057 T TGG 6649.17 PASS AA=132;AB=0.57854;ABA=110;ABP=16.996;ABR=151;AC=57;AF=0.0617;AN=924;BL=4530;BR=4790;BVAR;BaseQRankSum=-13.456;DB;DP=30353;DP4=2107,2168,61,66;Dels=0.00;EL=67;EPP=3.0761;ER=65;FR;FS=0.708;HETAR=46;HOMA=8;HOMR=1023;HP=3;HPLen=2;HR=2;HRun=2;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1241;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=2;LRB=0.027897;LRBP=18.76;MQ=109.61;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQM=79.833;MQRankSum=-0.699;NF;NR;NS=1077;PP;PV4=0.79,1,0.49,0.036;RA=5754;RL=61;RPP=4.6554;RR=71;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.309;SAB=0.45455;SAF=60;SAP=5.3792;SAR=72;SC=GATTAGAATGTGGATATCTTT;SRB=0.48836;SRF=2810;SRP=9.7866;SRR=2944;TC;TR=4;TU=GT;VQSLOD=8.5770;set=Intersection;sumGLbyD=27.19
-20 58468826 . ACAAG A 999 PASS AF=0.0014;AF1=0.003429;BaseQRankSum=4.082;CI95=0.003106,0.006211;DP=8461;DP4=2500,1817,8,2;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=5.034;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0183;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ=120.69;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.141;NF;NR;PP;PV4=0.21,1,0.054,1;ReadPosRankSum=2.096;SC=ATCCTGAAACACAAGAAGAAA;TC;TR=5;TU=AC;VQSLOD=7.4928;set=Intersection;sumGLbyD=29.17
-20 58731262 . TC T 999 PASS AA=21;AB=0.48649;ABA=19;ABP=3.069;ABR=18;AC=7;AF=0.0101;AF1=0.01493;AN=694;BL=939;BR=848;BVAR;BaseQRankSum=4.205;CI95=0.01106,0.02212;DEL;DP=12598;DP4=1766,1428,11,15;Dels=0.01;EL=13;EPP=5.5954;ER=8;FQ=999;FR;FS=1.796;HETAR=8;HOMA=1;HOMR=1031;HP=7;HPLen=8;HR=8;HRun=2;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0030;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.050923;LRBP=13.073;MQ=124.57;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=67.905;MQRankSum=1.103;NF;NR;NS=1040;PP;PV4=0.23,1,1,1;RA=4884;RL=10;RPP=3.1137;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.091;SAB=0.47619;SAF=10;SAP=3.1137;SAR=11;SC=TCATTTTTTTTCCTTGAAACT;SRB=0.58006;SRF=2833;SRP=274.9;SRR=2051;TC;TR=8;TU=T;VQSLOD=10.8783;set=Intersection;sumGLbyD=15.11
-20 59181229 rs11476579 CTT C,CT,CTTT,CTTTT 7787.17 PASS AC=19,195,104,91;AF=0.01599,0.16414,0.08754,0.07660;AF1=0.2124;AN=1188;BVAR;BaseQRankSum=6.347;CI95=0.146,0.2743;DB;DEL;DP=26140;DP4=932,880,352,375;Dels=0.13;FQ=85.6;FR;FS=11.914;HP=14;HR=14;HRun=14;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.4183;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=86.88;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.469;NF;NR;PP;PV4=0.17,1,1,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.055;SC=GGTGAGAAAGCTTTTTTTTTT;TC;TR=14;TU=T;VQSLOD=7.4340;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=7.02
-20 59213979 rs112141381 G GC 9068 PASS AA=131;AB=0.47115;ABA=110;ABP=4.5136;ABR=98;AF=0.0586;AN=700;BL=5395;BR=5816;BVAR;BaseQRankSum=15.453;DB;DP=23381;DP4=2191,2184,71,49;Dels=0.00;EL=66;EPP=3.0269;ER=65;FR;FS=7.907;HETAR=35;HOMA=5;HOMR=1019;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0283;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_C.;LEN=1;LRB=0.037552;LRBP=37.34;MQ=72.13;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=54.496;MQRankSum=0.897;NF;NR;NS=1059;PP;PV4=0.052,1,0.066,1;RA=4976;RL=59;RPP=5.8117;RR=72;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.811;SAB=0.58015;SAF=76;SAP=10.32;SAR=55;SC=GATGGACTGGGACAGTGACTC;SRB=0.49457;SRF=2461;SRP=4.2828;SRR=2515;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=9.3917;set=Intersection;sumGLbyD=28.58
-20 59252945 . CT C,CTT 557.18 PASS AA=24;AB=0.84868;ABA=23;ABP=163.53;ABR=129;AC=21,29;AF=0.01759,0.02429;BL=1217;BR=1336;BVAR;BaseQRankSum=5.135;DP=9970;Dels=0.01;EL=13;EPP=3.3722;ER=11;FS=2.302;HETAR=21;HOMA=1;HOMR=1012;HRun=9;INS;InbreedingCoeff=0.1549;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.046612;LRBP=15.055;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=67.208;MQRankSum=0.086;NS=1034;RA=4421;RL=11;RPP=3.3722;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.826;SAB=0.41667;SAF=10;SAP=4.4579;SAR=14;SRB=0.49649;SRF=2195;SRP=3.4823;SRR=2226;VQSLOD=2.8923;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.47
-20 60016966 . CT C 42650 PASS AA=37;AB=0.97834;ABA=31;ABP=2847;ABR=1400;AC=15;AF=0.0163;AN=920;BL=2596;BR=778;BVAR;BaseQRankSum=-0.632;DEL;DP=10967;Dels=0.00;EL=14;EPP=7.7641;ER=23;FS=4.094;HETAR=421;HOMA=256;HOMR=385;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0051;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.53883;LRBP=2130.2;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=120.3;MQRankSum=-0.911;NS=1072;RA=3413;RL=31;RPP=39.691;RR=6;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.062;SAB=0.48649;SAF=18;SAP=3.069;SAR=19;SRB=0.47407;SRF=1618;SRP=22.943;SRR=1795;VQSLOD=3.3758;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.27
-20 60188651 . AG A 17624.52 PASS AA=462;AB=0.76548;ABA=409;ABP=1070.7;ABR=1335;AC=403;AF=0.34444;AN=1170;BL=13877;BR=25909;BVAR;BaseQRankSum=6.180;DEL;DP=9900;Dels=0.08;EL=353;EPP=282.84;ER=109;FR;FS=2699.057;HETAR=346;HOMA=26;HOMR=633;HP=3;HR=4;HRun=1;HU=A;InbreedingCoeff=-0.2900;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.30242;LRBP=7904.3;MQ0Fraction=0.0004;MQM=56.119;MQRankSum=1.644;NF;NR;NS=1005;PP;RA=3521;RL=112;RPP=269.25;RR=350;RUN=1;ReadPosRankSum=2.490;SAB=0.0064935;SAF=3;SAP=980.34;SAR=459;SC=AGGCTTCAAAAGAAAAAAAAA;SRB=0.55978;SRF=1971;SRP=112.32;SRR=1550;TC;TR=4;TU=A;VQSLOD=-34.0667;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=7.81
-20 60195570 . GTACATACATACA ATACATACATACA,G,GTACATACA 20140 PASS ABR=102;AC=105,2;AF=0.08794,0.00168;AN=1194;BVAR;BaseQRankSum=-28.899;DB;DEL;DP=14347;Dels=0.02;FR;FS=52.125;HOMA=1;HOMR=1006;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=0.0695;IndelType=MIXED;MQ0Fraction=0.0007;MQRankSum=1.957;NF;NR;NS=1035;PP;RA=4759;RUN=1;ReadPosRankSum=-22.252;SAB=0.5;SAP=3.0103;SC=TGATAGATTCGTACATACATA;SRB=0.47615;SRF=2266;SRP=26.522;SRR=2493;TC;TR=21;TU=ACAT;VQSLOD=2.7673;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=19.14
-20 60670601 rs72127450 AT A,ATT 6401.59 PASS AC=177,79;AF=0.16239,0.07248;AF1=0.1602;AN=1090;BVAR;BaseQRankSum=8.618;CI95=0.1106,0.2058;DB;DEL;DP=17508;DP4=1285,1094,313,259;Dels=0.10;FQ=94.1;FR;FS=0.000;HP=12;HR=12;HRun=12;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1076;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;MQ=64.73;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.620;NF;NR;PP;PV4=0.78,1,0.012,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.294;SC=AGCCAGGCACATTTTTTTTTT;TC;TR=12;TU=T;VQSLOD=6.1650;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=5.80
-20 60685780 . TC T 1123.58 PASS AC=79;AF=0.07655;AN=1032;BaseQRankSum=14.949;DP=2084;FS=23.521;HRun=1;HaplotypeScore=19.7117;InbreedingCoeff=0.1356;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=53.57;MQ0=61;MQ0Fraction=0.0293;MQRankSum=-7.958;QD=4.35;ReadPosRankSum=-13.757;SB=-791.28;VQSLOD=6.3549;set=VQSR
-20 60744906 rs113528167 CG C 422.53 PASS AC=48;AF=0.0732;AN=656;BaseQRankSum=17.669;DB;DP=1189;FS=0.356;HRun=1;HaplotypeScore=15.1808;InbreedingCoeff=0.2111;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;MQ=82.83;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-10.455;QD=2.71;ReadPosRankSum=-16.887;SB=-326.46;VQSLOD=7.1707;set=VQSR
-20 60848742 . CGT C,CGTGT 999 PASS AF=0.00980,0.01225;BaseQRankSum=5.597;DP=17065;DP4=1928,2188,17,13;Dels=0.01;FR;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.2094;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=115.78;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.281;NF;NR;PP;PV4=0.36,0.4,0.12,0.12;ReadPosRankSum=-1.465;SB=-157.35;SC=TAGACGCTTCCGTGTGTGTGT;TC;TR=11;TU=GT;VQSLOD=1.7100;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=16.39
-20 61023668 rs57452309 G GAGC 6896.67 PASS AC=115;AF=0.1445;AN=796;BaseQRankSum=12.146;DB;DP=1423;FS=5.070;HRun=0;HaplotypeScore=29.8897;InbreedingCoeff=0.0740;IndelType=INS.NOVEL_3.;MQ=77.02;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-9.005;QD=19.16;ReadPosRankSum=-17.440;SB=-3045.82;VQSLOD=4.5788;set=VQSR
-20 61180519 . C CA,CT 1774.30 PASS ABR=135;AC=27,15;AF=0.02538,0.01410;BVAR;BaseQRankSum=-2.189;DP=8393;FR;FS=27.692;HOMA=2;HOMR=825;HP=6;HPLen=3;HR=3;HU=T;HaplotypeScore=19.5313;INS;InbreedingCoeff=0.0868;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;MQ=56.11;MQ0=172;MQ0Fraction=0.0667;MQRankSum=2.605;NF;NR;NS=854;PP;QD=1.99;RA=2868;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.324;SB=-385.54;SC=TTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT;SRB=0.32741;SRF=939;SRP=745.08;SRR=1929;TC;TR=69;TU=CTTT;VQSLOD=3.4398;set=filterInVQSR-2of5
-20 61184281 . AC A 9798.10 PASS AA=24;AB=0.96507;ABA=16;ABP=863.43;ABR=442;AC=4;AF=0.00341;AN=1174;BL=349;BR=1039;BVAR;BaseQRankSum=2.048;DEL;DP=10073;Dels=0.00;EL=11;EPP=3.3722;ER=13;FS=2.097;HETAR=141;HOMA=69;HOMR=829;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0697;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.49712;LRBP=747.85;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=98.042;MQRankSum=1.881;NS=1042;RA=3625;RL=5;RPP=20.744;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-8.009;SAB=0.75;SAF=18;SAP=16.039;SAR=6;SRB=0.52662;SRF=1909;SRP=25.323;SRR=1716;VQSLOD=1.8117;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.55
-20 62074219 . C CTAT,CTGT 2328 PASS ABR=99;AC=20,6;AF=0.01754,0.00526;BVAR;BaseQRankSum=11.221;DP=9498;DS;FS=4.510;HOMA=15;HOMR=645;HaplotypeScore=82.8868;INS;InbreedingCoeff=0.0880;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=3;MQ=29.88;MQ0=1378;MQ0Fraction=0.2286;MQRankSum=-5.309;NS=689;QD=0.77;RA=1679;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.510;SAR=1;SB=-93.21;SRB=0.70697;SRF=1187;SRP=627.71;SRR=492;VQSLOD=1.8325;set=filterInVQSR-2of5
-20 62304449 . CA C,CAA 6680.17 PASS AC=141,69;AF=0.12567,0.06150;AF1=0.08178;AN=1122;BVAR;BaseQRankSum=9.754;CI95=0.05088,0.1128;DEL;DP=15867;DP4=1252,1289,232,208;Dels=0.10;FQ=52.6;FR;FS=6.576;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1950;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;MQ=60.48;MQ0Fraction=0.0004;MQRankSum=-0.049;NF;NR;PP;PV4=0.2,1,1,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.137;SC=GATTCTGTGTCAAAAAAAAAA;TC;TR=11;TU=A;VQSLOD=7.4714;set=Intersection;sumGLbyD=8.36
-20 62804895 rs57769591 CCTT C 1148 PASS AC=8;AF=0.0085;AF1=0.002839;AN=938;BaseQRankSum=4.952;CI95=0.002212,0.006637;DB;DP=8889;DP4=2574,1668,4,8;FQ=12.3;FS=2.289;HPLen=3;HRun=0;HaplotypeScore=29.4184;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0270;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_3.;MQ0=876;MQ0Fraction=0.2674;MQRankSum=-0.641;PV4=0.074,1,1,1;QD=1.03;ReadPosRankSum=0.118;SB=-65.30;VQSLOD=6.4881;dbSNP=126;set=Intersection
-20 62907688 . AAT A 6629.57 PASS AC=164;AF=0.13735;AN=1194;BaseQRankSum=27.368;DP=2746;FS=5.985;HRun=0;HaplotypeScore=14.7748;InbreedingCoeff=0.1433;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_2.RepeatExpansion_AT.;MQ=96.65;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-3.318;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.789;SB=-2662.16;VQSLOD=6.1473;set=VQSR
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.1\r
-##INFO=<ID=PacBio,Number=1,Type=String,Description="Status of PacBio for this site">\r
-##INFO=<ID=Sqnm,Number=1,Type=String,Description="Status of Sequenom for this site">\r
-##INFO=<ID=Sanger,Number=1,Type=String,Description="Status of Sanger Sequencing for this site">\r
-##INFO=<ID=NotCalledInValidationSamples,Number=.,Type=Flag,Description="Was not called polymorphic in sequencing for any of the passing validation samples; could still be polymorphic">\r
-##reference=file:///humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta\r
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO \r
-20 207414 . G A . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 792106 . C G . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 894031 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 1508892 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 1686745 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 1818886 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 2062981 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 2773229 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 2817761 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 2994966 . G T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 3126723 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 3523369 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 3635082 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 3714080 . C G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 3905791 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 3907250 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 4171994 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 4246375 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 4375206 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 4434727 . A T . . PacBio=NoCall;Sqnm=Mono;Sanger=Mono\r
-20 4495199 . G C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 4835415 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 4915769 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 4983198 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 5441171 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 5978029 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 6061317 . C A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 6328925 . C A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 6675461 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 6976115 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 7013349 . G A . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 7039302 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 7638704 . C A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 7688381 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 7726350 . G T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 7733957 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 7850516 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 8095059 . G A . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 8232012 . T A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 8415290 . A C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 8438535 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 8815233 . G A . . PacBio=Mono;Sqnm=NoCall\r
-20 8953629 . C G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 9237267 . T A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 9744549 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 9780416 . C A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 10252552 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 10314038 . C G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 10757416 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 11087688 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 11094107 . G A . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 11098680 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 11353163 . G C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 11510559 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 11787224 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 11821024 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 11932295 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 11965311 . G T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 12023599 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 12505523 . G T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 12570054 . A C . . PacBio=NoCall;Sqnm=Poly\r
-20 12667452 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 12678271 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Mono\r
-20 12704885 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 12733996 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 12737269 . C T . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 12788981 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 12828594 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 12999157 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 13083804 . C G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 13197077 . G T . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 13217896 . A G . . PacBio=NoCall;Sqnm=Poly\r
-20 13276778 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 13375116 . G A . . PacBio=Mono;Sqnm=NoCall;NotCalledInValidationSamples\r
-20 13648056 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 13672895 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 14160159 . C G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 14266815 . T A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 14865143 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 14882868 . T G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 15244725 . C A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 15277072 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 15390867 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 15785205 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 15833020 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 15847620 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 15953253 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 15964434 . G C . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 16183922 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 16190824 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 16557779 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 16730061 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 16794015 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 17048741 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 17299827 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 17299845 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 17390323 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 17624973 . C G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 17666040 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 17735813 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 17794990 . A G . . PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples\r
-20 17809418 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 17860794 . C T . . PacBio=Mono;Sqnm=NoCall\r
-20 17881936 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 17893097 . C G . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 18188883 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 18199319 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 18233699 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 18536869 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 18637785 . T C . . PacBio=NoCall;Sqnm=Mono;Sanger=Mono;NotCalledInValidationSamples\r
-20 18763166 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 19102715 . A G . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 19244609 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 19573719 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 19815613 . A G . . PacBio=NoCall;Sqnm=Poly\r
-20 20511479 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly;Sanger=Poly\r
-20 20639358 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 21278490 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 21297718 . C G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 21418269 . A T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 21560553 . A T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 21618451 . G A . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 21705723 . C A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 22076189 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 22118677 . T A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 22320721 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 22368918 . C A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 23020003 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 23214163 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 23273877 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 23335790 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 23790659 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 23830388 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 23837678 . C G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 23901081 . A C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 23946361 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 23949242 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 24539119 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 24986457 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 25183729 . G A . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 25277133 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 25292464 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 25528915 . G C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 25851836 . A G . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 25970163 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 29920798 . C T . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 30007713 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 30051768 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 30183598 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 30604408 . G A . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 30759940 . G T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 30881454 . G T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 31356560 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 31450036 . A G . . PacBio=NoCall;Sqnm=Mono\r
-20 31589920 . A T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 31922121 . C T . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 32801430 . G C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 32943975 . G T . . PacBio=Mono;Sqnm=Mono\r
-20 33155812 . C A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 34090682 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 34254080 . C T . . PacBio=Mono;Sqnm=NoCall;NotCalledInValidationSamples\r
-20 34312126 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 34481504 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 34694577 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 35026572 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 35472344 . T G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 35882698 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 36044719 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 36047623 . C A . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 36204890 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 36469514 . G C . . PacBio=NoCall;Sqnm=Poly\r
-20 36840217 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 37460945 . C T . . PacBio=Mono;Sqnm=Poly\r
-20 37665246 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 37732397 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 37874645 . G T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 37958191 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 37996273 . C T . . PacBio=Mono;Sqnm=NoCall;NotCalledInValidationSamples\r
-20 38016547 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 38435682 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 38505534 . A T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 38803278 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 38963803 . G C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 38971986 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 39269586 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 39289390 . C A . . PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples\r
-20 39318956 . T A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 39736197 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 40241339 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 41473555 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 41878576 . T G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 42022716 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 42033671 . A C . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 42270334 . C T . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 42449590 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 42521157 . T G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 42624300 . C A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 42984548 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 43200148 . G C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 43425384 . T G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 43521990 . C G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 43565804 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 43591237 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 43805929 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 43866692 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 43902088 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 44478507 . C A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 44768810 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 45151582 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 45414003 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 45776825 . G C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 46454905 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 46823642 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 47001376 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 47079360 . G C . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 47248953 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 47480655 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 47529099 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 47703355 . A C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 47919541 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 48126120 . A C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 48157380 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 48233077 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 48488571 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 48534468 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 48631385 . G C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 48654970 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 48708007 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 48979827 . C A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 49100106 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 49509102 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 49631170 . G A . . PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples\r
-20 50210361 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 50309600 . C A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 50681296 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 50750138 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 51639257 . G A . . PacBio=Mono;Sqnm=Poly\r
-20 51814664 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 51891088 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 52299250 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 52363435 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 52583941 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 52787584 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 53256945 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 54155398 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 54172374 . G T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 54209446 . A G . . PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples;Sanger=Poly\r
-20 54317862 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 54852735 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 54889864 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 55208711 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 55220477 . G T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 55224856 . G T . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 55441530 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 55585710 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 55630163 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 56031994 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 56316071 . T G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 56366198 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 56703987 . G A . . PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples;Sanger=Poly\r
-20 56794829 . G C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 56797026 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 56922427 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 57025102 . A T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 57104529 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 57360225 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 57630386 . T A . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 57754033 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 57956631 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 57997801 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
-20 58046279 . C G . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 58186723 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 58214460 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 58317759 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 58491642 . A C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 58560045 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 58629232 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 58805192 . G T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 58869523 . A G . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 59337535 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 59441596 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 59445223 . G A . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 59605846 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 59864395 . G C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 60099821 . G T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 60290551 . A G . . PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples;Sanger=Poly\r
-20 60362527 . G C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 60516358 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 60559594 . C T . . PacBio=NoCall;Sqnm=Poly\r
-20 60745115 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 60831300 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 60907675 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 61458191 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 61717607 . C T . . PacBio=Mono;Sqnm=Poly\r
-20 61771154 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 61950497 . G A . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 62000091 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 62550780 . C T . . PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
-20 62558259 . T C . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
-20 62727205 . C T . . PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.1\r
-##INFO=<ID=Consensus,Number=1,Type=String,Description="Consensus validation result">\r
-##INFO=<ID=PacBio,Number=1,Type=String,Description="Status of PacBio for this site">\r
-##INFO=<ID=Sqnm,Number=1,Type=String,Description="Status of Sequenom for this site">\r
-##INFO=<ID=Sanger,Number=1,Type=String,Description="Status of Sanger Sequencing for this site">\r
-##INFO=<ID=NotCalledInValidationSamples,Number=.,Type=Flag,Description="Was not called polymorphic in sequencing for any of the passing validation samples; could still be polymorphic">\r
-##INFO=<ID=pcr454_ss,Number=1,Type=String,Description="Status of PCR-Roche 454 single-sample experiment for this site">\r
-##INFO=<ID=pcr454_ps,Number=1,Type=String,Description="Status of PCR-Roche 454 pooled-samples experiment for this site">\r
-##reference=file:///humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta\r
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO\r
-20 207414 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 792106 . C G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 894031 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 1508892 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 1686745 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 1818886 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 2062981 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 2773229 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 2817761 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 2994966 . G T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 3126723 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 3523369 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 3635082 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 3714080 . C G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 3905791 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 3907250 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 4171994 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 4246375 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 4375206 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 4434727 . A T 0 . Consensus=Mono;PacBio=Mono;Sqnm=Mono;Sanger=Mono;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=Poly\r
-20 4495199 . G C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 4835415 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 4915769 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 4983198 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 5441171 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 5978029 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 6061317 . C A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Poly\r
-20 6328925 . C A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 6675461 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 6976115 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 7013349 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 7039302 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 7638704 . C A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 7688381 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 7726350 . G T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 7733957 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 7850516 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 8095059 . G A 0 . Consensus=Mono;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 8232012 . T A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 8415290 . A C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 8438535 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 8815233 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Mono;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 8953629 . C G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Poly\r
-20 9237267 . T A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 9744549 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 9780416 . C A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 10252552 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 10314038 . C G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 10757416 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 11087688 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 11094107 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 11098680 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 11353163 . G C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 11510559 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 11787224 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 11821024 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 11932295 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 11965311 . G T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 12023599 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 12505523 . G T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 12570054 . A C 0 . Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 12667452 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 12678271 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Mono;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 12704885 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 12733996 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 12737269 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 12788981 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 12828594 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 12999157 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 13083804 . C G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 13197077 . G T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 13217896 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 13276778 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 13375116 . G A 0 . Consensus=Mono;PacBio=Mono;Sqnm=NoCall;NotCalledInValidationSamples;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
-20 13648056 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 13672895 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 14160159 . C G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 14266815 . T A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 14865143 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 14882868 . T G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 15244725 . C A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 15277072 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 15390867 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 15785205 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 15833020 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 15847620 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 15953253 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 15964434 . G C 0 . Consensus=NoCall;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 16183922 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 16190824 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 16557779 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 16730061 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 16794015 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 17048741 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 17299827 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 17299845 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 17390323 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 17624973 . C G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 17666040 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 17735813 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 17794990 . A G 0 . Consensus=Mono;PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 17809418 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 17860794 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Mono;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 17881936 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 17893097 . C G 0 . Consensus=Mono;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
-20 18188883 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 18199319 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 18233699 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 18536869 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 18637785 . T C 0 . Consensus=Mono;PacBio=NoCall;Sqnm=Mono;Sanger=Mono;NotCalledInValidationSamples;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
-20 18763166 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 19102715 . A G 0 . Consensus=Mono;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
-20 19244609 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 19573719 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 19815613 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 20511479 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;Sanger=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 20639358 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 21278490 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 21297718 . C G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 21418269 . A T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 21560553 . A T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 21618451 . G A 0 . Consensus=NoCall;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 21705723 . C A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 22076189 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 22118677 . T A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 22320721 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 22368918 . C A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 23020003 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 23214163 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 23273877 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 23335790 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Mono\r
-20 23790659 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 23830388 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 23837678 . C G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 23901081 . A C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 23946361 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 23949242 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 24539119 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 24986457 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 25183729 . G A 0 . Consensus=Mono;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
-20 25277133 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 25292464 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 25528915 . G C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 25851836 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 25970163 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 29920798 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 30007713 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 30051768 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 30183598 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 30604408 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 30759940 . G T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 30881454 . G T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=Poly\r
-20 31356560 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 31450036 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=Mono;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 31589920 . A T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 31922121 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 32801430 . G C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 32943975 . G T 0 . Consensus=Mono;PacBio=Mono;Sqnm=Mono;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 33155812 . C A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 34090682 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 34254080 . C T 0 . Consensus=Mono;PacBio=Mono;Sqnm=NoCall;NotCalledInValidationSamples;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
-20 34312126 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 34481504 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 34694577 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 35026572 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 35472344 . T G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 35882698 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 36044719 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 36047623 . C A 0 . Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 36204890 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 36469514 . G C 0 . Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 36840217 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 37460945 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Mono;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 37665246 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 37732397 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 37874645 . G T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 37958191 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 37996273 . C T 0 . Consensus=Mono;PacBio=Mono;Sqnm=NoCall;NotCalledInValidationSamples;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
-20 38016547 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 38435682 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 38505534 . A T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 38803278 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 38963803 . G C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 38971986 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 39269586 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 39289390 . C A 0 . Consensus=Mono;PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 39318956 . T A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=Poly\r
-20 39736197 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 40241339 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 41473555 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 41878576 . T G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 42022716 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 42033671 . A C 0 . Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 42270334 . C T 0 . Consensus=NoCall;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 42449590 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 42521157 . T G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 42624300 . C A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 42984548 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 43200148 . G C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 43425384 . T G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 43521990 . C G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 43565804 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 43591237 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 43805929 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 43866692 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 43902088 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 44478507 . C A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 44768810 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 45151582 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 45414003 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
-20 45776825 . G C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 46454905 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 46823642 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 47001376 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 47079360 . G C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 47248953 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 47480655 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 47529099 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 47703355 . A C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 47919541 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 48126120 . A C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 48157380 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 48233077 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 48488571 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 48534468 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 48631385 . G C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 48654970 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 48708007 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 48979827 . C A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 49100106 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 49509102 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 49631170 . G A 0 . Consensus=Mono;PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
-20 50210361 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 50309600 . C A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 50681296 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 50750138 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 51639257 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Mono;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
-20 51814664 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 51891088 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 52299250 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 52363435 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 52583941 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 52787584 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 53256945 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 54155398 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 54172374 . G T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=Poly\r
-20 54209446 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples;Sanger=Poly;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
-20 54317862 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 54852735 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 54889864 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 55208711 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 55220477 . G T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 55224856 . G T 0 . Consensus=NoCall;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 55441530 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 55585710 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 55630163 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 56031994 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 56316071 . T G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 56366198 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 56703987 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples;Sanger=Poly;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
-20 56794829 . G C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 56797026 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 56922427 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 57025102 . A T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 57104529 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 57360225 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 57630386 . T A 0 . Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 57754033 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 57956631 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 57997801 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 58046279 . C G 0 . Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 58186723 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 58214460 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 58317759 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 58491642 . A C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 58560045 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 58629232 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 58805192 . G T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 58869523 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 59337535 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 59441596 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 59445223 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 59605846 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 59864395 . G C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 60099821 . G T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 60290551 . A G 0 . Consensus=Poly;PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples;Sanger=Poly;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
-20 60362527 . G C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 60516358 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 60559594 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 60745115 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 60831300 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 60907675 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 61458191 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 61717607 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Mono;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
-20 61771154 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 61950497 . G A 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 62000091 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 62550780 . C T 0 . Consensus=NoCall;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
-20 62558259 . T C 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
-20 62727205 . C T 0 . Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.0
-##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
-##FilterLiftedVariants="analysis_type=FilterLiftedVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null reference_sequence=/local/sequence/reference/BWA_ref/hg19/hg19.fasta rodBind=[/local/scratch/xyliu/0.915136538286792.sorted.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false enable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null quiet_output_mode=false debug_mode=false help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub"
-##INFO=<ID=VC,Number=1,Type=String,Description="Variation Class">
-##INFO=<ID=AC,Number=.,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
-##INFO=<ID=AF,Number=.,Type=Float,Description="Allele Frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
-##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
-##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP Membership">
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT NA15029 NA15036 NA15038 NA15056b NA15072 NA15144C NA15213_006 NA15215A NA15216_A2 NA15221b NA15223_6v2 NA15224_4 NA15226A NA15227b NA15236_6 NA15242_005 NA15245v2 NA15268 NA15324_A1 NA15385b NA15386A NA15510_A1 NA15590_4 NA15594_005 NA18500b NA18501 NA18502 NA18503 NA18504 NA18505 NA18506 NA18507 NA18508 NA18515 NA18516 NA18517 NA18521 NA18522 NA18523 NA18524_B1 NA18526_B2 NA18529_B1 NA18532_B1 NA18537_B1 NA18540_B1 NA18542_B1 NA18545_5 NA18547_B1 NA18550_B1 NA18555_A2 NA18561_A3 NA18562_B1 NA18563 NA18564_4 NA18566_3 NA18570_3 NA18571_3 NA18572_3 NA18573_B3 NA18576_4 NA18577_B1 NA18579_B1 NA18582_B1 NA18592_2 NA18593_B1 NA18594_B1 NA18603_B1 NA18605_B1 NA18608_B1 NA18609_B1 NA18611_B1 NA18612_B1 NA18620_3 NA18621_B1 NA18622_B1 NA18623_B1 NA18624 NA18632_3 NA18635_A1 NA18637_2 NA18852 NA18853 NA18854 NA18855 NA18856 NA18857 NA18858 NA18859 NA18860 NA18861 NA18862 NA18863 NA18870 NA18871 NA18872 NA18912 NA18913 NA18914 NA18940_3 NA19092 NA19093 NA19094 NA19098 NA19099 NA19100 NA19101 NA19102 NA19103 NA19116 NA19119b NA19120 NA19127 NA19128 NA19129 NA19130b NA19131 NA19132b NA19137 NA19138 NA19139 NA19140b NA19141 NA19142 NA19143 NA19144 NA19145 NA19152 NA19153 NA19154 NA19159 NA19160 NA19161 NA19171 NA19172 NA19173 NA19192 NA19193 NA19194 NA19200 NA19201 NA19202 NA19203 NA19204 NA19205 NA19206 NA19207 NA19208v2 NA19209 NA19210 NA19211 NA19221 NA19222 NA19223 NA19238 NA19239 NA19240 NA_pos103a NS12911_1
-chr1 5911136 . T TGCCATTCCAAAGAGGCACTCA . PASS VC=INDEL;AC=28;AF=0.09;AN=316 GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 17054990 . G GA . PASS VC=INDEL;AC=25;AF=0.12;AN=200 GT ./. ./. 0/1 ./. 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/1 ./. ./. ./. ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/1 ./. ./. 0/0 ./. ./. ./. ./. ./. ./. ./. 0/1 0/1 ./.
-chr1 17390953 . CT C . PASS VC=INDEL;AC=118;AF=0.37;AN=316 GT 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1
-chr1 17754916 . CCT C . PASS VC=INDEL;AC=66;AF=0.21;AN=316;refseq.name=NM_018715;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1
-chr1 18293100 . C CCTC . PASS VC=INDEL;AC=263;AF=0.84;AN=314 GT 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 18823397 . T TTAAT . PASS VC=INDEL;AC=87;AF=0.28;AN=316 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 19215209 . G GAG . PASS VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=316;refseq.name=NM_003748;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 19943821 . CACAG C . PASS VC=INDEL;AC=12;AF=0.04;AN=308;refseq.name=NM_001032363;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 20092486 . GAAG G . PASS VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=314;refseq.name=NM_181719;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 20977854 . A ATTC . PASS VC=INDEL;AC=152;AF=0.52;AN=292;refseq.name=NM_032409;refseq.positionType=exon GT 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. ./. 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1 1/1 0/0 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1
-chr1 21275058 . CTTTG C . PASS VC=INDEL;AC=30;AF=0.1;AN=296;refseq.name=NM_003760;refseq.positionType=intron GT ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 22642904 . A AAC . PASS VC=INDEL;AC=255;AF=0.85;AN=300 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1
-chr1 22844297 . ATCT A . PASS VC=INDEL;AC=162;AF=0.51;AN=316;refseq.name=NM_001083621;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0
-chr1 22844299 . CTTC C . PASS VC=INDEL;AC=160;AF=0.51;AN=314;refseq.name=NM_001083621;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0
-chr1 23162393 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=44;AF=0.14;AN=316;refseq.name=NM_004442;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-chr1 23882634 . T TAGGTG . PASS VC=INDEL;AC=24;AF=0.08;AN=284 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0
-chr1 25799681 . CTCTG C . PASS VC=INDEL;AC=49;AF=0.21;AN=230;refseq.name=NM_018202;refseq.positionType=intron GT 0/1 ./. 1/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. ./. 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 1/1 ./. 1/1 0/0 0/1 1/1 ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 ./. ./. 0/1 ./. 0/1 ./. ./. 1/1 ./. 0/1 ./. 1/1 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 26081170 . CA C . PASS VC=INDEL;AC=17;AF=0.06;AN=308;refseq.name=NM_020379;refseq.positionType=intron GT 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 26240086 . GAT G . PASS VC=INDEL;AC=31;AF=0.1;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 26725650 . A ATGAAG . PASS VC=INDEL;AC=300;AF=0.95;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 26725655 . G GTGAAG . PASS VC=INDEL;AC=300;AF=0.95;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 27425097 . CTGG C . PASS VC=INDEL;AC=40;AF=0.16;AN=248;refseq.name=NM_003047;refseq.positionType=terminator GT 1/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0
-chr1 27737240 . A AT . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_006990;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 27744410 . GATCCATG G . PASS VC=INDEL;AC=166;AF=0.56;AN=296;refseq.name=NM_006990;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./.
-chr1 28156589 . G GGATG . PASS VC=INDEL;AC=127;AF=0.4;AN=314;refseq.name=NM_002713;refseq.positionType=promoter GT 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr1 28721777 . TA T . PASS VC=INDEL;AC=287;AF=0.91;AN=316;refseq.name=NM_001048183;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 28721778 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=287;AF=0.91;AN=316;refseq.name=NM_001048183;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 28907201 . GT G . PASS VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=224 GT 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/1 ./. ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. ./. ./. ./.
-chr1 29223339 . G GTGAG . PASS VC=INDEL;AC=203;AF=0.7;AN=292;refseq.name=NM_004437;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1
-chr1 29223342 . A AGCAA . PASS VC=INDEL;AC=71;AF=0.29;AN=242;refseq.name=NM_004437;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 1/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 ./. ./. ./. ./. 0/1 ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 ./. ./. 0/0
-chr1 29865521 . G GCTCCGT . PASS VC=INDEL;AC=115;AF=0.36;AN=316 GT 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0
-chr1 31128790 . C CT . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 31135886 . A AG . PASS VC=INDEL;AC=246;AF=0.92;AN=268 GT ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. ./. ./. 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 ./. ./. 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./.
-chr1 31503645 . AAAAGA A . PASS VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=314;refseq.name=NM_001020658;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 31504005 . C CAT . PASS VC=INDEL;AC=84;AF=0.27;AN=316;refseq.name=NM_001020658;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr1 31731414 . CCTCT C . PASS VC=INDEL;AC=40;AF=0.13;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 31775152 . A ACTA . PASS VC=INDEL;AC=47;AF=0.15;AN=308;refseq.name=NM_016505;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 31882582 . G GGCCTCA . PASS VC=INDEL;AC=163;AF=0.59;AN=274 GT 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. ./. ./. 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 ./. 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 ./. 0/1 ./. 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1
-chr1 32010706 . GG G . PASS VC=INDEL;AC=312;AF=1;AN=312 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 32078865 . G GT . PASS VC=INDEL;AC=78;AF=0.25;AN=316 GT 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1
-chr1 33422344 . G GAA . PASS VC=INDEL;AC=123;AF=0.39;AN=316;refseq.name=NM_153341;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1
-chr1 33634618 . TC T . PASS VC=INDEL;AC=238;AF=0.75;AN=316;refseq.name=NM_018207;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 33965999 . CCCAGTTC C . PASS VC=INDEL;AC=203;AF=0.65;AN=314 GT 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 ./. 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1
-chr1 34176371 . GAAACATAAG G . PASS VC=INDEL;AC=252;AF=0.95;AN=266;refseq.name=NM_052896;refseq.positionType=intron GT 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 ./. ./. ./. 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1
-chr1 34931817 . AT A . PASS VC=INDEL;AC=38;AF=0.12;AN=316 GT 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1
-chr1 35879227 . CAT C . PASS VC=INDEL;AC=31;AF=0.1;AN=316;refseq.name=NM_005095;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 36429590 . A AG . PASS VC=INDEL;AC=181;AF=0.57;AN=316;refseq.name=NM_024852;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0
-chr1 36558240 . C CAC . PASS VC=INDEL;AC=11;AF=0.03;AN=316;refseq.name=NM_017825;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 37034721 . ATACT A . PASS VC=INDEL;AC=44;AF=0.16;AN=282 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 ./. ./. ./. 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 37142202 . AATA A . PASS VC=INDEL;AC=24;AF=0.08;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 37169424 . TA T . PASS VC=INDEL;AC=176;AF=0.56;AN=316 GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0
-chr1 37169427 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=173;AF=0.56;AN=308 GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0
-chr1 37638341 . T TAT . PASS VC=INDEL;AC=11;AF=0.05;AN=222 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/1 ./. ./. ./. ./. ./. ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. ./. 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0
-chr1 38077349 . CTTATCCCCATACTAGTTATTATCGAAACCATCAGCCTACTCATTCAACCAATAGCCCTGGCCGTACGCCTA C . PASS VC=INDEL;AC=209;AF=0.77;AN=272;refseq.name=NM_001038633;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 ./. 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 ./. 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. ./. ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 ./. 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1
-chr1 38392549 . AT A . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_005540;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 38664242 . TA T . PASS VC=INDEL;AC=93;AF=0.29;AN=316 GT 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0
-chr1 38739177 . GTG G . PASS VC=INDEL;AC=32;AF=0.1;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 39288395 . CTTC C . PASS VC=INDEL;AC=36;AF=0.12;AN=306 GT 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-chr1 39615407 . C CGATAT . PASS VC=INDEL;AC=192;AF=0.63;AN=306;refseq.name=NM_012090;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 ./. 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 39615412 . T TGATAT . PASS VC=INDEL;AC=200;AF=0.63;AN=316;refseq.name=NM_012090;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 39736467 . T TATAT . PASS VC=INDEL;AC=27;AF=0.09;AN=316;refseq.name=NM_012090;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 39936801 . GTG G . PASS VC=INDEL;AC=23;AF=0.07;AN=314;refseq.name=NM_012090;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 40525320 . AACACAAGAAC A . PASS VC=INDEL;AC=21;AF=0.11;AN=196;refseq.name=NM_006367;refseq.positionType=intron GT ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 ./. 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/1 ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. ./. ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/1 0/1 0/0 ./. ./. ./. ./. ./. 0/0 ./. ./. ./. ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./.
-chr1 40728529 . TA T . PASS VC=INDEL;AC=216;AF=0.68;AN=316;refseq.name=NM_005857;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1
-chr1 41281719 . CT C . PASS VC=INDEL;AC=142;AF=0.45;AN=316;refseq.name=NM_004700;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr1 41808814 . CT C . PASS VC=INDEL;AC=32;AF=0.1;AN=308 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 41991662 . CCA C . PASS VC=INDEL;AC=17;AF=0.06;AN=304;refseq.name=NM_024503;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 ./.
-chr1 42083551 . C CT . PASS VC=INDEL;AC=139;AF=0.44;AN=316;refseq.name=NM_024503;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0
-chr1 42531504 . G GATAG . PASS VC=INDEL;AC=199;AF=0.66;AN=302 GT 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 ./. 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1
-chr1 42835720 . C CTTG . PASS VC=INDEL;AC=297;AF=0.94;AN=316 GT 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 42835723 . G GTTG . PASS VC=INDEL;AC=297;AF=0.94;AN=316 GT 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 42880843 . A ACA . PASS VC=INDEL;AC=179;AF=0.57;AN=316;refseq.name=NM_173642;refseq.positionType=exon GT 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1
-chr1 44114854 . C CGC . PASS VC=INDEL;AC=107;AF=0.45;AN=238;refseq.name=NM_014663;refseq.positionType=promoter GT 0/0 1/1 1/1 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 ./. 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. ./. ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. ./. 0/1 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. ./. ./. 0/1 ./. 0/0 0/1
-chr1 44231607 . CA C . PASS VC=INDEL;AC=216;AF=0.69;AN=314;refseq.name=NM_006279;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1
-chr1 44231608 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=215;AF=0.68;AN=314;refseq.name=NM_006279;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1
-chr1 44327106 . GCTGTCAGGACTTGTATAGA G . PASS VC=INDEL;AC=193;AF=0.66;AN=294;refseq.name=NM_006279;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. 1/1 1/1
-chr1 44730823 . G GGAGA . PASS VC=INDEL;AC=295;AF=0.96;AN=306;refseq.name=NM_024066;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 44881687 . GCAT G . PASS VC=INDEL;AC=29;AF=0.09;AN=314;refseq.name=NM_018150;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr1 45223909 . GATTAGCTG G . PASS VC=INDEL;AC=167;AF=0.55;AN=306;refseq.name=NM_006845;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1
-chr1 46900444 . T TGTGGGAATGC . PASS VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=296 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 46900720 . C CTT . PASS VC=INDEL;AC=244;AF=0.79;AN=308 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 46900721 . T TTT . PASS VC=INDEL;AC=241;AF=0.79;AN=304 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 47052336 . TGAAA T . PASS VC=INDEL;AC=76;AF=0.24;AN=316;refseq.name=NM_003684;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0
-chr1 47167062 . TT T . PASS VC=INDEL;AC=174;AF=0.64;AN=272;refseq.name=NM_014774;refseq.positionType=intron GT ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 ./. 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 ./. 0/0
-chr1 47324578 . CTACTACAAA C . PASS VC=INDEL;AC=150;AF=0.65;AN=232 GT 1/1 ./. ./. ./. ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 1/1 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 ./. ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. ./. ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1
-chr1 47325281 . CA C . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 47891688 . AT A . PASS VC=INDEL;AC=84;AF=0.29;AN=294 GT 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr1 47931769 . TTCTC T . PASS VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 48000154 . G GTTT . PASS VC=INDEL;AC=11;AF=0.05;AN=232 GT ./. 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0
-chr1 48146050 . CCTGA C . PASS VC=INDEL;AC=28;AF=0.09;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 48520865 . CAGGGTGAGTAGGCCTGGGCAG C . PASS VC=INDEL;AC=4;AF=0.01;AN=316 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 48520886 . GAG G . PASS VC=INDEL;AC=31;AF=0.14;AN=216 GT ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/0 1/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 ./. ./. ./.
-chr1 48544917 . G GTGTT . PASS VC=INDEL;AC=43;AF=0.14;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 49109456 . AGAGC A . PASS VC=INDEL;AC=31;AF=0.14;AN=226;refseq.name=NM_032785;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/1 ./. ./. ./. ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/1 0/1 0/1
-chr1 49124365 . C CGAG . PASS VC=INDEL;AC=93;AF=0.29;AN=316;refseq.name=NM_032785;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 49124368 . G GGAG . PASS VC=INDEL;AC=93;AF=0.29;AN=316;refseq.name=NM_032785;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 49126514 . C CTG . PASS VC=INDEL;AC=89;AF=0.3;AN=296;refseq.name=NM_032785;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 50107735 . G GA . PASS VC=INDEL;AC=68;AF=0.22;AN=312 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 50539498 . T TCT . PASS VC=INDEL;AC=312;AF=0.99;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 50652516 . A AGAA . PASS VC=INDEL;AC=247;AF=0.78;AN=316;refseq.name=NM_021952;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 51315116 . ACTG A . PASS VC=INDEL;AC=13;AF=0.04;AN=316;refseq.name=NM_007051;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 52336500 . TAATACA T . PASS VC=INDEL;AC=17;AF=0.07;AN=230;refseq.name=NM_002525;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./.
-chr1 52798171 . A AT . PASS VC=INDEL;AC=307;AF=0.97;AN=316;refseq.name=NM_004799;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 53554533 . A AT . PASS VC=INDEL;AC=33;AF=0.11;AN=294;refseq.name=NM_006671;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. ./. 0/1
-chr1 53986946 . TG T . PASS VC=INDEL;AC=188;AF=0.59;AN=316;refseq.name=NM_147193;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1
-chr1 54168427 . C CTCTG . PASS VC=INDEL;AC=109;AF=0.35;AN=308;refseq.name=NM_147193;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0
-chr1 54558546 . T TAGAC . PASS VC=INDEL;AC=66;AF=0.21;AN=316;refseq.name=NM_153035;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 54558548 . G GACAG . PASS VC=INDEL;AC=66;AF=0.21;AN=316;refseq.name=NM_153035;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 54619996 . AC A . PASS VC=INDEL;AC=193;AF=0.64;AN=302;refseq.name=NM_201546;refseq.positionType=promoter GT 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 ./. 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1
-chr1 54757161 . C CCA . PASS VC=INDEL;AC=186;AF=0.59;AN=314;refseq.name=NM_001009955;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1
-chr1 54757166 . C CAC . PASS VC=INDEL;AC=185;AF=0.59;AN=312;refseq.name=NM_001009955;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1
-chr1 55566411 . TTAGTC T . PASS VC=INDEL;AC=207;AF=0.66;AN=316;refseq.name=NM_015306;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1
-chr1 55743440 . C CCT . PASS VC=INDEL;AC=261;AF=0.84;AN=312 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 ./. 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 55888273 . T TC . PASS VC=INDEL;AC=265;AF=0.88;AN=302 GT 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 55888274 . C CC . PASS VC=INDEL;AC=271;AF=0.89;AN=306 GT 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 55892282 . T TAGAAAA . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 55998244 . CGCACGCTC C . PASS VC=INDEL;AC=265;AF=0.84;AN=314 GT 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 56495367 . CTGAG C . PASS VC=INDEL;AC=76;AF=0.24;AN=316 GT 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 57353886 . C CTA . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_000562;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 57854490 . AAT A . PASS VC=INDEL;AC=24;AF=0.08;AN=312;refseq.name=NM_021080;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 58391942 . G GAAA . PASS VC=INDEL;AC=10;AF=0.03;AN=314;refseq.name=NM_021080;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1
-chr1 58413348 . A AG . PASS VC=INDEL;AC=50;AF=0.22;AN=226;refseq.name=NM_021080;refseq.positionType=intron GT 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. ./. ./. ./. ./. ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 1/1 ./. 1/1
-chr1 58550673 . CT C . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_021080;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 58629900 . CAGA C . PASS VC=INDEL;AC=15;AF=0.05;AN=316;refseq.name=NM_021080;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 58999156 . AT A . PASS VC=INDEL;AC=151;AF=0.53;AN=286;refseq.name=NM_145243;refseq.positionType=intron GT ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1
-chr1 59009401 . T TT . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_145243;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 59104181 . GA G . PASS VC=INDEL;AC=271;AF=0.89;AN=304 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 59319761 . AG A . PASS VC=INDEL;AC=195;AF=0.67;AN=290 GT 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1
-chr1 59319762 . GG G . PASS VC=INDEL;AC=200;AF=0.68;AN=296 GT 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1
-chr1 59630873 . CT C . PASS VC=INDEL;AC=155;AF=0.49;AN=316 GT 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr1 59635600 . TAT T . PASS VC=INDEL;AC=287;AF=0.91;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1
-chr1 60128716 . G GC . PASS VC=INDEL;AC=309;AF=0.98;AN=316;refseq.name=NM_018291;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 60128717 . C CC . PASS VC=INDEL;AC=309;AF=0.98;AN=316;refseq.name=NM_018291;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 60228311 . T TCT . PASS VC=INDEL;AC=250;AF=0.8;AN=314;refseq.name=NM_018291;refseq.positionType=exon GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1
-chr1 60460874 . A ACTA . PASS VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316;refseq.name=NM_152377;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 61786308 . ATCTTA A . PASS VC=INDEL;AC=126;AF=0.4;AN=316;refseq.name=NM_005595;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0
-chr1 62087979 . T TGACCTACTGTGCT . PASS VC=INDEL;AC=194;AF=0.63;AN=310 GT 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 62128942 . CTTGCACA C . PASS VC=INDEL;AC=123;AF=0.39;AN=316 GT 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0
-chr1 62940266 . T TG . PASS VC=INDEL;AC=133;AF=0.43;AN=312;refseq.name=NM_033407;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1
-chr1 63331690 . TA T . PASS VC=INDEL;AC=234;AF=0.74;AN=316 GT 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1
-chr1 63331691 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=232;AF=0.74;AN=314 GT 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1
-chr1 63423181 . T TCAT . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 63907866 . A AATGTTT . PASS VC=INDEL;AC=229;AF=0.76;AN=300;refseq.name=NM_014288;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 ./. 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 63907868 . T TGTTTAT . PASS VC=INDEL;AC=229;AF=0.77;AN=298;refseq.name=NM_014288;refseq.positionType=intron GT ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 ./. ./. 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 63985884 . ATCAT A . PASS VC=INDEL;AC=91;AF=0.31;AN=298;refseq.name=NM_014288;refseq.positionType=intron GT ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 ./. 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1
-chr1 63987096 . ATG A . PASS VC=INDEL;AC=37;AF=0.18;AN=202;refseq.name=NM_014288;refseq.positionType=intron GT ./. 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. ./. ./. ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1
-chr1 64264921 . TTGTGTCAT T . PASS VC=INDEL;AC=136;AF=0.46;AN=298;refseq.name=NM_005012;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1
-chr1 64463351 . GT G . PASS VC=INDEL;AC=244;AF=0.77;AN=316;refseq.name=NM_005012;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 64627261 . A AAA . PASS VC=INDEL;AC=79;AF=0.25;AN=316;refseq.name=NM_005012;refseq.positionType=intron GT 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 65237568 . G GGTTA . PASS VC=INDEL;AC=237;AF=0.75;AN=316;refseq.name=NM_018211;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1
-chr1 65299673 . T TTAAG . PASS VC=INDEL;AC=10;AF=0.03;AN=314;refseq.name=NM_002227;refseq.positionType=exon GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 65545194 . A AT . PASS VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 65545195 . T TT . PASS VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 66063617 . ATGT A . PASS VC=INDEL;AC=212;AF=0.67;AN=316;refseq.name=NM_002303;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 66198019 . A ACCATCCA . PASS VC=INDEL;AC=76;AF=0.26;AN=296 GT 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 1/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1
-chr1 66460193 . T TC . PASS VC=INDEL;AC=301;AF=0.95;AN=316;refseq.name=NM_001037341;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 66801086 . TGT T . PASS VC=INDEL;AC=19;AF=0.06;AN=316;refseq.name=NM_001037341;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 66952677 . A ATC . PASS VC=INDEL;AC=158;AF=0.65;AN=244 GT 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 ./. ./. 0/1 0/0 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 ./. ./. 1/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1
-chr1 67152254 . ATAATTTCACGA A . PASS VC=INDEL;AC=9;AF=0.03;AN=316;refseq.name=NM_032291;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 67206037 . AATTG A . PASS VC=INDEL;AC=50;AF=0.19;AN=268;refseq.name=NM_032291;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1
-chr1 67459726 . T TT . PASS VC=INDEL;AC=54;AF=0.18;AN=300 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./.
-chr1 68038796 . ACA A . PASS VC=INDEL;AC=21;AF=0.08;AN=264 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0
-chr1 68291788 . GC G . PASS VC=INDEL;AC=19;AF=0.06;AN=316;refseq.name=NM_018841;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr1 68570194 . CCCT C . PASS VC=INDEL;AC=110;AF=0.35;AN=310;refseq.name=NM_001002292;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr1 69008683 . C CA . PASS VC=INDEL;AC=68;AF=0.3;AN=230 GT 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 1/1 ./. 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 ./. ./. 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 ./. ./. ./. 1/1 0/1 1/1 0/0 ./. 1/1 0/1 ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. ./. 1/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 0/1 0/0 1/1 ./. ./. ./. 0/0 ./. 1/1 ./. ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. ./. ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./.
-chr1 69398928 . CAAC C . PASS VC=INDEL;AC=66;AF=0.21;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr1 69424885 . AG A . PASS VC=INDEL;AC=257;AF=0.81;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1
-chr1 69424886 . GG G . PASS VC=INDEL;AC=257;AF=0.81;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1
-chr1 69702172 . T TT . PASS VC=INDEL;AC=186;AF=0.59;AN=316 GT 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 69947085 . T TT . PASS VC=INDEL;AC=199;AF=0.87;AN=230 GT ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 ./. ./. ./. 0/0 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/0 ./. ./. 1/1 ./. 1/1 ./. ./. 1/1 0/1 ./. 0/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 0/1 0/0 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 ./. ./. ./. ./. ./. ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1
-chr1 70116412 . T TAAT . PASS VC=INDEL;AC=236;AF=0.77;AN=308 GT 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 70794740 . AAAAC A . PASS VC=INDEL;AC=49;AF=0.17;AN=288;refseq.name=NM_030816;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 70796576 . TTACTT T . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_030816;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 71101845 . TG T . PASS VC=INDEL;AC=38;AF=0.12;AN=310 GT 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 71353307 . AT A . PASS VC=INDEL;AC=88;AF=0.28;AN=310;refseq.name=NM_000957;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1
-chr1 71366228 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=123;AF=0.39;AN=314;refseq.name=NM_000957;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 ./. 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1
-chr1 71366595 . A AAGTG . PASS VC=INDEL;AC=108;AF=0.34;AN=316;refseq.name=NM_000957;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1
-chr1 71366598 . T TGAGT . PASS VC=INDEL;AC=109;AF=0.34;AN=316;refseq.name=NM_000957;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1
-chr1 71693491 . TGAG T . PASS VC=INDEL;AC=32;AF=0.1;AN=312 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 71693493 . AGGA A . PASS VC=INDEL;AC=34;AF=0.11;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 72053145 . AG A . PASS VC=INDEL;AC=229;AF=0.72;AN=316;refseq.name=NM_173808;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 72321086 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=54;AF=0.17;AN=314;refseq.name=NM_173808;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1
-chr1 73854019 . T TTTTA . PASS VC=INDEL;AC=181;AF=0.59;AN=308 GT 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1
-chr1 74227801 . AG A . PASS VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 74404505 . TTT T . PASS VC=INDEL;AC=23;AF=0.07;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 74892891 . AG A . PASS VC=INDEL;AC=75;AF=0.24;AN=316;refseq.name=NM_001112808;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 74896404 . ACTCAA A . PASS VC=INDEL;AC=26;AF=0.08;AN=316;refseq.name=NM_001112808;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 75049490 . C CT . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_001002912;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 75156563 . GCTT G . PASS VC=INDEL;AC=259;AF=0.82;AN=316 GT 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1
-chr1 75661521 . TTCTT T . PASS VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=312 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 76005746 . A AC . PASS VC=INDEL;AC=184;AF=0.58;AN=316;refseq.name=NM_152697;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0
-chr1 76054645 . AT A . PASS VC=INDEL;AC=14;AF=0.05;AN=290;refseq.name=NM_152697;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0
-chr1 76110056 . ATCAT A . PASS VC=INDEL;AC=202;AF=0.7;AN=290 GT 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 ./. 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1
-chr1 76110059 . ATTCA A . PASS VC=INDEL;AC=198;AF=0.68;AN=290 GT ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1
-chr1 76603385 . A AA . PASS VC=INDEL;AC=45;AF=0.14;AN=316;refseq.name=NM_152996;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr1 76647177 . T TA . PASS VC=INDEL;AC=44;AF=0.15;AN=292;refseq.name=NM_152996;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0
-chr1 76772246 . TAG T . PASS VC=INDEL;AC=71;AF=0.22;AN=316;refseq.name=NM_152996;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1
-chr1 77019040 . G GA . PASS VC=INDEL;AC=123;AF=0.39;AN=316;refseq.name=NM_152996;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1
-chr1 77019568 . TTCTG T . PASS VC=INDEL;AC=72;AF=0.23;AN=316;refseq.name=NM_152996;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1
-chr1 77147457 . T TG . PASS VC=INDEL;AC=307;AF=0.97;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 77154589 . T TA . PASS VC=INDEL;AC=300;AF=0.95;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 77350958 . GT G . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_030965;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 77412672 . T TCAAA . PASS VC=INDEL;AC=183;AF=0.58;AN=316;refseq.name=NM_030965;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1
-chr1 77412677 . C CAAAC . PASS VC=INDEL;AC=183;AF=0.58;AN=316;refseq.name=NM_030965;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1
-chr1 77761353 . ATTCT A . PASS VC=INDEL;AC=87;AF=0.28;AN=310;refseq.name=NM_174858;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 78436001 . T TCT . PASS VC=INDEL;AC=139;AF=0.45;AN=308;refseq.name=NM_003902;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr1 78477804 . T TAAGAC . PASS VC=INDEL;AC=294;AF=0.93;AN=316;refseq.name=NM_007034;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 78533885 . CAG C . PASS VC=INDEL;AC=126;AF=0.4;AN=316;refseq.name=NM_017655;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1
-chr1 78533886 . AGA A . PASS VC=INDEL;AC=126;AF=0.4;AN=316;refseq.name=NM_017655;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1
-chr1 78752617 . TC T . PASS VC=INDEL;AC=160;AF=0.51;AN=314 GT 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1
-chr1 79595269 . T TC . PASS VC=INDEL;AC=37;AF=0.12;AN=312 GT 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1
-chr1 79694557 . CTTGT C . PASS VC=INDEL;AC=173;AF=0.68;AN=254 GT 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 1/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 ./. ./. 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0
-chr1 80133716 . CA C . PASS VC=INDEL;AC=74;AF=0.27;AN=276 GT 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 1/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 80193527 . CA C . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 80279810 . T TT . PASS VC=INDEL;AC=69;AF=0.22;AN=314 GT 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1
-chr1 80415715 . C CATGTCTATTAT . PASS VC=INDEL;AC=197;AF=0.62;AN=316 GT 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1
-chr1 80415717 . T TGTCTATTATAT . PASS VC=INDEL;AC=197;AF=0.62;AN=316 GT 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1
-chr1 80606020 . GTAGGC G . PASS VC=INDEL;AC=282;AF=0.89;AN=316 GT 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1
-chr1 80684057 . A AA . PASS VC=INDEL;AC=217;AF=0.69;AN=316 GT 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1
-chr1 80857688 . AAATA A . PASS VC=INDEL;AC=97;AF=0.31;AN=316 GT 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0
-chr1 81007659 . A AC . PASS VC=INDEL;AC=185;AF=0.59;AN=312 GT 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0
-chr1 81007660 . C CC . PASS VC=INDEL;AC=185;AF=0.59;AN=314 GT 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0
-chr1 81912884 . C CT . PASS VC=INDEL;AC=15;AF=0.05;AN=298 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0
-chr1 82042397 . TCTT T . PASS VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 82264610 . TG T . PASS VC=INDEL;AC=167;AF=0.54;AN=312;refseq.name=NM_012302;refseq.positionType=promoter GT 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0
-chr1 82264994 . G GGTAG . PASS VC=INDEL;AC=49;AF=0.16;AN=316;refseq.name=NM_012302;refseq.positionType=promoter GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0
-chr1 82280496 . ATGT A . PASS VC=INDEL;AC=84;AF=0.27;AN=316;refseq.name=NM_012302;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 82315714 . G GAGTG . PASS VC=INDEL;AC=38;AF=0.12;AN=306;refseq.name=NM_012302;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-chr1 82316526 . TT T . PASS VC=INDEL;AC=209;AF=0.67;AN=312;refseq.name=NM_012302;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0
-chr1 82329993 . CATAT C . PASS VC=INDEL;AC=305;AF=0.97;AN=316;refseq.name=NM_012302;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 82710650 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=297;AF=0.96;AN=310 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 83144930 . TC T . PASS VC=INDEL;AC=153;AF=0.55;AN=278 GT 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 ./. 0/0 1/1 ./. ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 83208212 . C CAGAT . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 83208213 . A AGATA . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 83581070 . C CCAGA . PASS VC=INDEL;AC=188;AF=0.74;AN=254 GT ./. ./. 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 0/1 ./. ./. ./. 1/1 1/1 ./. 0/0 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/0 1/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 ./. ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 ./. ./. ./. 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 ./. ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1
-chr1 84127066 . TCT T . PASS VC=INDEL;AC=71;AF=0.22;AN=316 GT 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-chr1 84822658 . TCAATTAAAACTCACAG T . PASS VC=INDEL;AC=45;AF=0.16;AN=286 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 85570521 . GTTC G . PASS VC=INDEL;AC=166;AF=0.53;AN=316;refseq.name=NM_145172;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1
-chr1 86565855 . T TCT . PASS VC=INDEL;AC=20;AF=0.06;AN=316;refseq.name=NM_152890;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr1 86714492 . T TA . PASS VC=INDEL;AC=263;AF=0.88;AN=300 GT 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1
-chr1 86786541 . CAG C . PASS VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 86839425 . TACTT T . PASS VC=INDEL;AC=15;AF=0.05;AN=280;refseq.name=NM_001007022;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0
-chr1 87558067 . CACATAC C . PASS VC=INDEL;AC=285;AF=0.97;AN=294;refseq.name=NM_012262;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1
-chr1 88184554 . T TCA . PASS VC=INDEL;AC=40;AF=0.14;AN=276 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/1
-chr1 88351056 . A AGT . PASS VC=INDEL;AC=222;AF=0.7;AN=316 GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0
-chr1 88391828 . C CCTT . PASS VC=INDEL;AC=216;AF=0.7;AN=310 GT 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1
-chr1 88391834 . T TCTT . PASS VC=INDEL;AC=219;AF=0.69;AN=316 GT 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1
-chr1 88423056 . T TA . PASS VC=INDEL;AC=210;AF=0.8;AN=262 GT 1/1 0/0 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. ./. 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 ./. 1/1 ./. 0/0 0/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 88878932 . TGAAG T . PASS VC=INDEL;AC=222;AF=0.71;AN=314 GT 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 88934449 . T TA . PASS VC=INDEL;AC=215;AF=0.71;AN=304 GT 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0
-chr1 89147233 . C CTG . PASS VC=INDEL;AC=270;AF=0.94;AN=288;refseq.name=NM_006256;refseq.positionType=promoter GT 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 89147234 . T TGT . PASS VC=INDEL;AC=193;AF=0.91;AN=212;refseq.name=NM_006256;refseq.positionType=promoter GT ./. 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. ./. ./. ./. ./. 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. ./. ./. 1/1 1/1 ./. 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. ./. ./. ./. ./. 1/1 ./. 1/1 ./. ./. ./. 0/1 ./. 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 ./. ./. ./. ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 ./. ./. ./. 1/1
-chr1 90055475 . TT T . PASS VC=INDEL;AC=35;AF=0.11;AN=316;refseq.name=NM_015350;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr1 90055577 . TATG T . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_015350;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 90305331 . G GA . PASS VC=INDEL;AC=301;AF=0.95;AN=316;refseq.name=NM_018103;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 91238816 . G GT . PASS VC=INDEL;AC=86;AF=0.29;AN=296 GT 0/0 0/0 ./. 1/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1
-chr1 91308113 . GC G . PASS VC=INDEL;AC=8;AF=0.03;AN=282 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0
-chr1 91354296 . TT T . PASS VC=INDEL;AC=252;AF=0.83;AN=304 GT 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 91544957 . ACT A . PASS VC=INDEL;AC=99;AF=0.32;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 91566585 . GTTA G . PASS VC=INDEL;AC=139;AF=0.45;AN=312 GT 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1
-chr1 92219769 . C CTCCTCAA . PASS VC=INDEL;AC=54;AF=0.17;AN=314;refseq.name=NM_003243;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 93167519 . C CTG . PASS VC=INDEL;AC=276;AF=1;AN=276;refseq.name=NM_005665;refseq.positionType=intron GT 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 93628710 . TACTC T . PASS VC=INDEL;AC=94;AF=0.31;AN=304;refseq.name=NM_016040;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1
-chr1 93704043 . T TCTAGAAAAATC . PASS VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=306;refseq.name=NM_206886;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 94443843 . G GAGAG . PASS VC=INDEL;AC=88;AF=0.3;AN=292 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0
-chr1 94634727 . TGAGT T . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_004815;refseq.positionType=exon GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 95103314 . AGCATCCTAAA A . PASS VC=INDEL;AC=6;AF=0.03;AN=240 GT ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 95167241 . TTAAC T . PASS VC=INDEL;AC=115;AF=0.36;AN=316 GT 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1
-chr1 95167244 . ACTAA A . PASS VC=INDEL;AC=116;AF=0.37;AN=316 GT 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1
-chr1 95266356 . A AAAATAAGAATCCA . PASS VC=INDEL;AC=212;AF=0.83;AN=256 GT 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. 0/0 1/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. ./. 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 ./. 1/1 ./. ./. ./.
-chr1 95349846 . G GG . PASS VC=INDEL;AC=195;AF=0.65;AN=302;refseq.name=NM_001114106;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 95638470 . GTAG G . PASS VC=INDEL;AC=9;AF=0.03;AN=306;refseq.name=NM_152487;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 96578762 . CAG C . PASS VC=INDEL;AC=78;AF=0.25;AN=314 GT 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1
-chr1 97069290 . G GT . PASS VC=INDEL;AC=57;AF=0.18;AN=316 GT 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr1 97352585 . A AGA . PASS VC=INDEL;AC=167;AF=0.53;AN=316 GT 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1
-chr1 97471673 . T TTA . PASS VC=INDEL;AC=39;AF=0.16;AN=238 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 1/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 1/1 ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/1
-chr1 97654513 . GTTAT G . PASS VC=INDEL;AC=17;AF=0.06;AN=302;refseq.name=NM_000110;refseq.positionType=intron GT ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 97728316 . AATA A . PASS VC=INDEL;AC=15;AF=0.05;AN=316;refseq.name=NM_000110;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 97862494 . TCCT T . PASS VC=INDEL;AC=47;AF=0.18;AN=256;refseq.name=NM_000110;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/1 1/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./.
-chr1 97940369 . TAACT T . PASS VC=INDEL;AC=37;AF=0.12;AN=306;refseq.name=NM_000110;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr1 98400957 . C CGATAT . PASS VC=INDEL;AC=290;AF=0.92;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 99032443 . T TTC . PASS VC=INDEL;AC=230;AF=0.79;AN=292 GT 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. ./. ./. ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/0 1/1
-chr1 99032444 . T TCT . PASS VC=INDEL;AC=236;AF=0.8;AN=296 GT 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 ./. 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1
-chr1 99662955 . A AAGA . PASS VC=INDEL;AC=146;AF=0.46;AN=316 GT 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 99714941 . GTTACAG G . PASS VC=INDEL;AC=6;AF=0.02;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 99848725 . AT A . PASS VC=INDEL;AC=50;AF=0.16;AN=316 GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 100194878 . C CCT . PASS VC=INDEL;AC=248;AF=0.78;AN=316;refseq.name=NM_001013660;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1
-chr1 100194903 . C CT . PASS VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=316;refseq.name=NM_001013660;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 100567908 . C CT . PASS VC=INDEL;AC=43;AF=0.14;AN=300;refseq.name=NM_194292;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 100793875 . CACTC C . PASS VC=INDEL;AC=105;AF=0.38;AN=274 GT 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/0 ./. 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 1/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0
-chr1 100808351 . TT T . PASS VC=INDEL;AC=27;AF=0.09;AN=294 GT ./. 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 ./. 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 ./. 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 100856872 . T TT . PASS VC=INDEL;AC=79;AF=0.25;AN=316;refseq.name=NM_003672;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0
-chr1 101093845 . TTCTGTAGTCAC T . PASS VC=INDEL;AC=24;AF=0.08;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 101295925 . CTA C . PASS VC=INDEL;AC=82;AF=0.26;AN=314 GT 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-chr1 101442572 . T TT . PASS VC=INDEL;AC=99;AF=0.31;AN=316;refseq.name=NM_133496;refseq.positionType=exon GT 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1
-chr1 101482924 . CTGTG C . PASS VC=INDEL;AC=32;AF=0.1;AN=316;refseq.name=NM_001077394;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 101859015 . G GA . PASS VC=INDEL;AC=107;AF=0.34;AN=316 GT 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0
-chr1 102315705 . A ATCTC . PASS VC=INDEL;AC=185;AF=0.59;AN=316;refseq.name=NM_058170;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 102315708 . T TCTCT . PASS VC=INDEL;AC=185;AF=0.59;AN=316;refseq.name=NM_058170;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 103391817 . TTA T . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=244;refseq.name=NM_001854;refseq.positionType=intron GT 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0
-chr1 103722297 . TGT T . PASS VC=INDEL;AC=32;AF=0.1;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 104533187 . A AGTT . PASS VC=INDEL;AC=148;AF=0.47;AN=316 GT 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1
-chr1 104896267 . GAG G . PASS VC=INDEL;AC=48;AF=0.15;AN=312 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr1 104896390 . ATATT A . PASS VC=INDEL;AC=38;AF=0.14;AN=268 GT 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 1/1 0/0 ./. 0/1 1/1 ./. 1/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/1 0/0
-chr1 105259435 . CACTAAACGTGCC C . PASS VC=INDEL;AC=6;AF=0.02;AN=250 GT ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 ./. 0/0
-chr1 105451424 . A ATCTAGT . PASS VC=INDEL;AC=98;AF=0.31;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1
-chr1 105504523 . C CTTT . PASS VC=INDEL;AC=82;AF=0.29;AN=282 GT ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/0 0/1 0/0 ./. 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1
-chr1 105837170 . T TAA . PASS VC=INDEL;AC=67;AF=0.24;AN=280 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 1/1 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/0
-chr1 105868766 . ATACTT A . PASS VC=INDEL;AC=92;AF=0.34;AN=274 GT ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 1/1 0/1 0/0 ./. 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 ./. 1/1 0/1 ./. 0/1 ./. 1/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1
-chr1 106762526 . AACT A . PASS VC=INDEL;AC=87;AF=0.28;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr1 106908645 . AC A . PASS VC=INDEL;AC=25;AF=0.08;AN=316 GT 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1
-chr1 107217236 . A AGGATCA . PASS VC=INDEL;AC=240;AF=0.79;AN=302 GT 1/1 1/1 ./. 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 107979567 . TT T . PASS VC=INDEL;AC=150;AF=0.55;AN=274;refseq.name=NM_001113226;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 1/1 ./. ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 ./. 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1
-chr1 108737087 . GG G . PASS VC=INDEL;AC=99;AF=0.32;AN=308;refseq.name=NM_013386;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-chr1 109186604 . A ATA . PASS VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 109295950 . TA T . PASS VC=INDEL;AC=54;AF=0.17;AN=312;refseq.name=NM_007269;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 109295955 . TTA T . PASS VC=INDEL;AC=57;AF=0.18;AN=310;refseq.name=NM_007269;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 109303951 . GTATAG G . PASS VC=INDEL;AC=89;AF=0.28;AN=316;refseq.name=NM_007269;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1
-chr1 109429108 . G GGAGAAAT . PASS VC=INDEL;AC=33;AF=0.14;AN=234;refseq.name=NM_013296;refseq.positionType=intron GT 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. ./. ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1
-chr1 109565068 . C CTC . PASS VC=INDEL;AC=304;AF=0.96;AN=316;refseq.name=NM_014969;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 110418161 . CTTAG C . PASS VC=INDEL;AC=56;AF=0.18;AN=316 GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1
-chr1 110911466 . AT A . PASS VC=INDEL;AC=67;AF=0.22;AN=310;refseq.name=NM_004696;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1
-chr1 111820993 . TTAAG T . PASS VC=INDEL;AC=46;AF=0.2;AN=232 GT 0/1 ./. 1/1 ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 ./. ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. ./. ./.
-chr1 111894729 . C CATG . PASS VC=INDEL;AC=32;AF=0.11;AN=302;refseq.name=NM_181643;refseq.positionType=exon GT 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0
-chr1 112384059 . G GG . PASS VC=INDEL;AC=111;AF=0.35;AN=314;refseq.name=NM_004980;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1
-chr1 112440856 . A ACTTA . PASS VC=INDEL;AC=138;AF=0.44;AN=312;refseq.name=NM_004980;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr1 112896532 . CTAAC C . PASS VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 112896636 . CA C . PASS VC=INDEL;AC=199;AF=0.64;AN=312 GT 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1
-chr1 112896637 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=199;AF=0.63;AN=316 GT 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1
-chr1 113322895 . TTCTA T . PASS VC=INDEL;AC=73;AF=0.3;AN=246 GT 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. ./. ./. 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 ./. 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. ./. ./. ./. 0/0 0/1 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0
-chr1 113467083 . CC C . PASS VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_003051;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 113635187 . C CTTTG . PASS VC=INDEL;AC=261;AF=0.83;AN=316;refseq.name=NM_014813;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 113635190 . T TGTTT . PASS VC=INDEL;AC=261;AF=0.83;AN=316;refseq.name=NM_014813;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 113640553 . GA G . PASS VC=INDEL;AC=111;AF=0.35;AN=314;refseq.name=NM_014813;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1
-chr1 113640556 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=112;AF=0.35;AN=316;refseq.name=NM_014813;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1
-chr1 113689905 . GAG G . PASS VC=INDEL;AC=41;AF=0.13;AN=316 GT 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 114240320 . A AA . PASS VC=INDEL;AC=229;AF=0.72;AN=316;refseq.name=NM_006608;refseq.positionType=exon GT 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 114339956 . C CTAAA . PASS VC=INDEL;AC=210;AF=0.78;AN=270;refseq.name=NM_018364;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/0 0/1 0/1 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 114565357 . CGGAGG C . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 116298599 . A ACTT . PASS VC=INDEL;AC=54;AF=0.17;AN=316;refseq.name=NM_001232;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 116435014 . ATAACCGA A . PASS VC=INDEL;AC=66;AF=0.26;AN=250 GT 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 1/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/0 1/1 ./. 0/0 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/0 ./. 1/1 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1
-chr1 116551982 . T TTAAAGC . PASS VC=INDEL;AC=31;AF=0.1;AN=304;refseq.name=NM_018420;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 116662025 . T TGA . PASS VC=INDEL;AC=55;AF=0.17;AN=316;refseq.name=NM_152367;refseq.positionType=intron GT 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 116662028 . G GAG . PASS VC=INDEL;AC=55;AF=0.17;AN=316;refseq.name=NM_152367;refseq.positionType=intron GT 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 117459931 . AAC A . PASS VC=INDEL;AC=90;AF=0.28;AN=316;refseq.name=NM_020440;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 117459932 . ACA A . PASS VC=INDEL;AC=90;AF=0.28;AN=316;refseq.name=NM_020440;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 117592136 . TTG T . PASS VC=INDEL;AC=24;AF=0.08;AN=300 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./.
-chr1 117722836 . C CA . PASS VC=INDEL;AC=36;AF=0.11;AN=316;refseq.name=NM_024626;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 120034138 . TCTAT T . PASS VC=INDEL;AC=99;AF=0.35;AN=284 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 1/1 1/1 0/0 0/0
-chr1 120185496 . G GGATT . PASS VC=INDEL;AC=264;AF=0.84;AN=314;refseq.name=NM_001080470;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 120280730 . TAA T . PASS VC=INDEL;AC=73;AF=0.23;AN=314;refseq.name=NM_006623;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 144995277 . AG A . PASS VC=INDEL;AC=41;AF=0.16;AN=258;refseq.name=NM_014644;refseq.positionType=promoter GT 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0
-chr1 145060382 . A AG . PASS VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316;refseq.name=NM_022359;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 146556039 . CCAAC C . PASS VC=INDEL;AC=64;AF=0.21;AN=310 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 146768690 . TC T . PASS VC=INDEL;AC=289;AF=0.91;AN=316 GT 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1
-chr1 146979526 . CCT C . PASS VC=INDEL;AC=63;AF=0.2;AN=316 GT 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0
-chr1 147047674 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=101;AF=0.32;AN=314;refseq.name=NM_004326;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1
-chr1 147108091 . A AC . PASS VC=INDEL;AC=227;AF=0.72;AN=314 GT 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 ./. 1/1
-chr1 147392223 . CATGGCTC C . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 147393527 . A AAGAA . PASS VC=INDEL;AC=10;AF=0.05;AN=218 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. ./. ./. ./. ./. ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/0 0/1 ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0
-chr1 147823728 . A AC . PASS VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=266 GT 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0
-chr1 151094921 . T TA . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 151094936 . CCTTA C . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 151743871 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=98;AF=0.32;AN=308;refseq.name=NM_016178;refseq.positionType=terminator GT 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 ./. 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1
-chr1 152348228 . TTAT T . PASS VC=INDEL;AC=9;AF=0.03;AN=316 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 152442163 . AAACA A . PASS VC=INDEL;AC=212;AF=0.68;AN=310 GT 0/1 ./. 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 ./. 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1
-chr1 152572426 . G GT . PASS VC=INDEL;AC=70;AF=0.25;AN=280;refseq.name=NM_178434;refseq.positionType=promoter GT 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 1/1 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. 0/0 ./. ./. 0/1 0/1 ./. 1/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1 0/0
-chr1 152797773 . C CC . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_178348;refseq.positionType=promoter GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 153703019 . TGTGTCTCTGCTT T . PASS VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_023015;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 154741714 . TAT T . PASS VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_002249;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 155303581 . AT A . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 155559888 . C CTTAT . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 156565049 . A AAC . PASS VC=INDEL;AC=314;AF=0.99;AN=316;refseq.name=NM_015590;refseq.positionType=exon GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 156572952 . T TGAA . PASS VC=INDEL;AC=39;AF=0.12;AN=312;refseq.name=NM_015590;refseq.positionType=promoter GT 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 156859572 . C CCT . PASS VC=INDEL;AC=219;AF=0.73;AN=300 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 156910892 . GCTCGTCTT G . PASS VC=INDEL;AC=39;AF=0.14;AN=270;refseq.name=NM_014784;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 157531425 . CA C . PASS VC=INDEL;AC=16;AF=0.06;AN=260 GT 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0
-chr1 157807166 . TGTTA T . PASS VC=INDEL;AC=250;AF=0.81;AN=310;refseq.name=NM_005894;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0
-chr1 157818429 . AC A . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 157924621 . ATAAG A . PASS VC=INDEL;AC=24;AF=0.08;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 157932325 . T TT . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 158154060 . CT C . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_001766;refseq.positionType=exon GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 158684734 . CA C . PASS VC=INDEL;AC=90;AF=0.28;AN=316 GT 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1
-chr1 158886780 . A AAGAT . PASS VC=INDEL;AC=241;AF=0.76;AN=316 GT 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 158886783 . A ATAGA . PASS VC=INDEL;AC=240;AF=0.76;AN=314 GT 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 158984187 . G GAGGC . PASS VC=INDEL;AC=26;AF=0.13;AN=198;refseq.name=NM_005531;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 1/1 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. ./. ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 1/1 1/1 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. ./. 1/1 1/1
-chr1 158984259 . AATT A . PASS VC=INDEL;AC=130;AF=0.49;AN=266;refseq.name=NM_005531;refseq.positionType=intron GT ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 ./. 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 ./. 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. ./. ./. ./. ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0
-chr1 159500234 . CT C . PASS VC=INDEL;AC=19;AF=0.06;AN=316 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 159741079 . TGT T . PASS VC=INDEL;AC=163;AF=0.52;AN=314 GT 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1
-chr1 160004099 . GATGTAGATAG G . PASS VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=314;refseq.name=NM_145167;refseq.positionType=promoter GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 160081222 . TGAAAAG T . PASS VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=312 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 160430789 . C CAG . PASS VC=INDEL;AC=51;AF=0.16;AN=314 GT 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 160464965 . AGTGAATTTTAGA A . PASS VC=INDEL;AC=12;AF=0.06;AN=214;refseq.name=NM_052931;refseq.positionType=intron GT ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1
-chr1 160578541 . C CA . PASS VC=INDEL;AC=277;AF=0.88;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 161765879 . T TCTT . PASS VC=INDEL;AC=77;AF=0.25;AN=310;refseq.name=NM_007348;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr1 161826110 . TT T . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=308;refseq.name=NM_007348;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 162354200 . AACAC A . PASS VC=INDEL;AC=32;AF=0.12;AN=262;refseq.name=NM_001085375;refseq.positionType=exon GT 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 ./. ./. ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1
-chr1 162629796 . C CGTT . PASS VC=INDEL;AC=238;AF=0.75;AN=316;refseq.name=NM_001014796;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 163132415 . TCCTGAACA T . PASS VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=314;refseq.name=NM_003617;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 163135904 . C CAGA . PASS VC=INDEL;AC=217;AF=0.84;AN=258;refseq.name=NM_003617;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 0/1 ./. 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1
-chr1 163136054 . T TTC . PASS VC=INDEL;AC=266;AF=0.84;AN=316;refseq.name=NM_003617;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 163136055 . T TCT . PASS VC=INDEL;AC=265;AF=0.84;AN=314;refseq.name=NM_003617;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 164351168 . ATTG A . PASS VC=INDEL;AC=261;AF=0.83;AN=316 GT 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 164448310 . AAAC A . PASS VC=INDEL;AC=236;AF=0.75;AN=316 GT 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 164548574 . TT T . PASS VC=INDEL;AC=11;AF=0.04;AN=308;refseq.name=NM_002585;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 164790567 . C CT . PASS VC=INDEL;AC=164;AF=0.52;AN=314;refseq.name=NM_002585;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0
-chr1 165207456 . TAGA T . PASS VC=INDEL;AC=17;AF=0.05;AN=316;refseq.name=NM_177398;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 165218477 . AGAGATTACTCTG A . PASS VC=INDEL;AC=79;AF=0.28;AN=280;refseq.name=NM_177398;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 ./. 1/1 1/1 0/0 0/1 ./. ./. 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 ./. 0/0 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1
-chr1 165261980 . TA T . PASS VC=INDEL;AC=129;AF=0.42;AN=308;refseq.name=NM_177398;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 ./. 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1
-chr1 165286489 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=23;AF=0.07;AN=314;refseq.name=NM_177398;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 165349359 . G GT . PASS VC=INDEL;AC=130;AF=0.42;AN=306 GT 0/1 ./. 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1
-chr1 165475542 . CT C . PASS VC=INDEL;AC=157;AF=0.5;AN=316 GT 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1
-chr1 165627134 . AT A . PASS VC=INDEL;AC=144;AF=0.46;AN=314 GT 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1
-chr1 165652540 . GTTAA G . PASS VC=INDEL;AC=202;AF=0.66;AN=304;refseq.name=NM_000696;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 1/1 0/1 1/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1
-chr1 165685796 . GGCACAGAT G . PASS VC=INDEL;AC=155;AF=0.49;AN=314 GT 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0
-chr1 165686450 . TAGG T . PASS VC=INDEL;AC=144;AF=0.46;AN=316 GT 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1
-chr1 165686452 . GGAG G . PASS VC=INDEL;AC=145;AF=0.46;AN=316 GT 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1
-chr1 166083223 . CCAC C . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_001017961;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 166602705 . TTGT T . PASS VC=INDEL;AC=73;AF=0.23;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0
-chr1 166639248 . A AAT . PASS VC=INDEL;AC=289;AF=0.91;AN=316 GT 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1
-chr1 166708316 . G GTAG . PASS VC=INDEL;AC=102;AF=0.32;AN=316 GT 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 167512714 . TTCCAAAACCGA T . PASS VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=316;refseq.name=NM_003851;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 167513042 . CA C . PASS VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=316;refseq.name=NM_003851;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 167516739 . T TAA . PASS VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_003851;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 167675717 . T TTC . PASS VC=INDEL;AC=22;AF=0.07;AN=296;refseq.name=NM_052862;refseq.positionType=terminator GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 167682039 . CCAAA C . PASS VC=INDEL;AC=68;AF=0.22;AN=316 GT 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1
-chr1 167682041 . AAACA A . PASS VC=INDEL;AC=68;AF=0.22;AN=316 GT 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1
-chr1 167697899 . GTG G . PASS VC=INDEL;AC=50;AF=0.16;AN=316;refseq.name=NM_003953;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr1 167985326 . TG T . PASS VC=INDEL;AC=144;AF=0.49;AN=294;refseq.name=NM_001017977;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 ./. ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1
-chr1 168053859 . ACTCA A . PASS VC=INDEL;AC=11;AF=0.03;AN=316;refseq.name=NM_153832;refseq.positionType=terminator GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 168133510 . CCTAAC C . PASS VC=INDEL;AC=96;AF=0.3;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1
-chr1 168200152 . GT G . PASS VC=INDEL;AC=135;AF=0.43;AN=316;refseq.name=NM_199344;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr1 168423776 . AGC A . PASS VC=INDEL;AC=4;AF=0.01;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 169066627 . T TC . PASS VC=INDEL;AC=301;AF=0.95;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0
-chr1 169066629 . C CC . PASS VC=INDEL;AC=301;AF=0.95;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0
-chr1 169095586 . T TAT . PASS VC=INDEL;AC=165;AF=0.52;AN=316;refseq.name=NM_001001787;refseq.positionType=intron GT 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1
-chr1 169214437 . CA C . PASS VC=INDEL;AC=10;AF=0.03;AN=316;refseq.name=NM_013330;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 169875635 . AG A . PASS VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 170054566 . CAAAT C . PASS VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 170213713 . C CA . PASS VC=INDEL;AC=302;AF=0.96;AN=314 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 170231599 . C CA . PASS VC=INDEL;AC=178;AF=0.57;AN=314 GT 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1
-chr1 170412385 . A AA . PASS VC=INDEL;AC=247;AF=0.79;AN=312 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 171564547 . T TT . PASS VC=INDEL;AC=141;AF=0.68;AN=206 GT 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 ./. 0/1 ./. ./. ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. ./. ./. 0/1 0/1 ./. ./. ./. 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 ./. 1/1 ./. ./. 0/1 ./. 0/1 ./. ./. ./. ./. 0/1 ./. 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 ./. ./. ./. ./. ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. 1/1 ./. ./. 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 ./. ./. 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 0/1 ./. ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1
-chr1 171668398 . C CATC . PASS VC=INDEL;AC=42;AF=0.13;AN=316 GT 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 171779854 . AAAG A . PASS VC=INDEL;AC=128;AF=0.46;AN=278 GT 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. ./. ./. 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1
-chr1 171799766 . A ACT . PASS VC=INDEL;AC=48;AF=0.18;AN=268 GT 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 171806532 . C CAT . PASS VC=INDEL;AC=14;AF=0.05;AN=308 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr1 172312482 . AAG A . PASS VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=316;refseq.name=NM_015569;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 172415351 . GA G . PASS VC=INDEL;AC=75;AF=0.24;AN=316;refseq.name=NM_139240;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1
-chr1 172620138 . A ACT . PASS VC=INDEL;AC=134;AF=0.42;AN=316 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 172620139 . C CTC . PASS VC=INDEL;AC=134;AF=0.43;AN=314 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 173063473 . A ATGTC . PASS VC=INDEL;AC=124;AF=0.62;AN=200 GT 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. ./. 1/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 1/1 ./. ./. 0/0 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 ./. 1/1 0/0 1/1 1/1 ./. ./. ./. ./. ./. ./. 1/1 ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 ./. 0/1 ./. 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 ./. 1/1 ./. ./. 0/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 ./. ./. 0/0 ./. 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 ./. ./. 1/1 0/0 ./. 0/1 ./. ./. 1/1 0/0 ./. ./. ./. 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 ./.
-chr1 173541560 . CAA C . PASS VC=INDEL;AC=233;AF=0.74;AN=316;refseq.name=NM_178527;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0
-chr1 173749093 . T TC . PASS VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316;refseq.name=NM_014458;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 173755936 . T TGAAG . PASS VC=INDEL;AC=182;AF=0.58;AN=316;refseq.name=NM_014458;refseq.positionType=terminator GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0
-chr1 173870326 . ACTA A . PASS VC=INDEL;AC=235;AF=0.74;AN=316 GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0
-chr1 174411392 . T TTGTAT . PASS VC=INDEL;AC=251;AF=0.8;AN=314;refseq.name=NM_014857;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0
-chr1 174524160 . T TAT . PASS VC=INDEL;AC=212;AF=0.67;AN=316;refseq.name=NM_014857;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0
-chr1 175131961 . GA G . PASS VC=INDEL;AC=85;AF=0.28;AN=306 GT 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/0 0/1
-chr1 175299777 . CAT C . PASS VC=INDEL;AC=18;AF=0.06;AN=316;refseq.name=NM_003285;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 175355790 . GG G . PASS VC=INDEL;AC=199;AF=0.74;AN=270;refseq.name=NM_003285;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 ./. ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. ./. 0/0 0/1 ./. 0/1
-chr1 175418807 . A AACA . PASS VC=INDEL;AC=118;AF=0.37;AN=316;refseq.name=NM_003285;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1
-chr1 175420618 . A AG . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_003285;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 175443036 . AGGAGA A . PASS VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_003285;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 175472120 . C CTAATCAGGATCTTGACATGTGACACAAGATCCTTGAG . PASS VC=INDEL;AC=14;AF=0.04;AN=316;refseq.name=NM_003285;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 175584762 . CT C . PASS VC=INDEL;AC=45;AF=0.14;AN=314;refseq.name=NM_003285;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1
-chr1 177236388 . C CG . PASS VC=INDEL;AC=167;AF=0.54;AN=312;refseq.name=NM_021165;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1
-chr1 177236389 . G GG . PASS VC=INDEL;AC=166;AF=0.53;AN=316;refseq.name=NM_021165;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1
-chr1 177558539 . G GAGA . PASS VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=290 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 177558541 . G GAAG . PASS VC=INDEL;AC=10;AF=0.03;AN=296 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 178521563 . TAAGAC T . PASS VC=INDEL;AC=21;AF=0.09;AN=246 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1 1/1 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 179038241 . GT G . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_014864;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 179293907 . CAA C . PASS VC=INDEL;AC=34;AF=0.11;AN=314;refseq.name=NM_003101;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1
-chr1 179724329 . G GG . PASS VC=INDEL;AC=307;AF=0.97;AN=316;refseq.name=NM_173509;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 179762445 . GT G . PASS VC=INDEL;AC=85;AF=0.27;AN=316;refseq.name=NM_173509;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr1 179762446 . TT T . PASS VC=INDEL;AC=85;AF=0.27;AN=316;refseq.name=NM_173509;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr1 179773170 . CTTGTC C . PASS VC=INDEL;AC=77;AF=0.28;AN=274;refseq.name=NM_173509;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 1/1 ./. ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1
-chr1 180108217 . T TTATC . PASS VC=INDEL;AC=229;AF=0.72;AN=316 GT 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 180722815 . TACTC T . PASS VC=INDEL;AC=4;AF=0.01;AN=316;refseq.name=NM_004736;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 180722816 . ACTCA A . PASS VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=316;refseq.name=NM_004736;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 180762626 . CAT C . PASS VC=INDEL;AC=12;AF=0.04;AN=296;refseq.name=NM_004736;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1
-chr1 180866670 . CCC C . PASS VC=INDEL;AC=73;AF=0.29;AN=256 GT 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/1 0/1 0/1 0/1
-chr1 180974402 . A AA . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=298;refseq.name=NM_005819;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0
-chr1 181233905 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=266 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0
-chr1 181456872 . CC C . PASS VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=300;refseq.name=NM_000721;refseq.positionType=intron GT ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 181610646 . CT C . PASS VC=INDEL;AC=58;AF=0.18;AN=314;refseq.name=NM_000721;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 182087446 . G GTCT . PASS VC=INDEL;AC=198;AF=0.68;AN=292 GT 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0
-chr1 182739634 . TAAGA T . PASS VC=INDEL;AC=65;AF=0.21;AN=316 GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 182951675 . AGA A . PASS VC=INDEL;AC=78;AF=0.25;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0
-chr1 183032447 . C CTAAG . PASS VC=INDEL;AC=125;AF=0.4;AN=316;refseq.name=NM_002293;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1
-chr1 183073109 . T TTG . PASS VC=INDEL;AC=125;AF=0.4;AN=316;refseq.name=NM_002293;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1
-chr1 183073111 . G GTG . PASS VC=INDEL;AC=125;AF=0.4;AN=316;refseq.name=NM_002293;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1
-chr1 183077296 . A AG . PASS VC=INDEL;AC=126;AF=0.4;AN=316;refseq.name=NM_002293;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1
-chr1 183097956 . G GTTA . PASS VC=INDEL;AC=127;AF=0.4;AN=314;refseq.name=NM_002293;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1
-chr1 183145207 . G GTAG . PASS VC=INDEL;AC=35;AF=0.11;AN=312 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr1 183180446 . GG G . PASS VC=INDEL;AC=54;AF=0.17;AN=316;refseq.name=NM_005562;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 183330737 . TAA T . PASS VC=INDEL;AC=197;AF=0.63;AN=312;refseq.name=NM_015039;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1
-chr1 183589923 . A ATCTT . PASS VC=INDEL;AC=117;AF=0.37;AN=314 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0
-chr1 183712910 . AC A . PASS VC=INDEL;AC=131;AF=0.42;AN=312;refseq.name=NM_015149;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1
-chr1 183806728 . T TG . PASS VC=INDEL;AC=229;AF=0.85;AN=270;refseq.name=NM_015149;refseq.positionType=intron GT 1/1 ./. 1/1 ./. ./. 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 ./. 0/1 ./. ./. 0/0 ./. 1/1 1/1 0/0 1/1 ./. 1/1 0/0 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 183996005 . C CTATTA . PASS VC=INDEL;AC=27;AF=0.09;AN=316;refseq.name=NM_015101;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 184391018 . C CTA . PASS VC=INDEL;AC=68;AF=0.22;AN=312;refseq.name=NM_030806;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 184561827 . CAGA C . PASS VC=INDEL;AC=47;AF=0.15;AN=316;refseq.name=NM_030806;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 184577643 . T TC . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_030806;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 185540897 . T TCCAG . PASS VC=INDEL;AC=136;AF=0.48;AN=286 GT 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0
-chr1 185865550 . C CAT . PASS VC=INDEL;AC=53;AF=0.17;AN=310;refseq.name=NM_031935;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr1 186378142 . CAGTT C . PASS VC=INDEL;AC=55;AF=0.21;AN=266;refseq.name=NM_017847;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 1/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 ./. 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr1 186769215 . T TA . PASS VC=INDEL;AC=45;AF=0.14;AN=316 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 186933480 . T TTAAT . PASS VC=INDEL;AC=135;AF=0.43;AN=316;refseq.name=NM_024420;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0
-chr1 187372829 . AGGCTT A . PASS VC=INDEL;AC=34;AF=0.11;AN=304 GT ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1
-chr1 187372830 . GGCTTG G . PASS VC=INDEL;AC=32;AF=0.1;AN=306 GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1
-chr1 187685847 . CAATT C . PASS VC=INDEL;AC=112;AF=0.36;AN=314 GT 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1
-chr1 187781028 . C CT . PASS VC=INDEL;AC=278;AF=0.9;AN=310 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 187815820 . A ACAA . PASS VC=INDEL;AC=21;AF=0.07;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr1 187899550 . AAA A . PASS VC=INDEL;AC=65;AF=0.21;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0
-chr1 188075358 . GTAAG G . PASS VC=INDEL;AC=63;AF=0.2;AN=316 GT 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr1 188110355 . C CT . PASS VC=INDEL;AC=222;AF=0.71;AN=312 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 ./. 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1
-chr1 188372559 . CAAG C . PASS VC=INDEL;AC=230;AF=0.73;AN=314 GT 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 188397016 . C CA . PASS VC=INDEL;AC=9;AF=0.03;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr1 188526820 . C CT . PASS VC=INDEL;AC=262;AF=0.91;AN=288 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 188533586 . G GTTCT . PASS VC=INDEL;AC=290;AF=0.92;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 188628449 . CAACT C . PASS VC=INDEL;AC=100;AF=0.32;AN=314 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 189027168 . C CTG . PASS VC=INDEL;AC=146;AF=0.69;AN=212 GT 1/1 ./. ./. ./. ./. ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 1/1 ./. ./. ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 ./. ./. 1/1 ./. ./. 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. ./. ./. ./. 1/1 0/1 ./. ./. ./. ./. 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 ./. ./. ./.
-chr1 189046798 . C CA . PASS VC=INDEL;AC=86;AF=0.27;AN=316 GT 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1
-chr1 189087000 . TTA T . PASS VC=INDEL;AC=159;AF=0.53;AN=302 GT 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 1/1
-chr1 189190273 . AT A . PASS VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=316 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 189547870 . A AAT . PASS VC=INDEL;AC=194;AF=0.79;AN=246 GT 0/1 ./. ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 ./. ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 ./. 0/1 ./. ./. 0/1 1/1 0/0 ./. 1/1 1/1 ./. ./. ./. 0/0 1/1 ./. ./. 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/0 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1
-chr1 189629285 . A ATAACT . PASS VC=INDEL;AC=158;AF=0.59;AN=266 GT 0/1 1/1 0/0 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 ./. 1/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/0 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 189867802 . G GC . PASS VC=INDEL;AC=23;AF=0.07;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 190095126 . CTAACA C . PASS VC=INDEL;AC=143;AF=0.45;AN=316;refseq.name=NM_199051;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1
-chr1 190095129 . ACATAA A . PASS VC=INDEL;AC=143;AF=0.45;AN=316;refseq.name=NM_199051;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1
-chr1 190636901 . C CTAA . PASS VC=INDEL;AC=131;AF=0.42;AN=314 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0
-chr1 190886420 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=76;AF=0.26;AN=292 GT 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1
-chr1 191196527 . A AAT . PASS VC=INDEL;AC=191;AF=0.6;AN=316 GT 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 191340485 . TTAGA T . PASS VC=INDEL;AC=175;AF=0.59;AN=296 GT 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/0 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1
-chr1 191464816 . A ATTA . PASS VC=INDEL;AC=213;AF=0.7;AN=306 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0
-chr1 191588586 . C CA . PASS VC=INDEL;AC=190;AF=0.61;AN=310 GT 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1
-chr1 191588587 . A AA . PASS VC=INDEL;AC=186;AF=0.61;AN=304 GT 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1
-chr1 191752595 . T TCTTT . PASS VC=INDEL;AC=132;AF=0.42;AN=316 GT 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0
-chr1 192047581 . TT T . PASS VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 192460381 . T TT . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 192612585 . T TCA . PASS VC=INDEL;AC=80;AF=0.25;AN=316;refseq.name=NM_002927;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0
-chr1 192726770 . C CT . PASS VC=INDEL;AC=121;AF=0.39;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 193118950 . AGACT A . PASS VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=316;refseq.name=NM_024529;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 193158515 . CTG C . PASS VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=316;refseq.name=NM_003783;refseq.positionType=promoter GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 193261423 . AAAGTA A . PASS VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=316 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 193421510 . A ATCT . PASS VC=INDEL;AC=102;AF=0.33;AN=310 GT 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr1 193482947 . CAA C . PASS VC=INDEL;AC=71;AF=0.22;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1
-chr1 193569090 . C CG . PASS VC=INDEL;AC=85;AF=0.27;AN=312 GT 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 193877310 . GG G . PASS VC=INDEL;AC=106;AF=0.34;AN=316 GT 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr1 193881567 . T TT . PASS VC=INDEL;AC=4;AF=0.01;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 194004698 . TCTT T . PASS VC=INDEL;AC=34;AF=0.11;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 194047765 . TAT T . PASS VC=INDEL;AC=48;AF=0.2;AN=238 GT ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1
-chr1 194160203 . TTAGT T . PASS VC=INDEL;AC=25;AF=0.12;AN=206 GT 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. ./. ./. 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 ./. ./. ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/1 ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1
-chr1 194193740 . A AG . PASS VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 194339262 . ATGT A . PASS VC=INDEL;AC=67;AF=0.21;AN=316 GT 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0
-chr1 194487871 . C CCTAT . PASS VC=INDEL;AC=302;AF=0.97;AN=312 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 194520551 . GG G . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 194563981 . TAAT T . PASS VC=INDEL;AC=169;AF=0.53;AN=316 GT 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1
-chr1 194738670 . T TTT . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 194763917 . CATG C . PASS VC=INDEL;AC=267;AF=0.84;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1
-chr1 195047681 . GG G . PASS VC=INDEL;AC=29;AF=0.1;AN=278 GT 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 ./. 0/0 1/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 ./. ./. ./. 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1
-chr1 195637390 . TA T . PASS VC=INDEL;AC=90;AF=0.29;AN=314 GT 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1
-chr1 195637391 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=89;AF=0.28;AN=316 GT 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1
-chr1 195877296 . T TAA . PASS VC=INDEL;AC=232;AF=0.73;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 195877297 . A AAA . PASS VC=INDEL;AC=232;AF=0.73;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 195934123 . CCTAT C . PASS VC=INDEL;AC=185;AF=0.59;AN=312 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0
-chr1 195934125 . TATCT T . PASS VC=INDEL;AC=184;AF=0.59;AN=312 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0
-chr1 196163677 . TT T . PASS VC=INDEL;AC=284;AF=0.9;AN=316 GT 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 196344374 . C CA . PASS VC=INDEL;AC=153;AF=0.53;AN=290;refseq.name=NM_198503;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. ./. 0/0
-chr1 196448625 . ATG A . PASS VC=INDEL;AC=7;AF=0.03;AN=266;refseq.name=NM_198503;refseq.positionType=intron GT ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0
-chr1 196448626 . TGTA T . PASS VC=INDEL;AC=8;AF=0.03;AN=302;refseq.name=NM_198503;refseq.positionType=intron GT ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0
-chr1 197406760 . GAA G . PASS VC=INDEL;AC=78;AF=0.25;AN=312;refseq.name=NM_201253;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr1 197613756 . ACCT A . PASS VC=INDEL;AC=25;AF=0.08;AN=316;refseq.name=NM_144977;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1
-chr1 197690664 . T TG . PASS VC=INDEL;AC=291;AF=0.92;AN=316;refseq.name=NM_144977;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 198792990 . T TG . PASS VC=INDEL;AC=131;AF=0.41;AN=316 GT 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr1 198940301 . C CCTT . PASS VC=INDEL;AC=258;AF=0.82;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1
-chr1 198940306 . T TTCT . PASS VC=INDEL;AC=258;AF=0.82;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1
-chr1 199277515 . AC A . PASS VC=INDEL;AC=36;AF=0.11;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr1 200575750 . AAATA A . PASS VC=INDEL;AC=97;AF=0.31;AN=314;refseq.name=NM_014875;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1
-chr1 201173407 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=56;AF=0.18;AN=314 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0
-chr1 201288249 . TATC T . PASS VC=INDEL;AC=209;AF=0.66;AN=316;refseq.name=NM_000299;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 201457641 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=55;AF=0.18;AN=310;refseq.name=NM_004078;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 1/1 1/1
-chr1 201587178 . CA C . PASS VC=INDEL;AC=145;AF=0.47;AN=310 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0
-chr1 201733889 . G GG . PASS VC=INDEL;AC=46;AF=0.15;AN=316;refseq.name=NM_020443;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1
-chr1 203792216 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=265;AF=0.93;AN=286;refseq.name=NM_014827;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 ./. ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 ./. ./. 1/1
-chr1 203829389 . CTCAAC C . PASS VC=INDEL;AC=195;AF=0.62;AN=316;refseq.name=NM_003094;refseq.positionType=promoter GT 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1
-chr1 203848383 . C CTT . PASS VC=INDEL;AC=275;AF=0.87;AN=316 GT 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1
-chr1 203848384 . T TTT . PASS VC=INDEL;AC=275;AF=0.87;AN=316 GT 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1
-chr1 204049028 . T TG . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_005686;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 204452618 . T TGT . PASS VC=INDEL;AC=141;AF=0.47;AN=300;refseq.name=NM_002646;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1
-chr1 205036040 . T TG . PASS VC=INDEL;AC=69;AF=0.23;AN=302;refseq.name=NM_005076;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1
-chr1 205036041 . G GG . PASS VC=INDEL;AC=71;AF=0.23;AN=310;refseq.name=NM_005076;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1
-chr1 206303222 . C CAGCCTAGCT . PASS VC=INDEL;AC=105;AF=0.33;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 206571046 . G GA . PASS VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=290;refseq.name=NM_015326;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./.
-chr1 206862605 . G GA . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_004759;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 206955760 . TGTAA T . PASS VC=INDEL;AC=95;AF=0.31;AN=310 GT 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 ./. 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1
-chr1 207260285 . T TCAATTCACAGGAGTATGTGA . PASS VC=INDEL;AC=197;AF=0.62;AN=316;refseq.name=NM_001017365;refseq.positionType=promoter GT 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1
-chr1 207277350 . CC C . PASS VC=INDEL;AC=201;AF=0.64;AN=316;refseq.name=NM_000715;refseq.positionType=promoter GT 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 207641329 . TTAAG T . PASS VC=INDEL;AC=13;AF=0.06;AN=216;refseq.name=NM_001006658;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. ./. ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 1/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 ./.
-chr1 207824638 . A AATTC . PASS VC=INDEL;AC=153;AF=0.48;AN=316;refseq.name=NM_175710;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1
-chr1 208201207 . GT G . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_025179;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 208514674 . GTTAC G . PASS VC=INDEL;AC=165;AF=0.53;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr1 208514676 . TACTT T . PASS VC=INDEL;AC=166;AF=0.53;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr1 208609280 . GGAAG G . PASS VC=INDEL;AC=55;AF=0.21;AN=256 GT 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 1/1 0/0 1/1 0/1 ./. ./. 0/1 1/1 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1
-chr1 208643013 . CA C . PASS VC=INDEL;AC=36;AF=0.12;AN=310 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 208643015 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=39;AF=0.12;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 208763800 . C CA . PASS VC=INDEL;AC=175;AF=0.55;AN=316 GT 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 209124169 . T TA . PASS VC=INDEL;AC=226;AF=0.72;AN=316 GT 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1
-chr1 209124171 . A AA . PASS VC=INDEL;AC=226;AF=0.72;AN=316 GT 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1
-chr1 209639686 . A AG . PASS VC=INDEL;AC=203;AF=0.64;AN=316 GT 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1
-chr1 209662878 . T TG . PASS VC=INDEL;AC=205;AF=0.65;AN=316 GT 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1
-chr1 209936964 . T TCA . PASS VC=INDEL;AC=184;AF=0.58;AN=316;refseq.name=NM_025228;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 210007940 . TCT T . PASS VC=INDEL;AC=190;AF=0.6;AN=316;refseq.name=NM_014388;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 210483472 . TG T . PASS VC=INDEL;AC=13;AF=0.04;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 210485101 . A AGGAC . PASS VC=INDEL;AC=232;AF=0.8;AN=290 GT 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/0 1/1 0/1 0/0 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./.
-chr1 210713503 . TT T . PASS VC=INDEL;AC=303;AF=0.96;AN=316;refseq.name=NM_018194;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 211710916 . CC C . PASS VC=INDEL;AC=55;AF=0.17;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 211786200 . TA T . PASS VC=INDEL;AC=147;AF=0.56;AN=264 GT ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 ./. 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 1/1 0/0 0/0 1/1 ./. 1/1 0/1
-chr1 212767202 . TTT T . PASS VC=INDEL;AC=63;AF=0.2;AN=316;refseq.name=NM_001030287;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr1 213150090 . T TGT . PASS VC=INDEL;AC=64;AF=0.21;AN=300;refseq.name=NM_024749;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 ./. ./. 0/0
-chr1 213160084 . A AG . PASS VC=INDEL;AC=129;AF=0.41;AN=312;refseq.name=NM_024749;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1
-chr1 213160085 . G GG . PASS VC=INDEL;AC=129;AF=0.41;AN=314;refseq.name=NM_024749;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1
-chr1 213393510 . AG A . PASS VC=INDEL;AC=62;AF=0.2;AN=316;refseq.name=NM_012424;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1
-chr1 213790399 . C CGA . PASS VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 214136369 . CTTC C . PASS VC=INDEL;AC=93;AF=0.29;AN=316 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr1 214365999 . C CTG . PASS VC=INDEL;AC=164;AF=0.59;AN=278 GT 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 ./. 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. ./. ./. 1/1 ./. ./. 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1
-chr1 214573392 . G GTTC . PASS VC=INDEL;AC=271;AF=0.86;AN=316;refseq.name=NM_005401;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 215120715 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=36;AF=0.12;AN=312 GT 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr1 216179286 . T TCAAT . PASS VC=INDEL;AC=30;AF=0.09;AN=316;refseq.name=NM_206933;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr1 216298294 . C CAG . PASS VC=INDEL;AC=113;AF=0.36;AN=316;refseq.name=NM_206933;refseq.positionType=intron GT 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1
-chr1 216298296 . G GAG . PASS VC=INDEL;AC=112;AF=0.35;AN=316;refseq.name=NM_206933;refseq.positionType=intron GT 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1
-chr1 216454053 . A AACA . PASS VC=INDEL;AC=224;AF=0.71;AN=316;refseq.name=NM_206933;refseq.positionType=intron GT 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr1 216780749 . C CC . PASS VC=INDEL;AC=10;AF=0.03;AN=316;refseq.name=NM_206594;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr1 216835074 . A AGTTT . PASS VC=INDEL;AC=89;AF=0.28;AN=316;refseq.name=NM_206594;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1
-chr1 217026745 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=13;AF=0.04;AN=304;refseq.name=NM_206594;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr1 217057204 . G GC . PASS VC=INDEL;AC=231;AF=0.73;AN=316;refseq.name=NM_206594;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1
-chr1 217363476 . CTATT C . PASS VC=INDEL;AC=40;AF=0.19;AN=212 GT 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 ./. 1/1 1/1 ./. ./. ./. 0/0 0/0 ./. 1/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. ./. ./. ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. ./. ./. ./. ./. ./.
-chr1 218217904 . C CG . PASS VC=INDEL;AC=130;AF=0.43;AN=302 GT 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 ./. 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./.
-chr1 218473680 . CGAG C . PASS VC=INDEL;AC=16;AF=0.05;AN=316;refseq.name=NM_016052;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 218574584 . A AT . PASS VC=INDEL;AC=21;AF=0.09;AN=236;refseq.name=NM_003238;refseq.positionType=intron GT 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 218845277 . TTTGT T . PASS VC=INDEL;AC=97;AF=0.31;AN=314 GT 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 219001503 . T TC . PASS VC=INDEL;AC=176;AF=0.56;AN=316 GT 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1
-chr1 219293844 . A ACT . PASS VC=INDEL;AC=274;AF=0.89;AN=308 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 219293846 . T TCT . PASS VC=INDEL;AC=199;AF=0.9;AN=222 GT 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 ./. ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. 1/1 ./. ./. ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 ./. ./. 0/1 0/0 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 ./. ./. 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 ./. 0/0 ./. 1/1 ./. 1/1 ./.
-chr1 219467766 . AAC A . PASS VC=INDEL;AC=102;AF=0.32;AN=314 GT 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-chr1 219839015 . C CATGG . PASS VC=INDEL;AC=73;AF=0.24;AN=306 GT 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1
-chr1 221137225 . T TCTT . PASS VC=INDEL;AC=159;AF=0.61;AN=262 GT 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0
-chr1 221202698 . GA G . PASS VC=INDEL;AC=82;AF=0.26;AN=310 GT 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 221279126 . CC C . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=312 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 221315912 . TTCT T . PASS VC=INDEL;AC=94;AF=0.3;AN=312 GT 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0
-chr1 222205539 . AATTGACC A . PASS VC=INDEL;AC=90;AF=0.29;AN=310 GT 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1
-chr1 222493300 . T TGA . PASS VC=INDEL;AC=310;AF=0.98;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 222493301 . G GAG . PASS VC=INDEL;AC=310;AF=0.98;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 222990213 . ATTTG A . PASS VC=INDEL;AC=9;AF=0.04;AN=254 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. ./. ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/1
-chr1 223387015 . CTG C . PASS VC=INDEL;AC=6;AF=0.02;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 223657734 . A ATGAG . PASS VC=INDEL;AC=231;AF=0.99;AN=234 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. ./. 0/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 223984835 . G GAA . PASS VC=INDEL;AC=194;AF=0.63;AN=306;refseq.name=NM_001031685;refseq.positionType=intron GT ./. 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0
-chr1 224264255 . A AG . PASS VC=INDEL;AC=150;AF=0.66;AN=228 GT 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 ./. 1/1 1/1 ./. ./. ./. 1/1 ./. 0/1 0/0 ./. ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 ./. 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 ./. 0/1 1/1 0/0 ./. 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 ./. ./. 1/1 0/0 0/1 ./. 1/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/0 1/1 ./. ./. ./. ./. 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. ./.
-chr1 224264346 . TGAG T . PASS VC=INDEL;AC=154;AF=0.63;AN=244 GT 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. ./. 1/1 ./. 1/1 0/0 1/1 1/1 ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. ./. ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 ./. 0/0 ./. ./. 1/1 0/1 ./. 1/1 ./. 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 ./. 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1
-chr1 224833844 . A AAGACGTAAGACAGT . PASS VC=INDEL;AC=215;AF=0.68;AN=314;refseq.name=NM_152495;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0
-chr1 225662220 . CT C . PASS VC=INDEL;AC=203;AF=0.66;AN=306 GT 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 225974486 . T TG . PASS VC=INDEL;AC=187;AF=0.6;AN=310;refseq.name=NM_003133;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1
-chr1 225974487 . G GG . PASS VC=INDEL;AC=189;AF=0.6;AN=314;refseq.name=NM_003133;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1
-chr1 226014266 . ATGG A . PASS VC=INDEL;AC=30;AF=0.1;AN=310;refseq.name=NM_000120;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./.
-chr1 226014267 . TGGT T . PASS VC=INDEL;AC=31;AF=0.1;AN=316;refseq.name=NM_000120;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 226878226 . ACTC A . PASS VC=INDEL;AC=45;AF=0.15;AN=306;refseq.name=NM_002221;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 226878233 . CTAC C . PASS VC=INDEL;AC=60;AF=0.21;AN=292;refseq.name=NM_002221;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 1/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0
-chr1 226913049 . GCCA G . PASS VC=INDEL;AC=14;AF=0.05;AN=302;refseq.name=NM_002221;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 226913051 . CACC C . PASS VC=INDEL;AC=6;AF=0.02;AN=280;refseq.name=NM_002221;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 227051261 . G GC . PASS VC=INDEL;AC=21;AF=0.07;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 227252431 . TTTC T . PASS VC=INDEL;AC=21;AF=0.07;AN=316;refseq.name=NM_003607;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-chr1 227401072 . GC G . PASS VC=INDEL;AC=122;AF=0.39;AN=316;refseq.name=NM_003607;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 227560279 . G GTCATAG . PASS VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 228479392 . ATG A . PASS VC=INDEL;AC=12;AF=0.04;AN=316;refseq.name=NM_001098623;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 229074693 . TAGAGG T . PASS VC=INDEL;AC=102;AF=0.32;AN=316 GT 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1
-chr1 229075090 . ATAGCCTG A . PASS VC=INDEL;AC=30;AF=0.11;AN=264 GT 1/1 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./.
-chr1 229336842 . CATTT C . PASS VC=INDEL;AC=19;AF=0.06;AN=300 GT ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr1 229631495 . A AC . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_018230;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 229922597 . CCTT C . PASS VC=INDEL;AC=144;AF=0.46;AN=316 GT 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1
-chr1 229922599 . TTCT T . PASS VC=INDEL;AC=142;AF=0.45;AN=314 GT 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1
-chr1 230272407 . GAG G . PASS VC=INDEL;AC=15;AF=0.05;AN=314;refseq.name=NM_004481;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 230625946 . T TGA . PASS VC=INDEL;AC=302;AF=0.96;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 230626726 . CTTTAAGTCCTGT C . PASS VC=INDEL;AC=59;AF=0.19;AN=314 GT 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 230626728 . TTAAGTCCTGTTT T . PASS VC=INDEL;AC=59;AF=0.19;AN=316 GT 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 230697057 . ACA A . PASS VC=INDEL;AC=152;AF=0.48;AN=316 GT 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0
-chr1 230952100 . GG G . PASS VC=INDEL;AC=34;AF=0.11;AN=316 GT 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1
-chr1 232200072 . CGACT C . PASS VC=INDEL;AC=86;AF=0.28;AN=312 GT 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1
-chr1 232606995 . GTCTG G . PASS VC=INDEL;AC=54;AF=0.17;AN=316;refseq.name=NM_020808;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1
-chr1 232883964 . G GTT . PASS VC=INDEL;AC=279;AF=0.88;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 232883965 . T TTT . PASS VC=INDEL;AC=279;AF=0.88;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 232944224 . AAGAA A . PASS VC=INDEL;AC=17;AF=0.05;AN=316;refseq.name=NM_019090;refseq.positionType=exon GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 233013835 . C CT . PASS VC=INDEL;AC=38;AF=0.18;AN=214 GT 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 1/1 ./. ./. ./. 1/1 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 ./. ./. ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. ./. ./. 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/0 ./. 0/0 1/1 ./. ./. 0/0 1/1 ./. ./. 0/0 ./. 1/1 ./. 1/1 ./. ./. 0/0 ./. ./.
-chr1 233013837 . T TT . PASS VC=INDEL;AC=78;AF=0.25;AN=310 GT 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 233458691 . ACAC A . PASS VC=INDEL;AC=18;AF=0.06;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1
-chr1 233593090 . TT T . PASS VC=INDEL;AC=257;AF=0.82;AN=312 GT 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 233991847 . T TCA . PASS VC=INDEL;AC=220;AF=0.72;AN=306 GT 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1
-chr1 234635298 . G GT . PASS VC=INDEL;AC=205;AF=0.65;AN=316 GT 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0
-chr1 234704346 . TCT T . PASS VC=INDEL;AC=36;AF=0.12;AN=312 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr1 235770627 . AATTA A . PASS VC=INDEL;AC=56;AF=0.18;AN=316;refseq.name=NM_004485;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 236043714 . ATCCTGTGTTGATTTA A . PASS VC=INDEL;AC=6;AF=0.02;AN=294 GT ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 236043717 . CTGTGTTGATTTATTA C . PASS VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 236118487 . TT T . PASS VC=INDEL;AC=12;AF=0.04;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 236195380 . GTG G . PASS VC=INDEL;AC=163;AF=0.52;AN=316;refseq.name=NM_002508;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1
-chr1 236375505 . T TG . PASS VC=INDEL;AC=130;AF=0.42;AN=310 GT 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 236555148 . T TA . PASS VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=316;refseq.name=NM_145861;refseq.positionType=promoter GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 236723352 . CGACCTCGCTCAGACTCTGTGAGGTGCTGAATAAGCAACA C . PASS VC=INDEL;AC=72;AF=0.23;AN=314;refseq.name=NM_018072;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr1 236723354 . ACCTCGCTCAGACTCTGTGAGGTGCTGAATAAGCAACAGA A . PASS VC=INDEL;AC=72;AF=0.23;AN=312;refseq.name=NM_018072;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr1 236848307 . A AG . PASS VC=INDEL;AC=62;AF=0.21;AN=300;refseq.name=NM_001103;refseq.positionType=promoter GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 237009685 . TAGC T . PASS VC=INDEL;AC=6;AF=0.02;AN=292;refseq.name=NM_000254;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 237009687 . GCAG G . PASS VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=304;refseq.name=NM_000254;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 237055125 . CA C . PASS VC=INDEL;AC=9;AF=0.03;AN=284;refseq.name=NM_000254;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 237277023 . C CA . PASS VC=INDEL;AC=18;AF=0.06;AN=312;refseq.name=NM_001035;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1
-chr1 237535965 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=280;refseq.name=NM_001035;refseq.positionType=intron GT 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0
-chr1 237539975 . GCTTGA G . PASS VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=316;refseq.name=NM_001035;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr1 237649833 . C CTCTT . PASS VC=INDEL;AC=140;AF=0.45;AN=312;refseq.name=NM_001035;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 ./. 0/0 1/1 0/1 ./. 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 237649835 . C CTTTC . PASS VC=INDEL;AC=138;AF=0.44;AN=312;refseq.name=NM_001035;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 ./. 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 237995162 . T TTTGA . PASS VC=INDEL;AC=301;AF=0.96;AN=312;refseq.name=NM_001035;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 238017296 . T TCT . PASS VC=INDEL;AC=80;AF=0.25;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0
-chr1 238125441 . AGA A . PASS VC=INDEL;AC=26;AF=0.08;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 238152842 . C CGTAA . PASS VC=INDEL;AC=165;AF=0.52;AN=316 GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0
-chr1 238152845 . A AAGTA . PASS VC=INDEL;AC=166;AF=0.53;AN=316 GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0
-chr1 238257585 . TGAT T . PASS VC=INDEL;AC=159;AF=0.61;AN=262 GT 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 ./. ./. 0/0 1/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 ./. ./. ./. 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 1/1 1/1
-chr1 238476744 . A ATCTA . PASS VC=INDEL;AC=283;AF=0.98;AN=290 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1
-chr1 238497833 . G GAGAA . PASS VC=INDEL;AC=232;AF=0.76;AN=304 GT 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/0 ./. ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1
-chr1 238623394 . C CTTGA . PASS VC=INDEL;AC=178;AF=0.58;AN=308 GT 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1
-chr1 238699979 . T TATCT . PASS VC=INDEL;AC=97;AF=0.31;AN=314 GT 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1
-chr1 238921290 . CATTCAT C . PASS VC=INDEL;AC=188;AF=0.59;AN=316 GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0
-chr1 238933453 . C CA . PASS VC=INDEL;AC=26;AF=0.08;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 238933454 . A AA . PASS VC=INDEL;AC=25;AF=0.08;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 239644576 . C CAA . PASS VC=INDEL;AC=46;AF=0.15;AN=300 GT 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 240115184 . GAAG G . PASS VC=INDEL;AC=62;AF=0.2;AN=316 GT 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1
-chr1 240170484 . ATCA A . PASS VC=INDEL;AC=30;AF=0.1;AN=310 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr1 240469105 . A ACT . PASS VC=INDEL;AC=44;AF=0.14;AN=308;refseq.name=NM_020066;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr1 240556294 . A AG . PASS VC=INDEL;AC=180;AF=0.73;AN=248;refseq.name=NM_020066;refseq.positionType=intron GT ./. 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 ./. 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. ./. ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 0/1 1/1 ./. ./. ./. ./. 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1
-chr1 240750353 . A AT . PASS VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=208;refseq.name=NM_022469;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./.
-chr1 241292738 . CGAC C . PASS VC=INDEL;AC=16;AF=0.06;AN=254;refseq.name=NM_002924;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 241342365 . TTCAA T . PASS VC=INDEL;AC=54;AF=0.18;AN=308;refseq.name=NM_002924;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 ./. 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1
-chr1 241864983 . A AGTCAAAC . PASS VC=INDEL;AC=235;AF=0.75;AN=314;refseq.name=NM_144625;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0
-chr1 241901460 . ACTG A . PASS VC=INDEL;AC=126;AF=0.4;AN=316;refseq.name=NM_144625;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 241920499 . TGTAG T . PASS VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=316;refseq.name=NM_144625;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1
-chr1 241920501 . TAGGT T . PASS VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=316;refseq.name=NM_144625;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1
-chr1 242055743 . C CTG . PASS VC=INDEL;AC=47;AF=0.15;AN=314 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0
-chr1 242257290 . TC T . PASS VC=INDEL;AC=59;AF=0.22;AN=270;refseq.name=NM_152666;refseq.positionType=intron GT 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 ./. 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0
-chr1 242281287 . T TCT . PASS VC=INDEL;AC=296;AF=0.95;AN=312;refseq.name=NM_152666;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1
-chr1 242328018 . CATTACACTACTTTT C . PASS VC=INDEL;AC=97;AF=0.4;AN=244;refseq.name=NM_152666;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 ./. 0/0 ./. 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. ./. ./. 0/1 0/1 ./. 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. 1/1 ./. 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/0 1/1 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 ./. 0/0 0/0
-chr1 242602261 . CC C . PASS VC=INDEL;AC=51;AF=0.16;AN=316;refseq.name=NM_152666;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1
-chr1 243409926 . AAGTT A . PASS VC=INDEL;AC=99;AF=0.32;AN=312;refseq.name=NM_014812;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1
-chr1 243410210 . G GTAT . PASS VC=INDEL;AC=137;AF=0.43;AN=316;refseq.name=NM_014812;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1
-chr1 243435760 . CATT C . PASS VC=INDEL;AC=26;AF=0.1;AN=272;refseq.name=NM_006642;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./.
-chr1 244015225 . GTCTG G . PASS VC=INDEL;AC=70;AF=0.22;AN=316 GT 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1
-chr1 244033256 . GTTGA G . PASS VC=INDEL;AC=18;AF=0.06;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 244186794 . T TT . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 244216819 . T TA . PASS VC=INDEL;AC=79;AF=0.25;AN=316;refseq.name=NM_006352;refseq.positionType=exon GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0
-chr1 244216822 . A AA . PASS VC=INDEL;AC=79;AF=0.25;AN=312;refseq.name=NM_006352;refseq.positionType=exon GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0
-chr1 244371962 . CAACTGGTCAAC C . PASS VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 244372739 . C CTA . PASS VC=INDEL;AC=70;AF=0.22;AN=312 GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1
-chr1 244517491 . A AG . PASS VC=INDEL;AC=229;AF=0.72;AN=316;refseq.name=NM_001012970;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 244552134 . CATTT C . PASS VC=INDEL;AC=41;AF=0.13;AN=314;refseq.name=NM_001012970;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 244794244 . T TAAC . PASS VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=316;refseq.name=NM_173807;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 245242885 . A ATT . PASS VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=316;refseq.name=NM_032328;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 245242887 . T TTT . PASS VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=316;refseq.name=NM_032328;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr1 245310839 . T TTAAAG . PASS VC=INDEL;AC=156;AF=0.59;AN=266 GT 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 ./. ./. ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 ./. 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1
-chr1 245453003 . G GCCAA . PASS VC=INDEL;AC=80;AF=0.26;AN=308;refseq.name=NM_018012;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1
-chr1 245709104 . A AGTCAAC . PASS VC=INDEL;AC=221;AF=0.7;AN=316;refseq.name=NM_018012;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1
-chr1 245868167 . G GTCTT . PASS VC=INDEL;AC=138;AF=0.44;AN=316 GT 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 245868172 . T TCTTT . PASS VC=INDEL;AC=137;AF=0.43;AN=316 GT 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0
-chr1 246124841 . A AAACAGAAG . PASS VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316;refseq.name=NM_022743;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 246124843 . A ACAGAAGAA . PASS VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316;refseq.name=NM_022743;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr1 246149511 . C CT . PASS VC=INDEL;AC=69;AF=0.32;AN=214;refseq.name=NM_022743;refseq.positionType=intron GT 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/0 ./. ./. 1/1 ./. ./. ./. 0/1 ./. 0/0 ./. ./. 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. ./. ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 ./. ./. ./. 1/1 0/1 ./. ./. 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 1/1 ./. ./. 1/1 ./. 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/1 ./.
-chr1 246152615 . GC G . PASS VC=INDEL;AC=164;AF=0.52;AN=316;refseq.name=NM_022743;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1
-chr1 247110970 . T TCA . PASS VC=INDEL;AC=157;AF=0.5;AN=316 GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1
-chr1 247340579 . TTTCTT T . PASS VC=INDEL;AC=232;AF=0.74;AN=312 GT 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 247694106 . C CTCCGTGGCCTAAACGGGCAGCCGAGCCCG . PASS VC=INDEL;AC=124;AF=0.62;AN=200;refseq.name=NM_198074;refseq.positionType=exon GT ./. ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. ./. ./. 0/1 ./. ./. ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 ./. ./. ./. 1/1 0/1 1/1 ./. ./. 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. ./. ./. ./. ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. ./. ./. 0/1 ./. 0/1 ./. ./. 0/1 ./. ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./.
-chr1 248807991 . TATGA T . PASS VC=INDEL;AC=85;AF=0.34;AN=252 GT 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 ./. ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 1/1 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 1/1 ./. ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 ./. 0/1 1/1 0/0 ./. ./. 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. ./. 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1
-chr1 248809274 . GAACA G . PASS VC=INDEL;AC=79;AF=0.26;AN=304 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1
-chr1 248809275 . AACAA A . PASS VC=INDEL;AC=79;AF=0.26;AN=306 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1
-chr1 248809277 . C CAATT . PASS VC=INDEL;AC=9;AF=0.03;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr1 249122808 . C CAT . PASS VC=INDEL;AC=176;AF=0.58;AN=304;refseq.name=NM_030645;refseq.positionType=promoter GT 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 ./. 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 ./. 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1
-chr1 249129038 . GCCTCTAACTT G . PASS VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 311906 . TA T . PASS VC=INDEL;AC=148;AF=0.48;AN=308 GT 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1
-chr2 341060 . TC T . PASS VC=INDEL;AC=52;AF=0.17;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr2 623863 . GTTC G . PASS VC=INDEL;AC=278;AF=0.9;AN=310 GT 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1
-chr2 623869 . CTTC C . PASS VC=INDEL;AC=283;AF=0.9;AN=314 GT 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1
-chr2 872231 . G GCC . PASS VC=INDEL;AC=46;AF=0.16;AN=284 GT 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 872234 . C CCC . PASS VC=INDEL;AC=53;AF=0.21;AN=248 GT 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 ./. ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 ./. ./. ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./.
-chr2 1131016 . TTTAGG T . PASS VC=INDEL;AC=189;AF=0.6;AN=316;refseq.name=NM_018968;refseq.positionType=intron GT 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1
-chr2 1146399 . T TA . PASS VC=INDEL;AC=280;AF=0.89;AN=316;refseq.name=NM_018968;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr2 1146400 . A AA . PASS VC=INDEL;AC=280;AF=0.89;AN=316;refseq.name=NM_018968;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr2 1184342 . CAACTT C . PASS VC=INDEL;AC=94;AF=0.3;AN=316;refseq.name=NM_018968;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1
-chr2 1369823 . AGC A . PASS VC=INDEL;AC=243;AF=0.77;AN=316;refseq.name=NM_018968;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0
-chr2 1371776 . T TTTAA . PASS VC=INDEL;AC=50;AF=0.16;AN=312;refseq.name=NM_018968;refseq.positionType=terminator GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr2 1371779 . A AATTA . PASS VC=INDEL;AC=38;AF=0.13;AN=282;refseq.name=NM_018968;refseq.positionType=terminator GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 ./. ./. 1/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./.
-chr2 1379755 . A AA . PASS VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 1789405 . A AT . PASS VC=INDEL;AC=63;AF=0.2;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-chr2 2440845 . A AA . PASS VC=INDEL;AC=87;AF=0.32;AN=272 GT ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. ./. ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 1/1 1/1 ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1
-chr2 2656901 . TG T . PASS VC=INDEL;AC=278;AF=0.9;AN=310 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1
-chr2 3126017 . G GG . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 3424142 . CGCTGAC C . PASS VC=INDEL;AC=112;AF=0.46;AN=244;refseq.name=NM_016030;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 ./. 1/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 1/1 ./. 0/0 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 ./. 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. ./. ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 1/1 ./. ./. 1/1 ./. 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 ./.
-chr2 3658789 . ACAAA A . PASS VC=INDEL;AC=95;AF=0.33;AN=284;refseq.name=NM_024027;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1
-chr2 3749151 . GGAA G . PASS VC=INDEL;AC=163;AF=0.53;AN=310;refseq.name=NM_018436;refseq.positionType=exon GT 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1
-chr2 3749158 . GAAG G . PASS VC=INDEL;AC=164;AF=0.53;AN=308;refseq.name=NM_018436;refseq.positionType=exon GT 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 ./. 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1
-chr2 4140967 . G GA . PASS VC=INDEL;AC=125;AF=0.4;AN=312 GT 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1
-chr2 4184693 . AGAG A . PASS VC=INDEL;AC=60;AF=0.22;AN=274 GT 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 1/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0
-chr2 4296243 . ACCTGGCCTTTT A . PASS VC=INDEL;AC=19;AF=0.06;AN=312 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr2 4604536 . ATCTG A . PASS VC=INDEL;AC=82;AF=0.27;AN=308 GT 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-chr2 4607815 . TAT T . PASS VC=INDEL;AC=90;AF=0.28;AN=316 GT 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-chr2 4874174 . CAT C . PASS VC=INDEL;AC=203;AF=0.64;AN=316 GT 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0
-chr2 4933418 . GATC G . PASS VC=INDEL;AC=86;AF=0.28;AN=304 GT 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr2 4987676 . A ACT . PASS VC=INDEL;AC=100;AF=0.32;AN=316 GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0
-chr2 4994909 . G GT . PASS VC=INDEL;AC=122;AF=0.41;AN=294 GT 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0
-chr2 5222830 . CTGTT C . PASS VC=INDEL;AC=127;AF=0.4;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1
-chr2 5418395 . T TAA . PASS VC=INDEL;AC=147;AF=0.47;AN=314 GT 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1
-chr2 5821332 . TTCAGTCCCCCTAATGCC T . PASS VC=INDEL;AC=261;AF=0.83;AN=316 GT 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1
-chr2 5821334 . CAGTCCCCCTAATGCCTC C . PASS VC=INDEL;AC=261;AF=0.83;AN=316 GT 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1
-chr2 7238500 . A ACTT . PASS VC=INDEL;AC=184;AF=0.58;AN=316 GT 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0
-chr2 7238505 . T TTCT . PASS VC=INDEL;AC=184;AF=0.58;AN=316 GT 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0
-chr2 7616680 . C CA . PASS VC=INDEL;AC=196;AF=0.62;AN=314 GT ./. 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1
-chr2 10714143 . CAA C . PASS VC=INDEL;AC=143;AF=0.47;AN=306;refseq.name=NM_024894;refseq.positionType=intron GT 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1
-chr2 11163207 . TCA T . PASS VC=INDEL;AC=63;AF=0.2;AN=316 GT 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 11163209 . ACA A . PASS VC=INDEL;AC=63;AF=0.2;AN=316 GT 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 11454443 . TTGTC T . PASS VC=INDEL;AC=85;AF=0.27;AN=310;refseq.name=NM_004850;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-chr2 11600452 . TT T . PASS VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316;refseq.name=NM_198256;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr2 11843046 . C CAACT . PASS VC=INDEL;AC=157;AF=0.5;AN=316 GT 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr2 11843047 . A AACTA . PASS VC=INDEL;AC=157;AF=0.5;AN=316 GT 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr2 12317135 . T TT . PASS VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 12787834 . GT G . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 12877501 . G GA . PASS VC=INDEL;AC=241;AF=0.76;AN=316;refseq.name=NM_021643;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1
-chr2 13123234 . A ACTTA . PASS VC=INDEL;AC=273;AF=0.89;AN=308 GT ./. 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1
-chr2 13297277 . GC G . PASS VC=INDEL;AC=23;AF=0.07;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 13446741 . T TCACT . PASS VC=INDEL;AC=105;AF=0.41;AN=256 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 ./. 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 ./. 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/0 0/1 1/1 ./. ./. 0/0
-chr2 13637137 . TTGCTG T . PASS VC=INDEL;AC=19;AF=0.06;AN=308 GT 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr2 13829513 . T TT . PASS VC=INDEL;AC=91;AF=0.29;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-chr2 13967190 . TAGAT T . PASS VC=INDEL;AC=22;AF=0.07;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr2 14096044 . AAA A . PASS VC=INDEL;AC=47;AF=0.16;AN=298 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 1/1 0/0 0/0
-chr2 14214846 . C CT . PASS VC=INDEL;AC=40;AF=0.13;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0
-chr2 14381137 . A ATC . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=280 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 14428427 . G GC . PASS VC=INDEL;AC=242;AF=0.77;AN=316 GT 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1
-chr2 14428428 . C CC . PASS VC=INDEL;AC=241;AF=0.77;AN=314 GT 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1
-chr2 14685393 . C CTTC . PASS VC=INDEL;AC=29;AF=0.09;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr2 15208721 . A AC . PASS VC=INDEL;AC=116;AF=0.38;AN=304 GT 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 ./. 1/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1
-chr2 15263072 . A AAGGA . PASS VC=INDEL;AC=86;AF=0.33;AN=262 GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 1/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/0 1/1 ./. 0/1 0/0 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 0/0
-chr2 15744484 . CT C . PASS VC=INDEL;AC=48;AF=0.15;AN=314;refseq.name=NM_004939;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr2 15907161 . G GACTG . PASS VC=INDEL;AC=60;AF=0.19;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0
-chr2 16916657 . T TAGAA . PASS VC=INDEL;AC=153;AF=0.51;AN=298 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0
-chr2 16916659 . G GAAAG . PASS VC=INDEL;AC=145;AF=0.49;AN=294 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0
-chr2 17460258 . C CC . PASS VC=INDEL;AC=54;AF=0.17;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1
-chr2 18018674 . TAT T . PASS VC=INDEL;AC=71;AF=0.23;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr2 18139969 . T TT . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 18291829 . TCT T . PASS VC=INDEL;AC=276;AF=0.87;AN=316 GT 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0
-chr2 18382578 . G GC . PASS VC=INDEL;AC=304;AF=0.97;AN=314 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr2 18386046 . ACAGA A . PASS VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 18673070 . CT C . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 18704268 . C CCATGACAAGAACTGCT . PASS VC=INDEL;AC=210;AF=0.66;AN=316 GT 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1
-chr2 18954606 . T TGTA . PASS VC=INDEL;AC=272;AF=0.87;AN=314 GT 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1
-chr2 19229223 . A AG . PASS VC=INDEL;AC=230;AF=0.82;AN=280 GT 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 ./. ./. 1/1
-chr2 19416083 . CAAT C . PASS VC=INDEL;AC=26;AF=0.08;AN=312 GT 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 19486700 . C CGT . PASS VC=INDEL;AC=200;AF=0.9;AN=222 GT 0/1 ./. ./. ./. 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. ./. ./. 0/1 ./. 1/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 ./. ./. ./. ./. 0/1 1/1 ./. ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./.
-chr2 19792293 . AAA A . PASS VC=INDEL;AC=92;AF=0.29;AN=316 GT 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1
-chr2 19850365 . ATA A . PASS VC=INDEL;AC=17;AF=0.06;AN=302 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr2 20061297 . A AATCA . PASS VC=INDEL;AC=10;AF=0.03;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 20902911 . G GC . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_021925;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 21209314 . GTG G . PASS VC=INDEL;AC=13;AF=0.04;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 21319809 . GACAA G . PASS VC=INDEL;AC=64;AF=0.2;AN=316 GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 21692599 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=78;AF=0.25;AN=314 GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0
-chr2 22508039 . GCCT G . PASS VC=INDEL;AC=70;AF=0.23;AN=300 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr2 23055890 . CTT C . PASS VC=INDEL;AC=32;AF=0.1;AN=310 GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 23059421 . CC C . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 23080285 . C CC . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 23252488 . T TGTTT . PASS VC=INDEL;AC=261;AF=0.83;AN=314 GT 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr2 23656105 . CT C . PASS VC=INDEL;AC=78;AF=0.25;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 23929327 . T TAACT . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 25136190 . TC T . PASS VC=INDEL;AC=190;AF=0.68;AN=280;refseq.name=NM_004036;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/0 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. ./. ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. ./. ./. ./. 0/1 0/1
-chr2 25696290 . CA C . PASS VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=314;refseq.name=NM_021907;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-chr2 25971939 . A AGTAAA . PASS VC=INDEL;AC=90;AF=0.28;AN=316;refseq.name=NM_018263;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1
-chr2 26471341 . T TTTC . PASS VC=INDEL;AC=10;AF=0.03;AN=316;refseq.name=NM_000183;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0
-chr2 26547936 . GAC G . PASS VC=INDEL;AC=69;AF=0.22;AN=308;refseq.name=NM_153835;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 ./. ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0
-chr2 26849198 . ACGGTT A . PASS VC=INDEL;AC=85;AF=0.28;AN=308;refseq.name=NM_001029881;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 ./. 0/0 0/1
-chr2 26849199 . CGGTTC C . PASS VC=INDEL;AC=83;AF=0.27;AN=302;refseq.name=NM_001029881;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 1/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 ./. 0/0 0/1
-chr2 27134249 . ATA A . PASS VC=INDEL;AC=100;AF=0.32;AN=316;refseq.name=NM_020134;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1
-chr2 27787778 . AAATTAAAATTCTAC A . PASS VC=INDEL;AC=10;AF=0.03;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 28368075 . CACAG C . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=306;refseq.name=NM_199193;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 28792105 . A AATA . PASS VC=INDEL;AC=100;AF=0.32;AN=308;refseq.name=NM_153021;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 ./. 1/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 1/1 0/1
-chr2 29191749 . GA G . PASS VC=INDEL;AC=87;AF=0.28;AN=316 GT 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1
-chr2 29191750 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=86;AF=0.27;AN=316 GT 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1
-chr2 29738576 . TA T . PASS VC=INDEL;AC=284;AF=0.9;AN=316;refseq.name=NM_004304;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr2 29738577 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=284;AF=0.9;AN=316;refseq.name=NM_004304;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr2 30158127 . C CA . PASS VC=INDEL;AC=192;AF=0.61;AN=316 GT 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0
-chr2 30158129 . A AA . PASS VC=INDEL;AC=192;AF=0.61;AN=316 GT 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0
-chr2 30645653 . A AAGCTTTTCTAATGAACATCTACAAGACTGTTGTG . PASS VC=INDEL;AC=303;AF=0.96;AN=316 GT 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1
-chr2 30727159 . C CAGTCTATATGCC . PASS VC=INDEL;AC=189;AF=0.6;AN=316;refseq.name=NM_182551;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr2 30727390 . GTTG G . PASS VC=INDEL;AC=31;AF=0.1;AN=314;refseq.name=NM_182551;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 30855218 . CCATGGGA C . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_182551;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 30937800 . GATTTT G . PASS VC=INDEL;AC=14;AF=0.06;AN=244 GT 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. ./. 0/1 ./. ./.
-chr2 31084461 . AATAAAATACAG A . PASS VC=INDEL;AC=36;AF=0.11;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 31249797 . ATATC A . PASS VC=INDEL;AC=34;AF=0.11;AN=316;refseq.name=NM_024572;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr2 31249799 . ATCTA A . PASS VC=INDEL;AC=47;AF=0.16;AN=302;refseq.name=NM_024572;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1
-chr2 31374768 . AGTA A . PASS VC=INDEL;AC=13;AF=0.05;AN=278 GT 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 31499486 . C CC . PASS VC=INDEL;AC=11;AF=0.03;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 32845664 . A AT . PASS VC=INDEL;AC=138;AF=0.44;AN=316 GT 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1
-chr2 32845666 . T TT . PASS VC=INDEL;AC=138;AF=0.44;AN=316 GT 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1
-chr2 33393523 . AGCAA A . PASS VC=INDEL;AC=10;AF=0.03;AN=308;refseq.name=NM_206943;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 33403610 . ATTG A . PASS VC=INDEL;AC=46;AF=0.15;AN=316;refseq.name=NM_206943;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0
-chr2 33478311 . TGAGT T . PASS VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=314;refseq.name=NM_206943;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 33542959 . TT T . PASS VC=INDEL;AC=258;AF=0.82;AN=316;refseq.name=NM_206943;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1
-chr2 33760624 . C CC . PASS VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=216;refseq.name=NM_170672;refseq.positionType=intron GT 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0
-chr2 33899643 . G GGAG . PASS VC=INDEL;AC=261;AF=0.83;AN=316 GT 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0
-chr2 34119549 . A AA . PASS VC=INDEL;AC=45;AF=0.14;AN=316 GT 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1
-chr2 34427438 . A AT . PASS VC=INDEL;AC=175;AF=0.76;AN=230 GT 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. ./. 0/1 1/1 ./. ./. ./. ./. 0/0 0/1 0/1 ./. ./. ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 0/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 ./. 0/1 ./. ./. ./. ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 ./. ./. 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. ./. 0/1 0/1 ./. 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1
-chr2 34841691 . TGAAT T . PASS VC=INDEL;AC=165;AF=0.79;AN=210 GT ./. ./. ./. 1/1 ./. ./. ./. 0/1 ./. 1/1 0/1 ./. 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 1/1 ./. ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 ./. ./. ./. ./. 1/1 ./. 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 ./. ./. ./. 0/1 ./. ./. 1/1 0/1 ./. ./. 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 ./. ./. ./. 0/1 ./. 0/1 0/0 1/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. ./. 0/1 1/1 0/1 ./. ./.
-chr2 35025338 . G GG . PASS VC=INDEL;AC=227;AF=0.72;AN=314 GT 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0
-chr2 35255151 . TCT T . PASS VC=INDEL;AC=29;AF=0.09;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 35667838 . A AGG . PASS VC=INDEL;AC=54;AF=0.21;AN=252 GT 0/0 ./. ./. ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. ./. ./. ./. ./. 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr2 35668564 . A AG . PASS VC=INDEL;AC=275;AF=0.87;AN=316 GT 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1
-chr2 36779604 . C CTT . PASS VC=INDEL;AC=130;AF=0.44;AN=298;refseq.name=NM_001042548;refseq.positionType=exon GT 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 ./. 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0
-chr2 37233064 . ACT A . PASS VC=INDEL;AC=48;AF=0.16;AN=302;refseq.name=NM_019024;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0
-chr2 37865906 . GA G . PASS VC=INDEL;AC=161;AF=0.51;AN=314 GT 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-chr2 37960289 . A AG . PASS VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=302 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./.
-chr2 38003881 . T TAGA . PASS VC=INDEL;AC=312;AF=0.99;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr2 38079466 . CAT C . PASS VC=INDEL;AC=93;AF=0.3;AN=308 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0
-chr2 38476518 . T TCA . PASS VC=INDEL;AC=179;AF=0.57;AN=316 GT 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr2 38682923 . T TTTCTCTCT . PASS VC=INDEL;AC=35;AF=0.11;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0
-chr2 38990657 . C CACTT . PASS VC=INDEL;AC=241;AF=0.76;AN=316 GT 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr2 39202671 . TCAC T . PASS VC=INDEL;AC=68;AF=0.22;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0
-chr2 39848964 . GACTA G . PASS VC=INDEL;AC=92;AF=0.3;AN=304 GT 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1
-chr2 40095196 . TCTT T . PASS VC=INDEL;AC=22;AF=0.07;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 40207026 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=314 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr2 40328669 . A ATC . PASS VC=INDEL;AC=182;AF=0.58;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1
-chr2 40396501 . G GTCAG . PASS VC=INDEL;AC=13;AF=0.04;AN=310;refseq.name=NM_001112802;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr2 40446174 . T TCTACCTGCAACCCTTGATTGGCCTC . PASS VC=INDEL;AC=196;AF=0.62;AN=314;refseq.name=NM_001112802;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 ./. 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1
-chr2 40527545 . T TGC . PASS VC=INDEL;AC=69;AF=0.22;AN=316;refseq.name=NM_001112802;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0
-chr2 40764424 . TATG T . PASS VC=INDEL;AC=6;AF=0.02;AN=314 GT ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 40840587 . A ATTG . PASS VC=INDEL;AC=15;AF=0.06;AN=242 GT ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 1/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 ./. ./. ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/0 0/0
-chr2 41367520 . A AT . PASS VC=INDEL;AC=187;AF=0.6;AN=314 GT 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1
-chr2 41554849 . TCAGA T . PASS VC=INDEL;AC=231;AF=0.74;AN=314 GT ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1
-chr2 41554851 . AGACA A . PASS VC=INDEL;AC=233;AF=0.74;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1
-chr2 41628974 . G GA . PASS VC=INDEL;AC=282;AF=0.9;AN=314 GT 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr2 41628975 . A AA . PASS VC=INDEL;AC=281;AF=0.9;AN=312 GT 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr2 41838136 . GGC G . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 42604189 . CTTATGGGTTAC C . PASS VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 42773644 . C CC . PASS VC=INDEL;AC=111;AF=0.35;AN=316 GT 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1
-chr2 43140881 . TA T . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 43205232 . A AAG . PASS VC=INDEL;AC=287;AF=0.91;AN=316 GT 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1
-chr2 43324908 . C CA . PASS VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr2 43570900 . TCT T . PASS VC=INDEL;AC=84;AF=0.27;AN=316;refseq.name=NM_022065;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0
-chr2 44397082 . AAGAGTA A . PASS VC=INDEL;AC=39;AF=0.12;AN=316;refseq.name=NM_177968;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr2 44735716 . TAAAC T . PASS VC=INDEL;AC=189;AF=0.6;AN=316;refseq.name=NM_024766;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1
-chr2 45472533 . T TATA . PASS VC=INDEL;AC=284;AF=0.92;AN=308 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1
-chr2 45472535 . T TAAT . PASS VC=INDEL;AC=291;AF=0.92;AN=316 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1
-chr2 47399270 . TCA T . PASS VC=INDEL;AC=140;AF=0.44;AN=316;refseq.name=NM_001743;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1
-chr2 48032874 . ACTAT A . PASS VC=INDEL;AC=254;AF=0.8;AN=316;refseq.name=NM_000179;refseq.positionType=intron GT 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0
-chr2 49026643 . A AA . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 49468159 . C CTCTT . PASS VC=INDEL;AC=57;AF=0.18;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 49514324 . GAAGAA G . PASS VC=INDEL;AC=179;AF=0.58;AN=310 GT 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1
-chr2 49982314 . T TT . PASS VC=INDEL;AC=196;AF=0.64;AN=304 GT 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 ./. 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/1 0/0 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1
-chr2 50152899 . TTTTC T . PASS VC=INDEL;AC=26;AF=0.1;AN=268;refseq.name=NM_004801;refseq.positionType=intron GT ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. ./. ./. 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr2 50693504 . AAC A . PASS VC=INDEL;AC=193;AF=0.63;AN=306;refseq.name=NM_004801;refseq.positionType=intron GT 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 ./. 1/1 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1
-chr2 50703696 . C CTG . PASS VC=INDEL;AC=287;AF=0.91;AN=314;refseq.name=NM_004801;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr2 50703699 . T TGT . PASS VC=INDEL;AC=285;AF=0.9;AN=316;refseq.name=NM_004801;refseq.positionType=intron GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-chr2 51260591 . T TAT . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_004801;refseq.positionType=promoter GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 51281539 . TT T . PASS VC=INDEL;AC=252;AF=0.8;AN=316 GT 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1
-chr2 51315220 . A ATT . PASS VC=INDEL;AC=55;AF=0.19;AN=292 GT 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1
-chr2 51315221 . T TTT . PASS VC=INDEL;AC=56;AF=0.19;AN=300 GT 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-chr2 51355364 . TTT T . PASS VC=INDEL;AC=30;AF=0.1;AN=304 GT 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0
-chr2 52397945 . A ATGCTATTCCAATATCTCAG . PASS VC=INDEL;AC=33;AF=0.15;AN=214 GT 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/1 ./. ./. ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1
-chr2 52643648 . G GAG . PASS VC=INDEL;AC=140;AF=0.53;AN=266 GT 0/1 ./. 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 ./. ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 ./. 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 ./. 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/1 1/1 ./. ./. ./. 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 ./. ./. 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 ./. 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1
-chr2 53056176 . G GAG . PASS VC=INDEL;AC=131;AF=0.49;AN=270 GT 1/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 ./. ./. ./. ./. 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 ./. 1/1
-chr2 53674036 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=106;AF=0.34;AN=310 GT 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-chr2 53737951 . AGGAT A . PASS VC=INDEL;AC=107;AF=0.35;AN=302 GT 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 0/1 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-chr2 54573230 . AACA A . PASS VC=INDEL;AC=62;AF=0.2;AN=316;refseq.name=NM_001100396;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-chr2 54726113 . G GA . PASS VC=INDEL;AC=269;AF=0.87;AN=308;refseq.name=NM_003128;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 ./. 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1
-chr2 54726287 . T TGTTA . PASS VC=INDEL;AC=269;AF=0.85;AN=316;refseq.name=NM_003128;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1
-chr2 54783793 . C CTT . PASS VC=INDEL;AC=270;AF=0.85;AN=316;refseq.name=NM_003128;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1
-chr2 55080611 . GCTTT G . PASS VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=310 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 55174675 . AC A . PASS VC=INDEL;AC=6;AF=0.02;AN=306 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./.
-chr2 55208953 . A ATATGAATCACATACAAGCTAAGAAAC . PASS VC=INDEL;AC=211;AF=0.67;AN=316;refseq.name=NM_020532;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1
-chr2 55208955 . A ATGAATCACATACAAGCTAAGAAACTA . PASS VC=INDEL;AC=211;AF=0.67;AN=316;refseq.name=NM_020532;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1
-chr2 55284481 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=90;AF=0.28;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0
-chr2 55355370 . CTG C . PASS VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 55473492 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=27;AF=0.11;AN=236;refseq.name=NM_002453;refseq.positionType=exon GT 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 ./.
-chr2 56088199 . TA T . PASS VC=INDEL;AC=21;AF=0.07;AN=316 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-chr2 56603301 . G GT . PASS VC=INDEL;AC=118;AF=0.39;AN=306;refseq.name=NM_001080433;refseq.positionType=intron GT 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0
-chr2 57161556 . CCTT C . PASS VC=INDEL;AC=24;AF=0.1;AN=230 GT 0/1 ./. ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. ./. ./. 0/0 ./. 0/1 0/1 ./. 0/1 ./. 0/1 0/1 ./. ./. ./. 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 ./. ./. ./. 0/1 ./. ./. ./. ./. 0/0
-chr2 58167700 . AA A . PASS VC=INDEL;AC=220;AF=0.73;AN=300 GT 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 ./. 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 ./. 0/1 1/1
-chr2 58193832 . A ACAA . PASS VC=INDEL;AC=35;AF=0.16;AN=222 GT 0/1 0/1 ./. 0/0 ./. ./. 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/0 ./. ./. 0/1 1/1 ./. ./. ./. 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 ./. 0/0 0/0 ./. ./. 0/0 ./. 0/0 0/1 1/1 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. ./. 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. ./. 0/0 ./. 0/1 ./. ./. ./. ./. ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 ./. ./. 1/1 0/0 0/1 0/0 ./. 0/1 ./. 0/1 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/1 ./. 0/0 ./. 0/0 0/0
-chr2 58274884 . C CAGG . PASS VC=INDEL;AC=125;AF=0.4;AN=314;refseq.name=NM_006296;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0
-chr2 58274891 . A AGGA . PASS VC=INDEL;AC=123;AF=0.4;AN=308;refseq.name=NM_006296;refseq.positionType=intron GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 ./. 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 ./. 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 ./. 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0
-chr2 58283746 . A ACT . PASS VC=INDEL;AC=268;AF=0.88;AN=304;refseq.name=NM_006296;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 ./. 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1
-chr2 58283749 . C CTC . PASS VC=INDEL;AC=266;AF=0.86;AN=308;refseq.name=NM_006296;refseq.positionType=intron GT 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 ./. 0/1 0/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 ./. 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 ./. 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1
-chr2 58385305 . T TCTTA . PASS VC=INDEL;AC=79;AF=0.25;AN=316;refseq.name=NM_006296;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0
-chr2 58385307 . T TTACT . PASS VC=INDEL;AC=79;AF=0.25;AN=316;refseq.name=NM_006296;refseq.positionType=intron GT 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.1
-##ApplyRecalibration="analysis_type=ApplyRecalibration input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/combined.phase1.chr20.raw.indels.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false recal_file=/humgen/gsa-scr1/delangel/VQSRIndels/data/trainMills75_truthMills75_p15_12_12_pctb0.05_std12.0_mG8_QD_FS_HS_RP_IC.recal tranches_file=/humgen/gsa-scr1/delangel/VQSRIndels/data/trainMills75_truthMills75_p15_12_12_pctb0.05_std12.0_mG8_QD_FS_HS_RP_IC.tranches out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub ts_filter_level=93.0 ignore_filter=null mode=INDEL"
-##CombineVariants="analysis_type=CombineVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20:41000001-42000000] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AFR/AFR.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/ASN/ASN.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AMR/AMR.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/EUR/EUR.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AFR.admix/AFR.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/ASN.admix/ASN.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AMR.admix/AMR.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/EUR.admix/EUR.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub genotypemergeoption=PRIORITIZE filteredrecordsmergetype=KEEP_IF_ANY_UNFILTERED rod_priority_list=AFR.admix,AMR.admix,EUR.admix,ASN.admix,AFR,AMR,EUR,ASN printComplexMerges=false filteredAreUncalled=false minimalVCF=false setKey=set assumeIdenticalSamples=false minimumN=1 masterMerge=false mergeInfoWithMaxAC=true"
-##FILTER=<ID=BothStrands,Description="Variant not seen on both strands">
-##FILTER=<ID=HARD_TO_VALIDATE,Description="MQ0 >= 4 && (MQ0 / (1.0 * DP)) > 0.1">
-##FILTER=<ID=HP10,Description="Variant occurs in long homopolymer run (>10)">
-##FILTER=<ID=HaplotypeScore,Description="HaplotypeScore>20.0">
-##FILTER=<ID=HighCoverage,Description="Coverage at variant site is > 7500">
-##FILTER=<ID=HomopolymerRun,Description="HRun>=15">
-##FILTER=<ID=LongRepeat,Description="Variant occurs in long tandem repeat (as defined by 1kg phase one filters)">
-##FILTER=<ID=LowQual,Description="QUAL<30.0">
-##FILTER=<ID=PP20,Description="Variant posterior phred is < 20">
-##FILTER=<ID=QualByDepth,Description="QD<1.0">
-##FILTER=<ID=StrandBias,Description="SB>=-1.0">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche93.00to94.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 3.9628 <= x < 4.1824">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche94.00to95.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 3.7129 <= x < 3.9628">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche95.00to96.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 3.3717 <= x < 3.7129">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche96.00to97.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 2.8762 <= x < 3.3717">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche97.00to98.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 2.2618 <= x < 2.8762">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche98.00to99.00+,Description="Truth sensitivity tranche level at VQS Lod < 1.2907">
-##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche98.00to99.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 1.2907 <= x < 2.2618">
-##FORMAT=<ID=AA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele observations">
-##FORMAT=<ID=AD,Number=.,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed">
-##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read Depth (only filtered reads used for calling)">
-##FORMAT=<ID=FT,Number=1,Type=String,Description="Sample Genotype Filter">
-##FORMAT=<ID=GL,Number=3,Type=Integer,Description="Genotype Likelihood, log-scaled likeilhoods of the data given the called genotype for each possible genotype generated from the reference and alternate alleles given the sample ploidy">
-##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Float,Description="Genotype Quality">
-##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
-##FORMAT=<ID=HQ,Number=.,Type=Integer,Description="Haplotype Quality">
-##FORMAT=<ID=PL,Number=3,Type=Float,Description="Normalized, Phred-scaled likelihoods for AA,AB,BB genotypes where A=ref and B=alt; not applicable if site is not biallelic">
-##FORMAT=<ID=RA,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele observations">
-##FORMAT=<ID=SA,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
-##FORMAT=<ID=SP,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled strand bias P-value">
-##FORMAT=<ID=SR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
-##INFO=<ID=AA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele observations">
-##INFO=<ID=AB,Number=1,Type=Float,Description="Allele balance at heterozygous sites: a number between 0 and 1 representing the ratio of reads showing the reference allele to all reads, considering only reads from individuals called as heterozygous">
-##INFO=<ID=ABA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele balance count: the number of sequence reads from apparent heterozygotes supporting the alternate allele">
-##INFO=<ID=ABP,Number=1,Type=Float,Description="Allele balance probability at heterozygous sites: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between ABR and ABA given E(ABR/ABA) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
-##INFO=<ID=ABR,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele balance count: the number of sequence reads from apparent heterozygotes supporting the reference allele">
-##INFO=<ID=AC,Number=.,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
-##INFO=<ID=AF,Number=.,Type=Float,Description="Allele Frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
-##INFO=<ID=AF1,Number=1,Type=Float,Description="Max-likelihood estimate of the site allele frequency of the first ALT allele">
-##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
-##INFO=<ID=BL,Number=1,Type=Integer,Description="Base Pairs Left: number of base pairs in reads supporting the alternate to the left (5') of the alternate allele">
-##INFO=<ID=BR,Number=1,Type=Integer,Description="Base Pairs Right: number of base pairs in reads supporting the alternate to the right (3') of the alternate allele">
-##INFO=<ID=BVAR,Number=0,Type=Flag,Description="The best genotype combination in the posterior is variant (non homozygous).">
-##INFO=<ID=BaseQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt Vs. Ref base qualities">
-##INFO=<ID=CI95,Number=2,Type=Float,Description="Equal-tail Bayesian credible interval of the site allele frequency at the 95% level">
-##INFO=<ID=CpG,Number=0,Type=Flag,Description="CpG site (either CpG, TpG or CpA)">
-##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP Membership">
-##INFO=<ID=DEL,Number=0,Type=Flag,Description="deletion allele">
-##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Filtered Depth">
-##INFO=<ID=DP4,Number=4,Type=Integer,Description="# high-quality ref-forward bases, ref-reverse, alt-forward and alt-reverse bases">
-##INFO=<ID=DS,Number=0,Type=Flag,Description="Were any of the samples downsampled?">
-##INFO=<ID=Dels,Number=1,Type=Float,Description="Fraction of Reads Containing Spanning Deletions">
-##INFO=<ID=EL,Number=1,Type=Integer,Description="Allele End Left: number of observations of the alternate where the alternate occurs in the left end of the read">
-##INFO=<ID=EPP,Number=1,Type=Float,Description="End Placement Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between EL and ER given E(EL/ER) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
-##INFO=<ID=ER,Number=1,Type=Integer,Description="Allele End Right: number of observations of the alternate where the alternate occurs in the right end of the read">
-##INFO=<ID=FQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred probability that sample chromosomes are not all the same">
-##INFO=<ID=FR,Number=0,Type=Float,Description="Estimated population frequency">
-##INFO=<ID=FS,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled p-value using Fisher's exact test to detect strand bias">
-##INFO=<ID=HETAR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of individuals heterozygous alternate / reference">
-##INFO=<ID=HOMA,Number=1,Type=Integer,Description="Number of individuals homozygous for the alternate">
-##INFO=<ID=HOMR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of individuals homozygous for the reference">
-##INFO=<ID=HP,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolmer run length">
-##INFO=<ID=HPLen,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer length">
-##INFO=<ID=HR,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length">
-##INFO=<ID=HRun,Number=1,Type=Integer,Description="Largest Contiguous Homopolymer Run of Variant Allele In Either Direction">
-##INFO=<ID=HU,Number=1,Type=String,Description="Homopolymer run unit (stranded)">
-##INFO=<ID=HaplotypeScore,Number=1,Type=Float,Description="Consistency of the site with at most two segregating haplotypes">
-##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Not provided in original VCF header">
-##INFO=<ID=INS,Number=0,Type=Flag,Description="insertion allele">
-##INFO=<ID=InbreedingCoeff,Number=1,Type=Float,Description="Inbreeding coefficient as estimated from the genotype likelihoods per-sample when compared against the Hardy-Weinberg expectation">
-##INFO=<ID=IndelType,Number=1,Type=String,Description="Indel type description">
-##INFO=<ID=KGPilot123,Number=0,Type=Flag,Description="1000 Genome discovery all pilots 2010(1,2,3)">
-##INFO=<ID=LEN,Number=1,Type=Integer,Description="allele length">
-##INFO=<ID=LRB,Number=1,Type=Float,Description="((max(BR, BL) / (BR + BL)) - 0.5) * 2 : The proportion of base pairs in reads on one side of the alternate allele relative to total bases, scaled from [0.5,1] to [0,1]">
-##INFO=<ID=LRBP,Number=1,Type=Float,Description="Left-Right Balance Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between BL and BR given E(BR/BL) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
-##INFO=<ID=MNP,Number=0,Type=Flag,Description="MNP allele">
-##INFO=<ID=MQ,Number=1,Type=Float,Description="RMS Mapping Quality">
-##INFO=<ID=MQ0,Number=1,Type=Integer,Description="Total Mapping Quality Zero Reads">
-##INFO=<ID=MQ0Fraction,Number=1,Type=Float,Description="Fraction of Mapping Quality Zero Reads">
-##INFO=<ID=MQM,Number=1,Type=Float,Description="Mean mapping quality of observed alternate alleles">
-##INFO=<ID=MQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read mapping qualities">
-##INFO=<ID=NF,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of forward reads containing this variant">
-##INFO=<ID=NR,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of reads containing this variant">
-##INFO=<ID=NS,Number=1,Type=Integer,Description="Number of samples with data">
-##INFO=<ID=PP,Number=0,Type=Float,Description="Posterior probability (phred scaled) that this variant segregates">
-##INFO=<ID=PV4,Number=4,Type=Float,Description="P-values for strand bias, baseQ bias, mapQ bias and tail distance bias">
-##INFO=<ID=QD,Number=1,Type=Float,Description="Variant Confidence/Quality by Depth">
-##INFO=<ID=RA,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele observations">
-##INFO=<ID=RL,Number=1,Type=Integer,Description="Reads Placed Left: number of reads supporting the alternate balanced to the left (5') of the alternate allele">
-##INFO=<ID=RPP,Number=1,Type=Float,Description="Read Placement Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between RPL and RPR given E(RPL/RPR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
-##INFO=<ID=RR,Number=1,Type=Integer,Description="Reads Placed Right: number of reads supporting the alternate balanced to the right (3') of the alternate allele">
-##INFO=<ID=RUN,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length: the number of consecutive nucleotides in the reference genome matching the alternate allele prior to the current position">
-##INFO=<ID=ReadPosRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read position bias">
-##INFO=<ID=SAB,Number=1,Type=Float,Description="Strand bias for the alternate allele: SAF / ( SAF + SAR )">
-##INFO=<ID=SAF,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations on the forward strand">
-##INFO=<ID=SAP,Number=1,Type=Float,Description="Strand balance probability for the alternate allele: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between SAF and SAR given E(SAF/SAR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
-##INFO=<ID=SAR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations on the reverse strand">
-##INFO=<ID=SB,Number=1,Type=Float,Description="Strand Bias">
-##INFO=<ID=SC,Number=1,Type=String,Description="Genomic sequence 10 bases either side of variant position">
-##INFO=<ID=SET_INTEGRATION,Number=0,Type=Flag,Description="SET_INTEGRATION Membership">
-##INFO=<ID=SET_WGVQSR,Number=0,Type=Flag,Description="SET_WGVQSR Membership">
-##INFO=<ID=SNP,Number=0,Type=Flag,Description="SNP allele">
-##INFO=<ID=SRB,Number=1,Type=Float,Description="Strand bias for the reference allele: SRF / ( SRF + SRR )">
-##INFO=<ID=SRF,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations on the forward strand">
-##INFO=<ID=SRP,Number=1,Type=Float,Description="Strand balance probability for the reference allele: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between SRF and SRR given E(SRF/SRR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
-##INFO=<ID=SRR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations on the reverse strand">
-##INFO=<ID=TC,Number=0,Type=Integer,Description="Total coverage">
-##INFO=<ID=TR,Number=1,Type=Integer,Description="Tandem repeat run length (bp)">
-##INFO=<ID=TS,Number=0,Type=Flag,Description="transition SNP">
-##INFO=<ID=TU,Number=1,Type=String,Description="tandem repeat run unit (stranded)">
-##INFO=<ID=TV,Number=0,Type=Flag,Description="transversion SNP">
-##INFO=<ID=VLD,Number=0,Type=Flag,Description="Is Validated. This bit is set if the snp has 2+ minor allele count based on frequency or genotype data.">
-##INFO=<ID=VQSLOD,Number=1,Type=Float,Description="Log odds ratio of being a true variant versus being false under the trained gaussian mixture model">
-##INFO=<ID=dbSNP,Number=1,Type=Integer,Description="First SNP Build for RS">
-##INFO=<ID=set,Number=1,Type=String,Description="Source VCF for the merged record in CombineVariants">
-##LeftAlignVariants="analysis_type=LeftAlignVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20] excludeIntervals=null reference_sequence=/seq/references/Homo_sapiens_assembly19/v1/Homo_sapiens_assembly19.fasta rodBind=[/humgen/gsa-scr1/ebanks/ALL.chr20.Oxford.20110407.indels.genotypes.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub"
-##SelectVariants="analysis_type=SelectVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20] excludeIntervals=null reference_sequence=/seq/references/Homo_sapiens_assembly19/v1/Homo_sapiens_assembly19.fasta rodBind=[/humgen/gsa-scr1/delangel/officialCalls/20110201_chr20_phase1_indels/dindel/20110208.chr20.dindel2.ALL.sites.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sample=null select_expressions=[] excludeNonVariants=false excludeFiltered=false discordance= concordance= family_structure= mendelianViolation=false mendelianViolationQualThreshold=0.0 select_random_number=0 select_random_fraction=0.0 selectSNPs=false selectIndels=true"
-##UnifiedGenotyper="analysis_type=UnifiedGenotyper input_file=[/broad/shptmp/delangel/calls/chr20/CHB.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/CHS.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/CLM.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/JPT.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/MXL.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/PUR.phase1.chr20.42.cleaned.bam] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20:41000001-42000000] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/humgen/gsa-scr1/delangel/otherIndelCallerAnalysis/ALL.indels.combined.chr20.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/GATK/data/dbsnp_132_b37.leftAligned.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=50 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=8 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false genotype_likelihoods_model=INDEL p_nonref_model=EXACT heterozygosity=0.0010 pcr_error_rate=1.0E-4 genotyping_mode=GENOTYPE_GIVEN_ALLELES output_mode=EMIT_ALL_SITES standard_min_confidence_threshold_for_calling=4.0 standard_min_confidence_threshold_for_emitting=4.0 noSLOD=false assume_single_sample_reads=null abort_at_too_much_coverage=-1 min_base_quality_score=17 min_mapping_quality_score=20 max_deletion_fraction=0.05 min_indel_count_for_genotyping=5 indel_heterozygosity=1.25E-4 indelGapContinuationPenalty=10.0 indelGapOpenPenalty=45.0 indelHaplotypeSize=80 doContextDependentGapPenalties=true getGapPenaltiesFromData=false indel_recal_file=indel.recal_data.csv indelDebug=false dovit=false GSA_PRODUCTION_ONLY=false exactCalculation=LINEAR_EXPERIMENTAL ignoreSNPAlleles=true output_all_callable_bases=false genotype=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub debug_file=null metrics_file=null annotation=[MappingQualityZeroFraction]"
-##VariantAnnotator="analysis_type=VariantAnnotator input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[./ALL.chr20.vqsr_2of5_union_sites_for_validation_boosted.vcf] rodToIntervalTrackName=variant BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sampleName=null annotation=[IndelType] group=[] expression=[] useAllAnnotations=false list=false assume_single_sample_reads=null vcfContainsOnlyIndels=false"
-##VariantFiltration="analysis_type=VariantFiltration input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[/humgen/1kg/processing/pipeline_test_bams/chr22_chunked.hg19.intervals] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/broad/shptmp/rpoplin/ALL.phase1.chr22.raw.indels.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false enable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null quiet_output_mode=false debug_mode=false help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub filterExpression=[MQ0 >= 4 && (MQ0 / (1.0 * DP)) > 0.1, QUAL<30.0, SB>=-1.0, QD<1.0, HRun>=15, HaplotypeScore>20.0] filterName=[HARD_TO_VALIDATE, LowQual, StrandBias, QualByDepth, HomopolymerRun, HaplotypeScore] genotypeFilterExpression=[] genotypeFilterName=[] clusterSize=3 clusterWindowSize=0 maskName=Mask missingValuesInExpressionsShouldEvaluateAsFailing=false"
-##commandline="/share/software/freebayes/bin/freebayes --stdin --min-alternate-count 2 --genotype-combo-step-max 20 --genotype-variant-threshold 4 --no-marginals --pvar 0.0001 --indels --mnps --no-filters --binomial-obs-priors --allele-balance-priors --region 20:0..100000 --vcf /d1/data/1000G/20101123/populations/finalised.phase1/integrated/including454/wg/ALL/Pipeline/none//freebayes/freebayes.20:0-100000.baq.20110328.vcf --fasta-reference /d2/data/references/build_37/human_reference_v37.fa"
-##contig=<ID=1,length=249250621,assembly=b37>
-##contig=<ID=10,length=135534747,assembly=b37>
-##contig=<ID=11,length=135006516,assembly=b37>
-##contig=<ID=12,length=133851895,assembly=b37>
-##contig=<ID=13,length=115169878,assembly=b37>
-##contig=<ID=14,length=107349540,assembly=b37>
-##contig=<ID=15,length=102531392,assembly=b37>
-##contig=<ID=16,length=90354753,assembly=b37>
-##contig=<ID=17,length=81195210,assembly=b37>
-##contig=<ID=18,length=78077248,assembly=b37>
-##contig=<ID=19,length=59128983,assembly=b37>
-##contig=<ID=2,length=243199373,assembly=b37>
-##contig=<ID=20,length=63025520,assembly=b37>
-##contig=<ID=21,length=48129895,assembly=b37>
-##contig=<ID=22,length=51304566,assembly=b37>
-##contig=<ID=3,length=198022430,assembly=b37>
-##contig=<ID=4,length=191154276,assembly=b37>
-##contig=<ID=5,length=180915260,assembly=b37>
-##contig=<ID=6,length=171115067,assembly=b37>
-##contig=<ID=7,length=159138663,assembly=b37>
-##contig=<ID=8,length=146364022,assembly=b37>
-##contig=<ID=9,length=141213431,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000191.1,length=106433,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000192.1,length=547496,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000193.1,length=189789,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000194.1,length=191469,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000195.1,length=182896,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000196.1,length=38914,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000197.1,length=37175,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000198.1,length=90085,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000199.1,length=169874,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000200.1,length=187035,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000201.1,length=36148,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000202.1,length=40103,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000203.1,length=37498,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000204.1,length=81310,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000205.1,length=174588,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000206.1,length=41001,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000207.1,length=4262,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000208.1,length=92689,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000209.1,length=159169,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000210.1,length=27682,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000211.1,length=166566,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000212.1,length=186858,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000213.1,length=164239,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000214.1,length=137718,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000215.1,length=172545,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000216.1,length=172294,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000217.1,length=172149,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000218.1,length=161147,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000219.1,length=179198,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000220.1,length=161802,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000221.1,length=155397,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000222.1,length=186861,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000223.1,length=180455,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000224.1,length=179693,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000225.1,length=211173,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000226.1,length=15008,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000227.1,length=128374,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000228.1,length=129120,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000229.1,length=19913,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000230.1,length=43691,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000231.1,length=27386,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000232.1,length=40652,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000233.1,length=45941,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000234.1,length=40531,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000235.1,length=34474,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000236.1,length=41934,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000237.1,length=45867,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000238.1,length=39939,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000239.1,length=33824,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000240.1,length=41933,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000241.1,length=42152,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000242.1,length=43523,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000243.1,length=43341,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000244.1,length=39929,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000245.1,length=36651,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000246.1,length=38154,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000247.1,length=36422,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000248.1,length=39786,assembly=b37>
-##contig=<ID=GL000249.1,length=38502,assembly=b37>
-##contig=<ID=MT,length=16569,assembly=b37>
-##contig=<ID=X,length=155270560,assembly=b37>
-##contig=<ID=Y,length=59373566,assembly=b37>
-##fileDate=2011-03-28
-##filedate=2011-02-08
-##filter="( SNP | MNP ) & ( MQM > 65 | QUAL > 1 ) & ABP < 30 & AB < 0.9 | ( INS | DEL ) & QUAL > 500"
-##phasing=none
-##reference=/lustre/scratch105/projects/g1k/ref/main_project/human_g1k_v37.fasta
-##reference=file:///humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta
-##source=Dindel2
-##source=SelectVariants
-##source_20110031.1=/nfs/users/nfs_p/pd3/cvs/vcftools/perl/vcf-annotate -d /nfs/users/nfs_p/pd3/sandbox/hapmap/dbSNP-b132/non-1kg-vld.desc -a /nfs/users/nfs_p/pd3/sandbox/hapmap/dbSNP-b132/non-1kg-vld.tab.gz -c CHROM,FROM,INFO/VLD,INFO/KGPilot123,INFO/dbSNP
-##vcfCTools=filter
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO
-20 458502 . G GA 4567.01 PASS AA=20;AB=0.61111;ABA=14;ABP=6.8707;ABR=22;AC=38;AF=0.0544;AN=698;BL=374;BR=1129;BVAR;BaseQRankSum=13.364;DP=15979;DP4=1882,2188,45,37;Dels=0.00;EL=5;EPP=13.868;ER=15;FR;FS=6.503;HETAR=11;HOMA=2;HOMR=985;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0157;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_A.;LEN=1;LRB=0.50233;LRBP=826.56;MQ=66.16;MQ0Fraction=0.0110;MQM=70.5;MQRankSum=-3.158;NF;NR;NS=998;PP;PV4=0.15,1,0.42,0.15;RA=3173;RL=1;RPP=38.188;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.346;SAB=0.7;SAF=14;SAP=9.959;SAR=6;SC=GGGCGTGGTGGTGCATGTAAT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.50047;SRF=1588;SRP=3.0165;SRR=1585;TC;TR=9;TU=GGT;VQSLOD=10.0079;set=Intersection;sumGLbyD=23.94
-20 573764 . TA T 591.51 PASS AC=91;AF=0.1987;AN=458;BaseQRankSum=0.137;DP=519;FS=3.153;HRun=1;HaplotypeScore=14.0744;InbreedingCoeff=0.1460;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=48.16;MQ0=26;MQ0Fraction=0.0501;MQRankSum=-1.636;QD=3.63;ReadPosRankSum=-4.140;SB=-408.14;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=5.2458;set=VQSR
-20 766143 . C CATCTGGTA 5521.70 PASS AA=24;AB=0.5;ABA=18;ABP=3.0103;ABR=18;AC=14;AF=0.0289;AF1=0.02038;AN=484;BL=655;BR=1542;BVAR;BaseQRankSum=3.801;CI95=0.01549,0.02655;DP=11749;DP4=2222,1998,14,8;Dels=0.00;EL=9;EPP=6.2675;ER=15;FQ=999;FR;FS=2.941;HETAR=9;HOMA=4;HOMR=901;HP=2;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0515;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_8.;LEN=8;LRB=0.40373;LRBP=780.64;MQ=56.81;MQ0Fraction=0.0253;MQM=22.167;MQRankSum=-4.809;NF;NR;NS=914;PP;PV4=0.39,1,5.8e-07,1;RA=3093;RL=6;RPP=16.039;RR=18;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.827;SAB=0.625;SAF=15;SAP=6.2675;SAR=9;SC=GCTTTAAATTCATCTGGTACT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.61623;SRF=1906;SRP=365.95;SRR=1187;TC;TR=1;TU=A;VQSLOD=7.0268;set=Intersection;sumGLbyD=50.23
-20 997076 rs11467490 CTG C 15379.78 PASS AA=195;AB=0.59878;ABA=132;ABP=30.896;ABR=197;AC=173;AF=0.14562;AN=1188;BL=7664;BR=7309;BVAR;BaseQRankSum=21.853;DB;DEL;DP=27127;DP4=1801,2002,241,282;Dels=0.13;EL=100;EPP=3.2887;ER=95;FQ=999;FR;FS=6.591;HETAR=77;HOMA=42;HOMR=815;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1284;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TG.;LEN=2;LRB=0.023709;LRBP=21.287;MQ=61.18;MQ0Fraction=0.0214;MQM=43.041;MQRankSum=6.886;NF;NR;NS=934;PP;PV4=0.61,1.5e-78,1,1;RA=2800;RL=120;RPP=25.56;RR=75;RUN=1;ReadPosRankSum=4.504;SAB=0.62051;SAF=121;SAP=27.609;SAR=74;SC=CAGCTAATTACTGTATTTTTA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.49821;SRF=1395;SRP=3.0879;SRR=1405;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=8.9396;set=Intersection;sumGLbyD=16.76
-20 1042261 rs10597473 CCCTG C 168658.05 PASS AA=4481;AB=0.29043;ABA=2128;ABP=1147.1;ABR=871;AC=1172;AF=0.97830;AN=1198;BL=169975;BR=194027;BVAR;BaseQRankSum=4.599;DB;DEL;DP=29418;DP4=29,47,1441,2403;Dels=0.84;EL=2358;EPP=29.772;ER=2123;FR;FS=9.122;HETAR=482;HOMA=559;HOMR=30;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.0470;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.066077;LRBP=3454.1;MQ=104.58;MQ0=4;MQ0Fraction=0.0014;MQM=58.257;MQRankSum=-3.368;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=0.91,6.8e-09,2.8e-05,1;RA=1039;RL=2088;RPP=48.09;RR=2393;RUN=1;ReadPosRankSum=5.288;SAB=0.41442;SAF=1857;SAP=288.09;SAR=2624;SC=CCAAACCCAACCCTGCCTGGC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.48893;SRF=508;SRP=4.1159;SRR=531;TC;TR=8;TU=CCTG;VQSLOD=8.5148;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=59.79
-20 1046297 rs33956316 C CT,CTT,CTTT 17698 PASS ABR=408;AC=432,79,230;AF=0.39779,0.07274,0.21179;BVAR;BaseQRankSum=-8.413;DB;DP=15649;DP4=147,199,534,436;FR;FS=11.580;HOMA=97;HOMR=457;HP=20;HR=16;HU=T;HaplotypeScore=16.0590;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.6018;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;KGPilot123;MQ0=19;MQ0Fraction=0.0093;MQRankSum=7.992;NF;NR;NS=767;PP;PV4=6e-05,1,1,1;QD=8.18;RA=1183;RUN=1;ReadPosRankSum=2.684;SB=-6384.08;SC=GGAAAATTTTCTTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;SRB=0.40913;SRF=484;SRP=87.859;SRR=699;TC;TR=16;TU=T;VQSLOD=8.4941;dbSNP=132;set=Intersection
-20 1405740 . T TA 257.28 PASS AF=0.0188;BaseQRankSum=-0.745;DP=3769;Dels=0.00;FS=0.742;HPLen=9;HRun=9;InbreedingCoeff=0.0462;IndelType=INS.NumRepetitions_9.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ0Fraction=0.0151;MQRankSum=-0.090;ReadPosRankSum=-1.582;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=5.6502;set=Intersection;sumGLbyD=6.94
-20 1690501 . TC T 27928 PASS AA=108;AB=0.91372;ABA=100;ABP=1726.1;ABR=1059;AC=35;AF=0.02966;AN=1180;BL=593;BR=6973;BVAR;BaseQRankSum=7.567;DEL;DP=10612;Dels=0.01;EL=50;EPP=4.2971;ER=58;FS=0.000;HETAR=378;HOMA=184;HOMR=477;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0495;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.84325;LRBP=11685;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=87.361;MQRankSum=4.088;NS=1045;RA=3125;RL=3;RPP=212.2;RR=105;RUN=1;ReadPosRankSum=-13.096;SAB=0.56481;SAF=61;SAP=6.9511;SAR=47;SRB=0.51776;SRF=1618;SRP=11.572;SRR=1507;VQSLOD=3.9824;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.07
-20 1991285 rs113891396 TAA T,TA,TAAA,TAAAAA,TAAAAAA,TAAAAAAA,TAAAAAAAA 39235.36 PASS AC=5,251,20,39,188,52,79;AF=0.0056,0.2789,0.0222,0.0433,0.2089,0.0578,0.0878;AN=900;BVAR;BaseQRankSum=1.124;DB;DEL;DP=54393;DP4=906,772,824,579;Dels=0.21;FR;FS=37.525;HP=12;HR=12;HRun=12;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.6891;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=76.81;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-6.593;NF;NR;PP;PV4=0.0087,1,6.3e-19,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.184;SC=ATCTGCCACTTAAAAAAAAAA;SET_WGVQSR;TC;TR=12;TU=A;VQSLOD=9.0007;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=11.45
-20 2355911 . TA T 11723 PASS AA=79;AB=0.9393;ABA=57;ABP=1577;ABR=882;AC=38;AF=0.0411;AN=924;BL=644;BR=5536;BVAR;BaseQRankSum=2.434;DEL;DP=9687;Dels=0.00;EL=45;EPP=6.3362;ER=34;FS=3.043;HETAR=321;HOMA=182;HOMR=555;HRun=5;InbreedingCoeff=0.0412;IndelType=DEL.NumRepetitions_5.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.79159;LRBP=8411.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=70.848;MQRankSum=0.137;NS=1058;RA=3415;RL=3;RPP=149.49;RR=76;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.116;SAB=0.44304;SAF=35;SAP=5.2367;SAR=44;SRB=0.43572;SRF=1488;SRP=125.55;SRR=1927;VQSLOD=3.8910;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.88
-20 2771621 rs11479849 GT G,GTT 1605.60 PASS AA=80;AB=0.79825;ABA=69;ABP=267.24;ABR=273;AC=79,91;AF=0.06551,0.07546;AN=1206;BL=2593;BR=3805;BVAR;BaseQRankSum=7.825;DB;DP=9790;Dels=0.04;EL=37;EPP=3.9875;ER=43;FR;FS=4.751;HETAR=62;HOMA=5;HOMR=958;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2646;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.18943;LRBP=501.57;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=52.45;MQRankSum=-0.560;NF;NR;NS=1025;PP;RA=3949;RL=29;RPP=16.148;RR=51;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.397;SAB=0.525;SAF=42;SAP=3.4446;SAR=38;SC=TCATTTTAACGTTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;SRB=0.54368;SRF=2147;SRP=68.46;SRR=1802;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=3.5989;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.92
-20 2891235 . G GT,GTTT 2869.87 PASS AC=236,246;AF=0.2803,0.2922;AN=842;BaseQRankSum=8.979;DP=1067;FS=3.911;HaplotypeScore=20.3595;InbreedingCoeff=0.6511;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=44.86;MQ0=114;MQ0Fraction=0.1068;MQRankSum=-2.273;QD=4.00;ReadPosRankSum=-6.601;SB=-991.85;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=5.4379;set=VQSR
-20 3033550 . TGAG T 2005.90 PASS AA=34;AB=0.51429;ABA=34;ABP=3.1344;ABR=36;AC=22;AF=0.0332;AN=662;BL=1374;BR=1649;BVAR;BaseQRankSum=5.192;DEL;DP=14639;DP4=2271,1492,12,21;Dels=0.02;EL=19;EPP=4.0322;ER=15;FR;FS=16.657;HETAR=17;HOMA=0;HOMR=914;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0454;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_3.;LEN=3;LRB=0.090969;LRBP=57.333;MQ=53.99;MQ0Fraction=0.0304;MQM=46.735;MQRankSum=1.938;NF;NR;NS=931;PP;PV4=0.0068,9.4e-05,1,1;RA=2985;RL=11;RPP=12.207;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.466;SAB=0.41176;SAF=14;SAP=5.3095;SAR=20;SC=CTTGGGAGGCTGAGGTGGGAG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.62781;SRF=1874;SRP=426.52;SRR=1111;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=8.9194;set=Intersection;sumGLbyD=24.41
-20 3873327 rs61519218 A AAG 683.85 PASS AC=25;AF=0.0313;AN=800;BaseQRankSum=4.839;DB;DP=1718;FS=4.265;HRun=0;HaplotypeScore=20.5789;InbreedingCoeff=0.1055;IndelType=INS.NOVEL_2.;MQ=53.70;MQ0=37;MQ0Fraction=0.0215;MQRankSum=2.468;QD=6.30;ReadPosRankSum=4.254;SB=-403.21;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=6.1858;set=VQSR
-20 4028835 . GC G 2511.30 PASS AA=66;AB=0.56954;ABA=65;ABP=9.3521;ABR=86;AC=22;AF=0.01836;AN=1198;BL=2303;BR=2463;BVAR;BaseQRankSum=7.621;DEL;DP=22795;DP4=1714,2774,22,37;Dels=0.02;EL=34;EPP=3.1419;ER=32;FQ=999;FR;FS=2.095;HETAR=21;HOMA=0;HOMR=1050;HP=2;HPLen=2;HR=2;HRun=2;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.0125;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.033571;LRBP=14.674;MQ=108.09;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=53.318;MQRankSum=5.257;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=1,5.4e-13,1,0.075;RA=6185;RL=36;RPP=4.1947;RR=30;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.059;SAB=0.45455;SAF=30;SAP=4.1947;SAR=36;SC=TGCTGTCACTGCCTTCTCCTA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.42118;SRF=2605;SRP=336.76;SRR=3580;TC;TR=2;TU=C;VQSLOD=10.2409;set=Intersection;sumGLbyD=12.71
-20 4039609 rs67812039 G GA 43457 PASS AA=909;AB=0.54639;ABA=572;ABP=26.583;ABR=689;AC=302;AF=0.3455;AN=874;BL=37070;BR=38211;BVAR;BaseQRankSum=20.147;DB;DP=25595;DP4=1483,1374,528,542;Dels=0.00;EL=467;EPP=4.5033;ER=442;FQ=999;FR;FS=5.441;HETAR=243;HOMA=127;HOMR=608;HP=4;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1388;IndelType=INS.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.015157;LRBP=40.563;MQ=119.50;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=83.197;MQRankSum=1.080;NF;NR;NS=978;PP;PV4=0.16,1,3.6e-12,1;RA=3033;RL=443;RPP=4.274;RR=466;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.000;SAB=0.32233;SAF=293;SAP=252.24;SAR=616;SC=TATGTTGGGAGAAATATCAGT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.38378;SRF=1164;SRP=358.85;SRR=1869;TC;TR=4;TU=AG;VQSLOD=9.9146;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=16.79
-20 4390056 . TC T 49312 PASS AA=91;AB=0.94353;ABA=86;ABP=2605.4;ABR=1437;AC=39;AF=0.03160;AN=1234;BL=6823;BR=731;BVAR;BaseQRankSum=2.727;DEL;DP=13149;Dels=0.00;EL=41;EPP=4.9431;ER=50;FS=4.002;HETAR=465;HOMA=313;HOMR=292;HRun=3;InbreedingCoeff=0.0326;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.80646;LRBP=10671;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=69.824;MQRankSum=-0.903;NS=1073;RA=3078;RL=89;RPP=183.62;RR=2;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.526;SAB=0.45055;SAF=41;SAP=4.9431;SAR=50;SRB=0.52567;SRF=1618;SRP=20.622;SRR=1460;VQSLOD=4.3235;set=Intersection;sumGLbyD=3.53
-20 4474622 . TA T,TAA,TAAA,TAAAA 94522.28 PASS ABR=114;AC=38,68,16,900;AF=0.03333,0.05965,0.01404,0.78947;AN=1140;BVAR;BaseQRankSum=9.741;DB;DP=16656;Dels=0.00;FR;FS=2.355;HOMA=3;HOMR=936;HP=10;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.4516;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0008;MQRankSum=-4.096;NF;NR;NS=980;PP;RA=3766;RUN=1;ReadPosRankSum=2.380;SC=AGAAAAAAATTAAAAAAAAAA;SET_WGVQSR;SRB=0.49734;SRF=1873;SRP=3.2409;SRR=1893;TC;TR=10;TU=A;VQSLOD=8.8186;set=Intersection;sumGLbyD=38.79
-20 4824911 . AC A 41998.70 PASS AC=1172;AF=0.97342;AN=1204;BaseQRankSum=8.604;DP=3615;FS=9.934;HRun=1;HaplotypeScore=39.6843;InbreedingCoeff=0.0980;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=129.80;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=3.378;QD=11.62;ReadPosRankSum=6.967;SB=-16955.28;VQSLOD=4.2689;set=VQSR
-20 4839897 rs35881880 TAA T,TA,TAAA,TAAAAA 3906.80 PASS AC=12,95,137,189;AF=0.01024,0.08106,0.11689,0.16126;AN=1172;BVAR;BaseQRankSum=15.271;DB;DEL;DP=15105;Dels=0.04;FR;FS=43.567;HP=19;HR=13;HRun=13;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.5716;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.569;NF;NR;PP;RUN=1;ReadPosRankSum=-13.794;SC=TGTTAAAAAATAAAAAAAAAA;TC;TR=13;TU=A;VQSLOD=8.1773;set=Intersection;sumGLbyD=3.77
-20 5507414 . G GCC 439.08 PASS AC=23;AF=0.01876;AN=1226;BaseQRankSum=3.051;DP=3023;FS=3.636;HRun=1;HaplotypeScore=30.3104;InbreedingCoeff=0.0204;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=112.09;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.065;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.709;SB=-302.22;VQSLOD=4.4311;set=VQSR
-20 5609676 . GA G,GAA 799.89 PASS AA=42;AB=0.79096;ABA=37;ABP=133.16;ABR=140;AC=43,65;AF=0.03607,0.05453;AF1=0.02826;AN=1192;BL=1360;BR=2334;BVAR;BaseQRankSum=5.069;CI95=0.01242,0.04037;DP=15610;DP4=1548,2441,21,30;Dels=0.02;EL=18;EPP=4.8716;ER=24;FQ=12.1;FR;FS=0.000;HETAR=36;HOMA=1;HOMR=991;HP=13;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2001;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.26367;LRBP=560.68;MQ=63.29;MQ0Fraction=0.0003;MQM=44.143;MQRankSum=1.755;NF;NR;NS=1028;PP;PV4=0.77,1,0.0087,0.0053;RA=4114;RL=15;RPP=10.455;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.978;SAB=0.5;SAF=21;SAP=3.0103;SAR=21;SC=AAAAAAGAAAGAAAAAAAAAA;SET_WGVQSR;SRB=0.39742;SRF=1635;SRP=379;SRR=2479;TC;TR=11;TU=AAAG;VQSLOD=4.1229;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=7.95
-20 5736211 rs35303106 CT C,CTT 4384.40 PASS AA=117;AB=0.71499;ABA=116;ABP=166.4;ABR=291;AC=32,145;AF=0.02712,0.12288;AN=1180;BL=5556;BR=4901;BVAR;BaseQRankSum=2.708;DB;DP=9157;Dels=0.01;EL=54;EPP=4.5136;ER=63;FR;FS=2.802;HETAR=79;HOMA=1;HOMR=837;HP=16;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.1903;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.062637;LRBP=92.1;MQ0Fraction=0.0273;MQM=48.932;MQRankSum=3.654;NF;NR;NS=917;PP;RA=2785;RL=79;RPP=34.209;RR=38;RUN=1;ReadPosRankSum=0.795;SAB=0.5641;SAF=66;SAP=7.1862;SAR=51;SC=TTTTCTTTTTCTTTTTTTTTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.41795;SRF=1164;SRP=165.85;SRR=1621;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=5.0895;set=Intersection;sumGLbyD=4.66
-20 5898626 rs34483659 CAAA C,CA,CAA,CAAAAA 1140.16 PASS ABR=34;AC=19,98,56,199;AF=0.0227,0.1172,0.0670,0.2380;AF1=0.08519;BVAR;BaseQRankSum=5.049;CI95=0.03727,0.1273;DB;DEL;DP=5091;DP4=539,408,121,123;FQ=4.43;FR;FS=5.701;HOMA=64;HOMR=156;HP=19;HR=18;HU=A;HaplotypeScore=11.5333;INDEL;InbreedingCoeff=0.7405;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=117;MQ0Fraction=0.0986;MQRankSum=6.290;NF;NR;NS=240;PP;PV4=0.043,1,1,0.0087;QD=1.22;RA=204;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.684;SB=-1015.09;SC=ACTAAAAATACAAAAAAAAAA;SET_WGVQSR;SRB=0.35294;SRF=72;SRP=41.33;SRR=132;TC;TR=18;TU=A;VQSLOD=4.1696;set=filterInVQSR-2of5
-20 5975126 rs10541892 C CAG 504.78 PASS AC=79;AF=0.07004;AN=1128;BaseQRankSum=10.498;DB;DP=2050;FS=38.228;HRun=0;HaplotypeScore=14.1426;InbreedingCoeff=-0.0053;IndelType=INS.NOVEL_2.;MQ=60.40;MQ0=80;MQ0Fraction=0.0390;MQRankSum=5.098;QD=1.63;ReadPosRankSum=-4.851;SB=-590.69;VQSLOD=4.8517;set=VQSR
-20 6040983 rs11087710 A AAAAAAGAG,AAAAAGAG,AAAAGAG,AAAAGAGAG,AAAGAG,AAAGAGAG,AAGAG,AAGAGAG,AG,AGAG,AGAGAG 66894.55 PASS ABR=468;AC=80,9,20,136,31,91,33,29,9,3,5;AF=0.0980,0.0110,0.0245,0.1667,0.0380,0.1115,0.0404,0.0355,0.0110,0.0037,0.0061;AN=816;BVAR;BaseQRankSum=-12.470;DB;DP=38726;DP4=426,611,310,472;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=6.635;HOMA=110;HOMR=506;HP=14;HR=15;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.8291;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;KGPilot123;MQ=54.22;MQ0Fraction=0.0168;MQRankSum=-5.329;NF;NR;NS=861;PP;PV4=0.56,1,6.9e-09,0.31;RA=1828;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.857;SC=AAAAAAAAAAAAGAGAGAGAG;SET_WGVQSR;SRB=0.62418;SRF=1141;SRP=247.85;SRR=687;TC;TR=15;TU=A;VQSLOD=9.0574;dbSNP=131;set=Intersection;sumGLbyD=36.72
-20 7024548 . G GAT 5041.27 PASS AC=123;AF=0.10336;AN=1190;BaseQRankSum=23.097;DP=3045;FS=7.979;HRun=0;HaplotypeScore=15.6967;InbreedingCoeff=0.1062;IndelType=INS.NumRepetitions_5.EventLength_2.RepeatExpansion_AT.;MQ=119.29;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0007;MQRankSum=-3.725;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.636;SB=-2257.45;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=5.9332;set=VQSR
-20 7484554 . A AT 5.09 PASS AC=0;AF=0.0000;AN=710;BaseQRankSum=-0.696;DP=1862;FS=2.835;HRun=9;HaplotypeScore=13.5425;InbreedingCoeff=0.0567;IndelType=INS.NumRepetitions_9.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=76.92;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.932;ReadPosRankSum=-1.701;VQSLOD=4.3156;set=VQSR
-20 7632194 rs77286341 GAA AAA,G 5324 PASS AC=0;AF=0.0000;AN=700;BaseQRankSum=-1.741;DB;DP=1772;FR;HP=4;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=A;HaplotypeScore=60.1795;InbreedingCoeff=0.0017;IndelType=MIXED;MQ=70.69;MQ0=13;MQ0Fraction=0.0073;MQRankSum=-1.315;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-3.650;SC=GAGAGAGAGAGAAAGGTGTAA;TC;TR=13;TU=AG;set=filterInVQSR-2of5
-20 7767508 rs71329674 G GA 17914 PASS AA=415;AB=0.61617;ABA=337;ABP=105.94;ABR=541;AC=141;AF=0.11614;AN=1214;BL=15187;BR=20323;BVAR;BaseQRankSum=-13.946;DB;DP=28222;Dels=0.00;EL=184;EPP=14.569;ER=231;FQ=999;FR;FS=13.296;HETAR=178;HOMA=35;HOMR=822;HP=14;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0714;IndelType=INS.NumRepetitions_9.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.14464;LRBP=1616.1;MQ=89.69;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=51.667;MQRankSum=0.664;NF;NR;NS=1035;PP;RA=3707;RL=171;RPP=30.894;RR=244;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.120;SAB=0.45301;SAF=188;SAP=10.969;SAR=227;SC=ATTCTAAAAAGAAAAAAAAAT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.38495;SRF=1427;SRP=429.23;SRR=2280;TC;TR=9;TU=A;VQSLOD=9.0748;set=Intersection;sumGLbyD=11.09
-20 7920261 . TA T,TAA 802.15 PASS AA=28;AB=0.8;ABA=28;ABP=112.45;ABR=112;AC=22,39;AF=0.01836,0.03255;AN=1198;BL=943;BR=1487;BVAR;BaseQRankSum=2.233;DP=10645;Dels=0.01;EL=11;EPP=5.8022;ER=17;FR;FS=1.691;HETAR=20;HOMA=0;HOMR=1007;HP=10;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.2256;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.22387;LRBP=267.46;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=57.571;MQRankSum=0.940;NF;NR;NS=1027;PP;RA=4776;RL=8;RPP=14.178;RR=20;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.567;SAB=0.53571;SAF=15;SAP=3.3205;SAR=13;SC=GTAACTGCTATAAAAAAAAAC;SET_WGVQSR;SRB=0.48576;SRF=2320;SRP=11.42;SRR=2456;TC;TR=9;TU=A;VQSLOD=4.0815;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.37
-20 8012465 rs10595338 TATGA T 2104.41 PASS AF=0.03339;BaseQRankSum=10.662;DB;DP=11772;DS;Dels=0.01;FR;FS=7.678;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;InbreedingCoeff=0.0266;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ0Fraction=0.0731;MQRankSum=0.603;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=1.276;SC=TGTATGTATGTATGATGTATG;TC;TR=19;TU=ATGT;VQSLOD=4.1376;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.53
-20 8573999 . CGTGT C,CGT,CGTGTGT,TGTGT 45865.96 PASS AC=458,0,731;AF=0.37727,0.00000,0.60214;AN=1214;BVAR;BaseQRankSum=-6.703;DEL;DP=37714;Dels=0.03;FR;FS=11.079;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.7632;IndelType=MIXED;LEN=2;MQ0Fraction=0.0026;MQRankSum=-1.394;NF;NR;PP;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.102;SC=TGTGTGTGCGCGTGTGTGTGT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=18;TU=GT;VQSLOD=6.1435;set=Intersection;sumGLbyD=3.53
-20 8610455 rs10571111 TTTTC T 11763.51 PASS AC=190;AF=0.17056;AN=1114;BaseQRankSum=-14.397;DB;DP=2323;FS=2.321;HRun=0;HaplotypeScore=39.8020;InbreedingCoeff=0.2502;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_4.;MQ=53.39;MQ0=104;MQ0Fraction=0.0448;MQRankSum=3.519;QD=19.07;ReadPosRankSum=4.150;SB=-4067.02;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=5.0554;set=VQSR
-20 9139079 . ATT A,AT,ATTT,ATTTT,ATTTTT 8777.90 PASS AC=23,140,114,69,113;AF=0.01993,0.12132,0.09879,0.05979,0.09792;AN=1154;BVAR;BaseQRankSum=-0.022;DEL;DP=25109;DP4=502,657,278,313;FR;FS=11.929;HP=16;HR=16;HU=T;HaplotypeScore=20.2361;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.5704;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=16;MQ0Fraction=0.0067;MQRankSum=2.624;NF;NR;PP;PV4=0.14,1,1,1;QD=1.48;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-2354.28;SC=CACCTGGCTAATTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;TC;TR=16;TU=T;VQSLOD=6.9180;set=Intersection
-20 9862448 . CT C 49312 PASS AA=60;AB=0.96003;ABA=53;ABP=2440.4;ABR=1273;AC=18;AF=0.01461;AN=1232;BL=3516;BR=140;BVAR;BaseQRankSum=-2.056;DEL;DP=11893;Dels=0.01;EL=35;EPP=6.6294;ER=25;FS=1.787;HETAR=396;HOMA=344;HOMR=334;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0379;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.92341;LRBP=6772.5;MQ0Fraction=0.0006;MQM=54.267;MQRankSum=-0.907;NS=1074;RA=2990;RL=60;RPP=133.3;RR=0;RUN=1;ReadPosRankSum=-10.579;SAB=0.58333;SAF=35;SAP=6.6294;SAR=25;SRB=0.47826;SRF=1430;SRP=15.284;SRR=1560;VQSLOD=3.0237;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.84
-20 9863736 rs73618103 G GT 50570.21 PASS AA=2247;AB=0.48878;ABA=1412;ABP=6.0324;ABR=1350;AC=546;AF=0.44463;AN=1228;BL=86886;BR=95862;BVAR;BaseQRankSum=-23.978;DB;DP=32517;DP4=1125,1133,1017,1048;Dels=0.00;EL=1089;EPP=7.6113;ER=1158;FQ=999;FR;FS=2.529;HETAR=445;HOMA=201;HOMR=393;HP=4;HPLen=4;HR=4;HRun=4;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1393;IndelType=INS.NumRepetitions_4.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;KGPilot123;LEN=1;LRB=0.049117;LRBP=960.35;MQ=68.10;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0006;MQM=50.931;MQRankSum=-1.580;NF;NR;NS=1039;PP;PV4=0.71,1,0.11,1;RA=3139;RL=1089;RPP=7.6113;RR=1158;RUN=1;ReadPosRankSum=0.846;SAB=0.54161;SAF=1217;SAP=36.804;SAR=1030;SC=TGATTGTATGGTTTTGTCCTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.53425;SRF=1677;SRP=34.987;SRR=1462;TC;TR=4;TU=T;VLD;VQSLOD=10.1800;dbSNP=131;set=Intersection;sumGLbyD=18.20
-20 10926959 . AG A 12239 PASS AA=65;AB=0.92801;ABA=64;ABP=1417.6;ABR=825;AC=24;AF=0.0264;AN=908;BL=616;BR=3782;BVAR;BaseQRankSum=9.990;DEL;DP=10708;Dels=0.01;EL=37;EPP=5.7163;ER=28;FS=1.652;HETAR=275;HOMA=70;HOMR=724;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0102;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.71987;LRBP=4952;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQM=118.82;MQRankSum=1.018;NS=1069;RA=4746;RL=5;RPP=104.07;RR=60;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.039;SAB=0.41538;SAF=27;SAP=7.0526;SAR=38;SRB=0.4764;SRF=2261;SRP=25.968;SRR=2485;VQSLOD=2.9713;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.10
-20 11299648 . TG T 49315 PASS AA=62;AB=0.95292;ABA=54;ABP=2046.7;ABR=1093;AC=28;AF=0.0373;AN=750;BL=3126;BR=528;BVAR;BaseQRankSum=-4.929;DEL;DP=10764;Dels=0.01;EL=26;EPP=6.5127;ER=36;FS=3.851;HETAR=366;HOMA=383;HOMR=304;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0267;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.711;LRBP=4014.1;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0005;MQM=76.468;MQRankSum=1.327;NS=1070;RA=2588;RL=54;RPP=77.121;RR=8;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.507;SAB=0.48387;SAF=30;SAP=3.1504;SAR=32;SRB=0.47643;SRF=1233;SRP=15.499;SRR=1355;VQSLOD=3.8673;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.00
-20 11561096 . CTA C 999 PASS AC=2;AF=0.0029;AF1=0.005602;BaseQRankSum=3.190;CI95=0.004425,0.01106;DP=7521;DP4=1998,1794,2,4;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=5.422;HP=3;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0056;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TA.;MQ=113.88;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.297;NF;NR;PP;PV4=0.43,0.024,1,1;ReadPosRankSum=1.406;SC=CAATAGTATTCTATGTCAGTC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=8.6243;set=Intersection;sumGLbyD=21.89
-20 11723671 . C CA 1096.60 PASS AA=35;AB=0.69565;ABA=35;ABP=41.247;ABR=80;AC=10;AF=0.0141;AN=710;BL=2005;BR=1702;BVAR;BaseQRankSum=-3.427;DP=9819;Dels=0.00;EL=20;EPP=4.5614;ER=15;FR;FS=3.814;HETAR=20;HOMA=0;HOMR=1034;HP=8;HPLen=7;HR=7;HRun=7;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0323;IndelType=INS.NumRepetitions_7.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.081737;LRBP=56.79;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=81.057;MQRankSum=0.050;NF;NR;NS=1054;PP;RA=5562;RL=22;RPP=8.0357;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.012;SAB=0.71429;SAF=25;SAP=16.97;SAR=10;SC=ATATTGAAGACAAAAAAACAG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.49371;SRF=2746;SRP=4.9233;SRR=2816;TC;TR=7;TU=A;VQSLOD=7.4342;set=Intersection;sumGLbyD=8.30
-20 12238835 rs113904674 CTCTTCATGGTCT C 1813.44 PASS AA=7;AB=0.73077;ABA=7;ABP=15.037;ABR=19;AC=4;AF=0.0056;AN=712;BL=360;BR=368;BVAR;BaseQRankSum=3.891;DB;DEL;DP=10309;Dels=0.00;EL=4;EPP=3.3205;ER=3;FR;FS=0.000;HETAR=3;HOMA=0;HOMR=1076;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=C;InbreedingCoeff=-0.0381;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_10orMore.;LEN=12;LRB=0.010989;LRBP=3.2012;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=37;MQRankSum=-3.793;NF;NR;NS=1079;PP;RA=6085;RL=4;RPP=3.3205;RR=3;RUN=1;ReadPosRankSum=1.319;SAB=0.42857;SAF=3;SAP=3.3205;SAR=4;SC=CTTAATGCTCCTCTTCATGGT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.51257;SRF=3119;SRP=11.364;SRR=2966;TC;TR=6;TU=CCT;VQSLOD=5.7551;set=Intersection;sumGLbyD=69.48
-20 12602812 . AT A 12344 PASS AA=47;AB=0.94372;ABA=43;ABP=1309.5;ABR=721;AC=14;AF=0.0196;AN=716;BL=2714;BR=217;BVAR;BaseQRankSum=1.424;DEL;DP=10743;Dels=0.00;EL=24;EPP=3.0565;ER=23;FS=0.629;HETAR=228;HOMA=65;HOMR=769;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0233;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.85193;LRBP=4622.3;MQ0Fraction=0.0000;MQM=99.574;MQRankSum=1.901;NS=1080;RA=4839;RL=46;RPP=96.568;RR=1;RUN=1;ReadPosRankSum=-9.906;SAB=0.53191;SAF=25;SAP=3.4261;SAR=22;SRB=0.51106;SRF=2473;SRP=8.148;SRR=2366;VQSLOD=2.8161;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.67
-20 13600884 . CTG C,CTGTG 1278.10 PASS AA=85;AB=0.77994;ABA=79;ABP=247.38;ABR=280;AC=71,22;AF=0.05907,0.01830;AN=1202;BL=3279;BR=3205;BVAR;BaseQRankSum=8.852;DEL;DP=24185;DP4=1317,931,52,49;Dels=0.03;EL=45;EPP=3.649;ER=40;FQ=999;FR;FS=31.826;HETAR=75;HOMA=4;HOMR=926;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1566;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=2;LRB=0.011413;LRBP=4.8442;MQ=65.06;MQ0Fraction=0.0012;MQM=48.671;MQRankSum=-0.511;NF;NR;NS=1005;PP;PV4=0.18,1,0.39,0.27;RA=3342;RL=35;RPP=8.7583;RR=50;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.329;SAB=0.43529;SAF=37;SAP=6.1015;SAR=48;SC=TCCCTTTACTCTGTGTGTGTG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.59066;SRF=1974;SRP=241.62;SRR=1368;TC;TR=15;TU=GT;VQSLOD=3.8635;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.23
-20 13666265 . T TATAG 556.88 PASS AC=21;AF=0.01959;AN=1072;BaseQRankSum=24.958;DP=2706;FS=2.581;HRun=0;HaplotypeScore=25.9952;InbreedingCoeff=0.1419;IndelType=INS.NOVEL_4.;MQ=72.43;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=2.888;QD=4.38;ReadPosRankSum=2.552;SB=-417.04;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=7.3380;set=VQSR
-20 13861245 rs72422273 C CTCA 2685.46 PASS AC=140;AF=0.11589;AN=1208;BaseQRankSum=24.355;DB;DP=2910;FS=6.808;HRun=0;HaplotypeScore=19.3095;InbreedingCoeff=-0.0991;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_3.;MQ=78.25;MQ0=22;MQ0Fraction=0.0076;MQRankSum=3.225;QD=3.64;ReadPosRankSum=2.607;SB=-1861.38;VQSLOD=4.1974;set=VQSR
-20 13865746 . T TA,TAA 1416.23 PASS AA=63;AB=0.80417;ABA=47;ABP=195.87;ABR=193;AC=122,21;AF=0.10133,0.01744;AN=1204;BL=3673;BR=1145;BVAR;BaseQRankSum=-3.336;DP=10513;Dels=0.00;EL=62;EPP=131.27;ER=1;FR;FS=716.583;HETAR=45;HOMA=1;HOMR=998;HP=2;HR=1;HRun=1;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0814;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.5247;LRBP=2883.3;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.143;MQRankSum=-1.197;NF;NR;NS=1044;PP;RA=4529;RL=62;RPP=131.27;RR=1;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.295;SAB=1;SAF=63;SAP=139.81;SAR=0;SC=GGAACATGGATACCCCCCTGC;SRB=0.52462;SRF=2376;SRP=26.853;SRR=2153;TC;TR=1;TU=A;VQSLOD=-4.2308;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.77
-20 13881703 . CTT C 152.85 PASS AC=8;AF=0.0093;AN=862;BaseQRankSum=3.941;DP=2063;FS=0.962;HRun=5;HaplotypeScore=24.0313;InbreedingCoeff=0.0790;IndelType=DEL.NumRepetitions_5.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=55.05;MQ0=49;MQ0Fraction=0.0238;MQRankSum=-1.418;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-93.04;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=5.3874;set=VQSR
-20 14260090 rs73619828 A AT 27935 PASS AA=596;AB=0.59484;ABA=487;ABP=96.922;ABR=715;AC=204;AF=0.17000;AN=1200;BL=21718;BR=28458;BVAR;BaseQRankSum=0.756;DB;DP=23629;DP4=1385,1492,287,328;Dels=0.00;EL=299;EPP=3.0249;ER=297;FQ=999;FR;FS=6.187;HETAR=218;HOMA=38;HOMR=788;HP=9;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0797;IndelType=INS.NumRepetitions_9.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.13433;LRBP=1969;MQ=100.81;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=57.084;MQRankSum=2.224;NF;NR;NS=1044;PP;PV4=0.53,1,1.2e-11,1;RA=4143;RL=238;RPP=55.475;RR=358;RUN=1;ReadPosRankSum=0.198;SAB=0.46812;SAF=279;SAP=8.2714;SAR=317;SC=CCTTAAGTTGATTTTTTTTTC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.50374;SRF=2087;SRP=3.514;SRR=2056;TC;TR=9;TU=T;VQSLOD=9.0018;set=Intersection;sumGLbyD=10.82
-20 14260558 . AC A 238 PASS AC=1;AF=0.0014;AF1=0.003368;BaseQRankSum=2.868;CI95=0.003106,0.006211;DP=9724;DP4=2075,2329,1,7;Dels=0.00;FQ=106;FR;FS=10.678;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=1;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0406;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=114.37;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.862;NF;NR;PP;PV4=0.074,0.0096,0.017,1;ReadPosRankSum=-0.042;SC=ATCAGGAATAACTGTGTGACC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=2;TU=A;VQSLOD=8.1618;set=Intersection;sumGLbyD=18.65
-20 14425481 . GTA G,GTATA 148.85 PASS AC=43,23;AF=0.03473,0.01858;AN=1238;BaseQRankSum=6.289;DP=25167;DP4=1800,2021,38,49;FR;FS=9.416;HP=2;HPLen=1;HR=1;HU=T;HaplotypeScore=17.7453;INDEL;InbreedingCoeff=0.0995;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=21;MQ0Fraction=0.0058;MQRankSum=-0.200;NF;NR;PP;PV4=0.59,1,0.04,0.023;QD=0.35;ReadPosRankSum=-1.689;SB=-367.50;SC=CTGTGTGTGTGTATATATATA;SET_WGVQSR;TC;TR=13;TU=AT;VQSLOD=3.5796;set=filterInVQSR-2of5
-20 14943522 rs11478299 GA AA,G 1761.24 PASS AA=117;AB=0.68142;ABA=108;ABP=99.919;ABR=231;AC=0;AF=0.0000;AF1=0.04204;AN=712;BL=4931;BR=5802;BVAR;BaseQRankSum=9.118;CI95=0.02876,0.05752;DB;DEL;DP=13717;DP4=1908,1684,59,58;Dels=0.05;EL=60;EPP=3.1773;ER=57;FQ=81.9;FR;HETAR=56;HOMA=1;HOMR=1011;HP=8;HPLen=8;HR=8;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1264;IndelType=MIXED;LEN=1;LRB=0.081152;LRBP=156.5;MQ=106.93;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=96.855;MQRankSum=1.619;NF;NR;NS=1068;PP;PV4=0.57,1,0.0003,1;QD=7.40;RA=5080;RL=56;RPP=3.4743;RR=61;RUN=1;ReadPosRankSum=0.814;SAB=0.52137;SAF=61;SAP=3.4743;SAR=56;SB=-1122.51;SC=GTTGTTTGGGGAAAAAAAACT;SET_WGVQSR;SRB=0.51083;SRF=2595;SRP=8.1825;SRR=2485;TC;TR=8;TU=A;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=9.81
-20 14974486 . A AG 4101.40 PASS AA=57;AB=0.57143;ABA=51;ABP=8.2839;ABR=68;AC=22;AF=0.01846;AN=1192;BL=2286;BR=2834;BVAR;BaseQRankSum=8.711;DP=20538;DP4=2172,2100,19,13;Dels=0.00;EL=32;EPP=4.877;ER=25;FS=0.517;HETAR=20;HOMA=4;HOMR=1027;HRun=1;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0677;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_G.;LEN=1;LRB=0.10703;LRBP=130.37;MQ=126.07;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.088;MQRankSum=-10.756;NS=1051;PV4=0.38,3.5e-51,7.9e-34,1;RA=5203;RL=26;RPP=3.9627;RR=31;RUN=1;ReadPosRankSum=1.283;SAB=0.54386;SAF=31;SAP=3.9627;SAR=26;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.51816;SRF=2696;SRP=17.918;SRR=2507;VQSLOD=8.0072;set=Intersection;sumGLbyD=25.60
-20 15111137 . GA G 13533 PASS AA=98;AB=0.84864;ABA=89;ABP=623.8;ABR=499;AC=47;AF=0.03796;AN=1238;BL=5324;BR=856;BVAR;BaseQRankSum=-11.577;DEL;DP=13384;Dels=0.01;EL=53;EPP=4.4284;ER=45;FS=6.099;HETAR=219;HOMA=845;HOMR=18;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0056;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.72298;LRBP=7017.4;MQ0Fraction=0.0003;MQM=90.449;MQRankSum=1.408;NS=1083;RA=590;RL=87;RPP=130.99;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-18.074;SAB=0.55102;SAF=54;SAP=5.2261;SAR=44;SRB=0.52373;SRF=309;SRP=5.8958;SRR=281;VQSLOD=4.1054;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.06
-20 15283028 . A AC,ACACACACACACAC 140844.83 PASS AA=180;AB=0.61442;ABA=123;ABP=39.285;ABR=196;AC=13,817;AF=0.01111,0.69829;AN=1170;BL=4453;BR=11407;BVAR;BaseQRankSum=24.686;DP=6365;Dels=0.00;EL=124;EPP=58.793;ER=56;FR;FS=10.912;HETAR=87;HOMA=48;HOMR=683;HP=1;HR=1;HRun=1;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2074;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.43846;LRBP=6624;MQ0Fraction=0.0558;MQM=38.211;MQRankSum=-21.111;NF;NR;NS=818;PP;RA=1732;RL=0;RPP=393.88;RR=180;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.620;SAB=0.31111;SAF=56;SAP=58.793;SAR=124;SC=ACACACACACATACACACATA;SRB=0.54042;SRF=936;SRP=27.584;SRR=796;TC;TR=21;TU=AC;VQSLOD=4.7569;set=Intersection;sumGLbyD=18.36
-20 15361056 . ATAACT A 4892.81 PASS AA=59;AB=0.63576;ABA=55;ABP=27.184;ABR=96;AC=34;AF=0.0487;AN=698;BL=3164;BR=1999;BVAR;BaseQRankSum=3.391;DEL;DP=7080;Dels=0.03;EL=27;EPP=3.9304;ER=32;FR;FS=4.816;HETAR=35;HOMA=6;HOMR=966;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=A;InbreedingCoeff=0.0785;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_5.;LEN=5;LRB=0.22564;LRBP=573.84;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=70.034;MQRankSum=-8.732;NF;NR;NS=1008;PP;RA=3915;RL=42;RPP=26.013;RR=17;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.735;SAB=0.44068;SAF=26;SAP=4.8137;SAR=33;SC=AGATTAGGAAATAACTTAGGG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.42682;SRF=1671;SRP=185.12;SRR=2244;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=7.0900;set=Intersection;sumGLbyD=43.38
-20 15579507 . AATTAGTC A,TATTAGTC 1936.38 PASS AA=16;AB=0.58974;ABA=16;ABP=5.7386;ABR=23;AC=64;AF=0.05229;AN=1224;BL=699;BR=775;BVAR;BaseQRankSum=-21.390;DEL;DP=21920;DP4=2099,2403,6,6;Dels=0.00;EL=8;EPP=3.0103;ER=8;FR;FS=2.920;HETAR=5;HOMA=0;HOMR=1063;HP=3;HPLen=4;HR=4;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0143;IndelType=MIXED;LEN=7;LRB=0.05156;LRBP=11.519;MQ=129.49;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=51.938;MQRankSum=3.331;NF;NR;NS=1068;PP;PV4=1,0.019,1.3e-07,1;RA=5334;RL=5;RPP=7.8961;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-16.901;SAB=0.4375;SAF=7;SAP=3.5532;SAR=9;SC=CATACTACAAAATTAGTCATT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.41695;SRF=2224;SRP=322.58;SRR=3110;TC;TR=4;TU=A;VQSLOD=3.2237;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=43.57
-20 15752535 . CT C,GT 3775.20 PASS AA=92;AB=0.78636;ABA=47;ABP=159.71;ABR=173;AC=0;AF=0.0000;AN=608;BL=4955;BR=2380;BVAR;BaseQRankSum=2.910;DEL;DP=3429;Dels=0.04;EL=13;EPP=105.82;ER=79;FR;HETAR=92;HOMA=95;HOMR=544;HP=2;HPLen=2;HR=2;HU=T;InbreedingCoeff=0.0483;IndelType=MIXED;LEN=1;LRB=0.35106;LRBP=1966;MQ0Fraction=0.0232;MQM=35.293;MQRankSum=-2.199;NF;NR;NS=732;PP;QD=4.91;RA=1272;RL=81;RPP=118.66;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.077;SAB=0.021739;SAF=2;SAP=185.79;SAR=90;SB=-59.51;SC=CAAGACCATCCTTGGCTAACA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.14623;SRF=186;SRP=1385.8;SRR=1086;TC;TR=2;TU=T;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=9.70
-20 15883060 rs73619850 A AT 1325.60 PASS AA=38;AB=0.59302;ABA=35;ABP=9.4742;ABR=51;AC=14;AF=0.0156;AN=896;BL=1078;BR=1638;BVAR;BaseQRankSum=-4.526;DB;DP=19854;DP4=1632,1800,15,20;Dels=0.00;EL=18;EPP=3.2389;ER=20;FR;FS=0.000;HETAR=14;HOMA=1;HOMR=1014;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=1;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=-0.0131;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.20619;LRBP=253.74;MQ=118.40;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.526;MQRankSum=0.892;NF;NR;NS=1029;PP;PV4=0.61,1,0.25,0.14;RA=4439;RL=14;RPP=8.7247;RR=24;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.061;SAB=0.42105;SAF=16;SAP=5.0675;SAR=22;SC=GGATTGGCAGATAAAAAATGG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.46429;SRF=2061;SRP=52.168;SRR=2378;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=9.7576;set=Intersection;sumGLbyD=15.69
-20 16122099 . GA G 12914 PASS AA=85;AB=0.85915;ABA=80;ABP=639.4;ABR=488;AC=19;AF=0.01542;AN=1232;BL=805;BR=5457;BVAR;BaseQRankSum=-6.084;DEL;DP=13592;Dels=0.00;EL=45;EPP=3.649;ER=40;FS=0.935;HETAR=218;HOMA=841;HOMR=14;HRun=2;InbreedingCoeff=0.0250;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.74289;LRBP=7507.5;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=103.01;MQRankSum=2.843;NS=1075;RA=541;RL=2;RPP=170.62;RR=83;RUN=1;ReadPosRankSum=-16.222;SAB=0.49412;SAF=42;SAP=3.0358;SAR=43;SRB=0.44917;SRF=243;SRP=15.152;SRR=298;VQSLOD=3.9745;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.97
-20 16828509 . G GT 843.62 PASS AA=30;AB=0.70103;ABA=29;ABP=37.06;ABR=68;AC=10;AF=0.0140;AN=714;BL=1368;BR=1786;BVAR;BaseQRankSum=-4.061;DP=8682;Dels=0.01;EL=14;EPP=3.2998;ER=16;FR;FS=2.681;HETAR=22;HOMA=1;HOMR=1020;HP=8;HPLen=8;HR=8;HRun=8;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.1389;IndelType=INS.NumRepetitions_8.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.13253;LRBP=123.3;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=62.8;MQRankSum=-1.491;NF;NR;NS=1043;PP;RA=4416;RL=11;RPP=7.6428;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.718;SAB=0.76667;SAF=23;SAP=21.54;SAR=7;SC=CCTTCAAAAGGTTTTTTTTGG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.5745;SRF=2537;SRP=215.91;SRR=1879;TC;TR=8;TU=T;VQSLOD=7.6258;set=Intersection;sumGLbyD=10.77
-20 17470034 . GC G 46975 PASS AA=57;AB=0.96043;ABA=52;ABP=2422.5;ABR=1262;AC=34;AF=0.02773;AN=1226;BL=418;BR=3446;BVAR;BaseQRankSum=-6.250;DEL;DP=12035;Dels=0.00;EL=22;EPP=9.4485;ER=35;FS=1.350;HETAR=416;HOMA=409;HOMR=244;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0083;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.78364;LRBP=5155.6;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=99.509;MQRankSum=2.192;NS=1076;RA=2396;RL=5;RPP=87.164;RR=52;RUN=1;ReadPosRankSum=-15.199;SAB=0.5614;SAF=32;SAP=4.877;SAR=25;SRB=0.52963;SRF=1269;SRP=21.285;SRR=1127;VQSLOD=3.8440;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.06
-20 17471374 . AGCGGC A 850.03 PASS AC=6;AF=0.0085;AF1=0.01301;AN=704;BaseQRankSum=6.259;CI95=0.00885,0.01991;DP=8180;DP4=2215,1878,4,5;Dels=0.01;FQ=131;FS=0.000;HRun=0;INDEL;InbreedingCoeff=0.0009;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_5.;MQ=104.41;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-5.521;PV4=0.74,0.37,0.0005,1;ReadPosRankSum=2.468;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=6.8773;set=Intersection;sumGLbyD=30.85
-20 18433202 rs35582929 G GA 2506.90 PASS AA=55;AB=0.5812;ABA=49;ABP=9.7103;ABR=68;AC=20;AF=0.0218;AN=918;BL=2263;BR=2175;BVAR;BaseQRankSum=-6.639;DB;DP=19467;DP4=1845,2365,27,26;Dels=0.00;EL=21;EPP=9.6826;ER=34;FQ=999;FR;FS=5.633;HETAR=16;HOMA=3;HOMR=1045;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=1;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0700;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.019829;LRBP=6.7994;MQ=114.03;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=83.345;MQRankSum=1.610;NF;NR;NS=1064;PP;PV4=0.33,1,1,1;RA=5380;RL=28;RPP=3.0498;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=0.873;SAB=0.47273;SAF=26;SAP=3.3656;SAR=29;SC=TATTTCATGGGAGCATTAAAA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.42862;SRF=2306;SRP=241.07;SRR=3074;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=10.0372;dbSNP=126;set=Intersection;sumGLbyD=13.10
-20 18551314 rs10659122 CA C,CAA,CAAA,CAAAA,CAAAAA 18810.74 PASS ABR=243;AC=19,169,216,164,188;AF=0.01816,0.16157,0.20650,0.15679,0.17973;BVAR;BaseQRankSum=-5.742;DB;DP=17637;DP4=136,77,560,237;FR;FS=2.693;HOMA=177;HOMR=299;HP=17;HR=17;HU=A;HaplotypeScore=15.5048;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.8901;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=11;MQ0Fraction=0.0069;MQRankSum=1.845;NF;NR;NS=658;PP;PV4=0.08,1,1,1;QD=12.66;RA=673;RUN=1;ReadPosRankSum=0.283;SB=-3514.45;SC=GATTCCATCTCAAAAAAAAAA;SET_WGVQSR;SRB=0.63596;SRF=428;SRP=111.06;SRR=245;TC;TR=17;TU=A;VQSLOD=10.6964;dbSNP=130;set=Intersection
-20 18785519 . G GTC 415.55 PASS AC=28;AF=0.0400;AN=700;BaseQRankSum=10.889;DP=1929;FS=8.778;HRun=0;HaplotypeScore=27.6448;InbreedingCoeff=0.0510;IndelType=INS.NOVEL_2.;MQ=61.99;MQ0=36;MQ0Fraction=0.0187;MQRankSum=4.508;QD=3.08;ReadPosRankSum=8.080;SB=-437.03;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=4.9313;set=VQSR
-20 20301041 rs35451634 ATATG A 200.42 PASS AC=21;AF=0.0449;AN=468;BaseQRankSum=5.251;DB;DP=579;FS=24.013;HRun=0;HaplotypeScore=27.8977;InbreedingCoeff=0.0113;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ=78.47;MQ0=26;MQ0Fraction=0.0449;MQRankSum=-5.284;QD=3.06;ReadPosRankSum=1.793;SB=-55.76;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=5.0981;set=VQSR
-20 20378174 . TC T 245.55 PASS AC=23;AF=0.01879;AN=1224;BaseQRankSum=0.990;DP=3225;FS=10.413;HRun=1;HaplotypeScore=22.6109;InbreedingCoeff=0.0244;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=93.70;MQ0=3;MQ0Fraction=0.0009;MQRankSum=-3.349;QD=1.86;ReadPosRankSum=-7.227;SB=-188.62;VQSLOD=4.2553;set=VQSR
-20 20809160 rs10571503 TAA AAA,T 3496 PASS AC=0;AF=0.0000;AN=612;BaseQRankSum=1.968;DB;DP=1092;FR;HP=4;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=A;HaplotypeScore=26.1253;InbreedingCoeff=0.0603;IndelType=MIXED;MQ=68.98;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0009;MQRankSum=1.520;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-4.042;SC=TATATATATATAAATTTAAAT;TC;TR=13;TU=AT;set=filterInVQSR-2of5
-20 22508765 . CT C 53877.84 PASS AA=187;AB=0.78077;ABA=171;ABP=537.09;ABR=609;AC=1017;AF=0.91787;AN=1108;BL=12690;BR=1718;BVAR;BaseQRankSum=13.773;DEL;DP=7430;Dels=0.02;EL=73;EPP=22.53;ER=114;FR;FS=16.352;HETAR=152;HOMA=9;HOMR=786;HP=8;HR=4;HRun=4;HU=T;InbreedingCoeff=0.3885;IndelType=DEL.NumRepetitions_4.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.76152;LRBP=18147;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=46.086;MQRankSum=0.971;NF;NR;NS=947;PP;RA=2868;RL=177;RPP=326.86;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=9.951;SAB=0.34759;SAF=65;SAP=40.738;SAR=122;SC=AAAAAATTTTCTTTTGAACTG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.46269;SRF=1327;SRP=37.684;SRR=1541;TC;TR=4;TU=T;VQSLOD=5.1182;set=Intersection;sumGLbyD=25.15
-20 22555082 rs11477526 AT A 11503 PASS AA=530;AB=0.50816;ABA=422;ABP=3.5063;ABR=436;AF=0.1614;AN=700;BL=21453;BR=23313;BVAR;BaseQRankSum=17.562;DB;DEL;DP=25587;DP4=1869,1600,283,201;Dels=0.14;EL=259;EPP=3.6003;ER=271;FQ=999;FR;FS=14.595;HETAR=159;HOMA=41;HOMR=846;HP=3;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0995;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.041549;LRBP=170.83;MQ=95.89;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=72.162;MQRankSum=2.564;NF;NR;NS=1046;PP;PV4=0.058,6.6e-129,0.04,1;RA=4303;RL=264;RPP=3.0267;RR=266;RUN=1;ReadPosRankSum=0.176;SAB=0.58679;SAF=311;SAP=37.688;SAR=219;SC=GGGAAAGCTGATTTACTGATT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.54892;SRF=2362;SRP=92.453;SRR=1941;TC;TR=3;TU=T;VQSLOD=8.7746;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=15.27
-20 22590907 . A AC 4204.88 PASS AA=67;AB=0.592;ABA=51;ABP=12.2;ABR=74;AF=0.0554;AF1=0.0468;AN=560;BL=2277;BR=2389;BVAR;BaseQRankSum=10.968;CI95=0.03759,0.05639;DP=14380;DP4=2514,2018,33,33;Dels=0.00;EL=22;EPP=20.155;ER=45;FQ=999;FR;FS=3.846;HETAR=25;HOMA=4;HOMR=1049;HP=4;HPLen=5;HR=5;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0719;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_C.;LEN=1;LRB=0.024003;LRBP=8.8481;MQ=110.68;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=96.149;MQRankSum=2.668;NF;NR;NS=1078;PP;PV4=0.39,1,0.46,0.36;RA=5468;RL=33;RPP=3.0427;RR=34;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.097;SAB=0.50746;SAF=34;SAP=3.0427;SAR=33;SC=TCATATCAAAAACATTACGTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.54389;SRF=2974;SRP=94.508;SRR=2494;TC;TR=5;TU=A;VQSLOD=10.0712;set=Intersection;sumGLbyD=27.69
-20 22806326 rs11468890 ATTCCATCAC A 105320.99 PASS AC=567;AF=0.48795;AN=1162;BVAR;BaseQRankSum=32.858;DB;DEL;DP=26278;DP4=727,796,554,587;Dels=0.30;FQ=999;FR;FS=1.923;HP=3;HPLen=3;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.2548;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_9.;LEN=9;MQ=89.42;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-23.545;NF;NR;PP;PV4=0.7,1,1.3e-167,1;RUN=1;ReadPosRankSum=4.384;SC=GGCTGCTCCCATTCCATCACT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=8.2594;set=Intersection;sumGLbyD=69.81
-20 22999898 rs55966257 CAGGA C 8019.97 PASS AA=23;AB=0.57778;ABA=19;ABP=5.3748;ABR=26;AC=214;AF=0.18838;AN=1136;BL=1143;BR=1040;BVAR;BaseQRankSum=29.294;DB;DEL;DP=8216;Dels=0.02;EL=11;EPP=3.1047;ER=12;FS=14.938;HETAR=14;HOMA=2;HOMR=948;HRun=0;InbreedingCoeff=0.0797;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.047183;LRBP=13.563;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=34.783;MQRankSum=-20.301;NS=964;RA=3637;RL=13;RPP=3.86;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=-24.607;SAB=0.47826;SAF=11;SAP=3.1047;SAR=12;SRB=0.49024;SRF=1783;SRP=6.02;SRR=1854;VQSLOD=7.9163;set=Intersection;sumGLbyD=9.43
-20 23385964 rs57723772 GAA G 8170.95 PASS AC=257;AF=0.20928;AN=1228;BaseQRankSum=32.220;DB;DP=3291;FS=1.688;HRun=3;HaplotypeScore=22.6739;InbreedingCoeff=0.0171;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=58.44;MQ0=32;MQ0Fraction=0.0097;MQRankSum=-4.893;QD=6.55;ReadPosRankSum=-35.524;SB=-3631.67;VQSLOD=5.6549;set=VQSR
-20 23534530 . TA T 3542.10 PASS AA=45;AB=0.75658;ABA=37;ABP=89.926;ABR=115;AC=35;AF=0.02991;AN=1170;BL=3090;BR=270;BVAR;BaseQRankSum=-6.892;DEL;DP=8108;Dels=0.00;EL=19;EPP=5.3748;ER=26;FS=1.026;HETAR=76;HOMA=896;HOMR=18;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0551;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.83929;LRBP=5142.4;MQ0Fraction=0.0017;MQM=41.578;MQRankSum=0.818;NS=991;RA=203;RL=43;RPP=84.127;RR=2;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.923;SAB=0.37778;SAF=17;SAP=8.8491;SAR=28;SRB=0.5665;SRF=115;SRP=10.808;SRR=88;VQSLOD=4.2093;set=Intersection;sumGLbyD=3.49
-20 23976810 rs5841018 A ATATTAAT 1782.38 PASS AF=0.1387;AF1=0.01507;BaseQRankSum=3.717;CI95=0.00188,0.03947;DB;DP=1712;DP4=357,376,7,2;Dels=0.00;FQ=31.1;FS=14.489;HPLen=2;HRun=0;INDEL;InbreedingCoeff=0.1123;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_7.;MQ=49.53;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0055;MQRankSum=-4.928;PV4=0.1,1,0.00085,0.016;ReadPosRankSum=-4.456;VQSLOD=5.3140;dbSNP=116;set=Intersection;sumGLbyD=19.98
-20 24222100 . CTTTTA C 4219.36 PASS AA=57;AB=0.59434;ABA=43;ABP=11.205;ABR=63;AF=0.01803;AF1=0.01547;AN=1220;BL=2073;BR=2345;BVAR;BaseQRankSum=7.990;CI95=0.0114,0.02137;DEL;DP=17536;DP4=2140,2346,7,12;Dels=0.01;EL=32;EPP=4.877;ER=25;FQ=104;FS=0.614;HETAR=21;HOMA=4;HOMR=1042;HRun=0;INDEL;InbreedingCoeff=0.1941;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_5.;LEN=5;LRB=0.061566;LRBP=39.374;MQ=73.32;MQ0Fraction=0.0021;MQM=39.614;MQRankSum=-5.728;NS=1067;PV4=0.37,1.1e-39,3.5e-09,1;RA=5527;RL=28;RPP=3.0484;RR=29;RUN=1;ReadPosRankSum=0.214;SAB=0.54386;SAF=31;SAP=3.9627;SAR=26;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.49267;SRF=2723;SRP=5.588;SRR=2804;VQSLOD=7.5428;set=Intersection;sumGLbyD=38.08
-20 24395018 . AT A 49310 PASS AA=146;AB=0.91198;ABA=130;ABP=2180.5;ABR=1347;AC=50;AF=0.04045;AN=1236;BL=587;BR=9625;BVAR;BaseQRankSum=-4.610;DEL;DP=12793;Dels=0.01;EL=54;EPP=24.487;ER=92;FS=22.108;HETAR=485;HOMA=384;HOMR=210;HRun=2;InbreedingCoeff=0.0374;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.88504;LRBP=17373;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=102.26;MQRankSum=2.256;NS=1080;RA=2377;RL=1;RPP=311.42;RR=145;RUN=1;ReadPosRankSum=-16.347;SAB=0.63699;SAF=93;SAP=26.807;SAR=53;SRB=0.52167;SRF=1240;SRP=12.702;SRR=1137;VQSLOD=3.2421;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.80
-20 24411517 . C CA 246.18 PASS AF=0.01546;AF1=0.01095;BaseQRankSum=7.832;CI95=0.005698,0.01709;DP=7981;DP4=983,2037,7,7;Dels=0.00;FQ=27.9;FS=18.815;HPLen=3;HRun=3;INDEL;InbreedingCoeff=0.0175;IndelType=INS.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=60.28;MQ0Fraction=0.0137;MQRankSum=-7.243;PV4=0.25,1,2.7e-05,1;ReadPosRankSum=-0.143;VQSLOD=4.3701;set=Intersection;sumGLbyD=6.56
-20 24421169 . AG A 27480 PASS AA=182;AB=0.8303;ABA=149;ABP=835;ABR=729;AC=89;AF=0.07224;AN=1232;BL=11276;BR=2214;BVAR;BaseQRankSum=-5.447;DEL;DP=11717;Dels=0.01;EL=103;EPP=9.8827;ER=79;FR;FS=15.492;HETAR=343;HOMA=607;HOMR=114;HP=4;HR=1;HRun=1;HU=G;InbreedingCoeff=0.0353;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.67176;LRBP=13222;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=88.324;MQRankSum=2.221;NF;NR;NS=1071;PP;RA=1226;RL=169;RPP=293.37;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-19.711;SAB=0.54945;SAF=100;SAP=6.876;SAR=82;SC=CCTTAGCCCCAGAAAACATCT;SRB=0.44535;SRF=546;SRP=34.814;SRR=680;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=4.2669;set=Intersection;sumGLbyD=3.91
-20 24765537 rs71841337 ATTT A,AT,ATT,ATTTT,ATTTTT 37852 PASS AC=13,120,527,51,92;AF=0.01102,0.10169,0.44661,0.04322,0.07797;AN=1180;BVAR;BaseQRankSum=8.172;DB;DEL;DP=39116;DP4=200,331,851,1169;FR;FS=2.394;HP=15;HR=15;HU=T;HaplotypeScore=20.8091;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.4815;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=4.344;NF;NR;PP;PV4=0.067,1,1,0.1;QD=7.90;RUN=1;ReadPosRankSum=1.798;SB=-8371.96;SC=CTCTGCAACAATTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;TC;TR=15;TU=T;VQSLOD=9.9679;dbSNP=120;set=Intersection
-20 25500689 . A AATTT 84980.72 PASS AC=1005;AF=0.89096;AN=1128;BaseQRankSum=17.400;DP=2324;FS=6.721;HRun=0;HaplotypeScore=25.3376;InbreedingCoeff=0.2148;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ=75.19;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQRankSum=-8.221;QD=38.28;ReadPosRankSum=4.504;SB=-34833.07;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=4.6038;set=VQSR
-20 25550373 . GA G 11251.31 PASS AA=246;AB=0.42963;ABA=154;ABP=14.624;ABR=116;AC=566;AF=0.6521;AN=868;BL=5230;BR=11845;BVAR;BaseQRankSum=7.418;DEL;DP=8885;Dels=0.02;EL=99;EPP=23.348;ER=147;FR;FS=50.357;HETAR=150;HOMA=849;HOMR=14;HP=1;HR=2;HRun=1;HU=G;InbreedingCoeff=0.1365;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.38741;LRBP=5567.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=97.561;MQRankSum=0.050;NF;NR;NS=1013;PP;RA=269;RL=75;RPP=84.361;RR=171;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.128;SAB=0.52846;SAF=130;SAP=4.7404;SAR=116;SC=CACGGAGGCGGAGGAAGCAGC;SRB=0.42379;SRF=114;SRP=16.58;SRR=155;TC;TR=6;TU=AGG;VQSLOD=4.0103;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.58
-20 25903865 . TTC T 7459.23 PASS AC=277;AF=0.23316;AN=1188;BaseQRankSum=31.479;DP=2969;FS=137.723;HRun=0;HaplotypeScore=37.3300;InbreedingCoeff=-0.1755;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TC.;MQ=53.49;MQ0=50;MQ0Fraction=0.0168;MQRankSum=-25.506;QD=4.70;ReadPosRankSum=-5.913;SB=-1747.98;VQSLOD=5.4731;set=VQSR
-20 25934237 . C CCACTT 771.36 PASS AC=37;AF=0.0426;AN=868;BaseQRankSum=16.331;DP=2253;FS=4.545;HRun=0;HaplotypeScore=29.9764;InbreedingCoeff=-0.0685;IndelType=INS.NOVEL_5.;MQ=48.12;MQ0=87;MQ0Fraction=0.0386;MQRankSum=-12.497;QD=3.37;ReadPosRankSum=-8.428;SB=-297.70;VQSLOD=4.2324;set=VQSR
-20 26054751 rs112967123 TATC T 33244 PASS AA=1863;AB=0.79012;ABA=1788;ABP=6231;ABR=6731;AC=227;AF=0.18218;AN=1246;BL=74924;BR=72452;BVAR;BaseQRankSum=32.258;DB;DEL;DP=36404;DS;Dels=0.05;EL=931;EPP=3.0115;ER=932;FR;FS=265.752;HETAR=527;HOMA=2;HOMR=565;HP=1;HR=2;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=-0.2137;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_3.;LEN=3;LRB=0.016773;LRBP=93.048;MQ0Fraction=0.0127;MQM=28.797;MQRankSum=-5.329;NF;NR;NS=1094;PP;RA=14604;RL=1014;RPP=34.743;RR=849;RUN=1;ReadPosRankSum=8.394;SAB=0.65486;SAF=1220;SAP=391.07;SAR=643;SC=TCACCATCATTATCATCATTA;SRB=0.56717;SRF=8283;SRP=575.39;SRR=6321;TC;TR=8;TU=ATC;VQSLOD=1.0486;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.54
-20 26120452 . CAG C 7863.19 PASS AA=163;AB=0.70489;ABA=157;ABP=196.99;ABR=375;AC=171;AF=0.1908;AN=896;BL=3455;BR=4877;BVAR;BaseQRankSum=25.536;DEL;DP=7014;Dels=0.10;EL=58;EPP=32.438;ER=105;FS=231.723;HETAR=90;HOMA=5;HOMR=387;HRun=0;InbreedingCoeff=-0.1966;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;LEN=2;LRB=0.17067;LRBP=530;MQ0Fraction=0.0470;MQM=21.951;MQRankSum=-23.449;NS=482;RA=1117;RL=62;RPP=23.273;RR=101;RUN=1;ReadPosRankSum=1.904;SAB=0.37423;SAF=61;SAP=25.404;SAR=102;SRB=0.41719;SRF=466;SRP=69.544;SRR=651;VQSLOD=-0.9395;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.06
-20 26185812 . AG A 322.58 PASS AF=0.0342;BaseQRankSum=3.668;DP=3014;Dels=0.01;FR;FS=10.238;HP=8;HPLen=6;HR=6;HRun=6;HU=G;InbreedingCoeff=0.1504;IndelType=DEL.NumRepetitions_6.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;MQ0Fraction=0.0473;MQRankSum=-5.464;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=0.536;SC=GGGTGGGTGGAGGGGGGAGGG;SET_WGVQSR;TC;TR=6;TU=G;VQSLOD=5.0767;set=Intersection;sumGLbyD=8.46
-20 30963468 . AGTTT A 2041.12 PASS AA=38;AB=0.75694;ABA=35;ABP=85.587;ABR=109;AC=34;AF=0.0377;AN=902;BL=1974;BR=668;BVAR;BaseQRankSum=3.060;DEL;DP=22806;DP4=1997,1747,28,36;Dels=0.02;EL=17;EPP=3.9246;ER=21;FR;FS=16.034;HETAR=29;HOMA=1;HOMR=1009;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.0752;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.49432;LRBP=1404.9;MQ=87.17;MQ0Fraction=0.0013;MQM=98.079;MQRankSum=6.021;NF;NR;NS=1039;PP;PV4=0.13,1.5e-07,1,0.051;RA=4052;RL=36;RPP=69.069;RR=2;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.847;SAB=0.5;SAF=19;SAP=3.0103;SAR=19;SC=AGAAGTAAGTAGTTTGTTTTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.53776;SRF=2179;SRP=53.19;SRR=1873;TC;TR=9;TU=AAGT;VQSLOD=7.3578;set=Intersection;sumGLbyD=14.03
-20 31963212 . AAAAAAAAAAAAG A 727.15 PASS AC=5;AF=0.0080;AN=622;BaseQRankSum=4.037;DP=1480;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=43.3793;InbreedingCoeff=0.0350;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_10orMore.;MQ=51.77;MQ0=59;MQ0Fraction=0.0399;MQRankSum=-1.799;QD=22.72;ReadPosRankSum=3.591;SB=-364.04;VQSLOD=5.3166;set=VQSR
-20 31997272 . CT C,CTT,CTTT 1837.10 PASS AA=63;AB=0.77559;ABA=57;ABP=170.57;ABR=197;AC=79,49,30;AF=0.06594,0.04090,0.02504;AN=1198;BL=2372;BR=2640;BVAR;BaseQRankSum=3.277;DP=9050;Dels=0.03;EL=24;EPP=10.766;ER=39;FR;FS=0.303;HETAR=45;HOMA=1;HOMR=981;HP=10;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2796;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.053472;LRBP=34.128;MQ0Fraction=0.0000;MQM=50.889;MQRankSum=0.610;NF;NR;NS=1027;PP;RA=3776;RL=30;RPP=3.3205;RR=33;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.800;SAB=0.39683;SAF=25;SAP=8.8354;SAR=38;SC=ACCCAACTTCCTTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;SRB=0.46213;SRF=1745;SRP=50.049;SRR=2031;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=4.1189;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.66
-20 33446974 rs113250263 TAA T,TA,TAAA 17130.16 PASS AC=65,417,184;AF=0.05941,0.38117,0.16819;AN=1094;BVAR;BaseQRankSum=3.400;DB;DEL;DP=22362;DP4=221,247,418,524;Dels=0.33;FR;FS=15.409;HP=15;HR=14;HRun=14;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.5215;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=61.32;MQ0Fraction=0.0021;MQRankSum=0.481;NF;NR;PP;PV4=0.33,1,1,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.056;SC=CTCCGTCTCATAAAAAAAAAA;SET_WGVQSR;TC;TR=14;TU=A;VQSLOD=8.0974;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=12.78
-20 33877149 . C CT 1784.40 PASS AA=58;AB=0.73096;ABA=53;ABP=94.289;ABR=144;AC=65;AF=0.05682;AN=1144;BL=3298;BR=1935;BVAR;BaseQRankSum=-2.066;DP=8074;Dels=0.02;EL=22;EPP=10.348;ER=36;FR;FS=11.452;HETAR=47;HOMA=3;HOMR=754;HP=16;HR=12;HRun=12;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.1178;IndelType=INS.NumRepetitions_10orMore.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.26046;LRBP=773.91;MQ0Fraction=0.0165;MQM=52.259;MQRankSum=0.734;NF;NR;NS=804;PP;RA=2141;RL=43;RPP=32.363;RR=15;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.273;SAB=0.46552;SAF=27;SAP=3.6093;SAR=31;SC=ATTTTCTTTTCTTTTTTTTTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.37553;SRF=804;SRP=291.14;SRR=1337;TC;TR=12;TU=T;VQSLOD=3.1540;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.84
-20 34387589 rs112431805 CT C,CTT 4039.10 PASS AA=121;AB=0.75368;ABA=117;ABP=268.53;ABR=358;AC=84,139;AF=0.07047,0.11661;AN=1192;BL=5557;BR=3901;BVAR;BaseQRankSum=2.693;DB;DP=10157;Dels=0.03;EL=47;EPP=16.093;ER=74;FR;FS=7.639;HETAR=89;HOMA=2;HOMR=913;HP=13;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2097;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.17509;LRBP=632.63;MQ0Fraction=0.0000;MQM=49.802;MQRankSum=-0.801;NF;NR;NS=1004;PP;RA=3789;RL=77;RPP=22.554;RR=44;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.691;SAB=0.3719;SAF=45;SAP=20.256;SAR=76;SC=AAGAAGTGTTCTTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;SRB=0.40987;SRF=1553;SRP=270.35;SRR=2236;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=4.0473;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.64
-20 34493409 rs73621682 C CAG 62288.93 PASS AA=1069;AB=0.54863;ABA=826;ABP=40.606;ABR=1004;AC=257;AF=0.3640;AN=706;BL=41524;BR=47039;BVAR;BaseQRankSum=-24.248;DB;DP=30195;DP4=1743,1636,614,487;Dels=0.00;EL=582;EPP=21.343;ER=487;FQ=999;FR;FS=5.080;HETAR=298;HOMA=63;HOMR=712;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1437;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;LEN=2;LRB=0.062272;LRBP=748.76;MQ=77.99;MQ0=3;MQ0Fraction=0.0015;MQM=54.446;MQRankSum=0.160;NF;NR;NS=1073;PP;PV4=0.016,1,0.01,1;RA=4461;RL=526;RPP=3.5973;RR=543;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.716;SAB=0.57343;SAF=613;SAP=53.08;SAR=456;SC=AGGAAGAGATCAGAGCTCCCC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.52634;SRF=2348;SRP=29.892;SRR=2113;TC;TR=4;TU=AG;VQSLOD=8.7047;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=49.82
-20 35957317 . CTGACT C,CGACT 4370.96 PASS ABR=81;AC=22,1;AF=0.0321,0.0015;AF1=0.04523;AN=686;BVAR;BaseQRankSum=7.969;CI95=0.0354,0.05752;DEL;DP=16632;DP4=1942,1815,17,21;Dels=0.03;FQ=999;FR;FS=0.531;HOMA=1;HOMR=998;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0587;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=83.38;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-7.201;NF;NR;NS=1020;PP;PV4=0.42,0.00017,4.5e-12,1;RA=4620;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.007;SC=CCTCTCAGCTCTGACTGAGTC;SET_WGVQSR;SRB=0.50043;SRF=2312;SRP=3.0178;SRR=2308;TC;TR=8;TU=ACTG;VQSLOD=9.9778;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=36.45
-20 36136198 . GTGTC G 2078.76 PASS AA=35;AB=0.54167;ABA=33;ABP=4.096;ABR=39;AC=17;AF=0.01384;AN=1228;BL=1212;BR=1523;BVAR;BaseQRankSum=6.900;DEL;DP=22483;DP4=1696,2291,9,16;Dels=0.01;EL=9;EPP=20.94;ER=26;FQ=999;FR;FS=3.023;HETAR=13;HOMA=1;HOMR=1061;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1113;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.11371;LRBP=79.803;MQ=93.98;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=83.686;MQRankSum=-1.683;NF;NR;NS=1075;PP;PV4=0.55,1,0.0083,1;RA=5771;RL=19;RPP=3.5687;RR=16;RUN=1;ReadPosRankSum=0.618;SAB=0.37143;SAF=13;SAP=8.0357;SAR=22;SC=TATCATTTTAGTGTCTGTCTG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.44966;SRF=2595;SRP=130.03;SRR=3176;TC;TR=11;TU=CTGT;VQSLOD=10.1935;set=Intersection;sumGLbyD=31.66
-20 36250522 . CA C 37933 PASS AA=51;AB=0.95582;ABA=44;ABP=1800.5;ABR=952;AC=23;AF=0.01885;AN=1220;BL=691;BR=3464;BVAR;BaseQRankSum=-2.418;DEL;DP=11998;Dels=0.00;EL=18;EPP=12.59;ER=33;FS=2.307;HETAR=348;HOMA=534;HOMR=164;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0763;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.66739;LRBP=4021.7;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0006;MQM=53.647;MQRankSum=1.083;NS=1047;RA=1663;RL=2;RPP=97.065;RR=49;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.726;SAB=0.68627;SAF=35;SAP=18.381;SAR=16;SRB=0.59651;SRF=992;SRP=137.56;SRR=671;VQSLOD=4.1346;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.29
-20 36285033 rs34715186 AT A 39417 PASS AA=530;AB=0.5406;ABA=447;ABP=16.939;ABR=526;AC=88;AF=0.0950;AN=926;BL=20722;BR=20406;BVAR;BaseQRankSum=15.611;DB;DEL;DP=36713;DP4=2551,2475,236,218;Dels=0.09;EL=241;EPP=12.45;ER=289;FQ=999;FR;FS=1.290;HETAR=141;HOMA=16;HOMR=926;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=1;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0742;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.0076833;LRBP=8.2825;MQ=104.81;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=84.285;MQRankSum=-0.702;NF;NR;NS=1083;PP;PV4=0.62,1,1,1;RA=6562;RL=263;RPP=3.0759;RR=267;RUN=1;ReadPosRankSum=0.090;SAB=0.55849;SAF=296;SAP=18.76;SAR=234;SC=AAAAACACAAATCAGATCGTG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.51707;SRF=3393;SRP=19.614;SRR=3169;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=10.5533;dbSNP=126;set=Intersection;sumGLbyD=14.15
-20 36384872 . CTG C 43532.41 PASS AC=1213;AF=0.99589;AN=1218;BaseQRankSum=0.802;DP=3208;FS=9.727;HRun=0;HaplotypeScore=46.6153;InbreedingCoeff=0.1085;IndelType=DEL.NumRepetitions_7.EventLength_2.RepeatExpansion_TG.;MQ=58.37;MQ0=50;MQ0Fraction=0.0156;MQRankSum=-1.672;QD=13.57;ReadPosRankSum=2.063;SB=-18894.12;VQSLOD=4.7353;set=VQSR
-20 36542802 . GTA G 31310.15 PASS AA=1481;AB=0.67546;ABA=1378;ABP=1138.4;ABR=2868;AC=437;AF=0.35938;AN=1216;BL=25719;BR=95500;BVAR;BaseQRankSum=9.478;DEL;DP=18068;DS;Dels=0.10;EL=889;EPP=132.34;ER=592;FS=320.726;HETAR=591;HOMA=44;HOMR=378;HRun=0;InbreedingCoeff=-0.4197;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TA.;LEN=2;LRB=0.57566;LRBP=87231;MQ0Fraction=0.0091;MQM=29.319;MQRankSum=-3.409;NS=1013;RA=4037;RL=3;RPP=3193;RR=1478;RUN=1;ReadPosRankSum=-6.687;SAB=0.40041;SAF=593;SAP=130.61;SAR=888;SRB=0.39014;SRF=1575;SRP=426.21;SRR=2462;VQSLOD=-1.6586;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.49
-20 36985025 . CCA C 4.57 PASS AC=0;AF=0.0000;AN=682;BaseQRankSum=4.199;DP=1504;FS=1.036;HRun=0;HaplotypeScore=18.5241;InbreedingCoeff=0.0460;IndelType=DEL.NumRepetitions_6.EventLength_2.RepeatExpansion_CA.;MQ=57.04;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.774;ReadPosRankSum=-2.105;VQSLOD=6.7455;set=VQSR
-20 37139725 . CAG C 250.77 PASS AF=0.0084;AF1=0.0139;BaseQRankSum=4.131;CI95=0.00885,0.01991;DP=7973;DP4=1808,1990,2,7;Dels=0.01;FQ=104;FR;FS=11.160;HP=3;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0001;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;MQ=103.71;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-3.378;NF;NR;PP;PV4=0.18,0.0011,0.041,1;ReadPosRankSum=0.605;SC=AGATGGGGAACAGAGAGCAAG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=6;TU=AG;VQSLOD=7.0630;set=Intersection;sumGLbyD=12.13
-20 37213224 . G GTA 3230.05 PASS AA=32;AB=0.50769;ABA=32;ABP=3.0437;ABR=33;AC=12;AF=0.0168;AF1=0.02635;AN=714;BL=1271;BR=1743;BVAR;BaseQRankSum=-7.288;CI95=0.02212,0.03319;DP=14304;DP4=2180,2256,13,21;Dels=0.00;EL=20;EPP=7.3532;ER=12;FQ=999;FR;FS=7.863;HETAR=9;HOMA=0;HOMR=1043;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0410;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TA.;LEN=2;LRB=0.1566;LRBP=163.52;MQ=95.56;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0005;MQM=51.562;MQRankSum=0.420;NF;NR;NS=1052;PP;PV4=0.23,1,0.03,0.33;RA=5138;RL=11;RPP=9.7962;RR=21;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.122;SAB=0.28125;SAF=9;SAP=16.311;SAR=23;SC=TTTGCATCCAGTAGCACCACT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.42293;SRF=2173;SRP=268.11;SRR=2965;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=9.7315;set=Intersection;sumGLbyD=36.69
-20 37282014 . ATGG A 2518.52 PASS AF=0.03519;BaseQRankSum=11.994;DP=24592;DP4=415,3804,8,49;DS;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=2.049;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1028;IndelType=DEL.NumRepetitions_5.EventLength_3.;MQ=51.01;MQ0Fraction=0.0139;MQRankSum=-5.912;NF;NR;PP;PV4=0.27,1,0.22,0.015;ReadPosRankSum=1.781;SC=GGTGGTGATGATGGTGGTGGT;TC;TR=17;TU=GGT;VQSLOD=2.1183;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=9.05
-20 37532218 . GTCCGTCCA ATCCGTCCA,G 76120.88 PASS AC=998;AF=0.92924;AN=1074;BaseQRankSum=-2.877;DP=3087;FR;FS=9.889;HP=2;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=T;HaplotypeScore=71.6244;InbreedingCoeff=-0.0027;IndelType=MIXED;MQ=52.68;MQ0=543;MQ0Fraction=0.1759;MQRankSum=-1.750;NF;NR;PP;QD=24.98;ReadPosRankSum=-0.850;SB=-36635.43;SC=CCGTCCGTCCGTCCGTCCATC;TC;TR=19;TU=CCGT;VQSLOD=5.3068;set=Intersection
-20 37712193 . AAG A 2670.33 PASS AA=106;AB=0.62821;ABA=87;ABP=36.418;ABR=147;AC=53;AF=0.0759;AN=698;BL=4672;BR=4303;BVAR;BaseQRankSum=13.696;DEL;DP=15155;DP4=1340,1852,32,52;Dels=0.06;EL=57;EPP=4.3214;ER=49;FR;FS=0.824;HETAR=43;HOMA=7;HOMR=982;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0861;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;LEN=2;LRB=0.041114;LRBP=35.954;MQ=86.12;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=54.236;MQRankSum=-5.745;NF;NR;NS=1034;PP;PV4=0.5,7.3e-26,1.1e-10,1;RA=4423;RL=58;RPP=5.0589;RR=48;RUN=1;ReadPosRankSum=2.617;SAB=0.38679;SAF=41;SAP=14.81;SAR=65;SC=GAAAATTCTGAAGAGAGTCAG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.43093;SRF=1906;SRP=186.29;SRR=2517;TC;TR=6;TU=AG;VQSLOD=9.8131;set=Intersection;sumGLbyD=14.20
-20 37739002 . T TCA 1395.38 PASS AA=16;AB=0.48387;ABA=16;ABP=3.0803;ABR=15;AC=11;AF=0.00950;AN=1158;BL=504;BR=630;BVAR;BaseQRankSum=-3.257;DP=13617;DP4=1660,883,7,5;Dels=0.00;EL=7;EPP=3.5532;ER=9;FR;FS=1.114;HETAR=9;HOMA=0;HOMR=991;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0527;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_CA.;LEN=2;LRB=0.11111;LRBP=33.411;MQ=88.41;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=83.75;MQRankSum=1.713;NF;NR;NS=1000;PP;PV4=0.76,1,1,0.5;RA=3257;RL=6;RPP=5.1818;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=1.190;SAB=0.6875;SAF=11;SAP=7.8961;SAR=5;SC=CCTTTTTTGTTCATTTCTGCA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.68806;SRF=2241;SRP=1003.5;SRR=1016;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=10.2220;set=Intersection;sumGLbyD=41.32
-20 38395256 . TTGAG T 633.19 PASS AF=0.0028;BaseQRankSum=5.667;DP=3839;Dels=0.00;FR;FS=10.238;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=-0.0097;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.276;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-1.016;SC=ATGTGTTTGTTTGAGTATGTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=10;TU=GTTT;VQSLOD=6.4906;set=Intersection;sumGLbyD=10.83
-20 39345038 . CTGAACCATAATGTG C,CCCATAATGTG 60744.52 PASS AA=23;AB=0.67143;ABA=23;ABP=20.878;ABR=47;AC=232,2;AF=0.19366,0.00167;AN=1198;BL=1607;BR=1843;BVAR;BaseQRankSum=30.955;DEL;DP=31490;DP4=1729,2100,265,278;Dels=0.13;EL=6;EPP=14.434;ER=17;FQ=999;FR;FS=1.767;HETAR=18;HOMA=0;HOMR=1015;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.1991;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=14;LRB=0.068406;LRBP=38.066;MQ=104.60;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=189.83;MQRankSum=-16.579;NF;NR;NS=1033;PP;PV4=0.12,1,5.5e-137,1;RA=5286;RL=14;RPP=5.3706;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=4.323;SAB=0.56522;SAF=13;SAP=3.86;SAR=10;SC=TGGGCTGGACCTGAACCATAA;SET_WGVQSR;SRB=0.46311;SRF=2448;SRP=65.493;SRR=2838;TC;TR=2;TU=C;VQSLOD=6.2643;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=65.43
-20 39418008 . AG A 46796 PASS AA=113;AB=0.9511;ABA=80;ABP=2894.6;ABR=1556;AC=30;AF=0.02412;AN=1244;BL=638;BR=6936;BVAR;BaseQRankSum=7.280;DEL;DP=14307;Dels=0.00;EL=50;EPP=6.2579;ER=63;FR;FS=5.707;HETAR=473;HOMA=361;HOMR=246;HP=3;HR=3;HRun=3;HU=G;InbreedingCoeff=0.0272;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.83153;LRBP=11375;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=62.398;MQRankSum=3.530;NF;NR;NS=1089;PP;RA=3000;RL=3;RPP=223.02;RR=110;RUN=1;ReadPosRankSum=-18.601;SAB=0.58407;SAF=66;SAP=9.9475;SAR=47;SC=ACTGGGGGAAAGGGATTCTAG;SRB=0.494;SRF=1482;SRP=3.9484;SRR=1518;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=4.5834;set=Intersection;sumGLbyD=3.06
-20 39876961 . GT G,GTT,GTTT 2302.10 PASS ABR=496;AC=45,51,45;AF=0.03664,0.04153,0.03664;AN=1228;BVAR;BaseQRankSum=4.462;DP=37649;DP4=1457,1975,57,59;Dels=0.02;FR;FS=9.938;HOMA=0;HOMR=978;HP=10;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2583;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=97.28;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.246;NF;NR;NS=1063;PP;PV4=0.15,1,1.9e-09,0.016;RA=5185;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.954;SC=AGTTTCTCCGGTTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;SRB=0.47464;SRF=2461;SRP=31.978;SRR=2724;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=4.9752;set=Intersection;sumGLbyD=4.39
-20 41013333 . TC T 20681 PASS AA=137;AB=0.89211;ABA=134;ABP=1661.6;ABR=1108;AC=68;AF=0.05601;AN=1214;BL=1091;BR=8981;BVAR;BaseQRankSum=1.354;DEL;DP=12998;Dels=0.01;EL=57;EPP=11.395;ER=80;FS=0.758;HETAR=359;HOMA=100;HOMR=610;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0104;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.78336;LRBP=13424;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=67.745;MQRankSum=2.563;NS=1072;RA=4447;RL=5;RPP=258.66;RR=132;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.092;SAB=0.59124;SAF=81;SAP=12.917;SAR=56;SRB=0.54194;SRF=2410;SRP=70.947;SRR=2037;VQSLOD=3.7531;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.14
-20 41659532 . GC G 40544 PASS AA=42;AB=0.97149;ABA=39;ABP=2644.5;ABR=1329;AC=15;AF=0.0209;AN=716;BL=2531;BR=135;BVAR;BaseQRankSum=-2.537;DEL;DP=12219;Dels=0.00;EL=25;EPP=6.3192;ER=17;FS=2.656;HETAR=374;HOMA=155;HOMR=551;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0270;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.89872;LRBP=4678.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=103.31;MQRankSum=2.828;NS=1088;RA=4736;RL=41;RPP=85.733;RR=1;RUN=1;ReadPosRankSum=-9.702;SAB=0.57143;SAF=24;SAP=4.8716;SAR=18;SRB=0.5625;SRF=2664;SRP=163.7;SRR=2072;VQSLOD=4.3267;set=Intersection;sumGLbyD=3.22
-20 41845580 . GA G 49310 PASS AA=83;AB=0.95258;ABA=69;ABP=2591.6;ABR=1386;AC=46;AF=0.03740;AN=1230;BL=1320;BR=5150;BVAR;BaseQRankSum=-1.121;DEL;DP=13336;Dels=0.00;EL=36;EPP=6.1759;ER=47;FR;FS=0.372;HETAR=442;HOMA=341;HOMR=295;HP=2;HR=3;HRun=1;HU=G;InbreedingCoeff=0.0238;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.59196;LRBP=4926.2;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=89.048;MQRankSum=0.897;NF;NR;NS=1080;PP;RA=3006;RL=5;RPP=142.43;RR=78;RUN=1;ReadPosRankSum=-15.412;SAB=0.55422;SAF=46;SAP=5.1294;SAR=37;SC=CCAGCTGTGGGAGAGAAACAT;SRB=0.47971;SRF=1442;SRP=13.762;SRR=1564;TC;TR=6;TU=AG;VQSLOD=4.4669;set=Intersection;sumGLbyD=3.65
-20 42209428 . GC G 13163 PASS AA=89;AB=0.86677;ABA=83;ABP=730.96;ABR=540;AC=39;AF=0.03218;AN=1212;BL=950;BR=5334;BVAR;BaseQRankSum=-10.119;DEL;DP=10692;Dels=0.01;EL=48;EPP=4.2058;ER=41;FS=0.000;HETAR=259;HOMA=727;HOMR=54;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0448;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.69764;LRBP=6644.4;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=126.55;MQRankSum=4.223;NS=1040;RA=723;RL=12;RPP=106.09;RR=77;RUN=1;ReadPosRankSum=-17.362;SAB=0.39326;SAF=35;SAP=11.818;SAR=54;SRB=0.37898;SRF=274;SRP=94.99;SRR=449;VQSLOD=3.7157;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.48
-20 42281109 . T TAG 2321.12 PASS AC=181;AF=0.3740;AN=484;BaseQRankSum=8.977;DP=435;FS=17.001;HRun=0;HaplotypeScore=14.6734;InbreedingCoeff=0.2340;IndelType=INS.NOVEL_2.;MQ=53.88;MQ0=47;MQ0Fraction=0.1080;MQRankSum=0.762;QD=12.41;ReadPosRankSum=3.399;SB=-1299.73;SET_INTEGRATION;VQSLOD=4.8926;set=VQSR
-20 42436117 . TC T 38933 PASS AA=18;AB=0.98435;ABA=17;ABP=2215.9;ABR=1069;AC=15;AF=0.01223;AN=1226;BL=498;BR=428;BVAR;BaseQRankSum=-7.224;DEL;DP=12436;Dels=0.00;EL=1;EPP=33.893;ER=17;FS=2.469;HETAR=303;HOMA=614;HOMR=123;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0439;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.075594;LRBP=14.501;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=98.611;MQRankSum=1.086;NS=1075;RA=1656;RL=10;RPP=3.4928;RR=8;RUN=1;ReadPosRankSum=-17.765;SAB=0.5;SAF=9;SAP=3.0103;SAR=9;SRB=0.49879;SRF=826;SRP=3.0313;SRR=830;VQSLOD=4.0821;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.04
-20 42682214 . C A,CAT 3904.51 PASS AA=24;AB=0.6383;ABA=17;ABP=10.818;ABR=30;AC=0;AF=0.0000;AN=636;BL=1119;BR=949;BVAR;BaseQRankSum=1.426;DP=6509;Dels=0.00;EL=9;EPP=6.2675;ER=15;FR;HETAR=12;HOMA=3;HOMR=876;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0006;IndelType=MIXED;LEN=2;LRB=0.082205;LRBP=33.356;MQ0Fraction=0.0046;MQM=40.792;MQRankSum=-0.296;NF;NR;NS=891;PP;QD=32.81;RA=2679;RL=15;RPP=6.2675;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.806;SAB=0.75;SAF=18;SAP=16.039;SAR=6;SB=-924.23;SC=TATACACACACATATATATAC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.66293;SRF=1776;SRP=620.76;SRR=903;TC;TR=9;TU=AC;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=32.75
-20 42973456 . CA C,CAA,CAAA 2675 PASS AA=90;AB=0.79177;ABA=86;ABP=308.39;ABR=327;AC=77,61,39;AF=0.06492,0.05143,0.03288;AN=1186;BL=2983;BR=4446;BVAR;BaseQRankSum=2.422;DP=9416;Dels=0.03;EL=39;EPP=6.4847;ER=51;FR;FS=31.555;HETAR=75;HOMA=1;HOMR=888;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.2696;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.19693;LRBP=628.63;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=55.567;MQRankSum=1.777;NF;NR;NS=964;PP;RA=3601;RL=37;RPP=9.1869;RR=53;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.991;SAB=0.55556;SAF=50;SAP=5.423;SAR=40;SC=TAGTGACTGTCAAAAAAAAAA;SET_WGVQSR;SRB=0.60622;SRF=2183;SRP=355.91;SRR=1418;TC;TR=11;TU=A;VQSLOD=1.0763;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.05
-20 43091870 . TC T 2455.60 PASS AA=120;AB=0.10619;ABA=101;ABP=155.22;ABR=12;AC=42;AF=0.03825;AN=1098;BL=573;BR=8744;BVAR;BaseQRankSum=-13.513;DEL;DP=9139;Dels=0.00;EL=64;EPP=4.1684;ER=56;FS=9.856;HETAR=118;HOMA=820;HOMR=0;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0833;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.877;LRBP=15564;MQ0Fraction=0.0017;MQM=45.1;MQRankSum=2.266;NS=938;RA=24;RL=1;RPP=254.97;RR=119;RUN=1;ReadPosRankSum=-15.803;SAB=0.475;SAF=57;SAP=3.6617;SAR=63;SRB=0.54167;SRF=13;SRP=3.3722;SRR=11;VQSLOD=3.9930;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.09
-20 43233648 rs74585029 GA G,GAA 1504.40 PASS AA=113;AB=0.78652;ABA=95;ABP=320.31;ABR=350;AC=41,65;AF=0.03394,0.05381;AF1=0.0115;AN=1208;BL=4677;BR=5548;BVAR;BaseQRankSum=6.744;CI95=0.004274,0.01852;DB;DEL;DP=13996;DP4=1736,1549,15,17;Dels=0.03;EL=69;EPP=15.021;ER=44;FQ=14;FR;FS=12.174;HETAR=119;HOMA=15;HOMR=892;HP=11;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.2359;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.085183;LRBP=164.12;MQ=89.12;MQ0Fraction=0.0000;MQM=69.867;MQRankSum=2.513;NF;NR;NS=1027;PP;PV4=0.59,1,0.065,0.33;RA=3845;RL=46;RPP=11.485;RR=67;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.957;SAB=0.33628;SAF=38;SAP=29.318;SAR=75;SC=AAAACAGCCAGAAAAAAAAAA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.43667;SRF=1679;SRP=136.95;SRR=2166;TC;TR=10;TU=A;VQSLOD=4.5121;set=Intersection;sumGLbyD=8.22
-20 43246548 . AC A,CC 41579.13 PASS AA=382;AB=0.72402;ABA=316;ABP=502.11;ABR=829;AC=1197;AF=0.99254;AN=1206;BL=9889;BR=14293;BVAR;BaseQRankSum=1.373;DEL;DP=10477;DS;Dels=0.05;EL=243;EPP=64.494;ER=139;FS=29.162;HETAR=291;HOMA=85;HOMR=624;HPLen=10;InbreedingCoeff=0.1392;IndelType=MIXED;LEN=1;LRB=0.18212;LRBP=1744.6;MQ0Fraction=0.0024;MQM=48.471;MQRankSum=5.726;NS=1001;RA=3138;RL=174;RPP=9.5816;RR=208;RUN=1;ReadPosRankSum=5.755;SAB=0.79843;SAF=305;SAP=298.51;SAR=77;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.70363;SRF=2208;SRP=1133.2;SRR=930;VQSLOD=5.6318;set=Intersection;sumGLbyD=5.22
-20 43258646 . T TT 1107.17 PASS AC=97;AF=0.08420;AN=1152;BaseQRankSum=4.525;DP=2345;FS=19.308;HRun=9;HaplotypeScore=13.6276;InbreedingCoeff=0.1299;IndelType=INS.NumRepetitions_10orMore.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=76.70;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.395;QD=2.67;ReadPosRankSum=-4.696;SB=-899.41;VQSLOD=5.4523;set=VQSR
-20 43718299 . ATTACT A 5497.06 PASS AA=56;AB=0.51818;ABA=53;ABP=3.3262;ABR=57;AC=18;AF=0.0251;AF1=0.03729;AN=718;BL=2321;BR=2591;BVAR;BaseQRankSum=11.142;CI95=0.03319,0.04425;DEL;DP=17576;DP4=2460,2692,31,22;Dels=0.02;EL=28;EPP=3.0103;ER=28;FQ=999;FR;FS=9.689;HETAR=15;HOMA=1;HOMR=1068;HP=2;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0448;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_5.;LEN=5;LRB=0.054967;LRBP=35.238;MQ=96.55;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=50.286;MQRankSum=-5.149;NF;NR;NS=1084;PP;PV4=0.13,1,1.2e-12,1;RA=6745;RL=28;RPP=3.0103;RR=28;RUN=1;ReadPosRankSum=0.828;SAB=0.5;SAF=28;SAP=3.0103;SAR=28;SC=ATGACAGTGGATTACTTTAGT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.46835;SRF=3159;SRP=61.709;SRR=3586;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=7.8832;set=Intersection;sumGLbyD=46.60
-20 43981749 . A AAAAAAC,AC 20899.71 PASS ABR=192;AC=91,0;AF=0.1285,0.0000;AN=708;BVAR;BaseQRankSum=7.858;DP=23372;DP4=1554,1457,55,42;Dels=0.00;FR;FS=0.000;HOMA=4;HOMR=995;HP=6;HPLen=7;HR=7;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2109;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=95.59;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-12.081;NF;NR;NS=1051;PP;PV4=0.35,1,8.9e-73,1;RA=5027;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.359;SC=TACACTAGCAAAAAAACAAAA;SET_WGVQSR;SRB=0.48518;SRF=2439;SRP=12.6;SRR=2588;TC;TR=7;TU=A;VQSLOD=8.0916;set=Intersection;sumGLbyD=54.33
-20 43999274 . TCAAA T 2948.85 PASS AA=59;AB=0.59441;ABA=58;ABP=14.08;ABR=85;AC=20;AF=0.0290;AF1=0.04249;AN=690;BL=2277;BR=2436;BVAR;BaseQRankSum=9.320;CI95=0.0354,0.05088;DEL;DP=14599;DP4=2052,2303,21,22;Dels=0.03;EL=32;EPP=3.9304;ER=27;FQ=999;FR;FS=0.000;HETAR=21;HOMA=0;HOMR=1043;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0037;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.033736;LRBP=14.658;MQ=90.05;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.339;MQRankSum=-1.294;NF;NR;NS=1064;PP;PV4=0.88,1,0.0026,1;RA=5732;RL=27;RPP=3.9304;RR=32;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.915;SAB=0.47458;SAF=28;SAP=3.3415;SAR=31;SC=GGTACACAGCTCAAACAGTCT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.4836;SRF=2772;SRP=16.4;SRR=2960;TC;TR=1;TU=C;VQSLOD=9.8086;set=Intersection;sumGLbyD=27.09
-20 44098622 . C CG 1092.40 PASS AA=129;AB=0.77301;ABA=74;ABP=214.06;ABR=252;AC=45;AF=0.0455;AN=988;BL=6586;BR=3029;BVAR;BaseQRankSum=2.802;DP=5177;Dels=0.00;EL=122;EPP=225.63;ER=7;FR;FS=355.273;HETAR=66;HOMA=11;HOMR=734;HP=6;HR=4;HRun=4;HU=G;INS;InbreedingCoeff=0.1759;IndelType=INS.NumRepetitions_4.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.36994;LRBP=2860.4;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=52.395;MQRankSum=1.946;NF;NR;NS=811;PP;RA=1981;RL=121;RPP=217.95;RR=8;RUN=1;ReadPosRankSum=-6.413;SAB=0.99225;SAF=128;SAP=274.51;SAR=1;SC=GCGGAAGTGGCGGGGACCCTT;SRB=0.41242;SRF=817;SRP=135;SRR=1164;TC;TR=4;TU=G;VQSLOD=-2.2690;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.04
-20 44327637 . A AG,AGGGGGG 14351.23 PASS AC=9,211;AF=0.0103,0.2409;AN=876;BaseQRankSum=15.517;DP=1704;FS=6.768;HaplotypeScore=31.5906;InbreedingCoeff=0.1538;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=54.64;MQ0=4;MQ0Fraction=0.0023;MQRankSum=-12.691;QD=20.83;ReadPosRankSum=-3.583;SB=-6278.99;VQSLOD=5.1556;set=VQSR
-20 45202636 . GA G 13269 PASS AA=25;AB=0.96162;ABA=18;ABP=871.09;ABR=451;AC=24;AF=0.02013;AN=1192;BL=567;BR=1728;BVAR;BaseQRankSum=-5.361;DEL;DP=10873;Dels=0.00;EL=10;EPP=5.1818;ER=15;FS=0.928;HETAR=169;HOMA=831;HOMR=45;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0999;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.50588;LRBP=1278.4;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=170.56;MQRankSum=0.161;NS=1049;RA=632;RL=2;RPP=41.315;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.760;SAB=0.68;SAF=17;SAP=10.046;SAR=8;SRB=0.51424;SRF=325;SRP=4.1235;SRR=307;VQSLOD=3.9290;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.90
-20 45417828 . TGAGC T,TGC 4672.90 PASS ABR=317;AC=69,104;AF=0.05712,0.08609;BVAR;BaseQRankSum=18.527;DEL;DP=11835;DS;FS=184.873;HOMA=48;HOMR=575;HaplotypeScore=65.5875;InbreedingCoeff=0.0599;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=29.78;MQ0=2988;MQ0Fraction=0.3629;MQRankSum=5.052;NS=713;QD=1.11;RA=1581;RUN=1;ReadPosRankSum=6.574;SB=-2116.87;SRB=0.47502;SRF=751;SRP=11.582;SRR=830;VQSLOD=0.0651;set=filterInVQSR-2of5
-20 45525657 rs66759083 TA AA,T 49315 PASS AA=2361;AB=0.45241;ABA=1398;ABP=53.235;ABR=1155;AC=20;AF=0.01701;AN=1176;BL=94913;BR=100886;BVAR;BaseQRankSum=0.740;DB;DEL;DP=30636;DP4=1258,881,1206,999;Dels=0.48;EL=1133;EPP=11.311;ER=1228;FQ=999;FR;FS=7.072;HETAR=503;HOMA=310;HOMR=218;HP=6;HPLen=7;HR=7;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.2271;IndelType=MIXED;LEN=1;LRB=0.030506;LRBP=398.68;MQ=102.24;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.359;MQRankSum=0.148;NF;NR;NS=1031;PP;PV4=0.0064,0,4.6e-23,0.47;RA=2042;RL=1183;RPP=3.0333;RR=1178;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.999;SAB=0.52139;SAF=1231;SAP=12.392;SAR=1130;SC=AGGATTTTTTTAAAAAGTTTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.55093;SRF=1125;SRP=49.017;SRR=917;TC;TR=7;TU=T;VQSLOD=7.1651;dbSNP=114;set=Intersection;sumGLbyD=18.51
-20 45783456 . T TG 2355.68 PASS AA=64;AB=0.78521;ABA=61;ABP=203.67;ABR=223;AC=15;AF=0.0165;AN=910;BL=815;BR=5486;BVAR;BaseQRankSum=8.593;DP=10348;Dels=0.00;EL=48;EPP=37.754;ER=16;FS=77.861;HETAR=56;HOMA=1;HOMR=970;HRun=1;INS;InbreedingCoeff=-0.0549;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_G.;LEN=1;LRB=0.74131;LRBP=7522.1;MQ0Fraction=0.0122;MQM=44.562;MQRankSum=-1.258;NS=1027;RA=4750;RL=0;RPP=141.98;RR=64;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.047;SAB=0.25;SAF=16;SAP=37.754;SAR=48;SRB=0.6;SRF=2850;SRP=415.59;SRR=1900;VQSLOD=1.3146;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.03
-20 46517110 . C CT 868.55 PASS AC=15;AF=0.0218;AN=688;BaseQRankSum=8.522;DP=1752;FS=6.570;HRun=0;HaplotypeScore=14.9548;InbreedingCoeff=0.0452;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_T.;MQ=77.73;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=3.874;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-396.78;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=6.7740;set=VQSR
-20 46629361 . TTTCTTTC T,TTTTC 13000.91 PASS AC=188,107;AF=0.2212,0.1259;AN=850;BaseQRankSum=7.214;DP=1846;FS=14.502;HaplotypeScore=40.8481;InbreedingCoeff=0.3210;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=50.74;MQ0=79;MQ0Fraction=0.0428;MQRankSum=-6.348;QD=13.59;ReadPosRankSum=3.943;SB=-3581.20;VQSLOD=5.9412;set=VQSR
-20 46951099 . G GT 1662.30 PASS AA=55;AB=0.7713;ABA=51;ABP=145.58;ABR=172;AC=47;AF=0.03923;AN=1198;BL=3288;BR=2434;BVAR;BaseQRankSum=-4.014;DP=27423;DP4=1483,1590,58,42;Dels=0.01;EL=21;EPP=9.6826;ER=34;FR;FS=9.565;HETAR=48;HOMA=0;HOMR=913;HP=16;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0952;IndelType=INS.NumRepetitions_10orMore.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.14925;LRBP=279.78;MQ=70.36;MQ0Fraction=0.0124;MQM=52.545;MQRankSum=0.717;NF;NR;NS=961;PP;PV4=0.067,1,1,0.17;RA=3035;RL=38;RPP=20.422;RR=17;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.014;SAB=0.47273;SAF=26;SAP=3.3656;SAR=29;SC=TTTGTTTTTTGTTTTTTTTTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.36013;SRF=1093;SRP=518.73;SRR=1942;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=5.4779;set=Intersection;sumGLbyD=3.49
-20 47201076 rs58052846 C CT 982.16 PASS AC=50;AF=0.0551;AN=908;BaseQRankSum=12.598;DB;DP=2449;FS=35.648;HRun=0;HaplotypeScore=29.4602;InbreedingCoeff=-0.0542;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_T.;MQ=63.54;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=2.196;QD=3.16;ReadPosRankSum=-13.833;SB=-488.19;VQSLOD=6.0429;set=VQSR
-20 47965974 rs60011158 G GA 999 PASS AA=21;AB=0.57143;ABA=21;ABP=5.1818;ABR=28;AC=7;AF=0.0101;AF1=0.02061;AN=690;BL=1043;BR=577;BVAR;BaseQRankSum=-3.087;CI95=0.01549,0.02655;DB;DP=14578;DP4=1554,3055,6,17;Dels=0.00;EL=11;EPP=3.1137;ER=10;FQ=999;FR;FS=5.982;HETAR=7;HOMA=0;HOMR=1041;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=1;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0356;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.28765;LRBP=294.09;MQ=80.17;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=64.19;MQRankSum=2.137;NF;NR;NS=1048;PP;PV4=0.51,1,1,1;RA=5224;RL=16;RPP=15.522;RR=5;RUN=1;ReadPosRankSum=0.236;SAB=0.38095;SAF=8;SAP=5.5954;SAR=13;SC=TTCATGTACAGAGCTGCTGTG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.31183;SRF=1629;SRP=1609.6;SRR=3595;TC;TR=4;TU=AG;VQSLOD=9.5466;dbSNP=129;set=Intersection;sumGLbyD=13.83
-20 48402974 rs57331436 GA G 27741 PASS AA=401;AB=0.5372;ABA=311;ABP=11.089;ABR=361;AC=84;AF=0.1186;AN=708;BL=16591;BR=14776;BVAR;BaseQRankSum=14.621;DB;DEL;DP=30607;DP4=1928,2310,195,225;Dels=0.11;EL=189;EPP=5.8749;ER=212;FQ=999;FR;FS=15.568;HETAR=110;HOMA=30;HOMR=923;HP=4;HPLen=3;HR=1;HRun=3;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1263;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;KGPilot123;LEN=1;LRB=0.057863;LRBP=231.06;MQ=106.68;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=63.005;MQRankSum=-2.010;NF;NR;NS=1063;PP;PV4=0.72,1,0.001,1;RA=5258;RL=223;RPP=13.976;RR=178;RUN=1;ReadPosRankSum=1.337;SAB=0.37656;SAF=151;SAP=56.084;SAR=250;SC=TGCCCTCAAAGAGAAAAAGGA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.38075;SRF=2002;SRP=652.44;SRR=3256;TC;TR=5;TU=AG;VQSLOD=8.7259;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=15.86
-20 49101936 . C CT 404.46 PASS AC=40;AF=0.03559;AN=1124;BaseQRankSum=0.750;DP=2162;FS=14.291;HRun=2;HaplotypeScore=30.9513;InbreedingCoeff=-0.0082;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=49.78;MQ0=113;MQ0Fraction=0.0523;MQRankSum=-1.289;QD=1.94;ReadPosRankSum=-2.041;SB=-385.48;VQSLOD=4.6365;set=VQSR
-20 49731218 . ATTTTATTTTTTATT A,ATTTTATT 8398.93 PASS AF=0.0656,0.0156;AF1=0.0996;BaseQRankSum=13.996;CI95=0.07743,0.1239;DP=6308;DP4=951,1311,23,35;Dels=0.05;FQ=999;FR;FS=12.503;HP=7;HPLen=4;HR=4;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1892;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=57.61;MQ0Fraction=0.0145;MQRankSum=-5.208;NF;NR;PP;PV4=0.79,1,6.3e-06,0.16;ReadPosRankSum=-2.239;SC=TATTTTATTTATTTTATTTTT;TC;TR=11;TU=ATTT;VQSLOD=4.3191;set=Intersection;sumGLbyD=42.27
-20 49894989 . TA T 172.25 PASS AF=0.0140;BaseQRankSum=7.220;DP=3882;Dels=0.00;FS=17.217;HPLen=2;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0531;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ0Fraction=0.0214;MQRankSum=-0.661;ReadPosRankSum=-0.592;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=3.0905;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.60
-20 50010923 rs66516522 C CT,CTGG 35851 PASS ABR=555;AC=310,11;AF=0.26451,0.00939;BVAR;BaseQRankSum=10.662;DB;DP=8188;FR;FS=34.411;HOMA=261;HOMR=399;HP=5;HR=6;HU=C;HaplotypeScore=45.1715;INS;InbreedingCoeff=0.2090;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=72.80;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=9.015;NF;NR;NS=831;PP;QD=9.69;RA=1986;RUN=1;ReadPosRankSum=-24.284;SB=-6038.55;SC=TGTCTGTCCCCCCTCAGCACT;SRB=0.45972;SRF=913;SRP=31.001;SRR=1073;TC;TR=6;TU=C;VQSLOD=6.1824;set=Intersection
-20 50228709 rs71192536 TG T 20517 PASS AA=924;AB=0.50203;ABA=735;ABP=3.0633;ABR=741;AC=200;AF=0.16502;AN=1212;BL=35460;BR=34197;BVAR;BaseQRankSum=13.810;DB;DEL;DP=32402;DP4=1760,2065,395,449;Dels=0.16;EL=439;EPP=7.9831;ER=485;FQ=999;FR;FS=0.558;HETAR=242;HOMA=63;HOMR=764;HP=5;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.1050;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.018132;LRBP=52.738;MQ=105.83;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.87;MQRankSum=3.895;NF;NR;NS=1069;PP;PV4=0.7,1.5e-173,1,1;RA=4708;RL=486;RPP=8.4249;RR=438;RUN=1;ReadPosRankSum=1.586;SAB=0.43615;SAF=403;SAP=35.733;SAR=521;SC=GTTTTCCAGGTGGGAAGACCG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.44074;SRF=2075;SRP=146.62;SRR=2633;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=10.4820;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=15.35
-20 50236115 . AGG A,ACGGG,AG,AGGG 7429.57 PASS AC=192,13,221,183;AF=0.2115,0.0143,0.2434,0.2015;AN=908;BaseQRankSum=1.045;DP=1177;FS=13.479;HaplotypeScore=11.8294;InbreedingCoeff=0.7959;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=52.98;MQ0=6;MQ0Fraction=0.0051;MQRankSum=-1.482;QD=7.28;ReadPosRankSum=-2.380;SB=-1229.31;SET_WGVQSR;VQSLOD=8.3762;set=VQSR
-20 51589568 . TAAAC AAAAC,T 12477.52 PASS AF=0.27949;BaseQRankSum=-28.122;DP=3777;Dels=0.00;FR;FS=31.799;HP=7;HPLen=4;HR=3;HRun=0;HU=A;InbreedingCoeff=-0.1429;IndelType=MIXED;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.196;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-16.483;SC=AAATTCAAAATAAACAAACAA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=18;TU=AAAC;VQSLOD=3.9201;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=52.43
-20 51617742 . TGC T,TGCGC 1374.91 PASS AF=0.06000,0.02000;BaseQRankSum=12.051;DP=6231;Dels=0.00;FS=189.609;HPLen=1;HRun=0;InbreedingCoeff=0.0862;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0Fraction=0.0180;MQRankSum=-2.959;ReadPosRankSum=-5.090;VQSLOD=-2.8715;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.97
-20 51770354 . AG A 1010.90 PASS AA=26;AB=0.52727;ABA=26;ABP=3.3656;ABR=29;AC=7;AF=0.0097;AF1=0.01637;AN=718;BL=1034;BR=964;BVAR;BaseQRankSum=5.588;CI95=0.01327,0.02212;DEL;DP=16259;DP4=2785,2239,15,10;Dels=0.01;EL=11;EPP=4.3466;ER=15;FQ=999;FR;FS=3.367;HETAR=8;HOMA=0;HOMR=1064;HP=2;HPLen=2;HR=2;HRun=2;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.0557;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.035035;LRBP=8.3357;MQ=90.48;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=61.346;MQRankSum=-0.019;NF;NR;NS=1072;PP;PV4=0.69,2.1e-08,0.078,1;RA=6173;RL=13;RPP=3.0103;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.460;SAB=0.61538;SAF=16;SAP=6.017;SAR=10;SC=GTGGTCCTGCAGGTCAATAAT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.56342;SRF=3478;SRP=218.68;SRR=2695;TC;TR=2;TU=G;VQSLOD=10.1601;set=Intersection;sumGLbyD=14.60
-20 51848430 . AT A,ATT 999 PASS AA=39;AB=0.83408;ABA=37;ABP=219.19;ABR=186;AC=14,33;AF=0.0153,0.0359;AF1=0.03062;AN=918;BL=1676;BR=1732;BVAR;BaseQRankSum=3.338;CI95=0.02212,0.03982;DP=14886;DP4=1970,1762,22,31;Dels=0.01;EL=18;EPP=3.5114;ER=21;FQ=999;FR;FS=3.004;HETAR=31;HOMA=0;HOMR=1040;HP=10;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1629;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.016432;LRBP=5.0085;MQ=80.05;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.667;MQRankSum=0.325;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=0.13,1,0.0095,0.064;RA=5318;RL=21;RPP=3.5114;RR=18;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.493;SAB=0.46154;SAF=18;SAP=3.5114;SAR=21;SC=ACAAAACAATATTTTTTTTTC;SET_WGVQSR;SRB=0.4968;SRF=2642;SRP=3.4823;SRR=2676;TC;TR=9;TU=T;VQSLOD=5.7417;set=Intersection;sumGLbyD=7.57
-20 51897203 . T TG 8427.20 PASS AA=237;AB=0.69846;ABA=215;ABP=246.92;ABR=498;AC=117;AF=0.1662;AN=704;BL=14961;BR=5990;BVAR;BaseQRankSum=22.203;DP=9710;Dels=0.00;EL=83;EPP=49.198;ER=154;FR;FS=9.450;HETAR=123;HOMA=9;HOMR=895;HP=5;HPLen=6;HR=6;HRun=0;HU=T;INS;InbreedingCoeff=-0.0513;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_G.;LEN=1;LRB=0.42819;LRBP=8344.3;MQ0Fraction=0.0291;MQM=45.861;MQRankSum=-10.426;NF;NR;NS=1027;PP;RA=4919;RL=210;RPP=309.85;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.843;SAB=0.29536;SAF=70;SAP=89.219;SAR=167;SC=TTTGTTTGTTTTTTGTTGTTG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.47794;SRF=2351;SRP=23.798;SRR=2568;TC;TR=23;TU=GTTT;VQSLOD=6.2670;set=Intersection;sumGLbyD=8.99
-20 52274070 . AAG A 1400.37 PASS AA=30;AB=0.74227;ABA=25;ABP=52.462;ABR=72;AC=21;AF=0.01756;AN=1196;BL=412;BR=1966;BVAR;BaseQRankSum=6.660;DEL;DP=9362;Dels=0.01;EL=16;EPP=3.2998;ER=14;FS=1.485;HETAR=18;HOMA=2;HOMR=1004;HRun=0;InbreedingCoeff=0.0317;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;LEN=2;LRB=0.65349;LRBP=2208.2;MQ0Fraction=0.0022;MQM=46.133;MQRankSum=-4.743;NS=1024;RA=3931;RL=2;RPP=51.941;RR=28;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.152;SAB=0.4;SAF=12;SAP=5.6161;SAR=18;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.49784;SRF=1957;SRP=3.1699;SRR=1974;VQSLOD=5.6452;set=Intersection;sumGLbyD=11.11
-20 52351501 . TAC T 199.59 PASS AC=22;AF=0.0238;AN=926;BaseQRankSum=7.874;DP=22911;DP4=2146,1691,26,22;FR;FS=2.898;HP=4;HPLen=3;HR=1;HRun=0;HU=A;HaplotypeScore=18.6111;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0326;IndelType=DEL.NumRepetitions_6.EventLength_2.RepeatExpansion_AC.;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0007;MQRankSum=1.011;NF;NR;PP;PV4=0.88,0.14,0.16,0.24;QD=1.10;ReadPosRankSum=-1.053;SB=-306.09;SC=GACACACAAATACACACACAC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=13;TU=AC;VQSLOD=4.0486;set=filterInVQSR-2of5
-20 52447173 . CA C 503.89 PASS AC=23;AF=0.01891;AN=1216;BaseQRankSum=0.801;DP=3266;FS=2.606;HRun=2;HaplotypeScore=22.1543;InbreedingCoeff=-0.0097;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=118.02;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.309;QD=2.65;ReadPosRankSum=-7.872;SB=-279.27;VQSLOD=4.1900;set=VQSR
-20 52498650 . GT G 24069 PASS AA=74;AB=0.90594;ABA=57;ABP=870.4;ABR=549;AC=28;AF=0.02333;AN=1200;BL=505;BR=4514;BVAR;BaseQRankSum=-3.837;DEL;DP=9798;Dels=0.01;EL=41;EPP=4.8883;ER=33;FS=4.085;HETAR=209;HOMA=663;HOMR=121;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0334;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.79876;LRBP=6956.6;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0007;MQM=57.784;MQRankSum=-2.951;NS=995;RA=957;RL=8;RPP=101.72;RR=66;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.806;SAB=0.39189;SAF=29;SAP=10.522;SAR=45;SRB=0.39916;SRF=382;SRP=87.53;SRR=575;VQSLOD=3.8710;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.90
-20 52823602 rs11469056 CAAA C,CA,CAA,CAAAA,CAAAAA,CAAAAAA,CAAAAAAA,CAAAAAAAA,CAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAA 14515.17 PASS AC=24,83,246,109,83,19,10,16,22,59;AF=0.02128,0.07358,0.21809,0.09663,0.07358,0.01684,0.00887,0.01418,0.01950,0.05230;AN=1128;BVAR;BaseQRankSum=4.150;DB;DEL;DP=28279;FR;FS=2.021;HP=17;HR=17;HU=A;HaplotypeScore=27.8032;INS;InbreedingCoeff=0.7740;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=69.00;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.418;NF;NR;PP;QD=7.90;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.864;SB=-3244.40;SC=GGTCCTAAGGCAAAAAAAAAA;SET_WGVQSR;TC;TR=17;TU=A;VQSLOD=14.1033;set=Intersection
-20 53308906 . CT C,CTT 2276 PASS AA=92;AB=0.84453;ABA=81;ABP=540.17;ABR=440;AC=53,81;AF=0.04351,0.06650;AN=1218;BL=3561;BR=4796;BVAR;BaseQRankSum=3.000;DP=11804;Dels=0.02;EL=48;EPP=3.3879;ER=44;FR;FS=13.197;HETAR=69;HOMA=3;HOMR=993;HP=11;HR=10;HRun=10;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2297;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.14778;LRBP=399.32;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=56.348;MQRankSum=3.154;NF;NR;NS=1065;PP;RA=5520;RL=39;RPP=7.6365;RR=53;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.140;SAB=0.57609;SAF=53;SAP=7.6365;SAR=39;SC=AATCCAAAGTCTTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;SRB=0.51576;SRF=2847;SRP=14.92;SRR=2673;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=2.4753;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.42
-20 53334602 . T TG,TGG 905.13 PASS ABR=325;AC=44,22;AF=0.03624,0.01812;BVAR;BaseQRankSum=-4.608;DP=15015;FR;FS=494.901;HOMA=0;HOMR=1004;HP=1;HR=1;HU=G;HaplotypeScore=20.5023;INS;InbreedingCoeff=0.0799;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=116.70;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=8.022;NF;NR;NS=1064;PP;QD=0.35;RA=5690;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.522;SB=-311.57;SC=AGCCATTGGCTGTTTCACTGA;SRB=0.40738;SRF=2318;SRP=426.97;SRR=3372;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=-2.3042;set=filterInVQSR-2of5
-20 53729115 . T TG 15.48 PASS AC=1;AF=0.0015;AN=668;BaseQRankSum=-1.001;DP=1711;FS=9.048;HRun=2;HaplotypeScore=12.4681;InbreedingCoeff=-0.0320;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;MQ=131.36;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.193;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.407;SB=-5.35;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=4.8071;set=VQSR
-20 54033830 . GTATTTTAAAATCA G 2220.86 PASS AF=0.0113;BaseQRankSum=5.506;DP=2577;Dels=0.01;FR;FS=6.533;HP=5;HPLen=4;HR=1;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=0.0032;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_10orMore.;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.969;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=1.322;SC=TCAATATTTTGTATTTTAAAA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=5.5145;set=Intersection;sumGLbyD=95.65
-20 54375236 . GT G 626.13 PASS AA=40;AB=0.63551;ABA=39;ABP=20.078;ABR=68;AC=18;AF=0.0256;AN=702;BL=1331;BR=1743;BVAR;BaseQRankSum=9.346;DEL;DP=8568;Dels=0.02;EL=26;EPP=10.828;ER=14;FS=0.610;HETAR=21;HOMA=1;HOMR=1035;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0056;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.13403;LRBP=122.92;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=67.125;MQRankSum=-2.537;NS=1058;RA=4870;RL=17;RPP=4.9646;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.229;SAB=0.525;SAF=21;SAP=3.2274;SAR=19;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.5271;SRF=2567;SRP=34.087;SRR=2303;VQSLOD=7.9228;set=Intersection;sumGLbyD=10.77
-20 54457331 . G GA 1793.40 PASS AA=77;AB=0.66667;ABA=74;ABP=56.573;ABR=148;AC=33;AF=0.02687;AN=1228;BL=3834;BR=1154;BVAR;BaseQRankSum=10.572;DP=10230;Dels=0.00;EL=77;EPP=170.21;ER=0;FS=139.433;HETAR=44;HOMA=1;HOMR=1001;HRun=1;INS;InbreedingCoeff=0.0023;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_A.;LEN=1;LRB=0.53729;LRBP=3129.8;MQ0Fraction=0.0095;MQM=4.7013;MQRankSum=-8.116;NS=1046;RA=4009;RL=77;RPP=170.21;RR=0;RUN=1;ReadPosRankSum=-6.026;SAB=1;SAF=77;SAP=170.21;SAR=0;SRB=0.57022;SRF=2286;SRP=174.7;SRR=1723;VQSLOD=1.1887;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.90
-20 54469810 . CA C 1697.62 PASS AA=93;AB=0.63855;ABA=90;ABP=44.53;ABR=159;AC=34;AF=0.0374;AF1=0.01719;AN=908;BL=3242;BR=5839;BVAR;BaseQRankSum=10.425;CI95=0.009317,0.02795;DEL;DP=15197;DP4=2134,1896,56,46;Dels=0.03;EL=34;EPP=17.604;ER=59;FQ=16;FR;FS=9.985;HETAR=41;HOMA=1;HOMR=1011;HP=9;HPLen=8;HR=8;HRun=8;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0472;IndelType=DEL.NumRepetitions_8.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.28598;LRBP=1615.8;MQ=83.37;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQM=64.075;MQRankSum=3.036;NF;NR;NS=1053;PP;PV4=0.76,1,0.31,0.22;RA=5150;RL=28;RPP=34.975;RR=65;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.252;SAB=0.5914;SAF=55;SAP=9.7582;SAR=38;SC=ATTGCTAAGACAAAAAAAAGA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.50621;SRF=2607;SRP=4.7374;SRR=2543;TC;TR=8;TU=A;VQSLOD=8.3677;set=Intersection;sumGLbyD=9.90
-20 54542453 . GTATA G,GTA 5109.66 PASS ABR=112;AC=66,56;AF=0.0682,0.0579;AN=968;BVAR;BaseQRankSum=17.089;DB;DEL;DP=5519;DS;Dels=0.06;FS=99.502;HOMA=15;HOMR=409;HRun=0;InbreedingCoeff=0.1584;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0Fraction=0.0178;MQRankSum=-6.854;NS=460;RA=864;RUN=1;ReadPosRankSum=0.855;SRB=0.79282;SRF=685;SRP=646.5;SRR=179;VQSLOD=0.6375;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=8.53
-20 54629773 . CA C 1799.50 PASS AA=49;AB=0.82707;ABA=46;ABP=250.17;ABR=220;AC=9;AF=0.00746;AN=1206;BL=173;BR=2277;BVAR;BaseQRankSum=5.240;DEL;DP=8557;Dels=0.01;EL=49;EPP=109.41;ER=0;FS=32.359;HETAR=35;HOMA=1;HOMR=325;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0892;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.85878;LRBP=3926.6;MQ0Fraction=0.0602;MQM=32.163;MQRankSum=-3.926;NS=361;RA=1091;RL=0;RPP=109.41;RR=49;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.512;SAB=0;SAF=0;SAP=109.41;SAR=49;SRB=0.49404;SRF=539;SRP=3.3467;SRR=552;VQSLOD=1.1233;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.54
-20 54710245 . TA T 999 PASS AF=0.0084;AF1=0.0148;BaseQRankSum=3.954;CI95=0.00885,0.02212;DP=8043;DP4=2000,1849,10,7;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=0.000;HP=9;HPLen=6;HR=3;HRun=6;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1181;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=78.51;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.095;NF;NR;PP;PV4=0.63,0.00056,1,1;ReadPosRankSum=-0.448;SC=CAACAAAAAATAAATAAATAA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=15;TU=AAAT;VQSLOD=7.8129;set=Intersection;sumGLbyD=19.02
-20 54968173 . A AAT,AATAT,AT,ATAT 89535.82 PASS ABR=994;AC=561,278,2,3;AF=0.50179,0.24866,0.00179,0.00268;AN=1118;BVAR;BaseQRankSum=-2.699;DB;DP=27837;DP4=168,177,1045,866;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=12.472;HOMA=71;HOMR=455;HP=3;HPLen=4;HR=4;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.6391;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;KGPilot123;MQ=80.36;MQ0Fraction=0.0055;MQRankSum=-1.512;NF;NR;NS=913;PP;PV4=0.046,1,1,1;RA=2015;RUN=1;ReadPosRankSum=1.015;SC=GGCCACTTAAAATATATATAT;SET_WGVQSR;SRB=0.44864;SRF=904;SRP=49.187;SRR=1111;TC;TR=15;TU=AT;VQSLOD=9.0092;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=42.33
-20 55176688 . TA T 421.84 PASS AF=0.01322;AF1=0.01845;BaseQRankSum=5.383;CI95=0.01282,0.02564;DP=10531;DP4=1975,2017,16,14;Dels=0.01;FQ=91.2;FR;FS=7.401;HP=6;HPLen=5;HR=5;HRun=5;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0829;IndelType=DEL.NumRepetitions_5.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=75.80;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=-0.471;NF;NR;PP;PV4=0.72,1,1,1;ReadPosRankSum=0.223;SC=CTGCAAAATATAAAAATTAGG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=5;TU=A;VQSLOD=6.6000;set=Intersection;sumGLbyD=12.15
-20 55664086 . GTT ATT,G,GT,GTTT 5622.44 PASS AC=6,71,136;AF=0.00498,0.05887,0.11277;AN=1206;BVAR;BaseQRankSum=3.173;DB;DEL;DP=40384;DP4=1567,1317,54,29;Dels=0.05;FR;FS=1.949;HP=14;HR=11;HRun=11;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.3490;IndelType=MIXED;MQ=77.90;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.052;NF;NR;PP;PV4=0.057,1,0.2,1.2e-05;RUN=1;ReadPosRankSum=-13.646;SC=AATTTTATTTGTTTTTTTTTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=11.7964;set=Intersection;sumGLbyD=8.09
-20 56045006 . TG T 342.15 PASS AC=72;AF=0.0940;AN=766;BaseQRankSum=4.992;DP=1238;FS=1.460;HRun=7;HaplotypeScore=20.2784;InbreedingCoeff=0.1795;IndelType=DEL.NumRepetitions_7.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;MQ=66.42;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0008;MQRankSum=-0.937;QD=1.84;ReadPosRankSum=-4.385;SB=-320.83;VQSLOD=5.2383;set=VQSR
-20 56158711 . AG A 922.47 PASS AA=18;AB=0.575;ABA=17;ABP=4.9646;ABR=23;AC=2;AF=0.0028;AN=714;BL=953;BR=808;BVAR;BaseQRankSum=3.129;DEL;DP=10462;Dels=0.01;EL=9;EPP=3.0103;ER=9;FR;FS=8.724;HETAR=4;HOMA=0;HOMR=1058;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=1;HU=A;InbreedingCoeff=0.0262;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.08234;LRBP=28.936;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=55.889;MQRankSum=2.052;NF;NR;NS=1062;PP;RA=6300;RL=9;RPP=3.0103;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.317;SAB=0.66667;SAF=12;SAP=7.3532;SAR=6;SC=TGGCCTAGCAAGCATCGTGAC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.48143;SRF=3033;SRP=21.883;SRR=3267;TC;TR=8;TU=AAGC;VQSLOD=8.3252;set=Intersection;sumGLbyD=13.22
-20 56258618 rs113670927 T C,TGC,TGTGC,TGTGTGC 37834.99 PASS ABR=441;AC=11,100,43;AF=0.0123,0.1119,0.0481;AN=894;BVAR;BaseQRankSum=19.514;DB;DP=23173;DP4=541,920,413,579;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=1.238;HOMA=28;HOMR=808;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2154;IndelType=MIXED;MQ=57.25;MQ0Fraction=0.0275;MQRankSum=-6.684;NF;NR;NS=976;PP;PV4=0.023,1,1,1;RA=3294;RUN=1;ReadPosRankSum=11.873;SC=TGCGTGTGTGTGTGTGTGTGT;SRB=0.42441;SRF=1398;SRP=166.5;SRR=1896;TC;TR=30;TU=GT;VQSLOD=6.7457;dbSNP=114;set=Intersection;sumGLbyD=21.27
-20 56395857 . T TAGGCAG 6614.22 PASS AA=30;AB=0.63415;ABA=30;ABP=15.827;ABR=52;AC=14;AF=0.0197;AF1=0.03154;AN=710;BL=991;BR=1813;BVAR;BaseQRankSum=-4.589;CI95=0.02434,0.04204;DP=13879;DP4=1543,1833,12,14;Dels=0.00;EL=14;EPP=3.2998;ER=16;FQ=999;FR;FS=1.482;HETAR=11;HOMA=0;HOMR=1051;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0774;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_6.;LEN=6;LRB=0.29315;LRBP=526.27;MQ=90.42;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=39.433;MQRankSum=-7.011;NF;NR;NS=1062;PP;PV4=1,1,3.7e-09,1;RA=5322;RL=9;RPP=13.433;RR=21;RUN=1;ReadPosRankSum=0.679;SAB=0.43333;SAF=13;SAP=4.1684;SAR=17;SC=AAGAGCATCTTAGGCAGAGGC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.47294;SRF=2517;SRP=36.853;SRR=2805;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=8.3045;set=Intersection;sumGLbyD=68.22
-20 56969289 . GTTTGT G 600.69 PASS AF=0.0056;AF1=0.007726;BaseQRankSum=2.907;CI95=0.004425,0.01327;DP=9643;DP4=1892,1749,6,3;Dels=0.00;FQ=117;FR;FS=16.601;HP=5;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0236;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_5.;MQ=92.59;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.134;NF;NR;PP;PV4=0.51,1,0.07,0.3;ReadPosRankSum=0.236;SC=TAAGGACGTTGTTTGTTTTGT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=10;TU=GTTT;VQSLOD=5.8458;set=Intersection;sumGLbyD=39.51
-20 57187557 . AG A,AGG 1486.69 PASS AA=130;AB=0.55446;ABA=90;ABP=8.2132;ABR=112;AC=56,26;AF=0.0574,0.0266;AN=976;BL=3817;BR=5968;BVAR;BaseQRankSum=5.517;DEL;DP=14174;DP4=925,721,59,48;Dels=0.05;EL=52;EPP=14.302;ER=78;FR;FS=0.917;HETAR=44;HOMA=17;HOMR=864;HP=4;HPLen=4;HR=4;HRun=4;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.2856;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.21983;LRBP=1029.8;MQ=91.56;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=63.631;MQRankSum=1.900;NF;NR;NS=925;PP;PV4=0.84,1,1,0.39;RA=2746;RL=44;RPP=32.476;RR=86;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.639;SAB=0.44615;SAF=58;SAP=6.2842;SAR=72;SC=TCAGGCCCGCAGGGGTCAGGG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.5772;SRF=1585;SRP=145.17;SRR=1161;TC;TR=4;TU=G;VQSLOD=7.7167;set=Intersection;sumGLbyD=14.85
-20 57282771 . T TG 506.43 PASS AA=34;AB=0.70312;ABA=19;ABP=25.946;ABR=45;AC=34;AF=0.0373;AN=912;BL=886;BR=1938;BVAR;BaseQRankSum=3.744;DP=4276;Dels=0.00;EL=18;EPP=3.2658;ER=16;FR;FS=0.639;HETAR=17;HOMA=9;HOMR=737;HP=9;HR=8;HRun=8;HU=G;INS;InbreedingCoeff=0.2149;IndelType=INS.NumRepetitions_8.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.37252;LRBP=853.99;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=49.706;MQRankSum=-0.051;NF;NR;NS=763;PP;RA=1822;RL=9;RPP=19.36;RR=25;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.111;SAB=0.55882;SAF=19;SAP=4.0322;SAR=15;SC=TCGGGGGGCGTGGGGGGGGTG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.51098;SRF=931;SRP=4.9172;SRR=891;TC;TR=8;TU=G;VQSLOD=5.7772;set=Intersection;sumGLbyD=7.95
-20 57419740 rs11481507 A AT 82613.57 PASS AA=3850;AB=0.41404;ABA=1786;ABP=198.63;ABR=1262;AC=919;AF=0.75328;AN=1220;BL=140665;BR=151383;BVAR;BaseQRankSum=-27.490;DB;DP=31794;DP4=588,585,1571,1721;Dels=0.00;EL=1924;EPP=3.0126;ER=1926;FQ=999;FR;FS=2.191;HETAR=482;HOMA=454;HOMR=135;HP=3;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0861;IndelType=INS.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.036699;LRBP=857.15;MQ=123.92;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=91.654;MQRankSum=3.016;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=0.16,1,0.12,1;RA=1850;RL=1874;RPP=8.8784;RR=1976;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.685;SAB=0.47636;SAF=1834;SAP=21.693;SAR=2016;SC=TACACTAGTGATTTAACCCTA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.49027;SRF=907;SRP=4.5315;SRR=943;TC;TR=3;TU=T;VQSLOD=9.2768;dbSNP=126;set=Intersection;sumGLbyD=22.78
-20 57558194 . CT C,CTT,CTTT 6470.30 PASS ABR=451;AC=104,161,177;AF=0.08919,0.13808,0.15180;BVAR;BaseQRankSum=1.172;DP=7985;FR;FS=2.202;HOMA=19;HOMR=778;HP=22;HR=15;HU=T;HaplotypeScore=16.1921;INS;InbreedingCoeff=0.6440;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=69.24;MQ0=27;MQ0Fraction=0.0109;MQRankSum=-0.003;NF;NR;NS=943;PP;QD=2.22;RA=2531;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-2096.85;SC=GCCTTTTTTTCTTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;SRB=0.34848;SRF=882;SRP=507.73;SRR=1649;TC;TR=15;TU=T;VQSLOD=6.5151;set=Intersection
-20 57693627 . AG A 1991.90 PASS AA=52;AB=0.49462;ABA=47;ABP=3.0336;ABR=46;AC=15;AF=0.01227;AN=1222;BL=1902;BR=1478;BVAR;BaseQRankSum=-6.121;DEL;DP=26459;DP4=2647,2873,16,20;Dels=0.01;EL=25;EPP=3.1773;ER=27;FR;FS=3.135;HETAR=15;HOMA=1;HOMR=1064;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=2;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0866;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.12544;LRBP=118.51;MQ=116.26;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=114.65;MQRankSum=1.942;NF;NR;NS=1080;PP;PV4=0.74,6.9e-08,1,0.38;RA=6781;RL=33;RPP=11.195;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.795;SAB=0.5;SAF=26;SAP=3.0103;SAR=26;SC=ATTGGAGGAAAGGCTTTTTCA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.46247;SRF=3136;SRP=85.976;SRR=3645;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=8.6672;set=Intersection;sumGLbyD=13.55
-20 57716287 . A AT 66.47 PASS AC=6;AF=0.00506;AN=1186;BaseQRankSum=1.369;DP=2744;FS=3.834;HRun=8;HaplotypeScore=11.2046;InbreedingCoeff=0.1196;IndelType=INS.NumRepetitions_8.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=73.00;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-0.086;QD=2.14;ReadPosRankSum=-2.588;SB=-53.80;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=4.2080;set=VQSR
-20 58121928 rs73625057 T TGG 6649.17 PASS AA=132;AB=0.57854;ABA=110;ABP=16.996;ABR=151;AC=57;AF=0.0617;AN=924;BL=4530;BR=4790;BVAR;BaseQRankSum=-13.456;DB;DP=30353;DP4=2107,2168,61,66;Dels=0.00;EL=67;EPP=3.0761;ER=65;FR;FS=0.708;HETAR=46;HOMA=8;HOMR=1023;HP=3;HPLen=2;HR=2;HRun=2;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1241;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=2;LRB=0.027897;LRBP=18.76;MQ=109.61;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQM=79.833;MQRankSum=-0.699;NF;NR;NS=1077;PP;PV4=0.79,1,0.49,0.036;RA=5754;RL=61;RPP=4.6554;RR=71;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.309;SAB=0.45455;SAF=60;SAP=5.3792;SAR=72;SC=GATTAGAATGTGGATATCTTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.48836;SRF=2810;SRP=9.7866;SRR=2944;TC;TR=4;TU=GT;VQSLOD=8.5770;set=Intersection;sumGLbyD=27.19
-20 58468826 . ACAAG A 999 PASS AF=0.0014;AF1=0.003429;BaseQRankSum=4.082;CI95=0.003106,0.006211;DP=8461;DP4=2500,1817,8,2;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=5.034;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0183;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ=120.69;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.141;NF;NR;PP;PV4=0.21,1,0.054,1;ReadPosRankSum=2.096;SC=ATCCTGAAACACAAGAAGAAA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=5;TU=AC;VQSLOD=7.4928;set=Intersection;sumGLbyD=29.17
-20 58731262 . TC T 999 PASS AA=21;AB=0.48649;ABA=19;ABP=3.069;ABR=18;AC=7;AF=0.0101;AF1=0.01493;AN=694;BL=939;BR=848;BVAR;BaseQRankSum=4.205;CI95=0.01106,0.02212;DEL;DP=12598;DP4=1766,1428,11,15;Dels=0.01;EL=13;EPP=5.5954;ER=8;FQ=999;FR;FS=1.796;HETAR=8;HOMA=1;HOMR=1031;HP=7;HPLen=8;HR=8;HRun=2;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0030;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.050923;LRBP=13.073;MQ=124.57;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=67.905;MQRankSum=1.103;NF;NR;NS=1040;PP;PV4=0.23,1,1,1;RA=4884;RL=10;RPP=3.1137;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.091;SAB=0.47619;SAF=10;SAP=3.1137;SAR=11;SC=TCATTTTTTTTCCTTGAAACT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.58006;SRF=2833;SRP=274.9;SRR=2051;TC;TR=8;TU=T;VQSLOD=10.8783;set=Intersection;sumGLbyD=15.11
-20 59181229 rs11476579 CTT C,CT,CTTT,CTTTT 7787.17 PASS AC=19,195,104,91;AF=0.01599,0.16414,0.08754,0.07660;AF1=0.2124;AN=1188;BVAR;BaseQRankSum=6.347;CI95=0.146,0.2743;DB;DEL;DP=26140;DP4=932,880,352,375;Dels=0.13;FQ=85.6;FR;FS=11.914;HP=14;HR=14;HRun=14;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.4183;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=86.88;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.469;NF;NR;PP;PV4=0.17,1,1,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.055;SC=GGTGAGAAAGCTTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;TC;TR=14;TU=T;VQSLOD=7.4340;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=7.02
-20 59213979 rs112141381 G GC 9068 PASS AA=131;AB=0.47115;ABA=110;ABP=4.5136;ABR=98;AF=0.0586;AN=700;BL=5395;BR=5816;BVAR;BaseQRankSum=15.453;DB;DP=23381;DP4=2191,2184,71,49;Dels=0.00;EL=66;EPP=3.0269;ER=65;FR;FS=7.907;HETAR=35;HOMA=5;HOMR=1019;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0283;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_C.;LEN=1;LRB=0.037552;LRBP=37.34;MQ=72.13;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=54.496;MQRankSum=0.897;NF;NR;NS=1059;PP;PV4=0.052,1,0.066,1;RA=4976;RL=59;RPP=5.8117;RR=72;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.811;SAB=0.58015;SAF=76;SAP=10.32;SAR=55;SC=GATGGACTGGGACAGTGACTC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.49457;SRF=2461;SRP=4.2828;SRR=2515;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=9.3917;set=Intersection;sumGLbyD=28.58
-20 59252945 . CT C,CTT 557.18 PASS AA=24;AB=0.84868;ABA=23;ABP=163.53;ABR=129;AC=21,29;AF=0.01759,0.02429;BL=1217;BR=1336;BVAR;BaseQRankSum=5.135;DP=9970;Dels=0.01;EL=13;EPP=3.3722;ER=11;FS=2.302;HETAR=21;HOMA=1;HOMR=1012;HRun=9;INS;InbreedingCoeff=0.1549;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.046612;LRBP=15.055;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=67.208;MQRankSum=0.086;NS=1034;RA=4421;RL=11;RPP=3.3722;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.826;SAB=0.41667;SAF=10;SAP=4.4579;SAR=14;SET_WGVQSR;SRB=0.49649;SRF=2195;SRP=3.4823;SRR=2226;VQSLOD=2.8923;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.47
-20 60016966 . CT C 42650 PASS AA=37;AB=0.97834;ABA=31;ABP=2847;ABR=1400;AC=15;AF=0.0163;AN=920;BL=2596;BR=778;BVAR;BaseQRankSum=-0.632;DEL;DP=10967;Dels=0.00;EL=14;EPP=7.7641;ER=23;FS=4.094;HETAR=421;HOMA=256;HOMR=385;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0051;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.53883;LRBP=2130.2;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=120.3;MQRankSum=-0.911;NS=1072;RA=3413;RL=31;RPP=39.691;RR=6;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.062;SAB=0.48649;SAF=18;SAP=3.069;SAR=19;SRB=0.47407;SRF=1618;SRP=22.943;SRR=1795;VQSLOD=3.3758;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.27
-20 60188651 . AG A 17624.52 PASS AA=462;AB=0.76548;ABA=409;ABP=1070.7;ABR=1335;AC=403;AF=0.34444;AN=1170;BL=13877;BR=25909;BVAR;BaseQRankSum=6.180;DEL;DP=9900;Dels=0.08;EL=353;EPP=282.84;ER=109;FR;FS=2699.057;HETAR=346;HOMA=26;HOMR=633;HP=3;HR=4;HRun=1;HU=A;InbreedingCoeff=-0.2900;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.30242;LRBP=7904.3;MQ0Fraction=0.0004;MQM=56.119;MQRankSum=1.644;NF;NR;NS=1005;PP;RA=3521;RL=112;RPP=269.25;RR=350;RUN=1;ReadPosRankSum=2.490;SAB=0.0064935;SAF=3;SAP=980.34;SAR=459;SC=AGGCTTCAAAAGAAAAAAAAA;SRB=0.55978;SRF=1971;SRP=112.32;SRR=1550;TC;TR=4;TU=A;VQSLOD=-34.0667;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=7.81
-20 60195570 . GTACATACATACA ATACATACATACA,G,GTACATACA 20140 PASS ABR=102;AC=105,2;AF=0.08794,0.00168;AN=1194;BVAR;BaseQRankSum=-28.899;DB;DEL;DP=14347;Dels=0.02;FR;FS=52.125;HOMA=1;HOMR=1006;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=0.0695;IndelType=MIXED;MQ0Fraction=0.0007;MQRankSum=1.957;NF;NR;NS=1035;PP;RA=4759;RUN=1;ReadPosRankSum=-22.252;SAB=0.5;SAP=3.0103;SC=TGATAGATTCGTACATACATA;SET_INTEGRATION;SRB=0.47615;SRF=2266;SRP=26.522;SRR=2493;TC;TR=21;TU=ACAT;VQSLOD=2.7673;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=19.14
-20 60670601 rs72127450 AT A,ATT 6401.59 PASS AC=177,79;AF=0.16239,0.07248;AF1=0.1602;AN=1090;BVAR;BaseQRankSum=8.618;CI95=0.1106,0.2058;DB;DEL;DP=17508;DP4=1285,1094,313,259;Dels=0.10;FQ=94.1;FR;FS=0.000;HP=12;HR=12;HRun=12;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1076;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;MQ=64.73;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.620;NF;NR;PP;PV4=0.78,1,0.012,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.294;SC=AGCCAGGCACATTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;TC;TR=12;TU=T;VQSLOD=6.1650;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=5.80
-20 60685780 . TC T 1123.58 PASS AC=79;AF=0.07655;AN=1032;BaseQRankSum=14.949;DP=2084;FS=23.521;HRun=1;HaplotypeScore=19.7117;InbreedingCoeff=0.1356;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=53.57;MQ0=61;MQ0Fraction=0.0293;MQRankSum=-7.958;QD=4.35;ReadPosRankSum=-13.757;SB=-791.28;VQSLOD=6.3549;set=VQSR
-20 60744906 rs113528167 CG C 422.53 PASS AC=48;AF=0.0732;AN=656;BaseQRankSum=17.669;DB;DP=1189;FS=0.356;HRun=1;HaplotypeScore=15.1808;InbreedingCoeff=0.2111;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;MQ=82.83;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-10.455;QD=2.71;ReadPosRankSum=-16.887;SB=-326.46;VQSLOD=7.1707;set=VQSR
-20 60848742 . CGT C,CGTGT 999 PASS AF=0.00980,0.01225;BaseQRankSum=5.597;DP=17065;DP4=1928,2188,17,13;Dels=0.01;FR;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.2094;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=115.78;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.281;NF;NR;PP;PV4=0.36,0.4,0.12,0.12;ReadPosRankSum=-1.465;SB=-157.35;SC=TAGACGCTTCCGTGTGTGTGT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=11;TU=GT;VQSLOD=1.7100;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=16.39
-20 61023668 rs57452309 G GAGC 6896.67 PASS AC=115;AF=0.1445;AN=796;BaseQRankSum=12.146;DB;DP=1423;FS=5.070;HRun=0;HaplotypeScore=29.8897;InbreedingCoeff=0.0740;IndelType=INS.NOVEL_3.;MQ=77.02;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-9.005;QD=19.16;ReadPosRankSum=-17.440;SB=-3045.82;VQSLOD=4.5788;set=VQSR
-20 61180519 . C CA,CT 1774.30 PASS ABR=135;AC=27,15;AF=0.02538,0.01410;BVAR;BaseQRankSum=-2.189;DP=8393;FR;FS=27.692;HOMA=2;HOMR=825;HP=6;HPLen=3;HR=3;HU=T;HaplotypeScore=19.5313;INS;InbreedingCoeff=0.0868;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;MQ=56.11;MQ0=172;MQ0Fraction=0.0667;MQRankSum=2.605;NF;NR;NS=854;PP;QD=1.99;RA=2868;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.324;SB=-385.54;SC=TTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT;SRB=0.32741;SRF=939;SRP=745.08;SRR=1929;TC;TR=69;TU=CTTT;VQSLOD=3.4398;set=filterInVQSR-2of5
-20 61184281 . AC A 9798.10 PASS AA=24;AB=0.96507;ABA=16;ABP=863.43;ABR=442;AC=4;AF=0.00341;AN=1174;BL=349;BR=1039;BVAR;BaseQRankSum=2.048;DEL;DP=10073;Dels=0.00;EL=11;EPP=3.3722;ER=13;FS=2.097;HETAR=141;HOMA=69;HOMR=829;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0697;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.49712;LRBP=747.85;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=98.042;MQRankSum=1.881;NS=1042;RA=3625;RL=5;RPP=20.744;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-8.009;SAB=0.75;SAF=18;SAP=16.039;SAR=6;SRB=0.52662;SRF=1909;SRP=25.323;SRR=1716;VQSLOD=1.8117;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.55
-20 62074219 . C CTAT,CTGT 2328 PASS ABR=99;AC=20,6;AF=0.01754,0.00526;BVAR;BaseQRankSum=11.221;DP=9498;DS;FS=4.510;HOMA=15;HOMR=645;HaplotypeScore=82.8868;INS;InbreedingCoeff=0.0880;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=3;MQ=29.88;MQ0=1378;MQ0Fraction=0.2286;MQRankSum=-5.309;NS=689;QD=0.77;RA=1679;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.510;SAR=1;SB=-93.21;SRB=0.70697;SRF=1187;SRP=627.71;SRR=492;VQSLOD=1.8325;set=filterInVQSR-2of5
-20 62304449 . CA C,CAA 6680.17 PASS AC=141,69;AF=0.12567,0.06150;AF1=0.08178;AN=1122;BVAR;BaseQRankSum=9.754;CI95=0.05088,0.1128;DEL;DP=15867;DP4=1252,1289,232,208;Dels=0.10;FQ=52.6;FR;FS=6.576;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1950;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;MQ=60.48;MQ0Fraction=0.0004;MQRankSum=-0.049;NF;NR;PP;PV4=0.2,1,1,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.137;SC=GATTCTGTGTCAAAAAAAAAA;SET_WGVQSR;TC;TR=11;TU=A;VQSLOD=7.4714;set=Intersection;sumGLbyD=8.36
-20 62804895 rs57769591 CCTT C 1148 PASS AC=8;AF=0.0085;AF1=0.002839;AN=938;BaseQRankSum=4.952;CI95=0.002212,0.006637;DB;DP=8889;DP4=2574,1668,4,8;FQ=12.3;FS=2.289;HPLen=3;HRun=0;HaplotypeScore=29.4184;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0270;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_3.;MQ0=876;MQ0Fraction=0.2674;MQRankSum=-0.641;PV4=0.074,1,1,1;QD=1.03;ReadPosRankSum=0.118;SB=-65.30;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=6.4881;dbSNP=126;set=Intersection
-20 62907688 . AAT A 6629.57 PASS AC=164;AF=0.13735;AN=1194;BaseQRankSum=27.368;DP=2746;FS=5.985;HRun=0;HaplotypeScore=14.7748;InbreedingCoeff=0.1433;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_2.RepeatExpansion_AT.;MQ=96.65;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-3.318;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.789;SB=-2662.16;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=6.1473;set=VQSR
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.1\r
-##INFO=<ID=Sample,Number=1,Type=String,Description="Sample picked for single sample pooled 454-PCR validation">\r
-##INFO=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">\r
-##INFO=<ID=PCR_454_AR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternative reads in 454-PCR sequencing data">\r
-##INFO=<ID=PCR_454_RR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference reads in 454-PCR sequencing data">\r
-##reference=file:///humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta\r
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO\r
-20 256726 . T A . . Sample=HG00097;GT=0/1;PCR_454_AR=739;PCR_454_RR=885\r
-20 256726 . T A . . Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=723;PCR_454_RR=714\r
-20 256726 . T A . . Sample=HG00106;GT=0/1;PCR_454_AR=1092;PCR_454_RR=1102\r
-20 256726 . T A . . Sample=HG00112;GT=0/1;PCR_454_AR=947;PCR_454_RR=1005\r
-20 256726 . T A . . Sample=HG00104;GT=1/1;PCR_454_AR=1970;PCR_454_RR=52\r
-20 257977 . G C . . Sample=NA19438;GT=0/1;PCR_454_AR=1312;PCR_454_RR=1123\r
-20 330407 . C G . . Sample=HG00134;GT=0/1;PCR_454_AR=1034;PCR_454_RR=1037\r
-20 330407 . C G . . Sample=HG00148;GT=0/1;PCR_454_AR=840;PCR_454_RR=820\r
-20 330407 . C G . . Sample=HG00151;GT=0/1;PCR_454_AR=952;PCR_454_RR=982\r
-20 330407 . C G . . Sample=HG00358;GT=0/1;PCR_454_AR=880;PCR_454_RR=957\r
-20 330407 . C G . . Sample=HG01277;GT=0/1;PCR_454_AR=914;PCR_454_RR=984\r
-20 368826 . G A . . Sample=NA20346;GT=0/1;PCR_454_AR=632;PCR_454_RR=591\r
-20 371957 . G A . . Sample=HG00150;GT=0/1;PCR_454_AR=403;PCR_454_RR=424\r
-20 371957 . G A . . Sample=NA12287;GT=0/1;PCR_454_AR=401;PCR_454_RR=435\r
-20 467031 . T A . . Sample=NA20510;GT=0/0;PCR_454_AR=5;PCR_454_RR=1763\r
-20 741858 . G A . . Sample=NA18634;GT=0/1;PCR_454_AR=1273;PCR_454_RR=1301\r
-20 947853 . C T . . Sample=HG00578;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=197\r
-20 947853 . C T . . Sample=NA18861;GT=0/1;PCR_454_AR=40;PCR_454_RR=39\r
-20 947853 . C T . . Sample=NA18868;GT=0/1;PCR_454_AR=88;PCR_454_RR=80\r
-20 947853 . C T . . Sample=NA18870;GT=0/1;PCR_454_AR=66;PCR_454_RR=99\r
-20 947853 . C T . . Sample=NA18917;GT=0/1;PCR_454_AR=96;PCR_454_RR=111\r
-20 947908 . C T . . Sample=NA11993;GT=0/1;PCR_454_AR=598;PCR_454_RR=2114\r
-20 947908 . C T . . Sample=NA18501;GT=0/1;PCR_454_AR=392;PCR_454_RR=1687\r
-20 947908 . C T . . Sample=NA18504;GT=0/1;PCR_454_AR=635;PCR_454_RR=2218\r
-20 947908 . C T . . Sample=NA18505;GT=0/1;PCR_454_AR=1312;PCR_454_RR=1429\r
-20 947908 . C T . . Sample=NA18507;GT=0/1;PCR_454_AR=598;PCR_454_RR=2127\r
-20 948715 . T G . . Sample=NA06989;GT=0/0;PCR_454_AR=4;PCR_454_RR=1252\r
-20 1144999 . C T . . Sample=NA18510;GT=0/1;PCR_454_AR=450;PCR_454_RR=447\r
-20 1144999 . C T . . Sample=NA19172;GT=0/1;PCR_454_AR=541;PCR_454_RR=531\r
-20 1285858 . A C . . Sample=NA19311;GT=0/1;PCR_454_AR=1210;PCR_454_RR=1315\r
-20 1285932 . G A . . Sample=HG00097;GT=0/1;PCR_454_AR=868;PCR_454_RR=867\r
-20 1285932 . G A . . Sample=HG00106;GT=0/1;PCR_454_AR=745;PCR_454_RR=680\r
-20 1285932 . G A . . Sample=HG00126;GT=0/1;PCR_454_AR=780;PCR_454_RR=838\r
-20 1285932 . G A . . Sample=HG00134;GT=0/1;PCR_454_AR=978;PCR_454_RR=944\r
-20 1285932 . G A . . Sample=HG00128;GT=1/1;PCR_454_AR=1499;PCR_454_RR=14\r
-20 1286090 . A G . . Sample=HG00235;GT=0/1;PCR_454_AR=1223;PCR_454_RR=1352\r
-20 1286090 . A G . . Sample=HG00351;GT=0/1;PCR_454_AR=799;PCR_454_RR=823\r
-20 1286090 . A G . . Sample=HG01125;GT=0/1;PCR_454_AR=1167;PCR_454_RR=1149\r
-20 1286090 . A G . . Sample=NA19773;GT=0/1;PCR_454_AR=1070;PCR_454_RR=1130\r
-20 1546804 . G A . . Sample=HG00141;GT=0/1;PCR_454_AR=1174;PCR_454_RR=1231\r
-20 1546804 . G A . . Sample=HG00149;GT=0/1;PCR_454_AR=1029;PCR_454_RR=1050\r
-20 1546804 . G A . . Sample=HG00151;GT=0/1;PCR_454_AR=1135;PCR_454_RR=1034\r
-20 1546804 . G A . . Sample=HG00177;GT=0/1;PCR_454_AR=1063;PCR_454_RR=1118\r
-20 1546804 . G A . . Sample=HG00179;GT=0/1;PCR_454_AR=1118;PCR_454_RR=954\r
-20 1551579 . T G . . Sample=NA20515;GT=0/0;PCR_454_AR=5;PCR_454_RR=1812\r
-20 1551579 . T G . . Sample=NA19466;GT=0/1;PCR_454_AR=1011;PCR_454_RR=1042\r
-20 1559334 . C T . . Sample=NA18941;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1193\r
-20 1615980 . G A . . Sample=NA19914;GT=0/1;PCR_454_AR=441;PCR_454_RR=492\r
-20 1616047 . C G . . Sample=NA07048;GT=0/1;PCR_454_AR=508;PCR_454_RR=813\r
-20 1629751 . T C . . Sample=HG00156;GT=0/1;PCR_454_AR=285;PCR_454_RR=282\r
-20 1896011 . C T . . Sample=NA18639;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=29\r
-20 1896011 . C T . . Sample=NA19314;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=47\r
-20 2291684 . T C . . Sample=NA19036;GT=0/1;PCR_454_AR=873;PCR_454_RR=1025\r
-20 2291684 . T C . . Sample=NA19347;GT=0/1;PCR_454_AR=1116;PCR_454_RR=1217\r
-20 2375127 . G A . . Sample=NA18615;GT=0/1;PCR_454_AR=1016;PCR_454_RR=1016\r
-20 2777844 . T C . . Sample=NA20819;GT=0/1;PCR_454_AR=908;PCR_454_RR=970\r
-20 2844678 . G A . . Sample=HG00360;GT=0/1;PCR_454_AR=1081;PCR_454_RR=1071\r
-20 2944927 . A T . . Sample=NA12347;GT=0/1;PCR_454_AR=704;PCR_454_RR=752\r
-20 2969014 . C G . . Sample=HG00151;GT=0/1;PCR_454_AR=684;PCR_454_RR=809\r
-20 2969014 . C G . . Sample=NA18511;GT=0/1;PCR_454_AR=666;PCR_454_RR=704\r
-20 2969014 . C G . . Sample=NA18523;GT=0/1;PCR_454_AR=767;PCR_454_RR=802\r
-20 2969014 . C G . . Sample=NA18549;GT=0/1;PCR_454_AR=772;PCR_454_RR=838\r
-20 2969014 . C G . . Sample=NA18858;GT=1/1;PCR_454_AR=1313;PCR_454_RR=8\r
-20 3026344 . A C . . Sample=NA18640;GT=0/1;PCR_454_AR=1652;PCR_454_RR=1336\r
-20 3128885 . G A . . Sample=NA19473;GT=0/1;PCR_454_AR=620;PCR_454_RR=669\r
-20 3128950 . G A . . Sample=NA18624;GT=0/1;PCR_454_AR=570;PCR_454_RR=517\r
-20 3128950 . G A . . Sample=NA18953;GT=0/1;PCR_454_AR=685;PCR_454_RR=700\r
-20 3128950 . G A . . Sample=NA18998;GT=0/1;PCR_454_AR=606;PCR_454_RR=638\r
-20 3128950 . G A . . Sample=NA19076;GT=0/1;PCR_454_AR=663;PCR_454_RR=643\r
-20 3128950 . G A . . Sample=NA19088;GT=0/1;PCR_454_AR=492;PCR_454_RR=472\r
-20 3171356 . T C . . Sample=NA12003;GT=0/0;PCR_454_AR=6;PCR_454_RR=1919\r
-20 3171356 . T C . . Sample=NA12872;GT=0/0;PCR_454_AR=6;PCR_454_RR=2324\r
-20 3193990 . G T . . Sample=NA12815;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1570\r
-20 3193990 . G T . . Sample=NA18505;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1586\r
-20 3204083 . G A . . Sample=HG00104;GT=0/1;PCR_454_AR=1059;PCR_454_RR=982\r
-20 3204083 . G A . . Sample=HG00118;GT=0/1;PCR_454_AR=1190;PCR_454_RR=1178\r
-20 3204083 . G A . . Sample=HG00122;GT=0/1;PCR_454_AR=1156;PCR_454_RR=1277\r
-20 3204083 . G A . . Sample=HG00099;GT=1/1;PCR_454_AR=2171;PCR_454_RR=12\r
-20 3204083 . G A . . Sample=HG00106;GT=1/1;PCR_454_AR=2027;PCR_454_RR=19\r
-20 3214580 . C T . . Sample=HG00097;GT=0/1;PCR_454_AR=852;PCR_454_RR=784\r
-20 3214580 . C T . . Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=628;PCR_454_RR=682\r
-20 3214580 . C T . . Sample=HG00129;GT=0/1;PCR_454_AR=869;PCR_454_RR=844\r
-20 3214580 . C T . . Sample=HG00130;GT=0/1;PCR_454_AR=651;PCR_454_RR=767\r
-20 3214580 . C T . . Sample=HG00128;GT=1/1;PCR_454_AR=1378;PCR_454_RR=3\r
-20 3214802 . T C . . Sample=NA18526;GT=0/1;PCR_454_AR=969;PCR_454_RR=1018\r
-20 3235915 . T C . . Sample=HG00560;GT=0/1;PCR_454_AR=795;PCR_454_RR=798\r
-20 3235915 . T C . . Sample=HG00566;GT=0/1;PCR_454_AR=688;PCR_454_RR=650\r
-20 3235915 . T C . . Sample=HG00596;GT=0/1;PCR_454_AR=863;PCR_454_RR=935\r
-20 3235915 . T C . . Sample=HG01124;GT=0/1;PCR_454_AR=802;PCR_454_RR=836\r
-20 3235915 . T C . . Sample=NA18487;GT=0/1;PCR_454_AR=942;PCR_454_RR=968\r
-20 3274851 . C T . . Sample=NA19704;GT=0/1;PCR_454_AR=486;PCR_454_RR=479\r
-20 3274851 . C T . . Sample=NA20334;GT=0/1;PCR_454_AR=512;PCR_454_RR=512\r
-20 3274851 . C T . . Sample=NA20336;GT=0/1;PCR_454_AR=510;PCR_454_RR=440\r
-20 3324372 . G C . . Sample=NA19003;GT=0/1;PCR_454_AR=1902;PCR_454_RR=1898\r
-20 3362102 . T G . . Sample=NA06994;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=526\r
-20 3362102 . T G . . Sample=NA12249;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=465\r
-20 3515923 . G A . . Sample=HG00122;GT=0/1;PCR_454_AR=237;PCR_454_RR=261\r
-20 3515923 . G A . . Sample=HG00126;GT=0/1;PCR_454_AR=299;PCR_454_RR=293\r
-20 3515923 . G A . . Sample=HG00130;GT=0/1;PCR_454_AR=307;PCR_454_RR=279\r
-20 3515923 . G A . . Sample=HG00128;GT=1/1;PCR_454_AR=633;PCR_454_RR=4\r
-20 3515923 . G A . . Sample=HG00129;GT=1/1;PCR_454_AR=580;PCR_454_RR=2\r
-20 3641233 . G T . . Sample=NA20773;GT=0/0;PCR_454_AR=3;PCR_454_RR=1477\r
-20 3650204 . G A . . Sample=HG00118;GT=0/1;PCR_454_AR=737;PCR_454_RR=771\r
-20 3650204 . G A . . Sample=HG00126;GT=0/1;PCR_454_AR=518;PCR_454_RR=552\r
-20 3650204 . G A . . Sample=HG00141;GT=0/1;PCR_454_AR=643;PCR_454_RR=668\r
-20 3650204 . G A . . Sample=HG00143;GT=0/1;PCR_454_AR=549;PCR_454_RR=613\r
-20 3650204 . G A . . Sample=HG00148;GT=0/1;PCR_454_AR=708;PCR_454_RR=830\r
-20 3652397 . G A . . Sample=NA18635;GT=0/1;PCR_454_AR=1604;PCR_454_RR=1658\r
-20 3672827 . A T . . Sample=HG00130;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=941\r
-20 3672827 . A T . . Sample=HG00349;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=943\r
-20 3675119 . G T . . Sample=NA20544;GT=0/1;PCR_454_AR=577;PCR_454_RR=657\r
-20 3687329 . T C . . Sample=NA18532;GT=0/1;PCR_454_AR=702;PCR_454_RR=746\r
-20 3842125 . C G . . Sample=NA12155;GT=0/1;PCR_454_AR=1193;PCR_454_RR=1178\r
-20 4680289 . G A . . Sample=NA18856;GT=0/1;PCR_454_AR=1335;PCR_454_RR=1278\r
-20 4680289 . G A . . Sample=NA19130;GT=0/1;PCR_454_AR=1273;PCR_454_RR=1286\r
-20 4680289 . G A . . Sample=NA19213;GT=0/1;PCR_454_AR=1305;PCR_454_RR=1241\r
-20 4680289 . G A . . Sample=NA19311;GT=0/1;PCR_454_AR=1332;PCR_454_RR=1400\r
-20 4680289 . G A . . Sample=NA19332;GT=0/1;PCR_454_AR=1272;PCR_454_RR=1275\r
-20 4848511 . G A . . Sample=NA19440;GT=0/0;PCR_454_AR=8;PCR_454_RR=2951\r
-20 4848511 . G A . . Sample=NA19448;GT=0/1;PCR_454_AR=1278;PCR_454_RR=1434\r
-20 4848511 . G A . . Sample=NA19461;GT=0/1;PCR_454_AR=1412;PCR_454_RR=1478\r
-20 5099300 . A G . . Sample=NA19138;GT=0/1;PCR_454_AR=511;PCR_454_RR=496\r
-20 5903387 . A C . . Sample=HG00566;GT=0/1;PCR_454_AR=1400;PCR_454_RR=1384\r
-20 5903387 . A C . . Sample=HG01124;GT=0/1;PCR_454_AR=856;PCR_454_RR=1007\r
-20 5903387 . A C . . Sample=HG01125;GT=0/1;PCR_454_AR=891;PCR_454_RR=816\r
-20 5903387 . A C . . Sample=HG01149;GT=0/1;PCR_454_AR=1011;PCR_454_RR=959\r
-20 5903387 . A C . . Sample=HG01278;GT=0/1;PCR_454_AR=1077;PCR_454_RR=1049\r
-20 5923222 . C T . . Sample=HG00592;GT=0/1;PCR_454_AR=968;PCR_454_RR=950\r
-20 5923222 . C T . . Sample=NA18567;GT=0/1;PCR_454_AR=678;PCR_454_RR=728\r
-20 5923222 . C T . . Sample=NA18602;GT=0/1;PCR_454_AR=926;PCR_454_RR=988\r
-20 5923222 . C T . . Sample=NA18624;GT=0/1;PCR_454_AR=991;PCR_454_RR=963\r
-20 5923222 . C T . . Sample=NA18632;GT=0/1;PCR_454_AR=892;PCR_454_RR=906\r
-20 5943955 . G C . . Sample=HG00565;GT=0/1;PCR_454_AR=259;PCR_454_RR=227\r
-20 5943955 . G C . . Sample=HG00566;GT=0/1;PCR_454_AR=245;PCR_454_RR=235\r
-20 5943955 . G C . . Sample=HG00577;GT=0/1;PCR_454_AR=264;PCR_454_RR=305\r
-20 5943955 . G C . . Sample=HG00578;GT=0/1;PCR_454_AR=210;PCR_454_RR=261\r
-20 5943955 . G C . . Sample=HG00593;GT=0/1;PCR_454_AR=261;PCR_454_RR=238\r
-20 6015109 . G A . . Sample=NA20796;GT=0/1;PCR_454_AR=440;PCR_454_RR=500\r
-20 6060150 . C T . . Sample=NA18961;GT=0/1;PCR_454_AR=384;PCR_454_RR=464\r
-20 7967973 . G A . . Sample=NA19371;GT=0/1;PCR_454_AR=281;PCR_454_RR=506\r
-20 7967973 . G A . . Sample=NA19390;GT=0/1;PCR_454_AR=410;PCR_454_RR=538\r
-20 8665657 . G A . . Sample=NA19740;GT=0/1;PCR_454_AR=724;PCR_454_RR=703\r
-20 9453955 . C A . . Sample=NA20314;GT=0/1;PCR_454_AR=1048;PCR_454_RR=1147\r
-20 9520132 . G A . . Sample=HG00143;GT=0/1;PCR_454_AR=472;PCR_454_RR=583\r
-20 9520132 . G A . . Sample=HG01624;GT=0/1;PCR_454_AR=589;PCR_454_RR=589\r
-20 9520132 . G A . . Sample=NA12046;GT=0/1;PCR_454_AR=688;PCR_454_RR=708\r
-20 9520132 . G A . . Sample=NA18517;GT=0/1;PCR_454_AR=566;PCR_454_RR=585\r
-20 9520132 . G A . . Sample=NA18858;GT=0/1;PCR_454_AR=550;PCR_454_RR=561\r
-20 9543621 . C T . . Sample=HG00097;GT=0/1;PCR_454_AR=499;PCR_454_RR=480\r
-20 9543621 . C T . . Sample=HG00104;GT=0/1;PCR_454_AR=524;PCR_454_RR=480\r
-20 9543621 . C T . . Sample=HG00112;GT=0/1;PCR_454_AR=467;PCR_454_RR=406\r
-20 9543621 . C T . . Sample=HG00099;GT=1/1;PCR_454_AR=1321;PCR_454_RR=9\r
-20 9543621 . C T . . Sample=HG00106;GT=1/1;PCR_454_AR=802;PCR_454_RR=6\r
-20 9547022 . G A . . Sample=NA18924;GT=0/1;PCR_454_AR=853;PCR_454_RR=944\r
-20 9560813 . T C . . Sample=NA12761;GT=0/1;PCR_454_AR=692;PCR_454_RR=734\r
-20 10030206 . C T . . Sample=NA19175;GT=0/1;PCR_454_AR=784;PCR_454_RR=759\r
-20 10030206 . C T . . Sample=NA19380;GT=0/1;PCR_454_AR=781;PCR_454_RR=739\r
-20 10030206 . C T . . Sample=NA19446;GT=0/1;PCR_454_AR=533;PCR_454_RR=540\r
-20 13098183 . A C . . Sample=NA19453;GT=0/1;PCR_454_AR=857;PCR_454_RR=1146\r
-20 16253907 . C A . . Sample=NA19087;GT=0/1;PCR_454_AR=868;PCR_454_RR=854\r
-20 16254032 . G A . . Sample=NA19651;GT=0/1;PCR_454_AR=299;PCR_454_RR=263\r
-20 16485159 . T G . . Sample=NA18625;GT=0/1;PCR_454_AR=160;PCR_454_RR=1004\r
-20 17474781 . G A . . Sample=NA18870;GT=0/1;PCR_454_AR=496;PCR_454_RR=536\r
-20 17585255 . C G . . Sample=NA18528;GT=0/1;PCR_454_AR=370;PCR_454_RR=390\r
-20 17923814 . C T . . Sample=HG00104;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1854\r
-20 17923814 . C T . . Sample=HG00126;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1724\r
-20 17928182 . T G . . Sample=NA18522;GT=0/1;PCR_454_AR=222;PCR_454_RR=1564\r
-20 17931030 . C G . . Sample=NA20508;GT=0/1;PCR_454_AR=495;PCR_454_RR=446\r
-20 17933265 . G A . . Sample=NA19137;GT=0/1;PCR_454_AR=300;PCR_454_RR=315\r
-20 17968811 . C G . . Sample=NA19222;GT=0/1;PCR_454_AR=150;PCR_454_RR=189\r
-20 18123396 . A G . . Sample=NA20507;GT=0/0;PCR_454_AR=5;PCR_454_RR=2239\r
-20 18125941 . T C . . Sample=NA12006;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=2354\r
-20 18125941 . T C . . Sample=NA12762;GT=0/0;PCR_454_AR=4;PCR_454_RR=1116\r
-20 18374912 . T A . . Sample=NA19189;GT=0/1;PCR_454_AR=896;PCR_454_RR=888\r
-20 18440904 . G C . . Sample=NA19058;GT=0/1;PCR_454_AR=685;PCR_454_RR=881\r
-20 19698200 . C T . . Sample=NA18574;GT=0/1;PCR_454_AR=1012;PCR_454_RR=1086\r
-20 20020489 . T C . . Sample=NA19000;GT=0/1;PCR_454_AR=459;PCR_454_RR=436\r
-20 20028425 . C T . . Sample=NA20787;GT=0/1;PCR_454_AR=687;PCR_454_RR=739\r
-20 20033171 . G A . . Sample=NA19468;GT=0/0;PCR_454_AR=109;PCR_454_RR=1866\r
-20 20051634 . A G . . Sample=NA19711;GT=0/1;PCR_454_AR=659;PCR_454_RR=2324\r
-20 20051634 . A G . . Sample=NA20126;GT=0/1;PCR_454_AR=687;PCR_454_RR=2379\r
-20 20177371 . T C . . Sample=NA19713;GT=0/1;PCR_454_AR=882;PCR_454_RR=785\r
-20 21346240 . C T . . Sample=HG01125;GT=0/1;PCR_454_AR=707;PCR_454_RR=711\r
-20 21346240 . C T . . Sample=NA18489;GT=0/1;PCR_454_AR=670;PCR_454_RR=648\r
-20 21346240 . C T . . Sample=NA18498;GT=0/1;PCR_454_AR=706;PCR_454_RR=667\r
-20 21346240 . C T . . Sample=NA18502;GT=0/1;PCR_454_AR=698;PCR_454_RR=678\r
-20 21346240 . C T . . Sample=NA18505;GT=1/1;PCR_454_AR=1096;PCR_454_RR=2\r
-20 21494183 . C T . . Sample=HG00128;GT=0/1;PCR_454_AR=556;PCR_454_RR=605\r
-20 21494183 . C T . . Sample=HG00151;GT=0/1;PCR_454_AR=465;PCR_454_RR=425\r
-20 21494183 . C T . . Sample=HG00234;GT=0/1;PCR_454_AR=583;PCR_454_RR=487\r
-20 21494183 . C T . . Sample=HG00355;GT=0/1;PCR_454_AR=608;PCR_454_RR=521\r
-20 21494183 . C T . . Sample=HG00362;GT=0/1;PCR_454_AR=518;PCR_454_RR=577\r
-20 21687304 . C T . . Sample=NA19657;GT=0/1;PCR_454_AR=804;PCR_454_RR=862\r
-20 23028428 . C T . . Sample=NA18970;GT=0/1;PCR_454_AR=360;PCR_454_RR=418\r
-20 23028637 . C G . . Sample=NA18517;GT=0/1;PCR_454_AR=358;PCR_454_RR=374\r
-20 23028637 . C G . . Sample=NA19118;GT=0/1;PCR_454_AR=502;PCR_454_RR=432\r
-20 23420987 . G T . . Sample=NA19076;GT=0/0;PCR_454_AR=20;PCR_454_RR=1732\r
-20 23420993 . C G . . Sample=NA19076;GT=0/0;PCR_454_AR=40;PCR_454_RR=3495\r
-20 23424637 . C T . . Sample=HG00126;GT=0/1;PCR_454_AR=766;PCR_454_RR=721\r
-20 23424637 . C T . . Sample=HG00150;GT=0/1;PCR_454_AR=444;PCR_454_RR=435\r
-20 23424637 . C T . . Sample=HG00247;GT=0/1;PCR_454_AR=510;PCR_454_RR=486\r
-20 23424637 . C T . . Sample=HG00565;GT=0/1;PCR_454_AR=684;PCR_454_RR=609\r
-20 23424637 . C T . . Sample=HG00593;GT=0/1;PCR_454_AR=640;PCR_454_RR=676\r
-20 23545657 . A C . . Sample=NA18924;GT=0/1;PCR_454_AR=767;PCR_454_RR=780\r
-20 23548918 . T C . . Sample=NA18501;GT=0/1;PCR_454_AR=1397;PCR_454_RR=1168\r
-20 23548918 . T C . . Sample=NA18502;GT=0/1;PCR_454_AR=1373;PCR_454_RR=1383\r
-20 23548918 . T C . . Sample=NA18856;GT=0/1;PCR_454_AR=1376;PCR_454_RR=1446\r
-20 23548918 . T C . . Sample=NA18907;GT=0/1;PCR_454_AR=1522;PCR_454_RR=1533\r
-20 23548918 . T C . . Sample=NA19036;GT=0/1;PCR_454_AR=1549;PCR_454_RR=1624\r
-20 23667793 . G T . . Sample=NA11994;GT=0/0;PCR_454_AR=135;PCR_454_RR=1637\r
-20 23667793 . G T . . Sample=NA12400;GT=0/1;PCR_454_AR=651;PCR_454_RR=619\r
-20 23667793 . G T . . Sample=NA18527;GT=0/1;PCR_454_AR=816;PCR_454_RR=732\r
-20 23667793 . G T . . Sample=NA18566;GT=0/1;PCR_454_AR=928;PCR_454_RR=2446\r
-20 23667793 . G T . . Sample=NA19064;GT=0/1;PCR_454_AR=892;PCR_454_RR=2346\r
-20 23667834 . A C . . Sample=NA18510;GT=0/0;PCR_454_AR=27;PCR_454_RR=622\r
-20 23667834 . A C . . Sample=NA18858;GT=0/0;PCR_454_AR=32;PCR_454_RR=615\r
-20 23731469 . G T . . Sample=NA20544;GT=0/1;PCR_454_AR=292;PCR_454_RR=376\r
-20 23804690 . A C . . Sample=NA19749;GT=0/1;PCR_454_AR=1141;PCR_454_RR=1145\r
-20 23807156 . G C . . Sample=HG00129;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1447\r
-20 23807156 . G C . . Sample=HG00130;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1603\r
-20 23860201 . C T . . Sample=NA18553;GT=0/1;PCR_454_AR=722;PCR_454_RR=657\r
-20 23965921 . G A . . Sample=NA18549;GT=0/0;PCR_454_AR=21;PCR_454_RR=582\r
-20 23965921 . G A . . Sample=NA19000;GT=0/0;PCR_454_AR=19;PCR_454_RR=337\r
-20 24523782 . G A . . Sample=NA19921;GT=0/1;PCR_454_AR=933;PCR_454_RR=1005\r
-20 24523986 . C A . . Sample=HG00104;GT=0/1;PCR_454_AR=1056;PCR_454_RR=1346\r
-20 24954343 . G A . . Sample=NA19146;GT=0/1;PCR_454_AR=1208;PCR_454_RR=1132\r
-20 25058490 . T G . . Sample=NA11830;GT=0/0;PCR_454_AR=5;PCR_454_RR=1757\r
-20 25187224 . A G . . Sample=NA19137;GT=0/1;PCR_454_AR=69;PCR_454_RR=566\r
-20 25203611 . T C . . Sample=NA12006;GT=0/1;PCR_454_AR=1326;PCR_454_RR=1209\r
-20 25252066 . A G . . Sample=NA18637;GT=0/1;PCR_454_AR=1208;PCR_454_RR=1230\r
-20 25262768 . G A . . Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=920;PCR_454_RR=727\r
-20 25262768 . G A . . Sample=HG00106;GT=0/1;PCR_454_AR=733;PCR_454_RR=613\r
-20 25262768 . G A . . Sample=HG00112;GT=0/1;PCR_454_AR=756;PCR_454_RR=723\r
-20 25262768 . G A . . Sample=HG00130;GT=0/1;PCR_454_AR=854;PCR_454_RR=827\r
-20 25262768 . G A . . Sample=HG00152;GT=0/1;PCR_454_AR=798;PCR_454_RR=764\r
-20 25277132 . C T . . Sample=NA18861;GT=0/1;PCR_454_AR=415;PCR_454_RR=446\r
-20 25434162 . C T . . Sample=NA19346;GT=0/1;PCR_454_AR=566;PCR_454_RR=613\r
-20 25434162 . C T . . Sample=NA19395;GT=0/1;PCR_454_AR=504;PCR_454_RR=531\r
-20 25439088 . C T . . Sample=NA19095;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1220\r
-20 25439088 . C T . . Sample=NA19923;GT=0/1;PCR_454_AR=575;PCR_454_RR=834\r
-20 25457145 . G A . . Sample=NA12842;GT=0/1;PCR_454_AR=333;PCR_454_RR=438\r
-20 25457559 . G A . . Sample=NA19159;GT=0/1;PCR_454_AR=1225;PCR_454_RR=1285\r
-20 25457665 . C T . . Sample=NA20341;GT=0/1;PCR_454_AR=627;PCR_454_RR=1348\r
-20 25459659 . T C . . Sample=NA18647;GT=0/0;PCR_454_AR=5;PCR_454_RR=2809\r
-20 25459659 . T C . . Sample=NA18748;GT=0/0;PCR_454_AR=5;PCR_454_RR=2184\r
-20 25459659 . T C . . Sample=HG01274;GT=0/1;PCR_454_AR=1246;PCR_454_RR=1375\r
-20 25459659 . T C . . Sample=NA12275;GT=0/1;PCR_454_AR=1183;PCR_454_RR=1148\r
-20 25459659 . T C . . Sample=NA12718;GT=0/1;PCR_454_AR=1017;PCR_454_RR=1225\r
-20 25478961 . G A . . Sample=HG00104;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1933\r
-20 25478961 . G A . . Sample=HG00234;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1964\r
-20 25478961 . G A . . Sample=HG00364;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=1909\r
-20 25478961 . G A . . Sample=HG00593;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=2173\r
-20 25478961 . G A . . Sample=HG01271;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=2082\r
-20 30407977 . A G . . Sample=NA12287;GT=0/1;PCR_454_AR=1313;PCR_454_RR=1488\r
-20 30432438 . C T . . Sample=NA19352;GT=0/1;PCR_454_AR=1043;PCR_454_RR=964\r
-20 30432438 . C T . . Sample=NA19654;GT=0/1;PCR_454_AR=937;PCR_454_RR=1465\r
-20 30432570 . T C . . Sample=NA18510;GT=0/1;PCR_454_AR=1224;PCR_454_RR=1413\r
-20 30432570 . T C . . Sample=NA18858;GT=0/1;PCR_454_AR=1050;PCR_454_RR=1052\r
-20 30432570 . T C . . Sample=NA18868;GT=0/1;PCR_454_AR=1087;PCR_454_RR=966\r
-20 30432570 . T C . . Sample=NA18871;GT=0/1;PCR_454_AR=1178;PCR_454_RR=1344\r
-20 30432570 . T C . . Sample=NA18522;GT=1/1;PCR_454_AR=1873;PCR_454_RR=7\r
-20 30602754 . C T . . Sample=NA19749;GT=0/1;PCR_454_AR=63;PCR_454_RR=409\r
-20 30729618 . G A . . Sample=NA11994;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1866\r
-20 30729618 . G A . . Sample=NA07037;GT=0/1;PCR_454_AR=1373;PCR_454_RR=1435\r
-20 30729618 . G A . . Sample=NA12058;GT=0/1;PCR_454_AR=963;PCR_454_RR=990\r
-20 30729618 . G A . . Sample=NA12144;GT=0/1;PCR_454_AR=1419;PCR_454_RR=1136\r
-20 30729618 . G A . . Sample=NA12282;GT=0/1;PCR_454_AR=1353;PCR_454_RR=1148\r
-20 30789767 . G A . . Sample=HG00350;GT=0/0;PCR_454_AR=36;PCR_454_RR=553\r
-20 30897726 . G A . . Sample=NA20507;GT=0/0;PCR_454_AR=239;PCR_454_RR=2404\r
-20 30918043 . C T . . Sample=NA19707;GT=0/1;PCR_454_AR=1147;PCR_454_RR=1123\r
-20 30918043 . C T . . Sample=NA20775;GT=0/1;PCR_454_AR=1234;PCR_454_RR=1140\r
-20 31021429 . G C . . Sample=NA18870;GT=0/1;PCR_454_AR=747;PCR_454_RR=929\r
-20 31021429 . G C . . Sample=NA19319;GT=0/1;PCR_454_AR=585;PCR_454_RR=657\r
-20 31021429 . G C . . Sample=NA19445;GT=0/1;PCR_454_AR=531;PCR_454_RR=553\r
-20 31021429 . G C . . Sample=NA20127;GT=0/1;PCR_454_AR=661;PCR_454_RR=679\r
-20 31021429 . G C . . Sample=NA20317;GT=0/1;PCR_454_AR=874;PCR_454_RR=917\r
-20 31022764 . C T . . Sample=NA18498;GT=0/1;PCR_454_AR=1455;PCR_454_RR=1259\r
-20 31022764 . C T . . Sample=NA18507;GT=0/1;PCR_454_AR=1020;PCR_454_RR=972\r
-20 31022764 . C T . . Sample=NA18511;GT=0/1;PCR_454_AR=1339;PCR_454_RR=1297\r
-20 31022764 . C T . . Sample=NA18856;GT=0/1;PCR_454_AR=1582;PCR_454_RR=1572\r
-20 31022764 . C T . . Sample=NA18870;GT=0/1;PCR_454_AR=1642;PCR_454_RR=1613\r
-20 31024033 . G A . . Sample=HG01356;GT=0/1;PCR_454_AR=1045;PCR_454_RR=1002\r
-20 31024033 . G A . . Sample=NA18537;GT=0/1;PCR_454_AR=794;PCR_454_RR=788\r
-20 31024033 . G A . . Sample=NA18557;GT=0/1;PCR_454_AR=830;PCR_454_RR=795\r
-20 31024033 . G A . . Sample=NA18558;GT=0/1;PCR_454_AR=833;PCR_454_RR=878\r
-20 31024033 . G A . . Sample=NA18637;GT=1/1;PCR_454_AR=1528;PCR_454_RR=6\r
-20 31040782 . G A . . Sample=HG00097;GT=0/1;PCR_454_AR=978;PCR_454_RR=1231\r
-20 31040782 . G A . . Sample=HG00179;GT=0/1;PCR_454_AR=1054;PCR_454_RR=993\r
-20 31040782 . G A . . Sample=HG01620;GT=0/1;PCR_454_AR=1091;PCR_454_RR=1111\r
-20 31040782 . G A . . Sample=NA12273;GT=0/1;PCR_454_AR=1073;PCR_454_RR=1182\r
-20 31040782 . G A . . Sample=NA12341;GT=0/1;PCR_454_AR=1102;PCR_454_RR=1318\r
-20 31375167 . G A . . Sample=NA18486;GT=0/1;PCR_454_AR=563;PCR_454_RR=523\r
-20 31375167 . G A . . Sample=NA19113;GT=0/1;PCR_454_AR=628;PCR_454_RR=620\r
-20 31388076 . C T . . Sample=NA18504;GT=0/1;PCR_454_AR=809;PCR_454_RR=773\r
-20 31388076 . C T . . Sample=NA18519;GT=0/1;PCR_454_AR=683;PCR_454_RR=752\r
-20 31388076 . C T . . Sample=NA18856;GT=0/1;PCR_454_AR=1012;PCR_454_RR=1073\r
-20 31388076 . C T . . Sample=NA18917;GT=0/1;PCR_454_AR=888;PCR_454_RR=931\r
-20 31388076 . C T . . Sample=NA18522;GT=1/1;PCR_454_AR=1422;PCR_454_RR=2\r
-20 31424592 . C T . . Sample=NA19146;GT=0/1;PCR_454_AR=237;PCR_454_RR=257\r
-20 31434427 . A G . . Sample=NA11995;GT=0/1;PCR_454_AR=325;PCR_454_RR=325\r
-20 31604884 . A G . . Sample=NA12748;GT=0/1;PCR_454_AR=1098;PCR_454_RR=1153\r
-20 31606483 . G C . . Sample=NA18740;GT=0/1;PCR_454_AR=595;PCR_454_RR=964\r
-20 31606907 . G A . . Sample=NA19753;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1627\r
-20 31606907 . G A . . Sample=NA19747;GT=0/1;PCR_454_AR=952;PCR_454_RR=884\r
-20 31622899 . A G . . Sample=NA19038;GT=0/1;PCR_454_AR=196;PCR_454_RR=111\r
-20 31626754 . G A . . Sample=NA18579;GT=0/1;PCR_454_AR=941;PCR_454_RR=902\r
-20 31643241 . A C . . Sample=NA18622;GT=0/1;PCR_454_AR=832;PCR_454_RR=877\r
-20 31659074 . G A . . Sample=NA19449;GT=0/1;PCR_454_AR=915;PCR_454_RR=863\r
-20 31672711 . A G . . Sample=NA20754;GT=0/1;PCR_454_AR=762;PCR_454_RR=820\r
-20 31680333 . C T . . Sample=HG00156;GT=0/1;PCR_454_AR=446;PCR_454_RR=438\r
-20 31680333 . C T . . Sample=HG00235;GT=0/1;PCR_454_AR=525;PCR_454_RR=435\r
-20 31680333 . C T . . Sample=HG01125;GT=0/1;PCR_454_AR=433;PCR_454_RR=415\r
-20 31680333 . C T . . Sample=NA12043;GT=0/1;PCR_454_AR=559;PCR_454_RR=477\r
-20 31680333 . C T . . Sample=NA12046;GT=0/1;PCR_454_AR=364;PCR_454_RR=330\r
-20 31695565 . C T . . Sample=NA19054;GT=0/1;PCR_454_AR=988;PCR_454_RR=944\r
-20 31889182 . T C . . Sample=HG01277;GT=0/1;PCR_454_AR=594;PCR_454_RR=639\r
-20 31889182 . T C . . Sample=HG01278;GT=0/1;PCR_454_AR=533;PCR_454_RR=540\r
-20 31889182 . T C . . Sample=HG01623;GT=0/1;PCR_454_AR=703;PCR_454_RR=668\r
-20 31889182 . T C . . Sample=NA18487;GT=0/1;PCR_454_AR=644;PCR_454_RR=647\r
-20 31889182 . T C . . Sample=NA18486;GT=1/1;PCR_454_AR=1419;PCR_454_RR=15\r
-20 31890796 . G A . . Sample=NA18595;GT=0/1;PCR_454_AR=36;PCR_454_RR=49\r
-20 31967485 . T C . . Sample=NA18757;GT=0/0;PCR_454_AR=4;PCR_454_RR=1506\r
-20 32162066 . G C . . Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=98;PCR_454_RR=92\r
-20 32162066 . G C . . Sample=NA12282;GT=0/1;PCR_454_AR=72;PCR_454_RR=74\r
-20 32162066 . G C . . Sample=NA12342;GT=0/1;PCR_454_AR=105;PCR_454_RR=134\r
-20 32162066 . G C . . Sample=NA12778;GT=0/1;PCR_454_AR=94;PCR_454_RR=122\r
-20 32162066 . G C . . Sample=NA19773;GT=0/1;PCR_454_AR=84;PCR_454_RR=115\r
-20 32295637 . A G . . Sample=NA19204;GT=0/1;PCR_454_AR=1263;PCR_454_RR=1230\r
-20 32298533 . G A . . Sample=HG01125;GT=0/1;PCR_454_AR=1577;PCR_454_RR=1574\r
-20 32298533 . G A . . Sample=NA18510;GT=0/1;PCR_454_AR=1537;PCR_454_RR=1597\r
-20 32298533 . G A . . Sample=NA18520;GT=0/1;PCR_454_AR=1689;PCR_454_RR=1754\r
-20 32298533 . G A . . Sample=NA19099;GT=0/1;PCR_454_AR=1900;PCR_454_RR=1940\r
-20 32298533 . G A . . Sample=NA19129;GT=0/1;PCR_454_AR=1900;PCR_454_RR=1840\r
-20 32336754 . G A . . Sample=HG00358;GT=0/1;PCR_454_AR=1185;PCR_454_RR=1161\r
-20 32336754 . G A . . Sample=HG00565;GT=0/1;PCR_454_AR=1018;PCR_454_RR=958\r
-20 32336754 . G A . . Sample=HG00595;GT=0/1;PCR_454_AR=1201;PCR_454_RR=1222\r
-20 32336754 . G A . . Sample=NA18532;GT=0/1;PCR_454_AR=1204;PCR_454_RR=1235\r
-20 32336754 . G A . . Sample=NA18542;GT=1/1;PCR_454_AR=2997;PCR_454_RR=11\r
-20 32358043 . A T . . Sample=NA18955;GT=0/1;PCR_454_AR=1050;PCR_454_RR=1022\r
-20 32881901 . T C . . Sample=NA19257;GT=0/1;PCR_454_AR=1007;PCR_454_RR=966\r
-20 33328321 . C T . . Sample=NA18487;GT=0/1;PCR_454_AR=637;PCR_454_RR=629\r
-20 33328321 . C T . . Sample=NA18516;GT=0/1;PCR_454_AR=613;PCR_454_RR=605\r
-20 33328321 . C T . . Sample=NA19044;GT=0/1;PCR_454_AR=629;PCR_454_RR=661\r
-20 33328321 . C T . . Sample=NA19102;GT=0/1;PCR_454_AR=680;PCR_454_RR=625\r
-20 33328321 . C T . . Sample=NA19175;GT=0/1;PCR_454_AR=652;PCR_454_RR=703\r
-20 33330691 . C G . . Sample=NA19189;GT=0/1;PCR_454_AR=604;PCR_454_RR=575\r
-20 33433247 . G A . . Sample=NA11919;GT=0/1;PCR_454_AR=196;PCR_454_RR=195\r
-20 33447313 . C T . . Sample=HG01125;GT=0/1;PCR_454_AR=260;PCR_454_RR=285\r
-20 33447313 . C T . . Sample=NA18504;GT=0/1;PCR_454_AR=231;PCR_454_RR=217\r
-20 33447313 . C T . . Sample=NA18517;GT=0/1;PCR_454_AR=298;PCR_454_RR=311\r
-20 33447313 . C T . . Sample=NA18520;GT=0/1;PCR_454_AR=254;PCR_454_RR=256\r
-20 33447313 . C T . . Sample=NA18522;GT=0/1;PCR_454_AR=286;PCR_454_RR=277\r
-20 33517251 . C T . . Sample=HG00126;GT=0/1;PCR_454_AR=685;PCR_454_RR=676\r
-20 33517301 . G A . . Sample=NA20282;GT=0/1;PCR_454_AR=1082;PCR_454_RR=1076\r
-20 33523396 . A C . . Sample=NA18910;GT=0/1;PCR_454_AR=879;PCR_454_RR=933\r
-20 33572880 . C T . . Sample=NA20516;GT=0/1;PCR_454_AR=935;PCR_454_RR=847\r
-20 33575007 . C T . . Sample=NA19118;GT=0/1;PCR_454_AR=793;PCR_454_RR=659\r
-20 33575043 . C T . . Sample=NA19036;GT=0/1;PCR_454_AR=972;PCR_454_RR=919\r
-20 33575043 . C T . . Sample=NA19308;GT=0/1;PCR_454_AR=801;PCR_454_RR=728\r
-20 33575043 . C T . . Sample=NA19434;GT=0/1;PCR_454_AR=825;PCR_454_RR=915\r
-20 33575043 . C T . . Sample=NA19439;GT=0/1;PCR_454_AR=1001;PCR_454_RR=1073\r
-20 33575043 . C T . . Sample=NA19466;GT=0/1;PCR_454_AR=936;PCR_454_RR=931\r
-20 33583330 . A G . . Sample=HG00097;GT=1/1;PCR_454_AR=651;PCR_454_RR=5\r
-20 33583330 . A G . . Sample=HG00099;GT=1/1;PCR_454_AR=326;PCR_454_RR=0\r
-20 33583330 . A G . . Sample=HG00104;GT=1/1;PCR_454_AR=430;PCR_454_RR=2\r
-20 33583330 . A G . . Sample=HG00106;GT=1/1;PCR_454_AR=613;PCR_454_RR=3\r
-20 33583330 . A G . . Sample=HG00112;GT=1/1;PCR_454_AR=632;PCR_454_RR=6\r
-20 33584196 . C T . . Sample=NA12286;GT=0/1;PCR_454_AR=989;PCR_454_RR=1638\r
-20 33584196 . C T . . Sample=NA12750;GT=0/1;PCR_454_AR=886;PCR_454_RR=1206\r
-20 33584196 . C T . . Sample=NA19750;GT=0/1;PCR_454_AR=1179;PCR_454_RR=1155\r
-20 33584196 . C T . . Sample=NA20807;GT=0/1;PCR_454_AR=1089;PCR_454_RR=1724\r
-20 33584196 . C T . . Sample=NA20826;GT=0/1;PCR_454_AR=1373;PCR_454_RR=1259\r
-20 33587399 . G A . . Sample=NA19328;GT=0/1;PCR_454_AR=893;PCR_454_RR=754\r
-20 33711732 . T A . . Sample=NA19347;GT=0/1;PCR_454_AR=887;PCR_454_RR=946\r
-20 33874473 . C A . . Sample=NA18626;GT=0/1;PCR_454_AR=1001;PCR_454_RR=1012\r
-20 33874719 . C T . . Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=585;PCR_454_RR=542\r
-20 33874719 . C T . . Sample=HG00141;GT=0/1;PCR_454_AR=499;PCR_454_RR=508\r
-20 33874719 . C T . . Sample=HG00142;GT=0/1;PCR_454_AR=541;PCR_454_RR=540\r
-20 33874719 . C T . . Sample=HG00143;GT=0/1;PCR_454_AR=699;PCR_454_RR=604\r
-20 33874719 . C T . . Sample=HG00156;GT=0/1;PCR_454_AR=722;PCR_454_RR=617\r
-20 34092317 . C A . . Sample=HG00128;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1205\r
-20 34092317 . C A . . Sample=HG00266;GT=0/0;PCR_454_AR=3;PCR_454_RR=3354\r
-20 34218898 . A G . . Sample=NA12763;GT=0/1;PCR_454_AR=295;PCR_454_RR=291\r
-20 34292440 . T C . . Sample=NA18639;GT=0/1;PCR_454_AR=481;PCR_454_RR=572\r
-20 34317286 . G A . . Sample=NA19204;GT=0/1;PCR_454_AR=665;PCR_454_RR=705\r
-20 34611604 . C T . . Sample=NA11893;GT=0/1;PCR_454_AR=1180;PCR_454_RR=1243\r
-20 35060852 . G A . . Sample=NA12283;GT=0/1;PCR_454_AR=433;PCR_454_RR=444\r
-20 35060852 . G A . . Sample=NA19676;GT=0/1;PCR_454_AR=368;PCR_454_RR=421\r
-20 35068262 . A C . . Sample=NA20759;GT=0/1;PCR_454_AR=1272;PCR_454_RR=1190\r
-20 35075140 . C T . . Sample=NA19444;GT=0/1;PCR_454_AR=1174;PCR_454_RR=605\r
-20 35075140 . C T . . Sample=NA19448;GT=0/1;PCR_454_AR=1574;PCR_454_RR=932\r
-20 35075309 . G A . . Sample=NA18549;GT=0/1;PCR_454_AR=923;PCR_454_RR=1559\r
-20 35075309 . G A . . Sample=NA19391;GT=0/1;PCR_454_AR=1114;PCR_454_RR=1064\r
-20 35075309 . G A . . Sample=NA19397;GT=0/1;PCR_454_AR=1198;PCR_454_RR=1233\r
-20 35176551 . A G . . Sample=NA20289;GT=0/1;PCR_454_AR=532;PCR_454_RR=1682\r
-20 35207263 . G A . . Sample=HG00234;GT=0/1;PCR_454_AR=235;PCR_454_RR=221\r
-20 35219406 . G C . . Sample=HG00105;GT=0/0;PCR_454_AR=57;PCR_454_RR=585\r
-20 35219406 . G C . . Sample=HG00130;GT=0/0;PCR_454_AR=58;PCR_454_RR=574\r
-20 35438474 . G A . . Sample=NA18642;GT=0/1;PCR_454_AR=1030;PCR_454_RR=1093\r
-20 35507540 . G A . . Sample=NA19740;GT=0/1;PCR_454_AR=466;PCR_454_RR=584\r
-20 35539699 . T C . . Sample=NA12717;GT=0/1;PCR_454_AR=336;PCR_454_RR=421\r
-20 35812756 . C T . . Sample=NA19726;GT=0/1;PCR_454_AR=1085;PCR_454_RR=1070\r
-20 35944759 . A C . . Sample=NA11831;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1726\r
-20 35944759 . A C . . Sample=NA11832;GT=0/0;PCR_454_AR=3;PCR_454_RR=1809\r
-20 36024598 . C T . . Sample=NA19682;GT=0/1;PCR_454_AR=677;PCR_454_RR=797\r
-20 36024598 . C T . . Sample=NA20528;GT=0/1;PCR_454_AR=691;PCR_454_RR=703\r
-20 36030944 . T C . . Sample=NA18618;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=985\r
-20 36030944 . T C . . Sample=NA18626;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=778\r
-20 36030944 . T C . . Sample=NA18916;GT=0/1;PCR_454_AR=454;PCR_454_RR=444\r
-20 36030944 . T C . . Sample=NA19150;GT=0/1;PCR_454_AR=471;PCR_454_RR=509\r
-20 36488331 . A G . . Sample=NA20340;GT=0/1;PCR_454_AR=1388;PCR_454_RR=1472\r
-20 36640610 . C G . . Sample=NA18508;GT=0/1;PCR_454_AR=985;PCR_454_RR=1026\r
-20 36641870 . G A . . Sample=HG00106;GT=0/1;PCR_454_AR=1062;PCR_454_RR=1095\r
-20 36641870 . G A . . Sample=NA11893;GT=0/1;PCR_454_AR=976;PCR_454_RR=1033\r
-20 36641870 . G A . . Sample=NA12399;GT=0/1;PCR_454_AR=971;PCR_454_RR=973\r
-20 36641870 . G A . . Sample=NA12489;GT=0/1;PCR_454_AR=1107;PCR_454_RR=1037\r
-20 36641870 . G A . . Sample=NA12749;GT=0/1;PCR_454_AR=947;PCR_454_RR=885\r
-20 36775155 . A G . . Sample=NA19067;GT=0/1;PCR_454_AR=771;PCR_454_RR=772\r
-20 36775233 . G A . . Sample=NA19352;GT=0/1;PCR_454_AR=732;PCR_454_RR=723\r
-20 36784261 . G A . . Sample=NA19171;GT=0/1;PCR_454_AR=1197;PCR_454_RR=1200\r
-20 36841848 . C T . . Sample=NA19449;GT=0/1;PCR_454_AR=402;PCR_454_RR=394\r
-20 36869075 . G A . . Sample=NA19185;GT=0/1;PCR_454_AR=1430;PCR_454_RR=1382\r
-20 36869206 . C T . . Sample=NA20287;GT=0/1;PCR_454_AR=584;PCR_454_RR=626\r
-20 36979308 . T A . . Sample=NA11894;GT=0/1;PCR_454_AR=973;PCR_454_RR=1087\r
-20 37001736 . C T . . Sample=NA18987;GT=0/1;PCR_454_AR=122;PCR_454_RR=88\r
-20 39798902 . C T . . Sample=NA18994;GT=0/1;PCR_454_AR=1212;PCR_454_RR=1202\r
-20 39981307 . G T . . Sample=NA18595;GT=0/1;PCR_454_AR=1273;PCR_454_RR=1102\r
-20 39981307 . G T . . Sample=NA18622;GT=0/1;PCR_454_AR=635;PCR_454_RR=623\r
-20 39981307 . G T . . Sample=NA18977;GT=0/1;PCR_454_AR=1251;PCR_454_RR=1141\r
-20 39981307 . G T . . Sample=NA18978;GT=0/1;PCR_454_AR=1286;PCR_454_RR=1331\r
-20 39981307 . G T . . Sample=NA18998;GT=0/1;PCR_454_AR=1174;PCR_454_RR=1225\r
-20 39986913 . G A . . Sample=NA20317;GT=0/1;PCR_454_AR=627;PCR_454_RR=535\r
-20 39987386 . G A . . Sample=NA19437;GT=0/1;PCR_454_AR=989;PCR_454_RR=971\r
-20 39992390 . G A . . Sample=NA18636;GT=0/1;PCR_454_AR=925;PCR_454_RR=969\r
-20 39993723 . C T . . Sample=NA18489;GT=0/1;PCR_454_AR=677;PCR_454_RR=819\r
-20 39993723 . C T . . Sample=NA18505;GT=0/1;PCR_454_AR=603;PCR_454_RR=578\r
-20 39993723 . C T . . Sample=NA18517;GT=0/1;PCR_454_AR=791;PCR_454_RR=747\r
-20 39993723 . C T . . Sample=NA19380;GT=0/1;PCR_454_AR=869;PCR_454_RR=972\r
-20 39993790 . G A . . Sample=NA18871;GT=0/1;PCR_454_AR=2297;PCR_454_RR=2512\r
-20 40033848 . A G . . Sample=HG00559;GT=0/0;PCR_454_AR=6;PCR_454_RR=2130\r
-20 40050233 . T G . . Sample=HG01133;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=1613\r
-20 40050233 . T G . . Sample=NA18502;GT=0/0;PCR_454_AR=4;PCR_454_RR=1967\r
-20 40162202 . T C . . Sample=NA12874;GT=0/1;PCR_454_AR=171;PCR_454_RR=157\r
-20 42143783 . A G . . Sample=NA20334;GT=0/1;PCR_454_AR=1011;PCR_454_RR=632\r
-20 42143783 . A G . . Sample=NA20336;GT=0/1;PCR_454_AR=1556;PCR_454_RR=492\r
-20 42196587 . G A . . Sample=NA19312;GT=0/1;PCR_454_AR=522;PCR_454_RR=486\r
-20 42196587 . G A . . Sample=NA19383;GT=0/1;PCR_454_AR=693;PCR_454_RR=821\r
-20 42333997 . C T . . Sample=NA19058;GT=0/1;PCR_454_AR=994;PCR_454_RR=994\r
-20 42680115 . G A . . Sample=NA18611;GT=0/1;PCR_454_AR=1042;PCR_454_RR=1086\r
-20 42747246 . C T . . Sample=HG00097;GT=0/1;PCR_454_AR=1132;PCR_454_RR=1174\r
-20 42747246 . C T . . Sample=HG00106;GT=0/1;PCR_454_AR=899;PCR_454_RR=983\r
-20 42747246 . C T . . Sample=HG00112;GT=0/1;PCR_454_AR=901;PCR_454_RR=960\r
-20 42747246 . C T . . Sample=HG00135;GT=0/1;PCR_454_AR=677;PCR_454_RR=680\r
-20 42747246 . C T . . Sample=HG00142;GT=0/1;PCR_454_AR=928;PCR_454_RR=956\r
-20 42939738 . C T . . Sample=NA18611;GT=0/1;PCR_454_AR=1131;PCR_454_RR=984\r
-20 43243299 . G C . . Sample=NA18633;GT=0/1;PCR_454_AR=1194;PCR_454_RR=1277\r
-20 43255152 . G A . . Sample=HG00130;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=2287\r
-20 43255152 . G A . . Sample=HG00234;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=2172\r
-20 43255152 . G A . . Sample=NA18618;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=2266\r
-20 43255152 . G A . . Sample=NA18956;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=2152\r
-20 43255152 . G A . . Sample=NA19083;GT=0/1;PCR_454_AR=986;PCR_454_RR=974\r
-20 43723672 . G A . . Sample=NA18530;GT=0/1;PCR_454_AR=356;PCR_454_RR=401\r
-20 43723672 . G A . . Sample=NA18622;GT=0/1;PCR_454_AR=449;PCR_454_RR=391\r
-20 43739354 . G A . . Sample=NA18504;GT=0/1;PCR_454_AR=455;PCR_454_RR=1477\r
-20 43934213 . G T . . Sample=HG01345;GT=0/1;PCR_454_AR=1327;PCR_454_RR=1169\r
-20 44190750 . T G . . Sample=HG00143;GT=0/1;PCR_454_AR=898;PCR_454_RR=938\r
-20 44190750 . T G . . Sample=NA12340;GT=0/1;PCR_454_AR=882;PCR_454_RR=872\r
-20 44424037 . G A . . Sample=HG00152;GT=0/1;PCR_454_AR=603;PCR_454_RR=593\r
-20 44469565 . C T . . Sample=NA18549;GT=0/1;PCR_454_AR=999;PCR_454_RR=246\r
-20 44485866 . T A . . Sample=NA12890;GT=0/1;PCR_454_AR=536;PCR_454_RR=596\r
-20 44506417 . G A . . Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=1320;PCR_454_RR=1305\r
-20 44506417 . G A . . Sample=HG00118;GT=0/1;PCR_454_AR=1559;PCR_454_RR=1533\r
-20 44506417 . G A . . Sample=HG00097;GT=1/1;PCR_454_AR=3211;PCR_454_RR=20\r
-20 44506417 . G A . . Sample=HG00112;GT=1/1;PCR_454_AR=2632;PCR_454_RR=20\r
-20 44506417 . G A . . Sample=HG00122;GT=1/1;PCR_454_AR=2875;PCR_454_RR=6\r
-20 44506987 . G C . . Sample=NA19117;GT=0/1;PCR_454_AR=1387;PCR_454_RR=1532\r
-20 44511253 . C T . . Sample=NA20799;GT=0/1;PCR_454_AR=1286;PCR_454_RR=1280\r
-20 44519372 . G A . . Sample=NA19437;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=2075\r
-20 44519372 . G A . . Sample=NA19917;GT=0/1;PCR_454_AR=1243;PCR_454_RR=1234\r
-20 44576246 . G A . . Sample=NA18912;GT=0/1;PCR_454_AR=458;PCR_454_RR=2154\r
-20 44576246 . G A . . Sample=NA18924;GT=0/1;PCR_454_AR=1131;PCR_454_RR=1078\r
-20 44576246 . G A . . Sample=NA20276;GT=0/1;PCR_454_AR=860;PCR_454_RR=852\r
-20 44576246 . G A . . Sample=NA20289;GT=0/1;PCR_454_AR=492;PCR_454_RR=2174\r
-20 44580998 . T C . . Sample=NA18566;GT=0/1;PCR_454_AR=877;PCR_454_RR=925\r
-20 44680318 . C G . . Sample=HG00592;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=3602\r
-20 44680318 . C G . . Sample=HG01139;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=3510\r
-20 44856207 . G A . . Sample=NA11995;GT=0/1;PCR_454_AR=127;PCR_454_RR=17\r
-20 44980779 . G A . . Sample=NA18553;GT=0/1;PCR_454_AR=993;PCR_454_RR=1022\r
-20 45919012 . C T . . Sample=NA19445;GT=0/1;PCR_454_AR=265;PCR_454_RR=525\r
-20 46271051 . C G . . Sample=NA18486;GT=0/1;PCR_454_AR=754;PCR_454_RR=749\r
-20 47262594 . C A . . Sample=NA20291;GT=0/1;PCR_454_AR=1210;PCR_454_RR=1153\r
-20 47558430 . C T . . Sample=NA20296;GT=0/1;PCR_454_AR=699;PCR_454_RR=682\r
-20 47733688 . T C . . Sample=NA18630;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=806\r
-20 47739668 . G A . . Sample=NA19036;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=2292\r
-20 47886859 . C T . . Sample=NA18956;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=2153\r
-20 47990798 . C G . . Sample=HG00105;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=387\r
-20 47990798 . C G . . Sample=HG00122;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=534\r
-20 48124475 . C T . . Sample=NA19257;GT=0/1;PCR_454_AR=628;PCR_454_RR=644\r
-20 48273201 . A C . . Sample=NA19914;GT=0/1;PCR_454_AR=338;PCR_454_RR=323\r
-20 48713355 . T C . . Sample=NA12155;GT=0/0;PCR_454_AR=8;PCR_454_RR=1686\r
-20 48713355 . T C . . Sample=NA12815;GT=0/0;PCR_454_AR=10;PCR_454_RR=1607\r
-20 49218698 . C T . . Sample=NA19338;GT=0/1;PCR_454_AR=776;PCR_454_RR=682\r
-20 49218698 . C T . . Sample=NA19457;GT=0/1;PCR_454_AR=803;PCR_454_RR=759\r
-20 49219065 . C T . . Sample=NA18599;GT=0/1;PCR_454_AR=1018;PCR_454_RR=1080\r
-20 49354597 . A G . . Sample=HG00177;GT=0/1;PCR_454_AR=580;PCR_454_RR=617\r
-20 49354597 . A G . . Sample=NA11829;GT=0/1;PCR_454_AR=778;PCR_454_RR=869\r
-20 49354597 . A G . . Sample=NA20510;GT=0/1;PCR_454_AR=518;PCR_454_RR=631\r
-20 49354597 . A G . . Sample=NA20512;GT=0/1;PCR_454_AR=238;PCR_454_RR=333\r
-20 49354597 . A G . . Sample=NA20586;GT=0/1;PCR_454_AR=562;PCR_454_RR=642\r
-20 50048925 . G C . . Sample=NA20507;GT=0/1;PCR_454_AR=774;PCR_454_RR=809\r
-20 50051804 . C T . . Sample=NA19102;GT=0/1;PCR_454_AR=136;PCR_454_RR=155\r
-20 50071136 . C T . . Sample=NA18637;GT=0/1;PCR_454_AR=334;PCR_454_RR=349\r
-20 50140178 . G A . . Sample=NA18924;GT=0/1;PCR_454_AR=540;PCR_454_RR=481\r
-20 50140178 . G A . . Sample=NA19321;GT=0/1;PCR_454_AR=481;PCR_454_RR=652\r
-20 50235576 . G A . . Sample=HG00106;GT=0/1;PCR_454_AR=982;PCR_454_RR=886\r
-20 50235576 . G A . . Sample=HG00122;GT=0/1;PCR_454_AR=838;PCR_454_RR=717\r
-20 50235576 . G A . . Sample=HG00126;GT=0/1;PCR_454_AR=795;PCR_454_RR=769\r
-20 50235576 . G A . . Sample=HG00135;GT=0/1;PCR_454_AR=972;PCR_454_RR=930\r
-20 50235576 . G A . . Sample=HG00148;GT=0/1;PCR_454_AR=933;PCR_454_RR=931\r
-20 50310567 . C T . . Sample=NA19152;GT=0/1;PCR_454_AR=689;PCR_454_RR=773\r
-20 50310567 . C T . . Sample=NA19377;GT=0/1;PCR_454_AR=736;PCR_454_RR=683\r
-20 50406859 . G A . . Sample=NA19921;GT=0/1;PCR_454_AR=1045;PCR_454_RR=930\r
-20 50407501 . A C . . Sample=HG00118;GT=0/1;PCR_454_AR=569;PCR_454_RR=608\r
-20 50407508 . C T . . Sample=NA20534;GT=0/1;PCR_454_AR=753;PCR_454_RR=2120\r
-20 50408613 . A G . . Sample=NA18487;GT=0/1;PCR_454_AR=637;PCR_454_RR=634\r
-20 50408613 . A G . . Sample=NA18502;GT=0/1;PCR_454_AR=561;PCR_454_RR=553\r
-20 50408613 . A G . . Sample=NA18519;GT=0/1;PCR_454_AR=571;PCR_454_RR=554\r
-20 50408613 . A G . . Sample=NA18908;GT=0/1;PCR_454_AR=731;PCR_454_RR=791\r
-20 50408613 . A G . . Sample=NA18909;GT=0/1;PCR_454_AR=683;PCR_454_RR=634\r
-20 50803476 . G A . . Sample=NA19046;GT=0/1;PCR_454_AR=692;PCR_454_RR=685\r
-20 50803476 . G A . . Sample=NA19375;GT=0/1;PCR_454_AR=735;PCR_454_RR=803\r
-20 50803476 . G A . . Sample=NA19376;GT=0/1;PCR_454_AR=892;PCR_454_RR=831\r
-20 51872037 . G A . . Sample=NA18502;GT=0/1;PCR_454_AR=602;PCR_454_RR=654\r
-20 51872037 . G A . . Sample=NA18504;GT=0/1;PCR_454_AR=717;PCR_454_RR=760\r
-20 51872037 . G A . . Sample=NA18507;GT=0/1;PCR_454_AR=790;PCR_454_RR=822\r
-20 51872037 . G A . . Sample=NA18508;GT=0/1;PCR_454_AR=868;PCR_454_RR=914\r
-20 51872037 . G A . . Sample=NA18501;GT=1/1;PCR_454_AR=1687;PCR_454_RR=5\r
-20 52192483 . T C . . Sample=HG00266;GT=0/1;PCR_454_AR=1044;PCR_454_RR=1029\r
-20 52198279 . G A . . Sample=NA19065;GT=0/1;PCR_454_AR=1001;PCR_454_RR=1070\r
-20 52561468 . A G . . Sample=HG00118;GT=0/1;PCR_454_AR=398;PCR_454_RR=501\r
-20 52561468 . A G . . Sample=HG00126;GT=0/1;PCR_454_AR=228;PCR_454_RR=250\r
-20 52561468 . A G . . Sample=HG00130;GT=0/1;PCR_454_AR=472;PCR_454_RR=535\r
-20 52561468 . A G . . Sample=HG00134;GT=0/1;PCR_454_AR=462;PCR_454_RR=543\r
-20 52561468 . A G . . Sample=HG00143;GT=0/1;PCR_454_AR=355;PCR_454_RR=404\r
-20 52779394 . G T . . Sample=NA20540;GT=0/1;PCR_454_AR=470;PCR_454_RR=557\r
-20 53205268 . T C . . Sample=NA19038;GT=0/1;PCR_454_AR=447;PCR_454_RR=421\r
-20 53226967 . G A . . Sample=NA19462;GT=0/1;PCR_454_AR=770;PCR_454_RR=792\r
-20 54961540 . A T . . Sample=HG00106;GT=0/1;PCR_454_AR=457;PCR_454_RR=411\r
-20 54961540 . A T . . Sample=HG00112;GT=0/1;PCR_454_AR=466;PCR_454_RR=483\r
-20 54961540 . A T . . Sample=HG00134;GT=0/1;PCR_454_AR=480;PCR_454_RR=467\r
-20 54961540 . A T . . Sample=HG00143;GT=0/1;PCR_454_AR=522;PCR_454_RR=458\r
-20 54961540 . A T . . Sample=HG00097;GT=1/1;PCR_454_AR=937;PCR_454_RR=4\r
-20 54970682 . C T . . Sample=NA18912;GT=0/1;PCR_454_AR=683;PCR_454_RR=745\r
-20 54970682 . C T . . Sample=NA19171;GT=0/1;PCR_454_AR=819;PCR_454_RR=792\r
-20 55021021 . G A . . Sample=NA19087;GT=0/1;PCR_454_AR=1018;PCR_454_RR=1144\r
-20 55108414 . G A . . Sample=NA20756;GT=1/1;PCR_454_AR=1220;PCR_454_RR=3\r
-20 55206884 . C T . . Sample=NA19726;GT=0/1;PCR_454_AR=806;PCR_454_RR=864\r
-20 55206884 . C T . . Sample=NA19738;GT=0/1;PCR_454_AR=988;PCR_454_RR=1033\r
-20 56087684 . C T . . Sample=NA18599;GT=0/1;PCR_454_AR=1158;PCR_454_RR=1234\r
-20 56089789 . C T . . Sample=HG01277;GT=0/1;PCR_454_AR=737;PCR_454_RR=779\r
-20 56137833 . A G . . Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=794;PCR_454_RR=777\r
-20 56137833 . A G . . Sample=HG00106;GT=0/1;PCR_454_AR=1272;PCR_454_RR=1196\r
-20 56137833 . A G . . Sample=HG00097;GT=1/1;PCR_454_AR=1763;PCR_454_RR=4\r
-20 56137833 . A G . . Sample=HG00104;GT=1/1;PCR_454_AR=1726;PCR_454_RR=5\r
-20 56137833 . A G . . Sample=HG00112;GT=1/1;PCR_454_AR=1821;PCR_454_RR=3\r
-20 57036354 . C T . . Sample=NA19080;GT=0/1;PCR_454_AR=1722;PCR_454_RR=1581\r
-20 57036538 . C T . . Sample=NA19248;GT=0/1;PCR_454_AR=1224;PCR_454_RR=902\r
-20 57415535 . C T . . Sample=NA19722;GT=0/1;PCR_454_AR=291;PCR_454_RR=1503\r
-20 57415601 . G A . . Sample=NA20296;GT=0/1;PCR_454_AR=1262;PCR_454_RR=350\r
-20 57428947 . G T . . Sample=NA19311;GT=0/1;PCR_454_AR=1304;PCR_454_RR=553\r
-20 57572729 . C T . . Sample=NA19707;GT=0/1;PCR_454_AR=840;PCR_454_RR=1015\r
-20 57576684 . T G . . Sample=NA18747;GT=0/0;PCR_454_AR=3;PCR_454_RR=1578\r
-20 57597952 . C T . . Sample=NA20529;GT=0/1;PCR_454_AR=816;PCR_454_RR=883\r
-20 57768304 . G A . . Sample=NA20818;GT=0/1;PCR_454_AR=710;PCR_454_RR=535\r
-20 57769546 . C T . . Sample=NA18917;GT=0/0;PCR_454_AR=61;PCR_454_RR=810\r
-20 57769738 . A G . . Sample=NA18527;GT=0/1;PCR_454_AR=799;PCR_454_RR=792\r
-20 57769738 . A G . . Sample=NA18530;GT=0/1;PCR_454_AR=558;PCR_454_RR=527\r
-20 57769738 . A G . . Sample=NA18532;GT=0/1;PCR_454_AR=734;PCR_454_RR=719\r
-20 57769738 . A G . . Sample=NA18545;GT=0/1;PCR_454_AR=524;PCR_454_RR=502\r
-20 57769738 . A G . . Sample=NA18593;GT=0/1;PCR_454_AR=809;PCR_454_RR=835\r
-20 58444902 . C T . . Sample=NA19095;GT=0/1;PCR_454_AR=164;PCR_454_RR=144\r
-20 58467100 . C T . . Sample=NA19324;GT=0/1;PCR_454_AR=312;PCR_454_RR=301\r
-20 58560056 . C T . . Sample=HG00593;GT=0/1;PCR_454_AR=1491;PCR_454_RR=1378\r
-20 58560056 . C T . . Sample=NA18553;GT=0/1;PCR_454_AR=1226;PCR_454_RR=1216\r
-20 58564005 . G A . . Sample=NA19355;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=2602\r
-20 58567458 . A C . . Sample=HG00143;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=878\r
-20 58567458 . A C . . Sample=HG00149;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=883\r
-20 58571705 . C T . . Sample=NA19319;GT=0/1;PCR_454_AR=342;PCR_454_RR=265\r
-20 60504808 . C T . . Sample=NA18639;GT=0/1;PCR_454_AR=1079;PCR_454_RR=1027\r
-20 60504808 . C T . . Sample=NA19921;GT=0/1;PCR_454_AR=914;PCR_454_RR=890\r
-20 60701482 . T A . . Sample=NA19651;GT=0/1;PCR_454_AR=540;PCR_454_RR=612\r
-20 60708462 . T C . . Sample=NA18962;GT=0/1;PCR_454_AR=891;PCR_454_RR=784\r
-20 60738559 . G A . . Sample=NA18965;GT=0/1;PCR_454_AR=1072;PCR_454_RR=896\r
-20 60838713 . C T . . Sample=NA20506;GT=0/1;PCR_454_AR=618;PCR_454_RR=642\r
-20 60866830 . A C . . Sample=NA18923;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=211\r
-20 60868936 . C T . . Sample=NA19119;GT=0/1;PCR_454_AR=1424;PCR_454_RR=1554\r
-20 60878814 . G A . . Sample=NA18638;GT=0/1;PCR_454_AR=223;PCR_454_RR=1299\r
-20 60884465 . G A . . Sample=NA19681;GT=0/1;PCR_454_AR=928;PCR_454_RR=1002\r
-20 60885810 . C T . . Sample=HG00134;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=2017\r
-20 60885810 . C T . . Sample=HG00350;GT=0/0;PCR_454_AR=4;PCR_454_RR=1963\r
-20 60886712 . T C . . Sample=NA19438;GT=0/1;PCR_454_AR=929;PCR_454_RR=721\r
-20 60891010 . C T . . Sample=NA19700;GT=0/1;PCR_454_AR=334;PCR_454_RR=389\r
-20 60893610 . C T . . Sample=HG00359;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=2041\r
-20 60893610 . C T . . Sample=NA19758;GT=0/1;PCR_454_AR=1173;PCR_454_RR=1158\r
-20 60893636 . C T . . Sample=NA20520;GT=0/1;PCR_454_AR=847;PCR_454_RR=1197\r
-20 60893636 . C T . . Sample=NA20540;GT=0/1;PCR_454_AR=776;PCR_454_RR=1355\r
-20 60893960 . C T . . Sample=NA19236;GT=0/1;PCR_454_AR=1310;PCR_454_RR=1388\r
-20 60897486 . C T . . Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=454;PCR_454_RR=403\r
-20 60897486 . C T . . Sample=HG00122;GT=0/1;PCR_454_AR=465;PCR_454_RR=352\r
-20 60897486 . C T . . Sample=HG00097;GT=1/1;PCR_454_AR=849;PCR_454_RR=3\r
-20 60897486 . C T . . Sample=HG00104;GT=1/1;PCR_454_AR=925;PCR_454_RR=4\r
-20 60897486 . C T . . Sample=HG00118;GT=1/1;PCR_454_AR=799;PCR_454_RR=7\r
-20 60907674 . G A . . Sample=HG00104;GT=0/1;PCR_454_AR=279;PCR_454_RR=228\r
-20 60907674 . G A . . Sample=HG00106;GT=0/1;PCR_454_AR=334;PCR_454_RR=295\r
-20 60907674 . G A . . Sample=HG00097;GT=1/1;PCR_454_AR=739;PCR_454_RR=4\r
-20 60907674 . G A . . Sample=HG00099;GT=1/1;PCR_454_AR=395;PCR_454_RR=3\r
-20 60907674 . G A . . Sample=HG00112;GT=1/1;PCR_454_AR=980;PCR_454_RR=6\r
-20 60911433 . A C . . Sample=NA11920;GT=0/1;PCR_454_AR=341;PCR_454_RR=380\r
-20 60911433 . A C . . Sample=NA20278;GT=0/1;PCR_454_AR=398;PCR_454_RR=444\r
-20 60913173 . C T . . Sample=NA18522;GT=0/1;PCR_454_AR=1062;PCR_454_RR=1032\r
-20 60920914 . T C . . Sample=NA18530;GT=0/1;PCR_454_AR=937;PCR_454_RR=877\r
-20 60920914 . T C . . Sample=NA18873;GT=0/1;PCR_454_AR=791;PCR_454_RR=836\r
-20 60920914 . T C . . Sample=NA19038;GT=0/1;PCR_454_AR=895;PCR_454_RR=857\r
-20 60920914 . T C . . Sample=NA19099;GT=0/1;PCR_454_AR=1115;PCR_454_RR=1150\r
-20 60920914 . T C . . Sample=NA19317;GT=0/1;PCR_454_AR=1165;PCR_454_RR=1206\r
-20 60927411 . G A . . Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=330;PCR_454_RR=345\r
-20 60927411 . G A . . Sample=HG00112;GT=0/1;PCR_454_AR=389;PCR_454_RR=468\r
-20 60927411 . G A . . Sample=HG00118;GT=0/1;PCR_454_AR=1434;PCR_454_RR=538\r
-20 60927411 . G A . . Sample=HG00097;GT=1/1;PCR_454_AR=993;PCR_454_RR=7\r
-20 60927411 . G A . . Sample=HG00104;GT=1/1;PCR_454_AR=837;PCR_454_RR=8\r
-20 60937543 . A G . . Sample=HG00115;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=3444\r
-20 60963387 . C T . . Sample=NA18992;GT=0/1;PCR_454_AR=689;PCR_454_RR=728\r
-20 60986026 . T C . . Sample=NA18511;GT=0/1;PCR_454_AR=510;PCR_454_RR=522\r
-20 60986026 . T C . . Sample=NA18520;GT=0/1;PCR_454_AR=384;PCR_454_RR=403\r
-20 60986026 . T C . . Sample=NA18861;GT=0/1;PCR_454_AR=372;PCR_454_RR=432\r
-20 60986026 . T C . . Sample=NA18908;GT=0/1;PCR_454_AR=428;PCR_454_RR=386\r
-20 60989186 . G T . . Sample=HG00351;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=299\r
-20 60989186 . G T . . Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=1182;PCR_454_RR=966\r
-20 60989186 . G T . . Sample=HG01344;GT=0/1;PCR_454_AR=654;PCR_454_RR=302\r
-20 60989186 . G T . . Sample=NA12045;GT=0/1;PCR_454_AR=504;PCR_454_RR=534\r
-20 60989186 . G T . . Sample=HG00130;GT=1/1;PCR_454_AR=76;PCR_454_RR=2\r
-20 60992370 . C T . . Sample=NA18917;GT=0/1;PCR_454_AR=598;PCR_454_RR=363\r
-20 60992370 . C T . . Sample=NA19453;GT=0/1;PCR_454_AR=541;PCR_454_RR=677\r
-20 61288592 . G A . . Sample=HG01625;GT=0/1;PCR_454_AR=852;PCR_454_RR=871\r
-20 61288592 . G A . . Sample=NA12383;GT=0/1;PCR_454_AR=794;PCR_454_RR=737\r
-20 61288592 . G A . . Sample=NA19780;GT=0/1;PCR_454_AR=1012;PCR_454_RR=880\r
-20 61288592 . G A . . Sample=NA20508;GT=0/1;PCR_454_AR=913;PCR_454_RR=773\r
-20 61512157 . C T . . Sample=NA18933;GT=0/1;PCR_454_AR=1227;PCR_454_RR=1206\r
-20 61512157 . C T . . Sample=NA18934;GT=0/1;PCR_454_AR=1110;PCR_454_RR=1182\r
-20 61512157 . C T . . Sample=NA19771;GT=0/1;PCR_454_AR=1250;PCR_454_RR=1148\r
-20 61512982 . T A . . Sample=NA18559;GT=0/1;PCR_454_AR=1255;PCR_454_RR=1117\r
-20 61513433 . T C . . Sample=NA20810;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=550\r
-20 61525226 . G A . . Sample=NA19428;GT=0/1;PCR_454_AR=719;PCR_454_RR=719\r
-20 61542496 . G C . . Sample=NA19648;GT=0/1;PCR_454_AR=237;PCR_454_RR=1305\r
-20 61574860 . C T . . Sample=NA19762;GT=0/1;PCR_454_AR=703;PCR_454_RR=488\r
-20 61591950 . T G . . Sample=HG00106;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=1219\r
-20 61591950 . T G . . Sample=HG00122;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1227\r
-20 61833992 . G A . . Sample=NA18489;GT=0/1;PCR_454_AR=738;PCR_454_RR=786\r
-20 61833992 . G A . . Sample=NA19093;GT=0/1;PCR_454_AR=839;PCR_454_RR=739\r
-20 61834856 . G A . . Sample=NA19041;GT=0/1;PCR_454_AR=389;PCR_454_RR=374\r
-20 61834856 . G A . . Sample=NA19095;GT=0/1;PCR_454_AR=383;PCR_454_RR=364\r
-20 61834856 . G A . . Sample=NA19113;GT=0/1;PCR_454_AR=322;PCR_454_RR=325\r
-20 61834856 . G A . . Sample=NA19318;GT=0/1;PCR_454_AR=434;PCR_454_RR=399\r
-20 61834856 . G A . . Sample=NA19334;GT=0/1;PCR_454_AR=380;PCR_454_RR=343\r
-20 61943307 . G C . . Sample=NA19201;GT=0/1;PCR_454_AR=920;PCR_454_RR=890\r
-20 61943346 . G A . . Sample=NA19758;GT=0/1;PCR_454_AR=683;PCR_454_RR=705\r
-20 62187372 . C G . . Sample=NA19117;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=963\r
-20 62187668 . C T . . Sample=NA12154;GT=0/1;PCR_454_AR=905;PCR_454_RR=664\r
-20 62194106 . C T . . Sample=NA18910;GT=0/1;PCR_454_AR=1083;PCR_454_RR=1040\r
-20 62194106 . C T . . Sample=NA19338;GT=0/1;PCR_454_AR=784;PCR_454_RR=854\r
-20 62194106 . C T . . Sample=NA19346;GT=0/1;PCR_454_AR=757;PCR_454_RR=817\r
-20 62194106 . C T . . Sample=NA19376;GT=0/1;PCR_454_AR=1152;PCR_454_RR=962\r
-20 62194106 . C T . . Sample=NA19439;GT=0/1;PCR_454_AR=1387;PCR_454_RR=1456\r
-20 62194211 . C A . . Sample=HG00156;GT=0/1;PCR_454_AR=1116;PCR_454_RR=536\r
-20 62194211 . C A . . Sample=NA07051;GT=0/1;PCR_454_AR=2089;PCR_454_RR=259\r
-20 62194211 . C A . . Sample=NA12003;GT=0/1;PCR_454_AR=1330;PCR_454_RR=796\r
-20 62194290 . C T . . Sample=NA19346;GT=0/1;PCR_454_AR=1000;PCR_454_RR=751\r
-20 62194290 . C T . . Sample=NA19351;GT=0/1;PCR_454_AR=901;PCR_454_RR=771\r
-20 62198552 . G C . . Sample=NA20542;GT=0/1;PCR_454_AR=1527;PCR_454_RR=1010\r
-20 62198883 . C T . . Sample=NA19346;GT=0/1;PCR_454_AR=1447;PCR_454_RR=1455\r
-20 62198883 . C T . . Sample=NA19351;GT=0/1;PCR_454_AR=903;PCR_454_RR=1401\r
-20 62198883 . C T . . Sample=NA20340;GT=0/1;PCR_454_AR=843;PCR_454_RR=892\r
-20 62198960 . G A . . Sample=NA20534;GT=0/1;PCR_454_AR=1223;PCR_454_RR=864\r
-20 62200240 . G A . . Sample=NA18910;GT=0/1;PCR_454_AR=1221;PCR_454_RR=1347\r
-20 62226984 . G C . . Sample=HG00559;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=1774\r
-20 62226984 . G C . . Sample=NA12003;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1871\r
-20 62250734 . C T . . Sample=NA19473;GT=0/1;PCR_454_AR=607;PCR_454_RR=722\r
-20 62297382 . A T . . Sample=NA11993;GT=0/0;PCR_454_AR=3;PCR_454_RR=2573\r
-20 62297382 . A T . . Sample=NA19117;GT=0/0;PCR_454_AR=5;PCR_454_RR=1753\r
-20 62305427 . G A . . Sample=HG00104;GT=0/0;PCR_454_AR=10;PCR_454_RR=803\r
-20 62305427 . G A . . Sample=HG00122;GT=0/0;PCR_454_AR=28;PCR_454_RR=1300\r
-20 62319912 . G T . . Sample=HG00128;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1911\r
-20 62319912 . G T . . Sample=HG00560;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=2111\r
-20 62324258 . C G . . Sample=NA18562;GT=0/1;PCR_454_AR=1126;PCR_454_RR=1126\r
-20 62324622 . C G . . Sample=NA18574;GT=0/1;PCR_454_AR=1153;PCR_454_RR=1158\r
-20 62325731 . G A . . Sample=NA18548;GT=0/1;PCR_454_AR=779;PCR_454_RR=2199\r
-20 62325821 . G A . . Sample=NA20278;GT=0/1;PCR_454_AR=819;PCR_454_RR=764\r
-20 62325821 . G A . . Sample=NA20507;GT=0/1;PCR_454_AR=1163;PCR_454_RR=1060\r
-20 62326150 . G A . . Sample=NA18870;GT=0/1;PCR_454_AR=1080;PCR_454_RR=892\r
-20 62326234 . C T . . Sample=HG00128;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=761\r
-20 62326234 . C T . . Sample=HG00179;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1158\r
-20 62326811 . G T . . Sample=HG00149;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1467\r
-20 62326811 . G T . . Sample=HG00151;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1492\r
-20 62407154 . C T . . Sample=NA18987;GT=0/0;PCR_454_AR=181;PCR_454_RR=2041\r
-20 62421536 . C T . . Sample=NA20521;GT=0/1;PCR_454_AR=856;PCR_454_RR=910\r
-20 62421536 . C T . . Sample=NA20543;GT=0/1;PCR_454_AR=865;PCR_454_RR=854\r
-20 62593676 . C T . . Sample=NA20291;GT=0/1;PCR_454_AR=1038;PCR_454_RR=995\r
-20 62594479 . C T . . Sample=NA19746;GT=0/1;PCR_454_AR=349;PCR_454_RR=347\r
-20 62595981 . C T . . Sample=NA19172;GT=0/1;PCR_454_AR=440;PCR_454_RR=415\r
-20 62630426 . C T . . Sample=NA19428;GT=0/1;PCR_454_AR=1246;PCR_454_RR=1277\r
-20 62632542 . C T . . Sample=NA18501;GT=0/1;PCR_454_AR=1203;PCR_454_RR=1150\r
-20 62657404 . C T . . Sample=NA18612;GT=0/1;PCR_454_AR=1480;PCR_454_RR=1071\r
-20 62700725 . G A . . Sample=NA19020;GT=0/1;PCR_454_AR=832;PCR_454_RR=815\r
-20 62700725 . G A . . Sample=NA19036;GT=0/1;PCR_454_AR=1024;PCR_454_RR=966\r
-20 62729481 . C T . . Sample=NA20276;GT=0/1;PCR_454_AR=401;PCR_454_RR=408\r
-20 62899302 . T C . . Sample=HG00104;GT=0/0;PCR_454_AR=10;PCR_454_RR=871\r
-20 62899302 . T C . . Sample=HG00128;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=950\r
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.0
-##filedate=2010-06-21
-##reference=NCBI36
-##INFO=<ID=GC, Number=0, Type=Flag, Description="Overlap with Gencode CCDS coding sequence">
-##INFO=<ID=DP, Number=1, Type=Integer, Description="Total number of reads in haplotype window">
-##INFO=<ID=AF, Number=1, Type=Float, Description="Dindel estimated population allele frequency">
-##INFO=<ID=CA, Number=1, Type=String, Description="Pilot 1 callability mask">
-##INFO=<ID=HP, Number=1, Type=Integer, Description="Reference homopolymer tract length">
-##INFO=<ID=NS, Number=1, Type=Integer, Description="Number of samples with data">
-##INFO=<ID=DB, Number=0, Type=Flag, Description="dbSNP membership build 129 - type match and indel sequence length match within 25 bp">
-##INFO=<ID=NR, Number=1, Type=Integer, Description="Number of reads covering non-ref variant on reverse strand">
-##INFO=<ID=NF, Number=1, Type=Integer, Description="Number of reads covering non-ref variant on forward strand">
-##FILTER=<ID=NoQCALL, Description="Variant called by Dindel but not confirmed by QCALL">
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO
-1 1000153 . TCACAC TC 100 PASS AF=0.115095;HP=1;NF=16;NR=13;NS=52;CA=0;DP=615
-1 1000906 . CAG CG 48 PASS AF=0.0772696;HP=1;NF=2;NR=9;NS=51;CA=0;DP=281
-1 1000950 rs60561655;-/G CGG CG 100 PASS AF=0.447771;HP=5;DB;NF=10;NR=20;NS=50;CA=M;DP=291
-1 1010786 rs36095298;-/G,mills,venter AC AGC 100 PASS AF=0.774334;HP=1;DB;NF=21;NR=27;NS=51;CA=0;DP=306
-1 1026158 . TG TGGGGGG 100 PASS AF=0.115637;HP=1;NF=5;NR=2;NS=52;CA=0;DP=591
-1 1028860 mills,venter ACTCC AC 10 PASS AF=0.0107751;HP=1;NF=5;NR=4;NS=52;CA=0;DP=522
-1 1040517 . CA CAA 100 PASS AF=0.0577672;HP=1;NF=7;NR=4;NS=52;CA=0;DP=426
-1 1043690 rs5772037;-/G,venter TG TGG 100 PASS AF=0.065857;HP=3;DB;NF=5;NR=8;NS=51;CA=0;DP=427
-1 1049375 . TA TACACACCTGAGCACACACACCTGTGCA 100 PASS AF=0.0808078;HP=1;NF=1;NR=1;NS=51;CA=M;DP=643
-1 1055459 venter ACC AC 100 PASS AF=0.936429;HP=2;NF=13;NR=24;NS=51;CA=M;DP=342
-1 1056251 rs34287831;-/A,venter CT CTT 100 PASS AF=0.725164;HP=1;DB;NF=31;NR=20;NS=52;CA=0;DP=375
-1 1057459 rs55853944;-/AG,venter CAGG CG 100 PASS AF=0.525146;HP=1;DB;NF=16;NR=18;NS=51;CA=0;DP=331
-1 1057537 rs35574593;-/CC,watson TG TGGG 100 PASS AF=0.591248;HP=1;DB;NF=30;NR=12;NS=50;CA=0;DP=341
-1 1058532 rs34990026;-/A GTT GT 100 PASS AF=0.702381;HP=4;DB;NF=29;NR=32;NS=52;CA=0;DP=405
-1 1058695 rs56086046;-/GCCTGCCTGCCCGGCC,watson CGCCGCCTGCCTGCCCGG CG 100 PASS AF=0.601284;HP=1;DB;NF=24;NR=23;NS=51;CA=0;DP=365
-1 1073880 . AC ACC 13 PASS AF=0.0555821;HP=2;NF=1;NR=6;NS=52;CA=0;DP=457
-1 1087270 mills,venter,watson CCCCAC CC 100 PASS AF=0.990156;HP=4;NF=32;NR=27;NS=50;CA=0;DP=339
-1 1088683 rs5772039;-/C,venter TCC TC 100 PASS AF=0.957928;HP=9;DB;NF=31;NR=26;NS=49;CA=0;DP=336
-1 1093553 . TC TCAC 100 PASS AF=0.962343;HP=5;NF=44;NR=17;NS=51;CA=0;DP=324
-1 1111698 rs57346441;-/TG,watson CA CTGA 100 PASS AF=0.0986662;HP=1;DB;NF=8;NR=5;NS=52;CA=0;DP=528
-1 1117471 . GT GTT 48 PASS AF=0.04843;HP=6;NF=20;NR=8;NS=52;CA=0;DP=510
-1 1118641 . CT CTTAT 38 PASS AF=0.0574453;HP=1;NF=5;NR=1;NS=51;CA=0;DP=424
-1 1119225 rs60117456;-/C AC ACC 50 PASS AF=0.0255886;HP=4;DB;NF=8;NR=5;NS=52;CA=0;DP=522
-1 1121774 . GCTGTTCAGACCTG GG 100 PASS AF=0.0749767;HP=1;NF=6;NR=6;NS=51;CA=0;DP=508
-1 1123178 . AACA AA 14 PASS AF=0.0195065;HP=3;NF=2;NR=3;NS=49;CA=0;DP=329
-1 1134362 . GGAG GG 100 PASS AF=0.142028;HP=2;NF=12;NR=17;NS=51;CA=0;DP=407
-1 1140087 . TCA TA 19 PASS AF=0.0635822;HP=1;NF=2;NR=5;NS=51;CA=0;DP=446
-1 1141951 . CTG CG 100 PASS AF=0.100135;HP=1;NF=7;NR=7;NS=52;CA=0;DP=463
-1 1148304 rs34808371;-/GT,venter GCAC GC 100 PASS AF=0.0786699;HP=1;DB;NF=11;NR=18;NS=52;CA=0;DP=687
-1 1148425 rs57524763;-/AC AACA AA 100 PASS AF=0.0744913;HP=2;DB;NF=17;NR=8;NS=51;CA=0;DP=647
-1 1149524 . GTTTTAT GT 100 PASS AF=0.0475567;HP=4;NF=19;NR=14;NS=50;CA=0;DP=395
-1 1150963 . CGCCACAGACACGGGCCACACACTCCACATG CG 100 PASS AF=0.111384;HP=1;NF=46;NR=28;NS=50;CA=0;DP=510
-1 1151863 . GT GCT 100 PASS AF=0.126132;HP=1;NF=8;NR=7;NS=52;CA=0;DP=416
-1 1153674 rs3831195;-/ACAG GG GGACAG 18 PASS AF=0.0388728;HP=2;DB;NF=3;NR=2;NS=51;CA=0;DP=418
-1 1154612 . GT GCT 100 PASS AF=0.0630518;HP=1;NF=7;NR=4;NS=52;CA=0;DP=531
-1 1155143 . GCAC GC 100 PASS AF=0.0991605;HP=1;NF=25;NR=23;NS=52;CA=0;DP=540
-1 1155183 . CATG CG 100 PASS AF=0.0714383;HP=1;NF=5;NR=8;NS=52;CA=0;DP=527
-1 1156953 rs57672822;-/ACCCCGGGA CCCCCGGGAAC CC 59 PASS AF=0.0847102;HP=5;DB;NF=5;NR=8;NS=50;CA=0;DP=312
-1 1164370 . AA AACATGCATCCA 100 PASS AF=0.0550752;HP=2;NF=2;NR=1;NS=51;CA=0;DP=481
-1 1166826 . AC ACC 11 PASS AF=0.0735648;HP=1;NF=1;NR=10;NS=52;CA=0;DP=379
-1 1167781 rs3835300;-/T CTG CG 100 PASS AF=0.0719128;HP=1;DB;NF=3;NR=3;NS=50;CA=0;DP=360
-1 1180776 rs35025185;-/T,mills CTT CT 15 PASS AF=0.0182173;HP=3;DB;NF=5;NR=1;NS=52;CA=0;DP=526
-1 1184391 . GC GCAC 16 PASS AF=0.0187867;HP=1;NF=2;NR=6;NS=51;CA=M;DP=521
-1 1204971 . TGG TG 100 PASS AF=0.0564084;HP=6;NF=11;NR=6;NS=50;CA=0;DP=419
-1 1207801 rs35647244;-/GT,watson CC CCAC 100 PASS AF=0.034013;HP=2;DB;NF=9;NR=4;NS=52;CA=0;DP=624
-1 1213486 . GTCT GT 100 PASS AF=0.504039;HP=1;NF=9;NR=5;NS=50;CA=M;DP=372
-1 1217527 rs3831920;-/CTCA,watson TTGAGT TT 100 PASS AF=0.098042;HP=2;DB;NF=11;NR=14;NS=51;CA=0;DP=444
-1 1224625 . AGG AG 40 PASS AF=0.0395551;HP=5;NF=4;NR=4;NS=51;CA=0;DP=406
-1 1228918 rs35156558;-/GGA,venter CC CCCTC 100 PASS AF=0.999996;HP=5;DB;NF=24;NR=30;NS=49;CA=0;DP=268
-1 1232491 . CTACCTGACCTTC CC 13 PASS AF=0.0510512;HP=1;NF=5;NR=5;NS=52;CA=0;DP=510
-1 1236119 . CGGCTCTGGGTCACAGGTG CG 17 PASS AF=0.0581287;HP=2;NF=6;NR=8;NS=49;CA=M;DP=277
-1 1245266 rs5772041;-/G,venter TGG TG 100 PASS AF=0.928175;HP=4;DB;NF=39;NR=39;NS=52;CA=0;DP=431
-1 1286232 venter,watson GACA GA 100 PASS AF=0.878082;HP=1;NF=31;NR=15;NS=50;CA=0;DP=249
-1 1292184 watson TG TGTGTGCAG 100 PASS AF=0.92351;HP=1;NF=36;NR=17;NS=51;CA=0;DP=633
-1 1475307 rs35008066;-/G,venter GCC GC 59 PASS AF=0.0854422;HP=2;DB;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=372
-1 1476800 rs3835461;-/C AG AGG 100 PASS AF=0.239098;HP=1;DB;NF=13;NR=18;NS=52;CA=0;DP=491
-1 1482738 rs34962853;-/AT,watson CATA CA 100 PASS AF=0.1747;HP=1;DB;NF=28;NR=14;NS=51;CA=0;DP=441
-1 1483969 rs3835460;-/T,mills CG CAG 100 PASS AF=0.180671;HP=5;DB;NF=6;NR=13;NS=52;CA=0;DP=512
-1 1484993 rs35384209;-/CT CA CAGA 100 PASS AF=0.182804;HP=1;DB;NF=9;NR=15;NS=52;CA=0;DP=441
-1 1485720 . TC TCGTAC 39 PASS AF=0.0207216;HP=1;NF=1;NR=3;NS=51;CA=0;DP=498
-1 1487504 rs35885836;-/AGAA,venter,watson TTTTCT TT 100 PASS AF=0.210263;HP=4;DB;NF=16;NR=20;NS=52;CA=0;DP=574
-1 1490348 rs3835459;-/CATGATCCGCCTGCCTT CAAGGCAGGCGGATCATGA CA 59 PASS AF=0.230233;HP=2;DB;NF=5;NR=66;NS=51;CA=M;DP=377
-1 1490873 . GT GGGCCCGACGGTGCT 100 PASS AF=0.133846;HP=1;NF=8;NR=3;NS=52;CA=0;DP=572
-1 1495811 venter ACC AC 100 PASS AF=0.232263;HP=8;NF=12;NR=29;NS=52;CA=0;DP=481
-1 1502734 rs35576478;-/G,venter AC ACC 100 PASS AF=0.221604;HP=4;DB;NF=16;NR=9;NS=51;CA=0;DP=388
-1 1507556 . AC ACC 42 PASS AF=0.0176775;HP=1;NF=1;NR=4;NS=51;CA=0;DP=511
-1 1508235 . CT CTT 100 PASS AF=0.2555;HP=1;NF=18;NR=15;NS=51;CA=0;DP=535
-1 1508689 . CG CGG 100 PASS AF=0.0922424;HP=5;NF=19;NR=17;NS=51;CA=0;DP=568
-1 1510533 . TTTTGT TT 100 PASS AF=0.423696;HP=7;NF=37;NR=39;NS=52;CA=0;DP=387
-1 1511216 . TA TAATAATAATAAAA 39 PASS AF=0.542394;HP=2;NF=7;NR=3;NS=51;CA=0;DP=331
-1 1512041 . CAAAAGTAAA CA 33 PASS AF=0.0333379;HP=4;NF=12;NR=13;NS=52;CA=0;DP=440
-1 1514403 . TTTTAT TT 100 PASS AF=0.771875;HP=5;NF=24;NR=58;NS=50;CA=0;DP=243
-1 1520133 rs34595829;-/GT,venter GA GACA 100 PASS AF=0.432871;HP=1;DB;NF=24;NR=19;NS=52;CA=0;DP=966
-1 1520238 venter,watson TG TGAGACAG 100 PASS AF=0.606404;HP=1;NF=52;NR=36;NS=52;CA=M;DP=847
-1 1520271 . CA CAGA 100 PASS AF=0.169509;HP=1;NF=48;NR=39;NS=52;CA=M;DP=736
-1 1520357 . CAGAGAGA CA 100 PASS AF=0.218715;HP=1;NF=44;NR=30;NS=52;CA=M;DP=708
-1 1520549 . CAGA CA 100 PASS AF=0.257166;HP=1;NF=41;NR=40;NS=52;CA=0;DP=790
-1 1520595 . CAGA CA 100 PASS AF=0.107822;HP=1;NF=52;NR=44;NS=52;CA=M;DP=804
-1 1520983 . GA GAGAGAGACA 34 PASS AF=0.0372679;HP=1;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=610
-1 1521139 . GA GAGACA 100 PASS AF=0.667375;HP=1;NF=10;NR=7;NS=52;CA=M;DP=537
-1 1521387 . GAGACA GA 100 PASS AF=0.361313;HP=1;NF=13;NR=34;NS=52;CA=M;DP=598
-1 1521833 . GACA GA 100 PASS AF=0.193306;HP=1;NF=23;NR=17;NS=52;CA=0;DP=737
-1 1522371 . CC CCCTCAGCTGGACTC 100 PASS AF=0.480499;HP=3;NF=11;NR=12;NS=51;CA=0;DP=535
-1 1530305 . AG AGG 15 PASS AF=0.0737746;HP=3;NF=13;NR=4;NS=51;CA=0;DP=569
-1 1536491 rs36101309;-/GA ATCT AT 100 PASS AF=0.128408;HP=1;DB;NF=22;NR=14;NS=51;CA=0;DP=621
-1 1537805 venter TT TCT 100 PASS AF=0.350404;HP=8;NF=3;NR=18;NS=52;CA=M;DP=419
-1 1539301 . CAAAAGA CA 56 PASS AF=0.0156055;HP=4;NF=9;NR=2;NS=51;CA=0;DP=577
-1 1549566 venter ATT AT 100 PASS AF=0.505899;HP=3;NF=25;NR=27;NS=52;CA=0;DP=451
-1 1554815 . TGG TG 100 PASS AF=0.158582;HP=6;NF=12;NR=6;NS=48;CA=0;DP=271
-1 1575329 . GCAAC GC 12 PASS AF=0.0174116;HP=1;NF=27;NR=21;NS=52;CA=0;DP=554
-1 1575977 rs35072492;-/A TCC TC 100 PASS AF=0.626664;HP=3;DB;NF=23;NR=50;NS=51;CA=0;DP=361
-1 1577203 venter,watson AA AAAACA 100 PASS AF=0.979791;HP=4;NF=59;NR=37;NS=52;CA=0;DP=498
-1 1584062 rs5772057;-/T,venter CT CTT 100 PASS AF=0.992883;HP=1;DB;NF=34;NR=22;NS=46;CA=0;DP=291
-1 1589954 . TTGT TT 100 PASS AF=0.0452889;HP=8;NF=5;NR=13;NS=51;CA=0;DP=424
-1 1611607 venter ATA AA 100 PASS AF=0.528232;HP=1;NF=7;NR=10;NS=50;CA=M;DP=243
-1 1615408 venter AC ACGC 100 PASS AF=0.553544;HP=9;NF=16;NR=20;NS=51;CA=M;DP=247
-1 1618248 . CTGA CA 100 PASS AF=0.0412633;HP=1;NF=5;NR=2;NS=51;CA=0;DP=789
-1 1637509 venter CG CTG 100 PASS AF=0.956642;HP=1;NF=57;NR=41;NS=52;CA=M;DP=533
-1 1637828 rs34259364;-/AT,mills CG CATG 100 PASS AF=0.24683;HP=1;DB;NF=5;NR=57;NS=52;CA=0;DP=744
-1 1638199 . GA GATGTTAA 100 PASS AF=0.962724;HP=1;NF=22;NR=22;NS=52;CA=0;DP=480
-1 1638366 venter AT ATT 100 PASS AF=0.471703;HP=4;NF=50;NR=16;NS=52;CA=0;DP=738
-1 1638469 rs34392519;-/AGC,mills GA GAGCA 100 PASS AF=0.428728;HP=1;DB;NF=34;NR=23;NS=52;CA=0;DP=804
-1 1639339 rs36127854;-/CT,venter TA TAGA 100 PASS AF=0.27562;HP=1;DB;NF=10;NR=15;NS=52;CA=0;DP=961
-1 1639610 . ATTCTC AC 59 PASS AF=0.0697107;HP=2;NF=31;NR=24;NS=52;CA=M;DP=817
-1 1640937 venter CG CTCGCTCTGTCACCCAGGCTG 100 PASS AF=0.639983;HP=2;NF=4;NR=3;NS=52;CA=M;DP=638
-1 1641995 rs34986248;-/ATT,venter,watson CT CTTAT 100 PASS AF=0.924551;HP=2;DB;NF=33;NR=29;NS=52;CA=0;DP=414
-1 1654133 rs34171153;-/ATCG TA TATCGA 100 PASS AF=0.2409;HP=1;DB;NF=10;NR=13;NS=52;CA=0;DP=463
-1 1656307 rs35516110;-/GTTT,venter GT GGTTTT 100 PASS AF=0.686901;HP=6;DB;NF=22;NR=20;NS=51;CA=0;DP=293
-1 1674207 venter CC CCCTC 100 PASS AF=0.303909;HP=3;NF=26;GC;NR=29;NS=52;CA=0;DP=534
-1 1675781 . TCCCTGGGACCGAAGTCGCCCCAC TC 100 PASS AF=0.270579;HP=3;NF=25;NR=24;NS=52;CA=0;DP=473
-1 1679986 rs35357728;-/TG,mills,venter,watson AA AACA 100 PASS AF=0.956895;HP=4;DB;NF=60;NR=58;NS=52;CA=0;DP=520
-1 1684058 . AAATGA AA 100 PASS AF=0.508762;HP=4;NF=48;NR=55;NS=52;CA=0;DP=471
-1 1684177 . TG TGGGGGGGG 100 PASS AF=0.126497;HP=1;NF=5;NR=3;NS=51;CA=0;DP=449
-1 1691268 rs35459537;-/AAAAACAAAAAC,mills,venter CAAAACAAAAACAA CA 100 PASS AF=0.305762;HP=4;DB;NF=54;NR=62;NS=51;CA=0;DP=443
-1 1697760 mills,venter GAAACA GA 100 PASS AF=0.276545;HP=3;NF=21;NR=43;NS=52;CA=0;DP=564
-1 1700966 rs34974144;-/AT,venter TT TTGT 100 PASS AF=0.37365;HP=3;DB;NF=34;NR=30;NS=52;CA=0;DP=445
-1 1715347 . TG TGGGGGG 24 PASS AF=0.0415083;HP=1;NF=4;NR=5;NS=52;CA=0;DP=519
-1 1717050 rs56070879;-/ACAAAAAA,venter TC TCAAAAAAAC 100 PASS AF=0.90619;HP=1;DB;NF=11;NR=7;NS=52;CA=0;DP=442
-1 1729683 . ACT AT 100 PASS AF=0.104273;HP=1;NF=9;NR=11;NS=52;CA=0;DP=587
-1 1729941 rs55730045;-/TTTG,watson TTTTGT TT 100 PASS AF=0.270089;HP=5;DB;NF=25;NR=44;NS=52;CA=M;DP=458
-1 1733706 rs4012956;-/GT,mills,venter TA TACA 100 PASS AF=0.737658;HP=1;DB;NF=58;NR=26;NS=52;CA=M;DP=547
-1 1750193 rs34820549;-/TG,venter TA TACA 100 PASS AF=0.417596;HP=1;DB;NF=42;NR=29;NS=52;CA=0;DP=495
-1 1761838 . GCAC GC 17 PASS AF=0.0186129;HP=1;NF=23;NR=23;NS=52;CA=0;DP=566
-1 1767123 . TACACACACACACACACACACACACACACACA TA 100 PASS AF=0.205885;HP=1;NF=32;NR=32;NS=52;CA=0;DP=560
-1 1767308 . AG ATG 12 PASS AF=0.363076;HP=2;NF=25;NR=12;NS=52;CA=0;DP=611
-1 1768358 . ACA AA 11 NoQCALL AF=0.0311546;HP=1;NF=1;NR=4;NS=52;CA=0;DP=502
-1 1768592 . AC ACAACAAAATCCCTTTTTC 100 PASS AF=0.0974177;HP=1;NF=2;NR=5;NS=52;CA=0;DP=597
-1 1769336 rs34011234;-/TA,venter,watson CT CTAT 100 PASS AF=0.385782;HP=1;DB;NF=21;NR=42;NS=52;CA=0;DP=534
-1 1769673 rs56979938;-/A,venter AGA AA 21 PASS AF=0.232442;HP=1;DB;NF=9;NR=3;NS=52;CA=0;DP=465
-1 1771291 . TG TGG 100 PASS AF=0.18937;HP=2;NF=5;NR=15;NS=52;CA=0;DP=590
-1 1778545 . TA TAAA 100 PASS AF=0.155668;HP=3;NF=5;NR=12;NS=52;CA=0;DP=621
-1 1778604 rs34483468;-/AGCC,venter GG GGGCTG 100 PASS AF=0.135521;HP=4;DB;NF=22;NR=28;NS=52;CA=0;DP=629
-1 1786587 watson ACCA AA 26 PASS AF=0.0677562;HP=2;NF=15;NR=22;NS=52;CA=M;DP=404
-1 1797136 rs59528461;-/C,venter TCC TC 100 PASS AF=0.94689;HP=10;DB;NF=58;NR=57;NS=52;CA=0;DP=531
-1 1797791 rs35226472;-/CT,venter CG CGAG 100 PASS AF=0.383219;HP=1;DB;NF=64;NR=38;NS=52;CA=0;DP=673
-1 1802225 rs34339560;-/A,mills,venter CAA CA 100 PASS AF=0.973419;HP=2;DB;NF=64;NR=71;NS=52;CA=0;DP=635
-1 1802305 . GGAG GG 100 PASS AF=0.273326;HP=2;NF=41;NR=34;NS=52;CA=0;DP=695
-1 1806743 . TTAGAT TT 100 PASS AF=0.179706;HP=2;NF=9;NR=6;NS=52;CA=0;DP=377
-1 1809681 . AG AGG 21 PASS AF=0.133833;HP=2;NF=7;NR=3;NS=52;CA=0;DP=482
-1 1810283 . AC ACC 30 PASS AF=0.0430128;HP=2;NF=4;NR=11;NS=52;CA=0;DP=523
-1 1810555 . CTTAAT CT 100 PASS AF=0.0498379;HP=2;NF=9;NR=7;NS=52;CA=0;DP=521
-1 1812953 rs34135959;-/TCTC CA CAGAGA 100 PASS AF=0.311555;HP=1;DB;NF=6;NR=8;NS=42;CA=0;DP=242
-1 1819911 . CATG CG 100 PASS AF=0.0319085;HP=1;NF=3;NR=6;NS=52;CA=0;DP=765
-1 1819947 rs60517384;-/AAGTTGGATATACACACAT CACACACATAAGTTGGATATA CA 100 PASS AF=0.0935091;HP=1;DB;NF=59;NR=69;NS=52;CA=0;DP=854
-1 1825723 venter AA AAAATAAATAAATA 100 PASS AF=0.348026;HP=4;NF=9;NR=10;NS=52;CA=0;DP=373
-1 1835530 . GTGAGAGTTGTTG GG 100 PASS AF=0.15298;HP=1;NF=12;NR=1;NS=51;CA=0;DP=528
-1 1838692 rs5772055;-/AC,mills AA AACA 100 PASS AF=0.0441449;HP=3;DB;NF=2;NR=3;NS=51;CA=0;DP=360
-1 1843475 rs3039777;-/ACTG,venter,watson TC TCTGAC 100 PASS AF=0.999998;HP=1;DB;NF=38;NR=39;NS=50;CA=0;DP=422
-1 1850674 . AGG AG 100 PASS AF=0.474687;HP=3;NF=7;NR=1;NS=49;CA=0;DP=271
-1 1855740 watson GT GTGTAT 100 PASS AF=0.646893;HP=1;NF=42;NR=28;NS=51;CA=0;DP=653
-1 1856762 . CACAGG CG 14 PASS AF=0.0324715;HP=1;NF=1;NR=2;NS=50;CA=M;DP=379
-1 1857166 . TACA TA 100 PASS AF=0.0531955;HP=1;NF=39;NR=29;NS=52;CA=0;DP=634
-1 1859140 mills ACACCAGGTCCACCTCTGGACACAGGTCCACCC AC 100 PASS AF=0.180806;HP=1;NF=26;NR=15;NS=52;CA=0;DP=672
-1 1859353 rs35385292;-/TC,venter ACTC AC 100 PASS AF=0.493919;HP=1;DB;NF=26;NR=38;NS=52;CA=M;DP=641
-1 1859424 rs34242289;-/CA,venter TCAG TG 100 PASS AF=0.3962;HP=1;DB;NF=40;NR=32;NS=52;CA=M;DP=695
-1 1859520 . TCAC TC 100 PASS AF=0.234548;HP=1;NF=26;NR=23;NS=52;CA=0;DP=729
-1 1859631 rs35205487;-/GA,venter AC ACTC 100 PASS AF=0.347295;HP=1;DB;NF=15;NR=28;NS=52;CA=0;DP=710
-1 1859792 rs34050188;-/AT,watson CG CATG 100 PASS AF=0.715253;HP=1;DB;NF=35;NR=44;NS=52;CA=0;DP=590
-1 1864576 . CG CGG 13 PASS AF=0.0158703;HP=1;NF=3;NR=2;NS=51;CA=0;DP=556
-1 1867274 rs34832935;-/C TGG TG 100 PASS AF=0.304336;HP=8;DB;NF=38;NR=23;NS=51;CA=0;DP=538
-1 1869711 rs56005703;-/ATAT,watson AA AATATA 100 PASS AF=0.652198;HP=3;DB;NF=16;NR=16;NS=51;CA=0;DP=349
-1 1870233 . TC TCCCTCCCTTCTTTCCTTCCCTTTCCCTCC 100 PASS AF=0.408049;HP=2;NF=11;NR=9;NS=52;CA=0;DP=814
-1 1870305 . CC CCTTTCCCTCCCTTACTCCTTCCTTCCTTC 100 PASS AF=0.121733;HP=4;NF=1;NR=5;NS=52;CA=0;DP=680
-1 1870363 . CT CTT 100 PASS AF=0.11398;HP=2;NF=4;NR=6;NS=52;CA=0;DP=680
-1 1870863 rs35875775;-/C,venter TT TGT 100 PASS AF=0.744276;HP=2;DB;NF=43;NR=22;NS=52;CA=0;DP=455
-1 1873164 . GT GTT 100 PASS AF=0.387355;HP=3;NF=20;NR=18;NS=52;CA=0;DP=523
-1 1873889 rs58267869;-/AAGA AA AAAAGA 100 PASS AF=0.252999;HP=5;DB;NF=57;NR=31;NS=52;CA=0;DP=536
-1 1874122 rs35595511;-/T TAA TA 100 PASS AF=0.338059;HP=9;DB;NF=38;NR=38;NS=51;CA=0;DP=519
-1 1876064 watson AG AGAGTG 100 PASS AF=0.0829624;HP=1;NF=6;NR=5;NS=52;CA=0;DP=465
-1 1876204 . AC ACAGC 100 PASS AF=0.256855;HP=1;NF=14;NR=10;NS=52;CA=0;DP=483
-1 1876616 . GC GCTGGTGCGCGTC 100 PASS AF=0.0656988;HP=1;NF=5;NR=2;NS=51;CA=0;DP=420
-1 1876971 rs3838975;-/G GCC GC 21 PASS AF=0.201137;HP=2;DB;NF=15;NR=6;NS=52;CA=0;DP=439
-1 1877704 . CCTGC CC 19 PASS AF=0.0183173;HP=2;NF=7;NR=13;NS=52;CA=0;DP=436
-1 1884832 rs34937714;-/T CA CAA 100 PASS AF=0.254902;HP=3;DB;NF=27;NR=6;NS=52;CA=0;DP=449
-1 1886549 rs3838974;-/T GG GAG 100 PASS AF=0.153123;HP=4;DB;NF=11;NR=10;NS=52;CA=0;DP=456
-1 1889260 rs55954278;-/ATGA GT GTGAAT 100 PASS AF=0.630203;HP=1;DB;NF=12;NR=17;NS=52;CA=0;DP=656
-1 1889311 . GTGAAT GT 100 PASS AF=0.167491;HP=1;NF=33;NR=18;NS=52;CA=0;DP=606
-1 1889402 rs34520694;-/GTGA AT ATGAGT 100 PASS AF=0.306146;HP=1;DB;NF=24;NR=32;NS=52;CA=0;DP=916
-1 1889884 rs56985589;-/G TGC TC 100 PASS AF=0.347999;HP=1;DB;NF=20;NR=28;NS=51;CA=0;DP=537
-1 1889966 rs61233860;-/CCT,watson TC TCTCC 100 PASS AF=0.211403;HP=1;DB;NF=12;NR=14;NS=52;CA=0;DP=554
-1 1892548 . ACTC AC 21 PASS AF=0.0207771;HP=1;NF=4;NR=3;NS=52;CA=0;DP=750
-1 1900826 . AACA AA 100 PASS AF=0.122368;HP=2;NF=13;NR=6;NS=52;CA=M;DP=435
-1 1908846 venter CT CTT 100 PASS AF=0.30139;HP=10;NF=11;NR=28;NS=51;CA=0;DP=350
-1 1910458 . TGAG TG 15 PASS AF=0.0208928;HP=1;NF=23;NR=12;NS=52;CA=0;DP=514
-1 1927207 rs61162553;-/GTTCTCTCTCTCTCTCTCTC,venter CTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTT CT 100 PASS AF=0.399955;HP=1;DB;NF=34;NR=47;NS=51;CA=0;DP=427
-1 1929307 rs36066718;-/T CAA CA 30 PASS AF=0.114706;HP=10;DB;NF=24;NR=15;NS=52;CA=0;DP=520
-1 1933578 . CA CAAAATAAAATA 100 PASS AF=0.562689;HP=4;NF=21;NR=28;NS=52;CA=0;DP=359
-1 1947079 rs3831907;-/C CGG CG 100 PASS AF=0.131218;HP=3;DB;NF=4;NR=10;NS=52;CA=0;DP=316
-1 1949721 rs35354651;-/G GC GCC 100 PASS AF=0.218024;HP=1;DB;NF=11;NR=5;NS=51;CA=0;DP=306
-1 1965555 rs56225932;-/CA,venter TACA TA 100 PASS AF=0.743144;HP=1;DB;NF=50;NR=67;NS=52;CA=0;DP=679
-1 1966402 venter,watson GC GCCGCC 100 PASS AF=0.988372;HP=2;NF=36;NR=16;NS=46;CA=0;DP=232
-1 1989567 . AC ACC 12 PASS AF=0.0334278;HP=6;NF=10;NR=9;NS=52;CA=0;DP=367
-1 1992350 . CA CACCTGGGCGTGTGA 56 PASS AF=0.19029;HP=1;NF=6;NR=3;NS=52;CA=0;DP=412
-1 1993852 rs34106910;-/G,venter GCC GC 100 PASS AF=0.178292;HP=2;DB;NF=15;NR=7;NS=51;CA=0;DP=388
-1 1996153 . GT GTT 59 PASS AF=0.126167;HP=8;NF=7;NR=14;NS=51;CA=0;DP=436
-1 2010531 rs35300904;-/C,venter CA CGA 100 PASS AF=0.2131;HP=1;DB;NF=18;NR=7;NS=52;CA=0;DP=418
-1 2019409 rs55716481;-/AGTGACTAAGGTGACCAGG,venter CA CAGGTGACCAGGAGTGACTAA 100 PASS AF=0.901172;HP=1;DB;NF=17;NR=16;NS=52;CA=0;DP=600
-1 2019867 rs58602729;-/CT CCTC CC 100 PASS AF=0.15521;HP=3;DB;NF=6;NR=12;NS=52;CA=0;DP=542
-1 2019961 mills CGTTTTGTTTTG CG 100 PASS AF=0.239816;HP=1;NF=44;NR=59;NS=52;CA=0;DP=513
-1 2027926 . CT CTT 100 PASS AF=0.591615;HP=1;NF=7;NR=4;NS=51;CA=M;DP=262
-1 2028042 . CT CTT 100 PASS AF=0.242884;HP=1;NF=28;NR=12;NS=51;CA=M;DP=738
-1 2031773 . GA GGGTA 100 PASS AF=0.197429;HP=1;NF=15;NR=7;NS=51;CA=0;DP=405
-1 2036771 . AC ACCCC 100 PASS AF=0.173415;HP=3;NF=1;NR=5;NS=52;CA=0;DP=532
-1 2040362 venter CT CTT 100 PASS AF=0.61548;HP=3;NF=31;NR=33;NS=52;CA=0;DP=522
-1 2042747 . CG CGGGGG 100 PASS AF=0.132985;HP=2;NF=11;NR=6;NS=51;CA=0;DP=880
-1 2042976 . GT GTTATT 100 PASS AF=0.225391;HP=2;NF=13;NR=25;NS=51;CA=M;DP=882
-1 2045297 . GT GTAGTTATT 36 PASS AF=0.513037;HP=2;NF=5;NR=16;NS=46;CA=M;DP=269
-1 2048642 rs56348719;-/A CAG CG 100 PASS AF=0.626672;HP=1;DB;NF=15;NR=37;NS=51;CA=0;DP=337
-1 2055895 watson AT AATT 100 PASS AF=0.183323;HP=1;NF=10;NR=14;NS=52;CA=0;DP=511
-1 2058884 watson GCCTC GC 100 PASS AF=0.258368;HP=2;NF=23;NR=18;NS=51;CA=0;DP=533
-1 2068674 . CTCTAT CT 100 PASS AF=0.0693035;HP=1;NF=7;NR=5;NS=52;CA=0;DP=600
-1 2076576 . GTGAT GT 100 PASS AF=0.0691863;HP=1;NF=32;NR=24;NS=52;CA=0;DP=918
-1 2076741 . GTGAT GT 49 PASS AF=0.200249;HP=1;NF=13;NR=21;NS=51;CA=0;DP=758
-1 2076895 . GTGAT GT 100 PASS AF=0.134423;HP=1;NF=21;NR=19;NS=51;CA=0;DP=658
-1 2076954 rs60433546;-/ATG AA AATGA 100 PASS AF=0.310432;HP=2;DB;NF=12;NR=27;NS=52;CA=0;DP=664
-1 2079377 rs3835418;-/T CT CTT 100 PASS AF=0.201153;HP=1;DB;NF=13;NR=15;NS=52;CA=0;DP=451
-1 2081537 rs56068331;-/GTGT CGTGTG CG 13 PASS AF=0.276967;HP=1;DB;NF=58;NR=66;NS=52;CA=0;DP=516
-1 2085600 rs3835419;-/CTGGGCCAACCC GA GACCCCTGGGCCAA 100 PASS AF=0.243746;HP=1;DB;NF=11;NR=6;NS=52;CA=0;DP=535
-1 2087974 . GCC GC 15 PASS AF=0.0623565;HP=8;NF=7;NR=14;NS=52;CA=0;DP=325
-1 2089182 rs34571180;-/CTC,mills,venter GCCTC GC 100 PASS AF=0.116512;HP=2;DB;NF=9;NR=4;NS=51;CA=0;DP=440
-1 2089950 . CG CGGGG 100 PASS AF=0.178382;HP=2;NF=20;NR=7;NS=51;CA=0;DP=444
-1 2091793 rs56317708;-/GATA,venter,watson AA AAGATA 100 PASS AF=0.896718;HP=2;DB;NF=37;NR=55;NS=52;CA=0;DP=525
-1 2094394 watson TCCACC TC 100 PASS AF=0.191274;HP=2;NF=15;NR=11;NS=52;CA=0;DP=554
-1 2099298 . TG TGG 100 PASS AF=0.234547;HP=1;NF=15;NR=4;NS=51;CA=0;DP=434
-1 2101678 . AGACG AG 100 PASS AF=0.0220699;HP=1;NF=10;NR=4;NS=51;CA=0;DP=533
-1 2104518 rs55672189;-/CGTCTC,venter AG AGTCTCCG 32 PASS AF=0.0318159;HP=1;DB;NF=1;NR=2;NS=51;CA=0;DP=303
-1 2110593 rs34825103;-/C TG TGG 100 PASS AF=0.0674605;HP=1;DB;NF=1;NR=4;NS=52;CA=M;DP=336
-1 2114205 . TT TTTGT 14 PASS AF=0.0440601;HP=4;NF=24;NR=27;NS=52;CA=0;DP=414
-1 2118677 rs35613376;-/T,venter GA GAA 100 PASS AF=0.110597;HP=1;DB;NF=4;NR=6;NS=51;CA=0;DP=395
-1 2129208 venter CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG CG 100 PASS AF=0.312577;HP=1;NF=50;NR=42;NS=51;CA=0;DP=395
-1 2136104 rs34745034;-/AC,venter,watson CTGT CT 100 PASS AF=0.148774;HP=1;DB;NF=9;NR=15;NS=51;CA=0;DP=394
-1 2147798 . CGG CG 100 PASS AF=0.069257;HP=5;NF=3;NR=7;NS=51;CA=0;DP=433
-1 2156467 rs34646035;-/A,venter GG GTG 100 PASS AF=0.0650203;HP=2;DB;NF=3;NR=2;NS=51;CA=0;DP=299
-1 2163248 rs34969427;-/CA,venter,watson CT CTGT 59 PASS AF=0.323344;HP=1;DB;NF=36;NR=42;NS=52;CA=0;DP=622
-1 2168152 rs34184068;-/C TG TGG 100 PASS AF=0.267631;HP=8;DB;NF=12;NR=25;NS=52;CA=0;DP=462
-1 2173905 rs59705675;-/C,venter GCC GC 100 PASS AF=0.519185;HP=4;DB;NF=28;NR=31;NS=52;CA=0;DP=472
-1 2178426 . ATCTCT AT 59 PASS AF=0.0153899;HP=1;NF=1;NR=2;NS=52;CA=0;DP=558
-1 2180516 . TG TGGG 15 PASS AF=0.10873;HP=1;NF=7;NR=3;NS=52;CA=0;DP=495
-1 2193017 rs35691128;-/C,venter TG TGG 100 PASS AF=0.296206;HP=9;DB;NF=9;NR=11;NS=52;CA=0;DP=367
-1 2204648 . AGGGG AG 100 PASS AF=0.0847086;HP=8;NF=9;NR=7;NS=52;CA=0;DP=441
-1 2211603 . TG TGGGGGGGGGG 100 PASS AF=0.176;HP=1;NF=5;NR=9;NS=52;CA=0;DP=507
-1 2211835 rs35471620;-/C,venter CG CGG 100 PASS AF=0.403922;HP=3;DB;NF=20;NR=20;NS=51;CA=0;DP=363
-1 2213004 rs35841716;-/G,mills,venter TGG TG 100 PASS AF=0.938006;HP=7;DB;NF=35;NR=9;NS=52;CA=0;DP=297
-1 2214726 . GC GCC 100 PASS AF=0.415474;HP=9;NF=18;NR=19;NS=51;CA=0;DP=416
-1 2220552 rs35472917;-/C,venter AGG AG 100 PASS AF=0.609848;HP=9;DB;NF=24;NR=22;NS=51;CA=0;DP=385
-1 2221276 . GC GCC 23 PASS AF=0.0895016;HP=2;NF=1;NR=11;NS=50;CA=0;DP=396
-1 2222657 . AC ACC 16 PASS AF=0.0530452;HP=2;NF=1;NR=3;NS=51;CA=0;DP=404
-1 2223900 . CAGGA CA 100 PASS AF=0.105506;HP=1;NF=9;NR=6;NS=52;CA=0;DP=517
-1 2232109 . CAGG CG 100 PASS AF=0.220422;HP=1;NF=14;NR=13;NS=51;CA=0;DP=430
-1 2233476 rs34394327;-/CGTTT,mills,venter,watson CC CCGTTTC 100 PASS AF=0.982218;HP=3;DB;NF=18;NR=31;NS=52;CA=0;DP=378
-1 2238242 rs56200665;-/C,mills GG GCG 100 PASS AF=0.745403;HP=4;DB;NF=37;NR=40;NS=51;CA=0;DP=419
-1 2242260 rs34121936;-/C AGG AG 100 PASS AF=0.107749;HP=4;DB;NF=7;NR=6;NS=51;CA=0;DP=427
-1 2246276 rs61120130;-/TGC,venter GG GGCTG 100 PASS AF=0.447977;HP=3;DB;NF=13;NR=17;NS=51;CA=0;DP=403
-1 2246469 . TT TTCCCTCCCTTCCTTCCTTCCCTCCCT 100 PASS AF=0.0710328;HP=3;NF=8;NR=6;NS=51;CA=B;DP=731
-1 2246586 rs59175712;-/CT CC CCTC 100 PASS AF=0.378253;HP=2;DB;NF=33;NR=29;NS=50;CA=0;DP=515
-1 2248450 rs61135926;-/CACA AA AACACA 100 PASS AF=0.367115;HP=3;DB;NF=24;NR=19;NS=51;CA=0;DP=445
-1 2248486 . CAGA CA 100 PASS AF=0.108968;HP=1;NF=14;NR=11;NS=51;CA=M;DP=382
-1 2248806 rs59142249;-/A CA CAA 100 PASS AF=0.0756571;HP=1;DB;NF=4;NR=12;NS=51;CA=0;DP=728
-1 2255198 . TGCTGGAAAGAACAG TG 100 PASS AF=0.115149;HP=1;NF=9;NR=12;NS=51;CA=0;DP=470
-1 2267148 . ACACACAGA AA 100 PASS AF=0.128331;HP=1;NF=4;NR=6;NS=51;CA=0;DP=681
-1 2268675 . TG TGG 10 PASS AF=0.0406249;HP=1;NF=7;NR=3;NS=52;CA=0;DP=508
-1 2269958 . GCACGCACACGCAC GC 40 PASS AF=0.0297002;HP=1;NF=6;NR=7;NS=50;CA=0;DP=288
-1 2270248 . CCTG CG 100 PASS AF=0.21901;HP=4;NF=14;NR=17;NS=52;CA=0;DP=478
-1 2272049 . AGGGGTGGCACGG AG 100 PASS AF=0.0657391;HP=4;NF=20;NR=19;NS=52;CA=0;DP=465
-1 2272576 rs35424701;-/T TA TAA 100 PASS AF=0.0794139;HP=1;DB;NF=5;NR=5;NS=51;CA=0;DP=426
-1 2273487 . TAA TA 10 PASS AF=0.0158231;HP=10;NF=25;NR=9;NS=51;CA=0;DP=564
-1 2282631 rs59328016;-/G AG AGG 100 PASS AF=0.230902;HP=1;DB;NF=1;NR=6;NS=52;CA=M;DP=310
-1 2282847 rs34534255;-/AG AC ACTC 100 PASS AF=0.108076;HP=1;DB;NF=5;NR=4;NS=50;CA=0;DP=293
-1 2284162 . CA CAA 12 PASS AF=0.0508845;HP=10;NF=7;NR=7;NS=52;CA=0;DP=406
-1 2285124 . TAAAAA TA 100 PASS AF=0.226133;HP=8;NF=14;NR=5;NS=52;CA=0;DP=315
-1 2288255 rs56670882;-/TACATAGAAAAA,venter,watson CAAAATACATAGAA CA 100 PASS AF=0.154865;HP=4;DB;NF=46;NR=50;NS=51;CA=0;DP=466
-1 2291012 venter ATAATT AT 100 PASS AF=0.140631;HP=1;NF=7;NR=9;NS=51;CA=0;DP=365
-1 2292525 rs60502597;-/CACAACAAC,venter CA CACAACCACAA 100 PASS AF=0.411828;HP=1;DB;NF=18;NR=3;NS=52;CA=0;DP=515
-1 2305015 rs35699260;-/T,venter CAG CG 100 PASS AF=0.283002;HP=1;DB;NF=14;NR=17;NS=51;CA=0;DP=451
-1 2310430 . AA AAAGA 100 PASS AF=0.382413;HP=6;NF=20;NR=11;NS=52;CA=0;DP=408
-1 2314333 venter CG CGGACGCCAGGCAGAGGACTTCATCCCAGGCTTCAGTGCTCCTG 100 PASS AF=0.736856;HP=2;NF=1;NR=2;NS=52;CA=0;DP=679
-1 2319273 rs57204595;-/C ACC AC 100 PASS AF=0.125223;HP=2;DB;NF=7;NR=13;NS=52;CA=0;DP=523
-1 2322519 . TCCT TT 100 PASS AF=0.200476;HP=2;NF=2;NR=10;NS=50;CA=0;DP=413
-1 2322562 . TCCACCCTCC TC 100 PASS AF=0.3747;HP=2;NF=8;NR=15;NS=51;CA=0;DP=325
-1 2322680 . CT CTT 100 PASS AF=0.284453;HP=1;NF=26;NR=24;NS=52;CA=M;DP=388
-1 2323804 venter TC TCC 100 PASS AF=0.865363;HP=3;NF=38;NR=47;NS=50;CA=0;DP=438
-1 2325452 . CG CGG 39 PASS AF=0.0242463;HP=3;NF=5;NR=8;NS=51;CA=0;DP=547
-1 2332518 . GA GAA 100 PASS AF=0.0862532;HP=1;NF=5;NR=13;NS=51;CA=0;DP=414
-1 2337697 rs55744642;-/CGACA,venter,watson GG GGGACAG 100 PASS AF=0.867582;HP=3;DB;NF=16;NR=23;NS=51;CA=0;DP=383
-1 2338712 rs34210450;-/AGCTTCCC,mills,venter GC GCCCAGCTTC 100 PASS AF=0.431742;HP=3;DB;NF=24;NR=15;NS=52;CA=0;DP=504
-1 2341261 . TCC TC 20 PASS AF=0.13716;HP=9;NF=4;NR=20;NS=51;CA=0;DP=258
-1 2343280 rs60532031;-/AAAAG,watson GA GAAGAAA 100 PASS AF=0.0544808;HP=2;DB;NF=2;NR=10;NS=49;CA=0;DP=348
-1 2343570 venter AA AAAACA 100 PASS AF=0.0882931;HP=6;NF=28;NR=18;NS=52;CA=0;DP=434
-1 2344468 . TTTTGT TT 100 PASS AF=0.233529;HP=7;NF=49;NR=55;NS=52;CA=0;DP=493
-1 2345597 rs35560781;-/T,venter TAA TA 100 PASS AF=0.501718;HP=6;DB;NF=36;NR=26;NS=52;CA=0;DP=532
-1 2352446 . CGTG CG 16 PASS AF=0.0185013;HP=1;NF=10;NR=25;NS=52;CA=0;DP=432
-1 2352629 rs35263617;-/CA,venter CG CGTG 100 PASS AF=0.4693;HP=1;DB;NF=44;NR=38;NS=51;CA=0;DP=539
-1 2355283 rs35314501;-/G TC TCC 100 PASS AF=0.408524;HP=4;DB;NF=21;NR=18;NS=52;CA=0;DP=436
-1 2356275 rs34090130;-/G,mills AGG AG 100 PASS AF=0.172214;HP=6;DB;NF=16;NR=9;NS=51;CA=0;DP=415
-1 2356753 rs58056215;-/TGGAGGC TGGCTGGAG TG 100 PASS AF=0.178356;HP=2;DB;NF=43;NR=59;NS=51;CA=0;DP=429
-1 2357119 . TGG TG 100 PASS AF=0.179635;HP=6;NF=12;NR=18;NS=52;CA=0;DP=495
-1 2357323 . TCCCT TT 100 PASS AF=0.0931072;HP=3;NF=8;NR=9;NS=52;CA=0;DP=484
-1 2357636 . CTCCACCTTT CT 100 PASS AF=0.252701;HP=1;NF=11;NR=9;NS=47;CA=M;DP=266
-1 2358758 . CAA CA 26 PASS AF=0.0241071;HP=3;NF=1;NR=3;NS=51;CA=0;DP=486
-1 2360543 rs34299371;-/G,venter GCC GC 100 PASS AF=0.460241;HP=7;DB;NF=18;NR=28;NS=51;CA=0;DP=403
-1 2365835 rs35499456;-/A GT GTT 100 PASS AF=0.299753;HP=3;DB;NF=19;NR=20;NS=52;CA=0;DP=431
-1 2370798 . AAACCA AA 100 PASS AF=0.315002;HP=4;NF=56;NR=52;NS=52;CA=0;DP=505
-1 2379981 rs35697743;-/C,venter TGC TC 100 PASS AF=0.0396508;HP=1;DB;NF=1;NR=5;NS=50;CA=0;DP=425
-1 2383170 rs35931789;-/T,venter CC CAC 100 PASS AF=0.441832;HP=7;DB;NF=24;NR=21;NS=52;CA=0;DP=453
-1 2383775 . ACC AC 19 PASS AF=0.0298335;HP=5;NF=6;NR=2;NS=52;CA=0;DP=442
-1 2388741 watson GCCTTCCTCAC GC 100 PASS AF=0.134128;HP=2;NF=6;NR=9;NS=47;CA=0;DP=257
-1 2394261 rs34886292;-/T,venter CA CAA 100 PASS AF=0.640008;HP=1;DB;NF=28;NR=33;NS=51;CA=0;DP=459
-1 2395694 venter AGG AG 100 PASS AF=0.518622;HP=3;NF=29;NR=23;NS=50;CA=0;DP=387
-1 2406522 rs35886782;-/CTCTGGACGCT,venter,watson TG TGCTCTCTGGACG 100 PASS AF=0.531691;HP=1;DB;NF=12;NR=19;NS=51;CA=0;DP=452
-1 2429911 rs3831090;-/AT,mills TT TTAT 100 PASS AF=0.138967;HP=3;DB;NF=24;NR=13;NS=52;CA=0;DP=328
-1 2458287 . CGTG CG 100 PASS AF=0.0696687;HP=1;NF=38;NR=32;NS=52;CA=0;DP=613
-1 2458465 . AGTG AG 31 PASS AF=0.0212179;HP=1;NF=18;NR=32;NS=51;CA=0;DP=600
-1 2460527 . TG TGCGGCCCATCTCAG 51 PASS AF=0.164756;HP=1;NF=1;NR=4;NS=51;CA=0;DP=496
-1 2477778 . AC ACCC 100 PASS AF=0.157812;HP=2;NF=2;NR=11;NS=51;CA=0;DP=389
-1 2501833 rs34000217;-/ATT AA AAATA 100 PASS AF=0.437274;HP=5;DB;NF=19;NR=23;NS=51;CA=0;DP=337
-1 2503512 rs59345997;-/CAAA AAAACA AA 100 PASS AF=0.46764;HP=4;DB;NF=44;NR=29;NS=52;CA=0;DP=456
-1 2506681 . TG TGGG 46 PASS AF=0.310909;HP=9;NF=14;NR=8;NS=51;CA=0;DP=273
-1 2513520 rs5772070;-/G,mills CGG CG 100 PASS AF=0.652792;HP=8;DB;NF=8;NR=34;NS=51;CA=0;DP=275
-1 2517761 . TGC TC 100 PASS AF=0.0839269;HP=1;NF=3;NR=6;NS=50;CA=0;DP=359
-1 2520201 rs34705971;-/C,venter AG AGG 100 PASS AF=0.612406;HP=1;DB;NF=42;NR=46;NS=52;CA=0;DP=518
-1 2521983 . TCAAACAAACAAAC TC 100 PASS AF=0.365407;HP=1;NF=35;NR=29;NS=52;CA=0;DP=501
-1 2522019 . CT CTGTT 100 PASS AF=0.523695;HP=1;NF=28;NR=12;NS=52;CA=0;DP=410
-1 2522313 rs34791736;-/A,venter CT CTT 100 PASS AF=0.621139;HP=1;DB;NF=47;NR=24;NS=52;CA=0;DP=472
-1 2524952 rs35090174;-/CT ACTC AC 100 PASS AF=0.224915;HP=1;DB;NF=19;NR=15;NS=51;CA=0;DP=517
-1 2529806 . CATA CA 100 PASS AF=0.236462;HP=1;NF=22;NR=13;NS=51;CA=0;DP=625
-1 2529841 . CACATA CA 100 PASS AF=0.190786;HP=1;NF=20;NR=19;NS=51;CA=0;DP=663
-1 2530205 rs61132608;-/CATATA,watson CA CACATATA 100 PASS AF=0.547698;HP=1;DB;NF=20;NR=28;NS=52;CA=0;DP=660
-1 2543402 rs5772073;-/GAG,mills TAGGA TA 100 PASS AF=0.24689;HP=1;DB;NF=12;NR=31;NS=52;CA=0;DP=543
-1 2547236 rs58240187;-/AGA,venter,watson GG GGAAG 100 PASS AF=0.531939;HP=2;DB;NF=25;NR=25;NS=52;CA=0;DP=444
-1 2551119 rs35955733;-/CCC,venter,watson GCCCC GC 100 PASS AF=0.606107;HP=9;DB;NF=24;NR=35;NS=52;CA=0;DP=492
-1 2551885 rs36036408;-/AC,venter CGTG CG 100 PASS AF=0.356574;HP=1;DB;NF=39;NR=38;NS=52;CA=0;DP=803
-1 2552076 . CGTG CG 100 PASS AF=0.066645;HP=1;NF=25;NR=15;NS=51;CA=0;DP=782
-1 2552384 . CTGT CT 12 PASS AF=0.0121638;HP=1;NF=13;NR=25;NS=52;CA=0;DP=612
-1 2556252 . ACACTC AC 59 PASS AF=0.143579;HP=1;NF=12;NR=9;NS=49;CA=0;DP=331
-1 2578474 . CCACACCCCCAG CG 100 PASS AF=0.930867;HP=3;NF=16;NR=12;NS=51;CA=M;DP=281
-1 2688911 rs34425096;-/TC,venter TTCT TT 100 PASS AF=0.26327;HP=5;DB;NF=17;NR=12;NS=52;CA=0;DP=451
-1 2691366 rs36213670;-/CTCTGGGCCA,mills,venter GCTCTGGGCCAC GC 39 PASS AF=0.191253;HP=1;DB;NF=21;NR=36;NS=52;CA=0;DP=344
-1 2691723 rs57511628;-/ACCCCAGGAGATCCCTGC TA TACCCCAGGAGATCCCTGCA 100 PASS AF=0.332823;HP=1;DB;NF=6;NR=7;NS=52;CA=0;DP=453
-1 2703254 . CA CAA 100 PASS AF=0.111948;HP=3;NF=8;NR=13;NS=51;CA=0;DP=502
-1 2703885 . AC ACC 100 PASS AF=0.0959517;HP=6;NF=24;NR=11;NS=51;CA=0;DP=531
-1 2725125 rs34936518;-/C,venter GCT GT 100 PASS AF=0.375093;HP=1;DB;NF=33;NR=32;NS=52;CA=0;DP=621
-1 2725735 . AACACA AA 24 PASS AF=0.0139746;HP=2;NF=16;NR=4;NS=51;CA=0;DP=639
-1 2726135 rs34620269;-/CA GCAC GC 100 PASS AF=0.0410325;HP=1;DB;NF=28;NR=22;NS=52;CA=0;DP=626
-1 2726213 . GC GCAC 13 PASS AF=0.0257105;HP=1;NF=8;NR=9;NS=52;CA=0;DP=552
-1 2746483 . AC ACC 40 PASS AF=0.0544668;HP=1;NF=4;NR=12;NS=51;CA=0;DP=544
-1 2747281 . TG TGAGAG 100 PASS AF=0.152256;HP=1;NF=11;NR=8;NS=52;CA=0;DP=855
-1 2754002 rs36202379;-/CTGCTTGT,mills,watson ATTGTCTGCT AT 100 PASS AF=0.260861;HP=2;DB;NF=32;NR=35;NS=52;CA=0;DP=496
-1 2755160 rs34916159;-/A TA TAA 100 PASS AF=0.532865;HP=7;DB;NF=10;NR=34;NS=52;CA=0;DP=533
-1 2755983 . GCC GC 100 PASS AF=0.106339;HP=3;NF=18;NR=26;NS=52;CA=M;DP=700
-1 2765711 . AA AAGGAAGGA 100 PASS AF=0.686149;HP=2;NF=11;NR=8;NS=50;CA=0;DP=364
-1 2765863 . AG AGG 100 PASS AF=0.999885;HP=1;NF=14;NR=36;NS=49;CA=0;DP=364
-1 2765952 . AG AGG 100 PASS AF=0.0789769;HP=1;NF=29;NR=29;NS=51;CA=B;DP=851
-1 2779479 . TTTTCTTCTCTTTCT TT 100 PASS AF=0.712577;HP=4;NF=29;NR=22;NS=50;CA=0;DP=322
-1 2794338 rs34131736;-/T CTG CG 100 PASS AF=0.089184;HP=1;DB;NF=7;NR=4;NS=51;CA=0;DP=440
-1 2801123 . TCCTCCCCACCCTGAC TC 48 PASS AF=0.0412327;HP=2;NF=13;NR=18;NS=51;CA=0;DP=343
-1 2803308 watson CATG CG 100 PASS AF=0.160766;HP=1;NF=23;NR=20;NS=52;CA=0;DP=816
-1 2805468 rs56260225;-/ACAA AAAACA AA 100 PASS AF=0.859977;HP=4;DB;NF=62;NR=35;NS=51;CA=0;DP=433
-1 2806441 rs34966309;-/G CG CGG 100 PASS AF=0.211987;HP=4;DB;NF=20;NR=11;NS=52;CA=0;DP=441
-1 2810388 . GCC GC 100 PASS AF=0.11183;HP=2;NF=8;NR=5;NS=51;CA=0;DP=431
-1 2822166 . TACATGCACACA TA 100 PASS AF=0.150719;HP=1;NF=43;NR=52;NS=52;CA=0;DP=844
-1 2822270 rs59677991;-/GC GGCG GG 18 NoQCALL AF=0.0194725;HP=2;DB;NF=15;NR=5;NS=52;CA=0;DP=806
-1 2822473 . CACACAC CC 100 PASS AF=0.138944;HP=1;NF=6;NR=7;NS=52;CA=0;DP=951
-1 2827616 . CAAGC CC 52 PASS AF=0.132317;HP=2;NF=8;NR=4;NS=51;CA=0;DP=300
-1 2828576 . CG CTG 100 PASS AF=0.168378;HP=1;NF=8;NR=2;NS=52;CA=0;DP=325
-1 2829365 rs35758696;-/A TAA TA 100 PASS AF=0.216995;HP=6;DB;NF=20;NR=20;NS=51;CA=0;DP=531
-1 2833106 . TG TGTTGGG 100 PASS AF=0.237115;HP=1;NF=11;NR=4;NS=52;CA=0;DP=336
-1 2834384 . AC ACC 32 PASS AF=0.0617917;HP=1;NF=3;NR=5;NS=52;CA=0;DP=592
-1 2835704 rs35824541;-/G AGG AG 100 PASS AF=0.188967;HP=3;DB;NF=15;NR=11;NS=52;CA=0;DP=691
-1 2836635 rs56691957;-/AT CATG CG 100 PASS AF=0.126742;HP=1;DB;NF=8;NR=13;NS=52;CA=0;DP=611
-1 2851063 . ATGTGTGTCT AT 100 PASS AF=0.224053;HP=1;NF=34;NR=32;NS=52;CA=0;DP=798
-1 2859183 rs34869376;-/CT ACTC AC 100 PASS AF=0.228335;HP=1;DB;NF=11;NR=14;NS=52;CA=0;DP=446
-1 2859269 rs34009406;-/C AC ACC 100 PASS AF=0.168197;HP=2;DB;NF=8;NR=14;NS=52;CA=0;DP=460
-1 2862455 rs34488344;-/T GT GTT 100 PASS AF=0.140555;HP=10;DB;NF=25;NR=16;NS=52;CA=0;DP=484
-1 2866073 . AC ACC 56 PASS AF=0.0758065;HP=1;NF=2;NR=11;NS=51;CA=0;DP=513
-1 2871504 . TA TACTAA 100 PASS AF=0.128765;HP=1;NF=11;NR=12;NS=52;CA=0;DP=676
-1 2871601 rs60410855;-/TCCA CC CCCATC 100 PASS AF=0.11635;HP=3;DB;NF=19;NR=14;NS=52;CA=0;DP=682
-1 2874709 . GT GTT 100 PASS AF=0.138394;HP=9;NF=8;NR=12;NS=51;CA=0;DP=534
-1 2876814 rs5772089;-/A,mills,venter GG GAG 100 PASS AF=0.999994;HP=10;DB;NF=39;NR=42;NS=50;CA=0;DP=343
-1 2877421 rs35085736;-/C,venter GC GCC 100 PASS AF=0.582204;HP=6;DB;NF=29;NR=37;NS=50;CA=0;DP=426
-1 2881114 . GG GTG 100 PASS AF=0.586283;HP=5;NF=16;NR=5;NS=47;CA=M;DP=256
-1 2883970 . GG GCG 16 PASS AF=0.516075;HP=4;NF=6;NR=2;NS=51;CA=M;DP=332
-1 2885504 . TCC TC 29 PASS AF=0.140908;HP=9;NF=12;NR=8;NS=51;CA=0;DP=353
-1 2886983 . AG AGG 50 PASS AF=0.0436199;HP=3;NF=7;NR=2;NS=50;CA=0;DP=401
-1 2887864 rs57379840;-/T,venter CG CTG 100 PASS AF=0.770236;HP=2;DB;NF=41;NR=25;NS=51;CA=0;DP=375
-1 2892284 . CAT CT 100 PASS AF=0.0885935;HP=1;NF=23;NR=17;NS=52;CA=0;DP=685
-1 2892433 venter AT ATCCATCCTCCATCCT 100 PASS AF=0.814532;HP=1;NF=13;NR=12;NS=52;CA=0;DP=620
-1 2892472 . CCCATC CC 100 PASS AF=0.181828;HP=3;NF=50;NR=61;NS=52;CA=0;DP=633
-1 2899352 . CTA CA 100 PASS AF=0.0433393;HP=1;NF=5;NR=2;NS=51;CA=0;DP=512
-1 2902379 . TAGA TA 40 PASS AF=0.0165292;HP=1;NF=3;NR=2;NS=51;CA=0;DP=476
-1 2903930 rs36097640;-/A TAA TA 12 PASS AF=0.0522384;HP=8;DB;NF=13;NR=15;NS=51;CA=0;DP=535
-1 2907194 rs35693840;-/G AG AGG 100 PASS AF=0.136995;HP=5;DB;NF=14;NR=8;NS=52;CA=0;DP=516
-1 2916313 . AC ACC 40 PASS AF=0.0606632;HP=1;NF=1;NR=13;NS=52;CA=0;DP=529
-1 2923107 . GA GGGGGGAA 35 PASS AF=0.311458;HP=1;NF=1;NR=2;NS=50;CA=0;DP=285
-1 2923994 . AAGGA AA 100 PASS AF=0.136914;HP=3;NF=4;NR=16;NS=52;CA=0;DP=475
-1 2926544 rs58065168;-/G TG TGG 100 PASS AF=0.231871;HP=7;DB;NF=23;NR=13;NS=51;CA=0;DP=445
-1 2927774 . GTCT GT 100 PASS AF=0.039848;HP=1;NF=24;NR=39;NS=52;CA=0;DP=466
-1 2928267 rs4013154;-/TCT CAGAA CA 100 PASS AF=0.176094;HP=1;DB;NF=10;GC;NR=20;NS=52;CA=0;DP=390
-1 2931584 . GTGGTGTTTTCATT GT 100 PASS AF=0.171247;HP=1;NF=23;NR=10;NS=52;CA=0;DP=486
-1 2932462 . GT GTGAT 56 PASS AF=0.766604;HP=1;NF=33;NR=13;NS=52;CA=M;DP=790
-1 2932531 . GT GTGGTGAT 56 PASS AF=0.365205;HP=1;NF=19;NR=4;NS=52;CA=M;DP=738
-1 2938240 rs57953122;-/AAGCC AC ACCAAGC 100 PASS AF=0.229942;HP=2;DB;NF=5;NR=7;NS=52;CA=0;DP=387
-1 2939820 rs35035410;-/C,venter GCC GC 100 PASS AF=0.270114;HP=6;DB;NF=15;NR=21;NS=52;CA=0;DP=477
-1 2940602 . GA GAA 100 PASS AF=0.245189;HP=10;NF=31;NR=30;NS=52;CA=0;DP=516
-1 2941986 . ACCC AC 100 PASS AF=0.242307;HP=10;NF=20;NR=20;NS=52;CA=0;DP=471
-1 2943041 rs34450334;-/G,mills CGG CG 100 PASS AF=0.212427;HP=8;DB;NF=13;NR=12;NS=52;CA=0;DP=523
-1 2943605 rs5772091;-/C,mills GC GCC 100 PASS AF=0.155328;HP=1;DB;NF=7;NR=7;NS=52;CA=0;DP=349
-1 2946559 . TT TTGT 100 PASS AF=0.174249;HP=3;NF=13;NR=14;NS=52;CA=0;DP=596
-1 2948391 . TT TTTTTCT 100 PASS AF=0.137955;HP=5;NF=19;NR=16;NS=52;CA=0;DP=557
-1 2949076 rs33910396;-/G,mills CG CGG 100 PASS AF=0.102902;HP=1;DB;NF=3;NR=8;NS=52;CA=0;DP=413
-1 2950056 . TC TCAAACAAAC 100 PASS AF=0.133966;HP=1;NF=9;NR=9;NS=51;CA=0;DP=587
-1 2950689 rs60031908;-/A CAA CA 100 PASS AF=0.200188;HP=8;DB;NF=20;NR=25;NS=51;CA=0;DP=517
-1 2958314 . CC CCCATC 100 PASS AF=0.190271;HP=3;NF=39;NR=18;NS=52;CA=M;DP=454
-1 2961502 rs60708459;-/T AT ATT 100 PASS AF=0.219472;HP=3;DB;NF=14;NR=16;NS=52;CA=0;DP=460
-1 2968615 . AG AGG 100 PASS AF=0.288912;HP=2;NF=11;NR=13;NS=51;CA=0;DP=324
-1 2982005 . GT GGGTT 100 PASS AF=0.189932;HP=5;NF=6;NR=5;NS=52;CA=0;DP=460
-1 2984462 rs34471979;-/C,venter TCC TC 100 PASS AF=0.423837;HP=2;DB;NF=20;NR=27;NS=51;CA=0;DP=459
-1 2985828 rs5772093;-/TTCGGGG,mills,venter,watson CT CTTCGGGGT 100 PASS AF=0.888966;HP=1;DB;NF=22;NR=15;NS=49;CA=0;DP=372
-1 2987353 . AGTG AG 39 PASS AF=0.0534166;HP=1;NF=13;NR=12;NS=51;CA=0;DP=341
-1 2990018 . TC TGC 51 PASS AF=0.347647;HP=1;NF=9;NR=5;NS=52;CA=0;DP=328
-1 2992552 rs55740340;-/TTGT,mills,venter,watson CT CTGTTT 100 PASS AF=0.633228;HP=1;DB;NF=31;NR=31;NS=52;CA=0;DP=471
-1 2994869 . TT TTTAT 48 PASS AF=0.246512;HP=4;NF=8;NR=15;NS=49;CA=0;DP=238
-1 2996339 rs60239912;-/TCATTCAT CT CTCATTCATT 100 PASS AF=0.288255;HP=1;DB;NF=27;NR=24;NS=52;CA=0;DP=550
-1 2996940 . TG TGGG 52 PASS AF=0.252534;HP=1;NF=5;NR=3;NS=51;CA=0;DP=485
-1 2997430 rs58914207;-/TC TTCT TT 17 PASS AF=0.0239916;HP=3;DB;NF=1;NR=3;NS=51;CA=0;DP=533
-1 2998548 rs3067411;-/GC,mills,watson TT TGCT 100 PASS AF=0.513959;HP=2;DB;NF=16;NR=33;NS=51;CA=0;DP=457
-1 2998746 rs33948447;-/CTGAGGGTAT,mills,watson CCTGAGGGTATC CC 100 PASS AF=0.567187;HP=2;DB;NF=32;NR=26;NS=51;CA=0;DP=446
-1 2998922 rs3067390;-/CA,mills,watson CTGT CT 100 PASS AF=0.344398;HP=1;DB;NF=25;NR=25;NS=52;CA=0;DP=544
-1 3001309 . TCTTCC TC 100 PASS AF=0.122521;HP=1;NF=13;NR=16;NS=51;CA=0;DP=463
-1 3003643 rs34727240;-/A CA CAA 100 PASS AF=0.30407;HP=4;DB;NF=23;NR=14;NS=51;CA=0;DP=462
-1 3003980 . ATTCT AT 100 PASS AF=0.0770408;HP=2;NF=12;NR=8;NS=51;CA=0;DP=436
-1 3015507 rs36215320;-/AATAAT,mills AAATAATA AA 100 PASS AF=0.341849;HP=4;DB;NF=19;NR=21;NS=52;CA=M;DP=287
-1 3020627 . GC GCGCGCAC 45 PASS AF=0.0864166;HP=1;NF=3;NR=4;NS=52;CA=0;DP=675
-1 3020729 . GCAC GC 100 PASS AF=0.270815;HP=1;NF=26;NR=22;NS=52;CA=0;DP=511
-1 3020780 . GCAC GC 100 PASS AF=0.0529136;HP=1;NF=14;NR=13;NS=52;CA=0;DP=580
-1 3020851 rs36140038;-/G,venter CC CGC 100 PASS AF=0.0570603;HP=2;DB;NF=7;NR=8;NS=52;CA=0;DP=580
-1 3020930 . GCAC GC 100 PASS AF=0.0608239;HP=1;NF=21;NR=20;NS=52;CA=0;DP=662
-1 3020996 . ACT AT 100 PASS AF=0.0376658;HP=1;NF=4;NR=2;NS=52;CA=0;DP=646
-1 3021049 rs58793198;-/CA AA AACA 100 PASS AF=0.0822964;HP=2;DB;NF=19;NR=18;NS=52;CA=0;DP=756
-1 3024532 . TGTGTGCG TG 100 PASS AF=0.0453628;HP=1;NF=12;NR=35;NS=51;CA=0;DP=585
-1 3035092 venter,watson CTCCCACCATGCTACTGGAGACCAT CT 100 PASS AF=0.175148;HP=1;NF=41;NR=54;NS=51;CA=0;DP=464
-1 3035605 rs56967751;-/TG,venter,watson AG AGTG 100 PASS AF=0.387697;HP=1;DB;NF=30;NR=25;NS=51;CA=0;DP=671
-1 3035812 . CGTG CG 100 PASS AF=0.051827;HP=1;NF=28;NR=20;NS=51;CA=0;DP=643
-1 3035887 . ATGT AT 50 PASS AF=0.0421027;HP=1;NF=24;NR=34;NS=52;CA=0;DP=556
-1 3036291 rs36033160;-/CCG CT CCCGT 100 PASS AF=0.0605711;HP=1;DB;NF=3;NR=5;NS=51;CA=0;DP=428
-1 3037949 rs34840011;-/A,venter TA TAA 100 PASS AF=0.096326;HP=8;DB;NF=5;NR=6;NS=52;CA=0;DP=462
-1 3046082 rs35271327;-/T AT ATT 19 PASS AF=0.0473995;HP=7;DB;NF=9;NR=8;NS=52;CA=0;DP=430
-1 3049499 . ACC AC 27 PASS AF=0.0269129;HP=3;NF=3;NR=1;NS=51;CA=0;DP=373
-1 3053337 . TGG TG 100 PASS AF=0.205181;HP=7;NF=15;NR=19;NS=52;CA=0;DP=424
-1 3058772 . TCATCC TC 100 PASS AF=0.716787;HP=1;NF=61;NR=51;NS=52;CA=0;DP=435
-1 3069377 . CATGGT CT 100 PASS AF=0.42044;HP=1;NF=3;NR=14;NS=48;CA=M;DP=257
-1 3076481 rs35945121;-/T,mills ATT AT 100 PASS AF=0.33892;HP=10;DB;NF=9;NR=38;NS=52;CA=0;DP=438
-1 3079028 . TA TCA 100 PASS AF=0.0528803;HP=1;NF=5;NR=3;NS=51;CA=0;DP=475
-1 3084256 watson AGTTTAGATACTG AG 100 PASS AF=0.123981;HP=1;NF=18;NR=14;NS=52;CA=0;DP=554
-1 3087172 rs34468831;-/A GAA GA 100 PASS AF=0.0618762;HP=3;DB;NF=2;NR=5;NS=50;CA=0;DP=475
-1 3087517 . CACACGCAGTCTTA CA 100 PASS AF=0.637316;HP=1;NF=41;NR=37;NS=52;CA=0;DP=973
-1 3087777 . TA TACA 100 PASS AF=0.377666;HP=1;NF=43;NR=55;NS=52;CA=M;DP=966
-1 3087871 . CACGGTCTTA CA 100 PASS AF=0.589214;HP=1;NF=16;NR=14;NS=51;CA=0;DP=710
-1 3087938 . AG AGTCTTACACAAGCGG 100 PASS AF=0.469462;HP=1;NF=28;NR=29;NS=52;CA=M;DP=816
-1 3088154 . GG GCAG 100 PASS AF=0.0511127;HP=2;NF=11;NR=10;NS=52;CA=M;DP=894
-1 3088232 rs35125658;-/TT GG GCAG 100 PASS AF=0.0967781;HP=2;DB;NF=3;NR=24;NS=51;CA=M;DP=938
-1 3088301 . CT CTTGCACACGCAGTTT 47 PASS AF=0.0188781;HP=2;NF=5;NR=2;NS=51;CA=M;DP=684
-1 3105704 rs35372326;-/G,mills CGG CG 100 PASS AF=0.0956114;HP=2;DB;NF=6;NR=4;NS=52;CA=0;DP=378
-1 3107408 rs5772098;-/G,mills AG AGG 100 PASS AF=0.107417;HP=5;DB;NF=19;NR=15;NS=52;CA=0;DP=504
-1 3107714 rs34461209;-/G,venter TG TGG 100 PASS AF=0.61875;HP=3;DB;NF=21;NR=28;NS=52;CA=0;DP=454
-1 3108534 rs59512254;-/GA GGAG GG 100 PASS AF=0.184609;HP=2;DB;NF=17;NR=11;NS=52;CA=0;DP=510
-1 3121064 . TG TGAG 59 PASS AF=0.0221492;HP=1;NF=7;NR=3;NS=52;CA=0;DP=555
-1 3131583 rs57750843;-/A GAA GA 100 PASS AF=0.166149;HP=9;DB;NF=21;NR=20;NS=52;CA=0;DP=490
-1 3131742 . GT GGGGGGGGGTT 27 PASS AF=0.243052;HP=3;NF=2;NR=1;NS=49;CA=0;DP=394
-1 3135855 rs34340862;-/TAA,mills CT CTAAT 100 PASS AF=0.183257;HP=1;DB;NF=11;NR=9;NS=51;CA=0;DP=520
-1 3146366 . GGAG GG 100 PASS AF=0.040688;HP=4;NF=13;NR=14;NS=51;CA=0;DP=434
-1 3152159 . AT ATT 100 PASS AF=0.0396994;HP=4;NF=8;NR=9;NS=52;CA=0;DP=489
-1 3157729 venter,watson AG AGGGGTGAGGTG 100 PASS AF=0.830079;HP=4;NF=30;NR=23;NS=51;CA=0;DP=548
-1 3158807 . AGG AG 100 PASS AF=0.705976;HP=6;NF=35;NR=30;NS=52;CA=0;DP=371
-1 3158885 . CATG CG 100 PASS AF=0.09216;HP=1;NF=6;NR=6;NS=51;CA=0;DP=375
-1 3163280 . CAAAATA CA 100 PASS AF=0.148526;HP=4;NF=13;NR=1;NS=49;CA=M;DP=326
-1 3164018 rs5772100;-/A,mills,venter TAA TA 100 PASS AF=0.999998;HP=3;DB;NF=67;NR=69;NS=52;CA=0;DP=511
-1 3174387 . CAGG CG 17 PASS AF=0.0141709;HP=1;NF=1;NR=2;NS=51;CA=0;DP=428
-1 3176024 . GACAGTCCCAGAGGAGCA GA 44 PASS AF=0.0444872;HP=1;NF=3;NR=10;NS=52;CA=M;DP=480
-1 3177102 . AG AGAGGAGGACAGTCGGGGAGGACAGTCCCGG 100 PASS AF=0.346135;HP=1;NF=8;NR=13;NS=52;CA=0;DP=550
-1 3179862 rs35987870;-/GTGG ATGTGT AT 100 PASS AF=0.0762534;HP=1;DB;NF=17;NR=17;NS=51;CA=0;DP=618
-1 3183094 rs33953525;-/GGTGCCGTGAACAGAGCCAGCGAGG,mills AG AGGTGCCGTGAACAGAGCCAGCGAGGG 100 PASS AF=0.665581;HP=2;DB;NF=15;NR=15;NS=52;CA=0;DP=424
-1 3183166 rs35451643;-/C,venter TCC TC 100 PASS AF=0.123295;HP=4;DB;NF=12;NR=6;NS=52;CA=0;DP=460
-1 3184208 rs59663829;-/GCACACACAA TA TGCACACACAAA 100 PASS AF=0.152939;HP=1;DB;NF=4;NR=4;NS=52;CA=0;DP=733
-1 3186299 . ACC AC 100 PASS AF=0.951135;HP=8;NF=16;NR=14;NS=51;CA=0;DP=311
-1 3202609 . TG TGGGGGGG 11 PASS AF=0.122471;HP=1;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=479
-1 3292566 . TC TCGGGGTGCCC 12 PASS AF=0.209628;HP=1;NF=22;NR=17;NS=51;CA=0;DP=462
-1 3292669 . AAGA AA 100 PASS AF=0.312194;HP=8;NF=13;NR=14;NS=51;CA=0;DP=483
-1 3293018 rs35846516;-/A,venter GAA GA 100 PASS AF=0.791047;HP=9;DB;NF=59;NR=44;NS=51;CA=0;DP=507
-1 3293422 rs34150215;-/A,mills,venter TA TAA 100 PASS AF=0.418316;HP=7;DB;NF=27;NR=18;NS=52;CA=0;DP=481
-1 3307979 rs35082175;-/A,venter CAT CT 100 PASS AF=0.379363;HP=1;DB;NF=36;NR=25;NS=52;CA=0;DP=659
-1 3308056 . CATA CA 100 PASS AF=0.0313721;HP=1;NF=4;NR=5;NS=52;CA=0;DP=699
-1 3308306 rs34659426;-/AA CAAA CA 100 PASS AF=0.238591;HP=3;DB;NF=23;NR=22;NS=52;CA=0;DP=732
-1 3308692 . GC GCC 100 PASS AF=0.610676;HP=6;NF=23;NR=26;NS=52;CA=0;DP=447
-1 3309461 . ACCCTCCTCTGAGTCTTCCTCCCCTTCCCGTGC AC 100 PASS AF=0.218197;HP=3;NF=28;NR=41;NS=51;CA=0;DP=430
-1 3313004 . ATT AT 18 PASS AF=0.117282;HP=10;NF=22;NR=12;NS=51;CA=0;DP=407
-1 3315219 rs35154920;-/GT CG CGTG 100 PASS AF=0.407055;HP=1;DB;NF=23;NR=17;NS=52;CA=0;DP=498
-1 3315279 rs34306698;-/AT CG CATG 100 PASS AF=0.27165;HP=1;DB;NF=18;NR=10;NS=51;CA=0;DP=460
-1 3315552 rs61650876;-/ATGT CATGTG CG 100 PASS AF=0.074251;HP=1;DB;NF=10;NR=7;NS=52;CA=0;DP=612
-1 3315608 . CGTG CG 44 PASS AF=0.0200264;HP=1;NF=15;NR=25;NS=52;CA=0;DP=622
-1 3316180 rs34769314;-/GTGA TGTGAG TG 100 PASS AF=0.13026;HP=1;DB;NF=29;NR=21;NS=52;CA=0;DP=930
-1 3316258 rs57503175;-/TGTATGTGCGTGTGTGTGGTGTG GG GGTGTGTGGTGTGTGTATGTGCGTG 100 PASS AF=0.277124;HP=3;DB;NF=3;NR=11;NS=52;CA=0;DP=898
-1 3316338 rs34133894;-/GT GGTG GG 100 PASS AF=0.121606;HP=2;DB;NF=18;NR=27;NS=52;CA=0;DP=901
-1 3316408 . TGG TG 100 PASS AF=0.153074;HP=7;NF=23;NR=10;NS=52;CA=0;DP=898
-1 3316476 rs60842130;-/GTG TGTGG TG 43 PASS AF=0.0151943;HP=1;DB;NF=4;NR=1;NS=52;CA=0;DP=732
-1 3317481 rs34240659;-/AT CATA CA 100 PASS AF=0.127605;HP=1;DB;NF=14;NR=8;NS=52;CA=0;DP=538
-1 3319964 . ACC AC 100 PASS AF=0.0511239;HP=5;NF=12;NR=4;NS=52;CA=0;DP=505
-1 3327173 rs56093721;-/A,venter TAA TA 100 PASS AF=0.89527;HP=9;DB;NF=37;NR=68;NS=52;CA=0;DP=540
-1 3328302 . AG AGGGGGG 53 PASS AF=0.124625;HP=2;NF=13;NR=2;NS=52;CA=0;DP=585
-1 3335208 . CGG CG 100 PASS AF=0.0438559;HP=2;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=448
-1 3335551 rs34869178;-/T CTC CC 100 PASS AF=0.0947355;HP=1;DB;NF=4;NR=8;NS=52;CA=0;DP=487
-1 3342021 rs34485545;-/A TA TAA 100 PASS AF=0.154806;HP=9;DB;NF=25;NR=23;NS=52;CA=0;DP=444
-1 3347098 venter CG CAG 100 PASS AF=0.931731;HP=1;NF=49;NR=54;NS=52;CA=0;DP=497
-1 3348129 rs55866341;-/G,venter CG CGG 100 PASS AF=0.883294;HP=1;DB;NF=55;NR=55;NS=52;CA=0;DP=521
-1 3352897 . AA ACA 46 PASS AF=0.0385898;HP=6;NF=2;NR=6;NS=51;CA=0;DP=407
-1 3353821 rs34792713;-/T AT ATT 36 PASS AF=0.0290672;HP=1;DB;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=428
-1 3356271 . TTCCT TT 15 PASS AF=0.00990969;HP=3;NF=1;NR=1;NS=52;CA=0;DP=537
-1 3356391 rs4018597;-/TA TT TTAT 100 PASS AF=0.0517593;HP=2;DB;NF=13;NR=11;NS=52;CA=0;DP=475
-1 3356436 rs5772104;-/GT CGTG CG 100 PASS AF=0.82813;HP=1;DB;NF=59;NR=53;NS=51;CA=0;DP=449
-1 3356871 . CATG CG 26 PASS AF=0.0193592;HP=1;NF=1;NR=3;NS=51;CA=0;DP=430
-1 3359412 rs34037774;-/G,venter TGG TG 59 PASS AF=0.0301496;HP=2;DB;NF=4;NR=5;NS=52;CA=0;DP=451
-1 3370575 rs35597752;-/TG,venter,watson CTGT CT 100 PASS AF=0.760154;HP=1;DB;NF=43;NR=36;NS=52;CA=0;DP=405
-1 3372018 rs34109718;-/G,venter CGG CG 100 PASS AF=0.891318;HP=3;DB;NF=46;NR=36;NS=51;CA=0;DP=349
-1 3383745 rs57207202;-/C AC ACC 100 PASS AF=0.182529;HP=4;DB;NF=9;NR=7;NS=47;CA=D;DP=229
-1 3384084 rs5772105;-/G,mills,venter CG CGG 100 PASS AF=0.937697;HP=2;DB;NF=49;NR=47;NS=50;CA=0;DP=457
-1 3385833 rs5772106;-/CC,mills,venter,watson ACCC AC 100 PASS AF=0.778535;HP=5;DB;NF=33;NR=14;NS=51;CA=0;DP=418
-1 3387275 rs56102150;-/TC,venter CC CCTC 100 PASS AF=0.999995;HP=4;DB;NF=16;NR=36;NS=50;CA=0;DP=364
-1 3388739 rs58188396;-/GGGGGGCGGGTAGCC GG GGGGGGGCGGGTAGCCG 40 PASS AF=0.263678;HP=7;DB;NF=3;NR=2;NS=48;CA=0;DP=326
-1 3393157 . AAAAAATA AA 100 PASS AF=0.0549314;HP=6;NF=23;NR=18;NS=51;CA=0;DP=468
-1 3393524 . GGTGTG GG 23 PASS AF=0.017751;HP=2;NF=1;NR=19;NS=49;CA=0;DP=266
-1 3409800 . AAGA AA 100 PASS AF=0.0431791;HP=3;NF=1;NR=8;NS=51;CA=0;DP=643
-1 3410131 rs58666986;-/GTGT ATGTGT AT 100 PASS AF=0.0433727;HP=1;DB;NF=7;NR=13;NS=52;CA=0;DP=603
-1 3411485 rs60864742;-/ACACCGGTAGCAAGGCA,mills ACACCGGTAGCAAGGCACC AC 100 PASS AF=0.0858716;HP=1;DB;NF=8;NR=17;NS=52;CA=0;DP=523
-1 3417374 . GCACACGCCCCCACCC GC 20 PASS AF=0.0294079;HP=1;NF=4;NR=3;NS=50;CA=0;DP=447
-1 3429498 rs56204236;-/G CG CGG 100 PASS AF=0.596026;HP=10;DB;NF=6;NR=7;NS=51;CA=0;DP=322
-1 3435396 . CACAGA CA 100 PASS AF=0.0433621;HP=1;NF=2;NR=6;NS=52;CA=0;DP=457
-1 3442767 rs36106109;-/G CG CGG 100 PASS AF=0.112939;HP=5;DB;NF=5;NR=6;NS=50;CA=0;DP=369
-1 3451064 rs36030995;-/C GC GCC 100 PASS AF=0.385449;HP=5;DB;NF=22;NR=12;NS=50;CA=0;DP=388
-1 3456931 rs35289361;-/G AG AGG 100 PASS AF=0.0676076;HP=4;DB;NF=11;NR=9;NS=52;CA=0;DP=554
-1 3467274 watson GGGCTG GG 100 PASS AF=0.132596;HP=3;NF=16;NR=12;NS=51;CA=0;DP=428
-1 3475422 rs61428836;-/G TG TGG 100 PASS AF=0.0480433;HP=3;DB;NF=6;NR=10;NS=52;CA=0;DP=468
-1 3482055 . CA CGTCTTATA 100 PASS AF=0.593516;HP=1;NF=10;NR=11;NS=49;CA=M;DP=256
-1 3482413 mills,watson TCTCC TC 100 PASS AF=0.414589;HP=1;NF=24;NR=32;NS=51;CA=0;DP=496
-1 3485140 venter,watson CCAAC CC 100 PASS AF=0.714294;HP=2;NF=21;NR=32;NS=52;CA=0;DP=460
-1 3486991 rs35452084;-/G,venter AGG AG 100 PASS AF=0.744909;HP=4;DB;NF=15;NR=35;NS=50;CA=0;DP=363
-1 3492812 . CGTG CG 14 PASS AF=0.0148914;HP=1;NF=22;NR=26;NS=51;CA=0;DP=585
-1 3494290 . AC ACAGGACCGGCC 100 PASS AF=0.117184;HP=1;NF=2;NR=22;NS=52;CA=0;DP=464
-1 3496820 rs34860893;-/C,mills,venter ACC AC 100 PASS AF=0.924032;HP=7;DB;NF=33;NR=48;NS=52;CA=0;DP=386
-1 3504928 rs36094767;-/C,venter TC TCC 100 PASS AF=0.786142;HP=4;DB;NF=23;NR=43;NS=51;CA=0;DP=405
-1 3511572 rs3072238;-/TCAC,venter ACACTC AC 100 PASS AF=0.160871;HP=1;DB;NF=22;NR=22;NS=52;CA=0;DP=824
-1 3511789 rs59801836;-/CTCA,watson ACACTC AC 100 PASS AF=0.620819;HP=1;DB;NF=54;NR=52;NS=52;CA=0;DP=740
-1 3511919 . TACA TA 100 PASS AF=0.049568;HP=1;NF=20;NR=22;NS=52;CA=0;DP=729
-1 3511980 rs57128321;-/ACTC,venter,watson AC ACACTC 100 PASS AF=0.937206;HP=1;DB;NF=63;NR=38;NS=52;CA=0;DP=712
-1 3512089 rs61705210;-/TCACAC,venter,watson AACTCACA AA 100 PASS AF=0.658764;HP=3;DB;NF=65;NR=52;NS=52;CA=0;DP=808
-1 3516936 rs60239345;-/CA,venter CG CCAG 100 PASS AF=0.999997;HP=1;DB;NF=52;NR=26;NS=52;CA=0;DP=391
-1 3519155 rs35740208;-/G,venter AGG AG 100 PASS AF=0.108418;HP=3;DB;NF=7;NR=11;NS=51;CA=0;DP=505
-1 3523781 rs56339243;-/GGCTCC,venter,watson AC ACCGGCTC 100 PASS AF=0.603986;HP=3;DB;NF=20;NR=23;NS=52;CA=0;DP=449
-1 3526023 . GGCACTTCCCGCCCCCGTCACCCCTGCCGCCATG GG 100 PASS AF=0.227609;HP=2;NF=10;NR=15;NS=52;CA=0;DP=454
-1 3526486 rs35020651;-/C,venter TC TCC 100 PASS AF=0.389171;HP=3;DB;NF=32;NR=20;NS=52;CA=0;DP=470
-1 3530060 . TGG TG 100 PASS AF=0.033793;HP=3;NF=6;NR=1;NS=52;CA=0;DP=540
-1 3531966 rs3838971;-/C TG TGG 100 PASS AF=0.155382;HP=6;DB;NF=14;NR=11;NS=49;CA=0;DP=292
-1 3534095 rs35816205;-/A,mills,venter TAA TA 100 PASS AF=0.160054;HP=3;DB;NF=9;NR=10;NS=52;CA=0;DP=455
-1 3535035 rs58849058;-/TCTGGGAGCTCCTCCCCCT,venter,watson GTTCTGGGAGCTCCTCCCCCT GT 100 PASS AF=0.609724;HP=2;DB;NF=50;NR=48;NS=52;CA=0;DP=487
-1 3535985 . CCAAAC CC 100 PASS AF=0.116123;HP=2;NF=10;NR=13;NS=51;CA=0;DP=553
-1 3536124 rs55905548;-/GGCG,venter,watson CCGGGC CC 100 PASS AF=0.45742;HP=3;DB;NF=28;NR=31;NS=51;CA=0;DP=499
-1 3543853 . TC TCC 100 PASS AF=0.156605;HP=6;NF=12;NR=13;NS=52;CA=0;DP=527
-1 3549495 . AC ACCCCC 34 PASS AF=0.0959154;HP=1;NF=1;NR=3;NS=52;CA=0;DP=496
-1 3553372 rs34514629;-/C,venter GCA GA 100 PASS AF=0.652107;HP=1;DB;NF=45;NR=47;NS=52;CA=0;DP=551
-1 3556485 rs3831025;-/CAGCCTGC,venter,watson AGCAGGCTGC AC 100 PASS AF=0.38103;HP=1;DB;NF=13;NR=9;NS=49;CA=0;DP=292
-1 3556883 . CA CATA 14 PASS AF=0.0221011;HP=1;NF=9;NR=13;NS=50;CA=0;DP=436
-1 3563429 . CG CGGGGG 56 PASS AF=0.17049;HP=2;NF=3;NR=7;NS=52;CA=0;DP=586
-1 3564334 rs3034639;-/GT,mills GA GACA 100 PASS AF=0.227635;HP=1;DB;NF=10;NR=13;NS=50;CA=0;DP=364
-1 3564964 rs5772113;-/G TGG TG 100 PASS AF=0.220888;HP=2;DB;NF=11;NR=18;NS=50;CA=0;DP=408
-1 3565238 venter GGTCTCCTACAGTCATATTTTGGGGTGACGTATTCTAG GG 100 PASS AF=0.145422;HP=2;NF=1;NR=10;NS=52;CA=M;DP=323
-1 3566253 rs57149403;-/GTCCAGC AC ACGTCCAGC 100 PASS AF=0.0476733;HP=1;DB;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=363
-1 3567114 . ATG AG 100 PASS AF=0.0358982;HP=1;NF=3;NR=5;NS=52;CA=0;DP=555
-1 3568146 rs3034606;-/TA GTAT GT 100 PASS AF=0.533957;HP=1;DB;NF=12;NR=29;NS=51;CA=0;DP=247
-1 3570893 rs34305694;-/C TCC TC 100 PASS AF=0.0467251;HP=2;DB;NF=5;NR=3;NS=52;CA=0;DP=443
-1 3574939 . CG CGTGTGTG 23 PASS AF=0.401022;HP=1;NF=46;NR=32;NS=52;CA=0;DP=481
-1 3586002 . ACTC AC 100 PASS AF=0.157197;HP=1;NF=17;NR=24;NS=52;CA=0;DP=691
-1 3586231 rs61542341;-/GTCTCT CTCTCTGT CT 12 PASS AF=0.0310208;HP=1;DB;NF=1;NR=11;NS=52;CA=M;DP=400
-1 3586281 . CTTT CT 21 PASS AF=0.115475;HP=3;NF=1;NR=3;NS=51;CA=M;DP=469
-1 3589610 rs57492244;-/G TGG TG 100 PASS AF=0.0691843;HP=7;DB;NF=11;NR=8;NS=51;CA=0;DP=527
-1 3593995 rs57765962;-/AT,watson AATG AG 100 PASS AF=0.127015;HP=2;DB;NF=10;NR=8;NS=52;CA=0;DP=423
-1 3603570 . GCGGGGCCCACCTCGCACCCGCGGCCCACGTCGCACCC GC 100 PASS AF=0.0758905;HP=1;NF=8;NR=12;NS=51;CA=0;DP=414
-1 3606881 rs5772119;-/A,venter TAG TG 100 PASS AF=0.333638;HP=1;DB;NF=12;NR=36;NS=51;CA=0;DP=522
-1 3618309 rs3841787;-/TG,watson CATG CG 100 PASS AF=0.219932;HP=1;DB;NF=14;NR=14;NS=50;CA=0;DP=449
-1 3619353 venter GCCCCTGCC GC 100 PASS AF=0.290838;HP=4;NF=18;NR=8;NS=51;CA=0;DP=322
-1 3629994 rs35939665;-/CTGC,mills,venter,watson TCTGCC TC 100 PASS AF=0.953969;HP=1;DB;NF=43;NR=31;NS=51;CA=0;DP=364
-1 3630547 rs35380007;-/A,venter TA TAA 100 PASS AF=0.373122;HP=2;DB;NF=20;NR=12;NS=51;CA=0;DP=293
-1 3632819 rs61728692;-/CGGA GT GCGGAT 100 PASS AF=0.63605;HP=1;DB;NF=18;NR=3;NS=48;CA=0;DP=238
-1 3632891 . GGATTG GG 46 PASS AF=0.024415;HP=2;NF=4;NR=2;NS=49;CA=0;DP=381
-1 3633325 . CG CGATGGATGGGTGG 100 PASS AF=0.870192;HP=1;NF=3;NR=4;NS=52;CA=0;DP=751
-1 3635416 rs3034587;-/CTCTCT,mills,venter AA AAGAGAGA 100 PASS AF=0.707697;HP=3;DB;NF=37;NR=27;NS=52;CA=0;DP=538
-1 3643833 . AC ACCC 25 PASS AF=0.0664372;HP=1;NF=3;NR=3;NS=51;CA=0;DP=511
-1 3648954 rs3216059;-/G AG AGG 100 PASS AF=0.42719;HP=4;DB;NF=35;NR=35;NS=51;CA=0;DP=551
-1 3660684 . GA GCA 100 PASS AF=0.136632;HP=1;NF=2;NR=10;NS=49;CA=0;DP=480
-1 3663009 rs35440871;-/AA CAAG CG 100 PASS AF=0.2595;HP=2;DB;NF=19;NR=14;NS=51;CA=0;DP=498
-1 3665663 rs60798590;-/TATTTAAAAAT,watson CA CAATTATTTAAAA 33 PASS AF=0.0338921;HP=2;DB;NF=8;NR=3;NS=51;CA=0;DP=388
-1 3665995 . TTTGAAACT TT 33 PASS AF=0.00986571;HP=4;NF=1;NR=3;NS=52;CA=0;DP=507
-1 3668078 . AGG AG 100 PASS AF=0.341281;HP=8;NF=21;NR=29;NS=52;CA=0;DP=467
-1 3677245 rs36002367;-/AG AAGA AA 100 PASS AF=0.137474;HP=3;DB;NF=6;NR=10;NS=52;CA=0;DP=521
-1 3680208 . TG TGG 10 PASS AF=0.0239017;HP=1;NF=7;NR=5;NS=51;CA=0;DP=448
-1 3681294 venter CC CGCAC 100 PASS AF=0.200075;HP=8;NF=7;NR=2;NS=50;CA=0;DP=245
-1 3682989 rs35616712;-/C TCC TC 100 PASS AF=0.0813904;HP=3;DB;NF=9;NR=3;NS=51;CA=0;DP=447
-1 3684305 venter CG CGG 100 PASS AF=0.0596707;HP=3;NF=4;NR=6;NS=51;CA=0;DP=416
-1 3686623 rs35661250;-/AG CA CAGA 100 PASS AF=0.0609898;HP=1;DB;NF=5;NR=6;NS=52;CA=0;DP=626
-1 3691009 rs35756038;-/A,venter CAA CA 100 PASS AF=0.444393;HP=2;DB;NF=24;NR=32;NS=52;CA=0;DP=562
-1 3696676 . CCTG CG 100 PASS AF=0.102585;HP=4;NF=7;NR=6;NS=52;CA=0;DP=502
-1 3697316 rs34679063;-/C,venter GC GCC 100 PASS AF=0.8246;HP=1;DB;NF=51;NR=32;NS=52;CA=0;DP=438
-1 3704105 . TT TTAATTTTTATATTAACCGTGTTAATAT 100 PASS AF=0.377269;HP=2;NF=17;NR=26;NS=52;CA=0;DP=476
-1 3708451 watson TG TGGAGG 43 PASS AF=0.0406373;HP=2;NF=3;NR=4;NS=52;CA=0;DP=587
-1 3710853 rs35447451;-/G,venter AG AGG 100 PASS AF=0.272856;HP=4;DB;NF=25;NR=31;NS=52;CA=0;DP=507
-1 3711553 rs36007194;-/T AT ATT 100 PASS AF=0.093968;HP=10;DB;NF=11;NR=13;NS=52;CA=0;DP=515
-1 3712668 rs35364504;-/GA,venter GGAG GG 100 PASS AF=0.369523;HP=5;DB;NF=18;NR=34;NS=51;CA=0;DP=320
-1 3713867 venter TTTTATTTAT TT 100 PASS AF=0.301438;HP=5;NF=21;NR=36;NS=49;CA=0;DP=294
-1 3714365 rs58666367;-/CTCAT,venter,watson GA GATCTCA 100 PASS AF=0.431722;HP=1;DB;NF=24;NR=17;NS=52;CA=0;DP=484
-1 3721514 rs3838969;-/A,venter CG CTG 100 PASS AF=0.472733;HP=2;DB;NF=27;NR=26;NS=52;CA=0;DP=461
-1 3726918 rs34085838;-/G CG CGG 100 PASS AF=0.242958;HP=1;DB;NF=17;NR=14;NS=52;CA=0;DP=479
-1 3728638 rs61301856;-/GA,venter,watson TGAG TG 100 PASS AF=0.446341;HP=1;DB;NF=54;NR=33;NS=52;CA=0;DP=666
-1 3729131 rs56900717;-/A TT TAT 100 PASS AF=0.489357;HP=2;DB;NF=33;NR=22;NS=52;CA=0;DP=466
-1 3733293 rs5772126;-/G,venter TG TGG 100 PASS AF=0.701257;HP=2;DB;NF=17;NR=26;NS=51;CA=0;DP=451
-1 3733413 . CA CAA 100 PASS AF=0.107016;HP=5;NF=12;NR=16;NS=52;CA=0;DP=523
-1 3735276 venter TA TAAA 100 PASS AF=0.491527;HP=1;NF=29;NR=33;NS=52;CA=0;DP=477
-1 3737219 rs61056063;-/A AGA AA 11 PASS AF=0.205567;HP=1;DB;NF=13;NR=6;NS=51;CA=0;DP=431
-1 3740075 rs35801288;-/C ACA AA 100 PASS AF=0.438207;HP=1;DB;NF=35;NR=12;NS=52;CA=0;DP=395
-1 3741588 rs34966926;-/T,venter GT GTT 100 PASS AF=0.212825;HP=10;DB;NF=21;NR=22;NS=51;CA=0;DP=541
-1 3748510 mills TTTTTTAT TT 53 PASS AF=0.0323102;HP=7;NF=21;NR=15;NS=51;CA=0;DP=420
-1 3759325 . CG CGGCCAAGGAG 100 PASS AF=0.391954;HP=2;NF=19;NR=18;NS=52;CA=0;DP=465
-1 3759824 . CG CGGG 22 PASS AF=0.0355289;HP=5;NF=4;NR=8;NS=52;CA=0;DP=591
-1 3760224 rs61309375;-/A,venter CAG CG 100 PASS AF=0.303624;HP=1;DB;NF=27;NR=13;NS=51;CA=0;DP=447
-1 3773150 . CTT CT 12 NoQCALL AF=0.0786801;HP=2;NF=1;NR=9;NS=52;CA=0;DP=540
-1 3774838 . GT GTT 11 PASS AF=0.0109686;HP=1;NF=2;NR=1;NS=52;CA=0;DP=492
-1 3774974 venter CG CTG 100 PASS AF=0.552417;HP=1;NF=26;NR=38;NS=52;CA=0;DP=559
-1 3776839 . TGG TG 100 PASS AF=0.0926011;HP=3;NF=5;NR=5;NS=52;CA=0;DP=441
-1 3780438 venter CT CTTT 100 PASS AF=0.113197;HP=2;NF=10;NR=13;NS=52;CA=0;DP=654
-1 3780687 rs34664006;-/G TGT TT 50 PASS AF=0.0614825;HP=1;DB;NF=4;NR=8;NS=50;CA=M;DP=299
-1 3784253 venter ACTGTGCCGGCTTTCTATTC AC 100 PASS AF=0.0567473;HP=1;NF=81;NR=75;NS=52;CA=0;DP=627
-1 3786092 . TACTCA TA 100 PASS AF=0.0330531;HP=1;NF=1;NR=6;NS=52;CA=0;DP=497
-1 3788460 rs35600694;-/ATA,watson CA CAATA 100 PASS AF=0.42686;HP=1;DB;NF=20;NR=17;NS=51;CA=0;DP=533
-1 3788666 rs34172576;-/T,venter GT GTT 100 PASS AF=0.481873;HP=1;DB;NF=26;NR=12;NS=52;CA=0;DP=409
-1 3804956 rs60302317;-/CAACA AACAACA AA 46 PASS AF=0.0866272;HP=2;DB;NF=6;NR=2;NS=52;CA=M;DP=556
-1 3805210 rs58663935;-/AAAG CA CAAAGA 100 PASS AF=0.0920558;HP=3;DB;NF=9;NR=2;NS=52;CA=0;DP=523
-1 3805480 . GAA GA 55 PASS AF=0.0675729;HP=8;NF=13;NR=11;NS=52;CA=0;DP=539
-1 3805914 . CCAGACACTGGCACCCCCCTTC CC 100 PASS AF=0.0288464;HP=2;NF=5;NR=4;NS=52;CA=0;DP=613
-1 3806447 rs35704040;-/C,mills GCC GC 100 PASS AF=0.0700176;HP=6;DB;NF=4;NR=8;NS=52;CA=0;DP=350
-1 3807398 rs35759189;-/G,venter AGG AG 100 PASS AF=0.324114;HP=3;DB;NF=21;NR=8;NS=50;CA=0;DP=355
-1 3808303 venter GT GTTCTTTTCTTT 100 PASS AF=0.475205;HP=2;NF=19;NR=9;NS=52;CA=0;DP=264
-1 3809301 . TACA TA 100 PASS AF=0.028676;HP=1;NF=26;NR=22;NS=52;CA=0;DP=553
-1 3813066 rs34938659;-/T ATT AT 100 PASS AF=0.131264;HP=2;DB;NF=8;NR=6;NS=52;CA=0;DP=521
-1 3814885 . TCACACACACACACACAC TC 34 PASS AF=0.149965;HP=1;NF=6;NR=2;NS=52;CA=M;DP=644
-1 3818483 . AC ACC 29 PASS AF=0.0676027;HP=3;NF=1;NR=7;NS=50;CA=0;DP=412
-1 3820456 . TGG TG 12 PASS AF=0.0215117;HP=4;NF=5;NR=1;NS=51;CA=0;DP=417
-1 3824944 . GCTC GC 100 PASS AF=0.174164;HP=1;NF=9;NR=17;NS=50;CA=0;DP=277
-1 3825911 . CG CGGGGGG 100 PASS AF=0.29134;HP=2;NF=24;NR=12;NS=52;CA=0;DP=514
-1 3827024 . TTCCCT TT 16 PASS AF=0.0318298;HP=2;NF=34;NR=70;NS=51;CA=M;DP=394
-1 3827604 . TG TGG 40 PASS AF=0.0159039;HP=1;NF=2;NR=5;NS=52;CA=0;DP=571
-1 3833062 watson TC TCCACC 100 PASS AF=0.312659;HP=2;NF=17;NR=16;NS=52;CA=0;DP=463
-1 3833266 venter,watson AT ATCAGT 100 PASS AF=0.497122;HP=1;NF=10;NR=19;NS=51;CA=0;DP=412
-1 3833395 . CTATCTT CT 24 PASS AF=0.0218407;HP=1;NF=7;NR=3;NS=50;CA=0;DP=400
-1 3833485 . GTCTAT GT 100 PASS AF=0.417779;HP=1;NF=11;NR=12;NS=50;CA=0;DP=323
-1 3833578 watson TTATCT TT 100 PASS AF=0.329625;HP=2;NF=27;NR=26;NS=51;CA=0;DP=388
-1 3833880 watson CA CATCTA 100 PASS AF=0.347946;HP=1;NF=11;NR=13;NS=52;CA=0;DP=458
-1 3906706 . TGG TG 100 PASS AF=0.149111;HP=3;NF=11;NR=9;NS=52;CA=0;DP=498
-1 3907565 rs34088401;-/C,mills TCC TC 100 PASS AF=0.191109;HP=6;DB;NF=11;NR=14;NS=51;CA=0;DP=478
-1 3909253 . AC ACC 100 PASS AF=0.0974891;HP=2;NF=10;NR=9;NS=52;CA=0;DP=591
-1 3909917 rs35302885;-/T,venter CTT CT 100 PASS AF=0.766256;HP=7;DB;NF=45;NR=61;NS=52;CA=0;DP=605
-1 3916501 rs55698528;-/A,venter GA GAA 100 PASS AF=0.624637;HP=1;DB;NF=37;NR=28;NS=52;CA=0;DP=488
-1 3920626 rs59758170;-/TAAATAAATA AATAAATAAATA AA 100 PASS AF=0.276985;HP=3;DB;NF=6;NR=6;NS=50;CA=M;DP=308
-1 3923069 . TCG TG 100 PASS AF=0.224119;HP=1;NF=23;NR=7;NS=52;CA=0;DP=488
-1 3925431 rs34400281;-/T,venter CTT CT 100 PASS AF=0.372459;HP=2;DB;NF=14;NR=10;NS=51;CA=0;DP=500
-1 3933527 . ATTCCCCACAGTGTCTATGGGGACTCTAGCACGGTCAGGGACCCT AT 100 PASS AF=0.0367516;HP=2;NF=29;NR=33;NS=51;CA=0;DP=622
-1 3934862 venter GCAC GC 100 PASS AF=0.565308;HP=1;NF=47;NR=42;NS=51;CA=0;DP=648
-1 3935044 . TCAC TC 40 PASS AF=0.0156518;HP=1;NF=25;NR=8;NS=52;CA=0;DP=717
-1 3937578 rs56700097;-/A,venter TG TAG 100 PASS AF=0.540707;HP=1;DB;NF=40;NR=17;NS=52;CA=0;DP=392
-1 3938627 rs58820377;-/ATAG TTAGAT TT 100 PASS AF=0.0846429;HP=2;DB;NF=10;NR=11;NS=52;CA=0;DP=489
-1 3945777 . CAGA CA 100 PASS AF=0.442957;HP=1;NF=49;NR=35;NS=52;CA=M;DP=511
-1 3967107 venter GAGAA GA 100 PASS AF=0.226936;HP=1;NF=10;NR=15;NS=52;CA=0;DP=543
-1 3971955 rs56102422;-/T AT ATT 100 PASS AF=0.275646;HP=10;DB;NF=12;NR=15;NS=52;CA=0;DP=477
-1 3973109 rs56883229;-/T,venter ATT AT 100 PASS AF=0.374332;HP=8;DB;NF=7;NR=38;NS=52;CA=0;DP=398
-1 3974590 . ATT AT 100 PASS AF=0.373956;HP=8;NF=19;NR=19;NS=51;CA=0;DP=352
-1 3976220 . TTCCAGCTGTTGGACTGGCAAACAGT TT 100 PASS AF=0.155908;HP=3;NF=51;NR=67;NS=52;CA=0;DP=702
-1 3983232 . GC GCC 100 PASS AF=0.153929;HP=3;NF=2;NR=12;NS=51;CA=0;DP=479
-1 3989673 rs34117538;-/T CTT CT 100 PASS AF=0.138005;HP=7;DB;NF=10;NR=16;NS=52;CA=0;DP=480
-1 3991472 . GT GTT 41 PASS AF=0.0921994;HP=10;NF=23;NR=19;NS=52;CA=0;DP=490
-1 3995340 . GAATA GA 100 PASS AF=0.126804;HP=2;NF=18;NR=25;NS=51;CA=0;DP=456
-1 3995701 rs35842317;-/A GA GAA 100 PASS AF=0.287765;HP=3;DB;NF=16;NR=28;NS=52;CA=0;DP=515
-1 3998289 rs34690250;-/C AT ATT 31 PASS AF=0.0505667;HP=1;DB;NF=5;NR=6;NS=50;CA=0;DP=373
-1 3998556 rs35439065;-/C,venter AC ACC 100 PASS AF=0.152989;HP=1;DB;NF=17;NR=4;NS=52;CA=0;DP=565
-1 4003805 . CCCTTC CC 100 PASS AF=0.497734;HP=3;NF=13;NR=9;NS=52;CA=M;DP=357
-1 4004467 . TA TAA 100 PASS AF=0.178845;HP=10;NF=39;NR=12;NS=52;CA=0;DP=482
-1 4005161 . AAGA AA 10 PASS AF=0.109604;HP=8;NF=5;NR=3;NS=52;CA=0;DP=418
-1 4009724 . GGAGAGGGAGAAG GG 100 PASS AF=0.0443217;HP=4;NF=7;NR=9;NS=51;CA=0;DP=347
-1 4010638 rs59300943;-/T CT CTT 100 PASS AF=0.238748;HP=5;DB;NF=17;NR=13;NS=52;CA=0;DP=424
-1 4018608 . GGGAG GG 14 PASS AF=0.0210215;HP=3;NF=11;NR=22;NS=52;CA=0;DP=439
-1 4020045 rs60135555;-/AAA,venter TA TAAAA 55 PASS AF=0.669408;HP=9;DB;NF=19;NR=3;NS=52;CA=0;DP=315
-1 4021381 . CTGGGAAC CC 26 PASS AF=0.0682584;HP=1;NF=1;NR=7;NS=52;CA=0;DP=500
-1 4022270 . TG TCG 59 PASS AF=0.0269606;HP=6;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=522
-1 4022431 rs58149124;-/CC,watson TC TCCC 100 PASS AF=0.833755;HP=1;DB;NF=29;NR=41;NS=52;CA=0;DP=574
-1 4024133 rs56013829;-/GTCA,venter ACAGTC AC 100 PASS AF=0.444062;HP=1;DB;NF=29;NR=25;NS=52;CA=0;DP=599
-1 4024168 rs56372495;-/AC,venter TCAC TC 100 PASS AF=0.370935;HP=1;DB;NF=14;NR=39;NS=52;CA=0;DP=645
-1 4024408 rs55816119;-/TT,watson TC TCAC 100 PASS AF=0.479654;HP=1;DB;NF=17;NR=29;NS=52;CA=0;DP=726
-1 4024524 . ACTC AC 100 PASS AF=0.220192;HP=1;NF=11;NR=5;NS=52;CA=0;DP=721
-1 4024673 . TT TTCACT 100 PASS AF=0.173855;HP=2;NF=11;NR=13;NS=52;CA=0;DP=887
-1 4024704 . TCAG TG 100 PASS AF=0.0291681;HP=1;NF=6;NR=1;NS=52;CA=0;DP=750
-1 4024735 venter TC TCAC 100 PASS AF=0.247468;HP=1;NF=19;NR=5;NS=52;CA=0;DP=775
-1 4024928 . CTCAGT CT 100 PASS AF=0.0974879;HP=1;NF=11;NR=7;NS=52;CA=0;DP=919
-1 4025065 . TCAC TC 100 PASS AF=0.273013;HP=1;NF=7;NR=12;NS=52;CA=0;DP=714
-1 4025127 . ACTC AC 100 PASS AF=0.380734;HP=1;NF=17;NR=20;NS=52;CA=M;DP=574
-1 4025165 . TC TCACTCAC 100 PASS AF=0.0820414;HP=1;NF=1;NR=9;NS=52;CA=M;DP=574
-1 4025232 watson TC TCAC 100 PASS AF=0.631924;HP=1;NF=15;NR=11;NS=52;CA=M;DP=459
-1 4025339 . TTCACT TT 53 PASS AF=0.159738;HP=2;NF=17;NR=14;NS=51;CA=0;DP=609
-1 4025399 . CA CATA 100 PASS AF=0.0862676;HP=1;NF=4;NR=7;NS=52;CA=0;DP=506
-1 4025472 . CA CATTTA 39 PASS AF=0.0270865;HP=1;NF=2;NR=1;NS=52;CA=0;DP=538
-1 4025543 venter,watson TC TCAC 100 PASS AF=0.26036;HP=1;NF=9;NR=12;NS=52;CA=0;DP=482
-1 4025589 . AC ACTC 53 PASS AF=0.0696821;HP=1;NF=1;NR=1;NS=52;CA=0;DP=575
-1 4025678 watson TACTCA TA 100 PASS AF=0.299176;HP=1;NF=14;NR=7;NS=52;CA=0;DP=549
-1 4025718 . CATT CT 100 PASS AF=0.0815807;HP=1;NF=8;NR=6;NS=52;CA=0;DP=570
-1 4025810 watson TC TCAC 100 PASS AF=0.240222;HP=1;NF=8;NR=8;NS=52;CA=0;DP=442
-1 4025920 . ACTCACACTC AC 15 PASS AF=0.0440807;HP=1;NF=5;NR=6;NS=52;CA=0;DP=439
-1 4025988 . ATCACT AT 100 PASS AF=0.115745;HP=1;NF=7;NR=3;NS=52;CA=M;DP=409
-1 4026021 . ATTCGC AC 19 PASS AF=0.0230633;HP=2;NF=4;NR=4;NS=52;CA=0;DP=408
-1 4026091 . ACAGTC AC 100 PASS AF=0.239672;HP=1;NF=10;NR=12;NS=52;CA=0;DP=418
-1 4026188 . GTCACTCGTT GT 100 PASS AF=0.0942528;HP=1;NF=17;NR=15;NS=51;CA=M;DP=704
-1 4026243 . AC ACTCACTC 100 PASS AF=0.0701669;HP=1;NF=8;NR=2;NS=52;CA=0;DP=852
-1 4026341 . AC ACTC 100 PASS AF=0.180464;HP=1;NF=7;NR=12;NS=52;CA=0;DP=797
-1 4026433 . AC ACTCACAGTC 100 PASS AF=0.0755971;HP=1;NF=10;NR=4;NS=52;CA=0;DP=727
-1 4026489 . CCACTC CC 100 PASS AF=0.152175;HP=2;NF=20;NR=14;NS=52;CA=0;DP=896
-1 4026521 . AT ACT 18 PASS AF=0.0348752;HP=1;NF=8;NR=8;NS=52;CA=0;DP=896
-1 4026676 . ACACTC AC 100 PASS AF=0.345964;HP=1;NF=25;NR=27;NS=52;CA=0;DP=805
-1 4026745 . ACTC AC 100 PASS AF=0.277096;HP=1;NF=6;NR=11;NS=52;CA=0;DP=625
-1 4026831 . AC ACTC 100 PASS AF=0.158736;HP=1;NF=13;NR=9;NS=52;CA=0;DP=585
-1 4026904 . TACTCA TA 59 PASS AF=0.094457;HP=1;NF=7;NR=4;NS=52;CA=0;DP=594
-1 4026996 . TT TTCACT 100 PASS AF=0.0816069;HP=2;NF=19;NR=16;NS=52;CA=0;DP=668
-1 4027100 watson GT GTCACT 100 PASS AF=0.51624;HP=1;NF=22;NR=20;NS=52;CA=0;DP=958
-1 4027153 . AC ACTCACACTC 100 PASS AF=0.221157;HP=1;NF=11;NR=7;NS=52;CA=0;DP=694
-1 4027249 . ACACTCGCTCAGTC AC 100 PASS AF=0.191741;HP=1;NF=20;NR=16;NS=52;CA=0;DP=528
-1 4027301 . TCAC TC 100 PASS AF=0.21653;HP=1;NF=6;NR=9;NS=52;CA=0;DP=511
-1 4027378 . TT TTCACT 100 PASS AF=0.23813;HP=2;NF=19;NR=16;NS=52;CA=0;DP=565
-1 4027440 . TT TTCACT 100 PASS AF=0.351897;HP=2;NF=28;NR=13;NS=52;CA=0;DP=736
-1 4031776 venter,watson GC GCTGCTCC 100 PASS AF=0.57914;HP=1;NF=17;NR=13;NS=52;CA=0;DP=475
-1 4046995 rs60127181;-/ATG,watson GC GGATC 100 PASS AF=0.863384;HP=1;DB;NF=37;NR=32;NS=51;CA=0;DP=427
-1 4053051 . AC AACC 10 PASS AF=0.0731381;HP=1;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=453
-1 4056743 rs57501900;-/T,venter ATT AT 100 PASS AF=0.863012;HP=6;DB;NF=63;NR=45;NS=52;CA=0;DP=485
-1 4078234 venter,watson CTGCCTGTGTGAGCAAGAT CT 100 PASS AF=0.308447;HP=1;NF=26;NR=18;NS=52;CA=0;DP=484
-1 4080449 rs35774756;-/T GTT GT 100 PASS AF=0.285891;HP=2;DB;NF=20;NR=24;NS=51;CA=0;DP=526
-1 4082493 rs35701497;-/G CGG CG 100 PASS AF=0.277913;HP=4;DB;NF=14;NR=16;NS=52;CA=0;DP=416
-1 4086137 . CA CTA 100 PASS AF=0.0260425;HP=1;NF=4;NR=2;NS=52;CA=0;DP=569
-1 4088196 . TTCT TT 100 PASS AF=0.0658972;HP=3;NF=67;NR=77;NS=51;CA=B;DP=647
-1 4091673 rs56198003;-/TTA GTTAT GT 100 PASS AF=0.0274099;HP=2;DB;NF=4;NR=7;NS=52;CA=0;DP=489
-1 4093407 rs35442233;-/G,venter TGG TG 100 PASS AF=0.056726;HP=4;DB;NF=4;NR=5;NS=51;CA=0;DP=432
-1 4097902 rs5772141;-/ATT,mills,venter,watson CA CATTA 100 PASS AF=0.999995;HP=1;DB;NF=38;NR=34;NS=52;CA=0;DP=432
-1 4106716 . AC ACACACACACACGC 100 PASS AF=0.316911;HP=1;NF=1;NR=1;NS=52;CA=0;DP=601
-1 4114274 rs60603556;-/CAT,watson AATCA AA 100 PASS AF=0.135224;HP=3;DB;NF=17;NR=9;NS=51;CA=0;DP=587
-1 4114592 rs56285575;-/ACA,venter AAACA AA 100 PASS AF=0.254759;HP=3;DB;NF=21;NR=18;NS=52;CA=0;DP=554
-1 4114812 . TTAT TT 33 PASS AF=0.14738;HP=3;NF=5;NR=4;NS=52;CA=0;DP=411
-1 4114996 . AA AATTATTA 11 PASS AF=0.228122;HP=2;NF=26;NR=29;NS=49;CA=0;DP=276
-1 4120825 . GAA GA 43 PASS AF=0.147904;HP=2;NF=11;NR=17;NS=51;CA=0;DP=328
-1 4121802 . ATGT AT 11 PASS AF=0.0113836;HP=1;NF=24;NR=16;NS=52;CA=0;DP=570
-1 4131826 . ATTGTTT AT 100 PASS AF=0.999996;HP=2;NF=38;NR=35;NS=52;CA=0;DP=456
-1 4134659 rs35271731;-/G TG TGG 100 PASS AF=0.417516;HP=5;DB;NF=21;NR=19;NS=52;CA=0;DP=429
-1 4139315 rs35859581;-/T,venter GT GTT 100 PASS AF=0.371694;HP=2;DB;NF=12;NR=16;NS=52;CA=0;DP=444
-1 4144542 . CAA CA 100 PASS AF=0.0915309;HP=2;NF=7;NR=8;NS=52;CA=M;DP=461
-1 4149378 rs35644791;-/CCT,venter,watson AC ACCTC 100 PASS AF=0.955034;HP=2;DB;NF=35;NR=24;NS=52;CA=0;DP=461
-1 4150078 . ATC AC 100 PASS AF=0.0248618;HP=1;NF=3;NR=1;NS=52;CA=0;DP=489
-1 4158176 rs61115653;-/A CA CAA 100 PASS AF=0.109858;HP=9;DB;NF=9;NR=8;NS=52;CA=0;DP=480
-1 4158371 rs35550030;-/G AGA AA 100 PASS AF=0.282272;HP=1;DB;NF=22;NR=13;NS=52;CA=0;DP=508
-1 4160853 . AG AGTG 100 PASS AF=0.883963;HP=1;NF=52;NR=40;NS=52;CA=0;DP=475
-1 4163479 rs35439066;-/T,venter ATT AT 100 PASS AF=0.421487;HP=7;DB;NF=35;NR=40;NS=52;CA=0;DP=580
-1 4165518 rs5772143;-/A,mills CAT CT 100 PASS AF=0.0997002;HP=1;DB;NF=8;NR=9;NS=52;CA=0;DP=569
-1 4168412 . TG TGG 100 PASS AF=0.0597927;HP=5;NF=7;NR=5;NS=50;CA=0;DP=411
-1 4174019 . CCTTTC CC 100 PASS AF=0.223832;HP=2;NF=5;NR=11;NS=51;CA=M;DP=369
-1 4176371 rs5772145;-/GGGCT,mills,venter,watson GG GGGGCTG 100 PASS AF=0.965127;HP=4;DB;NF=37;NR=39;NS=51;CA=0;DP=577
-1 4180359 rs35134459;-/T,venter CG CTG 100 PASS AF=0.994644;HP=2;DB;NF=70;NR=40;NS=52;CA=0;DP=510
-1 4198168 . GCCATTTACATCCCACC GC 100 PASS AF=0.0947023;HP=2;NF=47;NR=53;NS=52;CA=0;DP=625
-1 4203370 . TCAC TC 22 PASS AF=0.151126;HP=1;NF=40;NR=22;NS=51;CA=0;DP=481
-1 4224147 . ATGT AT 100 PASS AF=0.459042;HP=1;NF=45;NR=57;NS=52;CA=0;DP=508
-1 4236168 venter,watson GT GTCCTGTT 100 PASS AF=0.465028;HP=1;NF=21;NR=21;NS=51;CA=0;DP=473
-1 4238553 . TAG TG 100 PASS AF=0.0884036;HP=1;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=313
-1 4243904 . TG TGGGGG 28 PASS AF=0.177328;HP=1;NF=6;NR=9;NS=52;CA=0;DP=598
-1 4252300 . AATTTA AA 27 PASS AF=0.0160294;HP=2;NF=16;NR=12;NS=52;CA=0;DP=550
-1 4256051 . CC CCTCAC 100 PASS AF=0.423907;HP=2;NF=10;NR=6;NS=52;CA=M;DP=450
-1 4256251 rs56817136;-/AATCCATC TC TCATCAATCC 27 PASS AF=0.483921;HP=1;DB;NF=24;NR=28;NS=52;CA=M;DP=501
-1 4256338 rs59859709;-/CCAT CCCATC CC 100 PASS AF=0.420087;HP=3;DB;NF=47;NR=73;NS=52;CA=0;DP=510
-1 4258560 rs35749795;-/G,venter TGG TG 100 PASS AF=0.563751;HP=3;DB;NF=30;NR=43;NS=52;CA=0;DP=533
-1 4270968 rs5772150;-/A,mills,venter TAA TA 100 PASS AF=0.863858;HP=2;DB;NF=66;NR=65;NS=52;CA=0;DP=554
-1 4272781 rs34523387;-/CA,venter,watson TCAC TC 100 PASS AF=0.221206;HP=1;DB;NF=55;NR=32;NS=52;CA=0;DP=555
-1 4276688 rs56762609;-/A CA CAA 25 PASS AF=0.0168189;HP=4;DB;NF=5;NR=7;NS=52;CA=0;DP=567
-1 4278344 rs33957131;-/A,mills TAT TT 100 PASS AF=0.260307;HP=1;DB;NF=13;NR=14;NS=52;CA=M;DP=390
-1 4280264 rs35972891;-/G,venter TG TGG 100 PASS AF=0.36321;HP=6;DB;NF=16;NR=21;NS=52;CA=0;DP=487
-1 4280920 rs3058085;-/AGA,mills,venter,watson AT ATCTT 100 PASS AF=0.75024;HP=1;DB;NF=34;NR=50;NS=52;CA=0;DP=518
-1 4281851 rs59086076;-/TTGT CTGTTT CT 100 PASS AF=0.15371;HP=1;DB;NF=12;NR=13;NS=52;CA=0;DP=454
-1 4287207 rs3986843;-/CCT CA CAGGA 100 PASS AF=0.100002;HP=1;DB;NF=8;NR=1;NS=52;CA=0;DP=451
-1 4289708 . GTGTTAG GG 37 PASS AF=0.0904846;HP=1;NF=3;NR=9;NS=52;CA=0;DP=447
-1 4291813 . CGC CC 41 PASS AF=0.05598;HP=1;NF=1;NR=9;NS=52;CA=0;DP=504
-1 4291856 rs33950418;-/C,mills ACA AA 53 PASS AF=0.0424203;HP=1;DB;NF=2;NR=10;NS=52;CA=M;DP=504
-1 4292024 rs33982329;-/CA,mills CG CATG 100 PASS AF=0.0974178;HP=1;DB;NF=14;NR=14;NS=52;CA=0;DP=697
-1 4296830 . CTT CT 100 PASS AF=0.101792;HP=2;NF=15;NR=4;NS=52;CA=0;DP=805
-1 4298115 rs34054009;-/G,venter AG AGG 100 PASS AF=0.314255;HP=2;DB;NF=25;NR=10;NS=52;CA=0;DP=565
-1 4310246 rs35999105;-/A TA TAA 100 PASS AF=0.229765;HP=5;DB;NF=23;NR=13;NS=52;CA=0;DP=488
-1 4310305 venter GA GAA 39 PASS AF=0.078696;HP=9;NF=15;NR=5;NS=52;CA=0;DP=455
-1 4312461 . GAAAGAAA GA 24 PASS AF=0.0372797;HP=3;NF=23;NR=6;NS=52;CA=M;DP=401
-1 4313453 . GG GTG 23 PASS AF=0.026167;HP=2;NF=2;NR=5;NS=52;CA=0;DP=614
-1 4315016 rs34078493;-/T,venter CT CTT 100 PASS AF=0.459017;HP=1;DB;NF=25;NR=37;NS=52;CA=0;DP=493
-1 4316236 rs35864764;-/TC ATCT AT 100 PASS AF=0.164629;HP=1;DB;NF=18;NR=15;NS=52;CA=0;DP=434
-1 4317119 rs35907112;-/AG AAGA AA 100 PASS AF=0.210583;HP=3;DB;NF=19;NR=13;NS=52;CA=0;DP=652
-1 4319781 rs34098980;-/AAAAA,mills,venter CC CAAAAAC 100 PASS AF=0.451406;HP=2;DB;NF=9;NR=1;NS=52;CA=0;DP=605
-1 4323411 . GT GTT 41 PASS AF=0.0448346;HP=6;NF=4;NR=5;NS=52;CA=0;DP=498
-1 4326343 . CG CGGGGGGGGGGG 100 PASS AF=0.212625;HP=2;NF=5;NR=11;NS=52;CA=0;DP=475
-1 4329138 . GTGAT GT 47 PASS AF=0.0168095;HP=1;NF=35;NR=37;NS=52;CA=0;DP=675
-1 4329500 venter ATGGTGATGGT AT 100 PASS AF=0.0491;HP=1;NF=35;NR=49;NS=52;CA=0;DP=718
-1 4333035 . CCACTC CC 100 PASS AF=0.0536691;HP=2;NF=18;NR=17;NS=52;CA=0;DP=614
-1 4333090 . CCCATC CC 100 PASS AF=0.896174;HP=3;NF=52;NR=56;NS=52;CA=0;DP=564
-1 4333868 rs34013096;-/CCAT AC ACCATC 100 PASS AF=0.411752;HP=2;DB;NF=63;NR=59;NS=52;CA=0;DP=556
-1 4352929 . TAA TA 100 PASS AF=0.0606075;HP=5;NF=10;NR=5;NS=51;CA=0;DP=422
-1 4360308 . CAA CA 100 PASS AF=0.160821;HP=3;NF=12;NR=13;NS=52;CA=0;DP=502
-1 4360675 rs55750624;-/A GAA GA 100 PASS AF=0.209252;HP=2;DB;NF=18;NR=10;NS=52;CA=0;DP=456
-1 4362123 rs57250327;-/AAATT TA TAATTAA 100 PASS AF=0.202867;HP=2;DB;NF=23;NR=24;NS=52;CA=0;DP=404
-1 4372014 rs34773421;-/A,venter TAA TA 100 PASS AF=0.507594;HP=2;DB;NF=43;NR=31;NS=52;CA=0;DP=496
-1 4373092 . CATTTA CA 100 PASS AF=0.155807;HP=1;NF=19;NR=10;NS=52;CA=0;DP=440
-1 4375952 . TCT TT 100 PASS AF=0.0215948;HP=1;NF=3;NR=2;NS=52;CA=0;DP=530
-1 4376164 rs57973702;-/TG,venter CG CGTG 100 PASS AF=0.555727;HP=1;DB;NF=33;NR=60;NS=52;CA=0;DP=552
-1 4382255 . GT GTT 100 PASS AF=0.134524;HP=8;NF=12;NR=14;NS=52;CA=0;DP=445
-1 4382929 . CG CGCCGTGCCCTGCTCAG 100 PASS AF=0.293977;HP=1;NF=3;NR=1;NS=52;CA=0;DP=423
-1 4386769 rs34696074;-/G TGG TG 100 PASS AF=0.524405;HP=3;DB;NF=43;NR=31;NS=51;CA=0;DP=586
-1 4386900 rs35831569;-/GTGA,watson TG TGTGAG 100 PASS AF=0.786341;HP=1;DB;NF=49;NR=47;NS=52;CA=0;DP=728
-1 4387089 rs35106948;-/GA,venter,watson TGAG TG 100 PASS AF=0.76407;HP=1;DB;NF=42;NR=48;NS=52;CA=0;DP=730
-1 4398343 rs56075652;-/AGCTAG,mills,venter,watson GGAGCTAG GG 100 PASS AF=0.850798;HP=2;DB;NF=51;NR=52;NS=52;CA=0;DP=535
-1 4403445 . ATC AC 100 PASS AF=0.0257077;HP=1;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=579
-1 4413424 . GGAAG GG 100 PASS AF=0.0911622;HP=2;NF=13;NR=11;NS=52;CA=0;DP=539
-1 4415363 rs35655214;-/A,mills,venter CAA CA 100 PASS AF=0.279808;HP=10;DB;NF=16;NR=13;NS=52;CA=0;DP=623
-1 4419729 rs34301403;-/T,venter CT CTT 100 PASS AF=0.276688;HP=3;DB;NF=23;NR=17;NS=52;CA=0;DP=491
-1 4429935 . ACC AC 100 PASS AF=0.121066;HP=2;NF=8;NR=7;NS=52;CA=0;DP=509
-1 4432975 rs35185885;-/TTAT,venter TT TTTTAT 100 PASS AF=0.370788;HP=4;DB;NF=7;NR=50;NS=51;CA=0;DP=329
-1 4433724 . AC ACC 100 PASS AF=0.191535;HP=2;NF=16;NR=17;NS=52;CA=0;DP=609
-1 4434361 . GA GATGATATTGAAA 100 PASS AF=0.175787;HP=1;NF=8;NR=5;NS=52;CA=0;DP=496
-1 4439328 rs55695069;-/TGTG,watson TGTGAG TG 100 PASS AF=0.115075;HP=1;DB;NF=13;NR=10;NS=51;CA=0;DP=510
-1 4444447 . GC GCC 100 PASS AF=0.126735;HP=1;NF=8;NR=6;NS=52;CA=0;DP=442
-1 4444562 watson TTCG TG 100 PASS AF=0.167206;HP=3;NF=13;NR=9;NS=52;CA=0;DP=477
-1 4448379 rs55971665;-/A,venter GAA GA 100 PASS AF=0.999997;HP=5;DB;NF=29;NR=34;NS=51;CA=0;DP=398
-1 4456774 rs34368344;-/CTCA,watson TCTCAC TC 100 PASS AF=0.4985;HP=1;DB;NF=46;NR=35;NS=52;CA=0;DP=679
-1 4456823 . TT TTTTCTCTCT 100 PASS AF=0.281015;HP=3;NF=18;NR=7;NS=52;CA=0;DP=566
-1 4460399 . CAGA CA 17 PASS AF=0.0162627;HP=1;NF=4;NR=1;NS=52;CA=0;DP=437
-1 4461064 . TG TGGG 100 PASS AF=0.136493;HP=8;NF=11;NR=12;NS=52;CA=0;DP=516
-1 4461120 . GAGTCA GA 100 PASS AF=0.106497;HP=1;NF=4;NR=10;NS=52;CA=0;DP=513
-1 4462914 rs35786528;-/T,venter GTT GT 100 PASS AF=0.636288;HP=9;DB;NF=46;NR=44;NS=52;CA=0;DP=457
-1 4464201 rs35933446;-/G AGC AC 100 PASS AF=0.0422945;HP=1;DB;NF=3;NR=5;NS=52;CA=0;DP=559
-1 4465553 rs33984734;-/C,mills,venter GCC GC 100 PASS AF=0.832437;HP=3;DB;NF=43;NR=36;NS=52;CA=0;DP=507
-1 4465878 rs55781312;-/GAACA,watson TACAGAA TA 100 PASS AF=0.547352;HP=1;DB;NF=48;NR=55;NS=52;CA=0;DP=612
-1 4466414 rs34356738;-/T,venter AT ATT 100 PASS AF=0.0343632;HP=4;DB;NF=5;NR=2;NS=52;CA=0;DP=523
-1 4468803 . CT CTTTTCTTTTCTTT 100 PASS AF=0.185641;HP=2;NF=2;NR=1;NS=51;CA=0;DP=271
-1 4469024 . TT TTGTGT 26 PASS AF=0.65093;HP=2;NF=51;NR=54;NS=51;CA=0;DP=465
-1 4470162 rs34280110;-/T,venter CT CTT 100 PASS AF=0.19103;HP=3;DB;NF=13;NR=16;NS=52;CA=0;DP=581
-1 4472390 rs35540877;-/AAG TAAGA TA 100 PASS AF=0.0513799;HP=2;DB;NF=4;NR=3;NS=52;CA=0;DP=531
-1 4481812 rs34806922;-/A,venter GAA GA 100 PASS AF=0.0356083;HP=3;DB;NF=4;NR=4;NS=52;CA=0;DP=576
-1 4482705 . CA CATCTA 100 PASS AF=0.203301;HP=1;NF=34;NR=52;NS=50;CA=M;DP=382
-1 4482808 . CTA CA 16 PASS AF=0.0550307;HP=1;NF=1;NR=1;NS=51;CA=M;DP=356
-1 4482848 rs5772166;-/TCTCTCTC,mills ATCTCTCTCT AT 100 PASS AF=0.561639;HP=1;DB;NF=52;NR=17;NS=51;CA=M;DP=311
-1 4484471 rs3059158;-/CT,mills,watson AG ACTG 100 PASS AF=0.497825;HP=1;DB;NF=31;NR=34;NS=52;CA=0;DP=538
-1 4486660 rs34976033;-/CCCT,mills,venter,watson GCTCCC GC 100 PASS AF=0.593551;HP=1;DB;NF=42;NR=55;NS=52;CA=0;DP=566
-1 4486840 rs35808993;-/A,venter GAT GT 100 PASS AF=0.0446408;HP=1;DB;NF=4;NR=4;NS=52;CA=0;DP=539
-1 4495865 watson TGACCT TT 100 PASS AF=0.477912;HP=1;NF=15;NR=22;NS=52;CA=0;DP=386
-1 4498895 . TAAACTCA TA 100 PASS AF=0.365307;HP=3;NF=30;NR=28;NS=52;CA=0;DP=561
-1 4499763 . TT TTTTAGTTTAGTTTAGTTTAGTTTAGT 15 PASS AF=0.437504;HP=4;NF=5;NR=8;NS=51;CA=0;DP=440
-1 4500994 rs57293099;-/A,venter GG GAG 19 PASS AF=0.533167;HP=5;DB;NF=26;NR=15;NS=51;CA=0;DP=466
-1 4501978 rs34937816;-/T,mills,venter GT GTT 100 PASS AF=0.677682;HP=1;DB;NF=47;NR=42;NS=52;CA=0;DP=475
-1 4504724 venter,watson TAGACA TA 100 PASS AF=0.381777;HP=1;NF=34;NR=33;NS=52;CA=0;DP=728
-1 4504861 venter TACAGAGAGAGACAGAGAGA TA 100 PASS AF=0.208225;HP=1;NF=42;NR=31;NS=52;CA=0;DP=820
-1 4506249 rs56013880;-/T,mills,venter GC GTC 100 PASS AF=0.652109;HP=2;DB;NF=41;NR=48;NS=52;CA=0;DP=522
-1 4506287 venter TAG TG 100 PASS AF=0.348604;HP=1;NF=23;NR=27;NS=52;CA=0;DP=534
-1 4510123 rs35963445;-/C,venter TC TCC 100 PASS AF=0.750939;HP=6;DB;NF=32;NR=50;NS=52;CA=0;DP=488
-1 4511427 rs34235356;-/T,venter AT ATT 100 PASS AF=0.559297;HP=8;DB;NF=40;NR=27;NS=52;CA=0;DP=549
-1 4512561 rs57315980;-/GAG TGGAG TG 100 PASS AF=0.0276885;HP=2;DB;NF=7;NR=4;NS=52;CA=0;DP=581
-1 4512788 rs56318426;-/GGATAGTGTG TC TGTGTGGGATAC 100 PASS AF=0.145759;HP=1;DB;NF=7;NR=6;NS=52;CA=0;DP=570
-1 4513234 rs5772168;-/ATCA,venter,watson TA TATCAA 100 PASS AF=0.761132;HP=1;DB;NF=45;NR=38;NS=52;CA=0;DP=478
-1 4513552 rs34248962;-/G,venter CTC CC 100 PASS AF=0.397344;HP=1;DB;NF=19;NR=21;NS=52;CA=0;DP=502
-1 4518079 . CTTTATGTCAAC CC 31 PASS AF=0.0537494;HP=3;NF=13;NR=6;NS=52;CA=0;DP=567
-1 4519870 . CATAA CA 100 PASS AF=0.156873;HP=1;NF=25;NR=19;NS=52;CA=0;DP=518
-1 4520552 venter,watson ATATT AT 100 PASS AF=0.0454741;HP=1;NF=13;NR=21;NS=52;CA=0;DP=523
-1 4524683 rs60936673;-/A,venter GAC GC 100 PASS AF=0.0433734;HP=1;DB;NF=5;NR=1;NS=51;CA=0;DP=407
-1 4531795 . CG CGAGCAGATAG 100 PASS AF=0.0529244;HP=1;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=598
-1 4533811 rs61232512;-/TCCCTCCTGGACAGCCAGG,watson TCCTCCTGGACAGCCAGGTCC TC 100 PASS AF=0.455665;HP=2;DB;NF=9;NR=12;NS=52;CA=0;DP=455
-1 4535415 rs34971058;-/C,mills,venter GC GCC 100 PASS AF=0.872856;HP=1;DB;NF=71;NR=50;NS=52;CA=0;DP=585
-1 4540778 rs5772169;-/T,mills CTG CG 100 PASS AF=0.129616;HP=1;DB;NF=9;NR=6;NS=52;CA=0;DP=518
-1 4541031 . TT TTTTCT 100 PASS AF=0.0665496;HP=6;NF=18;NR=24;NS=51;CA=0;DP=371
-1 4541492 rs5772170;-/G,mills,venter TG TGG 100 PASS AF=0.912727;HP=3;DB;NF=57;NR=39;NS=52;CA=0;DP=454
-1 4542962 . CC CCTCTCTCTCTC 100 PASS AF=0.767807;HP=2;NF=57;NR=35;NS=52;CA=0;DP=481
-1 4544333 rs3059964;-/CT,venter ACTC AC 100 PASS AF=0.941425;HP=1;DB;NF=54;NR=73;NS=52;CA=0;DP=591
-1 4547027 rs34146010;-/C ACC AC 100 PASS AF=0.974502;HP=2;DB;NF=55;NR=74;NS=52;CA=0;DP=535
-1 4547927 rs34056554;-/T,venter ATT AT 100 PASS AF=0.867021;HP=3;DB;NF=7;NR=12;NS=51;CA=0;DP=398
-1 4551259 rs34018288;-/TG,venter,watson CT CTGT 100 PASS AF=0.964821;HP=1;DB;NF=25;NR=27;NS=52;CA=0;DP=445
-1 4552887 . GT GTCT 100 PASS AF=0.155774;HP=1;NF=6;NR=7;NS=52;CA=0;DP=507
-1 4556585 rs3833958;-/GGGCT,venter GA GAGCCCA 100 PASS AF=0.248571;HP=1;DB;NF=9;NR=9;NS=52;CA=0;DP=416
-1 4558195 rs58248788;-/T,venter ATT AT 100 PASS AF=0.949748;HP=4;DB;NF=38;NR=18;NS=51;CA=0;DP=446
-1 4558625 . AGA AA 100 PASS AF=0.105248;HP=1;NF=12;NR=4;NS=52;CA=0;DP=526
-1 4570630 . GT GGGTTT 14 PASS AF=0.0570941;HP=1;NF=4;NR=2;NS=52;CA=0;DP=480
-1 4574298 . GC GAC 41 PASS AF=0.0333335;HP=2;NF=1;NR=4;NS=52;CA=0;DP=497
-1 4574507 . TT TTCCTCTAATGCT 100 PASS AF=0.406213;HP=2;NF=13;NR=8;NS=52;CA=0;DP=437
-1 4577694 rs33988719;-/G,mills,venter TG TGG 100 PASS AF=0.999997;HP=1;DB;NF=52;NR=28;NS=52;CA=0;DP=381
-1 4578235 . TAT TT 26 PASS AF=0.292482;HP=1;NF=8;NR=14;NS=51;CA=0;DP=330
-1 4580634 . ATAAAATA AA 100 PASS AF=0.328083;HP=1;NF=11;NR=4;NS=51;CA=M;DP=372
-1 4581760 . CTT CT 100 PASS AF=0.0551414;HP=2;NF=4;NR=7;NS=52;CA=0;DP=578
-1 4583153 rs35427335;-/CA,venter,watson GCAC GC 100 PASS AF=0.0310016;HP=1;DB;NF=3;NR=4;NS=52;CA=0;DP=483
-1 4586257 rs34899280;-/T GTC GC 100 PASS AF=0.311452;HP=1;DB;NF=16;NR=8;NS=51;CA=0;DP=441
-1 4589959 venter,watson GG GGGCCTG 100 PASS AF=0.0494854;HP=3;NF=3;NR=4;NS=52;CA=0;DP=469
-1 4590830 rs34057361;-/GCAAAGC,mills,venter,watson TGCAAAGCG TG 100 PASS AF=0.739178;HP=1;DB;NF=42;NR=52;NS=50;CA=0;DP=465
-1 4595540 rs56784481;-/T TCT TT 53 PASS AF=0.154234;HP=1;DB;NF=7;NR=21;NS=52;CA=0;DP=439
-1 4596270 . AC ACGCTGAGGCTGCAGCACCCCTCGTGGAGC 100 PASS AF=0.171201;HP=1;NF=6;NR=1;NS=52;CA=0;DP=498
-1 4600396 rs36042545;-/AT,venter CATA CA 100 PASS AF=0.185579;HP=1;DB;NF=24;NR=23;NS=52;CA=0;DP=357
-1 4603645 rs60786353;-/C,venter AC ACC 100 PASS AF=0.999998;HP=1;DB;NF=76;NR=57;NS=52;CA=0;DP=571
-1 4607282 . GTGAT GT 100 PASS AF=0.287968;HP=1;NF=38;NR=26;NS=52;CA=0;DP=810
-1 4607435 . GTGAT GT 100 PASS AF=0.347474;HP=1;NF=39;NR=53;NS=52;CA=0;DP=674
-1 4611309 . CGTGTG CG 100 PASS AF=0.311775;HP=1;NF=38;NR=31;NS=52;CA=0;DP=486
-1 4621966 rs35610947;-/GT TTGT TT 100 PASS AF=0.252136;HP=3;DB;NF=41;NR=42;NS=52;CA=0;DP=612
-1 4623256 rs59174221;-/CTCCAGAAAGCAC GGAAAGCACCTCCAG GG 100 PASS AF=0.248792;HP=2;DB;NF=24;NR=28;NS=52;CA=0;DP=458
-1 4623618 rs60584333;-/GTGTCGGGAGCAGAGACTG,venter GC GCTGGTGTCGGGAGCAGAGAC 100 PASS AF=0.624955;HP=1;DB;NF=8;NR=16;NS=51;CA=0;DP=518
-1 4628242 rs56871532;-/TG,venter,watson CTGT CT 100 PASS AF=0.630417;HP=1;DB;NF=46;NR=41;NS=52;CA=0;DP=605
-1 4631325 watson GAGGACATA GA 100 PASS AF=0.0694082;HP=1;NF=14;NR=10;NS=51;CA=0;DP=388
-1 4633949 . TCC TC 100 PASS AF=0.223776;HP=7;NF=13;NR=4;NS=51;CA=0;DP=492
-1 4637510 . TAAA TA 18 PASS AF=0.0428857;HP=9;NF=13;NR=6;NS=52;CA=0;DP=456
-1 4639728 . GGTGTGTGTGTGTGTG GG 56 PASS AF=0.223403;HP=3;NF=39;NR=66;NS=51;CA=0;DP=466
-1 4645583 rs59275910;-/G,venter AG AGG 100 PASS AF=0.999998;HP=1;DB;NF=41;NR=59;NS=51;CA=0;DP=416
-1 4649824 . CTT CT 100 PASS AF=0.0615007;HP=2;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=371
-1 4653490 . GAG GG 19 PASS AF=0.016501;HP=1;NF=1;NR=2;NS=52;CA=0;DP=448
-1 4654099 rs3086606;-/GTCTGCA,mills CC CCAGTCTGC 100 PASS AF=0.299705;HP=2;DB;NF=11;NR=10;NS=52;CA=0;DP=440
-1 4655877 rs58828516;-/G TG TGG 100 PASS AF=0.083803;HP=6;DB;NF=13;NR=14;NS=52;CA=0;DP=553
-1 4656096 rs34592768;-/G,mills TGG TG 100 PASS AF=0.0586852;HP=2;DB;NF=6;NR=4;NS=52;CA=0;DP=486
-1 4656943 . GGTGTG GG 53 PASS AF=0.0156574;HP=2;NF=15;NR=18;NS=52;CA=0;DP=804
-1 4668803 . CTT CT 39 PASS AF=0.0748695;HP=8;NF=8;NR=6;NS=52;CA=0;DP=401
-1 4670089 rs34058244;-/AC,venter GA GACA 100 PASS AF=0.471432;HP=1;DB;NF=47;NR=39;NS=52;CA=0;DP=789
-1 4670383 rs35737766;-/TCAC,watson ACACTC AC 100 PASS AF=0.331554;HP=1;DB;NF=20;NR=35;NS=52;CA=0;DP=609
-1 4676654 . AGATG AG 10 PASS AF=0.011049;HP=1;NF=15;NR=18;NS=52;CA=0;DP=617
-1 4684590 . TCCTGCACCTGCTGTGCCCCTGGCTCCCAGCACC TC 100 PASS AF=0.0368566;HP=2;NF=13;NR=7;NS=52;CA=0;DP=543
-1 4689505 . TC TCTGTCCTCTCTCCTAGCTCTGGTGCCCTGAGATGC 100 PASS AF=0.355136;HP=1;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=597
-1 4693342 rs3835539;-/TTCA CC CCATTC 100 PASS AF=0.307703;HP=2;DB;NF=60;NR=61;NS=52;CA=0;DP=594
-1 4695582 venter TGTGAGG TG 100 PASS AF=0.630317;HP=1;NF=17;NR=29;NS=52;CA=0;DP=408
-1 4700273 . GCCT GT 51 PASS AF=0.154012;HP=2;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=402
-1 4700727 rs34897087;-/A,venter CG CGG 13 PASS AF=0.0702045;HP=8;DB;NF=22;NR=6;NS=51;CA=M;DP=305
-1 4702014 rs34592315;-/AA,venter TAAA TA 100 PASS AF=0.183045;HP=3;DB;NF=9;NR=20;NS=52;CA=0;DP=551
-1 4702135 . GCC GC 100 PASS AF=0.132917;HP=5;NF=18;NR=10;NS=52;CA=0;DP=561
-1 4702842 rs3835540;-/GAC TGACG TG 100 PASS AF=0.333162;HP=1;DB;NF=25;NR=19;NS=52;CA=0;DP=517
-1 4703849 rs35422518;-/TCTCCAGGC,mills,venter,watson AGCTCTCCAGG AG 100 PASS AF=0.461699;HP=1;DB;NF=52;NR=39;NS=52;CA=0;DP=558
-1 4704242 . ATT AT 100 PASS AF=0.124811;HP=6;NF=16;NR=12;NS=52;CA=0;DP=518
-1 4704545 . GCACAC GC 43 PASS AF=0.374122;HP=1;NF=68;NR=46;NS=52;CA=0;DP=586
-1 4709952 rs55677440;-/GT TT TTGT 100 PASS AF=0.111566;HP=3;DB;NF=37;NR=55;NS=52;CA=0;DP=757
-1 4712998 rs35177072;-/CTC,mills,venter,watson TCTCC TC 100 PASS AF=0.409205;HP=1;DB;NF=23;NR=30;NS=52;CA=0;DP=527
-1 4714785 rs3835541;-/A,venter CAA CA 100 PASS AF=0.207747;HP=2;DB;NF=12;NR=9;NS=52;CA=0;DP=525
-1 4715739 . GT GTT 100 PASS AF=0.0593871;HP=1;NF=4;NR=4;NS=52;CA=0;DP=486
-1 4717874 rs33969697;-/C,mills,venter TCA TA 100 PASS AF=0.644689;HP=1;DB;NF=37;NR=47;NS=52;CA=0;DP=521
-1 4720164 rs5772181;-/GA,mills,venter,watson TG TGAG 100 PASS AF=0.660601;HP=1;DB;NF=60;NR=61;NS=52;CA=0;DP=723
-1 4725394 venter AG AGAGAGACATGAGTGAAGAAGG 100 PASS AF=0.486541;HP=1;NF=34;NR=40;NS=52;CA=0;DP=600
-1 4726136 rs35816653;-/T,venter CT CTT 100 PASS AF=0.325542;HP=7;DB;NF=25;NR=33;NS=52;CA=0;DP=561
-1 4728249 rs35594902;-/TGTT CT CTGTTT 100 PASS AF=0.236832;HP=1;DB;NF=16;NR=16;NS=52;CA=0;DP=595
-1 4730619 rs56688128;-/AAGGC,venter,watson ACAAGGC AC 100 PASS AF=0.197783;HP=1;DB;NF=14;NR=10;NS=52;CA=0;DP=450
-1 4738491 . ATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT AT 100 PASS AF=0.109332;HP=1;NF=34;NR=36;NS=52;CA=0;DP=556
-1 4743143 rs34960969;-/T,venter ATT AT 100 PASS AF=0.443382;HP=2;DB;NF=27;NR=29;NS=51;CA=0;DP=521
-1 4750482 . AC ACC 44 PASS AF=0.0773717;HP=1;NF=1;NR=10;NS=52;CA=0;DP=532
-1 4751808 . CC CTC 100 PASS AF=0.287743;HP=6;NF=22;NR=19;NS=52;CA=0;DP=549
-1 4753639 rs56735073;-/G AG AGG 100 PASS AF=0.354197;HP=6;DB;NF=26;NR=25;NS=52;CA=0;DP=499
-1 4756338 . TGG TG 100 PASS AF=0.145276;HP=6;NF=12;NR=22;NS=52;CA=0;DP=505
-1 4756654 . CTGT CT 100 PASS AF=0.0253358;HP=1;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=502
-1 4768227 rs34482713;-/A,venter CAC CC 100 PASS AF=0.624286;HP=1;DB;NF=16;NR=29;NS=52;CA=0;DP=382
-1 4769408 rs3030792;-/CA,venter TC TCAC 100 PASS AF=0.564397;HP=1;DB;NF=37;NR=45;NS=51;CA=0;DP=550
-1 4771107 rs59952959;-/TTATCGGTGGTTT ATTATCGGTGGTTTC AC 100 PASS AF=0.43732;HP=2;DB;NF=24;NR=26;NS=52;CA=0;DP=437
-1 4771150 . AGGCAGAGGATTTAGGGGGCAGTGAAACTA AA 100 PASS AF=0.365014;HP=2;NF=25;NR=17;NS=51;CA=0;DP=446
-1 4773228 . AACA AA 100 PASS AF=0.358433;HP=4;NF=49;NR=37;NS=51;CA=0;DP=403
-1 4779293 rs35799766;-/A,venter GAA GA 100 PASS AF=0.620558;HP=4;DB;NF=40;NR=44;NS=52;CA=0;DP=539
-1 4783405 . TACGTATATACATATACA TA 100 PASS AF=0.346752;HP=1;NF=20;NR=40;NS=52;CA=0;DP=331
-1 4784171 . TA TAAGA 100 PASS AF=0.058761;HP=2;NF=4;NR=4;NS=52;CA=0;DP=522
-1 4787548 rs35350740;-/CA,mills AACA AA 100 PASS AF=0.294238;HP=3;DB;NF=43;NR=40;NS=52;CA=0;DP=565
-1 4790642 rs5772184;-/T,venter ATT AT 100 PASS AF=0.360239;HP=10;DB;NF=23;NR=25;NS=52;CA=0;DP=544
-1 4794867 . AATA AA 59 PASS AF=0.0541594;HP=2;NF=6;NR=24;NS=52;CA=0;DP=316
-1 4794934 . CT CTCTCTTT 21 PASS AF=0.322809;HP=1;NF=7;NR=9;NS=50;CA=M;DP=241
-1 4800829 rs35005833;-/C,venter TC TCC 100 PASS AF=0.404199;HP=5;DB;NF=48;NR=15;NS=52;CA=0;DP=479
-1 4806476 . GC GCC 100 PASS AF=0.0973173;HP=6;NF=8;NR=8;NS=52;CA=M;DP=398
-1 4808450 rs34573971;-/A,venter GAA GA 100 PASS AF=0.332411;HP=9;DB;NF=26;NR=22;NS=52;CA=0;DP=474
-1 4809140 rs60726929;-/TCCA,venter,watson TC TCATCC 100 PASS AF=0.348085;HP=1;DB;NF=49;NR=32;NS=52;CA=0;DP=579
-1 4810276 rs3030822;-/TAGT,watson ATAGTT AT 100 PASS AF=0.242205;HP=1;DB;NF=27;NR=13;NS=52;CA=0;DP=582
-1 4831434 . TA TACCACACACACA 100 PASS AF=0.49717;HP=1;NF=18;NR=17;NS=52;CA=0;DP=675
-1 4831567 rs34042090;-/CA CCAC CC 100 PASS AF=0.535527;HP=4;DB;NF=52;NR=45;NS=52;CA=0;DP=738
-1 4833596 rs35226825;-/T AT ATT 100 PASS AF=0.237481;HP=5;DB;NF=19;NR=19;NS=52;CA=0;DP=498
-1 4839967 . TCCTGCCAGCCGGGGGC TC 100 PASS AF=0.0394386;HP=2;NF=5;NR=2;NS=52;CA=0;DP=565
-1 4840948 rs59349393;-/AAACCACATCCCTTGAACT GACTAAACCACATCCCTTGAA GA 100 PASS AF=0.144437;HP=1;DB;NF=16;NR=17;NS=52;CA=0;DP=578
-1 4846284 rs36118323;-/T,venter CT CTT 100 PASS AF=0.130437;HP=7;DB;NF=12;NR=15;NS=52;CA=0;DP=415
-1 4855247 venter GA GACACA 100 PASS AF=0.301971;HP=1;NF=19;NR=3;NS=52;CA=0;DP=635
-1 4864897 venter AT ATT 100 PASS AF=0.215684;HP=6;NF=17;NR=20;NS=52;CA=0;DP=450
-1 4865373 rs34273857;-/A,venter CA CAA 100 PASS AF=0.169967;HP=6;DB;NF=17;NR=15;NS=52;CA=0;DP=533
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.1
-##INFO=<ID=BCM.AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count from BCM's (sequencing-based) genotypes subsetted to the 383 validation samples">
-##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP Membership">
-##INFO=<ID=SEQUENOM.AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count from Sequenom genotyping">
-##INFO=<ID=SRC,Number=1,Type=String,Description="Type of SNPs submitted for validation; VQSR refers to preliminary consensus set, not the final one">
-##INFO=<ID=PQ,Number=1,Type=Integer,Description="BWA mapping quality of the PCR primers">
-##FILTER=<ID=AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS,Description="Possible Sequenom miscalls based on manual review of cluster plots">
-##FILTER=<ID=HIGH_NO_CALL_RATE,Description="Extremely high no-call rate">
-##FILTER=<ID=INCORRECT_SEQUENOM_CALLS,Description="Clear Sequenom miscalls that cannot easily be fixed based on manual review of cluster plots">
-##FILTER=<ID=NOT_DESIGNED,Description="Primer not designed">
-##FILTER=<ID=NOT_TYPED,Description="Not typed">
-##FILTER=<ID=POLYMORPHIC_SAMPLES_FAILED,Description="All polymorphic samples from sequencing were no-called">
-##FILTER=<ID=POSSIBLE_PROBE_FAILURE,Description="Suspicious genotyping based on nearby SNPs">
-##FILTER=<ID=PQ10,Description="PQ<10">
-##fileDate=20110524
-##reference=ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/reference/human_g1k_v37.fasta.gz
-##source=EricBanksValidationQC;fromGoncaloAbecasisValidationSelection
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT HG00127 HG00128 HG00136 HG00137 HG00138 HG00139 HG00152 HG00156 HG00234 HG00235 HG00237 HG00242 HG00244 HG00262 HG01055 HG01079 NA19138 NA18974 NA18523 NA12717 NA19209 NA18577 NA18973 NA18943 NA12873 NA18623 NA18622 NA18948 NA19171 NA19204 NA06994 NA18563 NA18547 NA18861 NA18608 NA12282 NA12751 NA18959 NA19331 NA19453 NA20537 NA12046 NA20515 NA20516 NA20521 NA20524 NA20528 NA20759 NA20768 NA20769 NA20774 NA20775 NA20783 NA20787 NA20790 NA20800 NA20819 NA20812 NA20505 NA20530 NA20540 NA20538 NA20581 NA20815 NA20544 NA20810 NA20807 NA20816 NA20504 NA20753 NA20502 NA12342 NA19150 NA19468 NA20336 NA19395 NA19257 NA19360 NA19700 NA18867 NA20317 NA18968 NA19107 HG00111 HG00108 NA19077 NA19684 NA18511 NA12044 NA19382 NA19457 NA18933 NA18923 NA18965 HG00141 NA20341 NA18740 HG00537 HG00346 HG01173 HG00702 HG00313 HG00150 NA18612 HG00339 NA12273 HG00250 NA18593 NA18621 HG00478 HG00251 HG01070 NA19160 NA18995 NA10851 NA18976 NA18603 NA19200 HG01204 HG01191 HG01101 HG00146 HG00306 NA18985 HG00160 HG00635 HG00372 HG00357 HG00634 NA18541 NA18950 NA19759 HG00351 HG00257 HG00118 HG00336 HG00448 HG01354 NA18609 HG00428 HG00326 NA11894 NA18956 HG00173 HG00117 NA11893 HG01251 HG01441 HG01437 HG00182 HG00330 HG01060 HG00329 NA18960 NA18856 NA07346 NA18871 NA19057 NA18868 NA18636 NA12830 NA19007 NA18910 NA18874 NA19056 NA19064 NA19066 NA18487 NA18642 NA19236 NA07056 NA18637 NA19235 NA19309 NA19311 NA19334 NA19346 NA19347 NA19372 NA19376 NA19383 NA19384 NA19394 NA19428 NA19430 NA19451 NA19466 NA19313 NA19321 NA19324 NA19332 HG00479 HG00608 NA18573 HG00375 NA19248 NA19093 HG01170 HG00534 HG01171 HG01522 NA18624 HG00683 HG01521 NA19005 NA20412 NA18971 HG00446 NA12748 HG00530 HG00690 HG01356 HG01516 NA20532 HG00344 HG00328 NA18542 HG00254 HG00321 HG00577 HG00656 HG00342 HG00524 HG00650 HG00557 HG00319 HG00457 HG00125 HG00578 HG00543 HG00638 HG00171 HG00699 HG00595 HG00187 HG00704 HG00533 HG00596 HG00268 HG01083 HG00651 HG01133 HG00671 HG00327 HG01148 HG00246 HG00672 HG00556 HG00436 HG00554 NA18633 NA20344 NA11993 NA07037 NA11930 HG01366 HG01389 HG00620 NA19740 HG00190 HG00419 NA18535 HG01495 NA18592 HG01497 HG00174 HG01140 NA12287 HG00689 HG01550 HG00334 HG01375 HG00637 NA18507 HG01113 NA18550 NA19129 HG01551 HG01462 HG00331 NA12413 HG01456 HG01360 HG00708 HG01350 HG00684 NA19099 HG00284 NA12399 NA12286 NA12777 HG00277 HG00266 NA19985 HG00353 HG01102 NA07347 NA07051 NA19900 NA18984 NA07048 HG00640 HG01066 NA12812 HG01174 HG01188 NA19390 NA19436 NA19439 NA19440 NA19463 NA19470 NA19471 NA19472 NA19676 NA19660 NA19661 NA19663 NA19722 NA19725 NA19728 NA19729 NA19731 NA19749 NA19755 NA19756 NA19758 NA19770 NA19773 NA19777 NA19780 NA19783 NA20525 NA20589 NA20765 NA20802 NA20804 NA18544 NA18602 NA18546 NA18610 NA18957 NA18615 NA18616 NA19010 NA18638 NA18639 NA18627 NA19072 NA18630 NA19074 NA19080 NA19081 NA19083 NA19085 NA19088 NA20287 NA19835 NA20276 NA19818 NA20278 NA20282 NA20342 NA20296 NA20314 NA20346 NA19712 NA19198 NA19108 NA18934 NA18916 NA18907 NA18917 NA06989 NA12058 NA12341 NA12546 NA12489 HG01197 NA18983 NA11843 NA11892 NA12749
-20 82176 rs11906362 T C 318 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=16;DB;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
-20 249843 rs112456910 C T 1304 PASS BCM.AC=14;DB;SEQUENOM.AC=12;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=29 GT 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/1 . . 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 . . . 0/0 . 0/0 . . . . . . . . . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . . . . 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . . . . 0/0 0/0 . . 0/1 . . 0/0 . 0/1 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 . . . . . 0/0 . 0/1 . . . . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/1 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . . . . . . 0/0 . 0/0 . . . . . . . . . . 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/1 0/1 0/0 . . 0/0 0/0 . . 0/0 0/1 . . 0/1 . . . 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 .
-20 688672 rs116071340 C T 56 PASS BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=52 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 987773 rs6077519 T G 474 PASS DB;SEQUENOM.AC=73;SRC=VQSR-ONLY;PQ=42 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1166164 . G T 26 NOT_DESIGNED BCM.AC=20;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 1333317 . A G 4 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=32 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1372898 rs112426678 C A 833 PASS BCM.AC=7;DB;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=46 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1526045 rs11908182 A G 847 PQ10 BCM.AC=6;DB;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1565049 . C T 100 PASS SEQUENOM.AC=3;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=19 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1577285 . G A 4 HIGH_NO_CALL_RATE SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=57 GT . . . 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . . . . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . . . . . 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 . . . . . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . . 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 . . . . . . . . 0/0 . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 . 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 . . . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 . . . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 . . . . . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 . . . . . . 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0
-20 1577845 . G A 267 HIGH_NO_CALL_RATE BCM.AC=42;SEQUENOM.AC=5;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=37 GT 0/0 . . 0/0 . . . . . . 0/0 . . 0/0 . . 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 . 1/1 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 . . . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 . . . . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 . . 0/0 . . . 0/0 . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 . . 0/0 . . 0/0 0/0 . . 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . . . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 . . 0/0 . . . . . 0/0 . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 . 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 . . . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 . 0/0 . . . . . . 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 . . . . 0/0 . 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/1 . 0/0 . . . 0/0 . 1/1 . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0
-20 1590306 . A G 16 AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS SEQUENOM.AC=177;SRC=VQSR-ONLY;PQ=15 GT 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 . 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 . 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 . 0/0 . 0/1 0/1 0/1 . 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 . 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . . 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 . 0/1 0/1 0/1 0/1 . 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 . 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 . . 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 . 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0
-20 1643825 . G T 24 PQ10 BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1746733 . G A 9 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 1896670 . G C 16 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1934851 rs6045641 T C 53 NOT_DESIGNED BCM.AC=29;DB;SRC=VQSR-ONLY
-20 2083617 . G A 9 NOT_DESIGNED BCM.AC=4;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 2280790 rs214779 T A 57436 NOT_DESIGNED BCM.AC=758;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 2843004 rs118020362 T C 131 PASS BCM.AC=4;DB;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=57 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 2854191 . C T 78 POSSIBLE_PROBE_FAILURE BCM.AC=25;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 2999522 . G A 5 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 3935503 . G A 95 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=9
-20 4015187 . G C 93 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=14;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
-20 4260976 rs75912589 A G 8109 PASS BCM.AC=94;DB;SEQUENOM.AC=95;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0
-20 4557512 . C A 8 NOT_TYPED SRC=VQSR-ONLY;PQ=48
-20 4603711 . C T 20 PQ10 SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY;PQ=9 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5021712 rs115278430 C A 76 NOT_TYPED BCM.AC=2;DB;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=15
-20 5137904 . C T 70 PASS BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5500990 rs116723001 C A 1701 PASS BCM.AC=14;DB;SEQUENOM.AC=13;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=31 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5524677 . C T 21 PASS BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=57 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5601529 rs6085225 G A 1415 PQ10 BCM.AC=33;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5773125 . G A 165 NOT_TYPED BCM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=13
-20 5986950 rs6085343 G A 1226 PASS BCM.AC=68;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 6242013 . G A 10 NOT_TYPED;PQ10 SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0
-20 6320495 . C A 16 NOT_TYPED BCM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=29
-20 6575066 . T C 9.19 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7228334 . A G 108 PQ10 BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7274968 . C T 39 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=46 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7321986 . C G 5 PQ10 SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7377337 . C T 180 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=57 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7400995 rs114967944 C T 426 PASS BCM.AC=8;DB;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=57 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7466093 . C G 4.11 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=36 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7575759 rs28491496 A G 308 POSSIBLE_PROBE_FAILURE;PQ10 BCM.AC=17;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7678819 rs11699779 A G 12976 PASS BCM.AC=95;DB;SEQUENOM.AC=93;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=37 GT . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 . 0/1 . . 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-20 7924363 . G A 301 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 8165430 rs61262870 T C 1699 NOT_DESIGNED DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 8642873 . A G 19 NOT_DESIGNED BCM.AC=58;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 8700342 . T G 102 PASS BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=53 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 8799615 . C T 38 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=29 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 9149281 . C T 11 PASS BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 9214590 . T C 99 PASS BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=57 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 9276871 . C T 695 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=11;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=9
-20 10226915 rs74843547 G A 120 PASS BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 10259160 . T A 10 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=57 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 10482699 . G A 101 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 10625431 . T C 17 PASS BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 11506447 . G C 100 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=55 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 11565628 . G A 22 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 11625368 rs111669054 A G 138 PASS BCM.AC=2;DB;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=38 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 11798908 . A G 14 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12006592 . A G 57 PASS SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=29 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12025988 . C T 34 NOT_DESIGNED BCM.AC=43;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 12142653 . T A 12 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12171235 . A G 60 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=52 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12326082 . C T 118 NOT_TYPED;PQ10 SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
-20 12364163 . A G 8 PASS SEQUENOM.AC=2;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=53 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12718574 rs112953117 G C 656 PASS BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=40 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13241902 . A C 52 PQ10 BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13339930 rs6042043 A G 839 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=143;DB;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
-20 13410135 rs77634879 T A 50 PASS BCM.AC=39;DB;SEQUENOM.AC=37;SRC=VQSR-ONLY;PQ=60 GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13764237 . C T 51 NOT_TYPED BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=37
-20 14283363 rs111719158 G A 197 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=6;DB;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=0
-20 14589314 rs2209596 G T 30806 INCORRECT_SEQUENOM_CALLS BCM.AC=253;DB;SEQUENOM.AC=315;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT . 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 . 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 . 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 . 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 . 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 . 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1
-20 14843271 . A G 78 NOT_DESIGNED BCM.AC=343;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 15193914 . C T 48 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15581882 . C G 51 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15699667 . C T 59 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=52 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15913614 . G T 9 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16397068 . C G 1.16 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=20 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16475471 rs73597775 C T 234 HIGH_NO_CALL_RATE DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16487648 rs12479901 G A 1025 PASS BCM.AC=14;DB;SEQUENOM.AC=15;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=23 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 16936995 . C A 102 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17430784 . T C 18 PQ10 BCM.AC=7;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17828256 . C T 77 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17938631 . T C 218 PASS BCM.AC=8;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17980474 . G A 34 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=23 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17991241 . C T 49 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 18180100 . A G 100 NOT_TYPED;PQ10 SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0
-20 18198917 . C T 15 PASS SEQUENOM.AC=3;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18232143 rs77523268 C T 952 PASS BCM.AC=8;DB;SEQUENOM.AC=8;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=57 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18584068 . C A 81 NOT_TYPED;PQ10 SRC=VQSR-ONLY;PQ=0
-20 19212550 . C A 11 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY;PQ=46 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 19966683 rs199601 G A 56556 PASS BCM.AC=562;DB;SEQUENOM.AC=560;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 . 1/1 . 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1
-20 20157470 rs74569344 G T 159 NOT_TYPED;PQ10 DB;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0
-20 20850592 . G A 11.30 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0
-20 20987147 . T C 58 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21056309 . T C 12.30 PASS SEQUENOM.AC=2;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=33 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21195714 . A C 12 NOT_DESIGNED BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 21477015 . G A 140 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=9
-20 21491513 . C T 11 NOT_DESIGNED BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 21530607 rs4627653 G A 3116 PASS BCM.AC=21;DB;SEQUENOM.AC=21;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=46 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21569638 . G C 35 PASS BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=29 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21579389 . C T 169 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 21624143 . T C 63 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=43 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21734208 . A G 5.74 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=55 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21754065 . G A 16 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21764267 . G A 164 PASS BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=41 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21863337 . T C 174 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21910648 . C A 145 PQ10 BCM.AC=5;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 22016989 . G A 7 NOT_TYPED;PQ10 SRC=VQSR-ONLY;PQ=0
-20 22168952 . G T 107 PQ10 BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23102548 . G C 15 PASS BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=57 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23470735 . A T 12 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 23665595 . C T 205 PASS BCM.AC=4;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=43 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . . . 0/0 . . 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . .
-20 23758844 rs117686838 A T 1.18 NOT_DESIGNED DB;SRC=2-OF-7-ONLY
-20 23785676 . G A 90 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=23 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 24126594 . C T 16 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 24247752 . C T 6107 NOT_DESIGNED BCM.AC=42;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 24432806 . T C 21 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR-ONLY;PQ=57 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 24450030 . G A 8 NOT_TYPED SRC=VQSR-ONLY;PQ=60
-20 24792588 . C T 17 NOT_DESIGNED SRC=VQSR+2-OF-7
-20 24875997 rs6106960 T C 35367 PASS BCM.AC=238;DB;SEQUENOM.AC=233;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 . 0/0 . 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-20 25133654 . G A 13.40 PQ10 SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 25388911 . G T 28 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=53 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 25574143 . G A 77 PQ10 SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 25659422 . A G 11 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
-20 25700728 rs6037216 C G 1553 POSSIBLE_PROBE_FAILURE;PQ10 BCM.AC=7;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 25741857 rs73347142 G T 41907 PQ10 DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=9 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 25750038 . T G 86 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=493;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0
-20 25751184 . G C 100 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=180;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0
-20 25766473 . T A 124 NOT_TYPED;PQ10 SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
-20 25789517 . A T 40 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=319;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
-20 25794555 . G A 18 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=181;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0
-20 25922316 . T C 26 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=18 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 25999667 . C G 32 INCORRECT_SEQUENOM_CALLS;PQ10 BCM.AC=61;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 26046637 . G A 26 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=354;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0
-20 26057903 . G A 100 NOT_TYPED;PQ10 SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0
-20 26071009 . T C 9 AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS;PQ10 BCM.AC=586;SEQUENOM.AC=59;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 26126724 . G C 23737 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=18 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 26217247 . C A 374 PQ10 BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 26246019 rs79506355 C A 999 NOT_TYPED DB;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=11
-20 26258231 rs79859288 C T 527 NOT_TYPED DB;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=13
-20 26265474 . G T 460.59 PQ10 SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=9 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 26272553 . C G 100 PQ10 SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 26275939 . A G 81 NOT_TYPED SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=12
-20 26293152 . T C 100 PASS BCM.AC=14;SEQUENOM.AC=17;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=10 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0
-20 26301426 . A G 63 AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=11 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 26301793 . C G 8 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY;PQ=47 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 26304696 rs6051307 G A 100 PQ10 DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29494622 rs78775502 C T 935 PQ10 DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29514290 rs6087354 T A 19181 AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS;PQ10 DB;SEQUENOM.AC=278;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 . 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 . 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1
-20 29518801 rs113500384 G A 702.91 PQ10 DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29574811 rs73620522 G A 16281 HIGH_NO_CALL_RATE DB;SEQUENOM.AC=24;SRC=VQSR-ONLY;PQ=15 GT 0/1 1/1 1/1 . 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 . 1/1 1/1 . . 0/0 . . 1/1 . 1/1 1/1 . 1/1 1/1 0/1 1/1 . . 1/1 0/0 . 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 . 1/1 1/1 . 1/1 . . 1/1 . . . . 1/1 1/1 . . . . . . . . . . . 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 . 1/1 1/1 . . . . . 1/1 . 1/1 . 0/1 . . . 0/1 . 1/1 . 1/1 . 1/1 1/1 0/1 1/1 . . 1/1 . 1/1 . . . 1/1 1/1 . . 1/1 . . . 1/1 1/1 1/1 . 1/1 1/1 . 1/1 1/1 . 1/1 1/1 . 1/1 1/1 . 1/1 . 0/1 1/1 1/1 . 1/1 . . 1/1 1/1 . 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 . 1/1 1/1 . . 1/1 . 1/1 1/1 . . . . . 1/1 . 1/1 1/1 . 1/1 1/1 . 1/1 1/1 . 1/1 1/1 . 1/1 . . 1/1 1/1 . 1/1 . . 1/1 . . . 0/0 . 1/1 1/1 . . . . 1/1 1/1 . 1/1 1/1 . 1/1 . . . 1/1 . 1/1 1/1 . 1/1 . . . 1/1 1/1 1/1 1/1 . 1/1 . 1/1 . . . . . . . 1/1 . . . . . . . . . . 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 . . . . . 1/1 1/1 1/1 . 1/1 . . . . . . . 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 . 1/1 . . . . . . 1/1 1/1 1/1 . 1/1 0/0 . . . . . 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 . . 1/1 . 1/1 . 0/1 1/1 1/1 . 1/1 1/1 1/1 . . . . 1/1 . . . . . . . . . . . 1/1 1/1 . . 1/1 1/1 . 1/1 . 0/0 . . . . . . . 0/0 . . . . 1/1 . 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 . 1/1 . . . . 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 . . . 1/1 . . 1/1 . 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 . 1/1 1/1 . 1/1 . 1/1 . . 1/1 1/1 1/1 0/0
-20 29598472 rs73612735 T G 10639 NOT_TYPED;PQ10 DB;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0
-20 29632410 . T C 5.11 NOT_TYPED;PQ10 SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0
-20 29642272 rs77298479 T A 100 NOT_TYPED;PQ10 DB;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=9
-20 29827087 rs62641496 G C 100 NOT_DESIGNED DB;SRC=2-OF-7-ONLY
-20 30120025 . C G 1113 POSSIBLE_PROBE_FAILURE;PQ10 BCM.AC=9;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30595334 rs62206358 C A 62 PASS BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=20 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30616314 . G A 176 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=52 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30696393 rs76882848 T C 150 PASS BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30884360 . C A 6 PQ10 BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=9 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30910907 . A T 24 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 31107862 . T C 46 PQ10 BCM.AC=6;SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 31316775 . T G 47 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY;PQ=37 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 31576854 . C T 66 PQ10 BCM.AC=8;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32840139 . G A 1158 PQ10 BCM.AC=11;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 33588848 . C T 17 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY;PQ=34 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 33974818 . G A 959 NOT_TYPED BCM.AC=12;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=16
-20 34147834 rs368386 G A 105 NOT_DESIGNED BCM.AC=3;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 34155930 . T C 1200 NOT_DESIGNED BCM.AC=23;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 34589611 . C T 39 PQ10 SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 34595073 . T G 518 POSSIBLE_PROBE_FAILURE;PQ10 BCM.AC=4;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 35255604 . C T 367 POSSIBLE_PROBE_FAILURE BCM.AC=5;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=46 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 35644471 rs8115057 C T 10677 PQ10 BCM.AC=174;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 36480073 . T C 428 PASS BCM.AC=6;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=25 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 36563396 . G A 2.68 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 36645837 rs79088417 T C 342 NOT_DESIGNED DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 36667909 . C T 659 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=0
-20 36932648 rs5743498 C T 107 PASS BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=53 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37398143 . T A 31 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37790289 . G A 26 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=46 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37817201 . A G 222 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=37 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37873327 . A T 445 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37980382 . A G 78 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=20 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 38302429 rs73906408 C T 5149 PASS BCM.AC=24;DB;SEQUENOM.AC=24;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 38369195 . C T 43 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=56;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
-20 38901146 . C T 2046 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=60;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
-20 39110108 . C T 4.13 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 39624865 . G A 584 NOT_TYPED BCM.AC=9;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=29
-20 40505598 . A G 16 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=41 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 40927704 . T C 12 PASS BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41093733 . T C 5 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 41137712 rs230167 C T 24 NOT_DESIGNED DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 41311175 . C T 75 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=57 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41642529 . T G 72 PQ10 BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=9 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41756929 . C T 32 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41818162 rs117637352 G A 391 PASS BCM.AC=30;DB;SEQUENOM.AC=29;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42153349 . C T 25 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=57 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42171267 . A G 88.70 PASS SEQUENOM.AC=13;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42330199 . G A 590 PASS BCM.AC=5;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42474396 . G A 100 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=23 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42483892 . T C 112 NOT_TYPED BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=29
-20 42500754 rs6513891 C A 619 PQ10 DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42575810 . T C 3.60 PASS SEQUENOM.AC=2;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42762553 rs5014517 C T 759.47 NOT_DESIGNED BCM.AC=366;DB;SRC=2-OF-7-ONLY
-20 42908494 . T C 42 PASS BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42927494 . C G 17 PQ10 BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43033625 . G A 100 NOT_DESIGNED SRC=2-OF-7-ONLY
-20 43066015 rs6093982 C T 290 PASS BCM.AC=2;DB;SEQUENOM.AC=5;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=31 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43506182 . T C 28 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43582424 rs79775916 C T 9 PASS BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=43 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43744100 . G C 4.80 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=43 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43899736 . G A 35 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=46 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 44373763 . C T 730 PASS BCM.AC=6;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=43 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 45097507 rs454429 C T 25449 PASS BCM.AC=302;DB;SEQUENOM.AC=300;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 . 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 . 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 . 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 45919615 . T C 46 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=29 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 46997402 rs34772061 C G 19 NOT_TYPED;PQ10 DB;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
-20 47502684 . G A 66 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=55 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 48045398 . A G 20 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=37 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 48124745 . C T 10.30 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=39 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 48422538 rs73269151 A G 13012 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=282;DB;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=0
-20 48669886 rs73276465 G C 106 NOT_TYPED BCM.AC=8;DB;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60
-20 48691248 . A G 95 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=23 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 48917711 rs116072324 T C 129 NOT_DESIGNED BCM.AC=1;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 49098380 . A T 115 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49206794 rs116083969 G A 19 PASS BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49360238 . G A 50 PQ10 BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49712636 rs113933231 T A 93 PASS BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=52 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 50309600 . C A 46 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=46 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 50599968 rs6096700 T C 10667 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=426;DB;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
-20 50601297 . A T 7 PASS BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=57 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 50603254 rs6021599 A G 13052 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=520;DB;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
-20 50810123 rs28420712 A T 2671 NOT_DESIGNED BCM.AC=228;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 50892806 . A G 37 NOT_DESIGNED BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 51511870 . C T 116 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=43 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 51818730 . C T 130 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=54 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 51958269 . G C 48 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=23 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 52285202 rs113200595 T G 11071 NOT_DESIGNED BCM.AC=198;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 52308503 . T C 651 PASS BCM.AC=5;SEQUENOM.AC=5;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 52470222 rs28606974 A G 72 NOT_DESIGNED BCM.AC=22;DB;SRC=VQSR-ONLY
-20 52485230 . G T 74 NOT_DESIGNED BCM.AC=21;SRC=VQSR-ONLY
-20 53017837 rs112388078 T C 1190 PASS BCM.AC=8;DB;SEQUENOM.AC=8;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=37 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 53031638 . T G 4 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 53272023 rs4362623 G A 70728 PASS BCM.AC=692;DB;SEQUENOM.AC=690;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=57 GT 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 . 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1
-20 53423667 . T A 214 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=55 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 53580904 . T C 32 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 53599478 . C T 34 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=9
-20 54004274 rs114966870 A G 602 PASS BCM.AC=40;DB;SEQUENOM.AC=9;SRC=VQSR-ONLY;PQ=57 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54096380 . G A 46 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54146938 . G A 27 POLYMORPHIC_SAMPLES_FAILED BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=53 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54163701 . A G 130 PASS BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . .
-20 54199759 . T C 198 NOT_DESIGNED BCM.AC=9;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 54313664 rs112885916 A T 98 PASS BCM.AC=10;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=57 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54424603 . T C 116 PQ10 BCM.AC=8;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54542220 . C T 33 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 54628591 . G A 87 POLYMORPHIC_SAMPLES_FAILED;PQ10 BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54793377 . C T 8 HIGH_NO_CALL_RATE BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=60 GT . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
-20 55067830 . G A 6 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 55113534 . T G 21 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=16 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 55195413 . A G 20 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 55483325 . C T 17 NOT_TYPED;PQ10 BCM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0
-20 55598554 . T C 22.30 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=48 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 55790632 . G T 39 HIGH_NO_CALL_RATE BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 . . 0/0 . . . . 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 . . . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . . . . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . . . 0/0 . . . 0/0 . . . . . . . . . . 0/0 0/0 . . . . 0/0 . . . . . . 0/0 0/0 . . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . .
-20 55870101 . C T 129 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 56029723 rs74833660 G A 21 PASS BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=29 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 56309506 . C G 6.38 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 56335703 . G C 33 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=35 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 56549982 rs6099866 T C 999 PASS DB;SEQUENOM.AC=9;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=32 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 56792927 . C T 207 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 57266953 . C A 46 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 57566637 rs149265 C T 58555 PASS BCM.AC=513;DB;SEQUENOM.AC=505;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 . 1/1 1/1 1/1 1/1 . 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 . 1/1 . 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 . 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 . 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1
-20 57653509 rs6026678 C T 489 PASS BCM.AC=4;DB;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 57728647 . C T 13 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 58308048 . A G 35 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 58335635 . C T 7 PQ10 BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59211281 . A G 4.33 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=43 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59286435 . T C 5.69 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 60262734 rs73915327 C A 576 PASS BCM.AC=10;DB;SEQUENOM.AC=10;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 60291372 . A G 100 NOT_DESIGNED BCM.AC=21;SRC=2-OF-7-ONLY
-20 60520698 . T C 428 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 60547414 . G T 10 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 60560062 . C T 25 NOT_TYPED BCM.AC=343;SRC=VQSR-ONLY;PQ=50
-20 60578895 . G T 34 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=52 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 60641243 . G A 16 NOT_DESIGNED BCM.AC=150;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 60641369 . G A 16 PASS BCM.AC=159;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=43 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 60730826 . G A 11 AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=60 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 61206227 . C T 4.25 NOT_TYPED SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=37
-20 61286252 rs13433258 C T 123 PASS BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 61497927 . A C 47 PQ10 BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=9 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 61766484 . G T 58 NOT_DESIGNED BCM.AC=157;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 61788338 . C G 7 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 61830486 . G A 48 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 62191452 rs113748232 C T 143 PASS BCM.AC=7;DB;SEQUENOM.AC=7;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 62462285 . G A 66 NOT_DESIGNED BCM.AC=304;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 62480353 . T A 100 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=11 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 62724959 . G T 10 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 62888718 . T C 57 POLYMORPHIC_SAMPLES_FAILED BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 62918298 . G A 33 NOT_DESIGNED SRC=VQSR+2-OF-7
-20 62961477 . T C 17 AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS;PQ10 SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.0
-##fileDate=2011-07-18
-##source=Platypus_Version_0.1
-##platypusOptions={'bamFiles': ['/data/lindah/illumina_projects/rimmer_indels/AllData.bam'], 'labels': None, 'refFile': '/ib/groups/bsg/scratch/rimmer/Genomes/human_g1k_v37_ebv.fa', 'maxHaplotypes': 256, 'maxSize': 250, 'parseNCBI': 0, 'ploidy': 2, 'bufferSize': 1000000, 'nCPU': 1, 'minFlank': 3, 'minPosterior': 5, 'logFileName': 'log.txt', 'regions': ['20'], 'processRegionSize': 30000000, 'maxVariants': 8, 'maxReads': 5000000, 'genIndels': 1, 'minReads': 2, 'dataType': 'population', 'minMapQual': 20, 'rlen': 150, 'nInd': 1, 'getVariantsFromBAMs': 1, 'genSNPs': 1, 'strandFilter': 0, 'verbosity': 2, 'sourceFile': None, 'callOnlyIndels': 0, 'output': 'test.vcf', 'minBaseQual': 20}
-##INFO=<ID=FR,Number=0,Type=Float,Description="Estimated population frequency">
-##INFO=<ID=HP,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolmer run length">
-##INFO=<ID=TR,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of reads containing this variant">
-##INFO=<ID=PP,Number=0,Type=Float,Description="Posterior probability (phred scaled) that this variant segregates">
-##INFO=<ID=NF,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of forward reads containing this variant">
-##INFO=<ID=SC,Number=1,Type=String,Description="Genomic sequence 10 bases either side of variant position">
-##INFO=<ID=NR,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of reverse reads containing this variant">
-##INFO=<ID=TC,Number=0,Type=Integer,Description="Total coverage at this locus">
-##FILTER=<ID=sb,Description="Variant not seen at least once on both strands">
-##FILTER=<ID=pp10,Description="Posterior probability phred-score is less than 10">
-##FILTER=<ID=pp5,Description="Posterior probability phred-score is less than 5">
-##FILTER=<ID=hp10,Description="Inside a homopolymer of length greater than 10">
-##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Unphased genotypes">
-##FORMAT=<ID=FT,Number=1,Type=String,Description="Sample Genotype Filter">
-##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype quality, as Phred score">
-##FORMAT=<ID=HQ,Number=.,Type=Integer,Description="Haplotype Quality">
-##FORMAT=<ID=GL,Number=.,Type=Float,Description="Genotype log-likelihoods (log10) for AA,AB and BB genotypes, where A = ref and B = variant. Only applicable for bi-allelic sites">
-##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read depth at this position for this sample">
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT AllData.bam
-20 67500 . T TTGGTATCTAG . PASS FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=CCTGATTTCCTTGGTATTAAA;TC=20;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-198.02,-21.47,-166.02:100
-20 69506 . G GAC,GACACAC . PASS FR=0.5,0.5;HP=1;NF=1,3;NR=1,0;PP=44.0,72.0;SC=TGGACACGTGGACACACACAC;TC=20;TR=2,3 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 70484 . CTCTT C . PASS FR=0.5;HP=2;NF=13;NR=3;PP=100.0;SC=GTCTATGTCTCTCTTTCTCTT;TC=31;TR=16 GT:GL:GQ 0/1:-189.04,-24.53,-147.47:100
-20 72104 . TA T . PASS FR=0.5;HP=4;NF=9;NR=10;PP=100.0;SC=TTTAAGTCTGTAAAACCATAC;TC=39;TR=19 GT:GL:GQ 0/1:-173.69,-34.04,-169.85:100
-20 74729 . G GT . PASS FR=0.5;HP=9;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=AAGTTTTTTGGTTTTTTTTTA;TC=29;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-83.86,-25.71,-59.16:100
-20 117309 . G GCAGGATTTCAT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=CAGGATTTCTGCAGGATTTCA;TC=25;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-259.57,-46.67,-146.18:100
-20 119645 . G GT . PASS FR=1.0;HP=5;NF=6;NR=5;PP=100.0;SC=TTGTTTGTTTGTTGTTGTTGT;TC=16;TR=11 GT:GL:GQ 1/1:-157.48,-18.84,-7.1:77
-20 120122 . A AAG . PASS FR=1.0;HP=6;NF=10;NR=8;PP=100.0;SC=ATAAAGAAAAAAATTTTAAAA;TC=27;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-266.98,-24.1,-5.49:100
-20 120750 . C CAATT . PASS FR=1.0;HP=6;NF=10;NR=10;PP=100.0;SC=TTTTATAAAACAATTGAGACT;TC=21;TR=20 GT:GL:GQ 1/1:-319.22,-18.71,-2.07:100
-20 122806 . T TTA . PASS FR=0.5;HP=2;NF=8;NR=7;PP=100.0;SC=CAGAAAAGAATTATATATATA;TC=29;TR=15 GT:GL:GQ 0/1:-181.3,-19.86,-96.14:100
-20 126155 . GCAAA G . PASS FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=GCAATGTGCGGCAAACAAAGG;TC=32;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-122.73,-27.0,-209.16:100
-20 126310 . ACC A . PASS FR=0.5;HP=5;NF=3;NR=8;PP=100.0;SC=GATGGCTCCTACCCCCGTTTC;TC=26;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-153.97,-42.91,-110.82:100
-20 131505 . CTCT C . PASS FR=1.0;HP=2;NF=11;NR=11;PP=100.0;SC=TACTTGTGATCTCTTGTCTTT;TC=24;TR=22 GT:GL:GQ 1/1:-487.46,-251.24,-235.3:100
-20 131948 . C CCA . PASS FR=1.0;HP=1;NF=2;NR=11;PP=100.0;SC=TTATCTTACACCACACACACA;TC=27;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-201.6,-36.32,-23.94:100
-20 135116 . T TTTGCATTCACAGGAAGACTATAAATA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=TCTAGAGAAGTGCTCTCCAAT;TC=15;TR=3 GT:GL:GQ 1/1:-603.73,-461.77,-448.12:100
-20 135119 . TC T . PASS FR=1.0;HP=2;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=AGAGAAGTGCTCTCCAATAGA;TC=21;TR=4 GT:GL:GQ 1/1:-603.73,-576.89,-572.06:100
-20 137518 . GTA G . PASS FR=0.5005;HP=2;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=GTGTGTGTGTGTATATATATA;TC=21;TR=10 GT:GL:GQ 1/0:-210.61,-46.97,-32.7:29
-20 138178 . GC G . PASS FR=1.0;HP=3;NF=21;NR=5;PP=100.0;SC=CTTCTGGAAAGCCTGGCCATG;TC=29;TR=26 GT:GL:GQ 1/1:-267.55,-29.21,-9.21:100
-20 138570 . ATATGTGTGTG ATG,A . PASS FR=0.5,0.5;HP=2;NF=6,2;NR=9,2;PP=100.0,10.0;SC=TCAAATATATATATGTGTGTG;TC=28;TR=15,4 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:65
-20 140396 . TTTG T . PASS FR=1.0;HP=2;NF=15;NR=4;PP=100.0;SC=AGGTTTTTGCTTTGTTGTTGT;TC=34;TR=19 GT:GL:GQ 1/1:-246.82,-30.67,-15.42:100
-20 144832 . C CT . PASS FR=1.0;HP=3;NF=12;NR=22;PP=100.0;SC=TCCTAAAACTCTTGTAATATC;TC=35;TR=34 GT:GL:GQ 1/1:-541.89,-322.78,-299.72:100
-20 144884 . CCTT C . PASS FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=16;PP=100.0;SC=TGTAATGACACCTTCTTTTTC;TC=29;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-590.4,-430.25,-411.02:100
-20 145257 . G GC . PASS FR=1.0;HP=2;NF=11;NR=8;PP=100.0;SC=ATGGTGGCAGGGCCTGTAATC;TC=21;TR=19 GT:GL:GQ 1/1:-258.74,-106.61,-91.83:100
-20 153298 . T TTC . PASS FR=1.0;HP=2;NF=13;NR=17;PP=100.0;SC=CAGGATTTCTTTGTTTTAAGA;TC=34;TR=30 GT:GL:GQ 1/1:-447.58,-228.67,-205.19:100
-20 160111 . A AT . PASS FR=1.0;HP=10;NF=8;NR=9;PP=100.0;SC=GAGCTCTTGAATTTTTTTTTT;TC=25;TR=17 GT:GL:GQ 1/1:-115.49,-38.32,-28.08:85
-20 163607 . A AAT . PASS FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=14;PP=100.0;SC=ACATTAAATGATTCAAATGAT;TC=31;TR=26 GT:GL:GQ 1/1:-308.34,-35.98,-14.5:100
-20 163741 . T TACACAC . PASS FR=0.5243;HP=1;NF=13;NR=6;PP=100.0;SC=GAACCCTCTGTACACACACAC;TC=28;TR=19 GT:GL:GQ 0/1:-416.01,-75.48,-55.48:13
-20 164279 . G GAAAAC . PASS FR=0.5;HP=8;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=GAAAAGAAAAGAAAAGAAAAC;TC=34;TR=2 GT:GL:GQ 0/1:-492.01,-428.61,-448.28:100
-20 164284 . G GAAAAC,C . PASS FR=0.5,0.5;HP=8;NF=5,10;NR=11,9;PP=100.0,100.0;SC=GAAAAGAAAAGAAAACTCATC;TC=33;TR=16,19 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 176386 . CGTGTGT C . PASS FR=1.0;HP=2;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=TAATCCCATTCGTGTGTGTGT;TC=25;TR=5 GT:GL:GQ 1/1:-176.18,-68.1,-61.92:77
-20 179735 . TTAAAA T . PASS FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=ACCTTTGATCTTAAAATAAAA;TC=27;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-142.0,-61.37,-164.64:100
-20 218255 . A AG . PASS FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=TGCTCACTGCAATAAAAAGAA;TC=17;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-99.61,-20.66,-85.67:100
-20 222539 . C CA . PASS FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=9;PP=100.0;SC=TACCCAGCTACTTCTCTTAAG;TC=31;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-113.51,-40.72,-197.06:100
-20 230058 . CAT C . PASS FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=GACTCCATCTCATAAAAAAAA;TC=33;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-215.64,-148.07,-177.0:100
-20 236459 . G GAT . PASS FR=0.5001;HP=2;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=TTGGAATACAGATATATATAT;TC=14;TR=2 GT:GL:GQ 0/1:-82.0,-46.74,-54.25:35
-20 237649 . CAGAT C . PASS FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=1;PP=79.0;SC=AGATAGATGACAGATAGATAG;TC=23;TR=2 GT:GL:GQ 0/1:-209.52,-180.44,-254.54:100
-20 237816 . A AT . PASS FR=0.5;HP=4;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=CATTTTCATCATTTTAATAAC;TC=32;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-124.3,-28.61,-145.84:100
-20 243223 . C CT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=12;NR=4;PP=100.0;SC=ATCTGTGTGACTGTGATCAAA;TC=33;TR=16 GT:GL:GQ 0/1:-191.55,-34.68,-144.05:100
-20 246483 . T TTAAA . PASS FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=AGACTCCATCTTAAATAAATA;TC=25;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-110.34,-17.05,-40.1:100
-20 251373 . ACTT A . PASS FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=TTGCTCCAGCACTTCTTCTGG;TC=19;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-99.2,-52.91,-150.48:100
-20 271135 . G GC . PASS FR=1.0;HP=2;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=AAGACCGAGGGCGACCTCGAG;TC=16;TR=7 GT:GL:GQ 1/1:-163.65,-94.48,-85.08:78
-20 286648 . TAAATA T . PASS FR=0.5;HP=6;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=TCTAAATAAATAAATAAAAGG;TC=22;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-240.51,-100.72,-176.05:100
-20 299585 . AC A . PASS FR=1.0;HP=2;NF=4;NR=7;PP=21.0;SC=ACAGGGAGAGACCTTGTCGAA;TC=14;TR=11 GT:GL:GQ 1/1:-152.36,-140.91,-138.05:46
-20 334317 . TC T . PASS FR=1.0;HP=6;NF=9;NR=8;PP=100.0;SC=CCTGGATCCTTCCCCCCTTCT;TC=24;TR=17 GT:GL:GQ 1/1:-177.37,-48.79,-33.34:100
-20 337392 . ACC A . PASS FR=0.5;HP=6;NF=5;NR=1;PP=100.0;SC=CCTTGTTACCACCCCTCCCTG;TC=19;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-91.61,-45.67,-115.7:100
-20 340044 . GCAC G . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=5;PP=100.0;SC=ATGAAGGCTGGCACCACCAGT;TC=22;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-122.54,-28.81,-115.11:100
-20 343323 . A ATG . PASS FR=0.5;HP=2;NF=8;NR=4;PP=100.0;SC=GATAAACAGGATGTCCACCAG;TC=23;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-150.99,-48.03,-125.5:100
-20 346702 . AGCCTCCCAAAGGAG A . PASS FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=CACCCACCTCAGCCTCCCAAA;TC=17;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-191.1,-120.01,-173.49:100
-20 347858 . A AAAACAAAC . PASS FR=0.5;HP=4;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=TCCGTCTCCAAAAACAAACAA;TC=22;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-270.04,-201.07,-226.88:100
-20 347878 . A AAAAC . PASS FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=AAAAAACAAAACAAACAAACA;TC=22;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-258.23,-262.98,-327.72:100
-20 348365 . G GT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=ACGGCCCATGGGATCGAATAG;TC=19;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-127.12,-35.07,-72.46:100
-20 349321 . ACT A . PASS FR=0.5;HP=3;NF=10;NR=3;PP=100.0;SC=CCAGGCCTCCACTCTCTGCTG;TC=20;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-183.61,-95.19,-129.48:100
-20 355549 . A AC . PASS FR=1.0;HP=10;NF=12;NR=9;PP=100.0;SC=AACAACAACAAAAAAAAAAAC;TC=24;TR=21 GT:GL:GQ 1/1:-171.74,-97.15,-84.12:100
-20 356670 . T TCAAA . PASS FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=2;PP=100.0;SC=AGACACTGCCTCAAAAAAACA;TC=16;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-204.44,-131.78,-155.8:100
-20 356675 . A AAAAC . PASS FR=1.0;HP=6;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=CTGCCTCAAAAAAACAAACAA;TC=17;TR=5 GT:GL:GQ 1/1:-201.68,-85.68,-76.1:85
-20 358147 . CA C . PASS FR=1.0;HP=4;NF=10;NR=5;PP=100.0;SC=TGGGATTTGACAAACCCAGCT;TC=18;TR=15 GT:GL:GQ 1/1:-150.87,-32.16,-20.25:100
-20 360927 . TAA T . PASS FR=1.0;HP=7;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=ATGTGCTTTATAAAAAAGGGG;TC=18;TR=11 GT:GL:GQ 1/1:-185.94,-114.38,-104.3:84
-20 380790 . C CT . PASS FR=1.0;HP=3;NF=16;NR=12;PP=100.0;SC=CACCACACCCCGACCCTAATT;TC=32;TR=28 GT:GL:GQ 1/1:-323.67,-24.71,-1.84:100
-20 385989 . T TA . PASS FR=0.5;HP=7;NF=7;NR=4;PP=100.0;SC=AGATTTTTTTTAAAAAACTCT;TC=29;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-131.67,-23.75,-80.28:100
-20 386575 . GTTCT G . PASS FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=TGATAAGAATGTTCTTTCTTT;TC=24;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-109.28,-29.71,-86.14:100
-20 387657 . G GA . PASS FR=1.0;HP=8;NF=13;NR=19;PP=100.0;SC=ATGCTGAGAAGAAAAAATGAA;TC=38;TR=32 GT:GL:GQ 1/1:-284.64,-52.81,-28.53:100
-20 396023 . A AAAAC . PASS FR=1.0;HP=4;NF=9;NR=9;PP=100.0;SC=AAAAAAAACAAAAACAAACAA;TC=25;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-279.26,-33.44,-17.73:100
-20 403158 . GA G . PASS FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=7;PP=89.0;SC=ATCTATGAAGGAAGGACAGCA;TC=20;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-137.87,-107.23,-160.58:100
-20 405057 . A AC . PASS FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=AAACACATACACAGACCTCCT;TC=25;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-136.78,-33.82,-124.47:100
-20 421805 . T TCCA . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=AGAACACATTTCCAACTAAAC;TC=29;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-108.14,-30.52,-185.93:100
-20 425206 . GTTTT G . PASS FR=0.5;HP=7;NF=2;NR=7;PP=100.0;SC=TTGTTTGTTTGTTTTGTTTTT;TC=25;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-158.57,-21.01,-100.22:100
-20 430158 . GA G . PASS FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=AGAGTCGCTTGAAACCCAGGA;TC=16;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-74.97,-35.93,-74.51:100
-20 434939 . G GA . PASS FR=0.5;HP=10;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=AAGAAAAAAGGAAAAAAAAAA;TC=22;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-99.4,-65.02,-85.64:92
-20 436981 . TTTCATCCA T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=AGGTGTGTCCTTTCATCCATT;TC=27;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-88.19,-26.08,-154.96:100
-20 525046 . G GT . PASS FR=0.5;HP=10;NF=5;NR=8;PP=100.0;SC=AAAATACAGTGTTTTTTTTTC;TC=33;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-160.44,-103.25,-141.37:100
-20 538639 . C CA . PASS FR=1.0;HP=9;NF=14;NR=9;PP=100.0;SC=ACCACCACAACAAAAAAACCC;TC=36;TR=23 GT:GL:GQ 1/1:-261.69,-66.02,-42.16:100
-20 539756 . G GT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=AATGTGAGCAGTCTAGGTAAA;TC=24;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-130.62,-70.51,-165.77:100
-20 540198 . T TG . PASS FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=16;PP=100.0;SC=AGAGTCGCTGTTATTAAAACC;TC=26;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-262.05,-37.69,-19.11:100
-20 545849 . A AT . PASS FR=1.0;HP=9;NF=6;NR=13;PP=100.0;SC=CTCTGGACTGATTTTTTTTTA;TC=24;TR=19 GT:GL:GQ 1/1:-225.47,-140.74,-126.39:100
-20 555243 . C CT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=TTGGGGCCTCCTGGGTCCCAG;TC=23;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-124.01,-59.66,-144.99:100
-20 559298 . TACAC T . PASS FR=0.5081;HP=1;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=GGCACACATGTACACACACAC;TC=20;TR=2 GT:GL:GQ 0/1:-95.31,-59.31,-62.75:17
-20 570945 . A AACAC . PASS FR=1.0;HP=1;NF=7;NR=2;PP=100.0;SC=AGAAGGCAATAACACACACAC;TC=28;TR=9 GT:GL:GQ 1/1:-281.44,-73.27,-58.53:100
-20 576287 . T TTTA . PASS FR=1.0;HP=3;NF=2;NR=9;PP=100.0;SC=CTGGAAAAGTTTTATTATTAT;TC=26;TR=11 GT:GL:GQ 1/1:-188.46,-27.21,-14.74:100
-20 593205 . AG A . PASS FR=0.5;HP=6;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=GGGAGTGCGGAGGGGACTCCT;TC=14;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-90.79,-21.16,-46.9:100
-20 635817 . C CAGAAAAAAA . PASS FR=1.0;HP=1;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=GAGACTCTCTCAGAAAAAAAA;TC=23;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-318.1,-28.61,-13.35:100
-20 666340 . AAATAATAATAAT AAATAAT,A . PASS FR=0.5,0.5;HP=2;NF=1,2;NR=3,3;PP=100.0,100.0;SC=ATACAAATACAAATAATAATA;TC=16;TR=4,5 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 671463 . AGTGT A . PASS FR=1.0;HP=1;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=CATGCATGCAAGTGTGTGTGT;TC=25;TR=8 GT:GL:GQ 1/1:-248.41,-147.67,-140.04:63
-20 675799 . G GTA . PASS FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=3;PP=100.0;SC=TAATGAACATGTATATATACA;TC=20;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-154.12,-35.67,-66.33:100
-20 704073 . CTCT C . PASS FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=3;PP=100.0;SC=CTTCATTCTTCTCTTTTCTTT;TC=20;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-159.89,-91.96,-171.96:100
-20 704111 . C CTTTCT . PASS FR=0.5;HP=4;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=TTCCTCCTCTCTTTGTCTAGT;TC=20;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-189.74,-115.92,-237.08:100
-20 714136 . TA T . PASS FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=13;PP=100.0;SC=CTGTGGTTGTTAACTGTAGTC;TC=30;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-253.68,-26.24,-6.67:100
-20 715254 . G GGT,GGTGTGT . PASS FR=0.5,0.5;HP=1;NF=3,4;NR=0,1;PP=57.0,100.0;SC=ATAGTTTATAGGTGTGTGTGT;TC=23;TR=3,5 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 715847 . C CA . PASS FR=1.0;HP=7;NF=10;NR=6;PP=100.0;SC=GGCTCCGTCTCAAAAAAATAA;TC=26;TR=16 GT:GL:GQ 1/1:-157.25,-40.0,-26.17:100
-20 718268 . A AAATAAT . PASS FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=1;PP=81.0;SC=AAAAAATACAAAATAATAATA;TC=15;TR=2 GT:GL:GQ 0/1:-64.86,-29.69,-87.73:100
-20 724447 . A AG . PASS FR=0.5;HP=2;NF=12;NR=9;PP=100.0;SC=GGGTGTTGTGAGACTGATTGA;TC=42;TR=21 GT:GL:GQ 0/1:-229.53,-40.83,-188.06:100
-20 726275 . CAGA C . PASS FR=0.5;HP=3;NF=10;NR=10;PP=100.0;SC=ACATATATAACAGAAGGAGAG;TC=41;TR=20 GT:GL:GQ 0/1:-286.26,-52.94,-197.08:100
-20 728851 . CT C . PASS FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=1;PP=21.0;SC=GATCACACCACTGCAGTCCAG;TC=22;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-200.76,-185.85,-212.48:67
-20 732117 . CTTTATTTTAT C . PASS FR=0.9998;HP=4;NF=1;NR=1;PP=80.0;SC=TCAGGTATGTCTTTATTTTAT;TC=14;TR=2 GT:GL:GQ 1/1:-96.6,-68.07,-66.69:34
-20 739616 . CGTGTGTGT C . PASS FR=1.0;HP=1;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=TAAAAGTGCTCGTGTGTGTGT;TC=20;TR=8 GT:GL:GQ 1/1:-222.59,-24.43,-16.81:63
-20 744662 . A ACAGGTCAAT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=AAAGGACAAGACAGATCCCTG;TC=16;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-105.45,-32.23,-150.03:100
-20 746855 . A AG . PASS FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=5;PP=100.0;SC=CTGGGATTACAGTGTGAGCCA;TC=22;TR=14 GT:GL:GQ 1/1:-242.45,-177.27,-167.62:80
-20 747680 . A ATAG . PASS FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=3;PP=100.0;SC=CTTGTTGGTAATAGCAAGTTA;TC=17;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-177.8,-96.72,-120.09:100
-20 755106 . C CA . PASS FR=1.0;HP=3;NF=7;NR=15;PP=100.0;SC=GCTGAGAGGTCAAACCACAAA;TC=27;TR=22 GT:GL:GQ 1/1:-255.81,-41.84,-23.33:100
-20 757564 . T TG . PASS FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=1;PP=78.0;SC=GGTGGAGCCATGGGTGTCAAA;TC=10;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-67.44,-38.36,-58.29:89
-20 757919 . A AC . PASS FR=0.5;HP=9;NF=3;NR=9;PP=100.0;SC=AAAAAACAAAAAAAAAACACC;TC=27;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-172.2,-112.42,-144.61:100
-20 762893 . G GA . PASS FR=1.0;HP=6;NF=8;NR=9;PP=100.0;SC=TCTTGGGGGGGAAAAAATGGG;TC=24;TR=17 GT:GL:GQ 1/1:-215.19,-64.36,-48.0:100
-20 782496 . CAAATAAAT C . PASS FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=GACTCTGCCTCAAATAAATAA;TC=17;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-87.5,-27.65,-92.5:100
-20 786252 . AAG A . PASS FR=1.0;HP=5;NF=4;NR=13;PP=100.0;SC=TTAATTAAAAAAGATATTGCA;TC=19;TR=17 GT:GL:GQ 1/1:-216.25,-31.31,-17.45:100
-20 786764 . T TA . PASS FR=1.0;HP=3;NF=17;NR=12;PP=100.0;SC=ACTATATATATAATATATTTT;TC=33;TR=29 GT:GL:GQ 1/1:-388.27,-147.23,-125.36:100
-20 787870 . T TTTTATTTATTTATTTATTTA . PASS FR=1.0;HP=3;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=ATATCAAGCATTTTATTTATT;TC=19;TR=3 GT:GL:GQ 1/1:-317.88,-65.36,-53.59:99
-20 787893 . T TATTTATTTA . PASS FR=0.5;HP=4;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=TTTATTTATTTTTGAGATGGA;TC=20;TR=2 GT:GL:GQ 0/1:-356.98,-227.18,-263.76:5
-20 789767 . T TA . PASS FR=1.0;HP=10;NF=8;NR=5;PP=100.0;SC=CAAAGCCAATTAAAAAAAAAA;TC=29;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-124.57,-44.47,-30.25:100
-20 795148 . T TTTTA . PASS FR=1.0;HP=4;NF=9;NR=1;PP=100.0;SC=ATAAGTTTATTTTTATTTATT;TC=16;TR=10 GT:GL:GQ 1/1:-136.44,-12.46,-4.83:63
-20 797336 . GA G . PASS FR=1.0;HP=10;NF=18;NR=11;PP=100.0;SC=CCATTTATGTGAAAAAAAAAA;TC=35;TR=29 GT:GL:GQ 1/1:-156.82,-42.02,-20.72:100
-20 801157 . T TTTC . PASS FR=1.0;HP=6;NF=1;NR=6;PP=100.0;SC=CTTCTCTTTCTTTTTTTCTTT;TC=13;TR=7 GT:GL:GQ 1/1:-142.57,-41.24,-32.92:92
-20 825082 . TGCCCAGGTC T . PASS FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=1;PP=100.0;SC=CTGCTCAGGTTGCCCAGGTCG;TC=8;TR=6 GT:GL:GQ 1/0:-180.72,-60.67,-71.61:61
-20 833239 . ACT A . PASS FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=GGAGAAATAGACTCTCTCTCT;TC=21;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-96.13,-31.34,-89.12:100
-20 835500 . TTGTG T . PASS FR=1.0;HP=2;NF=8;NR=2;PP=100.0;SC=GTGTTTGTGTTTGTGTGTGTG;TC=29;TR=10 GT:GL:GQ 1/1:-258.26,-62.01,-52.79:77
-20 855678 . TC T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=TCTTTTTCTTTCTTTTTTTTC;TC=28;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-124.38,-62.93,-124.85:100
-20 860945 . A AG . PASS FR=0.5;HP=6;NF=2;NR=6;PP=100.0;SC=GTATATTAAGAGGGGGTGAAA;TC=23;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-96.52,-33.16,-85.46:100
-20 863148 . C CTAT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=12;PP=100.0;SC=CCAGAGAAGGCTATTGCTCTC;TC=37;TR=15 GT:GL:GQ 0/1:-223.19,-48.7,-208.9:100
-20 899789 . CTCTT C . PASS FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=3;PP=100.0;SC=TTTCCTTCTTCTCTTTCTTTC;TC=21;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-62.34,-23.94,-85.48:100
-20 900698 . T TC . PASS FR=1.0;HP=4;NF=11;NR=5;PP=100.0;SC=AGGAAGGCAGTCCCCTTTCCT;TC=29;TR=16 GT:GL:GQ 1/1:-292.54,-113.13,-95.49:100
-20 902060 . T TG,G . PASS FR=0.5,0.5;HP=5;NF=2,7;NR=2,4;PP=100.0,100.0;SC=TTGACTGCCCTCCTCCACTTT;TC=19;TR=4,11 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 909945 . TTATGG TTGG,T . PASS FR=0.5,0.5;HP=2;NF=10,8;NR=5,5;PP=100.0,100.0;SC=TTAGTTTAGTTTATGGTATCC;TC=32;TR=15,13 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 913303 . A AT . PASS FR=1.0;HP=10;NF=9;NR=4;PP=100.0;SC=AGATTTAAAGATTTTTTTTTT;TC=21;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-227.97,-180.37,-171.35:75
-20 922916 . A AT . PASS FR=1.0;HP=6;NF=2;NR=1;PP=27.0;SC=TTATTTATTTATTTATTTTTT;TC=7;TR=3 GT:GL:GQ 1/1:-68.71,-54.63,-52.11:41
-20 933970 . GTTAT G . PASS FR=1.0;HP=4;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=CAGGCTAATTGTTATTTATTT;TC=24;TR=10 GT:GL:GQ 1/1:-169.08,-10.86,-0.46:87
-20 934153 . A AT . PASS FR=1.0;HP=7;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=ATTTTTTTGTATTTTTTAATA;TC=11;TR=9 GT:GL:GQ 1/1:-123.08,-66.05,-59.03:57
-20 945474 . CAT C . PASS FR=1.0;HP=2;NF=2;NR=6;PP=100.0;SC=CACACACACACATATATATAT;TC=31;TR=8 GT:GL:GQ 1/1:-229.9,-58.37,-41.73:100
-20 954102 . A ATTGT . PASS FR=0.5;HP=6;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=TGTTTGTTTTATTGTTTGTTT;TC=30;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-77.28,-28.19,-134.91:100
-20 972071 . A AT . PASS FR=0.5;HP=8;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=ATTAAAAAAGATTTTTTTTGT;TC=27;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-76.99,-19.47,-57.49:100
-20 995685 . CAAAT C . PASS FR=1.0;HP=3;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=AACTCTATCTCAAATAAATAA;TC=15;TR=5 GT:GL:GQ 1/1:-96.06,-12.82,-6.68:77
-20 1000562 . TTTCA T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=10;NR=1;PP=100.0;SC=TCACCCTTTCTTTCATTCACT;TC=23;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-127.76,-31.92,-110.25:100
-20 1005659 . CTCAG C . PASS FR=1.0;HP=3;NF=15;NR=6;PP=100.0;SC=AACAAACAAACTCAGTCTGTC;TC=34;TR=21 GT:GL:GQ 1/1:-379.32,-49.71,-26.34:100
-20 1018266 . CAAT C . PASS FR=1.0;HP=4;NF=10;NR=7;PP=100.0;SC=GAAGTAACAACAATAATAATA;TC=26;TR=17 GT:GL:GQ 1/1:-307.78,-61.51,-42.82:100
-20 1023817 . C CCCT . PASS FR=1.0;HP=3;NF=7;NR=3;PP=100.0;SC=CAGTGCCCACCCCTCCTCTCC;TC=22;TR=10 GT:GL:GQ 1/1:-230.45,-50.55,-37.14:100
-20 1024121 . A AT . PASS FR=1.0;HP=6;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=CGGGTCAGGCATTTTTTATCA;TC=16;TR=8 GT:GL:GQ 1/1:-95.55,-28.09,-20.26:65
-20 1042261 . CCCTG C . PASS FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=10;PP=100.0;SC=CCAAACCCAACCCTGCCTGGC;TC=25;TR=20 GT:GL:GQ 1/1:-365.29,-133.94,-117.57:100
-20 1050585 . AT A . PASS FR=1.0;HP=10;NF=9;NR=15;PP=100.0;SC=TTCTAATTCCATTTTTTTTTT;TC=33;TR=24 GT:GL:GQ 1/1:-288.37,-205.98,-189.27:100
-20 1059991 . G GAATT . PASS FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=6;PP=100.0;SC=AACATTTGTTGAATTAATTAA;TC=25;TR=16 GT:GL:GQ 1/1:-290.89,-32.75,-16.81:100
-20 1072882 . CAG C . PASS FR=0.5;HP=6;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=ATCAGAAAAACAGAGACCACA;TC=23;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-124.42,-26.5,-135.46:100
-20 1084744 . TG T . PASS FR=1.0;HP=5;NF=9;NR=12;PP=100.0;SC=ACCATAAATGTGGGGCTACTG;TC=23;TR=21 GT:GL:GQ 1/1:-326.86,-192.89,-179.07:100
-20 1100621 . TAG T . PASS FR=0.5;HP=4;NF=6;NR=3;PP=100.0;SC=GCTTCTCAAATAGAGTCTTAA;TC=23;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-166.5,-71.13,-124.84:100
-20 1105206 . C CAT . PASS FR=1.0;HP=1;NF=15;NR=11;PP=100.0;SC=AATTTATCCACGTGTACCAGA;TC=32;TR=26 GT:GL:GQ 1/1:-427.57,-192.92,-171.28:100
-20 1114638 . C CTCTT . PASS FR=1.0;HP=4;NF=9;NR=17;PP=100.0;SC=TGTGTCCTCTCTTTGTATTTG;TC=34;TR=26 GT:GL:GQ 1/1:-420.88,-72.2,-49.92:100
-20 1118278 . GAA G . PASS FR=1.0;HP=5;NF=13;NR=8;PP=100.0;SC=AGAAAAGGGAGAAAAGGAGGC;TC=24;TR=21 GT:GL:GQ 1/1:-206.9,-16.17,-0.92:100
-20 1127807 . TCATCATCATCATCAC T . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=ATCATCATCATCATCATCATC;TC=18;TR=5 GT:GL:GQ 1/0:-246.11,-143.41,-171.3:100
-20 1133620 . GC G . PASS FR=1.0;HP=3;NF=17;NR=8;PP=100.0;SC=TAAGGACCAAGCCCTGTTTAT;TC=28;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-266.52,-52.99,-34.3:100
-20 1162839 . AG A . PASS FR=0.5;HP=10;NF=1;NR=6;PP=100.0;SC=GGGGTGGGGGAGGGGGTAGAA;TC=27;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-154.34,-117.72,-158.43:100
-20 1165265 . TACAC T . PASS FR=1.0;HP=1;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=CACACGCGCGTACACACACAC;TC=13;TR=3 GT:GL:GQ 1/1:-65.7,-24.93,-20.64:52
-20 1168799 . T TAC . PASS FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=3;PP=100.0;SC=ATATATATAATACACACACAC;TC=33;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-146.28,-74.63,-149.77:100
-20 1194678 . A AT . PASS FR=1.0;HP=8;NF=13;NR=12;PP=100.0;SC=TACAAGATTAATTTTTTTTGT;TC=37;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-428.37,-300.25,-279.55:89
-20 1195705 . AAAG A . PASS FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=12;PP=100.0;SC=AGAGATGGCCAAAGAAGACAT;TC=27;TR=22 GT:GL:GQ 1/1:-481.8,-237.54,-219.64:100
-20 1200593 . GA G . PASS FR=0.5;HP=5;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=TTTTTTAAAAGATCAACAAAA;TC=31;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-291.7,-258.36,-302.47:100
-20 1202056 . C CT . PASS FR=0.5;HP=6;NF=2;NR=1;PP=73.0;SC=TTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT;TC=17;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-78.02,-50.24,-96.3:100
-20 1217230 . C CT . PASS FR=0.5;HP=3;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=TGAATCTGAACTTTCTCTATT;TC=29;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-136.34,-37.11,-139.78:100
-20 1238533 . TATC T . PASS FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=8;PP=100.0;SC=ATTCCCTTATTATCCTTTTAA;TC=32;TR=14 GT:GL:GQ 0/1:-203.0,-27.66,-145.09:100
-20 1258183 . GTGTC G . PASS FR=0.5;HP=2;NF=9;NR=7;PP=100.0;SC=CTGTGCATGTGTGTCTGTGTG;TC=40;TR=16 GT:GL:GQ 0/1:-393.66,-270.04,-334.02:100
-20 1258199 . C CTG . PASS FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=8;PP=100.0;SC=GTGTGTGTATCTGTGTGTGTG;TC=39;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-443.43,-273.82,-255.93:100
-20 1258268 . C CTG . PASS FR=1.0;HP=1;NF=14;NR=7;PP=100.0;SC=GTATGTGTGCCTGTGTGTGTG;TC=36;TR=21 GT:GL:GQ 1/1:-385.28,-210.98,-205.13:73
-20 1258437 . GTGTGCCTGTGTGTGTC G . PASS FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=GCCTGTGTATGTGTGCCTGTG;TC=40;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-300.85,-170.75,-363.46:100
-20 1258704 . C CTGTT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=3;PP=100.0;SC=GTGTGTGTGTCTGTGTGTGTA;TC=34;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-182.12,-58.28,-233.67:100
-20 1270442 . CA C . PASS FR=1.0;HP=2;NF=5;NR=12;PP=100.0;SC=CACTGCACTCCAAGCCTAGGT;TC=17;TR=17 GT:GL:GQ 1/1:-162.61,-26.2,-14.46:98
-20 1272295 . CTCTGT C . PASS FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=7;PP=100.0;SC=CCAAGTTCTGCTCTGTTGATT;TC=25;TR=20 GT:GL:GQ 1/1:-389.78,-103.27,-85.17:100
-20 1272815 . C CATAG . PASS FR=1.0;HP=2;NF=11;NR=10;PP=100.0;SC=TAGTCTAAGGCATAGCATCCT;TC=27;TR=21 GT:GL:GQ 1/1:-368.78,-50.48,-32.46:100
-20 1291149 . GCAA G . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=CCTGGATACAGCAACAACAGT;TC=25;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-151.35,-93.7,-185.23:100
-20 1292033 . C CTTGT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=CTTACATTTGCTTGTTTGATA;TC=29;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-444.32,-314.49,-337.3:100
-20 1292718 . GT G . PASS FR=1.0;HP=8;NF=9;NR=3;PP=100.0;SC=TAATTTTTTAGTTTTTTTTGT;TC=17;TR=12 GT:GL:GQ 1/1:-140.26,-85.11,-76.3:73
-20 1292776 . T TA . PASS FR=1.0;HP=1;NF=14;NR=10;PP=100.0;SC=CTCCTGGACTTAGTGATCCTC;TC=25;TR=24 GT:GL:GQ 1/1:-310.19,-119.02,-102.21:100
-20 1303648 . A AG . PASS FR=0.5;HP=4;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=GGCAACACTCACCCGGCTGAG;TC=19;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-115.57,-32.83,-76.0:100
-20 1312294 . A AT . PASS FR=1.0;HP=7;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=CACCTGGCTAATTTTTTTATT;TC=17;TR=11 GT:GL:GQ 1/1:-196.82,-109.27,-98.21:93
-20 1318554 . TCCCACAGAGAAGTCC T . PASS FR=1.0;HP=3;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=ACCTAAGCATTCCCACAGAGA;TC=12;TR=9 GT:GL:GQ 1/1:-228.16,-15.45,-7.14:62
-20 1322791 . G GCACACA,GCACACACA . PASS FR=0.5,0.5;HP=1;NF=3,3;NR=0,4;PP=43.0,100.0;SC=GAGAACAAATGCACACACACA;TC=18;TR=3,7 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 1333430 . C CT . PASS FR=1.0;HP=2;NF=18;NR=9;PP=100.0;SC=ATGAAGGTGACTTCTCAGGTG;TC=32;TR=27 GT:GL:GQ 1/1:-276.34,-27.55,-7.09:100
-20 1342649 . AT A . PASS FR=1.0;HP=6;NF=17;NR=10;PP=100.0;SC=AGTGTATGAGATTTTTTGTTA;TC=29;TR=27 GT:GL:GQ 1/1:-209.72,-24.22,-4.14:100
-20 1349439 . C CCCT . PASS FR=0.5;HP=4;NF=2;NR=6;PP=100.0;SC=CCCACATTCCCCCTCCTCTGA;TC=22;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-157.47,-56.31,-133.86:100
-20 1358694 . C CAGTTTGGGCACTAACACCTACTT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=CTATACGGGTCAGTTTGGGCA;TC=19;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-272.45,-105.91,-212.24:100
-20 1364390 . G GA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=9;NR=6;PP=100.0;SC=GATCAAGTGGGAGATCACTTG;TC=25;TR=15 GT:GL:GQ 1/1:-334.68,-154.31,-139.66:100
-20 1369478 . CG C . PASS FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=4;PP=100.0;SC=TAAAAACCAACGAGGCTCCAC;TC=23;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-184.87,-113.86,-180.77:100
-20 1372404 . GA G . PASS FR=1.0;HP=7;NF=8;NR=5;PP=100.0;SC=GAGGGAGTGGGAAAAAAAGAG;TC=17;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-147.21,-77.38,-68.31:75
-20 1379453 . C CTG . PASS FR=1.0;HP=2;NF=4;NR=11;PP=100.0;SC=TGCCAGGACTCTCCTCGCTGT;TC=19;TR=15 GT:GL:GQ 1/1:-192.19,-47.83,-35.2:100
-20 1381135 . AG A . PASS FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=CTTGAGGACAAGGCATTATAG;TC=26;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-99.07,-46.56,-212.4:100
-20 1386382 . AGAG A . PASS FR=0.5;HP=3;NF=7;NR=1;PP=100.0;SC=ACTAATTAAAAGAGAACCCTG;TC=26;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-184.22,-117.09,-276.56:100
-20 1389225 . CGTGTGT C . PASS FR=1.0;HP=1;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=TATGAAGACTCGTGTGTGTGT;TC=12;TR=2 GT:GL:GQ 1/1:-80.8,-37.12,-33.18:48
-20 1392633 . AT A . PASS FR=0.5;HP=9;NF=8;NR=5;PP=100.0;SC=AAGCCAACACATTTTTTTTTC;TC=29;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-142.17,-103.31,-156.4:100
-20 1399660 . A AAAAAC . PASS FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=7;PP=100.0;SC=TGTTTATGTTAGAAACAAAAC;TC=28;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-237.24,-123.87,-245.2:100
-20 1401887 . T TC . PASS FR=0.5;HP=6;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=TGACTTTTTTTCTCCCTGAGA;TC=26;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-140.81,-26.64,-103.7:100
-20 1403888 . G GT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=CAGAGAGGGCGTAAGATTGGA;TC=18;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-134.33,-94.6,-144.84:100
-20 1411174 . G GT . PASS FR=1.0;HP=1;NF=14;NR=18;PP=100.0;SC=TTCCAACAGTGACAAGGGTTT;TC=34;TR=32 GT:GL:GQ 1/1:-370.91,-42.86,-18.85:100
-20 1411544 . TG T . PASS FR=0.5;HP=4;NF=7;NR=2;PP=36.0;SC=ATTTATAAAATGTTTTTGTTG;TC=28;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-275.92,-257.59,-310.84:82
-20 1420200 . CT C . PASS FR=1.0;HP=2;NF=13;NR=7;PP=100.0;SC=AAGATGGAACCTTAAGTTCAA;TC=24;TR=20 GT:GL:GQ 1/1:-229.24,-45.08,-29.19:100
-20 1421627 . GC G . PASS FR=1.0;HP=4;NF=12;NR=6;PP=100.0;SC=GGAGCCCAACGCCCATTTAAA;TC=24;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-219.35,-32.03,-15.65:100
-20 1428402 . A ATCTAT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=3;PP=100.0;SC=AATAGCTGATATCAGTTAAGG;TC=30;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-414.87,-348.43,-419.1:100
-20 1428454 . TC T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=11;NR=7;PP=100.0;SC=TTACACCGACTCTGTGCAGGT;TC=37;TR=18 GT:GL:GQ 0/1:-456.05,-415.06,-465.1:100
-20 1448428 . AC A . PASS FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=6;PP=100.0;SC=ACGGTAAACAACCTTCCCGCG;TC=21;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-289.43,-190.83,-179.1:98
-20 1450561 . A AAATAAT . PASS FR=1.0;HP=8;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=CTGTCTCAAAAAAAAATAATA;TC=23;TR=10 GT:GL:GQ 1/1:-324.02,-170.06,-160.02:94
-20 1454025 . GCACACACGCA G . PASS FR=1.0;HP=1;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=ACGCACACATGCACACACGCA;TC=23;TR=8 GT:GL:GQ 1/1:-298.98,-49.31,-43.52:72
-20 1455718 . AC A . PASS FR=0.5;HP=8;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=TGGTGGTAGCACCCCCCCAGG;TC=26;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-122.23,-68.33,-113.23:100
-20 1466298 . C CCA . PASS FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=CACACACACACCACACACACA;TC=25;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-174.97,-31.68,-40.82:42
-20 1470727 . TG T . PASS FR=1.0;HP=4;NF=9;NR=10;PP=100.0;SC=CAACAATCATTGGGGAATATT;TC=24;TR=19 GT:GL:GQ 1/1:-243.08,-66.7,-50.7:100
-20 1473489 . ATAATT A . PASS FR=0.5;HP=2;NF=13;NR=9;PP=100.0;SC=TTACTTACAAATAATTTTATT;TC=35;TR=22 GT:GL:GQ 0/1:-297.03,-26.79,-121.41:100
-20 1475430 . C CTCT . PASS FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=7;PP=100.0;SC=CTCATTTCTTCTCTTTTCATT;TC=31;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-179.5,-26.21,-143.42:100
-20 1477952 . AGTCTACACGT A . PASS FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=TTGTCTTTTCAGTCTACACGT;TC=26;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-132.31,-83.49,-272.8:100
-20 1485444 . TGAGAGAGA T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAGAGA;TC=17;TR=3 GT:GL:GQ 1/0:-294.27,-239.82,-244.87:100
-20 1498426 . G GA . PASS FR=1.0;HP=6;NF=18;NR=13;PP=100.0;SC=TACAACGGAAGAAAAGCCTAA;TC=33;TR=31 GT:GL:GQ 1/1:-335.62,-79.86,-57.15:100
-20 1499276 . TGAGA T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=2;PP=100.0;SC=TCAAAGTGAATGAGAGAGAGG;TC=23;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-190.39,-128.87,-245.46:100
-20 1500650 . A AG . PASS FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=8;PP=100.0;SC=AAGGAGCAGCAGTTCTGAGAG;TC=19;TR=17 GT:GL:GQ 1/1:-187.24,-32.97,-19.25:100
-20 1510246 . CA C . PASS FR=1.0;HP=10;NF=15;NR=6;PP=100.0;SC=AACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;TC=29;TR=21 GT:GL:GQ 1/1:-113.89,-25.37,-8.27:100
-20 1510966 . C CTA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=3;PP=100.0;SC=TTTTATCTCTCTGTGTCATTT;TC=21;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-215.34,-14.55,0.0:100
-20 1512623 . TTGTC T . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=7;PP=100.0;SC=ACTCCATAGATTGTCTGGGTA;TC=27;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-204.17,-64.36,-220.46:100
-20 1516154 . A AAG . PASS FR=0.5;HP=1;NF=9;NR=1;PP=100.0;SC=GTTTTATAAGAAGAGAGAGAG;TC=28;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-197.81,-103.51,-159.44:100
-20 1524117 . G GTGA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=14;PP=100.0;SC=TGGGATCAGGGTATTCCCTTC;TC=27;TR=26 GT:GL:GQ 1/1:-368.49,-35.51,-15.43:100
-20 1525024 . CT C . PASS FR=0.5;HP=7;NF=3;NR=3;PP=96.0;SC=CCTTCTTTGTCTTTTTTGATC;TC=18;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-53.12,-20.94,-98.55:100
-20 1525853 . G GT . PASS FR=0.5;HP=5;NF=7;NR=4;PP=100.0;SC=CCTGAAGTGTGTTTTCCAACT;TC=29;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-133.05,-52.13,-148.67:100
-20 1597255 . TG T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=13;NR=3;PP=100.0;SC=GTAAAAGTACTGGAAGAAAAG;TC=39;TR=16 GT:GL:GQ 0/1:-269.31,-182.14,-334.79:100
-20 1627288 . ATTTGT A . PASS FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=2;PP=100.0;SC=ACTTTTTTTCATTTGTTTTGT;TC=20;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-133.15,-70.66,-175.26:100
-20 1629280 . T TAATAAAATAA . PASS FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=ACTTAAAGTATAATAAAATAA;TC=18;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-155.63,-27.66,-95.67:100
-20 1648829 . CTTTCTTTTTCTTTTCT C . PASS FR=0.5;HP=6;NF=1;NR=1;PP=74.0;SC=TTCTTTCTTTCTTTCTTTTTC;TC=20;TR=2 GT:GL:GQ 0/1:-191.4,-160.88,-232.59:100
-20 1653387 . T TTTG . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=7;PP=100.0;SC=CGGCCAATCATTTGTTGTTGT;TC=25;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-189.9,-54.75,-106.65:100
-20 1656519 . GT G . PASS FR=0.5;HP=9;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=GAGCTGCACTGTTTTTTTTCT;TC=20;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-62.34,-19.97,-47.7:100
-20 1658890 . ACT A . PASS FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=CATGTGATACACTGTGGGCCC;TC=27;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-198.65,-163.08,-324.51:100
-20 1660493 . AT A . PASS FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=5;PP=100.0;SC=CATTTGGGAGATGCTATTACC;TC=31;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-160.86,-59.8,-177.36:100
-20 1661355 . TG T . PASS FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=GAAAAACACATGATTATCCAT;TC=34;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-171.31,-99.84,-269.81:100
-20 1661478 . G GT . PASS FR=0.5;HP=9;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=ATACTTTCTTGTTTTTTTGGC;TC=35;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-150.06,-61.16,-108.32:100
-20 1661816 . C CA . PASS FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=6;PP=100.0;SC=AATTTGCAATCATACAGAAAG;TC=24;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-96.53,-29.07,-136.56:100
-20 1662592 . GATATAACTA G . PASS FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=TATGGATATGGATATAACTAA;TC=23;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-238.09,-62.84,-220.35:100
-20 1665050 . A ATG . PASS FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=6;PP=100.0;SC=ATACACACATATATATATGTA;TC=34;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-151.91,-67.61,-244.28:100
-20 1667770 . TG T . PASS FR=0.5;HP=6;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=AGGGTTATGATGGGGGGAGAA;TC=29;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-75.51,-17.52,-115.09:100
-20 1674714 . A AT . PASS FR=1.0;HP=6;NF=12;NR=9;PP=100.0;SC=AAGGAGAATCATTTTTTCTTA;TC=26;TR=21 GT:GL:GQ 1/1:-198.16,-29.36,-11.98:100
-20 1679689 . TACACAC TACACACACAC,T . PASS FR=0.5,0.5;HP=3;NF=2,1;NR=0,1;PP=100.0,100.0;SC=TTAGATGCCCTACACACACAC;TC=23;TR=2,2 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 1680048 . G GA . PASS FR=0.5;HP=9;NF=4;NR=9;PP=100.0;SC=GAAAACAACAGAAAAAAAACT;TC=30;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-157.3,-90.19,-130.66:100
-20 1680109 . GA G . PASS FR=0.5;HP=4;NF=9;NR=8;PP=100.0;SC=AACAGCAAGAGAAATTATAAA;TC=32;TR=17 GT:GL:GQ 0/1:-210.03,-97.05,-217.17:100
-20 1682621 . A AT . PASS FR=1.0;HP=3;NF=18;NR=11;PP=100.0;SC=AATATATCATATTACACAGTG;TC=31;TR=29 GT:GL:GQ 1/1:-304.45,-32.07,-10.59:100
-20 1683112 . T TC . PASS FR=1.0;HP=2;NF=6;NR=11;PP=100.0;SC=CAAACCCTCTTCCTATACCAC;TC=23;TR=17 GT:GL:GQ 1/1:-265.19,-181.47,-172.55:74
-20 1683153 . CA C . PASS FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=7;PP=100.0;SC=GCAGCAGCTGCAAGAAGTCTC;TC=22;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-291.99,-237.27,-279.09:100
-20 1683250 . ATAGCTCTACCAGT A . PASS FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=AGTTCGAATCATAGCTCTACC;TC=22;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-267.9,-88.45,-154.18:100
-20 1683813 . C CT . PASS FR=0.5;HP=6;NF=12;NR=13;PP=100.0;SC=AAGAGAATGTCTTTTTAAAAT;TC=53;TR=25 GT:GL:GQ 0/1:-327.36,-122.23,-224.07:100
-20 1683959 . C CA . PASS FR=0.5;HP=8;NF=4;NR=9;PP=100.0;SC=TCAACAATGACAAAAAAAGCA;TC=24;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-130.55,-27.62,-42.34:66
-20 1684576 . A AATGTATAATAC . PASS FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=4;PP=96.0;SC=ATACTGTTTAAATATTTCCTG;TC=24;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-370.23,-353.25,-494.05:100
-20 1688002 . AAAAC A . PASS FR=1.0;HP=3;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=ACTCCCTCTCAAAACAAACAA;TC=22;TR=10 GT:GL:GQ 1/1:-132.2,-18.69,-9.78:74
-20 1690549 . CCT C . PASS FR=0.5;HP=3;NF=6;NR=6;PP=100.0;SC=GAAATCTTCCCCTGTCTGTGA;TC=32;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-184.81,-148.16,-332.53:100
-20 1694183 . CT C . PASS FR=0.5;HP=3;NF=8;NR=5;PP=100.0;SC=TATACAAAGACTTTATAACCA;TC=29;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-144.04,-44.56,-141.78:100
-20 1699510 . T TCCCA . PASS FR=0.5;HP=3;NF=10;NR=2;PP=100.0;SC=AATGTCTCATTCCCACATCCT;TC=19;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-164.23,-17.54,-74.37:100
-20 1701571 . TTAAAATAAAA T . PASS FR=0.5;HP=4;NF=5;NR=2;PP=100.0;SC=CATCTCAAAATTAAAATAAAA;TC=21;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-177.13,-95.66,-194.53:100
-20 1716144 . A AGTGT . PASS FR=0.5;HP=8;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=GGTTTTTTTTAGTGTGTGTGT;TC=23;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-151.21,-52.44,-109.8:100
-20 1719870 . TG T . PASS FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=11;PP=100.0;SC=ATCAAACCTCTGTGGGAGAGA;TC=27;TR=14 GT:GL:GQ 0/1:-146.54,-22.92,-111.48:100
-20 1721789 . GT G . PASS FR=0.5;HP=9;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=GCACTTGGGAGTTTTTTTTTC;TC=23;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-60.27,-22.43,-60.17:100
-20 1722316 . CCTTT C . PASS FR=1.0;HP=2;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=TTTCTCTCTTCCTTTCTTTCT;TC=7;TR=3 GT:GL:GQ 1/1:-85.7,-30.24,-25.46:57
-20 1727042 . T TA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=8;PP=100.0;SC=AATTAAATTATATAGAGGAAG;TC=20;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-223.19,-104.73,-92.26:100
-20 1728298 . G GT . PASS FR=1.0;HP=4;NF=11;NR=14;PP=100.0;SC=AAGAACAGAGGTTTTAAGCAT;TC=28;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-297.24,-94.99,-75.97:100
-20 1730788 . T TGATA . PASS FR=1.0;HP=3;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=AGATGATAAATGATAGATAGA;TC=36;TR=9 GT:GL:GQ 1/1:-190.89,-23.51,-13.12:87
-20 1731625 . CA C . PASS FR=1.0;HP=9;NF=5;NR=8;PP=100.0;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAG;TC=23;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-93.68,-29.69,-18.4:95
-20 1734082 . AAAAAT A . PASS FR=0.5;HP=4;NF=6;NR=3;PP=100.0;SC=CAATAGCTATAAAAATAAAAT;TC=38;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-124.98,-23.78,-220.83:100
-20 1738324 . T TC . PASS FR=1.0;HP=3;NF=7;NR=10;PP=100.0;SC=ACACTCCTTTTCCTTCATGAT;TC=22;TR=17 GT:GL:GQ 1/1:-213.69,-47.59,-33.85:100
-20 1738519 . A AG . PASS FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=11;PP=100.0;SC=CTGTCAAACTAGCCTCTGGCT;TC=29;TR=24 GT:GL:GQ 1/1:-269.52,-42.45,-23.17:100
-20 1741051 . T TAA . PASS FR=1.0;HP=1;NF=12;NR=12;PP=100.0;SC=TAAATATATATGACTATTTTT;TC=35;TR=24 GT:GL:GQ 1/1:-395.96,-52.09,-26.1:100
-20 1745352 . A ACAATAATCACATCAAAGAT . PASS FR=1.0;HP=2;NF=4;NR=8;PP=100.0;SC=CAAGACCATTACACTAATCAC;TC=17;TR=12 GT:GL:GQ 1/1:-425.27,-43.37,-23.58:100
-20 1746606 . GTA G . PASS FR=1.0;HP=2;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=ATATATATGTGTATATATATA;TC=9;TR=5 GT:GL:GQ 1/1:-98.72,-49.48,-45.34:50
-20 1768362 . G GAA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=14;PP=100.0;SC=TAGAGTGATGGAAGAGACTGG;TC=27;TR=21 GT:GL:GQ 1/1:-269.69,-41.32,-23.11:100
-20 1778684 . A AGTGCTT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=1;PP=83.0;SC=ATTGCCCTCCATTGGAGGCTG;TC=14;TR=2 GT:GL:GQ 1/0:-256.33,-220.54,-244.27:69
-20 1833292 . TA T . PASS FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=ATATTATGTATAATCTCAATT;TC=25;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-147.42,-89.75,-210.06:100
-20 1848829 . CTTTTCT C . PASS FR=1.0;HP=8;NF=6;NR=15;PP=100.0;SC=CTTTTCTTTTCTTTTCTTTTC;TC=25;TR=21 GT:GL:GQ 1/1:-409.42,-172.01,-156.56:100
-20 1848853 . CTT C . PASS FR=0.5;HP=4;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=CTTTCTTTCTCTTTCTTTCTT;TC=26;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-469.4,-397.68,-416.1:83
-20 1848877 . C CTT . PASS FR=0.9999;HP=4;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=TTCTTTCTTTCTCTTTCTTTC;TC=26;TR=3 GT:GL:GQ 1/1:-373.17,-284.63,-280.27:37
-20 1852149 . CCA C . PASS FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=CACCCCCTCTCCACACACACA;TC=23;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-139.51,-90.17,-161.53:100
-20 1855569 . AACACAC A . PASS FR=1.0;HP=1;NF=7;NR=3;PP=100.0;SC=GTCACTCTACAACACACACAC;TC=14;TR=10 GT:GL:GQ 1/1:-159.46,-18.21,-11.49:84
-20 1857852 . TC T . PASS FR=1.0;HP=6;NF=4;NR=19;PP=100.0;SC=CCCGTGTCCATCCCCCCTGTA;TC=58;TR=23 GT:GL:GQ 1/1:-667.45,-637.23,-632.11:63
-20 1857976 . G GT . PASS FR=1.0;HP=5;NF=12;NR=1;PP=100.0;SC=GCTTTGTTTTGTCAGTTGTTT;TC=22;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-196.6,-28.45,-14.03:100
-20 1872437 . AT A . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=TCCCTGGCTAATTCCCCCCAC;TC=23;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-111.11,-55.77,-134.66:100
-20 1890990 . CTT C . PASS FR=1.0;HP=5;NF=11;NR=12;PP=100.0;SC=TGTTTCATTACTTTTTAACTT;TC=24;TR=23 GT:GL:GQ 1/1:-245.45,-38.39,-20.54:100
-20 1895466 . T TATAG . PASS FR=1.0;HP=1;NF=11;NR=5;PP=100.0;SC=AGATTAGAATTAGCCCAGCTC;TC=24;TR=16 GT:GL:GQ 1/1:-500.31,-454.72,-448.18:79
-20 1895484 . ACT A . PASS FR=1.0;HP=1;NF=14;NR=4;PP=52.0;SC=CTCAGATGTGACTCTTCCAGA;TC=23;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-454.69,-436.37,-433.13:53
-20 1912065 . AC A . PASS FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=8;PP=100.0;SC=TGCCTTCATCACTGTTCCCAT;TC=25;TR=15 GT:GL:GQ 0/1:-166.95,-40.53,-113.76:100
-20 1930288 . TAAG T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=9;NR=4;PP=100.0;SC=TATAAGTTGTTAAGAAGAAAA;TC=31;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-196.67,-58.02,-140.92:100
-20 1940722 . GTT G . PASS FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=AAAAACCCAGGTTATATATAC;TC=25;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-178.3,-32.72,-93.72:100
-20 1940980 . G GA . PASS FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=AACTACTCAGGGGCTGAGATG;TC=20;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-91.81,-43.36,-126.02:100
-20 1941170 . A AC . PASS FR=0.5;HP=1;NF=10;NR=2;PP=100.0;SC=ATACCTGTATAGAAAAAAAGT;TC=31;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-250.35,-208.27,-291.77:100
-20 1943171 . T TG . PASS FR=0.5;HP=7;NF=1;NR=1;PP=56.0;SC=AGGGGAAGCCTGGGGGGGTTG;TC=19;TR=2 GT:GL:GQ 0/1:-65.38,-41.58,-85.08:100
-20 1949783 . C CT . PASS FR=0.5;HP=10;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=GTGCTGAGCCCTTTTTTTTTT;TC=26;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-82.34,-46.95,-63.27:73
-20 1959266 . A ATG . PASS FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=CAACCTGAATATGTGTGTGTG;TC=24;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-140.42,-42.47,-66.02:100
-20 1967894 . GATGA G . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=TTGAGTGATTGATGAATGAAT;TC=24;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-113.7,-41.87,-83.28:100
-20 1977448 . A ACACACACACG . PASS FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=ACACACACACATAGAAGGCCA;TC=32;TR=2 GT:GL:GQ 0/1:-253.96,-71.96,-163.76:100
-20 1996777 . CT C . PASS FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=GTGTTTTAGGCTGTTATTTCA;TC=21;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-127.06,-33.79,-125.68:100
-20 1997708 . CAT C . PASS FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=CACACACACACATACAAAATA;TC=31;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-145.15,-85.85,-245.36:100
-20 2004765 . T TG . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=2;PP=76.0;SC=AGGATTTTTCTATCAGTCCAC;TC=12;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-54.31,-25.7,-84.4:100
-20 2034931 . G GTTC . PASS FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=AGATAGGTAAGTTCTTCCCCA;TC=24;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-162.21,-52.77,-146.87:100
-20 2035677 . AACACAC AAC,A . PASS FR=0.5,0.5;HP=2;NF=2,3;NR=0,2;PP=39.0,100.0;SC=TTTTATAATAAACACACACAC;TC=29;TR=2,5 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:88
-20 2050099 . AATTG A . PASS FR=0.5;HP=2;NF=10;NR=5;PP=100.0;SC=TCTTATTCTTAATTGATCTAA;TC=35;TR=15 GT:GL:GQ 0/1:-259.54,-91.86,-224.89:100
-20 2052246 . AC A . PASS FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=GGTCCCAGCTACTCAGGAGGC;TC=19;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-113.96,-44.77,-115.57:100
-20 2053863 . C CA . PASS FR=0.5;HP=9;NF=3;NR=4;PP=96.0;SC=ACTAAAAATACAAAAAAAATA;TC=16;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-46.07,-13.04,-34.97:98
-20 2054845 . AAAGAGGAAAAAG A . PASS FR=0.5;HP=4;NF=7;NR=1;PP=100.0;SC=AAAAGAGGAAAAAGAGGAAAA;TC=27;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-251.05,-86.54,-294.87:100
-20 2055452 . AAAGG A . PASS FR=0.5;HP=4;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=AAGAAAAGAAAAAGGAAGGAA;TC=27;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-227.92,-152.39,-281.38:100
-20 2077127 . AAC A . PASS FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=3;PP=97.0;SC=TCTCTACTAAAACACACACAC;TC=17;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-57.31,-24.65,-94.33:100
-20 2078747 . CCT C . PASS FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=AGAAAATTCCCCTGTGGCCCT;TC=15;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-78.54,-32.73,-103.05:100
-20 2120509 . AAAGGT A . PASS FR=0.5;HP=2;NF=8;NR=1;PP=100.0;SC=CTGAAATGAGAAAGGTAAGGA;TC=19;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-189.27,-90.48,-174.84:100
-20 2122413 . CT C . PASS FR=0.5;HP=4;NF=3;NR=8;PP=100.0;SC=GTAACCTACCCTTTTCCACCT;TC=23;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-132.75,-34.8,-69.03:100
-20 2126052 . T TCTATGTGA . PASS FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=CATTTCCGTTTCTATGTGACC;TC=22;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-179.74,-76.1,-178.95:100
-20 2131707 . T TGG . PASS FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=1;PP=100.0;SC=CCCTGTTGCCTGACCTGAGCC;TC=20;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-145.56,-92.76,-163.87:100
-20 2153043 . C CTTTATTTA . PASS FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=GGTGACATCACTTTATTTATT;TC=21;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-97.11,-28.78,-48.32:87
-20 2155932 . C CAT . PASS FR=0.5;HP=7;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=AATTAAAAAACATATATATAT;TC=32;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-176.17,-66.01,-150.43:100
-20 2160585 . AT A . PASS FR=0.5;HP=7;NF=9;NR=11;PP=100.0;SC=GTTTTTAAATATTTTTTAATT;TC=41;TR=20 GT:GL:GQ 0/1:-237.9,-137.73,-264.06:100
-20 2162113 . A ATT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=TATCAGGAATAATTTTTTTTT;TC=25;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-145.37,-128.61,-213.61:100
-20 2165761 . GTTAT G . PASS FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=CTAATAACCTGTTATTTATTT;TC=28;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-79.63,-28.99,-73.78:100
-20 2171122 . CAAACA C . PASS FR=0.5;HP=4;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=AACAAACAGACAAACAAAACA;TC=18;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-113.12,-57.95,-91.54:100
-20 2171346 . TA T . PASS FR=0.5;HP=8;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=AATTTTTTTTTAAAATCCTTA;TC=20;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-174.43,-122.88,-194.49:100
-20 2171402 . T TA . PASS FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=1;PP=92.0;SC=TGATTGATCCTAACTTAATGA;TC=23;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-112.12,-79.99,-224.63:100
-20 2198337 . AAG A . PASS FR=0.5;HP=2;NF=17;NR=3;PP=100.0;SC=CAACCAAAGAAAGAATGGGAG;TC=38;TR=20 GT:GL:GQ 0/1:-234.35,-51.22,-161.95:100
-20 2199055 . G GCCACACACTTCTAAA . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=5;PP=100.0;SC=AGGGGGAAGTGCCATCAGATG;TC=20;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-318.25,-129.11,-238.35:100
-20 2199168 . T TG . PASS FR=0.5;HP=9;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=TGAGATTTGGTGGGGGGGACA;TC=37;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-144.44,-70.03,-129.92:100
-20 2209336 . A AGTG . PASS FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=GCTGGAGTGCAGTGGTACAAT;TC=18;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-105.48,-46.83,-99.81:100
-20 2215492 . T TA . PASS FR=1.0;HP=1;NF=17;NR=16;PP=100.0;SC=TGGATGAACGTATTTATTTAA;TC=37;TR=33 GT:GL:GQ 1/1:-589.49,-315.53,-293.02:100
-20 2215506 . G GT . PASS FR=1.0;HP=3;NF=18;NR=13;PP=100.0;SC=TATTTAACCAGTTTCTCTTGA;TC=36;TR=31 GT:GL:GQ 1/1:-602.79,-346.63,-325.98:100
-20 2216792 . CAG C . PASS FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=TGCGTTCATGCAGTTTATGGG;TC=25;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-181.42,-37.01,-108.03:100
-20 2217535 . CCT C . PASS FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=6;PP=100.0;SC=CATTGCATCACCTGCCTCTGA;TC=32;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-224.94,-75.19,-157.78:100
-20 2218702 . CA C . PASS FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=AATCACGACTCATTGTAGCCT;TC=18;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-111.7,-55.95,-90.25:100
-20 2221607 . TTTTCTTTCTTTCTTTTTCC T . PASS FR=0.5;HP=4;NF=4;NR=2;PP=100.0;SC=AAAGTTTTCTTTTTCTTTCTT;TC=29;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-196.61,-29.28,-142.76:100
-20 2241427 . AAAAC A . PASS FR=1.0;HP=4;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=CTTGTCTCTAAAAACAAACAA;TC=19;TR=7 GT:GL:GQ 1/1:-166.73,-37.97,-27.83:84
-20 2263098 . TG T . PASS FR=1.0;HP=4;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=TGACGGATGGTGGAGTGAGAA;TC=12;TR=10 GT:GL:GQ 1/1:-115.83,-17.15,-8.29:71
-20 2278675 . A ATGAATGGCACT . PASS FR=1.0;HP=4;NF=8;NR=9;PP=100.0;SC=ACTCTGAAAAATGGTCACAGA;TC=18;TR=17 GT:GL:GQ 1/1:-567.99,-218.0,-199.44:100
-20 2280081 . C CT . PASS FR=1.0;HP=3;NF=15;NR=9;PP=100.0;SC=TAACTTCATGCGGCTCCACCC;TC=30;TR=24 GT:GL:GQ 1/1:-287.69,-60.5,-41.43:100
-20 2280751 . TA T . PASS FR=1.0;HP=10;NF=11;NR=3;PP=100.0;SC=AGACTCCATTTAAAAAAAAAA;TC=22;TR=14 GT:GL:GQ 1/1:-139.24,-88.42,-77.92:88
-20 2280882 . A AAAAG . PASS FR=1.0;HP=6;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=AAGAAAGAAAAAAAGAAAGAA;TC=21;TR=4 GT:GL:GQ 1/1:-160.24,-78.2,-70.5:63
-20 2285898 . AGTCACTG A . PASS FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=3;PP=100.0;SC=CCAAGTCTCTAGTCACTGGTT;TC=19;TR=12 GT:GL:GQ 1/1:-272.68,-30.42,-16.26:99
-20 2287002 . TAAG T . PASS FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=8;PP=100.0;SC=GAAAAATCTCTAAGAAGGCTC;TC=24;TR=20 GT:GL:GQ 1/1:-245.61,-20.38,-4.14:100
-20 2294297 . A ACT . PASS FR=1.0;HP=2;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=AATCACACACACTCTCTCTCT;TC=24;TR=8 GT:GL:GQ 1/1:-199.54,-41.84,-28.04:100
-20 2297084 . AT A . PASS FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=7;PP=100.0;SC=GGTGGCACGCATTAACACCAG;TC=18;TR=17 GT:GL:GQ 1/1:-184.14,-27.34,-14.78:100
-20 2297605 . CT C . PASS FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=CAATCATGGCCTTTGGCTTCC;TC=24;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-137.24,-29.13,-84.17:100
-20 2298589 . C CAT,T . PASS FR=0.5,0.5;HP=1;NF=5,2;NR=2,3;PP=100.0,100.0;SC=ATATATATATCATATATATAT;TC=23;TR=7,5 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 2316853 . G GC . PASS FR=1.0;HP=4;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=TCACCCTGTAGCCCCTGTGCC;TC=15;TR=9 GT:GL:GQ 1/1:-147.72,-38.92,-28.94:83
-20 2318317 . GATCACACC G . PASS FR=1.0;HP=2;NF=8;NR=8;PP=100.0;SC=AGTGAGCCGAGATCACACCAC;TC=22;TR=16 GT:GL:GQ 1/1:-356.42,-104.52,-90.96:100
-20 2318716 . AG A . PASS FR=1.0;HP=3;NF=13;NR=4;PP=100.0;SC=CACTCAGAGCAGGGCACCGAT;TC=26;TR=17 GT:GL:GQ 1/1:-256.21,-181.8,-170.54:94
-20 2323655 . A AT . PASS FR=1.0;HP=8;NF=11;NR=9;PP=100.0;SC=AGGAAAAAAAAACACTGATGT;TC=31;TR=20 GT:GL:GQ 1/1:-290.56,-28.0,-5.91:100
-20 2326944 . G GA . PASS FR=1.0;HP=5;NF=6;NR=12;PP=100.0;SC=AGATACAGAGGAAAAATGAAG;TC=25;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-204.47,-32.24,-15.14:100
-20 2329825 . T TC . PASS FR=1.0;HP=1;NF=16;NR=4;PP=100.0;SC=ATATGGGTTGTCTTTGAGACT;TC=22;TR=20 GT:GL:GQ 1/1:-212.37,-32.28,-17.55:100
-20 2334719 . CTAT C . PASS FR=1.0;HP=3;NF=14;NR=16;PP=100.0;SC=TTCCCAGGTTCTATTATGTAG;TC=36;TR=30 GT:GL:GQ 1/1:-368.57,-33.34,-9.9:100
-20 2335944 . C CTG . PASS FR=1.0;HP=4;NF=10;NR=19;PP=100.0;SC=GCTGAGAAAACTATATCCAAA;TC=34;TR=29 GT:GL:GQ 1/1:-370.96,-31.85,-8.29:100
-20 2340299 . TTGTC T . PASS FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=15;PP=100.0;SC=ATCCTGTAGGTTGTCTGTTTA;TC=27;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-327.39,-42.17,-22.8:100
-20 2342117 . T TG . PASS FR=1.0;HP=5;NF=14;NR=14;PP=100.0;SC=TGCTTATTTTTTCCACTTAAT;TC=32;TR=28 GT:GL:GQ 1/1:-450.6,-326.69,-308.08:100
-20 2344369 . TAAG T . PASS FR=1.0;HP=2;NF=13;NR=10;PP=100.0;SC=TGAGAGGTGGTAAGAAGAAGA;TC=36;TR=23 GT:GL:GQ 1/1:-351.7,-76.99,-56.29:100
-20 2344451 . G GAGGA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=3;PP=100.0;SC=ACACCCAACAGAGGAAGGTTA;TC=20;TR=15 GT:GL:GQ 1/1:-372.02,-158.89,-145.61:100
-20 2344539 . T TTTTGTTTG . PASS FR=1.0;HP=3;NF=8;NR=4;PP=100.0;SC=ACTACCCCAGTTTTGTTTGTT;TC=23;TR=12 GT:GL:GQ 1/1:-243.77,-36.7,-24.92:99
-20 2345269 . TCCTGGC T . PASS FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=13;PP=100.0;SC=ATCGAGACCATCCTGGCTAAC;TC=21;TR=20 GT:GL:GQ 1/1:-260.12,-24.22,-9.67:100
-20 2346660 . T TAATAAATAAATAAATA . PASS FR=1.0;HP=3;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=CAATTCCTTATAATAAATAAA;TC=13;TR=7 GT:GL:GQ 1/1:-305.93,-18.69,-7.6:93
-20 2352930 . AC A . PASS FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=8;PP=100.0;SC=TTTCAGGCCTACCTCTCAAGC;TC=21;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-216.23,-90.38,-78.46:100
-20 2362643 . C CTG . PASS FR=1.0;HP=3;NF=11;NR=8;PP=100.0;SC=AAGAACTTGTCTTAGATGCTG;TC=21;TR=19 GT:GL:GQ 1/1:-259.19,-87.0,-72.75:100
-20 2379170 . TC T . PASS FR=0.5;HP=4;NF=1;NR=3;PP=99.0;SC=AGCTTGGGCTTCCCCACAATA;TC=23;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-84.89,-51.93,-137.5:100
-20 2401510 . ATGT A . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=CATTATATGGATGTACACAGT;TC=23;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-138.83,-80.65,-217.86:100
-20 2406090 . AACT A . PASS FR=0.5;HP=3;NF=8;NR=7;PP=100.0;SC=GTTGCCACAAAACTTCAATTT;TC=36;TR=15 GT:GL:GQ 0/1:-277.31,-158.31,-369.27:100
-20 2407722 . A AT . PASS FR=0.5;HP=9;NF=4;NR=11;PP=100.0;SC=AATTGCTATAATTTTTTTTTC;TC=38;TR=15 GT:GL:GQ 0/1:-112.13,-34.3,-69.71:100
-20 2409340 . C CAATA . PASS FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=CATAATAAATCAATCAATAAA;TC=22;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-189.45,-43.56,-132.72:100
-20 2409613 . G GCA . PASS FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=4;PP=57.0;SC=GGGATTATAGGCACAACACCA;TC=25;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-231.71,-206.44,-319.84:100
-20 2411731 . CAG C . PASS FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=2;PP=36.0;SC=GTGGATGAGCCAGAGAGAAGT;TC=13;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-55.56,-36.89,-120.4:84
-20 2414786 . G GA . PASS FR=1.0;HP=8;NF=8;NR=10;PP=100.0;SC=GAAGCTTTCAGAAAAAAACCC;TC=23;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-173.45,-78.53,-65.46:100
-20 2418166 . GTGTT G . PASS FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=CACCTGGCTAGTGTTTGTTTG;TC=21;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-134.79,-72.62,-117.78:100
-20 2425523 . A ATTTATTTTATTTTAT . PASS FR=0.5;HP=7;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=ATTTTATTTTATTTATTTTAT;TC=23;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-149.61,-12.23,-46.02:100
-20 2425934 . T TA . PASS FR=0.5;HP=8;NF=8;NR=4;PP=67.0;SC=TTAATCAATTTAAAAAAAATG;TC=25;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-160.28,-133.72,-162.95:100
-20 2430943 . ATGTG A . PASS FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=GTGCGTGTGCATGTGTGTGTG;TC=29;TR=2 GT:GL:GQ 0/1:-164.1,-78.49,-99.2:92
-20 2433931 . TC T . PASS FR=0.5;HP=5;NF=1;NR=1;PP=26.0;SC=CCCTGGAAGCTCCCCTTTGTG;TC=10;TR=2 GT:GL:GQ 0/1:-34.79,-18.58,-53.81:73
-20 2436455 . A AAAAAAG,AAAAAG . PASS FR=0.5,0.5;HP=9;NF=3,3;NR=1,4;PP=50.0,100.0;SC=CTACCAAAAAAAAAAGAAAAG;TC=25;TR=4,7 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 2436835 . A AC . PASS FR=0.5;HP=1;NF=7;NR=8;PP=100.0;SC=ACAATGATGTACATTTTTCAG;TC=37;TR=15 GT:GL:GQ 0/1:-177.52,-36.56,-198.23:100
-20 2448573 . CCT C . PASS FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=5;PP=100.0;SC=CCCATGCCACCCTGTTTTAGC;TC=34;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-159.22,-114.6,-320.68:100
-20 2450954 . CA C . PASS FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=CAAACTTCCGCAAGTCTGAGC;TC=22;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-106.22,-51.15,-126.38:100
-20 2452700 . TAAAAAAGAA T . PASS FR=0.5;HP=6;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=TTTCTTGGATTAAAAAAGAAA;TC=32;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-216.2,-29.76,-153.35:100
-20 2458350 . G GA . PASS FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=CAAGGTGGGAGAATTGCTTGA;TC=27;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-156.97,-38.22,-122.55:100
-20 2477736 . A AT . PASS FR=0.5;HP=10;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=AAAAAAAAAAATTTTACCATC;TC=23;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-89.51,-39.15,-127.81:100
-20 2498012 . GTA G . PASS FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=GTATATGTGTGTATATATATA;TC=22;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-140.02,-17.32,-103.73:100
-20 2516178 . GA G . PASS FR=0.5;HP=8;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=GTTTAATTGGGAAAAAAAATA;TC=17;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-52.67,-14.95,-45.28:100
-20 2520604 . T TAGCA . PASS FR=0.5;HP=4;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=CTCCCGCAAATAGCACACAAG;TC=20;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-194.0,-75.16,-105.67:100
-20 2522684 . G GA . PASS FR=0.5;HP=7;NF=5;NR=6;PP=83.0;SC=TTTCTTATTTGAAAAAAACTT;TC=31;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-153.71,-123.52,-187.08:100
-20 2523586 . T TA . PASS FR=1.0;HP=4;NF=11;NR=6;PP=100.0;SC=TTTTTCTTTTTAAAACAAAAT;TC=23;TR=17 GT:GL:GQ 1/1:-179.22,-18.0,-3.45:100
-20 2526468 . GAAGA G . PASS FR=0.5001;HP=2;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=AGAGGAAGAGGAAGAAAGAAA;TC=25;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-210.76,-128.72,-136.62:37
-20 2526552 . A AAG . PASS FR=0.5;HP=6;NF=5;NR=8;PP=100.0;SC=GAAAGAAAGAAAAAAAGAAAG;TC=30;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-215.19,-78.8,-144.35:100
-20 2527129 . G GTTGGGCATAAGCTGTAGATC . PASS FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=AACCTGCAGAGTTGGGCATAA;TC=18;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-243.57,-136.91,-199.82:100
-20 2534184 . T TGTTTTGTGTGAC . PASS FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=9;PP=100.0;SC=GATACAGGTCTGTTTTTGTCT;TC=31;TR=14 GT:GL:GQ 0/1:-444.44,-61.75,-181.17:100
-20 2546156 . TGG T . PASS FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=12;PP=100.0;SC=CCCAAAGTGCTGGGATTACAG;TC=31;TR=16 GT:GL:GQ 0/1:-172.01,-63.37,-146.93:100
-20 2568176 . G GT . PASS FR=1.0;HP=10;NF=12;NR=9;PP=100.0;SC=ATTTGGGAATGTTTTTTTTTA;TC=27;TR=21 GT:GL:GQ 1/1:-116.08,-18.72,-6.68:100
-20 2577356 . A AAT . PASS FR=0.5;HP=6;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=ATCAGAAAAAAATATATATGT;TC=26;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-199.48,-88.19,-98.9:49
-20 2579040 . C CTTTATTTA . PASS FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=CTTGCCTCTACTTTATTTATT;TC=16;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-103.59,-10.59,-52.57:100
-20 2586119 . GGA G . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=1;PP=30.0;SC=GCATGTGCATGGAGAGAGAGA;TC=23;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-35.49,-18.23,-170.44:77
-20 2594696 . A AT . PASS FR=0.5;HP=8;NF=2;NR=7;PP=100.0;SC=TTTCTGTCACATTTTTTTTCG;TC=24;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-70.9,-30.05,-77.99:100
-20 2597210 . TAAAG T . PASS FR=0.5;HP=7;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=GAAAGGAAAATAAAGAAGGAG;TC=20;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-85.33,-27.89,-144.98:100
-20 2611781 . A ATATCT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=8;NR=8;PP=100.0;SC=ATTATAATTAATATAACAAAC;TC=31;TR=16 GT:GL:GQ 0/1:-408.96,-183.07,-309.58:100
-20 2613623 . T TTTG . PASS FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=CTTCCATGGGTTTGTTGTTGT;TC=18;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-165.53,-112.66,-139.53:100
-20 2613971 . TA T . PASS FR=0.5;HP=4;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=CTTGGACACATAAACAGCCCT;TC=27;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-121.36,-29.89,-140.29:100
-20 2614405 . T TGGGTAGG . PASS FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=2;PP=52.0;SC=ACTACAGAACTGGGTAGGGGA;TC=30;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-185.89,-156.26,-363.71:100
-20 2616002 . C CT . PASS FR=0.5;HP=4;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=ACCTCCACCTCCCCCTCTCAG;TC=22;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-182.46,-117.29,-171.16:100
-20 2617861 . C CCT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=5;PP=100.0;SC=ATGGTGAACCCGTCTCTACTA;TC=17;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-111.22,-36.32,-97.76:100
-20 2625967 . TGAG T . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=CTGAGTAGGCTGAGGAGGAGG;TC=15;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-133.1,-85.47,-137.74:100
-20 2627766 . TTTTATTTA T . PASS FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=1;PP=86.0;SC=ACTGAATTTATTTTATTTATT;TC=19;TR=2 GT:GL:GQ 0/1:-102.46,-70.95,-132.69:100
-20 2630436 . T TACC . PASS FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=5;PP=100.0;SC=ACATGCCAGGTACACCATTGT;TC=23;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-159.47,-31.83,-143.4:100
-20 2634285 . CTG C . PASS FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=15;PP=100.0;SC=CTTGTGGGCACTGTAGTGACA;TC=29;TR=18 GT:GL:GQ 0/1:-229.42,-26.07,-86.72:100
-20 2641823 . C CTG . PASS FR=0.5;HP=5;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=ATTGCATTTTCTGTGTGTGTG;TC=21;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-96.78,-48.19,-99.13:100
-20 2643833 . G GAAATGCAAT . PASS FR=0.5;HP=4;NF=9;NR=2;PP=100.0;SC=TGGTATTCCAGAAATGCAATG;TC=31;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-379.88,-109.48,-180.95:100
-20 2650007 . T TACACACACACACACACAC . PASS FR=1.0;HP=1;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=ACCCTTTTCTTACACACACAC;TC=19;TR=4 GT:GL:GQ 1/1:-231.82,-84.82,-75.66:76
-20 2650235 . C CT . PASS FR=1.0;HP=9;NF=12;NR=9;PP=100.0;SC=TTTATTGGGCCTTTTTTTTTG;TC=28;TR=21 GT:GL:GQ 1/1:-325.44,-296.08,-289.77:79
-20 2656886 . AT A . PASS FR=1.0;HP=6;NF=17;NR=6;PP=100.0;SC=ATAAATAATAATTTTTTAAAA;TC=29;TR=23 GT:GL:GQ 1/1:-339.94,-246.4,-231.12:100
-20 2663020 . G GGAA . PASS FR=1.0;HP=1;NF=8;NR=7;PP=100.0;SC=AAGAGGAAGAGGAAGAAGACA;TC=28;TR=15 GT:GL:GQ 1/1:-408.26,-206.61,-189.41:100
-20 2665268 . TA T . PASS FR=1.0;HP=8;NF=2;NR=1;PP=43.0;SC=TATGCAGCCATAAAAAAATGA;TC=4;TR=3 GT:GL:GQ 1/1:-20.74,-4.04,-1.38:43
-20 2665956 . AG A . PASS FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=5;PP=100.0;SC=CCCAGGCTATAGTGCAGTGGC;TC=16;TR=14 GT:GL:GQ 1/1:-156.94,-33.67,-23.62:84
-20 2666401 . TA T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=8;NR=7;PP=100.0;SC=ACTTTTCTATTAAGAAACGCA;TC=38;TR=15 GT:GL:GQ 0/1:-158.74,-28.32,-160.06:100
-20 2668149 . A ATG . PASS FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=ATATATATATATGTGTGTGTG;TC=17;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-54.4,-18.57,-68.0:100
-20 2671350 . GTA G . PASS FR=1.0;HP=2;NF=8;NR=5;PP=100.0;SC=ATATATATGTGTATATATATA;TC=23;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-348.62,-348.37,-348.16:60
-20 2676135 . C CAG . PASS FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=TGCTGGGATGCAGAGGGCTTC;TC=17;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-189.45,-108.27,-131.01:100
-20 2678198 . A AAAAG . PASS FR=1.0;HP=10;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=CTCAAAAAAAAAAAGAAAGAA;TC=16;TR=3 GT:GL:GQ 1/1:-113.89,-62.27,-58.08:51
-20 2691794 . AAAT A . PASS FR=1.0;HP=3;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=ACCCTGTCTAAAATAATAATA;TC=12;TR=6 GT:GL:GQ 1/1:-83.97,-10.76,-5.22:69
-20 2713483 . C CAG . PASS FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=1;PP=100.0;SC=TTTTTTGAGACGGAATTATAA;TC=28;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-114.91,-36.16,-205.08:100
-20 2717474 . A ACAAAGGTCTC . PASS FR=1.0;HP=2;NF=9;NR=5;PP=100.0;SC=AGTCATAAGGACAAAGGACCC;TC=17;TR=14 GT:GL:GQ 1/1:-343.26,-32.05,-17.5:94
-20 2724519 . AG A . PASS FR=0.5;HP=3;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=CCAGATATTTAGGGTGTCCAT;TC=28;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-149.48,-35.03,-149.61:100
-20 2734607 . C CCCCCTTGGTTTTGAAACTTT . PASS FR=1.0;HP=4;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=TCTGTGGGCACCCCCTTGGGC;TC=12;TR=6 GT:GL:GQ 1/1:-301.3,-108.37,-98.31:100
-20 2742852 . C CCAGCAATCCTCAGT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=5;PP=100.0;SC=CTCAATAGCACCTGAGGATGA;TC=16;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-233.59,-35.77,-130.91:100
-20 2766949 . C CT . PASS FR=1.0;HP=10;NF=5;NR=10;PP=100.0;SC=ACTTCATTCCCTTTTTTTTTT;TC=28;TR=15 GT:GL:GQ 1/1:-134.68,-37.76,-21.4:100
-20 2782855 . AC A . PASS FR=1.0;HP=4;NF=3;NR=8;PP=100.0;SC=AATCACTTGTACCCCGGGGGC;TC=25;TR=11 GT:GL:GQ 1/1:-262.64,-187.36,-174.92:100
-20 2789088 . AC A . PASS FR=1.0;HP=9;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=CAAAAAAAAAACCAAAAAACA;TC=13;TR=5 GT:GL:GQ 1/1:-119.81,-36.46,-27.82:89
-20 2796485 . C CCTTTT . PASS FR=0.5;HP=4;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=CATCAGGCCCCCTTTTCTCCT;TC=18;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-128.25,-42.55,-123.81:100
-20 2797764 . AG A . PASS FR=1.0;HP=3;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=CTGCCTTGGCAGGGCCCAGAC;TC=14;TR=5 GT:GL:GQ 1/1:-134.46,-67.08,-59.42:63
-20 2834884 . T TAC . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=ACCCCGTCTCTACACACACAC;TC=22;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-64.62,-28.32,-80.82:100
-20 2849974 . AT A . PASS FR=0.5;HP=10;NF=4;NR=6;PP=99.0;SC=TTGGTTTGCAATTTTTTTTTT;TC=36;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-66.95,-34.01,-107.66:100
-20 2850721 . ACT A . PASS FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=CCAGTGAAAGACTCTTGGGGT;TC=17;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-88.06,-17.99,-74.67:100
-20 2858849 . GT G . PASS FR=0.5;HP=8;NF=1;NR=5;PP=52.0;SC=GACAGCTGTAGTTTTTTTTAA;TC=15;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-33.96,-11.94,-50.39:98
-20 2867547 . AT A . PASS FR=0.5;HP=6;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=AAATAAAAAAATGTAGTATCT;TC=32;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-115.49,-28.1,-161.94:100
-20 2880787 . C CCT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=GAAAAATCTGCCTCCTTTTTT;TC=27;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-140.77,-68.5,-172.28:100
-20 2890657 . C CAT . PASS FR=0.5003;HP=1;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=TATCATATATCATATATAATC;TC=5;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-44.82,-3.47,-10.33:32
-20 2890805 . CAT C . PASS FR=0.5017;HP=1;NF=1;NR=6;PP=100.0;SC=TACTATACGTCATATATAATA;TC=9;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-87.98,-14.06,-19.03:24
-20 2894312 . CTTATT C . PASS FR=0.5;HP=4;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=GTGCTGTGTTCTTATTTTATC;TC=22;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-141.94,-29.98,-159.98:100
-20 2896142 . T TTATC . PASS FR=1.0;HP=2;NF=9;NR=10;PP=100.0;SC=TAAGAGTTCTTTATTCTGATA;TC=30;TR=19 GT:GL:GQ 1/1:-399.17,-94.52,-74.73:100
-20 2912364 . T TTG . PASS FR=0.5004;HP=1;NF=1;NR=1;PP=75.0;SC=GGGTCTTGGCTTGTGTGTGTG;TC=20;TR=2 GT:GL:GQ 0/1:-121.99,-92.59,-99.11:31
-20 2926228 . GGTGTGTGT G . PASS FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=9;PP=100.0;SC=ATAATTGGCAGGTGTGTGTGT;TC=27;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-233.62,-33.54,-77.33:100
-20 2937307 . AAAATAAAT A . PASS FR=0.5;HP=4;NF=3;NR=3;PP=100.0;SC=TCAGTAAATAAAAATAAATAA;TC=17;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-165.86,-12.93,-101.78:100
-20 2950624 . T TAATA,TAATAAATAAATA . PASS FR=0.5,0.5;HP=5;NF=5,2;NR=2,2;PP=100.0,100.0;SC=TCTAAATAAATAATAAATAAA;TC=24;TR=7,4 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 2966530 . CTTGTTTGT CTTGT,C . PASS FR=0.5,0.5;HP=2;NF=1,1;NR=2,1;PP=100.0,27.0;SC=CAGCTGTCTCCTTGTTTGTTT;TC=22;TR=3,2 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:80
-20 2973326 . T TTTAGGGTTTTTC . PASS FR=0.5;HP=4;NF=1;NR=5;PP=100.0;SC=CATATCCAAATATTACGATTC;TC=15;TR=6 GT:GL:GQ 0/0:-275.74,-159.4,-213.4:3
-20 2977781 . CATAT C . PASS FR=0.5;HP=5;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=TGTGAGAAAACATATGTGGGA;TC=26;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-131.98,-30.22,-206.04:100
-20 2979576 . T TTATTA . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=5;PP=100.0;SC=TATTTATAATTTATTATATAT;TC=21;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-148.89,-17.32,-97.42:100
-20 2982245 . CT C . PASS FR=0.5;HP=3;NF=8;NR=4;PP=100.0;SC=CTGTGGAAATCTTATGTGAAG;TC=27;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-126.56,-21.8,-132.46:100
-20 2982823 . CA C . PASS FR=1.0;HP=7;NF=10;NR=9;PP=100.0;SC=TTCCATCTGACAAAAAATTGG;TC=21;TR=19 GT:GL:GQ 1/1:-196.74,-95.2,-82.42:100
-20 2989926 . AT A . PASS FR=0.5;HP=10;NF=2;NR=5;PP=29.0;SC=GAGTTGTGTGATTTTTTTTTT;TC=36;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-66.0,-49.11,-118.97:76
-20 3005541 . TC T . PASS FR=0.5;HP=5;NF=7;NR=7;PP=100.0;SC=AGCAGTTTTTTCTGTAAGAGC;TC=32;TR=14 GT:GL:GQ 0/1:-167.85,-53.03,-186.47:100
-20 3007694 . A AGGT . PASS FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=CCAGGGCCTGAGGTGGGAGCA;TC=22;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-162.22,-42.91,-117.4:100
-20 3012419 . C CTGTT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=CCTCCTTACTCTGTGTGTTTT;TC=26;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-154.4,-24.26,-143.38:100
-20 3022136 . GAATT G . PASS FR=0.5;HP=7;NF=8;NR=1;PP=100.0;SC=AAAAGAAAAAGAATTAATTAA;TC=20;TR=9 GT:GL:GQ 1/0:-190.17,-78.0,-90.9:100
-20 3039218 . GT G . PASS FR=1.0;HP=5;NF=12;NR=13;PP=100.0;SC=TGTTGTTGTTGTTTGTTTGTT;TC=29;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-226.7,-48.88,-31.11:100
-20 3042034 . T TA . PASS FR=1.0;HP=10;NF=5;NR=14;PP=100.0;SC=AAGACACTGATAAAAAAAAAT;TC=25;TR=19 GT:GL:GQ 1/1:-125.74,-31.3,-15.65:100
-20 3047853 . A ATTCCCCCATT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=1;PP=100.0;SC=ACTCCCTCTCATTCCCCCATT;TC=20;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-258.31,-36.83,-99.91:100
-20 3050529 . A AT . PASS FR=0.5;HP=10;NF=4;NR=1;PP=23.0;SC=GCAAAAAAAAAAATTTTTATT;TC=22;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-257.11,-262.46,-292.84:73
-20 3050531 . A ATTT,T . PASS FR=0.5,0.5;HP=10;NF=3,13;NR=0,6;PP=97.0,100.0;SC=AAAAAAAAAAATTTTTATTTT;TC=22;TR=3,19 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 3051123 . A AT . PASS FR=0.5;HP=6;NF=2;NR=1;PP=69.0;SC=TCAAGAAAAAAATATATATAT;TC=17;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-107.95,-81.12,-160.4:100
-20 3058938 . C CTT . PASS FR=1.0;HP=2;NF=19;NR=9;PP=100.0;SC=ACTGGATACTCTGAACTCCTA;TC=30;TR=28 GT:GL:GQ 1/1:-404.4,-115.7,-94.26:100
-20 3060201 . C CAAT . PASS FR=0.5;HP=4;NF=13;NR=9;PP=100.0;SC=ACAAAGTCAACAATAATTCAT;TC=44;TR=22 GT:GL:GQ 0/1:-325.42,-43.13,-189.79:100
-20 3062903 . T TC . PASS FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=5;PP=94.0;SC=TCCAGGCCTTTCCCTCTCTGC;TC=19;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-95.35,-62.58,-147.62:100
-20 3072606 . A AAGG . PASS FR=1.0;HP=5;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=CCAAGTAAAAAAGGGCGGGGG;TC=22;TR=8 GT:GL:GQ 1/1:-220.94,-78.12,-65.62:100
-20 3126086 . CCT TCT,C . PASS FR=0.5,0.5;HP=7;NF=1,1;NR=3,1;PP=8.0,36.0;SC=GCCTTTTTTTCCTTTTTTTTT;TC=19;TR=4,2 GT:GL:GQ 2/1:-1.0,-1.0,-1.0:42
-20 3159346 . C CA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=3;NR=12;PP=100.0;SC=GCTGGGACTACGGCATTTACT;TC=15;TR=15 GT:GL:GQ 1/1:-149.15,-11.32,-0.92:87
-20 3161722 . C CAGAT,CAGATAGAT . PASS FR=0.5,0.5;HP=2;NF=2,1;NR=2,2;PP=35.0,42.0;SC=GATAGATAGACAGATAGATAG;TC=18;TR=4,3 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:99
-20 3161783 . CTA C . PASS FR=1.0;HP=2;NF=9;NR=7;PP=100.0;SC=TTTTATATATCTATATATATA;TC=25;TR=16 GT:GL:GQ 1/1:-263.89,-139.12,-127.54:97
-20 3162560 . CAT C . PASS FR=0.5369;HP=2;NF=1;NR=3;PP=100.0;SC=CACACACACACATGGTCCATG;TC=6;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-84.99,-50.52,-52.5:11
-20 3169476 . T TTTG . PASS FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=9;PP=100.0;SC=AATGTTTACTTTTAATAAACT;TC=35;TR=14 GT:GL:GQ 0/1:-273.66,-64.07,-202.46:100
-20 3169541 . A AT . PASS FR=0.5;HP=7;NF=5;NR=9;PP=100.0;SC=AGGATCATAGATTTTTTTCCT;TC=23;TR=14 GT:GL:GQ 0/1:-204.2,-123.3,-145.94:100
-20 3172618 . GACAC G . PASS FR=0.7893;HP=1;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=TTGCTCCCCTGACACACACAC;TC=16;TR=4 GT:GL:GQ 1/1:-154.29,-100.95,-101.25:3
-20 3172771 . C CAT . PASS FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=6;PP=100.0;SC=CCGAGACACACGAGTGGTAAT;TC=24;TR=19 GT:GL:GQ 1/1:-267.07,-44.87,-28.98:100
-20 3177159 . T TA . PASS FR=1.0;HP=5;NF=6;NR=3;PP=87.0;SC=CTGTCTCCACTAAAAATACAA;TC=15;TR=9 GT:GL:GQ 1/1:-169.92,-142.98,-139.57:56
-20 3177517 . C CAT . PASS FR=1.0;HP=2;NF=15;NR=10;PP=100.0;SC=TAATAAATAACGTTACTGGAT;TC=26;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-294.64,-37.59,-18.88:100
-20 3188342 . A AAACAACAACAACAAC . PASS FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=CTCCATCTCAAAACAACAACA;TC=17;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-131.35,-46.51,-82.74:100
-20 3192138 . T TTTTGTTTGTTTG . PASS FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=1;PP=99.0;SC=TTTTGTTTTGTTTTGTTTGTT;TC=17;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-79.23,-33.31,-124.52:100
-20 3192798 . C CAG . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=6;PP=100.0;SC=GCCTGGGTGACAGAGAGAGAG;TC=20;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-108.84,-41.85,-123.5:100
-20 3198551 . G GTT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=2;PP=63.0;SC=AGTTTTTGTGGGTTTTTTTTT;TC=22;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-111.88,-112.41,-193.71:91
-20 3202220 . GTGGC G . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=5;PP=100.0;SC=TGTCCCGGGTGTGGCTGGCGA;TC=19;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-150.53,-63.82,-136.14:100
-20 3276659 . CT C . PASS FR=1.0;HP=3;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=ACATCGGGAACTTTCGGTTTC;TC=16;TR=11 GT:GL:GQ 1/1:-135.26,-24.21,-14.73:79
-20 3290980 . A AAAAG . PASS FR=0.9998;HP=4;NF=1;NR=1;PP=30.0;SC=AAGAGAAAGAAAAAGAAAGAA;TC=7;TR=2 GT:GL:GQ 1/1:-37.89,-18.65,-17.26:34
-20 3313547 . G GGTGT . PASS FR=1.0;HP=1;NF=1;NR=3;PP=100.0;SC=GTGTGCGTGTGGTGTGTGTGT;TC=20;TR=4 GT:GL:GQ 1/1:-194.22,-148.74,-144.19:56
-20 3314333 . G GT . PASS FR=1.0;HP=10;NF=9;NR=9;PP=100.0;SC=CTTATTAAAGGTTTTTTTTTT;TC=34;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-126.24,-28.85,-19.8:75
-20 3317061 . G GT . PASS FR=1.0;HP=10;NF=5;NR=7;PP=100.0;SC=GTTTTGTTCAGTTTTTTTTTT;TC=20;TR=12 GT:GL:GQ 1/1:-81.13,-22.72,-13.12:80
-20 3318622 . TATAAAATATATAATAC T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=ATATATAATATATAAAATATA;TC=21;TR=8 GT:GL:GQ 1/0:-309.41,-50.93,-55.49:45
-20 3320964 . AGTTT A . PASS FR=1.0;HP=1;NF=6;NR=12;PP=100.0;SC=AATCATACCTAGTTTGTACTA;TC=22;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-403.07,-167.86,-153.33:100
-20 3320971 . A AC . PASS FR=1.0;HP=1;NF=6;NR=13;PP=100.0;SC=CCTAGTTTGTACTATAAAAAA;TC=19;TR=19 GT:GL:GQ 1/1:-403.07,-261.66,-248.63:100
-20 3323678 . AT A . PASS FR=1.0;HP=5;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=TCTGATGATTATTTCTATTGC;TC=28;TR=4 GT:GL:GQ 1/1:-575.25,-570.95,-570.67:100
-20 3323683 . T TAAA . PASS FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=11;PP=100.0;SC=TGATTATTTCTATTGCTGTGC;TC=29;TR=24 GT:GL:GQ 1/1:-597.36,-560.99,-550.34:86
-20 3323709 . T TA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=16;NR=21;PP=100.0;SC=CATGTTCATTTGTTAGGTCCC;TC=38;TR=37 GT:GL:GQ 1/1:-694.83,-570.91,-558.14:100
-20 3325237 . TACACACAC T . PASS FR=1.0;HP=2;NF=4;NR=2;PP=100.0;SC=TACACACACATACACACACAC;TC=33;TR=6 GT:GL:GQ 1/1:-276.44,-185.04,-177.42:63
-20 3332481 . TTTTA T . PASS FR=1.0;HP=3;NF=7;NR=10;PP=100.0;SC=GTTTGTGTTATTTTATTTATT;TC=28;TR=17 GT:GL:GQ 1/1:-276.75,-43.8,-27.83:100
-20 3333166 . TCA T . PASS FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=10;PP=100.0;SC=TGGCTGTCATTCACATTCCAG;TC=22;TR=19 GT:GL:GQ 1/1:-222.99,-23.7,-9.78:100
-20 3333493 . T TTA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=TTCAAAATATTTATATATATA;TC=27;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-272.96,-96.81,-86.7:65
-20 3336192 . G GC . PASS FR=1.0;HP=2;NF=5;NR=10;PP=100.0;SC=CTGCACTCCAGCCTGGGTGAC;TC=18;TR=15 GT:GL:GQ 1/1:-163.64,-31.05,-19.12:100
-20 3338276 . G GCTTAT . PASS FR=1.0;HP=1;NF=8;NR=10;PP=100.0;SC=CACCCATCCAGCTTTATCTTT;TC=23;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-329.33,-26.75,-8.74:100
-20 3345587 . C CT . PASS FR=1.0;HP=6;NF=1;NR=10;PP=100.0;SC=CCTTCTTTTCCTTTTTTCTTT;TC=27;TR=11 GT:GL:GQ 1/1:-267.74,-155.91,-141.96:100
-20 3346020 . TTTTATTTA T . PASS FR=1.0;HP=3;NF=7;NR=6;PP=100.0;SC=TTTGATAACATTTTATTTATT;TC=29;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-347.46,-36.68,-23.65:100
-20 3349612 . T TA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=8;NR=3;PP=100.0;SC=ACCCCATTTCTCTAAAAATAC;TC=11;TR=11 GT:GL:GQ 1/1:-135.85,-60.43,-52.97:61
-20 3377965 . G GTTTTGTT . PASS FR=1.0;HP=8;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=TTTTTGTTTTGTTTTGTTTTT;TC=16;TR=5 GT:GL:GQ 1/1:-157.49,-62.9,-56.59:79
-20 3378366 . TG T . PASS FR=1.0;HP=10;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=AGATTTTTTTTGGGGGGGGGG;TC=22;TR=10 GT:GL:GQ 1/1:-84.99,-30.32,-19.67:66
-20 3382249 . T TA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=9;PP=100.0;SC=AATTATTATCTTTCATTCAAT;TC=19;TR=16 GT:GL:GQ 1/1:-178.1,-44.13,-31.76:100
-20 3382515 . TC T . PASS FR=1.0;HP=6;NF=2;NR=10;PP=100.0;SC=TGGGGAGGGCTCCCCCGCCCC;TC=19;TR=12 GT:GL:GQ 1/1:-132.42,-42.62,-32.12:88
-20 3398847 . T TAC . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=1;PP=82.0;SC=AATAACAACATACACACACAC;TC=26;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-87.09,-56.01,-103.69:100
-20 3418279 . TACACACACAC T . PASS FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=CACACGAGGGTACACACACAC;TC=17;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-117.7,-66.19,-77.13:50
-20 3419562 . TACAC T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=TCAAAATACATACACACACAC;TC=29;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-141.17,-79.46,-166.16:100
-20 3426771 . T TC . PASS FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=10;PP=100.0;SC=TTGCAGAAACTGACAAAATAG;TC=25;TR=23 GT:GL:GQ 1/1:-297.92,-207.29,-192.68:100
-20 3439128 . AT A . PASS FR=1.0;HP=4;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=TGTCTCAAAAATATATATATA;TC=13;TR=7 GT:GL:GQ 1/1:-127.06,-48.08,-43.43:57
-20 3439712 . CATTTATTTATTT CATTTATTT,C . PASS FR=0.5,0.5;HP=1;NF=2,5;NR=1,1;PP=100.0,100.0;SC=AACATAAAATCATTTATTTAT;TC=23;TR=3,6 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 3441674 . G GA . PASS FR=0.5;HP=7;NF=13;NR=3;PP=100.0;SC=TTCTTATTAGGAAAAAAACCA;TC=23;TR=16 GT:GL:GQ 0/1:-122.74,-20.86,-35.93:68
-20 3456629 . CA C . PASS FR=0.5;HP=8;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=TCCTCACTACCAAAAAAAAGA;TC=22;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-62.73,-25.03,-67.91:100
-20 3462307 . A ATTC . PASS FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=2;PP=100.0;SC=TAAATTTTTAATTAAGTTTTC;TC=17;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-213.54,-117.72,-169.88:100
-20 3465413 . G GTTA . PASS FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=TATATTTCCAGTTTAGGTCTC;TC=32;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-171.48,-39.39,-198.21:100
-20 3465556 . AATT A . PASS FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=3;PP=100.0;SC=TGGATTTTAAAATTATTATTA;TC=23;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-128.2,-26.49,-64.94:100
-20 3467027 . TTTTCC T . PASS FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=10;PP=100.0;SC=GTTGTTTTTCTTTTCCTTTTT;TC=35;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-205.57,-36.22,-212.27:100
-20 3468732 . AT A . PASS FR=0.5;HP=1;NF=7;NR=3;PP=100.0;SC=GTTGGCTAACATGTTCCCTGC;TC=24;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-129.57,-23.07,-107.21:100
-20 3472426 . T TA . PASS FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=CCCCAAAACTTATCTAAGTAT;TC=30;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-164.9,-36.91,-163.8:100
-20 3473769 . TTGTGTGTGTG TTGTGTGTG,T . PASS FR=0.5,0.5;HP=2;NF=3,2;NR=1,0;PP=100.0,100.0;SC=GTACGTTTGTTTGTGTGTGTG;TC=10;TR=4,2 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 3489906 . C CAG . PASS FR=0.5;HP=3;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=TGTAATGAGTCAAATATTGAA;TC=30;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-218.47,-143.39,-285.84:100
-20 3495915 . T TG . PASS FR=0.5;HP=1;NF=8;NR=2;PP=100.0;SC=GTGTTACCATTCTAGAGATGA;TC=24;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-170.31,-150.44,-250.52:100
-20 3509359 . CTAAAA C . PASS FR=0.5;HP=1;NF=7;NR=9;PP=100.0;SC=CCCCTTGAACCTAAAATAAAA;TC=36;TR=16 GT:GL:GQ 0/1:-259.32,-75.45,-201.38:100
-20 3516100 . GA G . PASS FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=AACATTACTTGATAACCTTTC;TC=24;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-89.87,-17.09,-134.48:100
-20 3517232 . T TA . PASS FR=0.5;HP=4;NF=5;NR=10;PP=100.0;SC=TTTATTCATTTAAAAGCAACA;TC=33;TR=15 GT:GL:GQ 0/1:-148.46,-23.56,-134.17:100
-20 3518135 . TTG T . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=7;PP=100.0;SC=TATTTTTTTCTTGTTTTTTTT;TC=24;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-164.48,-76.63,-118.93:100
-20 3520111 . TGAGAAACAGAAA T . PASS FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=GTCAAATACTTGAGAAACAGA;TC=30;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-291.42,-56.72,-205.51:100
-20 3533082 . C CTA . PASS FR=0.5;HP=6;NF=5;NR=7;PP=100.0;SC=CCAGATGTCCCCCCCAGTTAA;TC=28;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-172.54,-164.36,-281.23:100
-20 3536203 . CA C . PASS FR=0.5;HP=5;NF=5;NR=1;PP=100.0;SC=TGGTAGACCACAAAACAAAAT;TC=20;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-93.07,-22.5,-78.34:100
-20 3549166 . A AT . PASS FR=0.5;HP=7;NF=6;NR=5;PP=100.0;SC=ACTCAAAAAAAATATATTTCA;TC=27;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-132.66,-26.81,-119.92:100
-20 3550790 . AT A . PASS FR=0.5;HP=10;NF=9;NR=3;PP=100.0;SC=AATTGTCTCAATTTTTTTTTT;TC=36;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-95.8,-54.46,-109.39:100
-20 3554405 . TTTTA T . PASS FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=TTTTATTTTATTTTATTTATT;TC=28;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-169.52,-76.02,-126.65:100
-20 3557342 . G GTCTATCTATCTATCTATCTA,GTCTGTCTGTCTATCTA . PASS FR=0.5,0.5;HP=2;NF=0,1;NR=2,1;PP=100.0,100.0;SC=CTGTCTGTCTGTCTATCTATC;TC=14;TR=2,2 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 3577359 . AACTTT A . PASS FR=0.5;HP=3;NF=8;NR=4;PP=100.0;SC=GTTCTCTTAAAACTTTACTTT;TC=28;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-187.21,-26.31,-190.0:100
-20 3587084 . A ACT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=2;PP=100.0;SC=TTCTCTCTTCACTGTTTCCTG;TC=27;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-175.39,-93.87,-225.08:100
-20 3587106 . TGTG T . PASS FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=ATGTGGGACTTGTGGTGCCAC;TC=26;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-197.29,-142.58,-281.02:100
-20 3597598 . AT A . PASS FR=0.5;HP=5;NF=5;NR=7;PP=29.0;SC=CAAGGATCGCATTTTTATCCC;TC=39;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-225.54,-208.64,-370.51:76
-20 3599489 . G GGTT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=TGGTGGTGGTGGTTTTGTTTC;TC=28;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-173.69,-38.78,-110.57:100
-20 3601166 . T TAC . PASS FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=5;PP=100.0;SC=GTACTGGGATTAGGCGTGAGC;TC=23;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-99.56,-38.65,-114.14:100
-20 3607044 . TAAAAA T . PASS FR=0.5;HP=5;NF=6;NR=1;PP=100.0;SC=TTTTCTCTCTTAAAAAGAAAA;TC=23;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-96.17,-24.47,-167.72:100
-20 3608928 . A AAG . PASS FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=GAAAACTAGAAAGAAACTTCT;TC=32;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-96.19,-24.02,-201.47:100
-20 3610589 . G GT . PASS FR=0.5;HP=7;NF=7;NR=8;PP=100.0;SC=ATCATTCTGAGTTTTTTTATT;TC=36;TR=15 GT:GL:GQ 0/1:-148.28,-61.67,-123.51:100
-20 3612124 . A AC . PASS FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=1;PP=100.0;SC=GTCTGTTGAGACTGTGTCCTA;TC=17;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-86.01,-27.19,-97.39:100
-20 3627840 . C CA . PASS FR=0.5;HP=6;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=CTCAACTGTGCAAAAAACAAA;TC=27;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-99.01,-25.59,-91.79:100
-20 3627925 . A ATTAAC . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=9;PP=100.0;SC=AGTCAGATGAATTGTTTTCAT;TC=29;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-210.42,-38.37,-176.36:100
-20 3635158 . A AT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=8;NR=5;PP=100.0;SC=CAAGAAAGCCATAGACCGGAA;TC=23;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-191.76,-111.36,-148.51:100
-20 3642221 . TTC T . PASS FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=3;PP=100.0;SC=TCGCCACCATTTCTCCAGAAC;TC=20;TR=15 GT:GL:GQ 1/1:-312.08,-172.82,-161.67:43
-20 3643129 . TC T . PASS FR=1.0;HP=9;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=CGGGGTGGTATCCCCCCCCCA;TC=20;TR=8 GT:GL:GQ 1/1:-89.01,-45.99,-37.4:71
-20 3645120 . AAAAC A . PASS FR=1.0;HP=5;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=TTTTTTTTAAAAAACAAACAA;TC=18;TR=5 GT:GL:GQ 1/1:-88.2,-13.8,-7.58:77
-20 3650540 . A ACACCACC . PASS FR=1.0;HP=1;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=CCAGGCTCTGACAGCAGCCTG;TC=12;TR=7 GT:GL:GQ 1/1:-183.63,-21.64,-13.12:68
-20 3664603 . AG A . PASS FR=1.0;HP=6;NF=3;NR=9;PP=100.0;SC=TTCTGTAGACAGGGGGGTCTC;TC=16;TR=12 GT:GL:GQ 1/1:-110.02,-26.49,-16.31:85
-20 3667748 . C CG . PASS FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=5;PP=100.0;SC=AAAGTTCACCCGCCCCCAACT;TC=24;TR=17 GT:GL:GQ 1/1:-221.42,-44.79,-28.21:100
-20 3677095 . T TGCTG . PASS FR=1.0;HP=1;NF=4;NR=13;PP=100.0;SC=GGAGGCCTTCTGCTGGCTGGA;TC=22;TR=17 GT:GL:GQ 1/1:-297.16,-58.83,-44.05:100
-20 3685444 . A AT . PASS FR=1.0;HP=7;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=TTGTTTTTTAATTTTTTTGTA;TC=15;TR=10 GT:GL:GQ 1/1:-93.4,-15.67,-6.68:75
-20 3699376 . AAAAT A . PASS FR=1.0;HP=5;NF=4;NR=2;PP=100.0;SC=CAAAAAATAAAAAATAAATAA;TC=21;TR=6 GT:GL:GQ 1/1:-124.16,-19.34,-11.28:66
-20 3700024 . TTTAC T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=TATTTATTTATTTACTTACTT;TC=22;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-142.54,-24.82,-34.29:44
-20 3702676 . C CT . PASS FR=1.0;HP=9;NF=9;NR=6;PP=100.0;SC=ATATGTTGAACTTTTTTTTTA;TC=20;TR=15 GT:GL:GQ 1/1:-102.25,-23.87,-11.51:100
-20 3703373 . GAATA G . PASS FR=1.0;HP=3;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=TATACATGGAGAATAAATAAA;TC=24;TR=7 GT:GL:GQ 1/1:-129.84,-26.73,-19.11:63
-20 3705235 . G GGAAA . PASS FR=1.0;HP=3;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=AAGAAAGAAAGGAAAGAAATA;TC=24;TR=5 GT:GL:GQ 1/1:-319.51,-157.83,-145.36:98
-20 3717704 . AAAATAAATAAATAAAT AAAATAAATAAAT,A . PASS FR=0.5,0.5;HP=4;NF=1,0;NR=1,2;PP=100.0,55.0;SC=CTCTGCCTCAAAAATAAATAA;TC=12;TR=2,2 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 3719488 . AGT A . PASS FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=TCTGTGAGTGAGTGTGTGTGT;TC=28;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-149.53,-25.54,-102.21:100
-20 3736407 . CCCCCAGCCCAGTGG C . PASS FR=0.5;HP=4;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=AGCTGATCGACCCCCAGCCCA;TC=22;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-177.03,-114.74,-207.47:100
-20 3740620 . GCA G . PASS FR=1.0;HP=1;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=ACTCACACATGCACACACACA;TC=17;TR=10 GT:GL:GQ 1/1:-154.32,-36.11,-25.75:86
-20 3751453 . G GT . PASS FR=1.0;HP=6;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=CAAACACACGGTTTTTTGTTT;TC=25;TR=2 GT:GL:GQ 1/1:-234.3,-199.49,-191.92:62
-20 3752464 . A AACAC,AACACAC . PASS FR=0.5,0.5;HP=3;NF=4,3;NR=3,3;PP=100.0,100.0;SC=AAAAAGAGAAAACACACACAC;TC=29;TR=7,6 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 3755004 . G GACA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=1;NR=7;PP=100.0;SC=GACAGAGTGAGACATCTCATA;TC=13;TR=8 GT:GL:GQ 1/1:-134.63,-25.28,-17.61:63
-20 3768789 . A AAAAG . PASS FR=0.5;HP=8;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=ATCTCAAAAAAAAAGAAAGAA;TC=28;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-141.47,-38.74,-119.72:100
-20 3770324 . T TAATAATA . PASS FR=0.5;HP=8;NF=1;NR=2;PP=29.0;SC=GGCCAAAAAATAATAATAAAT;TC=11;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-67.44,-43.02,-52.14:42
-20 3774219 . AATTTT A . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=GGTTTTAGAGAATTTTATTTT;TC=20;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-126.4,-91.22,-154.58:100
-20 3775162 . GTT G . PASS FR=0.5;HP=10;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=TCTCGGGGCAGTTTTTTTTTT;TC=26;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-103.9,-68.26,-117.09:100
-20 3776005 . C CA . PASS FR=0.5;HP=8;NF=1;NR=4;PP=23.0;SC=GACTCCATCCCAAAAAAAACA;TC=14;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-145.51,-129.15,-148.62:73
-20 3776021 . AAAC A . PASS FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=AAACAAAACAAAACAAAAAGA;TC=21;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-163.41,-119.44,-232.96:100
-20 3780857 . T TGGACTGGAGACCTGGTGCTAG . PASS FR=0.5;HP=6;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=TACTCCCCCCTGGACTGGGGG;TC=10;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-153.98,-19.16,-34.72:70
-20 3786892 . C CT . PASS FR=1.0;HP=4;NF=10;NR=2;PP=100.0;SC=CTTGTCCCTTCTTCTCCCAAT;TC=16;TR=12 GT:GL:GQ 1/1:-171.33,-64.44,-53.38:92
-20 3787614 . CAT C . PASS FR=1.0;HP=2;NF=11;NR=13;PP=100.0;SC=AGTGCACACACATGTCAGGCA;TC=30;TR=24 GT:GL:GQ 1/1:-451.43,-312.17,-297.5:100
-20 3789927 . C CCCG . PASS FR=1.0;HP=2;NF=2;NR=10;PP=100.0;SC=AGTTACCACGCGCTCTCTTTC;TC=17;TR=12 GT:GL:GQ 1/1:-241.99,-120.76,-110.7:78
-20 3790246 . ATATAT A . PASS FR=1.0;HP=8;NF=5;NR=2;PP=92.0;SC=TCAAAAAAAAATATATATATA;TC=14;TR=7 GT:GL:GQ 1/1:-198.37,-176.0,-172.1:52
-20 3795480 . AGGCGTGAGCCACCGCGCCC A . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=CTGGGATTACAGGCGTGAGCC;TC=12;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-109.14,-46.17,-99.46:100
-20 3824585 . TTTTAC T . PASS FR=1.0;HP=3;NF=18;NR=4;PP=100.0;SC=AGATGATTTATTTTACTTTAT;TC=28;TR=22 GT:GL:GQ 1/1:-337.35,-36.39,-16.32:100
-20 3843259 . A AT . PASS FR=0.5;HP=10;NF=3;NR=7;PP=100.0;SC=AGTTTTCCAAATTTTTTTTTT;TC=31;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-80.23,-37.02,-73.45:100
-20 3859483 . TCACACACACA TCA,T . PASS FR=0.5,0.5;HP=1;NF=1,2;NR=1,1;PP=100.0,85.0;SC=TGAGACTCTGTCACACACACA;TC=21;TR=2,3 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 3860757 . AAAAC A . PASS FR=0.5;HP=4;NF=5;NR=2;PP=100.0;SC=GTCTCTACTAAAAACAAACAA;TC=18;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-108.81,-21.22,-75.5:100
-20 3860858 . GC G . PASS FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=1;PP=100.0;SC=AACCCAGGAGGCGGAGCTTGT;TC=16;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-84.65,-31.03,-99.29:100
-20 3865910 . A AGGC . PASS FR=0.5;HP=3;NF=8;NR=4;PP=100.0;SC=TCTGTCACCCAGGCTCAAGTT;TC=27;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-249.42,-106.14,-180.19:100
-20 3873092 . TTTTA T . PASS FR=1.0;HP=5;NF=6;NR=8;PP=100.0;SC=ACTAAATCTTTTTTATTTATT;TC=25;TR=14 GT:GL:GQ 1/1:-225.87,-50.85,-37.99:100
-20 3879882 . AGT A . PASS FR=1.0;HP=1;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=GCAGTGATGTAGTGTAGGCTC;TC=17;TR=8 GT:GL:GQ 1/1:-213.63,-128.83,-121.45:61
-20 3882311 . TTTTG T . PASS FR=1.0;HP=3;NF=15;NR=11;PP=100.0;SC=AAGTCAGTACTTTTGTTTATT;TC=29;TR=26 GT:GL:GQ 1/1:-341.87,-21.25,-0.46:100
-20 3883619 . GACACACACACACACAC G . PASS FR=0.5013;HP=2;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=GATGTGTATAGACACACACAC;TC=14;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-204.43,-28.1,-33.39:25
-20 3885810 . GACTGCACC G . PASS FR=1.0;HP=1;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=CATCGCTTGTGACTGCACCAC;TC=19;TR=11 GT:GL:GQ 1/1:-301.58,-43.69,-32.0:95
-20 3899973 . T TTGA . PASS FR=1.0;HP=3;NF=18;NR=6;PP=100.0;SC=AGAAAAACCCTTGAACATTCC;TC=30;TR=24 GT:GL:GQ 1/1:-376.13,-29.44,-7.6:100
-20 3900864 . T TA . PASS FR=1.0;HP=10;NF=11;NR=11;PP=100.0;SC=AAGTTAACCTTAAAAAAAAAA;TC=30;TR=22 GT:GL:GQ 1/1:-160.94,-53.86,-35.6:100
-20 3929292 . G GA . PASS FR=1.0;HP=1;NF=16;NR=6;PP=100.0;SC=TACATACCAGGATAACTGTTG;TC=29;TR=22 GT:GL:GQ 1/1:-330.17,-190.24,-173.09:100
-20 3930806 . T TGACTGG . PASS FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=14;PP=100.0;SC=CCTTGTATAGTGATGAATGTG;TC=26;TR=21 GT:GL:GQ 1/1:-450.24,-61.65,-40.95:100
-20 3945171 . A AT . PASS FR=1.0;HP=10;NF=7;NR=12;PP=100.0;SC=TTTTCAAGTAATTTTTTTTTT;TC=29;TR=19 GT:GL:GQ 1/1:-126.38,-32.45,-22.97:79
-20 3956227 . C CA . PASS FR=1.0;HP=5;NF=12;NR=13;PP=100.0;SC=ATTGTGTTCTCAAAAAGATAT;TC=28;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-249.31,-33.1,-13.35:100
-20 3965697 . AACC A . PASS FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=9;PP=100.0;SC=GAACAACAACAACCACAACAA;TC=26;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-461.94,-340.35,-326.48:100
-20 3971557 . G GTTCCATGATAACAT . PASS FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=8;PP=100.0;SC=ATTTGGCACAGTTCCATGATA;TC=27;TR=20 GT:GL:GQ 1/1:-553.38,-41.98,-23.08:100
-20 3990695 . CACAAACAA C . PASS FR=1.0;HP=1;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=GAGACCCTGTCACAAACAAAC;TC=23;TR=10 GT:GL:GQ 1/1:-176.37,-39.86,-31.94:65
-20 3995386 . GCACACA G . PASS FR=1.0;HP=2;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=ACTTGAATGCGCACACACACA;TC=18;TR=2 GT:GL:GQ 1/1:-95.82,-46.66,-41.67:61
-20 4008931 . C CTCTT . PASS FR=1.0;HP=2;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=TCTCATCTCTCTGTCTTTCTC;TC=9;TR=5 GT:GL:GQ 1/1:-127.43,-46.42,-40.22:77
-20 4021562 . C CGA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=8;NR=2;PP=100.0;SC=GAAGAGAAAGCGAGAGAGAGA;TC=21;TR=10 GT:GL:GQ 1/1:-216.37,-85.41,-73.73:98
-20 4025709 . TGA T . PASS FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=9;PP=100.0;SC=AAATACATAATGAGAGAGAGA;TC=26;TR=21 GT:GL:GQ 1/1:-247.4,-21.57,-4.6:100
-20 4035810 . T TGTTTGTATTACA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=4;PP=100.0;SC=TAGCTGGGCATGGTGGCGGGT;TC=15;TR=14 GT:GL:GQ 1/1:-361.94,-174.62,-163.57:92
-20 4042278 . A AT . PASS FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=15;PP=100.0;SC=AAACACATAAATCTCTCTCTC;TC=29;TR=22 GT:GL:GQ 1/1:-269.48,-66.17,-47.18:100
-20 4044153 . C CA . PASS FR=1.0;HP=6;NF=8;NR=10;PP=100.0;SC=GCCCCAGGGACGGGGGGCTGG;TC=21;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-167.11,-27.75,-13.35:100
-20 4048870 . AGAGTTATCTTGCCTGAG A . PASS FR=0.5;HP=4;NF=9;NR=5;PP=100.0;SC=CACGTGCCCCAGAGTTATCTT;TC=24;TR=14 GT:GL:GQ 1/0:-626.63,-331.02,-449.96:74
-20 4050067 . A AT . PASS FR=1.0;HP=8;NF=14;NR=11;PP=100.0;SC=TAAGTTTTAAATTTTTTTTGT;TC=36;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-400.71,-316.84,-301.94:100
-20 4052527 . A AT . PASS FR=1.0;HP=1;NF=15;NR=9;PP=100.0;SC=CTAAGCATGAAGTGGTCTCAG;TC=27;TR=24 GT:GL:GQ 1/1:-335.51,-240.21,-229.69:88
-20 4057207 . G GT . PASS FR=1.0;HP=3;NF=17;NR=11;PP=100.0;SC=TAGATTATTTGGTTTTTTTTT;TC=40;TR=28 GT:GL:GQ 1/1:-398.27,-278.49,-261.61:100
-20 4057861 . T TTTCC . PASS FR=1.0;HP=4;NF=8;NR=13;PP=100.0;SC=CTGATGATTTTTATGTTTTCT;TC=33;TR=21 GT:GL:GQ 1/1:-430.04,-131.81,-113.85:100
-20 4058335 . T TATTA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=14;NR=5;PP=100.0;SC=TTAATATGTTTATTATACATA;TC=19;TR=19 GT:GL:GQ 1/1:-424.99,-369.88,-364.34:69
-20 4060198 . CTCTT C . PASS FR=0.5;HP=3;NF=8;NR=6;PP=100.0;SC=TTCTATTGTTCTCTTTGTTTT;TC=37;TR=14 GT:GL:GQ 0/1:-273.47,-128.98,-306.0:100
-20 4060592 . C CTTTA . PASS FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=8;PP=100.0;SC=ATAATTTTTGCTTTATTTATT;TC=31;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-163.9,-38.86,-129.26:100
-20 4070170 . GTA G . PASS FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=GTGTGTGTGTGTATATATATA;TC=25;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-276.88,-237.9,-267.79:100
-20 4070252 . A ATGTATATATG . PASS FR=1.0;HP=2;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=GTGTGTATATATGTATATATG;TC=16;TR=4 GT:GL:GQ 1/1:-231.61,-30.38,-18.61:81
-20 4070382 . ATATGTGTGTGTG A . PASS FR=1.0;HP=2;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=ATGTGTATATATATGTGTGTG;TC=25;TR=3 GT:GL:GQ 1/1:-347.8,-231.66,-223.35:51
-20 4070396 . GTGTGTGTGTGTGTATATATATATATA G . PASS FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG;TC=18;TR=8 GT:GL:GQ 1/0:-384.34,-235.32,-225.8:62
-20 4071341 . CA C . PASS FR=0.5026;HP=9;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=CTGATTATGGCAAAAAAAAAC;TC=20;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-155.5,-119.13,-123.71:22
-20 4071895 . G GT . PASS FR=0.5;HP=8;NF=3;NR=3;PP=72.0;SC=TGGGACCTTTGTTTTTGCAAA;TC=22;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-127.95,-100.32,-170.75:100
-20 4074739 . G GA . PASS FR=0.5;HP=9;NF=2;NR=4;PP=75.0;SC=ACTACATCTCGAAAAAAAAAG;TC=16;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-104.75,-76.46,-99.49:100
-20 4077346 . ATATTAT A . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=TATGAGGACAATATTATTATT;TC=23;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-62.56,-10.62,-98.18:100
-20 4092195 . G GTCAGCCAGAGAGGCTC . PASS FR=1.0;HP=1;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=AGGTAAGACAGTCAGCCAGAG;TC=21;TR=12 GT:GL:GQ 1/1:-408.88,-45.59,-29.88:100
-20 4092421 . A AT . PASS FR=0.5;HP=4;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=CTGGCAGCAGATTTTCCCTTA;TC=31;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-137.54,-52.61,-154.29:100
-20 4095639 . T TATAC . PASS FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=TATATATATATACACACACAT;TC=30;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-239.61,-67.33,-166.02:100
-20 4096614 . T TG . PASS FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=8;PP=100.0;SC=TTTGATGGCTTGTGAAGCCCA;TC=42;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-166.13,-48.49,-243.23:100
-20 4099234 . C CTCT . PASS FR=1.0;HP=1;NF=2;NR=7;PP=100.0;SC=CTTCTTCTTCCTCTTCTTCCT;TC=17;TR=9 GT:GL:GQ 1/1:-213.81,-121.18,-113.85:91
-20 4106279 . C CA . PASS FR=1.0;HP=4;NF=9;NR=14;PP=100.0;SC=ATGATCCACCCCCTTGGCCTC;TC=27;TR=23 GT:GL:GQ 1/1:-261.7,-33.57,-14.72:100
-20 4106498 . AC A . PASS FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=ACCCGCCACCACGTCAAGCTA;TC=17;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-151.03,-63.2,-86.55:100
-20 4107003 . T TCTAA . PASS FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=9;PP=100.0;SC=TGGAGGTAACTCTAGGACATA;TC=28;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-216.14,-60.6,-196.15:100
-20 4108348 . A AC . PASS FR=1.0;HP=3;NF=9;NR=6;PP=100.0;SC=TTCTATGGAAAAGAGCAGTCA;TC=22;TR=15 GT:GL:GQ 1/1:-263.65,-164.58,-152.76:96
-20 4111438 . CA C . PASS FR=1.0;HP=2;NF=13;NR=9;PP=100.0;SC=GGTGATCACACAGGGGCATGG;TC=27;TR=22 GT:GL:GQ 1/1:-393.14,-310.63,-301.96:68
-20 4111530 . T TG . PASS FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=14;PP=100.0;SC=CATCAAAACTTGCAGAAGTAT;TC=30;TR=27 GT:GL:GQ 1/1:-576.34,-531.28,-526.81:55
-20 4112367 . TA T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=2;PP=100.0;SC=AGACTTTAGTTAATAATAATA;TC=25;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-105.53,-48.17,-185.05:100
-20 4124037 . TACAC TAC,T . PASS FR=0.5,0.5;HP=2;NF=0,1;NR=6,6;PP=100.0,100.0;SC=TGTATGTGTATACACACACAC;TC=29;TR=6,7 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 4165244 . C CAG . PASS FR=0.5;HP=3;NF=9;NR=7;PP=100.0;SC=TAAAACTCAACAGTTATATTT;TC=28;TR=16 GT:GL:GQ 0/1:-164.36,-34.34,-133.84:100
-20 4189405 . A AGTGTTCT . PASS FR=1.0;HP=1;NF=8;NR=19;PP=100.0;SC=TGATCACAGAAGTGTTGAATG;TC=31;TR=27 GT:GL:GQ 1/1:-510.65,-52.94,-31.94:100
-20 4193006 . T TA . PASS FR=1.0;HP=9;NF=5;NR=11;PP=100.0;SC=TGTGTTTGATTAAAAAAAAAT;TC=25;TR=16 GT:GL:GQ 1/1:-189.06,-113.86,-103.2:89
-20 4204545 . CAACAGGTTT C . PASS FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=TTTCAATTTACAACAGGTTTA;TC=29;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-264.93,-66.16,-208.86:100
-20 4210072 . T TA . PASS FR=0.5;HP=5;NF=7;NR=3;PP=100.0;SC=GGAAGGAAGATGGGGGCGAGT;TC=33;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-169.78,-122.55,-232.56:100
-20 4211685 . T TTTTCTTTC . PASS FR=1.0;HP=4;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=CTTTCTTTCTTTTTCTTTCTT;TC=17;TR=4 GT:GL:GQ 1/1:-163.69,-62.85,-59.76:50
-20 4222606 . TG T,AG . PASS FR=0.5,0.5;HP=2;NF=14,3;NR=8,0;PP=72.0,7.0;SC=CAGCACAGCCTGATGGCTCTG;TC=29;TR=22,3 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:41
-20 4223993 . CG C . PASS FR=1.0;HP=4;NF=10;NR=1;PP=100.0;SC=CTGGGCTCCTCGGGGCATCCG;TC=14;TR=11 GT:GL:GQ 1/1:-180.73,-119.68,-111.91:64
-20 4255571 . TGAAA T . PASS FR=1.0;HP=1;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=AGGTATGCTCTGAAAGGAAGA;TC=15;TR=9 GT:GL:GQ 1/1:-155.75,-66.2,-58.38:79
-20 4260218 . C CA . PASS FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=9;PP=100.0;SC=CTGGTCTCCCCAGCATCTAGT;TC=27;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-138.73,-38.26,-150.01:100
-20 4280077 . G GTGA . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=GATGTCTTTGGTGATGATGAT;TC=23;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-118.58,-26.45,-67.22:100
-20 4300671 . G GT . PASS FR=1.0;HP=9;NF=9;NR=7;PP=100.0;SC=TATTTTTTAAGTTTTTTTTTC;TC=22;TR=16 GT:GL:GQ 1/1:-112.49,-30.96,-17.5:100
-20 4305010 . C CCTGT . PASS FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=14;PP=100.0;SC=AGGTTTGGCTCCTGTCTGACA;TC=27;TR=23 GT:GL:GQ 1/1:-478.98,-124.12,-105.32:100
-20 4306264 . GT G . PASS FR=0.5;HP=3;NF=7;NR=4;PP=100.0;SC=ACAATATAAGGTTTACTTCAA;TC=24;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-115.0,-27.63,-111.62:100
-20 4310291 . T TC . PASS FR=1.0;HP=1;NF=20;NR=9;PP=100.0;SC=CTCCTACGTGTCATGCCAGCT;TC=32;TR=29 GT:GL:GQ 1/1:-333.81,-66.33,-44.4:100
-20 4310977 . GC G . PASS FR=0.5;HP=1;NF=14;NR=6;PP=100.0;SC=CCTGAAACTGGCGTAATTTAT;TC=41;TR=20 GT:GL:GQ 0/1:-231.9,-39.91,-159.66:100
-20 4321071 . A AG . PASS FR=0.5;HP=5;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=AAGTCAAATCAGGGGGAGGAA;TC=19;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-50.11,-15.88,-71.26:100
-20 4322091 . CA C . PASS FR=0.5;HP=1;NF=11;NR=7;PP=100.0;SC=GCCGTGTGTCCAGCCAAAACT;TC=33;TR=18 GT:GL:GQ 0/1:-210.17,-46.06,-156.61:100
-20 4329185 . TC T . PASS FR=0.5;HP=1;NF=8;NR=2;PP=100.0;SC=AATTCTAGGTTCTTTCTCTCA;TC=28;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-148.46,-71.81,-182.2:100
-20 4330761 . GGTGTGTGT G . PASS FR=1.0;HP=3;NF=1;NR=3;PP=100.0;SC=TAATTCATGGGGTGTGTGTGT;TC=30;TR=4 GT:GL:GQ 1/1:-224.07,-44.24,-35.58:72
-20 4332044 . TG T . PASS FR=1.0;HP=6;NF=5;NR=2;PP=57.0;SC=TTTGTTTTTTTGTTTTTTTTT;TC=24;TR=7 GT:GL:GQ 1/1:-226.96,-113.86,-100.61:42
-20 4343821 . TA T . PASS FR=0.5;HP=8;NF=5;NR=8;PP=100.0;SC=CATTTTTTTTTAAAATTTTTG;TC=35;TR=13 GT:GL:GQ 1/0:-274.8,-111.87,-90.41:100
-20 4349378 . A AT . PASS FR=0.5;HP=3;NF=11;NR=7;PP=100.0;SC=TTTTGAAGGCATTTCCAGGGT;TC=27;TR=18 GT:GL:GQ 0/1:-181.47,-28.52,-69.89:100
-20 4366637 . AAAAC A . PASS FR=1.0;HP=3;NF=8;NR=10;PP=100.0;SC=AAAACAAAACAAAACAAACAA;TC=29;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-255.42,-38.69,-23.59:100
-20 4378952 . A AAAC . PASS FR=1.0;HP=2;NF=5;NR=8;PP=100.0;SC=CAAAACAAACAAACAACAACA;TC=26;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-242.03,-34.58,-19.38:100
-20 4380979 . CACAT C . PASS FR=1.0;HP=2;NF=6;NR=6;PP=100.0;SC=CACACACACACACATACAAGC;TC=29;TR=12 GT:GL:GQ 1/1:-310.99,-41.83,-21.18:100
-20 4381267 . T TGTGTATTGTGGA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=4;NR=9;PP=100.0;SC=GACAGCCTCCTTCAACAAAAA;TC=23;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-573.3,-462.6,-447.82:96
-20 4381268 . TC T . PASS FR=1.0;HP=1;NF=4;NR=9;PP=100.0;SC=ACAGCCTCCTTCAACAAAAAA;TC=27;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-573.3,-567.48,-566.42:96
-20 4384878 . TAGAC T . PASS FR=0.5;HP=4;NF=7;NR=6;PP=100.0;SC=ATGGAAGAAATAGACAGAGAG;TC=32;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-215.18,-58.15,-186.03:100
-20 4390996 . ACT A . PASS FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=AACACTCGAGACTCTCCAGCT;TC=25;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-160.6,-43.63,-115.25:100
-20 4392384 . T TTG . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=GGGAATATAGTTGTGTGTGTG;TC=26;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-141.31,-92.22,-156.97:100
-20 4403198 . CGT CGTGT,C . PASS FR=0.5,0.5;HP=2;NF=3,3;NR=2,0;PP=100.0,91.0;SC=TGTGTGTGTGCGTGTGTGTGT;TC=16;TR=5,3 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 4418283 . TCC T . PASS FR=1.0;HP=5;NF=9;NR=17;PP=100.0;SC=TGAAAAATGCTCCCCAGGTTT;TC=26;TR=26 GT:GL:GQ 1/1:-235.22,-17.92,0.0:100
-20 4422138 . A AAGAGGCAAGGCTTCCCCACATGCTCAGAATGG,G . PASS FR=0.5,0.5;HP=1;NF=2,3;NR=0,5;PP=100.0,87.0;SC=CTACAGAAAGATGATGGAGGT;TC=14;TR=2,8 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:23
-20 4422142 . T TG . PASS FR=1.0;HP=2;NF=8;NR=6;PP=100.0;SC=AGAAAGATGATGGAGGTACTA;TC=19;TR=14 GT:GL:GQ 1/1:-319.37,-289.62,-286.77:23
-20 4427312 . A AGCTTCTAT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=TGTATAATAGAGTCCAGAGTC;TC=11;TR=2 GT:GL:GQ 1/0:-513.43,-441.06,-437.62:42
-20 4431651 . TA T . PASS FR=0.5;HP=5;NF=9;NR=13;PP=100.0;SC=TCTAGACCCTTAAAAATAACA;TC=34;TR=22 GT:GL:GQ 0/1:-196.04,-30.01,-107.67:100
-20 4438168 . T TTACACAAATGTAACCTATGTAACAA . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=CCTGCACATGTACCCTTGAAC;TC=16;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-418.07,-256.53,-367.22:100
-20 4439599 . GT G . PASS FR=0.5;HP=2;NF=11;NR=12;PP=100.0;SC=TGTGGGGAGAGTTAGCAAGAG;TC=36;TR=23 GT:GL:GQ 0/1:-329.81,-228.22,-300.4:100
-20 4442338 . CTTTATTTTATTTTAT CTTTATTTTAT,C . PASS FR=0.5,0.5;HP=3;NF=2,1;NR=0,3;PP=100.0,100.0;SC=AAGTATCTAACTTTATTTTAT;TC=21;TR=2,4 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 4445547 . T TAA . PASS FR=1.0;HP=1;NF=18;NR=22;PP=100.0;SC=TGTTTCCAGTTGTTATACTTT;TC=39;TR=40 GT:GL:GQ 1/1:-459.22,-244.89,-221.84:100
-20 4452980 . TACAC T . PASS FR=1.0;HP=2;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=TTAATTCTTATACACACACAC;TC=21;TR=3 GT:GL:GQ 1/1:-75.87,-32.41,-30.31:43
-20 4460649 . G GA . PASS FR=0.5;HP=9;NF=5;NR=8;PP=100.0;SC=TTTCCTCGGAGAAAAAAAACA;TC=39;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-191.57,-119.31,-159.65:100
-20 4462152 . GGTCAATGTTATAAACTTTGC G . PASS FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=5;PP=100.0;SC=CTACTTCTTGGGTCAATGTTA;TC=18;TR=11 GT:GL:GQ 1/0:-501.72,-174.1,-171.31:67
-20 4462516 . T TTC . PASS FR=0.5;HP=1;NF=16;NR=1;PP=100.0;SC=GGGTTTAAAGTTCTCTAATGA;TC=41;TR=17 GT:GL:GQ 0/1:-181.56,-38.08,-223.18:100
-20 4462799 . C CTT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=TCTTCTTCGTCCTTTTTTTTT;TC=36;TR=2 GT:GL:GQ 0/1:-520.7,-504.74,-499.84:81
-20 4465737 . TG T . PASS FR=1.0;HP=2;NF=9;NR=18;PP=100.0;SC=CTCCTTGACATGGACTGAGAA;TC=27;TR=27 GT:GL:GQ 1/1:-258.03,-34.15,-15.14:100
-20 4468340 . TA T . PASS FR=0.5;HP=10;NF=5;NR=2;PP=57.0;SC=ATATATATATTAAAAAAAAAA;TC=21;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-41.89,-18.73,-52.45:100
-20 4469569 . C CT . PASS FR=0.5;HP=4;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=CAAGTAAAGACTTTTGATTGT;TC=23;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-113.7,-24.95,-84.55:100
-20 4474613 . GA G . PASS FR=0.5;HP=8;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=ATTAGGAACAGAAAAAAATTA;TC=37;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-311.99,-245.02,-353.92:100
-20 4474629 . A AAAT . PASS FR=0.5;HP=9;NF=11;NR=5;PP=100.0;SC=AATTAAAAAAAAAATATACAC;TC=32;TR=16 GT:GL:GQ 0/1:-322.36,-111.27,-187.62:100
-20 4475883 . AT A . PASS FR=0.5;HP=5;NF=1;NR=3;PP=100.0;SC=AAATATATATATTTTAATATA;TC=14;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-74.26,-40.07,-92.44:100
-20 4481373 . A AG . PASS FR=1.0;HP=1;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=TCTTTTTTCAAGTTTTTAGCT;TC=13;TR=11 GT:GL:GQ 1/1:-84.43,-9.42,-0.46:74
-20 4484587 . T TA . PASS FR=0.5;HP=9;NF=4;NR=9;PP=100.0;SC=TCTCTGATTTTAAAAAAAAAG;TC=46;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-163.36,-92.55,-141.98:100
-20 4487527 . TG T . PASS FR=0.5006;HP=5;NF=8;NR=7;PP=100.0;SC=TACTAGGGGCTGGGGGCAGGG;TC=34;TR=15 GT:GL:GQ 0/1:-421.09,-350.88,-356.92:29
-20 4492336 . C CA . PASS FR=1.0;HP=1;NF=11;NR=14;PP=100.0;SC=ACATTCTTGCCACCTTTGGTA;TC=27;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-281.59,-90.33,-72.03:100
-20 4493592 . C CG . PASS FR=1.0;HP=2;NF=20;NR=17;PP=100.0;SC=GCATTTTGGACATCTCACCCT;TC=39;TR=37 GT:GL:GQ 1/1:-454.89,-182.56,-157.87:100
-20 4497462 . TTA T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=2;PP=88.0;SC=TAAATCAACTTTATATATATA;TC=14;TR=4 GT:GL:GQ 1/0:-149.41,-117.69,-112.45:46
-20 4500613 . G GC . PASS FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=13;PP=100.0;SC=ATGCCCAAGGGTGTCCCAGAG;TC=29;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-293.02,-49.83,-29.64:100
-20 4502874 . CT C . PASS FR=1.0;HP=4;NF=11;NR=7;PP=100.0;SC=TACAGCCCTTCTTGGGAGCCC;TC=24;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-204.97,-36.44,-20.43:100
-20 4512447 . AAAACAAAC AAAAC,A . PASS FR=0.5,0.5;HP=3;NF=3,4;NR=0,1;PP=100.0,100.0;SC=ACTCCATCTCAAAACAAACAA;TC=20;TR=3,5 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 4519983 . GA G . PASS FR=0.5;HP=3;NF=7;NR=13;PP=100.0;SC=TCCAAACTAAGACAGGTATTA;TC=36;TR=20 GT:GL:GQ 0/1:-201.76,-27.24,-148.43:100
-20 4524299 . AGTGTGT A . PASS FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=TCTGTGCTTTAGTGTGTGTGT;TC=28;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-144.55,-75.64,-138.78:100
-20 4530940 . CTT C . PASS FR=0.5002;HP=6;NF=2;NR=9;PP=80.0;SC=TTCTTTCTTTCTTTCTCTCTC;TC=25;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-323.77,-294.9,-301.87:33
-20 4541935 . A AGAG . PASS FR=0.5;HP=2;NF=8;NR=4;PP=100.0;SC=GTGGCAGATTAGAGGAGACAT;TC=32;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-211.5,-48.19,-198.54:100
-20 4547067 . G GA . PASS FR=0.5116;HP=10;NF=5;NR=1;PP=100.0;SC=TATAGAGAGAGAAAAAAAAAC;TC=18;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-156.12,-119.31,-122.4:16
-20 4553580 . GT G . PASS FR=0.5;HP=10;NF=1;NR=1;PP=71.0;SC=TTTTGTTTTTGTTTTTGTTTT;TC=17;TR=2 GT:GL:GQ 1/0:-197.42,-152.57,-154.01:100
-20 4553925 . T TC . PASS FR=1.0;HP=1;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=CGGCCCCTCTTCACTTTTAAG;TC=16;TR=12 GT:GL:GQ 1/1:-135.25,-18.29,-7.82:87
-20 4560578 . C CCTTA . PASS FR=1.0;HP=1;NF=11;NR=12;PP=100.0;SC=ATGTTATATACCTTTTAGAGA;TC=32;TR=23 GT:GL:GQ 1/1:-416.23,-42.65,-19.11:100
-20 4566007 . G GC . PASS FR=0.5;HP=1;NF=9;NR=3;PP=100.0;SC=AGCTGGGGCTGACTCATCTGA;TC=27;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-150.18,-87.47,-213.89:100
-20 4572622 . T TA . PASS FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=AAAGGGGTGCTAGGAATTCCA;TC=21;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-105.47,-33.77,-107.56:100
-20 4580659 . ATTG A . PASS FR=0.5;HP=3;NF=9;NR=11;PP=100.0;SC=AATAATTTATATTGTTATTAT;TC=41;TR=20 GT:GL:GQ 0/1:-343.69,-136.17,-313.1:100
-20 4580822 . AAC A . PASS FR=0.5;HP=1;NF=7;NR=7;PP=100.0;SC=TATCTTACATAACAGTGTATC;TC=27;TR=14 GT:GL:GQ 0/1:-159.59,-31.47,-183.78:100
-20 4589159 . TAC T . PASS FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=CACACACACGTACACACACAC;TC=25;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-134.67,-33.29,-88.29:100
-20 4590266 . T TCTGGCC . PASS FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=GCTGGCAGCCTCTGGCCCTGG;TC=20;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-180.62,-56.12,-103.3:100
-20 4613873 . T TATA . PASS FR=0.5;HP=3;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=CTCTTTCTTTTATAATAATAA;TC=26;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-121.23,-16.51,-65.45:100
-20 4616453 . G GAGTAGA . PASS FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=7;PP=100.0;SC=CACAGAGTAGGGGTTCAATAA;TC=22;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-211.56,-25.38,-113.94:100
-20 4617264 . G GAGAA . PASS FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=GAAAGCAAGAGAGAAAGAAGA;TC=22;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-126.22,-46.88,-138.67:100
-20 4617272 . AG A . PASS FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=3;PP=20.0;SC=GAGAGAAAGAAGAGAAGAGAA;TC=22;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-134.04,-119.35,-223.11:66
-20 4617303 . G GAGGA . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=GGGAGGGAGAGAGGAAGGAAG;TC=19;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-154.78,-90.63,-135.29:100
-20 4655424 . G GA . PASS FR=0.5;HP=8;NF=13;NR=4;PP=100.0;SC=GTTCTTTAGAGAAAAAAAGAT;TC=30;TR=17 GT:GL:GQ 0/1:-186.33,-114.25,-152.75:100
-20 4668235 . AT A . PASS FR=0.5;HP=10;NF=12;NR=5;PP=100.0;SC=TAGGAAATAGATTTTTTTTTT;TC=33;TR=17 GT:GL:GQ 0/1:-91.71,-31.87,-60.05:100
-20 4673330 . C CTTT . PASS FR=0.5;HP=5;NF=6;NR=8;PP=100.0;SC=TGAAGAAAATCTTTTCTTCCT;TC=24;TR=14 GT:GL:GQ 0/1:-183.35,-23.94,-71.42:100
-20 4684173 . TG T . PASS FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=1;PP=100.0;SC=CAGGCACAGTTGCTCACGCCT;TC=17;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-81.87,-25.35,-94.89:100
-20 4691383 . CA C . PASS FR=1.0;HP=2;NF=14;NR=12;PP=100.0;SC=TGGGGTCATCCAAGCATGGCT;TC=29;TR=26 GT:GL:GQ 1/1:-259.65,-39.57,-19.54:100
-20 4692075 . C CA . PASS FR=0.5;HP=9;NF=5;NR=3;PP=95.0;SC=AGTAATTGGACAAAAAAAACA;TC=26;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-67.83,-34.9,-96.78:100
-20 4704696 . A ATG . PASS FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=ATATGTATATATGTGTGTGTA;TC=30;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-168.25,-105.64,-257.19:100
-20 4706654 . GTGCCATCA G . PASS FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=4;PP=100.0;SC=TTACAGGTGTGTGCCATCATG;TC=17;TR=11 GT:GL:GQ 1/1:-236.92,-30.58,-21.39:67
-20 4727159 . C CATTTTATTTT . PASS FR=1.0;HP=1;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=ATAGCATTTGCATTTTATTTT;TC=27;TR=6 GT:GL:GQ 1/1:-510.26,-402.24,-397.15:63
-20 4735780 . T TTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC,C . PASS FR=0.5,0.5;HP=3;NF=0,5;NR=3,16;PP=100.0,100.0;SC=CCTTTCTTTCTTTTCTTTCTT;TC=27;TR=3,21 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 4737530 . T TA . PASS FR=1.0;HP=1;NF=11;NR=14;PP=100.0;SC=TTAAATGTATTGAGGCTCATT;TC=26;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-245.38,-21.97,-3.97:100
-20 4737701 . T TTGA . PASS FR=1.0;HP=1;NF=12;NR=7;PP=100.0;SC=ACTTTCTGTCTTGACCTGTCT;TC=19;TR=19 GT:GL:GQ 1/1:-227.02,-18.69,-5.52:100
-20 4741155 . G GGA . PASS FR=1.0;HP=1;NF=5;NR=11;PP=100.0;SC=AACACACCAGGTGTGTCAAAA;TC=22;TR=16 GT:GL:GQ 1/1:-218.41,-31.08,-15.98:100
-20 4743693 . G GTTAA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=AGCCCAGGAGGTTAAGTCTGC;TC=16;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-225.23,-59.89,-50.88:75
-20 4743774 . A AAAATAAAT . PASS FR=1.0;HP=5;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=AAAAGGAGAAAAAATAAATAA;TC=16;TR=7 GT:GL:GQ 1/1:-319.93,-209.77,-203.54:78
-20 4748739 . A ACTAT . PASS FR=1.0;HP=1;NF=12;NR=7;PP=100.0;SC=TCTTTCACCAACTATTTTCAC;TC=23;TR=19 GT:GL:GQ 1/1:-501.66,-334.66,-319.16:100
-20 4761877 . T TG . PASS FR=0.5;HP=8;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=ACAGATATTTTGGGGGGGGCA;TC=23;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-97.23,-58.4,-90.76:100
-20 4768475 . A AAGGGACT . PASS FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=8;PP=100.0;SC=CAGGGGTCCAAAGGCACCTTA;TC=23;TR=15 GT:GL:GQ 1/1:-372.13,-36.56,-17.94:100
-20 4783543 . CATAT C . PASS FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=TATATATATACATATATATAT;TC=23;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-115.71,-29.18,-62.14:100
-20 4794428 . CGT C . PASS FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=CAGTGTGTGGCGTGTGTGTGT;TC=28;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-119.46,-68.74,-106.78:100
-20 4796034 . TACC T . PASS FR=0.5;HP=1;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=TATCTGAGGCTACCACCACCC;TC=27;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-222.6,-98.55,-189.77:100
-20 4802486 . G GCC . PASS FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=GACTGCCACAGCCTAGGCATC;TC=24;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-135.36,-38.11,-126.44:100
-20 4803072 . CT C . PASS FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=5;PP=100.0;SC=GTGCACGCAGCTGTTGAGAGG;TC=15;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-82.81,-37.85,-91.55:100
-20 4823348 . AT A . PASS FR=1.0;HP=8;NF=17;NR=7;PP=100.0;SC=AATATTTTCCATTTTTTTTGA;TC=32;TR=24 GT:GL:GQ 1/1:-298.64,-180.3,-160.97:100
-20 4850186 . GAC G . PASS FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=2;PP=49.0;SC=ATCTCCAAATGACACACACAC;TC=34;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-186.75,-165.14,-349.63:96
-20 4880132 . AGCTCAATGCCTTCTGC A . PASS FR=1.0;HP=1;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=CAAACGGCGCAGCTCAATGCC;TC=17;TR=7 GT:GL:GQ 1/1:-255.52,-55.88,-53.61:44
-20 4883735 . G GGA . PASS FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=18;PP=100.0;SC=GGTGAAAAGAGTAATTCTAAA;TC=34;TR=31 GT:GL:GQ 1/1:-361.9,-346.05,-342.67:97
-20 4886527 . GA G . PASS FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=ACTCTACTGAGAAGAACAGAT;TC=19;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-166.67,-86.72,-123.24:100
-20 4892485 . AATTT A . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=7;PP=100.0;SC=TTTATTTATGAATTTATTTAT;TC=34;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-148.07,-23.75,-121.86:100
-20 4922648 . CTAAACTAACT C . PASS FR=0.5;HP=5;NF=1;NR=10;PP=100.0;SC=TCTATATTTTCTAAACTAACT;TC=33;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-284.06,-37.14,-228.78:100
-20 4942899 . C CA . PASS FR=0.5;HP=7;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=ACCCCCGCCCCAAAAAAACAG;TC=28;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-99.42,-46.78,-95.55:100
-20 4947451 . G GTTTGA . PASS FR=0.5;HP=4;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=ACTTTTGATAGTTTTACACAC;TC=18;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-283.81,-185.62,-217.52:100
-20 4947582 . TG T . PASS FR=0.5;HP=4;NF=9;NR=4;PP=100.0;SC=GATTACATGATGGGGAGCAGG;TC=22;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-139.84,-55.72,-119.49:100
-20 4947775 . T TA . PASS FR=0.5;HP=6;NF=8;NR=4;PP=100.0;SC=GAAATCTAAATAAACACAGGG;TC=24;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-128.76,-21.0,-91.02:100
-20 4949766 . CTT C . PASS FR=0.5;HP=3;NF=8;NR=4;PP=100.0;SC=GAGTTTCCCTCTTGTTACCCA;TC=25;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-147.72,-32.95,-112.56:100
-20 4954109 . G GGACTT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=8;PP=100.0;SC=ATGGCTGGAAGGACTTAACTA;TC=30;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-203.74,-23.32,-169.48:100
-20 4965192 . C CT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=GAGCAAGACTCTGTCTCAAAA;TC=26;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-134.47,-59.87,-111.38:100
-20 4969015 . AG A . PASS FR=1.0;HP=8;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=TGGGAAACCGAGGGGGGGCCA;TC=12;TR=9 GT:GL:GQ 1/1:-67.79,-12.99,-5.52:61
-20 4970270 . C CTTAATAT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=TGCAGTGAGCCATGATCTTGC;TC=22;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-247.44,-164.56,-281.24:100
-20 4972366 . TCA TCACACA,T . PASS FR=0.5,0.5;HP=2;NF=1,0;NR=1,2;PP=100.0,49.0;SC=AGACTCCGTTTCACACACACA;TC=15;TR=2,2 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:97
-20 4979252 . ATGAGG A . PASS FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=2;PP=100.0;SC=AAATGAATTAATGAGGTGAGG;TC=24;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-146.48,-63.04,-172.38:100
-20 4985646 . A AAAAT . PASS FR=0.5;HP=4;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=CTCCGTCTCAAAAATAAATAA;TC=22;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-69.57,-20.73,-73.7:100
-20 4987193 . T TTTTA . PASS FR=1.0;HP=3;NF=5;NR=7;PP=100.0;SC=GTAAAAGCCATTTTATTTATT;TC=33;TR=12 GT:GL:GQ 1/1:-198.93,-19.38,-8.29:93
-20 5003823 . C CA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=2;NR=1;PP=69.0;SC=CTCAGCCTCCCAGTAGCTGGG;TC=5;TR=3 GT:GL:GQ 1/1:-35.46,-12.52,-9.15:55
-20 5006924 . GTATATATATGTGTA G . PASS FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=ATGTATATATGTATATATATG;TC=17;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-102.23,-17.74,-69.04:100
-20 5019857 . C CT . PASS FR=1.0;HP=1;NF=5;NR=1;PP=100.0;SC=CACCCCTGCACTCCAGCCTGG;TC=10;TR=6 GT:GL:GQ 1/1:-78.84,-38.79,-34.59:51
-20 5021323 . T TC . PASS FR=1.0;HP=10;NF=8;NR=5;PP=100.0;SC=CTTTTTTTTTTTCAATGGCAA;TC=18;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-164.3,-19.64,-6.44:82
-20 5021471 . G GA . PASS FR=1.0;HP=1;NF=11;NR=14;PP=100.0;SC=ACATAATGCTGGTTAAAGAGG;TC=33;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-406.51,-306.39,-293.23:100
-20 5033824 . G GTATA . PASS FR=1.0;HP=8;NF=6;NR=6;PP=100.0;SC=CCAAAAAAAAGTATATATATA;TC=19;TR=12 GT:GL:GQ 1/1:-293.31,-92.78,-80.65:100
-20 5034013 . GGCAT G . PASS FR=1.0;HP=1;NF=8;NR=10;PP=100.0;SC=ATGACAGCCAGGCATGGGGGC;TC=24;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-275.61,-34.13,-17.26:100
-20 5044461 . A AAATTTTTAT . PASS FR=1.0;HP=4;NF=13;NR=12;PP=100.0;SC=GTTAACTTGGAAAAATTTCTA;TC=29;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-660.59,-158.53,-137.22:100
-20 5058110 . G GGGGGCT . PASS FR=1.0;HP=2;NF=6;NR=6;PP=100.0;SC=CAACATTTTGGGAGGTGGGTG;TC=14;TR=12 GT:GL:GQ 1/1:-206.1,-87.92,-82.33:69
-20 5062840 . AAAG A . PASS FR=1.0;HP=4;NF=12;NR=4;PP=100.0;SC=AATTTTTTAAAAAGAAGAAGA;TC=21;TR=16 GT:GL:GQ 1/1:-217.23,-55.74,-43.97:99
-20 5079870 . AAATAAATAAATCAATC A . PASS FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=ATAAATAAATAAATAAATAAA;TC=24;TR=10 GT:GL:GQ 1/0:-419.18,-202.82,-208.38:27
-20 5094493 . T TA . PASS FR=1.0;HP=1;NF=7;NR=16;PP=100.0;SC=AAAATGAACTTACTACTGGAC;TC=26;TR=23 GT:GL:GQ 1/1:-300.98,-148.38,-131.87:100
-20 5097837 . AC A . PASS FR=1.0;HP=1;NF=15;NR=5;PP=100.0;SC=TAAAGGTTATACGCCTAACTT;TC=25;TR=20 GT:GL:GQ 1/1:-243.65,-32.97,-15.65:100
-20 5100990 . AAG A . PASS FR=1.0;HP=1;NF=10;NR=6;PP=100.0;SC=TTGCAGCCTGAAGAGAGTACA;TC=18;TR=16 GT:GL:GQ 1/1:-198.64,-18.46,-5.29:100
-20 5105482 . C CATTTTAGG . PASS FR=1.0;HP=2;NF=6;NR=11;PP=100.0;SC=GTTCAGACCACATGTTATCCA;TC=22;TR=17 GT:GL:GQ 1/1:-471.45,-181.5,-164.38:100
-20 5118209 . A AT . PASS FR=0.5;HP=8;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=TTTAAGTCTTATTTTTTCAAA;TC=16;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-55.51,-21.15,-68.35:100
-20 5145860 . A AC . PASS FR=0.5;HP=5;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=TTTTTTGGAAACCCCCGTATT;TC=29;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-81.29,-28.9,-130.37:100
-20 5150896 . G GC . PASS FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=5;PP=100.0;SC=ACCTCGCTGTGCCCAGAGGAG;TC=17;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-79.22,-17.13,-53.13:100
-20 5156258 . CCT C . PASS FR=0.5093;HP=2;NF=6;NR=6;PP=100.0;SC=ATGGTGAAACCCTGTCTCTAC;TC=16;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-101.9,-26.13,-29.44:17
-20 5156432 . AAAAC A . PASS FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=ACTCCATCTCAAAACAAACAA;TC=23;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-98.71,-15.69,-97.38:100
-20 5173014 . C CA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=8;NR=13;PP=100.0;SC=GAAGGGGGGTCTAGGAAGCCG;TC=22;TR=21 GT:GL:GQ 1/1:-250.84,-61.97,-47.15:100
-20 5178081 . C CCT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=AGAGGTCAGCCGTGTCTGCCC;TC=22;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-193.35,-72.27,-102.13:100
-20 5181165 . C CA . PASS FR=0.5;HP=8;NF=1;NR=6;PP=91.0;SC=TTAGACACAACAAAAAAGAGA;TC=22;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-61.45,-29.38,-90.08:100
-20 5187401 . A AC . PASS FR=0.5;HP=6;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=TTTTCATGTCACCCCCGAGGT;TC=17;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-139.03,-104.99,-121.15:73
-20 5187831 . G GAATC . PASS FR=0.5;HP=5;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=TGAAAGGAAAGAAGCATGTTT;TC=22;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-144.73,-26.29,-132.63:100
-20 5192127 . A AATT . PASS FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=7;PP=100.0;SC=AATGTGTTAAAATTATATAAG;TC=32;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-228.5,-119.37,-283.27:100
-20 5212592 . TA T . PASS FR=1.0;HP=9;NF=20;NR=10;PP=100.0;SC=CCTGCCATATTAAAAAAAAAC;TC=39;TR=30 GT:GL:GQ 1/1:-191.03,-64.37,-41.93:100
-20 5223122 . TA T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=GAATAAGACCTAGTATTTGCT;TC=11;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-63.8,-25.4,-69.29:100
-20 5234499 . AAC A . PASS FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=1;PP=25.0;SC=GTGCCTTCACAACACACACAC;TC=26;TR=2 GT:GL:GQ 0/1:-75.14,-59.09,-216.84:72
-20 5236854 . A AATTAT . PASS FR=1.0;HP=1;NF=17;NR=9;PP=100.0;SC=AAAAGACATGAATTATCATTA;TC=29;TR=26 GT:GL:GQ 1/1:-427.74,-26.55,-5.07:100
-20 5240296 . CT C . PASS FR=0.5;HP=1;NF=7;NR=6;PP=100.0;SC=AATTGATACACTACAATGGCC;TC=39;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-220.75,-129.27,-297.86:100
-20 5242946 . A AC . PASS FR=0.5;HP=3;NF=6;NR=5;PP=100.0;SC=AGCTGGAACCACTGTTGTGGA;TC=22;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-141.29,-37.29,-109.65:100
-20 5246342 . GC G . PASS FR=0.5;HP=7;NF=6;NR=8;PP=100.0;SC=AACCGAGACAGCCCCCCCTTT;TC=21;TR=14 GT:GL:GQ 0/1:-107.74,-25.34,-35.96:49
-20 5247531 . T TTGCAGTAGAGAAACTCCC . PASS FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=TTGCAGGTTATTGCAGTAGAG;TC=31;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-296.8,-101.13,-189.63:100
-20 5251109 . ACTCTCTCTCTCTCTCTCT A . PASS FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=2;PP=37.0;SC=CATCCAGTGTACTCTCTCTCT;TC=27;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-322.05,-299.54,-356.33:100
-20 5251154 . G GTGTA . PASS FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=CTCTGTGTGTGTGTATGTGTG;TC=19;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-297.98,-257.24,-280.47:100
-20 5256228 . GAAAAAC G . PASS FR=0.5;HP=5;NF=8;NR=3;PP=100.0;SC=CAAATGTTTTGAAAAACAAAA;TC=29;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-159.47,-21.9,-134.38:100
-20 5256836 . CT C . PASS FR=0.5;HP=10;NF=4;NR=7;PP=58.0;SC=TCTCAACTCACTTTTTTTTTT;TC=23;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-145.3,-121.72,-154.45:100
-20 5260631 . G GA . PASS FR=0.5;HP=9;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=TTTAATGAAGGAAAAAAAAAT;TC=25;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-133.97,-86.93,-109.55:100
-20 5261161 . ACT A . PASS FR=0.5;HP=2;NF=9;NR=8;PP=100.0;SC=CTTGAATGAAACTTATCTAAC;TC=33;TR=17 GT:GL:GQ 0/1:-246.04,-189.54,-319.81:100
-20 5275657 . CAAAATAACTATTACAAATAACA C . PASS FR=0.5;HP=6;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=TCAAACATAACAAAATAACTA;TC=27;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-135.83,-52.75,-276.31:100
-20 5277471 . C CCTT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=11;NR=5;PP=100.0;SC=GTATCCATGTCCTAGGGTACA;TC=27;TR=16 GT:GL:GQ 0/1:-278.16,-87.4,-130.16:100
-20 5278336 . TA T . PASS FR=0.5;HP=4;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=TTGAACTCTTTAAAAGTTTGA;TC=24;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-132.29,-83.79,-178.99:100
-20 5280465 . TTG T . PASS FR=0.5;HP=4;NF=6;NR=8;PP=100.0;SC=GATGGGGTTTTTGGCCATGTT;TC=30;TR=14 GT:GL:GQ 0/1:-161.14,-49.68,-168.09:100
-20 5280839 . T TATA . PASS FR=0.5;HP=1;NF=9;NR=3;PP=100.0;SC=ACCACAAATGTATAATACAAA;TC=30;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-228.47,-89.38,-201.59:100
-20 5285786 . T TG . PASS FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=2;PP=21.0;SC=GGCTAATCAGTTCACTCTAAG;TC=24;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-80.46,-64.62,-184.45:71
-20 5289619 . GA G . PASS FR=0.5;HP=1;NF=9;NR=5;PP=100.0;SC=GAAGATCTAGGATGAAGCTGG;TC=22;TR=14 GT:GL:GQ 0/1:-219.59,-148.82,-190.02:100
-20 5291220 . TGATCA T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=6;PP=100.0;SC=GTTTAGAACCTGATCAGAGAA;TC=27;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-284.71,-179.16,-294.64:100
-20 5291304 . G GACTTATGGGGAGCTGGGGTATAAATACCCCAGCTCCCTCCT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=CCTCATCAATGACCTCCCACC;TC=8;TR=2 GT:GL:GQ 0/1:-488.84,-441.13,-506.41:71
-20 5293792 . ATG A . PASS FR=0.5;HP=3;NF=6;NR=12;PP=100.0;SC=TACAATTATTATGTGTCAATT;TC=42;TR=18 GT:GL:GQ 0/1:-201.09,-30.39,-231.82:100
-20 5303337 . CAGCT C . PASS FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=7;PP=100.0;SC=AAATGTCACACAGCTAGCTGG;TC=32;TR=14 GT:GL:GQ 0/1:-273.85,-111.21,-258.62:100
-20 5313928 . TA T . PASS FR=0.5;HP=10;NF=9;NR=8;PP=100.0;SC=ATACAGTTGATAAAAAAAAAC;TC=39;TR=17 GT:GL:GQ 0/1:-100.8,-36.94,-107.23:100
-20 5316589 . GT G . PASS FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=11;PP=100.0;SC=GAATATCTGGGTAAAATTTAA;TC=22;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-227.4,-66.98,-52.55:100
-20 5320851 . AT A . PASS FR=0.5;HP=6;NF=5;NR=10;PP=100.0;SC=ATCTCAATAGATTTTTTAAAA;TC=39;TR=15 GT:GL:GQ 0/1:-177.77,-103.88,-250.39:100
-20 5323468 . GA G . PASS FR=0.5;HP=10;NF=2;NR=4;PP=85.0;SC=GGCAACAAAAGAAAAAATAGA;TC=23;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-61.27,-31.53,-121.44:100
-20 5326511 . G GT . PASS FR=0.5;HP=9;NF=11;NR=2;PP=100.0;SC=TTGATTCAAAGTTTTTTTTTA;TC=29;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-178.07,-139.61,-153.82:64
-20 5326660 . T TA . PASS FR=0.5;HP=8;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=CTTTATCCTTTAAAAAAAATC;TC=26;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-181.43,-128.15,-159.02:100
-20 5328799 . CA C . PASS FR=1.0;HP=4;NF=10;NR=6;PP=100.0;SC=AACCACCTTCCAAAATGTGGA;TC=20;TR=16 GT:GL:GQ 1/1:-179.33,-21.23,-7.37:100
-20 5351875 . T TACACACAC . PASS FR=0.5;HP=6;NF=1;NR=1;PP=38.0;SC=ATCTTAAAAATACACACACAC;TC=12;TR=2 GT:GL:GQ 0/1:-48.31,-20.86,-63.23:100
-20 5354510 . G GGC . PASS FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=CCTCCTCCCTGCAGAGCTCCT;TC=28;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-148.18,-38.3,-173.54:100
-20 5373349 . A AATTT . PASS FR=0.5;HP=6;NF=1;NR=2;PP=96.0;SC=CTAATTTTTTAATTTTTTTTT;TC=20;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-100.6,-64.12,-96.6:100
-20 5390447 . C CA . PASS FR=0.5;HP=6;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=CATTAGCATACAAAAACCATC;TC=26;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-88.65,-28.46,-120.44:100
-20 5408475 . AAAAC A . PASS FR=0.5;HP=4;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=CTCTGTCTCAAAAACAAACAA;TC=29;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-128.94,-29.02,-144.52:100
-20 5410361 . G GA . PASS FR=1.0;HP=9;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=CTGGGTTGGGGAAAAAAAAAG;TC=25;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-119.78,-34.18,-19.33:100
-20 5419440 . CTCCCTGTG C . PASS FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=TGTTGTTCCCCTCCCTGTGTC;TC=19;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-128.97,-30.52,-125.82:100
-20 5432204 . A AG . PASS FR=0.5;HP=8;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=AAAGAAAGAGAAAAAAAAAGG;TC=19;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-83.51,-76.05,-116.49:100
-20 5432394 . G GT . PASS FR=1.0;HP=5;NF=9;NR=14;PP=100.0;SC=TTCCTCAATTGAAAAATCTTA;TC=26;TR=23 GT:GL:GQ 1/1:-328.05,-211.91,-196.14:100
-20 5435136 . GAGAAAA G . PASS FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=6;PP=44.0;SC=AAAAAAAGGGGAGAAAAAGAA;TC=24;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-190.59,-169.15,-271.82:96
-20 5435153 . A ATTT . PASS FR=0.5;HP=8;NF=4;NR=10;PP=100.0;SC=AGAAAAAAAAATTTTAATGTT;TC=22;TR=14 GT:GL:GQ 0/1:-325.96,-275.2,-333.88:100
-20 5435908 . G GTTAAT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=2;PP=100.0;SC=ACCAGGCCCAGTTATTTTTTG;TC=16;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-176.12,-112.78,-176.63:100
-20 5443418 . A ACAGGGGCAC . PASS FR=0.5;HP=4;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=GCTTTGTCCCACAGCCTGATG;TC=15;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-94.87,-42.4,-160.11:100
-20 5443724 . C CT . PASS FR=0.5;HP=3;NF=6;NR=4;PP=38.0;SC=GTTACCTTTCCCCTGAGATGC;TC=20;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-163.73,-143.91,-199.73:89
-20 5452897 . G GA . PASS FR=0.5;HP=10;NF=2;NR=2;PP=26.0;SC=TCAGTCAGAAGAAAAAAAATT;TC=15;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-34.37,-17.3,-53.75:77
-20 5460271 . C CA . PASS FR=0.5;HP=10;NF=2;NR=2;PP=67.0;SC=ACCCCTGTCTCAAAAAAAAAA;TC=21;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-56.83,-30.33,-56.83:100
-20 5473577 . A AGT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=8;PP=100.0;SC=AACTGAGCAGAGTTCCTTTTT;TC=29;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-165.26,-86.94,-217.65:100
-20 5475853 . CTTATTTAT CTTATTTATTTAT,C . PASS FR=0.5,0.5;HP=4;NF=1,1;NR=2,2;PP=100.0,100.0;SC=GAAGGCTCTTCTTATTTATTT;TC=18;TR=3,3 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 5485434 . C CT . PASS FR=0.5001;HP=10;NF=4;NR=1;PP=63.0;SC=TTTTTATCTTCTTTTTTTTCC;TC=9;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-37.99,-12.58,-20.26:36
-20 5518456 . C CG . PASS FR=0.5;HP=7;NF=7;NR=6;PP=100.0;SC=GTGACAAATGCGGGGGGTCTT;TC=27;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-115.32,-28.55,-76.08:100
-20 5546352 . A AAG . PASS FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=12;PP=100.0;SC=AAGTAGTCACAAGCTGTGATT;TC=26;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-322.1,-20.79,0.0:100
-20 5596481 . TTATG T . PASS FR=1.0;HP=2;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=TGCTACTGGTTTATGTATGTA;TC=20;TR=8 GT:GL:GQ 1/1:-167.17,-32.77,-22.47:86
-20 5596891 . ATGTGTGTG A . PASS FR=1.0;HP=2;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=AATTTGGGGTATGTGTGTGTG;TC=23;TR=7 GT:GL:GQ 1/1:-241.36,-45.12,-34.38:90
-20 5600458 . A AG . PASS FR=1.0;HP=2;NF=3;NR=3;PP=100.0;SC=TCTTGACCTGAGTGATACACC;TC=16;TR=6 GT:GL:GQ 1/1:-146.08,-65.05,-55.59:79
-20 5613790 . GA G . PASS FR=1.0;HP=4;NF=11;NR=9;PP=100.0;SC=CATGATTTCTGAAAACAAGCT;TC=26;TR=20 GT:GL:GQ 1/1:-222.44,-43.9,-26.57:100
-20 5624959 . C CCTCCTTACCCT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=AACTTGTCCACCTCCATTACC;TC=28;TR=2 GT:GL:GQ 0/1:-225.26,-176.16,-303.27:100
-20 5627592 . AT A . PASS FR=0.5;HP=6;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=TCTCAAAAAAATAATAAAGTT;TC=19;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-112.89,-28.55,-78.51:100
-20 5629324 . T TTAC . PASS FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=3;PP=100.0;SC=ATTATTACTATTATTATTATT;TC=26;TR=6 GT:GL:GQ 1/0:-227.05,-75.82,-72.8:100
-20 5635153 . TGGAATATGAAAGAG T . PASS FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=11;PP=100.0;SC=CAAGCCTGTTTGGAATATGAA;TC=27;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-490.0,-56.65,-38.89:100
-20 5635246 . T TTGTGTG,TTGTGTGTG . PASS FR=0.5,0.5;HP=1;NF=2,0;NR=2,3;PP=100.0,100.0;SC=AAAATGAATATTGTGTGTGTG;TC=22;TR=4,3 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 5644716 . GTCTCTCTCTCTC G . PASS FR=1.0;HP=1;NF=1;NR=6;PP=100.0;SC=ATGAGACCTCGTCTCTCTCTC;TC=22;TR=7 GT:GL:GQ 1/1:-261.18,-61.24,-58.02:52
-20 5654462 . C CGTGTGTGTGTGTGT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=TATACATATACGTGTGTGTGT;TC=16;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-129.11,-28.26,-136.2:100
-20 5654661 . AAAAAAATTTTTTTTGCTT A . PASS FR=0.5;HP=6;NF=7;NR=3;PP=100.0;SC=ATTTTTTGCCAAAAAAATTTT;TC=21;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-264.68,-158.41,-268.38:100
-20 5655925 . ACG A . PASS FR=0.5047;HP=2;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=TTGCATGCGCACGCGCGCACA;TC=34;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-234.34,-106.46,-110.43:20
-20 5674501 . T TTTTG . PASS FR=0.5;HP=4;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=AGATTTAGATTTTTGTTTGTT;TC=22;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-64.3,-21.33,-64.69:100
-20 5691054 . A AC . PASS FR=0.5;HP=6;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=GTATAGTGAGACCCCCCATCT;TC=18;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-137.75,-89.82,-120.86:100
-20 5696589 . AAAG A . PASS FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=9;PP=100.0;SC=AGAAAACCATAAAGAAGAGAA;TC=35;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-142.07,-32.31,-238.04:100
-20 5706639 . T TA . PASS FR=0.5;HP=9;NF=5;NR=2;PP=98.0;SC=TTGTCTCAATTAAAAAAAAAT;TC=31;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-60.75,-27.2,-75.24:100
-20 5707109 . A ATTTTTCCC . PASS FR=0.5;HP=7;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=TGCCCAGCTGATTTTTTTAAA;TC=15;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-95.63,-40.43,-104.52:100
-20 5740635 . T TAC,TACAC . PASS FR=0.5,0.5;HP=2;NF=3,1;NR=7,4;PP=100.0,100.0;SC=TGTATTTTTATACACACACAC;TC=23;TR=10,5 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 5747768 . ATTTTC ATTTTCTTTTC,A . PASS FR=0.5,0.5;HP=4;NF=1,4;NR=1,1;PP=100.0,100.0;SC=CTCCATTCACATTTTCTTTTC;TC=17;TR=2,5 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 5754003 . A AT . PASS FR=0.5;HP=9;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=AGAGAGTGGAATTTTTTTTTG;TC=33;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-69.42,-30.04,-87.94:100
-20 5762289 . A AT . PASS FR=0.5;HP=8;NF=2;NR=3;PP=95.0;SC=CTGCCCAGCTATTTTTTTGTA;TC=13;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-43.82,-10.94,-28.53:79
-20 5767540 . AGATCATTT A . PASS FR=1.0;HP=2;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=TTCTCAAGCCAGATCATTTGA;TC=16;TR=11 GT:GL:GQ 1/1:-333.85,-224.08,-215.75:69
-20 5768941 . AGTT A . PASS FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=9;PP=100.0;SC=TATATTCAGTAGTTGTTGTTT;TC=21;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-159.07,-13.83,-29.97:73
-20 5771896 . CAAATAAATA C . PASS FR=1.0;HP=3;NF=11;NR=5;PP=100.0;SC=AAAATCTTAGCAAATAAATAA;TC=26;TR=16 GT:GL:GQ 1/1:-433.86,-58.29,-43.98:62
-20 5778212 . AAAG A . PASS FR=1.0;HP=5;NF=6;NR=12;PP=100.0;SC=CCATCTCAAAAAAGAAGAAGA;TC=23;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-251.53,-37.12,-21.87:100
-20 5781503 . GCGTA G . PASS FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=6;PP=100.0;SC=GTGTGTGTGTGCGTATGTCTA;TC=23;TR=15 GT:GL:GQ 1/1:-450.31,-256.77,-243.2:93
-20 5788895 . C CAGCCTGGGTGACAG . PASS FR=1.0;HP=1;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=CACTGCACTCCAGCAAGACTC;TC=11;TR=9 GT:GL:GQ 1/1:-304.26,-23.03,-12.43:73
-20 5798352 . CTGGCATTA C . PASS FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=3;PP=100.0;SC=CTGGCTGTGCCTGGCATTATG;TC=29;TR=4 GT:GL:GQ 1/0:-390.33,-302.72,-305.99:100
-20 5798359 . T TGC . PASS FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=6;PP=100.0;SC=TGCCTGGCATTATGACTTAGT;TC=26;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-390.33,-366.98,-362.46:100
-20 5807781 . T TG . PASS FR=1.0;HP=3;NF=7;NR=3;PP=100.0;SC=TGAGTGGGCGTGGCACCCACA;TC=10;TR=10 GT:GL:GQ 1/1:-98.15,-11.06,-4.14:57
-20 5808542 . C CT . PASS FR=1.0;HP=3;NF=16;NR=16;PP=100.0;SC=ATCATTCACTCTTGTGGGTAG;TC=33;TR=32 GT:GL:GQ 1/1:-408.08,-203.57,-182.32:100
-20 5808967 . T TGTGTAGTAG . PASS FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=18;PP=100.0;SC=CTTAGAACAGTGTGATAGGTC;TC=28;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-678.96,-93.79,-70.92:100
-20 5809144 . TTGA T . PASS FR=1.0;HP=1;NF=10;NR=16;PP=100.0;SC=GAGTCATTTCTTGATGACTCC;TC=34;TR=26 GT:GL:GQ 1/1:-408.43,-70.02,-46.73:100
-20 5809747 . CCTGGGCTCA C . PASS FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=15;PP=100.0;SC=GGTCTCAACTCCTGGGCTCAA;TC=33;TR=28 GT:GL:GQ 1/1:-583.71,-71.8,-56.82:48
-20 5810527 . G GA . PASS FR=1.0;HP=9;NF=9;NR=9;PP=100.0;SC=TCTTCTTTAGGAAAAAAAAAC;TC=26;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-296.92,-216.99,-203.12:100
-20 5820132 . A AAGATAGAT,AAGATAGATAGAT . PASS FR=0.5,0.5;HP=2;NF=4,2;NR=2,6;PP=100.0,100.0;SC=ATTAGATAGAAAGATAGATAG;TC=36;TR=6,8 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 5822610 . A AAAG . PASS FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=GACTATGGAGAAAGAGAACAT;TC=30;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-160.25,-33.5,-176.54:100
-20 5830758 . C CAATAATAAT . PASS FR=1.0;HP=2;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=GACCCCGTCTCAATAATAATA;TC=8;TR=4 GT:GL:GQ 1/1:-112.77,-19.78,-14.93:60
-20 5848219 . C CAAAAT . PASS FR=1.0;HP=7;NF=10;NR=13;PP=100.0;SC=ATTAAACACTCAAAAAAATAA;TC=29;TR=23 GT:GL:GQ 1/1:-431.75,-125.0,-103.09:100
-20 5848530 . A AAT . PASS FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=10;PP=100.0;SC=ATATATATAGAATATATATAT;TC=33;TR=23 GT:GL:GQ 1/1:-409.72,-328.74,-317.3:96
-20 5850230 . A AT . PASS FR=1.0;HP=6;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=TAATTTTTGCATTTTTTGTTT;TC=22;TR=2 GT:GL:GQ 1/1:-134.01,-105.23,-98.33:86
-20 5854908 . A AATTTTATTTT . PASS FR=1.0;HP=3;NF=3;NR=7;PP=100.0;SC=CATATACTTTAATTTTATTTT;TC=28;TR=10 GT:GL:GQ 1/1:-352.01,-27.1,-12.2:100
-20 5856355 . CTAAA C . PASS FR=1.0;HP=4;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=GACCCTATTTCTAAATAAATA;TC=15;TR=4 GT:GL:GQ 1/1:-57.0,-6.23,-2.76:42
-20 5860647 . TGAG T . PASS FR=1.0;HP=4;NF=8;NR=6;PP=100.0;SC=AGAAAGAAAATGAGGAGCGAA;TC=18;TR=14 GT:GL:GQ 1/1:-182.28,-15.91,-4.13:99
-20 5879792 . CAA C . PASS FR=1.0;HP=10;NF=14;NR=15;PP=100.0;SC=ACAATAACATCAAAAAAAAAA;TC=39;TR=29 GT:GL:GQ 1/1:-170.66,-28.34,-5.76:100
-20 5898748 . GAA G . PASS FR=1.0;HP=2;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=AGCCAAGATTGAACTCCATTG;TC=13;TR=10 GT:GL:GQ 1/1:-132.95,-97.25,-91.93:66
-20 5900669 . G GC . PASS FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=2;PP=100.0;SC=CATGACAGATGCATTTCCCTG;TC=15;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-72.42,-12.46,-72.17:100
-20 5911588 . TCA T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=1;PP=100.0;SC=CTGGCAAATCTCACACACACA;TC=19;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-115.11,-26.04,-76.51:100
-20 5923828 . CAGAGAGAATACATGCTTA C . PASS FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=TGTATTCTTCCAGAGAGAATA;TC=22;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-297.99,-115.43,-361.46:100
-20 5928403 . T TA . PASS FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=ACCTAGGTGCTTTGAAACACT;TC=18;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-52.7,-18.59,-121.61:100
-20 5930573 . A AG . PASS FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=ACAGGTGATTAGGGTGTGGAG;TC=26;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-121.38,-46.04,-144.61:100
-20 5932104 . C CT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=TCTTTATTTACTTGTATACTT;TC=20;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-138.34,-48.83,-107.16:100
-20 5934084 . GGTGT GGT,G . PASS FR=0.5,0.5;HP=3;NF=1,2;NR=3,2;PP=100.0,100.0;SC=TCTCATGAGGGGTGTGTGTGT;TC=32;TR=4,4 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 5938650 . A AT . PASS FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=TTTTCCTTAAATTTCTTTTTT;TC=36;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-182.01,-137.8,-289.15:100
-20 5939638 . G GT . PASS FR=0.5;HP=7;NF=8;NR=7;PP=100.0;SC=ATTAGTGTCTGTTTTTTACCT;TC=37;TR=15 GT:GL:GQ 0/1:-244.24,-166.31,-240.23:100
-20 5946414 . TTTTACTTCTTAGAGTATGC T . PASS FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=TAAGTGCTGGTTTTACTTCTT;TC=34;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-213.07,-102.23,-466.92:100
-20 5948421 . CATT C . PASS FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=8;PP=100.0;SC=CTAGTTGAGTCATTGTAGGGA;TC=25;TR=14 GT:GL:GQ 0/1:-180.5,-26.28,-114.93:100
-20 5958367 . TATA T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=12;PP=100.0;SC=TAAATCAGGATATAATAATAC;TC=28;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-168.03,-21.02,-138.69:100
-20 5958971 . AT A . PASS FR=0.5;HP=8;NF=7;NR=10;PP=100.0;SC=ATTTGTGATCATTTTTTTTAA;TC=36;TR=17 GT:GL:GQ 0/1:-190.15,-122.85,-187.1:100
-20 5972522 . TC T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=8;PP=100.0;SC=AGTTTTCATCTCTTCAGCTTC;TC=35;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-138.05,-67.95,-261.75:100
-20 5974701 . T TTTTG . PASS FR=0.5;HP=6;NF=12;NR=8;PP=100.0;SC=TTAGCTTGATTTTTTTCAGCT;TC=40;TR=20 GT:GL:GQ 0/1:-282.01,-46.13,-199.33:100
-20 5979818 . CTA C . PASS FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=2;PP=100.0;SC=CACACACACACTATATAGAGT;TC=23;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-148.54,-97.12,-217.3:100
-20 5979861 . T TAG . PASS FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=6;PP=100.0;SC=GTATATATACTAGTGTGTATA;TC=23;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-206.33,-148.87,-246.11:100
-20 5979921 . ATATATATTATATATAC A . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=TCTATAAAGTATATATATTAT;TC=15;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-143.6,-52.22,-114.36:100
-20 5980041 . CTATA C . PASS FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=TATATATACACTATATATAGT;TC=35;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-130.29,-26.74,-240.87:100
-20 5982833 . CTT C . PASS FR=0.5;HP=5;NF=2;NR=5;PP=100.0;SC=GCAATGCACTCTTTTGCTTAC;TC=22;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-154.07,-87.47,-142.2:100
-20 5984269 . CTT C . PASS FR=0.5;HP=5;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=AATCCTTTCTCTTTTCACGTT;TC=31;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-161.92,-47.17,-162.99:100
-20 5986173 . A ATAATT . PASS FR=0.5;HP=3;NF=9;NR=5;PP=100.0;SC=AAAATTTAAAATAAAAACTAT;TC=31;TR=14 GT:GL:GQ 0/1:-275.95,-89.41,-205.85:100
-20 5997120 . T TGTGTGA . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=TGTGTGTGTGTGAGTTTTCTT;TC=20;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-128.89,-41.21,-139.69:100
-20 5999929 . G GTTA . PASS FR=0.5;HP=5;NF=7;NR=6;PP=100.0;SC=CTTTTGACCAGTTTTTAAGTT;TC=34;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-145.72,-26.46,-192.55:100
-20 6013970 . C CG . PASS FR=0.5;HP=4;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=TTAGTAGAGACGGGGTTTCAC;TC=18;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-76.07,-30.4,-70.18:100
-20 6019907 . TTGTGTGTGTGTGTGTG T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=GCAGTTTTGTTTGTGTGTGTG;TC=27;TR=2 GT:GL:GQ 0/1:-146.39,-89.3,-170.65:100
-20 6052252 . CT C . PASS FR=1.0;HP=2;NF=5;NR=9;PP=100.0;SC=ATCCCCAGCCCTTCCTGGCTT;TC=21;TR=14 GT:GL:GQ 1/1:-166.42,-15.59,-2.3:100
-20 6054897 . T TG . PASS FR=1.0;HP=3;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=TGGGCAAGGCTGGGAAGGAAG;TC=16;TR=11 GT:GL:GQ 1/1:-170.6,-33.42,-22.33:90
-20 6056042 . T TA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=8;NR=17;PP=100.0;SC=ACATCAAGTATATACGGTACA;TC=29;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-301.61,-48.56,-28.73:100
-20 6163149 . CATTT C . PASS FR=1.0;HP=1;NF=11;NR=10;PP=100.0;SC=AACCTCTGAGCATTTATTTCA;TC=24;TR=21 GT:GL:GQ 1/1:-265.47,-16.86,-0.92:100
-20 6169158 . C CT . PASS FR=1.0;HP=1;NF=11;NR=21;PP=100.0;SC=AATTGCAAGACCTTAAGAACC;TC=38;TR=32 GT:GL:GQ 1/1:-377.27,-55.22,-28.98:100
-20 6186522 . G GC . PASS FR=1.0;HP=6;NF=10;NR=10;PP=100.0;SC=TAAAAAATGTGTTTTTAATCA;TC=21;TR=20 GT:GL:GQ 1/1:-309.42,-177.87,-163.8:100
-20 6186628 . C CA . PASS FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=12;PP=100.0;SC=TTCATCACCTCAAACATTTAT;TC=33;TR=17 GT:GL:GQ 0/1:-173.72,-30.0,-131.16:100
-20 6189872 . C CCTT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=10;PP=100.0;SC=CTTCCTCCCTCCTTTCCCTCT;TC=26;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-217.8,-111.28,-184.18:100
-20 6190124 . C CTT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=4;PP=92.0;SC=TCCTGCCTCTCTCTTTCCTCC;TC=16;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-129.79,-96.5,-151.55:100
-20 6190921 . A AT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=CCATAAGTACATTAAAAAAAA;TC=24;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-121.19,-85.53,-104.7:86
-20 6202427 . C CT . PASS FR=1.0;HP=6;NF=6;NR=13;PP=100.0;SC=GAAATCCTTTCTTTCCCCCTA;TC=20;TR=19 GT:GL:GQ 1/1:-165.74,-14.09,-0.92:100
-20 6211244 . GT G . PASS FR=0.5;HP=10;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=TTGATTTCCAGTTTTTTTTTT;TC=33;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-97.67,-63.78,-117.4:100
-20 6217057 . T TA . PASS FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=TCTCTACAACTAACCATCAAC;TC=33;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-151.16,-56.84,-189.09:100
-20 6227811 . TTTTTCTTTTC T . PASS FR=0.5;HP=6;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=TATACTGCTTTTTTTCTTTTC;TC=28;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-171.28,-80.47,-279.48:100
-20 6228139 . TA T . PASS FR=0.5;HP=8;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=ACTGGTTGTTTAAAAAAAACA;TC=27;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-101.53,-37.68,-71.46:100
-20 6229361 . G GTA . PASS FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=TGCTTTTGAAGTATACCTTTA;TC=28;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-168.24,-128.05,-263.48:100
-20 6232719 . T TA . PASS FR=1.0;HP=4;NF=10;NR=14;PP=100.0;SC=CGTACCTCAATAAGTACTGTT;TC=26;TR=24 GT:GL:GQ 1/1:-246.13,-19.86,-1.84:100
-20 6235756 . T TA . PASS FR=0.5;HP=10;NF=4;NR=2;PP=51.0;SC=ATATAAAAGTTAAAAAAAAAA;TC=22;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-59.89,-37.16,-67.02:100
-20 6242610 . GCAGACC G . PASS FR=0.5;HP=1;NF=7;NR=3;PP=100.0;SC=ACTGGGAGAGGCAGACCCACC;TC=27;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-180.6,-46.65,-174.85:100
-20 6245977 . A AT . PASS FR=0.5;HP=6;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=CTTAGTTTTCATTTTTTAGCA;TC=29;TR=12 GT:GL:GQ 0/1:-149.75,-66.4,-136.45:100
-20 6258987 . CT C . PASS FR=0.5;HP=6;NF=4;NR=10;PP=100.0;SC=GTATGTTCTTCTTTTGTCCCC;TC=34;TR=14 GT:GL:GQ 0/1:-185.84,-121.45,-268.81:100
-20 6272029 . T TA . PASS FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=9;PP=100.0;SC=TAATAGCTGGTAAACCCAACC;TC=39;TR=13 GT:GL:GQ 0/1:-151.49,-56.11,-226.05:100
-20 6293812 . G GA . PASS FR=1.0;HP=7;NF=15;NR=12;PP=100.0;SC=GGAAAAGAAAGAAAAGAAAAA;TC=35;TR=27 GT:GL:GQ 1/1:-393.29,-260.24,-242.04:100
-20 6296458 . T TA . PASS FR=1.0;HP=8;NF=5;NR=17;PP=100.0;SC=GAAAGCACAATTTTTTTTTCT;TC=39;TR=22 GT:GL:GQ 1/1:-284.36,-128.48,-104.71:100
-20 6304002 . A ATG . PASS FR=1.0;HP=2;NF=6;NR=5;PP=100.0;SC=ATATATATATATATGTGTGTG;TC=30;TR=11 GT:GL:GQ 1/1:-328.64,-256.07,-245.8:100
-20 6307745 . GTA G . PASS FR=1.0;HP=3;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=TATATATGTTGTATATATATA;TC=16;TR=11 GT:GL:GQ 1/1:-114.94,-15.25,-6.19:75
-20 6307849 . TATATATATGGTATATATATC T . PASS FR=0.5034;HP=1;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=ATATATGGTGTATATATATGG;TC=11;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-108.24,-70.67,-74.96:21
-20 6307908 . TG T . PASS FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=ATATCATATATGGTGTATATA;TC=21;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-127.13,-92.55,-148.07:100
-20 6308166 . G GTA,GTATA . PASS FR=0.5,0.5;HP=2;NF=2,1;NR=0,3;PP=86.0,100.0;SC=GTGTGTGTGTGTATATATATA;TC=16;TR=2,4 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 6308279 . G GTA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=TATATATGGTGTATATATATA;TC=12;TR=9 GT:GL:GQ 1/1:-129.24,-92.18,-87.75:54
-20 6308322 . GTGTGTGTATATATATATATATATA G . PASS FR=1.0;HP=2;NF=1;NR=2;PP=88.0;SC=ATGTATGTGTGTGTGTGTATA;TC=16;TR=3 GT:GL:GQ 1/1:-227.62,-141.11,-132.99:40
-20 6319701 . G GGT . PASS FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=5;PP=100.0;SC=GAGTCTATGTGGTGTGTGTGT;TC=19;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-99.44,-38.84,-115.36:100
-20 6345189 . G GT . PASS FR=0.5;HP=8;NF=8;NR=3;PP=100.0;SC=ATTGTTTTCAGTTTTTTTTCT;TC=31;TR=11 GT:GL:GQ 0/1:-92.31,-34.03,-73.88:100
-20 6346428 . C CTCTGTATG . PASS FR=0.5;HP=4;NF=5;NR=1;PP=45.0;SC=TATTCTCTATCTTTAATTTAA;TC=31;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-234.84,-191.03,-405.18:86
-20 6349738 . TAC T . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=1;PP=86.0;SC=GACACATACGTACACACACAC;TC=15;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-95.85,-65.71,-99.67:100
-20 6364214 . ACTCTT A . PASS FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=10;PP=100.0;SC=TCTTTACAAAACTCTTCTAGA;TC=36;TR=15 GT:GL:GQ 0/1:-210.3,-34.68,-236.21:100
-20 6373382 . TCTACCTAC T . PASS FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=8;PP=100.0;SC=ATTTCCTCTATCTACCTACCT;TC=38;TR=17 GT:GL:GQ 1/1:-510.97,-41.39,-20.72:100
-20 6384835 . TACACACAC TAC,T . PASS FR=0.5,0.5;HP=2;NF=2,2;NR=7,1;PP=100.0,51.0;SC=GGATGACACATACACACACAC;TC=32;TR=9,3 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 6390974 . TAA T . PASS FR=1.0;HP=3;NF=19;NR=16;PP=100.0;SC=CTGCCTACCTTAAACACATAA;TC=42;TR=35 GT:GL:GQ 1/1:-376.88,-34.87,-5.52:100
-20 6401100 . A AT . PASS FR=1.0;HP=9;NF=15;NR=9;PP=100.0;SC=TTCAAAAAGCATTTTTTTTTG;TC=34;TR=24 GT:GL:GQ 1/1:-148.27,-28.49,-8.51:100
-20 6406758 . C CT . PASS FR=1.0;HP=7;NF=4;NR=16;PP=100.0;SC=TCTCTCCCCTCTTTTTTCTCC;TC=31;TR=20 GT:GL:GQ 1/1:-235.73,-83.65,-66.42:100
-20 6410888 . CAGGGCTTGGCCCTGGAGT C . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=TTCTCCACTCCAGGGCTTGGC;TC=24;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-188.53,-25.15,-199.92:100
-20 6426272 . T TCTC,TTTC . PASS FR=0.5,0.5;HP=1;NF=11,6;NR=5,5;PP=100.0,100.0;SC=TTAAAAATTATCTCATTTCCT;TC=28;TR=16,11 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 6428681 . CA C . PASS FR=0.5009;HP=2;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=GGTGGGCCACCAACAGTGTCT;TC=20;TR=9 GT:GL:GQ 0/1:-312.7,-243.18,-248.77:27
-20 6430456 . A AT . PASS FR=0.5;HP=10;NF=10;NR=6;PP=100.0;SC=TAATATTTAAATTTTTTTTTT;TC=35;TR=16 GT:GL:GQ 0/1:-143.54,-83.39,-119.6:100
-20 6438083 . TA T . PASS FR=0.5;HP=7;NF=2;NR=8;PP=100.0;SC=AACAGATATATAAAAAATGCT;TC=21;TR=10 GT:GL:GQ 0/1:-86.86,-14.54,-78.87:100
-20 6441903 . C CT . PASS FR=0.5;HP=9;NF=10;NR=11;PP=100.0;SC=AAATTAAATACTTTTTTTTTA;TC=43;TR=21 GT:GL:GQ 0/1:-221.48,-121.14,-137.31:73
-20 6443155 . TTA T . PASS FR=0.5005;HP=5;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=AAACAGTTTTTTATATATATA;TC=14;TR=4 GT:GL:GQ 0/1:-162.1,-119.94,-126.23:30
-20 6443546 . G GTA . PASS FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=ATATATATGTGTATATATATA;TC=14;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-156.72,-103.24,-116.61:61
-20 6447485 . C CA . PASS FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=13;PP=100.0;SC=TTTTGAATTTCAAATATTTTC;TC=38;TR=17 GT:GL:GQ 0/1:-255.09,-105.01,-200.26:100
-20 6448179 . TAATAA T . PASS FR=0.5;HP=5;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=TATCTCGAAATAATAAAATAA;TC=36;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-185.97,-96.1,-256.82:100
-20 6456952 . ATT AT,A . PASS FR=0.5,0.5;HP=10;NF=7,8;NR=4,5;PP=100.0,100.0;SC=CAATGATGTCATTTTTTTTTT;TC=27;TR=11,13 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 6458185 . GA G . PASS FR=0.5;HP=10;NF=11;NR=4;PP=100.0;SC=AAATAAAAATGAAAAAAAAAA;TC=48;TR=15 GT:GL:GQ 0/1:-255.96,-202.85,-273.91:100
-20 6459292 . G GA . PASS FR=0.5;HP=10;NF=2;NR=6;PP=49.0;SC=TATCCTATCAGAAAAAAAAAC;TC=30;TR=8 GT:GL:GQ 0/1:-83.74,-61.52,-111.1:99
-20 6473904 . TAGGTGAAATTTTCTTTTCTGTTTTTTTAA T . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=TCCCTAATTCTAGGTGAAATT;TC=25;TR=3 GT:GL:GQ 0/1:-202.85,-99.33,-502.66:100
-20 6481086 . T TTGTC . PASS FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=TTGTTCCTCTTTGTCAGAGCA;TC=21;TR=12 GT:GL:GQ 1/1:-268.34,-19.84,-4.6:100
-20 6488178 . CTTG C . PASS FR=1.0;HP=2;NF=13;NR=13;PP=100.0;SC=AAGCTACTTGCTTGTTGTTGA;TC=32;TR=26 GT:GL:GQ 1/1:-335.98,-26.27,-4.81:100
-20 6520175 . C CTT . PASS FR=1.0;HP=3;NF=12;NR=17;PP=100.0;SC=TTACTTAAGACTTTCTATTGA;TC=35;TR=29 GT:GL:GQ 1/1:-362.42,-32.47,-7.59:100
-20 6524976 . GACTAC G . PASS FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=13;PP=100.0;SC=CTATGAAATTGACTACACTAC;TC=32;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-403.49,-65.81,-45.47:100
-20 6531643 . GT G . PASS FR=1.0;HP=4;NF=17;NR=11;PP=100.0;SC=CAGATAAAGTGTTTAATTCAT;TC=31;TR=28 GT:GL:GQ 1/1:-281.56,-58.08,-38.11:100
-20 6544912 . CAGAT CAGATAGATAGATAGAT,C . PASS FR=0.5,0.5;HP=1;NF=1,1;NR=4,1;PP=100.0,100.0;SC=TATTCACTGCCAGATAGATAG;TC=24;TR=5,2 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 6548435 . A AAGAG . PASS FR=1.0;HP=2;NF=5;NR=8;PP=100.0;SC=GAGAAACAGAAAGAGAGAGAG;TC=33;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-316.58,-47.12,-29.98:100
-20 6549783 . C CTT . PASS FR=1.0;HP=9;NF=3;NR=10;PP=100.0;SC=TGGTCCAGGCCTTTTTTTTTG;TC=24;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-145.52,-61.65,-53.62:66
-20 6553955 . TTATA T . PASS FR=1.0;HP=3;NF=12;NR=6;PP=100.0;SC=ATTTTACATTTTATATATATA;TC=30;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-272.92,-35.6,-20.34:100
-20 6563467 . CTAGGTAGGTAGG C . PASS FR=1.0;HP=1;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=ACATGCATTCCTAGGTAGGTA;TC=22;TR=9 GT:GL:GQ 1/1:-367.98,-150.14,-139.95:85
-20 6565618 . CGTGT C . PASS FR=1.0;HP=2;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=TGTGTGTGTTCGTGTGTGTGT;TC=19;TR=7 GT:GL:GQ 1/1:-220.73,-126.68,-119.85:85
-20 6565651 . G GTA . PASS FR=0.5286;HP=2;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=GTGTATATGTGTATATATATA;TC=16;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-258.66,-193.34,-195.57:12
-20 6585232 . C CT . PASS FR=1.0;HP=2;NF=15;NR=16;PP=100.0;SC=ACAAACCCATCTCCTAAAATC;TC=33;TR=31 GT:GL:GQ 1/1:-314.24,-29.76,-6.91:100
-20 6590623 . C CCTGCTT . PASS FR=1.0;HP=1;NF=17;NR=14;PP=100.0;SC=AGAGTTATCTCCTGCTGTCAT;TC=32;TR=31 GT:GL:GQ 1/1:-527.33,-38.07,-14.51:100
-20 6603635 . C CA . PASS FR=1.0;HP=4;NF=12;NR=8;PP=100.0;SC=TTAGTCAAGCCAAAATCACAT;TC=27;TR=20 GT:GL:GQ 1/1:-325.58,-214.53,-199.34:100
-20 6609608 . CTT C . PASS FR=1.0;HP=3;NF=10;NR=9;PP=100.0;SC=TGTTTTGATGCTTTCTGGCTT;TC=27;TR=19 GT:GL:GQ 1/1:-576.75,-576.47,-576.51:100
-20 6609611 . T TGGAGGAGGA . PASS FR=1.0;HP=2;NF=9;NR=9;PP=100.0;SC=TTTGATGCTTTCTGGCTTGGA;TC=23;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-576.75,-311.9,-294.35:100
-20 6644452 . C CTGTAG . PASS FR=1.0;HP=1;NF=14;NR=16;PP=100.0;SC=ATAAAAGGCACTGTAGCATAG;TC=35;TR=30 GT:GL:GQ 1/1:-563.91,-35.77,-9.44:100
-20 6647434 . A ATC . PASS FR=1.0;HP=2;NF=4;NR=14;PP=100.0;SC=GGATACTGAGATTCTAAGTAG;TC=21;TR=18 GT:GL:GQ 1/1:-241.28,-23.07,-7.83:100
-20 6655343 . T TG . PASS FR=1.0;HP=6;NF=6;NR=9;PP=100.0;SC=AGTCTAAAGATTTTTTTCTGG;TC=18;TR=15 GT:GL:GQ 1/1:-141.83,-27.31,-14.91:95
-20 6655876 . GTATATA GTA,G . PASS FR=0.5,0.5;HP=1;NF=8,2;NR=11,1;PP=100.0,58.0;SC=TACATATATAGTATATATATA;TC=31;TR=19,3 GT:GL:GQ 1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
-20 6664331 . C CTG . PASS FR=1.0;HP=5;NF=5;NR=10;PP=100.0;SC=GGTTTAAAAACTGTGTGTGTG;TC=30;TR=15 GT:GL:GQ 1/1:-232.49,-35.13,-29.16:74
-20 6668238 . CT C . PASS FR=1.0;HP=10;NF=7;NR=15;PP=100.0;SC=ACTGGAGAAACTTTTTTTTTT;TC=30;TR=22 GT:GL:GQ 1/1:-332.94,-279.88,-269.29:89
-20 6677392 . CTGTGTG C . PASS FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=6;PP=100.0;SC=GTGTGTGGCCCTGTGTGTGTG;TC=24;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-156.67,-56.12,-128.5:100
-20 6687137 . CAT C . PASS FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=13;PP=100.0;SC=ATAAGATCCACATGAGACAAT;TC=26;TR=25 GT:GL:GQ 1/1:-279.85,-22.16,-4.14:100
-20 6690400 . T TG . PASS FR=1.0;HP=2;NF=22;NR=8;PP=100.0;SC=TTAATACATTTGTATGCCCTG;TC=31;TR=30 GT:GL:GQ 1/1:-315.1,-40.57,-19.1:100
-20 6694813 . GAA G . PASS FR=1.0;HP=6;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=AAGAAAGAAAGAAAGAGAAAG;TC=13;TR=9 GT:GL:GQ 1/1:-119.78,-18.28,-9.43:64
-20 6717401 . G GA . PASS FR=1.0;HP=10;NF=14;NR=6;PP=100.0;SC=CTCTCTTAAGGAAAAAAAAAA;TC=27;TR=20 GT:GL:GQ 1/1:-134.21,-33.86,-20.0:100
-20 6723994 . A AAC . PASS FR=1.0;HP=4;NF=10;NR=3;PP=100.0;SC=CACATACAAAAACACACACAC;TC=23;TR=13 GT:GL:GQ 1/1:-174.48,-22.71,-13.76:74
-20 6746236 . C CTTAT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=CTGGAGACTACTTATTTATTT;TC=23;TR=6 GT:GL:GQ 0/1:-115.46,-26.87,-109.86:100
-20 6759758 . A AAT . PASS FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=TAAATACATAAATATATATAT;TC=21;TR=5 GT:GL:GQ 0/1:-98.2,-23.97,-51.3:100
-20 6765134 . A AACAC . PASS FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=5;PP=100.0;SC=TTGAGAATCTAACACACACAC;TC=25;TR=7 GT:GL:GQ 0/1:-145.56,-56.64,-151.12:100
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.1
-##INFO=<ID=CallsetAC,Number=.,Type=Integer,Description="">
-##INFO=<ID=CallsetAC2,Number=.,Type=Integer,Description="">
-##INFO=<ID=HW_VIOLATION,Number=0,Type=Flag,Description="Genotypes violate Hardy-Weinberg">
-##INFO=<ID=SEQUENCING.AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count from sequencing-based genotypes over all samples">
-##INFO=<ID=SEQUENOM.AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count from Sequenom genotyping">
-##INFO=<ID=Groups,Number=.,Type=String,Description="Center that called this variant">
-##INFO=<ID=HR,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length">
-##INFO=<ID=TR,Number=1,Type=Integer,Description="Tandem repeat run length (bp)">
-##INFO=<ID=TU,Number=1,Type=String,Description="tandem repeat run unit (stranded)">
-##INFO=<ID=HU,Number=1,Type=String,Description="Homopolymer run unit (stranded)">
-##INFO=<ID=IH,Number=1,Type=Character,Description="Indel hotspot: estimated local rate exceeds SNP rate">
-##INFO=<ID=Set,Number=1,Type=String,Description="Set from which this site was chosen for validation">
-##FILTER=<ID=AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS,Description="Possible Sequenom miscalls based on manual review of cluster plots">
-##FILTER=<ID=INCORRECT_SEQUENOM_CALLS,Description="Clear Sequenom miscalls based on manual review of cluster plots">
-##FILTER=<ID=TOO_MANY_ALT_ALLELES,Description="Extremely high value (many times more or greater than 700) for SEQUENOM.AC given the SEQUENCING.AC">
-##fileDate=20110531
-##reference=ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/reference/human_g1k_v37.fasta.gz
-##source=EricBanksValidationQC;fromGertonLunterValidationSelection
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT HG00127 HG00128 HG00136 HG00137 HG00138 HG00139 HG00152 HG00156 HG00234 HG00235 HG00237 HG00242 HG00244 HG00262 HG01055 HG01079 NA19138 NA18974 NA18523 NA12717 NA19209 NA18577 NA18973 NA18943 NA12873 NA18623 NA18622 NA18948 NA19171 NA19204 NA06994 NA18563 NA18547 NA18861 NA18608 NA18995 NA10851 NA18976 NA18603 NA19200 HG01204 HG01191 HG01101 HG00146 HG00306 NA18985 HG00160 HG00635 HG00372 HG00357 HG00634 NA18541 NA18950 NA19759 HG00351 HG00257 HG00118 HG00336 HG00448 HG01354 NA18609 HG00428 HG00326 NA11894 NA18956 HG00173 HG00117 NA11893 HG01251 HG01441 HG01437 HG00182 HG00330 HG01060 HG00329 NA18960 NA18856 NA07346 NA18871 NA19057 NA18868 NA18636 NA12830 NA19007 NA18910 NA18874 NA19056 NA19064 NA19066 NA18487 NA18642 NA19236 NA07056 NA18637 NA19235 NA19309 NA19311 NA19334 NA19346 NA19347 NA19372 NA19376 NA19383 NA19384 NA19394 NA19428 NA19430 NA19451 NA19466 NA19313 NA19321 NA19324 NA19332 NA19390 NA19436 NA19439 NA19440 NA19463 NA19470 NA19471 NA19472 NA19676 NA19660 NA19661 NA19663 NA19722 NA19725 NA19728 NA19729 NA19731 NA19749 NA19755 NA19756 NA19758 NA19770 NA19773 NA19777 NA19780 NA19783 NA20525 NA20589 NA20765 NA20802 NA20804 NA18544 NA18602 NA18546 NA18610 NA18957 NA18615 NA18616 NA19010 NA18638 NA18639 NA18627 NA19072 NA18630 NA19074 NA19080 NA19081 NA19083 NA19085 NA19088 NA20287 NA19835 NA20276 NA19818 NA20278 NA20282 NA20342 NA20296 NA20314 NA20346 NA19712 NA19198 NA19108 NA18934 NA18916 NA18907 NA18917 NA06989 NA12058 NA12341 NA12546 NA12489 HG01197 NA18983 NA11843 NA11892 NA12749 NA12282 NA12751 NA18959 NA19331 NA19453 NA20537 NA12046 NA20515 NA20516 NA20521 NA20524 NA20528 NA20759 NA20768 NA20769 NA20774 NA20775 NA20783 NA20787 NA20790 NA20800 NA20819 NA20812 NA20505 NA20530 NA20540 NA20538 NA20581 NA20815 NA20544 NA20810 NA20807 NA20816 NA20504 NA20753 NA20502 NA12342 NA19150 NA19468 NA20336 NA19395 NA19257 NA19360 NA19700 NA18867 NA20317 NA18968 NA19107 HG00111 HG00108 NA19077 NA19684 NA18511 NA12044 NA19382 NA19457 NA18933 NA18923 NA18965 HG00141 NA20341 NA18740 HG00537 HG00346 HG01173 HG00702 HG00313 HG00150 NA18612 HG00339 NA12273 HG00250 NA18593 NA18621 HG00478 HG00251 HG01070 NA19160 HG00479 HG00608 NA18573 HG00375 NA19248 NA19093 HG01170 HG00534 HG01171 HG01522 NA18624 HG00683 HG01521 NA19005 NA20412 NA18971 HG00446 NA12748 HG00530 HG00690 HG01356 HG01516 NA20532 HG00344 HG00328 NA18542 HG00254 HG00321 HG00577 HG00656 HG00342 HG00524 HG00650 HG00557 HG00319 HG00457 HG00125 HG00578 HG00543 HG00638 HG00171 HG00699 HG00595 HG00187 HG00704 HG00533 HG00596 HG00268 HG01083 HG00651 HG01133 HG00671 HG00327 HG01148 HG00246 HG00672 HG00556 HG00436 HG00554 NA18633 NA20344 NA11993 NA07037 NA11930 HG01366 HG01389 HG00620 NA19740 HG00190 HG00419 NA18535 HG01495 NA18592 HG01497 HG00174 HG01140 NA12287 HG00689 HG01550 HG00334 HG01375 HG00637 NA18507 HG01113 NA18550 NA19129 HG01551 HG01462 HG00331 NA12413 HG01456 HG01360 HG00708 HG01350 HG00684 NA19099 HG00284 NA12399 NA12286 NA12777 HG00277 HG00266 NA19985 HG00353 HG01102 NA07347 NA07051 NA19900 NA18984 NA07048 HG00640 HG01066 NA12812 HG01174 HG01188
-20 669442 . TG T 99 PASS SEQUENCING.AC=101;CallSetAC=116,128,155,72,71;CallSetAC2=2,2,2,2,2;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=7;HU=G;IH=1;TR=7;TU=G;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=54 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 676148 . A AC 99 PASS SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,0,3,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=3;HU=A;IH=0;TR=6;TU=AAG;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 719486 . C CT 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,2,1,2;CallSetAC2=0,0,1,1,1;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=OX;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 890696 . C CAT 99 PASS SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=8,7,0,6,9;CallSetAC2=1,2,0,2,2;Groups=BC,BI,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=C;IH=0;TR=3;TU=C;Set=OX;SEQUENOM.AC=6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1102516 . CT C 99 PASS SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=0,7,11,4,7;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1149576 . CT C 99 PASS SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,3,2,2,0;CallSetAC2=0,1,1,1,0;Groups=BI,DINDEL,OX;HR=5;HU=T;IH=0;TR=5;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1195706 . AAG A 99 PASS SEQUENCING.AC=273;CallSetAC=0,569,0,0,4;CallSetAC2=0,8,0,0,0;Groups=BI,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=7;TU=AAG;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=334 GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 . 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1
-20 1342549 . A AAGAT 99 PASS SEQUENCING.AC=7;CallSetAC=8,6,12,8,7;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=2;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1366475 . CT C 99 PASS SEQUENCING.AC=12;CallSetAC=0,0,12,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1550416 . C CT 99 PASS SEQUENCING.AC=28;CallSetAC=32,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1655540 . AT A 99 PASS SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=7,5,4,4,4;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=4 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 2889034 . AAAAT A 99 PASS SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=10,9,10,7,8;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=5;HU=A;IH=0;TR=5;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 3203741 . CT C 99 PASS SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=12,5,9,6,6;CallSetAC2=2,1,0,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=7;HU=C;IH=1;TR=7;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=4 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 3700705 . CTTTGGG C 99 PASS SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=4,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=3;HU=T;IH=0;TR=7;TU=CTT;Set=BC;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 4037626 . TC T 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=2,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=3;HU=C;IH=0;TR=3;TU=C;Set=BC;SEQUENOM.AC=194 GT 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 . 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0
-20 4210074 . G GA 99 PASS SEQUENCING.AC=1124;CallSetAC=159,1498,819,1501,0;CallSetAC2=0,11,5,8,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX;HR=5;HU=G;IH=0;TR=5;TU=G;Set=BC;SEQUENOM.AC=565 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 . 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 . 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1
-20 4363519 . CATT C 99 PASS SEQUENCING.AC=15;CallSetAC=18,20,15,14,16;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 4366806 . CAAAT C 99 PASS SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,1,44,1,4;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=BI;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 4641550 . CCTTGA C 99 PASS SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,0,13,4,3;CallSetAC2=0,0,2,1,1;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5105482 . C CATTTTAGG 99 PASS SEQUENCING.AC=150;CallSetAC=165,256,230,156,127;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AC;Set=OX;SEQUENOM.AC=101 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5289619 . GA G 99 PASS SEQUENCING.AC=968;CallSetAC=1106,1033,956,1020,1090;CallSetAC2=9,10,9,9,9;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=377 GT 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 . 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0
-20 5416109 . CA C 99 PASS SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=0,7,6,5,6;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=BI;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5432262 . AGT A 99 PASS SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=9,10,9,8,9;CallSetAC2=1,1,2,0,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=7;TU=GT;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=4 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5724449 . T TC 99 PASS SEQUENCING.AC=15;CallSetAC=0,0,15,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 6877907 . CA C 99 PASS SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,2,3,2,4;CallSetAC2=0,1,2,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=2;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 6969412 . CAAAGAAT C 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,4,1,1;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7229260 . T TA 99 PASS SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,3,0,5,5;CallSetAC2=0,1,0,1,1;Groups=BI,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=BI;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7239075 . AG A 99 PASS SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=0,6,8,7,6;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=OX;SEQUENOM.AC=5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7942727 . A AC 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,1;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7950562 . C CT 99 PASS SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=0,6,7,4,5;CallSetAC2=0,1,2,0,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=4;TU=AC;Set=BI;SEQUENOM.AC=4 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 8195466 . C CT 99 PASS SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=14,3,9,6,7;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=6;HU=T;IH=1;TR=6;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 8233352 . TACTC T 99 PASS SEQUENCING.AC=146;CallSetAC=167,156,155,119,140;CallSetAC2=1,1,0,0,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=56 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 8504000 . TAG T 99 PASS SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=16,10,39,10,13;CallSetAC2=1,1,0,0,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=4;TU=AG;Set=BI;SEQUENOM.AC=5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 9231138 . AT A 99 PASS SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=0,0,11,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=4;HU=T;IH=0;TR=7;TU=AT;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 9921724 . AAAGT A 99 PASS SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=12,15,22,11,12;CallSetAC2=0,1,0,0,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=11 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 9925738 . T TG 99 PASS SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=3,3,3,3,3;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 10090376 . T TG 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,2;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 11229169 . T TA 99 PASS SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,5,0,4,0;CallSetAC2=0,1,0,1,0;Groups=BI,OX;HR=6;HU=A;IH=1;TR=6;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 11511920 . AC A 99 PASS SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,4,4,4,3;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=C;IH=0;TR=3;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 11893900 . ATTAG A 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,4,1,1;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=7;TU=ATT;Set=OX;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12021825 . A AG 99 PASS SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=14,10,15,11,13;CallSetAC2=1,0,0,0,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=1;TU=G;Set=BI;SEQUENOM.AC=5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12063752 . CTT C 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,5,2,2;CallSetAC2=0,0,1,1,1;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=6;TU=CT;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12094344 . TCAGGAGGC T 99 PASS SEQUENCING.AC=29;CallSetAC=37,59,27,15,33;CallSetAC2=1,2,1,1,2;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12114989 . CTA C 99 PASS SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,4,4,3,4;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=4 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12371546 . GACA G 99 PASS SEQUENCING.AC=20;CallSetAC=27,23,20,17,22;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=7;TU=AAC;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=10 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12512723 . G GTT 99 PASS SEQUENCING.AC=13;CallSetAC=15,16,27,14,13;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12634463 . TGA T 99 PASS SEQUENCING.AC=182;CallSetAC=208,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12692743 . TTATC T 99 PASS SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=0,12,61,10,10;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12837095 . G GA 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,1;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12928028 . TG T 99 PASS SEQUENCING.AC=22;CallSetAC=0,32,0,15,0;CallSetAC2=0,1,0,1,0;Groups=BI,OX;HR=6;HU=T;IH=1;TR=6;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13003323 . GGGA G 99 PASS SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,3,5,3,3;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=G;IH=0;TR=7;TU=AGG;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13128894 . CT C 99 PASS SEQUENCING.AC=27;CallSetAC=31,29,29,26,27;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=C;IH=0;TR=4;TU=C;Set=OX;SEQUENOM.AC=10 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13287841 . CAT C 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=36;CallSetAC=0,64,0,38,18;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=BI;SEQUENOM.AC=626 GT 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 . 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 . 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 . 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1
-20 13365589 . T TG 99 PASS SEQUENCING.AC=9;CallSetAC=11,9,9,8,11;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=BI;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13566260 rs78090544 AAATTG A 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=0,161,6,5,0;CallSetAC2=0,2,0,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=390 GT 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 . 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0
-20 13685184 . AT A 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,10,2,2;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13716193 . GAGAA G 99 PASS SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,3,0,0,3;CallSetAC2=0,1,0,0,1;Groups=BI,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=6;TU=AG;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13926445 . TA T 99 PASS SEQUENCING.AC=7;CallSetAC=0,0,7,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=2;HU=A;IH=0;TR=2;TU=A;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13960028 . TC T 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=10,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=188 GT 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 . 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . . 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0
-20 14159734 . T TA 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,1,1,3,1;CallSetAC2=0,0,0,1,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 14287634 . AGT A 99 PASS SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,0,0,0,3;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=5;TU=GT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 14383135 . TA T 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,15,1,1;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=6;TU=ATC;Set=OX;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 14669226 . G GA 99 AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS SEQUENCING.AC=268;CallSetAC=306,304,274,234,282;CallSetAC2=0,1,2,0,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=121 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-20 14697473 . TTC T 99 PASS SEQUENCING.AC=17;CallSetAC=20,22,17,15,16;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=9 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 14983337 . AGCC A 99 PASS SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,4,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI;HR=6;HU=A;IH=1;TR=6;TU=A;Set=BI;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15037520 . A AG 99 PASS SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=0,0,6,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=1;HU=G;IH=0;TR=1;TU=G;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15141272 . T TC 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,1;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15189597 . GA G 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=6,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=311 GT 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 . 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 . 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1
-20 15265098 . TG T 99 PASS SEQUENCING.AC=31;CallSetAC=27,79,0,41,4;CallSetAC2=1,1,0,1,0;Groups=BC,BI,OX,SAMTOOLS;HR=6;HU=T;IH=1;TR=6;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=125 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1
-20 15410763 . TGA T 99 PASS SEQUENCING.AC=54;CallSetAC=55,68,57,57,56;CallSetAC2=1,2,0,1,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=1;TU=G;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=29 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15543319 . AG A 99 PASS SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=13,12,10,12,14;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=BC;SEQUENOM.AC=7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15550845 . TG T 99 PASS SEQUENCING.AC=50;CallSetAC=58,58,56,47,53;CallSetAC2=2,2,2,1,2;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=7;TU=GTT;Set=BC;SEQUENOM.AC=34 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15703503 . TG T 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=9;CallSetAC=11,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=87 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15871330 . AG A 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=2,2,2,2,2;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16016504 . TA T 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=17;CallSetAC=4,36,0,18,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI,OX;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=578 GT 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 . 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1
-20 16192114 . AT A 99 INCORRECT_SEQUENOM_CALLS SEQUENCING.AC=45;CallSetAC=52,49,48,42,48;CallSetAC2=3,2,3,2,3;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=4;TU=CT;Set=BC;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16259934 . C CAA 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,0,0,2;CallSetAC2=0,1,0,0,1;Groups=BI,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=4;TU=CT;Set=BI;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16312599 . CTA C 99 PASS SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=0,6,5,3,6;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16723642 . GGTT G 99 PASS SEQUENCING.AC=9;CallSetAC=11,11,9,9,11;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=BI;SEQUENOM.AC=6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16747221 . CA C 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=1,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=473 GT 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 . 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1
-20 16813850 . C CA 99 PASS SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=12,12,11,7,8;CallSetAC2=1,1,3,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=5;HU=A;IH=0;TR=5;TU=A;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17250858 . T TC 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,1;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=1;HU=C;IH=0;TR=4;TU=CT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17331332 . TA T 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=18;CallSetAC=0,0,0,19,0;CallSetAC2=0,0,0,1,0;Groups=OX;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=682 GT 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 . 0/1 . 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-20 17473782 . TGC T 99 PASS SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,3,4,2,3;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17607627 . A AGT 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,2,2,2;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=4;TU=AG;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17753474 . C CA 99 PASS SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,0,3,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=1;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AC;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18417481 . AC A 99 PASS SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=9,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=6;HU=A;IH=1;TR=6;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=17 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18445795 . AAG A 99 PASS SEQUENCING.AC=15;CallSetAC=20,20,15,14,16;CallSetAC2=1,1,0,0,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AG;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18520672 . A ATT 99 PASS SEQUENCING.AC=85;CallSetAC=98,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=4;HU=A;IH=0;TR=4;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18522725 . ATTAAC A 99 PASS SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,5,5,4,5;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18915562 . TAA T 99 PASS SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=0,8,6,5,8;CallSetAC2=0,2,1,1,2;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=6;TU=AAT;Set=BI;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 19111235 . C CT 99 PASS SEQUENCING.AC=7;CallSetAC=8,7,9,7,8;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=4 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 19188693 . T TC 99 PASS SEQUENCING.AC=15;CallSetAC=0,0,15,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=1;HU=G;IH=0;TR=1;TU=G;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 19437778 . GGCCTGGGATGTAAA G 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,2,1,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL,OX;HR=2;HU=G;IH=0;TR=4;TU=GT;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 19805154 . CCTT C 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,1,1,1;CallSetAC2=0,0,1,1,1;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=C;IH=0;TR=6;TU=CTT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20030869 . CT C 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=1,11,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=404 GT 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1
-20 20286529 . A AC 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,1,1,0,1;CallSetAC2=0,1,1,0,1;Groups=BI,DINDEL,SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20404656 . ATTACAGACT A 99 PASS SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=12,19,14,11,13;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20434198 . TA T 99 PASS SEQUENCING.AC=17;CallSetAC=0,0,0,18,0;CallSetAC2=0,0,0,1,0;Groups=OX;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20716329 . CA C 99 PASS SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,5,6,4,5;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=BI;SEQUENOM.AC=4 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20760474 . TG T 99 PASS SEQUENCING.AC=21;CallSetAC=28,23,21,19,24;CallSetAC2=2,1,2,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=1;TU=G;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=15 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20952825 . T TC 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,1,2,1,1;CallSetAC2=0,1,2,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=C;IH=0;TR=4;TU=CT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20990240 . TC T 99 PASS SEQUENCING.AC=16;CallSetAC=0,0,16,0,0;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=DINDEL;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21406859 . ACTT A 99 PASS SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=4,4,4,4,4;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=A;IH=0;TR=6;TU=CTT;Set=BI;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21480245 . AG A 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,1,3,1,1;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21852048 . CA C 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=13;CallSetAC=12,49,0,14,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC,BI,OX;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=OX;SEQUENOM.AC=432 GT 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 . 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 . 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1
-20 21968507 . AC A 99 PASS SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=0,12,10,12,7;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=5;HU=C;IH=0;TR=5;TU=C;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 22434333 . C CA 99 PASS SEQUENCING.AC=26;CallSetAC=30,32,31,23,26;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=C;IH=0;TR=4;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 22637424 . C CAGCCA 99 PASS SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,5,4,4,6;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 22655862 . TATC T 99 PASS SEQUENCING.AC=12;CallSetAC=14,15,18,11,14;CallSetAC2=1,1,0,0,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AT;Set=OX;SEQUENOM.AC=6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23200197 . ATT A 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,1;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23293728 . CA C 99 PASS SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=15,12,15,9,13;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=BI;SEQUENOM.AC=8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23813095 . CT C 99 PASS SEQUENCING.AC=18;CallSetAC=0,27,17,0,21;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI,DINDEL,SAMTOOLS;HR=4;HU=C;IH=0;TR=4;TU=C;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=26 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23815381 . CT C 99 PASS SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,4,3,2,2;CallSetAC2=0,1,2,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=6;TU=CTT;Set=OX;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23889003 . GA G 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=2,1,1,2,3;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=6;TU=ATG;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 24710482 . GT G 99 PASS SEQUENCING.AC=9;CallSetAC=0,0,9,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=5;HU=T;IH=0;TR=5;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 24855121 . CT C 99 PASS SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=14,13,10,12,12;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=5;HU=C;IH=0;TR=5;TU=C;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 25503211 . CATA C 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,1,2,1,1;CallSetAC2=0,1,2,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=7;TU=AAT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 25905250 . GT G 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=56;CallSetAC=0,58,57,0,0;CallSetAC2=0,1,1,0,0;Groups=BI,DINDEL;HR=6;HU=T;IH=1;TR=6;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=764 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 . 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-20 29589873 . CCTT C 99 PASS SEQUENCING.AC=239;CallSetAC=333,196,0,0,0;CallSetAC2=1,1,0,0,0;Groups=BC,BI;HR=2;HU=C;IH=0;TR=6;TU=CTT;Set=BC;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29628180 . C CCACAAGAAG 99 PASS SEQUENCING.AC=7;CallSetAC=0,8,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI;HR=2;HU=C;IH=0;TR=6;TU=CTT;Set=BI;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29804699 . A AC 99 PASS SEQUENCING.AC=23;CallSetAC=27,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=2;HU=A;IH=0;TR=2;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29913425 . TATATC T 99 PASS SEQUENCING.AC=24;CallSetAC=30,25,82,25,26;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=5;TU=AT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=15 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30390854 . TTATACTA T 99 PASS SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,6,5,4,4;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=4;TU=AT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30534847 . ACAAT A 99 PASS SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,3,5,2,4;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30567910 . T TG 99 PASS SEQUENCING.AC=45;CallSetAC=52,7,0,48,0;CallSetAC2=1,0,0,1,0;Groups=BC,BI,OX;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=BC;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 31412616 . CT C 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,2;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 31760870 . CG C 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=2,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=2;HU=G;IH=0;TR=4;TU=AC;Set=BC;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32015223 . CT C 99 PASS SEQUENCING.AC=9;CallSetAC=11,11,11,9,9;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32158330 . CAG C 99 PASS SEQUENCING.AC=18;CallSetAC=23,24,16,15,21;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AG;Set=OX;SEQUENOM.AC=4 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32456076 . GT G 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,1,6,1,1;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=G;IH=0;TR=4;TU=GT;Set=OX;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32509752 . A AG 99 PASS SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,0,0,3,3;CallSetAC2=0,0,0,1,1;Groups=OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32700247 . GGCGTCTGA G 99 PASS SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,4,7,4,4;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=6;TU=CGG;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32968409 . GTC G 99 PASS SEQUENCING.AC=121;CallSetAC=0,127,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI;HR=1;HU=T;IH=0;TR=6;TU=ATG;Set=BI;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 33541746 . A AAG 99 PASS SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=9,11,9,9,10;CallSetAC2=0,1,1,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=A;IH=0;TR=5;TU=AG;Set=BC;SEQUENOM.AC=4 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 34251969 . C CA 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,0,0,2;CallSetAC2=0,1,0,0,1;Groups=BI,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AG;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 34313574 . A AT 99 PASS SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=0,9,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 34633573 . TAA T 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,3,2,2;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=6;HU=T;IH=1;TR=6;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 34831930 . CT C 99 PASS SEQUENCING.AC=13;CallSetAC=22,14,20,14,14;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 35329008 . ATC A 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,3,1,1;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=6;TU=ATC;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 35357903 . GA G 99 PASS SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=12,12,12,12,11;CallSetAC2=2,2,2,2,2;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=2;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 35847597 . CTT C 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,1,7,1,2;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=5;HU=T;IH=0;TR=5;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 36658020 . TG T 99 PASS SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=15,12,12,8,12;CallSetAC2=1,1,1,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=OX;SEQUENOM.AC=6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 36704724 . TC T 99 PASS SEQUENCING.AC=12;CallSetAC=15,13,14,10,14;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 36711544 . TAAAG T 99 PASS SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,0,3,0,1;CallSetAC2=0,0,1,0,1;Groups=DINDEL,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 36947086 . ATAC A 99 PASS SEQUENCING.AC=93;CallSetAC=107,109,94,86,100;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=6;TU=ACT;Set=OX;SEQUENOM.AC=33 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37139725 . CAG C 99 PASS SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=0,6,6,5,7;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=6;TU=AG;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37278654 . CAG C 99 PASS SEQUENCING.AC=17;CallSetAC=20,18,17,13,17;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37391272 . TG T 99 PASS SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=14,9,9,9,10;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=4 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37608002 . CAT C 99 PASS SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=8,13,12,9,10;CallSetAC2=0,1,1,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=5;TU=AC;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37678954 . C CTGG 99 PASS SEQUENCING.AC=7;CallSetAC=0,10,22,6,4;CallSetAC2=0,1,1,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=4;TU=CG;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37712193 . AAG A 99 PASS SEQUENCING.AC=44;CallSetAC=52,57,44,21,47;CallSetAC2=1,1,2,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=6;TU=AG;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=29 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37836124 . AAAT A 99 PASS SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=4,4,6,3,3;CallSetAC2=1,1,1,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=A;IH=0;TR=4;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37954797 . A AGT 99 PASS SEQUENCING.AC=110;CallSetAC=126,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=1;HU=T;IH=0;TR=5;TU=AT;Set=BC;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37962643 . T TAA 99 PASS SEQUENCING.AC=370;CallSetAC=395,424,394,367,423;CallSetAC2=4,4,4,3,3;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AT;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=178 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1
-20 38336199 . TA T 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,4,2,2;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 38495835 . T TA 99 AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS SEQUENCING.AC=147;CallSetAC=0,0,0,153,0;CallSetAC2=0,0,0,1,0;Groups=OX;HR=3;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AT;Set=OX;SEQUENOM.AC=14 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 38696054 . GAAGA G 99 PASS SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,3,5,3,3;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=6;TU=AAG;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 38784318 . CCTT C 99 PASS SEQUENCING.AC=17;CallSetAC=20,19,19,15,17;CallSetAC2=2,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=7;TU=CTT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 39042026 . T TG 99 PASS SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=0,0,11,0,0;CallSetAC2=0,0,3,0,0;Groups=DINDEL;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 39420665 . AG A 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=24;CallSetAC=3,51,0,25,0;CallSetAC2=0,2,0,1,0;Groups=BC,BI,OX;HR=2;HU=A;IH=0;TR=4;TU=GT;Set=OX;SEQUENOM.AC=688 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 . 1/1 . 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 . 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1
-20 39607037 . C CA 99 AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,0,4,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 39868369 . T TG 99 PASS SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=0,6,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI;HR=2;HU=T;IH=0;TR=4;TU=GT;Set=BI;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 40006262 . TGAG T 99 AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,4,6,0,0;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BI,DINDEL;HR=1;HU=G;IH=0;TR=6;TU=AGG;Set=BI;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 40110981 . A AG 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,1;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=4;TU=AG;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 40445967 . TG T 99 PASS SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=5,5,15,6,5;CallSetAC2=1,1,2,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=4;TU=GT;Set=BI;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 40742257 . TG T 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,10,2,2;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41000677 . T TG 99 PASS SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,5,8,5,0;CallSetAC2=0,1,2,1,0;Groups=BI,DINDEL,OX;HR=6;HU=G;IH=1;TR=6;TU=G;Set=BI;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41149621 . T TATCA 99 PASS SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=6,6,10,8,0;CallSetAC2=0,1,1,1,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41364251 . A AAG 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,1;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AC;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41543685 . CTAAGGAGGGAAAAAGATATAAT C 99 PASS SEQUENCING.AC=29;CallSetAC=0,36,29,22,0;CallSetAC2=0,1,1,1,0;Groups=BI,DINDEL,OX;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=12 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41851636 . TA T 99 PASS SEQUENCING.AC=208;CallSetAC=234,229,215,195,238;CallSetAC2=3,4,3,2,3;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=83 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 41964672 . A AT 99 PASS SEQUENCING.AC=243;CallSetAC=0,0,0,253,0;CallSetAC2=0,0,0,1,0;Groups=OX;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42145613 . TG T 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=300;CallSetAC=88,565,0,544,14;CallSetAC2=1,8,0,3,0;Groups=BC,BI,OX,SAMTOOLS;HR=5;HU=T;IH=0;TR=5;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=762 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 . 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 . 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-20 42159695 . GC G 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=7,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=BC;SEQUENOM.AC=87 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-20 42261635 . C CATTT 99 PASS SEQUENCING.AC=54;CallSetAC=62,75,76,57,58;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=5;TU=AC;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=24 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42470352 . CACTT C 99 PASS SEQUENCING.AC=37;CallSetAC=43,44,42,37,41;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=7;TU=AC;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=19 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42585924 . T TA 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,1,1,1;CallSetAC2=0,0,1,1,1;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=2;TU=A;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42856201 . CT C 99 PASS SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,5,5,3,4;CallSetAC2=0,1,2,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=C;IH=0;TR=4;TU=C;Set=OX;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42909154 . T TGGGTC 99 PASS SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=5,6,8,7,4;CallSetAC2=0,1,1,1,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=OX;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42918721 . AG A 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,1,1,1,1;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42930748 . A AG 99 PASS SEQUENCING.AC=30;CallSetAC=48,20,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC,BI;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=BI;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43245783 . AG A 99 PASS SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=3,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43371647 . GGGCTGTAA G 99 PASS SEQUENCING.AC=138;CallSetAC=158,179,179,128,155;CallSetAC2=0,2,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=80 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 43434234 . AG A 99 PASS SEQUENCING.AC=7;CallSetAC=8,8,16,7,6;CallSetAC2=1,1,3,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=BC;SEQUENOM.AC=4 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43539258 . T TAG 99 PASS SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,3,18,3,3;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43606638 . T TC 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,2;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43826992 . GC G 99 PASS SEQUENCING.AC=9;CallSetAC=11,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=BC;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43993933 . CA C 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=12;CallSetAC=5,22,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=BC;SEQUENOM.AC=565 GT 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 . 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1
-20 44071585 . C CT 99 PASS SEQUENCING.AC=293;CallSetAC=310,351,323,302,335;CallSetAC2=0,1,0,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=4;TU=CT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=132 GT 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1
-20 44220528 . T TC 99 PASS SEQUENCING.AC=29;CallSetAC=34,38,0,0,18;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI,SAMTOOLS;HR=5;HU=T;IH=0;TR=5;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=59 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 44340276 . AACAG A 99 PASS SEQUENCING.AC=36;CallSetAC=42,88,46,33,36;CallSetAC2=1,1,0,0,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=37 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 44464600 . T TA 99 PASS SEQUENCING.AC=57;CallSetAC=66,63,74,53,52;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=19 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 44470843 . GAGTGTCGT G 99 PASS SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=0,31,0,9,5;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 44572563 . GA G 99 PASS SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=6,4,4,4,4;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 44889286 . G GC 99 PASS SEQUENCING.AC=25;CallSetAC=29,28,39,22,26;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=BC;SEQUENOM.AC=13 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 45092013 . GT G 99 PASS SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=5,7,6,6,6;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=4 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 45300827 . CT C 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,3,1,1;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 45406096 . T TTC 99 PASS SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=9,13,7,7,9;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=T;IH=0;TR=5;TU=CT;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=4 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 45668403 . CTG C 99 PASS SEQUENCING.AC=186;CallSetAC=213,221,191,166,197;CallSetAC2=2,3,2,1,2;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=4;TU=GT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=86 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 46051811 . T TAAGC 99 PASS SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=0,4,9,9,3;CallSetAC2=0,0,1,1,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 46353646 . A AG 99 PASS SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,0,3,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 46413551 . TC T 99 PASS SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=6,6,9,3,4;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=C;IH=0;TR=1;TU=C;Set=BI;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 46569465 . CTG C 99 PASS SEQUENCING.AC=14;CallSetAC=15,18,16,15,15;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=10 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 46720983 . ATACTTGG A 99 PASS SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=0,8,5,4,7;CallSetAC2=0,1,0,0,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=2;TU=A;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 47032179 . GC G 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,3,2,2;CallSetAC2=0,1,2,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=BI;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 47136092 . A AGTC 99 PASS SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=6,5,5,4,5;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=BI;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 47335386 . GC G 99 PASS SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=7,4,4,4,5;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=OX;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 47428163 . C CA 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=141;CallSetAC=70,232,0,0,0;CallSetAC2=0,2,0,0,0;Groups=BC,BI;HR=7;HU=C;IH=1;TR=7;TU=C;Set=BC;SEQUENOM.AC=766 GT 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1
-20 47988904 . CA C 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=3,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=1;HU=A;IH=0;TR=4;TU=CT;Set=BC;SEQUENOM.AC=187 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 . 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 48262933 . CCTA C 99 PASS SEQUENCING.AC=29;CallSetAC=33,32,30,27,31;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=C;IH=0;TR=3;TU=C;Set=OX;SEQUENOM.AC=7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49438742 . G GT 99 PASS SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=13,15,16,10,10;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49451656 . T TG 99 PASS SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=0,0,6,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49537420 . AG A 99 PASS SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=12,11,12,9,11;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=BI;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49561273 . A AG 99 PASS SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,0,4,2,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL,OX;HR=2;HU=G;IH=0;TR=4;TU=AG;Set=OX;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49765611 . A AC 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,1,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=1;HU=C;IH=0;TR=1;TU=C;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 50136971 . TTTTC T 99 PASS SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=0,20,12,8,9;CallSetAC2=0,1,1,0,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 50373155 . A AT 99 PASS SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=12,11,13,11,11;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=4;TU=AT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 50772065 . T TC 99 PASS SEQUENCING.AC=7;CallSetAC=0,0,7,0,0;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=DINDEL;HR=7;HU=T;IH=1;TR=7;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 50806976 . G GAA 99 PASS SEQUENCING.AC=309;CallSetAC=357,333,309,296,330;CallSetAC2=0,1,0,1,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=7;TU=AGG;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=128 GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0
-20 50961401 . G GT 99 PASS SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=12,11,13,10,11;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=4 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 51547787 . AC A 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,1,14,1,1;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 51838824 . GA G 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=2,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=3;HU=G;IH=0;TR=4;TU=AC;Set=BC;SEQUENOM.AC=4 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 51961394 . ATTTG A 99 PASS SEQUENCING.AC=14;CallSetAC=19,15,18,15,14;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=8 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 53081927 . CATGA C 99 PASS SEQUENCING.AC=9;CallSetAC=11,11,10,8,9;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 53538294 . T TG 99 PASS SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,0,2,0,0;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=DINDEL;HR=1;HU=G;IH=0;TR=7;TU=GT;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 53602394 . T TA 99 PASS SEQUENCING.AC=15;CallSetAC=18,18,15,15,14;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AC;Set=BC;SEQUENOM.AC=7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54124185 . T TC 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,1;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=5;TU=CT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54150907 . CAG C 99 PASS SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,4,3,4,4;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AG;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54166824 . AC A 99 PASS SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=6,6,8,4,5;CallSetAC2=1,1,2,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=A;IH=0;TR=4;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54230743 . CAT C 99 PASS SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=8,7,8,6,6;CallSetAC2=2,1,2,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AC;Set=BI;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54262948 . A AC 99 PASS SEQUENCING.AC=684;CallSetAC=0,0,0,710,0;CallSetAC2=0,0,0,3,0;Groups=OX;HR=6;HU=A;IH=1;TR=6;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54309727 . TGAGC T 99 PASS SEQUENCING.AC=19;CallSetAC=24,20,0,12,22;CallSetAC2=1,1,0,1,1;Groups=BC,BI,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=1;TU=G;Set=BC;SEQUENOM.AC=7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54379666 . GT G 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=4,15,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=172 GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0
-20 55264363 . AG A 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=12;CallSetAC=7,0,0,19,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC,OX;HR=1;HU=G;IH=0;TR=5;TU=AG;Set=OX;SEQUENOM.AC=530 GT 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 . 1/1 . 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1
-20 55608811 . CT C 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=2,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=2;HU=C;IH=0;TR=4;TU=CT;Set=BC;SEQUENOM.AC=35 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 55611547 . CAA C 99 PASS SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,3,6,3,3;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 55658161 . GT G 99 PASS SEQUENCING.AC=129;CallSetAC=0,136,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI;HR=1;HU=T;IH=0;TR=5;TU=GT;Set=BI;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 55989765 . CA C 99 TOO_MANY_ALT_ALLELES SEQUENCING.AC=15;CallSetAC=17,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=208 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 56249865 . T TGAGG 99 PASS SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=0,6,5,6,6;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=4 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 56344957 . GT G 99 PASS SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,4,5,4,4;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 56419021 . T TG 99 PASS SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=0,11,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI;HR=1;HU=G;IH=0;TR=1;TU=G;Set=BI;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 56915853 . TG T 99 PASS SEQUENCING.AC=27;CallSetAC=36,29,37,24,29;CallSetAC2=2,2,2,2,2;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=G;IH=0;TR=6;TU=GGT;Set=BC;SEQUENOM.AC=17 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 57676578 . CCTTT C 99 PASS SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=14,11,14,8,9;CallSetAC2=1,1,1,1,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=BI;SEQUENOM.AC=7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 58288793 . TC T 99 PASS SEQUENCING.AC=87;CallSetAC=101,106,87,65,66;CallSetAC2=2,3,2,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=C;IH=0;TR=1;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=44 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59153061 . CTG C 99 PASS SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,2,5,3,3;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59186675 . TATTA T 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,13,1,1;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=7;TU=AT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59349754 . CCT C 99 PASS SEQUENCING.AC=26;CallSetAC=108,28,0,0,30;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI,SAMTOOLS;HR=3;HU=C;IH=0;TR=3;TU=C;Set=BI;SEQUENOM.AC=168 GT 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59365768 . TG T 99 PASS SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,5,26,4,5;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59769242 . C CT 99 PASS SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=7,4,8,5,5;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=4 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 60337932 . AC A 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,6,2,2;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=6;TU=AAC;Set=OX;SEQUENOM.AC=3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 60925525 . GC G 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,6,0,2;CallSetAC2=0,1,1,0,1;Groups=BI,DINDEL,SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 61000018 . GC G 99 PASS SEQUENCING.AC=318;CallSetAC=0,348,0,317,0;CallSetAC2=0,1,0,2,0;Groups=BI,OX;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=OX;SEQUENOM.AC=203 GT 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 . 0/1 . 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0
-20 61531765 . AG A 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,8,2,2;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=4;TU=CG;Set=BI;SEQUENOM.AC=0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 61983510 . TCTGC T 99 PASS SEQUENCING.AC=124;CallSetAC=142,187,162,95,108;CallSetAC2=0,0,2,1,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=C;IH=0;TR=7;TU=CCT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=75 GT 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 62154368 . G GA 99 PASS SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,3,0,0,3;CallSetAC2=0,1,0,0,1;Groups=BI,SAMTOOLS;HR=4;HU=G;IH=0;TR=4;TU=G;Set=BI;SEQUENOM.AC=2 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 62310426 . CTT C 99 PASS SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,6,2,2;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=1 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 62871860 . C CCCGCA 99 PASS SEQUENCING.AC=26;CallSetAC=29,49,32,20,30;CallSetAC2=0,1,2,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=C;IH=0;TR=4;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=27 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.1
-##INFO=<ID=BCM.AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count from BCM's (sequencing-based) genotypes subsetted to the 383 validation samples">
-##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP Membership">
-##INFO=<ID=HW_VIOLATION,Number=0,Type=Flag,Description="Genotypes violate Hardy-Weinberg">
-##INFO=<ID=SEQUENOM.AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count from Sequenom genotyping">
-##INFO=<ID=SRC,Number=1,Type=String,Description="Type of SNPs submitted for validation; VQSR refers to preliminary consensus set, not the final one">
-##FILTER=<ID=AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS,Description="Possible Sequenom miscalls based on manual review of cluster plots">
-##FILTER=<ID=DUPLICATE_MAPPING,Description="Site did not map uniquely in the genome">
-##FILTER=<ID=HIGH_NO_CALL_RATE,Description="Extremely high no-call rate">
-##FILTER=<ID=INCORRECT_SEQUENOM_CALLS,Description="Clear Sequenom miscalls that cannot easily be fixed based on manual review of cluster plots">
-##FILTER=<ID=NOT_DESIGNED,Description="Site did not design or genotype">
-##FILTER=<ID=POLYMORPHIC_SAMPLES_FAILED,Description="All polymorphic samples from sequencing were no-called">
-##FILTER=<ID=POSSIBLE_PROBE_FAILURE,Description="Suspicious genotyping based on nearby SNPs">
-##fileDate=20110524
-##reference=ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/reference/human_g1k_v37.fasta.gz
-##source=EricBanksValidationQC;fromGoncaloAbecasisValidationSelection
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT HG00127 HG00128 HG00136 HG00137 HG00138 HG00139 HG00152 HG00156 HG00234 HG00235 HG00237 HG00242 HG00244 HG00262 HG01055 HG01079 NA19138 NA18974 NA18523 NA12717 NA19209 NA18577 NA18973 NA18943 NA12873 NA18623 NA18622 NA18948 NA19171 NA19204 NA06994 NA18563 NA18547 NA18861 NA18608 NA12282 NA12751 NA18959 NA19331 NA19453 NA20537 NA12046 NA20515 NA20516 NA20521 NA20524 NA20528 NA20759 NA20768 NA20769 NA20774 NA20775 NA20783 NA20787 NA20790 NA20800 NA20819 NA20812 NA20505 NA20530 NA20540 NA20538 NA20581 NA20815 NA20544 NA20810 NA20807 NA20816 NA20504 NA20753 NA20502 NA12342 NA19150 NA19468 NA20336 NA19395 NA19257 NA19360 NA19700 NA18867 NA20317 NA18968 NA19107 HG00111 HG00108 NA19077 NA19684 NA18511 NA12044 NA19382 NA19457 NA18933 NA18923 NA18965 HG00141 NA20341 NA18740 HG00537 HG00346 HG01173 HG00702 HG00313 HG00150 NA18612 HG00339 NA12273 HG00250 NA18593 NA18621 HG00478 HG00251 HG01070 NA19160 NA18995 NA10851 NA18976 NA18603 NA19200 HG01204 HG01191 HG01101 HG00146 HG00306 NA18985 HG00160 HG00635 HG00372 HG00357 HG00634 NA18541 NA18950 NA19759 HG00351 HG00257 HG00118 HG00336 HG00448 HG01354 NA18609 HG00428 HG00326 NA11894 NA18956 HG00173 HG00117 NA11893 HG01251 HG01441 HG01437 HG00182 HG00330 HG01060 HG00329 NA18960 NA18856 NA07346 NA18871 NA19057 NA18868 NA18636 NA12830 NA19007 NA18910 NA18874 NA19056 NA19064 NA19066 NA18487 NA18642 NA19236 NA07056 NA18637 NA19235 NA19309 NA19311 NA19334 NA19346 NA19347 NA19372 NA19376 NA19383 NA19384 NA19394 NA19428 NA19430 NA19451 NA19466 NA19313 NA19321 NA19324 NA19332 HG00479 HG00608 NA18573 HG00375 NA19248 NA19093 HG01170 HG00534 HG01171 HG01522 NA18624 HG00683 HG01521 NA19005 NA20412 NA18971 HG00446 NA12748 HG00530 HG00690 HG01356 HG01516 NA20532 HG00344 HG00328 NA18542 HG00254 HG00321 HG00577 HG00656 HG00342 HG00524 HG00650 HG00557 HG00319 HG00457 HG00125 HG00578 HG00543 HG00638 HG00171 HG00699 HG00595 HG00187 HG00704 HG00533 HG00596 HG00268 HG01083 HG00651 HG01133 HG00671 HG00327 HG01148 HG00246 HG00672 HG00556 HG00436 HG00554 NA18633 NA20344 NA11993 NA07037 NA11930 HG01366 HG01389 HG00620 NA19740 HG00190 HG00419 NA18535 HG01495 NA18592 HG01497 HG00174 HG01140 NA12287 HG00689 HG01550 HG00334 HG01375 HG00637 NA18507 HG01113 NA18550 NA19129 HG01551 HG01462 HG00331 NA12413 HG01456 HG01360 HG00708 HG01350 HG00684 NA19099 HG00284 NA12399 NA12286 NA12777 HG00277 HG00266 NA19985 HG00353 HG01102 NA07347 NA07051 NA19900 NA18984 NA07048 HG00640 HG01066 NA12812 HG01174 HG01188 NA19390 NA19436 NA19439 NA19440 NA19463 NA19470 NA19471 NA19472 NA19676 NA19660 NA19661 NA19663 NA19722 NA19725 NA19728 NA19729 NA19731 NA19749 NA19755 NA19756 NA19758 NA19770 NA19773 NA19777 NA19780 NA19783 NA20525 NA20589 NA20765 NA20802 NA20804 NA18544 NA18602 NA18546 NA18610 NA18957 NA18615 NA18616 NA19010 NA18638 NA18639 NA18627 NA19072 NA18630 NA19074 NA19080 NA19081 NA19083 NA19085 NA19088 NA20287 NA19835 NA20276 NA19818 NA20278 NA20282 NA20342 NA20296 NA20314 NA20346 NA19712 NA19198 NA19108 NA18934 NA18916 NA18907 NA18917 NA06989 NA12058 NA12341 NA12546 NA12489 HG01197 NA18983 NA11843 NA11892 NA12749
-20 82176 rs11906362 T C 318 NOT_DESIGNED BCM.AC=16;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 249843 rs112456910 C T 1304 PASS BCM.AC=14;DB;SEQUENOM.AC=12;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/1 . . 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 . . . 0/0 . 0/0 . . . . . . . . . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . . . . 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . . . . 0/0 0/0 . . 0/1 . . 0/0 . 0/1 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 . . . . . 0/0 . 0/1 . . . . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/1 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . . . . . . 0/0 . 0/0 . . . . . . . . . . 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/1 0/1 0/0 . . 0/0 0/0 . . 0/0 0/1 . . 0/1 . . . 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 .
-20 688672 rs116071340 C T 56 PASS BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 987773 rs6077519 T G 474 PASS DB;HW_VIOLATION;SEQUENOM.AC=73;SRC=VQSR-ONLY GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1166164 . G T 26 NOT_DESIGNED BCM.AC=20;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 1333317 . A G 4 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1372898 rs112426678 C A 833 PASS BCM.AC=7;DB;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1526045 rs11908182 A G 847 PASS BCM.AC=6;DB;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1565049 . C T 100 PASS SEQUENOM.AC=3;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1577285 . G A 4 HIGH_NO_CALL_RATE SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY GT . . . 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . . . . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . . . . . 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 . . . . . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . . 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 . . . . . . . . 0/0 . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 . 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 . . . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 . . . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 . . . . . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 . . . . . . 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0
-20 1577845 . G A 267 HIGH_NO_CALL_RATE BCM.AC=42;SEQUENOM.AC=5;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 . . 0/0 . . . . . . 0/0 . . 0/0 . . 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 . 1/1 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 . . . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 . . . . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 . . 0/0 . . . 0/0 . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 . . 0/0 . . 0/0 0/0 . . 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . . . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 . . 0/0 . . . . . 0/0 . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 . 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 . . . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 . 0/0 . . . . . . 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 . . . . 0/0 . 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/1 . 0/0 . . . 0/0 . 1/1 . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0
-20 1590306 . A G 16 AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS SEQUENOM.AC=177;SRC=VQSR-ONLY GT 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 . 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 . 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 . 0/0 . 0/1 0/1 0/1 . 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 . 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . . 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 . 0/1 0/1 0/1 0/1 . 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 . 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 . . 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 . 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0
-20 1643825 . G T 24 PASS BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1746733 . G A 9 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 1896670 . G C 16 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1934851 rs6045641 T C 53 NOT_DESIGNED BCM.AC=29;DB;SRC=VQSR-ONLY
-20 2083617 . G A 9 NOT_DESIGNED BCM.AC=4;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 2280790 rs214779 T A 57436 NOT_DESIGNED BCM.AC=758;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 2843004 rs118020362 T C 131 PASS BCM.AC=4;DB;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 2854191 . C T 78 POSSIBLE_PROBE_FAILURE BCM.AC=25;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 2999522 . G A 5 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 3935503 . G A 95 NOT_DESIGNED BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 4015187 . G C 93 DUPLICATE_MAPPING BCM.AC=14;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 4260976 rs75912589 A G 8109 PASS BCM.AC=94;DB;SEQUENOM.AC=95;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0
-20 4557512 . C A 8 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 4603711 . C T 20 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5021712 rs115278430 C A 76 NOT_DESIGNED BCM.AC=2;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 5137904 . C T 70 PASS BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5500990 rs116723001 C A 1701 PASS BCM.AC=14;DB;SEQUENOM.AC=13;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5524677 . C T 21 PASS BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5601529 rs6085225 G A 1415 PASS BCM.AC=33;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5773125 . G A 165 NOT_DESIGNED BCM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION
-20 5986950 rs6085343 G A 1226 PASS BCM.AC=68;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 6242013 . G A 10 DUPLICATE_MAPPING SRC=2-OF-7-ONLY
-20 6320495 . C A 16 NOT_DESIGNED BCM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 6575066 . T C 9.19 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7228334 . A G 108 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7274968 . C T 39 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7321986 . C G 5 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7377337 . C T 180 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7400995 rs114967944 C T 426 PASS BCM.AC=8;DB;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7466093 . C G 4.11 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7575759 rs28491496 A G 308 POSSIBLE_PROBE_FAILURE BCM.AC=17;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7678819 rs11699779 A G 12976 PASS BCM.AC=95;DB;SEQUENOM.AC=93;SRC=VQSR+INTERSECTION GT . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 . 0/1 . . 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1
-20 7924363 . G A 301 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 8165430 rs61262870 T C 1699 NOT_DESIGNED DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 8642873 . A G 19 NOT_DESIGNED BCM.AC=58;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 8700342 . T G 102 PASS BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 8799615 . C T 38 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 9149281 . C T 11 PASS BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 9214590 . T C 99 PASS BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 9276871 . C T 695 NOT_DESIGNED BCM.AC=11;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 10226915 rs74843547 G A 120 PASS BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 10259160 . T A 10 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 10482699 . G A 101 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 10625431 . T C 17 PASS BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 11506447 . G C 100 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 11565628 . G A 22 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 11625368 rs111669054 A G 138 PASS BCM.AC=2;DB;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 11798908 . A G 14 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12006592 . A G 57 PASS SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12025988 . C T 34 NOT_DESIGNED BCM.AC=43;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 12142653 . T A 12 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12171235 . A G 60 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12326082 . C T 118 NOT_DESIGNED SRC=VQSR+2-OF-7
-20 12364163 . A G 8 PASS SEQUENOM.AC=2;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12718574 rs112953117 G C 656 PASS BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13241902 . A C 52 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13339930 rs6042043 A G 839 NOT_DESIGNED BCM.AC=143;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 13410135 rs77634879 T A 50 PASS BCM.AC=39;DB;SEQUENOM.AC=37;SRC=VQSR-ONLY GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13764237 . C T 51 NOT_DESIGNED BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 14283363 rs111719158 G A 197 NOT_DESIGNED BCM.AC=6;DB;SRC=VQSR+INTERSECTION
-20 14589314 rs2209596 G T 30806 INCORRECT_SEQUENOM_CALLS BCM.AC=253;DB;SEQUENOM.AC=315;SRC=VQSR+INTERSECTION GT . 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 . 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 . 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 . 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 . 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 . 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1
-20 14843271 . A G 78 NOT_DESIGNED BCM.AC=343;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 15193914 . C T 48 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15581882 . C G 51 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15699667 . C T 59 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15913614 . G T 9 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16397068 . C G 1.16 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16475471 rs73597775 C T 234 HIGH_NO_CALL_RATE DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16487648 rs12479901 G A 1025 PASS BCM.AC=14;DB;SEQUENOM.AC=15;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0
-20 16936995 . C A 102 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17430784 . T C 18 PASS BCM.AC=7;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17828256 . C T 77 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17938631 . T C 218 PASS BCM.AC=8;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17980474 . G A 34 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17991241 . C T 49 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 18180100 . A G 100 NOT_DESIGNED SRC=2-OF-7-ONLY
-20 18198917 . C T 15 PASS SEQUENOM.AC=3;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18232143 rs77523268 C T 952 PASS BCM.AC=8;DB;SEQUENOM.AC=8;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18584068 . C A 81 DUPLICATE_MAPPING SRC=VQSR-ONLY
-20 19212550 . C A 11 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 19966683 rs199601 G A 56556 PASS BCM.AC=562;DB;SEQUENOM.AC=560;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 . 1/1 . 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 1/1
-20 20157470 rs74569344 G T 159 NOT_DESIGNED DB;SRC=VQSR-ONLY
-20 20850592 . G A 11.30 NOT_DESIGNED BCM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY
-20 20987147 . T C 58 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21056309 . T C 12.30 PASS SEQUENOM.AC=2;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21195714 . A C 12 NOT_DESIGNED BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 21477015 . G A 140 NOT_DESIGNED BCM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 21491513 . C T 11 NOT_DESIGNED BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 21530607 rs4627653 G A 3116 PASS BCM.AC=21;DB;SEQUENOM.AC=21;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21569638 . G C 35 PASS BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21579389 . C T 169 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 21624143 . T C 63 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21734208 . A G 5.74 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21754065 . G A 16 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21764267 . G A 164 PASS BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21863337 . T C 174 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 21910648 . C A 145 PASS BCM.AC=5;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 22016989 . G A 7 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 22168952 . G T 107 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23102548 . G C 15 PASS BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 23470735 . A T 12 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 23665595 . C T 205 PASS BCM.AC=4;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . . . 0/0 . . 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . .
-20 23758844 rs117686838 A T 1.18 NOT_DESIGNED DB;SRC=2-OF-7-ONLY
-20 23785676 . G A 90 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 24126594 . C T 16 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 24247752 . C T 6107 NOT_DESIGNED BCM.AC=42;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 24432806 . T C 21 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 24450030 . G A 8 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 24792588 . C T 17 NOT_DESIGNED SRC=VQSR+2-OF-7
-20 24875997 rs6106960 T C 35367 PASS BCM.AC=238;DB;SEQUENOM.AC=233;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 . 0/0 . 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1
-20 25133654 . G A 13.40 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 25388911 . G T 28 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 25574143 . G A 77 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 25659422 . A G 11 NOT_DESIGNED BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 25700728 rs6037216 C G 1553 POSSIBLE_PROBE_FAILURE BCM.AC=7;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 25741857 rs73347142 G T 41907 PASS DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 25750038 . T G 86 DUPLICATE_MAPPING BCM.AC=493;SRC=VQSR-ONLY
-20 25751184 . G C 100 DUPLICATE_MAPPING BCM.AC=180;SRC=2-OF-7-ONLY
-20 25766473 . T A 124 DUPLICATE_MAPPING SRC=VQSR+2-OF-7
-20 25789517 . A T 40 DUPLICATE_MAPPING BCM.AC=319;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 25794555 . G A 18 DUPLICATE_MAPPING BCM.AC=181;SRC=VQSR-ONLY
-20 25922316 . T C 26 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 25999667 . C G 32 DUPLICATE_MAPPING;INCORRECT_SEQUENOM_CALLS BCM.AC=61;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 26046637 . G A 26 DUPLICATE_MAPPING BCM.AC=354;SRC=VQSR-ONLY
-20 26057903 . G A 100 NOT_DESIGNED SRC=2-OF-7-ONLY
-20 26071009 . T C 9 DUPLICATE_MAPPING;AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS BCM.AC=586;SEQUENOM.AC=59;SRC=VQSR-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 26126724 . G C 23737 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 26217247 . C A 374 PASS BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 26246019 rs79506355 C A 999 NOT_DESIGNED DB;SRC=2-OF-7-ONLY
-20 26258231 rs79859288 C T 527 NOT_DESIGNED DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 26265474 . G T 460.59 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 26272553 . C G 100 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 26275939 . A G 81 NOT_DESIGNED SRC=2-OF-7-ONLY
-20 26293152 . T C 100 PASS BCM.AC=14;SEQUENOM.AC=17;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0
-20 26301426 . A G 63 AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 26301793 . C G 8 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 26304696 rs6051307 G A 100 PASS DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29494622 rs78775502 C T 935 PASS DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29514290 rs6087354 T A 19181 AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS DB;SEQUENOM.AC=278;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 . 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 . 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0
-20 29518801 rs113500384 G A 702.91 PASS DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29574811 rs73620522 G A 16281 HIGH_NO_CALL_RATE DB;SEQUENOM.AC=24;SRC=VQSR-ONLY GT 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . 1/1 . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 . . 0/0 1/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 . . . . 0/0 0/0 . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . . . . 0/0 . 0/0 . 0/1 . . . 0/1 . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 . . 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 . . 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 . . . . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 . . 0/0 . . . 1/1 . 0/0 0/0 . . . . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . . . . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 1/1 . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 . 0/0 . 1/1 . . . . . . . 1/1 . . . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 . . . 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 1/1
-20 29598472 rs73612735 T G 10639 NOT_DESIGNED DB;SRC=VQSR-ONLY
-20 29632410 . T C 5.11 NOT_DESIGNED SRC=2-OF-7-ONLY
-20 29642272 rs77298479 T A 100 NOT_DESIGNED DB;SRC=2-OF-7-ONLY
-20 29827087 rs62641496 G C 100 NOT_DESIGNED DB;SRC=2-OF-7-ONLY
-20 30120025 . C G 1113 POSSIBLE_PROBE_FAILURE BCM.AC=9;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30595334 rs62206358 C A 62 PASS BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30616314 . G A 176 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30696393 rs76882848 T C 150 PASS BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30884360 . C A 6 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30910907 . A T 24 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 31107862 . T C 46 PASS BCM.AC=6;SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 31316775 . T G 47 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 31576854 . C T 66 PASS BCM.AC=8;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32840139 . G A 1158 PASS BCM.AC=11;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 33588848 . C T 17 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 33974818 . G A 959 NOT_DESIGNED BCM.AC=12;SRC=VQSR+INTERSECTION
-20 34147834 rs368386 G A 105 NOT_DESIGNED BCM.AC=3;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 34155930 . T C 1200 NOT_DESIGNED BCM.AC=23;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 34589611 . C T 39 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 34595073 . T G 518 POSSIBLE_PROBE_FAILURE BCM.AC=4;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 35255604 . C T 367 POSSIBLE_PROBE_FAILURE BCM.AC=5;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 35644471 rs8115057 C T 10677 PASS BCM.AC=174;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 36480073 . T C 428 PASS BCM.AC=6;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 36563396 . G A 2.68 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 36645837 rs79088417 T C 342 NOT_DESIGNED DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 36667909 . C T 659 NOT_DESIGNED BCM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION
-20 36932648 rs5743498 C T 107 PASS BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37398143 . T A 31 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37790289 . G A 26 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37817201 . A G 222 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37873327 . A T 445 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37980382 . A G 78 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 38302429 rs73906408 C T 5149 PASS BCM.AC=24;DB;SEQUENOM.AC=24;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 38369195 . C T 43 DUPLICATE_MAPPING BCM.AC=56;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 38901146 . C T 2046 NOT_DESIGNED BCM.AC=60;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 39110108 . C T 4.13 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 39624865 . G A 584 NOT_DESIGNED BCM.AC=9;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 40505598 . A G 16 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 40927704 . T C 12 PASS BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41093733 . T C 5 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 41137712 rs230167 C T 24 NOT_DESIGNED DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 41311175 . C T 75 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41642529 . T G 72 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41756929 . C T 32 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41818162 rs117637352 G A 391 PASS BCM.AC=30;DB;SEQUENOM.AC=29;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42153349 . C T 25 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42171267 . A G 88.70 PASS SEQUENOM.AC=13;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42330199 . G A 590 PASS BCM.AC=5;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42474396 . G A 100 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42483892 . T C 112 NOT_DESIGNED BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 42500754 rs6513891 C A 619 PASS DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42575810 . T C 3.60 PASS SEQUENOM.AC=2;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42762553 rs5014517 C T 759.47 NOT_DESIGNED BCM.AC=366;DB;SRC=2-OF-7-ONLY
-20 42908494 . T C 42 PASS BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42927494 . C G 17 PASS BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43033625 . G A 100 NOT_DESIGNED SRC=2-OF-7-ONLY
-20 43066015 rs6093982 C T 290 PASS BCM.AC=2;DB;SEQUENOM.AC=5;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43506182 . T C 28 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43582424 rs79775916 C T 9 PASS BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43744100 . G C 4.80 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43899736 . G A 35 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 44373763 . C T 730 PASS BCM.AC=6;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 45097507 rs454429 C T 25449 PASS BCM.AC=302;DB;SEQUENOM.AC=300;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 . 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 . 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 . 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 1/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 45919615 . T C 46 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 46997402 rs34772061 C G 19 NOT_DESIGNED DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 47502684 . G A 66 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 48045398 . A G 20 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 48124745 . C T 10.30 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 48422538 rs73269151 A G 13012 NOT_DESIGNED BCM.AC=282;DB;SRC=VQSR+INTERSECTION
-20 48669886 rs73276465 G C 106 NOT_DESIGNED BCM.AC=8;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 48691248 . A G 95 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 48917711 rs116072324 T C 129 NOT_DESIGNED BCM.AC=1;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 49098380 . A T 115 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49206794 rs116083969 G A 19 PASS BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49360238 . G A 50 PASS BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49712636 rs113933231 T A 93 PASS BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 50309600 . C A 46 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 50599968 rs6096700 T C 10667 NOT_DESIGNED BCM.AC=426;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 50601297 . A T 7 PASS BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 50603254 rs6021599 A G 13052 NOT_DESIGNED BCM.AC=520;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 50810123 rs28420712 A T 2671 NOT_DESIGNED BCM.AC=228;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 50892806 . A G 37 NOT_DESIGNED BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 51511870 . C T 116 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 51818730 . C T 130 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 51958269 . G C 48 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 52285202 rs113200595 T G 11071 NOT_DESIGNED BCM.AC=198;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 52308503 . T C 651 PASS BCM.AC=5;SEQUENOM.AC=5;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 52470222 rs28606974 A G 72 NOT_DESIGNED BCM.AC=22;DB;SRC=VQSR-ONLY
-20 52485230 . G T 74 NOT_DESIGNED BCM.AC=21;SRC=VQSR-ONLY
-20 53017837 rs112388078 T C 1190 PASS BCM.AC=8;DB;SEQUENOM.AC=8;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 53031638 . T G 4 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 53272023 rs4362623 G A 70728 PASS BCM.AC=692;DB;SEQUENOM.AC=690;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 . 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1
-20 53423667 . T A 214 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 53580904 . T C 32 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 53599478 . C T 34 NOT_DESIGNED BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 54004274 rs114966870 A G 602 PASS BCM.AC=40;DB;SEQUENOM.AC=9;SRC=VQSR-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54096380 . G A 46 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54146938 . G A 27 POLYMORPHIC_SAMPLES_FAILED BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54163701 . A G 130 PASS BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . .
-20 54199759 . T C 198 NOT_DESIGNED BCM.AC=9;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 54313664 rs112885916 A T 98 PASS BCM.AC=10;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54424603 . T C 116 PASS BCM.AC=8;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54542220 . C T 33 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 54628591 . G A 87 POLYMORPHIC_SAMPLES_FAILED BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54793377 . C T 8 HIGH_NO_CALL_RATE BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY GT . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
-20 55067830 . G A 6 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 55113534 . T G 21 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 55195413 . A G 20 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 55483325 . C T 17 NOT_DESIGNED BCM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY
-20 55598554 . T C 22.30 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 55790632 . G T 39 HIGH_NO_CALL_RATE BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 . . 0/0 . . . . 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 . . . 0/0 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 . . . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . . . . . . 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 . . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . 0/0 . . 0/0 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 . . . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . . . 0/0 . . . 0/0 . . . . . . . . . . 0/0 0/0 . . . . 0/0 . . . . . . 0/0 0/0 . . . . . . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . . . . . 0/0 0/0 . . 0/0 0/0 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0/0 . . . . . . . . .
-20 55870101 . C T 129 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 56029723 rs74833660 G A 21 PASS BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 56309506 . C G 6.38 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 56335703 . G C 33 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 56549982 rs6099866 T C 999 PASS DB;SEQUENOM.AC=9;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 56792927 . C T 207 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 57266953 . C A 46 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 57566637 rs149265 C T 58555 PASS BCM.AC=513;DB;SEQUENOM.AC=505;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 . 1/1 1/1 1/1 1/1 . 0/1 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 . 1/1 . 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 . 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/0 0/0 0/0 1/1 1/1 0/0 0/0 1/1 0/1 1/1 0/0 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/0 0/1 1/1 0/1 0/0 0/1 1/1 1/1 0/1 0/0 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 . 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/0 1/1 1/1 0/0 0/1 0/1 0/0 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 . 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 1/1 0/0 1/1 0/0 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/1 1/1 0/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 1/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/0 0/0 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 1/1 0/1 0/1 0/1 0/1
-20 57653509 rs6026678 C T 489 PASS BCM.AC=4;DB;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 57728647 . C T 13 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 58308048 . A G 35 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 1/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 58335635 . C T 7 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59211281 . A G 4.33 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59286435 . T C 5.69 PASS SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 60262734 rs73915327 C A 576 PASS BCM.AC=10;DB;SEQUENOM.AC=10;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/1 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 60291372 . A G 100 NOT_DESIGNED BCM.AC=21;SRC=2-OF-7-ONLY
-20 60520698 . T C 428 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 60547414 . G T 10 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 60560062 . C T 25 NOT_DESIGNED BCM.AC=343;SRC=VQSR-ONLY
-20 60578895 . G T 34 PASS BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 60641243 . G A 16 NOT_DESIGNED BCM.AC=150;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 60641369 . G A 16 PASS BCM.AC=159;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 60730826 . G A 11 AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY GT . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 61206227 . C T 4.25 NOT_DESIGNED SRC=2-OF-7-ONLY
-20 61286252 rs13433258 C T 123 PASS BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 61497927 . A C 47 PASS BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 61766484 . G T 58 NOT_DESIGNED BCM.AC=157;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 61788338 . C G 7 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 61830486 . G A 48 PASS BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 62191452 rs113748232 C T 143 PASS BCM.AC=7;DB;SEQUENOM.AC=7;SRC=VQSR+INTERSECTION GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/1 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 62462285 . G A 66 NOT_DESIGNED BCM.AC=304;SRC=VQSR+2-OF-7
-20 62480353 . T A 100 PASS SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 62724959 . G T 10 NOT_DESIGNED SRC=VQSR-ONLY
-20 62888718 . T C 57 POLYMORPHIC_SAMPLES_FAILED BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 62918298 . G A 33 NOT_DESIGNED SRC=VQSR+2-OF-7
-20 62961477 . T C 17 AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.0
-##FILTER=<ID=HardyWeinbergViolation,Description="The validation is in Hardy-Weinberg violation">
-##FILTER=<ID=HighNoCallRate,Description="The validation no-call rate is too high">
-##FILTER=<ID=TooManyHomVars,Description="The validation homozygous variant rate is too high">
-##INFO=<ID=AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
-##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
-##INFO=<ID=HW,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled Hardy-Weinberg violation p-value">
-##INFO=<ID=HetPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of heterozygous genotypes">
-##INFO=<ID=HomRefPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of homozygous reference genotypes">
-##INFO=<ID=HomVarPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent homozygous variant genotypes">
-##INFO=<ID=NoCallPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of no-calls">
-##ValidationMetrics_HardyWeinbergViolations="25 (8%)"
-##ValidationMetrics_HomVarViolations="0 (0%)"
-##ValidationMetrics_NoCallViolations="13 (4%)"
-##ValidationMetrics_PolymorphicPassingRecords="195 (75%)"
-##ValidationMetrics_RecordsPassingFilters="258 (87%)"
-##ValidationMetrics_RecordsProcessed=296
-##ValidationMetrics_SamplesAssayed=383
-##VariantValidationAssessor="analysis_type=VariantValidationAssessor input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[rawData/plink.renamed.sorted.fixed.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub maxHardy=20.0 maxNoCall=0.05 maxHomVar=1.1"
-##source=PLINK
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT HG00127 HG00128 HG00136 HG00137 HG00138 HG00139 HG00152 HG00156 HG00234 HG00235 HG00237 HG00242 HG00244 HG00262 HG01055 HG01079 NA19138 NA18974 NA18523 NA12717 NA19209 NA18577 NA18973 NA18943 NA12873 NA18623 NA18622 NA18948 NA19171 NA19204 NA06994 NA18563 NA18547 NA18861 NA18608 NA18995 NA10851 NA18976 NA18603 NA19200 HG01204 HG01191 HG01101 HG00146 HG00306 NA18985 HG00160 HG00635 HG00372 HG00357 HG00634 NA18541 NA18950 NA19759 HG00351 HG00257 HG00118 HG00336 HG00448 HG01354 NA18609 HG00428 HG00326 NA11894 NA18956 HG00173 HG00117 NA11893 HG01251 HG01441 HG01437 HG00182 HG00330 HG01060 HG00329 NA18960 NA18856 NA07346 NA18871 NA19057 NA18868 NA18636 NA12830 NA19007 NA18910 NA18874 NA19056 NA19064 NA19066 NA18487 NA18642 NA19236 NA07056 NA18637 NA19235 NA19309 NA19311 NA19334 NA19346 NA19347 NA19372 NA19376 NA19383 NA19384 NA19394 NA19428 NA19430 NA19451 NA19466 NA19313 NA19321 NA19324 NA19332 NA19390 NA19436 NA19439 NA19440 NA19463 NA19470 NA19471 NA19472 NA19676 NA19660 NA19661 NA19663 NA19722 NA19725 NA19728 NA19729 NA19731 NA19749 NA19755 NA19756 NA19758 NA19770 NA19773 NA19777 NA19780 NA19783 NA20525 NA20589 NA20765 NA20802 NA20804 NA18544 NA18602 NA18546 NA18610 NA18957 NA18615 NA18616 NA19010 NA18638 NA18639 NA18627 NA19072 NA18630 NA19074 NA19080 NA19081 NA19083 NA19085 NA19088 NA20287 NA19835 NA20276 NA19818 NA20278 NA20282 NA20342 NA20296 NA20314 NA20346 NA19712 NA19198 NA19108 NA18934 NA18916 NA18907 NA18917 NA06989 NA12058 NA12341 NA12546 NA12489 HG01197 NA18983 NA11843 NA11892 NA12749 NA12282 NA12751 NA18959 NA19331 NA19453 NA20537 NA12046 NA20515 NA20516 NA20521 NA20524 NA20528 NA20759 NA20768 NA20769 NA20774 NA20775 NA20783 NA20787 NA20790 NA20800 NA20819 NA20812 NA20505 NA20530 NA20540 NA20538 NA20581 NA20815 NA20544 NA20810 NA20807 NA20816 NA20504 NA20753 NA20502 NA12342 NA19150 NA19468 NA20336 NA19395 NA19257 NA19360 NA19700 NA18867 NA20317 NA18968 NA19107 HG00111 HG00108 NA19077 NA19684 NA18511 NA12044 NA19382 NA19457 NA18933 NA18923 NA18965 HG00141 NA20341 NA18740 HG00537 HG00346 HG01173 HG00702 HG00313 HG00150 NA18612 HG00339 NA12273 HG00250 NA18593 NA18621 HG00478 HG00251 HG01070 NA19160 HG00479 HG00608 NA18573 HG00375 NA19248 NA19093 HG01170 HG00534 HG01171 HG01522 NA18624 HG00683 HG01521 NA19005 NA20412 NA18971 HG00446 NA12748 HG00530 HG00690 HG01356 HG01516 NA20532 HG00344 HG00328 NA18542 HG00254 HG00321 HG00577 HG00656 HG00342 HG00524 HG00650 HG00557 HG00319 HG00457 HG00125 HG00578 HG00543 HG00638 HG00171 HG00699 HG00595 HG00187 HG00704 HG00533 HG00596 HG00268 HG01083 HG00651 HG01133 HG00671 HG00327 HG01148 HG00246 HG00672 HG00556 HG00436 HG00554 NA18633 NA20344 NA11993 NA07037 NA11930 HG01366 HG01389 HG00620 NA19740 HG00190 HG00419 NA18535 HG01495 NA18592 HG01497 HG00174 HG01140 NA12287 HG00689 HG01550 HG00334 HG01375 HG00637 NA18507 HG01113 NA18550 NA19129 HG01551 HG01462 HG00331 NA12413 HG01456 HG01360 HG00708 HG01350 HG00684 NA19099 HG00284 NA12399 NA12286 NA12777 HG00277 HG00266 NA19985 HG00353 HG01102 NA07347 NA07051 NA19900 NA18984 NA07048 HG00640 HG01066 NA12812 HG01174 HG01188
-20 676148 . A AC . PASS AC=0;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1342549 . A AAGAT . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1366475 . CT C . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 1550416 . C CT . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 3700705 . CTTTGGG C . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 5724449 . T TC . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 7942727 . A AC . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 9231138 . AT A . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 10090376 . T TG . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12094344 . TCAGGAGGC T . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12634463 . TGA T . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12837095 . G GA . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 12928028 . TG T . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13365589 . T TG . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 13926445 . TA T . PASS AC=0;AN=756;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 14287634 . AGT A . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 14983337 . AGCC A . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15037520 . A AG . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 15141272 . T TC . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16192114 . AT A . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 16259934 . C CAA . PASS AC=0;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17250858 . T TC . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 17753474 . C CA . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 18520672 . A ATT . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 19188693 . T TC . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 19437778 . GGCCTGGGATGTAAA G . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20434198 . TA T . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 20990240 . TC T . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 24710482 . GT G . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 25905250 . GT G . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29589873 . CCTT C . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29628180 . C CCACAAGAAG . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 29804699 . A AC . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 30567910 . T TG . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 31760870 . CG C . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32456076 . GT G . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 32968409 . GTC G . PASS AC=0;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 34313574 . A AT . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 35329008 . ATC A . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 37954797 . A AGT . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 39607037 . C CA . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 39868369 . T TG . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 40006262 . TGAG T . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 40110981 . A AG . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 40742257 . TG T . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 41964672 . A AT . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42145613 . TG T . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 42930748 . A AG . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43606638 . T TC . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 43826992 . GC G . PASS AC=0;AN=748;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=2.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 44470843 . GAGTGTCGT G . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 45300827 . CT C . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 46353646 . A AG . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 47428163 . C CA . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49451656 . T TG . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49561273 . A AG . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 49765611 . A AC . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 50772065 . T TC . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 53538294 . T TG . PASS AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 54262948 . A AC . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 55658161 . GT G . PASS AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 59186675 . TATTA T . PASS AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 . 0/0 . 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
-20 61531765 . AG A . PASS AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0 GT 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.0
-#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT DNA_pool_A
-chr1 1281168 . A G 14 . DP=37;AF1=0.6243;CI95=0.5,1;DP4=4,0,6,0;MQ=15;PV4=1,0.027,1,1 PL:GT:GQ 43,0,4:0/1:6
-chr1 1281205 . T C 26 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ 58,9,0:1/1:63
-chr1 1281206 . G C 25 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ 57,9,0:1/1:63
-chr1 1922737 . G C 13.2 . DP=21;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,21;MQ=22 PL:GT:GQ 46,63,0:1/1:99
-chr1 21197513 . A G 55.1 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=41 PL:GT:GQ 88,21,0:1/1:84
-chr1 21343209 . T C 5.45 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=14 PL:GT:GQ 37,51,0:1/1:99
-chr1 22097362 . T C 4.75 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30 PL:GT:GQ 35,9,0:1/1:63
-chr1 22254012 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 22650927 . G A 48.1 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=24 PL:GT:GQ 81,21,0:1/1:84
-chr1 23535401 . C T 40.4 . DP=25;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,16,0,5;MQ=19;PV4=1,0.2,1,1 PL:GT:GQ 73,13,0:1/1:65
-chr1 23543855 . T C 49.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=44 PL:GT:GQ 82,18,0:1/1:90
-chr1 24245107 . C G 32 . DP=4;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=36;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,0,35:0/1:38
-chr1 24274412 . G C 39.5 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=32 PL:GT:GQ 72,12,0:1/1:72
-chr1 36529832 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr1 37788090 . A G 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr1 43120440 . C T 34 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=49;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 64,0,31:0/1:34
-chr1 43980466 . C T 43 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=19 PL:GT:GQ 76,45,0:1/1:99
-chr1 46047795 . T C 29.1 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=31 PL:GT:GQ 62,18,0:1/1:90
-chr1 48860309 . C T 99 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=46 PL:GT:GQ 141,18,0:1/1:90
-chr1 49415599 . T C 4.61 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
-chr1 51601816 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 51955459 . G C 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr1 68479569 . T G 12 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 43,6,0:1/1:49
-chr1 69032455 . A G 15.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ 47,9,0:1/1:63
-chr1 71888225 . G T 9.31 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 72381528 . T C 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr1 82004013 . A G 37.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50 PL:GT:GQ 70,12,0:1/1:72
-chr1 86289622 . C T 18 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42 PL:GT:GQ 50,9,0:1/1:63
-chr1 90267663 . A G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=45 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr1 92699542 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 94867317 . G A 26.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 58,6,0:1/1:49
-chr1 96428713 . C G 3.98 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=27 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr1 100466329 . G C 4.85 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=22 PL:GT:GQ 36,18,0:1/1:90
-chr1 101909281 . G A 70 . DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=46;PV4=1,1,0.096,1 PL:GT:GQ 100,0,88:0/1:91
-chr1 106216572 . T A 22 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,16,0;MQ=21 PL:GT:GQ 55,48,0:1/1:99
-chr1 107901770 . T C 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 108431179 . A G 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=41 PL:GT:GQ 155,24,0:1/1:96
-chr1 112005344 . C T 99 . DP=52;AF1=1;CI95=1,1;DP4=7,0,27,0;MQ=44;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 196,25,0:1/1:99
-chr1 116625452 . C T 36 . DP=44;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,23,0,20;MQ=49;PV4=1,2.3e-69,0.42,1 PL:GT:GQ 66,0,179:0/1:69
-chr1 118060710 . G T 6.98 . DP=8;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=47;PV4=1,0.0071,1,1 PL:GT:GQ 36,0,73:0/1:39
-chr1 118198177 . A G 15.9 . DP=23;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:GT:GQ 47,6,0:1/1:49
-chr1 118586346 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 120809555 . G A 20 . DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,2,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 50,0,106:0/1:53
-chr1 130723110 . C A 20.7 . DP=8;AF1=0.5939;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,2;MQ=26;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 50,0,5:0/1:7
-chr1 133979895 . T C 14.9 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr1 134977940 . C T 30 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=38;PV4=1,1,0.26,1 PL:GT:GQ 60,0,31:0/1:34
-chr1 141768589 . G A 18.1 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,4,0;MQ=51;PV4=1,2.7e-05,1,1 PL:GT:GQ 48,0,100:0/1:51
-chr1 141768590 . G A 22 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=50;PV4=1,0.0033,1,1 PL:GT:GQ 52,0,40:0/1:43
-chr1 146506051 . T C 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=43 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr1 150997009 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 162915612 . G C 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr1 168455400 . A G 4.12 . DP=28;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,27;MQ=10 PL:GT:GQ 35,81,0:1/1:99
-chr1 172784744 . T C 17.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 49,6,0:1/1:49
-chr1 183627307 . G A 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr1 185789457 . T C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr1 187081827 . T C 4.77 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=17 PL:GT:GQ 36,30,0:1/1:99
-chr1 188468339 . C T 33 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=24 PL:GT:GQ 66,39,0:1/1:99
-chr1 188595435 . C T 41.8 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr1 188670561 . G C 3.55 . DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=18 PL:GT:GQ 34,27,0:1/1:99
-chr1 188924877 . G A 6.2 . DP=10;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=21;PV4=1,1,1,0.3 PL:GT:GQ 35,3,0:1/1:41
-chr1 190536295 . G A 68 . DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,36,0;MQ=18 PL:GT:GQ 101,108,0:1/1:99
-chr1 191129408 . T A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 195937816 . T C 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr1 198857619 . T C 89 . DP=61;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,38,0,17;MQ=30;PV4=1,0.032,1,1 PL:GT:GQ 119,0,139:0/1:99
-chr1 199057483 . T C 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr1 200133619 . G C 5.83 . DP=49;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=2,0,8,0;MQ=17;PV4=1,0.059,1,0.2 PL:GT:GQ 37,12,0:1/1:72
-chr1 200729661 . A T 36 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=27 PL:GT:GQ 69,42,0:1/1:99
-chr1 201374519 . T C 69.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=39 PL:GT:GQ 102,12,0:1/1:72
-chr1 202811668 . G A 20.2 . DP=4;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,3;MQ=24;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 50,0,12:0/1:15
-chr1 202960650 . C T 16.6 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=27 PL:GT:GQ 49,12,0:1/1:72
-chr1 205686638 . C T 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr1 205949857 . A G 3.14 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=21 PL:GT:GQ 33,15,0:1/1:75
-chr1 209806643 . A G 13.2 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=21 PL:GT:GQ 46,24,0:1/1:96
-chr1 209871501 . C T 25 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,4,0;MQ=41;PV4=1,7.7e-06,1,1 PL:GT:GQ 55,0,84:0/1:58
-chr1 211051323 . G A 99 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=49 PL:GT:GQ 176,24,0:1/1:96
-chr1 211389716 . C T 12 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ 43,6,0:1/1:49
-chr1 211868415 . G A 3.54 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=14 PL:GT:GQ 34,33,0:1/1:99
-chr1 211914531 . C T 84.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,4;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 116,7,0:1/1:57
-chr1 214691313 . A G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr1 215184650 . C T 40.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ 72,6,0:1/1:49
-chr1 215995258 . A G 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr1 217031394 . G C 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr1 217986960 . T C 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr1 218086681 . A G 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=34 PL:GT:GQ 142,27,0:1/1:99
-chr1 218546019 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 218632417 . G T 17.1 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=26 PL:GT:GQ 50,21,0:1/1:84
-chr1 218833355 . C G 23 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,2,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 53,0,63:0/1:56
-chr1 219303186 . T C 7.79 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,25;MQ=12 PL:GT:GQ 40,75,0:1/1:99
-chr1 219517634 . G A 26.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=42 PL:GT:GQ 59,12,0:1/1:72
-chr1 219590158 . T C 3.27 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 33,12,0:1/1:72
-chr1 219709853 . A T 99 . DP=124;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=80,0,41,0;MQ=44;PV4=1,0.26,1,1 PL:GT:GQ 143,0,156:0/1:99
-chr1 222457988 . A G 11.1 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=23 PL:GT:GQ 42,6,0:1/1:49
-chr1 222477914 . A G 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr1 223010233 . A G 18.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr1 223796360 . G A 6.79 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=21 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr1 224273784 . A T 14.2 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=15 PL:GT:GQ 47,30,0:1/1:99
-chr1 224454685 . C T 46.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=32 PL:GT:GQ 79,15,0:1/1:75
-chr1 224514706 . G C 21 . DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,38,0;MQ=19 PL:GT:GQ 54,114,0:1/1:99
-chr1 224515793 . C T 99 . DP=26;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,26,0;MQ=45 PL:GT:GQ 211,78,0:1/1:99
-chr1 224692969 . C A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr1 225607249 . A G 34 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=45;PV4=1,1,0,1 PL:GT:GQ 64,0,31:0/1:34
-chr1 226923918 . C A 29.1 . DP=52;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,10;MQ=27;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,18,0:1/1:90
-chr1 227125189 . T C 56.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=41 PL:GT:GQ 89,12,0:1/1:72
-chr1 227133712 . A T 20.1 . DP=26;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,10,0;MQ=23;PV4=1,1,0.48,1 PL:GT:GQ 50,0,39:0/1:42
-chr1 227943954 . G C 47 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=37 PL:GT:GQ 79,9,0:1/1:63
-chr1 227943974 . G A 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=34 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr1 228067480 . A G 42.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=45 PL:GT:GQ 75,15,0:1/1:75
-chr1 228067510 . A G 99 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=45 PL:GT:GQ 140,15,0:1/1:75
-chr1 228088778 . C T 6.79 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=23 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr1 228117888 . A C 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr1 228139641 . T C 44.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 77,12,0:1/1:72
-chr1 228577146 . T C 26 . DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,14;MQ=22;PV4=1,1,1,0.027 PL:GT:GQ 56,0,77:0/1:59
-chr1 229001369 . C A 45 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ 77,9,0:1/1:63
-chr1 229001386 . C T 8.44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 39,6,0:1/1:49
-chr1 229348080 . T C 18.1 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=40;PV4=1,0.33,0.17,0.33 PL:GT:GQ 48,0,31:0/1:34
-chr1 229439710 . C T 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=32 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr1 229655149 . T C 30 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=30 PL:GT:GQ 63,24,0:1/1:96
-chr1 229660873 . C G 81 . DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,20,0,7;MQ=36;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 111,0,120:0/1:99
-chr2a 3661005 . C G 24 . DP=13;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,4,0;MQ=27;PV4=1,1.1e-05,1,1 PL:GT:GQ 54,0,34:0/1:37
-chr2a 4140063 . G A 81 . DP=26;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=18,0,8,0;MQ=24;PV4=1,8.3e-09,1,1 PL:GT:GQ 110,0,3:0/1:5
-chr2a 4248440 . T C 20 . DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,7,0;MQ=25;PV4=1,1,0.47,1 PL:GT:GQ 50,0,92:0/1:53
-chr2a 4707656 . A G 63 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 95,9,0:1/1:63
-chr2a 5194801 . G A 7.59 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=24 PL:GT:GQ 38,6,0:1/1:49
-chr2a 14111103 . A G 7.84 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=20 PL:GT:GQ 40,21,0:1/1:84
-chr2a 17799746 . A G 11.3 . DP=5;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 41,0,35:0/1:37
-chr2a 24728910 . G A 45.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=28 PL:GT:GQ 78,15,0:1/1:75
-chr2a 29627939 . G T 5.44 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=27 PL:GT:GQ 36,9,0:1/1:63
-chr2a 31373164 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr2a 33935228 . T C 41.8 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr2a 36311856 . G A 99 . DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,29;MQ=44 PL:GT:GQ 213,87,0:1/1:99
-chr2a 39281204 . T C 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr2a 41087565 . C T 74.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=38 PL:GT:GQ 107,12,0:1/1:72
-chr2a 45574768 . C A 11.3 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=18 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr2a 55464464 . T C 26.1 . DP=7;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=5,0,2,0;MQ=26;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 55,1,0:1/1:23
-chr2a 63107673 . T A 70.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=34 PL:GT:GQ 103,12,0:1/1:72
-chr2a 63141732 . A T 22.8 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 54,6,0:1/1:49
-chr2a 63141910 . G A 3.41 . DP=16;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ 32,6,0:1/1:49
-chr2a 63141911 . C T 9.55 . DP=16;AF1=0.5031;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,3;MQ=33;PV4=1,0.43,1,1 PL:GT:GQ 39,0,19:0/1:22
-chr2a 63143543 . C T 28 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,17;MQ=16;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 61,42,0:1/1:99
-chr2a 66419805 . G A 3.69 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 34,15,0:1/1:75
-chr2a 66563922 . C T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr2a 67719136 . C T 39.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 71,6,0:1/1:49
-chr2a 72781453 . A C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr2a 76733211 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr2a 78190502 . A C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr2a 85021209 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr2a 88554861 . A T 39 . DP=74;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,4;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 69,0,92:0/1:72
-chr2a 88554877 . A G 92 . DP=90;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,23,0,13;MQ=41;PV4=1,0.3,1,1 PL:GT:GQ 122,0,128:0/1:99
-chr2a 88824857 . G A 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=37 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr2a 93546675 . C T 26 . DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,2,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 56,0,87:0/1:59
-chr2a 94788853 . A G 34.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43 PL:GT:GQ 67,15,0:1/1:75
-chr2a 96738146 . T C 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr2a 102737384 . A G 12.3 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,18,0;MQ=11 PL:GT:GQ 45,54,0:1/1:99
-chr2a 103407172 . A G 35 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=19 PL:GT:GQ 68,24,0:1/1:96
-chr2a 105774580 . T G 99 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=30 PL:GT:GQ 135,39,0:1/1:99
-chr2a 106376301 . C G 24.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=19 PL:GT:GQ 57,18,0:1/1:90
-chr2a 106376315 . C T 8.75 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=19 PL:GT:GQ 41,18,0:1/1:90
-chr2a 112422267 . C T 30 . DP=20;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=14,0,5,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 60,0,131:0/1:63
-chr2b 3049384 . A C 14.9 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr2b 3049385 . G C 14.9 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr2b 3049406 . C G 99 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=36 PL:GT:GQ 135,18,0:1/1:90
-chr2b 4213802 . T C 89.5 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr2b 5022895 . G A 66 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=49 PL:GT:GQ 99,30,0:1/1:99
-chr2b 6037666 . G T 56 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=17 PL:GT:GQ 89,39,0:1/1:99
-chr2b 13656952 . G A 19.2 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=21 PL:GT:GQ 52,18,0:1/1:90
-chr2b 15026944 . A G 6.79 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr2b 23362613 . A G 5.64 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22 PL:GT:GQ 37,15,0:1/1:75
-chr2b 45947861 . C G 68 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=50 PL:GT:GQ 101,33,0:1/1:99
-chr2b 46597824 . T C 65.6 . DP=39;AF1=0.5939;CI95=0.5,1;DP4=23,0,10,0;MQ=22;PV4=1,0.014,1,1 PL:GT:GQ 95,0,5:0/1:7
-chr2b 49665191 . G T 34.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=37 PL:GT:GQ 67,21,0:1/1:84
-chr2b 61001546 . A G 48 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=26 PL:GT:GQ 81,24,0:1/1:96
-chr2b 88502851 . T C 4.77 . DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=37;PV4=1,1,0.46,1 PL:GT:GQ 33,0,34:0/1:33
-chr2b 91675431 . C T 30 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=27 PL:GT:GQ 63,24,0:1/1:96
-chr2b 91870148 . T G 67 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,13;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 100,31,0:1/1:99
-chr2b 97066826 . G A 20.1 . DP=9;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,2;MQ=31;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 50,0,35:0/1:38
-chr2b 97670822 . G A 4.85 . DP=6;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=18 PL:GT:GQ 36,18,0:1/1:90
-chr2b 102773175 . A G 17.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38 PL:GT:GQ 49,9,0:1/1:63
-chr2b 109805532 . T C 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=45 PL:GT:GQ 176,24,0:1/1:96
-chr2b 110841448 . A G 11.1 . DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 42,6,0:1/1:49
-chr2b 123217025 . T C 31.5 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=37 PL:GT:GQ 64,12,0:1/1:72
-chr2b 123263214 . A G 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr2b 127747292 . C T 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=52 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr2b 130121958 . A G 89.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43 PL:GT:GQ 122,15,0:1/1:75
-chr2b 130253633 . A G 14.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr2b 130692761 . C T 49.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=51 PL:GT:GQ 82,18,0:1/1:90
-chr2b 130743365 . A G 99 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=42 PL:GT:GQ 140,15,0:1/1:75
-chr2b 131553874 . A C 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=37 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr2b 131716894 . A G 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=40 PL:GT:GQ 137,24,0:1/1:96
-chr2b 131716936 . G A 99 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=36 PL:GT:GQ 173,36,0:1/1:99
-chr2b 131716952 . A G 99 . DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,14;MQ=36;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 152,0,43:0/1:46
-chr2b 133360184 . C T 99 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,20;MQ=32 PL:GT:GQ 163,60,0:1/1:99
-chr2b 133644741 . T A 16.4 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=27 PL:GT:GQ 49,15,0:1/1:75
-chr2b 133720595 . T C 41 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=29 PL:GT:GQ 74,36,0:1/1:99
-chr2b 133727192 . C T 19.3 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 52,15,0:1/1:75
-chr2b 133727260 . G A 3.56 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=18 PL:GT:GQ 34,24,0:1/1:95
-chr2b 133800294 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=23 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr2b 134582754 . A C 56.1 . DP=37;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=36 PL:GT:GQ 89,21,0:1/1:84
-chr2b 134582763 . G C 78 . DP=37;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,36;MQ=34 PL:GT:GQ 111,108,0:1/1:99
-chr2b 134809668 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr3 527814 . C G 46 . DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,3,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 76,0,106:0/1:79
-chr3 559510 . G A 38 . DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,0,17,0;MQ=28;PV4=1,1,0.014,1 PL:GT:GQ 68,0,111:0/1:71
-chr3 879433 . T G 32 . DP=4;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,0,34:0/1:37
-chr3 1809645 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr3 3235812 . C T 7.59 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 38,6,0:1/1:49
-chr3 3250176 . A G 83 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=32 PL:GT:GQ 116,24,0:1/1:96
-chr3 5049073 . T A 99 . DP=25;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,0,9,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 136,0,129:0/1:99
-chr3 5142874 . G A 99 . DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,38,0;MQ=28 PL:GT:GQ 179,114,0:1/1:99
-chr3 5554864 . T C 3.54 . DP=7;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,3;MQ=27;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 31,0,35:0/1:33
-chr3 5749648 . G A 21.2 . DP=26;AF1=0.7303;CI95=0.5,1;DP4=0,7,0,7;MQ=26;PV4=1,0.16,1,0.17 PL:GT:GQ 50,0,2:0/1:3
-chr3 16451708 . A T 71.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=38 PL:GT:GQ 104,15,0:1/1:75
-chr3 23410276 . G A 99 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45 PL:GT:GQ 140,15,0:1/1:75
-chr3 51368824 . A G 28 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ 60,9,0:1/1:63
-chr3 53000453 . A G 54 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=19 PL:GT:GQ 87,30,0:1/1:99
-chr3 53000463 . A G 54 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=19 PL:GT:GQ 87,30,0:1/1:99
-chr3 59077423 . C T 77.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=33 PL:GT:GQ 110,15,0:1/1:75
-chr3 60040501 . T C 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr3 64203481 . A G 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr3 67947441 . C T 17.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ 50,12,0:1/1:72
-chr3 76372631 . A G 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr3 80611316 . C G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr3 81554381 . G T 17.6 . DP=24;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=26 PL:GT:GQ 50,12,0:1/1:72
-chr3 87614647 . A G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr3 93900455 . A T 11.6 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=13 PL:GT:GQ 44,15,0:1/1:75
-chr3 96174457 . A G 4.11 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=24 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
-chr3 96215569 . A C 3.41 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ 32,6,0:1/1:49
-chr3 96587998 . A C 7.08 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,6,0;MQ=17 PL:GT:GQ 39,18,0:1/1:90
-chr3 99711220 . A C 12.8 . DP=11;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 42,2,0:1/1:37
-chr3 99789741 . C G 99 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=47 PL:GT:GQ 210,51,0:1/1:99
-chr3 103667651 . A C 3.98 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr3 104604896 . G C 55 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:GT:GQ 87,9,0:1/1:63
-chr3 104997217 . G A 33.1 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,16,0;MQ=34;PV4=1,3e-10,0.17,0.36 PL:GT:GQ 66,19,0:1/1:76
-chr3 106097816 . A G 28 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=26 PL:GT:GQ 61,45,0:1/1:99
-chr3 106822259 . G C 99 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=50 PL:GT:GQ 140,15,0:1/1:75
-chr3 109946413 . G A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr3 121238963 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr3 126248567 . A G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr3 129733836 . A G 6.2 . DP=4;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=43;PV4=1,0.02,0.31,1 PL:GT:GQ 35,0,28:0/1:30
-chr3 131372785 . C T 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=34 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr3 132290987 . C T 22 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=45 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr3 136054421 . C T 73 . DP=82;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,78,0;MQ=28 PL:GT:GQ 106,235,0:1/1:99
-chr3 141075246 . G A 30.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=41 PL:GT:GQ 62,6,0:1/1:49
-chr3 141075262 . T G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=41 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr3 141430649 . G T 81.8 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,4;MQ=41;PV4=1,0.34,1,0.25 PL:GT:GQ 113,6,0:1/1:49
-chr3 143617747 . G T 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr3 163576128 . C T 5.6 . DP=4;AF1=0.7302;CI95=0.5,1;DP4=2,0,2,0;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 33,0,2:0/1:3
-chr3 163839828 . A G 4.45 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=26 PL:GT:GQ 35,12,0:1/1:72
-chr3 175839340 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr3 190193258 . G T 3.98 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr3 190777007 . G A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr3 190970350 . A G 61 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=37 PL:GT:GQ 94,30,0:1/1:99
-chr3 198686408 . G A 36.6 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,16;MQ=25;PV4=1,1,0.026,1 PL:GT:GQ 69,11,0:1/1:66
-chr3 199277478 . T C 3.61 . DP=6;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=21 PL:GT:GQ 34,18,0:1/1:90
-chr3 199780181 . G T 77 . DP=45;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,35,0,10;MQ=33;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 107,0,114:0/1:99
-chr3 199889335 . A C 9.54 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=18 PL:GT:GQ 42,24,0:1/1:96
-chr3 200018161 . A G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr4 195475 . A G 13 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr4 639141 . C A 14.9 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr4 639152 . C T 15.2 . DP=17;AF1=0.5016;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=33;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 45,0,22:0/1:25
-chr4 986497 . G T 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=33 PL:GT:GQ 163,30,0:1/1:99
-chr4 986516 . C T 55.1 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=37 PL:GT:GQ 88,21,0:1/1:84
-chr4 1207485 . A C 14.9 . DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr4 1323502 . G A 13.2 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=22 PL:GT:GQ 46,33,0:1/1:99
-chr4 1613521 . G A 89 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,16,0;MQ=32 PL:GT:GQ 122,48,0:1/1:99
-chr4 1748790 . C T 38 . DP=21;AF1=0.5005;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,8,0;MQ=40;PV4=1,0.09,1,1 PL:GT:GQ 68,0,27:0/1:30
-chr4 2255732 . T C 99 . DP=29;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,28,0;MQ=31 PL:GT:GQ 186,84,0:1/1:99
-chr4 3010159 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr4 3545023 . A G 99 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=38 PL:GT:GQ 145,27,0:1/1:99
-chr4 3586344 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr4 3879337 . A G 16.6 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 49,12,0:1/1:72
-chr4 3940733 . A G 47.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ 80,15,0:1/1:75
-chr4 4410338 . T C 13.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=31 PL:GT:GQ 46,15,0:1/1:75
-chr4 4796408 . T C 41 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=17 PL:GT:GQ 74,48,0:1/1:99
-chr4 4796414 . A G 11.3 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=17 PL:GT:GQ 44,45,0:1/1:99
-chr4 6436959 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr4 9494256 . T C 3.41 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=37 PL:GT:GQ 32,6,0:1/1:49
-chr4 24881479 . G A 14.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ 46,9,0:1/1:63
-chr4 26128644 . A G 23 . DP=18;AF1=0.5006;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,10,0;MQ=22;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 53,0,26:0/1:29
-chr4 42109100 . G A 17.1 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ 49,9,0:1/1:63
-chr4 42309652 . C T 68 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=50 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr4 46913966 . C T 9.08 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=16 PL:GT:GQ 41,12,0:1/1:72
-chr4 50335142 . A G 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr4 51658550 . C A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr4 58258023 . T C 26 . DP=5;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=34;PV4=1,1,1,0.05 PL:GT:GQ 56,0,32:0/1:35
-chr4 59219112 . C A 42.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=50 PL:GT:GQ 75,12,0:1/1:72
-chr4 62746067 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr4 67404338 . G T 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=39 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr4 73353380 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr4 73946294 . G C 4.77 . DP=51;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,3;MQ=40;PV4=1,0.19,0.37,0.11 PL:GT:GQ 33,0,64:0/1:36
-chr4 79607484 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr4 82337365 . G C 90 . DP=54;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=28 PL:GT:GQ 123,48,0:1/1:99
-chr4 82653801 . A G 4.11 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
-chr4 87130164 . C T 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr4 87130176 . G A 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr4 91459729 . C A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr4 96130778 . G C 99 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,19;MQ=45 PL:GT:GQ 211,57,0:1/1:99
-chr4 100709417 . A G 45.1 . DP=16;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=12,0,4,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 75,0,17:0/1:20
-chr4 107276770 . C T 70 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,6;MQ=31;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 100,0,97:0/1:98
-chr4 115327550 . G C 42 . DP=67;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,66;MQ=35;PV4=1,3.2e-24,0.13,1 PL:GT:GQ 75,162,0:1/1:99
-chr4 136558502 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr4 159572459 . G A 15.1 . DP=126;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,69,0,57;MQ=39;PV4=1,4.1e-96,0.077,1 PL:GT:GQ 45,0,175:0/1:48
-chr4 174968484 . G C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr4 175030633 . T C 14.3 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=29 PL:GT:GQ 47,18,0:1/1:90
-chr4 183410027 . G T 6.2 . DP=31;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=45;PV4=1,0.035,1,0.21 PL:GT:GQ 35,0,28:0/1:30
-chr4 190907368 . T C 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=50 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr4 192175690 . A G 76.8 . DP=7;AF1=0.95;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,4;MQ=35;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 105,0,0:1/1:10
-chr4 192673268 . G A 14.2 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=22 PL:GT:GQ 47,27,0:1/1:99
-chr4 192943966 . T C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr4 195460104 . C G 23.1 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=19 PL:GT:GQ 56,24,0:1/1:96
-chr4 198277830 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr5 170098 . A G 13 . DP=12;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr5 395814 . T C 4.77 . DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=36;PV4=1,1,0.48,1 PL:GT:GQ 33,0,33:0/1:33
-chr5 414024 . T A 10.4 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=20 PL:GT:GQ 42,9,0:1/1:63
-chr5 496767 . T C 13.9 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr5 805676 . C G 45 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=32 PL:GT:GQ 78,51,0:1/1:99
-chr5 1252896 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr5 1418370 . G A 3.65 . DP=8;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=4,0,4,0;MQ=13;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 30,0,2:0/1:3
-chr5 1494911 . G C 62 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=46 PL:GT:GQ 95,24,0:1/1:96
-chr5 1494932 . C T 6.98 . DP=8;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=46;PV4=1,0.1,0.077,1 PL:GT:GQ 36,0,31:0/1:33
-chr5 1506037 . T C 24.1 . DP=24;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=11,0,13,0;MQ=16;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 55,5,0:1/1:46
-chr5 1509406 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr5 1733649 . A G 99 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,25;MQ=47 PL:GT:GQ 212,75,0:1/1:99
-chr5 1747304 . A G 12.3 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=19 PL:GT:GQ 45,36,0:1/1:99
-chr5 1747308 . C A 44 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=19 PL:GT:GQ 77,36,0:1/1:99
-chr5 3519783 . C T 21.1 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=18 PL:GT:GQ 54,24,0:1/1:96
-chr5 4101593 . A G 69.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=43 PL:GT:GQ 102,12,0:1/1:72
-chr5 7204332 . T A 4.61 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=24 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
-chr5 11510398 . A C 34 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=51;PV4=1,1,0,1 PL:GT:GQ 64,0,31:0/1:34
-chr5 15406720 . T C 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr5 25152417 . C A 10.9 . DP=28;AF1=0.5718;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,6;MQ=25;PV4=1,1,0.21,1 PL:GT:GQ 40,0,6:0/1:8
-chr5 39072637 . A G 35.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=50 PL:GT:GQ 68,15,0:1/1:75
-chr5 46022699 . G A 44 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr5 55664181 . C G 10.4 . DP=8;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=3,0,5,0;MQ=18;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 40,3,0:1/1:41
-chr5 56253386 . T C 50.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=36 PL:GT:GQ 83,21,0:1/1:84
-chr5 56253447 . C T 42.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=45 PL:GT:GQ 75,12,0:1/1:72
-chr5 71950166 . G T 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr5 72703090 . C T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr5 73570280 . G T 5.45 . DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,41,0;MQ=15 PL:GT:GQ 37,123,0:1/1:99
-chr5 73701762 . G T 40.8 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:GT:GQ 72,6,0:1/1:49
-chr5 76956867 . T C 10.2 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ 41,6,0:1/1:49
-chr5 79097961 . C G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr5 87026167 . T C 22 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr5 97680525 . T C 3.27 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=23 PL:GT:GQ 33,12,0:1/1:72
-chr5 100674737 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr5 105389966 . T C 3.52 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=15 PL:GT:GQ 33,9,0:1/1:63
-chr5 109998341 . A C 12.7 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 45,12,0:1/1:72
-chr5 120629105 . C T 6.79 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr5 128383954 . C T 23 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,5;MQ=48;PV4=1,3.3e-07,1,1 PL:GT:GQ 53,0,98:0/1:56
-chr5 133925142 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr5 135375404 . T C 11.8 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=31;PV4=1,0.03,1,1 PL:GT:GQ 42,4,0:1/1:45
-chr5 136498281 . T G 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr5 136717285 . A G 82.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ 115,12,0:1/1:72
-chr5 136910734 . G A 62 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,13;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 95,31,0:1/1:99
-chr5 141208149 . C G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr5 148056348 . C A 37.1 . DP=4;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=38;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 66,1,0:1/1:23
-chr5 151941534 . G T 46.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=34 PL:GT:GQ 79,12,0:1/1:72
-chr5 159967229 . G C 22.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ 55,12,0:1/1:72
-chr5 174024541 . T G 29.5 . DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 59,2,0:1/1:37
-chr5 175525290 . A G 3.27 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=20 PL:GT:GQ 33,12,0:1/1:72
-chr5 175988954 . A C 14.2 . DP=23;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,4;MQ=47;PV4=1,1,0.2,1 PL:GT:GQ 44,0,76:0/1:47
-chr5 176782226 . T C 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr5 179132834 . C G 99 . DP=28;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,28;MQ=41 PL:GT:GQ 207,84,0:1/1:99
-chr5 180155809 . G C 3.01 . DP=36;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=25,0,9,0;MQ=35;PV4=1,1e-15,1,1 PL:GT:GQ 30,0,121:0/1:33
-chr5 181282819 . T G 38.3 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,9;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 71,14,0:1/1:70
-chr5 182426125 . G C 29 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=26 PL:GT:GQ 61,9,0:1/1:63
-chr5 182443682 . G A 3.69 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=21 PL:GT:GQ 34,15,0:1/1:75
-chr5 183008993 . C T 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr5 183312016 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr6_cox_hap1 519146 . G A 17.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=30 PL:GT:GQ 49,9,0:1/1:63
-chr6_cox_hap1 687497 . A G 33 . DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,0.0016,1,1 PL:GT:GQ 63,3,0:1/1:41
-chr6_qbl_hap2 120066 . T C 99 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37 PL:GT:GQ 139,27,0:1/1:99
-chr6 277954 . C T 53 . DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=4,0,37,0;MQ=19;PV4=1,1,0.3,1 PL:GT:GQ 86,49,0:1/1:99
-chr6 593158 . A G 4.61 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
-chr6 2865562 . T G 25 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=23 PL:GT:GQ 58,27,0:1/1:99
-chr6 3751403 . G A 42.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=32 PL:GT:GQ 75,15,0:1/1:75
-chr6 3884989 . A G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr6 4127278 . A T 13.9 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr6 5887783 . C G 99 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=34 PL:GT:GQ 142,21,0:1/1:84
-chr6 5887811 . C T 55.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=34 PL:GT:GQ 88,21,0:1/1:84
-chr6 6937170 . G C 99 . DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,47;MQ=28 PL:GT:GQ 157,141,0:1/1:99
-chr6 7262317 . C T 13.2 . DP=50;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=21,0,9,0;MQ=36;PV4=1,4e-05,0.17,0.26 PL:GT:GQ 43,0,158:0/1:46
-chr6 7533214 . A G 10.4 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ 42,9,0:1/1:63
-chr6 20979907 . A G 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=38 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr6 22321632 . A G 41 . DP=5;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=46;PV4=1,0.24,0.19,0.33 PL:GT:GQ 71,0,28:0/1:31
-chr6 25352296 . G A 7.8 . DP=4;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=38;PV4=1,1,0.16,1 PL:GT:GQ 37,0,28:0/1:30
-chr6 26298040 . T A 34 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=48;PV4=1,1,0.21,0.33 PL:GT:GQ 64,0,31:0/1:34
-chr6 33428755 . G A 70 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=32 PL:GT:GQ 103,27,0:1/1:99
-chr6 39512099 . G A 55.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=50 PL:GT:GQ 88,21,0:1/1:84
-chr6 39961094 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr6 40452120 . A G 40.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 72,6,0:1/1:49
-chr6 43204766 . A G 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=51 PL:GT:GQ 176,24,0:1/1:96
-chr6 52696512 . C T 70 . DP=76;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,34,0,42;MQ=18;PV4=1,0.11,1,1 PL:GT:GQ 100,0,51:0/1:54
-chr6 53785550 . A G 99 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=46 PL:GT:GQ 190,30,0:1/1:99
-chr6 53897484 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr6 57038290 . C T 10.2 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 41,6,0:1/1:49
-chr6 62925087 . G C 35 . DP=5;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,4,0;MQ=36;PV4=1,1,0.2,1 PL:GT:GQ 65,0,25:0/1:28
-chr6 62925094 . T C 25.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=36 PL:GT:GQ 58,15,0:1/1:75
-chr6 70834405 . G A 72.1 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=29 PL:GT:GQ 105,21,0:1/1:84
-chr6 71026058 . C T 48.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=42 PL:GT:GQ 81,18,0:1/1:90
-chr6 74420752 . T C 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr6 77498624 . T C 16.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ 48,6,0:1/1:49
-chr6 80416836 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr6 113611590 . A G 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=46 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr6 119308431 . T C 38.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=40 PL:GT:GQ 71,12,0:1/1:72
-chr6 151758592 . T C 3.07 . DP=17;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,8,0,9;MQ=13;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 29,1,0:1/1:23
-chr6 151759358 . A G 99 . DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=12,0,15,0;MQ=44;PV4=1,1,1,0.19 PL:GT:GQ 171,0,128:0/1:99
-chr6 154741755 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr6 161061053 . C A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=52 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr6 161474189 . C T 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr6 164304657 . C T 10.4 . DP=63;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,29,0,19;MQ=22;PV4=1,7.7e-11,1,0.049 PL:GT:GQ 40,0,37:0/1:38
-chr6 164703105 . T C 99 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=40 PL:GT:GQ 165,30,0:1/1:99
-chr6 167518328 . A G 78 . DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=27,0,14,0;MQ=33;PV4=1,0.026,0.43,0.056 PL:GT:GQ 108,0,149:0/1:99
-chr6 169906323 . G A 41.8 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr6 171893912 . G A 69.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=33 PL:GT:GQ 102,15,0:1/1:75
-chr6 173631604 . A G 6.98 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=37;PV4=1,0.069,1,1 PL:GT:GQ 36,0,34:0/1:35
-chr7 835856 . C T 27.5 . DP=13;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=4,0,6,0;MQ=23;PV4=1,0.46,1,1 PL:GT:GQ 57,2,0:1/1:37
-chr7 1046005 . C T 11.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr7 1564339 . C T 71 . DP=66;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=36,0,24,0;MQ=29;PV4=1,1,0.35,1 PL:GT:GQ 101,0,134:0/1:99
-chr7 1806266 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr7 1936013 . G T 7.77 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=17 PL:GT:GQ 39,9,0:1/1:63
-chr7 2319532 . C A 4.11 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=14 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
-chr7 2682121 . C T 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr7 3248116 . T C 36.5 . DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=37;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 66,2,0:1/1:37
-chr7 3624766 . C T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr7 5291140 . G C 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr7 5314457 . C A 3.56 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=18 PL:GT:GQ 34,24,0:1/1:95
-chr7 5595072 . T A 79 . DP=13;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,5,0;MQ=31;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 109,0,57:0/1:60
-chr7 5646060 . G C 7.79 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=10 PL:GT:GQ 40,30,0:1/1:99
-chr7 6056816 . C G 7.08 . DP=6;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 35,1,0:1/1:23
-chr7 6412641 . C T 40 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=33 PL:GT:GQ 73,33,0:1/1:99
-chr7 6766874 . A G 34.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=43 PL:GT:GQ 67,15,0:1/1:75
-chr7 8482729 . C T 5.08 . DP=16;AF1=0.8276;CI95=0.5,1;DP4=3,0,3,0;MQ=22;PV4=1,1,1,0.19 PL:GT:GQ 32,0,1:1/1:5
-chr7 9238362 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr7 9687781 . G A 33 . DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,16,0,12;MQ=48;PV4=1,6.5e-38,1,1 PL:GT:GQ 63,0,170:0/1:66
-chr7 9752803 . A T 14.2 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=18 PL:GT:GQ 47,27,0:1/1:99
-chr7 10240910 . T C 45.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ 78,12,0:1/1:72
-chr7 11046187 . C T 86.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=47 PL:GT:GQ 119,12,0:1/1:72
-chr7 11548207 . C G 14.6 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=6,1,0,5;MQ=18;PV4=0.015,1,1,1 PL:GT:GQ 46,7,0:1/1:57
-chr7 11580317 . C T 42 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,10;MQ=22;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 75,23,0:1/1:92
-chr7 11585384 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr7 13498356 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr7 13500887 . G A 15.1 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=22 PL:GT:GQ 48,30,0:1/1:99
-chr7 13827079 . C T 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr7 14403976 . T G 59 . DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=39 PL:GT:GQ 92,24,0:1/1:96
-chr7 14756588 . A G 44 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,10,0;MQ=44;PV4=1,5.3e-18,1,1 PL:GT:GQ 74,0,70:0/1:72
-chr7 14756619 . T G 44 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,10,0;MQ=44;PV4=1,6.4e-10,1,1 PL:GT:GQ 74,0,70:0/1:72
-chr7 36734598 . A C 11.1 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ 42,6,0:1/1:49
-chr7 36734599 . A T 11.1 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ 42,6,0:1/1:49
-chr7 36734603 . G C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr7 40634921 . A C 55 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=39 PL:GT:GQ 88,39,0:1/1:99
-chr7 48271285 . A T 73 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=25 PL:GT:GQ 106,30,0:1/1:99
-chr7 56264700 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr7 62326003 . C A 26.1 . DP=35;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=28 PL:GT:GQ 59,18,0:1/1:90
-chr7 109468934 . T G 5.13 . DP=10;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=39;PV4=1,0.031,1,1 PL:GT:GQ 33,2,0:1/1:37
-chr7 110208327 . C G 16.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 48,6,0:1/1:49
-chr7 125654934 . A G 4.11 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=27 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
-chr7 125770209 . A C 32 . DP=31;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,13,0;MQ=34;PV4=1,0.00017,0.16,0.22 PL:GT:GQ 62,0,105:0/1:65
-chr7 125770265 . G C 36 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,5;MQ=48;PV4=1,0.0047,0.016,0.035 PL:GT:GQ 66,0,110:0/1:69
-chr7 126687042 . A G 21.1 . DP=36;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=22 PL:GT:GQ 54,21,0:1/1:84
-chr7 132292897 . G T 99 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=43 PL:GT:GQ 167,21,0:1/1:84
-chr7 132334562 . A C 23 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=23 PL:GT:GQ 56,30,0:1/1:99
-chr7 132431838 . C T 13.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,4,0;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 44,5,0:1/1:46
-chr7 136324945 . T C 13.7 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 46,12,0:1/1:72
-chr7 136957634 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr7 141746871 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr7 146831870 . C T 4.77 . DP=14;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=37;PV4=1,0.0029,0.28,1 PL:GT:GQ 33,0,28:0/1:30
-chr7 147142770 . T C 45 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=31 PL:GT:GQ 77,9,0:1/1:63
-chr7 147713906 . C T 4.77 . DP=8;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,8.9e-06,0.48,0.27 PL:GT:GQ 33,0,29:0/1:31
-chr7 148742642 . G A 68 . DP=14;AF1=0.5032;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,10,0;MQ=28;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 98,0,19:0/1:22
-chr7 148879148 . C T 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr7 149484407 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr7 152444478 . A G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr7 154106613 . C T 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=51 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr7 154776891 . G T 14.4 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ 47,15,0:1/1:75
-chr7 155882061 . A C 29 . DP=24;AF1=0.502;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,4;MQ=46;PV4=1,0.018,0.15,0.29 PL:GT:GQ 59,0,21:0/1:24
-chr7 155956844 . G C 23 . DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,4;MQ=38;PV4=1,1,0.38,1 PL:GT:GQ 53,0,103:0/1:56
-chr7 156277694 . G A 62 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=46 PL:GT:GQ 95,24,0:1/1:96
-chr7 156720588 . T C 16.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ 48,9,0:1/1:63
-chr7 156807649 . T C 3.01 . DP=30;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,3;MQ=43;PV4=1,0.16,0.15,1 PL:GT:GQ 30,0,72:0/1:33
-chr7 157331292 . G T 43.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=34 PL:GT:GQ 76,21,0:1/1:84
-chr7 157382957 . T C 33.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr8 556382 . A G 37.1 . DP=5;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=31;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 66,1,0:1/1:23
-chr8 1661673 . T C 9.31 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr8 7379751 . C A 6.24 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=19 PL:GT:GQ 38,21,0:1/1:84
-chr8 8160505 . A T 68.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 101,12,0:1/1:72
-chr8 8160508 . C T 24.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 57,12,0:1/1:72
-chr8 16781011 . A G 55.5 . DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=34 PL:GT:GQ 88,12,0:1/1:72
-chr8 18716499 . A T 20 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,2;MQ=29;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 50,0,52:0/1:51
-chr8 23326483 . A G 60 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=47 PL:GT:GQ 92,9,0:1/1:63
-chr8 25842819 . T A 12 . DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ 43,6,0:1/1:49
-chr8 26300279 . T C 34 . DP=44;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,41,0;MQ=21 PL:GT:GQ 67,123,0:1/1:99
-chr8 29673470 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr8 29673473 . C G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr8 31685466 . C T 34 . DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,0,5,0;MQ=28;PV4=1,0.072,1,0.36 PL:GT:GQ 64,0,50:0/1:53
-chr8 37378739 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=34 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr8 51325952 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr8 59221963 . G A 16.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ 48,9,0:1/1:63
-chr8 62764995 . T G 20 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=32 PL:GT:GQ 52,9,0:1/1:63
-chr8 63157426 . C G 41.6 . DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,7,0,15;MQ=19;PV4=1,1,1,0.25 PL:GT:GQ 74,11,0:1/1:66
-chr8 68710444 . G A 30 . DP=5;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=3,0,2,0;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 59,0,3:0/1:5
-chr8 76416560 . G A 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=46 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr8 81425275 . T G 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr8 89842286 . G C 4.61 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=30 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
-chr8 100926281 . G A 38 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ 70,9,0:1/1:63
-chr8 102746002 . G C 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr8 107850176 . C T 43.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=45 PL:GT:GQ 76,18,0:1/1:90
-chr8 109966441 . T C 27.3 . DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=38 PL:GT:GQ 60,15,0:1/1:75
-chr8 118811716 . G T 99 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=50 PL:GT:GQ 155,18,0:1/1:90
-chr8 119440254 . A T 58.5 . DP=5;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=34;PV4=1,1,1,0.14 PL:GT:GQ 87,0,1:1/1:5
-chr8 121236024 . G A 39.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 71,6,0:1/1:49
-chr8 125489079 . C T 13 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr8 128502549 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr8 128502551 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr8 130951113 . G A 4.61 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=19 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
-chr8 135307123 . G A 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr8 138814155 . C T 57.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:GT:GQ 90,18,0:1/1:90
-chr8 140566111 . A G 18.1 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=15 PL:GT:GQ 51,36,0:1/1:99
-chr8 141586480 . T G 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr8 143376712 . A G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr8 150662729 . T C 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr8 150741294 . A G 25.1 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=34 PL:GT:GQ 58,18,0:1/1:90
-chr8 150975618 . A G 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr8 151580103 . T C 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=20 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr8 151634410 . G T 48 . DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,12,0,5;MQ=39;PV4=1,0.072,1,1 PL:GT:GQ 78,0,125:0/1:81
-chr8 151709267 . G A 91.1 . DP=8;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,7;MQ=40;PV4=1,1,0.28,0.37 PL:GT:GQ 121,0,16:0/1:19
-chr8 152636420 . G A 8.75 . DP=3;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=30;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 37,1,0:1/1:23
-chr8 152706967 . G A 3.01 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=16 PL:GT:GQ 33,30,0:1/1:99
-chr8 152786522 . T C 80.1 . DP=16;AF1=0.5102;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,12;MQ=31;PV4=1,0.25,1,1 PL:GT:GQ 110,0,14:0/1:17
-chr8 152863132 . T G 5.44 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=30 PL:GT:GQ 36,9,0:1/1:63
-chr9 23235268 . C T 12 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ 43,6,0:1/1:49
-chr9 26391176 . T C 15.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 47,6,0:1/1:49
-chr9 26868232 . C G 63 . DP=20;AF1=0.5025;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,13,0;MQ=22;PV4=1,0.2,1,0.44 PL:GT:GQ 93,0,20:0/1:23
-chr9 34223668 . C T 22 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,7;MQ=27;PV4=1,0.14,0.34,1 PL:GT:GQ 52,0,79:0/1:55
-chr9 39696645 . G A 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr9 40654130 . T G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr9 41145321 . T G 46.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ 79,12,0:1/1:72
-chr9 42273483 . G A 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr9 55633192 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr9 58705807 . T C 70 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=24 PL:GT:GQ 103,30,0:1/1:99
-chr9 61697149 . C G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr9 63152790 . A C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr9 63703913 . C G 90.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=38 PL:GT:GQ 123,21,0:1/1:84
-chr9 65116068 . T C 70 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=49 PL:GT:GQ 103,39,0:1/1:99
-chr9 71266598 . C A 3.98 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr9 73188677 . G T 52 . DP=294;AF1=1;CI95=1,1;DP4=44,0,245,0;MQ=33;PV4=1,0.28,0.0092,1 PL:GT:GQ 85,147,0:1/1:99
-chr9 78854179 . G T 22 . DP=97;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=21,0,12,0;MQ=44;PV4=1,0.02,0.032,0.0033 PL:GT:GQ 52,0,158:0/1:55
-chr9 82964679 . A C 13.2 . DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=36 PL:GT:GQ 45,9,0:1/1:63
-chr9 84124545 . G T 57 . DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,3,0;MQ=49;PV4=1,1,0.024,1 PL:GT:GQ 87,0,59:0/1:62
-chr9 86552862 . C T 14.4 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=26 PL:GT:GQ 47,15,0:1/1:75
-chr9 87548941 . A G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr9 89021101 . G A 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr9 90447825 . G A 9.31 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr9 92462035 . C A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr9 93077294 . T G 5.44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=31 PL:GT:GQ 36,9,0:1/1:63
-chr9 93998137 . G A 68 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=46 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr9 93998148 . C T 21.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=36 PL:GT:GQ 54,15,0:1/1:75
-chr9 95028964 . C A 99 . DP=83;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,57,0,26;MQ=32;PV4=1,9.3e-08,1,0.092 PL:GT:GQ 134,0,120:0/1:99
-chr9 103829155 . A G 33 . DP=96;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,96,0;MQ=16 PL:GT:GQ 66,255,0:1/1:99
-chr9 104981331 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr9 111070656 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr9 117395657 . T C 16.4 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 49,15,0:1/1:75
-chr9 117718907 . A G 46.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=29 PL:GT:GQ 79,18,0:1/1:90
-chr9 119149161 . T C 3.14 . DP=65;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22 PL:GT:GQ 33,15,0:1/1:75
-chr9 124528802 . G A 78 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=25 PL:GT:GQ 111,39,0:1/1:99
-chr9 126707903 . G A 26 . DP=37;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,21,0,8;MQ=46;PV4=1,2.6e-07,0.21,0.42 PL:GT:GQ 56,0,175:0/1:59
-chr9 128700686 . C G 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr9 129084077 . G A 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr9 129116900 . A T 20 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30 PL:GT:GQ 52,9,0:1/1:63
-chr9 130290720 . C G 21.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 53,6,0:1/1:49
-chr9 130306057 . C G 71 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=28 PL:GT:GQ 104,42,0:1/1:99
-chr9 130528990 . G A 99 . DP=31;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,31,0;MQ=27 PL:GT:GQ 174,93,0:1/1:99
-chr9 130529002 . A T 7.79 . DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=15 PL:GT:GQ 40,33,0:1/1:99
-chr9 130639996 . A G 8.44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 39,6,0:1/1:49
-chr9 130704890 . A G 3.27 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=26 PL:GT:GQ 33,12,0:1/1:72
-chr9 130708345 . G A 13.3 . DP=11;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=38;PV4=1,0.096,1,1 PL:GT:GQ 42,1,0:1/1:23
-chr9 131001601 . T A 3.98 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr9 131058539 . T A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr9 131808965 . C T 42 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37 PL:GT:GQ 75,27,0:1/1:99
-chr9 132551867 . C T 17.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ 49,9,0:1/1:63
-chr9 132685120 . A G 4.75 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ 35,9,0:1/1:63
-chr9 133175050 . A G 18.1 . DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=20 PL:GT:GQ 51,51,0:1/1:99
-chr9 133584978 . A G 99 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,25,0;MQ=45 PL:GT:GQ 212,75,0:1/1:99
-chr9 133661895 . A G 99 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=31 PL:GT:GQ 138,42,0:1/1:99
-chr9 133670376 . T C 68 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,16;MQ=39;PV4=1,1.4e-20,1,1 PL:GT:GQ 101,39,0:1/1:99
-chr9 133843777 . T C 99 . DP=9;AF1=0.5129;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,8,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 154,0,13:0/1:16
-chr9 134017265 . G C 3.27 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=13 PL:GT:GQ 33,12,0:1/1:72
-chr9 134105563 . T C 34.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=39 PL:GT:GQ 67,18,0:1/1:90
-chr9 134608906 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr9 134861929 . T A 9.49 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30 PL:GT:GQ 41,9,0:1/1:63
-chr10 796662 . A G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr10 1216716 . T A 18.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr10 1220781 . G A 21 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=18 PL:GT:GQ 54,27,0:1/1:99
-chr10 1225208 . T C 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=47 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr10 1727946 . T C 14.2 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=27 PL:GT:GQ 47,21,0:1/1:84
-chr10 5986542 . T C 83 . DP=93;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=39 PL:GT:GQ 116,30,0:1/1:99
-chr10 6436277 . G A 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr10 7704114 . C A 35 . DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,4;MQ=29;PV4=1,0.27,1,0.27 PL:GT:GQ 65,3,0:1/1:41
-chr10 10881734 . A G 9.52 . DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=42;PV4=1,0.0026,0.14,1 PL:GT:GQ 39,0,91:0/1:42
-chr10 13099383 . G A 27.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ 60,12,0:1/1:72
-chr10 15764077 . G C 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=40 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr10 18091502 . T C 47 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38 PL:GT:GQ 79,9,0:1/1:63
-chr10 19645913 . A T 15.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ 47,6,0:1/1:49
-chr10 22845062 . C T 18.1 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=18 PL:GT:GQ 51,21,0:1/1:84
-chr10 28282802 . T C 69 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,12,0;MQ=42 PL:GT:GQ 102,36,0:1/1:99
-chr10 28496872 . T G 8.44 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 39,6,0:1/1:49
-chr10 32746793 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr10 41437604 . T G 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr10 43051239 . C T 6.98 . DP=3;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=40;PV4=1,0.33,0.33,1 PL:GT:GQ 36,0,31:0/1:33
-chr10 44455192 . C T 4.41 . DP=6;AF1=0.8276;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,3;MQ=21;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 31,0,1:1/1:5
-chr10 48387336 . A G 13 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr10 51561705 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr10 51561712 . C G 39.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 71,6,0:1/1:49
-chr10 55617954 . G A 8.44 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ 39,6,0:1/1:49
-chr10 55718281 . T A 3.41 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ 32,6,0:1/1:49
-chr10 55888771 . T C 23.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ 56,12,0:1/1:72
-chr10 56025569 . C G 34.1 . DP=3;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=39;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 64,0,16:0/1:19
-chr10 57384943 . G T 84 . DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,0,13,0;MQ=26;PV4=1,0.015,1,1 PL:GT:GQ 114,0,110:0/1:99
-chr10 59873077 . T G 49 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=42 PL:GT:GQ 82,24,0:1/1:96
-chr10 61329572 . C T 15.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 47,6,0:1/1:49
-chr10 63790636 . T G 32.1 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,10,0;MQ=28;PV4=1,0.14,1,1 PL:GT:GQ 65,22,0:1/1:88
-chr10 64466048 . C G 18.2 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=28 PL:GT:GQ 51,18,0:1/1:90
-chr10 65053440 . G T 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=39 PL:GT:GQ 153,30,0:1/1:99
-chr10 65407358 . C G 84.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45 PL:GT:GQ 117,15,0:1/1:75
-chr10 65605291 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr10 66104447 . T C 99 . DP=47;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,21;MQ=34;PV4=1,1,0.15,1 PL:GT:GQ 136,0,162:0/1:99
-chr10 82160859 . G C 99 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=36 PL:GT:GQ 153,39,0:1/1:99
-chr10 82198579 . C T 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr10 87086290 . A G 4.13 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=17 PL:GT:GQ 35,27,0:1/1:99
-chr10 89550621 . T G 74 . DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,45;MQ=45 PL:GT:GQ 107,135,0:1/1:99
-chr10 92325046 . G A 42.3 . DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45 PL:GT:GQ 75,15,0:1/1:75
-chr10 94488050 . A G 5.46 . DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=43;PV4=1,0.16,1,1 PL:GT:GQ 34,0,34:0/1:34
-chr10 95024815 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr10 95466306 . G A 53 . DP=7;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=0,4,0,3;MQ=33;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 82,0,3:0/1:5
-chr10 100256777 . T G 3.83 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=23 PL:GT:GQ 34,12,0:1/1:72
-chr10 101510485 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr10 101530760 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr10 101879744 . T C 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=44 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr10 102147276 . G C 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=33 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr10 102642248 . T G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr10 107666616 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr10 108319945 . C G 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr10 109734371 . G A 12.7 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,12,0:1/1:72
-chr10 112870604 . C T 46.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=36 PL:GT:GQ 79,12,0:1/1:72
-chr10 115304673 . T C 11.3 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr10 119380588 . G A 14.2 . DP=4;AF1=0.502;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=43;PV4=1,0.18,0.32,1 PL:GT:GQ 44,0,21:0/1:24
-chr10 123063756 . C T 14.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=23 PL:GT:GQ 46,9,0:1/1:63
-chr10 128424770 . T G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr10 131229204 . T C 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr10 132420570 . G C 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr10 132528066 . C T 99 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,19,0;MQ=42 PL:GT:GQ 213,57,0:1/1:99
-chr10 132644619 . G A 19.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=23 PL:GT:GQ 52,15,0:1/1:75
-chr10 132707581 . G C 9.11 . DP=51;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=25;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 38,2,0:1/1:37
-chr10 133026892 . T C 55.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=44 PL:GT:GQ 88,18,0:1/1:90
-chr11 768033 . T C 33.5 . DP=4;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,0,1:1/1:5
-chr11 768042 . T C 33.5 . DP=6;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,0,1:1/1:5
-chr11 874568 . G C 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr11 1009210 . T C 4 . DP=70;AF1=0.6241;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,8;MQ=24;PV4=1,1,0.5,1 PL:GT:GQ 31,0,4:0/1:6
-chr11 1016692 . C T 27 . DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,38;MQ=22 PL:GT:GQ 60,114,0:1/1:99
-chr11 1034477 . A G 66 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ 98,9,0:1/1:63
-chr11 1074037 . G A 4.13 . DP=9;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=24;PV4=1,1,0.43,1 PL:GT:GQ 32,0,30:0/1:31
-chr11 1556298 . G A 11.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ 44,12,0:1/1:72
-chr11 1824777 . T C 27 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=28 PL:GT:GQ 60,30,0:1/1:99
-chr11 3395801 . C T 22 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr11 3411901 . G A 4.75 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ 35,9,0:1/1:63
-chr11 3731606 . A C 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr11 3783855 . C T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr11 3967636 . A G 4.29 . DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=24 PL:GT:GQ 35,15,0:1/1:75
-chr11 4385618 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr11 4424365 . T A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr11 5295586 . C T 3.01 . DP=52;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=33,0,10,0;MQ=29;PV4=1,0.0045,0.3,0.17 PL:GT:GQ 30,0,131:0/1:33
-chr11 6157144 . C G 45.1 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=35 PL:GT:GQ 78,21,0:1/1:84
-chr11 6352044 . C T 18 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=31 PL:GT:GQ 50,9,0:1/1:63
-chr11 6767356 . T C 9.63 . DP=3;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=29;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 38,1,0:1/1:23
-chr11 6999404 . G C 21 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=37 PL:GT:GQ 53,9,0:1/1:63
-chr11 9120930 . C G 17.6 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ 50,12,0:1/1:72
-chr11 9373125 . T C 19.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 51,6,0:1/1:49
-chr11 9585101 . C T 67 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=45 PL:GT:GQ 100,42,0:1/1:99
-chr11 10266192 . A C 14.3 . DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=27 PL:GT:GQ 47,18,0:1/1:90
-chr11 10303263 . T C 8.64 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,17;MQ=18 PL:GT:GQ 41,51,0:1/1:99
-chr11 10420170 . T C 35 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,15;MQ=28;PV4=1,0.12,1,0.4 PL:GT:GQ 68,36,0:1/1:99
-chr11 10912169 . G A 99 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=49 PL:GT:GQ 155,18,0:1/1:90
-chr11 11315826 . T G 6.29 . DP=27;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=19 PL:GT:GQ 38,18,0:1/1:90
-chr11 11603859 . A C 22 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,6;MQ=34;PV4=1,9.5e-13,0.22,1 PL:GT:GQ 52,0,115:0/1:55
-chr11 11700034 . C T 33 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=30 PL:GT:GQ 66,27,0:1/1:99
-chr11 11822758 . G A 15.1 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,3;MQ=38;PV4=1,0.18,1,1 PL:GT:GQ 45,0,88:0/1:48
-chr11 11976636 . C T 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=24 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr11 14380517 . C G 16.1 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,5,0;MQ=48;PV4=1,2.1e-05,0.13,1 PL:GT:GQ 46,0,113:0/1:49
-chr11 14419212 . A G 91.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=38 PL:GT:GQ 124,18,0:1/1:90
-chr11 14846792 . A G 55 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=19 PL:GT:GQ 88,33,0:1/1:99
-chr11 15494556 . C T 99 . DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=22,0,14,0;MQ=34;PV4=1,0.0071,1,1 PL:GT:GQ 146,0,159:0/1:99
-chr11 16262879 . A C 16.1 . DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=43;PV4=1,0.061,0.24,0.33 PL:GT:GQ 46,0,28:0/1:31
-chr11 21514947 . T C 24.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=41 PL:GT:GQ 57,12,0:1/1:72
-chr11 22532576 . C G 28 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,17;MQ=17 PL:GT:GQ 61,51,0:1/1:99
-chr11 23529238 . G T 4.29 . DP=13;AF1=0.5334;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=37;PV4=1,1,0.34,0.21 PL:GT:GQ 32,0,9:0/1:12
-chr11 24249554 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr11 24853167 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr11 33353903 . T C 24.3 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=36 PL:GT:GQ 57,15,0:1/1:75
-chr11 35126569 . T C 24.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ 57,12,0:1/1:72
-chr11 35132248 . C T 18.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr11 35155482 . T C 68 . DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=46 PL:GT:GQ 101,66,0:1/1:99
-chr11 52494088 . T C 99 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37 PL:GT:GQ 140,27,0:1/1:99
-chr11 57899943 . C G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr11 62261460 . G T 19.1 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,5;MQ=27;PV4=1,1.1e-06,1,1 PL:GT:GQ 49,0,58:0/1:51
-chr11 67456049 . C T 39.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=19 PL:GT:GQ 72,18,0:1/1:90
-chr11 68509708 . C G 3.65 . DP=9;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=0,5,0,4;MQ=17;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 30,0,2:0/1:3
-chr11 70115115 . T A 99 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=49 PL:GT:GQ 140,15,0:1/1:75
-chr11 72643951 . T C 70 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=39 PL:GT:GQ 103,66,0:1/1:99
-chr11 72647930 . G A 36 . DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=41;PV4=1,1,0.3,1 PL:GT:GQ 66,0,28:0/1:31
-chr11 73330148 . C T 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr11 81720893 . A G 5.83 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=19 PL:GT:GQ 37,12,0:1/1:72
-chr11 83813797 . A G 23.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ 56,12,0:1/1:72
-chr11 85949488 . C A 54 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=37 PL:GT:GQ 87,42,0:1/1:99
-chr11 87634829 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr11 90913093 . A T 35.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 67,6,0:1/1:49
-chr11 93793348 . G A 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=31 PL:GT:GQ 139,24,0:1/1:96
-chr11 100802294 . T C 16.6 . DP=21;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ 49,12,0:1/1:72
-chr11 107455449 . C T 8.44 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=26 PL:GT:GQ 39,6,0:1/1:49
-chr11 111344355 . A G 69.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=43 PL:GT:GQ 102,12,0:1/1:72
-chr11 111611115 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr11 113050466 . G C 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
-chr11 114332544 . T C 3.54 . DP=17;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,5;MQ=37;PV4=1,0.32,0.13,1 PL:GT:GQ 31,0,37:0/1:33
-chr11 114332549 . G A 3.54 . DP=17;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,8;MQ=36;PV4=1,3.1e-10,0.088,1 PL:GT:GQ 31,0,127:0/1:34
-chr11 114843578 . G C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr11 115580279 . A G 99 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,15,0;MQ=48 PL:GT:GQ 190,45,0:1/1:99
-chr11 116434328 . G A 17.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 50,12,0:1/1:72
-chr11 125914161 . A G 20.8 . DP=7;AF1=0.95;CI95=0.5,1;DP4=3,0,4,0;MQ=38;PV4=1,0.074,1,1 PL:GT:GQ 49,0,0:1/1:10
-chr11 125917089 . C T 12.3 . DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,28,0,12;MQ=44;PV4=1,4.7e-25,1,1 PL:GT:GQ 42,0,167:0/1:45
-chr11 127194100 . A G 60 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=49 PL:GT:GQ 93,24,0:1/1:96
-chr12 70856 . G A 27.5 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 60,12,0:1/1:72
-chr12 153693 . T C 52.3 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=38 PL:GT:GQ 85,15,0:1/1:75
-chr12 924547 . C G 37.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 69,6,0:1/1:49
-chr12 1555916 . G A 7.18 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 39,15,0:1/1:75
-chr12 1919860 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr12 2283756 . G A 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr12 2805983 . G C 12.7 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 45,12,0:1/1:72
-chr12 6088203 . T C 72.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=37 PL:GT:GQ 105,15,0:1/1:75
-chr12 7099460 . G C 10.8 . DP=6;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=3,0,3,0;MQ=26;PV4=1,0.027,1,1 PL:GT:GQ 39,0,1:1/1:5
-chr12 7099464 . G A 13.3 . DP=6;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=28;PV4=1,0.16,1,1 PL:GT:GQ 42,1,0:1/1:23
-chr12 7198516 . T G 4.61 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
-chr12 23331895 . C T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr12 28209020 . T G 14.4 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ 47,15,0:1/1:75
-chr12 30074073 . C T 32.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 64,6,0:1/1:49
-chr12 30563452 . T C 25 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ 57,9,0:1/1:63
-chr12 30563453 . A G 25 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ 57,9,0:1/1:63
-chr12 30563464 . C A 78.8 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,5;MQ=34;PV4=1,0.29,1,1 PL:GT:GQ 110,6,0:1/1:49
-chr12 31505085 . G A 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr12 34041336 . G A 5.46 . DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=36;PV4=1,1,0.48,0.21 PL:GT:GQ 34,0,34:0/1:34
-chr12 49003648 . C G 42 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=39 PL:GT:GQ 75,24,0:1/1:96
-chr12 51280690 . G A 69 . DP=98;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,18,0;MQ=45;PV4=1,1,0.051,1 PL:GT:GQ 99,0,84:0/1:87
-chr12 69206633 . T C 17.1 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=17 PL:GT:GQ 50,33,0:1/1:99
-chr12 80417253 . T C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr12 86633033 . C T 34 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=43;PV4=1,1,0.33,1 PL:GT:GQ 64,0,31:0/1:34
-chr12 98097274 . C T 47.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=31 PL:GT:GQ 80,15,0:1/1:75
-chr12 105269319 . C T 19 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=26 PL:GT:GQ 51,9,0:1/1:63
-chr12 109053425 . G A 9.53 . DP=8;AF1=0.5012;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,6,0;MQ=25;PV4=1,1,0.19,1 PL:GT:GQ 39,0,23:0/1:26
-chr12 111904540 . A G 3.41 . DP=65;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ 32,6,0:1/1:49
-chr12 115038686 . T C 15.2 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=27 PL:GT:GQ 48,21,0:1/1:84
-chr12 115039419 . A G 4.11 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
-chr12 115103890 . G A 66 . DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,38;MQ=49 PL:GT:GQ 99,114,0:1/1:99
-chr12 115833830 . G A 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr12 116361873 . T G 6.34 . DP=5;AF1=0.7302;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 34,0,2:0/1:3
-chr12 123583527 . G A 14.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ 46,9,0:1/1:63
-chr12 124115330 . A G 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr12 125062296 . G A 41.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr12 126718106 . A G 8.76 . DP=50;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=2,0,6,0;MQ=26;PV4=1,0.33,0.37,1 PL:GT:GQ 38,0,12:0/1:15
-chr12 133348311 . G A 24 . DP=18;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=14,0,3,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 54,0,118:0/1:57
-chr12 134494475 . C T 28 . DP=18;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=8,0,10,0;MQ=18;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 57,0,3:0/1:5
-chr12 134831761 . C T 41.3 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=27 PL:GT:GQ 74,15,0:1/1:75
-chr12 134992770 . A C,T 84 . DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,26,0;MQ=29 PL:GT:GQ 117,72,114,0,44,114:1/1:99
-chr12 135261117 . G A 49.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:GT:GQ 82,18,0:1/1:90
-chr12 135261144 . A G 99 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:GT:GQ 155,18,0:1/1:90
-chr12 135460302 . G A 99 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,23,0;MQ=40 PL:GT:GQ 198,69,0:1/1:99
-chr12 135463758 . A G 83 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=26 PL:GT:GQ 116,48,0:1/1:99
-chr12 135523325 . G A 99 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=26 PL:GT:GQ 136,66,0:1/1:99
-chr12 135782401 . T C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr12 135795472 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr13 18040027 . G C 42 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=33 PL:GT:GQ 74,9,0:1/1:63
-chr13 19494625 . G T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr13 20121126 . A G 15.1 . DP=36;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=25,0,9,0;MQ=36;PV4=1,1,0.13,1 PL:GT:GQ 45,0,153:0/1:48
-chr13 21536703 . A G 9.31 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr13 23160035 . G T 3.98 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr13 23476554 . C A 6.79 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=52 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr13 26632967 . C G 32 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=34 PL:GT:GQ 65,27,0:1/1:99
-chr13 26790010 . T C 89.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=35 PL:GT:GQ 122,15,0:1/1:75
-chr13 36083571 . T C 43 . DP=84;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,37,0;MQ=16;PV4=1,1,1,0.3 PL:GT:GQ 76,99,0:1/1:99
-chr13 44432419 . C T 3.58 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=19 PL:GT:GQ 34,21,0:1/1:84
-chr13 46592359 . T C 16.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 48,6,0:1/1:49
-chr13 52764657 . A T 3.14 . DP=32;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22 PL:GT:GQ 33,15,0:1/1:75
-chr13 53084193 . C T 9.11 . DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=29;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 38,2,0:1/1:37
-chr13 57763228 . C T 45 . DP=555;AF1=1;CI95=1,1;DP4=2,0,21,0;MQ=23;PV4=1,0.00021,1,0.3 PL:GT:GQ 78,45,0:1/1:99
-chr13 73857921 . G C 31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ 63,9,0:1/1:63
-chr13 76718001 . G A 59 . DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=45;PV4=1,1,0.12,1 PL:GT:GQ 89,0,28:0/1:31
-chr13 100912695 . A T 23 . DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,16,0,6;MQ=31;PV4=1,0.029,1,0.35 PL:GT:GQ 53,0,103:0/1:56
-chr13 101332001 . G C 21 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,23,0;MQ=21 PL:GT:GQ 54,69,0:1/1:99
-chr13 102637334 . C T 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr13 102895627 . C T 63 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=48 PL:GT:GQ 96,27,0:1/1:99
-chr13 103830322 . T C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr13 112842448 . G A 39 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=27 PL:GT:GQ 72,27,0:1/1:99
-chr13 113310291 . C T 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr13 114775162 . A G 80 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=21 PL:GT:GQ 113,51,0:1/1:99
-chr13 115267482 . A G 16.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ 48,9,0:1/1:63
-chr13 116068676 . C T 3.83 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=27 PL:GT:GQ 34,12,0:1/1:72
-chr13 116455918 . A G 33 . DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,15,0;MQ=42;PV4=1,1.8e-20,0.3,1 PL:GT:GQ 63,0,146:0/1:66
-chr13 116765012 . G A 30.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 62,6,0:1/1:49
-chr13 116779773 . C T 17.1 . DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=27,0,11,0;MQ=24;PV4=1,4.5e-35,1,1 PL:GT:GQ 47,0,106:0/1:50
-chr13 116779791 . C T 57 . DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=24,0,14,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 87,0,103:0/1:90
-chr14 20159250 . C T 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr14 23510676 . T C 52 . DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=32 PL:GT:GQ 85,66,0:1/1:99
-chr14 24735256 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr14 29525577 . G A 21 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=16 PL:GT:GQ 54,27,0:1/1:99
-chr14 36186389 . C T 6.79 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=20 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr14 36186394 . A G 6.79 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=20 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr14 37440609 . A G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr14 40432807 . A G 18.6 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=23 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr14 59466268 . T C 15.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=25 PL:GT:GQ 47,9,0:1/1:63
-chr14 61368162 . G T 7.18 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=17 PL:GT:GQ 39,15,0:1/1:75
-chr14 65152922 . G A 92 . DP=33;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,18,0,15;MQ=36;PV4=1,0.059,0.35,1 PL:GT:GQ 122,0,144:0/1:99
-chr14 69749148 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=25 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr14 74877658 . C T 45 . DP=48;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,12;MQ=36;PV4=1,0.02,1,0.39 PL:GT:GQ 78,28,0:1/1:99
-chr14 75546678 . C T 19.2 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=17 PL:GT:GQ 52,18,0:1/1:90
-chr14 76439185 . T C 67.1 . DP=7;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,6;MQ=33;PV4=1,1,0.056,0.29 PL:GT:GQ 97,0,17:0/1:20
-chr14 77313295 . T A 99 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=48 PL:GT:GQ 191,30,0:1/1:99
-chr14 77673422 . G A 11.5 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=24 PL:GT:GQ 44,18,0:1/1:90
-chr14 78646125 . T C 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=40 PL:GT:GQ 153,24,0:1/1:96
-chr14 91702449 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr14 91769842 . G A 63 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=47 PL:GT:GQ 95,9,0:1/1:63
-chr14 91775899 . C G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr14 91775924 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr14 93482918 . A C 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr14 93665819 . C T 75 . DP=7;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,4;MQ=42;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 105,0,31:0/1:34
-chr14 95422276 . A G 55.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=45 PL:GT:GQ 88,21,0:1/1:84
-chr14 95731986 . C T 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr14 96045464 . A G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr14 97172020 . C T 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=51 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr14 100515480 . A G 6.98 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=45;PV4=1,0.14,0.085,0.33 PL:GT:GQ 36,0,30:0/1:32
-chr14 100770214 . A T 8.69 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=16 PL:GT:GQ 41,21,0:1/1:84
-chr14 101258303 . G A 82 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,15,0;MQ=26 PL:GT:GQ 115,45,0:1/1:99
-chr14 101701492 . C G 66 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=49 PL:GT:GQ 99,30,0:1/1:99
-chr14 102113772 . T C 3.98 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=30 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
-chr14 102751431 . A C 36.5 . DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 66,2,0:1/1:37
-chr14 103708033 . A G 99 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=27 PL:GT:GQ 141,36,0:1/1:99
-chr14 104744582 . G A 3.52 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ 33,9,0:1/1:63
-chr14 105989100 . C T 3.14 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 33,15,0:1/1:75
-chr14 105989162 . C T 3.65 . DP=12;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,6;MQ=15;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 30,0,2:0/1:3
-chr14 106234810 . G A 25.3 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=39 PL:GT:GQ 58,15,0:1/1:75
-chr14 106995572 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr14 107283057 . T C 5.5 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=20 PL:GT:GQ 37,21,0:1/1:84
-chr14 107285319 . T C 33 . DP=36;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,35;MQ=22 PL:GT:GQ 66,105,0:1/1:99
-chr14 107640449 . A G 11.8 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=36 PL:GT:GQ 44,12,0:1/1:72
-chr15 20082092 . T G 18.3 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=24 PL:GT:GQ 51,15,0:1/1:75
-chr15 22955884 . T C 67 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,12,0;MQ=48 PL:GT:GQ 100,36,0:1/1:99
-chr15 22971987 . A G 5.29 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=22 PL:GT:GQ 35,6,0:1/1:49
-chr15 23233324 . C A 47 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=31 PL:GT:GQ 80,42,0:1/1:99
-chr15 25175286 . C T 36.5 . DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=42;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 66,2,0:1/1:37
-chr15 25385709 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr15 27372396 . A G 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=40 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr15 35998093 . C T 9.53 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=17 PL:GT:GQ 42,27,0:1/1:99
-chr15 36716538 . C G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr15 36793360 . G T 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr15 53783097 . A G 10.5 . DP=31;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=16 PL:GT:GQ 43,21,0:1/1:84
-chr15 54180175 . C T 10.4 . DP=7;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=27;PV4=1,1.2e-05,1,1 PL:GT:GQ 40,0,32:0/1:34
-chr15 54939306 . C T 99 . DP=34;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,18,0,16;MQ=49;PV4=1,1,0.18,1 PL:GT:GQ 172,0,181:0/1:99
-chr15 59377916 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr15 59685961 . G C 68 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=36 PL:GT:GQ 101,33,0:1/1:99
-chr15 60306384 . A G 18.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr15 60345642 . G C 14.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr15 60367387 . G A 13.2 . DP=6;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,3,0;MQ=34;PV4=1,0.098,0.24,1 PL:GT:GQ 43,0,35:0/1:37
-chr15 60367446 . C T 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
-chr15 61763755 . G A 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=45 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr15 61831362 . C G 11.3 . DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,3;MQ=30;PV4=1,0.00077,0.47,1 PL:GT:GQ 41,0,42:0/1:41
-chr15 63978880 . G C 60 . DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 90,3,0:1/1:41
-chr15 64342445 . A G 12.2 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=18 PL:GT:GQ 44,9,0:1/1:63
-chr15 65424859 . T C 11.3 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=21 PL:GT:GQ 44,30,0:1/1:99
-chr15 65603698 . C T 60 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 92,9,0:1/1:63
-chr15 67005078 . G A 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr15 71133512 . G C 22.3 . DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=25 PL:GT:GQ 55,15,0:1/1:75
-chr15 72619009 . A G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=48 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr15 73272688 . C T 70.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=39 PL:GT:GQ 103,15,0:1/1:75
-chr15 73699335 . T A 99 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=45 PL:GT:GQ 175,27,0:1/1:99
-chr15 74513352 . C T 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=37 PL:GT:GQ 139,30,0:1/1:99
-chr15 75540536 . G A 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr15 75822537 . C A 17.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=23 PL:GT:GQ 50,15,0:1/1:75
-chr15 78554005 . T C 12 . DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ 43,6,0:1/1:49
-chr15 80089369 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=28 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr15 83089149 . C G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr15 86839307 . T C 90.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43 PL:GT:GQ 123,15,0:1/1:75
-chr15 89836258 . T C 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=39 PL:GT:GQ 141,24,0:1/1:96
-chr15 89837706 . G A 4.13 . DP=8;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,4;MQ=30;PV4=1,1,0.25,1 PL:GT:GQ 32,0,59:0/1:35
-chr15 89857648 . T C 99 . DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,8,0;MQ=40;PV4=1,1,0.3,1 PL:GT:GQ 133,0,130:0/1:99
-chr15 89864228 . A C 32 . DP=4;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=42;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,0,31:0/1:34
-chr15 91261235 . G A 7.8 . DP=4;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=44;PV4=1,1,0.32,1 PL:GT:GQ 37,0,30:0/1:32
-chr16 256990 . A C 10.4 . DP=16;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=23;PV4=1,0.34,1,1 PL:GT:GQ 40,0,25:0/1:28
-chr16 260794 . T C 3.01 . DP=19;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,2,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 30,0,32:0/1:31
-chr16 419905 . A G 7.9 . DP=5;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=22;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 36,1,0:1/1:23
-chr16 824086 . T C 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr16 1085063 . C T 52 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,6,0;MQ=42;PV4=1,1,0.014,1 PL:GT:GQ 82,0,128:0/1:85
-chr16 1221305 . T C 54 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,3;MQ=40;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 84,0,60:0/1:63
-chr16 1411728 . A G 32.3 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=35 PL:GT:GQ 65,15,0:1/1:75
-chr16 1443197 . C G 64 . DP=26;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,25,0;MQ=36 PL:GT:GQ 97,75,0:1/1:99
-chr16 1478746 . A T 32 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=28 PL:GT:GQ 65,24,0:1/1:96
-chr16 1514438 . A C 45 . DP=49;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,48,0;MQ=26 PL:GT:GQ 78,144,0:1/1:99
-chr16 1601989 . T C 99 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=29 PL:GT:GQ 133,39,0:1/1:99
-chr16 2043883 . C T 30 . DP=33;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,33;MQ=14 PL:GT:GQ 63,99,0:1/1:99
-chr16 2137470 . A C 39 . DP=38;AF1=0.5016;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,6,0;MQ=34;PV4=1,0.02,1,1 PL:GT:GQ 69,0,22:0/1:25
-chr16 2537260 . A G 99 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=40 PL:GT:GQ 177,33,0:1/1:99
-chr16 2564737 . T C 99 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,22;MQ=41 PL:GT:GQ 199,66,0:1/1:99
-chr16 2612605 . A T 62.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=28 PL:GT:GQ 95,15,0:1/1:75
-chr16 2704518 . G A 41 . DP=48;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,17,0,12;MQ=48;PV4=1,1.9e-23,0.24,0.034 PL:GT:GQ 71,0,175:0/1:74
-chr16 3274307 . G T 68 . DP=39;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,30,0,8;MQ=37;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 98,0,138:0/1:99
-chr16 5467292 . G C 37.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 69,6,0:1/1:49
-chr16 10079145 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr16 11483702 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr16 12038227 . A T 23 . DP=47;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,22,0,23;MQ=32;PV4=1,4.4e-66,0.47,0.028 PL:GT:GQ 53,0,135:0/1:56
-chr16 21336880 . G C 55 . DP=35;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,12,0,19;MQ=47;PV4=1,5.6e-21,1,1 PL:GT:GQ 85,0,121:0/1:88
-chr16 21980241 . C T 16.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ 48,9,0:1/1:63
-chr16 23275383 . C G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr16 27546495 . G T 25 . DP=35;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=43 PL:GT:GQ 57,9,0:1/1:63
-chr16 27700399 . A T 17.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=17 PL:GT:GQ 50,12,0:1/1:72
-chr16 28021935 . A G 18.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 51,15,0:1/1:75
-chr16 29070016 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr16 29478618 . C T 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr16 29718140 . C T 46.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ 79,15,0:1/1:75
-chr16 30700759 . T C 17.1 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,14;MQ=14 PL:GT:GQ 50,42,0:1/1:99
-chr16 35139103 . A G 46.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=37 PL:GT:GQ 79,12,0:1/1:72
-chr16 35473348 . G A 3.83 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 34,12,0:1/1:72
-chr16 36213667 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr16 36705528 . G A 14.4 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=32 PL:GT:GQ 47,15,0:1/1:75
-chr16 43831353 . C T 69.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=42 PL:GT:GQ 102,12,0:1/1:72
-chr16 44715166 . A C 25 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=32 PL:GT:GQ 58,24,0:1/1:96
-chr16 44957661 . T C 7.03 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=18 PL:GT:GQ 39,21,0:1/1:84
-chr16 44958698 . C T 42.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=49 PL:GT:GQ 75,15,0:1/1:75
-chr16 44959163 . T C 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
-chr16 45167959 . C T 4.45 . DP=16;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=24 PL:GT:GQ 35,12,0:1/1:72
-chr16 50254956 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr16 52383122 . A C 46.5 . DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=42 PL:GT:GQ 79,12,0:1/1:72
-chr16 55978159 . C T 10.7 . DP=20;AF1=0.5336;CI95=0.5,1;DP4=2,0,5,0;MQ=35;PV4=1,0.038,1,0.059 PL:GT:GQ 40,0,9:0/1:12
-chr16 61358878 . T A 15.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ 47,6,0:1/1:49
-chr16 61392487 . G A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr16 61621603 . G T 6.59 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=22 PL:GT:GQ 38,12,0:1/1:72
-chr16 69120890 . G C 51.3 . DP=36;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=42 PL:GT:GQ 84,15,0:1/1:75
-chr16 70778219 . A G 21.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=39 PL:GT:GQ 53,6,0:1/1:49
-chr16 71899519 . T C 40 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=33 PL:GT:GQ 73,33,0:1/1:99
-chr16 72079251 . A G 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
-chr16 72093003 . G C 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr16 72672428 . A G 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
-chr16 72864515 . A G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr16 72890560 . G A 47.1 . DP=10;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,7;MQ=49;PV4=1,0.0019,0.0033,1 PL:GT:GQ 77,0,16:0/1:19
-chr16 73048929 . A G 6.29 . DP=4;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=27;PV4=1,1,1,0.33 PL:GT:GQ 34,1,0:1/1:23
-chr16 73177179 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr16 73191468 . C T 69.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=40 PL:GT:GQ 102,12,0:1/1:72
-chr16 73367439 . A C 7.41 . DP=36;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,13;MQ=26;PV4=1,1,0.027,1 PL:GT:GQ 37,4,0:1/1:45
-chr16 74259316 . C T 89.5 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr16 75271450 . C G 6.99 . DP=15;AF1=0.5015;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=44;PV4=1,0.065,0.31,1 PL:GT:GQ 36,0,22:0/1:25
-chr16 76199870 . G A 26 . DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,6,0;MQ=47;PV4=1,1.2e-06,0.32,1 PL:GT:GQ 56,0,141:0/1:59
-chr16 77723692 . A G 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
-chr17 165875 . G A 40.8 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42 PL:GT:GQ 72,6,0:1/1:49
-chr17 1443809 . C G 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr17 1618253 . C T 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=39 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr17 2815309 . T G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr17 3537486 . T G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr17 3734367 . C A 23.5 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=36 PL:GT:GQ 56,12,0:1/1:72
-chr17 5634764 . T C 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr17 6408090 . C G 3.54 . DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,2,0;MQ=40;PV4=1,1,0.36,1 PL:GT:GQ 31,0,66:0/1:34
-chr17 7089723 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr17 8731503 . G C 11.1 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 42,6,0:1/1:49
-chr17 9282935 . T C,G 24.5 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=40 PL:GT:GQ 57,12,61,0,3,61:1/1:72
-chr17 17284831 . T C 29 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ 61,9,0:1/1:63
-chr17 18439515 . G A 4.11 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=25 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
-chr17 18602146 . C T 4.76 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=16 PL:GT:GQ 36,33,0:1/1:99
-chr17 19427888 . C T 57 . DP=104;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=45,0,29,0;MQ=39;PV4=1,2.2e-12,1,1 PL:GT:GQ 87,0,131:0/1:90
-chr17 19604159 . T C 9.31 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
-chr17 19610366 . C T 13 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
-chr17 20484706 . C G 51 . DP=35;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,11,0,21;MQ=21;PV4=1,0.39,0.49,1 PL:GT:GQ 81,0,36:0/1:39
-chr17 20555720 . A G 26.3 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=28 PL:GT:GQ 59,15,0:1/1:75
-chr17 24328984 . A C 15.4 . DP=34;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=25 PL:GT:GQ 48,15,0:1/1:75
-chr17 26237090 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
-chr17 28394766 . C A 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
-chr17 31218277 . A G 3.62 . DP=38;AF1=0.5161;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=38;PV4=1,0.26,1,1 PL:GT:GQ 31,0,12:0/1:15
-chr17 31254021 . C T 15.1 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=35 PL:GT:GQ 47,9,0:1/1:63
-chr17 32516798 . G A 37.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 69,6,0:1/1:49
-chr17 32600253 . A G 16.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ 49,12,0:1/1:72
-chr17 34255214 . G C 19.2 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=21 PL:GT:GQ 52,18,0:1/1:90
-chr17 34365900 . T C 93.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=38 PL:GT:GQ 126,18,0:1/1:90
-chr17 35380386 . A T 6.79 . DP=44;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
-chr17 41993344 . C T 64 . DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,41;MQ=16 PL:GT:GQ 97,123,0:1/1:99
-chr17 42128201 . A G 4.13 . DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=52;PV4=1,0.0041,1,1 PL:GT:GQ 32,0,62:0/1:35
-chr17 42984490 . C A 56 . DP=33;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,12,0;MQ=42;PV4=1,0.004,1,1 PL:GT:GQ 86,0,34:0/1:37
-chr17 43419457 . G A 99 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,14;MQ=45 PL:GT:GQ 185,42,0:1/1:99
-chr17 43421225 . A G 65.1 . DP=31;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,17;MQ=43;PV4=1,0.004,1,1 PL:GT:GQ 98,18,0:1/1:90
-chr17 45206897 . G A 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=47 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
-chr17 45381302 . T C 18.6 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr17 45530812 . C A 3.54 . DP=6;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=40;PV4=1,1,0.37,1 PL:GT:GQ 31,0,58:0/1:34
-chr17 50242633 . G A 44 . DP=42;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,13;MQ=32;PV4=1,0.084,0.14,1 PL:GT:GQ 74,0,154:0/1:77
-chr17 51275317 . G A 14.9 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
-chr17 52325530 . C T 29 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,18;MQ=24 PL:GT:GQ 62,54,0:1/1:99
-chr17 52411748 . T G 18.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
-chr17 53190746 . C G 62.1 . DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=40 PL:GT:GQ 95,18,0:1/1:90
-chr17 58289916 . T C 18.2 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=22 PL:GT:GQ 51,18,0:1/1:90
-chr17 59796875 . C T 42 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=35 PL:GT:GQ 74,9,0:1/1:63
+++ /dev/null
-Edits that were necessary to parse these files:
-
-23.vcf: change
-##INFO=<ID=MQ0Fraction,Number=1,Type=Integer,Description="Fraction of Mapping Quality Zero Reads">
-to
-##INFO=<ID=MQ0Fraction,Number=1,Type=Float,Description="Fraction of Mapping Quality Zero Reads">
-
-similar changes in 16.vcf and 2.vcf
-
-13.vcf
-Flag should not have a value.
+++ /dev/null
-##fileformat=VCFv4.1
-##samtoolsVersion=0.1.18 (r982:295)
-##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Raw read depth">
-##INFO=<ID=DP4,Number=4,Type=Integer,Description="# high-quality ref-forward bases, ref-reverse, alt-forward and alt-reverse bases">
-##INFO=<ID=MQ,Number=1,Type=Integer,Description="Root-mean-square mapping quality of covering reads">
-##INFO=<ID=FQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred probability of all samples being the same">
-##INFO=<ID=AF1,Number=1,Type=Float,Description="Max-likelihood estimate of the first ALT allele frequency (assuming HWE)">
-##INFO=<ID=AC1,Number=1,Type=Float,Description="Max-likelihood estimate of the first ALT allele count (no HWE assumption)">
-##INFO=<ID=G3,Number=3,Type=Float,Description="ML estimate of genotype frequencies">
-##INFO=<ID=HWE,Number=1,Type=Float,Description="Chi^2 based HWE test P-value based on G3">
-##INFO=<ID=CLR,Number=1,Type=Integer,Description="Log ratio of genotype likelihoods with and without the constraint">
-##INFO=<ID=UGT,Number=1,Type=String,Description="The most probable unconstrained genotype configuration in the trio">
-##INFO=<ID=CGT,Number=1,Type=String,Description="The most probable constrained genotype configuration in the trio">
-##INFO=<ID=PV4,Number=4,Type=Float,Description="P-values for strand bias, baseQ bias, mapQ bias and tail distance bias">
-##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates that the variant is an INDEL.">
-##INFO=<ID=PC2,Number=2,Type=Integer,Description="Phred probability of the nonRef allele frequency in group1 samples being larger (,smaller) than in group2.">
-##INFO=<ID=PCHI2,Number=1,Type=Float,Description="Posterior weighted chi^2 P-value for testing the association between group1 and group2 samples.">
-##INFO=<ID=QCHI2,Number=1,Type=Integer,Description="Phred scaled PCHI2.">
-##INFO=<ID=PR,Number=1,Type=Integer,Description="# permutations yielding a smaller PCHI2.">
-##INFO=<ID=VDB,Number=1,Type=Float,Description="Variant Distance Bias">
-##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
-##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
-##FORMAT=<ID=GL,Number=3,Type=Float,Description="Likelihoods for RR,RA,AA genotypes (R=ref,A=alt)">
-##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="# high-quality bases">
-##FORMAT=<ID=SP,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled strand bias P-value">
-##FORMAT=<ID=PL,Number=G,Type=Integer,Description="List of Phred-scaled genotype likelihoods">
+++ /dev/null
-#!/usr/bin/env python
-'''unit testing code for pysam.
-
-Execute in the :file:`tests` directory as it requires the Makefile
-and data files located there.
-'''
-
-import sys
-import os
-import shutil
-import gzip
-import pysam
-import unittest
-import glob
-import re
-
-DATADIR = 'tabix_data'
-
-IS_PYTHON3 = sys.version_info[0] >= 3
-
-
-def myzip_open(infile, mode="r"):
- '''open compressed file and decode.'''
-
- def _convert(f):
- for l in f:
- yield l.decode("ascii")
-
- if IS_PYTHON3:
- if mode == "r":
- return _convert(gzip.open(infile, "r"))
- else:
- return gzip.open(mode)
-
-
-def loadAndConvert(infile, encode=True):
- '''load data from infile and convert all fields to string.
-
- Infile can be either plain or compressed (ending in .gz).
- '''
- data = []
- if infile.endswith(".gz"):
- for line in gzip.open(infile):
- line = line.decode("ascii")
- if line.startswith("#"):
- continue
- d = line.strip().split("\t")
- data.append(d)
- else:
- with open(infile) as f:
- for line in f:
- if line.startswith("#"):
- continue
- d = line.strip().split("\t")
- data.append(d)
-
- return data
-
-
-def splitToBytes(s):
- '''split string and return list of bytes.'''
- return [x.encode("ascii") for x in s.split("\t")]
-
-
-def checkBinaryEqual(filename1, filename2):
- '''return true if the two files are binary equal.'''
- if os.path.getsize(filename1) != os.path.getsize(filename2):
- return False
-
- infile1 = open(filename1, "rb")
- infile2 = open(filename2, "rb")
-
- d1, d2 = infile1.read(), infile2.read()
- found = False
- for c1, c2 in zip(d1, d2):
- if c1 != c2:
- break
- else:
- found = True
-
- infile1.close()
- infile2.close()
- return found
-
-
-class TestIndexing(unittest.TestCase):
- filename = os.path.join(DATADIR, "example.gtf.gz")
- filename_idx = os.path.join(DATADIR, "example.gtf.gz.tbi")
-
- def setUp(self):
-
- self.tmpfilename = "tmp_%i.gtf.gz" % id(self)
- shutil.copyfile(self.filename, self.tmpfilename)
-
- def testIndexPreset(self):
- '''test indexing via preset.'''
-
- pysam.tabix_index(self.tmpfilename, preset="gff")
- checkBinaryEqual(self.tmpfilename + ".tbi", self.filename_idx)
-
- def tearDown(self):
- os.unlink(self.tmpfilename)
- os.unlink(self.tmpfilename + ".tbi")
-
-
-class TestCompression(unittest.TestCase):
- filename = os.path.join(DATADIR, "example.gtf.gz")
- filename_idx = os.path.join(DATADIR, "example.gtf.gz.tbi")
- preset = "gff"
-
- def setUp(self):
-
- self.tmpfilename = "tmp_%i" % id(self)
- infile = gzip.open(self.filename, "rb")
- outfile = open(self.tmpfilename, "wb")
- outfile.write(infile.read())
- outfile.close()
- infile.close()
-
- def testCompression(self):
- '''see also issue 106'''
- pysam.tabix_compress(self.tmpfilename, self.tmpfilename + ".gz")
- checkBinaryEqual(self.tmpfilename, self.tmpfilename + ".gz")
-
- def testIndexPresetUncompressed(self):
- '''test indexing via preset.'''
-
- pysam.tabix_index(self.tmpfilename, preset=self.preset)
- # check if uncompressed file has been removed
- self.assertEqual(os.path.exists(self.tmpfilename), False)
- checkBinaryEqual(self.tmpfilename + ".gz", self.filename)
- checkBinaryEqual(self.tmpfilename + ".gz.tbi", self.filename_idx)
-
- def testIndexPresetCompressed(self):
- '''test indexing via preset.'''
-
- pysam.tabix_compress(self.tmpfilename, self.tmpfilename + ".gz")
- pysam.tabix_index(self.tmpfilename + ".gz", preset=self.preset)
- checkBinaryEqual(self.tmpfilename + ".gz", self.filename)
- checkBinaryEqual(self.tmpfilename + ".gz.tbi", self.filename_idx)
-
- def tearDown(self):
-
- try:
- os.unlink(self.tmpfilename)
- os.unlink(self.tmpfilename + ".gz")
- os.unlink(self.tmpfilename + ".gz.tbi")
- except OSError:
- pass
-
-
-class TestCompressionSam(TestCompression):
- filename = os.path.join(DATADIR, "example.sam.gz")
- filename_index = os.path.join(DATADIR, "example.sam.gz.tbi")
- preset = "sam"
-
-
-class TestCompressionBed(TestCompression):
- filename = os.path.join(DATADIR, "example.bed.gz")
- filename_index = os.path.join(DATADIR, "example.bed.gz.tbi")
- preset = "bed"
-
-
-class TestCompressionVCF(TestCompression):
- filename = os.path.join(DATADIR, "example.vcf.gz")
- filename_index = os.path.join(DATADIR, "example.vcf.gz.tbi")
- preset = "vcf"
-
-
-class IterationTest(unittest.TestCase):
-
- with_comments = False
-
- def setUp(self):
-
- lines = []
- inf = gzip.open(self.filename, "rb")
- for line in inf:
- line = line.decode('ascii')
- if line.startswith("#"):
- if not self.with_comments:
- continue
- lines.append(line)
- inf.close()
-
- # creates index of contig, start, end, adds content without newline.
- self.compare = [
- (x[0][0], int(x[0][3]), int(x[0][4]), x[1])
- for x in [(y.split("\t"), y[:-1]) for y in lines
- if not y.startswith("#")]]
-
- self.comments = [x[:-1] for x in lines if x.startswith("#")]
-
- def getSubset(self, contig=None, start=None, end=None):
-
- if contig is None:
- # all lines
- subset = [x[3] for x in self.compare]
- else:
- if start is not None and end is None:
- # until end of contig
- subset = [x[3]
- for x in self.compare if x[0] == contig
- and x[2] > start]
- elif start is None and end is not None:
- # from start of contig
- subset = [x[3]
- for x in self.compare if x[0] == contig
- and x[1] <= end]
- elif start is None and end is None:
- subset = [x[3] for x in self.compare if x[0] == contig]
- else:
- # all within interval
- subset = [x[3] for x in self.compare if x[0] == contig
- and min(x[2], end) - max(x[1], start) > 0]
-
- if self.with_comments:
- subset.extend(self.comments)
-
- return subset
-
- def checkPairwise(self, result, ref):
- '''check pairwise results.
- '''
- result.sort()
- ref.sort()
- a = set(result)
- b = set(ref)
-
- self.assertEqual(
- len(result), len(ref),
- "unexpected number of results: "
- "result=%i, expected ref=%i, differences are %s: %s"
- % (len(result), len(ref),
- a.difference(b),
- b.difference(a)))
-
- for x, d in enumerate(list(zip(result, ref))):
- self.assertEqual(
- d[0], d[1],
- "unexpected results in pair %i:\n'%s', expected\n'%s'" %
- (x, d[0], d[1]))
-
-
-class TestGZFile(IterationTest):
-
- filename = os.path.join(DATADIR, "example.gtf.gz")
- with_comments = True
-
- def setUp(self):
-
- IterationTest.setUp(self)
-
- self.iter = pysam.GZIterator(self.filename)
-
- def testAll(self):
- result = list(self.iter)
- ref = self.getSubset()
- self.checkPairwise(result, ref)
-
-
-class TestIterationWithoutComments(IterationTest):
- '''test iterating with TabixFile.fetch() when
- there are no comments in the file.'''
-
- filename = os.path.join(DATADIR,
- "example.gtf.gz")
-
- def setUp(self):
- IterationTest.setUp(self)
- self.tabix = pysam.TabixFile(self.filename)
-
- def testRegionStrings(self):
- """test if access with various region strings
- works"""
-
- self.assertEqual(218, len(list(
- self.tabix.fetch("chr1"))))
- self.assertEqual(218, len(list(
- self.tabix.fetch("chr1", 1000))))
- self.assertEqual(218, len(list(
- self.tabix.fetch("chr1", end=1000000))))
- self.assertEqual(218, len(list(
- self.tabix.fetch("chr1", 1000, 1000000))))
-
- def testAll(self):
- result = list(self.tabix.fetch())
- ref = self.getSubset()
- self.checkPairwise(result, ref)
-
- def testPerContig(self):
- for contig in ("chr1", "chr2", "chr1", "chr2"):
- result = list(self.tabix.fetch(contig))
- ref = self.getSubset(contig)
- self.checkPairwise(result, ref)
-
- def testPerContigToEnd(self):
-
- end = None
- for contig in ("chr1", "chr2", "chr1", "chr2"):
- for start in range(0, 200000, 1000):
- result = list(self.tabix.fetch(contig, start, end))
- ref = self.getSubset(contig, start, end)
- self.checkPairwise(result, ref)
-
- def testPerContigFromStart(self):
-
- start = None
- for contig in ("chr1", "chr2", "chr1", "chr2"):
- for end in range(0, 200000, 1000):
- result = list(self.tabix.fetch(contig, start, end))
- ref = self.getSubset(contig, start, end)
- self.checkPairwise(result, ref)
-
- def testPerContig2(self):
-
- start, end = None, None
- for contig in ("chr1", "chr2", "chr1", "chr2"):
- result = list(self.tabix.fetch(contig, start, end))
- ref = self.getSubset(contig, start, end)
- self.checkPairwise(result, ref)
-
- def testPerInterval(self):
-
- start, end = None, None
- for contig in ("chr1", "chr2", "chr1", "chr2"):
- for start in range(0, 200000, 2000):
- for end in range(start, start + 2000, 500):
- result = list(self.tabix.fetch(contig, start, end))
- ref = self.getSubset(contig, start, end)
- self.checkPairwise(result, ref)
-
- def testInvalidIntervals(self):
-
- # invalid intervals (start > end)
- self.assertRaises(ValueError, self.tabix.fetch, "chr1", 0, -10)
- self.assertRaises(ValueError, self.tabix.fetch, "chr1", 200, 0)
-
- # out of range intervals
- self.assertRaises(ValueError, self.tabix.fetch, "chr1", -10, 200)
- self.assertRaises(ValueError, self.tabix.fetch, "chr1", -10, -20)
-
- # unknown chromosome
- self.assertRaises(ValueError, self.tabix.fetch, "chrUn")
-
- # out of range access
- # to be implemented
- # self.assertRaises(IndexError, self.tabix.fetch, "chr1", 1000000, 2000000)
-
- # raise no error for invalid intervals
- self.tabix.fetch("chr1", 100, 100)
-
-
- def testGetContigs(self):
- self.assertEqual(sorted(self.tabix.contigs), [b"chr1", b"chr2"])
- # check that contigs is read-only
- self.assertRaises(
- AttributeError, setattr, self.tabix, "contigs", ["chr1", "chr2"])
-
- def testHeader(self):
- ref = []
- inf = gzip.open(self.filename)
- for x in inf:
- x = x.decode("ascii")
- if not x.startswith("#"):
- break
- ref.append(x[:-1].encode('ascii'))
- inf.close()
-
- header = list(self.tabix.header)
- self.assertEqual(ref, header)
-
- def testReopening(self):
- '''test repeated opening of the same file.'''
- def func1():
- # opens any tabix file
- inf = pysam.TabixFile(self.filename)
- return
-
- for i in range(10000):
- func1()
-
-
-class TestIterationWithComments(TestIterationWithoutComments):
- '''test iterating with TabixFile.fetch() when
- there are comments in the file.
-
- Tests will create plenty of warnings on stderr.
- '''
-
- filename = os.path.join(DATADIR, "example_comments.gtf.gz")
-
- def setUp(self):
- TestIterationWithoutComments.setUp(self)
-
-
-class TestParser(unittest.TestCase):
-
- filename = os.path.join(DATADIR, "example.gtf.gz")
-
- def setUp(self):
-
- self.tabix = pysam.TabixFile(self.filename)
- self.compare = loadAndConvert(self.filename)
-
- def testRead(self):
-
- for x, r in enumerate(self.tabix.fetch(parser=pysam.asTuple())):
- self.assertEqual(self.compare[x], list(r))
- self.assertEqual(len(self.compare[x]), len(r))
-
- # test indexing
- for c in range(0, len(r)):
- self.assertEqual(self.compare[x][c], r[c])
-
- # test slicing access
- for c in range(0, len(r) - 1):
- for cc in range(c + 1, len(r)):
- self.assertEqual(self.compare[x][c:cc],
- r[c:cc])
-
- def testWrite(self):
-
- for x, r in enumerate(self.tabix.fetch(parser=pysam.asTuple())):
- self.assertEqual(self.compare[x], list(r))
- c = list(r)
- for y in range(len(r)):
- r[y] = "test_%05i" % y
- c[y] = "test_%05i" % y
- self.assertEqual([x for x in c], list(r))
- self.assertEqual("\t".join(c), str(r))
- # check second assignment
- for y in range(len(r)):
- r[y] = "test_%05i" % y
- self.assertEqual([x for x in c], list(r))
- self.assertEqual("\t".join(c), str(r))
-
- def testUnset(self):
- for x, r in enumerate(self.tabix.fetch(parser=pysam.asTuple())):
- self.assertEqual(self.compare[x], list(r))
- c = list(r)
- e = list(r)
- for y in range(len(r)):
- r[y] = None
- c[y] = None
- e[y] = ""
- self.assertEqual(c, list(r))
- self.assertEqual("\t".join(e), str(r))
-
- def testIteratorCompressed(self):
- '''test iteration from compressed file.'''
- with gzip.open(self.filename) as infile:
- for x, r in enumerate(pysam.tabix_iterator(
- infile, pysam.asTuple())):
- self.assertEqual(self.compare[x], list(r))
- self.assertEqual(len(self.compare[x]), len(r))
-
- # test indexing
- for c in range(0, len(r)):
- self.assertEqual(self.compare[x][c], r[c])
-
- # test slicing access
- for c in range(0, len(r) - 1):
- for cc in range(c + 1, len(r)):
- self.assertEqual(self.compare[x][c:cc],
- r[c:cc])
-
- def testIteratorUncompressed(self):
- '''test iteration from uncompressed file.'''
- tmpfilename = 'tmp_testIteratorUncompressed'
- infile = gzip.open(self.filename, "rb")
- outfile = open(tmpfilename, "wb")
- outfile.write(infile.read())
- outfile.close()
- infile.close()
-
- with open(tmpfilename) as infile:
- for x, r in enumerate(pysam.tabix_iterator(
- infile, pysam.asTuple())):
- self.assertEqual(self.compare[x], list(r))
- self.assertEqual(len(self.compare[x]), len(r))
-
- # test indexing
- for c in range(0, len(r)):
- self.assertEqual(self.compare[x][c], r[c])
-
- # test slicing access
- for c in range(0, len(r) - 1):
- for cc in range(c + 1, len(r)):
- self.assertEqual(self.compare[x][c:cc],
- r[c:cc])
-
- os.unlink(tmpfilename)
-
-
-class TestIterators(unittest.TestCase):
-
- filename = os.path.join(DATADIR, "example.gtf.gz")
-
- iterator = pysam.tabix_generic_iterator
- parser = pysam.asTuple
- is_compressed = False
-
- def setUp(self):
-
- self.tabix = pysam.TabixFile(self.filename)
- self.compare = loadAndConvert(self.filename)
- self.tmpfilename_uncompressed = 'tmp_TestIterators'
- infile = gzip.open(self.filename, "rb")
- outfile = open(self.tmpfilename_uncompressed, "wb")
- outfile.write(infile.read())
- outfile.close()
- infile.close()
-
- def open(self):
-
- if self.is_compressed:
- infile = gzip.open(self.filename)
- else:
- infile = open(self.tmpfilename_uncompressed)
- return infile
-
- def testIteration(self):
-
- infile = self.open()
-
- for x, r in enumerate(self.iterator(infile, self.parser())):
- self.assertEqual(self.compare[x], list(r))
- self.assertEqual(len(self.compare[x]), len(r))
-
- # test indexing
- for c in range(0, len(r)):
- self.assertEqual(self.compare[x][c], r[c])
-
- # test slicing access
- for c in range(0, len(r) - 1):
- for cc in range(c + 1, len(r)):
- self.assertEqual(self.compare[x][c:cc],
- r[c:cc])
-
- def testClosedFile(self):
- '''test for error when iterating from closed file.'''
- infile = self.open()
- infile.close()
-
- # iterating from a closed file should raise a value error
- self.assertRaises(ValueError, self.iterator, infile, self.parser())
-
- def testClosedFileIteration(self):
- '''test for error when iterating from file that has been closed'''
-
- infile = self.open()
-
- i = self.iterator(infile, self.parser())
- x = i.next()
- infile.close()
- # Not implemented
- # self.assertRaises(ValueError, i.next)
-
- def tearUp(self):
- os.unlink(self.tmpfilename_uncompressed)
-
-
-class TestIteratorsGenericCompressed(TestIterators):
- is_compressed = True
-
-
-class TestIteratorsFileCompressed(TestIterators):
- iterator = pysam.tabix_file_iterator
- is_compressed = True
-
-
-class TestIteratorsFileUncompressed(TestIterators):
- iterator = pysam.tabix_file_iterator
- is_compressed = False
-
-
-class TestGTF(TestParser):
-
- def testRead(self):
-
- for x, r in enumerate(self.tabix.fetch(parser=pysam.asGTF())):
- c = self.compare[x]
- self.assertEqual(len(c), len(r))
- self.assertEqual(list(c), list(r))
- self.assertEqual(c, str(r).split("\t"))
- self.assertTrue(r.gene_id.startswith("ENSG"))
- if r.feature != 'gene':
- self.assertTrue(r.transcript_id.startswith("ENST"))
- self.assertEqual(c[0], r.contig)
-
-
-class TestIterationMalformattedGTFFiles(unittest.TestCase):
- '''test reading from malformatted gtf files.'''
-
- parser = pysam.asGTF
- iterator = pysam.tabix_generic_iterator
- parser = pysam.asGTF
-
- def testGTFTooManyFields(self):
-
- iterator = self.iterator(
- gzip.open(os.path.join(DATADIR,
- "gtf_toomany_fields.gtf.gz")),
- parser=self.parser())
- self.assertRaises(ValueError, iterator.next)
-
- def testGTFTooFewFields(self):
-
- iterator = self.iterator(
- gzip.open(os.path.join(DATADIR,
- "gtf_toofew_fields.gtf.gz")),
- parser=self.parser())
- self.assertRaises(ValueError, iterator.next)
-
-
-class TestBed(unittest.TestCase):
- filename = os.path.join(DATADIR, "example.bed.gz")
-
- def setUp(self):
-
- self.tabix = pysam.TabixFile(self.filename)
- self.compare = loadAndConvert(self.filename)
-
- def testRead(self):
-
- for x, r in enumerate(self.tabix.fetch(parser=pysam.asBed())):
- c = self.compare[x]
- self.assertEqual(len(c), len(r))
- self.assertEqual(c, str(r).split("\t"))
- self.assertEqual(c[0], r.contig)
- self.assertEqual(int(c[1]), r.start)
- self.assertEqual(int(c[2]), r.end)
- self.assertEqual(list(c), list(r))
-
- def testWrite(self):
-
- for x, r in enumerate(self.tabix.fetch(parser=pysam.asBed())):
- c = self.compare[x]
- self.assertEqual(c, str(r).split("\t"))
- self.assertEqual(list(c), list(r))
-
- r.contig = "test"
- self.assertEqual("test", r.contig)
- self.assertEqual("test", r[0])
-
- r.start += 1
- self.assertEqual(int(c[1]) + 1, r.start)
- self.assertEqual(str(int(c[1]) + 1), r[1])
-
- r.end += 1
- self.assertEqual(int(c[2]) + 1, r.end)
- self.assertEqual(str(int(c[2]) + 1), r[2])
-
-
-class TestVCF(unittest.TestCase):
-
- filename = os.path.join(DATADIR, "example.vcf40")
-
- def setUp(self):
- self.tmpfilename = "tmp_%s.vcf" % id(self)
- shutil.copyfile(self.filename, self.tmpfilename)
- pysam.tabix_index(self.tmpfilename, preset="vcf")
-
- def tearDown(self):
- os.unlink(self.tmpfilename + ".gz")
- if os.path.exists(self.tmpfilename + ".gz.tbi"):
- os.unlink(self.tmpfilename + ".gz.tbi")
-
-
-if IS_PYTHON3:
- class TestUnicode(unittest.TestCase):
- '''test reading from a file with non-ascii characters.'''
-
- filename = os.path.join(DATADIR, "example_unicode.vcf")
-
- def setUp(self):
- self.tmpfilename = "tmp_%s.vcf" % id(self)
- shutil.copyfile(self.filename, self.tmpfilename)
- pysam.tabix_index(self.tmpfilename, preset="vcf")
-
- def testFromTabix(self):
-
- # use ascii encoding - should raise error
- t = pysam.TabixFile(self.tmpfilename + ".gz", encoding="ascii")
- results = list(t.fetch(parser=pysam.asVCF()))
- self.assertRaises(UnicodeDecodeError, getattr, results[1], "id")
-
- t = pysam.TabixFile(self.tmpfilename + ".gz", encoding="utf-8")
- results = list(t.fetch(parser=pysam.asVCF()))
- self.assertEqual(getattr(results[1], "id"), u"Rene\xe9")
-
- def testFromVCF(self):
- self.vcf = pysam.VCF()
- self.assertRaises(
- UnicodeDecodeError,
- self.vcf.connect, self.tmpfilename + ".gz", "ascii")
- self.vcf.connect(self.tmpfilename + ".gz", encoding="utf-8")
- v = self.vcf.getsamples()[0]
-
-
-class TestVCFFromTabix(TestVCF):
-
- columns = ("contig", "pos", "id",
- "ref", "alt", "qual",
- "filter", "info", "format")
-
- def setUp(self):
-
- TestVCF.setUp(self)
-
- self.tabix = pysam.TabixFile(self.tmpfilename + ".gz")
- self.compare = loadAndConvert(self.filename)
-
- def testRead(self):
-
- ncolumns = len(self.columns)
-
- for x, r in enumerate(self.tabix.fetch(parser=pysam.asVCF())):
- c = self.compare[x]
- for y, field in enumerate(self.columns):
- # it is ok to have a missing format column
- if y == 8 and y == len(c):
- continue
- if field == "pos":
- self.assertEqual(int(c[y]) - 1, getattr(r, field))
- self.assertEqual(int(c[y]) - 1, r.pos)
- else:
- self.assertEqual(c[y], getattr(r, field),
- "mismatch in field %s: %s != %s" %
- (field, c[y], getattr(r, field)))
- if len(c) == 8:
- self.assertEqual(0, len(r))
- else:
- self.assertEqual(len(c), len(r) + ncolumns)
-
- for y in range(len(c) - ncolumns):
- self.assertEqual(c[ncolumns + y], r[y])
-
- def testWrite(self):
-
- ncolumns = len(self.columns)
-
- for x, r in enumerate(self.tabix.fetch(parser=pysam.asVCF())):
- c = self.compare[x]
- # check unmodified string
- cmp_string = str(r)
- ref_string = "\t".join([x for x in c])
-
- self.assertEqual(ref_string, cmp_string)
-
- # set fields and compare field-wise
- for y, field in enumerate(self.columns):
- # it is ok to have a missing format column
- if y == 8 and y == len(c):
- continue
- if field == "pos":
- rpos = getattr(r, field)
- self.assertEqual(int(c[y]) - 1, rpos)
- self.assertEqual(int(c[y]) - 1, r.pos)
- # increment pos by 1
- setattr(r, field, rpos + 1)
- self.assertEqual(getattr(r, field), rpos + 1)
- c[y] = str(int(c[y]) + 1)
- else:
- setattr(r, field, "test_%i" % y)
- c[y] = "test_%i" % y
- self.assertEqual(c[y], getattr(r, field),
- "mismatch in field %s: %s != %s" %
- (field, c[y], getattr(r, field)))
-
- if len(c) == 8:
- self.assertEqual(0, len(r))
- else:
- self.assertEqual(len(c), len(r) + ncolumns)
-
- for y in range(len(c) - ncolumns):
- c[ncolumns + y] = "test_%i" % y
- r[y] = "test_%i" % y
- self.assertEqual(c[ncolumns + y], r[y])
-
-
-class TestVCFFromVCF(TestVCF):
-
- columns = ("chrom", "pos", "id",
- "ref", "alt", "qual",
- "filter", "info", "format")
-
- # tests failing while parsing
- fail_on_parsing = (
- (5, "Flag fields should not have a value"),
- (9, "aouao"),
- (13, "aoeu"),
- (18, "Error BAD_NUMBER_OF_PARAMETERS"),
- (24, "Error HEADING_NOT_SEPARATED_BY_TABS"))
-
- # tests failing on opening
- fail_on_opening = ((24, "Error HEADING_NOT_SEPARATED_BY_TABS"),
- )
-
- def setUp(self):
-
- TestVCF.setUp(self)
-
- self.vcf = pysam.VCF()
- self.compare = loadAndConvert(self.filename, encode=False)
-
- def testConnecting(self):
-
- fn = os.path.basename(self.filename)
- for x, msg in self.fail_on_opening:
- if "%i.vcf" % x == fn:
- self.assertRaises(ValueError,
- self.vcf.connect,
- self.tmpfilename + ".gz")
- else:
- self.vcf.connect(self.tmpfilename + ".gz")
-
- def testParsing(self):
-
- fn = os.path.basename(self.filename)
- with open(self.filename) as f:
-
- for x, msg in self.fail_on_opening:
- if "%i.vcf" % x == fn:
- self.assertRaises(ValueError, self.vcf.parse, f)
- return
- else:
- iter = self.vcf.parse(f)
-
- for x, msg in self.fail_on_parsing:
- if "%i.vcf" % x == fn:
- self.assertRaises(ValueError, list, iter)
- break
- # python 2.7
- # self.assertRaisesRegexp(
- # ValueError, re.compile(msg), self.vcf.parse, f)
- else:
- # do the actual parsing
- for x, r in enumerate(iter):
- c = self.compare[x]
- for y, field in enumerate(self.columns):
- # it is ok to have a missing format column
- if y == 8 and y == len(c):
- continue
-
- val = r[field]
- if field == "pos":
- self.assertEqual(int(c[y]) - 1, val)
- elif field == "alt":
- if c[y] == ".":
- # convert . to empty list
- self.assertEqual(
- [], val,
- "mismatch in field %s: expected %s, got %s" %
- (field, c[y], val))
- else:
- # convert to list
- self.assertEqual(
- c[y].split(","), val,
- "mismatch in field %s: expected %s, got %s" %
- (field, c[y], val))
-
- elif field == "filter":
- if c[y] == "PASS" or c[y] == ".":
- # convert PASS to empty list
- self.assertEqual(
- [], val,
- "mismatch in field %s: expected %s, got %s" %
- (field, c[y], val))
- else:
- # convert to list
- self.assertEqual(
- c[y].split(";"), val,
- "mismatch in field %s: expected %s, got %s" %
- (field, c[y], val))
-
- elif field == "info":
- # tests for info field not implemented
- pass
- elif field == "qual" and c[y] == ".":
- self.assertEqual(
- -1, val,
- "mismatch in field %s: expected %s, got %s" %
- (field, c[y], val))
-
- elif field == "format":
- # format field converted to list
- self.assertEqual(
- c[y].split(":"), val,
- "mismatch in field %s: expected %s, got %s" %
- (field, c[y], val))
-
- elif type(val) in (int, float):
- if c[y] == ".":
- self.assertEqual(
- None, val,
- "mismatch in field %s: expected %s, got %s" %
- (field, c[y], val))
- else:
- self.assertEqual(
- float(c[y]), float(val),
- "mismatch in field %s: expected %s, got %s" %
- (field, c[y], val))
- else:
- self.assertEqual(
- c[y], val,
- "mismatch in field %s: expected %s, got %s" %
- (field, c[y], val))
-
-############################################################################
-# create a test class for each example vcf file.
-# Two samples are created -
-# 1. Testing pysam/tabix access
-# 2. Testing the VCF class
-vcf_files = glob.glob(os.path.join(DATADIR, "vcf", "*.vcf"))
-
-for vcf_file in vcf_files:
- n = "VCFFromTabixTest_%s" % os.path.basename(vcf_file[:-4])
- globals()[n] = type(n, (TestVCFFromTabix,), dict(filename=vcf_file,))
- n = "VCFFromVCFTest_%s" % os.path.basename(vcf_file[:-4])
- globals()[n] = type(n, (TestVCFFromVCF,), dict(filename=vcf_file,))
-
-############################################################################
-
-
-class TestRemoteFileHTTP(unittest.TestCase):
-
- url = "http://genserv.anat.ox.ac.uk/downloads/pysam/test/example_htslib.gtf.gz"
- region = "chr1:1-1000"
- local = os.path.join(DATADIR, "example.gtf.gz")
-
- def testFetchAll(self):
- remote_file = pysam.TabixFile(self.url, "r")
- remote_result = list(remote_file.fetch())
- local_file = pysam.TabixFile(self.local, "r")
- local_result = list(local_file.fetch())
-
- self.assertEqual(len(remote_result), len(local_result))
- for x, y in zip(remote_result, local_result):
- self.assertEqual(x, y)
-
-
-class TestIndexArgument(unittest.TestCase):
-
- filename_src = os.path.join(DATADIR, "example.vcf.gz")
- filename_dst = "tmp_example.vcf.gz"
- index_src = os.path.join(DATADIR, "example.vcf.gz.tbi")
- index_dst = "tmp_index_example.vcf.gz.tbi"
- preset = "vcf"
-
- def testFetchAll(self):
- shutil.copyfile(self.filename_src, self.filename_dst)
- shutil.copyfile(self.index_src, self.index_dst)
- same_basename_file = pysam.TabixFile(
- self.filename_src, "r", index=self.index_src)
- same_basename_results = list(same_basename_file.fetch())
- diff_index_file = pysam.TabixFile(
- self.filename_dst, "r", index=self.index_dst)
- diff_index_result = list(diff_index_file.fetch())
-
- self.assertEqual(len(same_basename_results), len(diff_index_result))
- for x, y in zip(same_basename_results, diff_index_result):
- self.assertEqual(x, y)
-
-
-def _TestMultipleIteratorsHelper(filename, multiple_iterators):
- '''open file within scope, return iterator.'''
-
- tabix = pysam.TabixFile(filename)
- iterator = tabix.fetch(parser=pysam.asGTF(),
- multiple_iterators=multiple_iterators)
- tabix.close()
- return iterator
-
-
-class TestMultipleIterators(unittest.TestCase):
-
- filename = os.path.join(DATADIR, "example.gtf.gz")
-
- def testJoinedIterators(self):
-
- # two iterators working on the same file
- tabix = pysam.TabixFile(self.filename)
- a = tabix.fetch(parser=pysam.asGTF()).next()
- b = tabix.fetch(parser=pysam.asGTF()).next()
- # the first two lines differ only by the feature field
- self.assertEqual(a.feature, "UTR")
- self.assertEqual(b.feature, "exon")
- self.assertEqual(re.sub("UTR", "", str(a)),
- re.sub("exon", "", str(b)))
-
- def testDisjointIterators(self):
- # two iterators working on the same file
- tabix = pysam.TabixFile(self.filename)
- a = tabix.fetch(parser=pysam.asGTF(), multiple_iterators=True).next()
- b = tabix.fetch(parser=pysam.asGTF(), multiple_iterators=True).next()
- # both iterators are at top of file
- self.assertEqual(str(a), str(b))
-
- def testScope(self):
- # technically it does not really test if the scope is correct
- i = _TestMultipleIteratorsHelper(self.filename,
- multiple_iterators=True)
- self.assertTrue(i.next())
- i = _TestMultipleIteratorsHelper(self.filename,
- multiple_iterators=False)
- self.assertRaises(IOError, i.next)
-
- def testDoubleFetch(self):
-
- f = pysam.TabixFile(self.filename)
-
- for a, b in zip(f.fetch(multiple_iterators=True),
- f.fetch(multiple_iterators=True)):
- self.assertEqual(str(a), str(b))
-
-
-if __name__ == "__main__":
- unittest.main()
projects / python-pysam.git / commitdiff